CN110197715A - 一种用于读片教学的医学影像浏览系统 - Google Patents
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Abstract
本发明属于医学图像处理技术领域,具体为一种读片教学用医学影像浏览系统。本发明包括:数据库、业务服务器、前端软件三个部分;数据库用于存储医学影像文件数据、典型影像学表现患者信息数据等;业务服务器为负责与数据库、与前端软件通讯的中间件,与数据库具有增删改查的通讯,与前端软件具有双向通讯;业务服务器通过调用大数据分析模块与影像分析模块,进行增量数据的分析等;前端软件为系统与用户进行交互的软件,具有数据库信息显示、影像数据浏览、数据标记与标注等功能。本发明系统可避免重复标注,降低标注的错误率;能够从众多标注中筛选正确率最高的标注,将用户的临床经验更好地转换为信息;并能为临床诊疗标准的建立提供依据。
Description
技术领域
本发明属于医学图像处理技术领域,具体涉及读片教学用医学影像浏览系统。
背景技术
目前,用于教学的影像浏览系统多为临床应用的PACS系统,该系统虽然调阅图像方便,也可根据影像学诊断搜索某类疾病的图像,但PACS上的诊断为影像科医生基于经验的主观判断,而不是病理学的“金标准”,故即使学生或低年资医生按照影像学诊断搜索的某类疾病的图像,可能并不是该疾病,造成了学生或者低年资医生无法将影像学图像与病理学对照学习,学习效率低下。目前为止,尚未见可以实现按照病理学分类搜索影像学图像的教学软件。
发明内容
为克服现有技术的不足,本发明提供了一种用于读片教学的医学影像浏览系统。
本发明提供的用于读片教学的医学影像浏览系统,包括数据库、业务服务器、前端软件三个部分;其中:
所述数据库用于存储医学影像文件数据、典型影像学表现(word文字)患者信息数据、标注数据、标准病例数据、病例备注数据等;数据的导入是按照病种分类号进行分类导入,并以病种分类号进行分类分级存储;
所述业务服务器为负责与数据库、与前端软件通讯的中间件,与数据库具有增删改查的通讯,与前端软件具有双向通讯;其主要功能为按照前端软件的请求,进行数据库的增、删、改、查,并将查询结果或数据库处理的成功/失败等状态反馈给前端软件;此外,业务服务器还具有大数据分析模块与影像分析模块;
所述大数据分析模块,用于定期查询并采集数据库中的数据,并进行数据的分类筛选、统计,分类与统计的内容包括统计数据库中每个病种数据的数量、变化量,已有病种对全部病种的覆盖范围,全部数据中和各病种数据中的性别比例、年龄比例,该模块支持增量分析,能够在原分析结果的基础上,通过新增数据,进行分析结果的更新,而非全部重新分析;
所述影像分析模块,用于在批量获取数据库数据的基础上,对医学影像数据、影像学表现数据等进行基于特征提取的数据分析、分类、模式匹配等。
业务服务器通过定期自动调用大数据分析模块与影像分析模块,进行增量数据的分析,或全部数据的分析,并将分析结果存储至数据库,或更新现有数据库中的分析结果。
本发明中,所述业务服务器能够兼容多种网络通讯协议。
所述前端软件为系统与用户进行交互的软件,具有数据库信息的显示,影像数据浏览,数据标记与标注,数据导入与导出,对图像的标注与图像绑定等功能,能够随图像的缩放、旋转、平移而产生相应的操作。
所述前端软件,能够运行于多种操作系统平台上,用户能够通过前端软件进行添加、修改、查看、筛选数据库的数据,并可以进行影像的浏览、对比。
对同一个数据,可以有多个用户通过不同终端上的前端软件,对同一个数据进行同步的修改,各个用户的修改与标注互相独立,并且,每个用户所做的修改均能够追溯。
一个用户能够通过前端软件对其他用户对数据所作的修改过程进行查看,并可对修改过程进行评分。
一个用户能够通过前端软件对其他用户对数据所作的修改过程进行查看,并可对修改过程进行评分,并且用户能够合并其他人的修改和标注,并在此基础上进行进一步调整,作为自己的一次修改和标注,在浏览其他人对数据的修改和标注时,可以通过切换的方式分开查看不同用户的修改和标注,也可通过叠加的方式一次性查看指定多个用户的修改和标注。
所述通过前端软件的修改,包括对图像数据的标注、对病历数据的备注、对图像数据分割的修改,以及对病历及其他数据的修改等。
所述前端软件中,一个用户对数据所作修改,被其他用户的评分,可以被所有用户看到。
所述前端软件包括数据库通讯模块、影像可视化模块、影像标注模块、病历检验信息可视化模块、网络通讯模块、用户IO模块、UI模块等。其中,数据库通讯模块用于将本地信息转换为数据库指令,或将数据库下发的数据转换为本地可解读的指令;网络通讯模块负责所有与业务服务器、数据库的数据传输工作;影像可视化模块负责将CT或MR等模态的数据显示为二维切片、三维重建立体模型等;影像标注模块将用户的坐标输入转换为影像坐标并与影像绑定,并可存储标注的类型如圆形、矩形、笔迹等,病历检验信息将业务服务器发来的相关数据重新整理为可视化的文字格式,并能够判断出不同条目下检验信息的变化;用户IO模块用于接收用户的鼠标、键盘等的输入;UI模块作为界面显示上述全部内容。
