病理切片显示方法及装置
技术领域
本发明涉及医疗领域,具体而言,涉及病理切片显示方法及装置。
背景技术
病理切片技术,通常是先取一定大小的病变组织,用病理组织学方法制成病理玻片,之后将玻片进行拍摄,进而制成切片照片,最后,将这些切片照片进行分解,以形成图像碎片,在需要显示的时候,只需要将这些图像碎片拼接,便可以形成能够直接观看的照片了。其中,针对同一个玻片所拍摄出的照片是有着不同分片率的,或者说是在每个图像碎片的大小均相同的情况下,不同分辨率的照片的图像碎片个数不同。
在生成图像碎片之后,每次需要显示图像的时候,首先调取同一分辨率下的图像碎片,之后,按照图像碎片的相对位置,将这些图像碎片拼接起来,进而形成一个完整的图像。由此可见,在显像的时候,会涉及到图像拼接技术,针对病理切片的图像拼接也是当前图像处理领域的研究热点。
由于目前在倍率类图形还在探索区,目前比较成熟的技术也仅仅是地图类相关,对于非地图类的倍率类图片还在探索区域,技术尚不成熟,所以在进行图像拼接时会造成误配的现象。目前,一般会采用全局优化的方法在图像碎片进行拼接的时候来修正,进而保证拼接后的图像的完整性。此种全局优化的方法,在理论上较为合理,但是速度和效果方面都欠佳。
目前,由于病理切片的显示技术都基本是各家只能使用各家的浏览工具,由于各家的浏览工具的工作原理和工作机制有差别,导致了某一家的病理切片在其他家浏览工具中无法读取(主要问题是出现在图像碎片的拼接方面),或者说是无法正常的显示出来。如图1所示,为一个碎图流(图像碎片),将每一张这样的碎图流拼接出来,也就能够形成一个完整的切片照片。
但在进行图像拼接的时候,由于难以确定某个图像碎片(碎图流)的具体坐标,导致拼接出现错误。
发明内容
本发明的目的在于提供病理切片显示方法,以使不同规格的病理切片,均能够在同一个浏览器中显示。
第一方面,本发明实施例提供了病理切片显示方法,包括:
根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标;
根据预先获取的像素宽、高计算切片照片中指定图像碎片的行列数;
根据所述行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数;
若所述影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数;
根据参考点坐标、实际层数和中心坐标,计算所述指定图像碎片所对应的显示层数和显示横纵坐标;
按照显示层数和显示横纵坐标显示所述指定图像碎片。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第一种可能的实施方式,其中,步骤所述根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标包括:
根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标;
根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第二种可能的实施方式,其中,步骤所述根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标包括:
使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点纵坐标=物理高度值/2-参考点纵坐标;
步骤所述根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标包括:
使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点横坐标=物理宽度值/2-参考点横坐标。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第三种可能的实施方式,其中,步骤所述若所述影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数包括:
若所述影响层数等于预设的标准值,则通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第四种可能的实施方式,其中,步骤所述根据所述行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数包括:
根据所述行列数、当前切片照片的倍率和干扰系数,计算影响层数。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第五种可能的实施方式,其中,所述干扰系数是通过如下步骤获取到的:
多次比较缝隙错位的切片照片与相应正确的切片照片,以得到多个参考系数;
统计所述参考系数,以计算出所述干扰系数。
第二方面,本发明实施例还提供了病理切片显示装置,包括:
中心坐标计算模块,用于根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标;
行列数计算模块,用于根据预先获取的像素宽、高计算切片照片中指定图像碎片的行列数;
影响层数计算模块,用于根据所述行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数;
实际层数计算模块,用于若所述影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数;
位置信息计算模块,用于根据参考点坐标、实际层数和中心坐标,计算所述指定图像碎片所对应的显示层数和显示横纵坐标;
显示模块,用于按照显示层数和显示横纵坐标显示所述指定图像碎片。
结合第二方面,本发明实施例提供了第二方面的第一种可能的实施方式,其中,中心坐标计算模块包括:
纵坐标计算单元,用于根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标;
横坐标计算单元,用于根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标。
