CN108628899A - 基因突变数据库检索方法和系统 - Google Patents

Abstract

本发明涉及一种基因突变数据库检索方法，其包括定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中；从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组；根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息；以及根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。本发明还提供一种基因突变数据库检索系统，本发明的基因突变数据库检索方法和系统检索速度快，用户体验好。

Description

基因突变数据库检索方法和系统

技术领域

本发明涉及基因测序领域，更具体地说，本发明涉及一种基因突变数据库检索方法和系统。

背景技术

基因测序需要处理大量的数据，现有数据库一般通过网页界面显示数据并提供查询窗口进行数据库查询，通过在前端显示的网页界面中直接检索关键词，需要遍历网页界面寻找节点获取所有的待搜索词，检索速度较慢，影响用户体验。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基因突变数据库检索方法和系统，旨在解决现有技术检索速度慢的技术问题。

一种基因突变数据库检索方法包括：

定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中；

从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组；

根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息；以及

根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。

进一步地，所述第一网页界面包括多个依次排列的分页界面，每个分页界面按照预设顺序依次排列和显示所述基因信息。

进一步地，所述定位第一网页界面的显示位置为：将检索结果指向的分页界面定义为前端显示界面，并在所述分页界面高亮显示对应包括第一关键词的基因信息。

进一步地，所述基因信息包括一个或多个突变信息，第一网页界面对应每个基因信息设置有基因信息展开按钮，用于控制显示每个基因信息对应的突变信息。

进一步地，所述突变信息和对应的基因信息预先存储在所述基因突变数据库中。

进一步地，所述突变信息包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。

进一步地，所述基因突变数据库检索方法进一步包括：

在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口；

根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息；以及

根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。

进一步地，所述第二网页界面为第一网页界面内的动态显示窗口。

一种基因突变数据库检索系统包括：

网页定义模块，用于定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中；

第一网页建立模块，用于从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组；

基因信息检索模块，用于根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息；以及

第一检索显示模块，用于根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。

进一步地，所述的基因突变数据库检索系统还包括：

第二网页建立模块，在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口；

突变信息检索模块，根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息；以及

第二检索显示模块，根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。

相较于现有技术，本发明的基因突变数据库检索方法和系统通过将生成所述第一网页界面所需的基因信息缓存至第一检索数组，用户直接从缓存的第一检索数组就可对网页显示或隐藏的基因信息数据进行检索，检索速度快体验较好，避免了用户对整个网页进行检索时分析网页结构遍历网页节点。进一步地，本发明提供的关键词匹配窗口可以根据第一搜索窗口或第二搜索窗口内内输入的部分关键词动态显示检索数组中含有所述部分关键词基因信息，使得用户可以更快地输入或选择完整的关键词，避免记忆大量基因信息。由于基因信息对应的突变信息量较大，名称也比较相似，为了方便用户查询对应基因信息的突变信息，本实施例提供第二网页界面进一步对用户关心的基因信息所包括的突变信息进行检索查询，由于第二网页界面是根据用户点选的基因信息动态生成，无需从数据库调用大量的突变信息数据，因此网页加载速度较快。另外，第二网页界面70提供第二搜索窗口直接调用第二检索数组进行第二关键词检索，无需对第一网页界面20和第二网页界面70进行分析和查询，因此检索速度非常快。

