CN112950587B - 基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法、系统及设备 - Google Patents

基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法、系统及设备 Download PDF

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Abstract

本发明属于图像分析领域,具体涉及了一种基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法、系统和设备,旨在解决现有的图像分析方法难以快速识别出手术中的肿瘤组织,难以辅助医生完成精准切除的问题。本发明包括:获取标本荧光图像作为待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络获得待测图像类别,将类别为肿瘤组织的待测图像通过肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级,通过Ki‑67表达水平识别网络获得待测图像的Ki‑67表达水平;其中脑胶质瘤图像识别网络基于EfficientNet卷积神经网络构建并通过二分类交叉熵损失函数训练。本发明实现了在手术中实时识别脑胶质瘤标本,辅助医生完成精准切除,同时提供分级和基因信息,帮助医生判断病人预后。

Description

基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法、系统及设备
背景技术
脑胶质瘤占成人原发性恶性脑肿瘤的75%。这些脑肿瘤患者中超过一半是最致命的胶质母细胞瘤,平均总生存期只有14.6个月。虽然对于脑胶质瘤患者已经存在多种先进治疗方法,但神经外科手术仍然是主要的治疗方式,在提高生存率方面发挥着重要作用。
目前,可见光下的显微手术是神经外科临床最常用的手术方法。但由于神经外科医生很难清楚地识别胶质瘤的边界,所以很容易导致肿瘤残留和早期复发的问题。因此,在手术中对组织标本进行快速、准确的诊断至关重要。术中应用苏木精-伊红(H&E)染色法对冰冻组织切片进行病理检查是一种常规而可靠的诊断方法,但它通常需要耗费很长时间(至少20-30分钟),并且通过复杂的步骤才能获得病理结果。此外,基于这种方法在手术中冷冻数十个或数百个标本是不现实的,这在一定程度上限制了它在肿瘤术中实时诊断尤其是多个组织标本中的应用。
荧光成像的发展使实时成像引导手术成为可能,这大大提高了高级别胶质瘤的完全切除率。吲哚青绿是一种安全、经济的近红外荧光显像剂,已在临床上用于脑胶质瘤手术,并表现出较高的灵敏度和一定的特异性。
在过去的几年里,人工智能技术如深度卷积神经网络已经被发展用于进行医学图像的分类,并且表现出良好的效果。通过与常规的影像学技术如磁共振成像等相结合,深度神经网络也被用于胶质瘤的治疗和诊断,例如提供分级和基因信息,自动化术后病理诊断,或帮助确定预后和指导治疗。然而,这些技术与方法主要集中在术前和术后影像,很少有应用到术中,在手术时进行胶质瘤的快速诊断。
发明内容
为了解决现有技术中的上述问题,即现有的技术无法快速准确地识别出肿瘤的组织,难以实际运用到术中,本发明提供了一种基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法。本发明基于的图像为可在术中实时、高通量采集的脑胶质瘤标本荧光图像,同时由于术中采集的荧光图像本身具有分辨率小、噪声高的特点,本发明提出了使用适用于荧光图像的数据预处理方法来扩增训练样本,并使用了余弦退火策略来进行网络训练。为了满足术中实时处理的需求,使用了基于EfficientNet的高效神经网络架构,在保证识别准确率的同时,尽可能地提高图像处理速度。本发明的具体步骤包括:
步骤S100,获取标本荧光图像,作为待测图像;
步骤S200,基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
步骤S300,基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平。
进一步地,所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络、基于深度学习的肿瘤分级网络和基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络,基于EfficientNet卷积神经网络构建;所述EfficientNet卷积神经网络包括顺次连接的输入层、特征提取层和预测层;其中,特征提取层包括顺次连接的1个Stem模块和n个结构相同特征数不同的MBConv模块;所述Stem模块为1个卷积核为3×3的卷积层;所述MBConv模块为逆瓶颈结构,包括顺次连接的卷积核为1×1的卷积层、包含注意力模块的卷积核为3×3的通道可分卷积和1个卷积核为1×1的卷积,其中3x3卷积的特征数大于1x1卷积的特征数。
进一步地,所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,其训练方法包括:
步骤A100,获取训练图像;
步骤A200,基于所述训练图像进行灰度映射生成灰度训练图像;
