CN113822389B - 一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,包括服务器和移动设备;所述服务器接收图片并标注后加入训练样本;通过主动学习方法将训练样本加入教师模型进行训练;使用教师模型预测未标注样本得到软标签;采用软标签蒸馏训练每个单学生模型和集成模型,并将模型配置到移动设备;所述移动设备进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;计算消化道疾病分类结果的可信度,将可信的消化道疾病图片分类结果进行输出显示。本发明基于主动学习和多学生知识蒸馏的分类模型使得原本依赖大量GPU资源的疾病分类任务可以在小型的移动设备上运行,从而更方便高效地帮助基层医院的医生提供诊断参考。
Description
技术领域
本发明涉及图像识别技术领域,具体涉及一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统。
背景技术
现今,内窥镜已成为检测诊断消化道疾病的常用设备,配合内窥镜使用的图像处理技术不断发展,获得病变组织的特殊图像,并能用图像分析技术实现对病变的定量分析和定量诊断。但现有的图像分析识别系统多使用大规模预训练模型,进行分类推理时需要大量GPU资源。
然而,移动设备没有强大的GPU计算资源,已有的方法不能支持移动设备,这给医生对疾病的诊断带来了不便,不能利用移动设备入个人手机提供诊断参考,该困难使得基于人工智能的消化道疾病识别系统的应用受到了很大的限制。例如:基层医院由于经费短缺,很难购买需要大量GPU资源的人工智能设备,医生只能人工判断内窥镜图片的疾病类别,对医生的精力以及经验来说是一种挑战。但是对于基层医院来说,有经验的医生非常缺乏,更迫切需要人工智能设备的帮助。
发明内容
本发明的目的是提供一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,能够不依赖于GPU计算资源,运行在移动设备上并具有良好的消化道疾病分类预测精准度。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,包括服务器和移动设备;
所述服务器包括:
数据处理模块,接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本;
教师模型训练模块,建立教师模型,通过主动学习方法将训练样本加入教师模型进行训练,实时保存当前最优的教师模型;使用当前最优的教师模型预测未标注样本得到概率值,该概率值为软标签;
多学生集成模型训练模块,包括多个学生模型以及由多个学生模型集成的集成模型,采用软标签蒸馏训练每个单学生模型和集成模型,实时保存当前最优的学生模型和集成模型,并将当前最优的学生模型和集成模型配置到移动设备;
所述移动设备包括:
测试模块,根据多学生集成模型训练模块配置的学生模型和集成模型进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;
分类结果判断模块,计算消化道疾病分类结果的可信度,将不可信的消化道疾病图片上传至数据处理模块,将可信的消化道疾病图片分类结果进行输出显示。
作为本发明的进一步改进,所述数据处理模块接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本的方法为:接收来自内窥镜设备输出的消化道疾病视频数据,按照固定时间切分视频片段并抽取每个视频片段中单位时间内的帧图片作为消化道疾病图片;同时,接收不可信的消化道疾病图片,当不可信的消化道疾病图片到达一定数量后进行人工标注,标注后加入训练样本。
作为本发明的进一步改进,所有消化道疾病图片加入训练样本前或进入测试模块中分类检测前,均进行预处理,所述预处理方法包括:对消化道疾病图片进行缩放裁剪、随机水平翻转或标准化处理。
作为本发明的进一步改进,所述教师模型为:
作为本发明的进一步改进,所述教师模型训练时,采用梯度下降法,所述教师模型的输出分类网络softmax层,公式如下:
