CN116590413A - 一种肿瘤标记物及其应用 - Google Patents
一种肿瘤标记物及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN116590413A CN116590413A CN202310261500.XA CN202310261500A CN116590413A CN 116590413 A CN116590413 A CN 116590413A CN 202310261500 A CN202310261500 A CN 202310261500A CN 116590413 A CN116590413 A CN 116590413A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- cancer
- seq
- nucleotide sequence
- tumor
- base sequence
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 title claims abstract description 47
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 276
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 claims abstract description 186
- 230000011987 methylation Effects 0.000 claims abstract description 183
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims abstract description 27
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims abstract description 21
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims abstract description 21
- 108091029430 CpG site Proteins 0.000 claims abstract description 16
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 8
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 claims abstract description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims abstract description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 279
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 148
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 71
- 206010030155 Oesophageal carcinoma Diseases 0.000 claims description 69
- 208000000461 Esophageal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 68
- 201000004101 esophageal cancer Diseases 0.000 claims description 68
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 67
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 67
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 67
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 67
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 claims description 62
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 claims description 62
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 claims description 62
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 56
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 56
- 208000014829 head and neck neoplasm Diseases 0.000 claims description 47
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims description 45
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims description 45
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims description 45
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 41
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims description 40
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims description 40
- 201000010536 head and neck cancer Diseases 0.000 claims description 39
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 29
- 208000006990 cholangiocarcinoma Diseases 0.000 claims description 29
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 claims description 28
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 28
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 28
- 208000000728 Thymus Neoplasms Diseases 0.000 claims description 28
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 claims description 28
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 claims description 28
- 201000009377 thymus cancer Diseases 0.000 claims description 28
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 claims description 28
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 claims description 28
- 208000030808 Clear cell renal carcinoma Diseases 0.000 claims description 27
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 claims description 27
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 claims description 27
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 27
- 206010073251 clear cell renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 27
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims description 27
- 201000006585 gastric adenocarcinoma Diseases 0.000 claims description 27
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 claims description 27
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 claims description 27
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 claims description 27
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 27
- 201000010279 papillary renal cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 27
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 claims description 26
- 206010061332 Paraganglion neoplasm Diseases 0.000 claims description 23
- 208000007312 paraganglioma Diseases 0.000 claims description 23
- 208000028591 pheochromocytoma Diseases 0.000 claims description 23
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 20
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 11
- 101100495925 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) chr3 gene Proteins 0.000 claims description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 7
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 5
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 claims description 5
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 4
- 206010004593 Bile duct cancer Diseases 0.000 claims description 3
- 208000026900 bile duct neoplasm Diseases 0.000 claims description 3
- 238000007031 hydroxymethylation reaction Methods 0.000 claims description 3
- 239000003596 drug target Substances 0.000 claims description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 2
- 230000006607 hypermethylation Effects 0.000 abstract description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 115
- 201000005249 lung adenocarcinoma Diseases 0.000 description 26