步骤A300,基于所述灰度训练图像,通过所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络的特征提取层获取训练图像特征;特征提取层的深度d、宽度w、输入分辨率r为:
Figure BDA0002957489720000031
s.t.α·β2·γ2≈2,α≥1,β≥1,γ≥1
其中,
Figure BDA0002957489720000032
为放缩系数,α表示深度常数,β表示宽度常数,γ表示分辨率常数;深度d指MBConv模块的重复次数,宽度w指MBConv中卷积的特征数;
特征提取层中所述MBConv的注意力模块的注意力函数为:
Figure BDA0002957489720000041
Figure BDA0002957489720000042
其中,SE表示注意力函数,X表示模块的输入,x表示空间横坐标,y表示空间纵坐标,H表示图像高度,W表示图像宽度,w1表示注意力模块中第一个全连接层的权重,w2表示注意力模块中第二个全连接层的权重,f表示注意力权重函数,g表示全局平均池化函数;
步骤A400,基于所述训练图像特征,通过预测层获得训练图像类别;并计算加权二分类交叉熵损失LBCE
Figure BDA0002957489720000043
Figure BDA0002957489720000044
其中,yt表示样本标签,
Figure BDA0002957489720000045
表示第i个样本的标签,yp表示网络输出的概率,
Figure BDA0002957489720000046
表示第i个样本输出的概率,P表示正样本类别,N表示负样本类别,αP表示正样本的权重,αN表示负样本的权重;
所述加权二分类交叉熵损失可以帮助模型针对目标类别进行学习,使模型在小分辨率、高噪声的荧光图像中学习到更多有利于脑胶质瘤识别的特征。
步骤A500,重复步骤A100-步骤A400,通过反向传播得到梯度,通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,获得训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络。
进一步地,所述通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,还包括:
通过余弦退火策略调整优化器的学习率η为:
Figure BDA0002957489720000051
其中,T表示总轮数,Tcur表示当前轮数,ηmax表示最大学习率,ηmin表示最小学习率,ηt表示当前学习率。
进一步地,所述加权二分类交叉熵损失函数,其权重由正负类别比例决定。
进一步地,步骤A200具体步骤包括:
步骤A210,基于所述训练图像,将荧光信号转换为灰度值生成灰度映射图像:
Figure BDA0002957489720000052
其中,I为包含原始荧光信号的待测图像,Imin为待测图像中荧光信号最小值,Imax为待测图像中荧光信号最大值,round表示将数值四舍五入为整数,I′为灰度映射图像;
步骤A220,基于所述灰度映射图像进行对比度自动调节,生成灰度训练图像;
所述对比度自动调节,其方法为:
IC=min(max(I′,Cmin),Cmax))
Figure BDA0002957489720000053
其中,Cmax为设置的灰度最大值,Cmin为设置的灰度最小值,IC为灰度训练图像,min函数表示取两者中的较小的值,max函数表示取两者中的较大的值,I′C为预处理后的灰度图像。
进一步地,步骤A300之前,包括对灰度训练图像预处理的步骤,包括以下一项或多项的预处理方法;
预处理方法一,将所述灰度训练图像进行填补黑边操作,使灰度训练图像的宽度和高度相等;
预处理方法二,将所述灰度训练图像缩放到与网络匹配的分辨率。
进一步地,所述步骤A100后,还包括样本扩增方法,具体步骤包括:
步骤B10,将所述训练图像依次进行随机尺寸放大或缩小、随机角度旋转、随机距离平移、随机位置裁剪、随机亮度调整和随机对比度调整生成初步处理的训练图像;
步骤B20,基于所述初步处理的训练图像,进行三通道像素值归一化处理,生成样本扩增后的训练图像。本发明的另一方面,提出了一种基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,包括:图像获取模块、图像识别模块和目标分析模块;
所述图像获取模块,配置为获取标本荧光图像,作为待测图像;
所述图像识别模块,配置为基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
所述目标分析模块,配置为基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平。
本发明的第三方面,提出了一种电子设备,其特征在于,包括:至少一个处理器;以及与至少一个所述处理器通信连接的存储器;其中,所述存储器存储有可被所述处理器执行的指令,所述指令用于被所述处理器执行以实现上述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法。
