CN113039428A - 补偿编辑器 - Google Patents
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Abstract
本发明包括用于显示和编辑溢出值的系统、设备、方法及溢出编辑器。溢出编辑器的视图可包含由行和列组成的三角形网格，所述行和列表示荧光团，每个行和列均包含至少一个显示区域和两个溢出值。接收到调整后溢出值后，所述溢出编辑器的调整后视图可包含使用所述调整后溢出值确定的调整后图。
Description
技术领域
本发明通常涉及自动颗粒评估技术领域，更具体而言，涉及样品分析和颗粒表征方法。
背景技术
颗粒分析仪(例如，流式细胞仪)可基于光散射和荧光等电光测量值来表征颗粒。在流式细胞仪中，例如，流体悬浮液中的颗粒(例如分子、与分析物结合的微珠或个别细胞)通过检测区域，在所述区域内，所述颗粒暴露于通常来自一个或更多个激光器的激发光中，并且测定所述颗粒的光散射和荧光特性。颗粒或其组分通常用荧光染料标记以便进行检测。各种不同的颗粒或组分可以通过用光谱特性不同的荧光染料标记来同时加以检测。不同的细胞类型可以通过用荧光染料标记的抗体或其他荧光探针标记各种细胞蛋白或其他组分而得到/产生的光散射特性和荧光发射加以识别。利用多色流式细胞术进行细胞(或其他颗粒)分析所获得的数据是多维的，其中每个细胞对应于由所述被测参数定义的多维空间中的一个点。细胞群或颗粒群被识别为所述数据空间中的点的聚类。
发明内容
本发明包括用于显示和编辑溢出值的方法的实施例。在一些实施例中，所述方法受处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)控制，并且包含：促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述方法可包含：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件。所述方法可包含：促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。所述方法可包含：接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述方法可包含：促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的方法的实施例。在一些实施例中，所述方法受处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)控制，并且包含：促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述方法可包含接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述方法可包含促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述方法可包含接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件。所述方法可包含促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
在一些实施例中，所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。在一些实施例中，所述方法包含确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
在一些实施例中，所述方法包含：获取包含所述溢出值的溢出矩阵(或溢出表)；以及利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出矩阵可以是默认的未经调整的溢出矩阵。所述溢出矩阵可以是第一调整后溢出矩阵。所述方法可包含：确定第二调整后溢出矩阵，所述溢出矩阵包含来自所述溢出矩阵的所述调整后溢出值；以及利用所述第二调整后溢出矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。所述方法可包含确定所述第二调整后溢出矩阵的逆矩阵，其中生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图包含利用所述第二调整后溢出矩阵的所述逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。所述方法可包含接收所述溢出矩阵。
在一些实施例中，所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。在一些实施例中，所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
在一些实施例中，所述方法包含：促使显示利用所述多维事件数据确定的所述多种细胞的多种细胞类型的群体层次结构；以及接收所述多种细胞类型中的一种或更多种类型的选择事件，其中所述一种或更多种目的细胞包含具有所述多种细胞类型中的所述一种或更多种类型中的任一种的所述多种细胞中的一种或更多种细胞。所述方法可包含：接收与所述第一多个荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据。
在一些实施例中，由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团是不同的。由所述多个列中的列表示的所述荧光团可具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
在一些实施例中，所述方法包含接收来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择(包含所述第一多个荧光团)。所述方法可包含接收来自所述第一多个荧光团的第二多个荧光团的选择(包含所述第二多个荧光团)。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。所述方法可包含促使显示所述溢出编辑器的第二调整后视图，所述视图包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述方法可包含生成所述溢出编辑器的所述第二调整后视图。
在一些实施例中，由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差一个。
在一些实施例中，所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域可彼此对齐。
在一些实施例中，每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。每一列的所述报头信息对象均可位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。
在一些实施例中，所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象可具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的。所述两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象可具有相同的背景颜色。所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可具有较高的对比度。所述文本标记的颜色可以是白色。
在一些实施例中，显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色可与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可具有较高的对比度。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色可以是白色。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且所述第二溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置水平相邻。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的右侧。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的左侧。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置相邻，并且所述第二溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置相邻。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一显示区域的右上角和左下角。所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值，并且所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
在一些实施例中，所述背景颜色是白色，并且所述调整后背景颜色是非白色。所述调整后背景颜色的所述非白色可与所述调整后溢出值和所述相应溢出值之间的差异相关。所述调整后背景颜色的所述非白色可与所述调整后溢出值和相应默认溢出值之间的差异相关。
在一些实施例中，所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。所述增加指示器可包含向上箭头，并且所述减少指示器包含向下箭头。接收所述调整后溢出值可包含接收所述增加指示器或所述减少激活器的激活事件。接收所述调整后溢出值可包含从用户处接收所述调整后溢出值的文本输入。
在一些实施例中，所述方法可包含：接收所述调整后溢出值的溢出值重置事件；并且促使显示所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出值重置事件可包含利用指向设备单击或双击位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
在一些实施例中，所述方法包含：接收所述第一多个显示区域中的显示区域的放大事件；以及促使显示所述溢出编辑器，所述溢出编辑器包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。所述显示区域的所述放大事件可包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。
在一些实施例中，所述方法可包含：确定所述更新后溢出值高于阈值；以及在与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置显示警告信息对象。所述阈值可以是100％。
在一些实施例中，所述方法可包含生成所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。在一些实施例中，所述方法可包含显示所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的计算系统的实施例。在一些实施例中，所述计算系统可包含：被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；以及与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)，所述处理器被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且可包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的计算系统的实施例。在一些实施例中，所述计算系统可包含：被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；以及与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)，所述处理器被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件；以及促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
在一些实施例中，所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：获取包含所述溢出值的溢出矩阵(或溢出表)；以及利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出矩阵可以是默认的未经调整的溢出矩阵。所述溢出矩阵可以是第一调整后溢出矩阵。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为：确定第二调整后溢出矩阵，所述溢出矩阵包含来自所述溢出矩阵的所述调整后溢出值；以及利用所述第二调整后溢出矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为：确定所述第二调整后溢出矩阵的逆矩阵，其中生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图包含利用所述第二调整后溢出矩阵的所述逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
在一些实施例中，所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。在一些实施例中，所述第一图和/或第二图可包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
在一些实施例中，所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染利用所述多维事件数据确定的所述多种细胞的多种细胞类型的群体层次结构；以及接收所述多种细胞类型中的一种或更多种类型的选择事件，其中所述一种或更多种目的细胞包含具有所述多种细胞类型中的所述一种或更多种类型中的任一种的所述多种细胞中的一种或更多种细胞。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为接收与所述第一多个荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据。
在一些实施例中，由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团可以是不同的。由所述多个列中的列表示的所述荧光团可具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
在一些实施例中，所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为接收来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择(包含所述第一多个荧光团)。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为接收来自所述第一多个荧光团的第二多个荧光团的选择(包含所述第二多个荧光团)。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第二调整后视图，所述视图包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为生成所述溢出编辑器的所述第二调整后视图。