- 208000000102 Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck Diseases 0.000 description 25
- 201000000459 head and neck squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 25
- 208000010507 Adenocarcinoma of Lung Diseases 0.000 description 22
- 238000012164 methylation sequencing Methods 0.000 description 15
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 14
- 230000007067 DNA methylation Effects 0.000 description 9
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 9
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 8
- 208000026037 malignant tumor of neck Diseases 0.000 description 8
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 8
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 4
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 102000012406 Carcinoembryonic Antigen Human genes 0.000 description 2
- 108010022366 Carcinoembryonic Antigen Proteins 0.000 description 2
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 2
- 102000052575 Proto-Oncogene Human genes 0.000 description 2
- 108700020978 Proto-Oncogene Proteins 0.000 description 2
- MEFKEPWMEQBLKI-AIRLBKTGSA-N S-adenosyl-L-methioninate Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](C[S+](CC[C@H](N)C([O-])=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 MEFKEPWMEQBLKI-AIRLBKTGSA-N 0.000 description 2
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 229960001570 ademetionine Drugs 0.000 description 2
- 102000013529 alpha-Fetoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108010026331 alpha-Fetoproteins Proteins 0.000 description 2
- 238000001369 bisulfite sequencing Methods 0.000 description 2
- 230000008995 epigenetic change Effects 0.000 description 2
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 2
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 2
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 2
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M Bisulfite Chemical compound OS([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 1
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 description 1
- 101710150820 Cellular tumor antigen p53 Proteins 0.000 description 1
- 108091029523 CpG island Proteins 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 230000033616 DNA repair Effects 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 208000022072 Gallbladder Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 102000016397 Methyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 208000032818 Microsatellite Instability Diseases 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 102000055027 Protein Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108700040121 Protein Methyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 1
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 230000002424 anti-apoptotic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003851 biochemical process Effects 0.000 description 1
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 1
- 230000000711 cancerogenic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 231100000315 carcinogenic Toxicity 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 description 1
- VUIKXKJIWVOSMF-GHTOIXBYSA-N d(CG)12 Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C(N=C(N)C=C2)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H](C[C@@H](O2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)O)C1 VUIKXKJIWVOSMF-GHTOIXBYSA-N 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000017858 demethylation Effects 0.000 description 1
- 238000010520 demethylation reaction Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007608 epigenetic mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 201000010175 gallbladder cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 1
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000022983 regulation of cell cycle Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000012070 whole genome sequencing analysis Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/154—Methylation markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
本申请是申请号为CN202011608940.0的分案申请。本发明提供了一种肿瘤标记物及其应用，所述肿瘤标记物位于人类基因组1号染色体、2号染色体、3号染色体、5号染色体、7号染色体、8号染色体、10号染色体、11号染色体和21号染色体上，且包括一个或多个可发生甲基化修饰的CpG位点；本发明提供了一类DNA表观修饰相关的肿瘤标记物，标记物在肿瘤患者中表现出显著性的高甲基化状态。肿瘤标记物可用于肿瘤的临床辅助的筛查、诊断以及预后等，或可用于设计诊断试剂及试剂盒。
Description
本申请是申请号为CN202011608940.0、申请日为2020年12月30日、发明名称为“肿瘤标记物及其应用”的分案申请。
技术领域
本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种肿瘤标记物及其应用。
背景技术
肿瘤的发生发展是一个复杂、多层面、多因素的动态过程，包含了外界环境、遗传学变异以及表观遗传学改变等多种因素的相互作用。外界环境因素包括物理、化学、生物等致癌因素以及不健康的生活习惯等；遗传学变异包括基因突变、拷贝数变化、染色体错位等；表观遗传学改变主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等变化因素。在肿瘤的发生发展过程中，上述因素相辅相成，共同作用，导致一系列抑癌基因的失活以及原癌基因的激活，进而导致肿瘤。及时得发现并诊断在肿瘤治疗中具有重要意义。
随着人们对肿瘤认识的加深以及科学技术的进步，许多新型的肿瘤标记物被发现并用于临床诊断。1980年之前，肿瘤标记物主要是一些激素、酶类、蛋白质等细胞分泌物，例如癌胚抗原(CEA)、甲胎抗原(AFP)等可以作为胃癌和肝癌等多种肿瘤的标记物。目前这一类肿瘤标记物虽然临床仍在用，但其敏感性与准确性已难以满足现在的临床需求。现在基于突变的标记物也越来越多，如肿瘤抑制因子p53的突变、BRCA基因突变、结直肠癌中的微卫星不稳定等，然而这类标记物在早期肿瘤的发现和诊断中效果不太理想。利用基于DNA甲基化的标记物可以在肿瘤发展的早期就可以将其诊断出来。
表观遗传学(Epigenomics)是研究基因在不发生DNA序列改变的情况下，基因功能的可遗传的变化，并最终导致表型变化的一门学科。表观遗传学主要包括DNA甲基化(DNAmethylation)、组蛋白修饰(histone modification)、microRNA水平变化等生化过程。DNA甲基化是研究较为深入的表观遗传学机制，在包括诊断和治疗在内的肿瘤临床实践中有着应用前景。DNA甲基化是指生物体内在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase，DMT)的催化下，以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体，将甲基转移到特定的碱基上的过程。在哺乳动物中DNA甲基化主要发生在5’-CpG-3’的C上，生成5-甲基胞嘧啶(5mC)。
在正常细胞中，一些CpG处于高度甲基化/转录沉默的状态，而在肿瘤细胞中这些CpG发生了广泛的去甲基化，导致重复序列的转录、转座子的活化，使得基因组高度不稳定和原癌基因转录增强。此外，一些原本在正常细胞中处于低甲基化状态的CpG岛在肿瘤细胞中会发生高甲基化，从而导致基因的转录失活，受影响的基因包括DNA修复基因、细胞周期控制基因和抗凋亡基因等。基因组DNA经亚硫酸氢盐处理后，通过PCR或测序等方式可以有效地确定特定位点的甲基化状态。利用上述技术，这些异常的DNA甲基化状态，可以在肿瘤发生的早期就被检测到。