作为本发明的进一步改进,所述教师模型训练时,采用主动学习方法将不可信的消化道疾病图片经人工标注后加入训练样本更新训练教师模型,即采用如下损失函数:
其中,N为已标注样本和经人工标注后的样本总数,m为消化道疾病图片的总类别数,为指示函数,若括号内等式成立取值为1,否则取值为0,i为第i张图片,j为第j个分类,表示分类网络第i张图片第j个类别的预测输出。
作为本发明的进一步改进,所述学生模型为:
作为本发明的进一步改进,所述学生模型训练时由教师模型分别蒸馏k个学生模型和集成模型,采用如下损失函数:
其中,C表示未标注样本数,m表示消化道疾病图片的总类别数,k表示学生模型中的网络个数,表示教师模型第i张图片第j个类别的预测输出,即软标签,表示第n个学生模型第i张图片第j个类别的预测输出,表示学生模型集成后第i张图片第j个类别的预测输出。
作为本发明的进一步改进,所述分类结果判断模块计算消化道疾病分类结果的可信度时,采用信息熵衡量分类结果的可信度,信息熵公式如下:
设置可信度阈值,当分类结果的信息熵低于阈值为可信的消化道疾病图片分类结果,否则为不可信的消化道疾病图片,对不可信的消化道疾病图片经人工标注后再次投入训练样本;
对可信的消化道疾病图片的分类标签进行输出显示,可信的消化道疾病图片的分类标签计算公式如下:
一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类方法,包括以下步骤:
S1:接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本;
S2:通过主动学习方法将训练样本加入提前建立的教师模型中进行训练,实时保存当前最优的教师模型;
S3:使用当前最优的教师模型预测未标注的消化道疾病图片得到概率值,将该概率值设置为软标签;
S4:采用软标签蒸馏训练提前建立的单学生模型和由多个学生模型集成的集成模型,实时保存当前最优的学生模型和集成模型;
S5:将当前最优的学生模型和集成模型配置到移动设备进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;
S6:计算消化道疾病分类结果的可信度,将不可信的消化道疾病图片返回步骤S1,并持续执行步骤S1-S5,直到获得可信的消化道疾病图片分类结果。
本发明的有益效果:本发明可以解决现有的系统由于使用大规模预训练模型,进行分类推理时需要大量GPU资源的问题,通过使用主动学习和压缩教师模型的方法,可以实现在移动设备上运行并保持较好的预测性能;
相对于目前主流单学生的知识蒸馏方法,本发明采用多学生蒸馏方式,利用集成学习思想提升了单学生蒸馏的性能,能够让蒸馏后多学生集成模型的分类效果同教师大模型的分类效果相同,甚至更好;另外一方面,本发明采用主动学习方法能够让蒸馏后的模型通过主动挑选新标注样本进一步提高分类效果。
附图说明
图1是本发明方法流程示意图;
图2是本发明消化道疾病图片示意图;
图3是本发明实施例提供的基于主动学习的多学生知识蒸馏模型;
图4是本发明实施例提供的可信图片实时结果显示图;
图5是本发明实施例提供的不可信图片实时结果显示图;
图6是本发明系统结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明,以使本领域的技术人员可以更好地理解本发明并能予以实施,但所举实施例不作为对本发明的限定。
参考图1,本发明提供了一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类方法,包括以下步骤:
S1:接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本;
S2:通过主动学习方法将训练样本加入提前建立的教师模型中进行训练,实时保存当前最优的教师模型;
S3:使用当前最优的教师模型预测未标注的消化道疾病图片得到概率值,将该概率值设置为软标签;
S4:采用软标签蒸馏训练提前建立的单学生模型和由多个学生模型集成的集成模型,实时保存当前最优的学生模型和集成模型;
S5:将当前最优的学生模型和集成模型配置到移动设备进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;
S6:计算消化道疾病分类结果的可信度,将不可信的消化道疾病图片返回步骤S1,并持续执行步骤S1-S5,直到获得可信的消化道疾病图片分类结果。
本发明教师模型训练采用主动学习方法,教师模型为大型网络,蒸馏的学生模型为多个超小型网络的集成,通过将大参数量的教师模型的知识传递给小参数量的多学生模型及集成模型,使得原本依赖大量GPU资源的疾病分类任务可以在小型的移动设备上运行,从而更方便高效地帮助基层医院的医生提供诊断参考。
具体的,步骤S1中接收来自内窥镜设备输出的消化道疾病视频数据,按照固定时间切分视频片段并抽取每个视频片段中单位时间的帧图片作为消化道疾病图片;同时,接收不可信的消化道疾病图片,不可信的消化道疾病图片来自经过移动设备检测后的分类结果图片,当不可信的消化道疾病图片到达一定数量后进行人工标注,标注后加入训练样本。由于一般的识别分类模型无法直接输入原生的视频,因此进一步要对视频数据进行视频帧的抽取,其中视频帧的抽取采用一定的时间间隔,本实施例不对具体的间隔时间作限定。比如,一段时长为10分钟的原生检测视频,以1分钟为时间段进行切分,共得到10段视频,每段视频以200ms为时间间隔进行抽取,共取得10组300张视频帧图片,如图2所示,为其中一张胃溃疡疾病帧图片。
所有消化道疾病图片加入训练样本前或进行步骤S5中的检测前,均进行预处理,图片预处理操作包括以下几种中的一种或多种:缩放裁剪处理、随机水平翻转处理、标准化处理。缩放裁剪处理用于将输入图片处理成固定的尺寸。标准化处理是指在图片的RGB维度上减去数据对应维度的统计平均值,以消除公共的部分、凸显个体之间的特征和差异。随机水平翻转处理也是为了进行数据增强来提高模型的泛化能力。本实施例不对图片缩放裁剪的取值作限定。比如,将不同输入图片的尺寸缩放为640*640*3的大小,随后裁剪为384*384*3的大小,剪去图片四个边角的黑色冗余部分,最后进行数据标准化得到最终的输入图像的特征。
具体模型训练及配置过程:教师模型为:
教师模型训练时,采用梯度下降法,所述教师模型的输出分类网络softmax层,公式如下:
教师模型训练时,采用主动学习方法将移动设备上传的消化道疾病图片经人工标注后加入训练样本更新训练教师模型,即采用如下损失函数:
其中,N为已标注样本和经人工标注后的样本总数,m为消化道疾病图片的总类别数,为指示函数,若括号内等式成立取值为1,否则取值为0,i为第i张图片,j为第j个分类,表示分类网络第i张图片第j个类别的预测输出。
学生模型为:
学生模型训练时由教师模型分别蒸馏k个学生模型和集成模型,利用软标签,采用如下损失函数:
其中,C表示未标注样本数,m表示消化道疾病图片的总类别数,k表示学生模型中的网络个数,表示教师模型第i张图片第j个类别的预测输出,即软标签,表示第n个学生模型第i张图片第j个类别的预测输出,表示学生模型集成后第i张图片第j个类别的预测输出。
步骤S6中,具体地,计算学生模型分类结果的不确定性,学生模型对未标注样本测试后,使用信息熵衡量分类结果的可信度,信息熵越大可信度越低,信息熵公式如下:
比较信息熵和阈值大小,信息熵低于阈值的分为可信度高的样本,否则分为可信度低的样本,对可信度低的样本上传返回步骤S1,经人工标注后再次投入训练样本,而可信度高的样本经过标签计算后输出显示,样本标签计算公式如下:
实施例一
参照图1、图3和图6,一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,在服务器上运行,接收来自内窥镜设备输出的消化道疾病视频数据和来自移动设备多学生集成模型测试模块中选取的不可信图片,当接收到的不可信图片数量大于Y时,提醒人工标注每张图片的疾病类别,例如Y可取128,然后进行图片预处理操作。
教师模型可以使用ViT-Huge网络,共32层,每层网络由4个主要的部分构成,即一个用于获取序列特征及信息的多头注意力层、一个用于非线性变换的前馈传播层和两个用于归一化的加和标准化层;在每一层的多头注意力层和前馈传播层之前都添加加和标准化层,前馈传播层位于多头注意力层之后,每一层ViT网络的输出直接作为下一层ViT网络的输入,公式如下:
可选地,如图3所示,教师模型训练时采用主动学习方法,根据学生模型测试出的不可信样本经人工标注后更新训练集,不断迭代训练。
学生模型可使用3个集成的Resnet18网络,每个网络一共由18个带有权重的层组成,使用的卷积核由1*1,3*3,1*1组成,主要分为6个部分,分别是conv1、conv2_x、conv3_x、conv4_x、conv5_x以及最后自适应全局池化层和全连接层。图片预处理后通过3个Resnet18网络的概率输出分别为,集成后概率输出为,公式如下:
如图3所示,学生模型训练时由教师模型分别蒸馏3个Resnet18模型和集成模型,损失函数的比例设成1:1:1:1。在训练过程中,设置批大小为64,教师模型的初始学习率为0.00001,学生模型的初始学习率为0.001,采用Adam优化器,在其它实施方式中,模型训练时对应的超参数也可以不同,批大小和初始学习率也可以为其它值,本实施例不对训练过程中的各个参数取值作限定。
将当前训练好的学生模型和集成模型配置到移动设备,这样可对移动设备直接输入待检测的内窥镜消化道疾病图片,在移动设备端通过学生模型和集成模型检测疾病分类结果,如图2所示的未标注的疾病图片,经学生模型输出后,计算分类结果的不确定性,学生模型对未标注样本测试后,使用信息熵衡量分类结果的可信度,信息熵越大可信度越低,因此,
设置可信度阈值,当分类结果的信息熵低于阈值为可信的消化道疾病图片分类结果,否则为不可信的消化道疾病图片,对不可信的消化道疾病图片经人工标注后再次投入训练样本;
信息熵公式如下:
对可信的消化道疾病图片的分类标签进行输出显示,可信的消化道疾病图片的分类标签计算公式如下:
在移动设备上课向用户显示学生模型对测试数据的测试结果,分为2种情况,如图4所示,若分类结果是可信的,显示该图片的分类标签,若分类结果是不可信的,如图5所示,提示用户将该图片上传至服务器端。
进一步的,学生模型中的小型网络可选用Resnet18,数量k可取值3,使用测试数据对多学生模型进行测试,测试结果分为3个Resnet18模型分别的概率输出以及集成后的概率输出。
参考下表一所示的教师模型ViT-Huge、多学生集成Resnet18模型在性能接近的情况下参数量的对比结果,学生模型相比教师模型的压缩比接近1:18,可见,本发明有效地解决了疾病分类任务依赖于GPU计算资源的问题,使得在移动设备上可以正常运行并具有良好的预测精准度。
表一
实施例二
如图6所示,本发明实施例提供一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,包括服务器和移动设备;
所述服务器包括:
数据处理模块,接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本;
教师模型训练模块,建立教师模型,通过主动学习方法将训练样本加入教师模型进行训练,实时保存当前最优的教师模型;使用当前最优的教师模型预测未标注样本得到概率值,该概率值为软标签;
多学生集成模型训练模块,包括多个学生模型以及由多个学生模型集成的集成模型,采用软标签蒸馏训练每个单学生模型和集成模型,实时保存当前最优的学生模型和集成模型,并将当前最优的学生模型和集成模型配置到移动设备;
所述移动设备包括:
测试模块,根据多学生集成模型训练模块配置的学生模型和集成模型进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;
分类结果判断模块,计算消化道疾病分类结果的可信度,将不可信的消化道疾病图片上传至数据处理模块,将可信的消化道疾病图片分类结果进行输出显示。
使用时,移动设备还包括视频接口模块、预处理数据模块、多学生集成模型测试模块和显示模块,多学生集成模型测试模块即根据服务器配置的多学生模型和集成模型,其经过教师模型的蒸馏训练,使得学生模型进行压缩,使其可以再移动设备上顺利运行,且蒸馏后的模型效果同教师大模型分类效果相同,甚至更好;视频接口模块接收内窥镜设备输出的消化道疾病图片,经过预处理数据模块对图片进行预处理后进入多学生集成模型测试模块进行检测,检测结果进入分类结果判断模块,分类结果判断模块计算消化道疾病分类结果的可信度,设置可信度阈值,当可信度小于阈值,即可信的图片结果,则输出可信消化道疾病分类结果到显示模块进行显示,否则将不可信的消化道疾病图片上传到服务器的数据处理模块,进行人工标注后加入训练样本,持续模型训练过程,采用主动学习方法能够让蒸馏后的模型通过主动挑选的新标注样本进一步提高分类效果。
在服务器上,整个教师模型和学生模型体系即多学生知识蒸馏模型体系,数据处理模块,接收内窥镜设备输出的消化道疾病图片并标注为原始样本;同时,接收移动设备上传的消化道疾病图片为未标注样本;其中,内窥镜设备输出的是消化道疾病视频数据,按照固定时间切分视频片段并抽取每个视频片段中单位时间的帧图片作为消化道疾病图片;数据处理模块内的帧图片到达一定数量后进行人工标注,标注后的帧图片加入训练样本。
教师模型训练模块,采用主动学习方法将原始样本作为训练样本建立教师模型,将未标注样本进行人工标注后加入训练样本训练教师模型,直至所有未标注样本经标注后都被加入训练样本,实时保存当前最优的教师模型;使用当前最优的教师模型预测未标注样本得到概率值,该概率值为软标签;
多学生集成模型训练模块,包括多个学生模型以及由多个学生模型集成的集成模型,采用软标签蒸馏每个单学生模型和集成模型进行训练,实时保存当前最优的多学生集成模型,并将当前最优的多学生集成模型配置到移动设备的多学生集成模型测试模块。
以上所述实施例仅是为充分说明本发明而所举的较佳的实施例,本发明的保护范围不限于此。本技术领域的技术人员在本发明基础上所作的等同替代或变换,均在本发明的保护范围之内。本发明的保护范围以权利要求书为准。
Claims (8)
1.一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,其特征在于:包括服务器和移动设备;
所述服务器包括:
数据处理模块,接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本;
教师模型训练模块,建立教师模型,通过主动学习方法将训练样本加入教师模型进行训练,实时保存当前最优的教师模型;使用当前最优的教师模型预测未标注样本得到概率值,该概率值为软标签;
多学生集成模型训练模块,包括多个学生模型以及由多个学生模型集成的集成模型,采用软标签蒸馏训练每个单学生模型和集成模型,实时保存当前最优的学生模型和集成模型,并将当前最优的学生模型和集成模型配置到移动设备;
所述移动设备包括:
测试模块,根据多学生集成模型训练模块配置的学生模型和集成模型进行消化道疾病图片分类检测,获得消化道疾病分类结果;
分类结果判断模块,计算消化道疾病分类结果的可信度,将不可信的消化道疾病图片上传至数据处理模块,将可信的消化道疾病图片分类结果进行输出显示;
所述学生模型训练时由教师模型分别蒸馏k个学生模型和集成模型,采用如下损失函数:
2.如权利要求1所述的一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,其特征在于:所述数据处理模块接收消化道疾病图片并标注后加入训练样本的方法为:接收来自内窥镜设备输出的消化道疾病视频数据,按照固定时间切分视频片段并抽取每个视频片段中单位时间内的帧图片作为消化道疾病图片;同时,接收不可信的消化道疾病图片,当不可信的消化道疾病图片到达一定数量后进行人工标注,标注后加入训练样本。
3.如权利要求1所述的一种基于内窥镜图片的消化道疾病分类系统,其特征在于:所有消化道疾病图片加入训练样本前或进入测试模块中分类检测前,均进行预处理,所述预处理方法包括:对消化道疾病图片进行缩放裁剪、随机水平翻转或标准化处理。
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PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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GR01 | Patent grant | ||
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