本系统的优点在于:
以业务服务器作为数据中转,实现了多人、同时、实时地对同一数据进行标注,并能够在标注过程中互相调用已标注好的结果,避免了重复标注,并可降低标注的错误率;
用户能够为他人的标注进行评分,通过多人评分,能够从众多标注中筛选正确率最高的标注,将用户的临床经验更好的转换为信息;
基于数据以及用户的标注,系统的大数据分析模块能够定时定期地调用多种分析方法对数据进行基于监督学习或无监督学习的数据分析与挖掘,由于数据的归档是按照病种进行的,因此便于大数据分析模块挖掘每个病种所对应的数据特征,为临床诊疗标准的建立提供依据。
附图说明
图1为本发明系统的结构框图。
具体实施方式
实施例1
数据库与业务服务器部署于互联网云服务器上,数据库与业务服务器部署在同个服务器集群内的不同服务器上,具备网络通讯;
构建数据库,基于mySQL或SQLserver的关系型数据库,数据库包含表L1、L2、L3、L4,其中,L1用于存储CT影像与MR影像的数据地址,L2用于存储患者信息,L3用于存储患者病历与随访病历,L4用于存储检验信息。L1具有影像编号、影像地址、病种、模态、数据数量、数据尺寸等多个字段,L2具有姓名、性别、出生日期、身份证号、病种类型、影像编号、病历编号、检验编号等多个字段,L3具有病历编号、病历内容、病历日期等多个字段,L4具有检验编号、检验类型、检验结果等多个字段。用户上传数据时,将首先在L2建立患者条目,填充对应的字段,然后在L1、L3、L4建立对应的条目,并将条目的编号存储至L2的患者条目中。检索时,可通过患者条目查找到对应的影像、检验、病历,也可直接查找影像、检验、病历条目,再根据条目的编号检索患者。
前端软件包括数据库通讯模块、影像可视化模块、影像标注模块、病历检验信息可视化模块、网络通讯模块、用户IO模块、UI模块等。其中,数据库通讯模块用于将本地信息转换为数据库指令,或将数据库下发的数据转换为本地可解读的指令;网络通讯模块负责所有与业务服务器、数据库的数据传输工作;影像可视化模块负责将CT或MR等模态的数据显示为二维切片、三维重建立体模型等;影像标注模块将用户的坐标输入转换为影像坐标并与影像绑定,并可存储标注的类型如圆形、矩形、笔迹等,病历检验信息将业务服务器发来的相关数据重新整理为可视化的文字格式,并能够判断出不同条目下检验信息的变化,用户IO模块用于接收用户的鼠标、键盘等的输入,UI模块作为界面显示上述全部内容。
前端软件安装、分布于三个地点的Windows系统计算机A、B、C上,计算机A、B、C上各有一名用户,分别记为U1、U2、U3。
一种使用方式,U1通过前端软件上传数据D1,D1包括影像数据(CT影像与MR影像,DICOM3.0标准)、患者信息(姓名、性别、年龄)、影像学表现、检验信息(血常规、尿常规);
U1通过前端软件,选择D1对应的病种,病种分为4级,分别为B1、B2、B3、B4;
U1上传后,数据通过业务服务器整理,归档存储至数据库服务器;
U2与U3通过前端软件,与业务服务器进行通讯,利用性别筛选、病种筛选,检索得到D1;
U2对D1进行修改与标注,修改了D1的影像数据中像素点位(X1,Y1,Z1)至(X2,Y2,Z2)所构成的立方体区域,并用红色笔迹进行了勾画,所作的修改与标注内容上传至业务服务器,并存储于数据库;
U3对D1进行修改与标注,修改了D1的影像数据中像素点位(X3,Y3,Z3)至(X4,Y4,Z4)所构成的立方体区域,并用绿色笔迹进行了勾画,所作的修改与标注内容上传至业务服务器,并存储于数据库;
U1通过前端软件显示D1的影像数据,能够看到U2、U3对D1对影像数据的修改记录条目,通过切换显示U2\U3的修改与标注,分别查看,也可以叠加同时显示U2与U3对影像数据的修改与标注,叠加顺序按照U2、U3的修改时间顺序,先修改的在底层,后修改的在上层;
U1对U2、U3的修改与标注进行评分,为U2评分2,U3评分5,并撰写评语;
U2、U3打开前端软件,能够看到U1对各自的评分与评语。
实施例2
系统的部署方式与用户与实施例1相同;
U1、U2、U3分别从各自的前端软件,耗时30天,上传了500个病种的50000例数据,平均每个病种100例数据,数据包括影像数据、检验数据、典型影像学征象、用户信息数据等;
业务服务器在其上传过程中,每天0:00对数据库中的数据进行备份;
业务服务器在其上传过程中,每天0:00,对数据库中数据的检验数据、用户信息数据、影像学表现进行统计,统计得到性别比例、年龄分布、血常规异常比例、血常规异常分布、尿常规异常比例、尿常规异常分布,统计得到的结果存储与数据库,并且可通过前端软件查看可视化的图表;
