CN114774262A - 一种动物源细菌耐药性监测溯源系统 - Google Patents

一种动物源细菌耐药性监测溯源系统 Download PDF

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Abstract

本发明提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，属于动物源细菌监测技术领域，包括：采样管理模块，下达采样任务，收集采样信息；样品检验和结果报告模块，开展检测工作，检测数据上传数据库管理模块，形成结果报告；数据库管理模块，对采样信息和检测数据统计分析，得到耐药性监测和细菌资源数据及监测分析结果，存入数据库，并将监测分析结果提供给养殖企业及管理部门；专家服务模块，专家编写精准用药指导报告以及开展耐药机理和传播规律研究。本发明实现养殖企业、科研机构和大专院校以及省市县三级管理部门监测数据共享，形成统一开放平台，及时掌握省内动物源细菌耐药性现状、产生原因以及耐药趋势，有效进行动物源细菌耐药性溯源。

Description

一种动物源细菌耐药性监测溯源系统
技术领域
本发明属于动物源细菌监测技术领域，具体涉及一种动物源细菌耐药性监测溯源系统。
背景技术
抗菌药在畜禽养殖上的应用对治疗和预防动物疾病、提高畜禽产品产量起到了积极作用,但长期、超剂量使用抗菌药会导致大量耐药菌出现，因此需要对动物源细菌耐药性进行监测，以掌握其发展趋势，指导养殖企业精准用药。
现有动物源细菌耐药性都是分散进行监测的，养殖企业、科研机构、大专院校的检测数据不能共享，缺少统一开放的互联网+大数据管理平台，无法掌握省内动物源细菌耐药性的现状、产生原因以及耐药趋势，更无法有效进行动物源细菌耐药性的溯源。
此为现有技术的不足，因此，针对现有技术中的上述缺陷，提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，是非常有必要的。
发明内容
针对现有技术的上述现有的动物源细菌耐药性都是分散进行监测的，缺少统一的数据管理平台，无法进行动物源细菌耐药性溯源的缺陷，本发明提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，以解决上述技术问题。
本发明提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，包括采样管理模块、样品检验和结果报告模块、数据库管理模块及专家服务模块；
采样管理模块，用于各养殖企业接收中心实验室和各养殖企业管理员下达的采样任务进行采样，将样品提供给各实验室，以及将采样信息上传到数据库管理模块，并自动生成唯一性编号；
样品检验和结果报告模块，用于各实验室按照规定的检测方法对样品开展检测工作，记录检测数据，并上传到数据库管理模块，形成养殖企业检验结果报告，提供给养殖企业及各级管理部门用户；
数据库管理模块，用于对采样管理模块及样品检验和结果报告模块上传的采样信息和检测数据进行统计分析，得到细菌耐药性监测数据、细菌资源数据及监测分析结果，将细菌耐药性监测数据和细菌资源数据存入数据库，并将监测分析结果按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；
专家服务模块，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块的统计分析结果及细菌耐药性监测数据库数据，向养殖企业反馈饲养管理以及精准用药指导报告，为各级管理部门用户提供技术咨询报告，以及进行耐药研究，制定防控策略。
进一步地，采样管理模块包括：
采样任务下达单元，用于中心实验室和各养殖企业管理员下达采样任务；
样品采集记录单元，用于各养殖企业技术人员根据采样任务确定畜禽品种、采样类型、采样数量和样品分布，启动采样过程，对采样过程进行拍照、视频拍摄以及文字、数字记录，形成采样信息；
采样信息上传单元，用于各养殖企业技术人员将采样信息上传到数据库管理模块，系统自动生成唯一性编号。对样品进行编号实现细菌的全程追溯。
进一步地，样品检验和结果报告模块包括：
检验任务下达单元，用于各实验室管理员根据采样任务向对应实验室技术人员下达检测任务；
样品检测数据记录单元，用于各实验室技术人员接收检验任务获取样品，根据监测细菌种类和监测指标，按照统一规定的检测方法开展以下检测工作：首先从样品中分离出目标菌种进行培养，再依次对目标菌种进行微生物生理生化鉴定或者微生物蛋白质指纹鉴定、药物敏感性试验、血清型鉴定、耐药基因筛查、耐药基因测序、毒力基因筛查以及菌株保藏，记录上述检测数据，并上传到数据库管理模块；
