CN116313161A - 实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 - Google Patents
实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 Download PDFInfo
- Publication number
- CN116313161A CN116313161A CN202310387350.7A CN202310387350A CN116313161A CN 116313161 A CN116313161 A CN 116313161A CN 202310387350 A CN202310387350 A CN 202310387350A CN 116313161 A CN116313161 A CN 116313161A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- slice
- scanner
- file
- digital
- engine
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 230000007170 pathology Effects 0.000 title claims abstract description 23
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 37
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 26
- 230000008569 process Effects 0.000 claims abstract description 25
- 238000004088 simulation Methods 0.000 claims abstract description 11
- 230000002457 bidirectional effect Effects 0.000 claims abstract description 10
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims abstract description 5
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 claims description 29
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 13
- 244000035744 Hura crepitans Species 0.000 claims description 12
- 239000011521 glass Substances 0.000 claims description 11
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 7
- 230000011218 segmentation Effects 0.000 claims description 5
- 238000007781 pre-processing Methods 0.000 claims description 4
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 claims description 3
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 claims description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 claims description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000003139 buffering effect Effects 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 231100000915 pathological change Toxicity 0.000 description 1
- 230000036285 pathological change Effects 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H80/00—ICT specially adapted for facilitating communication between medical practitioners or patients, e.g. for collaborative diagnosis, therapy or health monitoring
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H30/00—ICT specially adapted for the handling or processing of medical images