人类基因组全序列尽管已经被人们所掌握，但是基因组序列纷繁复杂，哪些基因或哪些区段与疾病密切相关，仍然不是很清楚。此外，由于肿瘤本身的复杂性，使得寻找到既敏感又特异的肿瘤标记物变得更加困难。在本发明中，发明人通过利用大量数据并结合更优化的方法，寻找出更精准的肿瘤标记物，为肿瘤的诊断提供更多的途径。
发明内容
本发明克服现有技术的缺陷，提供了一类DNA表观修饰相关的肿瘤标记物，标记物在肿瘤患者中表现出显著性的高甲基化状态。
本发明的第一个方面，提供了一种肿瘤标记物，所述肿瘤标记物位于人类基因组1号染色体、2号染色体、3号染色体、5号染色体、7号染色体、8号染色体、10号染色体、11号染色体和21号染色体上，且包括一个或多个可发生甲基化修饰的CpG位点。
优选的，所述肿瘤标记物包括作为乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌和胰腺癌中的一种或几种的标记物。
优选的，所述肿瘤标记物还包括作为膀胱癌、胆管癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌中的一种或几种的标记物。
优选的，所述甲基化修饰包括5-醛甲基化修饰、5-羟甲基化修饰、5-甲基化修饰或5-羧甲基化修饰。
优选的，所述肿瘤标记物包括位于人类基因组Hg19上(坐标从0开始)chr2:105459135-105459190、chr10:124902392-124902455、chr3:157812331-157812498、chr21:38378275-38378539、chr8:97170353-97170404、chr5:134880362-134880455、chr10:94835119-94835252、chr11:31826557-31826963、chr3:147114032-147114108、chr10:50819227-50819589、chr2:66809255-66809281、chr7:97361393-97361461、chr8:70984200-70984294、chr1:6515341-6515409区域的一种或多种。更优选的，所述肿瘤标记物包括以人类基因组hg19作为参考版本位于chr1:6515341-6515409区域。
优选的，所述chr2:105459135-105459190区域选自以下组中的至少一种：a)SEQID NO.1所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.1所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.1至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr10:124902392-124902455区域选自以下组中的至少一种：a)SEQID NO.2所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.2所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.2至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr3:157812331-157812498区域选自以下组中的至少一种：a)SEQID NO.3所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.3所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.3至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr21:38378275-38378539区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.4所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.4所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.4至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr8:97170353-97170404区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.5所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.5所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.5至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr5:134880362-134880455区域选自以下组中的至少一种：a)SEQID NO.6所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.6所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.6至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr10:94835119-94835252区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.7所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.7所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.7至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr11:31826557-31826963区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.8所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.8所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.8至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr3:147114032-147114108区域选自以下组中的至少一种：a)SEQID NO.9所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.9所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.9至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr10:50819227-50819589区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.10所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.10所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.10至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr2:66809255-66809281区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.11所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.11所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.11至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr7:97361393-97361461区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.12所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.12所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.12至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr8:70984200-70984294区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.13所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.13所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.13至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
优选的，所述chr1:6515341-6515409区域选自以下组中的至少一种：a)SEQ IDNO.14所示的碱基序列；b)SEQ ID NO.14所示的碱基序列的互补序列；c)与SEQ ID NO.14至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
上述序列及其反向互补序列如下表1所示。其中，加粗倾斜字体表示CpG位点，着重号下边的数字表示该检测位点的编号。
表1
本发明的第二个方面，提供了本发明所述的肿瘤标记物的应用，所述应用选自以下应用中的一种：所述肿瘤标记物在制备肿瘤的筛选试剂、预后试剂、检测试剂或诊断试剂中的应用；所述肿瘤标记物在作为肿瘤的药物靶点中的应用；所述肿瘤标记物在制备抑制肿瘤增生的药物中应用；检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化水平的试剂在制备检测肿瘤的试剂中的应用。其中，所述CpG位点如上表1所示。
优选的，所述肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌(食管癌)、胶质母细胞瘤、头颈部癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺癌(肺腺癌)、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌、乳腺癌；进一步优选的，所述肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌。具体地，SEQ ID NO.1或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌(头颈部癌)、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌(进一步优选：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肺腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌)；SEQ ID NO.2或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌；SEQID NO.3或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌；SEQ ID NO.4或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌(进一步优选：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌)；SEQ ID NO.5或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌(进一步优选：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌)；SEQ ID NO.6或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌(进一步优选：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌)；SEQ ID NO.7或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌；SEQ ID NO.8或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌(进一步优选：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌)；SEQ ID NO.9或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌；SEQ ID NO.10或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌；SEQ ID NO.11或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌；SEQ ID NO.12或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌；SEQ ID NO.13或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌；SEQ ID NO.14或其反义互补序列可作为标记物的肿瘤包括：乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌、胰腺癌。