本发明的第四方面,提出了一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于被所述计算机执行以实现上述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法。
本发明的有益效果:
(1)本发明基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法,通过从标本的荧光图像中提取的特征,深度神经网络可以自动识别手术中的标本是正常组织还是肿瘤组织,更进一步地还可将组织的情况进行分级评定和Ki-67评定,为医生判断病人预后提供有效信息。
附图说明
通过阅读参照以下附图所作的对非限制性实施例所作的详细描述,本申请的其它特征、目的和优点将会变得更明显:
图1是本发明第一实施例基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法的流程示意图;
图2是本发明实施例中的训练样本扩增原理示意图;
图3是本发明实施例中深度神经网络EfficientNet的结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本申请作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅用于解释相关发明,而非对该发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与有关发明相关的部分。
需要说明的是,在不冲突的情况下,本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本申请。
本发明的一种基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法,包括:
步骤S100,获取标本荧光图像,作为待测图像;
步骤S200,基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
步骤S300,基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平。
本发明基于的图像为可在术中实时、高通量采集的脑胶质瘤标本荧光图像,同时由于术中采集的荧光图像本身具有分辨率小、噪声高的特点,本发明提出了使用适用于荧光图像的数据预处理方法来扩增训练样本,并使用了余弦退火策略来进行网络训练。为了满足术中实时处理的需求,使用了基于EfficientNet的高效神经网络架构,在保证识别准确率的同时,尽可能地提高图像处理速度。
为了更清晰地对本发明基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法法进行说明,下面结合图1对本发明实施例中各步骤展开详述。
本发明第一实施例的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法,包括步骤S100-步骤S300,各步骤详细描述如下:
步骤S100,获取标本荧光图像,作为待测图像;本实施例采用的荧光图像为目标患者手术中切除的脑组织的手术标本的荧光图像;对于得到的荧光图像,将每个标本所在的区域从整张图像中裁剪出来,使得标本边缘恰好位于裁剪图像边缘。可由医疗人员手动完成,或通过边缘图像分割方法并构建目标框获取以获得待测图像。所述切除的脑组织的手术标本的病理分类结果可以帮助医生判断在该切除区域是否要扩大切除。
步骤S200,基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
在本实施例中,如图3所示,所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络、基于深度学习的肿瘤分级网络和基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络,基于EfficientNet卷积神经网络构建;所述EfficientNet卷积神经网络包括顺次连接的输入层、特征提取层和预测层;其中,特征提取层包括顺次连接的1个Stem模块和n个结构相同特征数不同的MBConv模块,在具体的实施环境中,MBConv模块的特征数也有相同的情况,再此不做具体的限定;所述Stem模块为1个卷积核为3×3的卷积层;所述MBConv模块为逆瓶颈结构包括顺次连接的卷积核为1×1的卷积层、包含注意力模块的卷积核为3×3的卷积和1个卷积核为1×1的卷积;预测层的神经元数目取决于目标类别数。以图3为例,所述特征提取层输入图片输入Stem模块,依次通过MBConv×3、MBConv×2、MBConv×6、MBConv×4和Dense层。
在本实施例中,如图1所示,所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,其训练方法包括:
训练前,将预测层的参数使用正态分布随机初始化;
步骤A100,获取训练图像;
在本实施例中,还包括样本扩增方法如图2所示,包括:
步骤B10,将所述训练图像依次进行随机尺寸放大或缩小、随机角度旋转、随机距离平移、随机位置裁剪、随机亮度调整和随机对比度调整生成初步处理的训练图像;其中,本步骤的调整方法择一或几种皆可达到本发明样本扩增的效果;
步骤B20,基于所述初步处理的训练图像,进行三通道像素值归一化处理,生成样本扩增后的训练图像。