在一些实施例中，由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差一个。
在一些实施例中，每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。每一列的所述报头信息对象均可位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。
在一些实施例中，所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域可彼此对齐。
在一些实施例中，所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象可具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱可以是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的，并且两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象可具有相同的背景颜色。所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可具有较高的对比度。所述文本标记的颜色可以是白色。
在一些实施例中，显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可具有较高的对比度。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色可以是白色。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置水平相邻。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的右侧。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的左侧。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一显示区域的右上角和左下角。所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
在一些实施例中，所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。所述增加指示器可包含向上箭头，并且所述减少指示器包含向下箭头。为了接收所述调整后溢出值，所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为接收所述增加指示器或所述减少激活器的激活事件。为了接收所述调整后溢出值，所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为从用户处接收所述调整后溢出值的文本输入。
在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：接收所述调整后溢出值的溢出值重置事件；并且促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出值重置事件可包含利用指向设备单击或双击位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：接收所述第一多个显示区域中的显示区域的放大事件；以及促使所述显示器渲染所述溢出编辑器，所述溢出编辑器包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。所述显示区域的所述放大事件可包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。
在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：确定所述更新后溢出值高于阈值；以及在与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置显示警告信息对象。所述阈值可以是100％。
在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为生成所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为显示所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图编辑。
本发明包括溢出编辑器的实施例。在一些实施例中，溢出编辑器的视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。在一些实施例中，所述溢出编辑器的选定视图可包含选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。在一些实施例中，所述溢出编辑器的第一调整后视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
在一些实施例中，所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。在一些实施例中，所述方法包含确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
所述溢出编辑器的所述视图可利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成。所述溢出矩阵可以是默认的未经调整的溢出矩阵。所述溢出矩阵可以是第一调整后溢出矩阵。
在一些实施例中，所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
在一些实施例中，所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
在一些实施例中，由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团是不同的。由所述多个列中的列表示的所述荧光团可具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
在一些实施例中，来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择可包含所述第一多个荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。所述溢出编辑器的第二调整后视图可包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。
在一些实施例中，由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差一个。
在一些实施例中，所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域可彼此对齐。
在一些实施例中，每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。每一列的所述报头信息对象均可位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。
在一些实施例中，所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象可具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的。所述两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象可具有相同的背景颜色。所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可具有较高的对比度。所述文本标记的颜色可以是白色。
在一些实施例中，显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色可与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可具有较高的对比度。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色可以是白色。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且所述第二溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置水平相邻。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的右侧。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的左侧。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置相邻，并且所述第二溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置相邻。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一显示区域的右上角和左下角。所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值，并且所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
在一些实施例中，所述背景颜色是白色，并且所述调整后背景颜色是非白色。所述调整后背景颜色的所述非白色可与所述调整后溢出值和所述相应溢出值之间的差异相关。所述调整后背景颜色的所述非白色可与所述调整后溢出值和相应默认溢出值之间的差异相关。
在一些实施例中，所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。所述增加指示器可包含向上箭头，并且所述减少指示器包含向下箭头。
在一些实施例中，所述溢出编辑器的视图可包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。所述显示区域的所述放大事件可包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。所述溢出编辑器的视图可包含位于与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置的警告信息对象。所述阈值可以是100％。
附图说明
图1展示了用于分析和显示生物事件的分选控制系统的一个示例的功能框图。
图2A是根据本文所示的一个实施例的颗粒分选仪系统的示意图。
图2B是根据本文所示的一个实施例的另一颗粒分选仪系统的示意图。
图3展示了用于基于计算的样品分析和颗粒表征的颗粒分析系统的功能框图。
图4描绘了根据本发明的说明性实施例的流式细胞仪。
图5A描绘了展示标记的发射光谱和光电检测器的滤光片窗口的示例的图表。图5B是比较无溢出和有溢出情况下的多色流式细胞术的示意图。
图6展示了溢出编辑器布局的非限制性示例性图示。
图7是具有荧光色素标记和溢出值的溢出编辑器布局中的图的非限制性示例性图示。
图8是具有被所述未经编辑的原始溢出值替代的所述两个荧光色素标记中的一个的溢出编辑器布局中的图的另一非限制性示例性图示。
图9展示了具有图(具有编辑后或调整后溢出值的图；以及由于具有不同的背景颜色(例如，白色和灰色)而无任何编辑后或调整后溢出的图)的另一非限制性示例性溢出编辑器布局。
图10展示了在溢出值过大时(例如，如果百分比溢出值超过100)显示的警告消息的非限制性示例性图示。
图11是展示用于显示和编辑溢出值的示例性方法的流程图。
图12是被配置成实现溢出编辑器的说明性计算系统的框图。
具体实施方式
在下文更为详细的描述中，参考了构成本文组成部分的附图。在附图中，除非上下文另外指出，否则类似符号通常标识类似组件。在详细描述、附图和权利要求中描述的说明性实施例并非旨在起限制作用。在不脱离本文所述主题的精神或范围的情况下，可使用其他实施例，且可做出其他变更。容易理解的是，本文通常所述的且在附图中示出的本发明的方面可以各种不同的配置来布置、替换、组合、分离和设计，所有这些都在本文中进行了明确的设想，且构成了本文公开内容的一部分。
颗粒分析仪(例如，流式细胞仪和扫描式细胞仪)是一种分析工具，其可基于光散射和荧光等电光测量值来表征颗粒。在流式细胞仪中，例如，流体悬浮液中的颗粒(例如分子、与分析物结合的微珠或个别细胞)通过检测区域，在所述区域内，所述颗粒暴露于通常来自一个或更多个激光器的激发光中，并且测定所述颗粒的光散射和荧光特性。颗粒或其组分通常用荧光染料标记以便进行检测。各种不同的颗粒或组分可以通过用光谱特性不同的荧光染料标记来同时加以检测。在一些实施方案中，所述分析仪包括多个光电检测器，一个适用于待测定的每个散射参数，一个或更多个适用于待检测的每种不同染料。例如，一些实施例包括光谱结构，其中针对每种染料使用一个以上的传感器或检测器。所获得的数据包含针对所述光散射检测器和所述荧光发射中的每一项测得的所述信号。
颗粒分析仪可以进一步包含用于记录所测得的数据并分析所述数据的装置。例如，可以使用与所述检测电子器件连接的计算机来进行数据存储和分析。例如，所述数据可以列表形式存储，其中每一行对应于一颗颗粒的数据，而所述列对应于每项被测特征。使用标准文件格式(例如，流式细胞术标准(“FCS”)文件格式)存储来自颗粒分析仪的数据有助于采用单独的程序和/或机器分析数据。采用当前分析方法时，所述数据通常以一维直方图或二维(2D)图的形式展示，以便于可视化，但也可采用其他方法来使多维数据可视化。
例如，使用流式细胞仪测定的参数通常包括所述颗粒以狭角主要沿前向散射(被称为前向散射(FSC))的光；所述颗粒沿与所述激发激光器正交的方向散射(被称为侧向散射(SSC))的光；以及由一个或更多个检测器(用于在一定光谱波长范围内测量信号)中的荧光分子发射出的光，或者由主要在所述特定检测器或检测器阵列中检测到的荧光染料发射出的光。不同的细胞类型可以通过用荧光染料标记的抗体或其他荧光探针标记各种细胞蛋白或其他组分而得到/产生的光散射特性和荧光发射加以识别。
流式细胞仪和扫描式细胞仪均可从诸如BD Biosciences(加利福尼亚州圣何塞)等处购得。流式细胞术的相关描述请见以下出版物，例如，Landy等人(编)，临床流式细胞术，纽约科学院年鉴，第677卷(1993年)；Bauer等人(编)，临床流式细胞术：原理与应用，Williams&Wilkins(1993年)；Ormerod(编)，流式细胞术：实用方法，牛津大学出版社(1994年)；Jaroszeski等人(编)，流式细胞术方案，Methods in Molecular Biology，第91期，Humana Press(1997年)；以及Shapiro，实用流式细胞术，第4版，Wiley-Liss(2003年)；这些出版物中的内容以引用方式并入本文。荧光成像显微镜检查的相关描述请见以下出版物，例如，Pawley(编)，生物共聚焦显微镜检查手册，第2版，Plenum Press(1989年)，其以引用方式并入本文。