优选的，在上述应用中，所述检测试剂为肿瘤标记物检测试剂盒，其包括特异性检测所述肿瘤标记物的引物或探针；和/或，所述抑制肿瘤增生的药物为所述肿瘤标记物的抑制剂。进一步优选的，所述引物或探针为特异性检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化的引物或探针；所述抑制剂为甲基化抑制剂。
本发明的第三个方面，提供了一种抑制肿瘤增生的药物，所述药物包含本发明所述的肿瘤标记物的抑制剂。优选的，所述抑制剂为甲基化抑制剂；进一步优选的，所述抑制剂为抑制上表1中的一种或多种CpG位点甲基化的抑制剂。上述药物还可包括药学上可接受的载体。
本发明的第四个方面，提供了一种肿瘤标记物的检测方法，包括以下步骤：S1、获取待检测组织样本；S2、抽提待检测组织样本DNA，获取样本的甲基化值；S3、计算出在所述肿瘤标记物序列区域内的每个CpG位点的甲基化情况或整个区域的平均甲基化情况。
优选的，步骤S2中获取样本的甲基化值的方法包括测序、探针、抗体、质谱等。
本发明的第五个方面，提供了一种肿瘤标记物检测试剂盒，包括特异性检测本发明所述的肿瘤标记物的引物或探针。优选的，所述特异性检测肿瘤标记物包括特异性检测所述肿瘤标记物的CpG位点的甲基化；其中，所述肿瘤标记物的CpG位点的甲基化为5-甲基化，包括5-醛甲基化、5-羟甲基化或5-羧甲基化。
本发明相对于现有技术具有如下优点：本发明提供了一类DNA表观修饰相关的肿瘤标记物，所述标记物在肿瘤患者中表现出显著性的高甲基化状态。所述肿瘤标记物可用于肿瘤的临床辅助的筛查、诊断以及预后等，或可用于设计诊断试剂及试剂盒等等。
附图说明
此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解，构成本发明的一部分，本发明的示意性实施例及其说明仅用于解释本发明，并不构成对本发明的不当限定。在附图中：
图1为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.1靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图2为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.3靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图3为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.4靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图4为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.5靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图5为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.6靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图6为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.8靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图7为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.10靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图8为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.12靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图9为本发明一实施例2中的SEQ ID NO.13靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值图；
图10为本发明一实施例3中的SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.14靶序列在不同肿瘤细胞系上的平均甲基化值热图；
图11为本发明一实施例4中的SEQ ID NO.1靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图12为本发明一实施例5中的SEQ ID NO.2靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图13为本发明一实施例6中的SEQ ID NO.3靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图14为本发明一实施例7中的SEQ ID NO.4靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图15为本发明一实施例8中的SEQ ID NO.5靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图16为本发明一实施例9中的SEQ ID NO.6靶序列在五种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图17为本发明一实施例10中的SEQ ID NO.7靶序列在五种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图18为本发明一实施例11中的SEQ ID NO.8靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图19为本发明一实施例12中的SEQ ID NO.9靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图20为本发明一实施例13中的SEQ ID NO.10靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图21为本发明一实施例14中的SEQ ID NO.11靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图22为本发明一实施例15中的SEQ ID NO.12靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图23为本发明一实施例16中的SEQ ID NO.13靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图；
图24为本发明一实施例17中的SEQ ID NO.14靶序列在六种肿瘤中的平均甲基化值分布及ROC图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例，对本发明的具体实施方式作进一步描述。以下实施例仅用于更加清楚地说明本发明的技术方案，而不能以此来限制本发明的保护范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，按照本领域常规方法和条件，或按照商品说明书选择。
下述实施例中验证的靶序列的具体序列信息如上表1所示。
实施例1-甲基化水平检测
采用RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing)、WGBS(WholeGenome Bisulfite Sequencing)等甲基化检测方法，主要步骤如下：获取样本：选择肿瘤细胞系，或者从临床获取癌症组织和癌旁正常组织；采用DNA提取试剂盒提取样本的DNA；将抽提的DNA进行全基因组测序；测序后将序列比对到靶序列上，计算出靶序列区域内的每个CpG位点的甲基化情况。计算靶序列中被测序到的CpG位点的平均甲基化值，作为此靶序列在该样本在上的平均甲基化值。
实施例2-TCGA数据库中的甲基化芯片数据验证SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.14靶序列
2.1、靶序列及数据库
SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.14靶序列如表1所示。使用TCGA数据库，在TCGA数据库中收集了20余种肿瘤类型的癌症组织及其癌旁正常组织的DNA甲基化芯片数据，这些肿瘤类型包括：膀胱癌(BLCA)、宫颈癌(CESC)、胆管癌(CHOL)、结肠癌(COADREAD)、食道癌(ESCA)、胶质母细胞瘤(GBM)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、肾透明细胞癌(KIRC)、乳头状肾细胞癌(KIRP)、肝癌(LIHC)、肺腺癌(LUNG)、胰腺癌(PAAD)、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PCPG)、前列腺癌(PRAD)、肉瘤(SARC)、黑色素瘤(SKCM)、胃腺癌(STAD)、甲状腺癌(THCA)、胸腺癌(THYM)、子宫内膜癌(UCEC)。
2.2、获取每个靶序列包含的探针数量，结果如表3所示；
表3每个靶序列包含的探针数量
| SEQ ID No | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 |
| 探针数量 | 1 | 0 | 1 | 2 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 2 | 0 |
2.3、按照实施例1的方法计算在这个靶序列内所有探针在所有的癌症样本、正常组织样本的平均甲基化值。结果如图1-图9所示。样本命名方式为：癌症英文名_C或N(数字)，其中C表示肿瘤组织、N表示正常组织、数字表示样本量。
图1为SEQ ID NO 1靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 1靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肺腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌17种癌症中的平均甲基化值均明显高于正常样本的平均甲基化值。
图2为SEQ ID NO 3靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 3靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌20种癌症中的平均甲基化值均高于正常样本的平均甲基化值。
图3为SEQ ID NO 4靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 4靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌19种癌症中的平均甲基化值均明显高于正常样本的平均甲基化值。在SEQ ID NO 4靶序列在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中的平均甲基化值与正常样本的平均甲基化值几乎无差别。
图4为SEQ ID NO 5靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 5靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌19种癌症中的平均甲基化值均明显高于正常样本的平均甲基化值。在SEQ ID NO 5靶序列在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中的平均甲基化值低于正常样本的平均甲基化值。
图5为SEQ ID NO 6靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 6靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌18种癌症中的平均甲基化值均明显高于正常样本的平均甲基化值。在SEQ ID NO6靶序列在胶质母细胞瘤、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤中的平均甲基化值低于正常样本的平均甲基化值。
