CN108375578A - 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法 - Google Patents

一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法 Download PDF

Info

Publication number
CN108375578A
CN108375578A CN201810065620.1A CN201810065620A CN108375578A CN 108375578 A CN108375578 A CN 108375578A CN 201810065620 A CN201810065620 A CN 201810065620A CN 108375578 A CN108375578 A CN 108375578A
Authority
CN
China
Prior art keywords
pathological section
scanning
tissue
multiple single
regions
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201810065620.1A
Other languages
English (en)
Inventor
张仁洁
方阳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hangzhou Bijian Gene Biotechnology Co Ltd
Original Assignee
Hangzhou Bijian Gene Biotechnology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hangzhou Bijian Gene Biotechnology Co Ltd filed Critical Hangzhou Bijian Gene Biotechnology Co Ltd
Priority to CN201810065620.1A priority Critical patent/CN108375578A/zh
Publication of CN108375578A publication Critical patent/CN108375578A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/84—Systems specially adapted for particular applications
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/01—Arrangements or apparatus for facilitating the optical investigation

Landscapes

  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Image Analysis (AREA)

Abstract

本发明涉及一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，所述病理切片扫描装置内置有识别程序，包括以下步骤：步骤S1、加载病理切片；步骤S2、对病理切片进行预览，获取预览图像；步骤S3、识别程序对所述预览图像进行自动识别，辨认所述预览图像中的组织区域；步骤S4、对所述组织区域通过预设的标注方法进行标注以获得对应的标记；步骤S5、对所述标记进行扫描以获得扫描结果。其优点在于，更加自由与灵活，能够自定义选择一个或多个扫描区域，只扫描实际需要扫描的部分；减少空白区域扫描，减少阅读非感兴趣区域时间；减少存储空间，降低存储成本；扫描区域分别单独选定，整体扫描区域为所有单独选定扫描区域的总和。

