CN114240964A - 一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法及系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法及系统,该方法通过在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;然后基于所述初始点确定初始水平集函数,并通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;然后基于心内膜分割结果和心外膜分割结果确定底层图像的心肌区域,确定下一层图像的初始点,从而确定出下一层图像的心肌区域分割,直到待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;最后输出待分割图像的心肌区域分割结果,实现了更加准确快速地在心脏磁共振图像中分割出心肌区域。
Description
技术领域
本发明属于磁共振图像技术领域,具体涉及一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法及系统。
背景技术
心血管疾病是一种致命性疾病,其死亡率居于各类疾病之首,而心脏病远高于其他类型的心血管疾病,位列世界致死因素之首。
心脏磁共振是一种无创的检查方法,对病人没有电离辐射,不需使用含碘的对比剂,成像序列和成像参数多,可以得到各种不同对比度的心脏图像,对软组织的密度分辨率和空间分辨率高,可以清楚地显示心肌的结构,成像方向灵活,可以得到心脏的短轴位、长轴位、四腔心位、三腔心位、左室流出道位和右室流出道位等各种方位的心脏图像。
然而,由于心脏生理结构的复杂性,在心脏磁共振图像那个对心脏的分割和功能分析存在较多难题,例如:
1、图像灰度不均匀,由于射频场的不均匀性,导致心脏磁共振图像的灰度产生不均匀现象,使信号发生了混淆,表现为图像中同一个器官或组织的像素灰度会发生缓慢平滑的变化。
2、部分容积(Partial Volume,PV)效应,由于病人体位的移动、心脏的周期性运动或变化、病人的呼吸运动、扫描层厚度的影响等,使得一个像素的数值成为一个小区域的累加值,造成心脏磁共振图像中各个软组织之间边界模糊或不连续。
3、图像噪声,心脏磁共振图像成像过程中因为受仪器设备等物理因素影响,图像中经常会带有噪声,造成分割精度降低。
在具体工作场景中,分割通常是由专家手动分割完成的,这一过程耗时耗力,而且最终的分割结果不便于修改与复制,主观性较强。
因此,如何快速准确地在心脏磁共振图像中分割出心肌区域,精确地分割心室与心肌,确定心内膜和心外膜的位置,是本领域技术人员亟待解决的技术问题。
发明内容
本发明的目的是为了快速准确地在心脏磁共振图像中分割出心肌区域,提出了心脏磁共振图像心肌区域分割方法及系统。
本发明的技术方案为:一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法,包括以下步骤:
S1、在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;
S2、基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓,所述k-水平集表示心外膜轮廓;
S3、通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;
S4、基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,并根据步骤S2-S4确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;
S5、输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
进一步地,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,在所述步骤S1之前还包括通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理。
进一步地,所述双层保凸水平集分割模型具体如下式所示:
进一步地,所述双层保凸水平集分割模型还包括凸性约束,具体通过如下公式进行表示:
进一步地,所述步骤S3中并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果具体包括以下分步骤:
S31、将所述心内膜分割结果输入到所述能量函数中;
S32、通过所述能量函数在预设区间中确定最优解,所述预设区间具体为心肌厚度的上界和下界组成的区间,单位为像素;
S33、通过所述双层保凸水平集分割模型将所述最优解进行迭代更新后确定出心外膜分割结果。
进一步地,所述能量函数具体如下式所示:
对应的,本发明还提出了一种心脏磁共振图像心肌区域分割系统,所述系统包括:
选择模块,用于在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;
函数模块,用于基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓,所述k-水平集表示心外膜轮廓;
第一确定模块,用于通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;
第二确定模块,用于基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,并根据步骤S2-S4确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;
输出模块,用于输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
进一步地,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,所述系统还包括预处理模块,所述预处理模块用于通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理,然后由选择模块在预处理后的待分割图像中选择初始点。
与现有技术相比,本发明具备以下有益效果:
(1)本发明在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;然后基于所述初始点确定初始水平集函数,并通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;然后基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,从而确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;最后输出所述待分割图像的心肌区域分割结果,实现了更加准确快速地在心脏磁共振图像中分割出心肌区域,且不需要大量的训练数据以及专业的心脏区域标注结果。
(2)本发明通过各向异性扩散方法对待分割图像进行预处理,这种预处理方式克服了高斯滤波的缺陷,可以在保留图像边缘细节特征的同时去除噪声的干扰,平滑图像,增强图像边缘的对比度。
附图说明
图1所示为本发明实施例提供的一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法的流程示意图;
图2所示为本发明实施例提供的一种心脏磁共振图像心肌区域分割系统的结构示意图;
图3所示为本发明实施例中待分割图像每一层图像的质心点及自动得到的心肌区域。
具体实施方式
下面将结合本申请实施例中的附图,对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本申请一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本申请中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本申请保护的范围。
实施例1:
本申请实施例提出了一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法,如图1所示,该方法包括以下步骤:
步骤S1、在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点。
在本申请实施例中,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,在所述步骤S1之前还包括通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理。
具体的,可采集正常人或心脏疾病患者的心脏磁共振图像,这一图像数据是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,然后通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理,然后第一个处理该数据也即待分割图像的底层图像。
首先在底层图像中选择待分割的心脏区域,选择待分割的心脏区域可由人工手动选择,也可由人工智能程序进行识别划分整个的心脏区域,然后在左心室或右心室的心腔中任选一点作为初始点。
步骤S2、基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓也即心内膜水平集函数,所述k-水平集表示心外膜轮廓也即心外膜水平集函数。
双层保凸水平集分割模型是本申请提出的模型,其用于对心内膜轮廓和心外膜轮廓进行演化。
在本申请实施例中,所述双层保凸水平集分割模型具体如下式所示:
具体的,心脏磁共振图像中左心室或右心室心内膜与心外膜的准确分割问题可以用数学语言重新定义为在图像中寻找水平集函数的0-水平集与k-水平集与真实的心内膜与心外膜的最佳匹配过程,并定义出一个双层水平集函数,其中0-水平集和k-水平集分别向期望得到的心内膜与心外膜同时演化,该双层水平集函数定义为:
其中,
通过链式法则对上述公式实用最速下降法实现最小化过程,得到双层保凸水平集分割模型的演化函数为:
本发明在上述步骤的基础上融入心脏几何结构特征的解剖学只是,以保证最终的分割结果是符合医学解剖学要求的凸的结构,因此,将曲率项融入到演化函数中,即得到:
具体而言,轮廓曲线在κ<0处,曲线表现为扩张,反之,当轮廓曲线在κ≥0处,轮廓曲线收缩。换言之,曲线的凹凸性可以通过对水平集函数添加曲率约束项来刻画。
在本申请实施例中,所述双层保凸水平集分割模型还包括凸性约束,具体通过如下公式进行表示:
对曲线上的每一点,若该点处曲率κ>0,则该处曲线为凸;若该点处曲率κ<0,则该处曲线为凹。根据心脏解剖学几何特征,需对水平集函数施加约束使其曲率为正,保证最终分割结果为凸。
步骤S3、通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果。
在本申请实施例中,所述步骤S3中并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果具体包括以下分步骤:
S31、将所述心内膜分割结果输入到所述能量函数中;
S32、通过所述能量函数在预设区间中确定出最优解,所述预设区间具体为心肌厚度的上界和下界组成的区间,单位为像素;
S33、通过所述双层保凸水平集分割模型将所述最优解进行迭代更新后确定出心外膜分割结果。
式中,E为自动选取k-水平集中最优k值的能量函数,k为最优解,为心内膜水平集函数,g为边缘指示函数,dx为一体,加上积分号表示对x求积分,Ω为图像区域,x为图像像素值,δ为狄拉克函数。kmin和kmax分别是心肌厚度的上界和下界(以像素为单位)。
而上述只能实现与心外膜轮廓总体上的大致拟合,需要将最优解代入到双层保凸水平集分割模型中进行迭代更新,使得水平集函数的k-水平集通过变形最终达到理想的心外膜轮廓边界,得到左心室或右心室的心外膜的分割结果
步骤S4、基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,从而确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成。
具体的,当获取底层图像的心肌区域后,会根据质心的计算原理自动计算下一层的初始点位置,并由此初始点得到水平集函数的初始轮廓,进一步演化迭代,直到在目标边界处停止,也即按照上述步骤进行心肌区域分割,直到待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成,如图3所示。
步骤S5、输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
实施例2:
本申请实施例提供了一种心脏磁共振心肌区域分割系统,如图2所示,该系统包括:
选择模块,用于在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;
在本申请实施例中,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,所述系统还包括预处理模块,所述预处理模块用于通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理,然后由选择模块在预处理后的待分割图像中选择初始点。
函数模块,用于基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓,所述k-水平集表示心外膜轮廓;
第一确定模块,用于通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;
在本申请实施例中,所述第一确定模块,具体用于:
将所述心内膜分割结果输入到所述能量函数中;
通过所述能量函数在预设区间中确定出最优解,所述预设区间具体为心肌厚度的上界和下界组成的区间,单位为像素;
通过所述双层保凸水平集分割模型将所述最优解进行迭代更新后确定出心外膜分割结果。
第二确定模块,用于基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,并根据步骤S2-S4确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;
输出模块,用于输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
本发明实施例提供了一种计算机可读存储介质,计算机可读存储介质存储有计算机程序,执行计算机程序时实现如本发明实施例1-实施例4中所述的任意一种牙齿点云配准方法的部分或全部步骤。
本发明实施例中,计算机可读存储介质包括但不限于U盘、移动硬盘、只读存储器(ROM,Read-Only Memory)、随机存取存储器(RAM,Random Access Memory)、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
本领域的普通技术人员将会意识到,这里所述的实施例是为了帮助读者理解本发明的原理,应被理解为本发明的保护范围并不局限于这样的特别陈述和实施例。本领域的普通技术人员可以根据本发明公开的这些技术启示做出各种不脱离本发明实质的其它各种具体变形和组合,这些变形和组合仍然在本发明的保护范围内。
Claims (8)
1.一种心脏磁共振图像心肌区域分割方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
S1、在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;
S2、基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓,所述k-水平集表示心外膜轮廓;
S3、通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;
S4、基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,并根据步骤S2-S4确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;
S5、输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
2.如权利要求1所述的心脏磁共振图像心肌区域分割方法,其特征在于,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,在所述步骤S1之前还包括通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理。
5.如权利要求1所述的心脏磁共振图像心肌区域分割方法,其特征在于,所述步骤S3中并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果具体包括以下分步骤:
S31、将所述心内膜分割结果输入到所述能量函数中;
S32、通过所述能量函数在预设区间中确定最优解,所述预设区间具体为心肌厚度的上界和下界组成的区间,单位为像素;
S33、通过所述双层保凸水平集分割模型将所述最优解进行迭代更新后确定出心外膜分割结果。
7.一种心脏磁共振图像心肌区域分割系统,其特征在于,所述系统包括:
选择模块,用于在待分割图像的底层图像中选择待分割的心脏区域,并在心腔中任选一点作为初始点;
函数模块,用于基于所述初始点确定双层保凸水平集分割模型的初始水平集函数,其中,所述初始水平集函数包括0-水平集和k-水平集,所述0-水平集表示心内膜轮廓,所述k-水平集表示心外膜轮廓;
第一确定模块,用于通过所述双层保凸水平集分割模型驱动所述初始水平集函数向心内膜的轮廓处移动,从而确定心内膜分割结果,并基于所述心内膜分割结果和能量函数确定心外膜分割结果;
第二确定模块,用于基于所述心内膜分割结果和所述心外膜分割结果确定所述底层图像的心肌区域,并基于所述底层区域的心肌区域和质心的计算方法确定下一层图像的初始点,并根据步骤S2-S4确定出下一层图像的心肌区域分割,直到所述待分割图像的所有层图像中的心肌区域全部分割完成;
输出模块,用于输出所述待分割图像的心肌区域分割结果。
8.如权利要求7所述的心脏磁共振图像心肌区域分割系统,其特征在于,所述待分割图像是包括舒张期和收缩期两个阶段的空间立体数据,所述系统还包括预处理模块,所述预处理模块用于通过各向异性扩散方法对待分割图像的所有层图像进行平滑和增强的预处理,然后由选择模块在预处理后的待分割图像中选择初始点。
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Also Published As
Publication number | Publication date |
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CN114240964B (zh) | 2023-04-07 |
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