- G16H30/20—ICT specially adapted for the handling or processing of medical images for handling medical images, e.g. DICOM, HL7 or PACS
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Radiology & Medical Imaging (AREA)
- Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)
- Processing Or Creating Images (AREA)
Abstract
本发明涉及一种实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统。包括：数字扫描仪互操作引擎：与已支持数字扫描仪的互操作并且能够二次处理和重建全息成像；模拟POSIX文件系统层：向不支持互操作的其他数字扫描仪提供写入接口；切片解析服务引擎：对模拟POSIX文件系统层的接口写入数据进行第三方便携式切片文件解析；对象化容器：对经过切片解析服务引擎和数字扫描仪互操作引擎统一格式化和编码后的文件进行保存；阅片服务的引擎：实现统一阅片功能；https虚拟双向服务单元：根据终端用户请求实现多点同时进行阅片或互操作功能。本发明能实现多点同时进行阅片，并且不受网络环境限制，进而实现各地专家会诊的目的。
Description
技术领域
本发明涉及一种实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统。
背景技术
在现代医学中病理学已经变得越来越重要，病理学的一种很重要的检查手段是通过观察人体的切片组织来判断人体相应组织器官是否有病变异常。比较传统方式的切片观察是肉眼通过显微镜观察玻璃载玻片上的切片组织来实现的，这种观察方式比较耗费人力，并且观察结果并不是非常精确。
随着计算机技术不断地发展，开始出现一种数字病理切片扫描仪，可以将玻璃载玻片转换为数字切片，以此来替代传统的切片观察的方法。数字病理切片扫描仪是一种能够利用显微镜对切片组织进行逐幅扫描并形成该切片组织表面细胞图像的一种仪器。
数字病理切片扫描仪扫描得到的病理切片图像并非一般的图像，而是可以提供给使用者进行任意放大或缩小操作的图像，在使用者放大图像中的局部区域时能够观察到该区域内细胞组织的放大图，从而使得医师能够更清楚准确地通过观察切片组织判断人体相关的组织器官是否出现病变异常。
生成出来的这个高分辨率的图片，比较难以保存和加载，因此需要对其进行重建和二次处理，以此实现病理切片全景成像。大多数的数字病理切片扫描仪厂商，在交付扫描仪时会提供一个软件和开发包，让病理医生可以方便地通过连接扫描仪的电脑处理、保存和查看扫描出来的数字病理切片。处理好之后，数字病理切片会保存为一个便携式的切片文件。
但由于目前并不存在也很难定义一个行业标准，所以各家扫描仪处理好的文件只能使用厂商提供的查看软件或者开发包来浏览，而且这种阅片方式很难实现多地同时阅片进行专家会诊。
发明内容
本发明针对上述问题，提供一种实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，不仅可以远程控制和处理一部分我们已经支持互操作的数字病理切片扫描仪，而且可以透明地将暂不支持互操作的数字病理切片扫描仪保存下来的便携式切片文件进行转换，实现多地同时阅片及专家会诊。
为此，本发明采取如下技术方案：实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于包括：
数字扫描仪互操作引擎：与已支持数字扫描仪的互操作并且能够二次处理和重建全息成像；
模拟POSIX文件系统层：向不支持互操作的其他数字扫描仪提供写入接口；
切片解析服务引擎：对模拟POSIX文件系统层的接口写入数据进行第三方便携式切片文件解析；
对象化容器：对经过切片解析服务引擎和数字扫描仪互操作引擎统一格式化和编码后的文件进行保存；
阅片服务的引擎：实现统一阅片功能；
https虚拟双向服务单元：根据终端用户请求实现多点同时进行阅片或互操作功能。
作为优选，所述的数字扫描仪互操作引擎在装置内部完成一个对控制信息和图像数据的缓冲预处理，数字扫描仪互操作引擎通过光线和运动控制线以及相机数据线连接数字扫描仪，同时对外提供配置和控制扫描接口。
作为优选，所述的缓冲预处理包括以太网协议编解码，以太网协议编解码负责接收从https虚拟双向服务单元处获取操作人员的操作请求，并对封装操作的协议数据进行解码，解码后获得运动或者光源控制指令，加入控制指令队列；此时指令队列中的指令首先会被预取出，然后加入指令模拟沙箱中，通过指令模拟沙箱实现指令预判。
作为优选，所述的指令预判是沙箱首先判断当前状态是否可以执行这个指令，如果不能执行就马上返回指令错误给以太网编解码器让它向操作人员反馈，反之就根据当前连接的数字扫描仪特性改变当前沙箱的状态，并将指令转码插入待发送运动或者光源控制的指令队列，之后，由读写运动控制串行线和光源控制串行线的例程按序向数字扫描仪发送指令，并通过控制线接收数字扫描仪的返回，接收到的返回信息解码后放入响应缓冲区，等待以太网协议编解码编码之后通过https虚拟双向服务单元返回给操作人员。
