CN112131867A - 临床试验医学编码系统 - Google Patents

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CN112131867A CN202011004404.XA CN202011004404A CN112131867A CN 112131867 A CN112131867 A CN 112131867A CN 202011004404 A CN202011004404 A CN 202011004404A CN 112131867 A CN112131867 A CN 112131867A
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Abstract

本发明公开了一种临床试验医学编码系统，其包括：源文件上传模块，用于上传临床试验研究的源文件，并在上传时指定待编码词语的所在列；医学编码模块，用于基于针对临床试验研究所对应的域，将待编码词语和与对应的标准词典进行匹配，以得到编码结果；编码结果导出模块，用于将编码结果和源文件中的待编码词语进行匹配，并作为完整结果导出。本发明通过源文件上传模块、医学编码模块和编码结果导出模块，实现了闭环的医学编码，有效提高医学编码的工作效率；而且基于针对临床试验研究所对应的域得到编码结果，可以把研究按照组进行分类，使用同一个域的研究共享一套编码结果，无需在研究之间进行拷贝，减小医学编码的工作量，极大地提高工作效率。

Description

临床试验医学编码系统
技术领域
本发明涉及生物医药技术领域，尤其涉及一种临床试验医学编码系统。
背景技术
医学编码是将临床试验过程中出现的各种医学事件、手术操作以及合并用药，用标准的医学词典将这些事件、操作以及药物用标准化的语言所展现出来，类似于一个翻译的过程。医学编码中使用的国际公认的标准化词典主要有MedDRA(Medical Dictionaryfor Regulatory Activities，国际医学用语词典)和WHODrug(World HealthOrganization Drug Dictiionaries，世界卫生组织药物词典)。
医学编码过程可以通过人工编码及工具编码的方式进行编码，传统人工编码的方式效率较低，且编码过程容易反复，很容易出现前后不一致的情况。目前通过工具编码的方式较为流行，然而通过编码工具进行编码的编码系统在编码效率上存在缺陷，不能完全满足用户的需求。
因此，为了提高医学编码的效率，亟需一种临床试验医学编码系统。
发明内容
本发明的目的是提供一种临床试验医学编码系统，以解决上述现有技术中的问题，能有效提高医学编码的效率。
本发明提供了一种临床试验医学编码系统，其中，包括：
源文件上传模块，用于上传临床试验研究的源文件，并在上传时指定待编码词语的所在列；
医学编码模块，用于基于针对所述临床试验研究所对应的域，将所述待编码词语和与所述临床试验研究对应的标准词典进行匹配，以得到编码结果；
编码结果导出模块，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果和所述源文件作为完整结果导出。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述源文件上传模块包括：
待编码词语确定单元，用于在所述源文件中选择工作簿，并在所选择的所述工作簿中选择需要编码的词语所在列，根据所选择的需要编码的词语所在列确定对应列的词语，并将确定的所述对应列的词语中非重复的词语加入待编码词语列表中；
源文件导入单元，用于导入所述待编码词语列表中的待编码词语。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述医学编码模块包括：
第一自动编码单元，用于在所述源文件上传模块上传所述源文件时，将所述待编码词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语进行自动匹配，以得到第一自动编码结果；
第二自动编码单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的待编码词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行自动匹配，以得到第二自动编码结果；
手动编码单元，用于将未能与所述标准词典进行自动匹配的待编码词语进行手动编码，以得到手动编码结果。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述编码结果导出模块包括：
编码结果整合单元，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果附加到所述源文件后面，以将所述编码结果和所述源文件进行整合；
编码结果语言切换单元，用于将所述整合了所述编码结果和所述源文件的完整结果切换成目标语言；
编码结果导出单元，用于将所述完整结果以所述目标语言导出。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述临床试验医学编码系统还包括词典升级模块，用于将所述临床试验研究和所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果进行升级。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述词典升级模块包括：
