CN111967465A - 肿瘤细胞含量评估方法、系统、计算机设备及存储介质 - Google Patents
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Abstract
本发明实施例公开了一种肿瘤细胞含量评估方法,通过获取数字病理切片图像,根据数字病理切片图像确定有效病理区域;通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,实现了对数字病理切片图像的肿瘤细胞含量的自动化评估,提高了对肿瘤细胞含量评估的准确性和客观性。此外,还提出了一种肿瘤细胞含量评估系统、计算机设备及存储介质。
Description
技术领域
本发明涉及图像处理技术领域,尤其涉及一种肿瘤细胞含量评估方法、系统、计算机设备及存储介质。
背景技术
肿瘤分子病理的基因检测及蛋白检测,目前已有大量的医疗市场需求,对于常见的肺癌、乳腺癌、肠癌等都有了相关的分子病理检测的方案。目前对于需要精准治疗,如靶向治疗和免疫治疗的肿瘤患者,需要提供肿瘤组织样本进行分子病理检查。而由于临床手术活检取材的病理学样本,受患者因素、肿瘤自身因素及临床手术医生活检取样等多重因素的影响。造成了每一份送检的病理学样本中,组织含量及肿瘤含量存在较大范围的波动。对于组织含量少或者肿瘤含量少的样本,对于分子病理检测技术平台来说,经常造成无法检出,造成假阴性的现象,或者患者将前后两次的样本送检分子病理检查,检测结果出现严重的不一致性的问题。
发明内容
基于此,有必要针对上述问题,提出一种肿瘤细胞含量评估方法、系统、计算机设备及存储介质,以提高对肿瘤细胞含量评估的客观性和准确性。
一种肿瘤细胞含量评估方法,所述方法包括:
获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
一种肿瘤细胞含量评估系统,所述系统包括:
区域确定模块,用于获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
肿瘤细胞识别模块,用于通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
含量评估模块,用于根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,所述计算机程序被所述处理器执行时,使得所述处理器执行以下步骤:
获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
一种计算机可读存储介质,存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时,使得所述处理器执行以下步骤:
获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
上述肿瘤细胞含量评估方法、系统、计算机设备及存储介质,通过获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,通过采用深度学习的方法对病理切片图像进行肿瘤细胞的识别,对识别出的细胞区域采用多种评估方式进行全面评估,通过机器视觉的识别技术,保证了肿瘤细胞识别得准确性和客观性,采用多种评估方式进行全面评估进一步提高了肿瘤细胞含量评估得准确性。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
其中:
图1为一个实施例中肿瘤细胞含量评估方法的流程图;
图2为一个实施例中有效病理区域确定方法的流程图;
图3为一个实施例中数字病理切片图像与灰度图像对比图;
图4为另一个实施例中肿瘤细胞含量评估方法的流程图;
图5为又一个实施例中肿瘤细胞含量评估方法的流程图;
图6为再一个实施例中肿瘤细胞含量评估方法的流程图;
图7为还一个实施例中肿瘤细胞含量评估方法的流程图;
图8为一个实施例中肿瘤细胞含量评估系统的结构框图;
图9为一个实施例中计算机设备的结构框图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
如图1所示,在一个实施例中,提供了一种肿瘤细胞含量评估方法,该肿瘤细胞含量评估方法既可以应用于终端,也可以应用于服务器,本实施例以应用于服务器举例说明。该肿瘤细胞含量评估方法具体包括以下步骤:
步骤102,获取数字病理切片图像,根据数字病理切片图像确定有效病理区域。
其中,数字病理切片图像是指将病理切片以数字图像的方式进行显示、保存的病理切片图像。具体地,可以通过数字病理扫描仪对活检样本的病理切片进行数字扫描后获取得到。有效病理区域,指病理切片中包含细胞的区域,其中的细胞包括正常和/或病变细胞。通过对数字病理切片图像进行分割,确定有效病理区域,其中的图像分割方法包括但不限于是图像二值化处理方法,基于机器学习的图像分割模型或者边缘检测算法等。作为本实施例的优选,采用二值化处理方式,即利用细胞区域和非细胞区域的平均灰度值不一致的特点,通过设置一个合理的灰度阈值,过滤掉一部分非细胞区域,从而提取出有效病理区域,该方法相较于机器学习的图像分割模型或者边缘检测算法,更加简单快速。
步骤104,通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与有效病理区域对应的肿瘤细胞区域。
其中,深度学习是机器学习中一种基于对数据进行表征学习的方法。观测值(例如图像)可以使用多种方式来表示,如每个像素强度值的向量,或者更抽象地表示成一系列边、特定形状的区域等。而使用某些特定的表示方法更容易从实例中学习任务(例如人脸识别)。深度学习用于建立、模拟人脑进行分析学习的神经网络,它模仿人脑的机制来解释数据,例如图像,声音和文本,用非监督式或半监督式的特征学习和分层特征提取高效算法来替代手工获取特征,能够有利于提高预测结果的客观性和准确性。病理图像分类器是一种分类器,可通过样本学习具备分类能力的机器学习算法模型,本实施例的病理图像分类器用于将不同的有效病理区域划分到肿瘤细胞区域和非肿瘤细胞区域中的一类。具体地,可以利用至少一个机器学习模型进行分类的分类器。其中的机器学习模型可以是如下的一个或者多个:神经网络(例如,卷积神经网络、BP神经网络等)、逻辑回归模型、支持向量机、决策树、随机森林、感知器以及其它机器学习模型。作为这样的机器学习模型的训练的部分,训练输入是各种有效病理区域对应图像,通过训练,建立有效病理区域与肿瘤细胞区域或者非肿瘤细胞区域的对应的关系分类器。使得该病理图像分类器具备判断输入的有效病理区域对应的是肿瘤细胞区域还是非肿瘤细胞区域的能力。本实施例中,该病理图像分类器为二分类器,即得到两个分类结果,也即肿瘤细胞区域或者非肿瘤细胞区域。