作为优选，所述的数字扫描仪互操作引擎包括相机图像处理进程单元，相机图像处理进程单元持续接收数字扫描仪逐幅扫描出来的每一幅光栅图像，在内存中分配一个虚拟图层，将每一幅图像根据扫描玻璃载玻片上的坐标绘制在虚拟图层上，绘制的同时进行光栅图像的矢量化；扫描完成以后，虚拟图层的整个全尺寸高分辨率的光栅图像将被切分为若干固定大小的对象，并生成一个uuid关联这些对象和玻璃载玻片对应的病理信息，一起存入对象化容器中。
作为优选，所述的模拟POSIX文件系统层是由一个切片解析服务进程根据POSIX规范向上层模拟的一套文件系统接口，该接口通过模拟一套读写接口达到将切片文件解析对象化处理。
作为优选，所述的切片解析服务引擎包括切片分段解析模块和信息图层校验模块，所述的切片分段解析模块采用流式的解析方法，把每一段数据根据自动发现其属性的方式写入病理信息内存数据库或者用于绘制虚拟图层；
每一段写入之后，由信息图层校验模块对到目前为止写入的病理信息内存数据库和已经绘制出的图层部分进行校验，看写入部分信息和图像是否匹配，如果校验失败就返回上层写入失败，否则返回给上层已经接收的数据字节数；如此，让上层完全无感知地就进行一个拷贝切片文件的行为之后，完成切片文件解析的过程。
作为优选，所述模拟的POSIX文件系统层的写接口是三个交互式接口组成的，它们分别是打开、写入和关闭，打开文件接口入参是路径，返回一个文件句柄，写入文件接口入参是文件句柄、写入内容和大小以及偏移量，关闭文件接口入参是文件句柄。
作为优选，对于打开文件接口，是接收上层给的一个伪路径，将这个路径作为变量来生成一个uuid并作为最后进入对象化容器的唯一关联标识，然后返回给上层一个伪文件句柄，用于表示这个唯一标识；对于写入接口，入参的文件句柄就是刚才我们打开接口返回给上层的伪文件句柄，当第一次写入时初始化一个病理信息内存数据库和一个虚拟图层。
作为优选，所述的切片解析服务引擎在解析病理信息内存数据库的同时绘制完整全尺寸高分辨率的光栅图像之后，通过伪路径生成的uuid进行关联，并将它们统一进行切分处理后保存到对象化容器中。
本发明的有益效果在：解决了人员必须坐在扫描仪旁边操作台式电脑系统中进行操作且受到数字扫描仪控制软件的限制的问题。使数字扫描仪的操作人员可以在网络可达的任意位置对数字扫描仪进行操作。同时内置的互操作引擎还接收来自数字扫描仪对焦后逐幅扫描的图像，对一幅一幅的图像和信息进行处理，并且在处理过程中可以实时观察扫描结果。并提供https虚拟双向服务，实现多点同时进行阅片，并且不受网络环境限制，进而实现各地专家会诊的目的。
附图说明
图1为本发明的系统结构示意图。
图2为本发明中对控制信息和图像数据的缓冲预处理的逻辑图。
图3为本发明通过模拟一套读写接口达到将切片文件解析对象化处理的示意图。
具体实施方式
下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。
如图1所示，本发明的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统包括以下组件：
数字扫描仪互操作引擎：与已支持数字扫描仪的互操作并且能够二次处理和重建全息成像；
模拟POSIX文件系统层：向不支持互操作的其他数字扫描仪提供写入接口；
切片解析服务引擎：对POSIX接口写入数据进行第三方便携式切片文件解析的服务引擎；
对象化容器：对经过切片解析服务引擎和数字扫描仪互操作引擎统一格式化和编码后的文件进行保存；
阅片服务的引擎：实现统一阅片功能；
https虚拟双向服务单元：根据终端用户请求实现多点同时进行阅片或互操作功能。
关于数字扫描仪互操作引擎的实现
装置采用内置的数字扫描仪互操作引擎替代了传统数字扫描仪厂商那种用单独本地台式电脑安装控制软件对数字扫描仪进行扫描的模式，是针对我们已经支持互操作的数字扫描仪进行控制、扫描、无缝拼接高分辨率的全切片图像(WSI,也称为虚拟切片)和将WSI统一格式化和编码。
装置内部的数字扫描仪互操作引擎通过光线和运动控制线以及相机数据线连接数字扫描仪并操作，同时对外提供配置和控制扫描接口，这些对外接口是通过https虚拟双向服务单元池里面的具有服务器属性的服务单元对操作人员开放控制界面，这样打破了传统操作人员必须坐在扫描仪旁边操作台式电脑系统中数字扫描仪控制软件的限制，使得数字扫描仪的操作人员可以在网络可达的任意位置对数字扫描仪进行操作。同时内置的互操作引擎还接收来自数字扫描仪对焦后逐幅扫描的图像，对一幅一幅的像进行处理，并且在处理过程中可以实时观察扫描结果。
数字扫描仪需要通过光线和运动控制线进行控制，以及相机数据线进行图像数据传输，并且宏图和全切片图也分为不同的相机数据线，因此对扫描仪读写完全不同于我们常用的网线走的以太网协议模式，无法直接通过网络实现上述的功能，因此引擎在装置内部需要完成一个对控制信息和图像数据的缓冲预处理。