结果报告编制单元，用于各实验室管理员根据对应实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告；
结果报告发送单元，用于各实验室管理员将养殖企业检验结果报告按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户。中心实验室管理员向中心实验室技术人员下达检验任务，而企业实验室管理员向企业实验室技术人员下达检验任务。检验完成后，中心实验室管理员根据中心实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告，而企业实验室管理员根据企业实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告。
进一步地，采样畜禽品种包括生猪、肉鸡、蛋鸡、肉鸭、肉牛、奶牛以及肉羊；
采样类型包括动物样品、养殖环境样品以及人源样品；采样类型不限于上述样品；
动物样品包括泄殖腔拭子、肛拭子、盲肠、盲肠内容物、牛奶、猪扁桃体以及病料组织；
养殖环境样品包括与动物养殖相关的空气、水以及土壤；
人源样品包括养殖企业工作人员的工作服、手套、胶鞋以及手部拭子；
监测细菌种类包括大肠杆菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌、弯曲菌、肠球菌和动物致病菌；
弯曲菌包括空肠弯曲菌和结肠弯曲菌；
肠球菌包括屎肠球菌和粪肠球菌；
动物致病菌包括猪链球菌、副猪嗜血杆菌和巴氏杆菌；
监测指标包括细菌的分离率、MIC值、耐药率、多重耐药率、耐药谱、耐药基因、血清型以及毒力基因；
进一步地，数据库管理模块包括：
数据管理平台，用于中心实验室或各企业实验室上传检测数据，对检测数据进行分析，并将分析结果按照相应权限反馈给养殖企业及各级管理部门用户，同时提取出细菌耐药性监测数据及细菌资源数据，存储到对应数据库中；
细菌耐药性监测数据库，用于存储数据管理平台分析得到的细菌耐药性监测数据及标准指标数据；
细菌资源库，用于存储数据管理平台分析得到的细菌资源数据；
菌种检索单元，用于各角色用户根据权限对细菌资源数据进行检索；
数据展示单元，用于对数据管理平台的检测数据分析结果进行展示。通过不同数据分析模型进行结果展示，包括细菌分离率、MIC值、耐药率、多重耐药率、耐药谱、耐药基因携带情况、血清型及毒力基因携带情况。
进一步地，数据管理平台包括：
实验室数据接口，用于接收中心实验室和各企业实验室技术人员上传的检测数据；
养殖企业接口，用于向养殖企业管理员反馈对应的检验结果报告以及饲养管理和精准用药指导报告；
数据分析单元，用于对中心实验室或各企业实验室技术人员上传的检测数据进行单独分析，形成养殖企业检验结果报告，以及对中心实验室及各企业实验室上传的检测数据进行统筹分析，并根据相应权限向各级管理部门进行反馈；
各级管理部门接口，用于各级管理部门根据权限获取区域范围内各养殖企业的细菌耐药性发展趋势、中心实验室报送的年度对应区域范围内细菌耐药性风险评估报告，以及科研院所及大专院校专家提供的技术咨询报告。
进一步地，实验室数据接口以excel文档格式上传检验数据；
数据分析单元从中心实验室或各企业实验室上传的检测数据中提取出监测指标的实际数据，从细菌耐药性监测数据库获取预设的标准指标数据，并将监测指标的实际数据与标准数据进行比较判断，再通过预设的各数据分析模型进行解析，得到不同维度下监测指标的判断结果。
进一步地，专家服务模块包括：
饲养管理及用药指导单元，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成饲养管理及精准用药指导报告，并将饲养管理及精准用药指导报告上传到数据库管理模块，提供给养殖企业管理员；
技术咨询提供单元，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成技术咨询报告，并将技术咨询报告上传到数据库管理模块，提供给各级管理部门用户；
耐药性研究单元，还用于科研院所及大专院校专家根据细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据进行耐药机理和耐药传播规律研究，制定防控策略。
进一步地，数据管理平台还包括：
专家接口，用于接收科研院所及大专院校专家上传的饲养管理及精准用药指导报告、技术咨询报告，以及向科研院所及大专院校专家反馈细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据，进行耐药机理和耐药传播规律研究。