附图说明

图1为本发明第一实施方式基因突变数据库检索方法的流程示意图。

图2为图1基因突变数据库检索方法第一网页界面的示意图。

图3为图2中第一网页界面的分页界面示意图。

图4为图2第一网页界面的关键词匹配窗口的示意图。

图5为图1第一实施方式基因突变数据库检索方法的检索结果示意图。

图6为本发明第二实施方式基因突变数据库检索方法的流程示意图。

图7为图6基因突变数据库检索方法使用的第二网页界面的示意图。

图8为图7第二网页界面的关键词匹配窗口的示意图。

图9为在图7第二网页界面的第二搜索窗口输入关键词的示意图。

图10为图1第二实施方式基因突变数据库检索方法的检索结果示意图。

图11为本发明第三实施方式基因突变数据库检索系统的模块示意图。

具体实施方式

为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合附图及实施方式，对本发明进行进一步详细说明。

请参考图1，本发明第一实施方式提供一种基因突变数据库检索方法，其包括步骤S11-S14。

步骤S11, 定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中。本发明中所述基因信息可以为基因名称。所述基因突变数据库中预先存储有多个与一种或多种疾病或能力相关的基因名称，所述基因通常包括一个或多个对应不同疾病或能力的突变信息或突变信息。本实施中，所述突变信息至少包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。所述第一搜索窗口用于输入需要检索的关键词。

步骤S12,从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组。一并参考图2-3，本实施例中，所述第一网页界面20包括多个依次排列的分页界面21，每个分页界面按照预设顺序依次排列和显示所述基因信息。本实施例中，为了加快用户浏览速度，所述多个分页界面的标签分别以字母顺序排列，每个分页界面的标签对应基因名称的首字母。参考图2-3，本实施例中，将所述基因突变数据库中读取的多个基因信息用于生成第一网页界面的同时缓存为数组，并将缓存的数组和所述第一搜索窗口相关联。

步骤S13,根据第一搜索窗口输入的关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息。本实施例中，进一步包括一关键词匹配窗口24，用于根据第一搜索窗口22内输入的全部或部分关键词动态显示检索数组中含有所述部分关键词的基因信息。请参考图3，一实施方式中，在第一搜索窗口22输入需要检索的部分关键词，例如 “F”,此时第一搜索窗口22的位置向下弹出所述关键词匹配窗口24，并匹配显示检索数组中含有“F”的多个基因信息，例如 “F8”、“F9”、“FBN1”、“FCER2”和“FGFR3”。本发明中由于第一搜索窗口直接调用第一检索数组进行关键词检索，因此检索速度非常快，而且关键词匹配窗口可以协助用户更快地输入完整的关键词，避免记忆大量基因信息。

步骤S14,根据关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。本实施例中，所述定位第一网页界面的显示位置为将检索结果指向的分页界面定义为前端显示界面，并在所述分页界面高亮显示对应包括关键词的基因信息。参阅图5，一实施例中，设第一搜索窗口输入的关键词为“F8”并通过查找按钮23进行查询后，第一搜索窗口22根据第一检索数组中“F8”在第一网页界面的位置将基因信息“F8”所在的第二个分页界面21定义为前端显示界面进行显示，并高亮关键词“F8”代表的基因信息。

相较于现有技术，本发明的基因突变数据库检索方法通过将生成所述第一网页界面所需的基因信息缓存至第一检索数组，用户直接从缓存的第一检索数组就可对网页显示或隐藏的基因信息数据进行检索，检索速度快体验较好，避免了用户对整个网页进行检索时分析网页结构遍历网页节点。进一步地，本发明提供的关键词匹配窗口可以根据第一搜索窗口内输入的部分关键词动态显示检索数组中含有所述部分关键词基因信息，使得用户可以更快地输入或选择完整的关键词，避免记忆大量基因信息。

请参考图2，本发明第二实施方式提供一种基因突变数据库检索方法，其包括步骤S61-S67。

步骤S61,定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息及对应突变信息预先存储在基因突变数据库中。本发明中所述基因信息可以为基因名称。所述基因突变数据库中预先存储有多个与一种或多种疾病或能力相关的基因名称，所述基因通常包括一个或多个对应不同疾病或能力的突变信息。本实施中，所述突变信息至少包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。所述第一搜索窗口用于输入需要检索的关键词。

步骤S62，从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组。一并参考图2-3，本实施例中，所述第一网页界面20包括多个依次排列的分页界面21，每个分页界面按照预设顺序依次排列和显示所述基因信息。本实施例中，为了加快用户浏览速度，所述多个分页界面的标签分别以字母顺序排列，每个分页界面的标签对应基因名称的首字母。参考图2-3，本实施例中，将所述基因突变数据库中读取的多个基因信息用于生成第一网页界面的同时缓存为数组，并将缓存的数组和所述第一搜索窗口相关联。

