CN109932306A - 一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 - Google Patents
一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 Download PDFInfo
- Publication number
- CN109932306A CN109932306A CN201910416333.5A CN201910416333A CN109932306A CN 109932306 A CN109932306 A CN 109932306A CN 201910416333 A CN201910416333 A CN 201910416333A CN 109932306 A CN109932306 A CN 109932306A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- data
- streaming
- streaming result
- result
- control group
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Landscapes
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Abstract
本发明实施例公开了一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质。该方法包括:获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,根据荧光强度筛选出对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;通过基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定样本组数据的阳性阈值分割线。本发明实施例通过获取流式结果数据,流式结果数据包括对照组数据和样本组数据,根据荧光强度筛选出对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,通过基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定样本组数据的阳性阈值分割线,以提高流式结果分析的准确性,且能实现流式结果的批量化处理,进而将流式检测方法进行临床推广。
Description
技术领域
本发明实施例涉及生物医学检测技术领域,尤其涉及一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质。
背景技术
流式细胞仪是以流式细胞术为基础来实现对细胞进行自动分析和分选的装置,主要由流动室和液流系统、激光源和光学系统、光电管和检测系统以及计算机和分析系统这四部分组成。
目前,流式结果的分析主要依赖于不同型号流式细胞仪自带的计算机分析系统或通用版分析软件FlowJo等进行分析,上述流式分析系统采用双分门工具对标记区的阳性阈值分割线进行划分。但是,这些软件在分析受检样本的阳性率时,尤其是流式结果图中的阳性阈值分割线时,由于对照组中存在具有极高荧光强度的颗粒,对阳性阈值分割线划分造成了极大的干扰,进而可能导致最终的流式结果存在较大差异。这样的情况不仅降低了流式结果的准确度和可信性,而且增加了流式检测方法在临床引用上的推广难度。
发明内容
本发明实施例提供一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质,以提高流式结果分析的准确性,且能实现流式结果的批量化处理,进而将流式检测方法进行临床推广。
第一方面,本发明实施例提供了一种流式结果的分析方法,该分析方法包括:
获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
通过所述基准数据和和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
进一步地,在获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据之后,包括:
选取所述流式结果数据的目的门区,其中,所述流式结果数据的目的门区包括所述对照组数据的目的门区和所述样本组数据的目的门区。
进一步地,在选取所述流式结果数据的目的门区之后,还包括:
对所述对照组数据的目的门区之外的数据点以及所述样本组数据的目的门区之外的数据点进行删除。
进一步地,所述根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,包括:
对所述对照组数据的目的门区之内的数据点按照荧光强度由低到高进行排列;
筛选排列后的所述对照组数据的目的门区之内的数据点,并保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据点;
将所述保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据作为基准数据。
进一步地,所述通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线,包括:
确定所述基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点占基准数据的总数据点的百分比;
根据所述百分比确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
进一步地,所述分析方法还包括:
根据所述样本组数据的阳性阈值分割线获取所述样本组数据的阳性率。
进一步地,所述流式结果数据是一组或是多组数据,每组流式结果数据包括一组所述对照组数据和至少一组所述样本组数据。