处理逻辑如下图2所示，以太网协议编解码负责接收从https虚拟双向服务单元处获取操作人员的操作请求，并对封装操作的协议数据进行解码，解码后获得运动或者光源控制指令，加入控制指令队列。对于以太网协议来说，指令链路只有一条就是以太网，但是对于数字扫描仪而言指令线路是分开的，因此需要对指令在执行前进行预判。此时指令队列中的指令首先会被预取出，然后加入指令模拟沙箱中。指令模拟沙箱是为了指令预判，进而防止指令出现乱序或者错误操作数字扫描仪，而在内存中开辟一块模拟当前控制线路连接的数字扫描仪内部状态的虚拟空间。当沙箱接收到一个预取指令，首先判断当前状态是否可以执行这个指令(因为数字扫描仪的某些状态下，有些指令是不可以被执行的，但用户web界面上选择执行时可能并不知道)，如果不能执行就马上返回指令错误给以太网编解码器让它向操作人员反馈，反之就根据当前连接的数字扫描仪特性改变当前沙箱的状态，并将指令转码插入待发送运动或者光源控制的指令队列。
之后，由读写运动控制串行线和光源控制串行线的例程按序向数字扫描仪发送指令，并通过控制线接收数字扫描仪的返回，接收到的返回信息解码后放入响应缓冲区，等待以太网协议编解码编码之后通过https虚拟双向服务单元返回给操作人员。
与此同时，相机图像处理进程持续接收数字扫描仪逐幅扫描出来的每一幅光栅图像，在内存中分配一个虚拟图层，将每一幅图像根据扫描玻璃载玻片上的坐标绘制在虚拟图层上，绘制的同时进行光栅图像的矢量化。在扫描过程中当客户端需要请求正在扫描的切片时由绘制矢量化的图层来进行返回，得益于矢量图的特性无论是查看整体进程还是局部放大查看都非常方便。当扫描完成以后，虚拟图层的整个全尺寸高分辨率的光栅图像将被切分为若干固定大小的对象，并生成一个uuid关联这些对象和玻璃载玻片对应的病理信息，一起存入对象化容器中。
关于切片解析服务模拟为POSIX文件系统层的实现
切片解析服务模拟为POSIX文件系统层是用于将一些第三方我们不支持互操作的数字扫描仪的切片数据，统一格式编码并保存到我们的对象化容器中，以实现切片文件统一保存和统一阅片。之所以称之为模拟POSIX文件系统层，是因为这个文件系统不存在，甚至根本就不是一个文件系统，而是由一个切片解析服务进程根据POSIX规范向上层模拟的一套文件系统接口。
传统的文件系统向上提供一套文件系统接口逻辑是将上层的读写操作作用于硬盘或者外围硬件，并且根据文件系统的要求组织目录结构等等。但这里提供的接口，并不作为读写持久化设备的接口，而是通过模拟一套读写接口达到将切片文件解析对象化处理，并且这一切对于上层来说是无感知的一个拷贝过程。
如图3所示，模拟的POSIX文件系统层下方是一个切片分段解析模块，因此对应于POSIX文件系统层的写接口并不是将切片文件落盘，而是一个根据文件系统写接口特性来进行切片文件解析的服务。
文件系统的写接口是三个交互式接口组成的，它们分别是打开、写入和关闭。打开文件接口入参是路径，返回一个文件句柄。写入文件接口入参是文件句柄、写入内容和大小以及偏移量。关闭文件接口入参是文件句柄。对于打开接口，我们接收上层给的一个伪路径，将这个路径作为变量来生成一个uuid并作为最后进入对象化容器的唯一关联标识，然后返回给上层一个伪文件句柄，用于表示这个唯一标识。对于写入接口，入参的文件句柄就是刚才我们打开接口返回给上层的伪文件句柄，当第一次写入时需要初始化一个病理信息内存数据库和一个虚拟图层。由于文件系统接口写入切片文件的时候是分段写入的，因此分段解析模块并不是分析一个完整的切片文件，而是采用流式的解析方法，把每一段数据根据自动发现其属性的方式(判断文本还是像素点)写入病理信息内存数据库或者用于绘制虚拟图层。每一段写入之后，由信息图层校验模块对到目前为止写入的病理信息内存数据库和已经绘制出的图层部分进行校验，看写入部分信息和图像是否匹配，如果校验失败就返回上层写入失败，否则返回给上层已经接收的数据字节数。
如前所述，我们让上层完全无感知地就进行一个拷贝切片文件的行为之后，完成了一个切片文件解析的过程。解析为病理信息内存数据库和同时绘制完整个全尺寸高分辨率的光栅图像之后，跟上一章节的最后一步操作一样，通过伪路径生成的uuid进行关联，并将它们统一进行切分处理后保存到对象化容器中。这样，我们就把无论是否由我们已经支持直接控制连接的数字扫描仪还是第三方的数字扫描仪得到的全尺寸高分辨率的光栅图像，并联合病理信息库统一格式编码保存在了对象化容器中。
阅片服务实现
阅片服务实际上是一个模拟的http服务，将之前我们统一格式化编码并对象化保存之后的病例信息和图像数据进行浏览，并支持点、长方形或者多边形的图像标记和局部缩放。阅片服务例程启动后与https虚拟双向服务单元池里面的具有客户端属性的服务单元相连，https虚拟双向服务单元池建立一个url和这个客户端属性的服务单元的映射关系，当操作人员通过浏览器https请求阅片操作时(无论浏览器是否是长链接，也无论是否通过同一个浏览器发送的请求)，https虚拟双向服务单元池只通过url把浏览器https请求发送给对应的客户端属性的服务单元，这样就保证了阅片服务例程对对象化容器中保存的某一个切片数据一次加载多次浏览。
阅片服务实现了HTTP的GET和PUT两种方法，其中GET方法通过url传递参数的方法指定对象和位置信息等来获取病理信息数据、图像数据和保存的标记数据，而PUT方法通过上传json数据的方式把标记数据送给阅片服务例程。当阅片服务例程接收到第一个GET请求时，从对象容器里面把与病理信息和图像元数据相关的对象全部加载到一个内存数据库中，同时根据这些信息把对象化容器中的切分过的图像数据异步读取出，并在内存中建立虚拟图层进行光栅图像矢量化绘制。然后根据GET请求的位置参数返回对应的病理信息和图像数据，也可以对矢量图进行局部缩放。PUT方法也是通过同一个url(通过同一个客户端属性的服务单元来对应到同一个阅片服务例程)，将标记数据上传以达到在虚拟图层上进行标记的目的，并且阅片服务例程通过加载切片数据的uuid关联到用于标记的json数据，把这些json数据也保存到对象化容器中，后续阅片时一起加载，这样多次阅片都可以看到曾经的标记。