利用多色流式细胞术进行细胞(或其他颗粒)分析所获得的数据是多维的，其中每个细胞对应于由所述被测参数定义的多维空间中的一个点。细胞群或颗粒群被识别为所述数据空间中的点的聚类。可以通过在所述数据的一张或更多张二维图(被称为“散点图”或“点阵图”)中显示的某一群体周围绘制门来手动识别聚类和群体。或者，可以自动识别聚类，而且可以自动确定定义所述群体界限的门。用于自动设门的方法示例请见以下出版物，例如，编号如下的美国专利：4,845,653；5,627,040；5,739,000；5,795,727；5,962,238；6,014,904；6,944,338和8,990,047；这些专利中的内容以引用方式并入本文。
流式细胞术是用于分析和分离生物颗粒(例如，细胞和组成分子)的有效方法，因此，它广泛应用于诊断和治疗中。所述方法利用流体介质线性分离颗粒，使所述颗粒可以排成一排，以通过检测装置。个别细胞可以根据其在流体介质中的位置以及是否存在可检测标记物来区分。因此，流式细胞仪可用于表征和生成生物颗粒群的诊断配置文件。
生物颗粒的分离已通过使流式细胞仪具有分选或收集功能而实现。经检测具有一种或更多种所需特征的分离流中的颗粒通过机械或电气分离方式从所述样品流中单独分离出来。这种流式分选方法已用于分选不同类型的细胞，分离含有X和Y染色体的精子以进行动物育种，分选染色体以进行遗传分析，以及从复杂的生物种群中分离出特定的生物体。
设门用于帮助理解可能由样品生成的大量数据并对其进行分类。鉴于给定样品所呈现出的大量数据，需要有效控制所述数据的图形显示。
荧光激活颗粒分选或细胞分选是专用流式细胞术。荧光激活颗粒分选或细胞分选提供了将颗粒异质混合物分选至一个或更多个容器中的方法，所述方法基于各细胞的特定光散射和荧光特性实施，每次分选一种细胞。它记录来自个体细胞的荧光信号，并在物理上分离特定目的细胞。缩略词FACS是Becton,Dickinson and Company(新泽西州富兰克林湖)的商标且归Becton Dickinson所有，可用于指代执行荧光激活颗粒分选或细胞分选的设备。
所述颗粒悬浮液置于狭窄、快速流动的液流中心附近。所述流的安置使得平均而言，在颗粒随机抵达(例如，泊松过程)所述检测区域时，相对于其直径，颗粒之间存在较大的间隔。振动机制可使流出的流体介质稳定破碎成单一液滴，所述液滴中包含先前在所述检测区域中表征的颗粒。通常可对所述系统进行调整，使液滴中存在一颗以上颗粒的概率偏低。如果将颗粒归类为待收集，则在一段时间内，可向所述流动池和流出流中施加电荷，以形成一滴或更多滴液滴并与所述流脱离。而后，这些带电液滴穿过静电偏转系统，所述系统依据向所述液滴施加的电荷，将液滴转移至目标容器中。
样品可能包括(即使没有数百万也有)数千个细胞。可以对细胞进行分选以使样品纯化为目的细胞。所述分选过程通常可以识别出三种细胞：目的细胞、非目的细胞和无法识别的细胞。为了分选出具有高纯度的细胞(例如，高浓度的目的细胞)，如果所需细胞与另一不合需求的细胞过于接近，则生成液滴的细胞分选仪可以电子方式中止所述分选，从而减少因无意间使含有目的颗粒的液滴内包括不合需求的颗粒而对已分选群体造成的污染。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的方法的实施例。在一些实施例中，所述方法受处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)控制，并且包含：促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述方法可包含：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件。所述方法可包含：促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。所述方法可包含：接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述方法可包含：促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的方法的实施例。在一些实施例中，所述方法受处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)控制，并且包含：促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述方法可包含接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述方法可包含促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述方法可包含接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件。所述方法可包含促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的计算系统的实施例。在一些实施例中，所述计算系统可包含：被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；以及与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)，所述处理器被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且可包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
本发明包括用于显示和编辑溢出值的计算系统的实施例。在一些实施例中，所述计算系统可包含：被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；以及与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器(例如，硬件处理器或虚拟处理器)，所述处理器被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。所述处理器可被所述可执行指令编程为：促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。所述硬件处理器可被所述可执行指令编程为：接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件；以及促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
本发明包括溢出编辑器的实施例。在一些实施例中，溢出编辑器的视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。在一些实施例中，所述溢出编辑器的选定视图可包含选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。在一些实施例中，所述溢出编辑器的第一调整后视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域可具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
定义
本文中使用的下文具体阐述的术语具有以下定义。除非本部分另有定义，否则本文中使用的所有术语的含义与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同。
本文中使用的“系统”、“仪器”、“装置”和“设备”通常涵盖硬件(例如，机械和电子硬件)，而且在一些实施方案中，也涵盖相关软件(例如，用于图形控制的专用计算机程序)组件。
本文中使用的“事件”或“事件数据”通常是指从单种颗粒(例如，细胞或合成颗粒)中测得的数据(例如，组合数据包)。通常情况下，从单种颗粒中测得的数据包括许多参数或特征，包括一个/种或更多个/种光散射参数或特征，以及至少一个/种利用从所述颗粒中检测到的荧光所得到的其他参数或特征，例如，所述荧光强度。因此，每个事件均可被表示为参数和特征测量值向量，其中每个被测参数或特征对应于数据空间的一个维度。在一些实施例中，从单种颗粒中测得的数据包括图像、电气数据、时间数据或声学数据。事件可与实验、测定或样品来源(可以通过测量数据来识别)相关联。
本文中使用的颗粒“群体”或“子群体”(例如，细胞或其他颗粒)通常是指相对于一个或更多个被测参数具有特性(例如，光学、阻抗或时间特性)的一组颗粒，其使得被测参数数据在数据空间中形成聚类。因此，群体可被识别为数据中的聚类。相反，虽然通常也观测到了对应于噪点或本底的聚类，但每个数据聚类通常被解释为对应于特定类型的细胞或颗粒群。可以在所述维度的子集(例如，相对于被测参数的子集)中定义聚类，其对应于仅在被测参数或特征(提取自所述细胞或颗粒测量值)的子集中有所不同的群体。
本文中使用的“门”通常是指识别目的数据子集的分类器边界。在细胞计量中，门可能与一组特定目的事件相关联。本文中使用的“设门”通常是指针对给定数据集，利用定义门对所述数据进行分类的过程，其中所述门可以是一个或更多个与布尔逻辑相结合的目的区域。
下文进一步描述了各种实施例和系统的具体示例(可实现所述实施例和系统)。
分选控制系统
图1展示了用于分析和显示生物事件的分选控制系统(例如分析控制器100)的一个示例的功能框图。分析控制器100可被配置成实施用于控制生物事件图形显示的各种过程。
颗粒分析仪或分选系统102可被配置成采集生物事件数据。例如，流式细胞仪可以生成流式细胞术事件数据。颗粒分析仪102可被配置成将生物事件数据提供给分析控制器100。可以在颗粒分析仪102和分析控制器100之间纳入数据通信通道。可以经由所述数据通信通道将所述生物事件数据提供给分析控制器100。
分析控制器100可被配置成接收来自颗粒分析仪102的生物事件数据。接收自颗粒分析仪102的生物事件数据可以包括流式细胞术事件数据。分析控制器100可被配置成向显示设备106提供包括生物事件数据第一图的图形显示。例如，分析控制器100可进一步被配置成围绕由显示设备106所示的多个生物事件数据渲染作为门的目的区域，其覆盖在第一图上。在一些实施例中，所述门可以是在单参数直方图或双变量图上绘制的一个或更多个目的图形区域的逻辑组合。
或者，分析控制器100可进一步被配置成以不同于门外生物事件数据中其他事件的方式在门内的显示设备106上显示生物事件数据。例如，分析控制器100可被配置成使门内含有的生物事件数据的颜色与门外的生物事件数据的颜色不同。显示设备106可以显示器、平板计算机、智能电话或被配置成展示图形界面的其他电子设备的形式实现。
分析控制器100可被配置成接收来自第一输入设备的识别所述门的门选择信号。例如，所述第一输入设备可以鼠标110的形式实现。鼠标110可以向分析控制器100发出门选择信号，以确定待在显示设备106上显示或经由显示设备206操纵的门(例如，当光标位于此处时，在所需门上或内单击)。在一些实施方案中，第一设备可以键盘108或用于向分析控制器100提供输入信号的其他装置(例如触摸屏、触控笔、光学检测器或语音识别系统)的形式实现。某些输入设备可能包括多种输入功能。在此等实施方案中，所述输入功能可以各自地被视为是一种输入设备。例如，如图1所示，鼠标110可以包括鼠标右键和鼠标左键，其均可产生触发事件。
所述触发事件可以促使分析控制器100改变显示数据的方式(在显示设备106上实际显示部分数据)，和/或提供输入以作进一步处理，例如选择目的群体进行颗粒分选。
在一些实施例中，分析控制器100可被配置成检测鼠标110启动门选择的时间。分析控制器100可进一步被配置成自动修改图可视化，以便促进所述设门过程。所述修改可以基于由分析控制器100接收的生物事件数据的特定分布进行。
分析控制器100可与存储设备104连接。存储设备104可被配置成接收和存储来自分析控制器100的生物事件数据。存储设备104还可被配置成接收和存储来自分析控制器100的流式细胞术事件数据。存储设备104还可被配置成允许分析控制器100检索生物事件数据，例如，流式细胞术事件数据。
显示设备106可被配置成接收来自分析控制器100的显示数据。所述显示数据可以包含生物事件数据图和概述所述图部分的门。显示设备106可进一步被配置成根据接收自分析控制器100的输入以及接收自颗粒分析仪102、存储设备104、键盘108和/或鼠标110的输入来改变所展示的信息。
在一些实施方案中，分析控制器100可以生成用户界面以接收示例事件，以便进行分选。例如，所述用户界面可以包括用于接收示例事件或示例图像的控件。可以在采集样品的事件数据之前或基于所述样品某一部分的初始事件集合来提供示例事件或图像或示例门。
颗粒分选仪系统
常用流式分选技术(被称为“静电细胞分选”)采用液滴分选，其中使含有线性分离颗粒的流或移动液柱破碎成液滴，且使含有目的颗粒的液滴带电并通过电场偏转至收集管中。液滴分选系统能够在通过直径小于100微米的喷嘴的流体介质中以100,000滴/秒的速率形成液滴。液滴分选通常要求液滴在与喷嘴头相距一定距离处与所述流脱离。所述距离通常距离喷嘴头约几毫米，而且对于不受干扰的流体介质，所述距离是稳定的，且可以通过以预先确定的频率以及使所述脱离保持恒定的振幅振荡喷嘴头来维持。例如，在一些实施例中，在给定频率下调整正弦波形电压脉冲的振幅，使所述脱离保持稳定和恒定。
通常情况下，所述流中的线性分离颗粒的特征在于它们会通过位于流动池或比色皿内或喷嘴头正下方的观测点。一旦确定颗粒满足一项或更多项所需标准，便可以预测其到达液滴破碎点并以一滴液滴的形式与所述流脱离的时间。理想情况下，在含有选定颗粒的液滴与所述流脱离之前，先对所述流体介质施加短暂的电荷，然后在液滴破碎后使其立即接地。待分选的液滴在与所述流体介质脱离时会保持带电状态，而所有其他液滴则不带电。所述带电液滴在电场作用下侧向偏离其他液滴的下行轨迹，并被收集在样品管中。所述不带电的液滴直接落入排放管。
图2A是根据本文所示的一个实施例的颗粒分选仪系统200(例如，颗粒分析仪102)的示意图。在一些实施例中，颗粒分选仪系统200是细胞分选仪系统。如图2A所示，液滴形成传感器202(例如，压电振荡器)与流体导管201(其可与喷嘴203耦合，也可以包括或可以是喷嘴203)耦合。在流体导管201内，鞘液204以流体动力学的方式使样品流体206(包含颗粒209)聚集至移动液柱208(例如，流)中。在所述移动液柱208内，使颗粒209(例如，细胞)排成一排，以穿过由辐照源212(例如，激光器)辐照的受监测区域211(例如，激光流交点)。所述液滴形成传感器202振动使得移动液柱208破碎成多滴液滴210，其中一些含有颗粒209。
在运行中，检测站214(例如，事件检测器)确定目的颗粒(或目的细胞)何时穿过受监测区域211。检测站214馈入定时电路228，转而馈入瞬时充电电路230。在液滴破碎点，在定时液滴延迟(Δt)通知后，可向所述移动液柱208中施加瞬时电荷，使目的液滴带电。所述目的液滴可以包括一颗/个或更多颗/个待分选颗粒或细胞。然后，可以通过启用偏转板(未示出)来分选所述带电液滴，使液滴偏转至诸如收集管或多孔或微孔样品板等容器中，其中孔或微孔可与特定目的液滴相关联。如图2A所示，所述液滴可被收集在排放容器238中。
检测系统216(例如，液滴边界检测器)用于在目的颗粒通过受监测区域211时自动确定液滴驱动信号的相位。示例性液滴边界检测器如第7,679,039号美国专利所述，所述专利全文以引用方式并入本文。检测系统216允许仪器准确地计算每颗检测到的颗粒在液滴中的位置。检测系统216可以馈入振幅信号220和/或相位218信号，然后依次(通过放大器222)馈入振幅控制电路226和/或频率控制电路224。振幅控制电路226和/或频率控制电路224反过来控制液滴形成传感器202。振幅控制电路226和/或频率控制电路224可以包括在控制系统中。