第二方面,本发明实施例还提供了一种流式结果的分析系统,该分析系统包括:
流式结果数据获取模块,用于获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
基准数据获得模块,用于根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
阳性阈值分割线确定模块,用于通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
第三方面,本发明实施例还提供了一种流式细胞仪,该流式细胞仪包括:
一个或多个处理器;
存储装置,用于存储多个程序,
当所述多个程序中的至少一个被所述一个或多个处理器执行时,使得所述一个或多个处理器实现本发明第一方面实施例所提供的一种流式结果的分析方法。
第四方面,本发明实施例还提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现本发明第一方面实施例所提供的流式结果的分析的方法。
本发明实施例通过获取流式结果数据,流式结果数据包括对照组数据和样本组数据,根据荧光强度筛选出对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,通过基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定样本组数据的阳性阈值分割线,以提高流式结果分析的准确性,且能实现流式结果的批量化处理,进而将流式检测方法进行临床推广。
附图说明
图1是本发明实施例一提供的一种流式结果的分析方法的流程图;
图2是本发明实施例二提供的一种流式结果的分析方法的流程图;
图3是本发明实施例提供的示例性的现有技术对流式结果分析的重叠直方图;
图4是本发明实施例提供的示例性的流式结果散点图中目的门区选择的示意图;
图5是本发明实施例提供的示例性的确定流式结果数据的目的门区后剔除目的门区以外的数据点的示意图;
图6是本发明实施例提供的示例性的流式结果分析的重叠直方图;
图7是本发明实施例提供的一种流式结果的批量处理分析的结果对比图;
图8是本发明实施例三提供的一种流式结果的分析系统的结构图;
图9是本发明实施例四提供的一种流式细胞仪的硬件结构示意图。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面结合附图对本发明具体实施例作进一步的详细描述。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释本发明,而非对本发明的限定。
另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与本发明相关的部分而非全部内容。在更加详细地讨论示例性实施例之前应当提到的是,一些示例性实施例被描述成作为流程图描绘的处理或方法。虽然流程图将各项操作(或步骤)描述成顺序的处理,但是其中的许多操作可以被并行地、并发地或者同时实施。此外,各项操作的顺序可以被重新安排。当其操作完成时所述处理可以被终止,但是还可以具有未包括在附图中的附加步骤。所述处理可以对应于方法、函数、规程、子例程、子程序等等。
实施例一
图1为本发明实施例一提供的一种流式结果的分析方法的流程图,本实施例可适用于客观地对流式检测结果进行分析的情况,该方法可以由一种流式结果的分析系统来执行,具体包括如下步骤:
S110、获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据。
其中,流式细胞仪在整个流式结果文档中检测流式结果数据,检测出的流式结果数据可以是一组或是多组数据,每组流式结果数据包括一组所述对照组数据和至少一组所述样本组数据。
示例性地,采用美国BD公司的流式细胞仪产生文件后缀名为.c6的流式结果数据文档,在整个流式结果数据文档中检测出了4组流式结果数据,每组流式结果数据均设有对照组数据、样本A组数据以及样本B组数据等,在本实施例中具体的样本组数据的组数是由实际需要分析的流式结果数据的目的以及本领域技术人员的分析要求进行设置的,此处样本组数据的具体名称仅是示例,而非对其进行的限制。
S120、根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据。
具体地,预设阈值可以在本发明实施例提供的流式结果的分析系统上由本领域技术人员根据分析要求进行自由设定,本实施仅对此进行解释说明,不对具体的阈值进行限制。
对照组数据中的数据点可以按照荧光强度由低到高进行排列,筛选对照组数据中小于预设阈值的数据,相当于对排列后的对照组数据的数据点保留了预设阈值左侧一定范围的数据点,例如,在本发明实施例提供的流式结果的分析系统上进行保留99.8%或是保留97%等形式的输入,而将在范围以外的数据点直接进行剔除,也就是说,这样设置的目的是为了去除对照组中具有极高荧光值的异常数据点。由于对照组数据中存在极少数具有极高荧光强度的颗粒,对阳性阈值分割线划分造成了极大的干扰,从而导致了分析样本阳性率的结果存在较大的差异。例如,示例样本(表1和表2中GPC1样本组标记区间的阳性率结果),在采用统一的样本阳性阈值分割线(例如,对照组中阳性阈值分割线右侧数据点数,占对照组总数据点数的0.03%)情况下,按现有技术划分阳性率时,样本阳性率为18.89%(表1),且主观上的结果与检测结果并不相符,而去除对照组中极少数的异常荧光强度点(约90个极高荧光强度的数据点,约占门区内数据点数的0.3%,门区内收集30000个数据点)后重新划分阳性率为83.04%(表2),此时分析结果更接近客观事实。故而在临床上批量处理检测结果时极易造成阳性受检者被误判为阴性,然而,这个严肃的问题尚未引起流式分析人员的重视,甚至是在科研类研究中也未提及这个问题。而本实施例提供的技术方案解决了由于对照组数据中存在一定量的极高荧光强度的颗粒,对流式结果直方图中标记区的阳性阈值分割线位置的确定造成影响的问题,得到更为准确的用于流式结果分析的基准数据,同时可以通过本发明实施例提供的流式结果数据的分析系统上自由设定需要去除的对照组数据中异常数据点的比例,具体的设定去除比例的方式可以通过python对分析系统的程序进行选择性的修改进行实现,也可以通过其他编程语言对分析系统的程序进行修改以达到自由设定去除比例的功能,本发明实施例对具体的实现方式仅做示例性解释,而不对此进行限制。