本发明的多种数字病理扫描仪切片的多点统一阅片装置，不仅可以远程控制和处理一部分已经支持互操作的数字病理切片扫描仪，而且可以透明地将暂不支持互操作的数字病理切片扫描仪保存下来的便携式切片文件进行转换。将它们统一装入并发对象容器，并提供https虚拟双向服务，实现多点同时进行阅片，并且不受网络环境限制，进而实现各地专家会诊的目的。
应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。此外应理解，在阅读了本发明讲授的内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
Claims (10)
1.实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于包括：
数字扫描仪互操作引擎：与已支持数字扫描仪的互操作并且能够二次处理和重建全息成像；
模拟POSIX文件系统层：向不支持互操作的其他数字扫描仪提供写入接口；
切片解析服务引擎：对模拟POSIX文件系统层的接口写入数据进行第三方便携式切片文件解析；
对象化容器：对经过切片解析服务引擎和数字扫描仪互操作引擎统一格式化和编码后的文件进行保存；
阅片服务的引擎：实现统一阅片功能；
https虚拟双向服务单元：根据终端用户请求实现多点同时进行阅片或互操作功能。
2.根据权利要求1所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的数字扫描仪互操作引擎
在装置内部完成一个对控制信息和图像数据的缓冲预处理，数字扫描仪互操作引擎通过光线和运动控制线以及相机数据线连接数字扫描仪，同时对外提供配置和控制扫描接口。
3.根据权利要求2所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的缓冲预处理包括以太网协议编解码，以太网协议编解码负责接收从https虚拟双向服务单元处获取操作人员的操作请求，并对封装操作的协议数据进行解码，解码后获得运动或者光源控制指令，加入控制指令队列；此时指令队列中的指令首先会被预取出，然后加入指令模拟沙箱中，通过指令模拟沙箱实现指令预判。
4.根据权利要求3所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的指令预判是沙箱首先判断当前状态是否可以执行这个指令，如果不能执行就马上返回指令错误给以太网编解码器让它向操作人员反馈，反之就根据当前连接的数字扫描仪特性改变当前沙箱的状态，并将指令转码插入待发送运动或者光源控制的指令队列，之后，由读写运动控制串行线和光源控制串行线的例程按序向数字扫描仪发送指令，并通过控制线接收数字扫描仪的返回，接收到的返回信息解码后放入响应缓冲区，等待以太网协议编解码编码之后通过https虚拟双向服务单元返回给操作人员。
5.根据权利要求4所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的数字扫描仪互操作引擎包括相机图像处理进程单元，相机图像处理进程单元持续接收数字扫描仪逐幅扫描出来的每一幅光栅图像，在内存中分配一个虚拟图层，将每一幅图像根据扫描玻璃载玻片上的坐标绘制在虚拟图层上，绘制的同时进行光栅图像的矢量化；
扫描完成以后，虚拟图层的整个全尺寸高分辨率的光栅图像将被切分为若干固定大小的对象，并生成一个uuid关联这些对象和玻璃载玻片对应的病理信息，一起存入对象化容器中。
6.根据权利要求1-5任一所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的模拟POSIX文件系统层是由一个切片解析服务进程根据POSIX规范向上层模拟的一套文件系统接口，该接口通过模拟一套读写接口达到将切片文件解析对象化处理。
7.根据权利要求6所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的切片解析服务引擎包括切片分段解析模块和信息图层校验模块，所述的切片分段解析模块采用流式的解析方法，把每一段数据根据自动发现其属性的方式写入病理信息内存数据库或者用于绘制虚拟图层；
每一段写入之后，由信息图层校验模块对到目前为止写入的病理信息内存数据库和已经绘制出的图层部分进行校验，看写入部分信息和图像是否匹配，如果校验失败就返回上层写入失败，否则返回给上层已经接收的数据字节数；如此，让上层完全无感知地就进行一个拷贝切片文件的行为之后，完成切片文件解析的过程。
8.根据权利要求6所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述模拟的POSIX文件系统层的写接口是三个交互式接口组成的，它们分别是打开、写入和关闭，打开文件接口入参是路径，返回一个文件句柄，写入文件接口入参是文件句柄、写入内容和大小以及偏移量，关闭文件接口入参是文件句柄。
