CN106845942A - 一种生物分析平台中的工程项目发布系统 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种生物分析平台中的工程项目发布系统，所述系统包括：第一选择单元用于选择生物信息分析的物种、样本来源、分析类型；第二选择单元用于选择测序产品或发布数据分析需求；第三选择单元用于选择项目信息，包括：项目周期、预算，第三选择单元用于输入：研究分析背景、目标、分析要求；生成单元用于基于第一选择单元、第二选择单元、第三选择单元的选择信息和输入信息，生成工程项目信息；发布单元用于将生成的工程项目信息在生物分析平台中发布，实现了通过本申请中系统，用户通过简单的选择和输入能够快速高效的完成工程项目的发布，且发布的信息完善准确，有助于项目顺利完成技术效果。

Description

一种生物分析平台中的工程项目发布系统

技术领域

本发明涉及生物分析研究领域，具体地，涉及一种生物分析平台中的工程项目发布系统。

背景技术

生物信息分析是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析，分析基因序列中表达的结构功能的生物信息。从事生命科学的科研人员在阐述生物信息分析目标时，没有一个成熟、准确、专门针对生物信息分析，并能智能收集用户操作习惯的项目发布方法。

现有的生物信息分析工程项目发布方法为：用户根据自己的习惯或者需要，通过粗糙的描述进行任务发布，一方面不便于用户使用，增加了相应的工作量，另一方面容易导致任务信息发布不准确，并且不便于工程项目实施者准确的获得项目信息，导致工程项目无法顺利完成。

综上所述，本申请发明人在实现本申请发明技术方案的过程中，发现上述技术至少存在如下技术问题：

在现有技术中，现有的生物工程项目发布存在效率和准确率较低，项目信息不完善，容易导致项目无法顺利完成的技术问题。

发明内容

本发明提供了一种生物分析平台中的工程项目发布系统，解决了现有的生物工程项目发布存在效率和准确率较低，项目信息不完善，容易导致项目无法顺利完成的技术问题，实现了通过本申请中系统，用户通过简单的选择和输入能够快速高效的完成工程项目的发布，且发布的信息完善准确，有助于项目顺利完成技术效果。

为解决上述技术问题，本申请提供了一种生物分析平台中的工程项目发布系统，所述系统包括：

第一选择单元，所述第一选择单元用于选择生物信息分析的物种、样本来源、分析类型；

第二选择单元，所述第二选择单元用于选择测序产品或发布数据分析需求；

第三选择单元，所述第三选择单元用于选择项目信息，包括：项目周期、预算，第三选择单元用于输入：研究分析背景、目标、分析要求；

生成单元，所述生成单元用于基于第一选择单元、第二选择单元、第三选择单元的选择信息和输入信息，生成工程项目信息；

发布单元，所述发布单元用于将生成的工程项目信息在生物分析平台中发布。

其中，本申请技术方案的原理为：当用户需要发布工程项目时，首先利用第一选择单元提供的选项，进行选择生物信息分析的物种、样本来源、分析类型，并对用户选择的信息进行保存，然后利用第二选择单元，用户进一步选择测序产品或发布数据分析需求，并对用户的选择或发布的内容进行保存；然后利用第三选择单元用户选择项目信息，包括：项目周期、预算，或者输入：研究分析背景、目标、分析要求；并对用户的选择和输入内容进行保存；然后系统中的生成单元会根据用户选择的信息或者输入的信息，生成一个完整的工程项目信息，最后利用发布单元在生物分析平台中发布，便于相应的生物工程师进行完成。

其中，本申请中的系统首先进行生物信息分析的物种、样本来源、分析类型，便于从整体上对生物分析项目奠定基调，然后选择测序产品或发布数据分析需求，进一步对项目的具体类型进行确定，最后选择项目的具体信息，便于发布人员从整体到具体的细节进行选择，便于准确的对项目信息进行体现，逻辑清晰且符合生命科学人员的阐述路径。

其中，分析的物种包括：人、动物、植物、微生物、病毒；样本来源包括：组织、器官、血液、根、茎、叶、花、果；分析类型包括：DNA、RNA、蛋白质组学、代谢组学。

其中，所述第二选择单元具体包括：

形成模块，所述形成模块用于：根据历史数据统计不同分析类型下选择测序或数据分析的概率分布，形成不同分析类型下的转移概率矩阵；

选择模块，所述选择模块用于：读取转移概率矩阵中当前分析类型概率最大的测序或数据分析选项，并将读取的选项内容供用户进行选择。

其中，当四川用户选择“真核转录组测序”的分析类型后，系统自动读取当前四川用户在该分析类型下各选项的转移概率矩阵，发现在当前其中选择“标准化分析+个性化分析”的概率最大，并且其中个性化分析中选择“qPCR验证结果分析”的概率最大，则默认选中“标准化分析+个性化分析”，其中标准化分析内容包括：1.数据过滤质控及统计；2.与参考序列比对及统计、评估；3.基因和转录本表达定量分析；4.基因差异表达分析；5.差异基因的功能富集分析；6.差异基因层次聚类分析等，个性化分析内容包括qPCR验证结果分析。用户也可以选择其他分析内容。

