CN112446860A - 一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,通过光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿进行标记,使用训练好的深度残差神经人工智能模型提取患者的眼部特征并根据眼部特征进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,随后使用眼底彩照数据集训练通过迁移学习技术对深度残差神经人工智能模型极性调整,得到最终基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。通过基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的对光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿的患者进行识别分类,可提高糖尿病黄斑水肿高危人群筛查的准确率和工作效率,也减少病人诊治疾病的花费,从而使更多的病人得到及时的诊疗。
Description
技术领域
本发明涉及人工智能医疗应用的技术领域,具体涉及一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法。
背景技术
糖尿病性黄斑水肿是指由糖尿病引起的黄斑区血一视网膜屏障功能的破坏,导致黄斑区细胞外液积聚所致的视网膜增厚或硬性渗出沉积。病损首先涉及视网膜毛细血管内皮细胞,即血一视网膜内屏障,严重者损伤外屏障,即色素上皮损伤,导致水肿不易消除。是糖尿病视网膜病变患者视力下降的主要原因之一。发病率和糖尿病病程呈正相关,其4年的发病率为5.4% ,临床有意义的黄斑水肿的发病率为7.2%。
糖尿病性黄斑水肿起病隐匿,不易被觉察。由于视神经的损害不能逆转,等到病人发现不适去医院就诊时,通常视力已经严重受损,因此早期诊断对这类疾病的治疗而言非常重要。眼科光学相干断层扫描影像可应用于眼病诊断与治疗等各方面,但是其检查设备动辄百万以上,在很多边远地区或机构的运用受限,因此,迫切需要高效便捷的检查方法尽早筛查这类病例。
发明内容
本发明的目的是提供一种能够通过眼底彩照来进行糖尿病黄斑水肿高危人群筛查的基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法。
本发明提供了一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,包括自动筛查方法如下步骤:
S1:获取光学相干断层的扫描影像及眼底彩照;
S2:对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集;
S3:基于光学相干断层扫描影像,构建深度残差网络初始模型;
S4:光学相关断层扫描训练集对深度残差网络初始模型进行训练,获取深度残差神经人工智能模型;
S5:利用深度残差神经人工智能模型对光学相干断层的扫描影像进行整体特征的识别和提取,获取待识别患者的眼部特征;
S6:利用深度残差神经人工智能模型对待识别的眼底特征进行验证和识别并根据识别结果对光学相干断层扫描影像进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,获得有无糖尿病黄斑水肿的光学相干断层扫描影像分类结果;
S7:使用眼底彩照训练集通过迁移学习对深度残差神经人工智能模型的全连接层调整,获取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。
进一步的,所述S2中具体为:
对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记并对标记后的光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行预处理,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
进一步的,所述预处理包括:
将光学相干断层扫描影像和眼底彩照降采样至256*256分辨率,和局部空间色彩平均,图像增强,平移1-3个像素、旋转90°、180°或者270°并进行扩增以及对光学相干断层扫描影像和眼底彩照图像进行归一化处理,使输入数据归一化为0到1之间,从而得到光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
进一步的,所述S7之后还包括S8:
获取新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像;
对新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,构成外部验证集;
根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行验证;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果一致时,则确定所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型准确;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果不一致时,则根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行修正。
进一步的,所述S3中的深度卷积神经网络算法包括:
所述的残差网络包括一个由6个卷积层、2个激活函数层、2个BN层以及1个跳跃连接层组成的基本的残差模块连接1个激活函数层。
进一步的,所述S4具体包括:
将所述光学相关断层扫描数据集分为训练集与内部验证集,将训练集数据输入深度残差网络初始模型,将内部验证集表现最好的深度残差神经人工智能模型作为训练结果保存。
进一步的,所述S1具体为:
通过数据库获取预设的训练样本并根据训练样本,获取的光学相干断层的扫描影像及眼底彩照。
进一步的,所述训练样本的数值为9000,糖尿病黄斑水肿与正常眼底彩照比例为1:2;
所述数据库为医院门诊的接访数据库。
进一步的,所述外部验证集的数值为3000。
本发明的有益效果:
本发明的实施例提供一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,通过光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿进行标记,使用训练好的深度残差神经人工智能模型提取患者的眼部特征并根据眼部特征进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,随后使用眼底彩照数据集训练通过迁移学习技术对深度残差神经人工智能模型极性调整,得到最终基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。通过基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的对光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿的患者进行识别分类,可提高糖尿病黄斑水肿高危人群筛查的准确率和工作效率,也减少病人诊治疾病的花费,从而使更多的病人得到及时的诊疗。
附图说明
利用附图对本发明作进一步说明,但附图中的实施例不构成对本发明的任何限制,对于本领域的普通技术人员,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据以下附图获得其它的附图。
图1为本发明的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法的结构框图。
具体实施方式
结合以下实施例对本发明作进一步描述。
如图1所示,结合以下实施例对本发明作进一步描述。
实施例一:
本实施例的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,包括自动筛查方法如下步骤:
S1:获取光学相干断层的扫描影像及眼底彩照;
通过光学相干断层扫描仪获取光学相干断层的扫描影像生成患者的取光学相干断层的扫描影像的数据库,在数据库内获取光学相干断层的扫描影像;通过眼底照相机获取眼底彩照生成眼底彩照的数据库。
S2:对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集;
即将光学相干断层扫描影像中能够诊断出患有糖尿病黄斑水肿患者的光学相干断层扫描影像和没有患有糖尿病黄斑水肿患者的光学相干断层扫描影像分开进行标记,标记完了形成光学相干断层扫描训练集;同样的将眼底彩照中能够诊断出患有糖尿病黄斑水肿患者的眼底彩照和没有患有糖尿病黄斑水肿患者的眼底彩照分开进行标记,标记完了形成眼底彩照训练集。
其中,所述S2中具体为:
对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记并对标记后的光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行预处理,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
所述预处理包括:
将光学相干断层扫描影像和眼底彩照降采样至256*256分辨率,和局部空间色彩平均,图像增强,平移1-3个像素、旋转90°、180°或者270°并进行扩增以及对光学相干断层扫描影像和眼底彩照图像进行归一化处理,使输入数据归一化为0到1之间,从而得到光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
其中,还能够将光学相干断层扫描影像和眼底彩照转化为矩阵的形式;
将训练集进行增广,在其最后再增加一列。
S3:基于光学相干断层扫描影像,构建深度残差网络初始模型;
其中,所述S3中的深度卷积神经网络算法包括:
所述的残差网络包括一个由6个卷积层、2个激活函数层、2个BN层以及1个跳跃连接层组成的基本的残差模块连接1个激活函数层。
S4:光学相关断层扫描训练集对深度残差网络初始模型进行训练,获取深度残差神经人工智能模型;
构建具有升维功能的残差模块,一个具有由4个卷积层、3个激活函数层、3个BN层以及1个跳跃连接层组成,最后再连接1个激活函数层。
构建网络前段,从而使用串联的残差模块对眼底彩照进行特征提取。
构建网络后端,连接2个全连接层,2个激活函数和1个dropout层形成到网络输出。
上述S4中的深度残差网络初始模型通过残差块和输入数据增量,不断调整残差网络的参数,直至深度残差网络初始模型达到预期的深度残差神经人工智能模型。
所述S4具体包括:
将所述光学相关断层扫描数据集分为训练集与内部验证集,将训练集数据输入深度残差网络初始模型,将内部验证集表现最好的深度残差神经人工智能模型作为训练结果保存。
S5:利用深度残差神经人工智能模型对光学相干断层的扫描影像进行整体特征的识别和提取,获取待识别患者的眼部特征;
S6:利用深度残差神经人工智能模型对待识别的眼底特征进行验证和识别并根据识别结果对光学相干断层扫描影像进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,获得有无糖尿病黄斑水肿的光学相干断层扫描影像分类结果;
通过有无糖尿病黄斑水肿的光学相干断层扫描影像分类结果对深度残差神经人工智能模型进行进一步的调整。
S7:使用眼底彩照训练集通过迁移学习对深度残差神经人工智能模型的全连接层调整,获取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。
本发明的实施例提供一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,通过光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿进行标记,使用训练好的深度残差神经人工智能模型提取患者的眼部特征并根据眼部特征进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,随后使用眼底彩照数据集训练通过迁移学习技术对深度残差神经人工智能模型极性调整,得到最终基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。通过基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的对光学相干断层扫描图像以及眼底彩照对是否患有糖尿病黄斑水肿的患者进行识别分类,可提高糖尿病黄斑水肿高危人群筛查的准确率和工作效率,也减少病人诊治疾病的花费,从而使更多的病人得到及时的诊疗。
本发明通过迁移学习和残差网络技术,客观性提取、分析患者眼底特征来对眼底彩照来进行糖尿病黄斑水肿高危人群筛查,利用迁移学习的优良的泛化特性,残差网络强大的非线性表达能力和解决解决梯度消失的能力等优势,提高了糖尿病黄斑水肿高危人群筛查的准确性,具有较高的应用价值。
其中,所述S7之后还包括S8:
获取新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像;
对新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,构成外部验证集;
根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行验证;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果一致时,则确定所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型准确;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果不一致时,则根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行修正。
基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型通过大样本进行内部数据库及外部验证,证实其在不同人群中均具有较高的准确性。
其中,所述训练样本的数值为9000,糖尿病黄斑水肿与正常眼底彩照比例为1:2;
所述数据库为医院门诊的接访数据库。
所述数据库内的多个患者的图像数据为每次试验前从数据库中随机抽取1/3,使用 5倍交叉验证,并重复测试10次,以10次测试的平均值作为最终的智能预测模型准确率。通过反复的验证提升所述智能预测模型的准确率。
获取医院门诊的接访数据库系统内的患者眼底彩照和光学相干断层扫描影像,构成外部验证集,将糖尿病黄斑水肿的自动分级模型应用于外部验证集,通过外部验证修正所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。通外部验证修正所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型,进一步的提升了基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的预测结果的准确性。所述外部验证集的数值范围是3000名。
纳入3000名临床诊断为糖尿病黄斑水肿的患者,以及6000名确定无糖尿病黄斑水肿的对照者,收集其眼底彩照与光学相干断层扫描影像。
将眼底彩照与光学相干断层扫描影像,基于患者有无糖尿病黄斑水肿进行标记及图像预处理。
将数据按2:1比例分为训练集与内部验证集,进一步的,将深度残差网络初始模型在内部验证集中进行验证及进一步优化,保存内部验证集准确性最好的模型作为初步的深度残差神经人工智能模型。使用眼底彩照训练集,进行迁移学习,调整迁移学习初始模型的全连接层,达到最终的取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。进一步的,利用医院数据库调取3000名患者眼底及全身数据,构成外部验证集,对优化后的糖尿病黄斑水肿的取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型再次进行验证,外部验证集表现最好的模型确定为最终的取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。
最终,在应用于筛查工作时,通过眼底彩照获取受检者的眼底彩照,将眼底彩照输入最终确定的取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型内,即可获得患者有无糖尿病黄斑水肿的预测结果。
本发明实施例的计算机可读存储介质与上述实施例一的方法属于同一构思,其具体实现过程详细见对应的方法实施例,且方法实施例中的技术特征在本计算机可读存储介质实施例中均对应适用,这里不再赘述。
以上对本发明一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法进行了详细介绍,本文中应用了具体个例对本发明的原理及实施方式进行了阐述。以上实施例的说明只是用于帮助理解本发明的核心思想;同时,对于本领域的一般技术人员,依据本发明的思想,在具体实施方式及应用 范围上均会有改变之处,综上所述,本说明书内容不应理解为对本发明的限制。
Claims (9)
1.一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于:包括自动筛查方法如下步骤:
S1:获取光学相干断层的扫描影像及眼底彩照;
S2:对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集;
S3:基于光学相干断层扫描影像,构建深度残差网络初始模型;
S4:光学相关断层扫描训练集对深度残差网络初始模型进行训练,获取深度残差神经人工智能模型;
S5:利用深度残差神经人工智能模型对光学相干断层的扫描影像进行整体特征的识别和提取,获取待识别患者的眼部特征;
S6:利用深度残差神经人工智能模型对待识别的眼底特征进行验证和识别并根据识别结果对光学相干断层扫描影像进行有无糖尿病黄斑水肿的分类,获得有无糖尿病黄斑水肿的光学相干断层扫描影像分类结果;
S7:使用眼底彩照训练集通过迁移学习对深度残差神经人工智能模型的全连接层调整,获取基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型。
2.如权利要求1所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述S2中具体为:
对光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记并对标记后的光学相干断层扫描影像和眼底彩照进行预处理,获取光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
3.如权利要求2所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述预处理包括:
将光学相干断层扫描影像和眼底彩照降采样至256*256分辨率,和局部空间色彩平均,图像增强,平移1-3个像素、旋转90°、180°或者270°并进行扩增以及对光学相干断层扫描影像和眼底彩照图像进行归一化处理,使输入数据归一化为0到1之间,从而得到光学相干断层扫描训练集和眼底彩照训练集。
4.如权利要求3所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述S7之后还包括S8:
获取新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像;
对新收集糖尿病患者的眼底彩照和光学相干断层扫描图像进行是否患有糖尿病黄斑水肿的标记,构成外部验证集;
根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行验证;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果一致时,则确定所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型准确;
当外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型的结果不一致时,则根据外部验证集对所述基于眼底彩照的糖尿病黄斑水肿的智能筛查模型进行修正。
5.如权利要求4所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述S3中的深度卷积神经网络算法包括:
所述的残差网络包括一个由6个卷积层、2个激活函数层、2个BN层以及1个跳跃连接层组成的基本的残差模块连接1个激活函数层。
6.如权利要求5所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述S4具体包括:
将所述光学相关断层扫描数据集分为训练集与内部验证集,将训练集数据输入深度残差网络初始模型,将内部验证集表现最好的深度残差神经人工智能模型作为训练结果保存。
7.如权利要求6所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述S1具体为:
通过数据库获取预设的训练样本并根据训练样本,获取的光学相干断层的扫描影像及眼底彩照。
8.如权利要求7所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,
所述训练样本的数值为9000,糖尿病黄斑水肿与正常眼底彩照比例为1:2;
所述数据库为医院门诊的接访数据库。
9.如权利要求8所述的一种基于迁移学习的糖尿病黄斑水肿自动筛查方法,其特征在于,所述外部验证集的数值为3000。
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