CN110263684B - 基于轻量级神经网络的心电图分类方法 - Google Patents

基于轻量级神经网络的心电图分类方法 Download PDF

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Abstract

一种基于轻量级神经网络的心电图分类方法,通过单导联心电图数据和轻量级神经网络模型实现心律失常自动分类的方法。首先,肢体II导联心电信号蕴含足够的信息;其次,使用卷积核大小为1的卷积层和全局平均池化层压缩特征维度;最后使用流线型的深度可分离卷积快速提取特征。利用单导联数据集和轻量级神经网络模型可以在保证模型准确率的基础上大幅度提高模型运算速度。

Description

基于轻量级神经网络的心电图分类方法
技术领域
本发明涉及心电图分类技术领域,具体涉及一种基于轻量级神经网络的心电图分类方法。
背景技术
心电图检查在医院已成为常见检验项目,心电图是医生判断病人心脏状况最基本的指标。心电图信号是由心脏的电活动引起的非平稳周期性生物信号,蕴含大量复杂的心脏活动信息,只有经过专业培训的医生才能准确解读。因为心脏结构复杂和心脏活动规律较多,所以心律失常类型分类较多。普通的深度学习方法虽然预测结果较好,但是网络过于复杂,在计算能力有限的平台上难以满足实时性要求。
发明内容
本发明为了克服以上技术的不足,提供了一种提高网络学习精度的轻量级神经网络(LNet)的心电图分类方法。
本发明克服其技术问题所采用的技术方案是:
一种基于轻量级神经网络的心电图分类方法,包括如下步骤:
a)计算机从MIT-BIH心律失常数据库中获取心电数据,根据心电数据中导联记录内容,选择upper信号为Ⅱ导联信号作为实验数据;
b)使用基于双尺度小波变换法对实验数据进行降噪处理,定位实验数据中的QRS波群,通过QRS波群获取心电信号中的P波和T波的位置,获取一个心拍数据,通过边缘填充随机剪裁算法得到心拍数据的扩充数据集;
c)对扩充数据集添加高斯白噪声,得到数据集集合,通过公式Xi={x11,x12,...,x1N}计算数据集集合中第i个样本Xi,式中x11为心电数据中肢体II导联信号第1个点位电压,N为心电数据中肢体II导联信号使用的像素点个数;
d)通过包含c1个卷积核的一维卷积层Conv1D对数据集集合提取特征,得到特征图a1,其中c1为特征图a1通道数,w1为特征图a1每个通道特征宽度,从特征图a1抽取得到第k个通道的特征图
Figure GDA0002796842520000021
e)通过卷积核为1的卷积层将特征图
Figure GDA0002796842520000022
进行压缩,得到压缩特征图a2.1,其中压缩特征图a2.1通道数为c2.1,压缩特征图a2.1每个通道特征宽度为w2.1,通过深度卷积层计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure GDA0002796842520000023
其中压缩特征图
Figure GDA0002796842520000024
的通道数为c2.2,压缩特征图
Figure GDA0002796842520000025
的每个通道特征宽度为w2.2
f)通过批处理层,利用公式
Figure GDA0002796842520000026
计算压缩特征图
Figure GDA0002796842520000027
归一化数据均值u2.2,式中
Figure GDA0002796842520000028
为压缩特征图
Figure GDA0002796842520000029
第k个通道的第i个特征,通过公式
Figure GDA00027968425200000210
计算压缩特征图
Figure GDA00027968425200000211
归一化数据方差σ2.2,通过公式
Figure GDA00027968425200000212
计算压缩特征图
Figure GDA00027968425200000213
规范化函数BNγ,β(a2.2),其中
Figure GDA00027968425200000214
式中ε为常数,式中0<ε<0.001,γ为线性规范化的斜率,β为线性规范化的截距,a2.3为a2.2批规范化的结果;
g)通过非线性激活层,利用公式
Figure GDA00027968425200000215
计算得到线性修正结果a2.4,通过逐点卷积层对线性修正结果a2.4计算得到扩张特征图a2.5,通过批处理层和ReLU激活函数对扩张特征图a2.5计算得到特征图a2,其中特征图a2的通道数为c2,特征图a2的每个通道特征宽度为w2
h)通过最大池化层,计算特征图a2压缩后的结果特征图a3
i)用结果特征图a3替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a4,其中心电特征图a4的通道数为c4,心电特征图a4的每个通道特征宽度为w4
j)通过池化层,计算心电特征图a4压缩后的结果特征图a5
k)用结果特征图a5替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a6,其中心电特征图a6的通道数为c6,心电特征图a6的每个通道特征宽度为w6
