CN107945879A - 一种用于治未病的医疗数据挖掘方法 - Google Patents
一种用于治未病的医疗数据挖掘方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开一种用于治未病的医疗数据挖掘方法。本发明对每种疾病患者的历史体征数据进行分析,获得患者从健康状态到患病之前的体征变化趋势模型,然后使用该趋势模型对健康人群的体征数据进行跟踪,一旦发现符合趋势模型的个体,就可以对他(她)进行预警。本发明能够有效识别出个体体征数据的变化趋势并进行预警,同时解决了个体基础体征差异、体征数据的时间序列不一致、随机和周期性等噪音等问题。这一方法在健康人群体检数据筛查中应用,可以尽早发现具有潜在发病可能的个体,提高预防和治疗效果,降低治疗成本。
Description
技术领域
本发明涉及一种用于治未病的医疗数据挖掘方法。
背景技术
医疗大数据对海量的历史病例和健康人群的体征数据进行长期跟踪、分 析和处理,可以对体征数据的变化趋势进行学习,发现具有较高患病风险的 人群。对这些人群进行针对性的预防和早期检查措施,可以有效降低发病率 或者使发现时间提早。借用中医中治未病的概念,本发明专利提出一种用于 治未病的医疗数据挖掘方法。
目前普遍使用传统统计方法对于疾病进行检测,例如统计指标A对疾病g 的灵敏度和特异性。其中:
灵敏度=真阳性人数/(真阳性人数+假阴性人数)*100%
特异度=真阴性人数/(真阴性人数+假阳性人数)*100%
使用同样的方法也可以得到一些疾病的前驱症状,从而对疾病进行提前 发现,使病人可以尽早获得诊断和治疗。
现在一些互联网企业开始使用网络数据对流行性疾病进行预测,例如百 度和谷歌根据不同区域人群的搜索词频来判断流感的扩散趋势:一个区域的 人群如果在某一时间对感冒、发烧、板蓝根等词汇的搜索频率提升时,通常 会认为感冒的发病率提高,如果临近区域对同一类词汇的搜索频率相继提升 时,会认为可能出现流感。
但是在症状或者检验指标呈阳性时,往往疾病已经发生,互联网手段也 只能对群体性的疾病传播进行预测和控制,而对个体的疾病预测并无帮助。
当前,随着便携式电子设备的迅猛发展和常规体检的普及,如何对体征 和检验大数据进行分析和挖掘,根据个体的体征及变化趋势,在疾病发生之 前进行预测,使得针对性的预防成为可能,极大的提高人民的生活质量,并 有效节省医疗资源。
发明内容
本发明的核心思想,是对每种疾病患者的历史体征数据进行分析,获得 患者从健康状态到患病之前的体征变化趋势模型,然后使用该趋势模型对健 康人群的体征数据进行跟踪,一旦发现符合趋势模型的个体,就可以对他(她) 进行预警。实现该趋势模型的几个关键点在于:
1.历史体征数据的时间并不均匀一致。不同的人检查某一体征指标的时 间不固定,频率也不同。为了挖掘相关性需要对历史体征数据进行处理;
2.考虑每个个体不同的基础体征。不同的个体,其基础体征有一定的差 异,用整个人群的平均体征数据去衡量个体体征会有较大的误差。
3.具有噪音过滤的模型。个体体征数据具有周期性和随机性特征,在模 型中既要发现变化趋势,又要过滤掉这些噪音。
疾病g对应的体征指标A(具有较高灵敏度和特异性)的原始数据如表1:
表1:原始数据表orig
其中id字段为被跟踪人员的编号,发病时间为该人员在发现患病后估算得 到的初始发病时间,length字段表示该人员总共测量体征指标A的次数。每 个record[]字段都记录一次测量体征指标A的结果,每个record有测量时间 time和测量得到的值value两个域。其中time表示从格林威治时间1970年 01月01日00时00分00秒起至测量采样时为止的总秒数。
对原始数据的挖掘过程依次执行以下步骤:
参数变量定义:
orig:原始数据表;c_orig:时间序列体征数据表;
I:人员编号;Inter:时间间隔常数;
or=orig[i]:第i号人员的原始数据;cr=c_orig[i]:第i号人员的时间序列 体征数据;
or_p:当前人员在原始数据表中的第几次体检数据;
cr_p:当前人员在时间序列体征数据表中的第几个体征数据;
c_time:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据对应的 时间;
or.record[or_p].value:当前人员在原始数据表中的第or_p次体检数据;
cr.value[cr_p]:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据;
or.record[or_p].time:当前人员在原始数据表中的第or_p次的体检时间;
next_ov、base:临时变量;p、q:常量,其中p为长期均线周期数,q 为短期均线周期数,且p>q;
cr.length:当前人员在时间序列体征数据表中的体征数据个数;
or.length:当前人员在原始数据表中的体检个数;
or.ill_time:当前人员在原始数据表中的发病时间;
arv_p:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p 个体征数据的均值;
arv_q:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p 个体征数据的均值;