S130、通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
具体的,在获取到基准数据后,将基准数据和样本组数据的散点图生成分析视图,分析视图中的图形都是重叠直方图,重叠直方图的横坐标为对数模式,纵坐标为线性模式。每个图中有且只有一个范围门限。基准数据中预设门内数据阈值可以由本领域技术人员根据实际情况进行设置,在本发明实施例中可以将基准数据中预设门内数据阈值左侧或是右侧范围内的数据点作为基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点,则根据基准数据中预设门内数据阈值左侧或是右侧范围内的数据点占所述基准数据的总数据点的百分比,进一步确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
需要说明的是,所述预设门内数据阈值与满足基准数据中预设门内数据阈值的数据点占所述基准数据的总数据点的百分比有直接明确对应关系。例如,将基准数据中预设门内数据阈值右侧范围内的数据点占所述基准数据的总数据点的百分比设定为0.03%,则表示对照组中阳性阈值分割线右侧的数据点占对照组的总数据点的0.03%。此时,对照组中阳性阈值分割线右侧的数据点即为满足基准数据中预设门内数据阈值的数据点。
具体的,在本发明实施例提供的流式结果的分析系统上,指定基准数据和基准数据中预设门内数据阈值左侧范围内的数据点占基准数据的总数据点的百分比,此时可在重叠直方图中确定基准数据中满足预设门内数据阈值条件范围内数据点的右侧边界限,即为对应样本组数据的阳性阈值分割线。如果指定基准数据和基准数据预设门内数据阈值右侧范围内的数据点占基准数据的总数据点的百分比,此时可在重叠直方图中确定基准数据中满足预设门内数据阈值条件范围内数据点的左侧边界限,即为对应样本组数据的阳性阈值分割线。现有技术中,在进行样本阳性率分析时如何实现精准阳性阈值分割线的确定,是流式检测结果分析中的难题。在采用流式细胞术分析样本阳性率时,需要对目的门区内的数据进行再次分析,根据阴性对照组数据的荧光强度范围来确定样本阴阳性的划分阈值线。然而,目前关于阈值线的位置的确定完全依赖于分析人员的主观判断,研究界尚未有最佳的对阴阳性阈值分割线进行划分的统一标准或限定范围,因此,流式检测结果分析对分析人员专业性的要求比较高,这是流式检测项目在临床推广应用过程中的难点之一。本发明实施例的技术方案克服了分析人员主观决定阈值分割线对数据分析结果的影响,基于基准数据以及根据基准数据和预设门内数据阈值左侧或是右侧范围内的数据点占基准数据的百分比的自由设定,结合实验目的、实验对象以及实验数据等方面进行有目的的设定,实现对整个流式结果数据分析的精准把控。通过确定基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点占所述基准数据的总数据点的百分比,在对样本组数据批量处理确定其阳性阈值分割线时,可以批量预设该阈值,实现流式检测数据的批量化处理。需要说明的是本发明实施例中流式结果数据在对应的分析软件中是由散点图进行显示的,基于对流式结果数据文件的要求,采集视图中的第一个图形是FSC-A与SSC-A散点图,散点图的横坐标和纵坐标均为线性模式,图中有且只有一个矩形门限。
需要说明的是本发明实施例提供的整个流式结果分析过程中,可以由本发明实施例提供的流式结果数据的分析系统进行实现,但不限于仅可以由该分析系统进行实现,可以由任意的流式结果数据的分析软件进行执行,即任意能够实现本发明实施例提供的流式结果数据的分析方法的分析软件,本发明实施例仅是对流式结果数据的分析过程进行解释说明,而不对实现手段进行限制。同时,在本发明实施例提供的整个流式结果数据的分析过程后,可以实现将得到的流式结果数据仍然生成适用于流式结果数据处理软件打开的文档格式,以使得处理后的流式结果数据依然具有通用性,示例性地,采用美国BD公司的流式细胞仪产生的文件后缀名为.c6的流式结果数据文档,在经过本发明实施例的分析方法进行处理以后,得到的流式结果数据的文件后缀名仍然为.c6,即处理后的流式结果数据的文件仍然可以被美国BD公司的BD Accuri C6 Software打开。
另外需要说明的是目前批量化流式结果的分析主要依赖于不同型号流式细胞仪自带的计算机分析系统进行分析,通用版分析软件如FlowJo等,上述流式分析系统采用双分门工具对标记区的阳性阈值分割线进行划分。但是,这些软件在分析受检样本的阳性率时,尤其是流式结果图中的阳性阈值分割线时,必须依赖于分析人员针对每一个样本单独调整。若批量化处理则会导致多数样本出现阳性率过高或过低的问题,经本发明实施例前期研究发现,其主要原因之一在于对照组中存在极少数具有极高荧光强度的颗粒,对阳性阈值分割线划分造成了极大的干扰,从而导致了样本阳性率结果存在较大的差异。现有技术中,门区设定是根据FSC 和SSC的散点图来设定的,而样本1的对照组中异常荧光强度点的位置与样本2、样本3等异常荧光强度点的位置无法保证在同一区域,适用于样本1去除异常荧光强度点的二次或多次门区,并不适用于其他样本。因此,采用二次或多次设定门区的方法,也不能解决批量处理流式检测结果时门区内异常荧光强度点造成的干扰的问题。在本发明实施例的技术方案中提到的流式检测结果处理分析方法是流式结果批量化分析中极其重要的创新点,其可以解决流式结果分析对分析人员专业程度的高度依赖性问题,以及流式检测结果分析标准化的问题,有利于流式检测方法在临床上的应用及推广。