l)通过全局平均池化层,利用公式
Figure GDA0002796842520000031
计算压缩得到的结果特征图a7,式中ai 6是第i个位置的特征;
m)通过展平层将结果特征图a7展平成为一维向量a8,通过全连接层根据公式a9=Wi 8·a8+b8计算样本对应每类疾病得分a9,式中Wi 8是全连接层权重,b8为全连接层偏倚,通过softmax激活函数根据公式
Figure GDA0002796842520000032
计算预测结果a10,其中
Figure GDA0002796842520000033
表示对第i类疾病预测得分,
Figure GDA0002796842520000034
表示对第j类疾病预测得分;
n)使用交叉熵函数计算预测结果a10的损失,如果损失小于制定阈值Threshold则跳转至步骤p),如果损失大于等于制定阈值Threshold则跳转至步骤o);
o)使用Adam优化算法调整模型参数,跳转至步骤e);
p)保存模型参数,算法结束。
进一步的,步骤c)中对扩充数据集分别添加信噪比为40db、60db和80db的高斯白噪声,形成40db数据集、60db数据集和80db数据集,40db数据集、60db数据集和80db数据集构成数据集集合。
进一步的,步骤c)中N=64。
进一步的,步骤d)中通过公式
Figure GDA0002796842520000041
计算得到一个通道特征向量的宽度w1,式中F为卷积核大小,P为边缘填充密度,S为步长,通过公式
Figure GDA0002796842520000042
计算第k个通道的特征图,其中
Figure GDA0002796842520000043
为卷积层第1层第k个通道的权重,
Figure GDA0002796842520000044
为卷积层第1层第k个通道的偏倚,Conv1D为一维卷积神经网络计算函数。
进一步的,步骤e)中通过公式
Figure GDA0002796842520000045
计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure GDA0002796842520000046
式中,
Figure GDA0002796842520000047
为深度卷积层的权重,
Figure GDA0002796842520000048
为深度卷积层的偏倚。
进一步的,步骤n)中制定阈值Threshold=0.001。
进一步的,步骤n)使用Adam优化算法调整步骤d)中的权重
Figure GDA0002796842520000049
偏倚
Figure GDA00027968425200000410
调整步骤e)中的权重
Figure GDA00027968425200000411
偏倚
Figure GDA00027968425200000412
调整步骤m)中的权重Wi 8、偏倚b8
本发明的有益效果是:通过单导联心电图数据和轻量级神经网络模型实现心律失常自动分类的方法。首先,肢体II导联心电信号蕴含足够的信息;其次,使用卷积核大小为1的卷积层和全局平均池化层压缩特征维度;最后使用流线型的深度可分离卷积快速提取特征。利用单导联数据集和轻量级神经网络模型可以在保证模型准确率的基础上大幅度提高模型运算速度。
具体实施方式
下面对本发明做进一步说明。
一种基于轻量级神经网络的心电图分类方法,包括如下步骤:
a)计算机从MIT-BIH心律失常数据库中获取心电数据,根据心电数据中导联记录内容,选择upper信号为Ⅱ导联信号作为实验数据;
b)使用基于双尺度小波变换法对实验数据进行降噪处理,定位实验数据中的QRS波群,通过QRS波群获取心电信号中的P波和T波的位置,获取一个心拍数据,通过边缘填充随机剪裁算法得到心拍数据的扩充数据集;
c)对扩充数据集添加高斯白噪声,得到数据集集合,通过公式Xi={x11,x12,...,x1N}计算数据集集合中第i个样本Xi,式中x11为心电数据中肢体II导联信号第1个点位电压,N为心电数据中肢体II导联信号使用的像素点个数;
d)通过包含c1个卷积核的一维卷积层Conv1D对数据集集合提取特征,得到特征图a1,其中c1为特征图a1通道数,w1为特征图a1每个通道特征宽度,从特征图a1抽取得到第k个通道的特征图
Figure GDA0002796842520000051
e)通过卷积核为1的卷积层将特征图
Figure GDA0002796842520000052
进行压缩,得到压缩特征图a2.1,其中压缩特征图a2.1通道数为c2.1,压缩特征图a2.1每个通道特征宽度为w2.1,通过深度卷积层计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure GDA0002796842520000053
其中压缩特征图
Figure GDA0002796842520000054
的通道数为c2.2,压缩特征图
Figure GDA0002796842520000055
的每个通道特征宽度为w2.2
f)通过批处理层,利用公式
Figure GDA0002796842520000056
计算压缩特征图