图6为SEQ ID NO 8靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 8靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌19种癌症中的平均甲基化值均明显高于正常样本的平均甲基化值。在SEQ ID NO 8靶序列在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤
图7为SEQ ID NO 10靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 10靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌20种癌症中的平均甲基化值均高于正常样本的平均甲基化值。
图8为SEQ ID NO 12靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 12靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌20种癌症中的平均甲基化值均高于正常样本的平均甲基化值。
图9为SEQ ID NO 13靶序列在TCGA数据库中的平均甲基化值，可见，SEQ ID NO 13靶序列在膀胱癌、宫颈癌、胆管癌、结肠癌、食道癌、胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、肺腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌20种癌症中的平均甲基化值均高于正常样本的平均甲基化值。
可以看出，在上述绝大数肿瘤类型中，靶序列SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.3、SEQ IDNO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ IDNO.13在肿瘤样本的平均甲基化值要高于在正常组织中的平均甲基化值。
实施例3-SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.14靶序列在肿瘤细胞系的甲基化水平
收集11种肿瘤细胞系样本，分别为：胆管癌、乳腺癌、结直肠癌、胆囊癌、肾癌、白血病、肝癌、肺癌、胰腺癌、前列腺癌和胃癌。根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术获得14个靶序列在各个样本上的平均甲基化值。结果如图10。图中白色表示未检测到或测序质量不达标，颜色越深表示平均甲基化值越高。可见，SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ IDNO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.12和SEQ IDNO.13靶序列的甲基化情况在11种肿瘤细胞系中都可以被检测到，且在11种肿瘤细胞系中的平均甲基化值都很高。SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11和SEQID NO.14靶序列的甲基化情况仅在部分肿瘤细胞系中被检测到。
实施例4-SEQ ID NO.1靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织3例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.1靶序列在这26个肿瘤组织、26个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图11所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在6种肿瘤中，SEQ ID NO.1靶序列在肿瘤样本中的平均甲基化值均高于癌旁正常组织。根据样本在SEQ ID NO.1靶序列上的平均甲基化值，可以准确的将肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例5-SEQ ID NO.2靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织3例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.2靶序列在这25个肿瘤组织、26个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图12所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在6种肿瘤中，SEQ ID NO.2靶序列在肿瘤样本中的平均甲基化值均高于癌旁正常组织。根据样本在SEQ ID NO.2靶序列上的平均甲基化值，可以准确的将肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例6-SEQ ID NO.3靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织5例，癌旁正常组织4例)、头颈部癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织2例)和胰腺癌(癌症组织2例，癌旁正常组织2例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.3靶序列在这26个肿瘤组织、23个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图13所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在5种肿瘤中，SEQ ID NO.3靶序列在肿瘤样本中的平均甲基化值均高于癌旁正常组织；在食管癌中，大部分的肿瘤样本的平均甲基化值要高于癌旁正常组织的平均甲基化值,根据样本在SEQ ID NO.3靶序列上的平均甲基化值，可以准确的将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例7-SEQ ID NO.4靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织4例)、宫颈癌(癌症组织5例，癌旁正常组织2例)、食管癌(癌症组织5例，癌旁正常组织4例)、头颈部癌(癌症组织2例，癌旁正常组织4例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.4靶序列在这26个肿瘤组织、24个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图14所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、头颈部癌样本和食管癌样本中SEQ ID NO.4靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在食管癌样本、宫颈癌样本和肺癌样本中，SEQ ID NO.4靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO 4靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例8-SEQ ID NO.5靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织3例，癌旁正常组织4例)、食管癌(癌症组织4例，癌旁正常组织3例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织2例，癌旁正常组织2例)和胰腺癌(癌症组织3例，癌旁正常组织2例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.5靶序列在这21个肿瘤组织、21个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图15所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、肺癌样本中SEQ ID NO.4靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在食管癌、头颈部癌和肺癌样本中，SEQ ID NO.5靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.5靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例9-SEQ ID NO.6靶序列在临床检测中的应用
样本：5种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织2例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织3例，癌旁正常组织1例)和胰腺癌(癌症组织2例，癌旁正常组织1例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.6靶序列在这17个肿瘤组织、13个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图16所示。图中共包含A、B、C、D、E，5组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：食管癌样本及其对照，C：头颈部癌样本及其对照，D：肺癌样本及其对照，E：胰腺癌样本及其对照。可见，在5种肿瘤中，SEQ ID NO.6靶序列在肿瘤样本中的平均甲基化值均高于癌旁正常组织。根据样本在SEQ ID NO.6靶序列上的平均甲基化值，可以准确的将肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例10-SEQ ID NO.7靶序列在临床检测中的应用
样本：5种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织4例)、宫颈癌(癌症组织2例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织2例，癌旁正常组织2例)、肺癌(癌症组织3例，癌旁正常组织3例)和胰腺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.7靶序列在这16个肿瘤组织、15个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图17所示。图中共包含A、B、C、D、E，5组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：头颈部癌样本及其对照，D：肺癌样本及其对照，E：胰腺癌样本及其对照。可见，在5种肿瘤中，SEQ ID NO.7靶序列在肿瘤样本中的平均甲基化值均高于癌旁正常组织。