CN110596397B - 一种用于结核耐药诊断的血清蛋白标志物及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了血清蛋白标志物作为结核耐药诊断标志物的应用,其中,血清蛋白为补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)、α‑2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α‑1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1‑47蛋白(IGLV1‑47)、V4‑31蛋白(IGHV4‑31)中的至少一种。根据不同结核耐药类型个体的血清蛋白进行分析,从血清蛋白的角度为结核耐药的靶向治疗提供新的思路。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物医学领域,特别涉及一种用于结核耐药诊断的血清蛋白标志物及其应用。
背景技术
结核(Tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)引起的一种严重传染性疾病,特别是在发展中国家仍然是传染性相关疾病主要的发病和致死疾病之一。每年结核分枝杆菌感染致病的达860万人。WHO 2013年的报告中显示多耐药结核(Multidrug-resistant TB,MDR-TB)出现在所有国家并且全球每年有4万的新发MDR-TB病例,在全球的新发TB患者占了3.6%,并且在不断增长。MDR-TB是结核分枝杆菌至少对异烟肼(isoniazid,INH)和利福平(rifampicin,RIF)这两个抗结核治疗一线药物耐药,是导致患者死亡的主要原因,大多数结核病相关的死亡可以通过早期诊断和治疗进行预防,这提示我们使用快速、准确的工具对于结核的早期诊断异常重要。
耐药结核的诊断主要包括表型检测和分子基因型检测。传统药物敏感性检测(drug susceptibility testing,DST)是耐药结核检测的金标准,但总体而言,基于结核菌培养的表型检测技术检测周期长、操作复杂、不易标准化,不能充分满足临床快速诊断的需要。此外,部分标本因结核菌含量低、培养阴性,无法进行耐药性检测。分子基因型药敏检测技术与培养法相比具有检测迅速、特异性和灵敏度高的特点,周期短至1-2d,但它无法鉴定未知的耐药突变和部分一、二线药物耐药突变,且对异质性耐药标本检测敏感性低,因此临床上不能完全取代表型检测技术。总之,目前TB耐药的常规实验室检测缺乏足够的灵敏度和特异性。
抗体检测是一项感染性疾病常用的诊断方法,抗体的产生通常是感染后抗原暴露的结果,优势抗原是诊断和免疫治疗的首要靶标。在疾病活动期结核分枝杆菌抗原的释放检测被认为是一个特异性高的理想方法在TB的血清学诊断中。但至今没有商品化的耐药TB血清诊断产品。随着质谱分析的发展,使得蛋白组检测作为一种诊断技术成为可能。利用蛋白质芯片和质谱技术,可以检测疾病血清中的蛋白,并筛选出特定的蛋白作为疾病的诊断标志物。现在我们基于LC-MS/MS的平台能鉴定出数千种蛋白,并能对其进行准确定量。蛋白组学被认为是研究复杂生物样本蛋白组成的有力工具,蛋白组学不仅能揭示蛋白表达信息,还能显示蛋白间的互作和信号网络。对于MDR-TB患者血清蛋白组的研究将进一步的揭示TB不同耐药类型的耐药机制和诊断标志物。对于新药、疫苗和快速诊断工具的开发有重大意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于结核耐药诊断的血清蛋白标志物及其应用。
本发明所采取的技术方案是:
血清蛋白标志物作为结核耐药诊断标志物的应用,其中,血清蛋白为补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)、α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)中的至少一种。
进一步地,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)用于预测结核耐异烟肼药物风险。
进一步地,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)相对于结核药敏患者血清蛋白丰度上调标志着结核耐异烟肼药物风险高。
进一步地,α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)用于预测结核耐利福平药物风险。
进一步地,α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)相对于结核药敏患者血清蛋白丰度上调标志着结核耐利福平药物风险高。
定量血清蛋白含量的试剂在制备结核耐药诊断试剂中的应用,其中,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)、α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)中的至少一种。
进一步地,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)用于预测结核耐异烟肼药物风险。
进一步地,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)相对于结核药敏患者血清蛋白丰度上调标志着结核耐异烟肼药物风险高。
进一步地,α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)用于预测结核耐利福平药物风险。
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本发明的有益效果是:
本发明提供了一种快速诊断结核耐药类型的生物标志物。根据不同结核耐药类型个体的血清蛋白进行分析,从血清蛋白的角度为结核耐药的靶向治疗提供新的思路。
附图说明
图1蛋白多肽图谱在MR-INH和DS中的表达:(A)KRT9(B)C4B(C)C4A(D)LDHB(峰高:MR-INH组,峰低:DS组);
图2蛋白多肽图谱在MR-RFP和DS中的表达:(A)TF(B)F11(C)JCHAIN(D)IGHA1(E)IGLV1-47(F)IGHV4-31(G)IGHM(H)A2M(峰高:MR-RFP组,峰低:DS组)。
具体实施方式
发明人基于测定的总计4例结核药敏(drug sensitivity,DS)、3例单耐药异烟肼(monoresistanceisoniazide,MR-INH)、3例单耐药利福平(monoresistance rifampin,MR-RFP)患者的血清样本蛋白组结果分析,鉴别出其中的蛋白标志物。
耐异烟肼和药敏组差异蛋白的相对丰度如表1所示,蛋白的多肽图谱如图1所示。
表1耐异烟肼(MR-INH)和药敏组(DS)差异蛋白的相对丰度
通过对结核异烟肼耐药个体和结核药敏个体的血清样本的蛋白丰度进行差异比较分析,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)在结核异烟肼耐药个体的痰液样本含量显著高于结核药敏个体的含量,且具有统计学意义,因此补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)作为结核耐异烟肼的潜在标志物,四种蛋白的丰度上调标志着结核耐异烟肼风险高。
耐利福平和药敏组差异蛋白的相对丰度如表2所示,蛋白的多肽图谱如图2所示。
表2耐利福平(MR-RFP)和药敏组(DS)差异蛋白的相对丰度
通过对耐利福平个体和结核药敏个体的痰液样本的微生物丰度进行差异比较分析,α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)在结核利福平耐药个体的痰液样本含量显著高于结核药敏个体的含量,且具有统计学意义,因此α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)作为结核耐利福平的潜在标志物,其丰度的上调标志着结核耐利福平风险高。
利用上述差异蛋白为标志物,预测个体耐药类型。
标志物及预测模型效果验证
发明人另外收集了共30个样品作为测试集,其中药敏12人,耐异烟肼10人,耐利福平8人。所述的蛋白标志物在人群中的丰度情况如表3~4所示:
表3耐异烟肼(MR-INH)和药敏组(DS)差异蛋白的相对丰度
表4耐利福平(MR-RFP)和药敏组(DS)差异蛋白的相对丰度
预测结果如表5~6所示,发现本发明中的标志物及预测模型表现良好。对于耐异烟肼分类模型,模型预测了10个阳性结果,通过混淆矩阵评估,其中8个真阳性,1个假阳性,2个假阴性,准确度达到了90%(表5)。对于耐利福平,模型预测了8个阳性结果,其中6个真阳性,2个假阳性,2个假阴性结果,准确度达到了86.67%(表6)。
表5耐异烟肼分类模型评估混淆矩阵
表6耐利福平分类模型评估混淆矩阵
Claims (3)
1.血清蛋白标志物作为结核耐药诊断标志物在制备结核耐药诊断试剂中的应用,其特征在于,所述血清蛋白标志物由补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)、α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)组成,其中,补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)用于预测结核耐异烟肼药物风险;α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)用于预测结核耐利福平药物风险。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:补体蛋白C4A(C4A)、补体蛋白C4B(C4B)、乳酸脱氢酶B(LDHB)、角蛋白9(KRT9)相对于结核药敏患者血清蛋白丰度上调标志着结核耐异烟肼药物风险高。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:α-2巨球蛋白(A2M)、凝血因子XI(F11)、血清铁传递蛋白(TF)、免疫球蛋白α-1(IGHA1)、免疫球蛋白(IGHM)、免疫球蛋白J链(JCHAIN)、V1-47蛋白(IGLV1-47)、V4-31蛋白(IGHV4-31)相对于结核药敏患者血清蛋白丰度上调标志着结核耐利福平药物风险高。
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