本发明实施例通过获取流式结果数据,流式结果数据包括对照组数据和样本组数据,筛选出对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,通过基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定样本组数据的阳性阈值分割线,以提高流式结果分析的准确性,且能实现流式结果的批量化处理,进而将流式检测方法进行临床推广。
实施例二
图2为本发明实施例二提供的一种流式结果的分析方法的流程图。本实施例以上述实施例为基础进行优化。本实施例的方法具体包括:
S210、获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据。
S220、选取所述流式结果数据的目的门区,其中,所述流式结果数据的目的门区包括所述对照组数据的目的门区和所述样本组数据的目的门区。
具体的,在流式结果数据通过相应的流式结果数据分析软件进行打开后,采集视图是散点图,现有技术中对流式结果数据进行分析,也是先对流式结果数据进行目的门区的选择,也就是说,流式结果数据分析的数据是可以由本领域技术人员指定流式结果数据门区内的数据点进行分析的。
需要说明的是现有技术中在流式检测过程中主要通过调节FSC以及SSC的参数来排除碎片或噪声的干扰,并根据FSC 和SSC散点图上不同细胞分布来设定目的群体的门区。而设门是一个主观行为,所以设门是需要主观决策,同时也要尽可能的客观。而为了尽可能减少门区设定以及分析人员主观决定对数据的影响,现有技术通常在流式检测过程中根据目的颗粒群体的位置设定门区,然后收集目的门区内10000-20000个颗粒,通过增加门区内数据收集量来尽可能减少门区内异常荧光强度数据点对样本阳性率分析时的干扰。然而,在临床上,尤其是以样本阳性率作为临床诊断标准时,流式结果判读的准确性和统一的判读标准是非常必要的条件。同样,在科学研究中,流式结果的处理也迫切需要在同一分析标准下进行数据处理,这就要求流式检测结果分析要更加客观准确,且能实现数据批量化处理。本实施例提供的技术方案旨在客观的完成目的门区内数据的分析,依据流式结果数据的分析要求对目的门区进行指定的设置,操作简便。
示例性地,以流式细胞仪检测出的一组流式结果数据为例,流式结果数据包括一组对照组数据和两组样本组数据。一组对照组数据为不加目的蛋白一抗,仅加荧光二抗的对照组,荧光二抗是专门与一抗进行特异性反应和结合的抗体;一组样本组数据为加CD82一抗识别CD82蛋白的CD82蛋白样本组,另一组样本组数据为加GPC1一抗识别GPC1蛋白的GPC1蛋白样本组。采用传统的流式结果数据分析方法,得到的分析结果的重叠直方图如图3所示,具体的流式检测结果数据分析见下表1,流式结果数据中CD82蛋白样本组的阳性率为38.65%,GPC1蛋白样本组的阳性率为18.89%,从图3中可以看出CD82蛋白样本组及GPC1蛋白样本组明显属于强阳性样本,经分析是对照组数据存在一定量极高荧光强度的颗粒,干扰标记区阳性界限位置的确定。
表1:流式结果数据的分析
名称 | 颗粒数 | 占目的门区内数据点的百分比 | 占读取到全部数据点的百分比 | 平均荧光强度 |
对照组的目的门区内数据点 | 30,000 | 100.00% | 54.97% | 2,616.90 |
对照组的标记区间内数据点 | 31 | 0.03% | 0.06% | 25,523.42 |
CD82蛋白样本组的目的门区内数据点 | 30,000 | 100.00% | 58.71% | 19,630.73 |
CD82蛋白样本组 的标记区间内数据点 | 11,596 | 38.65% | 22.69% | 27,297.21 |
GPC1蛋白样本组的目的门区内数据点 | 30,000 | 100.00% | 56.36% | 15,535.05 |
GPC1蛋白样本组 的标记区间内数据点 | 5,668 | 18.89% | 10.65% | 26,168.30 |
S230、对所述对照组数据的目的门区之外的数据点以及所述样本组数据的目的门区之外的数据点进行删除。
在本发明实施例提供的技术方案中,如图4是本发明实施例提供的示例性的在流式结果分析的散点图中选择目的门区的示意图,在确定流式结果数据的目的门区后剔除目的门区以外的数据点的示意图如图5所示。
S240、对所述对照组数据的目的门区之内的数据点按照荧光强度由低到高进行排列。
S250、筛选排列后的所述对照组数据的目的门区之内的数据点,并保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据点。
S260、将所述保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据作为基准数据。
相对于现有技术中仅是选择目的门区后对门区内全部数据点进行分析,本发明所得到的分析结果相较于现有技术更为准确。
S270、确定所述基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点占基准数据的总数据点的百分比。
S280、根据所述百分比确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
在本发明实施例提供的技术方案中,将经过筛选的对照组数据定义为基准数据,通过本发明实施例提供的流式结果分析系统指定分析基准数据和预设门内数据阈值左侧或是右侧范围内的数据点占基准数据总数据点的百分比数据,此时得到如图6所示的流式结果分析的重叠直方图,图6中所示的门限左侧边界即该流式结果分析得到的阳性阈值分割线。
S290、根据所述样本组数据的阳性阈值分割线获取所述样本组数据的阳性率。