根据样本在SEQ ID NO.7靶序列上的平均甲基化值，可以准确的将肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例11-SEQ ID NO.8靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.8靶序列在这26个肿瘤组织、30个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图18所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、肺癌、头颈部癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.8靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在食管癌样本中，SEQ ID NO.8靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.8靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例12-SEQ ID NO.9靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织5例，癌旁正常组织4例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织4例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织4例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.9靶序列在这28个肿瘤组织、27个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图19所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、肺癌、头颈部癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.9靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在食管癌样本中，SEQ ID NO.9靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.9靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例13-SEQ ID NO.10靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织4例，癌旁正常组织3例)、食管癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织3例)和胰腺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.10靶序列在这25个肿瘤组织、26个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图20所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、肺癌、头颈部癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.10靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在食管癌样本中，SEQ ID NO.10靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.10靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例14-SEQ ID NO.11靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织2例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织1例，癌旁正常组织3例)、头颈部癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织4例)和胰腺癌(癌症组织3例，癌旁正常组织3例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.11靶序列在这20个肿瘤组织、25个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图21所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、肺癌、食管癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.11靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在头颈部癌样本中，SEQ ID NO.11靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.11靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例15-SEQ ID NO.12靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织3例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织4例，癌旁正常组织3例)、头颈部癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.12靶序列在这27个肿瘤组织、28个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图22所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、头颈部癌、食管癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.12靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在肺癌样本中，SEQ ID NO.12靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.12靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例16-SEQ ID NO.13靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织1例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织2例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)和胰腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.13靶序列在这22个肿瘤组织、26个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图23所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、头颈部癌、食管癌和胰腺癌样本中SEQ ID NO.13靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在肺癌样本中，SEQ ID NO.13靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.13靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
实施例17-SEQ ID NO.14靶序列在临床检测中的应用
样本：6种肿瘤组织及其癌旁正常组织样本，分别为乳腺癌(癌症组织5例，癌旁正常组织5例)、宫颈癌(癌症组织3例，癌旁正常组织5例)、食管癌(癌症组织3例，癌旁正常组织1例)、头颈部癌(癌症组织4例，癌旁正常组织5例)、肺癌(癌症组织3例，癌旁正常组织3例)和胰腺癌(癌症组织2例，癌旁正常组织2例)。
根据实施例1的方法利用RRBS甲基化测序技术分别获得SEQ ID NO.14靶序列在这20个肿瘤组织、21个癌旁正常组织的平均甲基化值。结果如图24所示。图中共包含A、B、C、D、E、F，6组图片。每组图片含有2张图，其中左图表示肿瘤样本和癌症正常样本(对照)在靶序列上的平均甲基化值分布的箱线图，通过该图可以看出靶序列在肿瘤样本和正常样本中甲基化的差异；右图表示检测的ROC曲线图，通过该图可以看出差异结果的特异性。其中，A：乳腺癌样本及其对照，B：宫颈癌样本及其对照，C：食管癌样本及其对照，D：头颈部癌样本及其对照，E：肺癌样本及其对照，F：胰腺癌样本及其对照。可见，在乳腺癌样本、宫颈癌样本、头颈部癌、食管癌和肺癌样本中SEQ ID NO.14靶序列的平均甲基化值均高于癌旁正常组织的平均甲基化值。在胰腺癌样本中，SEQ ID NO.14靶序列的平均甲基化值大部分高于癌旁正常组织的平均甲基化值，且其平均甲基化值的均值高于癌旁正常组织的平均甲基化值的均值。根据样本在SEQ ID NO.14靶序列上的平均甲基化值，可以将绝大部分肿瘤样本和癌症正常组织区分开。
以上对本发明的具体实施例进行了详细描述，但其只作为范例，本发明并不限制于以上描述的具体实施例。对于本领域技术人员而言，任何对本发明进行的等同修改和替代也都在本发明的范畴之中。因此，在不脱离本发明的精神和范围下所作的均等变换和修改，都应涵盖在本发明的范围内。
Claims (10)
1.一种肿瘤标记物，其特征在于，所述肿瘤标记物位于人类基因组1号染色体、2号染色体、3号染色体、5号染色体、7号染色体、8号染色体、10号染色体、11号染色体、21号染色体中的至少一种上，且包括一个或多个可发生甲基化修饰的CpG位点；所述肿瘤标记物包括作为乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌和胰腺癌中的一种或几种的标记物。
2.根据权利要求1所述的肿瘤标记物，其特征在于，所述肿瘤标记物还包括作为膀胱癌、胆管癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌中的一种或几种的标记物。
3.根据权利要求1所述的肿瘤标记物，其特征在于，所述甲基化修饰包括5-醛甲基化修饰、5-羟甲基化修饰、5-甲基化修饰或5-羧甲基化修饰。
4.根据权利要求1所述的肿瘤标记物，其特征在于，所述肿瘤标记物包括以人类基因组hg19作为参考版本位于chr2:105459135-105459190、chr10:124902392-124902455、chr3:157812331-157812498、chr21:38378275-38378539、chr8:97170353-97170404、chr5:134880362-134880455、chr10:94835119-94835252、chr11:31826557-31826963、chr3:147114032-147114108、chr10:50819227-50819589、chr2:66809255-66809281、chr7:97361393-97361461、chr8:70984200-70984294、chr1:6515341-6515409区域的一种或多种。
5.根据权利要求4所述的肿瘤标记物，其特征在于，
所述chr2:105459135-105459190区域选自以下组：
a)SEQ ID NO.1所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.1所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.1至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr10:124902392-124902455区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.2所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.2所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.2至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr3:157812331-157812498区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.3所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.3所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.3至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr21:38378275-38378539区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.4所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.4所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.4至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr8:97170353-97170404区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.5所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.5所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.5至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr5:134880362-134880455区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.6所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