CN112529907B - 基于sr染色的大鼠肺部纤维分析系统及其工作方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统及其工作方法;属于病理分析领域;其技术要点:其包括:包括:成像扫描仪、存储单元、显示单元、处理单元;其中,所述成像扫描仪与存储单元连接;其中,所述成像扫描仪用于对SR染色的大鼠肺部切片进行成像;所述存储单元用于存储成像扫描仪、处理单元传递而来的信息;所述处理单元用于将原始的图像选定视野、确定特征参数、对特征部位进行分析与计算;所述显示单元用于显示各类结果;所述成像扫描仪针对切片进行扫描,将扫描的图像发送到存储单元,成像扫描仪的输出端与存储单元的输入端连接;所述处理单元与所述存储单元双向连接,即信息能够双向流通。
Description
技术领域
本发明涉及医学研究、病理分析等技术领域,更具体地说,尤其涉及一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统及其工作方法。
背景技术
天狼猩红和其衬染液都百是强酸性染料,易与胶原分子中的碱性基团结合,吸附牢靠。偏振光镜检查,胶原纤维有正的单轴双折射光的属性,与天狼度星红染色液结合后问,可增强双折射,提高分辨率,从而区分两型胶原纤维。胶原纤维(Collagen Fiber)是结缔组织中分布最广含量最多的一种纤维,广泛分布于各种脏器答,其中皮肤、巩膜、肌腱最丰富。天狼星红染色液的溶剂为衬染PA饱和溶液,主要用于各种组内织病变时对胶原纤维异常或纤维增生的研究中。因此,纤维占比是判断病变的一个核心指标。
大鼠是试验室中常用的动物模型,例如:南京凯斯艾生物科技有限公司在CN105148254A 公开了一种大鼠单侧肺肺纤维化模型的建立;又如:中国科学院合肥物质科学研究院在 CN104784676A公开了一种大鼠单肺肺纤维化模型的建立方法。
但是,在上述两篇技术文献中,均无法做到对大鼠肺部纤维化的定量分析。
发明内容
本发明的目的在于针对上述现有技术的不足,提供一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统及其工作方法。
一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统,包括:成像扫描仪、存储单元、显示单元、处理单元;
其中,所述成像扫描仪与存储单元连接;
其中,所述成像扫描仪用于对SR染色的大鼠肺部切片进行成像;
所述存储单元用于存储成像扫描仪、处理单元传递而来的信息;
所述处理单元用于将原始的图像选定视野、确定特征参数、对特征部位进行分析与计算;
所述显示单元用于显示各类结果;
所述成像扫描仪针对切片进行扫描,将扫描的图像发送到存储单元,成像扫描仪的输出端与存储单元的输入端连接;
所述处理单元与所述存储单元双向连接,即信息能够双向流通;
进一步,还包括:接口单元,所述接口单元用于读取、写入存储单元的数据,在处理单元工作时,用于写入选择视野以及确定特征参数;
所述接口单元的输出端与所述存储单元的输入端连接,所述显示单元的输入端与所述存储单元的输出端连接;
所述接口单元的输出端与所述处理单元的输入端连接。
进一步,处理单元对成像扫描仪的初始图像进行处理,其包括:视野选择模块、特征参数设置模块、特征分析模块;
其中,视野选择模块,是根据用户的需求来将存储单元传送来的原始图像中选择分析区域;
其中,所述特征参数设置模块是输入肺部纤维特征标志物;
其中,所述特征分析模块,用于对病理特征部位进行分析计算。
进一步,其中,特征参数设置模块在设置时,对于SR染色的切片在进行大鼠肺部纤维分析时,特征采用参数包括:第一参数为,所述第一参数为采用RGB-G模式,色阈值为粉红色;
进一步,还包括第二参数,所述第二参数为:线条粗细在60-180微米之间,使待测目标的阳性表达区域线条与实际染色阳性表达线条粗细相对吻合。
进一步,还包括第三参数,所述第三参数为:区域分析最小面积在0微米2-10微米2;使待测目标的阳性表量与实际染色的阳性表达量相对吻合。
一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的工作方法,其包括如下步骤:
S1,成像,采用成像扫描仪对染色切片进行扫描;
S2,打开特征参数设置模块,通过接口单元输入特征参数;
S3,通过接口单元打开要分析的图像;
S4,选择待分析的区域,打开视野选择模块,通过接口单元选择要分析的区域;
S5,特征分析模块进行分析;
S6,显示结果,显示单元显示:分析区域的肺纤维面积、分析区域的肺纤维区域示图。
本申请的优点在于:
第一,本申请给出了一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统,其包括:成像扫描仪、存储单元、显示单元、处理单元。
第二,本申请一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的工作方法,其包括如下步骤: S1,成像,采用成像扫描仪对染色切片进行扫描;S2,打开特征参数设置模块,通过接口单元输入特征参数;S3,通过接口单元打开要分析的图像;S4,选择待分析的区域,打开视野选择模块,通过接口单元选择要分析的区域;S5,特征分析模块进行分析;S6,显示结果,显示单元显示:分析区域的肺纤维面积、分析区域的肺纤维区域示图。
第三,本申请给出了基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的特征标记:特征采用参数包括:第一参数为,所述第一参数为采用RGB-G模式,色阈值为粉红色;还包括第二参数,所述第二参数为:线条粗细在60-180微米之间,使待测目标的阳性表达区域线条与实际染色阳性表达线条粗细相对吻合;还包括第三参数,所述第三参数为:区域分析最小面积在0微米2-10微米2;使待测目标的阳性表量与实际染色的阳性表达量相对吻合。
附图说明
下面结合附图中的实施例对本发明作进一步的详细说明,但并不构成对本发明的任何限制。
图1是一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的构造图。
图2是RGB-G模式示意图。
图3是区域分析最小面积示意图。
图4是一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的工作方法流程图。
图5是整体展示的示意图。
图6是细节展示的示意图。
具体实施方式
实施例1,一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统,包括:成像扫描仪1、存储单元2、接口单元3、显示单元4、处理单元5;
其中,所述成像扫描仪与存储单元2连接;
其中,所述成像扫描仪用于对SR染色的大鼠肺部切片进行成像;
所述存储单元2用于存储成像扫描仪1、处理单元5传递而来的信息;
所述处理单元5用于将原始的图像选定视野、确定特征参数、对特征部位进行分析与计算;
所述显示单元4用于显示各类结果;
所述成像扫描仪1针对切片进行扫描,将扫描的图像发送到存储单元2,成像扫描仪1 的输出端与存储单元2的输入端连接;
所述处理单元3与所述存储单元2双向连接,即信息能够双向流通;
所述接口单元3的输出端与所述存储单元2的输入端连接,所述显示单元4的输入端与所述存储单元2的输出端连接。
其中,处理单元5对成像扫描仪1的初始图像进行处理,其包括:视野选择模块5-1、特征参数设置模块5-2、特征分析模块5-3;
其中,视野选择模块5-1,是根据用户的需求来将存储单元2传送来的原始图像中选择分析区域;
其中,所述特征参数设置模块5-2是输入肺部纤维特征标志物,即:红色区域表示调整所选部分线条的粗细;
其中,所述特征分析模块5-3,用于对病理特征部位进行分析计算。
一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的工作方法,包括如下步骤:
S1,成像,采用成像扫描仪对染色切片进行扫描;
S2,打开特征参数设置模块5-2,通过接口单元输入特征参数;
S3,通过接口单元打开要分析的图像;
S4,选择待分析的区域,打开视野选择模块5-1,通过接口单元选择要分析的区域;
S5,特征分析模块5-3进行分析;
S6,显示结果,显示单元显示:分析区域的肺纤维面积(即组织内有肺部纤维特征的面积/组织的分析面积)、分析区域的肺纤维区域示图。
其中,特征参数设置模块5-2在设置时,对于SR染色的切片在进行大鼠肺部纤维分析时,特征采用3个参数:
如图2所示,
采用RGB-G模式(拜耳阵列模式)进行分析,色阈值为粉红色,线条粗细在60-180微米之间(使待测目标的阳性表达区域线条与实际染色阳性表达线条粗细相对吻合);
如图3所示,区域分析最小面积在0微米2-10微米2;使待测目标的阳性表量与实际染色的阳性表达量相对吻合。
如图5-6,为实例分析示意图(整体示意选择10个区域进行分析、细节示意)。
纤维化测量区域,数据结果则为该面积的占比。纤维含量占比=纤维面积/分析区域面积。
以上所举实施例为本发明的较佳实施方式,仅用来方便说明本发明,并非对本发明作任何形式上的限制,任何所属技术领域中具有通常知识者,若在不脱离本发明所提技术特征的范围内,利用本发明所揭示技术内容所作出局部更动或修饰的等效实施例,并且未脱离本发明的技术特征内容,均仍属于本发明技术特征的范围内。
Claims (1)
1.一种基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统的工作方法,其特征在于,所述的基于SR染色的大鼠肺部纤维分析系统包括:成像扫描仪、存储单元、显示单元、处理单元;其中,所述成像扫描仪与存储单元连接;其中,所述成像扫描仪用于对SR染色的大鼠肺部切片进行成像;所述存储单元用于存储成像扫描仪、处理单元传递而来的信息;所述处理单元用于将原始的图像选定视野、确定特征参数、对特征部位进行分析与计算;所述显示单元用于显示各类结果;所述成像扫描仪针对切片进行扫描,将扫描的图像发送到存储单元,成像扫描仪的输出端与存储单元的输入端连接;所述处理单元与所述存储单元双向连接,即信息能够双向流通;还包括:接口单元,所述接口单元用于读取、写入存储单元的数据,在处理单元工作时,用于写入选择视野以及确定特征参数;所述接口单元的输出端与所述存储单元的输入端连接,所述显示单元的输入端与所述存储单元的输出端连接;所述接口单元的输出端与所述处理单元的输入端连接;处理单元对成像扫描仪的初始图像进行处理,其包括:视野选择模块、特征参数设置模块、特征分析模块;其中,视野选择模块,是根据用户的需求来将存储单元传送来的原始图像中选择分析区域;其中,所述特征参数设置模块是输入肺部纤维特征标志物;其中,所述特征分析模块,用于对病理特征部位进行分析计算;其中,特征参数设置模块在设置时,对于SR染色的切片在进行大鼠肺部纤维分析时,特征采用参数包括:第一参数、第二参数、第三参数,所述第一参数为采用RGB-G模式,色阈值为粉红色;所述第二参数为:线条粗细在60-180微米之间,使待测目标的阳性表达区域线条与实际染色阳性表达线条粗细相对吻合,所述第三参数为:区域分析最小面积在0微米2-10微米2;使待测目标的阳性表量与实际染色的阳性表达量相对吻合;
其包括如下步骤:
S1,成像,采用成像扫描仪对染色切片进行扫描;
S2,打开特征参数设置模块,通过接口单元输入特征参数;
S3,通过接口单元打开要分析的图像;
S4,选择待分析的区域,打开视野选择模块,通过接口单元选择要分析的区域;
S5,特征分析模块进行分析;
S6,显示结果,显示单元显示:分析区域的肺纤维面积、分析区域的肺纤维区域示图。
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