业务服务器能够对所有数据的影像数据与检验数据,通过影像分析模块,生成影像直方图,并提取直方图中平均灰度分布、灰度分布标准差、翘点特征等一阶特征,以及基于高斯非线性拟合的高斯分布特征、曲率尺度特征等高阶特征,同时,提取检验数据的模式特征,根据各项检验数据对各个病种的模型符合程度,或检验数据异常比例、异常程度偏离量等特征,对每一例数据,通过顺序组合的方式形成特征向量,以病种或子病种作为标记,利用基于SVM的机器学习分类算法,对上述特征进行学习与训练,得到分类器,将该分类器用于对新上传的数据自动归类,而无需选择病种。
Claims (8)
1.一种用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,包括数据库、业务服务器、前端软件三个部分;其中:
所述数据库用于存储医学影像文件数据、典型影像学表现患者信息数据、标注数据、标准病例数据、病例备注数据,数据的导入是按照病种分类号进行分类导入,并以病种分类号进行分类分级存储;
所述业务服务器为负责与数据库、与前端软件通讯的中间件,与数据库具有增删改查的通讯,与前端软件具有双向通讯;其主要功能为按照前端软件的请求,进行数据库的增、删、改、查,并将查询结果或数据库处理的成功/失败等状态反馈给前端软件;此外,业务服务器还具有大数据分析模块与影像分析模块;
所述大数据分析模块,用于定期查询并采集数据库中的数据,并进行数据的分类筛选、统计,分类与统计的内容包括统计数据库中每个病种数据的数量、变化量,已有病种对全部病种的覆盖范围,全部数据中和各病种数据中的性别比例、年龄比例,该模块支持增量分析,在原分析结果的基础上,通过新增数据,进行分析结果的更新;
所述影像分析模块,用于在批量获取数据库数据的基础上,对医学影像数据、影像学表现数据等进行基于特征提取的数据分析、分类、模式匹配;
业务服务器通过定期自动调用大数据分析模块与影像分析模块,进行增量数据的分析,或全部数据的分析,并将分析结果存储至数据库,或更新现有数据库中的分析结果;
所述前端软件为系统与用户进行交互的软件,具有数据库信息的显示、影像数据浏览、数据标记与标注、数据导入与导出、对图像的标注与图像绑定功能,能够随图像的缩放、旋转、平移而产生相应的操作。
2.根据权利要求1所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,所述业务服务器能够兼容多种网络通讯协议。
3.根据权利要求1所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,所述前端软件运行于多种操作系统平台上,用户通过前端软件能够进行添加、修改、查看、筛选数据库的数据,并进行影像的浏览、对比。
4.根据权利要求3所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,对同一个数据,多个用户通过不同终端上的前端软件,对同一个数据进行同步的修改,各个用户的修改与标注互相独立,并且,每个用户所做的修改均能够追溯。
5.根据权利要求3所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,一个用户能够通过前端软件对其他用户对数据所作的修改过程进行查看,并可对修改过程进行评分,并且用户能够合并其他人的修改和标注,并在此基础上进行进一步调整,作为自己的一次修改和标注,在浏览其他人对数据的修改和标注时,可以通过切换的方式分开查看不同用户的修改和标注,也可通过叠加的方式一次性查看指定多个用户的修改和标注。
6.根据权利要求4或5所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,所述通过前端软件的修改,包括对图像数据的标注、对病历数据的备注、对图像数据分割的修改,以及对病历及其他数据的修改。
7.根据权利要求6所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,通过所述前端软件,一个用户对数据所作修改,被其他用户的评分,可以被所有用户看到。
8.根据权利要求3所述的用于读片教学的医学影像浏览系统,其特征在于,所述前端软件包括数据库通讯模块、影像可视化模块、影像标注模块、病历检验信息可视化模块、网络通讯模块、用户IO模块、UI模块;其中,数据库通讯模块用于将本地信息转换为数据库指令,或将数据库下发的数据转换为本地可解读的指令;网络通讯模块负责所有与业务服务器、数据库的数据传输工作;影像可视化模块负责将CT或MR等模态的数据显示为二维切片、三维重建立体模型;影像标注模块将用户的坐标输入转换为影像坐标并与影像绑定,并可存储标注的类型,病历检验信息将业务服务器发来的相关数据重新整理为可视化的文字格式,并能够判断出不同条目下检验信息的变化;用户IO模块用于接收用户的鼠标、键盘等的输入;UI模块作为界面显示上述内容。
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