CN111915609B - 病灶检测分析方法、装置、电子设备及计算机存储介质 - Google Patents

病灶检测分析方法、装置、电子设备及计算机存储介质 Download PDF

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Abstract

本发明涉及人工智能技术,揭露了一种病灶检测分析方法,包括:获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;选择所述标准数据集中的一张切片数据,根据所述标准数据集计算切片步长,并在选择所述切片数据的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集;将所述输入切片集输入至病灶分割模型进行空洞卷积,提取特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。本发明还提出了一种病灶检测分析装置、设备及计算机可读存储介质。此外,本发明还涉及区块链技术,所述CT切片数据可存储于区块链节点中。本发明可以提高病灶分割的精度,并对病灶进行多方面的分析。

Description

病灶检测分析方法、装置、电子设备及计算机存储介质
技术领域
本发明涉及人工智能技术领域,尤其涉及一种病灶检测分析方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质。
背景技术
随着深度学习在图像领域取得的巨大发展,基于深度学习方法在医疗影像数据上也被广泛应用。病灶检测分析和分割是其中的一个重要分支,利用计算机自动化识别影像中的病灶区域,确定患者的严重程度,便于后续医生进行精细诊断。
目前已有的病灶检测分析方法是基于深度学习算法的,但是对病灶的分割精度较低,并且只对病灶进行区域大小的检测,并没有对各病灶区域进行进一步分析,使对于病灶区域体积的定量指标未有明显改变的治愈情况难以检测出来。
发明内容
本发明提供一种病灶检测分析方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质,其主要目的在于提高病灶分割的精度,并对病灶进行多方面的分析。
为实现上述目的,本发明提供的一种病灶检测分析方法,包括:
获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数;
将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;
对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。
可选地,所述选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,包括:
在所述标准数据集中选择其中一张切片S,并采用下述公式计算切片步长
Figure 140251DEST_PATH_IMAGE001
Figure 656683DEST_PATH_IMAGE002
其中,
Figure DEST_PATH_IMAGE003
为所述标准数据集中的Z轴最大坐标;
根据所述切片步长采用下述公式依次计算与所述切片S的前n张切片和所述切片S的后m张切片在所述标准数据集中的位置,得到输入切片集:
Figure 763179DEST_PATH_IMAGE004
Figure DEST_PATH_IMAGE005
其中,
Figure 646952DEST_PATH_IMAGE006
为所述切片S的z轴坐标,/>
Figure DEST_PATH_IMAGE007
为所述切片S的前一张切片的z轴坐标,/>
Figure 762676DEST_PATH_IMAGE008
为所述切片S的后一张切片的z轴坐标。
可选地,所述利用所述病灶分割模型不同的空洞参数对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域,包括:
利用所述病灶分割模型中的上采样层对所述输入切片集进行多次不同空洞率的空洞卷积、池化操作,得到多个尺度的特征图;
利用所述病灶分割模型中的跳跃连接层和下采样层将所述多个尺度的特征图进行融合,并输出病灶分割结果图,并根据所述病灶分割结果图确定病灶区域。
可选地,在将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型之前,该方法还包括:
获取训练集,并将所述训练集输入至所述病灶分割模型中,得到预测结果;
利用预设的损失函数对所述预测结果进行损失计算,得到损失函数值;
根据所述损失函数值反向传播更新所述病灶分割模型的参数;
返回上述的损失计算步骤,直到达到预设迭代次数,得到训练完成的病灶分割模型。
可选地,所述对所述病灶区域进行密度分析,包括:
对每个所述病灶区域,从所述CT切片数据中提取与所述病灶区域对应位置的多个亨氏单位值;
对所述多个亨氏单位值进行统计,生成关于亨氏单位值数量的直方图;
