CN107577917A - 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法 - Google Patents

一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法 Download PDF

Info

Publication number
CN107577917A
CN107577917A CN201610520386.8A CN201610520386A CN107577917A CN 107577917 A CN107577917 A CN 107577917A CN 201610520386 A CN201610520386 A CN 201610520386A CN 107577917 A CN107577917 A CN 107577917A
Authority
CN
China
Prior art keywords
unit
data
high performance
processing method
module
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201610520386.8A
Other languages
English (en)
Inventor
魏霖静
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Individual
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Individual filed Critical Individual
Priority to CN201610520386.8A priority Critical patent/CN107577917A/zh
Publication of CN107577917A publication Critical patent/CN107577917A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Landscapes

  • Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)

Abstract

本发明涉及一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,包括服务器模块,所述服务器模块通过Internet网络分别电性连接信息采集模块与云计算模块,且所述服务器模块连接预算模块,所述信息采集模块内设有样品分配单元、样品检测单元、器材管理单元与标记单元,所述标记单元连接样品分配单元,所述样品分配单元连接样品检测单元,所述服务器模块内设有操作软件,所述操作软件包括人机交互界面,人机交互界面内设有数据更新单元,所述数据更新单元一侧设有用户管理单元,所述用户管理单元一侧设有同步区单元,所述同步区单元一侧设有归纳分类单元,所述归纳分类单元下方设有预览单元,实现了生物信息学大数据的分类管理与计算,提高工作效率。