步骤S63，根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息。本实施例中，所述第一搜索窗口还包括第一关键词匹配窗口，用于根据第一搜索窗口内输入的全部或部分第一关键词动态显示检索数组中含有所述部分第一关键词基因信息。请参考图4，一实施方式中，在第一搜索窗口22输入需要检索的部分第一关键词，例如“F”,此时第一搜索窗口的位置向下弹出所述第一关键词匹配窗口，并匹配显示检索数组中含有“F”的多个基因信息，例如 “F8”、“F9”、“FBN1”、“FCER2”和“FGFR3”。本发明中由于第一搜索窗口直接调用第一检索数组进行第一关键词检索，因此检索速度非常快，而且第一关键词匹配窗口可以协助用户更快地输入完整的第一关键词，避免记忆大量基因信息。

步骤S64,根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。本实施例中，所述定位第一网页界面的显示位置为将检索结果指向的分页界面定义为前端显示界面，并在所述分页界面高亮显示对应包括第一关键词的基因信息。参阅图5，一实施例中，设第一搜索窗口输入的第一关键词为“F8”并通过点选查找按钮23进行查询后，第一搜索窗口22根据第一检索数组中“F8”在第一网页界面的位置将基因信息“F8”所在的第二个分页界面21定义为前端显示界面进行显示，并高亮关键词“F8”代表的基因信息。

步骤S65，在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口。请一并参阅图7，本实施例中，第一网页界面对应每个基因信息设置有一个基因信息展开按钮76，用于控制显示每个基因信息对应的突变信息。本实施例中，所述突变信息和对应的基因信息预先存储在所述基因突变数据库中，所述突变信息至少包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。当用户点击基因信息对应的展开菜单按钮76时，所述网页程序自动从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面70，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口72。本实施例所述第二网页界面为第一网页界面内的动态显示窗口。

步骤S66，根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息。本实施例中，所述第二搜索窗口72还包括第二关键词匹配窗口74，用于根据第二搜索窗口72内输入的全部或部分第二关键词动态显示第二检索数组中含有所述部分第二关键词突变信息。请参考图8，一实施方式中，在第二搜索窗口72输入需要检索的部分关键词，例如 “c.205”,此时第二搜索窗口72的位置向下弹出所述第二关键词匹配窗口74，并匹配显示检索数组中含有“c.205”的多个突变信息，例如 “c.2059C>T”、“c.205C>G”和“c.205_206delCT”，用户可以直接选取关注的第二关键词进行检索不必输入完整的第二关键词。

步骤S67，根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。本实施例中，所述定位第二网页界面的显示位置为根据检索结果滚动第二界面并高亮显示检索结果对应的突变信息在前端界面。参阅图9，一实施例中，设第二搜索窗口输入的第二关键词为“c.205_206delCT”并通过查找按钮73点选进行查询后，第二搜索窗口72根据第二检索数组中“c.205_206delCT”在第二网页界面70的位置滚动滚动网页界面，对突变信息“c.205_206delCT”进行前端高亮显示，如图10所示。

由于基因信息对应的突变信息量较大，名称也比较相似，为了方便用户查询对应基因信息的突变信息，本实施例提供第二网页界面70进一步对用户关心的基因信息所包括的突变信息进行检索查询，由于第二网页界面是根据用户点选的基因信息动态生成，无需从数据库调用大量的突变信息数据，因此网页加载速度较快。另外，第二网页界面70提供第二搜索窗口直接调用第二检索数组进行第二关键词检索，无需对第一网页界面20和第二网页界面70进行分析和查询，因此检索速度非常快；而且第二关键词匹配窗口可以协助用户更快地输入完整的第二关键词，避免记忆大量突变信息，用户使用非常方便。

请参考图11，本发明第三实施方式提供一种基因突变数据库检索系统100，所述基因突变数据库检索系统100包括网页定义模块110、第一网页建立模块120、基因信息检索模块130、第一检索显示模块140、第二网页建立模块150、突变信息检索模块160和第二检索显示模块170。本实施方式中，本实施例中所述基因突变数据库检索系统100的运行环境可以是服务器系统或电脑系统。所述模块或系统可以是执行特定功能的集成电路，也可以是存储在存储器中并通过服务器或电脑处理器执行完成特定功能的软件程序。

所述网页定义模块110，用于定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中。本发明中所述基因信息可以为基因名称。所述基因突变数据库中预先存储有多个与一种或多种疾病或能力相关的基因名称，所述基因通常包括一个或多个对应不同疾病或能力的突变信息。本实施中，所述突变信息至少包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。所述第一搜索窗口用于输入需要检索的关键词。

所述第一网页建立模块120，用于从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组。一并参考图2-3，本实施例中，所述第一网页界面20包括多个依次排列的分页界面21，每个分页界面按照预设顺序依次排列和显示所述基因信息。本实施例中，为了加快用户浏览速度，所述多个分页界面的标签分别以字母顺序排列，每个分页界面的标签对应基因名称的首字母。本实施例中，将所述基因突变数据库中读取的多个基因信息用于生成第一网页界面的同时缓存为数组，并将缓存的数组和所述第一搜索窗口相关联。

所述基因信息检索模块130，用于根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息。本实施例中，所述第一搜索窗口还包括第一关键词匹配窗口，用于根据第一搜索窗口内输入的全部或部分第一关键词动态显示检索数组中含有所述部分第一关键词基因信息。请参考图4，一实施方式中，在第一搜索窗口22输入需要检索的部分第一关键词，例如 “F”,此时第一搜索窗口的位置向下弹出所述第一关键词匹配窗口24，并匹配显示检索数组中含有“F”的多个基因信息，例如 “F8”、“F9”、“FBN1”、“FCER2”和“FGFR3”。本发明中由于第一搜索窗口22直接调用第一检索数组进行第一关键词检索，因此检索速度非常快，而且第一关键词匹配窗口可以协助用户更快地输入完整的第一关键词，避免记忆大量基因信息。

所述第一检索显示模块140，用于根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。本实施例中，所述第一检索显示模块140将检索结果指向的分页界面定义为前端显示界面，并在所述分页界面高亮显示对应包括第一关键词的基因信息。参阅图5，一实施例中，设第一搜索窗口22输入的第一关键词为“F8”并通过点选查找按钮23进行查询后，第一搜索窗口22根据第一检索数组中“F8”在第一网页界面的位置将基因信息“F8”所在的第二个分页界面21定义为前端显示界面进行显示，并高亮关键词“F8”代表的基因信息，如图5所示。

所述第二网页建立模块150，在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口。请一并参阅图7，本实施例中，第一网页界面对应每个基因信息设置有一个基因信息展开按钮76，用于控制显示每个基因信息对应的突变信息。本实施例中，所述突变信息和对应的基因信息预先存储在所述基因突变数据库中，所述突变信息至少包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。当用户点击基因信息对应的展开菜单按钮76时，所述网页程序自动从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面70，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面70包括第二搜索窗口72。本实施例所述第二网页界面为第一网页界面内的动态显示窗口。

所述突变信息检索模块160，根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息。本实施例中，所述第二搜索窗口72还包括第二关键词匹配窗口74，用于根据第二搜索窗口72内输入的全部或部分第二关键词动态显示第二检索数组中含有所述部分第二关键词突变信息。请参考图8，一实施方式中，在第二搜索窗口72输入需要检索的部分关键词，例如 “c.205”,此时第二搜索窗口72的位置向下弹出所述第二关键词匹配窗口74，并匹配显示检索数组中含有“c.205”的多个突变信息，例如 “c.2059C>T”、“c.205C>G”和“c.205_206delCT”，用户可以直接选取关注的第二关键词进行检索而不必输入完整的第二关键词。