根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果。
可选地,所述根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果,包括:
基于所述直方图确定比例阈值条件;
根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果。
可选地,所述将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集,包括:
根据所述CT切片数据中各切片的像素值构建对应的三维矩阵;
利用下述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,得到归一化后的标准数据集:
Figure DEST_PATH_IMAGE009
其中,
Figure 179620DEST_PATH_IMAGE010
为归一化的数据,/>
Figure DEST_PATH_IMAGE011
为所述三维矩阵。
为了解决上述问题,本发明还提供一种病灶检测分析装置,所述装置包括:
数据处理模块,用于获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
输入切片集获取模块,用于选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数;
病灶区域确定模块,用于将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;
密度分析模块,用于对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。
为了解决上述问题,本发明还提供一种电子设备,所述电子设备包括:
至少一个处理器;以及,
与所述至少一个处理器通信连接的存储器;其中,
所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的计算机程序,所述计算机程序被所述至少一个处理器执行,以使所述至少一个处理器能够执行上述所述的病灶检测分析方法。
为了解决上述问题,本发明还提供一种计算机可读存储介质,包括存储数据区和存储程序区,存储数据区存储创建的数据,存储程序区存储有计算机程序;其中,所述计算机程序被处理器执行时实现上述所述的病灶检测分析方法。
本发明实施例通过获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集,可以减少极端数据的干扰,确保结果的准确性;选择所述标准数据集中的一张切片数据,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,输入多张切片数据而不是单张切片数据,可以适配更多不同层厚的CT数据,提高模型的精确度;所述病灶分割模型中还采用了可切换的空洞卷积机制,可以识别出更多不同大小的病灶区域,提高病灶分割结果的准确度;同时还对所述病灶区域进行密度分析,对病灶区域的分析更加全面。因此本发明提出的病灶检测分析方法、装置及计算机可读存储介质,可以提高病灶分割的精度,并对病灶进行多方面的分析。
附图说明
图1为本发明实施例提供的病灶检测分析方法的流程示意图;
图2为图1中其中一个步骤的详细实施流程示意图;
图3为图1中另外一个步骤的详细实施流程示意图;
图4为本发明实施例提供的病灶检测分析装置的模块示意图;
图5为本发明实施例提供的实现病灶检测分析方法的电子设备的内部结构示意图;
本发明目的的实现、功能特点及优点将结合实施例,参照附图做进一步说明。
具体实施方式
应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
本申请实施例提供的病灶检测分析方法的执行主体包括但不限于服务端、终端等能够被配置为执行本申请实施例提供的该方法的电子设备中的至少一种。换言之,所述病灶检测分析方法可以由安装在终端设备或服务端设备的软件或硬件来执行,所述软件可以是区块链平台。所述服务端包括但不限于:单台服务器、服务器集群、云端服务器或云端服务器集群等。
本发明提供一种病灶检测分析方法。参照图1所示,为本发明一实施例提供的病灶检测分析方法的流程示意图。该方法可以由一个装置执行,该装置可以由软件和/或硬件实现。
在本实施例中,病灶检测分析方法包括:
S1、获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集。
本发明实施例中所述CT切片数据包括多个按顺序排列的医学影像图片,如肺炎患者的肺部CT影像,可以从医疗设备的数据库中获取。
优选地,所述CT切片数据可以从一区块链的节点中获取,通过将CT切片数据存储于区块链中,可以提高CT切片数据的安全性。
详细地,所述将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集,包括:
根据所述CT切片数据中各切片的像素值构建对应的三维矩阵;