通过本发明实施例提供的流式结果分析系统可以得到样本组数据的阳性率,该阳性率不限于仅可以由该分析系统进行获取,可以由能够实现本发明实施例提供的流式结果数据的分析方法的任意的流式结果数据的分析软件进行获取,本发明实施例仅是对流式结果数据的分析过程进行解释说明,而不对实现手段进行限制。
示例性地,通过本发明实施例提供的流式结果分析方法对流式数据进行定比例去除极高荧光强度数据点后得到的分析结果见下表2所示,所得到的流式结果数据中CD82蛋白样本组的阳性率为95.33%,GPC1蛋白样本组的阳性率为83.04%。可见,在去除对照组数据中0.3%的极高荧光强度数据点后(例如流式结果数据共采集了30000个数据点,则去除90个数据点),然后进行标记门区的阳性阈值分割线的划分,此时从重叠直方图6中可以看出标记区的阳性阈值分割线明显向左移动,这样就证实了传统方法中阳性率偏低的现象确实是由对照组数据中少数离群点(即极高荧光强度颗粒)造成的干扰。
表2:流式结果定比例去极值得到的分析结果
名称 | 颗粒数 | 占目的门区内数据点的百分比 | 占读取到全部数据点的百分比 | 平均荧光强度 |
对照组的目的门区内数据点 | 29,910 | 100.00% | 100.00% | 2,570.07 |
对照组的标记区间内数据点 | 9 | 0.03% | 0.03% | 10,402.67 |
CD82蛋白样本组的目的门区内数据点 | 30,000 | 100.00% | 100.00% | 19,630.73 |
CD82蛋白样本组 的标记区间内数据点 | 28,599 | 95.33% | 95.33% | 20,217.90 |
GPC1蛋白样本组的目的门区内数据点 | 30,000 | 100.00% | 100.00% | 15,535.05 |
GPC1蛋白样本组 的标记区间内数据点 | 24,912 | 83.04% | 83.04% | 17,105.00 |
图7为本发明实施例提供的一种流式结果的批量处理分析的结果对比图,其中,虚线箭头是未去除极值点的阳性阈值分割线位置,实线箭头是去除0.3%极高荧光强度数据点后的阳性阈值分割线位置。为确认流式结果定比例去极值分析法的效果,对现有技术中对照组数据保留100%的数据点的分析结果,与本发明实施例提供的流式结果定比例去极值分析法中对照组数据保留最小值右侧99.7%的数据点获得的GPC1蛋白、CD82蛋白的阳性率,随机选取56例样本进行比较。结果显示如图7所示,采用本发明实施例提供的流式结果定比例去极值分析法,分析后流式结果GPC1蛋白、CD82蛋白的阳性率变化程度可以划分为3组,组1的阳性率明显升高,平均升高34.41%,42.85%(fig D),组2的阳性率平均升高13.24%,15.04%(fig E),组3阳性率平均升高4.57%,4.11%(Fig F),不具备统计学差异。结合直方图figABC可以看出本发明实施例提供的较高阳性率样本(A、B)流式结果定比例去极值分析法得到的阳性阈值分割线位置更接近阴阳性直观分割点,而对于低阳性率样本(C),优化后的阳性阈值分割线其阳性率结果并未有明显差异,或异常升高现象,即本发明实施例提供的流式结果定比例去极值分析法不仅避免了传统分析方法判读造成的假阴性结果,还可以保证真阴性结果的稳定性,是一种保证流式检测结果客观准确分析的新方法。本发明实施例提供的流式结果定比例去极值分析法不仅应用方法简便、适用性强,还可批量化处理流式检测数据,极具推广优势。
实施例三
图8为本发明实施例三提供的一种流式结果的分析系统的结构图,本实施例可适用于客观地对流式检测结果进行分析的情况。
如图8所示,所述分析系统包括:流式结果数据获取模块310、基准数据获得模块320和阳性阈值分割线确定模块330,其中:
流式结果数据获取模块310,用于获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
基准数据获得模块320,用于根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
阳性阈值分割线确定模块330,用于通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
本实施例的一种流式结果的分析系统,通过获取流式结果数据,流式结果数据包括对照组数据和样本组数据,筛选出对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,通过基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定样本组数据的阳性阈值分割线,以提高流式结果分析的准确性,且能实现流式结果的批量化处理,进而将流式检测方法进行临床推广。
在上述各实施例的基础上,在获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据之后,包括:
选取所述流式结果数据的目的门区,其中,所述流式结果数据的目的门区包括所述对照组数据的目的门区和所述样本组数据的目的门区。
在上述各实施例的基础上,在选取所述流式结果数据的目的门区之后,还包括:
对所述对照组数据的目的门区之外的数据点以及所述样本组数据的目的门区之外的数据点进行删除。
在上述各实施例的基础上,所述基准数据获得模块320,包括:
数据点排列单元,用于对所述对照组数据的目的门区之内的数据点按照荧光强度由低到高进行排列;
数据保留单元,用于筛选排列后的所述对照组数据的目的门区之内的数据点,并保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据点;
基准数据确定单元,用于将所述保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据作为基准数据。
在上述各实施例的基础上,阳性阈值分割线确定模块330,包括:
百分比确定单元,用于确定所述基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点占基准数据的总数据点的百分比;
阳性阈值分割线确定单元,用于根据所述百分比确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
在上述各实施例的基础上,所述分析系统还包括:
阳性率获取模块,用于根据所述样本组数据的阳性阈值分割线获取所述样本组数据的阳性率。
在上述各实施例的基础上,所述流式结果数据是一组或是多组数据,每组流式结果数据包括一组所述对照组数据和至少一组所述样本组数据。
上述各实施例所提供的流式结果的分析系统可执行本发明任意实施例所提供的流式结果的分析方法,具备执行流式结果的分析方法相应的功能模块和有益效果。
实施例四
如图9所示是本发明实施例四提供的一种流式细胞仪的硬件结构示意图,如图9所示,该流式细胞仪包括:一个或多个处理器410,图9中以一个处理器410为例;存储器420;所述流式细胞仪还可以包括:输入装置430和输出装置440。
所述设备中的处理器410、存储器420、输入装置430和输出装置440可以通过总线或者其他方式连接,图9中以通过总线450连接为例。
存储器420作为一种非暂态计算机可读存储介质,可用于存储软件程序、计算机可执行程序以及模块,如本发明实施例中的一种流式结果的分析方法对应的程序指令/模块(例如,附图8所示的流式结果数据获取模块310、基准数据获得模块320和阳性阈值分割线确定模块330)。处理器410通过运行存储在存储器420中的软件程序、指令以及模块,从而执行设备的各种功能应用以及数据处理,即实现上述方法实施例的一种流式结果的分析方法。
存储器420可以包括存储程序区和存储数据区,其中,存储程序区可存储操作系统、至少一个功能所需要的应用程序;存储数据区可存储根据设备的使用所创建的数据等。此外,存储器420可以包括高速随机存取存储器,还可以包括非暂态性存储器,例如至少一个磁盘存储器件、闪存器件、或其他非暂态性固态存储器件。在一些实施例中,存储器420可选包括相对于处理器410远程设置的存储器,这些远程存储器可以通过网络连接至终端设备。上述网络的实例包括但不限于互联网、企业内部网、局域网、移动通信网及其组合。
输入装置430可用于接收输入的数字或字符信息,以及产生与设备的用户设置以及功能控制有关的键信号输入。输出装置440可包括显示屏等显示设备。
实施例五
本发明实施例五还提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如本发明实施例所提供的流式结果的分析方法,该分析方法包括:
获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
当然,本发明实施例所提供的一种计算机可读存储介质,其上存储的计算机程序不限于如上所述的方法操作,还可以执行本发明任意实施例所提供的流式结果的分析方法中的相关操作。
本发明实施例的计算机存储介质,可以采用一个或多个计算机可读的介质的任意组合。计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的系统、装置或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子(非穷举的列表)包括:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(CD-ROM)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本文件中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用。
计算机可读的信号介质可以包括在基带中或者作为载波一部分传播的数据信号,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的数据信号可以采用多种形式,包括但不限于电磁信号、光信号或上述的任意合适的组合。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行系统、装置或者器件使用或者与其结合使用的程序。
计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括——但不限于无线、电线、光缆、RF等等,或者上述的任意合适的组合。
可以以一种或多种程序设计语言或其组合来编写用于执行本发明操作的计算机程序代码,所述程序设计语言包括面向对象的程序设计语言—诸如Java、Smalltalk、C++、python,还包括常规的过程式程序设计语言—诸如”C”语言或类似的程序设计语言。程序代码可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络——包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。
注意,上述仅为本发明的较佳实施例及所运用技术原理。本领域技术人员会理解,本发明不限于这里所述的特定实施例,对本领域技术人员来说能够进行各种明显的变化、重新调整和替代而不会脱离本发明的保护范围。因此,虽然通过以上实施例对本发明进行了较为详细的说明,但是本发明不仅仅限于以上实施例,在不脱离本发明构思的情况下,还可以包括更多其他等效实施例,而本发明的范围由所附的权利要求范围决定。
Claims (10)
1.一种流式结果的分析方法,其特征在于,包括:
获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据之后,包括:
选取所述流式结果数据的目的门区,其中,所述流式结果数据的目的门区包括所述对照组数据的目的门区和所述样本组数据的目的门区。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,在选取所述流式结果数据的目的门区之后,还包括:
对所述对照组数据的目的门区之外的数据点以及所述样本组数据的目的门区之外的数据点进行删除。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据,包括:
对所述对照组数据的目的门区之内的数据点按照荧光强度由低到高进行排列;
筛选排列后的所述对照组数据的目的门区之内的数据点,并保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据点;
将所述保留排列后的所述对照组数据的目的门区之内小于预设阈值的数据作为基准数据。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线,包括:
确定所述基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点占所述基准数据的总数据点的百分比;
根据所述百分比确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括:
根据所述样本组数据的阳性阈值分割线获取所述样本组数据的阳性率。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述流式结果数据是一组或是多组数据,每组流式结果数据包括一组所述对照组数据和至少一组所述样本组数据。
8.一种流式结果的分析系统,其特征在于,包括:
流式结果数据获取模块,用于获取基于流式细胞仪检测出的流式结果数据,其中,所述流式结果数据包括对照组数据和样本组数据;
基准数据获得模块,用于根据荧光强度筛选出所述对照组数据中小于预设阈值的数据作为基准数据;
阳性阈值分割线确定模块,用于通过所述基准数据和基准数据中满足预设门内数据阈值条件的数据点确定所述样本组数据的阳性阈值分割线。
9.一种流式细胞仪,其特征在于,所述流式细胞仪包括:
一个或多个处理器;
存储装置,用于存储一个或多个程序;
当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行,使得所述一个或多个处理器实现如权利要求1-7中任一所述的流式结果的分析方法。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理器执行时实现如权利要求1-7中任一所述的流式结果的分析方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910416333.5A CN109932306A (zh) | 2019-05-20 | 2019-05-20 | 一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201910416333.5A CN109932306A (zh) | 2019-05-20 | 2019-05-20 | 一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN109932306A true CN109932306A (zh) | 2019-06-25 |
Family
ID=66991358
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201910416333.5A Pending CN109932306A (zh) | 2019-05-20 | 2019-05-20 | 一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN109932306A (zh) |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20130137119A1 (en) * | 2011-11-30 | 2013-05-30 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human | Detection of bacterial contamination in a sample |
CN107532333A (zh) * | 2015-02-22 | 2018-01-02 | 里兰斯坦福初级大学理事会 | 微筛选装置、方法和产品 |
-
2019
- 2019-05-20 CN CN201910416333.5A patent/CN109932306A/zh active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20130137119A1 (en) * | 2011-11-30 | 2013-05-30 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human | Detection of bacterial contamination in a sample |
CN107532333A (zh) * | 2015-02-22 | 2018-01-02 | 里兰斯坦福初级大学理事会 | 微筛选装置、方法和产品 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
ARIFUL AZAD: "Immunophenotype Discovery, Hierarchical Organization, and Template-Based Classification of Flow Cytometry Samples", 《IMMUNOPHENOTYPE DISCOVERY》 * |