所述第二检索显示模块170，根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。本实施例中，所述定位第二网页界面的显示位置为根据检索结果滚动第二界面并高亮显示检索结果对应的突变信息在前端界面。参阅图9，一实施例中，设第二搜索窗口72输入的第二关键词为“c.205_206delCT”并通过查找按钮73点选进行查询后，第二搜索窗口72根据第二检索数组中“c.205_206delCT”在第二网页界面70的位置滚动网页界面，对突变信息“c.205_206delCT”进行前端高亮显示，如图10所示。

相较于现有技术，本发明的基因突变数据库检索方法和系统通过将生成所述第一网页界面所需的基因信息缓存至第一检索数组，用户直接从缓存的第一检索数组就可对网页显示或隐藏的基因信息数据进行检索，检索速度快体验较好，避免了用户对整个网页进行检索时分析网页结构遍历网页节点。进一步地，本发明提供的关键词匹配窗口可以根据第一搜索窗口或第二搜索窗口内内输入的部分关键词动态显示检索数组中含有所述部分关键词基因信息，使得用户可以更快地输入或选择完整的关键词，避免记忆大量基因信息。由于基因信息对应的突变信息量较大，名称也比较相似，为了方便用户查询对应基因信息的突变信息，本实施例提供第二网页界面进一步对用户关心的基因信息所包括的突变信息进行检索查询，由于第二网页界面是根据用户点选的基因信息动态生成，无需从数据库调用大量的突变信息数据，因此网页加载速度较快。另外，第二网页界面70提供第二搜索窗口直接调用第二检索数组进行第二关键词检索，无需对第一网页界面20和第二网页界面70进行分析和查询，因此检索速度非常快。

以上所述仅为本发明的较佳实施方式而已，并不用以限制本发明，凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (10)

1.一种基因突变数据库检索方法，其特征在于包括：

定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中；

从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组；

根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息；以及

根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。

2.根据权利要求1所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述第一网页界面包括多个依次排列的分页界面，每个分页界面按照预设顺序依次排列和显示所述基因信息。

3.根据权利要求2所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述定位第一网页界面的显示位置为：将检索结果指向的分页界面定义为前端显示界面，并在所述分页界面高亮显示对应包括第一关键词的基因信息。

4.根据权利要求1所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述基因信息包括一个或多个突变信息，第一网页界面对应每个基因信息设置有基因信息展开按钮，用于控制显示每个基因信息对应的突变信息。

5.根据权利要求4所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述突变信息和对应的基因信息预先存储在所述基因突变数据库中。

6.根据权利要求5所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述突变信息包括氨基酸突变信息和核苷酸突变信息。

7.根据权利要求4所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，进一步包括：

在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口；

根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息；以及

根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。

8.根据权利要求7所述的基因突变数据库检索方法，其特征在于，所述第二网页界面为第一网页界面内的动态显示窗口。

9.一种基因突变数据库检索系统，其特征在于包括：

网页定义模块，用于定义第一网页界面，所述第一网页界面包括多个基因信息及第一搜索窗口，所述基因信息预先存储在基因突变数据库中；

第一网页建立模块，用于从基因突变数据库中读取所述多个基因信息生成所述第一网页界面，同时将所述多个基因信息缓存至第一检索数组；

基因信息检索模块，用于根据第一搜索窗口输入的第一关键词查询缓存的第一检索数组中对应基因信息；以及

第一检索显示模块，用于根据第一关键词查询结果定位第一网页界面的显示位置。

10.根据权利要求9所述的基因突变数据库检索系统，进一步包括：

第二网页建立模块，在第一网页界面内选定基因信息，从基因突变数据库中读取选定基因信息对应多个突变信息生成第二网页界面，同时将所述多个突变信息缓存至第二检索数组，所述第二网页界面包括第二搜索窗口；

突变信息检索模块，根据第二搜索窗口输入的第二关键词查询缓存的第二检索数组中对应的突变信息；以及

第二检索显示模块，根据第二关键词查询结果定位第二网页界面的显示位置。