利用下述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,得到归一化后的标准数据集:
Figure 722597DEST_PATH_IMAGE012
其中,
Figure 296928DEST_PATH_IMAGE013
为归一化的数据,/>
Figure 685184DEST_PATH_IMAGE014
为所述三维矩阵。
具体地,本发明实施例中利用上述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,是对所述三维矩阵中的每个元素,都用所述公式进行计算,得到计算结果;若所述计算结果大于1,则将所述元素的值赋值为1;若所述计算结果小于0,则将所述元素的值赋值为0。
优选地,当不同的特征成列在一起的时候,由于特征本身表达方式的原因会导致在绝对数值上的小数据被大数据覆盖的情况,因此对特征数据进行归一化处理,可以保证每个特征被分类器平等对待。
S2、选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数。
优选地,所述标准数据集包含多个按顺序排列的切片图像,所述切片的顺序与各切片的Z轴值对应,排在前的Z轴值越小,排在后的则Z轴值越大。
优选地,本发明实施例中m和n可以相同,为1。
详细地,参照图2所示,所述S2包括:
S20、在所述标准数据集中选择一张切片S,并采用下述公式计算切片步长
Figure 910629DEST_PATH_IMAGE015
Figure 562191DEST_PATH_IMAGE016
其中,
Figure 138665DEST_PATH_IMAGE017
为所述标准数据集中切片的Z轴最大坐标;
S21、根据所述切片步长采用下述公式依次计算与所述切片S的前n张切片和所述切片S的后m张切片在所述标准数据集中的位置,得到输入切片集:
Figure 317230DEST_PATH_IMAGE018
Figure 397182DEST_PATH_IMAGE019
其中,
Figure 750803DEST_PATH_IMAGE006
为所述切片S的z轴坐标,/>
Figure 548995DEST_PATH_IMAGE007
为所述切片S的前一张切片的z轴坐标,/>
Figure 295365DEST_PATH_IMAGE008
为所述切片S的后一张切片的z轴坐标。
优选地,传统的分割模型会输入单张切片或者先缩放再整体输入,本发明实施例在输入单张切片的同时,还输入前后两张切片,其中,前后两张切片的位置是根据层厚动态调整的,通过输入三张切片,可以提高病灶分割的精度。
S3、将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,根据所述特征数据确定病灶区域。
优选地,所述病灶分割模型是一种卷积神经网络模型,可以用于分类、检测和分割。所述病灶分割模型包括用于抽取抽象特征以扩大感受野的下采样层、用于恢复细节信息的上采样层和用于使用低层特征为高层特征补充细节信息的跳跃连接层。
详细地,参照图3所示,所述S3包括:
S30、利用所述病灶分割模型中的上采样层对所述输入切片集进行多次不同空洞率的空洞卷积、池化操作,得到多个尺度的特征图;
S31、利用所述病灶分割模型中的跳跃连接层和下采样层将所述多个尺度的特征图进行融合,并输出病灶分割结果图,并根据所述病灶分割结果图确定病灶区域。
本发明实施例中利用所述病灶分割模型在输出时会对输出图片中各个像素点进行类别判断,判断其是否为病灶,通过输出的病灶分割结果图可以检测出对应所述CT切片数据中的病灶区域,并对所述病灶区域进行标识,分割出所述病灶区域。
较佳地,本发明实施例中所述病灶分割模型采用了可切换的空洞卷积(SAC,Switchable Atrous Convolution),可以以不同的空洞率对输入图片进行卷积,并使用switch函数合并卷积后的结果,通过上述卷积操作,使得所述病灶分割模型能够对不同大小区域的病灶进行不同的卷积,识别出更多病灶区域,输出病灶分割图,提高病灶分割结果的准确度。
可选地,本发明实施例在将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型之前,还包括对所述病灶分模型进行训练,具体如下:
获取训练集,并将所述训练集输入至所述病灶分割模型中,得到预测结果;
利用预设的损失函数对所述预测结果进行损失计算,得到损失函数值;
根据所述损失函数值反向传播更新所述病灶分割模型的参数;
返回上述的损失计算步骤,直到达到预设迭代次数,得到训练完成的病灶分割模型。
进一步地,所述损失函数包括:
Figure 229823DEST_PATH_IMAGE020
其中,
Figure 223187DEST_PATH_IMAGE021
为损失函数值,Y_true表示真实的病灶标签,Y_pred则表示所述卷积神经网络模型预测出的病灶标签,N是所述训练集的样本总数。
优选地,本发明实施例将经过训练后得到的模型作为病灶分割模型,通过所述病灶分割模型,即可预测肺炎病灶区域。