在一些实施方案中，分选电子器件(例如，检测系统216、检测站214、处理器240)可与被配置成存储所检测到的事件和基于其的分选决策的存储器耦合。所述分选决策可以包括在颗粒的事件数据中。在一些实施方案中，检测系统216和检测站214可以单个检测单元的形式实现或以通信方式耦合，使得事件测量值可以由检测系统216或检测站214中的一项收集并提供给所述非收集元件。
图2B是根据本文所示的一个实施例的颗粒分选仪系统的示意图。图2B所示的颗粒分选仪系统200包括偏转板252和254。电荷通过倒钩中的流充电线施加。这产生了含有用于分析的颗粒210的液滴流210。所述颗粒可以用一个或更多个光源(例如，激光)照射，以产生光散射并生成荧光信息。所述颗粒信息通过诸如分选电子器件或其他检测系统(图2B中未示出)来进行分析。可以独立地控制偏转板252和254来吸引或排斥所述带电液滴，以将所述液滴引导至目的地收集容器中(例如，272、274、276或278中的一项)。如图2B所示，可以控制偏转板252和254，以沿着第一路径262朝向容器274或沿着第二路径268朝向容器278引导颗粒。如果所述颗粒并非目的颗粒(例如，在指定的分选范围内，不显示散射或照射信息)，则偏转板可使所述颗粒沿着流路264继续流动。此类不带电液滴可以经由诸如抽吸器270进入废弃物容器。
可以包括所述分选电子器件，以开始收集测量值，接收颗粒的荧光信号，并确定如何调整所述偏转板以分选所述颗粒。图2B中所示的实施例的示例实施方案包括由Becton,Dickinson and Company(新泽西州富兰克林湖)市售的BD FACSAriaTM系列流式细胞仪。
在一些实施例中，适用于颗粒分选仪系统200的一个或更多个所述组件可用于颗粒分析和表征，无论是否将所述颗粒物理分选至收集容器中。同样地，适用于颗粒分析系统300(图3)的一个或更多个下述组件也可用于颗粒分析和表征，无论是否将所述颗粒物理分选至收集容器中。例如，可以采用颗粒分选仪系统200或颗粒分析系统300中的一个或更多个所述组件，对颗粒进行分组或使其显示在树中，所述树包括至少三个本文所述的分组。
图3展示了用于基于计算的样品分析和颗粒表征的颗粒分析系统的功能框图。在一些实施例中，颗粒分析系统300是流式系统。图3所示的颗粒分析系统300可被配置成全部或部分执行本文所述的方法。颗粒分析系统300包括射流系统302。射流系统302可以包括样品管310和样品管内的移动液柱，或与所述样品管耦合，在所述样品管内，样品中的颗粒330(例如，细胞)沿共同样品路径320移动。
颗粒分析系统300包括检测系统304，所述检测系统304被配置成在每颗颗粒沿所述共同样品路径穿过一个或更多个检测站时，收集来自每颗颗粒的信号。检测站308通常是指所述共同样品路径的受监测区域340。在一些实施方案中，检测可以包括在颗粒330穿过受监测区域340时，检测光或所述颗粒的一种或更多种其他特性。在图3中，显示了具有受监测区域340的检测站308。颗粒分析系统300的一些实施方案可以包括多个检测站。此外，某些检测站可能监测一个以上区域。
为每个信号分配信号值，以构成每颗颗粒的数据点。如上所述，所述数据可以被称为事件数据。所述数据点可以是多维数据点，其包括针对颗粒的各所测特性的值。检测系统304被配置成在第一时间间隔内收集一系列所述数据点。
颗粒分析系统300还包括控制系统306。控制系统306可以包括一个或更多个处理器、振幅控制电路226和/或频率控制电路224，具体如图2B所示。所示控制系统206在操作上可与射流系统302相关联。控制系统206可被配置成基于泊松分布以及在所述第一时间间隔内由检测系统304收集的数据点数量，针对所述第一时间间隔的至少一部分生成计算出的信号频率。控制系统306可进一步被配置成基于在所述第一时间间隔的所述部分内的数据点数量，生成实验信号频率。此外，控制系统306可将所述实验信号频率与计算出的信号频率或预先确定的信号频率进行比较。
颗粒分选仪的照明和检测
图4展示了用于根据本发明的说明性实施例的流式细胞术的系统400。系统400包括流式细胞仪410、控制器/处理器490和存储器495。流式细胞仪410包括一个或更多个激发激光器415a-415c、聚焦透镜420、流动室425、前向散射检测器430、侧向散射检测器435、荧光收集透镜440、一个或更多个分束器445a-445g、一个或更多个带通滤光片450a-450e、一个或更多个长通(“LP”)滤光片455a-455b以及一个或更多个荧光检测器460a-460f。
激发激光器115a-c发射出激光束形式的光。在图4所示的示例系统中，从激发激光器415a-415c中发射出的激光束的波长分别为488nm、633nm和325nm。4.所述激光束首先被引导通过分束器445a和445b中的一个或更多个。分束器445a透射波长为488nm的光并反射波长为633nm的光。分束器445b透射UV光(波长范围为10至400nm的光)并反射波长为488nm和633nm的光。
而后，所述激光束被引导至聚焦透镜420，所述透镜将所述光束聚焦于流动室425内的所述流体介质(含有样品中的颗粒)部分上。所述流动室是射流系统的一部分，所述射流系统将流中的颗粒引导至所述聚焦后的激光束中(通常一次一颗颗粒)，以进行询问。所述流动室可包含台式细胞仪中的流动池或气中流型细胞仪中的喷嘴头。
来自所述激光束的光通过衍射、折射、反射、散射和吸收与所述样品中的颗粒相互作用，并基于所述颗粒的特性(例如粒径、内部结构以及一种或更多种附着于或天然存在于所述颗粒上或内的荧光分子的存在)在各种不同的波长下重新发射。所述荧光发射以及所述衍射光、折射光、反射光和散射光可以通过分束器445a-445g、带通滤光片450a-450e、长通滤光片455a-455b和荧光收集透镜440中的一项或更多项传导至前向散射检测器430、侧向散射检测器435和一个或更多个荧光检测器460a-460f中的一项或更多项。
荧光收集透镜440收集由所述颗粒-激光束相互作用发射的光，并将所述光传导至一个或更多个分束器和滤光片。带通滤光片(例如带通滤光片450a-450e)允许窄范围的波长的光通过所述滤光片。例如，带通滤光片450a是510/20滤光片。所述第一个数字表示光谱带的中心。所述第二个数字提供了所述光谱带的范围。因此，510/20滤光片的相应波长在所述光谱带中心的每一侧延伸10nm，或者从500nm延伸至520nm。短通滤光片透射波长等于或小于指定波长的光。长通滤光片(例如长通滤光片455a-455b)透射波长等于或大于指定光波长的光。例如，长通滤光片455a(即670nm长通滤光片)透射波长等于或长于670nm的光。通常选择滤光片以优化检测器对特定荧光色素的特异性。可以配置所述滤光片，以使传输至所述检测器的光的所述光谱带接近荧光染料的所述发射峰。
分束器在不同方向上引导不同波长的光。分束器可以通过短通和长通等滤光特性来表征。例如，分束器445g是620SP分束器，这意味着分束器445g在不同方向上透射波长为620nm或更短的光，并且反射波长长于620nm的光。在一实施例中，分束器445a-445g可包含光学反射镜，例如二向色镜。
前向散射检测器430位于相较于穿过所述流动池的所述直射光束略微偏离轴线的位置，并且被配置成检测衍射光，所述激发光主要沿前向穿过所述颗粒或环绕所述颗粒运动。由所述前向散射检测器检测到的光的强度取决于所述颗粒的整体尺寸。所述前向散射检测器可包括光电二极管。侧向散射检测器435被配置成检测来自所述颗粒的表面和内部结构的折射光和反射光，并且倾向于随着颗粒结构复杂性的增加而增加。来自荧光分子(与所述颗粒相关联)的所述荧光发射可以用所述一个或更多个荧光检测器460a-460f来检测。侧向散射检测器435和荧光检测器可包括光电倍增管。在前向散射检测器430、侧向散射检测器435和荧光检测器处检测到的信号可以通过所述检测器转换成电子信号(电压)。此数据可以提供有关所述样品的信息。
本领域技术人员认识到，根据本发明的实施例的流式细胞仪不限于图4所描绘的流式细胞仪，但可包括本领域已知的任何流式细胞仪。例如，流式细胞仪可以具有各种波长和各种配置的任何数量的激光器、分束器、滤光片和检测器。
在运行中，细胞仪运行受控制器/处理器490控制，并且来自所述检测器的测量数据可存储于存储器495中，并用控制器/处理器490对所述数据加以处理。尽管未明确示出，但控制器/处理器190与所述检测器耦合，以从中接收所述输出信号，并且还可以与流式细胞仪400的电气和机电组件耦合，以控制所述激光器、流体流量参数等。还可以在所述系统中提供输入/输出(I/O)功能497。存储器495、控制器/处理器490和I/O497可以完全作为流式细胞仪410的组成部分提供。在此类实施例中，显示器还可以构成用于将实验数据呈现给细胞仪400的用户的I/O功能497的一部分。或者，存储器495和控制器/处理器490以及I/O功能中的一些或全部可以是一台或更多台外部设备(例如通用计算机)的一部分。在一些实施例中，存储器495和控制器/处理器490中的一些或全部可与细胞仪410进行无线或有线通信。控制器/处理器490与存储器495和I/O 497均可被配置成执行与流式细胞仪实验的准备和分析有关的各种功能。
图4所示的系统包括在六种不同波长带(其在本文中可以被称为给定检测器的“滤光片窗口”)下检测荧光的六个不同检测器，所述波长带由从流动池425至每个检测器的光束路径中的滤光片和/或分离器的配置所定义。用于流式细胞仪实验的不同荧光分子会在其自身特征波长带下发出光。可以选择用于实验的特定荧光标记及其相关联的荧光发射带，使其与所述检测器的滤光片窗口大体上重合。但是，由于提供了更多的检测器，并且利用了更多的标记，因此滤光片窗口与荧光发射光谱之间不可能完美地对应。通常的情况是，尽管特定荧光分子的所述发射光谱的所述峰可能位于一个特定检测器的滤光片窗口内，但所述标记的所述发射光谱中的一些也会与一个或更多个其他检测器的滤光片窗口重叠。这可以称之为溢出。
I/O 497可被配置成接收有关流式细胞仪实验的数据，所述实验具有荧光标记组和多个细胞群(具有多种标记物)，每个细胞群具有所述多种标记物的子集。I/O 497还可被配置成接收将一种或更多种标记物分配给一个或更多个细胞群的生物学数据、标记物密度数据、发射光谱数据、将标记分配给一种或更多种标记物的数据以及细胞仪配置数据。流式细胞仪实验数据(例如标记光谱特性和流式细胞仪配置数据)也可存储于存储器495中。控制器/处理器490可被配置成评价针对标记物的一种或更多种标记分配。
溢出
图5A展示了由不同标记的发射光谱重叠所引起的溢出的说明性示例。图5A展示了用FITC标记的标记物的所述发射光谱(以对应波长从约475nm延伸至650nm的曲线表示)以及“FITC检测器”的滤光片窗口。一块或更多块滤光片(例如图4中所示的带通滤光片150b)可以安置于所述检测器的前面，从而限制可以抵达所述检测器处的波长范围，所述波长范围构成滤光片窗口。所述FITC检测器的滤光片窗口是530/30，这意味着滤光片窗口从515nm延伸至545nm。所述FITC滤光片窗口由从515nm延伸至545nm的阴影矩形表示。图5A还展示了用PE标记的标记物的所述发射光谱，其以从约525nm延伸至约725nm的曲线表示。一块或更多块滤光片(例如图4中所示的带通滤光片450c)可以安置于所述检测器的前面。所述PE检测器的滤光片窗口是585/42，这意味着滤光片窗口从564nm延伸至606nm。所述PE滤光片窗口由从564nm延伸至606nm的阴影矩形表示。图5A表明，FITC的所述发射光谱的一部分与所述PE检测器的所述滤光片窗口重叠，所述重叠部分标记为“FITC溢出至PE中”。因此，所述FITC标记的所述荧光发射中的一些在所述PE检测器中被检测到，并与所述PE标记的所述荧光发射一同进行测量。溢出可导致得出有关颗粒上存在的大量标记的不准确结论。随着更多标记和检测器的利用，此问题对于流式细胞仪的最新用途而言尤为严重，它使得荧光峰和滤光片窗口的分离减少。此外，鉴于可用荧光标记数量不断增加(通常有数十种方案可供实验者选择)，并且具有各种峰值波长、发射强度和能量、光谱宽度特性、表征的细胞上各种标记物密度以及在一些情况下可选择的滤光片窗口，因此针对流式细胞仪实验设计合适的装置极具挑战性。进一步的复杂问题是表征的细胞或其他颗粒的自发荧光。此自发荧光信号还会与一个或更多个滤光片窗口重叠，导致在测量中产生噪声。所述自发荧光噪声信号可以进一步取决于所询问的颗粒/细胞的类型。
为了考虑适用于多个标记的多个检测器的溢出，可以通过每个相应的滤光片窗口表征所有检测器中所有标记的光谱重叠值。在各检测事件中，给定检测器的响应是具有各标记的给定检测器滤光片窗口的重叠值分别与所述检测事件期间存在的各标记的数量相乘得到的乘积的总和。对于在实验期间用于检测n个不同标记的m个检测器组，有关所观察到的所述事件处(具有)的m个检测器响应(具有各事件处的n个标记中任一标记的标记丰度)的线性方程组可以表示为d＝Ma，其中d是所述事件处全部m个检测器的输出测量值的m×1列向量，a是所述实验中使用的所述n个标记中每个标记的标记丰度的n×1列向量，并且M是m行×n列“溢出矩阵”。溢出矩阵M具有项Sij，其中Sij对应于检测器i(其中i的取值范围为1至m)对标记j(其中j的取值范围为1至n)做出的响应。例如，图5中“FITC溢出至PE中”区域的面积表示溢出矩阵项，其中检测器i对应于PE检测器，标记j对应于FITC标记。在进行实验时，对各事件的检测器输出进行测量，并使用公式a＝M-1d推导出各事件的标记丰度，从而基于各事件的测得的检测器输出针对各事件处的各标记产生丰度值。
在“理想的”实验配置中，如果各检测器均对来自一个且仅有一个标记的发射敏感，并且不存在来自其他标记的发射的溢出，则矩阵M是正交矩阵，因此可精确地转化为矩阵M-1。由于检测器与标记之间的一对一对应关系因溢出而丢失，因此矩阵M的正交性越来越低。随着M的正交性降低，在所述检测器测量值中，所述相同噪声水平在推导出的标记丰度下产生的误差越来越大。为了量化矩阵M与正交矩阵的接近程度，矩阵M可用所谓的“条件数”来表征。矩阵的条件数(CN)由方程式CN＝(maxσ)/(minσ)定义，其中CN是条件数，maxσ是M的最大奇异值，minσ是M的最小奇异值。精确正交矩阵具有彼此相等的奇异值，因此其CN为1，这是矩阵的最小可能CN值。矩阵M的CN越大，正交性越小，而且通常实验结果的准确性也越低。
溢出。在多色流式细胞术中，多个检测器(被称为D1、D2等)检测来自多个/种荧光团或荧光色素(被称为F1、F2等)的信号。来自不同荧光色素的信号可具有不同的生物学意义。因此，理想情况下，各检测器均可被配置成检测来自仅一种荧光色素的信号，例如，F1(用D1检测)、F2(用D2检测)等。但是，实际上，可能发生溢出：来自F1的一些信号(例如小信号)也由检测器D2、D3等接收；来自F2的一些信号由D1、D3等接收。图5B是比较无溢出和有溢出情况下的多色流式细胞术的示意图。
补偿。在仪器(例如，诸如流式细胞仪之类的颗粒分析仪)记录来自检测器的混合信号后，所述混合信号中来自各荧光色素的信号可通过被称为补偿的计算来确定。为了执行此计算，需要有关溢出至各通道的各荧光色素所占的比重的信息。此信息可载于诸如表1a之类的表中。表中的数字(分数)是溢出系数。对角元素在所述示例溢出表中都是一。这是因为从荧光色素传输至荧光色素专用检测器的信号所占的比重始终为1。有时，所述比重以百分比表示。表1b是一个此类溢出表。
表1a.溢出表。
表1b.溢出表(单位：百分比)
| F1 | F2 | F3 | F4 | |
| D1 | 100 | 40 | 1 | 4 |
| D2 | 30 | 100 | 2 | 5 |
| D3 | 20 | 50 | 100 | 6 |
| D4 | 10 | 60 | 3 | 100 |
溢出编辑器