arv_p’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1 个体征数据的均值;
arv_q’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1 个体征数据的均值;
步骤1.使用插值法获得时间序列均匀一致的体征数据表,具体的实现过 程如下:
步骤1-1.创建时间序列体征数据表c_orig,表格形式参看表2;初始化人 员编号i=0;inter赋值为时间间隔常数,例如需要一致化为间隔一个月的体征 数据,inter可以设置为3600*24*30,如果需要一致化为间隔一周的体征数据, inter可以设置为3600*24*7。
表2.时间序列体征数据表c_orig
步骤1-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr= c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤1-3.将or.record[or_p].value、or.record[or_p].time分别赋值到cr.value[cr_p]和c_time;
步骤1-4.针对第or_p+1次体检,将or_p+1赋值给or_p,即or_p=or_p+1; 如果or_p大于等于or.length,则跳转到步骤1-10;否则将or.record[or_p].value 赋值给next_ov;
步骤1-5.计算时间序列体征数据表中的第cr_p+1个体征数据对应的时间 c_time+inter,并将时间c_time+inter赋值到c_time,即c_time=c_time+inter, 如果赋值后的c_time大于等于or.record[or_p].time,则跳转到步骤1-8;
步骤1-6.计算cr.value[cr_p+1],具体的:
cr.value[cr_p+1]=inter*(next_ov-cr.value[cr_p])/(or.record[or_p].time-c_time);
cr_p=cr_p+1;
步骤1-7.跳转到步骤1-5;
步骤1-8.如果c_time等于or.record[or_p].time,则将next_ov赋值给 cr.value[cr_p+1];
步骤1-9.跳转到步骤1-4;
步骤1-10.将cr_p赋值给cr.length,然后针对下一个人员,即i=i+1;若i 小于等于n,n为原始数据表中人员个数,则跳转到步骤1-2;否则结束。
步骤2.对基础体征进行处理
步骤2-1.初始化人员编号,即i=0。
步骤2-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr= c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤2-3.初始化base=0;
步骤2-4.如果or.ill_time>0且or.record[or_p].time>or.ill_time,则直接跳转 到步骤2-11;
步骤2-5.将base+or.record[i].value赋值给base,同时or_p=or_p+1;
步骤2-6.如果or_p<or.length,则跳转到步骤2-4;
步骤2-7.如果base不等于0,则base=base/or_p;
步骤2-8.初始化cr_p=0;
步骤2-9.将cr.value[cr_p]-base赋值给cr.value[cr_p];
步骤2-10.对cr_p累加,即cr_p=cr_p+1;再对cr_p进行判断,如果 cr_p<cr.length,则跳转到步骤2-9;
步骤2-11.对i进行累加,即i=i+1;再对i进行判断,如果i<n,则跳转到步 骤2-2;
步骤3.任取时间序列体征数据表中的一行,即某个人员的时间序列体征 数据cr,并对cr进行预警判断,具体如下:
步骤3-1.初始化cr_p=p+1;
步骤3-2.计算
arv_p=(cr.value[cr_p-p+1]+cr.value[cr_p-p+2]+...+cr.value[cr_p])/p;
步骤3-3.计算
arv_q=(cr.value[cr_p-q+1]+cr.value[cr_p-q+2]+...+cr.value[cr_p])/q
步骤3-4.计算
arv_p’=(cr.value[cr_p-p]+cr.value[cr_p-p+1]+...+cr.value[cr_p-1])/p
步骤3-5.计算
arv_q’=(cr.value[cr_p-q]+cr.value[cr_p-q+1]+...+cr.value[cr_p-1])/q
步骤3-6.若arv_q>arv_q’且arv_p>arv_p’且arv_q>arv_p且
cr.value[cr_p]>arv_q,则对该人员进行预警,并结束;
步骤3-7.对cr_p进行累加,即cr_p=cr_p+1,然后对cr_p进行判断,如果 cr_p<cr.length,则跳转到步骤3-2,否则结束;
趋势计算模型,为过滤噪音并发现体征数据变化趋势,本发明使用均线 系统建立趋势模型。采用长期均线(周期数为p)和短期均线(周期数为q) 两种均线,其中p>q,一旦长短期均线都上升,短期均线高于长期均线并且当 前周期的体征值高于短期均线,表明趋势成立,均线系统自动过滤了噪音。