进一步地，细菌耐药性监测数据库中还存储有检测技术规范或标准，并通过养殖企业接口向养殖企业管理员反馈；
采样任务下达单元下达的采样任务中包括检测技术规范或标准，样品采集记录单元中，各养殖企业技术人员依据检测技术规范或标准的要求进行采样；
样品检验和结果报告模块中，各实验室依据检测技术规范或标准的要求分离菌种、鉴定以及开展检测工作。中心实验室和各企业实验室均按照检测技术规范或标准进行检测。
进一步地，数据库管理模块还包括：
日志单元，用于记录各角色用户对数据库管理模块的操作记录。
本发明的有益效果在于，
本发明提供的动物源细菌耐药性监测溯源系统，通过采样管理模块、样品检验和结果报告模块、数据库管理模块以及专家服务模块实现动物源细菌耐药性统一监测，实现养殖企业、科研机构和大专院校以及省市县三级管理部门对监测数据共享，形成统一开放的互联网+大数据管理平台，及时掌握省内动物源细菌耐药性的现状、产生原因以及耐药趋势，有效进行动物源细菌耐药性溯源。
本发明提供的动物源细菌耐药性监测溯源系统，通过采样管理模块实现了各养殖企业采样信息化、自动化管理，采样任务下达单元下达采样任务，样品采集记录单元将采样过程形成采样信息进行记录，采样信息上传单元将采样信息自动化上传；本发明通过样品检验和结果报告模块实现各实验室检验信息化、智能化和无纸化管理，检验任务下达单元下达检测任务，样品检测记录单元记录记录检测数据，结果报告编制单元编制养殖企业检验结果报告，结果报告发送单元将养殖企业检验结果报告发送到养殖企业和各级管理部门用户；本发明通过数据库管理模块建立了细菌耐药性监测数据库和细菌资源数据库，并对各级管理部门辖区内的动物源细菌耐药性变化趋势进行分析，数据管理平台对检测数据进行分析，将分析结果提供给养殖企业和各级管理部门用户，提取出细菌耐药性监测数据和细菌资源数据，分别存储到细菌耐药性监测数据库和细菌资源数据库；本发明通过专家服务模块提供的技术咨询报告能够为各级管理部门决策提供技术支撑，以及通过专家服务模块可以指导养殖企业精准用药，有效遏制细菌耐药性蔓延趋势，饲养管理及用药指导单元将饲养管理及精准用药指导报告提供给养殖企业管理员，技术咨询提供单元将技术咨询报告提供给各级管理部门用户，耐药性研究单元根据耐药机理和耐药传播规律研究，制定防控策略。
此外，本发明设计原理可靠，结构简单，具有非常广泛的应用前景。
由此可见，本发明与现有技术相比，具有突出的实质性特点和显著的进步，其实施的有益效果也是显而易见的。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本发明的动物源细菌耐药性监测溯源系统实施例1示意图。
图2是本发明的动物源细菌耐药性监测溯源系统实施例2示意图。
图中，1-采样管理模块；1.1-采样任务下达单元；1.2-样品采集记录单元；1.3-采样信息上传单元；2-样品检验和结果报告模块；2.1-检测任务下达单元；2.2-检测数据记录单元；2.3-结果报告编制单元；2.4-结果报告发送单元；3-数据库管理模块；3.1-数据管理平台；3.1.1-实验室数据接口；3.1.2-养殖企业接口；3.1.3-数据分析单元；3.1.4-各级管理部门接口；3.1.5-专家接口；3.2-细菌耐药性监测数据库；3.3-细菌资源库；3.4-菌种检索单元；3.5-数据展示单元；3.6-日志单元；4-专家服务模块；4.1-饲养管理及用药指导单元；4.2-技术咨询提供单元；4.3-耐药性研究单元。
具体实施方式
为了使本技术领域的人员更好地理解本发明中的技术方案，下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本发明保护的范围。
MIC是minimum inhibitory concentration缩写，指最低抑菌浓度，最低抑菌浓度是测量抗菌药物的抗菌活性大小的一个指标，指在体外培养细菌18至24小时后能抑制培养基内病原菌生长的最低药物浓度。
实施例1：
如图1所示，本发明提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，包括采样管理模块1、样品检验和结果报告模块2、数据库管理模块3及专家服务模块4；
采样管理模块1，用于各养殖企业接收中心实验室和各养殖企业管理员下达的采样任务进行采样，将样品提供给各实验室，以及将采样信息上传到数据库管理模块3，并自动生成唯一性编号；采样管理模块1包括：
采样任务下达单元1.1，用于中心实验室和各养殖企业管理员下达采样任务；