非肿瘤细胞区域是指有效病理区域中正常细胞所在的区域,肿瘤细胞区域是指有效病理区域中发生病变的细胞所在的区域,用于医生对该区域的自爆含量进行分析实现疾病诊断。可以理解地,通过深度学习的方式对有效病理区域中的肿瘤细胞区域进行识别,实现了对肿瘤细胞区域的自动检测,提高了对肿瘤细胞识别的准确性和客观性。
步骤106,根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
其中,预设的评估规则是指预先设定的用于评估肿瘤细胞含量的评估方式或者指标,例如可以根据肿瘤细胞区域的面积,细胞数量、肿瘤占比和肿瘤间质比等进行评估。可以理解地,通过采用预设的评估规则进行评估,从而实现了从多个角度对数字病理切片图像的肿瘤细胞含量的自动化评估,保证了评估的全面性和客观性,提高了肿瘤细胞含量的评估得准确性和一致性,避免人工分析存在主观偏差,无法得到统一、精确的评估结果。
上述肿瘤细胞含量评估方法,通过获取数字病理切片图像,根据数字病理切片图像确定有效病理区域;通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,实现了对数字病理切片图像的肿瘤细胞含量的自动化评估,提高了对肿瘤细胞含量评估的准确性和客观性。
如图2所示,在一个实施例中,根据数字病理切片图像确定有效病理区域,包括:
步骤102A,将数字病理切片图像进行二值化处理,得到灰度图像;
步骤102B,从灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域作为有效病理区域。
在这个实施例中,有效病理区域的颜色为红色和蓝色两种染色试剂所染区域,背景区域的灰度为无色或者白色,灰度值比有效病理区域的灰度值大,根据有效病理区域的灰度确定预设灰度阈值,因此,通过数字病理切片图像进行二值化处理,其中的二值化处理包括但不限于是全局二值化、基于直方图的最优阈值方法或者基于聚类的OTSU大津阈值方法,即将彩色图片颜色值转变为灰度图像。以肺癌的数字病理切片图像为例,如图3所示的数字病理切片图像与灰度图像对比图。从灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域,从而提取出了有效病理区域,以便后续对有效病理区域进行进一步处理。
如图4所示,在一个实施例中,根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,包括:
步骤106A,确定肿瘤细胞区域的第一面积,并确定有效病理区域的第二面积;
步骤106B,根据第一面积和第二面积计算得到数字病理切片图像的肿瘤占比和肿瘤间质比。
具体地,根据肿瘤细胞区域可以计算得到第一面积,根据有效病理区域可以计算得到第二面积。采用如下两个公式分别计算肿瘤占比和肿瘤间质比:
P1=S1/S2×100%;
P2=S1/[S2-S1]×100%;
公式中,S1表示为第一面积,S2表示为第二面积,P1表示为肿瘤占比,P2表示为肿瘤间质比。本实施例中,通过肿瘤占比和肿瘤间质比作为评估肿瘤细胞含量的指标,以便医生根据肿瘤占比和肿瘤间质比进行疾病诊断。
如图5所示,在一个实施例中,在根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:
步骤108,获取多个肿瘤细胞对应的多个测试直径,并对多个测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径;
步骤110,根据单个肿瘤细胞的平均直径确定单个肿瘤细胞的平均面积;
步骤112,根据单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数;
步骤114,根据第一面积和单位面积内肿瘤细胞数计算得到肿瘤细胞的第一数量。
具体地,通过预先测试一种肿瘤细胞(如肺癌细胞)的直径,例如测试多个肿瘤细胞(如100个),得到100个测试直径,并对多个测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径,根据单个肿瘤细胞的平均直径计算单个肿瘤细胞的平均面积,S=π×(d/2)2,d表示为平均直径,S表示为平均面积根据单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数,将第一面积乘以单位面积内肿瘤细胞数,即可计算得到肿瘤细胞的第一数量。本实施例中,通过计算肿瘤细胞区域的细胞的第一数量,以便医生基于该第一数量进行疾病诊断和分析。
在一个实施例中,在根据肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:
通过细胞分割算法对肿瘤细胞区域进行细胞分割,确定肿瘤细胞的第二数量。
其中,细胞分割算法是一种用于对细胞进行分割的方法,包括但不限于是FCN全卷积神经网络的细胞分割算法、U-Net模型的细胞分割算法或者基于深度学习的小分割算法等。通过将肿瘤细胞区域中的细胞分割开来,然后统计细胞的数量,级得到第二数量,以便医生基于该第一数量进行疾病诊断和分析。
值得说明的是,本实施例中第二数量由于是基于细胞本身特征进行计算得到,比步骤114中的第一数量更为精确。因此,适用于更多的检验或者疾病诊断场合。
如图6所示,在一个实施例中,还包括:
步骤116,获取训练样本集,训练样本集中包括训练病理区域和对应的训练细胞类型;
步骤118,将训练病理区域作为预设的分类器的输入,将训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的病理图像分类器。
