CN110246592A - 实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统,属于数据治理领域,本发明要解决的技术问题为如何实现医疗机构异构数据值域代码标准化过程的自动化,提高映射效率,保证同一值域代码映射到标准值域代码的唯一性,技术方案为:①该方法是由匹配和字典两种方式结合将不同医疗机构的值域代码映射到标准值域代码中,匹配是基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典是基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。②该系统包括匹配映射模块和字典映射模块。
Description
技术领域
本发明涉及数据治理领域,具体地说是一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统。
背景技术
数据治理是按照平台既有标准对采集数据合理化处理,对数据的获取、处理、使用进行监管。在医疗机构异构数据治理过程中,数据标准化是一项繁重而又十分重要的工作,其中涉及值域代码标准化的映射工作。
标准值域代码是映射结果集,它可以是国家制定的标准,也可以是医疗平台自己制定的标准,如表1为制定的部分标准化学药物大类的药物类型值域代码,值域代码名称命名为STD_DRUG_TYPE。
表1部分化学药物大类的药物类型值域代码
值域代码 | 值域代码名称 | 值 | 值含义 | 说明 |
STD_DRUG_TYPE | 药物类型代码 | 10119 | 抗真菌药 | |
STD_DRUG_TYPE | 药物类型代码 | 10901 | 利尿药及脱水药 | |
STD_DRUG_TYPE | 药物类型代码 | 12203 | 眼科用药 |
医疗机构值域代码为各个医疗机构使用的值域代码,如表2为某个医疗机构化学药物大类的药物类型的值域代码部分数据。
表2某医疗机构化学药物大类的部分药物类型的值域代码
某医疗机构药物类型值 | 某医疗机构药物类型值含义 |
10119 | 抗真菌药 |
10901 | 利尿药 |
4668 | 防治白内障药 |
人工进行值域代码标准化的映射情况大体分三种:
①、医疗机构值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义内容完全匹配,如表3行号2所示;
②、医疗机构值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义相互包含一部分的,如表3行号3所示;
③、医疗机构值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义字面无任何相关性,但实际具有包含关系,如表3行号4所示;
表3映射情况表
由于目前各医疗机构业务系统(HIS、LIS、PACS、EMR等)设计方案、逻辑架构的不同,数据实行的值域代码标准各不相同,需要较多的人工去映射,人工进行值域代码标准化工作量大,并且此工作存在重复性;另外由于人对医疗数据的认识不同,手工映射也会出现同一个值域代码映射到不同标准值域代码的情况,因此需要一种统一的映射方式,既能提高映射效率,又能保证同一值域代码映射到标准值域代码的唯一性。故如何实现医疗机构异构数据值域代码标准化过程的自动化,提高映射效率,把重复性、手工的工作尽量降到最低,同时保证同一值域代码映射到标准值域代码的唯一性是目前现有技术中急需解决的技术问题。
CN109215765A公开了可实现异构业务数据互联互通的医疗机构信息集成平台系统,包括ESB平台、代码在线编译和服务在线发布、连接池、异构子业务系统集合和用户登录界面四个实体,所述的ESB平台遵循ESB规范,提供数据查询请求、写入请求、流程定制;所述在线发布服务,摒弃以往的服务类实现、配置、重启web服务从而达到发布Webservice的方式,直接代码实现、代码动态编译、在线发布接口服务,所述的多连接池,采用连接医疗机构各业务数据库均采用连接池方式。该技术方案解决了现有技术中医疗机构数据集成交互平台资源使用成本高和使用麻烦的缺陷,同时让医疗机构信息管理人员能自助实现接口,实现真正的接口免费,但是不能实现医疗机构异构数据值域代码标准化映射。
发明内容
本发明的技术任务是提供一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统,来解决如何实现医疗机构异构数据值域代码标准化过程的自动化,提高映射效率,把重复性、手工的工作尽量降到最低,同时保证同一值域代码映射到标准值域代码的唯一性的问题。
本发明的技术任务是按以下方式实现的,一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,该方法是由匹配和字典两种方式结合将不同医疗机构的值域代码映射到标准值域代码中,匹配是基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典是基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。
作为优选,该方法的具体步骤如下:
S1、输入具体医疗机构映射的值域代码参数,值域代码参数包括医疗机构编码、医疗机构值域代码值、医疗机构值域代码值含义以及标准值域代码,下一步执行步骤S2;
S2、根据输入的标准值域代码逐行读取医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值含义进行匹配映射和字典映射,其中先判断是否有该医疗机构值域代码值的字典:
①、若是,则跳转至步骤S5;
②、若否,则下一步执行步骤S3;
S3、匹配映射,下一步执行步骤S4;
S4、判断匹配映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S8;
