CN112330561A - 基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,包括以下步骤:对原图像进行标准化处理;利用形态学开运算消除图像中存在的白点噪声及边缘;将图像前景所在的大致位置使用矩形框标注出来,将图像中背景区域剔除;利用高斯混合模型对图像确定性前景与背景进行建模,创建新的像素分布,生成完整图像;利用图像信息熵找到完整图像分割的阈值,并转为二值化图像;通过分水岭算法对二值化图像进行图像提取,得到所需图像。本发明通过交互式前景提取法滤除图像边缘,结合信息熵与分水岭算法,能够将图像进行有效的分割,获得的肝脏CT图像完整,克服了因像素值分布不均、前景子图相互连接与个体间肝脏器官形状各异带来的干扰。
Description
技术领域
本发明涉及图像处理领域,特别涉及一种基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法。
背景技术
随着医学成像技术、图像模式识别技术的发展,图像分割在医学处理与分析领域起着先导性作用,图像分割主要目的是将医学图像中具有特定意义的部分分割出来,为临床诊断与病理研究提供可靠依据,有效降低了医生机械化的阅片负担,做出更准确的诊断。由于医学图像自身具有复杂性,在分割过程中需要解决个体差异以及像素值分布不均等一系列问题。目前尚未存在一种具有广泛性的医学图像分割理论与方法。
目前国内外广泛运用的医学图像分割方法有很多种,比如基于区域生长的分割方法。区域生长法是将具有相似性质的像素集合起来构成区域,其具体思路为:首先对目标分割的区域中选取一个种子像素作为生长的起点,然后将种子像素周围领域中具有相似性质的像素合并到种子像素所在的区域中,直到没有可以用来合并的邻近点或区域为止。文献“基于形态学和区域生长法的医学图像分割”提出了基于形态学和区域生长法的医学图像分割,其为了提高分割质量,利用数学形态学的基本运算对生长结果进行修正,填充区域生长后的小孔洞噪声,提高了分割效果。文献“基于区域生长的OCT图像分割算法研究”提出了基于区域生长的OCT图像分割算法的研究,其通过对医学OCT图像性质的分析,提出了一种基于区域生长的改进算法,此算法可以实现此类医用OCT图像的快速自动分割,大幅度提高了图像分割的精度,使过分分割现象大幅度降低,提高了分割效率。
通常在腹部CT图像中,像素值普遍集中在较低的范围内,腹部器官之间缺乏对比度,同时由于器官病变以及个体之间器官形状大小的差异,使得传统的利用灰度信息值寻找图像边缘的分割方法难以取得较好的分割效果,其处理存在分割不完整或噪声较多的影响。
发明内容
为了解决上述技术问题,本发明提供一种算法简单、分割速度快、分割精度高的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法。
本发明解决上述问题的技术方案是:一种基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,包括以下步骤:
步骤一:对原图像进行标准化处理;
步骤二:利用形态学开运算消除标准化处理后的图像中存在的白点噪声及边缘;
步骤三:将图像前景所在的大致位置使用矩形框标注出来,矩形框以外的区域认定为确定性背景,其他区域为确定性前景,将图像中背景区域剔除;
步骤四:利用高斯混合模型对图像确定性前景与背景进行建模,创建新的像素分布,根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像;
步骤五:利用图像信息熵找到完整图像分割的阈值,并转为二值化图像;
步骤六:通过分水岭算法对二值化图像进行图像提取,得到最终所需图像。
上述基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,所述步骤一中,首先判断原图像是否符合标准尺寸,若不符合,则将原图像标准化,然后阈值处理转换为二值化图像。
上述基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,所述步骤四中,利用高斯混合模型对确定性前景与背景建模,高斯混合模型根据预设的位置创建新的像素分布,根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像,图像中的每一个节点就是像素点,所有的背景像素都与背景节点相连,所有的前景像素都与前景节点相连;每个像素归类到背景节点还是前景节点的权重由该像素是背景还是前景的概率所决定,在背景与前景之间连接处,两个像素的边的权重是由背景与前景之间相似度所决定的,背景与前景之间像素颜色越接近,边的权重就越大;根据各自边的权重关系进行分割,将不同像素点划分为前景节点与背景节点;不断重复上述过程,直至分类收敛为止。
上述基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,所述步骤五中,采用图像最大信息熵分割步骤四所得完整图像;具体过程为:
5-1)在图像中,设某一灰度值x出现的概率为p(x),则信息熵H的求解公式如(1)所示:
5-2)在灰度图像中,如果设定某一阈值为T,那么灰度值在0-T的范围内看作是背景B,灰度值在T+1至T+255看作是前景F;计算每一个灰度值在背景与前景中所占的概率,计算公式分别如(2)(3)所示:
其中,pi表示灰度值为i的概率,PB表示每个灰度级在背景B中所占概率,PF表示每个灰度级在前景F中所占概率,pT表示阈值T在整个图像中的概率;
5-3)计算背景信息熵HB与前景信息熵HF,计算公式分别如(4)(5)所示。
遍历穷举阈值取值为0-255,求得使图像有最大信息熵时的最大的阈值T,该阈值就是对灰度图像分割的最佳阈值点。
上述基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,所述步骤六中,对一副灰度图像,把它看作是三维地理图上的地形,灰度值较低的区域看作是山谷,灰度值较高的区域看作是山峰,分水岭算法实现过程就是将图像分成两个不同的集合:分水岭线与积水盆地;分水岭算法具体过程为:
6-1)首先对图像进行形态学开运算,消除图像内噪声;
6-2)由于图像内子图是连接在一起的,采用距离变换法将确定性前景提取出来;
6-3)接着对距离变换得到的图像阈值处理,获取实际图像的确定性前景;
6-4)在获取确定性前景图像之后,获取确定性背景,对于开运算后的图像进行形态学膨胀处理,所得膨胀图像的背景就是原图像的确定性背景,膨胀图像减去确定性前景图像所获得的就是未知区域;
6-5)按照确定性背景、确定性前景与未知区域三大类划分整个图像空间,将确定性背景用“1”表示,将确定性前景用正整数从“2”开始依次表示,未知区域则采用“0”表示,对每一类采用不同颜色标注;
6-6)利用分水岭算法实现对图像的分割,划分出不同类别的区域。
上述基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,所述步骤6-2)中,采用距离变换法计算的是图像中非零值像素点到最近的零值像素点的距离,即计算二值图像中所有像素点距离其最近的值为0的像素点距离。
本发明的有益效果在于:本发明通过交互式前景提取法滤除图像边缘,结合信息熵与分水岭算法,能够将图像进行有效的分割,获得的肝脏CT图像完整且无较多的杂质干扰,克服了因像素值分布不均、前景子图相互连接与个体间肝脏器官形状各异带来的干扰。
附图说明
图1为本发明的流程图。
图2为本发明实施例中阈值处理与形态学操作转换图。
图3为本发明实施例中滤除确定性背景的过程图。
图4为为本发明实施例中提取完整的腹部器官图像的过程图。
图5为本发明实施例中图像信息熵处理的效果图。
图6为为本发明实施例中确定性前景的提取效果图。
图7为本发明实施例中确定性背景与未知区域的示意图。
图8为为本发明实施例中划分图像空间的效果图。
图9为本发明实施例中用分水岭算法实现分割的效果图。
图10-图13为本发明实施例中对4幅不同图像进行分割操作所得的结果图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明做进一步的说明。
如图1所示,一种基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,包括以下步骤:
步骤一:对原图像进行标准化处理。
首先判断原图像是否符合标准尺寸,若不符合,则将原图像标准化,然后阈值处理转换为二值化图像。
步骤二:对所得二值化图像利用形态学开运算消除图像中存在的白点噪声及细小边缘,实现边缘的初步消除。其转换结果如图2所示。
步骤三:腹部CT图像经过阈值处理与形态学操作之后,可以将图像前景所在的大致位置使用矩形框标注出来,矩形框以外的区域认定为确定性背景,其他区域为确定性前景,以此初步将图像中背景区域剔除,为后续分割任务提供良好的模板。其操作过程如图3所示。