本发明包括溢出编辑器(也被称为补偿编辑器)的实施例。在一些实施例中，所述溢出编辑器可以是具有显示区域的三角形矩阵或网格，所述显示区域包括在图(例如，荧光色素或荧光团的分布的双变量图)上具有叠加的溢出值(例如，以百分比或比重表示的溢出值)的图。图6展示了非限制性示例性溢出编辑器布局。所述溢出编辑器启动后，用户可根据颗粒分析实验(例如流式细胞术实验)的所述原始配置或所述实验的默认溢出矩阵中的所述溢出值来调整所述矩阵内的值。例如，所述荧光色素可根据波长在水平和垂直方向上进行排序(例如，降序或升序)和颜色编码。
各图(或包含图的各显示区域)可显示两个溢出值。在本文所揭示的溢出编辑器的一些实施例中，可以将与各图相关(例如，最相关)的溢出值叠加于此图上。用户于所述网格中选定图后，所述溢出编辑器还可显示两种荧光色素的标记。在一些实施例中，与所述荧光色素缔合(例如共轭)的生物学标记未在所述选定图中显示为所述荧光色素的所述标记的部分。(有关示例请参见图7)。图7表明，所述溢出源的标记和所述溢出目标的标记分别位于所述图或显示区域的左上方和右下方。在一些实施例中，所述溢出源的标记和所述溢出目标的标记可分别位于所述图或显示区域的右下方和左上方。在一些实施例中，所述溢出源的标记和所述溢出目标的标记可分别位于所述图或显示区域的右上方和左下方。在一些实施例中，所述溢出源的标记和所述溢出目标的标记可分别位于所述图或显示区域的左下方和右上方。
用户调整所述溢出值或数字时，所述溢出编辑器可使用户通过用所述原始数值替代所述标记查看用户开始操作时的所述原始值(例如，来自所述实验的默认溢出矩阵中)(有关示例请参见图8)。图8展示了具有所述两个正在编辑的溢出值中的一个以及被所述未经编辑的原始溢出值替代的所述两个荧光色素标记中的一个的溢出编辑器布局中的图的非限制性示例性图示。在用户调整所述溢出值时，可以在整个网格上调整或更新补偿(使用所述调整后溢出值生成)和未补偿图。在一些实施例中，在用户调整所述溢出值时，可以在整个网格上调整或更新使用所述默认溢出值生成的补偿图和使用所述调整后溢出值生成的补偿图。所述用户可以双击所述原始溢出值，以用所述值替换当前的编辑值。在一些实施例中，本文所揭示的溢出编辑器向用户提供了重置每张图的值的能力。
用户调整溢出值时，所述溢出编辑器可创建可视踪迹以向用户指示用户已编辑的图，以诸如通过更改具有编辑后溢出值的图的背景颜色来帮助评估目前为止完成的工作(有关示例请参见图9)。图9展示了具有图(具有编辑后或调整后溢出值的图；以及由于具有不同的背景颜色(例如，白色和阴影)而无任何编辑后或调整后溢出的图)的另一非限制性示例性溢出编辑器布局。在一些实施例中，本文所揭示的溢出编辑器向用户提供在每张图内做出的改变的可视历史记录。在一些实施例中，所述溢出编辑器可以具有历史记录功能，用户可以借此查看用户开始操作时的所有值的快照以及最新值的最后快照(有关示例请参见图9)。
在一些实施例中，用户可调整叠加于图上(或接近包含所述图的所述显示区域中的图)的溢出数量。将所述溢出值叠加于所述图上(或接近包括所述图的所述显示区域中的图)的所述溢出编辑器可使用户以可读且便于使用的方式同时查看有用的信息(例如，编辑后或调整后溢出值以及调整所述溢出值对所述图上的所述细胞分布造成的影响)。在一些实施例中，所述显示区域中的溢出值足够大、可读和/或易辨认(例如，与溢出表中的溢出值相比)。在一些实施例中，荧光团名称的行和列标记足够大、可读和/或易辨认(例如，无示出的抗体名称)。在一些实施例中，在无与所述荧光团缔合(例如共轭)的抗体的靶标的名称的情况下，示出了所述荧光团的名称以及在所述图上显示的溢出值。将所述溢出值叠加于所述图上并在所述图上进行编辑时，可以轻易地观察到调整所述溢出值对所述图造成的影响。
在一些实施例中，所述溢出编辑器具有基于群体层次结构的滤光功能。所述溢出编辑器可以显示或渲染细胞类型或门的层次结构。所述层次结构可包括表示样品的所有事件(例如，样品中的所有细胞)的根节点。所述根节点可包括一个或更多个子节点(例如，细胞亚群，例如目的细胞类型中的细胞，其基于与抗体(与所述样品中的所述细胞结合)共轭的荧光团的多维荧光强度数据确定)。在生成或更新由图组成的所述三角形矩阵时，可以针对滤光选择或取消选择一些子节点。
在一些实施例中，所述溢出编辑器提供放大功能，在此功能下，用户可将鼠标悬停于图上，并且更详细地查看诸如补偿数据与未补偿数据之间的变动。在一些实施例中，所述溢出编辑器可向用户提供警告图标(有关示例请参见图9)，所述图标提示百分比溢出值超过100。单击所述警告图标后，所述溢出编辑器可显示警告消息(有关示例请参见图10)。利用本文所揭示的直观的溢出编辑器，用户(例如，无经验用户)可轻易地调整溢出值并执行流式细胞术实验所需的补偿调整。
显示和编辑溢出值
图11是展示用于显示和编辑溢出值的示例性方法1100的流程图。方法1100可以体现在存储于计算机可读介质(例如，计算系统的一个或更多个磁盘驱动器)上的一组可执行程序指令中。例如，图12所示以及下文中更为详细地描述的计算系统1200可以执行一组可执行程序指令，以实施方法1100。在启用方法1100时，所述可执行程序指令可被加载至诸如RAM的存储器中，并由计算系统1200的一个或更多个处理器执行。虽然就图12所示的计算系统1200描述了方法1100，但所述描述仅为了说明目的而提供，而非旨在进行限定。在一些实施例中，方法1100或其部分可以由多个计算系统串行或并行执行。
方法1100在框1104处开始后，方法1100前进至框1108，其中计算系统可显示或促使显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示第一多个荧光团中的荧光团。所述多个行和所述多个列中的每项可各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联。所述第一多个显示区域中的每个区域均可位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中。所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团。所述第一多个显示区域中的每个区域均可包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值。所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差至少一个。
在一些实施例中，由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量可相差一个。
在一些实施例中，每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。每一列的所述报头信息对象均可位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。在一些实施例中，所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象可具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可以近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱可以是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的，并且两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象可具有相同的背景颜色。所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色可具有较高的对比度。所述文本标记的颜色可以是白色。
在一些实施例中，所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域可彼此对齐。
在一些实施例中，所述第一图可包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
在一些实施例中，由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团可以是不同的。由所述多个列中的列表示的所述荧光团可具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
在一些实施例中，显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可以近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色可具有较高的对比度。所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色可以是白色。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置水平相邻。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第二标记信息对象位置的右侧。所述第一溢出值信息对象位置可位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的左侧。所述第一溢出值信息对象位置可与所述第二标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻。
在一些实施例中，所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置可位于所述第一显示区域的右上角和左下角。所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值可以是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
在一些实施例中，所述计算系统可以：获取包含所述溢出值的溢出矩阵；以及利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出矩阵可以是默认的未经调整的溢出矩阵。所述溢出矩阵可以是第一调整后溢出矩阵。
在一些实施例中，所述计算系统可以：接收来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择(包含所述第一多个荧光团)。所述计算系统可接收来自所述第一多个荧光团的第二多个荧光团的选择(包含所述第二多个荧光团)。所述多个行和所述多个列中的每项均可表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且所述第一多个显示区域中的每个区域均可表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。所述计算系统可促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第二调整后视图，所述视图包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述计算系统可生成所述溢出编辑器的所述第二调整后视图。
方法1100从框1108前进至框1112，其中所述计算系统可接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件。
在框1112处接收到所述选择事件后，方法1100前进至框1116，其中所述计算系统可显示或促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
方法1100从框1116前进至框1120，其中所述计算系统可接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值。在一些实施例中，所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。所述增加指示器可包含向上箭头，并且所述减少指示器包含向下箭头。为了接收所述调整后溢出值，所述计算系统可接收所述增加指示器或所述减少激活器的激活事件。为了接收所述调整后溢出值，所述计算系统可从用户处接收所述调整后溢出值的文本输入。
在一些实施例中，所述计算系统可以：接收所述调整后溢出值的溢出值重置事件；并且促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的所述视图。所述溢出值重置事件可包含利用指向设备单击或双击位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。在一些实施例中，本文所揭示的溢出编辑器提供了重置每张图的值的能力。
在一些实施例中，所述计算系统可以：确定所述更新后溢出值高于阈值；以及在与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置显示警告信息对象。所述阈值可以是100％。
在框1120处接收到所述调整后溢出值后，方法1100前进至框1124，其中所述计算系统可促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且可包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
在一些实施例中，所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。在一些实施例中，所述计算系统可确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
所述计算系统可以：确定第二调整后溢出矩阵，所述溢出矩阵包含来自所述溢出矩阵的所述调整后溢出值；以及利用所述第二调整后溢出矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。所述计算系统可以：确定所述第二调整后溢出矩阵的逆矩阵，其中生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图包含利用所述第二调整后溢出矩阵的所述逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
在一些实施例中，所述第二图可包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。所述双变量图可包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
所述计算系统可以：促使所述显示器渲染利用所述多维事件数据确定的所述多种细胞的多种细胞类型的群体层次结构；以及接收所述多种细胞类型中的一种或更多种类型的选择事件，其中所述一种或更多种目的细胞包含具有所述多种细胞类型中的所述一种或更多种类型中的任一种的所述多种细胞中的一种或更多种细胞。所述计算系统可以接收与所述第一多个荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据。
在一些实施例中，所述计算系统可以：接收所述第一多个显示区域中的显示区域的放大事件；以及促使所述显示器渲染所述溢出编辑器，所述溢出编辑器包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。所述显示区域的所述放大事件可包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。
在一些实施例中，所述计算系统可生成所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。在一些实施例中，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为显示所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图编辑。方法1100结束于框1128。
