CN103414904A - 医学大容量dicom动态影像数据压缩存储方法 - Google Patents

医学大容量dicom动态影像数据压缩存储方法 Download PDF

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吴小朋
汤光宇
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Abstract

本发明公开了一种医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,包括以下步骤:读取DICOM影像服务器中指定文件夹中没有压缩的DICOM动态影像的文件头信息后修改传输语法信息标签并保存到一个临时DICOM文件中;读取没有压缩的DICOM动态影像中的每个帧的图像数据,根据设定的压缩比每帧保存为一个JPEG图像文件并按照循序保存到临时目录中;打开保存的临时DICOM文件,按照循序读取各个JPEG文件并写入到该临时DICOM中作为压缩的DICOM影像进行保存,再拷贝该文件到DICOM影像服务器中指定的文件夹中存储。该方法对PACS系统中DICOM影像服务器上存储的没有压缩的大容量动态DICOM影像,实现了无视觉损失的JPEG有损压缩后再存储,减少了影像的储存空间和存储费用,解决了传输与存储过程中效率很低的问题,提高了医生的诊断工作效率。

Description

医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法
技术领域
本发明属于医学DICOM动态影像技术领域,具体的说是涉及一种医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法。
背景技术
近年来,随着医学影像技术的发展,在心血管疾病诊疗中,血管内超声(intravenous ultrasound,简称IVUS)和光学相干断层成像(Optical Coherence Tomography,简称OCT)等已经是不可缺少的诊断设备。从IVUS和OCT设备中得到的包括患者信息等附加信息的数字影像和通信标准(DigitalImaging and Communications in Medicine,简称DICOM)图像,被发送到影像归档和通信系统(Picture Archiving andCommunication Systems,简称PACS)中进程存储和管理,在心血管疾病诊疗中已经得到了广泛的应用。
在PACS系统中,IVUS和OCT设备得到的是动态DICOM影像,通过和DICOM影像服务器的通信,将动态DICOM图像发送到DICOM影像服务器存储和管理,而IVUS和OCT设备得到的动态影像,一般都是数千帧的DICOM图像文件,如果不做压缩处理,一个图像文件有1GB以上的数据量。而目前,有的IVUS和OCT设备不能输出压缩的DICOM动态影像,只能把不压缩的原始的大容量DICOM动态影像发送到PACS系统的DICOM影像服务器,由影像服务器对动态DICOM影像做无视觉损失JPEG(Joint Photographic Experts Group)有损压缩后保存。然而很多PACS系统的DICOM影像服务器,使用美国MergeHealthcare公司的图像开发工具包(Merge DICOM Toolkit)或是美国Lead Technology公司的图像开发工具包(LeadToo1)等作为开发平台所开发,受这些开发平台可以打开动态DICOM影像最大内存的限制,只能对小容量的DICOM动态影像做压缩处理,不具备对接受到的大容量DICOM动态影像的再压缩存储保存功能。这样存储到DICOM影像服务器的动态DICOM影像,会发生图像占用存储量大、在传输与存储过程中效率很低等问题,直接影响医生的诊断工作效率。
发明内容
为了克服上述缺陷,本发明提供了一种医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,能够减少图像的储存空间和存储费用,解决图像传输和存储过程中效率很低的问题,提高医生的诊断工作效率。
本发明为了解决其技术问题所采用的技术方案是:一种医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,包括以下步骤:
A1、读取DICOM影像服务器中指定文件夹中没有压缩的DICOM动态影像的文件头信息后修改传输语法信息标签并保存到一个临时DICOM文件中;
A2、读取没有压缩的DICOM动态影像中的每个帧的图像数据,根据设定的压缩比每帧保存为一个JPEG文件并按照循序保存到临时目录中;
A3、打开保存的临时DICOM文件,按照循序读取各个JPEG文件并写入到该临时DICOM文件中作为压缩的DICOM影像文件进行保存,再拷贝该DICOM影像文件到DICOM影像服务器中指定的文件夹中存储。
作为本发明的进一步改进,在所述步骤A1中,自动检查DICOM影像中传输语法标签Tag(0002,0010),
①如果是1.2.840.10008.1.2.1(Explicit VR LittleEndian),则修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
②如果是1.2.840.10008.1.2.2(Explicit VR BigEndian),则修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为l.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
③如果是1.2.840.10008.1.2(Implicit VR LittleEndian),则修改DICOM文件中数据元素的类型表示VR为显式类型并修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为l.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
④如果上述三种均不是则退出。
作为本发明的进一步改进,所述步骤A2中,按帧的循序读取动态DICOM图像中各帧图像后按照指定的压缩比压缩为JPEG数据后保存为JPEG图像文件。
作为本发明的进一步改进,所述步骤A3中,打开保存的临时DICOM文件后,按照循序一个一个地读取JPEG图像文件后写入到该临时DICOM文件中,最后把该临时DICOM文件保存到PACS系统中DICOM影像服务器指定的路径中存储。
本发明的有益效果是:该医学大容量DICOM动态影像压缩存储方法,对PACS系统中DICOM影像服务器上存储的没有压缩的大容量动态DICOM影像,实现了无视觉损失的JPEG有损压缩后再存储,减少了影像的储存空间和存储费用,并且解决了传输与存储过程中效率很低的问题,从而提高医生的诊断工作效率。
附图说明
图1为本发明实施例的工作流程图。
具体实施方式
结合附图,对本发明作详细说明,但本发明的保护范围不限于下述实施例,即但凡以本发明申请专利范围及说明书内容所作的简单的等效变化与修饰,皆仍属本发明专利涵盖范围之内。
DICOM文件由多个数据集组成。数据集表现了现实世界信息对象的相关属性,比如患者名字,性别等。数据集由数据元素组成,每个数据元素有4个部分组成:标签(Tag)、值表示类型(Value Representat ion,VR)、值长度(Value Length)、值域(Value Field),数据元素有3种结构,其中2种具有类型表示VR(由传输语法来决定)。
如图1所示,为本发明医学大容量DICOM动态影像压缩存储方法流程示意图,包括如下步骤:
S100:读取DICOM影像服务器中指定文件夹中没有压缩的DICOM动态影像的文件头信息后修改传输语法信息标签并保存到一个临时DICOM文件中;
S200:读取没有压缩的DICOM动态影像中的每个帧的图像数据,根据设定的压缩比每帧保存为一个JPEG文件按照循序保存到临时目录中;
S300:打开保存的临时DICOM文件,按照循序读取各个JPEG文件并写入到该临时DICOM中并作为压缩的DICOM影像文件保存后,拷贝该DICOM影像文件到DICOM影像服务器中指定的文件夹中存储。
PACS影像服务器接受到来自IVUS或是OCT诊断设备发送来的DICOM动态影像后,在指定的路径中保存。
在上述Si00中,根据保存到PACS影像服务器上的非压缩的DICOM大容量动态影像的路径,找到要压缩处理的DICOM目标图像文件后,打开该DICOM图像文件,读取DICOM图像文件的文件头信息到内存中,根据DICOM3.0标准,从内存中查找传输语法标签Tag(0002,0010),判定该标签值是不是1.2.840.10008.1.2.1(Explicit VR Little Endian)、或是1.2.840.10008.1.2.2(Explicit VR Big Endian),若是,则修改传输语法标签Tag(0002,0010)为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1));判定该标签值是不是1.2.840.10008.1.2(Implicit VR LittleEndian),如果是,把内存中的DICOM头信息的数据元素全部改为具有类型表示VR的格式并修改传输语法标签Tag(0002,0010)为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1))。如果标签Tag(0002,0010)是上述3类传输语法,则把内存中的头信息保存为临时DICOM文件,然后执行S200。若不是则结束。
在S200中,为了保存每个帧的JPEG图像,首先创建一个临时目录。然后打开要压缩的目标DICOM图像,根据DICOM动态影像中的图像帧数标签Tag(0028,0008)得到帧数,然后读取每一帧的图像数据到内存后,根据在PACS服务器上的参数设定INI(Initialization File,简称INI)文件中设定的JPEG图像的压缩比做JPEG压缩后按照帧循序保存为一个一个的JPEG文件到临时目录。
在S300中,打开保存的临时DICOM文件后,按照循序以单个文件为单位读取临时目录中保存的JPEG文件到内存后写入临时DICOM文件中,全部的JPEG文件写入DICOM临时文件结束后保存为压缩DICOM动态影像文件,再拷贝该压缩DICOM动态影像文件到DICOM影像服务器中指定的文件夹中存储;最后删除临时目录中的全部的JPEG图像文件和临时目录。

Claims (4)

1.一种医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,其特征在于,包括以下步骤:
A1、读取DICOM影像服务器中指定文件夹中没有压缩的DICOM动态影像的文件头信息后修改传输语法信息标签并保存到一个临时DICOM文件中;
A2、读取没有压缩的DICOM动态影像中的每个帧的图像数据,根据设定的压缩比每帧保存为一个JPEG文件并按照循序保存到临时目录中;
A3、打开保存的临时DICOM文件,按照循序读取各个JPEG文件并写入到该临时DICOM文件中作为压缩的DICOM影像文件进行保存,再拷贝该DICOM影像文件到DICOM影像服务器中指定的文件夹中存储。
2.根据权利所述要求1所述的医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,其特征在于,在所述步骤A1中,自动检查DICOM影像中传输语法标签Tag(0002,0010),
①如果是1.2.840.10008.1.2.1(Explicit VR LittleEndian),则修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
②如果是1.2.840.10008.1.2.2(Explicit VR BigEndian),则修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
③如果是1.2.840.10008.1.2(Implicit VR LittleEndian),则修改DICOM文件中数据元素的类型表示VR为显式类型并修改传输语法标签Tag(0002,0010)值为1.2.840.10008.1.2.4.50(JPEG Baseline(Process1)),然后执行步骤A2;
④如果上述三种均不是则退出。
3.根据权利所述要求1或2所述的医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,其特征在于,所述步骤A2中,按帧的循序读取动态DICOM图像中各帧图像后按照指定的压缩比压缩为JPEG数据后保存为JPEG图像文件。
4.根据权利所述要求1或2所述的医学大容量DICOM动态影像数据压缩存储方法,其特征在于,所述步骤A3中,打开保存的临时DICOM文件后,按照循序一个一个地读取JPEG图像文件后写入到该临时DICOM文件中,最后把该临时DICOM文件保存到PACS系统中DICOM影像服务器指定的路径中存储。
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