.6所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.6至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr10:94835119-94835252区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.7所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.7所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.7至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr11:31826557-31826963区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.8所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.8所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.8至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；和/或，所述chr3:147114032-147114108区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.9所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.9所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.9至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr10:50819227-50819589区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.10所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.10所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.10至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr2:66809255-66809281区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.11所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.11所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.11至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr7:97361393-97361461区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.12所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.12所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.12至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr8:70984200-70984294区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.13所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.13所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.13至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列；
和/或，所述chr1:6515341-6515409区域选自以下组中的至少一种：
a)SEQ ID NO.14所示的碱基序列；
b)SEQ ID NO.14所示的碱基序列的互补序列；
c)与SEQ ID NO.14至少70％同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。
6.一种如权利要求1-5中任一项所述的肿瘤标记物的应用，其特征在于，所述应用选自以下应用中的一种：所述肿瘤标记物在制备肿瘤的筛选试剂、预后试剂、检测试剂或诊断试剂中的应用；所述肿瘤标记物在作为肿瘤的药物靶点中的应用；所述肿瘤标记物在制备抑制肿瘤增生的药物中应用；检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化水平的试剂在制备检测肿瘤的试剂中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述检测试剂为肿瘤标记物检测试剂盒，其包括特异性检测所述肿瘤标记物的引物或探针；和/或，所述抑制肿瘤增生的药物为所述肿瘤标记物的抑制剂。
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述引物或探针为特异性检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化的引物或探针；所述抑制剂为甲基化抑制剂。
9.根据如权利要求6～8中任一项所述的应用，其特征在于，所述应用包括以下步骤：
S1、获取待检测组织样本；
S2、抽提待检测组织样本DNA，获取样本的甲基化值；
S3、计算出所述肿瘤标记物序列区域内的每个CpG位点的甲基化情况或整个区域的平均甲基化情况。
10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，步骤S2所述的获取样本的甲基化值的方法包括：测序、探针、抗体、质谱。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310261500.XA CN116590413A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种肿瘤标记物及其应用 |
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310261500.XA CN116590413A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种肿瘤标记物及其应用 |
| CN202011608940.0A CN113025711B (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 肿瘤标记物及其应用 |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202011608940.0A Division CN113025711B (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 肿瘤标记物及其应用 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN116590413A true CN116590413A (zh) | 2023-08-15 |
Family
ID=76460519
Family Applications (14)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202310261751.8A Pending CN116240291A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262910.6A Pending CN116179713A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于7号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310261986.7A Pending CN116479125A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于8号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310261648.3A Pending CN116219021A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262695.XA Pending CN116426640A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其在检测肿瘤中的应用 |
| CN202310261500.XA Pending CN116590413A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310261880.7A Pending CN117004716A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于21号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262136.9A Pending CN116179712A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于5号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262988.8A Pending CN116219022A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于8号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262756.2A Pending CN116083589A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上与dna表观修饰相关的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262581.5A Pending CN116426639A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于11号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262266.2A Pending CN116377071A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上的肿瘤标记物及其在检测肿瘤中的应用 |
| CN202011608940.0A Active CN113025711B (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262837.2A Pending CN116103405A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于2号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
Family Applications Before (5)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202310261751.8A Pending CN116240291A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262910.6A Pending CN116179713A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于7号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310261986.7A Pending CN116479125A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于8号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310261648.3A Pending CN116219021A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262695.XA Pending CN116426640A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其在检测肿瘤中的应用 |