Figure GDA0002796842520000057
归一化数据均值u2.2,式中
Figure GDA0002796842520000058
为压缩特征图
Figure GDA0002796842520000059
第k个通道的第i个特征,通过公式
Figure GDA00027968425200000510
计算压缩特征图
Figure GDA00027968425200000511
归一化数据方差σ2.2,通过公式
Figure GDA00027968425200000512
计算压缩特征图
Figure GDA00027968425200000513
规范化函数BNγ,β(a2.2),其中
Figure GDA0002796842520000061
式中ε为常数,式中0<ε<0.001,γ为线性规范化的斜率,β为线性规范化的截距,a2.3为a2.2批规范化的结果;
g)通过非线性激活层,利用公式
Figure GDA0002796842520000062
计算得到线性修正结果a2.4,通过逐点卷积层对线性修正结果a2.4计算得到扩张特征图a2.5,通过批处理层和ReLU激活函数对扩张特征图a2.5计算得到特征图a2,其中特征图a2的通道数为c2,特征图a2的每个通道特征宽度为w2
h)通过最大池化层,计算特征图a2压缩后的结果特征图a3
i)用结果特征图a3替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a4,其中心电特征图a4的通道数为c4,心电特征图a4的每个通道特征宽度为w4
j)通过池化层,计算心电特征图a4压缩后的结果特征图a5
k)用结果特征图a5替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a6,其中心电特征图a6的通道数为c6,心电特征图a6的每个通道特征宽度为w6
l)通过全局平均池化层,利用公式
Figure GDA0002796842520000063
计算压缩得到的结果特征图a7,式中
Figure GDA0002796842520000064
是第i个位置的特征;
m)通过展平层将结果特征图a7展平成为一维向量a8,通过全连接层根据公式a9=Wi 8·a8+b8计算样本对应每类疾病得分a9,式中Wi 8是全连接层权重,b8为全连接层偏倚,通过softmax激活函数根据公式
Figure GDA0002796842520000071
计算预测结果a10,其中
Figure GDA0002796842520000072
表示对第i类疾病预测得分,
Figure GDA0002796842520000073
表示对第j类疾病预测得分;
n)使用交叉熵函数计算预测结果a10的损失,如果损失小于制定阈值Threshold则跳转至步骤p),如果损失大于等于制定阈值Threshold则跳转至步骤o);
o)使用Adam优化算法调整模型参数,跳转至步骤e);
p)保存模型参数,算法结束。
通过单导联心电图数据和轻量级神经网络模型实现心律失常自动分类的方法。首先,肢体II导联心电信号蕴含足够的信息;其次,使用卷积核大小为1的卷积层和全局平均池化层压缩特征维度;最后使用流线型的深度可分离卷积快速提取特征。利用单导联数据集和轻量级神经网络模型可以在保证模型准确率的基础上大幅度提高模型运算速度。
优选的,步骤c)中对扩充数据集分别添加信噪比为40db、60db和80db的高斯白噪声,形成40db数据集、60db数据集和80db数据集,40db数据集、60db数据集和80db数据集构成数据集集合。
优选的,步骤c)中N=64。
优选的,步骤d)中通过公式
Figure GDA0002796842520000074
计算得到一个通道特征向量的宽度w1,式中F为卷积核大小,P为边缘填充密度,S为步长,通过公式
Figure GDA0002796842520000075
计算第k个通道的特征图,其中
Figure GDA0002796842520000076
为卷积层第1层第k个通道的权重,
Figure GDA0002796842520000077
为卷积层第1层第k个通道的偏倚,Conv1D为一维卷积神经网络计算函数。
步骤e)中通过公式
Figure GDA0002796842520000081
计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure GDA0002796842520000082
式中,
Figure GDA0002796842520000083
为深度卷积层的权重,
Figure GDA0002796842520000084
为深度卷积层的偏倚。
优选的,步骤n)中制定阈值Threshold=0.001。
优选的,步骤n)使用Adam优化算法调整步骤d)中的权重
Figure GDA0002796842520000085
偏倚
Figure GDA0002796842520000086
调整步骤e)中的权重
Figure GDA0002796842520000087
偏倚
Figure GDA0002796842520000088
调整步骤m)中的权重Wi 8、偏倚b8