具体地,获取通过医生进行标注的肿瘤细胞区域和非肿瘤细胞区域的样本,将训练病理区域作为预设的分类器的输入,训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,可生成与训练样本集中的训练病理区域相应的细胞类型,从而根据与当前训练病理区域对应的期望的输出,训练预设的分类器,得到训练完成的病理图像分类器。
本实施例中,训练样本集包括肿瘤细胞区域和非肿瘤细胞区域,保证了训练样本集的全面性,利用这样训练样本集训练出的细胞类型能够学习到更加全面准确的细胞类型分类规则,提高了训练机器学习预设分类器的效率,从而可以进一步提高对肿瘤细胞区域识别的效率。
如图7所示,在一个实施例中,在将训练病理区域作为预设的分类器的输入,将训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的病理图像分类器之前,还包括:
步骤120,获取测试样本集,测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型;
步骤122,将测试有效区域输入预设的分类器,获取输出的验证细胞类型;
步骤124,获取验证细胞类型与测试细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定预设的分类器训练完毕;
或,获取预设的分类器对应的训练次数,在训练次数达到最大预设次数的情况下,确定预设的分类器训练完毕。
具体地,获取测试样本集,测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型,并利用训练的机器学习的分类器对测试样本集进行预测,获取测试样本集已知的分类结果即期望的细胞类型,将预测得到的预测结果与已知的分类结果比较,得到相应机器学习分类器的分类预测正确率,获取验证细胞类型与期望的细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定预设的分类器训练完毕,或者,获取预设的分类器对应的训练次数,在训练次数达到最大预设次数的情况下,确定预设的分类器训练完毕,获取该机器学习的分类器所用的参数取值,否则,利用获取的参数取值以及测试样本集继续训练机器学习分类器。
本实施例中,利用测试样本集粗略定位参数取值,通过获取验证细胞类型与期望的环境类型之间的误差,或者训练次数,可以尽可能找到最合适的参数取值,从而利用该参数取值以及测试样本集进行训练,训练出的机器学习分类器对细胞类型进行区分可以达到更高的正确率。
如图8所示,在一个实施例中,提出了一种肿瘤细胞含量评估系统,所述系统包括:
区域确定模块802,用于获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
肿瘤细胞识别模块804,用于通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
含量评估模块806,用于根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
在一个实施例中,区域确定模块包括:
二值化处理单元,用于将所述数字病理切片图像进行二值化处理,得到灰度图像;
区域确定单元,用于从所述灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域作为有效病理区域。
在一个实施例中,含量评估模块包括:
面积确定单元,用于确定所述肿瘤细胞区域的第一面积,并确定所述有效病理区域的第二面积;
含量评估单元,用于根据所述第一面积和所述第二面积计算得到所述数字病理切片图像的肿瘤占比和肿瘤间质比。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估系统还包括:
直径获取模块,用于获取多个肿瘤细胞对应的多个测试直径,并对多个所述测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径;
面积计算模块,用于根据所述单个肿瘤细胞的平均直径确定单个肿瘤细胞的平均面积;
细胞数计算模块,用于根据所述单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数;
第一数量计算模块,用于根据所述第一面积和所述单位面积内肿瘤细胞数计算得到肿瘤细胞的第一数量。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估系统还包括:第二数量确定模块,用于通过细胞分割算法对所述肿瘤细胞区域进行细胞分割,确定肿瘤细胞的第二数量。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估系统还包括:
训练样本获取模块,用于获取训练样本集,所述训练样本集中包括训练病理区域和对应的训练细胞类型;
分类器训练模块,用于将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估系统还包括:
测试样本获取模块,用于获取测试样本集,所述测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型;
分类测试模块,用于将所述测试有效区域输入预设的分类器,获取输出的验证细胞类型;
验证模块,用于获取验证细胞类型与测试细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕;
或,获取所述预设的分类器对应的训练次数,在所述训练次数达到最大预设次数的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕。
图9示出了一个实施例中计算机设备的内部结构图。该计算机设备具体可以是服务器,所述服务器包括但不限于高性能计算机和高性能计算机集群。如图9所示,该计算机设备包括通过系统总线连接的处理器、存储器和网络接口。其中,存储器包括非易失性存储介质和内存储器。该计算机设备的非易失性存储介质存储有操作系统,还可存储有计算机程序,该计算机程序被处理器执行时,可使得处理器实现肿瘤细胞含量评估方法。该内存储器中也可储存有计算机程序,该计算机程序被处理器执行时,可使得处理器执行肿瘤细胞含量评估方法。本领域技术人员可以理解,图9中示出的结构,仅仅是与本申请方案相关的部分结构的框图,并不构成对本申请方案所应用于其上的计算机设备的限定,具体的计算机设备可以包括比图中所示更多或更少的部件,或者组合某些部件,或者具有不同的部件布置。
在一个实施例中,本申请提供的肿瘤细胞含量评估方法可以实现为一种计算机程序的形式,计算机程序可在如图9所示的计算机设备上运行。计算机设备的存储器中可存储组成肿瘤细胞含量评估系统的各个程序模板。比如,区域确定模块802,肿瘤细胞识别模块804,含量评估模块806。
一种计算机设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现如下步骤:获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
在一个实施例中,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域,包括:将所述数字病理切片图像进行二值化处理,得到灰度图像;从所述灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域作为有效病理区域。
在一个实施例中,根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,包括:确定所述肿瘤细胞区域的第一面积,并确定所述有效病理区域的第二面积;根据所述第一面积和所述第二面积计算得到所述数字病理切片图像的肿瘤占比和肿瘤间质比。
在一个实施例中,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:获取多个肿瘤细胞对应的多个测试直径,并对多个所述测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径;根据所述单个肿瘤细胞的平均直径确定单个肿瘤细胞的平均面积;根据所述单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数;根据所述第一面积和所述单位面积内肿瘤细胞数计算得到肿瘤细胞的第一数量。
在一个实施例中,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:通过细胞分割算法对所述肿瘤细胞区域进行细胞分割,确定肿瘤细胞的第二数量。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估方法还包括:获取训练样本集,所述训练样本集中包括训练病理区域和对应的训练细胞类型;将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器。
在一个实施例中,在所述将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器之前,还包括:获取测试样本集,所述测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型;将所述测试有效区域输入预设的分类器,获取输出的验证细胞类型;获取验证细胞类型与测试细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕;或,获取所述预设的分类器对应的训练次数,在所述训练次数达到最大预设次数的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕。
一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如下步骤:获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
在一个实施例中,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域,包括:将所述数字病理切片图像进行二值化处理,得到灰度图像;从所述灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域作为有效病理区域。
在一个实施例中,根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,包括:确定所述肿瘤细胞区域的第一面积,并确定所述有效病理区域的第二面积;根据所述第一面积和所述第二面积计算得到所述数字病理切片图像的肿瘤占比和肿瘤间质比。
在一个实施例中,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:获取多个肿瘤细胞对应的多个测试直径,并对多个所述测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径;根据所述单个肿瘤细胞的平均直径确定单个肿瘤细胞的平均面积;根据所述单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数;根据所述第一面积和所述单位面积内肿瘤细胞数计算得到肿瘤细胞的第一数量。
在一个实施例中,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:通过细胞分割算法对所述肿瘤细胞区域进行细胞分割,确定肿瘤细胞的第二数量。
在一个实施例中,该肿瘤细胞含量评估方法还包括:获取训练样本集,所述训练样本集中包括训练病理区域和对应的训练细胞类型;将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器。
在一个实施例中,在所述将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器之前,还包括:获取测试样本集,所述测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型;将所述测试有效区域输入预设的分类器,获取输出的验证细胞类型;获取验证细胞类型与测试细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕;或,获取所述预设的分类器对应的训练次数,在所述训练次数达到最大预设次数的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕。
本领域普通技术人员可以理解实现上述实施例方法中的全部或部分流程,是可以通过计算机程序来指令相关的硬件来完成,所述的程序可存储于一非易失性计算机可读取存储介质中,该程序在执行时,可包括如上述各方法的实施例的流程。其中,本申请所提供的各实施例中所使用的对存储器、存储、数据库或其它介质的任何引用,均可包括非易失性和/或易失性存储器。非易失性存储器可包括只读存储器(ROM)、可编程ROM(PROM)、电可编程ROM(EPROM)、电可擦除可编程ROM(EEPROM)或闪存。易失性存储器可包括随机存取存储器(RAM)或者外部高速缓冲存储器。作为说明而非局限,RAM以多种形式可得,诸如静态RAM(SRAM)、动态RAM(DRAM)、同步DRAM(SDRAM)、双数据率SDRAM(DDRSDRAM)、增强型SDRAM(ESDRAM)、同步链路(Synchlink)DRAM(SLDRAM)、存储器总线(Rambus)直接RAM(RDRAM)、直接存储器总线动态RAM(DRDRAM)、以及存储器总线动态RAM(RDRAM)等。
以上实施例的各技术特征可以进行任意的组合,为使描述简洁,未对上述实施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述,然而,只要这些技术特征的组合不存在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
以上所述实施例仅表达了本申请的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本申请专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本申请构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本申请的保护范围。因此,本申请专利的保护范围应以所附权利要求为准。
Claims (10)
1.一种肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,包括:
获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
2.根据权利要求1所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,所述根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域,包括:
将所述数字病理切片图像进行二值化处理,得到灰度图像;
从所述灰度图像中提取出灰度值小于预设灰度阈值的区域作为有效病理区域。
3.根据权利要求1所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量,包括:
确定所述肿瘤细胞区域的第一面积,并确定所述有效病理区域的第二面积;
根据所述第一面积和所述第二面积计算得到所述数字病理切片图像的肿瘤占比和肿瘤间质比。
4.根据权利要求3所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:
获取多个肿瘤细胞对应的多个测试直径,并对多个所述测试直径进行均值计算,得到单个肿瘤细胞的平均直径;
根据所述单个肿瘤细胞的平均直径确定单个肿瘤细胞的平均面积;
根据所述单个肿瘤细胞的平均面积,计算得到单位面积内肿瘤细胞数;
根据所述第一面积和所述单位面积内肿瘤细胞数计算得到肿瘤细胞的第一数量。
5.根据权利要求1所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,在所述根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量之后,还包括:
通过细胞分割算法对所述肿瘤细胞区域进行细胞分割,确定肿瘤细胞的第二数量。
6.根据权利要求1所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,所述方法还包括:
获取训练样本集,所述训练样本集中包括训练病理区域和对应的训练细胞类型;
将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器。
7.根据权利要求6所述的肿瘤细胞含量评估方法,其特征在于,在所述将所述训练病理区域作为预设的分类器的输入,将所述训练细胞类型作为期望的输出,对预设的分类器进行训练,得到训练完成的所述病理图像分类器之前,还包括:
获取测试样本集,所述测试样本包括测试有效区域和对应的测试细胞类型;
将所述测试有效区域输入预设的分类器,获取输出的验证细胞类型;
获取验证细胞类型与测试细胞类型之间的误差,在误差小于预设误差的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕;
或,获取所述预设的分类器对应的训练次数,在所述训练次数达到最大预设次数的情况下,确定所述预设的分类器训练完毕。
8.一种肿瘤细胞含量评估系统,其特征在于,所述肿瘤细胞含量评估系统包括:
区域确定模块,用于获取数字病理切片图像,根据所述数字病理切片图像确定有效病理区域;
肿瘤细胞识别模块,用于通过基于深度学习的病理图像分类器,识别与所述有效病理区域对应的肿瘤细胞区域;
含量评估模块,用于根据所述肿瘤细胞区域,采用预设的评估规则确定所述数字病理切片图像的肿瘤细胞含量。
9.一种计算机设备,其特征在于,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至7任一项所述肿瘤细胞含量评估方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述肿瘤细胞含量评估方法的步骤。
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