9.根据权利要求8所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于对于打开文件接口，是接收上层给的一个伪路径，将这个路径作为变量来生成一个uuid并作为最后进入对象化容器的唯一关联标识，然后返回给上层一个伪文件句柄，用于表示这个唯一标识；对于写入接口，入参的文件句柄就是刚才我们打开接口返回给上层的伪文件句柄，当第一次写入时初始化一个病理信息内存数据库和一个虚拟图层。
10.根据权利要求7所述的实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统，其特征在于所述的切片解析服务引擎在解析病理信息内存数据库的同时绘制完整全尺寸高分辨率的光栅图像之后，通过伪路径生成的uuid进行关联，并将它们统一进行切分处理后保存到对象化容器中。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310387350.7A CN116313161B (zh) | 2023-04-12 | 2023-04-12 | 实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202310387350.7A CN116313161B (zh) | 2023-04-12 | 2023-04-12 | 实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN116313161A true CN116313161A (zh) | 2023-06-23 |
| CN116313161B CN116313161B (zh) | 2024-06-11 |
Family
ID=86781524
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202310387350.7A Active CN116313161B (zh) | 2023-04-12 | 2023-04-12 | 实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN116313161B (zh) |
Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20030181804A1 (en) * | 2002-03-20 | 2003-09-25 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Distributed diagnostic imaging systems |
| CN102035834A (zh) * | 2010-12-11 | 2011-04-27 | 常州达奇医疗科技有限公司 | 对显微镜进行网络遥操作的远程阅片系统 |
| CN102253922A (zh) * | 2010-05-18 | 2011-11-23 | 北京普利生仪器有限公司 | 远程分析病理切片的方法 |
| CN102368283A (zh) * | 2011-02-21 | 2012-03-07 | 麦克奥迪实业集团有限公司 | 一种基于数字切片的数字病理远程诊断系统及其方法 |
| CN106446568A (zh) * | 2016-09-29 | 2017-02-22 | 北京和缓医疗科技有限公司 | 一种实现远程病理会诊的方法及装置 |
-
2023
- 2023-04-12 CN CN202310387350.7A patent/CN116313161B/zh active Active
Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20030181804A1 (en) * | 2002-03-20 | 2003-09-25 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Distributed diagnostic imaging systems |
| CN102253922A (zh) * | 2010-05-18 | 2011-11-23 | 北京普利生仪器有限公司 | 远程分析病理切片的方法 |
| CN102035834A (zh) * | 2010-12-11 | 2011-04-27 | 常州达奇医疗科技有限公司 | 对显微镜进行网络遥操作的远程阅片系统 |
| CN102368283A (zh) * | 2011-02-21 | 2012-03-07 | 麦克奥迪实业集团有限公司 | 一种基于数字切片的数字病理远程诊断系统及其方法 |
| CN106446568A (zh) * | 2016-09-29 | 2017-02-22 | 北京和缓医疗科技有限公司 | 一种实现远程病理会诊的方法及装置 |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| 方坤丁 等: "《Serverless从入门到进阶：架构、原理与实践》", 机械工业出版社, pages: 48 - 53 * |
