CN115019082B - 一种非侵入性的肝功能分级系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种非侵入性的肝功能分级系统,该系统包括NLGBP特征提取模块和SVM分类器,其中NLGBP特征提取模块用于对肝脏ROI图像提取NLGBP特征;SVM分类器用于根据NLGBP特征获取肝脏分级结果。该分级系统克服了血液指标评分和肝脏组织活检方法的缺陷;且通过多尺度多方向的特征提取与NLBP特征相结合,深入挖掘CT图像特征,精确获取类间细微的差异,从而得到准确的肝功能分级结果。
Description
技术领域
本发明属于医学图像处理技术领域,具体涉及一种非侵入性的肝功能分级系统。
背景技术
肝功能检查用于监测人体肝脏分泌、排泄,合成储备功能,是诊断肝细胞损伤、纤维化和肝硬化等肝胆系统疾病的重要手段之一。肝功能评价广泛应用于肝脏外科切除、肝移植、介入治疗等方面。目前,对肝功能进行评价面临的主要问题如下:1)基于血液学指标估算肝功能评分的方法中,血液学检测需要空腹完成,时效性不足,无法满足急诊及危重病人快速诊疗的需求;2)肝脏组织活检方法准确率高,但创伤性大,患者不易接受,临床不将其作为常规检查。
研究显示,肝脏CT图像的影像特征与肝脏病变具有良好的相关性,肝脏CT图像已成为除病理学检查以外良好的潜在替代评估方法。然而,肝脏正常和异常组织在影像学的差异明显,人眼视觉能够区分,而不同等级肝功能CT图像的类间差异细微,对其分类更具挑战性,基于CT图像进行肝功能评价的研究目前鲜有报道。人眼直接观察肝脏组织无法辨别差异,但是从熵、均值等统计值及直方图可以看出,图像之间存在差异。如果能够进一步深入挖掘CT图像特征,开展与肝功能相关的智能医学影像识别方面的研究,揭示医学影像与肝功能分级之间的相关性,将为构建基于CT图像特征描述的肝功能分级新体系,为实现快速、无创的肝功能分级提供理论和技术支持。
发明内容
发明目的:本发明提供一种非侵入性的肝功能分级系统,该系统能够根据肝脏ROI图像得到对应的肝功能分级。
技术方案:本发明采用如下技术方案:
一种非侵入性的肝功能分级系统,包括:
NLGBP特征提取模块1,用于对肝脏ROI图像提取NLGBP特征FNLGBP;
SVM分类器2,用于根据NLGBP特征获取肝脏分级结果;
所述NLGBP特征提取模块包括:
多尺度纹理特征提取模块11,用于提取肝脏ROI图像的多尺度纹理特征Fu,v(x,y):
其中,I(x,y)表示肝脏ROI图像中坐标(x,y)处的灰度值,“*”表示卷积运算;Au,v(x,y)和θu,v(x,y)分别表示第v个尺度、第u个方向上的幅频和相频响应,u=0,1,…,7,v=1,2,…,5;Ψu,v(x,y)为多尺度纹理特征提取滤波器,定义为:
其中,(x,y)为像素点坐标,σx和σy分别为图像中X轴和Y轴上高斯包络的标准差,fv为复正弦平面波在第v个尺度上的中心频率,fmax表示多尺度纹理特征提取滤波器的最大频率;θu为复正弦平面波在第u个方向的角度,θu=πu/8;
主要方向计算模块12,用于计算像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y):
方向编码模块13,用于根据像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y)按下式进行编码:
Cv(x,y)=8D1,v(x,y)+D2,v(x,y) (5)
其中,Cv(x,y)表示像素点(x,y)在第v个尺度上的编码值,图像中每个像素点的编码值构成方向编码图像;
方向编码图像直方图统计模块14,用于将每个尺度的方向编码图像进行分块直方图统计,并将所有尺度的直方图进行级联,得到方向编码图像的直方图具体步骤为:
将第v个尺度的方向编码图像Cv分为K个子块,计算第k个子块的直方图k=1,2,…,K;即有:
其中,“∪”表示级联;
像素点排序模块15,用于对肝脏ROI图像中所有像素点按灰度值从小到大进行排序:
其中,表示肝脏ROI图像排序前像素点灰度值构成的集合,表示排序后像素点灰度值构成的序列,M是肝脏ROI图像的像素点数量,sort(·)表示升序排序函数;
anchor确定模块16,用于根据排序后中心像素点灰度值构成的序列确定J个anchor,其中第j个anchor的灰度值为:
其中j=1,...,J,为向下取整运算符;
差异编码模块17,用于计算像素点与每个anchor之间的差异编码;对于像素点(x,y),其与第j个anchor的差异编码为:
其中表示像素点(x,y)周围半径为r的邻域内第p个像素点处的灰度值,p=0,1,…,P-1,P为像素点(x,y)周围半径为r的邻域内像素总数;U(NLBP(x,y))的计算如下:
其中s(·)为符号函数,定义为:
NLBP编码图像获取模块18,用于获取肝脏ROI图像的NLBP编码图像,
对于一幅肝脏ROI图像,生成J个NLBP编码图像,其中第j个NLBP编码图像在像素点(x,y)处的灰度值为j=1,...,J;
NLBP编码直方图统计模块19,用于获取NLBP编码图像的直方图具体步骤为:
S19.1、对J个NLBP编码图像做如下操作:
将第j个NLBP编码图像分为K个子块,计算其中第k个子块的直方图级联后得到第j个NLBP编码图像的直方图/>
S19.2、将J个NLBP编码图像的直方图进行级联,得到肝脏ROI图像对应的NLBP编码图像的直方图/>
NLGBP特征获取模块20,用于将方向编码图像的直方图和NLBP编码图像的直方图级联,得到肝脏ROI图像的NLGBP特征FNLGBP:
所述SVM分类器按如下步骤进行训练:
S1、采集患者肝脏CT图像和同时期的血液学指标;从肝脏CT图像中提取ROI图像;计算MELD评分;根据MELD评分将肝功能划分为三个等级;
构建训练样本集,所述训练样本集中的样本为肝脏ROI图像,所述样本的标签为肝功能等级;
S2、将样本中的肝脏ROI图像输入NLGBP特征提取模块1中,得到对应的NLGBP特征;以NLGBP特征为输入,样本标签为输出,训练SVM分类器。
具体地,所述MELD评分Rmeld的计算式为:
Rmeld=3.8×ln a+11.2×ln(INR)+9.6×ln b+6.4×c
其中a和b分别为胆红素浓度和肌酐浓度,单位均为mg/dl;INR为凝血酶原时间国际标准化比值;c为病因影响因子,当患者为胆汁性或酒精性时c为0,其他c为1;
具体地,根据MELD评分将肝功能划分为三个等级,具体为:
Rmeld<15时,等级为低危;15≤Rmeld≤18时,等级为中危;Rmeld≥18时,等级为高危。
作为优选,所述多尺度纹理特征提取模块11中,
作为优选,所述方向编码图像直方图统计模块14和NLBP编码直方图统计模块19采用相同的划分方式将图像划分为K个子块。
有益效果:本发明公开的非侵入性的肝功能分级系统根据肝脏ROI图像得到其肝功能分级结果,克服了血液指标评分和肝脏组织活检方法的缺陷;且通过多尺度多方向的特征提取与NLBP特征相结合,深入挖掘CT图像特征,增大了不同肝功能等级所对应的CT图像之间的特征差异,获得了图像较大范围的像素关系,有效的克服了不同肝功能等级之间差异性过小的不足,精确获取类间细微的差异,从而得到准确的肝功能分级结果。
附图说明
图1为本发明公开的肝功能分级系统组成示意图;
图2为不同肝功能等级的肝脏ROI示意图;
图3为不同肝功能等级的肝脏ROI图像的幅频响应图;
图4为不同肝功能等级的肝脏ROI图像的不同尺度的方向编码图;
图5为像素点邻域内的像素点编码示意图;
图6为不同肝功能等级的肝脏ROI图像的NLGBP编码图。
具体实施方式
下面结合附图和具体实施方式,进一步阐明本发明。
本发明公开了一种非侵入性的肝功能分级系统,如图1所示,包括:
NLGBP特征提取模块1,用于对肝脏ROI图像提取NLGBP特征FNLGBP;
SVM分类器2,用于根据NLGBP特征获取肝脏分级结果;
所述NLGBP特征提取模块包括:
多尺度纹理特征提取模块11,用于提取肝脏ROI图像的多尺度纹理特征
其中,I(x,y)表示肝脏ROI图像中坐标(x,y)处的灰度值,“*”表示卷积运算;Au,v(x,y)和θu,v(x,y)分别表示第v个尺度、第u个方向上的幅频和相频响应,u=0,1,…,7,v=1,2,…,5。肝脏ROI图像为从肝脏CT图像中提取到的,如图2所示,为不同肝功能等级的ROI图像;图3为不同肝功能等级的肝脏ROI图像的幅频响应图,其中图3(a)和图3(b)分别为低危和高危肝功能ROI图像,以及在不同方向,不同尺度下的幅频响应图。
Ψu,v(x,y)为多尺度纹理特征提取滤波器,定义为:
其中,(x,y)为像素点坐标,σx和σy分别为图像中X轴和Y轴上高斯包络的标准差,本实施例中,fv为复正弦平面波在第v个尺度上的中心频率,/>fmax表示多尺度纹理特征提取滤波器的最大频率;θu为复正弦平面波在第u个方向的角度,θu=πu/8;
从多尺度多方向提取纹理特征,充分考虑了不同肝功能等级的ROI图像纹理结构相似、纹理细节不丰富的特点。为了进一步增大不同肝功能等级之间的差异,提取更为丰富的细节特征的同时克服特征的维度过高的问题,在各个尺度上计算每个像素点的主要方向。
主要方向计算模块12,用于计算像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y):
方向编码模块13,用于根据像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y)按下式进行编码:
Cv(x,y)=8D1,v(x,y)+D2,v(x,y) (5)
其中,Cv(x,y)表示像素点(x,y)在第v个尺度上的编码值,图像中每个像素点的编码值构成方向编码图像;如图4所示,为不同肝功能等级的肝脏ROI图像不同尺度的方向编码图;其中图4(a)和图4(b)分别为低危和高危肝功能ROI图像,以及在5个尺度的方向编码图。
方向编码图像直方图统计模块14,用于将每个尺度的方向编码图像进行分块直方图统计,并将所有尺度的直方图进行级联,得到方向编码图像的直方图具体步骤为:
将第v个尺度的方向编码图像Cv分为K个子块,计算第k个子块的直方图k=1,2,…,K;即有:
其中,“∪”表示级联;
像素点排序模块15,用于对肝脏ROI图像中所有像素点按灰度值从小到大进行排序:
其中,表示肝脏ROI图像排序前像素点灰度值构成的集合,表示排序后像素点灰度值构成的序列,M是肝脏ROI图像的像素点数量,sort(·)表示升序排序函数;
像素点排序模块15图像的所有像素点的灰度值进行排序,能够获得较大范围的像素关系对紧致邻域的影响。
anchor确定模块16,用于根据排序后中心像素点灰度值构成的序列确定J个anchor;其中第j个anchor的灰度值为:
其中j=1,...,J,为向下取整运算符;
差异编码模块17,用于计算像素点与每个anchor之间的差异编码;对于像素点(x,y),其与第j个anchor的差异编码为:
其中表示像素点(x,y)周围半径为r的邻域内第p个像素点处的灰度值,p=0,1,…,P-1,P为像素点(x,y)周围半径为r的邻域内像素总数;U(NLBP(x,y))的计算如下:
其中s(·)为符号函数,定义为:
如图5所示,当r=1时,像素点(x,y)周围的8个像素点构成其邻域,即P=8,图5中像素点中的数字表示邻域内像素点的编号,即p的值。式(11)计算了像素点(x,y)周围半径为r的邻域内相邻像素点灰度值之差的和。
差异编码模块17采用扩展的旋转不变编码方式,对其邻域中的像素点与每个anchor之间的差异进行编码。在纹理图像中有局部的冗余,计算的anchor通过简单的平均,可以大致捕捉到图像中强度的分布信息。很明显,当图像旋转,计算的anchor是不变的。
NLBP编码图像获取模块18,用于获取肝脏ROI图像的NLBP编码图像;
对于一幅肝脏ROI图像,会生成J个NLBP编码图像,其中第j个NLBP编码图像在像素点(x,y)处的灰度值为差异编码模块17计算得到的j=1,...,J。如图6所示,为J取不同值时不同肝功能等级的肝脏ROI图像的NLGBP编码图像;其中图6(a)为低危时J分别取1-4时得到的NLBP编码图像,图6(b)为高危时J分别取1-4时得到的NLBP编码图像。NLBP编码直方图统计模块19,用于获取NLBP编码图像的直方图/>具体步骤为:
S19.1、对J个NLBP编码图像做如下操作:
采用方向编码图像直方图统计模块14对方向编码图像划分方式,将第j个NLBP编码图像分为K个子块,计算其中第k个子块的直方图级联后得到第j个NLBP编码图像的直方图/>
S19.2、将J个NLBP编码图像的直方图进行级联,得到肝脏ROI图像对应的NLBP编码图像的直方图/>
NLGBP特征获取模块20,用于将方向编码图像的直方图和NLBP编码图像的直方图级联,得到肝脏ROI图像的NLGBP特征FNLGBP:
所述SVM分类器2按如下步骤进行训练:
S1、采集患者肝脏CT图像和同时期的血液学指标;从肝脏CT图像中提取ROI图像;计算MELD评分;根据MELD评分将肝功能划分为三个等级;
所述MELD评分Rmeld的计算式为:
Rmeld=3.8×ln a+11.2×ln(INR)+9.6×ln b+6.4×c
其中a和b分别为胆红素浓度和肌酐浓度,单位均为mg/dl;INR为凝血酶原时间国际标准化比值;c为病因影响因子,当患者为胆汁性或酒精性时c为0,其他c为1;
根据MELD评分将肝功能划分为三个等级,具体为:
Rmeld<15时,等级为低危;15≤Rmeld≤18时,等级为中危;Rmeld≥18时,等级为高危。
构建训练样本集,所述训练样本集中的样本为肝脏ROI图像,所述样本的标签为肝功能等级;
S2、将样本中的肝脏ROI图像输入NLGBP特征提取模块1中,得到对应的NLGBP特征;以NLGBP特征为输入,样本标签为输出,训练SVM分类器。
在使用时,获取待分级的肝脏ROI图像,将其输入非侵入性的肝功能分级系统中,NLGBP特征提取模块1提取输入图像的NLGBP特征FNLGBP;SVM分类器2根据FNLGBP得到输入图像的肝功能分级结果。
最后,应当理解的是,本发明中所述实施例仅用以说明本发明实施例的原则;其他的变形也可能属于本发明的范围;因此,作为示例而非限制,本发明实施例的替代配置可视为与本发明的教导一致;相应地,本发明的实施例不限于本发明明确介绍和描述的实施例。
Claims (6)
1.一种非侵入性的肝功能分级系统,其特征在于,包括:
NLGBP特征提取模块(1),用于对肝脏ROI图像提取NLGBP特征FNLGBP;
SVM分类器(2),用于根据NLGBP特征获取肝脏分级结果;
所述NLGBP特征提取模块包括:
多尺度纹理特征提取模块(11),用于提取肝脏ROI图像的多尺度纹理特征Fu,v(x,y):
其中,I(x,y)表示肝脏ROI图像中坐标(x,y)处的灰度值,“*”表示卷积运算;Au,v(x,y)和θu,v(x,y)分别表示第v个尺度、第u个方向上的幅频和相频响应,u=0,1,…,7,v=1,2,…,5;Ψu,v(x,y)为多尺度纹理特征提取滤波器,定义为:
其中,(x,y)为像素点坐标,σx和σy分别为图像中X轴和Y轴上高斯包络的标准差,fv为复正弦平面波在第v个尺度上的中心频率,fmax表示多尺度纹理特征提取滤波器的最大频率,θu为复正弦平面波在第u个方向的角度,θu=πu/8;
主要方向计算模块(12),用于计算像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y):
方向编码模块(13),用于根据像素点(x,y)处各个尺度上的幅频响应最大和最小值所对应的方向数值D1,v(x,y)和D2,v(x,y)按下式进行编码:
Cv(x,y)=8D1,v(x,y)+D2,v(x,y) (5)
其中,Cv(x,y)表示像素点(x,y)在第v个尺度上的编码值,图像中每个像素点的编码值构成方向编码图像;
方向编码图像直方图统计模块(14),用于将每个尺度的方向编码图像进行分块直方图统计,并将所有尺度的直方图进行级联,得到方向编码图像的直方图具体步骤为:
将第v个尺度的方向编码图像Cv分为K个子块,计算第k个子块的直方图k=1,2,*,K;即有:
其中,“∪”表示级联;
像素点排序模块(15),用于对肝脏ROI图像中所有像素点按灰度值从小到大进行排序:
其中,表示肝脏ROI图像排序前像素点灰度值构成的集合,/>表示排序后像素点灰度值构成的序列,M是肝脏ROI图像的像素点数量,sort(·)表示升序排序函数;
anchor确定模块(16),用于根据排序后中心像素点灰度值构成的序列确定J个anchor,其中第j个anchor的灰度值为:
其中j=1,...,J, 为向下取整运算符;
差异编码模块(17),用于计算像素点与每个anchor之间的差异编码;对于像素点(x,y),其与第j个anchor的差异编码为:
其中表示像素点(x,y)周围半径为r的邻域内第p个像素点处的灰度值,p=0,1,…,P-1,P为像素点(x,y)周围半径为r的邻域内像素总数;U(NLBP(x,y))的计算如下:
其中s(·)为符号函数,定义为:
NLBP编码图像获取模块(18),用于获取肝脏ROI图像的NLBP编码图像,
对于一幅肝脏ROI图像,生成J个NLBP编码图像,其中第j个NLBP编码图像在像素点(x,y)处的灰度值为
NLBP编码直方图统计模块(19),用于获取NLBP编码图像的直方图具体步骤为:
S19.1、对J个NLBP编码图像做如下操作:
将第j个NLBP编码图像分为K个子块,计算其中第k个子块的直方图级联后得到第j个NLBP编码图像的直方图/>
S19.2、将J个NLBP编码图像的直方图进行级联,得到肝脏ROI图像对应的NLBP编码图像的直方图/>
NLGBP特征获取模块(20),用于将方向编码图像的直方图和NLBP编码图像的直方图级联,得到肝脏ROI图像的NLGBP特征FNLGBP:
2.根据权利要求1所述的肝功能分级系统,其特征在于,所述SVM分类器按如下步骤进行训练:
S1、采集患者肝脏CT图像和同时期的血液学指标;从肝脏CT图像中提取ROI图像;计算MELD评分;根据MELD评分将肝功能划分为三个等级;
构建训练样本集,所述训练样本集中的样本为肝脏ROI图像,所述样本的标签为肝功能等级;
S2、将样本中的肝脏ROI图像输入NLGBP特征提取模块(1)中,得到对应的NLGBP特征;以NLGBP特征为输入,样本标签为输出,训练SVM分类器。
3.根据权利要求2所述的肝功能分级系统,其特征在于,所述MELD评分Rmeld的计算式为:
Rmeld=3.8×lna+11.2×ln(INR)+9.6×lnb+6.4×c
其中a和b分别为胆红素浓度和肌酐浓度,单位均为mg/dl;INR为凝血酶原时间国际标准化比值;c为病因影响因子,当患者为胆汁性或酒精性时c为0,其他c为1。
4.根据权利要求3所述的肝功能分级系统,其特征在于,根据MELD评分将肝功能划分为三个等级,具体为:
Rmeld<15时,等级为低危;15≤Rmeld≤18时,等级为中危;Rmeld≥18时,等级为高危。
5.根据权利要求1所述的肝功能分级系统,其特征在于,所述多尺度纹理特征提取模块(11)中,
6.根据权利要求1所述的肝功能分级系统,其特征在于,所述方向编码图像直方图统计模块(14)和NLBP编码直方图统计模块(19)采用相同的划分方式将图像划分为K个子块。
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基于形状纹理特征的食管癌和肝包虫病图像分类;娜迪亚・阿卜杜迪克依木;姚娟;刘志华;严传波;;中国医学物理学杂志;20191225(第12期);全文 * |
娜迪亚・阿卜杜迪克依木 * |
Also Published As
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CN115019082A (zh) | 2022-09-06 |
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