Description

一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的 方法
技术领域
本发明涉及切片扫描技术领域，尤其涉及一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法。
背景技术
病理切片是病理标本的一种。在制作病理切片时，技术人员将部分有病变的组织或脏器经过各种化学品和埋藏法的处理，使组织或脏器固定硬化，在切片机上切成薄片，并粘附在玻片上，再进行染色，以便技术人员在显微镜下进行检查，从而观察病理变化，作出相应的病理诊断，为临床诊断和治疗提供帮助。病理切片扫描装置是把病理切片从实体化转化成数字化的一种工具，从而替代传统显微镜。
但是现有的病理切片扫描装置都是单区域选定扫描，某些特殊的病理切片由于扫描对象在切片上较为分散，如果是单区域选定，会造成很大部分扫描区域为空白区域，或是非感兴趣区域，导致浪费扫描时间，增加阅读非感兴趣区域时间，降低工作效率。如图1所示，每个玻片上有两个相距较远的扫描对象，利用现有的扫描方法，则会出现图1右侧的扫描结果，即扫描区域中大片空白区域，延长扫描时间，浪费扫描资源，增加阅读切片时间。
因此，亟需一种能够自由选择扫描区域，降低扫描时间，减少数字图像存储成本的病理切片扫描方法，而目前关于这种扫描方法还未见报道。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术中的不足，提供一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法。
为实现上述目的，本发明采取的技术方案是：
一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，所述病理切片扫描装置内置有识别程序，包括以下步骤：
步骤S1、加载病理切片；
步骤S2、对病理切片进行预览，获取预览图像；
步骤S3、识别程序对所述预览图像进行自动识别，辨认所述预览图像中的组织区域；
步骤S4、对所述组织区域通过预设的标注方法进行标注以获得对应的标记；
步骤S5、对所述标记进行扫描以获得扫描结果。
优选的，所述步骤S3中，所述自动识别是根据组织的几何特征对预览图像进行识别。
优选的，所述步骤S3中，所述自动识别是将预览图像与一数据库内的组织模板进行匹配以对预览图像进行识别。
优选的，所述步骤S3中，所述自动识别是根据组织连通域的属性进行识别。
优选的，所述步骤S4中，所述标注方法为利用一预设的标注程序对所述组织区域进行自动标注。
优选的，所述步骤S4中，所述标注方法为对所述组织区域进行人工标注。
优选的，所述步骤S4中，所述标注方法为在利用一预设的标注程序对所述组织区域进行自动标注后，再对所述组织区域进行人工标注。
优选的，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的所有区域。
优选的，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的部分区域。
本发明采用以上技术方案，与现有技术相比，具有如下技术效果：
本发明的一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，使病理切片扫描装置在确定扫描对象时更加自由与灵活，能够自定义选择一个或多个扫描区域，使病理切片扫描装置只扫描实际需要扫描的部分；减少空白区域扫描，降低扫描时间，减少阅读非感兴趣区域时间，提高工作效率；减少数字图像的存储空间，降低存储成本，提高传输效率；扫描区域分别单独选定，整体扫描区域为所有单独选定扫描区域的总和。
附图说明
图1是现有技术的示意图。
图2是本发明的一个优选实施例的工作流程图。
图3是本发明的一个较佳的实施例。
图4是本发明的另一个较佳的实施例。
图5是本发明与现有技术的对比示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。
需要说明的是，在不冲突的情况下，本发明中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。
下面结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明，但不作为本发明的限定。
一个优选的实施例，如图1所示，本发明的一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，所述病理切片扫描装置内置有识别程序，包括以下步骤：
步骤S1、加载病理切片；
步骤S2、对病理切片进行预览，获取预览图像；
步骤S3、识别程序对所述预览图像进行自动识别，辨认所述预览图像中的组织区域；
步骤S4、对所述组织区域通过预设的标注方法进行标注以获得对应的标记；
步骤S5、对所述标记进行扫描以获得扫描结果。
作为一个优选的实施例，在步骤S3中，所述自动识别是根据组织的几何特征对预览图像进行识别。
采用上述技术方案，将组织的形状、局部关系作为识别组织的重要特征，根据这些重要特征对图像进行识别，并输出识别结果。
作为一个优选的实施例，在步骤S3中，所述自动识别是将预览图像与一数据库内的组织模板进行匹配以对预览图像进行识别。
采用上述技术方案，将提取的组织特征数据与数据库中的特征模版进行搜索匹配，通过设定一相似度阈值，当相似度超过该相似度阈值时，则把匹配得到的结果输出。
作为一个优选的实施例，所述步骤S3中，所述自动识别是根据组织连通域的属性进行识别。
通过识别组织连通域进而识别预览图像中的组织，是本领域技术人员熟知的方法，在此不再赘述。
作为一个优选的实施例，在步骤S4中，所述标注方法为利用一预设的标注程序对所述组织区域进行自动标注。
采用上述技术方案，利用预设的标注程序进行自动标注，可快速标注所有识别出的待扫描对象，并获得多个标注对象，速度快、效率高。
作为一个优选的实施例，在步骤S4中，所述标注方法为对所述组织区域进行人工标注。
采用上述技术方案，利用人工标注，操作人员可不标注整个待扫描对象，只标注待扫描对象的部分区域，精度高。
作为一个优选的实施例，在步骤S4中，所述标注方法为在利用一预设的标注程序对所述组织区域进行自动标注后，再对所述组织区域进行人工标注。
采用上述技术方案，利用自动标注与人工标注结合，可在快速标注的基础上，人工选择需要扫描的区域，既节约时间又提高扫描精度。
作为一个优选的实施例，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的所有区域。
作为一个优选的实施例，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的部分区域。
采用上述技术方案，在步骤S4中，如果单个组织较小，可标注整个组织；反之，如果单个组织较大且有无关信息存在，则可以标注单个组织内的部分区域，从而节约扫描时间。
采用上述技术方案，每个标注对象只对应一个标注。
作为一个较佳的实施例，如图3所示，预览后的图像包含3个较小的扫描对象，切片扫描仪可以对这3个扫描对象进行自动标注，并获得3个标注区域，然后切片扫描仪仅扫描这3个标注区域即可，即分别选定扫描区域，整体扫描区域为所有扫描区域的总和，节约扫描时间，减少阅读时间。
作为另一个较佳的实施例，如图4所示，预览后的图像包含1个较小的扫描对象和1个较大的扫描对象，切片扫描仪可对较小的扫描对象进行自动标注，获得1个标注区域；操作人员在较大的扫描对象中选择感兴趣的区域并进行手动标注；切片扫描仪仅需扫描这2个标注区域即可。相较于自动标注，在较大扫描对象标注时，手动标注可有效减少标注区域面积，提高扫描效率。
作为再一个较佳的实施例，如图5所示，将本发明的扫描方法与现有技术进行对比，图5左下方为现有技术扫描区域的选定，图5右下方为本发明扫描区域的选定。在现有技术中，切片扫描仪选定整个扫描对象并扫描，包含了很多无关信息，导致扫描时间长，技术人员阅读时间长，降低工作效率，延误诊断；而采用本发明的扫描区域选定方法，切片扫描仪仅选定2个标注区域进行扫描，可快速获得扫描信息，技术人员阅读时间减少，提高诊断效率，为治疗获取更多时间。
以上所述仅为本发明较佳的实施例，并非因此限制本发明的实施方式及保护范围，对于本领域技术人员而言，应当能够意识到凡运用本发明说明书及图示内容所作出的等同替换和显而易见的变化所得到的方案，均应当包含在本发明的保护范围内。

