CN110033830A - 一种数据发送方法、装置、设备及存储介质 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种数据发送方法、装置、设备及存储介质。该方法包括:获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,通过本发明的技术方案,能够提升用户的使用体验。
Description
技术领域
本发明实施例涉及生物技术领域,尤其涉及一种数据发送方法、装置、设备及存储介质。
背景技术
随着科学的进步,对于样本的研究也越发成熟,进而出现了很多用于采集样本的特性的设备,但是由于设备的显示结果非常深奥,非生物学的专家很难读懂其中的含义,并进行拆分,以供用户参考研究。
发明内容
本发明实施例提供一种数据发送方法、装置、设备及存储介质,以实现便于用户读懂设备采集数据的含义,将不同的数据发送至需求该数据的用户,进而提升用户的使用体验。
第一方面,本发明实施例提供了一种数据发送方法,包括:
获取待处理样本;
根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;
根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;
对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
进一步的,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单包括:
对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;
根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
进一步的,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单之前,还包括:
创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
进一步的,创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单之前,还包括:
按照预设规则设置上机参数。
第二方面,本发明实施例还提供了一种数据发送装置,该装置包括:
获取模块,用于获取待处理样本;
确定模块,用于根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;
分析模块,用于根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;
发送模块,用于对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
进一步的,所述确定模块具体用于:
对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;
根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
进一步的,还包括:
创建模块,用于创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
进一步的,还包括:
设置模块,用于按照预设规则设置上机参数。
第三方面,本发明实施例还提供了一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述程序时实现如本发明实施例中任一所述的数据发送方法。
第四方面,本发明实施例还提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如本发明实施例中任一所述的数据发送方法。
本发明实施例通过获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,能够提升用户的使用体验。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本发明的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
图1是本发明实施例一中的一种数据发送方法的流程图;
图2是本发明实施例二中的一种数据发送方法的流程图;
图3是本发明实施例三中的一种数据发送装置的结构示意图;
图4是本发明实施例四中的一种计算机设备的结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释本发明,而非对本发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与本发明相关的部分而非全部结构。
应注意到:相似的标号和字母在下面的附图中表示类似项,因此,一旦某一项在一个附图中被定义,则在随后的附图中不需要对其进行进一步定义和解释。同时,在本发明的描述中,术语“第一”、“第二”等仅用于区分描述,而不能理解为指示或暗示相对重要性。
实施例一
图1为本发明实施例一提供的一种数据发送方法的流程图,本实施例可适用于数据发送的情况,该方法可以由本发明实施例中的数据发送装置来执行,该装置可采用软件和/或硬件的方式实现,如图1所示,该方法具体包括如下步骤:
S110,获取待处理样本。
其中,所述待处理样本可以为其他公司送来的细胞样本,也可以为其他需要进行生物研究的样本,本发明实施例对此不进行限制。
其中,所述待处理样本的数量为多个。
具体的,获取待处理样本,例如可以是,获取公司A送来的待处理样本,获取公司B送来的待处理样本。
S120,根据待处理样本确定样本信息单和项目信息单。
其中,所述样本信息单包括样本的数量,样本名称,以及样本的其他信息,或者样本分组情况,例如可以是,一组10个细胞。
其中,所述项目信息单包括样本对应的公司名称或者公司代码,或者其他能够表征样本所属公司的特征,例如可以是,所述项目信息单包括:公司A送来样本Q,公司B送来样本W。
具体的,根据获取到的待处理样本确定样本信息单和项目信息单。
可选的,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单之前,还包括:
创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
可选的,创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单之前,还包括:
按照预设规则设置上机参数。
S130,根据样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据。
其中,对待处理样本进行生物分析可以通过设备对待处理样本进行参数采集,然后再对采集到的数据进行分析,还可以直接通过设备对待处理样本进行生物分析,本发明实施例对此不进行限制。
其中,所述目标数据与样本信息单和项目信息单有关,例如可以是,将A公司的细胞的分析结果标记A公司对应的标记,将B公司的细胞的分析结果标记B公司对应的标记,A公司的细胞的分析结果和标记的A公司对应的标记,B公司的细胞的分析结果和标记的B公司对应的标记均为目标数据。
具体的,根据样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据。
S140,对目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
其中,对目标数据进行拆分的方式为根据INDEX进行拆分,也可以为其他拆分形式,本发明实施例对此不进行限制。具体的,根据INDEX进行拆分为先通过下机数据的INDEX找到对应样本在LIMS系统中的流水号,对下机文件进行fastq转换,根据INDEX找到对应的BARCODE,进而匹配到相应的项目,将下机数据进行分类并转移至对应的RAWDATA目录,生成QCsummary并进行最终质控操作。
具体的,对目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,例如可以是,A公司需要得到细胞的品质结果,则将A公司对应的细胞的品质结果发送至A公司对应的终端设备,B公司需要得到细胞的基因序列,则将B公司对应的细胞的基因序列发送至B公司对应的终端设备。
本实施例的技术方案,通过获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,能够提升用户的使用体验。
实施例二
图2为本发明实施例二中的一种数据发送方法的流程图,本实施例以上述实施例为基础进行优化,在本实施例中,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单包括:对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
如图2所示,本实施例的方法具体包括如下步骤:
S210,获取待处理样本。
S220,对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本。
具体的,通过对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,将样本中的劣质样本去除,得到优化样本。
S230,根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
具体的,样本上机测序前会在LIMS系统中排Lane,将多条Lane汇聚至单个Run中,并按照客户要求配置项目和平台类型,并根据样本信息设置上机参数以及包Lane类型。通过下机数据的flowcell,匹配LIMS系统中对应的Run,LIMS系统会自动关联并生成该run中的样本相关的信息单以及项目信息单。
具体的,根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
S240,根据样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据。
S250,对目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
本实施例的技术方案,通过获取待处理样本;对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,能够提升用户的使用体验。
实施例三
图3为本发明实施例三提供的一种数据发送装置的结构示意图。本实施例可适用于数据发送的情况,该装置可采用软件和/或硬件的方式实现,该装置可集成在任何提供数据发送的功能的设备中,如图3所示,所述数据发送装置具体包括:获取模块310、确定模块320、分析模块330和发送模块340。
其中,获取模块310,用于获取待处理样本;
确定模块320,用于根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;
分析模块330,用于根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;
发送模块340,用于对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
可选的,所述确定模块具体用于:
对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;
根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
可选的,还包括:
创建模块,用于创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
可选的,还包括:
设置模块,用于按照预设规则设置上机参数。
上述产品可执行本发明任意实施例所提供的方法,具备执行方法相应的功能模块和有益效果。
本实施例的技术方案,通过获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备,能够提升用户的使用体验。
实施例四
图4为本发明实施例四中的一种计算机设备的结构示意图。图4示出了适于用来实现本发明实施方式的示例性计算机设备12的框图。图4显示的计算机设备12仅仅是一个示例,不应对本发明实施例的功能和使用范围带来任何限制。
如图4所示,计算机设备12以通用计算设备的形式表现。计算机设备12的组件可以包括但不限于:一个或者多个处理器或者处理单元16,系统存储器28,连接不同系统组件(包括系统存储器28和处理单元16)的总线18。
总线18表示几类总线结构中的一种或多种,包括存储器总线或者存储器控制器,外围总线,图形加速端口,处理器或者使用多种总线结构中的任意总线结构的局域总线。举例来说,这些体系结构包括但不限于工业标准体系结构(ISA)总线,微通道体系结构(MAC)总线,增强型ISA总线、视频电子标准协会(VESA)局域总线以及外围组件互连(PCI)总线。
计算机设备12典型地包括多种计算机系统可读介质。这些介质可以是任何能够被计算机设备12访问的可用介质,包括易失性和非易失性介质,可移动的和不可移动的介质。
系统存储器28可以包括易失性存储器形式的计算机系统可读介质,例如随机存取存储器(RAM)30和/或高速缓存存储器32。计算机设备12可以进一步包括其它可移动/不可移动的、易失性/非易失性计算机系统存储介质。仅作为举例,存储系统34可以用于读写不可移动的、非易失性磁介质(图4未显示,通常称为“硬盘驱动器”)。尽管图4中未示出,可以提供用于对可移动非易失性磁盘(例如“软盘”)读写的磁盘驱动器,以及对可移动非易失性光盘(例如CD-ROM,DVD-ROM或者其它光介质)读写的光盘驱动器。在这些情况下,每个驱动器可以通过一个或者多个数据介质接口与总线18相连。存储器28可以包括至少一个程序产品,该程序产品具有一组(例如至少一个)程序模块,这些程序模块被配置以执行本发明各实施例的功能。
具有一组(至少一个)程序模块42的程序/实用工具40,可以存储在例如存储器28中,这样的程序模块42包括——但不限于——操作系统、一个或者多个应用程序、其它程序模块以及程序数据,这些示例中的每一个或某种组合中可能包括网络环境的实现。程序模块42通常执行本发明所描述的实施例中的功能和/或方法。
计算机设备12也可以与一个或多个外部设备14(例如键盘、指向设备、显示器24等)通信,还可与一个或者多个使得用户能与该计算机设备12交互的设备通信,和/或与使得该计算机设备12能与一个或多个其它计算设备进行通信的任何设备(例如网卡,调制解调器等等)通信。这种通信可以通过输入/输出(I/O)接口22进行。另外,本实施例中的计算机设备12,显示器24不是作为独立个体存在,而是嵌入镜面中,在显示器24的显示面不予显示时,显示器24的显示面与镜面从视觉上融为一体。并且,计算机设备12还可以通过网络适配器20与一个或者多个网络(例如局域网(LAN),广域网(WAN)和/或公共网络,例如因特网)通信。如图所示,网络适配器20通过总线18与计算机设备12的其它模块通信。应当明白,尽管图中未示出,可以结合计算机设备12使用其它硬件和/或软件模块,包括但不限于:微代码、设备驱动器、冗余处理单元、外部磁盘驱动阵列、RAID系统、磁带驱动器以及数据备份存储系统等。
处理单元16通过运行存储在系统存储器28中的程序,从而执行各种功能应用以及数据处理,例如实现本发明实施例所提供的数据发送方法:获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
实施例五
本发明实施例五提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如本申请所有发明实施例提供的数据发送方法:获取待处理样本;根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
可以采用一个或多个计算机可读的介质的任意组合。计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的系统、装置或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子(非穷举的列表)包括:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(CD-ROM)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本文件中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用。
计算机可读的信号介质可以包括在基带中或者作为载波一部分传播的数据信号,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的数据信号可以采用多种形式,包括——但不限于——电磁信号、光信号或上述的任意合适的组合。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用的程序。
计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括——但不限于——无线、电线、光缆、RF等等,或者上述的任意合适的组合。
可以以一种或多种程序设计语言或其组合来编写用于执行本发明操作的计算机程序代码,所述程序设计语言包括面向对象的程序设计语言—诸如Java、Smalltalk、C++,还包括常规的过程式程序设计语言—诸如“C”语言或类似的程序设计语言。程序代码可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络——包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。
注意,上述仅为本发明的较佳实施例及所运用技术原理。本领域技术人员会理解,本发明不限于这里所述的特定实施例,对本领域技术人员来说能够进行各种明显的变化、重新调整和替代而不会脱离本发明的保护范围。因此,虽然通过以上实施例对本发明进行了较为详细的说明,但是本发明不仅仅限于以上实施例,在不脱离本发明构思的情况下,还可以包括更多其他等效实施例,而本发明的范围由所附的权利要求范围决定。
Claims (10)
1.一种数据发送方法,其特征在于,包括:
获取待处理样本;
根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;
根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;
对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单包括:
对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;
根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单之前,还包括:
创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单之前,还包括:
按照预设规则设置上机参数。
5.一种数据发送装置,其特征在于,包括:
获取模块,用于获取待处理样本;
确定模块,用于根据所述待处理样本确定样本信息单和项目信息单;
分析模块,用于根据所述样本信息单和项目信息单对待处理样本进行生物分析,得到目标数据;
发送模块,用于对所述目标数据进行拆分,并将拆分后的目标数据分别发送至对应的终端设备。
6.根据权利要求5所述的装置,其特征在于,所述确定模块具体用于:
对所述待处理样本进行index优化和反向互补去重,得到优化样本;
根据项目类型、上机参数、平台类型以及包Lane类型和优化样本得到样本信息单和项目信息单。
7.根据权利要求5述的装置,其特征在于,还包括:
创建模块,用于创建工作目录,用于存放样本信息单和项目信息单。
8.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,还包括:
设置模块,用于按照预设规则设置上机参数。
9.一种计算机设备,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述程序时实现如权利要求1-4中任一所述的方法。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-4中任一所述的方法。
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