执行环境
图12描绘了示例计算设备1200的总体架构，所述示例计算设备被配置成操作本文所揭示的代谢物、注释和基因整合系统。图12所示的计算设备1200的所述总体架构包括计算机硬件和软件组件的布置。计算设备1200可以包括相较于图12中示出的元件更多(或更少)的元件。但是，提供实现性公开内容时，无需示出所有此类常规元件。如图所示，计算设备1200包括处理单元1210、网络接口1220、计算机可读介质驱动器1230、输入/输出设备接口1240、显示器1250和输入设备1260，所有这些都可以通过通信总线与另一设备进行通信。网络接口1220可与一个或更多个网络或计算系统连接。处理单元1210因此可以经由网络从其他计算系统或服务处接收信息和指令。处理单元1210还可以与存储器1270进行通信，且可以通过输入/输出设备接口1240进一步为可选显示器1250提供输出信息。输入/输出设备接口1240还可以接受来自可选输入设备1260的输入，例如键盘、鼠标、数位笔、麦克风、触摸屏、手势识别系统、语音识别系统、游戏手柄、加速度计、陀螺仪或其他输入设备。
存储器1270可以含有计算机程序指令(在一些实施例中被分组为模块或组件)，所述指令由处理单元1210执行以实现一个或更多个实施例。存储器1270通常包括RAM、ROM和/或其他持久性、辅助性或非暂时性计算机可读介质。存储器1270可以存储操作系统1272，所述操作系统提供计算机程序指令以供处理单元1210在计算设备1200的常规管理和操作中使用。存储器1270可以进一步包括用于实现本发明的方面的计算机程序指令和其他信息。
例如，在一实施例中，存储器1270包括用于生成溢出编辑器的视图的溢出值显示模块1274以及用于编辑在溢出编辑器中示出并叠加于细胞分布图上的溢出值的溢出值编辑模块1276(例如，用于接收调整后溢出值)，例如图11中所述的用于显示和编辑溢出值的方法1100。另外，存储器1270可以包括数据存储器1290和/或一个或更多个其他数据存储器或与之通信，所述数据存储器存储多维荧光强度数据、溢出值、包含所述溢出值的溢出矩阵、调整后溢出值和/或包含所述调整后溢出值的调整后溢出矩阵。
术语
本文中使用的术语“确定”涵盖各种活动。例如，“确定”可以包括计算、计算机计算、处理、推导、调查、查找(例如，在表、数据库或另一数据结构中查找)、查明等。此外，“确定”可以包括接收(例如，接收信息)、访问(例如，访问存储器中的数据)等。此外，“确定”可以包括解析、选定、选择、建立等。
本文中使用的术语“提供”涵盖各种活动。例如，“提供”可以包括将值存储在便于后续检索的存储设备的位置、将值通过至少一种有线或无线通信介质直接发送给接收者、发送或存储对值的引用等。“提供”还可以包括经由硬件元件进行的编码、解码、加密、解密、确认、验证等。
本文中使用的术语“选择性地”或“选择性”可以涵盖各种活动。例如，“选择性”过程可以包括从多个选项中确定一个选项。“选择性”过程可以包括以下一项或更多项：动态确定的输入、预先配置的输入或用户为确定而发起的输入。在一些实施方案中，可以包括n输入切换以提供选择性功能，其中n是用于进行选择的输入数量。
本文中使用的术语“消息”涵盖用于传达(例如，发送或接收)信息的各种格式。消息可以包括机器可读的信息聚合，例如，XML文档、固定字段消息、逗号分隔消息等。在一些实施方案中，消息可以包括用于传输一种或更多种信息表示的信号。虽然以单数形式叙述，但应当理解，消息可以多个部分组成、发送、存储、接收等。
本文中使用的“用户界面”(也被称为交互式用户界面、图形用户界面或UI)可以指基于网络的包括数据字段、按钮或用于接收输入信号或提供电子信息或向用户提供信息以响应于任何接收到的输入信号的其他交互控件。可以采用诸如超文本标记语言(HTML)、JAVASCRIPTTM、FLASHTM、JAVATM,.NETTM、WINDOWS OSTM、macOSTM、Web服务和丰富站点摘要(RSS)等技术来全部或部分实现UI。在一些实施方案中，可以将UI包括在被配置成根据所述的一个或更多个方面进行通信(例如，发送或接收数据)的独立客户端(例如，胖客户端、胖客户机)中。
本文中使用的“数据存储器”可以体现在可以访问某一设备或由所述设备访问的硬盘驱动器、固态存储器和/或任何其他类型的非暂时性计算机可读存储介质中，所述设备包括存取设备、服务器或其他所述的计算设备等。如本领域所公知，在不脱离本发明的范围的情况下，数据存储器还可以或替代地在多个本地和/或远程存储设备上实现分布或分区。在其他实施例中，数据存储器可以包括或体现在数据存储网络服务中。
本领域技术人员应当理解，可以使用各种不同技术和技巧中的任何一种来表示信息、消息和信号。例如，在上述整个说明书中可能提及的数据、指令、命令、信息、信号、位、符号和芯片可以用电压、电流、电磁波、磁场或粒子、光场或光学粒子或其任何组合表示。
本领域技术人员应当进一步理解，结合本文所揭示的实施例描述的各种说明性逻辑块、模块、电路和算法步骤可以电子硬件、计算机软件或两者的组合的形式实现。为了清楚阐明硬件和软件的这种可互换性，上文已大体上就其功能描述了各种说明性组件、块、模块、电路和步骤。这种功能以硬件还是软件的形式实现取决于特定应用以及对于整个系统的设计约束。技术人员可以针对各特定应用以各种方式执行所述功能，但是这种执行决策不应被解释为导致脱离本发明的范围。
本文所述的技术可以硬件、软件、固件或其任何组合的形式来实施。所述技术可以在各种设备中的任何一种中实施，例如，专门编程的事件处理计算机、无线通信设备或集成电路器件。被描述为模块或组件的任何功能都可以在集成逻辑设备中一同执行，或在离散但可互操作的逻辑设备中分别执行。如果以软件形式实施，则所述技术可以至少部分通过计算机可读数据存储介质来实现，所述计算机可读数据存储介质包括指令，执行所述指令时，即执行上述一种或更多种方法。所述计算机可读数据存储介质可以构成计算机程序产品的一部分，其可以包括包装材料。所述计算机可读介质可以包含存储器或数据存储介质，例如，随机存取存储器(RAM)(例如同步动态随机存储器(SDRAM))、只读存储器(ROM)、非易失性随机存取存储器(NVRAM)、电可擦可编程只读存储器(EEPROM)、闪速存储器、磁性或光学数据存储介质等。所述计算机可读介质可以是非暂时性存储介质。此外或另外，所述技术可以至少部分通过计算机可读通信介质来实现，所述计算机可读通信介质以指令或数据结构的形式携带或传递程序代码，而且可以通过计算设备来访问、读取和/或执行，例如传播的信号或波。
所述程序代码可以由专门编程的分选策略处理器执行，所述分选策略处理器可以包括一个或更多个处理器，例如，一个或更多个数字信号处理器(DSP)、可配置微处理器、专用集成电路(ASIC)、现场可编程门阵列(FPGA)或其他等效的集成或离散逻辑电路系统。所述图形处理器可以被专门配置成执行本发明中所描述的任何技术。计算设备的组合(例如，DSP和微处理器的组合、多个微处理器、与DSP内核结合的一个或更多个微处理器或至少部分数据连接中的任何其他此等配置)可以执行一项或更多项所述功能。在一些方面，本文所述的功能可以在被配置成用于编码和解码的专用软件模块或硬件模块内提供，或者将其并入专用分选控制卡中。
本领域技术人员应当理解，一般而言，本文使用的术语，特别是所附权利要求书中(例如，在所附权利要求书的主体部分中)使用的术语，通常应理解为“开放”术语(例如，术语“包括”应解释为“包括但不限于”，术语“具有”应解释为“至少具有”等)。本领域技术人员还应理解，如果意在所引入的权利要求中标明具体数目，则这种意图将在该权利要求中明确指出，而在无这种明确标明的情况下，则视为不存在这种意图。例如，为帮助理解，所附权利要求可能使用了引导短语“至少一个”和“一个或更多个”来引入权利要求中的特征。然而，这种短语的使用不应被解释为暗示着由不定冠词“一”或“一个”引入的权利要求特征将含有该特征的任意特定权利要求限制为仅含有一个该特征的实施例，即便是该权利要求既包括引导短语“一个或更多个”或“至少一个”又包括不定冠词如“一”或“一个”(例如，“一”和/或“一个”应当被解释为意指“至少一个”或“一个或更多个”)；在使用定冠词来引入权利要求中的特征时，同样如此。另外，即使明确指出了所引入权利要求特征的具体数目，本领域技术人员应当认识到，这种列举应解释为意指至少是所列数目(例如，不存在其他修饰语的短语“两个特征”意指至少两个该特征，或者两个或更多该特征)。另外，在使用类似于“A、B和C等中至少一个”这样的表述的情况下，一般来说应该按照本领域技术人员通常理解该表述的含义来予以解释(例如，“具有A、B和C中至少一个的系统”应包括但不限于单独具有A、单独具有B、单独具有C、具有A和B、具有A和C、具有B和C和/或具有A、B和C的系统等)。在使用类似于“A、B或C等中至少一个”这样的表述的情况下，一般来说应该按照本领域技术人员通常理解该表述的含义来予以解释(例如，“具有A、B或C中至少一个的系统”应包括但不限于单独具有A、单独具有B、单独具有C、具有A和B、具有A和C、具有B和C和/或具有A、B和C的系统等)。本领域技术人员还应当理解，实质上任意表示两个或更多可选项目的转折连词和/或短语，无论是在说明书、权利要求书还是附图中，都应被理解为给出了包括这些项目之一、这些项目任一方或两个项目的可能性。例如，短语“A或B”应当被理解为包括“A”或“B”或“A和B”的可能性。
另外，在以马库什组描述本发明的特征或方面的情况下，本领域技术人员应当认识到，本发明因此也是以该马库什组中的任意单独成员或成员子组来描述的。
本领域技术人员应当理解，出于任意和所有目的，例如为了提供书面说明，本文所揭示的所有范围也包含任意及全部可能的子范围及其子范围的组合。任意列出的范围可被轻易地视作充分描述且实现了将该范围至少进行二等分、三等分、四等分、五等分、十等分等。作为非限制性示例，在此所讨论的每一范围均可被轻易地分成下三分之一、中三分之一和上三分之一等。本领域技术人员应当理解，所有诸如“直至”、“至少”、“大于”、“小于”之类的语言包括所列数字，并且指代了随后可以如上所述被分成子范围的范围。最后，本领域技术人员应当理解，范围包括每一单独数字。因此，例如具有1-3个单元的组是指具有1、2或3个单元的组。类似地，具有1-5个单元的组是指具有1、2、3、4或5个单元的组，以此类推。
本文所揭示的方法包含用于实现所述方法的一个或更多个步骤或动作。在不脱离权利要求书的范围的情况下，所述方法步骤和/或动作可以彼此互换。换言之，除非指定了步骤或动作的特定顺序，否则可以在不脱离权利要求书的范围的情况下，修改特定步骤和/或动作的顺序和/或用途。
虽然已在本文中揭示了各方面和实施例，但是其他方面和实施例对于本领域技术人员而言是显而易见的。本文所揭示的各方面和实施例是为了说明目的而提供，而非旨在进行限定，其真实范围和精神由以下权利要求书指示。
Claims (136)
1.一种用于显示和编辑溢出值的方法，所述方法包含：
在处理器的控制下：
促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色，
其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示第一多个荧光团中的荧光团，其中所述多个行和所述多个列中的每项各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联，
其中所述第一多个显示区域中的每个区域均位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中，其中，所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值，以及
其中由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个；
接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件；
促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象；
接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值；以及
促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象，其中所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
2.一种用于显示和编辑溢出值的方法，所述方法包含：
在处理器的控制下：
促使显示溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色，
其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示第一多个荧光团中的荧光团，其中所述多个行和所述多个列中的每项各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联，以及
其中所述第一多个显示区域中的每个区域均位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中，其中，所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，所述信息对象包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值；
接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值；以及
促使显示所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象，其中所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
3.根据权利要求2所述的方法，其中由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。
4.根据权利要求2-3中任一项所述的方法，其包含：
接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件；以及
促使显示所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。
6.根据权利要求5所述的方法，其包含确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其包含：
获取包含所述溢出值的溢出矩阵；以及
利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述视图。
8.根据权利要求7所述的方法，其中所述溢出矩阵是默认的未经调整的溢出矩阵。
9.根据权利要求7所述的方法，其中所述溢出矩阵是第一调整后溢出矩阵。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其包含：
确定第二调整后溢出矩阵，所述溢出矩阵包含来自所述溢出矩阵的所述调整后溢出值；以及
利用所述第二调整后溢出矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
11.根据权利要求10所述的方法，其包含：
确定所述第二调整后溢出矩阵的逆矩阵，其中生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图包含利用所述第二调整后溢出矩阵的所述逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述第一图包含未补偿图，并且其中所述第二图包含利用所述调整后溢出值生成的补偿图。