所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络、基于深度学习的肿瘤分级网络和基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络,基于EfficientNet卷积神经网络构建;所述EfficientNet卷积神经网络包括顺次连接的输入层、特征提取层和预测层;其中,特征提取层包括顺次连接的1个Stem模块和n个结构相同特征数不同的MBConv模块;所述Stem模块为1个卷积核为3×3的卷积层;所述MBConv模块包括顺次连接的卷积核为1×1的卷积层、包含注意力模块的卷积核为3×3的卷积和1个卷积核为1×1的卷积。所述MBConv模块中的逆瓶颈结构使用特征数较大的3x3卷积,所以可以从小分辨率的荧光图像中提取较丰富的图像语义特征,帮助进行脑胶质瘤识别。所述MBConv模块中的注意力模块通过注意力机制,使模型在从噪声较大的荧光图像中特征提取时,聚焦有利于识别脑胶质瘤的部分,进而减小荧光图像中噪声产生的影响。步骤A200,基于所述训练图像进行灰度映射生成灰度训练图像;
步骤A200具体步骤包括:
步骤A210,基于所述训练图像,将荧光信号转换为灰度值生成灰度映射图像如公式(1)所示:
Figure BDA0002957489720000111
其中,I为包含原始荧光信号的待测图像,Imin为待测图像中荧光信号最小值,Imax为待测图像中荧光信号最大值,round表示将数值四舍五入为整数,I′为灰度映射图像;
步骤A220,基于所述灰度映射图像进行对比度自动调节,生成灰度训练图像;
所述对比度自动调节,其方法如公式(2)和(3)所示:
IC=min(max(I′,Cmin),Cmax))  (2)
Figure BDA0002957489720000112
其中,Cmax为设置的灰度最大值,Cmin为设置的灰度最小值,IC为灰度训练图像,min函数表示取两者中的较小的值,max函数表示取两者中的较大的值,I′C为预处理后的灰度图像。步骤A300,基于所述灰度训练图像,通过所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络的特征提取层获取训练图像特征;特征提取层的深度d、宽度w、输入分辨率r如公式(4)所示:
Figure BDA0002957489720000113
其中,
Figure BDA0002957489720000114
为放缩系数,α表示深度常数,β表示宽度常数,γ表示分辨率常数;深度d指MBConv模块的重复次数,宽度w指MBConv中卷积的特征数;放缩系数
Figure BDA0002957489720000115
越大则得到的网络规模越大,越适用于准确率要求高,速度要求不高的场景。
特征提取层中所述MBConv的注意力模块的注意力函数如公式(5)和(6)所示:
Figure BDA0002957489720000121
Figure BDA0002957489720000122
其中,SE表示注意力函数,X表示模块的输入,x表示空间横坐标,y表示空间纵坐标,H表示图像高度,W表示图像宽度,w1表示注意力模块中第一个全连接层的权重,w2表示注意力模块中第二个全连接层的权重,f表示注意力权重函数,g表示全局平均池化函数;
步骤A400,基于所述训练图像特征,通过预测层获得训练图像类别;并计算加权二分类交叉熵损失LBCE如公式(7)和(8)所示:
Figure BDA0002957489720000123
Figure BDA0002957489720000124
其中,yt表示样本标签,
Figure BDA0002957489720000125
表示第i个样本的标签,yp表示网络输出的为正样本的概率,
Figure BDA0002957489720000126
表示第i个样本输出的概率,P表示正样本类别,N表示负样本类别,αP表示正样本的权重,αN表示负样本的权重;在本实施例中,可采用Adam优化器进行优化;
所述加权二分类交叉熵损失可以帮助模型针对目标类别进行学习,使模型在小分辨率、高噪声的荧光图像中学习到更多有利于脑胶质瘤识别的特征。
步骤A500,重复步骤A100-步骤A400,通过反向传播得到梯度,通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,获得训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络。
在本实施例中,所述通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,还包括:
通过余弦退火策略调整优化器的学习率η如公式(9)所示:
Figure BDA0002957489720000131
其中,T表示总轮数,Tcur表示当前轮数,ηmax表示最大学习率,ηmin表示最小学习率,ηt表示当前学习率。
所述加权二分类交叉熵损失函数,其正负类别权重分别为αP与αN,由正负类别比例决定。
在本实施例中,还包括对灰度训练图像预处理的步骤,包括以下一项或多项:
预处理方法一,将所述灰度训练图像进行填补黑边操作,使灰度训练图像的宽度和高度相等;
预处理方法二,将所述灰度训练图像缩放到与网络匹配的分辨率。
步骤S300,基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平。
肿瘤等级分为低级别和高级别,Ki-67表达水平分为低水平和高水平,脑胶质瘤的分级根据世界卫生组织的标准分为I,II,III,IV四个等级,低级别指I,II两个级别,高级别指III,IV两个级别。Ki-67是一种增殖细胞的相关抗原,Ki-67指标的范围是0到100,所述低水平指Ki-67指标的范围处于0-10,高水平指Ki-67指标的范围处于10-100。
本发明第二实施例的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,包括图像获取模块、图像识别模块和目标分析模块;
所述图像获取模块,配置为获取标本荧光图像,作为待测图像;
所述图像识别模块,配置为基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
所述目标分析模块,配置为基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平。
所属技术领域的技术人员可以清楚地了解到,为描述的方便和简洁,上述描述的系统的具体工作过程及有关说明,可以参考前述方法实施例中的对应过程,在此不再赘述。
需要说明的是,上述实施例提供的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,仅以上述各功能模块的划分进行举例说明,在实际应用中,可以根据需要而将上述功能分配由不同的功能模块来完成,即将本发明实施例中的模块或者步骤再分解或者组合,例如,上述实施例的模块可以合并为一个模块,也可以进一步拆分成多个子模块,以完成以上描述的全部或者部分功能。对于本发明实施例中涉及的模块、步骤的名称,仅仅是为了区分各个模块或者步骤,不视为对本发明的不当限定。
本发明第三实施例的一种电子设备,其特征在于,包括:至少一个处理器;以及与至少一个所述处理器通信连接的存储器;其中,所述存储器存储有可被所述处理器执行的指令,所述指令用于被所述处理器执行以实现上述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法
本发明第四实施例的一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于被所述计算机执行以实现上述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析方法。
所属技术领域的技术人员可以清楚地了解到,为描述的方便和简洁,上述描述的存储装置、处理装置的具体工作过程及有关说明,可以参考前述方法实施例中的对应过程,在此不再赘述。
术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象,而不是用于描述或表示特定的顺序或先后次序。
术语“包括”或者任何其它类似用语旨在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者设备/装置不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其它要素,或者还包括这些过程、方法、物品或者设备/装置所固有的要素。
至此,已经结合附图所示的优选实施方式描述了本发明的技术方案,但是,本领域技术人员容易理解的是,本发明的保护范围显然不局限于这些具体实施方式。在不偏离本发明的原理的前提下,本领域技术人员可以对相关技术特征做出等同的更改或替换,这些更改或替换之后的技术方案都将落入本发明的保护范围之内。

Claims (7)

1.一种基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,其特征在于,所述系统包括:图像获取模块、图像识别模块和目标分析模块;
所述图像获取模块,配置为获取标本荧光图像,作为待测图像;
所述图像识别模块,配置为基于所述待测图像,通过训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,获得待测图像类别;其中,待测图像类别包括正常组织和肿瘤组织;
所述目标分析模块,配置为基于类别为肿瘤组织的待测图像,通过训练好的基于深度学习的肿瘤分级网络获得待测图像的肿瘤等级;通过训练好的基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络获得待测图像的Ki-67表达水平;
所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络、基于深度学习的肿瘤分级网络和基于深度学习的Ki-67表达水平识别网络,基于EfficientNet卷积神经网络构建;所述EfficientNet卷积神经网络包括顺次连接的输入层、特征提取层和预测层;其中,特征提取层包括顺次连接的1个Stem模块和n个结构相同特征数不同的MBConv模块;所述Stem模块为1个卷积核为3×3的卷积层;所述MBConv模块为逆瓶颈结构,包括顺次连接的卷积核为1×1的卷积层、包含注意力模块的卷积核为3×3的卷积和1个卷积核为1×1的卷积;
所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络,其训练方法包括:
步骤A100,获取训练图像;