S4、对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。
本发明实施例对检测出来的病灶区域还进行密度分析,通过密度分析可以确定对应病灶区域的性质,本发明实施例利用CT影像中的CT值来对各病灶区域进行密度分析。其中,所述CT值是测定人体某一局部组织或器官密度大小的一种计量单位,通常称亨氏单位(hounsfield unit ,HU)空气为-1000,致密骨为+1000,通过CT值可以了解CT影像中某个部位的成分属性。
详细地,所述对所述病灶区域进行密度分析,包括:
对每个所述病灶区域,从所述CT切片数据中提取与所述病灶区域对应位置的多个亨氏单位值;
对所述多个亨氏单位值进行统计,生成关于亨氏单位值数量的直方图;
根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果。
优选地,本发明实施例中所述分析结果可以是所述病灶区域的性质,包括纯磨玻璃病灶、实性病灶和半磨玻璃半实性病灶。
进一步地,所述根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果,包括:
基于所述直方图确定比例阈值条件;
根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果。
优选地,本发明实施例按照下述计算公式确定比例阈值条件:
Figure 508674DEST_PATH_IMAGE022
Figure 822850DEST_PATH_IMAGE023
其中,F(hu)表示所述直方图中符合要求的亨氏单位值的总数量,如
Figure 877394DEST_PATH_IMAGE024
为所述直方图中亨氏单位值大于-50的总数量。
进一步地,本发明实施例所述根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果,包括:
Figure 41659DEST_PATH_IMAGE025
其中,pGGO为纯磨玻璃病灶,solid为实性病灶,mGGO为半磨玻璃半实性病灶。
本发明实施例根据所述病灶密度确定所述病灶区域的性质,在传统的病灶检测分析模型对病灶进行量化分析的基础上增加定性分析,以实现对病灶多方面的分析,使病灶检测分析结果更加精确、全面。
优选地,本发明实施例通过提取亨氏单位直方图,采用阈值方式确定各病灶区域的性质,让后续的随访中,即使病灶区域相同,也能够通过病灶的性质与计算得出的定量数值来评估后期疗效,并依据结果制定后续治疗方案,从而帮助患者得到更好的治疗。
本发明实施例通过获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集,可以减少极端数据的干扰,确保结果的准确性;选择所述标准数据集中的一张切片数据,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,输入多张切片数据而不是单张切片数据,可以适配更多不同层厚的CT数据,提高模型的精确度;所述病灶分割模型中还采用了可切换的空洞卷积机制,可以识别出更多不同大小的病灶区域,提高病灶分割结果的准确度;同时还对所述病灶区域进行密度分析,对病灶区域的分析更加全面。因此本发明提出的病灶检测分析方法、装置及计算机可读存储介质,可以提高病灶分割的精度,并对病灶进行多方面的分析。
如图4所示,是本发明病灶检测分析装置的模块示意图。
本发明所述病灶检测分析装置100可以安装于电子设备中。根据实现的功能,所述病灶检测分析装置可以包括数据处理模块101、输入切片集获取模块102、病灶区域确定模块103和密度分析模块104。本发明所述模块也可以称之为单元,是指一种能够被电子设备处理器所执行,并且能够完成固定功能的一系列计算机程序段,其存储在电子设备的存储器中。
在本实施例中,关于各模块/单元的功能如下:
所述数据处理模块101,用于获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
本发明实施例中所述CT切片数据包括多个按顺序排列的医学影像图片,如肺炎患者的肺部CT影像,可以从医疗设备的数据库中获取。
优选地,所述CT切片数据可以从一区块链的节点中获取,通过将CT切片数据存储于区块链中,可以提高CT切片数据的安全性。
详细地,在将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集时,所述数据处理模块具体执行下述操作:
根据所述CT切片数据中各切片的像素值构建对应的三维矩阵;
利用下述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,得到归一化后的标准数据集:
Figure 80022DEST_PATH_IMAGE012
其中,
Figure 902616DEST_PATH_IMAGE010
为归一化的数据,/>
Figure 873983DEST_PATH_IMAGE011
为所述三维矩阵。
具体地,本发明实施例中利用上述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,是对所述三维矩阵中的每个元素,都用所述公式进行计算,得到计算结果;若所述计算结果大于1,则将所述元素的值赋值为1;若所述计算结果小于0,则将所述元素的值赋值为0。
优选地,当不同的特征成列在一起的时候,由于特征本身表达方式的原因会导致在绝对数值上的小数据被大数据覆盖的情况,因此对特征数据进行归一化处理,可以保证每个特征被分类器平等对待。
所述输入切片集获取模块102,用于选择所述标准数据集中的一张切片数据,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数。
优选地,所述标准数据集包含多个按顺序排列的切片图像,所述切片的顺序与各切片的Z轴值对应,排在前的Z轴值越小,排在后的则Z轴值越大。
优选地,本发明实施例中m和n可以相同,为1。
详细地,所述输入切片集获取模块102具体用于:
在所述标准数据集中选择一张切片S,并采用下述公式计算切片步长
Figure 740307DEST_PATH_IMAGE001
Figure 783743DEST_PATH_IMAGE026
其中,
Figure 393716DEST_PATH_IMAGE003
为所述标准数据集中的Z轴最大坐标;
根据所述切片步长采用下述公式依次计算与所述切片S的前n张切片和所述切片S的后m张切片在所述标准数据集中的位置,得到输入切片集:
Figure 626114DEST_PATH_IMAGE004
Figure 210811DEST_PATH_IMAGE005
其中,
Figure 692607DEST_PATH_IMAGE006
为所述切片S的z轴坐标,/>
Figure 903009DEST_PATH_IMAGE007
为所述切片S的前一张切片的z轴坐标,/>
Figure 770340DEST_PATH_IMAGE008
为所述切片S的后一张切片的z轴坐标。
优选地,传统的分割模型会输入单张切片或者先缩放再整体输入,本发明实施例在输入单张切片的同时,还输入前后两张切片,其中,前后两张切片的位置是根据层厚动态调整的,通过输入三张切片,可以提高病灶分割的精度。
所述病灶区域确定模块103,用于将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,根据所述特征数据确定病灶区域。
优选地,所述病灶分割模型是一种卷积神经网络模型,可以用于分类、检测和分割。所述病灶分割模型包括用于抽取抽象特征以扩大感受野的下采样层、用于恢复细节信息的上采样层和用于使用低层特征为高层特征补充细节信息的跳跃连接层。
详细地,所述病灶区域确定模块103具体用于:
利用所述病灶分割模型中的上采样层对所述输入切片集进行多次不同空洞率的空洞卷积、池化操作,得到多个尺度的特征图;
利用所述病灶分割模型中的跳跃连接层和下采样层将所述多个尺度的特征图进行融合,并输出病灶分割结果图,并根据所述病灶分割结果图确定病灶区域。
本发明实施例中利用所述病灶分割模型在输出时会对输出图片中各个像素点进行类别判断,判断其是否为病灶,通过输出的病灶分割结果图可以检测出对应所述CT切片数据中的病灶区域,并对所述病灶区域进行标识,分割出所述病灶区域。
较佳地,本发明实施例中所述病灶分割模型采用了可切换的空洞卷积(SAC,Switchable Atrous Convolution),可以以不同的空洞率对输入图片进行卷积,并使用switch函数合并卷积后的结果,通过上述卷积操作,使得所述病灶分割模型能够对不同大小区域的病灶进行不同的卷积,识别出更多病灶区域,输出病灶分割图,提高病灶分割结果的准确度。
可选地,本发明实施例在将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型之前,还包括对所述病灶分模型进行训练,具体如下:
获取训练集,并将所述训练集输入至所述病灶分割模型中,得到预测结果;
利用预设的损失函数对所述预测结果进行损失计算,得到损失函数值;
根据所述损失函数值反向传播更新所述病灶分割模型的参数;
返回上述的损失计算步骤,直到达到预设迭代次数,得到训练完成的病灶分割模型。
进一步地,所述损失函数包括:
Figure 244046DEST_PATH_IMAGE020
其中,
Figure 9877DEST_PATH_IMAGE021
为损失函数值,Y_true表示真实的病灶标签,Y_pred则表示所述卷积神经网络模型预测出的病灶标签,N是所述训练集的样本总数。
优选地,本发明实施例将经过训练后得到的模型作为病灶分割模型,通过所述病灶分割模型,即可预测肺炎病灶区域。
所述密度分析模块104,用于对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。
本发明实施例对检测出来的病灶区域还进行密度分析,通过密度分析可以确定对应病灶区域的性质,本发明实施例利用CT影像中的CT值来对各病灶区域进行密度分析。其中,所述CT值是测定人体某一局部组织或器官密度大小的一种计量单位,通常称亨氏单位(hounsfield unit ,HU)空气为-1000,致密骨为+1000,通过CT值可以了解CT影像中某个部位的成分属性。