Claims (9)

1.一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述病理切片扫描装置内置有识别程序，包括以下步骤：
步骤S1、加载病理切片；
步骤S2、对病理切片进行预览，获取预览图像；
步骤S3、识别程序对所述预览图像进行自动识别，辨认所述预览图像中的组织区域；
步骤S4、对所述组织区域通过预设的标注方法进行标注以获得对应的标记；
步骤S5、对所述标记进行扫描以获得扫描结果。
2.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S3中，所述自动识别是根据组织的几何特征对预览图像进行识别。
3.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S3中，所述自动识别是将预览图像与一数据库内的组织模板进行匹配以对预览图像进行识别。
4.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S3中，所述自动识别是根据组织连通域的属性进行识别。
5.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S4中，所述标注方法为利用一标注程序对所述组织区域进行自动标注。
6.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S4中，所述标注方法为对所述组织区域进行人工标注。
7.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S4中，所述标注方法为在利用一标注程序对所述组织区域进行自动标注后，再对所述标记进行人工审核。
8.根据权利要求1所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的所有区域。
9.根据权利要求6所述的基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法，其特征在于，所述步骤S4中，所述组织区域为单个组织的部分区域。
CN201810065620.1A 2018-01-23 2018-01-23 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法 Pending CN108375578A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810065620.1A CN108375578A (zh) 2018-01-23 2018-01-23 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810065620.1A CN108375578A (zh) 2018-01-23 2018-01-23 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN108375578A true CN108375578A (zh) 2018-08-07

Family

ID=63016579

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201810065620.1A Pending CN108375578A (zh) 2018-01-23 2018-01-23 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN108375578A (zh)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109145851A (zh) * 2018-08-30 2019-01-04 宁波江丰生物信息技术有限公司 结核杆菌的识别方法及装置
CN109979588A (zh) * 2019-01-22 2019-07-05 北京金智拓科技有限公司 图像扫描病理切片系统
CN110532408A (zh) * 2019-08-28 2019-12-03 广州金域医学检验中心有限公司 病理切片管理方法、装置、计算机设备及存储介质
JPWO2021192117A1 (zh) * 2020-03-25 2021-09-30