新版标准词典上传单元，用于将新版本标准词典进行上传；
域条目升级单元，用于将所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果在原版本标准词典的原编码路径与在新版本标准词典的新编码路径进行匹配，若所述原编码路径在所述新编码路径中存在，则编码结果路径匹配成功，并生成对应新版标准词典的域条目升级结果；
研究条目升级单元，用于根据所述域条目升级结果和所述新版本标准词典，将所述临床试验研究内的词语的编码结果进行升级。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述研究条目升级单元包括：
第一研究条目自动升级子单元，用于将所述临床试验研究内的词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码路径进行自动匹配，以得到第一研究条目自动升级结果；
第二研究条目自动升级子单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行编码路径的自动匹配，以得到第二研究条目自动升级结果；
研究条目手动升级子单元，用于将所述临床试验研究中未能与所述标准词典进行自动匹配的词语进行编码路径的手动匹配，以得到研究条目手动升级结果。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述临床试验医学编码系统还包括域管理模块，用于对所述临床试验研究所对应的域进行管理。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述临床试验医学编码系统还包括词典版本管理模块，用于对所述标准词典的版本进行管理。
如上所述的临床试验医学编码系统，其中，优选的是，所述临床试验医学编码系统还包括研究设置模块，用于对所述临床试验研究的研究参数进行设置。
本发明提供一种临床试验医学编码系统，通过源文件上传模块、医学编码模块和编码结果导出模块，实现了闭环的医学编码，有效提高了医学编码的工作效率；而且医学编码模块基于针对临床试验研究所对应的域得到编码结果，可以把临床试验研究按照组进行分类，使用同一个域的研究共享一套编码结果，无需在研究之间进行拷贝，减小了医学编码的工作量，降低人工参与的环节，极大地提高了医学编码的工作效率。
进一步地，与常规的编码结果导出后需要在外部和源文件进行匹配合并相比，本发明的编码结果导出模块以源文件为基础，可以一键导出合并后的结果；与常规的只能导出编码时所用的标准词典所对应的语言，需要另外一种语言的编码结果时需要在外部再做处理相比，本发明以源文件为基础，可以一键导出中/英文的编码结果。
进一步地，词典升级模块通过域条目升级单元和研究条目升级单元，极大地提高了词典升级的方便性，进一步提高了医学编码的工作效率。
附图说明
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合附图对本发明作进一步描述，其中：
图1为本发明提供的临床试验医学编码系统的实施例的结构框图。
具体实施方式
现在将参照附图来详细描述本公开的各种示例性实施例。对示例性实施例的描述仅仅是说明性的，决不作为对本公开及其应用或使用的任何限制。本公开可以以许多不同的形式实现，不限于这里所述的实施例。提供这些实施例是为了使本公开透彻且完整，并且向本领域技术人员充分表达本公开的范围。应注意到：除非另外具体说明，否则在这些实施例中阐述的部件和步骤的相对布置、材料的组分、数字表达式和数值应被解释为仅仅是示例性的，而不是作为限制。
本公开中使用的“第一”、“第二”：以及类似的词语并不表示任何顺序、数量或者重要性，而只是用来区分不同的部分。“包括”或者“包含”等类似的词语意指在该词前的要素涵盖在该词后列举的要素，并不排除也涵盖其他要素的可能。“上”、“下”等仅用于表示相对位置关系，当被描述对象的绝对位置改变后，则该相对位置关系也可能相应地改变。
在本公开中，当描述到特定部件位于第一部件和第二部件之间时，在该特定部件与第一部件或第二部件之间可以存在居间部件，也可以不存在居间部件。当描述到特定部件连接其它部件时，该特定部件可以与所述其它部件直接连接而不具有居间部件，也可以不与所述其它部件直接连接而具有居间部件。
本公开使用的所有术语(包括技术术语或者科学术语)与本公开所属领域的普通技术人员理解的含义相同，除非另外特别定义。还应当理解，在诸如通用字典中定义的术语应当被解释为具有与它们在相关技术的上下文中的含义相一致的含义，而不应用理想化或极度形式化的意义来解释，除非这里明确地这样定义。
对于相关领域普通技术人员已知的技术、方法和设备可能不作详细讨论，但在适当情况下，技术、方法和设备应当被视为说明书的一部分。
如图1所示，本发明实施例提供了一种临床试验医学编码系统，其包括：
源文件上传模块1，用于上传临床试验研究的源文件，并在上传时指定待编码词语的所在列；
医学编码模块2，用于基于针对所述临床试验研究所对应的域，将所述待编码词语和与所述临床试验研究对应的标准词典进行匹配，以得到编码结果；
编码结果导出模块3，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果和所述源文件作为完整结果导出。
其中，所述源文件上传模块1包括：
待编码词语确定单元，用于在所述源文件中选择工作簿，并在所选择的所述工作簿中选择需要编码的词语所在列，根据所选择的需要编码的词语所在列确定对应列的词语，并将确定的所述对应列的词语中非重复的词语加入待编码词语列表中；
源文件导入单元，用于导入所述待编码词语列表中的待编码词语。
其中，源文件是指临床试验研究中的临床试验数据，通常为Excel格式的文件，待编码词语确定单元会选择Excel中的哪个工作簿(sheet)进行导入，然后针对选择的sheet选择需要编码的是哪一列，然后将这一列所对应的词语中非重复的词语加入待编码词语列表中。在具体实现中，待编码词语确定单元每确定一个待编码词语，就将其加入待编码词语列表，与此同时，待编码词语列表更新一次，若某个对应列的词语已经存在于待编码词语列表中，则不将该对应列的词语加入待编码词语列表中，若某个对应列的词语不存在于待编码词语列表中，则将该对应列的词语加入待编码词语列表中，即在确定的待编码词语列表中不存在重复的词语。进一步地，源文件导入单元是以工作簿为单位导入待编码词语的。
进一步地，所述医学编码模块2包括：
第一自动编码单元，用于在所述源文件上传模块上传所述源文件时，将所述待编码词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语进行自动匹配，以得到第一自动编码结果；
第二自动编码单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的待编码词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行自动匹配，以得到第二自动编码结果；
手动编码单元，用于将未能与所述标准词典进行自动匹配的待编码词语进行手动编码，以得到手动编码结果。
其中，域可以理解为由与词典里的编码结果路径匹配的词语所构成的集合，一个临床试验研究只能对应一个域，一个域可以对应多个临床试验研究。
所述临床试验研究对应的标准词典包括但不限于MedDRA、WHODrug等。手动编码单元在进行手动编码时，需要对待编码词语进行理解，根据语义在标准词典内寻找对应的标准词语，然后将选定的结果编码给指定的待编码词语。具体而言，手动编码单元包括检索结果存储子单元，用于在手动编码时，使编码员在标准词典内检索与待编码词语有关的所有信息(例如，名称、编号、级别等)，并将检索结果一键存储。因此，与现有技术的编码员在在标准词典官网上一个一个地把检索结果记录下来相比，提高了检索的灵活性，极大地提高了编码效率。
所述编码结果导出模块3包括：
编码结果整合单元，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果附加到所述源文件后面，以将所述编码结果和所述源文件进行整合；
编码结果语言切换单元，用于将所述整合了所述编码结果和所述源文件的完整结果切换成目标语言；
编码结果导出单元，用于将所述完整结果以所述目标语言导出。
编码结果整合单元在整合编码结果和源文件时，将源文件中的待编码词语列表和编码结果里的编码列进行比对，若比对结果为一致，则将编码结果附加到源文件后面，作为完整结果。与常规的编码结果导出后，需要在外部和源文件进行匹配合并相比，本发明以源文件为基础，可以一键导出合并后的结果。
作为一个示例而非限制，编码结果语言切换单元可以选择导出中文结果或英文结果，与常规的只能导出编码时所用的标准词典所对应的语言，需要另外一种语言的编码结果时，需要在外部再做处理相比，本发明以源文件为基础，可以一键导出中/英文的编码结果。例如，当前研究按照中文进行编码，导出时可以选择英文结果，此时根据中文结果内的编码路径(例如LLT_Code(低位语编码路径)、PT_Code(首选语编码路径)、SOC_Code(系统器官分类编码路径)等)去对应英文标准字典内将相应的结果取出，整合成最后的导出文件，大大的提高了效率。
由此，相对于现有技术而言，本实施例提供的临床试验医学编码系统，通过源文件上传模块、医学编码模块和编码结果导出模块，实现了闭环的医学编码，有效提高了医学编码的工作效率；而且医学编码模块基于针对临床试验研究所对应的域得到编码结果，可以把临床试验研究按照组进行分类，使用同一个域的研究共享一套编码结果，无需在研究之间进行拷贝，减小了医学编码的工作量，降低人工参与的环节，极大地提高了医学编码的工作效率。
进一步地，所述临床试验医学编码系统还包括词典升级模块4，用于将所述临床试验研究和所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果进行升级。
标准词典(MedDRA、WHODrug)通常每年发布2次，由于临床研究时间一般长于半年，大部分情况下，当新版本词典发布时，需要将临床研究的编码词语升级到最新版本。
其中，所述词典升级模块4包括：
新版标准词典上传单元，用于将新版本标准词典进行上传；
域条目升级单元，用于将所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果在原版本标准词典的原编码路径与在新版本标准词典的新编码路径进行匹配，若所述原编码路径在所述新编码路径中存在，则编码结果路径匹配成功，并生成对应新版标准词典的域条目升级结果；
研究条目升级单元，用于根据所述域条目升级结果和所述新版本标准词典，将所述临床试验研究内的词语的编码结果进行升级。
示例性地，待编码词语为“肾病合并高血压”，编码结果为LLT:“高血压肾病”，PT：“高血压肾病”，HLT：“高血压并发症”，HLGT：“血管性高血压疾病”，SOC：“血管与淋巴管类疾病”，若原编码路径在所述新编码路径中存在，则编码结果路径匹配成功，并生成对应新版标准词典的域条目升级结果。若原编码路径在所述新编码路径中不存在，则编码结果路径匹配不成功，则需要通过研究条目升级单元对编码结果进行升级了。假设，在第20版本的MedDRA标准词典中，高血压肾病属于对应SOC为血管与淋巴管类疾病这条路径，在第21版本的标准词典中，高血压肾病属于SOC为肾脏及泌尿系统疾病这条路径，由于肾病合并高血压的原编码路径在新编码路径中不存在，因此不会将其放在新版本的域里了。
进一步地，所述研究条目升级单元包括：
第一研究条目自动升级子单元，用于将所述临床试验研究内的词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码路径进行自动匹配，以得到第一研究条目自动升级结果；
第二研究条目自动升级子单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行编码路径的自动匹配，以得到第二研究条目自动升级结果；
研究条目手动升级子单元，用于将所述临床试验研究中未能与所述标准词典进行自动匹配的词语进行编码路径的手动匹配，以得到研究条目手动升级结果。
域条目升级单元对域升级完成后，再通过研究条目升级单元对临床试验研究的编码词语进行升级，具体而言，根据最新的域词语列表和最新词典进行词语的匹配，不能完全匹配的词语则需要重新进行手动编码。词典升级对于医学编码过程是一个难点，通过域条目升级单元和研究条目升级单元，极大地提高了词典升级的方便性。
进一步地，所述临床试验医学编码系统还包括研究设置模块7，用于对所述临床试验研究的研究参数进行设置。具体地，研究设置模块7在研究级别设置相关参数，如研究所使用的域，以及每种标准字典(例如，MedDRA、WHODrug等)的版本，语言等。并且可以针对每种标准词典进行细化设置，譬如针对MedDRA词典是否采用“主SOC(系统器官分类)”编码。
进一步地，所述临床试验医学编码系统还包括域管理模块5，用于对所述临床试验研究所对应的域进行管理。
具体地，域管理模块对域的管理主要是对域的增加和/或删出和/或修改和/或查询中的至少一者。对于不能进行自动编码的词语，需要进行手动编码，手动编码后的结果可以统一存储到域内，所以域可以理解为手动编码的词编码结果的集合，针对域内存在的词语，下次进行自动编码时可进行自动匹配，无需再次进行手工编码。
与传统的按照研究级别管理手动编码词语不同，本发明通过域管理可以把研究按照组进行分类，使用同一个域的研究共享一套手动编码结果的集合，不用在研究之间进行拷贝，也减小了词典升级时所带来的工作量。
进一步地，所述临床试验医学编码系统还包括词典版本管理模块6，用于对所述标准词典的版本进行管理。
具体而言，词典版本管理模块6把从MedDRA或WHODrug官网下载的源文件(txt格式)，通过设置一定的参数(例如，是否采用“主SOC”编码、中文版词典是否去除重复条目等)上传到系统内。由于两种词典的结构(例如，字段、编排格式)不同，在临床试验医学编码系统的后台数据库内需要分开存储，但在临床试验医学编码系统的前端可以在词典版本管理界面统一进行增加和/或删出和/或修改和/或查询中的至少一者。
进一步地，所述临床试验医学编码系统还包括用户角色管理模块8，用于对使用临床试验医学编码系统的用户的角色进行管理。
医学编码过程中有编码员、审阅员等不同角色，每种角色可以进行的任务不同，通过用户角色管理模块8可以对针对每种角色所配置的细化任务权限进行管理。
综上所述，本发明实施例提供的临床试验医学编码系统，通过源文件上传模块、医学编码模块、编码结果导出模块、词典升级模块、域管理模块、词典版本管理模块、研究设置模块、用户角色管理模块，实现了闭环的医学编码，有效提高了医学编码的工作效率；而且医学编码模块基于针对临床试验研究所对应的域得到编码结果，可以把临床试验研究按照组进行分类，使用同一个域的研究共享一套编码结果，无需在研究之间进行拷贝，减小了医学编码的工作量，降低人工参与的环节，极大地提高了医学编码的工作效率。
进一步地，与常规的编码结果导出后需要在外部和源文件进行匹配合并相比，本发明的编码结果导出模块以源文件为基础，可以一键导出合并后的结果；与常规的只能导出编码时所用的标准词典所对应的语言，需要另外一种语言的编码结果时需要在外部再做处理相比，本发明以源文件为基础，可以一键导出中/英文的编码结果。
进一步地，词典升级模块通过域条目升级单元和研究条目升级单元，极大地提高了词典升级的方便性，进一步提高了医学编码的工作效率。
至此，已经详细描述了本公开的各实施例。为了避免遮蔽本公开的构思，没有描述本领域所公知的一些细节。本领域技术人员根据上面的描述，完全可以明白如何实施这里公开的技术方案。