步骤A200,基于所述训练图像进行灰度映射生成灰度训练图像;
步骤A300,基于所述灰度训练图像,通过所述基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络的特征提取层获取训练图像特征;特征提取层的深度d、宽度w、输入分辨率r为:
Figure FDA0004003041500000021
s.t.α·β2·γ2≈2,α≥1,β≥1,γ≥1
其中,
Figure FDA0004003041500000022
为放缩系数,α表示深度常数,β表示宽度常数,γ表示分辨率常数;深度d指MBConv模块的重复次数,宽度w指MBConv中卷积的特征数;
特征提取层中所述MBConv的注意力模块的注意力函数为:
Figure FDA0004003041500000023
Figure FDA0004003041500000024
其中,SE表示注意力函数,X表示模块的输入,x表示空间横坐标,y表示空间纵坐标,H表示图像高度,W表示图像宽度,w1表示注意力模块中第一个全连接层的权重,w2表示注意力模块中第二个全连接层的权重,f表示注意力权重函数,g表示全局平均池化函数;
步骤A400,基于所述训练图像特征,通过预测层获得训练图像类别;并计算加权二分类交叉熵损失LBCE
Figure FDA0004003041500000025
Figure FDA0004003041500000026
其中,yt表示样本标签,
Figure FDA0004003041500000027
表示第i个样本的标签,yp表示网络输出的概率,
Figure FDA0004003041500000031
表示第i个样本输出的概率,P表示正样本类别,N表示负样本类别,αP表示正样本的权重,αN表示负样本的权重;
步骤A500,重复步骤A100-步骤A400,通过反向传播得到梯度,通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,获得训练好的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像识别网络。
2.根据权利要求1所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,其特征在于,所述通过随机梯度下降算法对网络参数进行优化,还包括:
通过余弦退火策略调整优化器的学习率η为:
Figure FDA0004003041500000032
其中,T表示总轮数,Tcur表示当前轮数,ηmax表示最大学习率,ηmin表示最小学习率,ηt表示当前学习率。
3.根据权利要求1所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,其特征在于,步骤A200具体步骤包括:
步骤A210,基于所述训练图像,将荧光信号转换为灰度值生成灰度映射图像:
Figure FDA0004003041500000033
其中,I为包含原始荧光信号的待测图像,Imin为待测图像中荧光信号最小值,Imax为待测图像中荧光信号最大值,round表示将数值四舍五入为整数,I′为灰度映射图像;
步骤A220,基于所述灰度映射图像进行对比度自动调节,生成灰度训练图像;
所述对比度自动调节,其方法为:
IC=min(max(I′,Cmin),Cmax))
Figure FDA0004003041500000041
其中,Cmax为设置的灰度最大值,Cmin为设置的灰度最小值,IC为灰度训练图像,min函数表示取两者中的较小的值,max函数表示取两者中的较大的值,I′C为预处理后的灰度映射图像。
4.根据权利要求1所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,其特征在于,在步骤A300之前,还包括对灰度训练图像预处理的步骤,包括以下一项或多项:
预处理方法一,将所述灰度训练图像进行填补黑边操作,使灰度训练图像的宽度和高度相等;
预处理方法二,将所述灰度训练图像缩放到与网络匹配的分辨率。
5.根据权利要求1所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统,其特征在于,所述步骤A100后,还包括样本扩增方法,具体包括:
步骤B10,将所述训练图像依次进行随机尺寸放大或缩小、随机角度旋转、随机距离平移、随机位置裁剪、随机亮度调整和随机对比度调整生成初步处理的训练图像;
步骤B20,基于所述初步处理的训练图像,进行三通道像素值归一化处理,生成样本扩增后的训练图像。
6.一种电子设备,其特征在于,包括:至少一个处理器;以及与至少一个所述处理器通信连接的存储器;其中,所述存储器存储有可被所述处理器执行的指令,所述指令用于被所述处理器执行以实现权利要求1-5任一项所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统的功能。
7.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于被所述计算机执行以实现权利要求1-5任一项所述的基于深度学习的脑胶质瘤荧光图像分析系统的功能。
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