Description

一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法
技术领域
本发明涉及一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,属于计算机网络软件技术领域。
背景技术
随着生命科学领域在实验技术方面的快速发展,科研仪器的自动化、智能化水平日益提高,数据产出能力有了突飞猛进的发展,生命科学研究对分析测试的对象,无论是数量、分析周期、分析项目运算处理速度、和数据准确性方面均提出更高的要求与使用标准,生物实验室研究产出的信息呈现出爆炸式增长,传统生物实验室中,由于数据类型多样,格式不统一,数据难以保存,交换、查询、分析、维护都不方便、严重地阻碍了研究人员之间的信息交流与数据比对,在生物信息学中的测序、高性能计算环节,专业测序实验室需要进行大量基因测序订单处理,安排测序实验,及时处理高速产出的测序结果,目前日益增长的测序需求和高速产出的数据,仅仅使用计算机文件系统进行管理非常困难,而且各个项目进度不统一,数据处理困难,难以从宏观把握整体进度,测序实验一般采用电子表格与纸质文档保存数据库,然而这些大量分散的数据难以集中管理,使用者在数据检索和进度查询方面面临挑战,因此需要建立一个规范化的软件管理系统,即能够保存相关实验数据,又能够集成索引、显示、整合关联、分析、打包为一体,管理不同实验样品与实验结果。
发明内容
本发明的目的就在于为了解决上述问题而提供一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法。
本发明通过以下技术方案来实现上述目的:一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,包括服务器模块,所述服务器模块通过Internet网络分别电性连接信息采集模块与云计算模块,且所述服务器模块连接预算模块,所述信息采集模块内设有样品分配单元、样品检测单元、器材管理单元与标记单元,所述标记单元连接样品分配单元,所述样品分配单元连接样品检测单元,所述服务器模块内设有操作软件,所述操作软件包括人机交互界面,人机交互界面内设有数据更新单元,所述数据更新单元一侧设有用户管理单元,所述用户管理单元一侧设有同步区单元,所述同步区单元一侧设有归纳分类单元,所述归纳分类单元下方设有预览单元,所述预览单元一侧设有分析处理单元,所述分析处理单元下方设有查询单元,所述预算模块内设有采购单元、立项单元与匹配单元。
优选的,所述数据更新单元包括自动和手动更新按钮,所述数据更新单元每隔45分钟自动匹配更新数据图片,若使用者未指定更新数据图片,则更新软件系统默认数据图片(默认图片格式可调整),手动更新按钮更新用户指定内容。
优选的,操作软件内包括有与器材管理单元相对应的IP地址。
优选的,所述同步区单元包括函数选择 、图片显示调整 、图片绑定关系、选择图片文件四部分,所述同步区单元记录软件使用时间、操作者代码与流程。
优选的,所述同步区单元可获取实时实验数据,所述归纳分类单元内包括实验数据分类与归纳、实验样品分配与实验器材分配。
优选的,所述服务器模块内还包括有CPU、8G内存、集成显卡、1000M网卡、8K显示器与500GSSD硬盘。
优选的,所述用户管理单元内包括资质核查与权限匹配,并为用户设置操作者代码。
本发明的有益效果是:通过本发明,将所有联网的实验室采集到的数据自动保存,并且可以自动或者手动实时更新最新实验数据,并且将获得的实验数据自动进行分类与整理、分析与显示,检索方便,使得不同实验数据更加形象地展示在使用者面前,而且各个数据可以快速调阅,将所有实验环节连成一个整体,实现了统一化管理,并且针对实验进度与预算可以进行优化,规范生物信息学中实验阶段使用流程,数据维护方便,通过连接云计算平台,非常适用于生物信息学中的大数据分析处理与信息化管理。
附图说明
附图用来提供对本发明的进一步理解,并且构成说明书的一部分,与本发明的实施例一起用于解释本发明,并不构成对本发明的限制。
图1是本发明一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法结构图。
图中标号:1、服务器模块;2、信息采集模块;3、云计算模块;4、预算模块;5、样品分配单元;6、样品检测单元;7、器材管理单元;8、标记单元;9、操作软件;10、数据更新单元,;11、用户管理单元;12、同步区单元;13、归纳分类单元;14、预览单元;15、分析处理单元;16、查询单元;17、采购单元;18、立项单元;19、匹配单元。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例,基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
请参阅图1,一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,包括服务器模块1,所述服务器模块1通过Internet网络分别电性连接信息采集模块2与云计算模块3,将所述信息采集模块2的数据采集进入服务器,并且可以通过所述云计算模块3将一些难处理大数据通过云计算平台解决,且所述服务器模块1连接预算模块4,所述预算模块4主要用于实验前的相关采购与立项,做好前期准备工作,所述信息采集模块2内设有样品分配单元5、样品检测单元6、器材管理单元7与标记单元8,将待实验样品进行分类标记,所述标记单元8连接样品分配单元5,标记好的样品分配给各相对应实验器材,所述样品分配单元5连接样品检测单元6,通过所述样品检测单元6进行相关实验于检测,所述服务器模块1内设有操作软件9,所述操作软件9包括人机交互界面,方便使用者使用,人机交互界面内设有数据更新单元10,自动将获得的实验数据与前端实验器材得到的数据同步,所述数据更新单元10一侧设有用户管理单元11,管理每一位使用者情况,规范化操作,所述用户管理单元11一侧设有同步区单元12,将获得的数据同步到前端进行显示,所述同步区单元12一侧设有归纳分类单元13,所述归纳分类单元13对获得的不同实验结果自动完成比对,并进行归类,所述归纳分类单元13下方设有预览单元14,所述预览单元14可以直接预览现阶段实验进度与实验各阶段相关图表,便于了解实验进展情况,所述预览单元14一侧设有分析处理单元15,起到快速分析处理数据作用,所述分析处理单元15下方设有查询单元16,方便用户查询需要的实验数据与接下来的实验进程安排,所述预算模块4内设有采购单元17、立项单元18与匹配单元19,采购相关实验器材,分配到各相关实验室。
所述数据更新单元10包括自动和手动更新按钮,所述数据更新单元10每隔45分钟自动匹配更新数据图片,若使用者未指定更新数据图片,则更新软件系统默认数据图片默认图片格式可调整,手动更新按钮更新用户指定内容,保证数据处于变动状态,使用户可以掌握最近实验情况,不至于再费时间搜寻,操作软件内包括有与器材管理单元7相对应的IP地址,通过IP地址了解相关器材是否处于正常状态,所述同步区单元12包括函数选择 、图片显示调整 、图片绑定关系、选择图片文件四部分,为用户提供一个更加清洗明了的分析结果,所述同步区单元12记录软件使用时间、操作者代码与流程,规范使用者的实验行为,便于明确责任,所述同步区单元12可获取实时实验数据,所述归纳分类单元13内包括实验数据分类与归纳、实验样品分配与实验器材分配,所述服务器模块1内还包括有CPU、8G内存、集成显卡、1000M网卡、8K显示器与500GSSD硬盘,从而提高数据运算与显示能力,所述用户管理单元11内包括资质核查与权限匹配,并为用户设置操作者代码,通过代码可以溯源到使用者信息情况。
本发明在使用时,通过所述服务器模块1电性连接信息采集模块2,将实验的相关数据采集到服务器,并且可以通过所述云计算模块3,将一些大数据进行高效计算节省计算时间,提高计算效率,并且通过所述预算模块4,将实验项目进行规范合理地设计,降低实验成本,加快实验进度,通过所述操作软件9,实现了所有联网的实验室采集到的数据自动保存,并且可以自动或者手动实时更新最新实验数据,并且将获得的实验数据自动进行分类与整理、分析与显示,检索方便,使得不同实验数据更加形象地展示在使用者面前,而且各个数据可以快速调阅,将所有实验环节连成一个整体,实现了统一化管理,还可以规范生物信息学中实验阶段使用流程,数据维护方便,非常适用于生物信息学中的大数据分析处理与信息化管理。
对于本领域技术人员而言,显然本发明不限于上述示范性实施例的细节,而且在不背离本发明的精神或基本特征的情况下,能够以其他的具体形式实现本发明,因此,无论从哪一点来看,均应将实施例看作是示范性的,而且是非限制性的,本发明的范围由所附权利要求而不是上述说明限定,因此旨在将落在权利要求的等同要件的含义和范围内的所有变化囊括在本发明内,不应将权利要求中的任何附图标记视为限制所涉及的权利要求。
此外,应当理解,虽然本说明书按照实施方式加以描述,但并非每个实施方式仅包含一个独立的技术方案,说明书的这种叙述方式仅仅是为清楚起见,本领域技术人员应当将说明书作为一个整体,各实施例中的技术方案也可以经适当组合,形成本领域技术人员可以理解的其他实施方式。