13.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述第一图包含利用与所述调整后溢出值相对应的所述溢出值生成的补偿图，并且其中所述第二图包含利用所述调整后溢出值生成的补偿图。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述双变量图包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。
16.根据权利要求14所述的方法，其中所述双变量图包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
17.根据权利要求16所述的方法，其包含：
促使显示利用所述多维事件数据确定的所述多种细胞的多种细胞类型的群体层次结构；以及
接收所述多种细胞类型中的一种或更多种类型的选择事件，其中所述一种或更多种目的细胞包含具有所述多种细胞类型中的所述一种或更多种类型中的任一种的所述多种细胞中的一种或更多种细胞。
18.根据权利要求1-17中任一项所述的方法，其包含接收与所述第一多个荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据。
19.根据权利要求1-18中任一项所述的方法，其中由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团是不同的。
20.根据权利要求1-19中任一项所述的方法，其中由所述多个列中的列表示的所述荧光团具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
21.根据权利要求1-20中任一项所述的方法，其包含接收来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择(包含所述第一多个荧光团)。
22.根据权利要求1-20中任一项所述的方法，其包含接收来自所述第一多个荧光团的第二多个荧光团的选择(包含所述第二多个荧光团)。
23.根据权利要求22所述的方法，其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且其中所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。
24.根据权利要求22-23中任一项所述的方法，其包含促使显示所述溢出编辑器的第二调整后视图，所述视图包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。
25.根据权利要求24所述的方法，其包含生成所述溢出编辑器的所述第二调整后视图。
26.根据权利要求1-25中任一项所述的方法，其中由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。
27.根据权利要求1-26中任一项所述的方法，其中由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差一个。
28.根据权利要求1-27中任一项所述的方法，其中每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。
29.根据权利要求1-28中任一项所述的方法，其中每一列的所述报头信息对象均位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。
30.根据权利要求1-29中任一项所述的方法，其中所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。
31.根据权利要求1-30中任一项所述的方法，其中所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域彼此对齐。
32.根据权利要求1-31中任一项所述的方法，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。
33.根据权利要求32所述的方法，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。
34.根据权利要求33所述的方法，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
35.根据权利要求33所述的方法，其中所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
36.根据权利要求33-35中任一项所述的方法，其中所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的，并且其中所述两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象具有相同的背景颜色。
37.根据权利要求33-36中任一项所述的方法，其中所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色具有较高的对比度。
38.根据权利要求32-37中任一项所述的方法，其中所述文本标记的所述颜色是白色。
39.根据权利要求33-38中任一项所述的方法，其中显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。
40.根据权利要求39所述的方法，其中所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
41.根据权利要求39所述的方法，其中所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
42.根据权利要求39-41中任一项所述的方法，其中所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色具有较高的对比度。
43.根据权利要求39-41中任一项所述的方法，其中所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色是白色。
44.根据权利要求1-43中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。
45.根据权利要求1-44中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置水平相邻。
46.根据权利要求1-45中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的右侧。
47.根据权利要求1-46中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的左侧。
48.根据权利要求1-43中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻。
49.根据权利要求1-48中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。
50.根据权利要求1-49中任一项所述的方法，其中所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一显示区域的右上角和左下角。
51.根据权利要求1-50中任一项所述的方法，其中所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值，并且其中所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。
52.根据权利要求51所述的方法，其中所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且其中所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
53.根据权利要求1-52中任一项所述的方法，其中所述背景颜色是白色，并且所述调整后背景颜色是非白色。
54.根据权利要求53所述的方法，其中所述调整后背景颜色的所述非白色与所述调整后溢出值和所述相应溢出值之间的差异相关。
55.根据权利要求54所述的方法，其中所述相应溢出值是默认溢出值。
56.根据权利要求1-55中任一项所述的方法，其中所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。
57.根据权利要求56所述的方法，其中所述增加指示器包含向上箭头，并且其中所述减少指示器包含向下箭头。
58.根据权利要求56-57中任一项所述的方法，其中接收所述调整后溢出值包含接收所述增加指示器或所述减少激活器的激活事件。
59.根据权利要求1-58中任一项所述的方法，其中接收所述调整后溢出值包含从用户处接收所述调整后溢出值的文本输入。
60.根据权利要求1-59中任一项所述的方法，其包含：
接收所述调整后溢出值的溢出值重置事件；并且促使显示所述溢出编辑器的所述视图。
61.根据权利要求60所述的方法，其中所述溢出值重置事件包含利用指向设备单击或双击位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
62.根据权利要求1-61中任一项所述的方法，
63.根据权利要求1-61中任一项所述的方法，其包含：
接收所述第一多个显示区域中的显示区域的放大事件；以及
促使显示所述溢出编辑器，所述溢出编辑器包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。
64.根据权利要求63所述的方法，其中所述显示区域的所述放大事件包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。
65.根据权利要求1-64中任一项所述的方法，其包含：
确定所述更新后溢出值高于阈值；以及
在与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置显示警告信息对象。
66.根据权利要求65所述的方法，其中所述阈值是100％。
67.根据权利要求1-66中任一项所述的方法，其包含生成所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
68.根据权利要求1-67中任一项所述的方法，其包含显示所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
69.一种用于显示和编辑溢出值的计算系统，所述方法包含：
被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；
显示器；以及
与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器，所述处理器被所述可执行指令编程为：
促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色，
其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示第一多个荧光团中的荧光团，其中所述多个行和所述多个列中的每项各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联，
其中所述第一多个显示区域中的每个区域均位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中，其中，所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)与由所述第一图表示的所述两个荧光团相关的多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，每个信息对象均包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值，以及
其中由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个；
接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的选择事件；
促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象；
接收所述选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值；以及
促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象，其中所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
70.一种用于显示和编辑溢出值的计算系统，所述方法包含：
被配置成存储可执行指令的非暂时性存储器；
显示器；以及
与所述非暂时性存储器和所述显示器进行通信的处理器，所述处理器被所述可执行指令编程为：
促使所述显示器渲染溢出编辑器的视图，所述视图包含由多个行和多个列组成的三角形网格，每个行和列均包含第一多个显示区域中的至少一个显示区域，所述多个显示区域具有所述显示区域的背景颜色，
其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示第一多个荧光团中的荧光团，其中所述多个行和所述多个列中的每项各自与由所述行和列表示的所述荧光团的报头信息对象相关联，以及
其中所述第一多个显示区域中的每个区域均位于所述多个行中的行以及所述多个列中的列中，其中，所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第一多个荧光团中的所述两个荧光团，其中所述第一多个显示区域中的每个区域均包含(i)多个第一图中的第一图；以及(ii)两个溢出值信息对象，所述信息对象包含在第一溢出值信息对象位置和第二溢出值信息对象位置处与由所述显示区域表示的所述荧光团相关联的溢出值；
接收在所述多个行中的选定行和所述多个列中的选定列中的所述第一多个显示区域中的选定显示区域的所述两个溢出值信息对象中第一溢出值信息对象的调整后溢出值；以及
促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的第一调整后视图，所述视图包含所述第一多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的第二图；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象，其中所述选定显示区域具有所述显示区域的调整后背景颜色，并且包含(i)位于所述第一溢出值信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述调整后溢出值；以及(ii)位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
71.根据权利要求70所述的计算系统，其中由所述多个行中的两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。
72.根据权利要求70-71中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