进一步的，当用户选择测序产品时，所述第二选择单元还用于引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品。

进一步的，所述第二选择单元具体还用于：

根据历史数据，统计不同地区的用户在选择测试产品时，选择各个品牌的概率分布；

读取品牌概率转换矩阵中概率最大的品牌作为用户的默认品牌，引导用户操作，并提供人工选择其他品牌的功能。

例如：当四川用户选择“真核转录组测序”的类型进行测序时，系统自动读取当前四川用户在该分析类型下选择各测序品牌的转移概率矩阵，发现选择“华大基因”的概率最大，则默认选择华大基因的品牌。用户也可以选择其他品牌进行调整。

进一步的，当用户选择数据分析时，所述第二选择单元还用于引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品。

进一步的，所述第二选择单元具体还用于：

根据历史数据统计在选择该分析类型时选择标准化、个性化、定制化分析的概率分布；

读取概率转换矩阵中最大的选项作为用户的默认选择，引导用户操作，并提供人工切换的功能。

本申请提供的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

实现了通过本申请中系统，用户通过简单的选择和输入能够快速高效的完成工程项目的发布，且发布的信息完善准确，有助于项目顺利完成技术效果。

附图说明

此处所说明的附图用来提供对本发明实施例的进一步理解，构成本申请的一部分，并不构成对本发明实施例的限定；

图1是本申请中生物分析平台中的工程项目发布系统的组成示意图；

图2是本申请中有限状态转换示意图；

图3是本申请中有限状态转换示意图；

图4是本申请中有限状态转换示意图。

具体实施方式

本发明提供了一种生物分析平台中的工程项目发布系统，解决了现有的生物工程项目发布存在效率和准确率较低，项目信息不完善，容易导致项目无法顺利完成的技术问题，实现了通过本申请中系统，用户通过简单的选择和输入能够快速高效的完成工程项目的发布，且发布的信息完善准确，有助于项目顺利完成技术效果。

为了能够更清楚地理解本发明的上述目的、特征和优点，下面结合附图和具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述。需要说明的是，在相互不冲突的情况下，本申请的实施例及实施例中的特征可以相互组合。

在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本发明，但是，本发明还可以采用其他不同于在此描述范围内的其他方式来实施，因此，本发明的保护范围并不受下面公开的具体实施例的限制。

实施例一：

请参考图1-图4，本申请提供了一种生物分析平台中的工程项目发布系统，所述系统包括：

第一选择单元，所述第一选择单元用于选择生物信息分析的物种、样本来源、分析类型；

第二选择单元，所述第二选择单元用于选择测序产品或发布数据分析需求；

第三选择单元，所述第三选择单元用于选择项目信息，包括：项目周期、预算，第三选择单元用于输入：研究分析背景、目标、分析要求；

生成单元，所述生成单元用于基于第一选择单元、第二选择单元、第三选择单元的选择信息和输入信息，生成工程项目信息；

发布单元，所述发布单元用于将生成的工程项目信息在生物分析平台中发布。

本发明系统采用引导的形式，通过智能采集用户操作习惯，针对生物信息分析项目引导科研人员发布快捷、专业的项目需求。

生物分析平台中项目发布系统的引导过程描述：

1、首先系统引导选择生物信息分析的物种和分析类型；

2、针对不同类型，系统引导用户选择测序或者数据分析内容。本阶段根据所选类型的统计数据(当前采用转移概率矩阵)，引导用户默认选择测序产品或者发布分析需求(提供人工切换功能)；

3、当用户选择测序产品时，系统引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品。本阶段根据不同地区用户不同类型的统计数据，采用数理统计方法(当前采用转移概率矩阵)，引导用户默认选择最可能的品牌、打包产品或自定义产品(提供人工切换功能)；

4、当用户选择发布数据分析需求时，系统引导用户选择标准化、个性化、定制化分析内容。本阶段根据不同地区用户不同类型的统计数据，采用数理统计方法(当前采用转移概率矩阵)，引导用户默认选择最可能的标准化、个性化、定制化分析内容(提供人工切换功能)；

5、系统引导用户选择项目周期、预算，输入研究分析背景、目标、分析要求等信息。

系统中工程项目具体发布过程如下：

步骤1：选择生物信息分析的物种和分析类型；

(1)选择物种及样本来源，物种包括人、动物、植物、微生物、病毒、其他等，样本来源包括组织、器官、血液、根、茎、叶、花、果、其他等；

(2)选择分析类型，分析类型包括DNA、RNA、蛋白质组学、代谢组学4种大类，每种大类包括多个具体小的类型，例如DNA大类下包括动植物de novo测序、微生物de novo测序、人全基因组重测序、动植物全基因组重测序、目标区域测序、全外显子组测序、ChIP-seq、简化基因组-RAD等。

步骤2：针对不同类型，引导用户选择测序或者数据分析内容；

(1)根据历史数据统计不同分析类型下选择测序或者分析的概率分布，形成不同分析类型下的转移概率矩阵；有限状态转换如图2所示。

(2)读取转移概率矩阵中当前分析类型概率最大的选项(测序或者数据分析)，引导用户默认进入选择测序产品或者发布数据分析需求，并提供人工切换的方式重新选择测序产品或者发布数据分析需求。

步骤3：当用户选择测序产品时，引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品；

(1)根据历史数据统计不同地区的用户在选择测试产品时选择各个品牌的概率分布；

(2)读取概率转换矩阵中概率最大的品牌作为用户的默认品牌，引导用户操作，并提供人工选择其他品牌的功能；有限状态转换如图3所示。：

(3)根据历史数据统计在选择各个品牌后选择不同打包产品或自定义产品的概率分布，例如选择“真核转录组测序”的分析类型后，再选择“华大基因”品牌后，根据统计的概率转换矩阵默认选择“真核链特异转录组”、“真核单细胞转录组”、“真核常规转录组”中概率最大的“真核链特异转录组”作为默认选择的产品，引导用户进行操作。

步骤4：当用户选择数据分析时，引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品；

(1)根据历史数据统计在选择该分析类型时选择“标准化”、“个性化”、“定制化”分析的概率分布；

(2)读取概率转换矩阵中最大的选项作为用户的默认选择，引导用户操作，并提供人工切换的功能；有限状态转换如图4所示。

(3)根据历史数据统计在选择各个品牌后选择“个性化”、“定制化”后用户选择不同模板内容的概率分布，例如选择“表达谱”的分析类型后，根据统计概率默认显示标准化分析内容“1.数据过滤质控及统计；2.测序评估；3.基因表达注释；4.差异基因表达分析；5.组间差异基因表达分析；6.差异基因表达模式聚类；7.GO功能分类及富集分析；8.Pathway分类及富集分析……”，并默认选择个性化分析中的“与其他组学数据联合分析；功能验证定制分析”这两项。

步骤5：引导用户选择项目周期、预算，输入研究分析背景、目标、分析要求等信息

本申请提供的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：

实现了通过本申请中系统，用户通过简单的选择和输入能够快速高效的完成工程项目的发布，且发布的信息完善准确，有助于项目顺利完成技术效果。

尽管已描述了本发明的优选实施例，但本领域内的技术人员一旦得知了基本创造性概念，则可对这些实施例作出另外的变更和修改。所以，所附权利要求意欲解释为包括优选实施例以及落入本发明范围的所有变更和修改。

显然，本领域的技术人员可以对本发明进行各种改动和变型而不脱离本发明的精神和范围。这样，倘若本发明的这些修改和变型属于本发明权利要求及其等同技术的范围之内，则本发明也意图包含这些改动和变型在内。

Claims (7)

1.一种生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，所述系统包括：

第一选择单元，所述第一选择单元用于选择生物信息分析的物种、样本来源、分析类型；

第二选择单元，所述第二选择单元用于选择测序产品或发布数据分析需求；

第三选择单元，所述第三选择单元用于选择项目信息，包括：项目周期、预算，第三选择单元用于输入：研究分析背景、目标、分析要求；

生成单元，所述生成单元用于基于第一选择单元、第二选择单元、第三选择单元的选择信息和输入信息，生成工程项目信息；

发布单元，所述发布单元用于将生成的工程项目信息在生物分析平台中发布。

2.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，分析的物种包括：人、动物、植物、微生物、病毒；样本来源包括：组织、器官、血液、根、茎、叶、花、果；分析类型包括：DNA、RNA、蛋白质组学、代谢组学。

3.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，所述第二选择单元具体包括：

形成模块，所述形成模块用于：根据历史数据统计不同分析类型下选择测序或数据分析的概率分布，形成不同分析类型下的转移概率矩阵；

选择模块，所述选择模块用于：读取转移概率矩阵中当前分析类型概率最大的测序或数据分析选项，并将读取的选项内容供用户进行选择。

4.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，当用户选择测序产品时，所述第二选择单元还用于引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品。

5.根据权利要求4所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，所述第二选择单元具体还用于：

根据历史数据，统计不同地区的用户在选择测试产品时，选择各个品牌的概率分布；

读取品牌概率转换矩阵中概率最大的品牌作为用户的默认品牌，引导用户操作，并提供人工选择其他品牌的功能。

6.根据权利要求1所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，当用户选择数据分析时，所述第二选择单元还用于引导用户选择测序品牌、打包产品或自定义产品。

7.根据权利要求6所述的生物分析平台中的工程项目发布系统，其特征在于，所述第二选择单元具体还用于：

根据历史数据统计在选择该分析类型时选择标准化、个性化、定制化分析的概率分布；

读取概率转换矩阵中最大的选项作为用户的默认选择，引导用户操作，并提供人工切换的功能。