Claims (7)

1.一种基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于,包括如下步骤:
a)计算机从MIT-BIH心律失常数据库中获取心电数据,根据心电数据中导联记录内容,选择upper信号为Ⅱ导联信号作为实验数据;
b)使用基于双尺度小波变换法对实验数据进行降噪处理,定位实验数据中的QRS波群,通过QRS波群获取心电信号中的P波和T波的位置,获取一个心拍数据,通过边缘填充随机剪裁算法得到心拍数据的扩充数据集;
c)对扩充数据集添加高斯白噪声,得到数据集集合,通过公式Xi={x11,x12,...,x1N}计算数据集集合中第i个样本Xi,式中x11为心电数据中肢体II导联信号第1个点位电压,N为心电数据中肢体II导联信号使用的像素点个数;
d)通过包含c1个卷积核的一维卷积层Conv1D对数据集集合提取特征,得到特征图a1,其中c1为特征图a1通道数,w1为特征图a1每个通道特征宽度,从特征图a1抽取得到第k个通道的特征图
Figure FDA0002796842510000011
e)通过卷积核为1的卷积层将特征图
Figure FDA0002796842510000012
进行压缩,得到压缩特征图a2.1,其中压缩特征图a2.1通道数为c2.1,压缩特征图a2.1每个通道特征宽度为w2.1,通过深度卷积层计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure FDA0002796842510000013
其中压缩特征图
Figure FDA0002796842510000014
的通道数为c2.2,压缩特征图
Figure FDA0002796842510000015
的每个通道特征宽度为w2.2
f)通过批处理层,利用公式
Figure FDA0002796842510000016
计算压缩特征图
Figure FDA0002796842510000017
归一化数据均值u2.2,式中
Figure FDA0002796842510000018
为压缩特征图
Figure FDA0002796842510000019
第k个通道的第i个特征,通过公式
Figure FDA00027968425100000110
计算压缩特征图
Figure FDA00027968425100000111
归一化数据方差σ2.2,通过公式
Figure FDA00027968425100000112
计算压缩特征图
Figure FDA00027968425100000113
规范化函数BNγ,β(a2.2),其中
Figure FDA0002796842510000021
式中ε为常数,0<ε<0.001,γ为线性规范化的斜率,β为线性规范化的截距,a2.3为a2.2批规范化的结果;
g)通过非线性激活层,利用公式
Figure FDA0002796842510000022
计算得到线性修正结果a2.4,通过逐点卷积层对线性修正结果a2.4计算得到扩张特征图a2.5,通过批处理层和ReLU激活函数对扩张特征图a2.5计算得到特征图a2,其中特征图a2的通道数为c2,特征图a2的每个通道特征宽度为w2
h)通过最大池化层,计算特征图a2压缩后的结果特征图a3
i)用结果特征图a3替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a4,其中心电特征图a4的通道数为c4,心电特征图a4的每个通道特征宽度为w4
j)通过池化层,计算心电特征图a4压缩后的结果特征图a5
k)用结果特征图a5替换步骤d)中的特征图a1后重复执行步骤e)至步骤h),得到心电特征图a6,其中心电特征图a6的通道数为c6,心电特征图a6的每个通道特征宽度为w6
l)通过全局平均池化层,利用公式
Figure FDA0002796842510000023
计算压缩得到的结果特征图a7,式中
Figure FDA0002796842510000024
是第i个位置的特征;
m)通过展平层将结果特征图a7展平成为一维向量a8,通过全连接层根据公式a9=Wi 8·a8+b8计算样本对应每类疾病得分a9,式中Wi 8是全连接层权重,b8为全连接层偏倚,通过softmax激活函数根据公式
Figure FDA0002796842510000031
计算预测结果a10,其中
Figure FDA0002796842510000032
表示对第i类疾病预测得分,
Figure FDA0002796842510000033
表示对第j类疾病预测得分;
n)使用交叉熵函数计算预测结果a10的损失,如果损失小于制定阈值Threshold则跳转至步骤p),如果损失大于等于制定阈值Threshold则跳转至步骤o);
o)使用Adam优化算法调整模型参数,跳转至步骤e);
p)保存模型参数,算法结束。
2.根据权利要求1所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤c)中对扩充数据集分别添加信噪比为40db、60db和80db的高斯白噪声,形成40db数据集、60db数据集和80db数据集,40db数据集、60db数据集和80db数据集构成数据集集合。
3.根据权利要求1所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤c)中N=64。
4.根据权利要求1所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤d)中通过公式
Figure FDA0002796842510000034
计算得到一个通道特征向量的宽度w1,式中F为卷积核大小,P为边缘填充密度,S为步长,通过公式
Figure FDA0002796842510000035
计算第k个通道的特征图,其中
Figure FDA0002796842510000036
为卷积层第1层第k个通道的权重,
Figure FDA0002796842510000037
为卷积层第1层第k个通道的偏倚,Conv1D为一维卷积神经网络计算函数。
5.根据权利要求4所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤e)中通过公式
Figure FDA0002796842510000038
计算得到第k个通道的压缩特征图
Figure FDA0002796842510000041
式中,
Figure FDA0002796842510000042
为深度卷积层的权重,
Figure FDA0002796842510000043
为深度卷积层的偏倚。
6.根据权利要求1所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤n)中制定阈值Threshold=0.001。
7.根据权利要求5所述的基于轻量级神经网络的心电图分类方法,其特征在于:步骤n)使用Adam优化算法调整步骤d)中的权重
Figure FDA0002796842510000044
偏倚
Figure FDA0002796842510000045
调整步骤e)中的权重
Figure FDA0002796842510000046
偏倚
Figure FDA0002796842510000047
调整步骤m)中的权重Wi 8、偏倚b8
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