步骤四:利用高斯混合模型对图像确定性前景与背景进行建模,创建新的像素分布,根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像。
由于在步骤一已对待处理图像进行尺寸标准化处理,可在很大程度上消除个体间的差异。因此算法可以预设图像确定性前景和确定性背景的大致位置。利用高斯混合模型对确定性前景与背景建模,高斯混合模型根据预设的位置创建新的像素分布,对未分类的像素(可能是背景或前景)根据其与预设分类像素(前景与背景)的关系依次归类。根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像,图像中的每一个节点就是像素点,所有的背景像素都与背景节点相连,所有的前景像素都与前景节点相连;每个像素归类到背景节点还是前景节点的权重由该像素是背景还是前景的概率所决定,在背景与前景之间连接处,两个像素的边的权重是由背景与前景之间相似度所决定的,背景与前景之间像素颜色越接近,边的权重就越大;根据各自边的权重关系进行分割,将不同像素点划分为前景节点与背景节点;不断重复上述过程,直至分类收敛为止。提取完整的腹部器官图像如图4所示。
步骤五:利用图像信息熵找到完整图像分割的阈值,并转为二值化图像。
阈值分割基于灰度阈值的选取将灰度图像划分为一个或者几个区域,实现对图像的分割。阈值分割方法的关键是阈值选取算法,常用的算法有最大类间方差(OTSU法)和信息熵。为提高肝脏器官的分割精度,采用图像最大信息熵分割步骤四所得完整图像;具体过程为:
5-1)在图像中,设某一灰度值x出现的概率为p(x),则信息熵H的求解公式如(1)所示:
5-2)在灰度图像中,如果设定某一阈值为T,那么灰度值在0-T的范围内看作是背景B,灰度值在T+1至T+255看作是前景F;计算每一个灰度值在背景与前景中所占的概率,计算公式分别如(2)(3)所示:
其中,pi表示灰度值为i的概率,PB表示每个灰度级在背景B中所占概率,PF表示每个灰度级在前景F中所占概率,pT表示阈值T在整个图像中的概率;
5-3)计算背景信息熵HB与前景信息熵HF,计算公式分别如(4)(5)所示。
遍历穷举阈值取值为0-255,求得使图像有最大信息熵时的最大的阈值T,该阈值就是对灰度图像分割的最佳阈值点。实现效果如图5所示。利用信息熵实现阈值分割时,可采用最大类间方差(OTSU法)找到最佳阈值。
步骤六:通过分水岭算法对二值化图像进行图像提取,得到最终所需图像。
对一副灰度图像,把它看作是三维地理图上的地形,灰度值较低的区域看作是山谷,灰度值较高的区域看作是山峰,分水岭算法实现过程就是将图像分成两个不同的集合:分水岭线与积水盆地;分水岭算法具体过程为:
6-1)首先对图像进行形态学开运算,能够消除图像内噪声,以此避免噪声对图像分割可能造成的影响。
6-2)由于通常情况下图像内子图是连接在一起的,所以需要借助距离变换法将确定性前景提取出来。一般情况下,借助距离变换法计算的是图像中非零值像素点到最近的零值像素点的距离,即计算二值图像中所有像素点距离其最近的值为0的像素点距离。这一过程不仅能够实现初步获取图像确定性前景,还能计算前景对象的中心、细化轮廓等。
6-3)接着对距离变换得到的图像阈值处理,获取实际图像的确定性前景,如图6所示。
6-4)在获取确定性前景图像之后,需要获取确定性背景,对于开运算后的图像进行形态学膨胀处理,所得膨胀图像的背景就是原图像的确定性背景,膨胀图像减去确定性前景图像所获得的就是未知区域;效果如图7所示。
6-5)按照确定性背景、确定性前景与未知区域三大类划分整个图像空间,将确定性背景用“1”表示,将确定性前景用正整数从“2”开始依次表示,未知区域则采用“0”表示,对每一类采用灰色、黑色、白色标注,效果如图8所示。
6-6)利用分水岭算法实现对图像的分割,划分出不同类别的区域。由于个体间肝脏所处位置大致相同,因此可根据大致位置筛选出肝脏图像。其实现效果如图9所示。
利用本发明的算法对4幅不同图像进行肝脏图像分割操作,所得结果分别如图10、图11、图12和图13所示。从图像分割结果可以看出,通过交互式前景提取法滤除图像边缘,结合信息熵与分水岭算法,能够将图像进行有效的分割。获得的肝脏CT图像完整且无较多的杂质干扰,克服了因像素值分布不均、前景子图相互连接与个体间肝脏器官形状各异带来的干扰。在对大量医学腹部CT图像进行分割,均取得了良好的图像分割效果。
Claims (6)
1.一种基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一:对原图像进行标准化处理;
步骤二:利用形态学开运算消除标准化处理后的图像中存在的白点噪声及边缘;
步骤三:将图像前景所在的大致位置使用矩形框标注出来,矩形框以外的区域认定为确定性背景,其他区域为确定性前景,将图像中背景区域剔除;
步骤四:利用高斯混合模型对图像确定性前景与背景进行建模,创建新的像素分布,根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像;
步骤五:利用图像信息熵找到完整图像分割的阈值,并转为二值化图像;
步骤六:通过分水岭算法对二值化图像进行图像提取,得到最终所需图像。
2.根据权利要求1所述的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤一中,首先判断原图像是否符合标准尺寸,若不符合,则将原图像标准化,然后阈值处理转换为二值化图像。
3.根据权利要求1所述的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤四中,利用高斯混合模型对确定性前景与背景建模,高斯混合模型根据预设的位置创建新的像素分布,根据得到的像素分布情况生成一幅完整的图像,图像中的每一个节点就是像素点,所有的背景像素都与背景节点相连,所有的前景像素都与前景节点相连;每个像素归类到背景节点还是前景节点的权重由该像素是背景还是前景的概率所决定,在背景与前景之间连接处,两个像素的边的权重是由背景与前景之间相似度所决定的,背景与前景之间像素颜色越接近,边的权重就越大;根据各自边的权重关系进行分割,将不同像素点划分为前景节点与背景节点;不断重复上述过程,直至分类收敛为止。
4.根据权利要求3所述的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤五中,采用图像最大信息熵分割步骤四所得完整图像;具体过程为:
5-1)在图像中,设某一灰度值x出现的概率为p(x),则信息熵H的求解公式如(1)所示:
5-2)在灰度图像中,如果设定某一阈值为T,那么灰度值在0-T的范围内看作是背景B,灰度值在T+1至T+255看作是前景F;计算每一个灰度值在背景与前景中所占的概率,计算公式分别如(2)(3)所示:
其中,pi表示灰度值为i的概率,PB表示每个灰度级在背景B中所占概率,PF表示每个灰度级在前景F中所占概率,pT表示阈值T在整个图像中的概率;
5-3)计算背景信息熵HB与前景信息熵HF,计算公式分别如(4)(5)所示。
遍历穷举阈值取值为0-255,求得使图像有最大信息熵时的最大的阈值T,该阈值就是对灰度图像分割的最佳阈值点。
5.根据权利要求4所述的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤六中,对一副灰度图像,把它看作是三维地理图上的地形,灰度值较低的区域看作是山谷,灰度值较高的区域看作是山峰,分水岭算法实现过程就是将图像分成两个不同的集合:分水岭线与积水盆地;分水岭算法具体过程为:
6-1)首先对图像进行形态学开运算,消除图像内噪声;
6-2)由于图像内子图是连接在一起的,采用距离变换法将确定性前景提取出来;
6-3)接着对距离变换得到的图像阈值处理,获取实际图像的确定性前景;
6-4)在获取确定性前景图像之后,获取确定性背景,对于开运算后的图像进行形态学膨胀处理,所得膨胀图像的背景就是原图像的确定性背景,膨胀图像减去确定性前景图像所获得的就是未知区域;
6-5)按照确定性背景、确定性前景与未知区域三大类划分整个图像空间,将确定性背景用“1”表示,将确定性前景用正整数从“2”开始依次表示,未知区域则采用“0”表示,对每一类采用不同颜色标注;
6-6)利用分水岭算法实现对图像的分割,划分出不同类别的区域。
6.根据权利要求5所述的基于交互式前景提取与信息熵分水岭的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤6-2)中,采用距离变换法计算的是图像中非零值像素点到最近的零值像素点的距离,即计算二值图像中所有像素点距离其最近的值为0的像素点距离。
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- 2020-11-05 CN CN202011226634.0A patent/CN112330561B/zh active Active
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