结合第二方面,本发明实施例提供了第二方面的第二种可能的实施方式,其中,纵坐标计算单元,进一步用于使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点纵坐标=物理高度值/2-参考点纵坐标;
横坐标计算单元,进一步用于使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点横坐标=物理宽度值/2-参考点横坐标。
结合第二方面,本发明实施例提供了第二方面的第三种可能的实施方式,其中,实际层数计算模块包括:
实际层数计算单元,若所述影响层数等于预设的标准值,则用于通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数。
本发明实施例提供的病理切片显示方法,采用自适应算法,与现有技术中的各家浏览器的工作原理不同,并且图像碎片的格式不同,导致同一批图像碎片(能够组成一个完整切片照片的图像碎片)无法在不同的浏览器中显示相比,其通过先计算出切片照片的中心坐标,再计算出该切片照片中指定图像碎片的行列数,并且通过计算出影响层数进一步确定实际层数,最后,确定图像碎片的显示层数和显示横纵坐标,并按照该显示层数和显示横纵坐标显示图像碎片,进而显示出全部的切片照片。使得一个显示设备能够对不同种类的切片照片进行显示,也就是提高了显示设备的兼容性。
为使本发明的上述目的、特征和优点能更明显易懂,下文特举较佳实施例,并配合所附附图,作详细说明如下。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本发明的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
图1示出了相关技术中,一个碎图流的示意图;
图2示出了相关技术中,由图像碎片组成完整切片照片的示意图;
图3示出了相关技术中,相邻两层切片照片的对比示意图;
图4示出了本发明实施例所提供的病理切片显示方法的基本流程图;
图5示出了本发明实施例所提供的病理切片显示方法的切片照片与所在玻片的示意图。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。通常在此处附图中描述和示出的本发明实施例的组件可以以各种不同的配置来布置和设计。因此,以下对在附图中提供的本发明的实施例的详细描述并非旨在限制要求保护的本发明的范围,而是仅仅表示本发明的选定实施例。基于本发明的实施例,本领域技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
将病理切片保存为电子图片(切片照片),便于医生随时随地的调取和观看,如在会诊时、会议时,均可以采用调取的方式将病理切片显示出来,来让多个专家同时观看。在保存病理切片的时候,一个病例切片不会只有一种保存方式(主要是指不会只保存一个分辨率的切片),这是考虑到医生在观察该病例切片的时候,需要将病理切片进行放大、移动等等操作,来保证医生能够从不同的层面来观察该病理切片,进而保证观察病例切片的准确性和完整性。而且,考虑到在同一台电脑(也可以是如投影器等其他显示器件)上同时加载完整的图像时,当分辨率很高的时候,电脑屏幕不会将完整的图像都显示出来,而且如果同时显示出来的话电脑的负荷会比较大。因此,在制作将病理切片制作为切片照片的时候,就会将切片照片进行分解,以形成多个图像碎片,形成如图2的形式,并且在显示的时候,只将一部分图像碎片拼接成一个局部的图像,在显示器上显示出来。可以想到的是,分辨率越高的切片照片,其图像碎片也就越多(通常,不论何种分辨率的切片照片,单个图像碎片的在显示器上呈现的大小均是相同的)。当用户进行放大的时候,电脑也就将分辨率更高的切片照片在显示器上显示出来。
如图1所示,每一张图像碎片都有行(Y)、列(X)、层\倍率(Z)这三个属性,这类似于一张放在三维空间的平面图片,图像拼接也就是将同一层\倍率的图形碎片拼接成某一个分辨率的切片照片,之后,按照类似的方式将每层切片都拼接完成,也就形成了不同分辨率下的切片照片。在进行拼接的时候,主要是指,将层数相的图像碎片拼接到一起,其中,最主要是找到对应的图像碎片的三系坐标,在知悉图像碎片的三系坐标之后,也就能够将这个图像碎片放到指定的位置上。如图2所示,示出了某一层的图像碎片拼接结果,可以看出,针对某一层图片的拼接也就是是将指定的图像碎片放置到指定的位置上(指定横、纵坐标的位置上)。具体的相邻两层的图片有类似如图3所示的关系(此处用以两张同层的9层以及只有一张的8层来展现其层与行列的关系),由下图可发现,8层与9层四个角坐标是对应的,9层的倍率是8层的2倍,即,第8层照片中的一张图像碎片所对应的真实大小,与第9层照片中的两张图像碎片所对应的真实大小是相同的。
每种切片照片均有其固有的显示形式,如电脑中不同的类型(不同后缀)的文件需要使用不同的方式打开。某一种类型的切片照片均有其特有的打开方式(将图像碎片拼接到一起并进行显示的方式),尤其是各家的照片保存形式不同,这导致某一种切片照片只能在某一种电脑中打开,无法被其他的电脑打开(也可以说是其他电脑不知晓将这种图像碎片拼接到一起的方式)。这直接导致了当切片照片转移给不同的医院时,接收到切片照片的医院无法正常显示这些切片照片(也就是无法将该切片照片的碎片组装成一个完整的切片照片)。
有鉴于此,本申请提供了病理切片显示方法,如图1所示,包括:
S101,根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标;
S102,根据预先获取的像素宽、高计算切片照片中指定图像碎片的行列数;
S103,根据行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数;
S104,若影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与影响层数,确定实际层数;
S105,根据参考点坐标、实际层数和中心坐标,计算指定图像碎片所对应的显示层数和显示横纵坐标;
S106,按照显示层数和显示横纵坐标显示指定图像碎片。
具体的,步骤S101,根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标,可分为如下两个步骤:
11,根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标;
12,根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标。
具体的,步骤11,根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标包括:
使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点纵坐标=物理高度值/2-参考点纵坐标;
步骤12,根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标包括:
使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点横坐标=物理宽度值/2-参考点横坐标。
具体的,步骤104,若影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与影响层数,确定实际层数包括:
若影响层数等于预设的标准值,则通过比较当前调用的层数与影响层数,确定实际层数。
具体的,步骤103,根据行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数包括:
根据行列数、当前切片照片的倍率和干扰系数,计算影响层数。
具体的,干扰系数是通过如下步骤获取到的:
多次比较缝隙错位的切片照片与相应正确的切片照片,以得到多个参考系数;
统计参考系数,以计算出干扰系数。
需要说明的是,如图5所示,示出了一个玻片上,所拍摄到组织的切片照片的示意图(俯视图)。该图中,组织是整个玻片中的一个局部,也就是拍摄出来的切片照片所呈现的区域,也只是玻片中的一个局部。物理宽和物理高分别指被拍摄的组织的实际宽度和高度(即,照片所对应的范围的高度和宽度)。中心坐标指的是该组织的中心点的坐标。参考点坐标一般指的是该组织左上角的坐标,当然,也可以统一为右上角,或者其他点位置。像素宽和像素高是受拍摄的相机所影响,在将该组织的切片照片拍摄完成之后,便会确定,像素宽、高为拍摄时通过机器分辨率系数转换所得。此系数单位为pixel/um,即像素和微米的比例值。此比例值为机器拍摄时自带的值。机器直接将参考点坐标(物理x、物理y)计算反馈得出,具体过程在此不过多说明。
干扰系数为多次试验所得一个比较正确的值,该值反应了实际显示图片与预期显示图片的差距,进而通过使用该系数,可以用于对图片出现缝隙错位的调整,类似的,影响层数也是通过多次实验所得。
步骤S106在执行的时候,首先判断影响层数是否等于标准值,如果等于,则当前调用的层数和影响层数计算出实际层数。或者是根据参考点坐标、实际层数和中心坐标,计算所述指定图像碎片所对应的显示层数和显示横纵坐标,也就是确定了该图像碎片的层数和位置,当确定了每个碎片的层数和位置之后,便可以显示出一个完整的切片照片了。
下面简述一个具体的实例,来说明本申请所提供的病理切片显示方法:
1,已知参考点的坐标,物理X=-10000物理Y=-10000要调取20倍最小一层的所有图片;
通过算法可知:中心坐标X=5000中心坐标Y=5000并且分辨率最小的一层只有一张图片,影响层数为8。
2,求第八层图片则得出最小一层的参数为,调用层数8层坐标X 4872坐标Y 4872。
3,按照计算得出的层数和坐标,显示该图像碎片即可。
与方法相对应的,本申请实施例中还提供了与病理切片显示方法相对应的病理切片显示装置,包括:
中心坐标计算模块,用于根据切片照片的物理宽、高和参考点坐标,计算切片照片的中心坐标;
行列数计算模块,用于根据预先获取的像素宽、高计算切片照片中指定图像碎片的行列数;
影响层数计算模块,用于根据所述行列数、当前切片照片的倍率,计算影响层数;
实际层数计算模块,用于若所述影响层数满足预设的条件,则通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数;
位置信息计算模块,用于根据参考点坐标、实际层数和中心坐标,计算所述指定图像碎片所对应的显示层数和显示横纵坐标;
显示模块,用于按照显示层数和显示横纵坐标显示所述指定图像碎片。
优选的,中心坐标计算模块包括:
纵坐标计算单元,用于根据切片照片的物理高度值和参考点纵坐标,计算切片照片的中心点纵坐标;
横坐标计算单元,用于根据切片照片的物理宽度值和参考点横坐标,计算切片照片的中心点横坐标。
优选的,纵坐标计算单元,进一步用于使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点纵坐标=物理高度值/2-参考点纵坐标;
横坐标计算单元,进一步用于使用如下公式计算中心点纵坐标,中心点横坐标=物理宽度值/2-参考点横坐标。
优选的,实际层数计算模块包括:
实际层数计算单元,若所述影响层数等于预设的标准值,则用于通过比较当前调用的层数与所述影响层数,确定实际层数。
所属领域的技术人员可以清楚地了解到,为描述的方便和简洁,上述描述的系统、装置和单元的具体工作过程,可以参考前述方法实施例中的对应过程,在此不再赘述。
所述功能如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解,本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品存储在一个存储介质中,包括若干指令用以使得一台计算机设备(可以是个人计算机,服务器,或者网络设备等)执行本发明各个实施例所述方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括:U盘、移动硬盘、只读存储器(ROM,Read-Only Memory)、随机存取存储器(RAM,Random Access Memory)、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
以上所述,仅为本发明的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,可轻易想到变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应所述以权利要求的保护范围为准。