S5、字典映射,下一步执行步骤S6;
S6、判断字典映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S4;
S7、输出完整映射信息结果,下一步执行步骤S9;
S8、只输出医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值对应的含义,下一步执行步骤S9;
S9、匹配映射和字典映射完成后要对映射结果进行人工稽核,对映射错误或未映射成功的值域代码进行人工映射。
更优地,所述匹配映射是对标准值域代码值含义和各医疗机构值域代码值含义形成“X.*?X.*?X”的表达式,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;其中,X代表任一字符。
更优地,所述匹配映射是根据Python3.6中的re模块实现。
更优地,所述匹配映射的具体步骤如下:
(1)、制定正则表达式:根据输入的值进行字拆分,形成含输入值的规则;
(2)、输入待匹配的值与标准值域代码值含义进行模式匹配,并判断是否找到匹配结果:
①、若找到第一个匹配结果,则下一步执行步骤(3);
②、若未有任何一个匹配结果,则返回未匹配标志None;
(3)、把匹配结果存入到一个数组中并为该数组命名;
(4)、遍历匹配标准值域代码值含义后对匹配结果按照匹配度进行排序,把最优的匹配结果作为最终结果;匹配度的计算公式如下:
匹配度=输入值域代码值含义/匹配出的标准值域代码值含义*100%;
(5)、匹配结果处理:输出匹配成功的匹配结果,匹配成功则表示医疗机构值域代码值和标准值域代码值存在相互包含关系,默认为两个值存在意义相同或相近关系,即完成了医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射,把医疗机构值域代码值和标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。
作为优选,所述字典映射是基于已经匹配的经验值构建字典,字典映射不仅匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义之间互为包含的情况,也匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义字面无任何相关性的情况。
更优地,所述字典映射的具体步骤如下:
(1)、字典构建:把已经映射好的映射关系按规则形成文档;
(2)、字典加载:根据输入的值域代码去加载字典;
(3)、逐行读取医疗机构值域代码值含义,并去字典中查找医疗机构值域代码值含义,若在字典中查找到医疗机构值域代码值含义,则会找到医疗机构值域代码值含义对应的标准值域代码值含义,即完成医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射;
(4)、根据标准值域代码值含义查询出标准值域代码值,把医疗机构的标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。
一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射系统,该系统包括匹配映射模块和字典映射模块,匹配映射模块用一个基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典映射模块用于基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。
本发明的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统具有以下优点:
(一)、本发明通过使用“匹配+字典”的方式,将不同医疗机构的值域代码映射到标准值域代码中;匹配是基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,来达到值域代码的映射;字典是基于之前手工匹配的医疗机构值域代码和标准值域代码的映射关系维护的一个经验值,通过字典能实现基于经验的值域代码映射,随着字典数量和准确度的不断完善,映射质量也会逐渐提高;
(二)、现有技术中医疗机构异构数据值域代码标准化过程,需要较多的人工去映射,并且此工作存在重复性;另外不同人手工映射也会出现同一值域代码映射到不同标准值域代码的情况,而本发明是尽可能的实现其自动化,把重复性、手工做的工作尽可能降到最低,并且保证同一值域代码映射到标准值域代码的唯一性;
(三)、本发明所提出的“匹配+字典”的映射方法能把重复性、手工映射工作降到最低,并且保证相同值域代码到标准值域代码映射的唯一性,随着字典数据量的增多和准确度的提高,需要人工映射的数量会逐渐减少,映射准确度会逐渐提高。
附图说明
下面结合附图对本发明进一步说明。
附图1为实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法流程框图。
具体实施方式
参照说明书附图和具体实施例对本发明的一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法及系统作以下详细地说明。
实施例1:
如附图1所示,本发明的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,该方法是由匹配和字典两种方式结合将不同医疗机构的值域代码映射到标准值域代码中,匹配是基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典是基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化;具体步骤如下:
S1、输入具体医疗机构映射的值域代码参数,值域代码参数包括医疗机构编码、医疗机构值域代码值、医疗机构值域代码值含义以及标准值域代码,下一步执行步骤S2;