| 胡东升;吴天顺;毕研峰;王彬;许麦珍;: "病理远程会诊系统的结构与应用", 医疗卫生装备, no. 01, 15 January 2013 (2013-01-15), pages 40 - 41 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN116313161B (zh) | 2024-06-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7489643B2 (ja) | ユーザ向けの医療撮像及び情報パッケージングのシステム、ならびに圧縮及び配信のシステム | |
| Jeong et al. | Ssecrett and neurotrace: interactive visualization and analysis tools for large-scale neuroscience data sets | |
| JP5584193B2 (ja) | バーチャルスライドを閲覧するためのシステムおよび方法 | |
| CN103838813A (zh) | 零空间占用医学图像查看的系统和方法 | |
| US20090290768A1 (en) | Remote interpretation of medical images | |
| US20130305138A1 (en) | Systems and methods for acquiring and transmitting high-resolution pathology images | |
| CN110268476A (zh) | 用于管理大医学图像数据的系统和方法 | |
| US9667696B2 (en) | Low latency web-based DICOM viewer system | |
| US20140140589A1 (en) | Memory sensitive medical image browser | |
| Dietz et al. | Review of the use of telepathology for intraoperative consultation | |
| Ponchio et al. | ARIADNE Visual Media Service: easy web publishing of advanced visual media | |
| JP6949909B2 (ja) | 画像ビューア | |
| CN116313161B (zh) | 实现多种数字病理扫描仪切片多点统一阅片系统 | |
| Thomas et al. | ImageJ/Fiji ROI 1-click tools for rapid manual image annotations and measurements | |
| Jin et al. | Pai-wsit: An AI service platform with support for storing and sharing whole-slide images with metadata and annotations | |
| Massone et al. | State of the art of teledermatopathology | |
| CN110276818A (zh) | 用于自动合成内容感知填充的交互式系统 | |
| US20220263907A1 (en) | Collaboration design leveraging application server | |
| KR102374278B1 (ko) | 순수웹기반 pacs에서 의료영상의 적응적 로딩을 통한 렌더링 방법 및 그 장치 | |
| Giansanti et al. | WhatsApp in mHealth: design and evaluation of an mHealth tool to share dynamic images in hemodynamics | |
| Huisman | Digital pathology for education | |
| US11342065B2 (en) | Systems and methods for workstation rendering medical image records | |
| Jeong et al. | A Collaborative Digital Pathology System for Multi‐Touch Mobile and Desktop Computing Platforms | |
| Patil et al. | Evaluation and comparison between smartphone and photomicrography based whole slide imaging | |
| Feit et al. | Hypertext atlas of dermatopathology with expert system for epithelial tumors of the skin |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant |