CN111063390A - 一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统 - Google Patents

一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统 Download PDF

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Abstract

本申请提供了一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统，其特征在于，包括：获取待检测基因；将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。该方案能够快速准确的对待检测基因中的融合基因数据进行检测。

Description

一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统
技术领域
本申请涉及基因技术领域，具体而言，本申请涉及一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统。
背景技术
所谓融合基因，是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下，构成的嵌合基因。
融合基因的表达产物为融合蛋白。根据构成融合基因的种类，可以将融合基因分为四大类：(1)由报告基因和功能基因构成的融合基因。常用的报告基因有：GFP(绿色荧光蛋白)基因、GUS基因、LacZ基因和Luciferasese(虫荧光素酶)基因等，主要目的是对功能基因进行示踪，研究其功能及特性。(2)由信号肽或单体蛋白的序列与功能基因构成的融合基因。其主要目的是利用信号肽或单体序列携带目的基因高效表达，从而提取纯化目的蛋白，为生产或科研所用。(3)功能基因与功能基因的融合。可分为两类：A相同功能基因的融合，目的是增强基因的功能，扩大基因的应用范围，如杀虫基因之间的融合。B不同功能基因的融合，为特殊需要而构建，如生产无毒疫苗等。(4)报告基因与抗药性基因的融合用于构建融合载体，以利于插入大片段的cDNA或作为双功能标记。
大数据(big data)，是指无法在一定时间范围内用常规软件工具进行捕捉、管理和处理的数据集合，是需要新处理模式才能具有更强的决策力、洞察发现力和流程优化能力的海量、高增长率和多样化的信息资产。
目前，亟需提供一种基于大数据的融合基因数据检测方法。
发明内容
本申请的目的旨在至少能解决上述的技术缺陷之一，特提出以下技术方案：
第一方面，本申请实施例提供了一种基于大数据的融合基因数据检测方法，包括：
获取待检测基因；
将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
在本申请的一种可选实施例中，所述获取待检测基因，包括：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
在本申请的一种可选实施例中，所述方法还包括：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
在本申请的一种可选实施例中，所述根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，包括：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
第二方面，本申请实施例提供了一种基于大数据的融合基因数据检测系统，包括：
获取模块，用于获取待检测基因；
比对模块，用于将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
检测模块，用于若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
在本申请的一种可选实施例中，所述获取模块具体用于：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
在本申请的一种可选实施例中，所述系统还包括构建模块，用于：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
在本申请的一种可选实施例中，所述比对模块具体用于：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
第三方面，本申请实施例提供了一种电子设备，包括存储器和处理器；
存储器中存储有计算机程序；
处理器，用于执行计算机程序以实现第一方面实施例中所提供的方法。
第四方面，本申请实施例提供了一种计算机可读存储介质，计算机可读存储介质上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现第一方面实施例中所提供的方法。
本申请提供的一种基于大数据的融合基因数据检测方法及系统，将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，该方法能够快速准确的对待检测基因中的融合基因数据进行检测。
附图说明
为了更清楚地说明本申请实施例中的技术方案，下面将对本申请实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍。
图1为本申请实施例提供的一种基于大数据的融合基因数据检测方法的流程示意图；
图2为本申请实施例提供的一种基于大数据的融合基因数据检测系统的结构框图；
图3为本申请实施例提供的一种电子设备的结构示意图。
具体实施方式
下面详细描述本申请的实施例，所述实施例的示例在附图中示出，其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的，仅用于解释本申请，而不能解释为对本发明的限制。
本技术领域技术人员可以理解，除非特意声明，这里使用的单数形式“一”、“一个”、“所述”和“该”也可包括复数形式。应该进一步理解的是，本申请的说明书中使用的措辞“包括”是指存在所述特征、整数、步骤、操作、元件和/或组件，但是并不排除存在或添加一个或多个其他特征、整数、步骤、操作、元件、组件和/或它们的组。应该理解，当我们称元件被“连接”或“耦接”到另一元件时，它可以直接连接或耦接到其他元件，或者也可以存在中间元件。此外，这里使用的“连接”或“耦接”可以包括无线连接或无线耦接。这里使用的措辞“和/或”包括一个或更多个相关联的列出项的全部或任一单元和全部组合。
为使本申请的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合附图对本申请实施方式作进一步地详细描述。
图1为本申请实施例提供的一种基于大数据的融合基因数据检测方法的流程示意图，如图1所示，该方法包括：
S101，获取待检测基因；
S102，将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
S103，若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
其中，利用基因获取装置获取待检测基因，该待检测基因中可能存在融合基因，是否携带融合基因，以及携带的融合基因的多少，都对病理分析具有很重要的指导作用。因此，需要对待检测基因进行融合基因数据的检测。
具体的，对待检测基因中的融合基因数据进行检测时，采用将其与预设大数据基因数据库中的基因数据进行一一比对的方法，或者对大数据基因数据库中的基因数据进行筛选后，再将待检测基因与筛选得到的金银数据进行一一比对。
本申请提供的一种基于大数据的融合基因数据检测方法，将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，该方法能够快速准确的对待检测基因中的融合基因数据进行检测。
在本申请的一种可选实施例中，所述获取待检测基因，包括：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
在本申请的一种可选实施例中，所述方法还包括：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
在本申请的一种可选实施例中，所述根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，包括：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
图2是本申请实施例提供的一种基于大数据的融合基因数据检测系统，该系统200包括：获取模块201、比对模块202和检测模块203，其中，
获取模块201用于获取待检测基因；
比对模块202用于将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
检测模块203用于若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
本申请提供的一种基于大数据的融合基因数据检测系统，将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，该方法能够快速准确的对待检测基因中的融合基因数据进行检测。
在本申请的一种可选实施例中，所述获取模块具体用于：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
在本申请的一种可选实施例中，所述系统还包括构建模块，用于：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
在本申请的一种可选实施例中，所述比对模块具体用于：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
基于相同的原理，本申请实施例还提供了一种电子设备，该电子设备包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，处理器执行该计算机程序时，实现本申请任一可选实施例中所提供的方法，具体可实现如下情况：
获取待检测基因；将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
本申请实施例提供了一种计算机可读存储介质，该计算机可读存储介质上存储有计算机程序，该程序被处理器执行时实现本申请任一实施例所示的方法。
可以理解的是，介质中存储的可以是基于大数据的融合基因数据检测方法对应的计算机程序。
图3中示出了本申请实施例所适用的一种电子设备的结构示意图，如图3所示，图3所示的电子设备300包括：处理器301和存储器303。其中，处理器301和存储器303相连，如通过总线302相连。进一步地，电子设备300还可以包括收发器304，电子设备300可以通过收发器304与其他电子设备进行数据的交互。需要说明的是，实际应用中收发器304不限于一个，该电子设备300的结构并不构成对本申请实施例的限定。
其中，处理器301应用于本申请实施例中，可以用于实现图2所示的获取模块、比对模块以及检测模块的功能。
处理器301可以是CPU，通用处理器，DSP，ASIC，FPGA或者其他可编程逻辑器件、晶体管逻辑器件、硬件部件或者其任意组合。其可以实现或执行结合本申请公开内容所描述的各种示例性的逻辑方框，模块和电路。处理器301也可以是实现计算功能的组合，例如包含一个或多个微处理器组合，DSP和微处理器的组合等。
总线302可包括一通路，在上述组件之间传送信息。总线302可以是PCI总线或EISA总线等。总线302可以分为地址总线、数据总线、控制总线等。为便于表示，图3中仅用一条粗线表示，但并不表示仅有一根总线或一种类型的总线。
存储器303可以是ROM或可存储静态信息和指令的其他类型的静态存储设备，RAM或者可存储信息和指令的其他类型的动态存储设备，也可以是EEPROM、CD-ROM或其他光盘存储、光碟存储(包括压缩光碟、激光碟、光碟、数字通用光碟、蓝光光碟等)、磁盘存储介质或者其他磁存储设备、或者能够用于携带或存储具有指令或数据结构形式的期望的程序代码并能够由计算机存取的任何其他介质，但不限于此。
存储器303用于存储执行本申请方案的应用程序代码，并由处理器301来控制执行。处理器301用于执行存储器303中存储的应用程序代码，以实现图2所示实施例提供的基于大数据的融合基因数据检测系统的动作。
应该理解的是，虽然附图的流程图中的各个步骤按照箭头的指示依次显示，但是这些步骤并不是必然按照箭头指示的顺序依次执行。除非本文中有明确的说明，这些步骤的执行并没有严格的顺序限制，其可以以其他的顺序执行。而且，附图的流程图中的至少一部分步骤可以包括多个子步骤或者多个阶段，这些子步骤或者阶段并不必然是在同一时刻执行完成，而是可以在不同的时刻执行，其执行顺序也不必然是依次进行，而是可以与其他步骤或者其他步骤的子步骤或者阶段的至少一部分轮流或者交替地执行。
以上仅是本申请的部分实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本申请原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本申请的保护范围。

Claims (10)

1.一种基于大数据的融合基因数据检测方法，其特征在于，包括：
获取待检测基因；
将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取待检测基因，包括：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据，包括：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
5.一种基于大数据的融合基因数据检测系统，其特征在于，包括：
获取模块，用于获取待检测基因；
比对模块，用于将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对；其中，所述预设大数据基因数据库中都存储有各基因数据对应的融合基因数据；
检测模块，用于若比对得到与所述待检测基因相匹配的基因数据，则根据所述相匹配的基因数据获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
6.根据权利要求5所述的系统，其特征在于，所述获取模块具体用于：
获取所述待检测基因的基因序列；
所述将所述待检测基因与预设大数据基因数据库中的基因数据进行比对，包括：
将所述待检测基因的基因序列与所述预设大数据基因数据库中的基因数据对应的基因序列进行比对。
7.根据权利要求5所述的系统，其特征在于，所述系统还包括构建模块，用于：
获取融合基于相关的大数据；
基于所述融合数据相关的大数据构建所述预设大数据基因数据库。
8.根据权利要求5所述的系统，其特征在于，所述比对模块具体用于：
基于所述预设大数据基因数据库中数据的存储规则和所述相匹配的基因数据，获取所述待监测基因对应的融合基因数据。
9.一种电子设备，其特征在于，包括存储器和处理器；
所述存储器中存储有计算机程序；
所述处理器，用于执行所述计算机程序以实现权利要求1至5中任一项所述的方法。
10.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至5中任一项所述的方法。
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