举例某医疗机构药物类型数据标准化时,输入如下参数:
①、医疗机构编码:HOSPITAL_XXX
②、药物类型值域代码:STD_DRUG_TYPE
③、医疗机构值域代码值和值含义,如下表4所示:
表4输入的医疗机构值域代码值和值含义
值域代码值 | 值域代码值含义 |
10119 | 抗真菌药 |
10901 | 利尿药 |
4668 | 防治白内障药 |
S2、根据输入的标准值域代码逐行读取医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值含义进行匹配映射和字典映射,其中先判断是否有该医疗机构值域代码值的字典:
①、若是,则跳转至步骤S5;
②、若否,则下一步执行步骤S3;
S3、匹配映射,下一步执行步骤S4;
S4、判断匹配映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S8;
S5、字典映射,下一步执行步骤S6;
S6、判断字典映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S4;
S7、输出完整映射信息结果,下一步执行步骤S9;
S8、只输出医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值对应的含义,下一步执行步骤S9;
S9、匹配映射和字典映射完成后要对映射结果进行人工稽核,对映射错误或未映射成功的值域代码进行人工映射。
其中,匹配映射是对标准值域代码值含义和各医疗机构值域代码值含义形成“X.*?X.*?X”的表达式,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;其中,X代表任一字符。匹配映射是根据Python3.6中的re模块实现。匹配映射的具体步骤如下:
(1)、制定正则表达式:根据输入的值进行字拆分,形成含输入值的规则;如输入“利尿药”,则形成“利.*?尿.*?药”的规则。
Python3.6的制定方法如下:
pattern='.*?'.join(“利尿药”)
注:pattern为字符串变量,通过join()方法形成规则。
(2)、输入待匹配的值与标准值域代码值含义进行模式匹配,并判断是否找到匹配结果:
①、若找到第一个匹配结果,则下一步执行步骤(3);
②、若未有任何一个匹配结果,则返回未匹配标志None;
Python3.6的制定方法如下:
根据规则形成正则表达式对象regex=re.compile(pattern),
然后与标准值域代码值含义“利尿药及脱水药”进行模式匹配,返回一个match对象:
match=regex.search("利尿药及脱水药")
如果match不为None,则表示匹配成功。
(3)、把匹配结果存入到一个数组中并为该数组命名,如命名为result=[];
(4)、遍历匹配标准值域代码值含义后对匹配结果按照匹配度进行排序,把最优的匹配结果作为最终结果;匹配度的计算公式如下:
匹配度=输入值域代码值含义/匹配出的标准值域代码值含义*100%;
(5)、匹配结果处理:输出匹配成功的匹配结果,匹配成功则表示医疗机构值域代码值和标准值域代码值存在相互包含关系,默认为两个值存在意义相同或相近关系,即完成了医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射,把医疗机构值域代码值和标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。如下表5为样本匹配后的映射关系。
表5映射关系结果表
字典映射是基于已经匹配的经验值构建字典,字典映射不仅匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义之间互为包含的情况,也匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义字面无任何相关性的情况。字典映射的具体步骤如下:
(1)、字典构建:把已经映射好的映射关系按规则形成文档;如表6中为已经映射好的药物类型的部分映射关系,形成表7所示的字典文档格式:
表6映射关系
表7字典文档表
标准值域代码值含义 | 医疗机构值域代码值含义 |
抗真菌药 | 抗真菌药 |
利尿药及脱水药 | 利尿药 |
眼科用药 | 防治白内障药 |
将其文档根据药物类型的值域代码STD_DRUG_TYPE命名为STD_DRUG_TYPE.txt。
(2)、字典加载:根据输入的值域代码去加载字典,如映射药物类型的值域代码,则加载STD_DRUG_TYPE.txt文档中的内容;
(3)、逐行读取医疗机构值域代码值含义,并去字典中查找医疗机构值域代码值含义,若在字典中查找到医疗机构值域代码值含义,则会找到医疗机构值域代码值含义对应的标准值域代码值含义,即完成医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射;
(4)、根据标准值域代码值含义查询出标准值域代码值,把医疗机构的标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。如下表8为样本进行字典映射后的映射关系。
表8映射关系结果表
实施例2:
本发明的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射系统,该系统包括匹配映射模块和字典映射模块,匹配映射模块用一个基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典映射模块用于基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。