样品采集记录单元1.2，用于各养殖企业技术人员根据采样任务确定畜禽品种、采样类型、采样数量和样品分布，启动采样过程，对采样过程进行拍照、视频拍摄以及文字、数字记录，形成采样信息；
采样信息上传单元1.3，用于各养殖企业技术人员将采样信息上传到数据库管理模块3，系统自动生成唯一性编号；对样品进行编号实现细菌的全程追溯；
样品检验和结果报告模块2，用于各实验室按照规定的检测方法对样品开展检测工作，记录检测数据，并上传到数据库管理模块3，形成养殖企业检验结果报告，提供给养殖企业及各级管理部门用户；样品检验和结果报告模块2包括：
检验任务下达单元2.1，用于各实验室管理员根据采样任务向对应实验室技术人员下达检测任务；
样品检测数据记录单元2.2，用于各实验室技术人员接收检验任务获取样品，根据监测细菌种类和监测指标，按照统一规定的检测方法开展以下检测工作：首先从样品中分离出目标菌种进行培养，再依次对目标菌种进行微生物生理生化鉴定或者微生物蛋白质指纹鉴定、药物敏感性试验、血清型鉴定、耐药基因筛查、耐药基因测序、毒力基因筛查以及菌株保藏，记录上述检测数据，并上传到数据库管理模块3；
结果报告编制单元2.3，用于各实验室管理员根据对应实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告；
结果报告发送单元2.4，用于各实验室管理员将养殖企业检验结果报告按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；
采样畜禽品种包括生猪、肉鸡、蛋鸡、肉鸭、肉牛、奶牛及肉羊；
采样类型包括动物样品、养殖环境样品以及人源样品；
动物样品包括泄殖腔拭子、肛拭子、盲肠、盲肠内容物、牛奶、猪扁桃体以及病料组织；
养殖环境样品包括与动物养殖相关的空气、水以及土壤；
人源样品包括养殖企业工作人员的工作服、手套、胶鞋以及手部拭子；
监测细菌种类包括大肠杆菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌、弯曲菌、肠球菌和动物致病菌；
弯曲菌包括空肠弯曲菌和结肠弯曲菌；肠球菌包括屎肠球菌和粪肠球菌；动物致病菌包括猪链球菌、副猪嗜血杆菌和巴氏杆菌；
监测指标包括细菌的分离率、MIC值、耐药率、多重耐药率、耐药谱、耐药基因、血清型以及毒力基因；
数据库管理模块3，用于对采样管理模块1及样品检验和结果报告模块2上传的采样信息和检测数据进行统计分析，得到细菌耐药性监测数据、细菌资源数据及监测分析结果，将细菌耐药性监测数据和细菌资源数据存入数据库，并将监测分析结果按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；数据库管理模块3包括：
数据管理平台3.1，用于中心实验室或各企业实验室上传检测数据，对检测数据进行分析，并将分析结果按照相应权限反馈给养殖企业及各级管理部门用户，同时提取出细菌耐药性监测数据及细菌资源数据，存储到对应数据库中；各级管理部门以省市县三级管理部门为例，每一级管理部门在线监测各自辖区内细菌耐药性变化趋势，三级管理部门进行数据共享；
细菌耐药性监测数据库3.2，用于存储数据管理平台3.1分析得到的细菌耐药性监测数据及标准指标数据；
细菌资源库3.3，用于存储数据管理平台3.1分析得到的细菌资源数据；
菌种检索单元3.4，用于各角色用户根据权限对细菌资源数据进行检索；
数据展示单元3.5，用于对数据管理平台3.1的检测数据分析结果进行展示；通过不同数据分析模型进行结果展示，包括细菌分离率、MIC值、耐药率、多重耐药率、耐药谱、耐药基因携带情况、血清型及毒力基因携带情况；
日志单元3.6，用于记录各角色用户对数据库管理模块3的操作记录；
专家服务模块4，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果及细菌耐药性监测数据库数据，向养殖企业反馈饲养管理以及精准用药指导报告，为各级管理部门用户提供技术咨询报告，以及进行耐药研究，制定防控策略；专家服务模块4包括：
饲养管理及用药指导单元4.1，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，生成饲养管理及精准用药指导报告，并将饲养管理及精准用药指导报告上传到数据库管理模块3，提供给养殖企业管理员；
技术咨询提供单元4.2，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，生成技术咨询报告，并将技术咨询报告上传到数据库管理模块3，提供给各级管理部门用户；
耐药性研究单元4.3，还用于科研院所及大专院校专家根据细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据进行耐药机理和耐药传播规律研究，制定防控策略。
实施例2：
如图2所示，本发明提供一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，包括采样管理模块1、样品检验和结果报告模块2、数据库管理模块3及专家服务模块4；
采样管理模块1，用于各养殖企业接收中心实验室和各养殖企业管理员下达的采样任务进行采样，将样品提供给各实验室，以及将采样信息上传到数据库管理模块3，并自动生成唯一性编号；采样管理模块1包括：
采样任务下达单元1.1，用于中心实验室和各养殖企业管理员下达采样任务；
样品采集记录单元1.2，用于各养殖企业技术人员根据采样任务确定畜禽品种、采样类型、采样数量和样品分布，启动采样过程，对采样过程进行拍照、视频拍摄以及文字、数字记录，形成采样信息；
实验室采样信息上传单元1.3，用于各养殖企业技术人员将采样信息上传到数据库管理模块3，系统自动生成唯一性编号；对样品进行编号实现细菌的全程追溯；
样品检验和结果报告模块2，用于各实验室按照规定的检测方法对样品开展检测工作，记录检测数据，并上传到数据库管理模块3，形成养殖企业检验结果报告，提供给养殖企业及各级管理部门用户；样品检验和结果报告模块2包括：
检验任务下达单元2.1，用于各实验室管理员根据采样任务向对应实验室技术人员下达检测任务；
样品检测数据记录单元2.2，用于各实验室技术人员接收检验任务获取样品，根据监测细菌种类和监测指标，按照统一规定的检测方法开展以下检测工作：首先从样品中分离出目标菌种进行培养，再依次对目标菌种进行微生物生理生化鉴定或者微生物蛋白质指纹鉴定、药物敏感性试验、血清型鉴定、耐药基因筛查、耐药基因测序、毒力基因筛查以及菌株保藏，记录上述检测数据，并上传到数据库管理模块3；
结果报告编制单元2.3，用于各实验室管理员根据对应实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告；
结果报告发送单元2.4，用于各实验室管理员将养殖企业检验结果报告按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；
采样畜禽品种包括生猪、肉鸡、蛋鸡、肉鸭、肉牛、奶牛以及肉羊；
采样类型包括动物样品、养殖环境样品以及人源样品；
动物样品包括泄殖腔拭子、肛拭子、盲肠、盲肠内容物、牛奶、猪扁桃体以及病料组织；
养殖环境样品包括与动物养殖相关的空气、水以及土壤；
人源样品包括养殖企业工作人员的工作服、手套、胶鞋以及手部拭子；
监测细菌种类包括大肠杆菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌、弯曲菌、肠球菌和动物致病菌；
弯曲菌包括空肠弯曲菌和结肠弯曲菌；肠球菌包括屎肠球菌和粪肠球菌；动物致病菌包括猪链球菌、副猪嗜血杆菌和巴氏杆菌；
监测指标包括细菌的分离率、MIC值、耐药率、多重耐药率、耐药谱、耐药基因、血清型以及毒力基因；
数据库管理模块3，用于对采样管理模块1及样品检验和结果报告模块2上传的采样信息和检测数据进行统计分析，得到细菌耐药性监测数据、细菌资源数据及监测分析结果，将细菌耐药性监测数据和细菌资源数据存入数据库，并将监测分析结果按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；数据库管理模块3包括：
数据管理平台3.1，用于中心实验室或各企业实验室上传检测数据，对检测数据进行分析，并将分析结果按照相应权限反馈给养殖企业及各级管理部门用户，同时提取出细菌耐药性监测数据及细菌资源数据，存储到对应数据库中；各级管理部门以省市县三级管理部门为例，每一级管理部门在线监测各自辖区内细菌耐药性变化趋势，三级管理部门进行数据共享；数据管理平台3.1包括：
实验室数据接口3.1.1，用于接收中心实验室和各企业实验室技术人员上传的检测数据；实验室数据接口3.1.1接收中心实验室和各企业实验室以excel文档格式上传检验数据；养殖企业可以使用本养殖企业当年数据指导精准用药，也可以利用数据库中本养殖企业往年数据分析耐药性发展趋势；
养殖企业接口3.1.2，用于向养殖企业管理员反馈对应的检验结果报告以及饲养管理和精准用药指导报告；