详细地,在对所述病灶区域进行密度分析时,所述密度分析模块具体执行下述操作:
对每个所述病灶区域,从所述CT切片数据中提取与所述病灶区域对应位置的多个亨氏单位值;
对所述多个亨氏单位值进行统计,生成关于亨氏单位值数量的直方图;
根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果。
优选地,本发明实施例中所述分析结果可以是所述病灶区域的性质,包括纯磨玻璃病灶、实性病灶和半磨玻璃半实性病灶。
进一步地,所述根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果,包括:
基于所述直方图确定比例阈值条件;
根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果。
优选地,本发明实施例按照下述计算公式确定比例阈值条件:
Figure 243543DEST_PATH_IMAGE022
Figure 981692DEST_PATH_IMAGE023
其中,F(hu)表示所述直方图中符合要求的亨氏单位值的总数量,如
Figure 360721DEST_PATH_IMAGE024
为所述直方图中亨氏单位值大于-50的总数量。
进一步地,本发明实施例所述根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果,包括:
Figure 877764DEST_PATH_IMAGE027
其中,pGGO为纯磨玻璃病灶,solid为实性病灶,mGGO为半磨玻璃半实性病灶。
本发明实施例根据所述病灶密度确定所述病灶区域的性质,在传统的病灶检测分析模型对病灶进行量化分析的基础上增加定性分析,以实现对病灶多方面的分析,使病灶检测分析结果更加精确、全面。
优选地,本发明实施例通过提取亨氏单位直方图,采用阈值方式确定各病灶区域的性质,让后续的随访中,即使病灶区域相同,也能够通过病灶的性质与计算得出的定量数值来评估后期疗效,并依据结果制定后续治疗方案,从而帮助患者得到更好的治疗。
如图5所示,是本发明实现病灶检测分析方法的电子设备的结构示意图。
所述电子设备1可以包括处理器10、存储器11和总线,还可以包括存储在所述存储器11中并可在所述处理器10上运行的计算机程序,如病灶检测分析程序12。
其中,所述存储器11至少包括一种类型的可读存储介质,所述可读存储介质包括闪存、移动硬盘、多媒体卡、卡型存储器(例如:SD或DX存储器等)、磁性存储器、磁盘、光盘等。所述存储器11在一些实施例中可以是电子设备1的内部存储单元,例如该电子设备1的移动硬盘。所述存储器11在另一些实施例中也可以是电子设备1的外部存储设备,例如电子设备1上配备的插接式移动硬盘、智能存储卡(Smart Media Card, SMC)、安全数字(SecureDigital, SD)卡、闪存卡(Flash Card)等。进一步地,所述存储器11还可以既包括电子设备1的内部存储单元也包括外部存储设备。所述存储器11不仅可以用于存储安装于电子设备1的应用软件及各类数据,例如病灶检测分析程序12的代码等,还可以用于暂时地存储已经输出或者将要输出的数据。
所述处理器10在一些实施例中可以由集成电路组成,例如可以由单个封装的集成电路所组成,也可以是由多个相同功能或不同功能封装的集成电路所组成,包括一个或者多个中央处理器(Central Processing unit,CPU)、微处理器、数字处理芯片、图形处理器及各种控制芯片的组合等。所述处理器10是所述电子设备的控制核心(Control Unit),利用各种接口和线路连接整个电子设备的各个部件,通过运行或执行存储在所述存储器11内的程序或者模块(例如执行病灶检测分析程序等),以及调用存储在所述存储器11内的数据,以执行电子设备1的各种功能和处理数据。
所述总线可以是外设部件互连标准(peripheral component interconnect,简称PCI)总线或扩展工业标准结构(extended industry standard architecture,简称EISA)总线等。该总线可以分为地址总线、数据总线、控制总线等。所述总线被设置为实现所述存储器11以及至少一个处理器10等之间的连接通信。
图5仅示出了具有部件的电子设备,本领域技术人员可以理解的是,图5示出的结构并不构成对所述电子设备1的限定,可以包括比图示更少或者更多的部件,或者组合某些部件,或者不同的部件布置。
例如,尽管未示出,所述电子设备1还可以包括给各个部件供电的电源(比如电池),优选地,电源可以通过电源管理装置与所述至少一个处理器10逻辑相连,从而通过电源管理装置实现充电管理、放电管理、以及功耗管理等功能。电源还可以包括一个或一个以上的直流或交流电源、再充电装置、电源故障检测电路、电源转换器或者逆变器、电源状态指示器等任意组件。所述电子设备1还可以包括多种传感器、蓝牙模块、Wi-Fi模块等,在此不再赘述。