最后应说明的是:以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对其限制;尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明,本领域的普通技术人员应当理解:其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换;而这些修改或者替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
Claims (8)
1.一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,该方法是由匹配和字典两种方式结合将不同医疗机构的值域代码映射到标准值域代码中,匹配是基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典是基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。
2.根据权利要求1所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,该方法的具体步骤如下:
S1、输入具体医疗机构映射的值域代码参数,值域代码参数包括医疗机构编码、医疗机构值域代码值、医疗机构值域代码值含义以及标准值域代码,下一步执行步骤S2;
S2、根据输入的标准值域代码逐行读取医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值含义进行匹配映射和字典映射,其中先判断是否有该医疗机构值域代码值的字典:
①、若是,则跳转至步骤S5;
②、若否,则下一步执行步骤S3;
S3、匹配映射,下一步执行步骤S4;
S4、判断匹配映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S8;
S5、字典映射,下一步执行步骤S6;
S6、判断字典映射是否映射成功:
①、若是,则下一步执行步骤S7;
②、若否,则跳转至步骤S4;
S7、输出完整映射信息结果,下一步执行步骤S9;
S8、只输出医疗机构值域代码值和医疗机构值域代码值对应的含义,下一步执行步骤S9;
S9、匹配映射和字典映射完成后要对映射结果进行人工稽核,对映射错误或未映射成功的值域代码进行人工映射。
3.根据权利要求1或2所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,所述匹配映射是对标准值域代码值含义和各医疗机构值域代码值含义形成“X.*?X.*?X”的表达式,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;其中,X代表任一字符。
4.根据权利要求3所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,所述匹配映射是根据Python3.6中的re模块实现。
5.根据权利要求4所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,所述匹配映射的具体步骤如下:
(1)、制定正则表达式:根据输入的值进行字拆分,形成含输入值的规则;
(2)、输入待匹配的值与标准值域代码值含义进行模式匹配,并判断是否找到匹配结果:
①、若找到第一个匹配结果,则下一步执行步骤(3);
②、若未有任何一个匹配结果,则返回未匹配标志None;
(3)、把匹配结果存入到一个数组中并为该数组命名;
(4)、遍历匹配标准值域代码值含义后对匹配结果按照匹配度进行排序,把最优的匹配结果作为最终结果;匹配度的计算公式如下:
匹配度=输入值域代码值含义/匹配出的标准值域代码值含义*100%;
(5)、匹配结果处理:输出匹配成功的匹配结果,匹配成功则表示医疗机构值域代码值和标准值域代码值存在相互包含关系,默认为两个值存在意义相同或相近关系,即完成了医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射,把医疗机构值域代码值和标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。
6.根据权利要求1所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,所述字典映射是基于已经匹配的经验值构建字典,字典映射不仅匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义之间互为包含的情况,也匹配出标准值域代码值含义和医疗机构值域代码值含义字面无任何相关性的情况。
7.根据权利要求1或6所述的实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射方法,其特征在于,所述字典映射的具体步骤如下:
(1)、字典构建:把已经映射好的映射关系按规则形成文档;
(2)、字典加载:根据输入的值域代码去加载字典;
(3)、逐行读取医疗机构值域代码值含义,并去字典中查找医疗机构值域代码值含义,若在字典中查找到医疗机构值域代码值含义,则会找到医疗机构值域代码值含义对应的标准值域代码值含义,即完成医疗机构值域代码值含义到标准值域代码值含义的映射;
(4)、根据标准值域代码值含义查询出标准值域代码值,把医疗机构的标准值域代码值补充完整后,存入Excel数据表格中。
8.一种实现医疗机构异构数据值域代码标准化的映射系统,其特征在于,该系统包括匹配映射模块和字典映射模块,匹配映射模块用一个基于正则表达式实现医疗机构值域代码值含义和标准值域代码值含义之间的相互匹配,实现值域代码值含义相互包含情况的映射;字典映射模块用于基于经验值形成的映射字典来实现对已经映射过的值域代码自动化映射,通过字典的方式实现已经映射过的值域代码重复映射的自动化。
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