接收在所述多个行中的所述选定行和所述多个列中的所述选定列中的所述第一多个显示区域中的所述选定显示区域的选择事件；以及
促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的选定视图，所述视图包含所述选定显示区域，所述显示区域包含(i)所述选定显示区域的所述第一图；以及(ii)在所述选定显示区域的第一标记信息对象位置和第二标记信息对象位置处由所述选定显示区域表示的所述荧光团的标记信息对象。
73.根据权利要求69-72中任一项所述的计算系统，其中所述溢出编辑器的所述第一调整后视图中的所述第一多个显示区域中的每个区域均包含所述显示区域中叠加的所述第一图和所述第二图。
74.根据权利要求73所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为确定选择事件以叠加所述第一图和所述第二图。
75.根据权利要求69-74中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
获取包含所述溢出值的溢出矩阵；以及
利用所述溢出矩阵和/或所述溢出矩阵的逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述视图。
76.根据权利要求75所述的计算系统，其中所述溢出矩阵是默认的未经调整的溢出矩阵。
77.根据权利要求75所述的计算系统，其中所述溢出矩阵是第一调整后溢出矩阵。
78.根据权利要求69-77中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
确定第二调整后溢出矩阵，所述溢出矩阵包含来自所述溢出矩阵的所述调整后溢出值；以及
利用所述第二调整后溢出矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
79.根据权利要求78所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
确定所述第二调整后溢出矩阵的逆矩阵，其中生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图包含利用所述第二调整后溢出矩阵的所述逆矩阵生成所述溢出编辑器的所述第一调整后视图。
80.根据权利要求69-79中任一项所述的计算系统，其中所述第一图包含未补偿图，并且其中所述第二图包含利用所述调整后溢出值生成的补偿图。
81.根据权利要求69-79中任一项所述的计算系统，其中所述第一图包含利用与所述调整后溢出值相对应的所述溢出值生成的补偿图，并且其中所述第二图包含利用所述调整后溢出值生成的补偿图。
82.根据权利要求69-81中任一项所述的计算系统，其中所述第一图和/或第二图包含与由所述第一图表示的所述荧光团相关的双变量图。
83.根据权利要求82所述的计算系统，其中所述双变量图包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据的分布。
84.根据权利要求82所述的计算系统，其中所述双变量图包含与由所述双变量图表示的所述荧光团相关并与多种细胞中的一种或更多种目的细胞相关联的多维事件数据的分布。
85.根据权利要求84所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
促使所述显示器渲染利用所述多维事件数据确定的所述多种细胞的多种细胞类型的群体层次结构；以及
接收所述多种细胞类型中的一种或更多种类型的选择事件，其中所述一种或更多种目的细胞包含具有所述多种细胞类型中的所述一种或更多种类型中的任一种的所述多种细胞中的一种或更多种细胞。
86.根据权利要求69-85中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为接收与所述第一多个荧光团相关并与多种细胞相关联的多维事件数据。
87.根据权利要求69-86中任一项所述的计算系统，其中由所述多个显示区域中的每个区域表示的所述两个荧光团是不同的。
88.根据权利要求69-87中任一项所述的计算系统，其中由所述多个列中的列表示的所述荧光团具有发射光谱，所述发射光谱中具有最高发射的波长大于由所述多个列中的后续列表示的荧光团的发射光谱中具有最高发射的波长。
89.根据权利要求69-88中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为接收来自第二多个荧光团的所述第一多个荧光团的选择(包含所述第一多个荧光团)。
90.根据权利要求69-88中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为接收来自所述第一多个荧光团的第二多个荧光团的选择(包含所述第二多个荧光团)。
91.根据权利要求90所述的计算系统，其中所述多个行和所述多个列中的每项均表示所述第二多个荧光团中的荧光团，并且其中所述第一多个显示区域中的每个区域均表示由所述显示区域所在的所述行和所述列表示的所述第二多个荧光团中的所述两个荧光团。
92.根据权利要求90-91中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为促使显示所述溢出编辑器的第二调整后视图，所述视图包含第二多个显示区域，每个显示区域包含(i)与基于所述调整后溢出值生成的所述相应第一图相关的所述第二图，其表示所述第二多个荧光团中的两个荧光团；以及(ii)所述显示区域中位于所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置处的所述两个溢出信息对象。
93.根据权利要求92所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为生成所述溢出编辑器的所述第二调整后视图。
94.根据权利要求69-93中任一项所述的计算系统，其中由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差至少一个。
95.根据权利要求69-94中任一项所述的计算系统，其中由所述多个行中的任意两个相邻行和所述多个列中的两个相邻列组成的所述一个或更多个显示区域的数量相差一个。
96.根据权利要求69-95中任一项所述的计算系统，其中每一行的所述报头信息对象均位于所述行的所述至少一个显示区域中最左侧显示区域的左侧。
97.根据权利要求69-96中任一项所述的计算系统，其中每一列的所述报头信息对象均位于所述列的所述至少一个显示区域中最顶端显示区域的顶部。
98.根据权利要求69-97中任一项所述的计算系统，其中所述多个行中每一行的所述至少一个显示区域中的最右侧显示区域彼此对齐。
99.根据权利要求69-98中任一项所述的计算系统，其中所述多个列中每一列的所述至少一个显示区域中的最顶端显示区域彼此对齐。
100.根据权利要求69-99中任一项所述的计算系统，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象各自包含所述荧光团的文本标记。
101.根据权利要求100所述的计算系统，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象具有与所述荧光团的发射光谱有关的背景颜色。
102.根据权利要求101所述的计算系统，其中所述荧光团的所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色是所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
103.根据权利要求101所述的计算系统，其中所述报头信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色近似所述荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
104.根据权利要求101-103中任一项所述的计算系统，其中所述多个荧光团中的两个荧光团的所述发射光谱是不同的和/或所述两个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长是不同的，并且其中所述两个荧光团的所述报头信息对象和/或所述标记信息对象具有相同的背景颜色。
105.根据权利要求101-104中任一项所述的计算系统，其中所述背景信息对象和/或至少一个所述标记信息对象的所述荧光团的所述文本标记的颜色与所述背景信息对象和/或所述至少一个所述标记信息对象的所述背景颜色具有较高的对比度。
106.根据权利要求100-105中任一项所述的计算系统，其中所述文本标记的所述颜色是白色。
107.根据权利要求101-106中任一项所述的计算系统，其中显示区域的所述溢出值信息对象中至少一个对象的溢出值的颜色与由所述显示区域表示的所述荧光团中一个荧光团的所述发射光谱相关联。
108.根据权利要求107所述的计算系统，其中所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色是由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
109.根据权利要求107所述的计算系统，其中所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色近似由所述显示区域表示的所述荧光团中所述一个荧光团的所述发射光谱中具有所述最高发射的所述波长的颜色。
110.根据权利要求107-109中任一项所述的计算系统，其中所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色与所述溢出值信息对象中至少一个对象的所述溢出值的所述颜色具有较高的对比度。
111.根据权利要求107-109中任一项所述的计算系统，其中所述溢出值信息对象中所述至少一个对象的背景颜色是白色。
112.根据权利要求69-111中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻。
113.根据权利要求69-112中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置水平相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置水平相邻。
114.根据权利要求69-113中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置位于所述第一标记信息对象位置的左侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的右侧。
115.根据权利要求69-114中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置位于所述第一标记信息对象位置的右侧，和/或其中所述第二溢出值信息对象位置位于所述第二标记信息对象位置的左侧。
116.根据权利要求69-111中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置与所述第二标记信息对象位置相邻，并且其中所述第二溢出值信息对象位置与所述第一标记信息对象位置相邻。
117.根据权利要求69-116中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一图和/或所述第二图的相对角。
118.根据权利要求69-117中任一项所述的计算系统，其中所述第一溢出值信息对象位置和所述第二溢出值信息对象位置位于所述第一显示区域的右上角和左下角。
119.根据权利要求69-118中任一项所述的计算系统，其中所述第一显示区域中所述第一溢出值信息对象的所述溢出值是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中第一荧光团的发射变成所述两个荧光团中第二荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值，并且其中所述第一显示区域中所述第二溢出值信息对象的所述溢出值是与由所述第一显示区域表示的所述两个荧光团中所述第二荧光团的发射变成所述两个荧光团中所述第一荧光团的所检测到的发射相关联的溢出值。
120.根据权利要求119所述的计算系统，其中所述第一荧光团由所述显示区域所在的所述列表示，并且其中所述第二荧光团由所述显示区域所在的所述行表示。
121.根据权利要求69-120中任一项所述的计算系统，其中所述背景颜色是白色，并且所述调整后背景颜色是非白色。
122.根据权利要求121所述的计算系统，其中所述调整后背景颜色的所述非白色与所述调整后溢出值和所述相应溢出值之间的差异相关。
123.根据权利要求122所述的计算系统，其中所述相应溢出值是默认溢出值。
124.根据权利要求69-123中任一项所述的计算系统，其中所述第一多个显示区域中的每个区域和/或所述选定显示区域的所述溢出值信息对象各自包含增加指示器和减少指示器。
125.根据权利要求124所述的计算系统，其中所述增加指示器包含向上箭头，并且其中所述减少指示器包含向下箭头。
126.根据权利要求124-125中任一项所述的计算系统，其中为了接收所述调整后溢出值，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为接收所述增加指示器或所述减少激活器的激活事件。
127.根据权利要求69-126中任一项所述的计算系统，其中为了接收所述调整后溢出值，所述硬件处理器被所述可执行指令编程为从用户处接收所述调整后溢出值的文本输入。
128.根据权利要求69-127中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
接收所述调整后溢出值的溢出值重置事件；并且促使所述显示器渲染所述溢出编辑器的所述视图。
129.根据权利要求128所述的计算系统，其中所述溢出值重置事件包含利用指向设备单击或双击位于所述第一标记信息对象位置处的所述第一溢出值信息对象的所述溢出值。
130.根据权利要求69-129中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
接收所述第一多个显示区域中的显示区域的放大事件；
和
促使所述显示器渲染所述溢出编辑器，所述溢出编辑器包含与所述放大事件所处的所述显示区域相对应的放大显示区域。
131.根据权利要求130所述的计算系统，其中所述显示区域的所述放大事件包含悬停于所述放大事件所处的所述显示区域上的指向设备。
132.根据权利要求69-131中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为：
确定所述更新后溢出值高于阈值；以及
在与所述第一溢出值信息对象位置相邻的警告信息对象位置显示警告信息对象。
133.根据权利要求132所述的计算系统，其中所述阈值是100％。
134.根据权利要求69-133中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为生成所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图编辑。
135.根据权利要求69-134中任一项所述的计算系统，其中所述硬件处理器被所述可执行指令编程为显示所述溢出编辑器的所述视图、所述溢出编辑器的所述选定视图和/或所述溢出编辑器的所述第一调整后视图编辑。
136.一种根据前述权利要求中任一项所述的溢出编辑器。
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