进一步地,所述电子设备1还可以包括网络接口,可选地,所述网络接口可以包括有线接口和/或无线接口(如WI-FI接口、蓝牙接口等),通常用于在该电子设备1与其他电子设备之间建立通信连接。
可选地,该电子设备1还可以包括用户接口,用户接口可以是显示器(Display)、输入单元(比如键盘(Keyboard)),可选地,用户接口还可以是标准的有线接口、无线接口。可选地,在一些实施例中,显示器可以是LED显示器、液晶显示器、触控式液晶显示器以及OLED(Organic Light-Emitting Diode,有机发光二极管)触摸器等。其中,显示器也可以适当的称为显示屏或显示单元,用于显示在电子设备1中处理的信息以及用于显示可视化的用户界面。
应该了解,所述实施例仅为说明之用,在专利申请范围上并不受此结构的限制。
所述电子设备1中的所述存储器11存储的病灶检测分析程序12是多个计算机程序的组合,在所述处理器10中运行时,可以实现:
获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
选择所述标准数据集中的一张切片数据,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数;
将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;
对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户。
进一步地,所述电子设备1集成的模块/单元如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。所述计算机可读介质可以包括:能够携带所述计算机程序代码的任何实体或装置、记录介质、U盘、移动硬盘、磁碟、光盘、计算机存储器、只读存储器(ROM,Read-Only Memory)。
进一步地,所述计算机可用存储介质可主要包括存储程序区和存储数据区,其中,存储程序区可存储操作系统、至少一个功能所需的应用程序等;存储数据区可存储根据区块链节点的使用所创建的数据等。
在本发明所提供的几个实施例中,应该理解到,所揭露的设备,装置和方法,可以通过其它的方式实现。例如,以上所描述的装置实施例仅仅是示意性的,例如,所述模块的划分,仅仅为一种逻辑功能划分,实际实现时可以有另外的划分方式。
所述作为分离部件说明的模块可以是或者也可以不是物理上分开的,作为模块显示的部件可以是或者也可以不是物理单元,即可以位于一个地方,或者也可以分布到多个网络单元上。可以根据实际的需要选择其中的部分或者全部模块来实现本实施例方案的目的。
另外,在本发明各个实施例中的各功能模块可以集成在一个处理单元中,也可以是各个单元单独物理存在,也可以两个或两个以上单元集成在一个单元中。上述集成的单元既可以采用硬件的形式实现,也可以采用硬件加软件功能模块的形式实现。
对于本领域技术人员而言,显然本发明不限于上述示范性实施例的细节,而且在不背离本发明的精神或基本特征的情况下,能够以其他的具体形式实现本发明。
因此,无论从哪一点来看,均应将实施例看作是示范性的,而且是非限制性的,本发明的范围由所附权利要求而不是上述说明限定,因此旨在将落在权利要求的等同要件的含义和范围内的所有变化涵括在本发明内。不应将权利要求中的任何附关联图表记视为限制所涉及的权利要求。
本发明所指区块链是分布式数据存储、点对点传输、共识机制、加密算法等计算机技术的新型应用模式。区块链(Blockchain),本质上是一个去中心化的数据库,是一串使用密码学方法相关联产生的数据块,每一个数据块中包含了一批次网络交易的信息,用于验证其信息的有效性(防伪)和生成下一个区块。区块链可以包括区块链底层平台、平台产品服务层以及应用服务层等。
此外,显然“包括”一词不排除其他单元或步骤,单数不排除复数。系统权利要求中陈述的多个单元或装置也可以由一个单元或装置通过软件或者硬件来实现。第二等词语用来表示名称,而并不表示任何特定的顺序。
最后应说明的是,以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或等同替换,而不脱离本发明技术方案的精神和范围。

Claims (9)

1.一种病灶检测分析方法,其特征在于,所述方法包括:
获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数;
将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;
对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户;
其中,所述选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,包括:
在所述标准数据集中选择其中一张切片S,并采用下述公式计算切片步长
Figure QLYQS_1
Figure QLYQS_2
其中,
Figure QLYQS_3
为所述标准数据集中的Z轴最大坐标;
根据所述切片步长采用下述公式依次计算与所述切片S的前n张切片和所述切片S的后m张切片在所述标准数据集中的位置,得到输入切片集:
Figure QLYQS_4
Figure QLYQS_5
其中,
Figure QLYQS_6
为所述切片S的z轴坐标,/>
Figure QLYQS_7
为所述切片S的前一张切片的z轴坐标,/>
Figure QLYQS_8
为所述切片S的后一张切片的z轴坐标。
2.如权利要求1所述的病灶检测分析方法,其特征在于,所述利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域,包括:
利用所述病灶分割模型中的上采样层对所述输入切片集进行多次不同空洞率的空洞卷积、池化操作,得到多个尺度的特征图;
利用所述病灶分割模型中的跳跃连接层和下采样层将所述多个尺度的特征图进行融合,并输出病灶分割结果图,并根据所述病灶分割结果图确定病灶区域。
3.如权利要求2所述的病灶检测分析方法,其特征在于,在将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型之前,该方法还包括:
获取训练集,并将所述训练集输入至所述病灶分割模型中,得到预测结果;
利用预设的损失函数对所述预测结果进行损失计算,得到损失函数值;
根据所述损失函数值反向传播更新所述病灶分割模型的参数;
返回上述的损失计算步骤,直到达到预设迭代次数,得到训练完成的病灶分割模型。
4.如权利要求1中所述的病灶检测分析方法,其特征在于,所述对所述病灶区域进行密度分析,包括:
对每个所述病灶区域,从所述CT切片数据中提取与所述病灶区域对应位置的多个亨氏单位值;
对所述多个亨氏单位值进行统计,生成关于亨氏单位值数量的直方图;
根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果。
5.如权利要求4所述的病灶检测分析方法,其特征在于,所述根据所述直方图确定所述病灶区域的分析结果,包括:
基于所述直方图确定比例阈值条件;
根据所述比例阈值条件确定所述病灶的分析结果。
6.如权利要求1所述的病灶检测分析方法,其特征在于,所述将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集,包括:
根据所述CT切片数据中各切片的像素值构建对应的三维矩阵;
利用下述公式对所述三维矩阵进行归一化处理,得到归一化后的标准数据集:
Figure QLYQS_9
其中,
Figure QLYQS_10
为归一化的数据,/>
Figure QLYQS_11
为所述三维矩阵。
7.一种病灶检测分析装置,其特征在于,所述装置包括:
数据处理模块,用于获取CT切片数据,将所述CT切片数据进行归一化操作,得到标准数据集;
输入切片集获取模块,用于选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,其中,n和m为大于等于1的整数;
病灶区域确定模块,用于将所述输入切片集输入至预先构建的病灶分割模型,利用所述病灶分割模型对所述输入切片集进行空洞卷积,提取所述输入切片集的特征数据,并根据所述特征数据确定病灶区域;
密度分析模块,用于对所述病灶区域进行密度分析,将所述密度分析的结果反馈给用户;
其中,所述选择所述标准数据集中的其中一张切片,根据所述标准数据集计算切片步长,并根据所述切片步长在所述标准数据集中选择所述切片的前n张切片和所述切片的后m张切片,得到输入切片集,包括:
在所述标准数据集中选择其中一张切片S,并采用下述公式计算切片步长
Figure QLYQS_12
Figure QLYQS_13
其中,
Figure QLYQS_14
为所述标准数据集中的Z轴最大坐标;
根据所述切片步长采用下述公式依次计算与所述切片S的前n张切片和所述切片S的后m张切片在所述标准数据集中的位置,得到输入切片集:
Figure QLYQS_15
Figure QLYQS_16
其中,
Figure QLYQS_17
为所述切片S的z轴坐标,/>
Figure QLYQS_18
为所述切片S的前一张切片的z轴坐标,/>
Figure QLYQS_19
为所述切片S的后一张切片的z轴坐标。
8.一种电子设备,其特征在于,所述电子设备包括:
至少一个处理器;以及,
与所述至少一个处理器通信连接的存储器;其中,
所述存储器存储有可被所述至少一个处理器执行的计算机程序,所述计算机程序被所述至少一个处理器执行,以使所述至少一个处理器能够执行如权利要求1至6中任一项所述的病灶检测分析方法。
9.一种计算机可读存储介质,包括存储数据区和存储程序区,存储数据区存储创建的数据,存储程序区存储有计算机程序;其中,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至6中任一项所述的病灶检测分析方法。
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