CN113825400A - 改善植物生长和产量的手段和方法 - Google Patents

Abstract

本发明涉及用于改善植物生长和/或产量的纯化的细菌菌株。本发明还涉及细菌群、微生物活性成分、农业活性成分、合成组合物和通过改善植物中具有农艺学重要性的性状和通过赋予对植物病原体感染的抗性来改善植物生长和/或产量的方法。

Description

改善植物生长和产量的手段和方法

技术领域

本发明涉及植物生物学和细菌菌株领域。更具体地，本发明提供了新的细菌菌株，其在定殖于植物后为植物提供有益特征。特别地，本文公开的组合物和方法可用于增强植物生长和/或产量。

背景技术

需要能够以更少的资源和更具环境可持续性的投入来满足食物生产需求的改进的农业植物、改进了对各种生物和非生物胁迫的响应的植物。

作物的性能主要通过针对作物基因型(例如植物育种、遗传修饰的(GM)作物)与其周围环境(例如肥料、合成除草剂、杀虫剂)之间相互作用的技术来优化。虽然这些范例已帮助增加了全球食物产量，但许多主要作物的产量增长率却停滞不前。气候变化与生产不稳定性以及不断变化的病虫害压力有关。此外，遗传操纵(GM)的作物和农用化学品对其在多个农业上重要的作物和国家的使用提出了挑战，这导致许多GM特性未被接受，并且GM作物和许多农用化学品被排除在全球市场之外。因此，迫切需要新的作物改良解决方案，更具体地说，需要创新、有效、环境可持续和公众可接受的方法来改善植物的生长、产量和农艺学上重要的其他特性。

一个有前景的实践是使用微生物来促进植物生长和产量，增加对不利条件的耐受性，或提高资源利用效率。特别是，生活在植物组织内部和周围的大量细菌支持植物的健康和生长。

WO2016200987公开了通过将植物与链霉菌属的有益内生菌联合来为植物提供益处的方法和组合物。特别地，该发明涉及改进大豆和玉米植物的组合物和方法。

WO2015035099涉及用于为农业植物、特别是甘氨酸农业植物的种子或幼苗提供益处的方法和材料。

WO2017019633公开了用于增强具有农艺学重要性的作物物种的生长和产量的细菌内生菌菌株。在实验室和生长室中已经证明了总体的生物量改进，但在温室和田间缺乏这种改进。

Liaqat等(2016)描述了来自对等根茎的内生细菌分离物。对该分离物的生化分析揭示了植物促进特性。尽管如此，没有证据表明在宿主植物中具有所述植物促进特性，也没有暗示该分离物用于作物改良和/或改进的用途。

Williamson等(2010)和Zhang等(2010)描述了土壤微生物群落，但未提及将细菌用于作物保护或改良细菌分离物，且这些研究都没有公开细菌分离株用于作物保护和/或改良的用途。

细菌通过多种机制影响植物生长，在某些情况下还通过与其他细菌的相互作用来影响植物生长。特定的细菌菌株栖息在各种宿主植物组织中，并已将其从植物叶、茎和根中分离出。已经公开了几种细菌，它们增加植物生长和/或降低对真菌、细菌、病毒或其他植物病原体引起的疾病的易感性。

然而，为了成功地提高植物的生长和/或产量，纯化的细菌菌株必须在其被布置的植物要素(plant element)或植物中保持临界群质量。此外，纯化的细菌菌株应该能够在植物生长培养基中与其他微生物的资源竞争中胜出。此外，可取的是，纯化的细菌菌株不仅降低对疾病的易感性，还有效抑制病原体的生长。

本发明旨在解决至少一些上述缺点。本发明的目的是提供改善农业植物的生长和/或产量的手段和方法。

发明内容

通过在一方面改进具有农艺学重要性的性状并在另一方面赋予对植物病原体感染的抗性，申请人鉴定出了新的细菌菌株作为植物生长和/或产量的有效促进剂。

为此，本发明涉及权利要求1至3所述的纯化的细菌菌株。

本发明还涉及权利要求4或5所述的用于改善植物生长和/或产量的细菌群。

此外，本发明涉及权利要求6所述的用于改善植物生长和/或产量的微生物活性成分。

本发明还涉及权利要求7和8所述的用于改善植物生长和/或产量的农业活性制剂和合成组合物。

在以下方面，本发明涉及权利要求9和10所述的用途。本文所述的用途通过改进具有农艺学重要性的性状来提供改进的植物生长和/或产量。本发明的另一个实施方式的用途通过有效抑制植物病原体的生长来提供改善的植物生长和/或产量。

本发明的另一方面涉及权利要求11所述的赋予植物对植物病原体感染的抗性的方法。

本发明的另一方面涉及权利要求12至17中任一项所述的通过改进具有农艺学重要性的性状来增强植物生长和/或产量的方法。

在最后一个方面，本发明涉及权利要求18所述的植物要素。

附图说明

以下对本发明的具体实施方式的附图的描述本质上仅是示例性的，并不旨在限制本教导、它们的应用或用途。

根据图1到5，左边的图显示了对处理的种子和模拟处理的种子的干生物量估计值，95％置信区间，而右边的图显示了处理的种子和模拟处理的种子之间的干生物量之差的估计值，95％置信区间。百分比表示以占模拟处理的百分比表达的干生物量之差。

图1A-1L显示了从用包含纯化细菌菌株的制剂处理的种子获得的小麦植物播种后6周时每株植物的干生物量增加的图示。保藏号B/00180(图1A)；B/00185、B/00189和B/00177(图1B)；B/00184(图1C)；B/00175、B/00192和B/00193(图1D)；B/00194(图1E)；B/00196、B/00197和B/00199(图1F)；B/00202(图1G)；B/00205(图1H)；B/00204和B/00206(图1I)；B/00207和B/00191(图1J)；B/00195(图1K)；B/00178、B/00209、B/00214和B/00211(图1L)的细菌菌株显示了每株小麦植物的干生物量增加。

图2A-2J显示了从用包含纯化细菌菌株的制剂处理的种子获得的小麦植株播种后6周时每株小麦植物的分蘖数增加的图示。保藏号B/00179(图2A)；B/00190(图2B)；B/00183(图2C)；B/00196(图2D)；B/00200(图2E)；B/00201和B/00202(图2F)；B/00205(图2G)；B/00203和B/00204(图2H)；B/00207；B/00213(图2I)；和B/00195(图2J)的细菌菌株显示了每株小麦植物的分蘖数增加。

图3显示了从用包含两种细菌菌株的制剂(在图中用“聚生体2菌株”表示)和包含六种细菌菌株的制剂(在图中用“聚生体6菌株”表示)处理的种子获得的小麦植株播种后6周时每株小麦植物的干生物量增加的图示。保藏号B/00195和B/00207的两种组合细菌菌株显示了每株小麦植物的干生物量增加。甚至是保藏号B/00178、B/00182、B/00195、B/00198、B/00202和B/00207的六种细菌菌株的组合。

图4显示了从用细菌菌株的全细胞肉汤培养物处理的种子获得的玉米植物播种后6周时每株玉米植物的干生物量增加的图示，所述细菌菌株是保藏号B/00196的根瘤菌属(Rhizobium)成员(图4A)或保藏号B/00179的短波单胞杆菌属(Brevundimonas)成员(图4B)。

图5显示了从用包含保藏号B/00178的纯化细菌菌株的制剂处理的种子获得的小麦植物播种后6周时每株植物的湿生物量增加的图示。显示了每株小麦植物的湿生物量的增加。

图6显示了增加的种子产量的图示。小麦植物获自用包含保藏号B/00196或B/00206的纯化细菌菌株的制剂处理的小麦种子。

图7显示了增加的种子产量的图示。小麦植物获自用包含保藏号B/00196或B/00202的纯化细菌菌株的制剂处理的小麦种子。

具体实施方式

定义

除非另有定义，用于公开本发明的所有术语，包括技术术语和科学术语，具有本发明所属领域的普通技术人员通常理解的含义。通过进一步的指导，包括术语定义以更好地理解本发明的教导。

如本文所用，以下术语具有以下含义：

除非上下文另有明确规定，否则本文所用的“”一个、“一种”和“所述”指的是单数和复数的所指对象。举例来说，“一个隔间”是指一个或多于一个的隔间。

如本文所用，提及诸如参数、量、持续时间等的可测量值时所用的“约”意在涵盖指定值附近+/-20％或更小、优选+/-10％或更小、更优选+/-5％或更小、甚至更优选+/-1％或更小、进一步更优选+/-0.1％或更小的变化，使得这样的变化在所公开的发明中适于实施。然而应当理解，修饰语“约”所指的值本身也被具体公开。

如本文所用，“包含”和“包括”与“含有”同义，并且是包容性或开放性术语，其指定了其后内容(例如成分)的存在，并且不排除或排斥本领域已知的或本文中公开的附加的、未列举的成分、特征、要素、构件、步骤的存在。

此外，说明书和权利要求中的术语第一、第二、第三等用于区分相似的元件并且不一定用于描述顺序或时间先后，除非另有说明。应当理解，如此使用的术语在适当的情况下是可互换的，并且本文描述的本发明的实施方式能够以不同于本文描述或图示的其他顺序进行操作。

以端点表述的数值范围包括在该范围内的所有数字和分数，以及所引用的端点。

尽管术语“一个或多个”或“至少一个”，例如一组成员中的一个或多个或至少一个成员，本身是清楚的，但通过进一步举例说明，该术语尤其包括提及任何一个所述成员，或任何两个或多个所述成员，例如所述成员中的任何≥3、≥4、≥5、≥6或≥7个等，最多至所有所述成员。

如本文所用，“菌株”或“细菌菌株”是指属于同一物种类别(包括物种)的任何原核微生物。本发明的纯化细菌菌株可以是内生菌。

“内生菌”是能够生活在植物要素(例如根际或叶际)上或植物要素内(例如内生层)或与植物要素物理接近的表面上(例如根际或种子上)的生物体。内生菌可占据植物组织的细胞内或细胞外空间，所述组织包括但不限于叶、茎、花、果实、种子或根。内生菌可以是例如细菌或真菌生物体，并且可以赋予宿主植物有益的特性，例如产量、生物量、抗性或适应性的增加。内生菌可以是真菌或细菌。如本文所用，术语“微生物”或“菌株”有时用于描述内生菌。如本文所用，如本文所述的微生物或菌株可被标记为内生菌。

如本文所用，术语“微生物”是指微生物的任何株、任何物种或分类群，包括但不限于古细菌、细菌、微藻、真菌(包括霉菌和酵母物种)、支原体、小孢子、纳米细菌、卵菌和原生动物。在一些实施方式中，微生物是细菌菌株。在一些实施方式中，微生物是内生菌，例如细菌或真菌内生菌，其能够生活在植物内。在一些实施方式中，微生物包括单个细胞(例如，单细胞微生物)或多于一个的细胞(例如，多细胞微生物)。

如本文所用，术语“细菌”通常指任何原核生物，并且可以指来自真细菌界(细菌)和/或古细菌界(古细菌)的生物。在某些情况下，由于各种原因(例如但不限于全基因组测序的新兴领域)，细菌的属已被重新分配，并且可以理解，此类命名法上的重新分配在任何要求保护的属的范围内。

术语“16S核苷酸序列”或“16S”是指细菌的16S核糖体RNA(rRNA)序列的DNA序列。16SrRNA基因测序是研究细菌系统发育和分类学的成熟方法。全长16S核酸序列的长度约为1500个核苷酸。

“生物质”是指在给定时刻一种或多种植物组织、整株植物或植物种群的总质量或重量(新鲜或干燥)。生物质通常以每单位面积的重量给出。该术语还可以指群落中的所有植物或物种(群落生物质)。

术语“纯化的”旨在特指从其原始来源移出的生物体、细胞、组织、多核苷酸或多肽。术语“纯化”并不一定反映微生物被纯化的程度。

如本文所用，“纯化的细菌菌株”是已从其自然环境中移出的菌株。术语“纯化的细菌菌株”是指除了所需菌株之外基本上没有其他菌株，因此基本上不含其他污染物，其他污染物可以包括微生物污染物。此外，如本文所用，“纯化的细菌菌株”旨在表示与通常在自然界中发现的物质分离的菌株。与其他菌株异源布置的菌株，或与自然界中通常不存在的化合物或材料共存的菌株，仍被定义为“纯化的细菌菌株”。

“植物”或“宿主植物”包括任何植物，特别是具有农艺重要性的植物，在其内部或上面异源地布置有菌株。如本文所用，当菌株在植物或微生物生命周期的至少一部分期间作为与植物或植物要素相关的菌株存在时，称该菌株定殖于植物、植物要素、根或种子。在一些实施方式中，当在一段时间内，例如一天或多天、数周、数月或数年，可以在植物或植物要素内稳定检测到菌株时，称菌株“定殖”于植物或植物要素。在此描述的一些组合物和方法涉及有效定殖植物的量的多种微生物。

核苷酸序列背景下的术语“同一性”或“相同”是指当为了最大对应而比对时两个序列中相同的核苷酸。本领域已知不同的算法可用于测量核苷酸序列同一性。核苷酸序列同一性可以通过局部或全局比对来测量，优选实施最优局部或最优全局比对算法。例如，可以利用Needleman-Wunsch算法的执行来生成全局比对。例如，可以利用Smith-Waterman算法的执行来生成局部比对。

空位是一种比对区域，其中序列不与该比对中的另一序列中的位置对齐。在全局比对中，在计算同一性之前弃去末端空位。对于局部和全局比对，内部空位被计为差异。末端空位是在比对中从序列末端开始的区域，其中该序列末端位置的核苷酸不对应比对中另一序列中的核苷酸位置，并延伸至该序列中的所有连续位置，其中该序列的核苷酸不对应于比对中的另一序列中的核苷酸位置。

术语“参照植物”或“参照物”是一个比较性术语，指的是遗传上相同但处理方式可能不同的植物。在一个实例中，两个遗传上相同的玉米植物胚胎可以分成两个不同的组，一个接受处理(例如用异源多核苷酸转化，以产生遗传修饰的植物)，另一个是未经此处理的对照，例如参照物。因此，两组之间的任何表型差异可能仅归因于该处理，而不是植物遗传组成中的任何固有性质。在另一个实例中，两个遗传相同的小麦种子可以用制剂处理，一个引入细菌群，另一个不引入。源自(例如，从这些种子生长或获得)这些种子的植物之间的任何表型差异可归因于细菌处理。

类似地，术语“参照农业植物”是指相同物种、品种或栽培品种的农业植物，其并未接受或接触本文所述的处理、制剂、组合物或细菌菌株制剂。因此，除了细菌菌株的存在以外，参照农业植物与经处理的植物相同，并且可以用作检测赋予植物的细菌菌株效果的对照。

“参照环境”是指进行测量时植物的环境、处理或条件。例如，可以在干旱胁迫的参照环境中测量与细菌菌株异源布置的植物中的化合物产量，并与相同的干旱胁迫条件下的参照农业植物中该化合物的水平进行比较。或者，可以在相同的无胁迫条件下测量与细菌菌株异源布置的植物和参照农业植物中的化合物水平。

“植物要素”旨在泛指整个植物或植物组分，包括但不限于植物组织、部分和细胞类型。植物要素优选是以下之一：整株植物、幼苗、分生组织、地面组织、维管组织、真皮组织、种子、叶、根、新枝(shoot)、茎、花、谷穗(ear)、花穗(spike)、小穗、果实、匍匐茎、鳞茎、块茎、球茎、幼株(keiki)、芽。如本文所用，“植物要素”与植物的“部分”同义，是指植物的任何部分，可以包括不同的组织和/或器官，并且始终可以与术语“组织”互换使用。此外，“植物要素”旨在泛指能够通过植物的有性或无性繁殖来长成另一植物的任何植物部分，例如但不限于：种子、幼苗、根、新枝、插枝、接穗、嫁接、匍匐茎、鳞茎、块茎、球茎、幼株或芽。

“农业植物”或“具有农艺学重要性的植物”包括由人类栽培用于食物、饲料、纤维、燃料和/或工业目的的植物。在一些实施方式中，按照本发明处理的植物(包括种子和其他植物要素)是单子叶植物。在特定实施方式中，农业植物选自由小麦(Triticum aestivum和相关品种)、大麦(Hordeum vulgare和相关品种)或玉米(Zea mays和相关品种)组成的组。

“活性制剂”是指促进纯化的细菌菌株的稳定性、储存和/或应用的化学品混合物。处理制剂可以包含任何一种或多种试剂，例如：载体、溶剂、佐剂、油、乳化剂、涂抹剂、冷冻保护剂、粘合剂、分散剂、表面活性剂、缓冲剂、增粘剂、微生物稳定剂、杀真菌剂、络合剂、除草剂、杀线虫剂、杀昆虫剂、植物生长调节剂、杀鼠剂、干燥剂、营养剂、赋形剂、润湿剂或盐。

如本文所用，“农业相容性载体”是指除水之外的能够添加到植物要素而不对该植物要素或由该植物要素生长出的植物造成或具有不利影响(例如，减少种子发芽)的任何材料。

如本文所用，“集落形成单位”或“CFU”用作样品中活微生物的量度。CFU是能够在固体培养基上形成可见集落的单个活细胞，该集落的各个细胞是由一个亲代细胞通过细胞分裂衍生而来的。

术语“上清液”是指通过离心、过滤、沉降或本领域公知的其他方式去除了肉汤中生长的细胞时剩余的液体肉汤。

术语“提取物”是指各种形式的微生物产品。所述微生物产物通过去除细菌菌株的细胞壁和/或细胞膜获得，该过程称为裂解。从而获得培养物种的细菌菌株的一种或多种内源产物。

如本文所用，微生物、植物或植物要素在其包含人工引入的遗传或表观遗传“修饰”时被“修饰”。在一些实施方式中，修饰通过基因组工程技术引入。在一些实施方式中，修饰由靶向核酸酶引入。在一些实施方式中，靶向核酸酶包括但不限于转录激活因子样效应核酸酶(TALEN)、锌指核酸酶(ZNF)、成簇调节间隔短回文重复序列(CRISPR)、CRISPR/Cas9、CRISPR/CPFL及其组合。在一些实施方式中，修饰是表观遗传修饰。在一些实施方式中，修饰通过用DNA甲基转移酶抑制剂(例如5-氮杂胞苷)或组蛋白脱乙酰酶抑制剂(例如2-氨基-7-甲氧基-3H-吩噁嗪-3-酮)进行处理来引入。在一些实施方式中，修饰通过组织培养引入。在一些实施方式中，经修饰的微生物、植物或植物要素包含转基因。

本说明书中引用的所有参考文献均通过引用整体并入本文。特别地，本文具体提及的所有参考文献的教导通过引用并入。

除非另有定义，用于公开本发明的所有术语，包括技术术语和科学术语，具有本发明所属领域的普通技术人员通常理解的含义。通过进一步的指导，在说明书中使用的术语的定义是为了更好地理解本发明的教导。此处使用的术语或定义仅用于帮助理解本发明。

在整个说明书中，提及“一个实施方式”或“实施方式”意味着结合该实施方式描述的特定特征、结构或特性包括在本发明的至少一个实施方式中。因此，在本说明书中的各个地方出现的短语“在一个实施方式中”或“在实施方式中”不一定都指代相同的实施方式，而是可以。此外，在一个或多个实施方式中，特定特征、结构或特性可以以任何合适的方式组合，如本领域技术人员从本公开中显而易见的。此外，虽然本文描述的一些实施方式包括其他实施方式中的一些但不是所有特征，但意在将不同实施方式的特征的组合包含在本发明的范围内，并且形成不同的实施方式，这是本领域技术人员将理解的。例如，在以下权利要求中，可以以任何组合使用任何要求保护的实施方式。

多种多样的植物相关微生物可以通过多种方式对植物健康和生理学产生正面影响。本发明中描述的细菌菌株为植物、特别是农业植物(例如小麦、大麦和玉米)提供了若干显著优势。

在第一方面，本发明涉及纯化的细菌菌株，其中所述菌株可用于改善植物生长和/或产量，其中所述细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。优选地，所述菌株具有与选自由SEQ IDNO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29组成的组的序列具有至少95％同一性的16S序列。优选地，所述纯化的细菌菌株包含至少一个与选自SEQ ID NO:1至30的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

在本发明的一个实施方式中，纯化的细菌菌株包含至少一个表1中描述的16S核苷酸序列。换言之，纯化的细菌菌株包含至少一个与表1中所述的16S核苷酸序列相同、即100％相同的16S核苷酸序列。优选地，所述菌株具有与选自SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的序列相同的16S序列。

在另一个实施方式中，纯化的细菌菌株包含一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。在另一个实施方式中，所述纯化的细菌菌株包含一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

在另一个或其他实施方式中，纯化的细菌菌株包含两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列拷贝。在一个具体实施方式中，所述纯化的细菌菌株包含两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

在另一个实施方式中，纯化的细菌菌株包含至少两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少两个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少两个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列拷贝。在另一个或其他实施方式中，所述纯化的细菌菌株包含至少两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

根据另一个实施方式中，纯化的细菌菌株包含至少三个、优选至少四个、至少五个、至少六个、至少七个、至少八个、至少九个、至少十个、至少十一个、至少十二个、至少十三个、至少十四个、至少十五个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少两个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少两个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列拷贝。在另一个或其他实施方式中，所述纯化的细菌菌株包含至少两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ IDNO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

根据另一个实施方式中，纯化的细菌菌株包含多拷贝的与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少两个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少两个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列拷贝。在另一个或其他实施方式中，所述纯化的细菌菌株包含至少两个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

在一个优选实施方式中，纯化的细菌菌株可用于改善植物中具有农艺学重要性的性状，其中所述细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

在更优选的实施方式中，纯化的细菌菌株可用于使植物克服胁迫条件，例如营养胁迫，其中所述细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

在另一个实施方式中，纯化的细菌菌株可用于赋予植物对植物病原体感染的抗性，其中所述细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

在更优选的实施方式中，纯化的细菌菌株可用于赋予植物对镰刀菌属(Fusarium)感染的抗性，其中所述细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:20、23或30组成的组的或表1中描述的至少一个序列具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

本发明的纯化的细菌菌株可用于在植物、植物要素和生长培养基中赋予对植物病原体感染的抗性。

在一个优选实施方式中，纯化的细菌菌株根据布达佩斯条约的条款保藏在波兰微生物保藏中心，保藏号分别为：B/00182、B/00183、B/00184、B/00195、B/00196、B/00197、B/00199、B/00200、B/00201、B/00202、B/00203、B/00204、B/00205、B/00206、B/00213、B/00175、B/00194、B/00198、B/00207、B/00191、B/00192、B/00193、B/00177、B/00180、B/00185、B/00189、B/00190、B/00179、B/00178、B/00223。

在一个实施方式中，纯化的细菌菌株改进了植物生长和/或产量，并且所述菌株以以下保藏号保藏：B/00182、B/00183、B/00184、B/00195、B/00196、B/00197、B/00199、B/00200、B/00201、B/00202、B/00203、B/00204、B/00205、B/00206、B/00213、B/00175、B/00194、B/00198、B/00207、B/00191、B/00192、B/00193、B/00177、B/00180、B/00185、B/00189、B/00190、B/00179、B/00178或B/00223。优选地，所述菌株以以下保藏号保藏：B/00182、B/00184、B/00195、B/00196、B/00197、B/00202、B/00203、B/00205、B/00206、B/00213、B/00207、B/00192或B/00178。

在本发明的另一个实施方式中，16S核苷酸序列同一性在至少100个核苷酸的比对区域上确定。在一个优选实施方式中，16S核苷酸序列同一性在至少100个核苷酸的比对区域上确定，包括任何内部空位。

在另一个实施方式中，16S核苷酸序列同一性在至少200个核苷酸、更优选至少300个核苷酸、更优选至少400个核苷酸、更优选至少500个核苷酸的比对区域上确定。在优选实施方式中，16S核苷酸序列同一性在至少200个核苷酸、优选至少300个核苷酸、优选至少400个核苷酸、更优选至少500个核苷酸的比对区域上确定，包括任何内部空位。在更优选的实施方式中，16S核苷酸序列同一性在考虑全长16S序列核苷酸的比对区域上确定。

在第二个方面，本发明涉及包含一种以上、优选两种以上纯化的细菌菌株的细菌群，其中所述菌株如本发明所述。

本发明的细菌群包含一种以上、优选两种以上(例如3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25种或多于25种)纯化的细菌菌株，其中所述菌株来自不同的细菌科或不同的细菌属，或来自同一细菌属但不同的细菌物种。分类学上的不同菌株可以获自同一植物栽培品种、同一植物的不同栽培品种、或同一类型植物的不同物种。细菌菌株可以获自植物生长的土壤。在使用一种以上、优选两种以上纯化的细菌菌株的实施方式中，每种细菌菌株可具有不同的性质或活性，例如产生不同的代谢物、产生不同的酶、赋予不同的有益性状。

优选地，所述细菌群中的纯化的细菌菌株以大约等量存在。优选地，当所述制剂是液体制剂时，所述细菌群中每种纯化的细菌菌株的浓度为至少10^2CFU/ml或孢子/ml，至少10^2CFU/ml或孢子/ml，至少10^4CFU/ml或孢子/ml，至少10^5CFU/ml或孢子/ml，至少10^6CFU/ml或孢子/ml，至少10^7CFU/ml或孢子/ml，至少10^8CFU/ml或孢子/ml，至少10^9CFU/ml或孢子/ml，或至少10^10CFU/ml或孢子/ml。更优选地，当所述制剂是液体制剂时，所述细菌群中每种纯化的细菌菌株的浓度为10^3至10^10CFU/ml或孢子/ml、10^4至10^10CFU/ml或孢子/ml、10^5至10^10CFU/ml或孢子/ml、10^6至10^10CFU/ml或孢子/ml、10^6至10^9CFU/ml或孢子/ml、10^7至10^9CFU/ml或孢子/ml、或10^8至10^9CFU/ml或孢子/ml。当所述制剂是非液体制剂时，所述细菌群中每种纯化的细菌菌株的浓度与液体制剂中的浓度相似，如上所述，但表示为CFU/mg非液体制剂。

本发明中描述的纯化的细菌菌株能够定殖于植物。成功的定植可以通过检测植物中菌株的存在来确认。例如，在将菌株施加于植物要素后，可以在从所述植物要素发育出的植物的根和新枝中检测到高滴度的该菌株。检测植物中菌株的存在可以通过在对植物要素或植物进行表面灭菌后测量菌株的活力来完成：菌株定植导致了菌株的内部定位，使其对表面灭菌条件具有抗性。菌株的存在和数量也可以使用本领域已知的其他方式来确定，例如，使用微生物特异性抗体的免疫荧光显微术，或荧光原位杂交。或者，可以使用识别来自菌株的保守序列的特异性核酸探针来扩增区域，例如通过定量PCR来扩增，并通过标准曲线与CFU相关联。

在某些情况下，本文所述的菌株能够从一种组织类型移动到另一种组织类型。例如，本发明在处理植物要素的外部后对植物成熟组织内的菌株进行的检测和分离证明了它们具有从该植物要素移动到成熟中的植物的营养组织中的能力。因此，在一些实施方式中，细菌菌株群能够从外部的植物要素移动到植物的营养组织中。在一些实施方式中，布置在植物的植物要素上的菌株能够在植物要素发育成营养状态时定位于植物的另一组织。例如，菌株能够定位于植物中的任一种组织，包括：根、不定根、种子根、根毛、新枝、叶、花、谷穗、花穗、小穗、芽、雄花穗、分生组织、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实、匍匐茎、根状茎、根瘤、块茎、毛状体、保卫细胞、水囊、花瓣、萼片、颖片、轴、维管形成层、韧皮部和木质部。在一个实施方式中，菌株能够定位于植物的根和/或根毛。在另一实施方式中，菌株能够定位于光合组织，例如植物的叶和新枝。在其他情况下，菌株定位于植物的维管组织，例如木质部和韧皮部。在又一个实施方式中，菌株能够定位于植物的生殖组织(花、花粉、雌蕊、子房、雄蕊、果实、花穗、小穗)。在另一个实施方式中，菌株能够定位于植物的根、新枝、叶和生殖组织。在又一个实施方式中，菌株定殖于植物的果实或植物要素组织。在又一个实施方式中，菌株能够定殖植物以使其存在于植物表面中(即，其可检测地存在于植物外部)。在其他实施方式中，菌株能够定位于植物的基本上所有或所有组织。在某些情况下，菌株能够在宿主植物内复制并定植于该植物。

在一个实施方式中，纯化的细菌菌株或细菌群可以在培养基上培养，或可以适于在培养基上培养。所述培养基在接种所述细菌菌株之前是无菌的，并且包含供菌株在培养基上生长和维持的所有营养物。此外，培养基可以是固体、半固体或液体形式。

在以下方面，本发明涉及用于改善植物生长和/或产量的微生物活性成分，其中所述成分包含一种或多种从培养物中分离出的物质，在所述培养物中培养了本发明的纯化的细菌菌株或本发明的细菌群.

优选地，微生物活性成分包含一种或多种从细菌培养物中分离出的物质，所述培养物包含本发明的一种或多种细菌菌株或细菌群。

细菌菌株产生过多的小化合物和次级代谢物，它们可以分泌在培养物中或内源性储存。因此，在一个具体实施方式中，来自已培养了本发明的细菌菌株或细菌群的培养物的上清液可用于改善植物生长和/或产量。在另一个实施方式中，来自已培养了本发明的细菌菌株或细菌群的培养物的提取物或提取物级分可用于改善植物生长和/或产量。内源性产物的非限制性实例是氨基酸、肽、酶、次级代谢物、维生素、矿物质。去除培养物中的细菌菌株的细胞壁和/或细胞膜可以通过本领域技术人员熟知的几种程序实现。非限制性实例是向所述培养物中加入化学品、加热所述培养物或以机械方式诱导裂解。提取物也可以通过细菌菌株的自溶获得。

在一个优选实施方式中，微生物活性成分包括孢子悬浮液、喷雾干燥的孢子或全细胞肉汤。

为了将纯化的细菌菌株或细菌群施用于植物、植物要素或生长培养基，适当的是将菌株配制在制剂或组合物中，其中所述制剂或组合物还可包含其他生物制品或农用化学品以模拟植物生长。

在某些实施方式中，基于与常用的生物制品或农用化学品的相容性来选择菌株。植物，特别是农业植物，可以用许多生物制品或农用化学品进行处理。

在某些情况下，为了在植物中持久存在，菌株与生物制品或农用化学品(特别是那些具有络合性的)的相容可能很重要，但存在许多在至少足以干扰菌株的浓度下不会渗透植物的此类络合剂。因此，在植物中使用系统性络合剂的情况下，待接种的菌株与此类试剂的相容性将是一个重要的标准。在一个实施方式中，与生物制品或农用化学品相容的纯化的细菌菌株可用于根据本文所述的方法接种植物、植物要素或生长培养基。

也可以通过在液体培养基上进行选择来分离杀细菌剂相容性菌株。菌株培养物可以铺在培养皿上，无需任何形式的诱变；或者，可以使用本领域已知的任何方法诱变菌株。例如，在包含杀真菌剂的培养基上进行选择之前，菌株培养物可以暴露于紫外线、伽马辐射或化学诱变剂，例如甲磺酸乙酯(EMS)、溴乙锭(EtBr)、敌敌畏(DDVP)、甲磺酸甲酯(MMS)、磷酸三乙酯(TEP)、磷酸三甲酯(TMP)、亚硝酸或DNA碱基类似物。最后，在特定杀细菌剂的作用机制已知的情况下，可以特异性突变靶基因(通过基因缺失、基因替换、定点诱变等)以产生对该特定化学物质有适应力的菌株。值得注意的是，上述方法可用于分离与细菌抑制化合物和杀细菌化合物均相容的菌株。

可以在样品中检测到产生的生物制品或农用化学品相容性菌株。例如，在引入转基因以使菌株与生物制品或农用化学品相容的情况下，转基因可用作通过PCR扩增和检测的靶基因。此外，当对特定基因或多个基因的一部分进行点突变或点缺失导致与生物制品或农用化学品相容时，独特的点突变同样可以通过PCR或本领域已知的其他方法来检测。即使菌株不再存活，也可用此类方法检测菌株。

此外，本发明涉及一种农业活性制剂，其包含农业相容性载体和一种或多种细菌菌株或细菌群，所述细菌菌株或细菌群的浓度在液体制剂中为至少约10^2CFU/ml或孢子/ml或在非液体制剂中为约10^2CFU/mg，其中所述细菌菌株和细菌群如本文所述。

优选地，所述农业相容性载体可以是天然或合成的有机或无机材料，所述载体与细菌菌株或衍生自所述细菌菌株的培养物的产物组合以促进将它们应用到植物要素、植物或植物生长培养基中。此外，所述载体通常是惰性的并且必须对于农业应用是可接受的。本领域普通技术人员可以容易地确定要使用的适当载体。

所述农业活性制剂的非限制性实例是可溶性粉剂、可溶性颗粒剂、可湿性颗粒剂、片剂制剂、干流动剂、水性流动剂、可湿性分散颗粒、油分散体、悬浮浓缩物、可分散浓缩物、可乳化的浓缩物、水悬浮液、肥料颗粒或喷雾剂。

在一个优选实施方式中，所述农业活性制剂包含至少一种油、表面活性剂和聚合物。优选地，所述制剂还包含以下一种或多种：杀真菌剂、杀线虫剂、杀细菌剂、杀昆虫剂、杀软体动物剂、杀藻剂、除草剂、肥料、微量营养素肥料材料、稳定剂、防腐剂、载体、络合剂或其任意组合。在一个优选实施方式中，该制剂的细菌菌株和细菌群是贮存稳定的，并且所述制剂是贮存稳定的。可选地，贮存稳定的制剂是干制剂、粉末制剂或冻干制剂。在一些实施方式中，将制剂配制成提供菌株的稳定性。在一个实施方式中，制剂在约-20℃至约50℃的温度下基本稳定至少约1、2、3、4、5或6天，或1、2、3或4周，或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月，或一年或多年。在另一个实施方式中，制剂在约4℃至约37℃的温度下基本稳定至少约5、10、15、20、25、30天或超过30天。

在另一个实施方式中，农业活性制剂包含农业相容性载体和一种或多种微生物活性成分，所述微生物活性成分的浓度在液体制剂中为至少约10^2CFU/ml或孢子/ml，或在非液体制剂中为约10^2CFU/mg，其中所述微生物活性成分如本发明中所述。优选地，一种或多种微生物活性成分的浓度可有效改善植物生长和/或产量。

在一个优选实施方式中，在农业活性制剂中本发明的任何细菌菌株与植物要素是异源布置的。在另一个优选实施方式中，在农业活性制剂中本发明的任何细菌群与植物要素是异源布置的。在另一实施方式中，在农业活性制剂中本发明的任何微生物活性成分与植物要素是异源布置的。除了植物要素之外，植物本身或使植物或植物要素生长的生长培养基可以用本发明的任何细菌菌株、细菌群、微生物活性成分或农业活性制剂处理。

在另一方面，本发明提供了一种合成组合物，其包含植物要素和与所述植物要素异源布置的细菌菌株或细菌群，其中所述细菌菌株或细菌群如本发明所述，并且其中，与不进一步包含菌株或细菌群的参照植物要素相比，该合成组合物能够改善植物生长和/或产量。

在优选的实施方式中，合成组合物包含植物要素和与所述植物要素异源布置的细菌群。在更优选的实施方式中，合成组合物包含植物要素和与所述植物要素异源布置的微生物活性成分。

在另一个实施方式中，本文所述的任何合成组合物是贮存稳定的。细菌菌株可以是贮存稳定的，其中在以干燥形式(即水分含量为30％以下)在4℃或室温下储存1、2、3、4、5、6、7、8、9、10周或超过10周后至少0.01％的CFU是存活的。可选地，贮存稳定的组合物为干燥组合物、粉末组合物或冻干组合物。在一些实施方式中，将组合物配制成提供菌株的稳定性。在一个实施方式中，组合物在约-20℃至约50℃的温度下基本稳定至少约1、2、3、4、5或6天，或1、2、3或4周，或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月，或一年或多年。在另一个实施方式中，组合物在约4℃至约37℃的温度下基本稳定至少约5、10、15、20、25、30天或大于30天。优选地，组合物在约4℃至约37℃的温度下基本稳定至少一年或大于一年。

在另一实施方式中，本文所述的任何合成组合物还包含植物要素，其中所述植物要素是种子，可选地，其中种子被修饰。优选地，将植物要素置于促进植物生长的基质中，可选地置于土壤中。在特定实施方式中，多个所述植物要素成行放置在土壤中，每行内的每个种子之间具有基本相等的间距。

在另一个实施方式中，本文所述的任何合成组合物进一步包含稳定剂、防腐剂、载体、表面活性剂、络合剂或其任何组合中的一种或多种和/或以下中的一种或多种：杀真菌剂、杀线虫剂、杀细菌剂、杀昆虫剂或除草剂。

在一个优选实施方式中，本文所述的任何合成组合物被限制在选自由以下组成的组的物体内：瓶、罐、安瓿、包装、器皿、袋、盒、箱、信封、纸箱、容器、筒仓、运输容器、卡车床或外套。

在与该方面相关的优选实施方式中，本发明涉及由先前实施方式中所述的合成组合物生长的植物，其中所述植物表现出具有农艺学意义的性状，该性状选自由以下组成的组：抗病性、耐旱性、耐热性、耐寒性、耐盐性、耐金属性、耐除草剂性、耐化学性、水分利用效率改善、磷溶解改善、磷动员改善、氮利用改善、固氮作用改善、抗害虫性、食草动物抗性、病原体抗性、产量增加、缺水条件下的产量增加、健康增强、活力改善、生长改善、植物出苗改善、光合能力改善、营养增强、蛋白质含量改变、油含量改变、生物量增加、每株分蘖数增加、新枝长度增加、根长度增加、根结构改善、种子重量增加、种子碳水化合物组成改变、种子油组成改变、胚根长度增加、衰老延迟、保持绿色、种子蛋白组成改变、成熟植物生殖要素干重增加、成熟植物生殖要素鲜重增加、每株成熟植物生殖要素数量增加、叶绿素含量增加、每株枯萎叶数减少、每株严重枯萎叶数减少、每株未枯萎叶数增加、或植物视觉外观改善。

在一些实施方式中，本发明使用与植物或植物要素异源的微生物来制备微生物活性成分、农业活性制剂或合成组合物。如果未经处理的植物、植物要素或植物生长培养基(例如，未用本文所述的细菌菌株处理的种子)不含有可检测水平的微生物，则认为该微生物与所述植物、植物要素或植物生长培养基是异源的。当以在施加微生物之前在植物上未发现的数量将该微生物施加或布置在植物上时，认为该微生物是“异源布置”在该植物或植物组织的外表面上或内部。例如，布置在种子外表面上或内部的纯化的细菌菌株可以是可与成熟植物相关但在种子表面或种子内未发现的内生细菌。因此，当将微生物施加到既不在用于布置微生物的表面或特定组织内部天然地含有该微生物、也不在表面或特定组织内部天然地含有所施加数量的该微生物的植物上时，该微生物视为是异源布置的。

在另一个实施方式中，菌株是异源布置的，例如以在成熟植物中可检测到的有效量布置在植物的生殖要素的表面上。在一个特定实施方式中，以在成熟植物中可检测到的有效量来异源布置菌株，其量为至少约100CFU、100至200CFU、至少约200CFU、200至300CFU、至少约300CFU、300至400CFU、至少约500CFU、500至1,000CFU、至少约1,000CFU、1,000至3,000CFU、至少约3,000CFU、3,000至10,000CFU、至少约10,000CFU、10,000至30,000CFU、至少约30,000CFU、30,000至100,000CFU、至少约100,000CFU或更多。

在又一方面，本发明涉及上述细菌菌株、细菌群、微生物活性成分、农业活性制剂或合成组合物，其用于通过改善植物中的具有农艺学重要性的性状来改善植物生长和/或产量。

与参照植物相比，所述细菌菌株能够增加经处理的植物的营养吸收和/或营养利用效率。此外，与参照植物相比，所述细菌菌株能够增加经处理的植物的固氮能力或磷吸收。特别地，与参照植物相比，所述细菌菌株能够增加经处理的植物的生物量的量。优选地，与参照植物相比，所述细菌菌株能够增加经处理的植物的每株植物的分蘖数。优选地，这些具有农艺学重要性的性状的改善导致植物生长增加，更具体地导致产量增加。

例如，纯化的细菌菌株可以在植物中提供改善的具有农艺学重要性的性状，与在相同条件下生长的参照植物相比，所述改善为至少3％、3％至5％、至少5％、5％至10％、至少10％、10％至15％，例如至少15％、15％至20％、至少20％、20％至30％、至少30％、30％至40％、至少40％、40％至50％、至少50％、50％至60％、至少60％、60％至75％、至少75％、75％至100％、至少100％、100％至150％、至少150％、150％至200％、至少200％、200％至300％、至少300％或更多。

本发明的细菌群和微生物活性成分改善了植物中与如上所述相同的具有农艺重要性的性状。

本发明的一个方面还涉及如前所述的细菌菌株、细菌群、微生物活性成分、农业活性制剂或合成组合物，其用于通过有效抑制植物病原体(优选镰刀菌属的植物病原体)的生长来改善植物生长和/或产量。

细菌菌株、细菌群、微生物活性成分、农业活性制剂或合成组合物的用于赋予对植物病原体感染的抗性的所述用途是生物控制的有效和生态应用。

镰刀菌属是丝状真菌的一个大属，广泛分布于土壤中并与植物相关。一些镰刀菌属物种在谷类作物中产生真菌霉素，如果它们进入食物链则能够影响人类和动物的健康。

预期可通过改善植物的农艺学重要特征和/或通过赋予植物对植物病原体感染的抗性来设法改善植物生长和/或产量。

本文所述的方法还可用于包含一种或多种外源转基因的转基因植物，例如，以产生由新引入的细菌菌株赋予的额外性状益处。

在另一方面，本发明涉及一种通过用纯化的细菌菌株、细菌群、微生物活性成分或农业活性制剂处理植物来赋予所述植物对植物病原体感染的抗性的方法，其中所述菌株、群、成分或制剂如本发明中所述。

在与该方面相关的另一实施方式中，本发明还提供一种通过用本文所述的菌株、群、成分或制剂处理植物要素来赋予所述植物要素对植物病原体感染的抗性的方法。

在另一个实施方式中，本发明提供了一种通过用本文所述的菌株、群、成分或制剂处理植物和/或该植物生长的植物和/或生长培养基来赋予该植物对植物病原体感染的抗性的方法。在与该方面相关的另一实施方式中，本发明还提供了一种通过用本文所述的菌株、群、成分或制剂处理植物要素和/或培养该植物要素的植物生长培养基来赋予该植物要素对植物病原体感染的抗性的方法。优选地，通过用本文所述的菌株、群、成分或制剂处理(例如喷洒)植物谷穗来提供赋予植物对镰刀菌属感染的抗性的方法。优选地，用本发明的菌株、群、成分或制剂处理小麦谷穗、花穗、小穗、茎和/或叶以赋予对镰刀菌属感染的抗性。更优选地，在赋予对镰刀菌属感染的抗性的方法中，使用保藏号为B/00177、B/00191和/或B/00XXX的菌株、群、成分或制剂。可选地，可以用本文所述的菌株、群、成分或制剂处理植物生长培养基(例如土壤)以赋予对土壤传播的植物病原体的抗性。

用纯化的细菌菌株、细菌群、微生物活性成分、农业活性制剂处理植物要素、植物或植物生长培养基，赋予了对植物病原体感染的抗性。此外，所述处理有效地抑制植物病原体在植物要素、植物或植物生长培养基中的生长，其中所述植物要素、植物或植物生长培养基被所述植物病原体感染。

结果，可以在经处理的农业植物中防止植物病原体感染。并且如果农业植物被植物病原体感染，在没有针对植物病原体处理所述植物或针对植物病原体进行了错误的处理时，上述处理会导致植物病原体的生长抑制。尽管有病原体感染，但可以改善植物生长和/或产量。

在以下方面，本发明涉及改善植物生长和/或产量的方法，所述方法包括用有效量的纯化的细菌菌株、细菌群或微生物活性成分处理植物要素的步骤，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量，其中，所述纯化的细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，所述细菌群包含一种以上、优选两种以上所述菌株，并且所述微生物活性成分包含一种以上从培养所述细菌菌株或所述细菌群的培养物中分离出的物质。

优选地，所述纯化的细菌菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有95％至96％、至少96％、96％至97％、至少97％、97％至98％、至少98％、98％至99％、至少99％、至少99.1％、至少99.2％、至少99.3％、至少99.4％、至少99.5％、至少99.6％、至少99.7％、至少99.8％、至少99.9％同一性的16S核苷酸序列。

如本文所用，认为纯化的细菌菌株赋予了改善的农业性状，无论该改善的性状是来自植物、菌株、或植物与细菌菌株之间的协作。因此，例如，无论植物或菌株是否产生有益的激素或化学物质，出于多种目的，将认为与未异源布置所述菌株的参照植物相比所述菌株已赋予宿主植物改善的农艺学性状。

在一个优选实施方式中，纯化的细菌菌株以有效量异源布置于植物要素，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的农艺学重要性状，其中所述纯化的细菌菌株如本发明所述。在一个优选实施方式中，异源布置于植物要素的菌株量能够有效地维持所述植物要素中的临界群质量。在另一个实施方式中，异源布置于植物要素的菌株量能够有效地维持从所述植物要素发育成的成熟植物中的临界群质量。

在一个更优选的实施方式中，细菌群、微生物活性成分、农业活性制剂或合成组合物以有效量异源布置于植物要素，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的农艺学重要性状，其中所述群、成分、制剂或组合物如本发明中所述。

在一个实施方式中，所述植物要素被修饰。本领域技术人员熟悉多种常规的和更先进的修饰植物要素的方法。根据另一个实施方式，植物要素是具有固有的植物繁殖特征的任何植物要素。由于植物的全能性，可以使用植物的任何部分(例如茎切段、叶切片、根的一部分)，但它通常是高度分生组织部分，例如根和茎末端、芽、块茎、鳞茎、根茎、匍匐茎或用于营养繁殖的任何植物部分。在有性繁殖中，植物要素是种子或孢子。根据优选实施方式，植物要素是根或种子的一部分。优选地，小麦谷穗、花穗、小穗、茎和/或叶被修饰。

在一些实施方式中，本发明的植物要素包括野生植物和驯化品种。植物要素可以通过任何技术来开发，包括但不限于定向进化、选择、标记辅助选择、杂交、异交、回交、近交、多倍化、反向育种、双单倍体、诱导突变、其他遗传或表观遗传修饰，及其组合。

在一个实施方式中，预期本发明的植物、更特别是农业植物是小麦(Triticumaestivum和相关品种)、大麦(Hordeum vulgare和相关品种)或玉米(Zea mays和相关品种)。

在另一方面，本发明涉及一种改善植物生长和/或产量的方法，所述方法包括用有效量的第一纯化细菌菌株和第二纯化细菌菌株处理植物要素的步骤，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量，其特征在于，所述第一菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列；且所述第二菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

所述第一和第二纯化细菌菌株为本发明中描述的纯化的细菌菌株。在与该方面相关的一个实施方式中，第一和第二细菌菌株是分类学相同的两种细菌菌株。特别地，所述菌株源自相同的细菌科、属或种。所述菌株可在菌株水平上不同。可选地，与该方面相关的第一和第二细菌菌株是分类学不同的两种细菌菌株。具体地，所述菌株源自不同的细菌科或不同的细菌属，或来自同一细菌属但不同的细菌物种。分类学上不同的菌株可以从同一植物栽培品种、同一植物的不同栽培品种、或同一类型植物的不同物种中获得。在使用两种细菌菌株的实施方式中，每种细菌菌株可具有不同的性质或活性，例如产生不同的代谢物、产生不同的酶、赋予不同的有益形状、显示协同效应。

在另一个实施方式中，额外的第三纯化细菌菌株以有效量异源布置于植物要素，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够改善源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量。优选地，用有效量的一种以上、优选两种以上纯化的细菌菌株处理植物要素，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量。特别地，用有效量的细菌群处理植物要素，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量能够增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量。在另一个实施方式中，有效量的一种以上、优选两种以上纯化的细菌菌株异源布置于植物要素，所述有效量能够抑制镰刀菌属植物病原体在由经处理的植物要素生长的植物上的生长。

本发明还公开了一种改善植物生长和/或产量的方法，所述方法包括：用纯化的细菌菌株、细菌群或微生物活性成分接种植物生长培养基的步骤；和在所述培养基中使植物生长的步骤，其中，所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，所述细菌群包含一种以上、优选两种以上所述菌株，并且所述微生物活性成分包含一种以上从培养所述细菌菌株或所述细菌群的培养物中分离出的物质。

植物生长培养基的接种可以使用例如但不限于液体、粉末、颗粒、丸剂来进行。植物、特别是农业植物可以在植物生长培养基中生长。在一个实施方式中，所述植物生长培养基是土壤、沙、砾石、多糖、护根物、堆肥、泥炭苔藓、稻草、原木、粘土或其组合。在另一个实施方式中，植物生长培养基还可以包括水培系统或体外培养系统。

在一个具体实施方式中，提供了一种改善植物的生长和/或产量的方法，其中所述植物没有疾病和/或病原体压力和/或害虫生物。在一个优选实施方式中，提供该方法以抑制植物病原体的生长。

水培是在无土培养基或水生环境中使植物生长，而体外培养系统是指在无菌条件下、在受控环境中和在缩小空间内在具有合成培养基的接收器上或接收器内使植物或外植体生长。外植体是指植物的各个部分，从所有地上部分到分离的细胞，例如叶、根、种子、球茎、块茎、芽的部分。对于水培或体外培养，可以在播种之前、期间和/或之后或在植物生长周期开始之前、期间和/或之后用纯化的细菌菌株、细菌群或微生物活性成分接种所述植物生长培养基。接种可以在植物生长周期中进行一次或多次。

在以下方面，本发明提供了一种通过用一种或多种纯化的细菌菌株人工接种植物来改善植物生长和/或产量的方法，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，并且其中将所述菌株作为粉末、丸粒、颗粒或液体施加至所述植物。

在一个优选实施方式中，本发明提供了一种通过用本发明所述的细菌群、微生物活性成分或农业活性制剂人工接种植物来改善所述植物的生长和/或产量的方法。

在另一个实施方式中，本发明提供了一种通过用一种或多种纯化的细菌菌株人工接种植物的植物要素(特别是根)来增强所述植物的植物生长和/或植物产量的方法，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，并且其中将所述菌株作为粉末、丸粒、颗粒或液体施加至所述植物。

在本发明的一个更优选的实施方式中，提供了一种通过用一种或多种纯化的细菌菌株、细菌群、微生物活性成分或农业活性制剂人工接种植物来增强所述植物的植物生长和/或植物产量的方法，其中以有效量施加所述菌株、群、成分或制剂，所述有效量使所述植物产生的果实或种子的生物量和/或产量与参照农业植物的果实或种子相比增加至少1％、至少2％、至少3％、至少5％、至少10％、至少15％、至少20％、至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少90％、至少100％或更多。

在另一方面，本发明涉及一种处理植物的种子以改善植物生长和/或产量的方法，所述方法包括：用包含农业上可接受的载体和纯化的细菌菌株的农业活性制剂机械地或手动地接种多个植物种子，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的16S核苷酸序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，其中用有效量的所述菌株接种种子，所述有效量使得能够定殖于由接种的种子发育成的植物，并且与由在相同条件下生长和播种的参照种子发育成的植物相比能够增加由接种的种子发育成的植物的种子产量。

在另一个实施方式中，该方法涉及用农业活性制剂接种植物种子，其中所述制剂包含农业上可接受的载体和本发明的纯化细菌菌株、细菌群或微生物活性成分。

在与该方面相关的优选实施方式中，种子被细菌菌株涂覆、与细菌菌株一起培养或种植在细菌菌株附近，使得菌株能够定殖于种子。

本发明的另一方面还涉及用根据本发明的农业活性制剂涂覆的植物元件，例如种子。也可以将纯化的细菌菌株或微生物聚生体作为涂层施加到植物元件上。

本发明还涉及一种制备合成组合物的方法，其中所述方法包括用细菌菌株处理植物要素的步骤，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的16S核酸序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列，其中，与由未用所述组合物处理的植物要素生长成的参照植物相比，所述细菌菌株在所述组合物中的存在量能够在由所述植物要素生长成的植物中调节选自由基因转录、转录物水平、蛋白表达、激素水平、代谢物水平和内源微生物群组成的组的至少一种农艺学重要的植物性状。

本发明的一个优选实施方式涉及一种制备合成组合物的方法，其中所述方法包括用细菌菌株、细菌群或微生物活性成分处理植物要素的步骤，其中所述菌株、群和成分在如本文所述。

在制备合成组合物的方法的一个优选实施方式中，细菌菌株的存在量为每个植物要素至少约10^2CFU。在制备合成组合物的方法的一个更优选的实施方式中，细菌菌株的存在量为每株从植物要素生长成的植物至少约10^2。

优选地，细菌菌株以在选自果实、种子、叶或根或其部分的成熟植物靶组织内可检测的有效量存在于植物要素上。例如，在成熟植物中，细菌菌株可以以至少约100CFU或孢子、100至200CFU或孢子、至少约200CFU或孢子、200至300CFU或孢子、至少约300CFU或孢子、300至400CFU或孢子、至少约500CFU或孢子、500至1,000CFU或孢子、至少约1,000CFU或孢子、1,000至3,000CFU或孢子、至少约3,000CFU或孢子、3,000至10,000CFU或孢子、至少约10,000CFU或孢子、10,000至30,000CFU或孢子、至少约30,000CFU或孢子、30,000至100,000CFU或孢子、至少约10^5CFU或孢子、10^5至10^6CFU或孢子、至少约10^6CFU或孢子或更多的量被检测到。

在本发明的最后一个方面，本发明涉及一种提高纯化的细菌菌株在应用中的功效的方法，所述方法包括选择额外的纯化的细菌菌株，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列；且其中所述额外的菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

在提高功效的所述方法的优选实施方式中，所述应用选自由以下组成的组：农业、植物改良、水质改良、生物修复、工业化合物生产、药物化合物生产和生物工程物质的生产。特别地，本申请是一种组合物的生产方法，该组合物属于选自以下的一类化合物：酸、醇、氨基酸、淀粉酶、抗生素、沼气、生物塑料、柠檬酸、酶、酯、脂肪酸、调味剂、谷氨酸、人类或动物激素、人类生长激素、冰、胰岛素、乳酸、脂肪酶、脂质、矿物质、氮、油、核酸、果胶酶、防腐剂、蛋白、雪、糖、疫苗、病毒、维生素和蜡。

此外，本发明涉及一种改进纯化的细菌菌株在应用中的性能的方法，所述方法包括选择额外的纯化的细菌菌株，其中所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列；且其中所述额外的菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:1至30组成的组的或表1中描述的至少一个序列(更优选SEQ ID NO:1、3、4、5、6、10、11、13、14、15、19、21或29的至少一个序列)具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

在一些实施方式中，所述额外的细菌菌株与植物要素相关，和/或所述细菌菌株是革兰氏阴性的，和/或所述细菌菌株是革兰氏阳性的，和/或所述细菌菌株具有改进的孢子形成能力，和/或所述细菌菌株包含选自由功效、存活力、贮存稳定性、抗生素耐受性、对降低的环境湿度的耐受性组成的组的特征。

本发明通过以下非限制性实施例得到进一步描述，这些实施例进一步说明本发明，并且不意图也不应将它们解释为限制本发明的范围。

实施例

现在将参考以下实施例进一步举例说明本发明。本发明不限于给定的实施例或附图中呈现的实施方式。

实施例1：小麦中每株植物的干生物量增加和分蘖数增加

对于处理，用含有细菌菌株的制剂处理5×24粒小麦种子。五个种植箱装有盆栽土壤混合物并用水浸透。作为对照，用不含细菌菌株的制剂处理10×24粒小麦种子以进行比较(模拟处理)。种子按照每个种植箱三行8粒种子来播种。播种后两周和三周将营养物质添加到种植箱中。在从用所述细菌菌株处理的种子获得的小麦植株播种后6周，计数每株植物的分蘖数。在计数每株植物的分蘖数后，切下所有新枝并称重每个种植箱的新鲜生物量(即所有24个新枝一起)。然后将植物新枝在60℃下干燥1周，并确定每个种植箱的干生物量(以mg为单位)。

对于所有评估的制剂(每个制剂都含有本发明的细菌菌株)，参照不含细菌菌株的制剂，可以看到每株植物的干生物量增加和/或分蘖数增加。如图1A-1L所示，对于所评估的制剂，干生物量的增加为6.2％至31.7％。如图2A-2I所示，分蘖数的增加为16.1％至111.6％。

实施例2：小麦中每株植物的干生物量增加

对于处理，用含有两种或六种本发明的细菌菌株的制剂处理5×24粒小麦种子。五个种植箱装有盆栽土壤混合物并用水浸透。作为对照，用不含细菌菌株的制剂处理10×24粒小麦种子以进行比较(模拟处理)。种子按照每个种植箱三行8粒种子来播种。播种后两周和三周将营养物质添加到种植箱中。播种后5周测量中间行的植物高度。播种后6周，切下所有新枝并称重每个种植箱的新鲜生物量(即所有24个新枝一起)。然后将植物新枝在60℃下干燥1周，并确定每个种植箱的干生物量(以mg为单位)。本发明的两种细菌菌株的组合相对于模拟物显示出了12.7％的干生物量增加(以mg计)(图3)。本发明的六种细菌菌株的组合相对于模拟物显示出了12.8％的干生物量增加(以mg计)(图3)。细菌菌株的组合建立了协同效应，增加了经处理的小麦的干生物量。

实施例3：玉米中每株植物的干生物量增加

对于处理，用全细胞肉汤处理5×24粒玉米种子，所述全细胞肉汤中接种有保藏号为B/00196的作为根瘤菌属(Rhizobium)成员的纯化的细菌菌株(图4A)或保藏号为B/00179的作为短波单胞杆菌属(Brevundimonas)成员的纯化的细菌菌株(图4B)。五个种植箱装有盆栽土壤混合物并用水浸透。作为对照，用不含细菌菌株的制剂处理10×24粒玉米种子以进行比较(模拟处理)。种子按照每个种植箱三行8粒种子来播种。播种后两周和三周将营养物质添加到种植箱中。播种后5周测量中间行的植物高度。播种后6周，切下所有新枝并称重每个种植箱的新鲜生物量(即所有24个新枝一起)。然后将植物新枝在60℃下干燥1周，并确定每个种植箱的干生物量(以mg为单位)。与用模拟物处理的玉米植物相比，用培养有B/00196或B/00179的全细胞肉汤处理的玉米植物分别显示出12.5％和14.2％的干生物量增加。

实施例4：镰刀菌属植物病原体的生长抑制

保藏号为B/00191的作为伯霍尔德杆菌属(Burkholderia)成员的纯化的细菌菌株成员的共培养实验与真菌病原体镰刀菌进行，已知镰刀菌是许多农业植物的病原体。制备固体NA培养基并将其分配在直径8cm的培养皿上。纯化的细菌菌株在液体LB培养物中培养，直至形成致密的细菌培养物。取一定量(特别是10μl)的液体培养物，并接种在距培养皿中心2.5cm处。将培养皿在28℃下温育过夜。此后，在培养皿的中心接种15μl的温育有镰刀菌的液体培养物，并在21℃下温育至少三天。根据真菌的生长情况将培养皿评分为A、B、C或无效，其中当真菌生长限于距真菌栓1cm时评分为A，当观察到真菌生长达到距真菌栓2cm时评分为B，当真菌病原体到达细菌生长线时评分为C，当真菌病原体胜过细菌生长时评分为无效。保藏号为B/00191的细菌菌株有效地抑制了镰刀菌的生长，评分为A，这是因为镰刀菌生长的边缘远离细菌生长线，更具体的镰刀菌生长仅出现在距接种中心小于0.5cm处。

实施例5：小麦中每株植物的湿生物量增加

对于处理，用包含保藏号为B/00178的细菌菌株的制剂处理5×24粒小麦种子。五个种植箱装有盆栽土壤混合物并用水浸透。作为对照，用不含细菌菌株的制剂处理10×24粒小麦种子以进行比较(模拟处理)。种子按照每个种植箱三行8粒种子来播种。播种后两周和三周将营养物质添加到种植箱中。在从用所述细菌菌株或模拟物处理的种子获得的小麦植株播种后6周，切下所有新枝并称重每个种植箱的新鲜生物量(即所有24个新枝一起)。确定每个种植箱的湿生物量(以mg为单位)。与从模拟处理的种子获得的小麦植株相比，上述小麦植株的湿生物量显示出6.9％的增加，如图5所示。

实施例6：田间小麦的谷物产量增加

对于处理，1.5kg春小麦种子涂覆有包含纯化的细菌菌株和着色剂的制剂。使用标准农业实践在每个田地位置的4个重复地块(15m²地块大小)上播种种子。播种密度为400粒种子/m²。播种在4月5日左右完成，并在在8月15日左右收获。根据土壤分析计算施肥量。播种时施加50kg磷(P₂O₅)肥和50kg钾(K₂O)肥。在两个时刻施加氮肥：分蘖期35kg ha^-1和抽穗期55kg ha^-1。使用Delta地块联合收割机(Wintersteiger AG，Ried，奥地利)进行收获，并根据在每个单独地块收获的谷物产量并考虑15％的种子水分来计算谷物产量(kg/ha)。将谷物产量与模拟处理进行比较。模拟处理的种子是涂覆有相同制剂和着色剂但没有细菌菌株的种子。处理结果在图6中示出。该图显示了涂覆种子和模拟涂覆种子的谷物产量估计值，95％置信区间。图中的虚线代表模拟处理。用含有纯化的细菌菌株B/00196和着色剂的制剂处理的小麦显示出4.7％的产量增加。用含有纯化的细菌菌株B/00206和着色剂的制剂处理的小麦也表现出3.8％的产量增加。纯化的细菌菌株B/00196和B/00206改善了植物生长和产量。

此外，对于用包含纯化的细菌菌株B/00182、B/00184、B/00195、B/00197、B/00202、B/00203、B/00205、B/00213、B/00207、B/00192或B/00178之一的上述制剂处理的小麦种子，第一批结果显示出小麦植株的产量高于模拟处理的种子。观察到了约5％的产量增加，这与用B/00196和B/00206处理的结果一致(数据未示出)。

实施例7：在多个不同地点的田间小麦谷物产量增加

在欧洲的6个不同地点进行了实施例6中公开的实验分析。处理结果在图7中示出。该图示出了6个不同位置的涂覆种子和模拟涂覆种子的谷物产量估计值，95％置信区间。图中的虚线代表模拟处理。用含有纯化的细菌菌株B/00196和着色剂的制剂处理的小麦显示出约5％的产量增加。用含有纯化的细菌菌株B/00202和着色剂的制剂处理的小麦也显示出约5％的产量增加。纯化的细菌菌株B/00196和B/00202改善了植物产量。此外，纯化的细菌菌株在不同地点(即气候条件)显示出显著的产量增加，进一步证实了它们在植物生长和产量方面作为有益菌株的作用。

此外，对于用包含纯化的细菌菌株B/00182、B/00184、B/00195、B/00197、B/00203、B/00205、B/00206、B/00213、B/00207、B/00192或B/00178之一的上述制剂处理的小麦种子，第一批结果显示小麦植株的产量高于模拟处理的种子。观察到约5％的产量增加，这与用B/00196和B/00202处理的结果一致(数据未示出)。

序列保藏

本发明的细菌菌株根据布达佩斯条约的条款保藏于波兰微生物保藏中心，保藏号为：B/00182、B/00183、B/00184、B/00195、B/00196、B/00197、B/00199、B/00200、B/00201、B/00202、B/00203、B/00204、B/00205、B/00206、B/00213、B/00175、B/00194、B/00198、B/00207、B/00191、B/00192、B/00193、B/00177、B/00180、B/00185、B/00189、B/00190、B/00179、B/00178和B/00223。

序列表

本申请包含具有30个序列的序列表，其整体以引用方式并入本文。这30个序列列于表1中。本发明的纯化的细菌菌株的全长16S核苷酸序列如下列出并以SEQ ID NO标记。此外，每个纯化的细菌菌株的保藏号及其相应的16S核苷酸序列在表1中标出。

仅由受理局填写

序列表

<110> 阿法埃生物公司

<120> 改善植物生长和产量的手段和方法

<130> APHE-008-EP

<160> 30

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 1468

<212> DNA

<213> 墨西哥假假黄单胞菌(Pseudoxanthomonas mexicana)

<400> 1

agtgaacgct ggcggtaggc ctaacacatg caagtcgaac ggcagcacag gagagcttgc 60

tctctgggtg gcgagtggcg gacgggtgag gaatacatcg gaatctacct tgtcgtgggg 120

gataacgtag ggaaacttac gctaataccg catacgacct tcgggtgaaa gtgggggacc 180

gcaaggcctc acgcgattag atgagccgat gtcggattag ctagttggcg gggtaatggc 240

ccaccaaggc gacgatccgt agctggtctg agaggatgat cagccacact ggaactgaga 300

cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct 360

gatccagcca taccgcgtgg gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagccct tttgttggga 420

aagaaatcct atcgattaat actcggtggg gatgacggta cccaaagaat aagcaccggc 480

taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg aagggtgcaa gcgttactcg gaattactgg 540

gcgtaaagcg tgcgtaggtg gttgtttaag tctgttgtga aagccctggg ctcaacctgg 600

gaattgcagt ggatactggg cgactagagt gtggtagagg atagtggaat ttccggtgta 660

gcagtgaaat gcgtagagat cggaaggaac atctgtggcg aaggcgacta tctgggccaa 720

cactgacact gaggcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca 780

cgccctaaac gatgcgaact ggatgttggg tgcaacttgg cacccagtat cgaagctaac 840

gcgttaagtt cgccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg 900

gggcccgcac aagcggtgga gtatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct 960

ggtcttgaca tccacggaac tttccagaga tggattggtg ccttcgggaa ccgtgagaca 1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080

cgcaaccctt gtccttagtt gccagcacgt aatggtggga actctaagga gaccgccggt 1140

gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg accagggcta 1200

cacacgtact acaatggtta ggacagaggg ctgcaaaccc gcgagggtga gccaatccca 1260

gaaacctaat ctcagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct 1320

agtaatcgca gatcagcatt gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc 1380

gtcacaccat gggagtttgt tgcaccagaa gcaggtagct taaccttcgg gagggcgctt 1440

gccacggtgt ggccgatgac tggggtga 1468

<210> 2

<211> 1339

<212> DNA

<213> 不解糖鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas asaccharolytica)

<400> 2

ccatgcaagt cgaacgagac cttcgggtct agtggcgcac gggtgcgtaa cgcgtgggaa 60

tctgcccttg ggttcggaat aacagtgaga aattactgct aataccgaat gatgacgtaa 120

gtccaaagat ttatcgccca gggatgagcc cgcgtaggat tagctagttg gtgaggtaaa 180

agctcaccaa ggcgacgatc cttagctggt ctgagaggat gatcagccac actgggactg 240

agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa tgggcgaaag 300

cctgatccag caatgccgcg tgagtgatga aggccttagg gttgtaaagc tcttttaccc 360

gggatgataa tgacagtacc gggagaataa gctccggcta actccgtgcc agcagccgcg 420

gtaatacgga gggagctagc gttattcgga attactgggc gtaaagcgca cgtaggcggc 480

tttgtaagtt agaggtgaaa gcctggagct caactccaga actgccttta agactgcatc 540

gcttgaatcc aggagaggtg agtggaattc cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc 600

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tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgcagaac cttaccagcg tttgacatgt ccggacgatt 900

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ccatcattta gttgggtact ctaaaggaac cgccggtgat aagccggagg aaggtgggga 1080

tgacgtcaag tcctcatggc ccttacgcgc tgggctacac acgtgctaca atggcgacta 1140

cagtgggcag caatctcgcg agggtgagct aatctccaaa agtcgtctca gttcggattg 1200

cactctgcaa ctcgagtgca tgaaggcgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc 1260

ggtgaatacg ttcccaggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggattcac 1320

ccgaaggcgt tgcgctaac 1339

<210> 3

<211> 1386

<212> DNA

<213> 长野雷夫松氏菌(Leifsonia shinshuensis)

<400> 3

atgtacctgg agcttgctct aggggattag tggcgaacgg gtgagtaaca cgtgagtaac 60

ctgcccttga ctctgggata acctccggaa acggaagcta ataccggata tgacgtacgg 120

aggcatctcc tgtacgtgga aagaacttcg gtcaaggatg gactcgcggc ctatcaggta 180

gttggtgagg taacggccca ccaagcctac gacgggtagc cggcctgaga gggtgaccgg 240

ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgc 300

acaatgggcg caagcctgat gcagcaacgc cgcgtgaggg atgacggcct tcgggttgta 360

aacctctttt agtagggaag aagcgaaagt gacggtacct gcagaaaaag caccggctaa 420

ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttgtccggaa ttattgggcg 480

taaagagctc gtaggcggtc tgtcgcgtct gctgtgaaaa cccgaggctc aacctcgggc 540

ctgcagtggg tacgggcaga ctagagtgcg gtaggggaga atggaattcc tggtgtagcg 600

gtggaatgcg cagatatcag gaggaacacc gatggcgaag gcagttctct gggccgtaac 660

tgacgctgag gagcgaaagc gtggggagcg aacaggatta gataccctgg tagtccacgc 720

cgtaaacgtt gggcgctaga tgtggggacc attccacggt ttccgtgtcg cagctaacgc 780

attaagcgcc ccgcctgggg agtacggccg caaggctaaa actcaaagga attgacgggg 840

gcccgcacaa gcggcggagc atgcggatta attcgatgca acgcgaagaa ccttaccaag 900

gcttgacata tacgagaacg ggccagaaat ggtcaactct ttggacactc gtaaacaggt 960

ggtgcatggt tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc 1020

aaccctcgtt ctatgttgcc agcacgtaat ggtgggaact cataggagac tgccggggtc 1080

aactcggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgtct tgggcttcac 1140

gcatgctaca atggccggta caaagggctg caataccgta aggtggagcg aatcccaaaa 1200

agccggtctc agttcggatt gaggtctgca actcgacctc atgaagtcgg agtcgctagt 1260

aatcgcagat cagcaacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc 1320

aagtcatgaa agtcggtaac acccgaagcc ggtggcccaa cccttgtgga gggagccgtc 1380

gaaggt 1386

<210> 4

<211> 966

<212> DNA

<213> 叶片微杆菌Microbacterium foliorum)

<400> 4

tacctgcagt cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg gatcagtggc gaacgggtga 60

gtaacacgtg agcaacctgc ccctgactct gggataagcg ctggaaacgg cgtctaatac 120

tggatacgag tagcgatcgc atggtcagct actggaaaga ttttttggtt ggggatgggc 180

tcgcggccta tcagcttgtt ggtgaggtaa tggctcacca aggcgtcgac gggtagccgg 240

cctgagaggg tgaccggcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca 300

gcagtgggga atattgcaca atgggcggaa gcctgatgca gcaacgccgc gtgagggatg 360

acggccttcg ggttgtaaac ctcttttagc agggaagaag cgaaagtgac ggtacctgca 420

gaaaaagcgc cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggc gcaagcgtta 480

tccggaatta ttgggcgtaa agagctcgta ggcggtttgt cgcgtctgct gtgaaatccc 540

gaggctcaac ctcgggcctg cagtgggtac gggcagacta gagtgcggta ggggagattg 600

gaattcctgg tgtagcggtg gaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat ggcgaaggca 660

gatctctggg ccgtaactga cgctgaggag cgaaagggtg gggagcatac aggcttagat 720

accctggtag tccaccccgt atacgttggg aactagttgt ggagtccatt ccacggattc 780

cgtgacgcag ctaacgcatt aagttccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaaaact 840

caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg 900

cgaagaacct taccaaggct tgacatatac gagaacgggc caaaatggtc aactctttgg 960

acactc 966

<210> 5

<211> 1017

<212> DNA

<213> 葡萄牙根瘤菌(Rhizobium lusitanum)

<400> 5

aaggggagcg gcagacgggt gagtaacgcg tgggaatcta cccttttcta cggaataacg 60

cagggaaact tgtgctaata ccgtatgtgt ccttcgggag aaagatttat cgggaaagga 120

tgagcccgcg ttggattagc tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatccata 180

gctggtctga gaggatgatc agccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg 240

aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg atccagccat gccgcgtgag 300

tgatgaaggc cctagggttg taaagctctt tcaccggaga agataatgac ggtatccgga 360

gaagaagccc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaagggg gctagcgttg 420

ttcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgta ggcggatcga tcagtcaggg gtgaaatccc 480

agggctcaac cctggaactg cctttgatac tgtcgatctg gagtatggaa gaggtgagtg 540

gaattccgag tgtagaggtg aaattcgtag atattcggag gaacaccagt ggcgaaggcg 600

gctcactggt ccattactga cgctgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat 660

accctggtag tccacgccgt aaacgatgaa tgttagccgt cgggcagtat actgttcggt 720

ggcgcagcta acgcattaaa cattccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa 780

aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga agcaacgcgc 840

agaaccttac cagcccttga catcctgtgt tacccgtaga gatatggggt ccacttcggt 900

ggcgcagaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag 960

tcccgcaacg agcgcaaccc tcgcccttag ttgccagcat ttagttgggc actctaa 1017

<210> 6

<211> 972

<212> DNA

<213> 西表岛壤霉菌(Agromyces iriomotensis)

<400> 6

tacctgcaag tcgaacgatg aactccagct tgctgggggg attagtggcg aacgggtgag 60

taacacgtga gtaacctgcc ctggactctg ggataacccc gagaaatcgg agctaatacc 120

ggataggacc ctgtaccgca tggtgtgggg tggaaagttt tttcggtctg ggatggactc 180

gcggcctatc agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc 240

tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc 300

agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gcgggatgac 360

ggccttcggg ttgtaaaccg cttttagtaa ggaagaaggg gagcttgctc cttgacggta 420

cttgcagaaa aaggaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtccga 480

gcgttgtccg gaattattgg gcgtaaagag ctcgtaggcg gtttgtcgcg tctgctgtga 540

aatcccgagg ctcaacctcg ggcctgcagt gggtacgggc agactggagt gcggtagggg 600

agaatggaat tcctggtgta gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accgatggcg 660

aaggcagttc tctgggccgt aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga 720

ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gttgggcgct agatgtgggg acctttccac 780

ggtttccgtg tcgtagctaa cgcattaagc gccccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct 840

aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggcgg agcatgcgga ttaattcgat 900

gcaacgcgaa gaaccttacc aaggcttgac ataccgagaa cgccgcagaa atgtggaact 960

ctttggacac tc 972

<210> 7

<211> 947

<212> DNA

<213> 葡萄牙草螺菌(Herbaspirillum lusitanum)

<400> 7

ttacctgcag tcgaacggca gcacgggagc ttgctcctgg tggcgagtgg cgaacgggtg 60

agtaatatat cggaacgtgc cctagagtgg gggataacta gtcgaaagat tagctaatac 120

cgcatacgat ctacggatga aagtggggga tcgcaagacc tcatgctcat ggagcggccg 180

atatctgatt agctagttgg tggggtaaaa gctcaccaag gcgacgatca gtagctggtc 240

tgagaggacg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc 300

agtggggaat tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc aatgccgcgt gagtgaagaa 360

ggccttcggg ttgtaaagct cttttgtcag ggaagaaacg gtcttggtta atacctgggg 420

ctaatgacgg tacctgaaga ataagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata 480

cgtagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgtgcgcagg cggttgtgca 540

agacagatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaattgca tttgtgactg cacggctaga 600

gtgtgtcaga ggggggtaga attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagat atgtggagga 660

ataccgatgg cgaaggcagc cccctgggat aacactgacg ctcatgcacg aaagcgtggg 720

gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgtcta ctagttgtcg 780

ggtcttaatt gacttggtaa cgcagctaac gcgtgaagta gaccgcctgg ggagtacggt 840

cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggtgga tgatgtggat 900

taattcgatg caacgcgaaa accttaccta cccttgactg tacggaa 947

<210> 8

<211> 958

<212> DNA

<213> 争论贪噬菌(Variovorax paradoxus)

<400> 8

accatgcaag tcgaacggca gcgcgggagc aatcctggcg gcgagtggcg aacgggtgag 60

taatacatcg gaacgtgccc aatcgtgggg gataacgcag cgaaagctgt gctaataccg 120

catacgatct acggatgaaa gcaggggatc gcaagacctt gcgcgaatgg agcggccgat 180

ggcagattag gtagttggtg aggtaaaggc tcaccaagcc ttcgatctgt agctggtctg 240

agaggacgac cagccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag 300

tggggaattt tggacaatgg gcgaaagcct gatccagcca tgccgcgtgc aggatgaagg 360

ccttcgggtt gtaaactgct tttgtacgga acgaaacggc cttttctaat aaagagggct 420

aatgacggta ccgtaagaat aagcaccggc taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg 480

tagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg tgcgcaggcg gtaatgtaag 540

acagttgtga aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatc tgtgactgca ttgctggagt 600

acggcagagg gggatggaat tccgcgtgta gcagtgaaat gcgtagatat gcggaggaac 660

accgatggcg aaggcaatcc cctgggcctg tactgacgct catgcacgaa agcgtgggga 720

gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccctaaac gatgtcaact ggttgttggg 780

tcttcactga ctcagtaacg aagctaacgc gtgaagttga ccgcctgggg agtacggccg 840

caaggttgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggttta 900

attcgatgca acgcgaaaaa ccttacccac ctttgacatg tacggaattc gccagaga 958

<210> 9

<211> 1468

<212> DNA

<213> 朝鲜戴氏菌(Dyella koreensis)

<400> 9

attgaacgct ggcggcatgc ctaacacatg caagtcgaac ggcagcacag cagtagcaat 60

actgtgggtg gcgagtggcg gacgggtgag taatgcatcg ggacctgccc agacgtgggg 120

gataacgtag ggaaacttac gctaataccg catacgtcct acgggagaaa gcgggggatc 180

gaaagacctc gcgcggttgg atggaccgat gttcgattag ctagttggtg aggtaatggc 240

tcaccaaggc gacgatcgat agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga 300

cacggcccac actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgcaagcct 360

gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact tttatcagga 420

gcgaaatacc acgggttaat accctatggg gctgacggta cctgaggaat aagcaccggc 480

taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg aagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg 540

gcgtaaaggg tgcgtaggcg gttcgttaag tctgttgtga aatccccggg ctcaacctgg 600

gaatggcaat ggatactggc gagctagagt gtgatagagg atggtggaat tcccggtgta 660

gcggtgaaat gcgtagagat cgggaggaac atcagtggcg aaggcggcca tctggatcaa 720

cactgacgct gaagcacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca 780

cgccctaaac gatgcgaact ggatgttggt ctcaactcgg agatcagtgt cgaagctaac 840

gcgttaagtt cgccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg 900

gggcccgcac aagcggtgga gtatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct 960

ggccttgaca tgtctggaat cctgcagaga tgcgggagtg ccttcgggaa tcagaacaca 1020

ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080

cgcaaccctt gtccttagtt gccagcacgt aatggtggga actctaagga gactgccggt 1140

gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg gccagggcta 1200

cacacgtact acaatggtcg gtacagaggg ttgcaatacc gcgaggtgga gctaatccca 1260

gaaagccgat cccagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct 1320

agtaatcgca gatcagctat gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc 1380

gtcacaccat gggagtgagt tgctccagaa gccgttagtc taaccgcaag ggggacgacg 1440

accacggagt ggttcatgac tggggtga 1468

<210> 10

<211> 1545

<212> DNA

<213> 梨孢雷夫松氏菌(Leifsonia poae)

<400> 10

gcagtcgaac atgtagctga ctcaggtcac agagtttgat cctggctcag gacgaacgct 60

ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gatgaacctg gagcttgctc tgggggatta 120

gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgcccttg actctgggat aacctccgga 180

aacggaagct aataccggat atgacgtacg gaggcatctc ctgtgcgtgg aaagaatttc 240

ggtcaaggat ggactcgcgg cctatcaggt agttggtgag gtaacggctc accaagccta 300

cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac 360

tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcaacg 420

ccgcgtgagg gacgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt tagtagggaa gaagcgaaag 480

tgacggtacc tgcagaaaaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta 540

gggtgcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggt ttgtcgcgtc 600

tgctgtgaaa acccgaggct caacctcggg cctgcagtgg gtacgggcag actagagtgc 660

ggtaggggag aatggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac 720

cgatggcgaa ggcagttctc tgggccgtaa ctgacgctga ggagcgaaag cgtggggagc 780

gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacgt tgggcgctag atgtggggac 840

cattccacgg tttccgtgtc gcagctaacg cattaagcgc cccgcctggg gagtacggcc 900

gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag catgcggatt 960

aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacgagaac gggccagaaa 1020

tggtcaactc tttggacact cgtaaacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt 1080

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt tctatgttgc cagcacgtaa 1140

tggtgggaac tcataggaga ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa 1200

atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt acaaagggct 1260

gcaataccgt aaggtggagc gaatcccaaa aagccggtct cagttcggat tgaggtctgc 1320

aactcgacct catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacgc tgcggtgaat 1380

acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt caagtcatga aagtcggtaa cacccgaagc 1440

cggtggccta acccttgtgg aaggagccgt cgaaggtggg atcggtgatt aggactaagt 1500

cgtaacaagg taaccctacg atgtgatgct tgcacaagtg atcca 1545

<210> 11

<211> 1452

<212> DNA

<213> 中等食酸菌(Acidovorax temperans)

<400> 11

attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac ggtaacaggt cttcggatgc 60

tgacgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacgtgc ccgagagtgg gggataacga 120

agcgaaagct ttgctaatac cgcatacgat ctcaggatga aagcagggga ccgcaaggcc 180

ttgcgctcac ggagcggccg atggcagatt aggtagttgg tgggataaaa gcttaccaag 240

ccgacgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca ctgggactga gacacggccc 300

agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttggacaat gggcgcaagc ctgatccagc 360

catgccgcgt gcaggatgaa ggccttcggg ttgtaaactg cttttgtacg gaacgaaaag 420

actctggata atacctgggg ttcatgacgg taccgtaaga ataagcaccg gctaactacg 480

tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttaat cggaattact gggcgtaaag 540

cgtgcgcagg cggttatata agacagatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca 600

tttgtgactg tatagctaga gtacggcaga gggggatgga attccgcgtg tagcagtgaa 660

atgcgtagat atgcggagga acaccgatgg cgaaggcaat cccctgggcc tgtactgacg 720

ctcatgcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccctaa 780

acgatgtcaa ctggttgttg ggtcttcact gactcagtaa cgaagctaac gcgtgaagtt 840

gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggttg aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac 900

aagcggtgga tgatgtggtt taattcgatg caacgcgaaa aaccttaccc acctttgaca 960

tgtacggaat cctttaaaga tagaggagtg ctcgaaagag agccgtaaca caggtgctgc 1020

atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc 1080

ttgccattag ttgctacgaa agggcactct aatgggactg ccggtgacaa accggaggaa 1140

ggtggggatg acgtcaagtc ctcatggccc ttataggtgg ggctacacac gtcatacaat 1200

ggctggtaca gagggttgcc aacccgcgag ggggagccaa tcccataaag ccagtcgtag 1260

tccggatcgc agtctgcaac tcgactgcgt gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcggatca 1320

gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggtct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagc 1380

gggttctgcc agaagtagtt agcctaaccg caaggagggc gattaccacg gcagggttcg 1440

tgactggggt ga 1452

<210> 12

<211> 1454

<212> DNA

<213> 土壤副伯霍尔德杆菌(Paraburkholderia soli)

<400> 12

attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac ggcagcacgg gggcaaccct 60

ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatac atcggaacgt gtcctagagt gggggatagc 120

ccggcgaaag ccggattaat accgcatacg ctcgagagag gaaagcgggg gatcttcgga 180

cctcgcgctc aaggggcggc cgatggcgga ttagctagtt ggtagggtaa aggcctacca 240

aggcgacgat ccgtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc 300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca atgggggcaa ccctgatcca 360

gcaatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag cacttttgtc cggaaagaaa 420

tcctctgccc taatacggcg gggggatgac ggtaccggaa gaataagcac cggctaacta 480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa 540

agcgtgcgca ggcggttcgc taagaccgat gtgaaatccc cgggcttaac ctgggaactg 600

cattggtgac tggcgagcta gagtgtggca gaggggggta gaattccacg tgtagcagtg 660

aaatgcgtag agatgtggag gaataccgat ggcgaaggca gccccctggg ctaacactga 720

cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct 780

aaacgatgtc aactagttgt tggggattca tttccttagt aacgaagcta acgcgtgaag 840

ttgaccgcct ggggagtacg gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc 900

acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctacccttga 960

catggacgga actccgctga gaggtggagg tgctcgaaag agaaccgtcg cacaggtgct 1020

gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac 1080

ccttgtctct agttgctacg aaagggcact ctagagagac tgccggtgac aaaccggagg 1140

aaggtgggga tgacgtcaag tcctcatggc ccttatgggt agggcttcac acgtcataca 1200

atggtcggaa cagagggttg ccaagccgcg aggtggagcc aatcccagaa aaccgatcgt 1260

agtccggatt gcactctgca actcgagtgc atgaagctgg aatcgctagt aatcgcggat 1320

cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga 1380

gtgggtttta ccagaagtgg ctagtctaac cgcaaggagg acggtcacca cggtaggatt 1440

catgactggg gtga 1454

<210> 13

<211> 1456

<212> DNA

<213> 霍德勒分枝菌酸小杆菌(Mycolicibacterium hodleri)

<400> 13

agtcgaacgg aaaggccctt cggggtactc gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt 60

gatctgccct gcacttcggg ataagcctgg gaaactgggt ctaataccgg atatgacctt 120

gggatgcatg tcctttggtg gaaagctttt gcggtgtggg atgggcccgc ggcctatcag 180

cttgttggtg gggttaaggc ctaccaaggc gacgacgggt agccggcctg agagggtgac 240

cggccacact gggactgaga tacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat 300

tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga cgccgcgtga gggacgacgg ccttcgggtt 360

gtaaacctct ttcagcacag acgaagcgcg agtgacggta tgtgcagaag aaggaccggc 420

caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg tagggtccga gcgttgtccg gaattactgg 480

gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg ttgttcgtga aaactcacag ctcaactgtg 540

ggcgtgcggg cgatacgggc agactagagt actgcagggg agactggaat tcctggtgta 600

gcggtggaat gcgcagatat caggaggaac accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt 660

aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca 720

cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt ttccttcctt gggatccgtg ccgtagctaa 780

cgcattaagt accccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg 840

ggggcccgca caagcggcgg agcatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc 900

tgggtttgac atgcacagga cgctggtaga gatatcagtt cccttgtggc ctgtgtgcag 960

gtggtgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc 1020

gcaaccccta tcttatgttg ccagcgcgtc atggcgggga ctcgtaagag actgccgggg 1080

tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg ccccttatgt ccagggcttc 1140

acacatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcgatgccg tgaggtggag cgaatccttt 1200

aaagccggtc tcagttcgga tcggggtctg caactcgacc ccgtgaagtc ggagtcgcta 1260

gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg 1320

tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gagggagccg 1380

tcgaaggtgg gatcggcgat tgggacgaag tcgtaacaag gtaaccctac gatgtgatgc 1440

ttgcacaagt gatcca 1456

<210> 14

<211> 1454

<212> DNA

<213> 胡萝卜根杆菌(Rhizobacter dauci)

<400> 14

attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac ggcagcacgg gagcaatcct 60

ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatat atcggaacgt gcccagttgt gggggatagc 120

ccggcgaaag ccggattaat accgcatacg acctgagggt gaaagcgggg gatcgcaaga 180

cctcgcgcaa ttggagcggc cgatatcaga ttagctagtt ggtggggtaa aggcctacca 240

aggcgacgat ctgtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactgggact gagacacggc 300

ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca atgggcgcaa gcctgatcca 360

gccatgccgc gtgcgggaag aaggccttcg ggttgtaaac cgcttttgtc agggaagaaa 420

cggtctgatc taataaattg gactaatgac ggtacctgaa gaataagcac cggctaacta 480

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa 540

agcgtgcgca ggcggctatg caagacagat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg 600

catttgtgac tgcatggcta gagtacggta gagggggatg gaattccgcg tgtagcagtg 660

aaatgcgtag atatgcggag gaacaccgat ggcgaaggca atcccctgga cctgtactga 720

cgctcatgca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct 780

aaacgatgtc aactggttgt tggacggctt gctgttcagt aacgaagcta acgcgtgaag 840

ttgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac ggggacccgc 900

acaagcggtg gatgatgtgg tttaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctacccttga 960

catgtctaga agttaccaga gatggtttcg tgctcgaaag agagctagaa cacaggtgct 1020

gcatggccgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac 1080

ccttatcatt agttgctacg caagggcact ctaatgagac tgccggtgac aaaccggagg 1140

aaggtgggga tgacgtcagg tcatcatggc ccttatgggt agggctacac acgtcataca 1200

atggccggta cagagggctg ccaacccgcg agggggagct aatctcagaa aaccggtcgt 1260

agtccggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgcggat 1320

cagcttgccg cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga 1380

gcgggttctg ccagaagtag ttagcctaac cgcaaggggg gcgattacca cggcagggtt 1440

cgtgactggg gtga 1454

<210> 15

<211> 1401

<212> DNA

<213> 转化人参皂苷土地杆菌(Pedobacter ginsenosidimutans)

<400> 15

tatacatgca gtcgaacgat agatagaggc ttgcttctat cgaaagtggc gcacgggtgc 60

gtaacgcgta tgcaacctac cttaatcagg gggatagccc ggagaaatcc ggattaatac 120

cgcataaaat cacagtccca cctgggacaa tgatcaaaca tttatgggat tgagatgggc 180

atgcgtgtca ttagctagtt ggcggggtaa cggcccacca aggcgacgat gactagggga 240

tctgagagga tggcccccca cactggtact gagacacgga ccagactcct acgggaggca 300

gcagtaagga atattggtca atggaggcaa ctctgaacca gccatgccgc gtgcaggaag 360

actgccctat gggttgtaaa ctgcttttat ccgggaataa acctctttac gtgtaaagag 420

ctgaatgtac cggaagaata aggatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg 480

aggatccaag cgttatccgg atttattggg tttaaagggt gcgtaggcgg cctgttaagt 540

caggggtgaa agacggtagc tcaactatcg cagtgccctt gatactgatg ggcttgaatg 600

gactagaggt aggcggaatg agacaagtag cggtgaaatg catagatatg tctcagaaca 660

ccgattgcga aggcagctta ctatggtctt attgacgctg aggcacgaaa gcgtggggat 720

caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgaacactc gctgttggcg 780

atacacagtc agcggctaag cgaaagcgtt aagtgttcca cctggggagt acgctcgcaa 840

gagtgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gaggagcatg tggtttaatt 900

cgatgatacg cgaggaacct tacccgggct tgaaagttag tgaatcattt agagataaat 960

gagtgagcaa tcacacgaaa ctaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gccgtgaggt 1020

gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctatgttta gttgccagca cgttatggtg 1080

gggactctaa acagactgcc tgtgcaaaca gagaggaagg aggggacgac gtcaagtcat 1140

catggccctt acgtccgggg ctacacacgt gctacaatgg atggtacaga gggcagctac 1200

atagcaatat gatgcgaatc tcacaaagcc attcacagtt cggattgggg tctgcaactc 1260

gaccccatga agttggattc gctagtaatc gcgtatcagc aatgacgcgg tgaatacgtt 1320

cccgggcctt gtacacaccg cccgtcaagc catggaagtt gggggtacct aaagtatgta 1380

accgcaagga gcgtcctagt a 1401

<210> 16

<211> 1380

<212> DNA

<213> 长野雷夫松氏菌(Leifsonia shinshuensis)

<400> 16

aacccggagc ttgctctggg ggattagtgg cgaacgggtg agtaacacgt gagtaacctg 60

cccttgactc tgggataacc tccggaaacg gaagctaata ccggatacga cgtacggagg 120

catctcctgt acgtggaaag aacttcggtc aaggatggac tcgcggccta tcaggtagtt 180

ggtgaggtaa cggctcacca agcctacgac gggtagccgg cctgagaggg tgaccggcca 240

cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca 300

atgggcgcaa gcctgatgca gcaacgccgc gtgagggatg acggccttcg ggttgtaaac 360

ctcttttagt agggaagaag cgaaagtgac ggtacctgca gaaaaagcac cggctaacta 420

cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgttg tccggaatta ttgggcgtaa 480

agagctcgta ggcggtctgt cgcgtctgct gtgaaaaccc gaggctcaac ctcgggcctg 540

cagtgggtac gggcagacta gagtgcggta ggggagaatg gaattcctgg tgtagcggtg 600

gaatgcgcag atatcaggag gaacaccgat ggcgaaggca gttctctggg ccgtaactga 660

cgctgaggag cgaaagcgtg gggagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt 720

aaacgttggg cgctagatgt ggggaccatt ccacggtttc cgtgtcgcag ctaacgcatt 780

aagcgccccg cctggggagt acggccgcaa ggctaagact caaaggaatt gacgggggcc 840

cgcacaagcg gcggagcatg cggattaatt cgatgcaacg cgaagaacct taccaaggct 900

tgacatacac gagaacgggc cagaaatggt caactctttg gacactcgtg aacaggtggt 960

gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac 1020

cctcgttcta tgttgccagc gcgtaatggc gggaactcat aggagactgc cggggtcaac 1080

tcggaggaag gtggggatga cgtcaaatca tcatgcccct tatgtcttgg gcttcacgca 1140

tgctacaatg gccggtacaa agggctgcaa taccgtaagg tggagcgaat cccaaaaagc 1200

cggtctcagt tcggattgag gtctgcaact cgacctcatg aagtcggagt cgctagtaat 1260

cgcagatcag caacgctgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag 1320

tcatgaaagt cggtaacacc cgaagccggt ggcccaaccc ttgtggaggg agcgtcgaag 1380

<210> 17

<211> 1403

<212> DNA

<213> 叶片微杆菌(Microbacterium foliorum)

<400> 17

atgcagtcga acggtgaaca cggagcttgc tctgtgggat cagtggcgaa cgggtgagta 60

acacgtgagc aacctgcccc tgactctggg ataagcgctg gaaacggcgt ctaatactgg 120

atacgagtag cgatcgcatg gtcagctact ggaaagattt tttggttggg gatgggctcg 180

cggcctatca gcttgttggt gaggtaatgg ctcaccaagg cgtcgacggg tagccggcct 240

gagagggtga ccggccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca 300

gtggggaata ttgcacaatg ggcggaagcc tgatgcagca acgccgcgtg agggatgacg 360

gccttcgggt tgtaaacctc ttttagcagg gaagaagcga aagtgacggt acctgcagaa 420

aaagcgccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggcgca agcgttatcc 480

ggaattattg ggcgtaaaga gctcgtaggc ggtttgtcgc gtctgctgtg aaatcccgag 540

gctcaacctc gggcctgcag tgggtacggg cagactagag tgcggtaggg gagattggaa 600

ttcctggtgt agcggtggaa tgcgcagata tcaggaggaa caccgatggc gaaggcagat 660

ctctgggccg taactgacgc tgaggagcga aagggtgggg agcaaacagg cttagatacc 720

ctggtagtcc accccgtaaa cgttgggaac tagttgtggg gtccattcca cggattccgt 780

gacgcagcta acgcattaag ttccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc taaaactcaa 840

aggaattgac ggggacccgc acaagcggcg gagcatgcgg attaattcga tgcaacgcga 900

agaaccttac caaggcttga catatacgag aacgggccag aaatggtcaa ctctttggac 960

actcgtaaac aggtggtgca tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt 1020

cccgcaacga gcgcaaccct cgttctatgt tgccagcacg taatggtggg aactcatggg 1080

atactgccgg ggtcaactcg gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat 1140

gtcttgggct tcacgcatgc tacaatggcc ggtacaaagg gctgcaatac cgtgaggtgg 1200

agcgaatccc aaaaagccgg tcccagttcg gattgaggtc tgcaactcga cctcatgaag 1260

tcggagtcgc tagtaatcgc agatcagcaa cgctgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt 1320

acacaccgcc cgtcaagtca tgaaagtcgg taacacctga agccggtggc ctaacccttg 1380

tggagggagc cgtcgaaggg atc 1403

<210> 18

<211> 1214

<212> DNA

<213> 丽水黄色杆菌(Luteibacter yeojuensis)

<400> 18

tggcctacca aggcgacgat cgatagctgg tctgagagga tgatcagcca cactgggact 60

gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgcaa 120

gcctgatcca gcaatgccgc gtgtgtgaag aaggccctcg ggttgtaaag cacttttatc 180

aggagcgaaa tctgcccggt taatacctgg gtagtctgac ggtacctgag gaataagcac 240

cggctaattc cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta 300

ctgggcgtaa agggtgcgta ggcggttgtt taagtctgtt gtgaaatccc cgggctcaac 360

ctgggaatgg caatggatac tggacagcta gagtgtgtca gaggatggtg gaattcccgg 420

tgtagcggtg aaatgcgtag agatcgggag gaacatcagt ggcgaaggcg gccatctggg 480

acaacactga cgctgaagca cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag 540

tccacgccct aaacgatgcg aactggatgt tggtctcaac tcggagatca gtgtcgaagc 600

taacgcgtta agttcgccgc ctggggagta cggtcgcaag actgaaactc aaaggaattg 660

acgggggccc gcacaagcgg tggagtatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt 720

acctggcctt gacatgtccg gaatcctgca gagatgcggg agtgccttcg ggaatcggaa 780

cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa 840

cgagcgcaac ccttgtcctt agttgccagc acgtaatggt gggaactcta aggagactgc 900

cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacggccagg 960

gctacacacg tactacaatg gtcggtacag agggttgcga gaccgcgagg tggagccaat 1020

cccagaaagc cgatcccagt ccggattgga gtctgcaact cgactccatg aagtcggaat 1080

cgctagtaat cgcggatcag ctatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc 1140

gcccgtcaca ccatgggagt gagctgctcc agaagccgtt agtctaaccg caagggggac 1200

gacgaccacg gtgt 1214

<210> 19

<211> 1554

<212> DNA

<213> 根食酸菌(Acidovorax radicis)

<400> 19

tggatcactt gtgcaagcat cacatcgtag ggttaccttg ttacgacttc accccagtca 60

cgaaccctgc cgtggtaatc gccctccttg cggttaggct aactacttct ggcagaaccc 120

gctcccatgg tgtgacgggc ggtgtgtaca agacccggga acgtattcac cgtgacattc 180

tgatccacga ttactagcga ttccgacttc acgcagtcga gttgcagact gcgatccgga 240

ctacgaatgg ctttatggga ttggctcccc ctcgcgggtt ggcgaccctt tgtaccatcc 300

attgtatgac gtgtgtagcc ccacctataa gggccatgag gacttgacgt catccccacc 360

ttcctccggt ttgtcaccgg cagtctcatt agagtgccca actaaatgta gcaactaatg 420

acaagggttg cgctcgttgc gggacttaac ccaacatctc acgacacgag ctgacgacag 480

ccatgcagca cctgtgttac ggttctcttt cgagcactcc tctatctcta aaggattccg 540

tacatgtcaa aggtgggtaa ggtttttcgc gttgcatcga attaaaccac atcatccacc 600

gcttgtgcgg gtccccgtca attcctctga gtttcaacct tgcggccgta ctccccaggc 660

ggtcaacttc acgcgttagc ttcgttactg agtcagtgaa gacccaacaa ccagttgaca 720

tcgtttaggg cgtggactac cagggtatct aatcctgttt gctccccacg ctttcgtgca 780

tgagcgtcag tacaggtcca ggggattgcc ttcgccatcg gtgttcctcc gcatatctac 840

gcatttcact gctacacgcg gaattccatc cccctctacc gtactctagc tatacagtca 900

caaatgcagt tcccaggttg agcccgggga tttcacatct gtcttatata accgcctgcg 960

cacgctttac gcccagtaat tccgattaac gcttgcaccc tacgtattac cgcggctgct 1020

ggcacgtagt tagccggtgc ttattcttac ggtaccgtca tggaccccag gtattaacca 1080

gagtcttttc gttccgtaca aaagcagttt acaacccgaa ggccttcatc ctgcacgcgg 1140

catggctgga tcaggctttc gcccattgtc caaaattccc cactgctgcc tcccgtagga 1200

gtctgggccg tgtctcagtc ccagtgtggc tggtcgtcct ctcagaccag ctacagatcg 1260

tcggcttggt aagcttttat cccaccaact acctaatctg ccatcggccg ctccgtccgc 1320

gcaaggcctt gcggtcccct gctttcatcc gtagatcgta tgcggtatta gcaaagcttt 1380

cgctccgtta tcccccacga tcgggcacgt tccgatgtat tactcacccg ttcgccactc 1440

gtcagcatcc gaagacctgt taccgttcga cttgcatgtg taaggcatgc cgccagcgtt 1500

caatctgagc catgatcaaa ctctgtgacc tgagtcagct acatgttcga ctgc 1554

<210> 20

<211> 1554

<212> DNA

<213> 双向伯霍尔德杆菌(Burkholderia ambifaria)

<400> 20

gcagtcgaac atgtagctga ctcaggtcac agagtttgat cctggctcag attgaacgct 60

ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac ggcagcacgg gtgcttgcac ctggtggcga 120

gtggcgaacg ggtgagtaat acatcggaac atgtcctgta gtgggggata gcccggcgaa 180

agccggatta ataccgcata cgatctacgg atgaaagcgg gggaccttcg ggcctcgcgc 240

tatagggttg gccgatggct gattagctag ttggtggggt aaaggcctac caaggcgacg 300

atcagtagct ggtctgagag gacgaccagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc 360

ctacgggagg cagcagtggg gaattttgga caatgggcga aagcctgatc cagcaatgcc 420

gcgtgtgtga agaaggcctt cgggttgtaa agcacttttg tccggaaaga aatccttggt 480

tctaatatag ccgggggatg acggtaccgg aagaataagc accggctaac tacgtgccag 540

cagccgcggt aatacgtagg gtgcgagcgt taatcggaat tactgggcgt aaagcgtgcg 600

caggcggttt gctaagaccg atgtgaaatc cccgggctca acctgggaac tgcattggtg 660

actggcaggc tagagtatgg cagagggggg tagaattcca cgtgtagcag tgaaatgcgt 720

agagatgtgg aggaataccg atggcgaagg cagccccctg ggccaatact gacgctcatg 780

cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc ctaaacgatg 840

tcaactagtt gttggggatt catttcctta gtaacgtagc taacgcgtga agttgaccgc 900

ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg 960

tggatgatgt ggattaattc gatgcaacgc gaaaaacctt acctaccctt gacatggtcg 1020

gaatcccgct gagaggtggg agtgctcgaa agagaaccgg cgcacaggtg ctgcatggct 1080

gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc 1140

ttagttgcta cgcaagagca ctctaaggag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg 1200

gatgacgtca agtcctcatg gcccttatgg gtagggcttc acacgtcata caatggtcgg 1260

aacagagggt tgccaacccg cgagggggag ctaatcccag aaaaccgatc gtagtccgga 1320

ttgcactctg caactcgagt gcatgaagct ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgc 1380

cgcggtgaat acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttt 1440

taccagaagt ggctagtcta accgcaagga ggacggtcac cacggtagga ttcatgactg 1500

gggtgaagtc gtaacaaggt aaccctacga tgtgatgctt gcacaagtga tcca 1554

<210> 21

<211> 1402

<212> DNA

<213> 云南微球菌Micrococcus yunnanensis)

<400> 21

tacctgcaag tcgaacgatg aagcccagct tgctgggtgg attagtggcg aacgggtgag 60

taacacgtga gtaacctgcc cttaactctg ggataagcct gggaaactgg gtctaatacc 120

ggataggagc gtccaccgca tggtgggtgt tggaaagatt tatcggtttt ggatggactc 180

gcggcctatc agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgacgacgg gtagccggcc 240

tgagagggtg accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc 300

agtggggaat attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc gacgccgcgt gagggatgac 360

ggccttcggg ttgtaaacct ctttcagtag ggaagaagcg aaagtgacgg tacctgcaga 420

agaagcaccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttatc 480

cggaattatt gggcgtaaag agctcgtagg cggtttgtcg cgtctgtcgt gaaagtccgg 540

ggcttaaccc cggatctgcg gtgggtacgg gcagactaga gtgcagtagg ggagactgga 600

attcctggtg tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg cgaaggcagg 660

tctctgggct gtaactgacg ctgaggagcg aaagcatggg gagcgaacag gattagatac 720

cctggtagtc catgccgtaa acgttgggca ctaggtgtgg ggaccattcc acggtttccg 780

cgccgcagct aacgcattaa gtgccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca 840

aaggaattga cgggggcccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg 900

aagaacctta ccaaggcttg acatgttctc gatcgccgta gagatacggt ttcccctttg 960

gggcgggttc acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa 1020

gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgttccat gttgccagca cgtaatggtg gggactcatg 1080

ggagactgcc ggggtcaact cggaggaagg tgaggacgac gtcaaatcat catgcccctt 1140

atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaat gggttgcgat actgtgaggt 1200

ggagctaatc ccaaaaagcc ggtctcagtt cggattgggg tctgcaactc gaccccatga 1260

agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggcctt 1320

gtacacaccg cccgtcaagt cacgaaagtt ggtaacaccc gaagccggtg gcctaaccct 1380

tgtgggggga gccgtcgaag at 1402

<210> 22

<211> 1407

<212> DNA

<213> 迟钝水杆形菌(Undibacterium pigrum)

<400> 22

taccatgcag tcgaacggca gcgcggggca acctggcggc gagtggcgaa cgggtgagta 60

aaatatcgga acatacccta gagtggggga taacgtagcg aaagttacgc taataccgca 120

tacgcactaa ggtggaaagt gggggatcgc aagacctcat gctcatggag tggccgatat 180

ctgattagct agttggtagg gtaaaagcct accaaggcga cgatcagtag ctggtttgag 240

agaacgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg 300

gggaattttg gacaatgggg gcaaccctga tccagcaatg ccgcgtgagt gaagaaggcc 360

ctcgggttgt aaagctcttt tgtcagggaa gaaacggtga gttctaatac agcttgctaa 420

tgacggtacc tgaagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta 480

gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tttataagtc 540

tgatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcattgg agactgtaag gctagagtgt 600

gtcagagggg ggtagaattc cacgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgt ggaggaatac 660

cgatggcgaa ggcagccccc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc 720

aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtctactag ttgtcgggtc 780

ttaattgact tggtaacgca gctaacgcgt gaagtagacc gcctggggag tacggtcgca 840

agattaaaac tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat 900

tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgga aggaatcccg aagagatttg 960

ggagtgctcg aaagagaacc tttacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt 1020

gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg 1080

cactctaatg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca 1140

tggcccttat gggtagggct tcacacgtca tacaatggta catacagagg gccgccaacc 1200

cgcgaggggg agctaatccc agaaagtgta tcgtagtccg gattgtagtc tgcaactcga 1260

ctacatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc 1320

gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagcgggt tctgccagaa gtagttagct 1380

taaccgcaag gagggcgata ccacgac 1407

<210> 23

<211> 910

<212> DNA

<213> 刺槐博斯氏菌(Bosea robiniae)

<400> 23

ttggaatcac tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggactttt aagtcggagg tgaaagccca 60

gggctcaacc ctggaattgc cttcgatact gggagtcttg agttcggaag aggttggtgg 120

aactgcgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcgcaag aacaccggtg gcgaaggcgg 180

ccaactggtc cgatactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata 240

ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gccagccgtt ggggagcttg ctcttcagtg 300

gcgcagctaa cgctttaagc attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa 360

ggaattgacg ggggcccgca caagcggggg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca 420

gaaccttacc agcttttgac atgtccggtt tgatcggcag agatgccttt cttcagttcg 480

gctggccgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt 540

aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgcccc tagttgccat cattaagttg ggaactctag 600

ggggactgcc ggtgataagc cgcgaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct 660

tacaggctgg gctacacacg tgctacaatg gcggtgacaa tgggcagcga aagggcgacc 720

tcgagctaat cccaaaaagc cgtctcagtt cagattgcac tctgcaactc gagtgcatga 780

aggtggaatc gctagtaatc gtggatcagc atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg 840

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg ggtttacccg aaggcgtcgc gctaaccgca 900

aggaggcagg 910

<210> 24

<211> 1397

<212> DNA

<213> 嗜糖土地芽孢杆菌(Terrimicrobium sacchariphilum)

<400> 24

agtcgaacgg aattttttct gtagtaatac agaggaagtt tagtggcgta cgggtgcgta 60

acacgtgagt aatctgccga gaagtggggg atagcttgcc gaaaggcaaa ttaataccgc 120

atatggccat tcttcgattg gaggaaaagc taaagcagca atgcgcttct tgatgaactc 180

gcggcctatc agctagatgg cggggtaaag gcccaccatg gctatgacgg gtagctggtc 240

tgagaggacg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agacacctac tggtggcagc 300

agtcgagaat ttttcacaat gggggaaacc ctgatggagc gacgccgcgt ggaggatgaa 360

ggccctcggg ttgtaaactc ctgtcatgcg ggaacaagaa agtgatagta ccgcaagagg 420

aagagacggc taactctgtg ccagcagccg cggtaataca gaggtctcaa gcgttgttcg 480

gattcattgg gcgtaaaggg tgcgtaggtg gcgatgtaag tctaacgtga aatctcgggg 540

ctcaaccccg aaattgcgtc ggatactgcg ttgctagagg attgtagagg agagtggaat 600

tcatggtgta gcagtgaaat gcgtagatat catgaggaag accagttgcg aaggcgactc 660

tctgggcaat tcctgacact gaggcacgaa ggctagggga gcaaacggga ttagataccc 720

cggtagtcct agcagtaaac ggtgcacgtt tggtgtgggt gggttcagac cccatccgtg 780

ccggagctaa cgcgttaaac gtgccgcctg ggaagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa 840

gaaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agtatgtggc ttaattcgat gcaacgcgaa 900

gaaccttacc tggtcttgac atgcactgtg tcatcggtga aagccggtta gttggtagca 960

atatcaacac tttgcacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1020

gttaagtccc gcaacgagcg caacccctgt gtccagttgc ccgcaaggga tctctggaca 1080

gactgccctg tgaaacgggg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcagtat ggcccttacg 1140

gccagggctg cacacgtact acaatgctca gtacagaatg aaccgaatcc gcgaggtaga 1200

ggaaatctca aaaactgagc ccagttcgga ttggaggctg caactcgcct ccatgaagtc 1260

ggaatcgcta gtaatggcgc atcagctacg gcgccgtgaa tacgttcccg ggccttgtac 1320

acaccgcccg tcacatcatg ggagtcgttt gtagccgaag tacgtaagct aaccgcaagg 1380

aagcagcgtc ctacgct 1397

<210> 25

<211> 1396

<212> DNA

<213> 类诺卡氏菌属物种(Nocardioides sp.)

<400> 25

taccatgcag tcgagcggaa ggccacttcg gtggtactcg agcggcgaac gggtgagtaa 60

cacgtgagta atctgcccct ggctttggga tagccaccgg aaacggtgat taataccgga 120

tacgacaact tcttgcatga gatggttgtg gaaagttttt cggccaggga tgtgctcgcg 180

gcctatcagc ttgatggtga ggtaatggct caccatggct tcgacgggta gccggcctga 240

gagggtgacc ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt 300

ggggaatatt ggacaatggg cggaagcctg atccagcaac gccgcgtgag ggatgacggc 360

cttcgggttg taaacctctt tcagcaggga cgaagcgcaa gtgacggtac ctgcagaaga 420

agcaccggcc aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcgag cgttgtccgg 480

aattattggg cgtaaagggc tcgtaggcgg tttgtcgcgt cgggagtgaa aaccaggtgc 540

ttaacacctg gcttgctttc gatacgggca gactagaggt attcagggga gaacggaatt 600

cctggtgtag cggtgaaatg cgcagatatc aggaggaaca ccggtggcga aggcggttct 660

ctgggaatga cctgacgctg aggagcgaaa gtgtggggag cgaacaggat tagataccct 720

ggtagtccac accgtaaacg ttgggcgcta ggtgtggggt ccattccacg gattccgtgc 780

cgcagctaac gcattaagcg ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag 840

gaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag 900

aaccttacct gggtttgaca tacaccctgc cgctccagag atggggcttc ttttgggggt 960

gtacaggtgg tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca 1020

acgagcgcaa ccctcgttct atgttgccag cacgtaatgg tggggactca taggagactg 1080

ccggggtcaa ctcggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatgcccc ttatgtccag 1140

ggcttcacgc atgctacaat ggccggtaca aagggctgcg atcccgtaag ggggagcgaa 1200

tcccaaaaag ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag 1260

tcgctagtaa tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac 1320

cgcccgtcac gtcacgaaag tcggcaacac ccgaagccgg tggcccaacc cttgtggagg 1380

gagccgtcga aggtgt 1396

<210> 26

<211> 1421

<212> DNA

<213> 水藤黄单胞菌(Luteimonas aquatica)

<400> 26

ccatgcaagt cgaacggcag cacagaggag cttgctcctt gggtggcgag tggcggacgg 60

gtgaggaata catcggaatc taccctgtcg tgggggataa cgtagggaaa cttacgctaa 120

taccgcatac gaccttcggg tgaaagtatg ggatcgcaag accttacgcg attggatgag 180

ccgatgtcgg attagcttgt tggcggggta aaagcccacc aaggcgacga tccgtagctg 240

gtctgagagg atgatcagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc 300

agcagtgggg aatattggac aatgggcgca agcctgatcc agccataccg cgtgggtgaa 360

gaaggccttc gggttgtaaa gcccttttgt tgggaaagaa atcctgtcgg ttaatacccg 420

gtagggatga cggtacccaa agaataagca ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta 480

atacgaaggg tgcaagcgtt actcggaatt actgggcgta aagcgtgcgt aggtggtttg 540

ttaagtctga tgtgaaagcc ctgggctcaa cctgggaatg gcattggata ctggcgagct 600

agagtgcggt agaggatggc ggaattcccg gtgtagcagt gaaatgcgta gagatcggga 660

ggaacatctg tggcgaaggc ggccatctgg accagcactg acactgaggc acgaaagcgt 720

ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccc taaacgatgc gaactggatg 780

ttgggtgcaa cttggcactc agtatcgaag ctaacgcgtt aagttcgccg cctggggagt 840

acggtcgcaa gactgaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagtatg 900

tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct tacctggcct tgacatgtcc ggaatcctgc 960

agagatgcgg gagtgccttc gggaatcgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc 1020

gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtcct tagttgccag 1080

cacgtaatgg tgggaactct aaggagaccg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg 1140

acgtcaagtc atcatggccc ttacggccag ggctacacac gtactacaat ggagaggaca 1200

gagggctgca aacccgcgag ggcgagccaa tcccagaaac ctcttctcag tccggatcgg 1260

agtctgcaac tcgactccgt gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcagatca gcattgctgc 1320

ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tttgttgcac 1380

cagaagcagg tagcttaacc gcaaggaggg cgctgccacg t 1421

<210> 27

<211> 1412

<212> DNA

<213> 博罗尼库曼葡萄球菌(Variovorax boronicumulans)

<400> 27

catgcagtcg aacggcagcg cgggagcaat cctggcggcg agtggcgaac gggtgagtaa 60

tacatcggaa cgtgcccaat cgtgggggat aacgcagcga aagctgtgct aataccgcat 120

acgatctacg gatgaaagca ggggatcgca agaccttgcg cgaatggagc ggccgatggc 180

agattaggta gttggtgagg taaaggctca ccaagccttc gatctgtagc tggtctgaga 240

ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg 300

ggaattttgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg atgaaggcct 360

tcgggttgta aactgctttt gtacggaacg aaacggcctt ttctaataaa gagggctaat 420

gacggtaccg taagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag 480

ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc gcaggcggtt atgtaagaca 540

gttgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatctgt gactgcatag ctagagtacg 600

gtagaggggg atggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg tagatatgcg gaggaacacc 660

gatggcgaag gcaatcccct ggacctgtac tgacgctcat gcacgaaagc gtggggagca 720

aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtcaactggt tgttgggtct 780

tcactgactc agtaacgaag ctaacgcgtg aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa 840

ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggtttaatt 900

cgatgcaacg cgaaaaacct tacccacctt tgacatgtac ggaattcgcc agagatggct 960

tagtgctcga aagagaaccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg 1020

agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgct acattcagtt 1080

gggcactcta atgagactgc tggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtcc 1140

tcatggccct tataggtggg gctacacacg tcatacaatg gctggtacaa agggttgcca 1200

acccgcgagg gggagctaat cccataaaac cagtcgtagt ccggatcgca gtctgcaact 1260

cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgtcacgg tgaatacgtt 1320

cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagcg ggttctgcca gaagtagtta 1380

gcttaaccgc aaggagggcg ataccacggc ag 1412

<210> 28

<211> 1333

<212> DNA

<213> 泡状短波单胞杆菌(Brevundimonas bullata)

<400> 28

gccatgcagt cgaacggacc tttcggggtt agtggcggac gggtgagtaa cacgtgggaa 60

cgtgccttta ggttcggaat agctcctgga aacgggtggt aatgccgaat gtgcccttcg 120

ggggaaagat ttatcgcctt tagagcggcc cgcgtctgat tagctagttg gttgaggtaa 180

cggctcacca aggcgacgat cagtagctgg tctgagagga tggccagcca cattgggact 240

gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga atcttgcgca atgggcgaaa 300

gcctgacgca tccatgccgc gtgaatgatg aaggtcttag gattgtaaaa ttctttcacc 360

ggggacgata atgacggtac ccggagaaga agccccggct aacttcgtgc cagcagccgc 420

ggtaatacga agggggctag cgttgctcgg aattactggg cgtaaagggc gcgtaggcgg 480

acatttaagt caggggtgaa atcccagagc tcaactctgg aactgccttt gatactgggt 540

gtcttgagtg tgagagaggt atgtggaact ccgagtgtag aggtgaaatt cgtagatatt 600

cggaagaaca ccagtggcga aggcgacata ctggctcatt actgacgctg aggcgcgaaa 660

gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgattgcta 720

gttgtcgggc tgcatgcagt tcggtgacgc agctaacgca ttaagcaatc cgcctgggga 780

gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca 840

tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgcagaac cttaccacct tttgacatgc ctggaccgcc 900

agagagatct ggctttccct tcggggacta ggacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc 960

tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcgcc attagttgcc 1020

atcatttagt tgggaactct aatgggactg ccggtgctaa gccggaggaa ggtggggatg 1080

acgtcaagtc ctcatggccc ttacagggtg ggctacacac gtgctacaat ggcgactaca 1140

gagggttaat ccttaaaagt cgtctcagtt cggattgtcc tctgcaactc gagggcatga 1200

agttggaatc gctagtaatc gcggatcagc atgccgcggt gaatacgttc ccgggccttg 1260

tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttg gttctacccg aaggcgatgc gctaacccgc 1320

aagggaggca gtc 1333

<210> 29

<211> 1192

<212> DNA

<213> 泡囊短波单胞杆菌(Brevundimonas vesicularis)

<400> 29

agagcggccc gcgtctgatt agctagttgg tgaggtaaag gctcaccaag gcgacgatca 60

gtagctggtc tgagaggatg atcagccaca ttgggactga gacacggccc aaactcctac 120

gggaggcagc agtggggaat cttgcgcaat gggcgaaagc ctgacgcagc catgccgcgt 180

gaatgatgaa ggtcttagga ttgtaaaatt ctttcaccgg ggacgataat gacggtaccc 240

ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg taatacgaag ggggctagcg 300

ttgctcggaa ttactgggcg taaagggagc gtaggcggac atttaagtca ggggtgaaat 360

cccggggctc aacctcggaa ttgcctttga tactgggtgt cttgagtatg agagaggtgt 420

gtggaactcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg gaagaacacc agtggcgaag 480

gcgacacact ggctcattac tgacgctgag gctcgaaagc gtggggagca aacaggatta 540

gataccctgg tagtccacgc cgtagacgat gattgctagt tgtcgggatg catgcatttc 600

ggtgacgcag ctaacgcatt aagcaatccg cctggggagt acggtcgcaa gattaaaact 660

caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg 720

cgcagaacct taccaccttt tgacatgcct ggaccgccag agagatctgg ctttcccttc 780

ggggactagg acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt 840

aagtcccgca acgagcgcaa ccctcgccat tagttgccat catttagttg ggaactctaa 900

tgggactgcc ggtgctaagc cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt 960

acagggtggg ctacacacgt gctacaatgg cgactacaga gggttaatcc ttaaaagtcg 1020

tctcagttcg gattgtcctc tgcaactcga gggcatgaag ttggaatcgc tagtaatcgc 1080

ggatcagcat gccgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat 1140

gggagttggt tctacccgaa ggcgctgcgc tgaccgcaag gaggcagggg ac 1192

<210> 30

<211> 1097

<212> DNA

<213> 硬水黄杆菌(Flavobacterium aquidurense)

<400> 30

cagtgaggaa tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgcaggatga 60

cggtcctatg gattgtaaac tgcttttata cgagaagaaa cactacttcg tgaagtagct 120

tgacggtatc gtaagaataa ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga 180

ggatccaagc gttatccgga atcattgggt ttaaagggtc cgtaggcggt ttaataagtc 240

agtggtgaaa gcccatcgct caacggtgga acggccattg atactgttaa acttgaatta 300

ttaggaagta actagaatat gtagtgtagc ggtgaaatgc ttagagatta catggaatac 360

caattgcgaa ggcaggttac tactaatgga ttgacgctga tggacgaaag cgtgggtagc 420

gaacaggatt agatacgctg gtagtccacg ccgtaaacga tggatactag ctgttggaag 480

caatttcagt ggctaagcga aagtgataag tatcccacct ggggagtacg ttcgcaagaa 540

tgagactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 600

tgatacgcga ggaaccttac caaggcttaa atgtagattg accggtttgg aaacagatct 660

ttcgcaagac aatttacaag gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtca 720

ggttaagtcc tataacgagc gcaacccctg ttgttagttg ccagcgagtc aagtcgggaa 780

ctctaacaag actgccagtg caaactgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcacg 840

gcccttacgc cttgggctac acacgtgcta caatggccgg tacagagagc agccactggg 900

cgaccaggag cgaatctata aaaccggtca cagttcggat cggagtctgc aactcgactc 960

cgtgaagctg gaatcgctag taatcggata tcagccatga tccggtgaat acgttcccgg 1020

gccttgtaca caccgcccgt caagccatgg aagctggggg tgcctgaagt cggtgaccgc 1080

aaggagctgc ctaggta 1097

Claims (18)

1.一种用于改善植物生长和/或产量的纯化的细菌菌株，其特征在于，所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:5、1、3、4、6、10、11、13、14、15、19、21或29组成的组的序列具有至少95％同一性的16S核苷酸序列。

2.如权利要求1所述的纯化的细菌菌株，其特征在于，所述菌株包含至少一个与选自由SEQ ID NO:5、1、3、4、6、10、11、13、14、15、19、21或29组成的组的序列相同的16S核苷酸序列。

3.如权利要求1或2所述的纯化的细菌菌株，其特征在于，所述菌株依照布达佩斯条约的条款保藏在波兰微生物保藏中心，保藏号分别为：B/00196、B/00182、B/00184、B/00195、B/00197、B/00202、B/00203、B/00205、B/00206、B/00213、B/00207、B/00192、B/00178。

4.一种用于改善植物生长和/或产量的细菌群，其中，所述细菌群包含至少一种前述权利要求1至3中任一项所述的细菌菌株。

5.如权利要求4所述的细菌群，其包含两种以上前述权利要求1至3中任一项所述的细菌菌株。

6.一种用于改善植物生长和/或产量的微生物活性成分，其特征在于，所述成分包含一种或多种分离自细菌培养物的物质，所述细菌培养物包含一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的细菌菌株或权利要求4或5所述的细菌群。

7.一种农业活性制剂，其包含农业相容性载体和一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株或权利要求4或5所述的细菌群，当所述制剂为液体制剂时，其浓度为至少约10^2CFU/ml或孢子/ml，或当所述制剂为非液体制剂时，其浓度为约10^2CFU/mg。

8.一种用于改善植物生长和/或产量的合成组合物，其中，所述组合物包含：植物要素，和前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株或权利要求4或5所述的细菌群。

9.前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株、权利要求4或5所述的细菌群、权利要求6所述的微生物活性成分、权利要求7所述的农业活性制剂或权利要求8所述的合成组合物的用途，其用于通过改善植物中具有农艺学重要性的性状来改善植物生长和/或产量。

10.如权利要求9所述的菌株、群、成分、制剂或组合物的用途，其用于通过有效抑制植物病原体的生长来改善植物生长和/或产量。

11.一种通过处理植物来赋予植物对植物病原体感染的抗性的方法，其中，用一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株、权利要求4或5所述的细菌群、权利要求6所述的微生物活性成分或权利要求4所述的农业活性制剂处理所述植物。

12.一种改善植物生长和/或产量的方法，其包括用有效量的一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株、权利要求4或5所述的细菌群、或权利要求6所述的微生物活性成分处理植物要素的步骤，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量。

13.一种改善植物生长和/或产量的方法，其包括用有效量的第一细菌菌株和第二细菌菌株处理植物要素的步骤，相对于源自参照植物要素的植物，所述有效量增加源自经处理的植物要素的植物的生长和/或产量，其特征在于，所述第一和第二细菌菌株符合前述权利要求1至3中任一项所述的菌株。

14.一种改善植物生长和/或产量的方法，其包括以下步骤：用一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株、权利要求5所述的细菌群或权利要求6所述的微生物活性成分接种植物生长培养基；和使植物在所述培养基中生长。

15.一种处理植物种子以改善植物生长和/或产量的方法，其包括用农业活性制剂机械地或手动地接种多个植物种子，所述农业活性制剂包含农业上可接受的载体和一种或多种权利要求1至3中任一项所述的纯化的细菌菌株，其特征在于，用有效量的所述菌株接种所述种子，所述有效量使得定殖于由接种的种子发育成的植物，并且与由在相同条件下生长和播种的参照种子发育成的植物相比能够增加由接种的种子发育成的植物的种子产量。

16.如权利要求13所述的方法，其特征在于，所述植物种子用所述菌株涂覆、与所述菌株一起培养或种植在所述菌株附近，使得所述菌株能够定殖于所述种子。

17.一种用合成组合物处理植物要素以改善植物生长和/或产量的方法，其中所述方法包括用一种或多种前述权利要求1至3中任一项所述的细菌菌株处理植物要素的步骤，其特征在于，与由未用所述组合物处理的植物要素生长成的参照植物相比，所述细菌菌株在所述组合物中的存在量能够在由所述植物要素生长成的植物中调节至少一个具有农艺学重要性的植物性状，所述性状选自由基因转录、转录物水平、蛋白表达、激素水平、代谢物水平和内源微生物群组成的组。

18.一种植物要素，例如种子，其涂覆有权利要求7所述的农业活性制剂。

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