本发明有益效果如下:
本发明方法针对个体某种特定疾病未发病时的预警,提出一种个体体征 数据的挖掘方法。该方法可以有效识别出个体体征数据的变化趋势并进行预 警,同时解决了个体基础体征差异、体征数据的时间序列不一致、随机和周 期性等噪音等问题。这一方法在健康人群体检数据筛查中应用,可以尽早发 现具有潜在发病可能的个体,提高预防和治疗效果,降低治疗成本。
具体实施方式
本发明的核心思想,是对每种疾病患者的历史体征数据进行分析,获得 患者从健康状态到患病之前的体征变化趋势模型,然后使用该趋势模型对健 康人群的体征数据进行跟踪,一旦发现符合趋势模型的个体,就可以对他(她) 进行预警。实现该趋势模型的几个关键点在于:
历史体征数据的时间并不均匀一致。不同的人检查某一体征指标的时间 不固定,频率也不同。为了挖掘相关性需要对历史体征数据进行处理;
考虑每个个体不同的基础体征。不同的个体,其基础体征有一定的差异, 用整个人群的平均体征数据去衡量个体体征会有较大的误差。
具有噪音过滤的模型。个体体征数据具有周期性和随机性特征,在模型 中既要发现变化趋势,又要过滤掉这些噪音。
疾病g对应的体征指标A(具有较高灵敏度和特异性)的原始数据如表1:
表1:原始数据表orig
其中id字段为被跟踪人员的编号,发病时间为该人员在发现患病后估算得 到的初始发病时间,length字段表示该人员总共测量体征指标A的次数。每 个record[]字段都记录一次测量体征指标A的结果,每个record有测量时间 time和测量得到的值value两个域。其中time表示从格林威治时间1970年 01月01日00时00分00秒起至测量采样时为止的总秒数。
对原始数据的挖掘过程依次执行以下步骤:
参数变量定义:
orig:原始数据表;c_orig:时间序列体征数据表;
I:人员编号;Inter:时间间隔常数;
or=orig[i]:第i号人员的原始数据;cr=c_orig[i]:第i号人员的时间序列 体征数据;
or_p:当前人员在原始数据表中的第几次体检数据;
cr_p:当前人员在时间序列体征数据表中的第几个体征数据;
c_time:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据对应的 时间;
or.record[or_p].value:当前人员在原始数据表中的第or_p次体检数据;
cr.value[cr_p]:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据;
or.record[or_p].time:当前人员在原始数据表中的第or_p次的体检时间;
next_ov、base:临时变量;p、q:常量,其中p为长期均线周期数,q 为短期均线周期数,且p>q;
cr.length:当前人员在时间序列体征数据表中的体征数据个数;
or.length:当前人员在原始数据表中的体检个数;
or.ill_time:当前人员在原始数据表中的发病时间;
arv_p:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p 个体征数据的均值;
arv_q:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p 个体征数据的均值;
arv_p’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1 个体征数据的均值;
arv_q’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1 个体征数据的均值;
步骤1.使用插值法获得时间序列均匀一致的体征数据表,具体的实现过 程如下:
步骤1-1.创建时间序列体征数据表c_orig,表格形式参看表2;初始化人 员编号i=0;inter赋值为时间间隔常数,例如需要一致化为间隔一个月的体征 数据,inter可以设置为3600*24*30,如果需要一致化为间隔一周的体征数据, inter可以设置为3600*24*7。
表2.时间序列体征数据表c_orig
步骤1-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr= c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤1-3.将or.record[or_p].value、or.record[or_p].time分别赋值到cr.value[cr_p]和c_time;
步骤1-4.针对第or_p+1次体检,将or_p+1赋值给or_p,即or_p=or_p+1; 如果or_p大于等于or.length,则跳转到步骤1-10;否则将or.record[or_p].value 赋值给next_ov;
步骤1-5.计算时间序列体征数据表中的第cr_p+1个体征数据对应的时间 c_time+inter,并将时间c_time+inter赋值到c_time,即c_time=c_time+inter, 如果赋值后的c_time大于等于or.record[or_p].time,则跳转到步骤1-8;
步骤1-6.计算cr.value[cr_p+1],具体的:
cr.value[cr_p+1]=inter*(next_ov-cr.value[cr_p])/(or.record[or_p].time-c_time);
cr_p=cr_p+1;
步骤1-7.跳转到步骤1-5;
步骤1-8.如果c_time等于or.record[or_p].time,则将next_ov赋值给 cr.value[cr_p+1];
步骤1-9.跳转到步骤1-4;
步骤1-10.将cr_p赋值给cr.length,然后针对下一个人员,即i=i+1;若i 小于等于n,n为原始数据表中人员个数,则跳转到步骤1-2;否则结束。
步骤2.对基础体征进行处理
步骤2-1.初始化人员编号,即i=0。
步骤2-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr= c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤2-3.初始化base=0;
步骤2-4.如果or.ill_time>0且or.record[or_p].time>or.ill_time,则直接跳转 到步骤2-11;
步骤2-5.将base+or.record[i].value赋值给base,同时or_p=or_p+1;
步骤2-6.如果or_p<or.length,则跳转到步骤2-4;
步骤2-7.如果base不等于0,则base=base/or_p;
步骤2-8.初始化cr_p=0;
步骤2-9.将cr.value[cr_p]-base赋值给cr.value[cr_p];
步骤2-10.对cr_p累加,即cr_p=cr_p+1;再对cr_p进行判断,如果 cr_p<cr.length,则跳转到步骤2-9;
步骤2-11.对i进行累加,即i=i+1;再对i进行判断,如果i<n,则跳转到步 骤2-2;
步骤3.任取时间序列体征数据表中的一行,即某个人员的时间序列体征 数据cr,并对cr进行预警判断,具体如下:
步骤3-1.初始化cr_p=p+1;
步骤3-2.计算
arv_p=(cr.value[cr_p-p+1]+cr.value[cr_p-p+2]+...+cr.value[cr_p])/p;
步骤3-3.计算
arv_q=(cr.value[cr_p-q+1]+cr.value[cr_p-q+2]+...+cr.value[cr_p])/q
步骤3-4.计算
arv_p’=(cr.value[cr_p-p]+cr.value[cr_p-p+1]+...+cr.value[cr_p-1])/p
步骤3-5.计算
arv_q’=(cr.value[cr_p-q]+cr.value[cr_p-q+1]+...+cr.value[cr_p-1])/q
步骤3-6.若arv_q>arv_q’且arv_p>arv_p’且arv_q>arv_p且
cr.value[cr_p]>arv_q,则对该人员进行预警,并结束;
步骤3-7.对cr_p进行累加,即cr_p=cr_p+1,然后对cr_p进行判断,如果 cr_p<cr.length,则跳转到步骤3-2,否则结束;
趋势计算模型,为过滤噪音并发现体征数据变化趋势,本发明使用均线 系统建立趋势模型。采用长期均线(周期数为p)和短期均线(周期数为q) 两种均线,其中p>q,一旦长短期均线都上升,短期均线高于长期均线并且当 前周期的体征值高于短期均线,表明趋势成立,均线系统自动过滤了噪音。
Claims (1)
1.一种用于治未病的医疗数据挖掘方法,其特征在于具体包括如下步骤:
步骤1.使用插值法获得时间序列均匀一致的体征数据表,具体的实现过程如下:
参数变量定义:
orig:原始数据表;c_orig:时间序列体征数据表;
I:人员编号;Inter:时间间隔常数;
or=orig[i]:第i号人员的原始数据;cr=c_orig[i]:第i号人员的时间序列体征数据;
or_p:当前人员在原始数据表中的第几次体检数据;
cr_p:当前人员在时间序列体征数据表中的第几个体征数据;
c_time:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据对应的时间;
or.record[or_p].value:当前人员在原始数据表中的第or_p次体检数据;
cr.value[cr_p]:当前人员在时间序列体征数据表中的第cr_p个体征数据;
or.record[or_p].time:当前人员在原始数据表中的第or_p次的体检时间;
next_ov、base:临时变量;p、q:常量,其中p为长期均线周期数,q为短期均线周期数,且p>q;
cr.length:当前人员在时间序列体征数据表中的体征数据个数;
or.length:当前人员在原始数据表中的体检个数;
or.ill_time:当前人员在原始数据表中的发病时间;
arv_p:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p个体征数据的均值;
arv_q:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p+1个到第cr_p个体征数据的均值;
arv_p’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1个体征数据的均值;
arv_q’:中间变量,用于记录时间序列体征数据表中第cr_p-p个到第cr_p-1个体征数据的均值;
表1:疾病g对应的体征指标A的原始数据表orig
其中id字段为被跟踪人员的编号,发病时间为该人员在发现患病后估算得到的初始发病时间,length字段表示该人员总共测量体征指标A的次数;每个record[]字段都记录一次测量体征指标A的结果,每个record有测量时间time和测量得到的值value两个域;其中time表示从格林威治时间1970年01月01日00时00分00秒起至测量采样时为止的总秒数;
步骤1-1.创建时间序列体征数据表c_orig,表格形式参看表2;初始化人员编号i=0;inter赋值为时间间隔常数;
表2.时间序列体征数据表c_orig
步骤1-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr=c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤1-3.将or.record[or_p].value、or.record[or_p].time分别赋值到cr.value[cr_p]和c_time;
步骤1-4.针对第or_p+1次体检,将or_p+1赋值给or_p,即or_p=or_p+1;如果or_p大于等于or.length,则跳转到步骤1-10;否则将or.record[or_p].value赋值给next_ov;
步骤1-5.计算时间序列体征数据表中的第cr_p+1个体征数据对应的时间c_time+inter,并将时间c_time+inter赋值到c_time,即c_time=c_time+inter,如果赋值后的c_time大于等于or.record[or_p].time,则跳转到步骤1-8;
步骤1-6.计算cr.value[cr_p+1],具体的:
cr.value[cr_p+1]=inter*(next_ov-cr.value[cr_p])/(or.record[or_p].time-c_time);
cr_p=cr_p+1;
步骤1-7.跳转到步骤1-5;
步骤1-8.如果c_time等于or.record[or_p].time,则将next_ov赋值给cr.value[cr_p+1];
步骤1-9.跳转到步骤1-4;
步骤1-10.将cr_p赋值给cr.length,然后针对下一个人员,即i=i+1;若i小于等于n,n为原始数据表中人员个数,则跳转到步骤1-2;否则结束;
步骤2.对基础体征进行处理
步骤2-1.初始化人员编号,即i=0;
步骤2-2.获得第i号人员的原始数据or=orig[i]和时间序列体征数据cr=c_orig[i];并初始化or_p=0、cr_p=0;
步骤2-3.初始化base=0;
步骤2-4.如果or.ill_time>0且or.record[or_p].time>or.ill_time,则直接跳转到步骤2-11;
步骤2-5.将base+or.record[i].value赋值给base,同时or_p=or_p+1;
步骤2-6.如果or_p<or.length,则跳转到步骤2-4;
步骤2-7.如果base不等于0,则base=base/or_p;
步骤2-8.初始化cr_p=0;
步骤2-9.将cr.value[cr_p]-base赋值给cr.value[cr_p];
步骤2-10.对cr_p累加,即cr_p=cr_p+1;再对cr_p进行判断,如果cr_p<cr.length,则跳转到步骤2-9;
步骤2-11.对i进行累加,即i=i+1;再对i进行判断,如果i<n,则跳转到步骤2-2;
步骤3.任取时间序列体征数据表中的一行,即某个人员的时间序列体征数据cr,并对cr进行预警判断,具体如下:
步骤3-1.初始化cr_p=p+1;
步骤3-2.计算
arv_p=(cr.value[cr_p-p+1]+cr.value[cr_p-p+2]+...+cr.value[cr_p])/p;
步骤3-3.计算
arv_q=(cr.value[cr_p-q+1]+cr.value[cr_p-q+2]+...+cr.value[cr_p])/q
步骤3-4.计算
arv_p’=(cr.value[cr_p-p]+cr.value[cr_p-p+1]+...+cr.value[cr_p-1])/p
步骤3-5.计算
arv_q’=(cr.value[cr_p-q]+cr.value[cr_p-q+1]+...+cr.value[cr_p-1])/q
步骤3-6.若arv_q>arv_q’且arv_p>arv_p’且arv_q>arv_p且
cr.value[cr_p]>arv_q,则对该人员进行预警,并结束;
步骤3-7.对cr_p进行累加,即cr_p=cr_p+1,然后对cr_p进行判断,如果cr_p<cr.length,则跳转到步骤3-2,否则结束。
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