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1405726A (zh) * 2001-08-16 2003-03-26 力捷电脑股份有限公司 自动识别扫描区域的方法
JP2013228232A (ja) * 2012-04-24 2013-11-07 Asahi Glass Co Ltd 基板外観検査方法
CN104331694A (zh) * 2014-04-02 2015-02-04 上海齐正微电子有限公司 医疗影像特征区域实时提取和标示方法
CN104463292A (zh) * 2013-09-16 2015-03-25 深圳市同盛绿色科技有限公司 光学识别方法及移动设备

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1405726A (zh) * 2001-08-16 2003-03-26 力捷电脑股份有限公司 自动识别扫描区域的方法
JP2013228232A (ja) * 2012-04-24 2013-11-07 Asahi Glass Co Ltd 基板外観検査方法
CN104463292A (zh) * 2013-09-16 2015-03-25 深圳市同盛绿色科技有限公司 光学识别方法及移动设备
CN104331694A (zh) * 2014-04-02 2015-02-04 上海齐正微电子有限公司 医疗影像特征区域实时提取和标示方法

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109145851A (zh) * 2018-08-30 2019-01-04 宁波江丰生物信息技术有限公司 结核杆菌的识别方法及装置
CN109979588A (zh) * 2019-01-22 2019-07-05 北京金智拓科技有限公司 图像扫描病理切片系统
CN110532408A (zh) * 2019-08-28 2019-12-03 广州金域医学检验中心有限公司 病理切片管理方法、装置、计算机设备及存储介质
JPWO2021192117A1 (zh) * 2020-03-25 2021-09-30
WO2021192117A1 (ja) * 2020-03-25 2021-09-30 日本電気株式会社 光干渉断層撮像装置

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN108375578A (zh) 一种基于病理切片扫描装置的多个单区域选定扫描区域的方法
US5796861A (en) Mosaic construction, processing, and review of very large electronic micrograph composites
US20060127880A1 (en) Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample
WO2003105675A2 (en) Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample
CN104143094A (zh) 一种无需答题卡的试卷自动阅卷处理方法及系统
CN113962976B (zh) 用于病理玻片数字图像的质量评估方法
CN107945156A (zh) 一种自动评价数字病理扫描图像画质的方法
CN106780520B (zh) 一种mri腰椎图像中椎骨的自动提取方法
CN112102247B (zh) 基于机器学习的病理切片质量评价方法及相关设备
KR102105489B1 (ko) 골수 판독을 위한 현미경용 슬라이드 스캐닝 시스템
CN114004969A (zh) 一种内镜图像病灶区检测方法、装置、设备及存储介质
US20090169113A1 (en) Automatic and Semi-Automatic Detection of Planar Shapes from 2D Images
CN117557560B (zh) 基于pet和ct图像融合的肺结节病灶识别方法及系统
CN114998223A (zh) 组织切片的扫描图像处理方法、装置及存储介质
JP2024027078A (ja) マルチスケールに基づく全スライド病理特徴融合抽出方法、システム、電子機器及び記憶媒体
CN114399764A (zh) 一种病理切片的扫描方法及系统
CN110680321B (zh) 脊柱mri扫描参数的确定方法、装置及图像处理设备
CN116779093A (zh) 一种医学影像结构化报告的生成方法、装置和计算机设备
CN112381839A (zh) 一种基于深度学习的乳腺癌病理图像he癌巢分割方法
CN112190275B (zh) 扫描方法、装置及系统
US20220318979A1 (en) Image Quality Analysis for Artifact Detection in Pathology Slide Images
CN109949906B (zh) 病理切片图像处理和模型训练方法及设备
Fu et al. Evaluation of an automated tissue sectioning machine for digital pathology
CN113658209B (zh) 一种基于形态学的切片组织裱贴位置优良判别方法
CN111583275A (zh) 一种切片病理号的识别方法、系统、装置和存储介质

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20180807

RJ01 Rejection of invention patent application after publication