CN103793621A - 一种腹泻病综合监测平台 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种腹泻病综合监测平台,该监测平台包含腹泻病监测数据库和监测点选择模块,以及向所述的腹泻病监测数据库传送数据的腹泻症状信息采集模块、腹泻传染病例信息采集模块、腹泻聚集性疫情信息采集模块、腹泻病原谱与耐药性信息采集模块以及腹泻危险因素信息采集模块;本发明提供的腹泻病综合监测平台,将有助于对腹泻病暴发的早期预警,追踪病原谱变迁趋势,探明病原致病因子,结合分析发病危险因素监测数据将有助于对疾病发病趋势进行全方位预测,为制定预防控制措施提供科学依据。
Description
技术领域
本发明涉及一种疾病综合监测系统,具体地,涉及一种腹泻病综合监测平台。
背景技术
腹泻病是一组以感染性腹泻为主,严重危害人民身体健康的多发病,是全球公共卫生问题之一,系统地开展监测,了解腹泻在社区居民中的分布特征,是控制和降低此类疾病在人群中发生和流行的基础。
腹泻病指多病原多因素引起的以大便次数增多,大便性状改变为特点的消化道综合症。按病因分类为感染性腹泻和非感染性腹泻;按病程分类为急性、迁延性和慢性;按腹泻程度分为轻型腹泻、中型腹泻和重型腹泻 。据世界卫生组织统计,除中国外,全世界每年有10亿人患腹泻,其中5亿人发生在第三世界,导致每年500万小儿死亡。我国曾组织全国20个省、市入户调查,经分析,我国估计腹泻病年发病率约为0.7次/人,5岁以下小儿的年发病率为1.9次/人;对21个省、市调查估计,我国每年有8.36亿人次患腹泻,其中5岁以下小儿有3亿人次。
疾病监测是指长期、连续和系统地收集疾病的动态分布及其影响因素的资料,经过分析将信息及时上报和反馈,以便及时采取干预措施并评价其效果。疾病监测主要包括症状监测、病例监测、病原学监测和危险因素监测,这些手段在目前的公共卫生各个领域已广泛使用。然而单一的监测手段并不能反映某一疾病的总体特征,更不能对它的发病趋势做出预判。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于腹泻病综合监测的系统,建立病例监测、症状监测和病原谱监测相结合的腹泻病综合监测平台将有助于对腹泻病暴发的早期预警,追踪病原谱变迁趋势,探明病原致病因子,结合分析发病危险因素监测数据将有助于对疾病发病趋势进行全方位预测,为制定预防控制措施提供科学依据。
为了达到上述目的,本发明提供了一种腹泻病综合监测平台,其中,该监测平台包含腹泻病监测数据库和监测点选择模块,以及向所述的腹泻病监测数据库传送数据的腹泻症状信息采集模块、腹泻传染病例信息采集模块、腹泻聚集性疫情信息采集模块、腹泻病原谱与耐药性信息采集模块以及腹泻危险因素信息采集模块;所述的监测点选择模块在数据源中采用异质区域均值估计(Mean of Surface with Non-homogeneity,MSN)模型选取监测点;所述的腹泻症状信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人的症状信息;所述的腹泻传染病例信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人法定传染病例信息;所述的腹泻聚集性疫情信息采集模块在监测点所在区域进行监测并采集聚集性疫情信息;所述的腹泻病原谱与耐药性信息采集模块在各监测点采集通过腹泻病人采样标本进行的细菌和病毒检测结果的信息,和检测所得的阳性病原菌进行抗生素的药敏检测的信息,以及对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源的信息;所述的腹泻危险因素信息采集模块在监测点所在区域进行监测,并采集通过对危险因素监测进行标本检测所得的信息。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的数据源是指不同医疗机构的肠道门诊。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的腹泻病人是指凡24小时内大便次数大于或等于3次,且大便性状有改变的门诊病例。大便性状有改变是指呈稀便、水样便、粘脓便或脓血便等。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的腹泻症状信息采集模块采集的信息包含患者的症状、抗生素使用情况,以及性别、年龄和职业等。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的法定传染病例为包含霍乱、0157:H7、细菌性痢疾、伤寒副伤寒等的感染性腹泻病例。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的集聚集性疫情为各监测点对发现的1周内包含学校、幼儿园、自然村寨、社区或建筑工地等的同一集体单位中发生10例及以上腹泻病病例,或死亡1例及以上的疫情。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源,通过脉冲场凝胶电泳技术进行。
对每个病例通过肛拭或粪便采集双份标本分别进行细菌和病毒检测。细菌和病毒检测包含诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒,以及沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、弯曲菌、致泻性大肠杆菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌和小肠结肠炎耶尔森菌等。对检测所得的阳性病原菌进行抗生素的药敏检测,即检测耐药性。
对病原菌进行抗生素的药敏检测,是指对沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌以及弯曲菌进行抗生素的药敏检测。
抗生素的药敏检测,包含对氧氟沙星、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢他啶、头孢西丁、头孢呋辛、庆大霉素、阿莫西林/克拉维酸、甲氧嘧啶、复方新诺明、萘啶酸、氨苄西林、氯霉素、四环素、链霉素、米卡星、环丙沙星、阿奇霉素、红霉素、诺氟沙星等中的12~14种抗生素的药敏检测。
通过脉冲场凝胶电泳技术(PFGE),对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源研究。具体是指对沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、弯曲菌检测的阳性菌株进行脉冲场凝胶电泳分型。即,依据血清型作为同源性分析来找出真正的致病源头,即,依据血清型作为同源性分析来找出真正的致病源头,脉冲场凝胶电泳(pulse-field gelelectrophoresis,PFGE)是对细菌DNA 进行研究,通过对菌株间微小差异的分析,判断各致病菌株间亲缘关系,由此得到的同源性分析比血清型更具有可靠性、科学性。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的危险因素监测包含对饮水和食品微生物污染的监测。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,所述的对饮水和食品微生物污染的监测,是指每月采集食品和水样标本,进行病原菌检测。其中包含霍乱弧菌、沙门菌、副溶血性弧菌、致泻性大肠杆菌等检测。
上述的腹泻病综合监测平台,其中,还能够通过所述的腹泻病监测数据库进行数据分析和处理。
本发明提供的腹泻病综合监测平台具有以下优点:
1. 在传统的病例监测基础上,融合症状监测、病原谱监测和危险因素监测等方法,构建了腹泻病综合监测网络,各种监测结果相互补充,相互印证,从多方面探索腹泻病发病特征、发病趋势,加深了对疾病发病因素的了解。
2. 先进的监测点选择理论(MSN模型)和实际工作相结合,优选出最佳的监测点组合方案,使监测工作开展更为高效,在保证监测结果可信度和外推性的基础上,最大限度的节约了公共卫生资源,提高了公共卫生效益。
3. 每个病例采集双份标本,同时进行细菌和病毒检测,得到了较为全面的病原谱构成,使监测结果更加科学可信,在病因探索方面具有十分积极的意义。
4. 在病原谱检测的基础上,对主要病原进一步进行基因分型和病原溯源研究,能够进一步加深对疾病的认识,并为发现典型病例、聚集性病例提供十分重要的线索。
5. 开展耐药菌监测,选择多种常用抗生素对主要致病菌进行药敏实验,实验结果对腹泻病临床治疗用药具有直接的指导意义。
6. 通过研究,建立了成熟的腹泻病监测网络,数据采集、实验室检测、数据分析和质量控制等多方面均建立了较为完善、可行的方法和制度,能够持续开展,并推广至其它监测工作。借鉴该研究的经验和成果,可进一步提高本区传染病综合防控能力。
附图说明
图1为本发明的监测点就诊人数图。
图2为本发明的法定传染病发病情况示意图。
图3为本发明的腹泻病人细菌谱构成按年分布图。
图4为本发明的腹泻病人病毒谱构成按年分布图。
图5为本发明的沙门菌药敏检测结果示意图。
图6为本发明的志贺菌药敏检测结果示意图。
图7为本发明的副溶血弧菌药敏检测结果示意图。
图8为本发明的弯曲菌药敏检测结果示意图。
图9为本发明的副溶血弧菌食品分离株聚类分析图。
图10为本发明的副溶血弧菌病人分离株聚类分析图。
图11为本发明的宋内志贺菌PFGE聚类分析图。
图12为本发明的沙门菌食品分离株聚类分析图。
图13a~13c为本发明的沙门菌病人分离株聚类分析图。
图14为本发明的沙门菌食品、病人分离株聚类分析图。
图15为本发明的空肠弯曲菌病人分离株聚类分析图。
图16为本发明的腹泻病门诊初诊人数与法定肠道传染病发病数的相关性分析示意图。
图17为本发明的细菌谱阳性率与病毒谱阳性率的相关性分析示意图。
具体实施方式
以下结合附图对本发明的具体实施方式作进一步地说明。
本发明提供的腹泻病综合监测平台,包含腹泻病监测数据库和监测点选择模块,以及向腹泻病监测数据库传送数据的腹泻症状信息采集模块、腹泻传染病例信息采集模块、腹泻聚集性疫情信息采集模块、腹泻病原谱与耐药性信息采集模块以及腹泻危险因素信息采集模块。
监测点选择模块在数据源中采用异质区域均值估计模型选取监测点。
数据源是指不同医疗机构的肠道门诊。
腹泻症状信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人的症状信息。
腹泻病人是指凡24小时内大便次数大于或等于3次,且大便性状有改变的门诊病例。大便性状有改变是指呈稀便、水样便、粘脓便或脓血便等。
腹泻症状信息采集模块采集的信息包含患者的症状、抗生素使用情况,以及性别、年龄和职业等。
腹泻传染病例信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人法定传染病例信息。
法定传染病例为包含霍乱、0157:H7、细菌性痢疾、伤寒副伤寒等的感染性腹泻病例。
腹泻聚集性疫情信息采集模块在监测点所在区域进行监测并采集聚集性疫情信息。
集聚集性疫情为各监测点对发现的1周内包含学校、幼儿园、自然村寨、社区或建筑工地等的同一集体单位中发生10例及以上腹泻病病例,或死亡1例及以上的疫情。
腹泻病原谱与耐药性信息采集模块在各监测点采集通过腹泻病人采样标本进行的细菌和病毒检测结果的信息,和检测所得的阳性病原菌进行抗生素的药敏检测的信息,以及对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源的信息。
对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源,通过脉冲场凝胶电泳技术进行。
对每个病例通过肛拭或粪便采集双份标本分别进行细菌和病毒检测。细菌和病毒检测包含诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒,以及沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、弯曲菌、致泻性大肠杆菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌和小肠结肠炎耶尔森菌等。对检测所得的阳性病原菌进行抗生素的药敏检测,即检测耐药性。
对病原菌进行抗生素的药敏检测,是指对沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌以及弯曲菌进行抗生素的药敏检测。
抗生素的药敏检测,包含对氧氟沙星、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢他啶、头孢西丁、头孢呋辛、庆大霉素、阿莫西林/克拉维酸、甲氧嘧啶、复方新诺明、萘啶酸、氨苄西林、氯霉素、四环素、链霉素、米卡星、环丙沙星、阿奇霉素、红霉素、诺氟沙星等中的12~14种抗生素的药敏检测。
通过脉冲场凝胶电泳技术(PFGE),对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源研究。具体是指对沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、弯曲菌检测的阳性菌株进行脉冲场凝胶电泳分型。即,依据血清型作为同源性分析来找出真正的致病源头,脉冲场凝胶电泳是对细菌DNA 进行研究,通过对菌株间微小差异的分析,判断各致病菌株间亲缘关系,由此得到的同源性分析比血清型更具有可靠性、科学性。
腹泻危险因素信息采集模块在监测点所在区域进行监测,并采集通过对危险因素监测进行标本检测所得的信息。
危险因素监测包含对饮水和食品微生物污染的监测。
对饮水和食品微生物污染的监测,是指每月采集食品和水样标本,进行病原菌检测。其中包含霍乱弧菌、沙门菌、副溶血性弧菌、致泻性大肠杆菌等检测。
本发明提供的腹泻病综合监测平台,还能够通过所述的腹泻病监测数据库进行数据分析和处理。
实施例1
在指定地区,根据近三年各级医院每月肠道门诊初诊量数据,结合实际可操作性,初步计划选取10家左右医院作为监测点。为了使监测工作更加高效的开展,结论更具外推性,通过监测点选择模块,采用异质区域均值估计(Mean of Surface with Non-homogeneity,MSN)模型选取监测点。MSN模型是目前针对分层总体进行样本优化设计和统计推断的最优理论,它将分层抽样、医院之间的相关性和克里金(Kriging)优化技术进行有效结合,实现对目标对象均值和总量的无偏最优估计。
根据该区腹泻病病人就诊情况、医疗机构区域分布及历史发病情况,结合实际可操作性,最终选择12家医疗机构作为腹泻病监测点,其中2家三级医院、7家二级医院、3家社区卫生服务中心。
各监测点通过腹泻症状信息采集模块,收集每天肠道门诊就诊的初诊腹泻病人信息,包括患者的性别、年龄、职业、症状、抗生素使用等,然后向腹泻症状监测数据库传送监测数据。
腹泻病人是指凡24小时内大便次数大于或等于3次,且大便性状有改变(呈稀便、水样便、粘脓便或脓血便等)的门诊病例。
腹泻病综合监测结果如下。
1. 通过腹泻症状信息采集模块进行症状监测。
如图1所示,在该腹泻病症状监测系统运行的30个月内,即2011年1月1日~2013年6月30日,各监测点肠道门诊就诊人次数共43549人次,平均每天47.75人次,7~9月为腹泻病就诊高峰期。从人群分布来看,女性就诊者多于男性,性别比为0.87:1;就诊人群以20~40岁年龄段为主,年龄中位数41岁。职业分布以职员、离退休人员和工人为主,占就诊数的82.79%。临床表现以腹泻、腹痛、恶心和呕吐为主,其中99.57%有腹泻,68.76%有腹痛,37.80%有恶心,25.64%有呕吐,另外有11.18%伴发热;大便性状以稀水样便为主,占95.47%。临床诊断以肠炎和急性胃肠炎为主,分别占80.41%和12.96%。
从时间趋势来看,该区域腹泻病季节性发病特点明显,流行高峰主要在夏秋季,特别是7-9月为腹泻病发病高峰期。
2. 通过腹泻传染病例信息采集模块进行传染病例监测。
如图2所示,2011年-2013年6月共报告霍乱、痢疾、伤寒副伤寒、感染性腹泻等有腹泻症状的法定肠道传染病697例,其中2011年报告310例(发病率5.99/10万),2012年报告288例(发病率5.47/10万),2013年上半年报告99例。痢疾287例,伤寒/副伤寒9例,感染性腹泻401例。近两年疫情均处于历史较低水平。
3. 通过腹泻聚集性疫情信息采集模块进行聚集性疫情监测。
2011-2013年6月,该地区共发生11起聚集性腹部不适事件,其中3起发生在养老院,2起发生在医疗机构,5起发生在学校和托幼机构,1起发生在家庭自然村,见下表1。 11起聚集性事件中有7起是诺如病毒感染导致,另外4起分别由副溶血弧菌、腊样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌和轮状病毒感染引起。
表1聚集性腹部不适事件一览表。
4. 通过腹泻危险因素信息采集模块进行危险因素监测。
每月各采集散装生禽畜样品15~16件,其中集贸市场监测点采集鸡肉、鸭肉和猪肉各2件,牛肉和羊肉各1件,大型超市监测点采集鸡肉和猪肉各2件,鸭肉、牛肉和羊肉各1件,全年共采集180~192件。
对标本分别进行金葡菌、单增李斯特菌和沙门菌检测,2011年检出沙门菌阳性标本7份,检出率3.89%;2012年检出沙门菌阳性标本42件,检出率23.30%;2013年1-6月共采样96份,检出沙门菌阳性11份,检出率11.46%,检出单增李斯特菌阳性5件,检出率5.21%,检出金黄色葡萄球菌阳性4件,检出率4.17%,见下表2。
表2食品微生物检测结果。
肠道传染病流行季节高风险食品监测共抽检样品970份,其中海水产品240份,肉类制品185份,禽类制品175份,蔬菜229份,奶类食品102份,蛋类食品39份。970份样品中共检出病原菌122株,分布于4类食品121份样品中,总检出率为12.47%,其中沙门菌检出81株,占8.35%,副溶性弧菌检出28株,占2.89%,弯曲菌检出12份,占1.24%,另外检出1株小肠结肠耶尔森菌,占0.10%;EHEC O157:H7、志贺氏菌等未检出。6类食品中病原菌检出率最高的为肉类制品,为28.11%,其次为禽类食品和海水产品,分别为22.86%和10.83%,检出率较低的是蔬菜,为1.75%,奶类食品和蛋类食品中均未检出病原菌见下表3。
表3不同种类食品肠道病原菌的检出率。
5. 通过腹泻病原谱与耐药性信息采集模块进行病原谱与耐药性检测。
5.1细菌和病毒检测
一年病原谱监测样本量选取约3000份。将样本量按照门诊量比例按周分配至各个监测点医院,要求每月送样量上下浮动不得超过5%。监测病例选择症状典型,没有抗生素应用史的急性期病人。每个病例采集双份标本(肛拭或粪便)分别开展细菌和病毒检测,检测项目包括8种细菌和5种病毒共13种病原体,即轮状病毒、肠道腺病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒以及沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、弯曲菌、致泻性大肠杆菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌和小肠结肠炎耶尔森菌。
监测点医疗机构常年开设肠道门诊,对以上医疗机构就诊的符合监测病例定义的腹泻病例进行流行病学调查,内容包括:一般情况、临床表现、实验室检查等。
粪便标本的收集及送检方法为:用 3根无菌棉拭子采集患者新鲜粪便 lg左右,插入卡布(Cary-Blair)氏运送培养基底部,塞好管口,室温下当天送检,冷藏环境下可第 2天送检,同时采集 5g左右粪便至病毒采集盒,室温下当天送检,-20 ℃冷冻环境下可第 2天送检。
置于Cary-Blair半固体培养基内的粪便标本,增菌后接种不同培养基作沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、弯曲菌、致泻性大肠杆菌、气单胞菌、类志贺邻单胞菌和小肠结肠炎耶尔森菌等细菌分离培养和生化鉴定和血清分型。即,将标本接种在 SS琼脂(salmonella-shigella agar)平板上,37 ℃培养箱内培养 18 h,挑取可疑菌落进行生化试验及血清分型试验。
置于采集盒中的粪便标本用实时定量聚合酶链式反应(real time polymerase chain reaction,RT-PCR)法进行轮状病毒、肠道腺病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒的核酸检测。肠道病原菌和病毒的检验技术方案和规程按照中国疾病预防控制中心制定的腹泻症候群监测方案执行。
检测结果:
2011年1月-2013年6月,共对5322例腹泻门诊病例进行了采样检测,2011年1-6月对病例标本进行细菌学检测,从2011年7月开始,每一病例采集2份标本,分别进行细菌检测和病毒检测。截止2013年6月30日,任一细菌检测阳性的标本922份,细菌检测总体阳性率为17.32%;任一病毒检测阳性标本1151份,病毒检测总体阳性率为29.58%。如下表4所示。
表4:2011-2013年6月腹泻病例采样监测结果。
如图3所示,2011年细菌检测阳性病例中,以副溶血弧菌、沙门菌和弯曲菌为主要病原体,从2012年5月份起,致泻性大肠杆菌和气单胞菌阳性检出率有所增高,其他主要病原菌与2011年类似。大部分阳性标本为单一细菌感染,其中71份标本存在2种细菌混合感染的情况,有6份标本混合感染了三种病原体,混合感染率相对较高的有沙门菌、致泻性大肠埃希菌、气单胞菌、弯曲菌等。
如图4所示,两年半的监测结果均显示该区病毒性腹泻的优势病原为诺如病毒,其阳性标本所占比例超过50%,另外检出较多的还有轮状病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒。
从病原谱时间特征上来看,夏秋季(7-9月)细菌性腹泻病例较多,而秋冬季(10月-3月)腹泻病例多为病毒感染,总体而言,秋季是细菌和病毒导致的感染性腹泻高发季节,符合全国感染性腹泻病的流行规律。
5.2耐药性检测
对沙门菌、志贺菌属、副溶血性弧菌、弯曲菌进行了12~14种抗生素的药敏检测,检测结果分为敏感、中度敏感和耐药三类。
采用临床实验室标准化协会(clinical and laboratory standards institute,CLSI)推荐的 Kirby-Bauer(纸片扩散)法进行药敏试验,判断标准参照 CLSI 2010年颁布的标准。
挑取经纯化的菌落以及标准质控菌株,用生理盐水稀释并校正至 0. 5麦氏单位,用无菌棉签蘸取菌液,均匀涂布在 MH琼脂(muller hinton agar)平板表面,用纸片分配器将含药纸片贴在 MH琼脂平板表面,37 ℃培养箱内培养 16 h,用游标卡尺测量抑菌圈直径并记录结果。判断标准参照 CLSI 2010年颁布的标准。药敏纸片选自氧氟沙星、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢他啶、头孢西丁、头孢呋辛、庆大霉素、阿莫西林/克拉维酸、甲氧嘧啶、复方新诺明、萘啶酸、氨苄西林、氯霉素、四环素、链霉素、米卡星、环丙沙星、阿奇霉素、红霉素、诺氟沙星等中的12~14种抗生素。
检测结果:
如图5所示,沙门菌对氧氟沙星、头孢吡肟、庆大霉素、阿莫西林/克拉维酸、头孢他啶、甲氧嘧啶、复方新诺明、氯霉素的敏感程度较高,敏感率均大于85%,对萘啶酸、氨苄西林、氯霉素、四环素呈现不同程度的耐药,尤其以萘啶酸耐药率最高。
如图6所示,志贺菌对氯霉素、氧氟沙星、头孢他啶、头孢吡肟较为敏感,对链霉素、萘啶酸、甲氧嘧啶全部耐药,对氨苄西林、庆大霉素、四环素、复方新诺明耐药也较为严重。
如图7所示,副溶血弧菌对头孢他啶、头孢吡肟、四环素、氯霉素、复方新诺明、头孢噻肟等均较为敏感,对米卡星和环丙沙星较不敏感,对氨苄西林全部耐药。
如图8所示,弯曲菌除了对阿奇霉素、红霉素、氯霉素敏感性较高外,对其他抗生素均有不同程度的耐药,对头孢西丁全部耐药,对萘啶酸、环丙沙星、左氧氟沙星、头孢呋辛、诺氟沙星耐药率均大于90%。
5.3病原溯源研究
对腹泻病例病原检测阳性的病例,开展流行病学调查,并结合监测点附近的危险因素监测对相应病例探明病原致病因子,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术分子生物学技术,开展病原溯源研究。
通过对2011和2012年的腹泻病人、食品中的阳性株,对沙门菌、志贺菌、副溶血弧菌、空肠弯曲菌进行了PFGE分型,结果显示:
(1)2011-2012年副溶血弧菌食品分离株PFGE带型呈现遗传多样性,并且未得到与散发病人分离株相同的PFGE带型,提示这些监测食品与病人分离株间遗传关系较远,可能为自然株系;病人分离株有聚类的带型均出现在当年,提示该区域不同时间段存在不同株系的污染源。
(2)宋内志贺菌病人分离株2012年与2011年有所不同,2012年的菌株呈现遗传多样性,无疑似暴发菌株。
(3)2年里空肠弯曲菌病人分离株中有菌株聚类的带型大都出现在当年,提示一段时间里存在着被这些株系污染的传染源;个别的带型跨年度出现,提示两者遗传关系极其密切。
(4)2年中均在沙门菌食品分离株中得到与散发病人分离株具有相同PFGE带型,提示两者具有相同遗传关系。
(5)沙门菌病人分离株与空肠弯曲菌相同,2年中主要流行带型大都出现在当年,个别带型跨年度出现,提示该区域存在遗传谱系紧密相关的流行克隆系。
具体结果如下:
副溶血弧菌
如图9和图10所示,食品分离株中15株菌株共得到14个PFGE带型,呈现遗传多样性,并且未与散发病人或食物中毒分离株具有相同PFGE带型。来自相同监测点的同一带型可能来源于同一污染源,但未得到相同带型的病人分离株,且与最相近的病人分离株相似性系数为80.6%,提示这些监测食品与病人分离株遗传关系较远。
病人分离株的可分型的49株菌株中,共得到29个PFGE型别,相似性系数为56.6%,有5个带型中含有2株或以上菌株,其余带型中均只有1株。有病人出现在相同时间、相同或不同监测点,提示感染来源来自于同一环节的可能。在不同时间、不同或相同监测点持续出现的株系,提示这一段时间内持续存在被该株系污染的传染源,因实验室检测的时间与病例发病时间相隔超过半年,无法通过流行病学调查进行证实。
宋内志贺菌
如图11所示,PFGE可分型菌株为19株,共得到15个带型,其中3个带型内有2株或以上分离株聚类,分其余12个带型内各只有1株分离株。无优势带型,各带型总的相似性系数为84.1%。同一带型内采自不同地点的2株菌株,提示感染来源来自于同一环节的可能,但因实验室检测的时间与病例发病时间相隔超过半年,无法通过流行病学调查进行证实。
沙门菌
如图12、图13a~13c以及图14所示,食品分离株中14株菌株共得到14个PFGE带型,菌株间相似性系数为36.4%,呈现遗传多样性,有3株来自东明送检的食品分离株与散发病人分离株具有相同PFGE带型。上述病例的腹泻是否由这些食品引起需要进行流行病学调查加以证实,可惜因实验室检测的时间与病例发病时间相隔超过半年,无法通过流行病学调查得到证实。
病人分离株可分型的117株菌株中共得到89个PFGE型,其中15个带型内有2株或以上菌株的聚类,其余各型内均只有1株菌株。有病人出现在相同时间、相同或不同监测点,提示感染来源来自于同一环节或食品的可能,但因实验室检测的时间与病例发病时间相隔超过半年,无法通过流行病学调查进行证实。
空肠弯曲菌
如图15所示,共得到62株病人分离株,其中PFGE可分型菌株为57株,共得到49个PFGE型别,相似性系数为17.1%,有6个带型中含有2株或以上菌株,其余带型中均只有1株菌株,其中出现在相同时间、相同监测点的病人,提示提示感染来源来自于同一环节或食品的可能,但因实验室检测的时间与病例发病时间相隔超过半年,无法通过流行病学调查进行证实。
5.4数据输入与分析。
将病例信息和检测结果输入监测数据库,然后使用 Excel 2007进行数据汇总和基本分析,使用 SPSS 17. 0软件对数据进行统计分析,检验水准 α = 0. 05。
6. 通过腹泻病监测数据库进行腹泻病综合监测数据相关性分析。
分析症状监测、病例监测、危险因素监测、聚集性事件监测和病原谱监测结果,各监测数据之间呈现一定的关联性。
6.1 腹泻病症状监测数与法定肠道传染病发病数
如图16所示,对2011年1月-2013年6月各月份腹泻病症状监测数与具有腹泻症状法定肠道传染病发病人数进行相关性分析,二者呈现正相关(r=0.69),且相关系数显著性检验P<0.01。
6.2细菌谱阳性率与病毒谱阳性率
如图17所示,将2011年7月-2013年6月各月份腹泻病监测样品细菌学阳性率与病毒学阳性率进行相关性分析,二者呈现负相关(r=-0.67),且相关系数显著性检验p<0.01。
6.3 任一病原阳性率与腹泻病症状人数、法定肠道传染病发病数
将2011年7月-2013年6月各月份腹泻病监测样品任一病原阳性率与腹泻病症状人数、法定肠道传染病发病数进行相关性分析,未发现相关性。
6.4食品沙门菌检测阳性率与细菌谱阳性率、法定肠道传染病发病数
将2011年1月-2013年6月食品沙门菌检测阳性率与人群细菌谱阳性率、法定肠道传染病发病数进行相关性分析,未发现相关性。
通过系统和持续地收集食源性疾病、食品污染以及食品中有害因素的监测数据及相关信息,对腹泻病发病趋势做出预测。由于涉及两个系统的数据,需要完整、连续、代表性较高的数据支撑才能将食品安全风险监测数据与腹泻病监测相结合。
本发明提供的腹泻病综合监测平台,建立了以腹泻病例监测、症状监测、病原谱监测和危险因素监测为主的综合监测平台,采用现场流行病学、实验流行病学、分子生物学等技术,分析了腹泻病的症候群、病例和病原的流行病学特征,开展了腹泻主要病原体的基因分型和病源溯源,建立了腹泻病细菌学PFGE分子分型操作技术规程, 并能够对腹泻病发病趋势做出综合预测,为制定腹泻病防控措施提供了科学依据。
尽管本发明的内容已经通过上述优选实施例作了详细介绍,但应当认识到上述的描述不应被认为是对本发明的限制。在本领域技术人员阅读了上述内容后,对于本发明的多种修改和替代都将是显而易见的。因此,本发明的保护范围应由所附的权利要求来限定。
Claims (9)
1.一种腹泻病综合监测平台,其特征在于,该监测平台包含腹泻病监测数据库和监测点选择模块,以及向所述的腹泻病监测数据库传送数据的腹泻症状信息采集模块、腹泻传染病例信息采集模块、腹泻聚集性疫情信息采集模块、腹泻病原谱与耐药性信息采集模块以及腹泻危险因素信息采集模块;
所述的监测点选择模块在数据源中采用异质区域均值估计模型选取监测点;
所述的腹泻症状信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人的症状信息;
所述的腹泻传染病例信息采集模块在监测点进行监测并采集腹泻病人法定传染病例信息;
所述的腹泻聚集性疫情信息采集模块在监测点所在区域进行监测并采集聚集性疫情信息;
所述的腹泻病原谱与耐药性信息采集模块在各监测点采集通过腹泻病人采样标本进行的细菌和病毒检测结果的信息,和检测所得的阳性病原菌进行抗生素的药敏检测的信息,以及对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源的信息;
所述的腹泻危险因素信息采集模块在监测点所在区域进行监测,并采集通过对危险因素监测进行标本检测所得的信息。
2.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的数据源是指不同医疗机构的肠道门诊。
3.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的腹泻病人是指凡24小时内大便次数大于或等于3次,且大便性状有改变的门诊病例。
4.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的腹泻症状信息采集模块采集的信息包含患者的症状、抗生素使用情况,以及性别、年龄和职业。
5.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的法定传染病例为包含霍乱、0157:H7、细菌性痢疾、伤寒副伤寒的感染性腹泻病例。
6.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的集聚集性疫情为各监测点对发现的1周内包含学校、幼儿园、自然村寨、社区或建筑工地的同一集体单位中发生10例及以上腹泻病病例,或死亡1例及以上的疫情。
7.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的对腹泻病例病原检测阳性的病例进行病原溯源,通过脉冲场凝胶电泳技术进行。
8.如权利要求1所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的危险因素监测包含对饮水和食品微生物污染的监测。
9.如权利要求8所述的腹泻病综合监测平台,其特征在于,所述的对饮水和食品微生物污染的监测,是指每月采集食品和水样标本,进行病原菌检测。
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