虽然已经通过示例对本公开的一些特定实施例进行了详细说明，但是本领域的技术人员应该理解，以上示例仅是为了进行说明，而不是为了限制本公开的范围。本领域的技术人员应该理解，可在不脱离本公开的范围和精神的情况下，对以上实施例进行修改或者对部分技术特征进行等同替换。本公开的范围由所附权利要求来限定。

Claims (10)

1.一种临床试验医学编码系统，其特征在于，包括：
源文件上传模块，用于上传临床试验研究的源文件，并在上传时指定待编码词语的所在列；
医学编码模块，用于基于针对所述临床试验研究所对应的域，将所述待编码词语和与所述临床试验研究对应的标准词典进行匹配，以得到编码结果；
编码结果导出模块，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果和所述源文件作为完整结果导出。
2.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述源文件上传模块包括：
待编码词语确定单元，用于在所述源文件中选择工作簿，并在所选择的所述工作簿中选择需要编码的词语所在列，根据所选择的需要编码的词语所在列确定对应列的词语，并将确定的所述对应列的词语中非重复的词语加入待编码词语列表中；
源文件导入单元，用于导入所述待编码词语列表中的待编码词语。
3.根据权利要求2所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述医学编码模块包括：
第一自动编码单元，用于在所述源文件上传模块上传所述源文件时，将所述待编码词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语进行自动匹配，以得到第一自动编码结果；
第二自动编码单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的待编码词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行自动匹配，以得到第二自动编码结果；
手动编码单元，用于将未能与所述标准词典进行自动匹配的待编码词语进行手动编码，以得到手动编码结果。
4.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述编码结果导出模块包括：
编码结果整合单元，用于将所述编码结果和所述源文件中的所述待编码词语进行匹配，并将所述编码结果附加到所述源文件后面，以将所述编码结果和所述源文件进行整合；
编码结果语言切换单元，用于将所述整合了所述编码结果和所述源文件的完整结果切换成目标语言；
编码结果导出单元，用于将所述完整结果以所述目标语言导出。
5.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述临床试验医学编码系统还包括词典升级模块，用于将所述临床试验研究和所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果进行升级。
6.根据权利要求5所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述词典升级模块包括：
新版标准词典上传单元，用于将新版本标准词典进行上传；
域条目升级单元，用于将所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码结果在原版本标准词典的原编码路径与在新版本标准词典的新编码路径进行匹配，若所述原编码路径在所述新编码路径中存在，则编码结果路径匹配成功，并生成对应新版标准词典的域条目升级结果；
研究条目升级单元，用于根据所述域条目升级结果和所述新版本标准词典，将所述临床试验研究内的词语的编码结果进行升级。
7.根据权利要求6所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述研究条目升级单元包括：
第一研究条目自动升级子单元，用于将所述临床试验研究内的词语与所述临床试验研究所对应的域内的词语的编码路径进行自动匹配，以得到第一研究条目自动升级结果；
第二研究条目自动升级子单元，用于将未能与所述域内的词语自动匹配的词语与所述临床试验研究对应的标准词典进行编码路径的自动匹配，以得到第二研究条目自动升级结果；
研究条目手动升级子单元，用于将所述临床试验研究中未能与所述标准词典进行自动匹配的词语进行编码路径的手动匹配，以得到研究条目手动升级结果。
8.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述临床试验医学编码系统还包括域管理模块，用于对所述临床试验研究所对应的域进行管理。
9.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述临床试验医学编码系统还包括词典版本管理模块，用于对所述标准词典的版本进行管理。
10.根据权利要求1所述的临床试验医学编码系统，其特征在于，所述临床试验医学编码系统还包括研究设置模块，用于对所述临床试验研究的研究参数进行设置。
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