Family Applications After (8)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202310261880.7A Pending CN117004716A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于21号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262136.9A Pending CN116179712A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于5号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262988.8A Pending CN116219022A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于8号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262756.2A Pending CN116083589A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上与dna表观修饰相关的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262581.5A Pending CN116426639A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于11号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262266.2A Pending CN116377071A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于10号染色体上的肿瘤标记物及其在检测肿瘤中的应用 |
| CN202011608940.0A Active CN113025711B (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 肿瘤标记物及其应用 |
| CN202310262837.2A Pending CN116103405A (zh) | 2020-12-30 | 2020-12-30 | 一种位于2号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP4273269A1 (zh) |
| JP (1) | JP2024501576A (zh) |
| CN (14) | CN116240291A (zh) |
| WO (1) | WO2022142677A1 (zh) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN116240291A (zh) * | 2020-12-30 | 2023-06-09 | 上海奕谱生物科技有限公司 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN107190076B (zh) * | 2017-06-28 | 2019-12-27 | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 一种人肿瘤相关的甲基化位点及其筛选方法和用途 |
| CN109680060A (zh) * | 2017-10-17 | 2019-04-26 | 华东师范大学 | 甲基化标志物及其在肿瘤诊断、分类中的应用 |
| WO2020116573A1 (ja) * | 2018-12-05 | 2020-06-11 | 学校法人慶應義塾 | 子宮体癌の予後の判定方法 |
| CN109456968B (zh) * | 2018-12-29 | 2022-10-04 | 上海奕谱生物科技有限公司 | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物 |
| CN110257525B (zh) * | 2019-08-05 | 2022-10-11 | 上海奕谱生物科技有限公司 | 对肿瘤诊断具有显著性的标记物及其用途 |
| CN111455058A (zh) * | 2020-05-27 | 2020-07-28 | 深圳市因诺转化医学研究院 | 一种乳腺癌肿瘤相关的肿瘤标志物及应用、试剂盒 |
| CN116240291A (zh) * | 2020-12-30 | 2023-06-09 | 上海奕谱生物科技有限公司 | 一种位于3号染色体上的肿瘤标记物及其应用 |
-
2020
- 2020-12-30 CN CN202310261751.8A patent/CN116240291A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262910.6A patent/CN116179713A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310261986.7A patent/CN116479125A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310261648.3A patent/CN116219021A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262695.XA patent/CN116426640A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310261500.XA patent/CN116590413A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310261880.7A patent/CN117004716A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262136.9A patent/CN116179712A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262988.8A patent/CN116219022A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262756.2A patent/CN116083589A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262581.5A patent/CN116426639A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202310262266.2A patent/CN116377071A/zh active Pending
- 2020-12-30 CN CN202011608940.0A patent/CN113025711B/zh active Active
- 2020-12-30 CN CN202310262837.2A patent/CN116103405A/zh active Pending
-
2021
- 2021-10-29 WO PCT/CN2021/127464 patent/WO2022142677A1/zh active Application Filing
- 2021-10-29 EP EP21913421.0A patent/EP4273269A1/en active Pending
- 2021-10-29 JP JP2023540629A patent/JP2024501576A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN113025711A (zh) | 2021-06-25 |
| CN116240291A (zh) | 2023-06-09 |
| EP4273269A9 (en) | 2024-04-10 |
| EP4273269A1 (en) | 2023-11-08 |
| CN116179713A (zh) | 2023-05-30 |
| CN116479125A (zh) | 2023-07-25 |
| WO2022142677A1 (zh) | 2022-07-07 |
| JP2024501576A (ja) | 2024-01-12 |
| CN117004716A (zh) | 2023-11-07 |
| CN113025711B (zh) | 2023-04-07 |
| CN116426640A (zh) | 2023-07-14 |
| CN116179712A (zh) | 2023-05-30 |
| CN116219022A (zh) | 2023-06-06 |
| CN116083589A (zh) | 2023-05-09 |
| CN116103405A (zh) | 2023-05-12 |
| CN116219021A (zh) | 2023-06-06 |
| CN116426639A (zh) | 2023-07-14 |
| CN116377071A (zh) | 2023-07-04 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Beheshti et al. | Chromosomal localization of DNA amplifications in neuroblastoma tumors using cDNA microarray comparative genomic hybridization | |
| CN109554476B (zh) | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物stamp-ep3 | |
| EP2707506A2 (en) | Method of detecting cancer through generalized loss of stability of epigenetic domains, and compositions thereof | |
| WO2020135862A1 (zh) | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物stamp-ep5 | |
| EP3839070A1 (en) | Dna methylation-related marker for diagnosing tumor, and application thereof | |
| Li et al. | Microarray‐based analysis of whole‐genome DNA methylation profiling in early detection of breast cancer | |
| WO2020135864A1 (zh) | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物stamp-ep6 | |
| CN113025711B (zh) | 肿瘤标记物及其应用 | |
| WO2020221315A1 (zh) | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物stamp-ep8及其应用 | |
| WO2020221314A1 (zh) | 基于甲基化修饰的肿瘤标记物stamp-ep7及其应用 | |
| Luo et al. | Methylated biomarkers for breast cancer identified through public database analysis and plasma target capture sequencing | |
| CN111020034A (zh) | 新型的诊断肿瘤的标志物及其应用 | |
| Zitzelsberger et al. | Chromosomal aberrations in thyroid follicular-cell neoplasia: in the search of novel oncogenes and tumour suppressor genes | |
| CN116064809A (zh) | 用于乳腺癌诊断的甲基化生物标记物及其应用 | |
| Nikolaidis | DNA methylation-assisted diagnosis of lung cancer in bronchial washings |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination |