CN113628759A - 一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,属于神经网络和大数据领域,包括如下步骤:步骤1:对疫情分布大数据进行收集和预处理,构建疫情多信息分布图像数据集;步骤2:计算安全性向量标签;步骤3:构建由采用RepVGG‑B3为主干网络的卷积模块和长短时记忆模块组成的神经网络;步骤4:通过映射梯度对损失曲面变形;步骤5:训练所构建的神经网络;步骤6:使用训练所得神经网络进行预测,并对网络输出的安全性向量进行处理。本发明能够通过梯度映射对损失曲面进行变形,缓解甚至避免神经网络训练中的梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题,提升疫情安全区域预测的精度和自动化程度。
Description
技术领域
本发明涉及一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,属于神经网络和大数据领域。
背景技术
传染病疫情的迅速扩散对国家和人民造成了巨大的损失。由于全国各地区交通发达程度以及人口流量和流向差异等因素,传染病疫情在各地的严重程度不尽相同。在人们选择出行时,往往需要提前规划和确定行程,然而未来的疫情安全区域的时空发展趋势却难以提前获知;另外这种发展趋势对国家和地方政府的交通收放政策的制定而言有重要参考作用。目前,随着疫情管理系统的不断完善,疫情大数据不断积累。这为基于大数据和人工智能的疫情安全区域预测方法提供了基础。
此外,考虑到神经网络在特征提取、自主学习等方面的突出表现,充分运用神经网络等前沿技术对传染病疫情进行时空预测至关重要。然而,目前的深度神经网络和卷积神经网络训练中还存在梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题,制约了这类神经网络性能的进一步提升;而本发明提供的通过梯度映射对损失曲面变形的方法有助于解决上述问题。
中国专利文献号CN 111933295 A,公开/公告日2020年11月13日,发明名称为“一种基于大数据的潜伏期传染病区域预警方法”中公开了一种根据患者手机信号活跃区域手动构建预警模型的潜伏期传染病区域预警方法,但未使用机器学习模型,缺乏灵活性,且需要监测患者活动,数据获取困难;中国专利文献号CN 111462917 A,公开/公告日2020年07月28日,发明名称为“基于空间地理分析和机器学习的疫情预警方法及系统”中公开了一种基于机器学习的疫情预警系统,其根据相关性分析处理空间信息后使用机器学习模型进行训练,但其所用机器学习模型并未统一处理时空信息,且未能解决深度神经网络和卷积神经网络训练中梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题;中国专利文献号CN111768873 A,公开/公告日2020年10月13日,发明名称为“一种COVID-19实时风险预测方法”中公开了一种针对COVID-19、利用动力学模型和熵值-层次分析模型等进行实时风险预测的方法,但并未使用机器学习模型自动分析,且预警时间跨度较短。
考虑到这些,亟需一种基于大数据、综合分析处理时空信息、具有较大时间跨度预测能力的自动化高精度传染病疫情安全区域预测方法。
发明内容
针对现有疫情预测技术和方法中存在未能基于神经网络协同考虑时空信息、缺乏针对安全区域的长时预测方法、预测精度有待提高等不足,本发明提供一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,旨在通过梯度映射对损失曲面进行变形,缓解甚至避免神经网络训练中的梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题,提升疫情安全区域预测的精度和自动化程度。本发明首先对疫情分布地图数据进行预处理,然后将预处理后的图像作为输入,将疫情安全区域作为标签,以对一个由卷积模块、长短时记忆模块组成的神经网络进行训练,进行传染病疫情安全区域预测。
为达到上述目的,本发明提供如下技术方案。
步骤1:对疫情分布大数据进行收集和预处理,构建疫情多信息分布图像数据集。获取区域r和时刻t的传染病新增确诊人数γ1,r,t、累计确诊人数γ2,r,t、新增死亡人数γ3,r,t、累计死亡人数γ4,r,t、境外输入病例数γ5,r,t、气温γ6,r,t6个项目(统一记为γi,r,t,其中下标i=1,2,...,6表示第i个项目)的数据。去除数据中不需要的字段;采用自由边界的三次样条插值填充缺失数值,若无缺失则无需填充;去除异常值;进行格式内容清洗并整合。进行如上处理后,假设共有个区域,个总时刻。对于第i个项目,将γi,r,t线性地映射到0-255之间的灰度值,即:
其中,γ′i,r,t为所得灰度值,min(·)和max(·)分别表示取最小值和取最大值,将各区域在时刻t关于第i个项目的灰度值填充至地图相应区域,得到6张单通道的分布图像。将这些单通道分布图像分别作为一个通道叠加后构成一张6通道的疫情多信息分布图像,并将其作为一个样本。按照时刻先后顺序,对总共个时刻进行上述通道叠加处理,得到个样本。根据所有样本建立张量其中,是输入通道数,是输入图片高度,是输入图片宽度。将输入张量映射到[0,1]区间:X′=(1/255)X,并将X′作为神经网络的输入张量。
其中,符号∏表示连乘,q表示时刻t之后的q个时刻,v代表感染人数,e为自然对数,β为敏感性系数,是一个手动设定的参数,默认取1。β越大安全性越容易接近0,但各区域的安全性排序结果保持不变。st,r的含义为:从时刻t开始,往后q个时刻内始终安全的程度。实际应用中,q的取值取决于需要在某区域停留的时刻数,默认取1。若q个时刻内数据已终止,则将空缺数据用最末一个已有数据填充。在此基础上,时刻t的安全性向量被定义为神经网络在时刻t的标签被取为安全性向量的真实值。
步骤3:构建由采用RepVGG-B3为主干网络的卷积模块和长短时记忆模块组成的神经网络。构建卷积模块用于提取各时刻疫情分布空间特征。RepVGG-B3在全局平均池化和全连接层之后,由5个阶段(stage)组成,这些stage包含的层数从前往后依次为1、4、6、16、1;每个stage的第一层采用stride=2的3x3卷积进行降采样,并用1x1卷积进行跨层连接;其余每个层由stride=1的3x3卷积组成,并用1x1卷积和恒等连接作为跨层连接。RepVGG-B3在stage 1、2、3、4、5的宽度依次为64、192、384、768、2560。RepVGG-B3在stage 2的结构示意如图1所示,其余stage仅宽度和深度不同。使用下式表示2维卷积操作:
其中,表示第l层在第t个时刻第c个通道的特征图,ReLU(·)表示ReLU函数,表示第l-1层与第l层之间的卷积核,表示第l层的输入通道数,★表示卷积运算,表示偏置。经过卷积模块处理的疫情分布空间特征被输入到长短时记忆模块,以学习时序信息。长短时记忆模块遵循以下公式:
It=σ(WIIAt+BII+WHIHt-1+BHI), (4)
Ft=σ(WIFAt+BIF+WHFHt-1+BHF), (5)
Gt=tanh(WIGAt+BIG+WHGHt-1+BHG), (6)
Ot=σ(WIOAt+BIO+WHOHt-1+BHO), (7)
Ct=Ft⊙Ct-1+It⊙Gt, (8)
Ht=Ot⊙tanh(Ct), (9)
Yt=σ(WOOHt), (10)
其中,I表示输入门,σ(·)表示Sigmoid函数,W表示权重,A表示输入,B表示偏置,H表示隐藏状态,F表示遗忘门,G表示单元门,O表示输出门,C表示单元状态,Y表示输出,⊙表示哈达马积,下标t表示t时刻,下标II表示从输入到输入门,下标HI表示从隐藏状态到输入门,依此类推。假设有个时刻的训练数据,若需得到时刻的预测值,则将预测所得时刻的值合并至输入以获得时刻的值,以此类推获得时刻的预测值。
步骤4:通过映射梯度对损失曲面变形。首先,定义梯度形变函数为
其中,g为损失函数对参数的梯度,a1,a2,a3>0为控制形变方式的可调超参数,sign(·)为取符号操作。梯度形变函数的设计旨在通过控制损失曲面的形状,进而缓解深度神经网络和循环神经网络训练中常出现的梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题。如图所示,a1越小,则的值域越小,意味着损失曲面陡峭程度的上限越小,可缓解梯度爆炸问题;a2越大,则g较小的区域越大,意味着将梯度绝对值较小的区域变得更陡峭,可缓解梯度消失、鞍点和高原问题;a3越大,则g=0的邻域内的绝对值越大,避免了梯度极接近0而使训练接近停滞的情形,且增强了梯度下降后期的随机性,有助于泛化。
步骤5:训练所构建的神经网络。经过梯度映射后,带动量的梯度下降参数迭代公式为
θk+1=θk+ρk, (15)
其中,g是个样本的平均梯度,下标k代表第k步迭代,代表在样本Xj上损失函数对参数θ的梯度,μ为动量因子,η为学习率。θ表示神经网络中(包括卷积模块和长短时记忆模块)的任意可训练参数。利用公式(11)-(15)对所得神经网络进行训练。
步骤6:使用训练所得神经网络进行预测,并对网络输出的安全性向量进行处理。完成模型训练后,使用神经网络预测得到未来个时刻的安全性向量t时刻预测所得安全性向量st包含的是个区域的安全性度量。按照构造标签时各个区域对应元素在st中的位置,可以得到特定区域的安全性度量值。对不同区域的安全性度量值进行排序以获取安全性序列。
与现有技术相比,本发明的有益效果在于:综合了卷积模块和长短时记忆模块协同提取时空特征,能缓解甚至避免神经网络训练中的梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题,进而实现高精度且自动化的传染病疫情安全区域预测,可以为国家和地方政府的政策制定以及人民的出行规划提供参考。
附图说明
为了说明本发明的目的、技术方案,本发明提供如下附图说明:
图1为本发明的执行流程图;
图2为本发明的优选实施例的疫情多信息分布图像;
图3为本发明的优选实施例的神经网络结构图;
图4为本发明的优选实施例中RepVGG-B3卷积神经网络模块在第2个stage的结构图,其余stage仅深度和宽度不同;
图5为本发明的优选实施例中利用梯度对损失曲面变形的函数示意图,横坐标为原始梯度,纵坐标为变换后梯度;
图6为本发明的优选实施例中利用梯度对损失曲面变形前后示意图,横坐标为参数,纵坐标为损失函数。
具体实施方式
下面结合附图对本发明的优选实施例进行详细描述。本发明可以由下述所限定的和覆盖的多种不同方式实施。
步骤1:对全国34个省、自治区、直辖市疫情分布大数据进行收集和预处理,构建疫情多信息分布图像数据集。获取区域r和时刻t的传染病新增确诊人数γ1,r,t、累计确诊人数γ2,r,t、新增死亡人数γ3,r,t、累计死亡人数γ4,r,t、境外输入病例数γ5,r,t、气温γ6,r,t6个项目(统一记为γi,r,t,其中下标i=1,2,...,6表示第i个项目)的数据。去除数据中不需要的字段;采用自由边界的三次样条插值填充缺失数值,若无缺失则无需填充;去除异常值(如数值极大的离群点);进行格式内容清洗并整合为表格。进行如上处理后,共有个区域,个总时刻。对于第i个项目,将γi,r,t线性地映射到0-255之间的灰度值,即:
其中,γ′i,r,t为所得灰度值,min(·)和max(·)分别表示取最小值和取最大值,将各区域在时刻t关于第i个项目的灰度值填充至中国地图相应区域,得到6张单通道的分布图像。将这些单通道分布图像分别作为一个通道叠加后构成一张6通道的疫情多信息分布图像,并将其作为一个样本,如图2所示。按照时刻先后顺序,对总共个时刻进行上述通道叠加处理,得到个样本。根据所有样本建立张量其中,是输入通道数,是输入图片高度,是输入图片宽度。将输入张量映射到[0,1]区间:X′=(1/255)X,并将X′作为神经网络的输入张量。
其中,符号∏表示连乘,q表示时刻t之后的q个时刻,v代表感染人数,e为自然对数,β为敏感性系数,在此实施例中取1。β越大安全性越容易接近0,但各区域的安全性排序结果保持不变。st,r的含义为:从时刻t开始,往后q个时刻内始终安全的程度。实际应用中,q的取值取决于需要在某区域停留的时刻数,在此实施例中取1。若q个时刻内数据已终止,则将空缺数据用最末一个已有数据填充。在此基础上,时刻t的安全性向量被定义为神经网络在时刻t的标签被取为安全性向量的真实值。
步骤3:构建由采用RepVGG-B3为主干网络的卷积模块和长短时记忆模块组成的神经网络。神经网络结构图如图3所示。卷积模块用于提取各时刻疫情分布空间特征。RepVGG-B3在全局平均池化和全连接层之后,由5个阶段(stage)组成,这些stage包含的层数从前往后依次为1、4、6、16、1;每个stage的第一层采用stride=2的3x3卷积进行降采样,并用1x1卷积进行跨层连接;其余每个层由stride=1的3x3卷积组成,并用1x1卷积和恒等连接作为跨层连接。RepVGG-B3在stage 1、2、3、4、5的宽度依次为64、192、384、768、2560。RepVGG-B3在stage 2的结构示意如图4所示,其余stage仅宽度和深度不同。使用下式表示2维卷积操作:
其中,表示第l层在第t个时刻第c个通道的特征图,ReLU(·)表示ReLU函数,表示第l-1层与第l层之间的卷积核,表示第l层的输入通道数,★表示卷积运算,表示偏置。经过卷积模块处理的疫情分布空间特征被输入到长短时记忆模块,以学习时序信息。长短时记忆模块遵循以下公式:
It=σ(WIIAt+BII+WHIHt-1+BHI), (19)
Ft=σ(WIFAt+BIF+WHFHt-1+BHF), (20)
Gt=tanh(WIGAt+BIG+WHGHt-1+BHG), (21)
Ot=σ(WIOAt+BIO+WHOHt-1+BHO), (22)
Ct=Ft⊙Ct-1+It⊙Gt, (23)
Ht=Ot⊙tanh(Ct), (24)
Yt=σ(WOOHt), (25)
其中,I表示输入门,σ(·)表示Sigmoid函数,W表示权重,A表示输入,B表示偏置,H表示隐藏状态,F表示遗忘门,G表示单元门,O表示输出门,C表示单元状态,Y表示输出,⊙表示哈达马积,下标t表示t时刻,下标II表示从输入到输入门,下标HI表示从隐藏状态到输入门,依此类推。假设有个时刻的训练数据,若需得到时刻的预测值,则将预测所得时刻的值合并至输入以获得时刻的值,以此类推获得时刻的预测值。
步骤4:通过映射梯度对损失曲面变形。首先,定义梯度形变函数为
其中,g为损失函数对参数的梯度,a1,a2,a3>0为控制形变方式的可调超参数,sign(·)为取符号操作。梯度形变函数的设计旨在通过控制损失曲面的形状,进而缓解深度神经网络和循环神经网络训练中常出现的梯度爆炸、梯度消失、鞍点和高原附近难以训练的问题。如图所示,a1越小,则的值域越小,意味着损失曲面陡峭程度的上限越小,可缓解梯度爆炸问题;a2越大,则g较小的区域越大,意味着将梯度绝对值较小的区域变得更陡峭,可缓解梯度消失、鞍点和高原问题;a3越大,则g=0的邻域内的绝对值越大,避免了梯度极接近0而使训练接近停滞的情形,且增强了梯度下降后期的随机性,有助于泛化。在此实施例中,a1=1.5,a2=5,a3=0.1。
步骤5:基于PyTorch框架训练所构建的神经网络。经过梯度映射后,带动量的梯度下降参数迭代公式为
θk+1=θk+ρk, (30)
其中,g是个样本的平均梯度,下标k代表第k步迭代,代表在样本Xj上损失函数对参数θ的梯度,μ为动量因子,η为学习率。θ表示神经网络中(包括卷积模块和长短时记忆模块)的任意可训练参数。基于PyTorch框架,利用公式(11)-(15)对所得神经网络进行训练。
步骤6:使用训练所得神经网络进行预测,并对网络输出的安全性向量进行处理。完成模型训练后,使用神经网络预测得到未来个时刻的安全性向量t时刻预测所得安全性向量st包含的是全国34个省、自治区、直辖市的安全性度量。按照构造标签时各个区域对应元素在st中的位置,可以得到特定区域的安全性度量值。对不同区域的安全性度量值进行排序,可以为国家和地方政府的政策制定以及人民的出行规划提供参考。
以上优选实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管通过上述优选实施例已经对本发明进行了详细的描述,但本领域技术人员应当理解,可以在形式上和细节上对其做出各种各样的改变,而不偏离本发明权利要求书所限定的范围。
Claims (7)
1.一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,其特征在于,该方法包含以下步骤:
步骤1:对疫情分布大数据进行收集和预处理,构建疫情多信息分布图像数据集;
步骤2:计算安全性向量标签;
步骤3:构建由采用RepVGG-B3为主干网络的卷积模块和长短时记忆模块组成的神经网络;
步骤4:通过映射梯度对损失曲面变形;
步骤5:训练所构建的神经网络;
步骤6:使用训练所得神经网络进行预测,并对网络输出的安全性向量进行处理。
2.根据权利要求1所述的一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,其特征在于,所述的步骤1具体如下:
获取区域r和时刻t的传染病新增确诊人数γ1,r,t、累计确诊人数γ2,r,t、新增死亡人数γ3,r,t、累计死亡人数γ4,r,t、境外输入病例数γ5,r,t、气温γ6,r,t6个项目(统一记为γi,r,t,其中下标i=1,2,…,6表示第i个项目)的数据;去除数据中不需要的字段;采用自由边界的三次样条插值填充缺失数值,若无缺失则无需填充;去除异常值;进行格式内容清洗并整合;进行如上处理后,假设共有个区域,个总时刻;对于第i个项目,将γi,r,t线性地映射到0-255之间的灰度值,即:
4.根据权利要求1所述的一种基于大数据的传染病疫情安全区域预测方法,其特征在于,所述的步骤3具体如下:
构建卷积模块用于提取各时刻疫情分布空间特征;RepVGG-B3在全局平均池化和全连接层之后,由5个阶段(stage)组成,这些stage包含的层数从前往后依次为1、4、6、16、1;每个stage的第一层采用stride=2的3x3卷积进行降采样,并用1x1卷积进行跨层连接;其余每个层由stride=1的3x3卷积组成,并用1x1卷积和恒等连接作为跨层连接;RepVGG-B3在stage 1、2、3、4、5的宽度依次为64、192、384、768、2560;用下式表示2维卷积操作:
其中,表示第l层在第t个时刻第c个通道的特征图,ReLU(·)表示ReLU函数,表示第l-1层与第l层之间的卷积核,表示第l层的输入通道数,★表示卷积运算,表示偏置;经过卷积模块处理的疫情分布空间特征被输入到长短时记忆模块,以学习时序信息;长短时记忆模块遵循以下公式:
It=σ(WIIAt+BII+WHIHt-1+BHI), (4)
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