数据分析单元3.1.3，用于对中心实验室或各企业实验室技术人员上传的检测数据进行单独分析，形成养殖企业检验结果报告，以及对中心实验室及各企业实验室上传的检测数据进行统筹分析，并根据相应权限向各级管理部门进行反馈；数据分析单元3.1.3从中心实验室或各企业实验室上传的检测数据中提取出监测指标的实际数据，从细菌耐药性监测数据库3.2获取预设的标准指标数据，并将监测指标的实际数据与标准数据进行比较判断，再通过预设的各数据分析模型进行解析，得到不同维度下监测指标的判断结果；利用多种数据分析模型，从畜禽品种、地区、年代及养殖企业不同维度解析数据价值，给数据赋能，变成活资源；以下述8个数据分析模型为例，对8个监测指标数据进行分析：
分离率数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同血清型的各种细菌分离率进行分析；
MIC值数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同血清型、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份各种细菌对不同药物的MIC值分布进行分析；
耐药率数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份、不同血清型的各种耐药率进行分析；
多重耐药率数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同血清型、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份各种细菌多重耐药率进行分析；
耐药谱数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份、不同血清型的各种耐药谱进行分析；
耐药基因携带情况数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份的各种耐药基因携带情况进行分析；
血清型数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同年份各种细菌的血清型进行分析；
毒力基因携带情况数据分析模型，对不同动物、不同养殖场、不同地区、不同年代、不同年份、不同月份各种毒力基因携带情况进行分析；
通过上述8个数据分析模型，可以进行数据溯源，可以实现根据8个监测指标中任意一个进行数据查询的功能；
通过上述8个数据分析模型，实现了指导养殖企业精准用药功能，有效控制了抗菌药滥用，减少了药物残留和交叉耐药问题；
各级管理部门接口3.1.4，用于各级管理部门根据权限获取区域范围内各养殖企业的细菌耐药性发展趋势、中心实验室报送的年度对应区域范围内细菌耐药性风险评估报告，以及科研院所及大专院校专家提供的技术咨询报告；省市县三级管理部门可以及时掌握本辖区内细菌耐药性发展趋势；
专家接口3.1.5，用于接收科研院所及大专院校专家上传的饲养管理及精准用药指导报告、技术咨询报告，以及向科研院所及大专院校专家反馈细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据，进行耐药机理和耐药传播规律研究；
细菌耐药性监测数据库3.2，用于存储数据管理平台3.1分析得到的细菌耐药性监测数据及标准指标数据；
细菌资源库3.3，用于存储数据管理平台3.1分析得到的细菌资源数据；
菌种检索单元3.4，用于各角色用户根据权限对细菌资源数据进行检索；
数据展示单元3.5，用于对数据管理平台3.1的检测数据分析结果进行展示；数据展示单元3.5通过excel电子表格的形式对判断结果进行输出，各项监测指标的分析结果可以使用热图、直方图、柱形图、条形图、横状图、饼图、雷达图、面积图、散点图、股价图、折线图、组合图等多种形式展现，使结果之间的比较更加直观；
日志单元3.6，用于记录各角色用户对数据库管理模块3的操作记录；
专家服务模块4，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果及细菌耐药性监测数据库数据，向养殖企业反馈饲养管理以及精准用药指导报告，为各级管理部门用户提供技术咨询报告，以及进行耐药研究，制定防控策略；专家服务模块4包括：
饲养管理及用药指导单元4.1，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成饲养管理及精准用药指导报告，并将饲养管理及精准用药指导报告上传到数据库管理模块3，提供给养殖企业管理员；
技术咨询提供单元4.2，用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块3的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成技术咨询报告，并将技术咨询报告上传到数据库管理模块3，提供给各级管理部门用户；
耐药性研究单元4.3，还用于科研院所及大专院校专家根据细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据进行耐药机理和耐药传播规律研究，制定防控策略。
上述实施例2中，细菌耐药性监测数据库3.2中还存储有检测技术规范或标准，并通过养殖企业接口3.1.2向养殖企业管理员反馈；
采样任务下达单元1.1下达的采样任务中包括检测技术规范或标准，样品采集记录单元1.2中，各养殖企业技术人员依据检测技术规范或标准的要求进行采样；
样品检验和结果报告模块2中，各实验室依据检测技术规范或标准的要求分离菌种、鉴定以及开展检测工作。
尽管通过参考附图并结合优选实施例的方式对本发明进行了详细描述，但本发明并不限于此。在不脱离本发明的精神和实质的前提下，本领域普通技术人员可以对本发明的实施例进行各种等效的修改或替换，而这些修改或替换都应在本发明的涵盖范围内，任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内，可以轻易想到变化或替换，都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此，本发明的保护范围应以所述以上权利要求的保护范围为准。

Claims (10)

1.一种动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，包括采样管理模块（1）、样品检验和结果报告模块（2）、数据库管理模块（3）及专家服务模块（4）；
采样管理模块（1），用于各养殖企业接收中心实验室和各养殖企业管理员下达的采样任务进行采样，将样品提供给各实验室，以及将采样信息上传到数据库管理模块（3），并自动生成唯一性编号；
样品检验和结果报告模块（2），用于各实验室按照规定的检测方法对样品开展检测工作，记录检测数据，并上传到数据库管理模块（3），形成养殖企业检验结果报告，提供给养殖企业及各级管理部门用户；
数据库管理模块（3），用于对采样管理模块（1）及样品检验和结果报告模块（2）上传的采样信息和检测数据进行统计分析，得到细菌耐药性监测数据、细菌资源数据及监测分析结果，将细菌耐药性监测数据和细菌资源数据存入数据库，并将监测分析结果按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户；
专家服务模块（4），用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块（3）的统计分析结果及细菌耐药性监测数据库数据，向养殖企业反馈饲养管理以及精准用药指导报告，为各级管理部门用户提供技术咨询报告，以及进行耐药研究，制定防控策略。
2.如权利要求1所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，采样管理模块（1）包括：
采样任务下达单元（1.1），用于中心实验室和各养殖企业管理员下达采样任务；
样品采集记录单元（1.2），用于各养殖企业技术人员根据采样任务确定畜禽品种、采样类型、采样数量和样品分布，启动采样过程，对采样过程进行拍照、视频拍摄以及文字、数字记录，形成采样信息；
实验室采样信息上传单元（1.3），用于各养殖企业技术人员将采样信息上传到数据库管理模块（3），系统自动生成唯一性编号。
3.如权利要求1所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，样品检验和结果报告模块（2）包括：
检验任务下达单元（2.1），用于各实验室管理员根据采样任务向对应实验室技术人员下达检测任务；
样品检测数据记录单元（2.2），用于各实验室技术人员接收检验任务获取样品，根据监测细菌种类和监测指标，按照统一规定的检测方法开展以下检测工作：首先从样品中分离出目标菌种进行培养，再依次对目标菌种进行微生物生理生化鉴定或者微生物蛋白质指纹鉴定、药物敏感性试验、血清型鉴定、耐药基因筛查、耐药基因测序、毒力基因筛查以及菌株保藏，记录上述检测数据，并上传到数据库管理模块（3）；
结果报告编制单元（2.3），用于各实验室管理员根据对应实验室技术人员提供的检测数据编制养殖企业检验结果报告；
结果报告发送单元（2.4），用于各实验室管理员将养殖企业检验结果报告按照权限提供给养殖企业及各级管理部门用户。
4.如权利要求1所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，数据库管理模块（3）包括：
数据管理平台（3.1），用于中心实验室或各企业实验室上传检测数据，对检测数据进行分析，并将分析结果按照相应权限反馈给养殖企业及各级管理部门用户，同时提取出细菌耐药性监测数据及细菌资源数据，存储到对应数据库中；
细菌耐药性监测数据库（3.2），用于存储数据管理平台（3.1）分析得到的细菌耐药性监测数据及标准指标数据；
细菌资源库（3.3），用于存储数据管理平台（3.1）分析得到的细菌资源数据；
菌种检索单元（3.4），用于各角色用户根据权限对细菌资源数据进行检索；
数据展示单元（3.5），用于对数据管理平台（3.1）的检测数据分析结果进行展示。
5.如权利要求4所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，数据管理平台（3.1）包括：
实验室数据接口（3.1.1），用于接收中心实验室和各企业实验室技术人员上传的检测数据；
养殖企业接口（3.1.2），用于向养殖企业管理员反馈对应的检验结果报告以及饲养管理和精准用药指导报告；
数据分析单元（3.1.3），用于对中心实验室或各企业实验室技术人员上传的检测数据进行单独分析，形成养殖企业检验结果报告，以及对中心实验室及各企业实验室上传的检测数据进行统筹分析，并根据相应权限向各级管理部门进行反馈；
各级管理部门接口（3.1.4），用于各级管理部门根据权限获取区域范围内各养殖企业的细菌耐药性发展趋势、中心实验室报送的年度对应区域范围内细菌耐药性风险评估报告，以及科研院所及大专院校专家提供的技术咨询报告。
6.如权利要求5所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，实验室数据接口（3.1.1）以excel文档格式上传检验数据；
数据分析单元（3.1.3）从中心实验室或各企业实验室上传的检测数据中提取出监测指标的实际数据，从细菌耐药性监测数据库（3.2）获取预设的标准指标数据，并将监测指标的实际数据与标准数据进行比较判断，再通过预设的各数据分析模型进行解析，得到不同维度下监测指标的判断结果。
7.如权利要求5所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，专家服务模块（4）包括：
饲养管理及用药指导单元（4.1），用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块（3）的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成饲养管理及精准用药指导报告，并将饲养管理及精准用药指导报告上传到数据库管理模块（3），提供给养殖企业管理员；
技术咨询提供单元（4.2），用于科研院所及大专院校专家根据数据库管理模块（3）的统计分析结果，以及依托细菌耐药性监测数据库，形成技术咨询报告，并将技术咨询报告上传到数据库管理模块（3），提供给各级管理部门用户；
耐药性研究单元（4.3），还用于科研院所及大专院校专家根据细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据进行耐药机理和耐药传播规律研究，制定防控策略。
8.如权利要求7所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，数据管理平台（3.1）还包括：
专家接口（3.1.5），用于接收科研院所及大专院校专家上传的饲养管理及精准用药指导报告、技术咨询报告，以及向科研院所及大专院校专家反馈细菌耐药性监测数据库和细菌资源库中数据，进行耐药机理和耐药传播规律研究。
9.如权利要求5所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，细菌耐药性监测数据库（3.2）中还存储有检测技术规范或标准，并通过养殖企业接口（3.1.2）向养殖企业管理员反馈；
采样任务下达单元（1.1）下达的采样任务中包括检测技术规范或标准，样品采集记录单元（1.2）中，各养殖企业技术人员依据检测技术规范或标准的要求进行采样；
样品检验和结果报告模块（2）中，各实验室依据检测技术规范或标准的要求分离菌种、鉴定以及开展检测工作。
10.如权利要求4所述的动物源细菌耐药性监测溯源系统，其特征在于，数据库管理模块（3）还包括：
日志单元（3.6），用于记录各角色用户对数据库管理模块（3）的操作记录。
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