DEREK DAVIES: "putting down a marker in flow cytometry to help determine positivity", 《HTTPS://BITESIZEBIO.COM/24573/PUTTING-DOWN-A-MARKER-IN-FLOW-CYTOMETRY-TO-HELP-DETERMINE-POSITIVITY》 * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Tanaka et al. | Performance evaluation of platelet counting by novel fluorescent dye staining in the XN‐series automated hematology analyzers | |
US11879829B2 (en) | Methods and systems for classifying fluorescent flow cytometer data | |
EP2694960B1 (en) | Identifying and enumerating early granulated cells (egcs) | |
US20230071301A1 (en) | Blood cell analysis method and blood cell analyzer | |
JP2008523354A (ja) | フロー・アナライザからデータを管理するための装置と方法 | |
WO2019015611A1 (zh) | 提高白细胞分类结果准确性和计数结果重复性的方法及设备 | |
Chain et al. | Digital image‐assisted quantitative nuclear analysis improves diagnostic accuracy of thyroid fine‐needle aspiration cytology | |
Tantanate et al. | Performance evaluation of automated impedance and optical fluorescence platelet counts compared with international reference method in patients with thalassemia | |
JP5370486B2 (ja) | プログラム動作をフィルタリング・モニタリングするための方法とシステム | |
CN103364324A (zh) | 一种用于血液细胞分析仪的自适应分类计算方法 | |
CN104568844A (zh) | 尿样本分析装置及尿样本分析方法 | |
WO2021225792A1 (en) | Methods and systems for characterizing spillover spreading in flow cytometer data | |
Sireci et al. | A method for optimizing and validating institution-specific flagging criteria for automated cell counters | |
US10241048B2 (en) | Blood analyzing method and blood analyzer | |
US11709123B2 (en) | Method for analyzing nucleated red blood cells, blood cell analyzer, and storage medium | |
Rosenberg et al. | Exploring dyserythropoiesis in patients with myelodysplastic syndrome by imaging flow cytometry and machine‐learning assisted morphometrics | |
CN110887818B (zh) | 一种血液样本的分析方法和血液细胞分析仪及存储介质 | |
US11193927B2 (en) | Automated body fluid analysis | |
Lee et al. | Performance evaluation of Mindray CAL 8000 (BC‐6800 and SC‐120) hematology analyzer and slidemaker/stainer | |
Craig et al. | Computational analysis optimizes the flow cytometric evaluation for lymphoma | |
CN109932306A (zh) | 一种流式结果的分析方法、系统、流式细胞仪及介质 | |
WO2020042027A1 (zh) | 血液样本检测的方法、血液样本检测仪和存储介质 | |
CN109389972A (zh) | 语义云功能的质量测试方法、装置、存储介质和设备 | |
Da Rin et al. | Multicentric evaluation of the variability of digital morphology performances also respect to the reference methods by optical microscopy | |
Mohamed-Rachid et al. | Comparative analysis of four methods for enumeration of platelet counts in thrombocytopenic patients |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20190625 |
|
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |