CN116403684A - 一种数字病理图像加载方法和装置 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及病理图像加载技术,公开了一种数字病理图像加载方法和装置,其包括对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。本发明设计的对数字病理图像的加载方法其实现了病理图像自动加载的功能,通过DFA进行加载图像的判断,对数字病理图像增量识别过程消耗服务器计算资源过少,且加载时间短。
Description
技术领域
本发明涉及病理图像加载技术,尤其涉及了一种数字病理图像加载方法和装置。
背景技术
在数字化病理诊断的工作流程中需要使用生物扫描仪扫描产生多层级病理图像文件,把病理图像通过光纤写入存储服务器指定目录,病理系统需要遍历存储服务器目录中的所病理图像文件,使用病理图像文件名与已加载的同目录下的病理图像文件名。
生物扫描仪生成的病理图像加载主要分2种方式:
被动方式,即病理服务端与生物扫描仪进行通信,从扫描仪接收扫描信号,然后加载病理图像,但市面上扫描仪种类繁多,功能标准不易,通信协议多私有化,通用性较低有较大的适配限制;
主动方式,即病理服务器主动通过监听扫描仪的产出内容进行,读取文件信息,然后加载并理图像,该方法使用生物扫描仪扫描产生多层级病理图像文件,把病理图像通过光纤写入存储服务器指定目录,
病理系统需要遍历存储服务器目录中的所病理图像文件,使用病理图像文件名与已加载的同目录下的病理图像文件名,在FOR循环中进行逐个比对,FOR循环的每一步都会对文件名的每个字符位置进行等与运算。
若未被加载,则读取病理图像的创建时间、文件名、图像大小、图像倍率信息加载到病理系统中。
如现有技术文件1,专利申请号,CN201910138363.4,专利名称为一种病理图片加载方法和装置;其公开了,应用于图片解析服务器中,所述图片解析服务器中存储切割病理图片,包括:接收客户端发送的病理图片获取请求;根据所述病理图片获取请求确定病理图片层级;根据所述病理图片层级在图片解析服务器中查找对应的目标切割病理图片;若查找到对应的目标切割病理图片,则将所述目标切割病理图片发送至所述客户端。通过图像解析服务器对病理图片进行预切割,当用户请求查看特定层级的病理图片时,直接将切割后的病理图片发送至客户端。
如现有技术文件2,专利申请号,CN201910100748 .1,专利名称为:一种病理图像加载方法和装置;其公开了采用预设缩放级别对所述图像解析服务器中的病理图像进行切割,并保存切割后的所述病理图像;接收客户端发送的病理图像查看请求;其中,所述病理图像查看请求包括:病理图像标识和第一缩放级别;根据所述病理图像标识查找与所述病理图像标识对应的病理图像;判断与所述第一缩放级别对应的所述病理图像是否满足预切割条件;若是,则获取与所述第一缩放级别对应的切割后的所述病理图像,并将切割后的所述病理图像发送至客户端。
对于现有技术中,其主要是加载至客户端,其加载方式不能很好的应用于病理系统中,而且其加载方式复杂,占用的资源多,消耗时间久。
发明内容
本发明针对现有技术中主要是将数字病理图像加载至客户端,其加载方式不能很好的应用于病理系统中,而且其加载方式复杂,占用的资源多,消耗时间久的问题,提供了一种数字病理图像加载方法和装置。
为了解决上述技术问题,本发明通过下述技术方案得以解决:
一种数字病理图像加载方法,包括病理服务端、中间存储端和输入端,其方法包括:
数字图像文件树形数据结构的构建,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;
病理图像文件的编码,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
作为优选,数字图像文件树形数据结构的构建,树形数据结构以数字图像文件命的第一个字符为树形数据结构的第一层,文件名的第二个字符为树形数据结构的第二层,依次,则文件名的第n个字符为树形数据结构的第n层;且每一层树形数据结构包含有数个子节点,每个子节点按照递增方式排序。
作为优选,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断包括:
遍历中间存储端数字病理图像文件的存储目录,并将数字病理图像文件名去除后缀,得到不带后缀的文件名;
将不带后缀的文件名构成N个元素的单链表数据结构;
依据单链表数据结构中的元素及数字图像文件树形数据结构T进行查找,并记录查找结果布尔值R;
依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息。
作为优选,依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息,当布尔值R为真时,则数字图像文件已经加载,否则数字图像文件未被加载。
作为优选,单链表数据结构中的元素对数字图像文件树形数据结构T查找的方法为二分查找法;二分查找法通过数字图像文件树形数据结构T中的中间值进行比对,当大于数字图像文件树形数据结构T中的中间值则向右查找,否则向左查找。
作为优选,病理图像文件的编码通过纯数字的方式对病理图像文件进行编码。
作为优选,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,传输方式通过光纤通信的方式传输。
作为优选,输入端输入数字病理图像文件,通过生物扫描仪扫描物理病理玻片产生数字病理图像文件。
为了解决上述技术问题,本发明还提供了一种数字病理图像加载装置,其通过所述的数字病理图像加载方式实现的装置,包括数字图像文件树形数据结构的构建模块、病理图像文件的编码模块、数字病理图像文件的存储模块和数字病理图像文件加载的判断模块;
数字图像文件树形数据结构的构建模块,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;
病理图像文件的编码模块,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储模块,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断模块,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
本发明由于采用了以上技术方案,具有显著的技术效果:
本发明设计的对数字病理图像的加载方法其实现了病理图像自动加载的功能。
本发明通过DFA进行加载图像的判断,对于数字病理图像增量识别过程消耗服务器计算资源过少,且图像加载时间短。
附图说明
图1是本发明的流程图。
图2是本发明的 DFA算法流程图。
图3是本发明的树结构示意图。
图4是本发明的实施例3流程图。
具体实施方式
下面结合附图与实施例对本发明作进一步详细描述。
实施例1
一种数字病理图像加载方法,包括病理服务端、中间存储端和输入端,图1中,其方法包括:
数字图像文件树形数据结构的构建,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T,如图3所示的树结构,依据文件名长度从上至下构建树的层级,依据每一层出现的字符集合从左到右构建递增的子节点;
病理图像文件的编码,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
数字图像文件树形数据结构的构建,树形数据结构以数字图像文件命的第一个字符为树形数据结构的第一层,文件名的第二个字符为树形数据结构的第二层,依次,则文件名的第n个字符为树形数据结构的第n层;且每一层树形数据结构包含有数个子节点,每个子节点按照递增方式排序。
在图2中,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断包括:
遍历中间存储端数字病理图像文件的存储目录,并将数字病理图像文件名去除后缀,得到不带后缀的文件名;
将不带后缀的文件名构成N个元素的单链表数据结构;
依据单链表数据结构中的元素及数字图像文件树形数据结构T进行查找,并记录查找结果布尔值R;
依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息。
依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息,当布尔值R为真时,则数字图像文件已经加载,否则数字图像文件未被加载。
对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,传输方式通过光纤通信的方式传输。
输入端输入数字病理图像文件,通过生物扫描仪扫描物理病理玻片产生数字病理图像文件。
实施例2
在实施例1基础上,图4中,通过二分查找法进行单链表数据结构中的元素对数字图像文件树形数据结构T查找;二分查找法通过数字图像文件树形数据结构T中子节点的中间值进行比对,当大于数字图像文件树形数据结构T中子节点的中间值则向右查找,否则向左查找。
使用生物扫描仪扫描物理病理玻片产生数字病理图像文件,并以13位纯数字的唯一编码号加文件后缀命名病理图像文件如“2305181625001.svs”。
以纯数字成分命名,可以降低树的子节点树,本方案树T的每一层子节点,不会超过10;控制文件名长度为13,可以提供10的13次幂的业务容量,满足了本业务场景,又保证树的最大层级为13+1;树T的子节点数和层数的简化对DFA查找的效率有利。
将病理图像“2305181625001.svs”去除文件后缀,得到输入字符”2305181625001”;
将“2305181625001”构造为”2”->”3”->”0”->”5”->”1”->”8”->”1”->”6”->”2”->”5”->”0”->”0”->”1”的长度等于13单链表结构数据,命名为N。
通过单向链表方式构建的数据结构,依次向下查找节点的过程因为没有对key的hash运算过程,所以效率高于传统以hash表建构的结构。
使用N的第一个元素”0”在T的子节点上进行查找,记查找结果为布尔值R1,R1为真则命名该子节点为T1,继续使用N的第2个元素在T1的的子节点查找,记查找结果为布尔值R2,R2为真则命名该子节点为T2,继续...直到N的所有元素全部查找完成,Rn为真则该病理图像已被加载;任意一次Rn为假查找结束,该病理图像未被加载;
子节点的查找结合二分法进行查找,因为T的每一层子节点已按递增方式从左到右排序,查找过程取中间值进行比对,若大于该值则向右查找,否则向左查找。因为二分查找相比线性查找省去了大量的无关元素比对,所以大大降低了查找时间。
实施例3
在上述实施例基础上,本实施例的病理图像文件的编码通过纯数字的方式对病理图像文件进行编码。
实施例4
在上述实施例基础上,本实施例输入端输入数字病理图像文件,通过荧光扫描仪扫描物理病理玻片产生数字病理图像文件。
实施例5
在上述实施例基础上,本实施例为一种数字病理图像加载装置,其通过所述的数字病理图像加载方式实现的装置,包括数字图像文件树形数据结构的构建模块、病理图像文件的编码模块、数字病理图像文件的存储模块和数字病理图像文件加载的判断模块;
数字图像文件树形数据结构的构建模块,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;
病理图像文件的编码模块,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储模块,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断模块,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
Claims (9)
1.一种数字病理图像加载方法,包括病理服务端、中间存储端和输入端,其方法包括:
数字图像文件树形数据结构的构建,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;
病理图像文件的编码,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
2.根据权利要求1所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,数字图像文件树形数据结构的构建,树形数据结构以数字图像文件命的第一个字符为树形数据结构的第一层,文件名的第二个字符为树形数据结构的第二层,依次,则文件名的第n个字符为树形数据结构的第n层;且每一层树形数据结构包含有数个子节点,每个子节点按照递增方式排序。
3.根据权利要求1所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断包括:
遍历中间存储端数字病理图像文件的存储目录,并将数字病理图像文件名去除后缀,得到不带后缀的文件名;
将不带后缀的文件名构成N个元素的单链表数据结构;
依据单链表数据结构中的元素及数字图像文件树形数据结构T进行查找,并记录查找结果布尔值R;
依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息。
4.根据权利要求3所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,依据布尔值R确定数字图像文件的加载信息,当布尔值R为真时,则数字图像文件已经加载,否则数字图像文件未被加载。
5.根据权利要求3所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,单链表数据结构中的元素对数字图像文件树形数据结构T查找的方法为二分查找法;二分查找法通过数字图像文件树形数据结构T中的中间值进行比对,当大于数字图像文件树形数据结构T中的中间值则向右查找,否则向左查找。
6.根据权利要求1所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,病理图像文件的编码通过纯数字的方式对病理图像文件进行编码。
7.根据权利要求1所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,传输方式通过光纤通信的方式传输。
8.根据权利要求1所述的一种数字病理图像加载方法,其特征在于,输入端输入数字病理图像文件,通过生物扫描仪扫描物理病理玻片产生数字病理图像文件。
9.一种数字病理图像加载装置,其特征在于,通过权利要求1-8任一所述的数字病理图像加载方法实现的装置,包括数字图像文件树形数据结构的构建模块、病理图像文件的编码模块、数字病理图像文件的存储模块和数字病理图像文件加载的判断模块;
数字图像文件树形数据结构的构建模块,对病理服务端中同一个目录下的文件构建数字图像文件树形数据结构T;
病理图像文件的编码模块,通过输入端输入数字病理图像文件,并对病理图像文件进行编码;
数字病理图像文件的存储模块,对于编码后的数字病理图像文件传送至中间存储端,并确定中间存储端数字病理图像文件的存储目录;
数字病理图像文件加载的判断模块,通过DFA算法进行数字病理图像文件加载的判断,当加载了该数字病理图像文件则结束,否则病理服务端加载病理图像信息并返回至数字病理图像文件树形结构的更新。
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