Claims (7)

1.一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,包括服务器模块(1),其特征在于,所述服务器模块(1)通过Internet网络分别电性连接信息采集模块(2)与云计算模块(3),且所述服务器模块(1)连接预算模块(4),所述信息采集模块(2)内设有样品分配单元(5)、样品检测单元(6)、器材管理单元(7)与标记单元(8),所述标记单元(8)连接样品分配单元(5),所述样品分配单元(5)连接样品检测单元(6),所述服务器模块(1)内设有操作软件(9),所述操作软件(9)包括人机交互界面,人机交互界面内设有数据更新单元(10),所述数据更新单元(10)一侧设有用户管理单元(11),所述用户管理单元(11)一侧设有同步区单元(12),所述同步区单元(12)一侧设有归纳分类单元(13),所述归纳分类单元(13)下方设有预览单元(14),所述预览单元(14)一侧设有分析处理单元(15),所述分析处理单元(15)下方设有查询单元(16),所述预算模块(4)内设有采购单元(17)、立项单元(18)与匹配单元(19)。
2.根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:所述数据更新单元(10)包括自动和手动更新按钮,所述数据更新单元(10)每隔45分钟自动匹配更新数据图片,若使用者未指定更新数据图片,则更新软件系统默认数据图片(默认图片格式可调整),手动更新按钮更新用户指定内容。
3.根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:操作软件内包括有与器材管理单元(7)相对应的IP地址。
4. 根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:所述同步区单元(12)包括函数选择 、图片显示调整 、图片绑定关系、选择图片文件四部分,所述同步区单元(12)记录软件使用时间、操作者代码与流程。
5.根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:所述同步区单元(12)可获取实时实验数据,所述归纳分类单元(13)内包括实验数据分类与归纳、实验样品分配与实验器材分配。
6.根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:所述服务器模块(1)内还包括有CPU、8G内存、集成显卡、1000M网卡、8K显示器与500GSSD硬盘。
7.根据权利要求1所述一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法,其特征在于:所述用户管理单元(11)内包括资质核查与权限匹配,并为用户设置操作者代码。
CN201610520386.8A 2016-07-05 2016-07-05 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法 Pending CN107577917A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610520386.8A CN107577917A (zh) 2016-07-05 2016-07-05 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610520386.8A CN107577917A (zh) 2016-07-05 2016-07-05 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN107577917A true CN107577917A (zh) 2018-01-12

Family

ID=61049616

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610520386.8A Pending CN107577917A (zh) 2016-07-05 2016-07-05 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN107577917A (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110838338A (zh) * 2018-08-15 2020-02-25 上海美吉生物医药科技有限公司 生物分析项目的建立系统、方法、存储介质、及电子设备
CN112434944A (zh) * 2020-11-24 2021-03-02 德州学院 一种高效率生物信息学信息化管理系统及数据处理方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102982409A (zh) * 2012-11-07 2013-03-20 浪潮电子信息产业股份有限公司 一种生物信息学高性能计算平台的信息化管理设计方法
WO2014039556A1 (en) * 2012-09-04 2014-03-13 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
CN105051742A (zh) * 2013-01-25 2015-11-11 Illumina公司 利用云计算环境来共享生物相关数据的方法和系统
CN105321018A (zh) * 2014-07-18 2016-02-10 中国农业科学院作物科学研究所 一种自动化dna测序管理系统

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014039556A1 (en) * 2012-09-04 2014-03-13 Guardant Health, Inc. Systems and methods to detect rare mutations and copy number variation
CN102982409A (zh) * 2012-11-07 2013-03-20 浪潮电子信息产业股份有限公司 一种生物信息学高性能计算平台的信息化管理设计方法
CN105051742A (zh) * 2013-01-25 2015-11-11 Illumina公司 利用云计算环境来共享生物相关数据的方法和系统
CN105321018A (zh) * 2014-07-18 2016-02-10 中国农业科学院作物科学研究所 一种自动化dna测序管理系统

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110838338A (zh) * 2018-08-15 2020-02-25 上海美吉生物医药科技有限公司 生物分析项目的建立系统、方法、存储介质、及电子设备
CN110838338B (zh) * 2018-08-15 2023-09-29 上海美吉生物医药科技有限公司 生物分析项目的建立系统、方法、存储介质、及电子设备
CN112434944A (zh) * 2020-11-24 2021-03-02 德州学院 一种高效率生物信息学信息化管理系统及数据处理方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Junker et al. Exploration of biological network centralities with CentiBiN
Shen et al. BarleyBase—an expression profiling database for plant genomics
Shen et al. ngs. plot: Quick mining and visualization of next-generation sequencing data by integrating genomic databases
Chen et al. Predicting anatomical therapeutic chemical (ATC) classification of drugs by integrating chemical-chemical interactions and similarities
Akiyama et al. PRIMe: a Web site that assembles tools for metabolomics and transcriptomics
Chen et al. Cytobank: providing an analytics platform for community cytometry data analysis and collaboration
Barrett et al. Mining microarray data at NCBI’s Gene Expression Omnibus (GEO)
CN112102887B (zh) 多尺度集成可视化的高通量自动计算流程及数据智能系统
US10216696B2 (en) Data processing system for adaptive visualization of faceted search results
CN107391963A (zh) 基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法
CN102257495A (zh) 使用颜色布局相关性对图像搜索结果进行交互地排列
Dehal et al. A phylogenomic gene cluster resource: the Phylogenetically Inferred Groups (PhIGs) database
Stopar et al. Citation analysis and mapping of nanoscience and nanotechnology: identifying the scope and interdisciplinarity of research
CN105205621A (zh) 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法
Wattam et al. Comparative genomic analysis at the PATRIC, a bioinformatic resource center
CN101751400A (zh) 技术数据分析的系统与方法以及专利分析的系统
US20090112850A1 (en) Bioitem Searcher, Bioitem Search Terminal, Bioitem Search Method, and Program
CN107577917A (zh) 一种生物信息学高性能信息化管理系统及数据处理方法
CN105321018A (zh) 一种自动化dna测序管理系统
Edlund et al. Design of the MCAW compute service for food safety bioinformatics
Colangelo et al. YPED: an integrated bioinformatics suite and database for mass spectrometry-based proteomics research
JP2009252185A (ja) 情報検索装置、情報検索方法、制御プログラム及び記録媒体
Lushbough et al. BioExtract server—an integrated workflow-enabling system to access and analyze heterogeneous, distributed biomolecular data
Zhang et al. Gene Expression Browser: large-scale and cross-experiment microarray data integration, management, search & visualization
Zaslavsky et al. Visualization of large influenza virus sequence datasets using adaptively aggregated trees with sampling-based subscale representation

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20180112