发明内容
本发明克服现有技术的一些局限,提供用于安全或有效治疗肿瘤、病毒感染和涉及CCR4+细胞的其它疾病和状况(如炎症或免疫紊乱)的新的治疗组合物和方法。本发明基于结合CCR4的抗体,更具体地结合CCR4的胞外域内的表位的抗体,更具体地是人抗体。这样的抗体有效治疗肿瘤和病毒感染和涉及CCR4+细胞的其它疾病和状况,如炎症或免疫紊乱。本发明的组合物和方法同样扩展至使用该具体种类抗体的免疫交联物和组合物的应用。
本发明的一种具体的优势是提供的抗体能够抑制MDC和/或TARC与CCR4结合。这与临床领域的主要抗体形成对比,这些主要抗体不抑制MDC和/或TARC与CCR4结合。
本申请发明人已经制备了结合CCR4的CCR4特异抗体。例如,结合CCR4+细胞的抗体,具体地,所述CCR4+细胞是转染CCR4的HEK293T细胞、转染CCR4的DT40细胞和天然表达CCR4的CCRF-CEM细胞(见实施例2)。重要地,所述抗体不明显地结合CCR4-细胞,即不表达CCR4的细胞。因此,本发明公开的抗体特异地结合CCR4,使它们成为诊断和治疗本文讨论的状况的合适候选物。
与CCR4的胞外域中的表位、包括互补决定区(CDR)的它们的VH和VL域结合的本发明的优选抗体分子的氨基酸和/或DNA序列在本文列出的多个SEQ ID NO.中展示。
因此,本发明提供一种与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体。
优选地,所述抗体是分离抗体。同样优选地,所述抗体是人抗体。优选地,所述抗体结合CCR4的胞外域中的表位。所述CCR4优选是人CCR4。因此,任何涉及“结合CCR4”包括“结合CCR4的胞外域中的表位”的优选实施方式。
因此,本发明优选地提供一种分离的人抗体,所述人抗体结合人CCR4的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4结合。
在一种实施方式中,本发明提供一种与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体,所述抗体包括重链CDR1域,所述重链CDR1域包含SEQ ID NO:1、7、19、101、125、126、135或136的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQ ID NO:101、125、126、135和136。
可选地或另外地,在本发明的一种实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括重链CDR2域,所述重链CDR2域包含SEQ ID NO:2、8、20、127或128的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQ ID NO:8、127和128。
可选地或另外地,在本发明的一种实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括重链CDR3域,所述重链CDR3域包含SEQ ID NO:3、9、15或21的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQ ID NO:9。
可选地或另外地,在本发明的一种实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括轻链CDR1域,所述轻链CDR1域包含SEQ ID NO:4、10、16、22、108、129或130的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQID NO:10、129或130。
可选地或另外地,在本发明的一种实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括轻链CDR2域,所述轻链CDR2域包含SEQ ID NO:5、11、17、23、110、131或132的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQID NO:11、131和132。
可选地或另外地,在本发明的一种实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括轻链CDR3域,所述轻链CDR3域包含SEQ ID NO:6、12、18、24、112、133、134、137或138的氨基酸序列或与这些序列中任何一条基本同源的序列,其中特别优选的是SEQ ID NO:12、133、134、137和138。
SEQ ID NO:133和134在位点11包含氨基酸Y,但是优选地,这些序列中位点11的氨基酸是V。SEQ ID NO:137和138对应于SEQ ID NO:133和134,除了位点11的氨基酸是V。因此,在本文公开的任何实施方式中,任何提及SEQ ID NO:133应当被理解为包含提及SEQID NO:137,任何提及SEQ ID NO:134应当被理解为包含提及SEQ ID NO:138。
因此,在一些实施方式中,本发明提供一种与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体,所述抗体包括一个或多个重链CDR域,其中所述重链CDR域选自:
(a)包含SEQ ID NO:1、7、19、101、125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域;
(b)包含SEQ ID NO:2、8、20、127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域;
(c)包含SEQ ID NO:3、9、15或21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域。
在一些实施方式中,本发明还提供一种与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体,所述抗体包括一个或多个轻链CDR域,其中所述轻链CDR域选自:
(a)包含SEQ ID NO:4、10、16、22、108、129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域;
(b)包含SEQ ID NO:5、11、17、23、110、131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域;
(c)包含SEQ ID NO:6、12、18、24、112、133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也提供:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ IDNO:4的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:5的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也存在:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ IDNO:10的氨基酸序列或与其基本同源的序列,和/或SEQ ID NO:101的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:11的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也存在:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ IDNO:16的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:17的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也存在:包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQID NO:22的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:23的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:112的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也存在:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ IDNO:108的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:110的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一些优选的实施方式中,与CCR4结合并能够抑制MDC与CCR4结合的抗体包括:
(a)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域;和(b)包含SEQ ID NO:133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
更优选地,也存在:包含SEQ ID NO:125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR1域,和/或包含SEQID NO:127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列和/或SEQ ID NO:131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的CDR2域。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:101的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:108的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:110的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:112的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
在一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1、包含SEQ ID NO:127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2和包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3。
在另一种优选的实施方式中,单独或组合地提供:包含SEQ ID NO:129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1、包含SEQ ID NO:131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2和包含SEQ ID NO:133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3。
换一种方式看,在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:112的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:110的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:7或101的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:108的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
换一种方式看,在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:8、127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:11、131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:12、133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:7、101、125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:10、129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:110的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:112的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:108的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
换一种方式看,在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
换一种方式看,在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:6的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:7、125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:10、129或130的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:12、133、134、137或138的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:8、127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:11、131或132的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
换一种方式看,在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:101的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:12的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:11的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:108的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:112的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:110的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
在一些实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR1域和/或包含SEQ ID NO:22的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR1域。
所述抗体可选地进一步包括:包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR3域和/或包含SEQ ID NO:24的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR3域和/或进一步包括:包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列的重链CDR2域和/或包含SEQ ID NO:23的氨基酸序列或与其基本同源的序列的轻链CDR2域。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:1、2、3、4、5和6或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:7、8、9、10、11和12或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:101、8、9、10、11和12或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:7、8、9、108、110和112或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:1、2、15、16、17和18或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:19、20、21、22、23或24或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:125、127、9、129、131或133(137)或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括一个或多个选自SEQ ID NO:126、128、9、130、132或134(138)或与上述SEQ ID NO中任意一条基本同源的序列的CDR。
本发明的一些优选抗体包括两个或更多个选自SEQ ID NO:4、5和6,或10、11和12,或16、17和18,或22、23和24,或108、110和112,或129、131和133(137),或130、132和134(138),或与任意一条上述SEQ ID NO基本同源的序列的轻链CDR。
特别优选的结合分子包括三个轻链CDR,所述三个轻链CDR为SEQ ID NO:4、5和6,或10、11和12,或16、17和18,或22、23和24,或108、110和112,或129、131和133(137),或130、132和134(138),或与任意一条上述SEQ ID NO(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
其它一些优选抗体包括两个或更多个重链CDR,所述重链CDR选自SEQ ID NO:1、2和3,或7、8和9,或1、2和15,或19、20和21,或101、8和9,或125和127和9,或126和128和9,或与任意一条上述SEQ ID NO基本同源的序列。
特别优选的抗体包括三个重链CDR,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:1、2和3,或7、8和9,或1、2和15,或19、20和21,或101、8和9,或125和127和9,或126和128和9,或与任意一条上述SEQ ID NO(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
在一些实施方式中,特别优选的是SEQ ID NO:1的重链CDR1与SEQ ID NO:2的重链CDR2的组合。
在一些实施方式中,特别优选的是SEQ ID NO:9的重链CDR3与SEQ ID NO:8的重链CDR2和/或SEQ ID NO:7或101的重链CDR1的组合。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:4、5和6或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:1、2和3或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:10、11和12或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:7、8和9或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:10、11和12或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:101、8和9或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:108、110和112或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ IDNO:7、8和9或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:16、17和18或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:1、2和15或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:22、23和24或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ IDNO:19、20和21或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些更特别优选的抗体包括三个轻链CDR和三个重链CDR,所述三个轻链CDR是:SEQID NO:129、131和133(137)或与这些序列中任何一条(即,上述轻链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列,所述三个重链CDR是:SEQ ID NO:125、127和9或与这些序列中任何一条(即,上述重链CDR1和CDR2和CDR3或与其基本同源的序列的每一种中的一个)基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:1的重链CDR1域、SEQ ID NO:2的重链CDR2域和SEQ ID NO:3的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:4的轻链CDR1域、SEQ ID NO:5的轻链CDR2域和SEQ ID NO:6的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:7或101的重链CDR1域、SEQ ID NO:8的重链CDR2域和SEQ ID NO:9的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:10的轻链CDR1域、SEQ ID NO:11的轻链CDR2域和SEQ IDNO:12的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:7的重链CDR1域、SEQ ID NO:8的重链CDR2域和SEQ ID NO:9的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:108的轻链CDR1域、SEQ ID NO:110的轻链CDR2域和SEQ ID NO:112的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:1的重链CDR1域、SEQ ID NO:2的重链CDR2域和SEQ ID NO:15的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:16的轻链CDR1域、SEQ ID NO:17的轻链CDR2域和SEQ ID NO:18的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:19的重链CDR1域、SEQ ID NO:20的重链CDR2域和SEQ ID NO:21的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:22的轻链CDR1域、SEQ ID NO:23的轻链CDR2域和SEQ ID NO:24的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
一些特别优选的抗体包括SEQ ID NO:125、126、135或136的重链CDR1域、SEQ ID NO:127或128的重链CDR2域和SEQ ID NO:9的重链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列;和/或包括SEQ ID NO:129或130的轻链CDR1域、SEQ ID NO:131或132的轻链CDR2域和SEQ ID NO:133(137)或134(138)的轻链CDR3域,或所述序列是与上述序列中任何一条基本同源的序列。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:3或15的氨基酸序列的VH CDR3。
在该实施方式的一种优选的方面,一个或多个所述轻链可变区CDR选自:
(i)具有SEQ ID NO:4或16的氨基酸序列的VL CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:5或17的氨基酸序列的VL CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:6或18的氨基酸序列的VL CDR3。
优选地,两个或三个所述轻链可变区CDR选自上面的组。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:7或101的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VH CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3。
在该实施方式的一种优选的方面,一个或多个所述轻链可变区CDR选自:
(i)具有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的VL CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:11的氨基酸序列的VL CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VL CDR3。
优选地,两个或三个所述轻链可变区CDR选自上面的组。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:7的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VH CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3。
在该实施方式的一种优选的方面,一个或多个所述轻链可变区CDR选自:
(i)具有SEQ ID NO:108的氨基酸序列的VL CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:110的氨基酸序列的VL CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:112的氨基酸序列的VL CDR3。
优选地,两个或三个所述轻链可变区CDR选自上面的组。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:19的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VH CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3。
在该实施方式的一种优选的方面,一个或多个所述轻链可变区CDR选自:
(i)具有SEQ ID NO:22的氨基酸序列的VL CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:23的氨基酸序列的VL CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:24的氨基酸序列的VL CDR3。
优选地,两个或三个所述轻链可变区CDR选自上面的组。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:125、126、135或136的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:127或128的氨基酸序列的VH CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3。
在该实施方式的一种优选的方面,一个或多个所述轻链可变区CDR选自:
(i)具有SEQ ID NO:129或130的氨基酸序列的VL CDR1,
(ii)具有SEQ ID NO:131或132的氨基酸序列的VL CDR2,和
(iii)具有SEQ ID NO:133(137)或134(138)的氨基酸序列的VL CDR3。
优选地,两个或三个所述轻链可变区CDR选自上面的组。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:1、2或3或与SEQ ID NO:1、2或3中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:4、5或6或与SEQ ID NO:4、5或6中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:7、8、9或101或与SEQ IDNO:7、8、9或101中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:10、11或12或与SEQ ID NO:10、11或12中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:7、8或9或与SEQ ID NO:7、8或9中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:108、110或112或与SEQ ID NO:108、110或112中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:1、2或15或与SEQ ID NO:1、2或15中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:16、17或18或与SEQ ID NO:16、17或18中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:19、20或21或与SEQ ID NO:19、20或21中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:22、23或24或与SEQ ID NO:22、23或24中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的一些更加优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含一个、两个或三个重链CDR的VH域和/或包含一个、两个或三个轻链CDR的VL域,其中所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:125、127或9或与SEQ IDNO:125、127或9中的一个或多个基本同源的序列,所述轻链CDR的序列是SEQ ID NO:129、131或133(137)或与SEQ ID NO:129、131或(137)中的一个或多个基本同源的序列。
本发明的更特别优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含三个轻链CDR的VL域和包含三个重链CDR的VH域,所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:1、2和3或15。在优选的实施方式中,一个、两个或三个轻链CDR如在SEQ ID NO:4、5和6,或16、17和18中所定义的。
本发明的更特别优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含三个轻链CDR的VL域和包含三个重链CDR的VH域,所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:8、9和7或101。在优选的实施方式中,一个、两个或三个轻链CDR如在SEQ ID NO:10、11和12,或108、110和112中所定义的。
本发明的更特别优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括:包含三个轻链CDR的VL域和包含三个重链CDR的VH域,所述重链CDR的序列是SEQ ID NO:125、127和9。在优选的实施方式中,一个、两个或三个轻链CDR如在SEQ ID NO:129、131和133(137)中所定义的。
在本文描述的本发明所有实施方式中,存在于氨基酸序列中的X表示可变氨基酸。因此,当序列包含多于一个X时,每一个X都可以是不同的,但一个或多个X也可以是相同的。优选地,SEQ ID NO:125的位置1的X=S或N,和/或SEQ ID NO:125的位置4的X=I或M,和/或SEQ ID NO:127的位置1的X=G或A,和/或SEQ ID NO:127的位置3的X=I或S,和/或SEQ ID NO:127的位置5的X=I或S,和/或SEQ ID NO:127的位置6的X=F或G,和/或SEQ ID NO:127的位置8的X=T或S,和/或SEQ ID NO:127的位置9的X是A或T,和/或SEQ ID NO:129的位置3的X=S或G,和/或SEQ ID NO:129的位置4的X=T或G,和/或SEQ ID NO:129的位置9的X=S或R,和/或SEQ ID NO:129的位置10的X=R或H,和/或SEQ ID NO:129的位置11的X=Y或F,和/或SEQ ID NO:129的位置13的X=Y或F,和/或SEQ ID NO:131的位置3的X=H或N,和/或SEQ ID NO:133或137的位置2的X=A或V,和/或SEQ ID NO:133或137的位置6的X=S或T。
SEQ ID NO:125的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:126,SEQ ID NO:127的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:128,SEQ ID NO:129的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:130,SEQ ID NO:131的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:132,以及SEQ ID NO:133的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:134。
SEQ ID NO:125和/或SEQ ID NO:126的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:135,更优选地是SEQ ID NO:136。SEQ ID NO:133的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:137或SEQ IDNO:138。SEQ ID NO:134的一种优选的实施方式是SEQ ID NO:138。
优选的实施方式是存在SEQ ID NO:125的重链CDR1。同样优选的实施方式是存在SEQID NO:101的重链CDR1。因此,所述重链CDR1优选地以氨基酸S(丝氨酸)起始。
本发明的一些优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:139、69、71、73、75或105的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:140、70、72、74、76或115的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。优选地,所述VH和/或VL域具有至少1、2、3、4或5个,如6个本文公开的CDR序列。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:139、69、71、73、75或105的氨基酸序列的VH域和包含三个轻链CDR的VL域。优选地,所述轻链CDR具有SEQ ID NO:4、5和6,或10、11和12,或16、17和18,或22、23和24,或108、110和112,或129、131和133(137),或130、132和134(138)。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:69的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:70的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:71的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:72的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:71的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:115的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:105的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:72的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:73的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:74的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:75的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:76的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
更优选的实施方式提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包括具有SEQ ID NO:139的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH域和/或具有SEQ ID NO:140的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VL域。
在另一种实施方式中,本发明提供一种结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的抗体,所述抗体包含氨基酸序列:SEQ ID NO:35(所述抗体在本文中也被指定为17G scFv)、SEQ IDNO:46(所述抗体在本文中也被指定为9E scFv)、SEQ ID NO:104(所述抗体在本文中也被指定为9E10J scFv)、SEQ ID NO:114(所述抗体在本文中也被指定为9E1D scFv)、SEQ ID NO:57(所述抗体在本文中也被指定为1O scFv)或SEQ ID NO:68(所述抗体在本文中也被指定为11F scFv),或者包括结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4的任何抗体的片段,或与任意一条上述序列基本同源的序列。
本发明由单克隆抗体17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D举例说明,它们的单链形式在表1、2、3、4、11和12中显示(分别是SEQ ID NO:35、46、57、68、103和114)。已经获得了全长IgG形式的抗体17G、9E、1O和11F,且它们的序列分别在表5、6、7和8中显示。17G、9E、11F和1O抗体的CDR域、VH和VL域在表1-4和图1-4中显示,9E10J和9E1D抗体的CDR域、VH和VL域在表11和12中显示。已经获得了全长IgG形式的抗体9E10J和9E1D,它们的序列在表13和14中显示。表23列出了共同序列。本发明的优选方面是包含这些CDR域或VH和VL域(或与其基本一样的序列)的抗体。
本发明的一种优选实施方式是scFv形式的17G抗体,包含SEQ ID NO:35或由SEQ IDNO:35组成,其优选地由SEQ ID NO:34编码。更优选地,所述抗体包含图1所示的氨基酸序列或由图1所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图1所示的核酸序列编码。
本发明的另一种优选实施方式是scFv形式的9E抗体,包含SEQ ID NO:46或由SEQ IDNO:46组成,其优选地由SEQ ID NO:45编码。更优选地,所述抗体包含图2所示的氨基酸序列或由图2所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图2所示的核酸序列编码。
本发明的另一种优选实施方式是scFv形式的9E10J抗体,包含SEQ ID NO:104或由SEQID NO:104组成,其优选地由SEQ ID NO:103编码。更优选地,所述抗体包含图27所示的氨基酸序列或由图27所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图27所示的核酸序列编码。
本发明的另一种优选实施方式是scFv形式的9E1D抗体,包含SEQ ID NO:114或由SEQID NO:114组成,其优选地由SEQ ID NO:113编码。更优选地,所述抗体包含图28所示的氨基酸序列或由图28所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图28所示的核酸序列编码。
本发明的另一种优选实施方式是scFv形式的1O抗体,包含SEQ ID NO:57或由SEQ IDNO:57组成,其优选地由SEQ ID NO:56编码。更优选地,所述抗体包含图3所示的氨基酸序列或由图3所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图3所示的核酸序列编码。
本发明的另一种优选实施方式是scFv形式的11F抗体,包含SEQ ID NO:68或由SEQ IDNO:68组成,其优选地由SEQ ID NO:67编码。更优选地,所述抗体包含图4所示的氨基酸序列或由图4所示的氨基酸序列组成,且更优选地,该抗体由图4所示的核酸序列编码。
其它优选实施方式是IgG形式的17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D抗体,优选地是全长IgG形式。最优选地是任何这些抗体的IgG1形式。
因此,本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:87(氨基酸)的重链和/或SEQ IDNO:88(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:85编码的重链和/或由SEQ ID NO:86编码的轻链的IgG抗体。应当理解,全长IgG抗体将包括两条基本相同的重链和两条基本相同的轻链。
本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:91(氨基酸)的重链和/或SEQ ID NO:92(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:89编码的重链和/或由SEQ ID NO:90编码的轻链的IgG抗体。
本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:95(氨基酸)的重链和/或SEQ ID NO:96(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:93编码的重链和/或由SEQ ID NO:94编码的轻链的IgG抗体。
本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:99(氨基酸)的重链和/或SEQ ID NO:100(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:97编码的重链和/或由SEQ ID NO:98编码的轻链的IgG抗体。
本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:119(氨基酸)的重链和/或SEQ ID NO:120(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:117编码的重链和/或由SEQ ID NO:118编码的轻链的IgG抗体。
本发明的另一种优选实施方式是包括SEQ ID NO:123(氨基酸)的重链和/或SEQ ID NO:124(氨基酸)的轻链的全长IgG抗体。同样优选的是包括由SEQ ID NO:121编码的重链和/或由SEQ ID NO:122编码的轻链的IgG抗体。
人们相信,本发明的抗体可以与对于已知的抗CCR4抗体家族的不同表位结合,所述抗体家族包括KM2160、KM3060、KM2760和KM-0761。抗体KM2160是一种鼠抗体,由针对CCR4的肽片段产生,且识别存在于人CCR4的N-末端2-29位的氨基酸区域的表位(EP1270595)。KM2760是一种嵌合形式的抗体,具有相同的结合性质(EP1270595)。除了高度岩藻糖化以外,抗体KM3060与KM2760相同(Niwa等2004,Cancer Research 64,2127-2133)。KM-0761是KM2760的人源化形式(Ishida等,Annals of Oncology 2008,19卷,附录4,513)。
已经报导KM2760不阻止CCR4和TARC或MDC的交互作用(Ishida等,2006,CancerResearch 66(11),5716-5722页),这与本发明人在实施例3中展示的使用相当的抗体KM3060var(与KM3060相应,但是潜在地具有不同的糖性质,因为它是在不同的宿主中表达)所得到的发现一致。相反,发现本发明的抗体能够阻止CCR4与MDC的交互作用和CCR4与TARC的交互作用(见实施例3)。这强烈地暗示了本发明的抗体与现有技术的包括KM2160、KM3060、KM2760和KW-0761的家族相比结合不同的表位。
此外,发现抗体17G和9E对结合CCR4彼此竞争,表示它们结合相同、相似或至少重叠的表位。对结合CCR4,这些抗体与KM3060var都不竞争,表明KM3060var结合不同表位。
同样相信,本发明的抗体可以结合与商业可获得的抗CCR4抗体1G1识别的表位不同的表位。BD Pharmingen将该抗体在技术数据表上阐述清楚,该抗体不是中和抗体。相反,本发明的抗体能够阻止MDC和TARC与CCR4结合并抑制MDC或TARC诱导的胞内钙离子的增加。这强烈地暗示本发明的抗体与1G1抗体结合不同的表位。
因此,同样提供对于结合CCR4与本文描述的任何抗体竞争的抗体。
本文使用的术语“竞争抗体”指与“提及抗体”结合大约、基本或实质相同、或完全一样的表位的抗体。“竞争抗体”包括具有重叠表位特异性的抗体。因此竞争抗体能够有效地与提及抗体竞争结合CCR4。优选地,所述竞争抗体能够结合与提及抗体识别的表位相同的表位。换一种方式看,所述竞争抗体优选地具有与提及抗体相同的表位特异性。
本文使用的“提及抗体”是能够结合人CCR4的胞外域中的表位的抗体,所述抗体具有一个或多个本文定义的CDR序列,优选地本文定义的VH和VL域,更优选地SEQ ID NO:130的VH和SEQ ID NO:140的VL,或SEQ ID NO:69的VH和SEQ ID NO:70的VL,或SEQID NO:71的VH和SEQ ID NO:72的VL,或SEQ ID NO:105的VH和SEQ ID NO:72的VL,或SEQ ID NO:71的VH和SEQ ID NO:115的VL,或SEQ ID NO:73的VH和SEQ IDNO:74的VL,或SEQ ID NO:75的VH和SEQ ID NO:76的VL。最优选的提及抗体选自17G、9E、11F、1O、9E10J和9E1D。
既然已经提供了提及抗体如17G、9E、11F、1O、9E10J和9E1D,鉴定一种或多种竞争抗体是一个简单的技术问题。由于竞争抗体的鉴定是通过与提及抗体相比所确定的,应当理解,为了鉴定竞争抗体,任何方式都不需要确定一个或两个抗体结合所的表位。但是,如果需要,可以使用标准技术进行表位作图。
例如,在本文中提及下述用于鉴定和定义表位的方法。CCR4的氨基酸序列是已知的,所以合成肽可以用于表位作图,如使用Pepscan实验。定点突变也是表位作图中的有力工具,且可以用于评价单个氨基酸在免疫复合物形成中的作用。蛋白足迹法依赖于当结合成为抗体-抗原复合体时,表位被保护免于切割的事实。酶联免疫吸附测定(ELISA)和血凝实验和狭缝印迹(slot-blotting)同样可以用于表位作图。抗原与抗体的结晶化可以用于作图非线性表位。实施这些方法的方案是广泛可用的,本领域技术人员将知道表位作图的可选择的方法。
可以使用多种免疫筛选分析的任何一种容易地确定竞争抗体的鉴定,在所述分析中可以测定抗体竞争。所有这些分析在本领域都是常规的并在本文中详细描述。出于包括进一步补充本发明的关于如何鉴定竞争抗体的教导的目的,美国专利6,342,219、6,524,583、7,056,509、6,887,468、6,342,221、6,676,941、6,703,020和6,416,758中的每一篇都通过引用的方式特别结合至本文。本说明书的实施例4公开了一种合适的竞争分析。
例如,当需要检测的测试抗体来自于不同来源的动物,或甚至来自不同的同种型,可以进行简单的竞争分析,其中混合(或预吸附)提及抗体和测试抗体并将它们应用于含有CCR4的组合物,优选地是表达CCR4的细胞、展示CCR4的噬菌体或包含固定的CCR4的生物芯片。基于ELISA的方案特别适合应用于这样的简单竞争研究中。
在一些实施方式中,在应用于抗原组合物之前,实施者可能将提及抗体(如17G、9E、11F、1O、9E10J和9E1D)和不同量的测试抗体(如,1∶10、1∶100或1∶1000)预混合一段时间。在其它实施方式中,可以在应用于抗原组合物过程中简单地混合所述提及抗体和不同量的测试抗体。无论如何,通过使用核素或同种型二级抗体,实施者将能够探测仅结合的提及抗体,它的结合将由于“竞争”结合的测试抗体的存在而减少。
为进行提及抗体和任何测试抗体(无论种类或同种型)之间的抗体竞争研究,实施者可以首先用可探测的标记物如生物素或酶标记物或放射性标记物标记提及抗体(如17G、9E、11F、1O、9E10J和9E1D)以能够进行后续鉴定。在这些情况中,实施者可以以不同的比例(如1∶10、1∶100或1∶1000)预混合或孵育标记的待检测的提及抗体和测试抗体,(可选地在合适的时间之后)然后分析标记的提及抗体的反应性并将其与孵育物中无潜在的竞争测试抗体的对照值进行比较。
所述分析可以是基于抗体结合的免疫学分析的范围内的任何一种,且可以通过探测它们的标记物的方式来探测提及抗体,所述探测标记物的方式如:在生物素化的抗体的情况下使用链亲和素或通过使用与酶标记物连接的发色底物(如过氧化物酶的3,3′5,5′-四甲基联苯胺(TMB)底物)或通过简单地探测放射性标记物。如通过结合的标记物的减少所证明的,与提及抗体竞争结合CCR4的抗体将能够有效地或明显地减少提及抗体结合CCR4。
当不存在完全不相关的抗体时,所述(标记的)提及抗体的反应性将是对照的高值。对照的低值将通过孵育标记的提及抗体(如17G、9E、11F、1O、9E10J或9E1D)和完全相同类型的未标记的抗体而获得,此时将发生竞争并减少标记抗体的结合。在测试分析中,在存在测试抗体时,标记抗体的反应性的明显较少预示着与标记抗体“竞争”结合CCR4的测试抗体。
有效减少是“可重复的”,即持续观察到的结合减少。依照本申请的“有效减少”被定义为在大约1∶10和大约1∶100之间的任何比例下(在ELISA中所述提及抗体与CCR4的结合)可重复减少至少大约20%,更优选地至少大约25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%或65%,甚至更优选地至少大约70%、大约75%或大约80%。具有甚至更严格竞争活性的抗体将展示在大约1∶10和大约1∶100之间的任何比例下(在ELISA或其它合适的分析中所述提及抗体与CCR4的结合)可重复减少至少大约82%、大约85%、大约88%、大约90%、大约92%或大约95%。尽管实施本发明不需要,但并不排除如提及抗体与CCR4的结合可重复减少大约99%、大约98%、大约97%或大约96%的完全或近完全竞争。
上述方法仅是合适的竞争分析的一个例子。本领域技术人员将知道其它合适的方法和变化。下面将描述一种可选择的竞争分析。
在使用流式细胞术进行可选择竞争分析之前,一些量的被测抗体应当如通过生物素化来标记。测定生物素化的产物的功能性(结合细胞的性质的持续力)和针对固定数量的CCR4+细胞给予次高结合水平的本发明的生物素化的抗体(Ab1)的最小浓度。从指数生长培养物中收获总量为106个细胞,并在合适的温度下与不同浓度抗体孵育合适时间,如4℃下孵育1小时。清洗所述细胞并在合适温度下与合适的探测抗体孵育合适的时间,如4℃下再孵育1小时。清洗之后,通过流式细胞术分析所述细胞。对于每一种测试抗体,通过绘制中值荧光强度(MFI)对抗体浓度从所述数据获得饱和曲线。
对于可选择的竞争分析,可以如上述制备CCR4+细胞并用固定浓度的标记(生物素化的)抗体(bio-Ab1)和逐渐增加浓度的非标记的竞争性抗体的混合物一式两份处理CCR4+细胞。所述固定浓度是如上测定的对固定数量的肿瘤细胞产生合理的荧光信号的抗体最小浓度。理想地,所述以nM计的固定浓度应当低于平衡状态时(KD)处理抗体的亲和力。在这种情况下,上述方法可以用于估计竞争性抗体的亲和力(Schodin和Kranz,1993,J Biol Chem268:25755-7)。在合适温度下所述抗体混合物与靶细胞孵育合适的时间,如4℃下1小时。清洗所述细胞并通过与FITC标记的链亲和素孵育来显示生物素化的抗体的细胞结合。从对于每一个测试样品(bio-Ab1+Ab2)读取的中值荧光值中减去背景荧光(PBS-5%FCS)后,根据以下公式计算每一个Ab2浓度“c”的百分比抑制:
%抑制=(1-MFIbio-Ab1+Ab2″c″/MFIbio-Ab1)×100
预期能够结合CCR4且能够抑制MDC结合CCR4且能够与本文描述的任何抗体竞争的抗体,但是优选的抗体在下文中列出。因此,下文中提供一些优选的实施方式。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:4的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:5的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:6的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:11的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:7或101的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:108的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:110的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:112的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:7的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:16的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:17的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:18的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:15的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:22的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:23的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:24的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:19的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:21的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
一种抗体,结合人CC趋化因子受体4(CCR4)的胞外域中的表位并能够抑制MDC与CCR4的结合,其中所述抗体
(a)包括至少一个包含三个CDR的重链可变区和至少一个包含三个CDR的轻链可变区,其中所述轻链可变区包括:
(i)具有SEQ ID NO:129或130的氨基酸序列的可变轻链(VL)CDR1;
(ii)具有SEQ ID NO:131或132的氨基酸序列的VL CDR2;和/或
(iii)具有SEQ ID NO:133、134、137或138的氨基酸序列的VL CDR3;和/或
其中所述重链可变区包括:
(iv)具有SEQ ID NO:125、126、135或136的氨基酸序列的可变重链(VH)CDR1;
(v)具有SEQ ID NO:127或128的氨基酸序列的VH CDR2;和/或
(vi)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VH CDR3;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:69的VH域和SEQ ID NO:70的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:71的VH域和SEQ ID NO:72的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:105的VH域和SEQ ID NO:72的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:71的VH域和SEQ ID NO:115的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:73的VH域和SEQ ID NO:74的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:75的VH域和SEQ ID NO:76的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
在一种实施方式中,所述抗体
(a)具有SEQ ID NO:139的VH域和SEQ ID NO:140的VL域;或
(b)是与抗体(a)竞争结合CCR4的抗体。
优选地,抗体(b)具有一个或多个本文描述的CDR序列、VH域和/或VL域。
优选地,抗体(b)与抗体(a)结合相同的表位。
基本同源序列的一些例子是与公开的氨基酸序列具有至少70%一致性的序列。在一些实施方式中,结合CCR4并能够抑制MDC与CCR4结合的本发明的抗体包括包括至少一个轻链可变区和/或至少一个重链可变区,所述轻链可变区包括与SEQ ID NO:140、70、72、74、76或115的氨基酸序列有至少大约75%、更优选地至少大约80%、更优选地至少大约85%、更优选地至少大约90%或95%以及最优选地至少大约97%的氨基酸序列一致性的氨基酸序列区,所述重链可变区包括与SEQ ID NO:139、69、71、73、75或105的氨基酸序列具有至少大约75%、更优选地至少大约80%、更优选地至少大约85%、更优选地至少大约90%或95%以及最优选地至少大约97%的氨基酸序列一致性的氨基酸序列区。
基本同源序列的其它优选的例子是公开的氨基酸序列中包含保守氨基酸取代的序列。
基本同源序列的其它优选的例子是在公开的一个或多个CDR区中包含多达1、2、3或4个,优选地多达1或2个变化的氨基酸的序列。这样的变化可以是保守氨基酸取代或非保守氨基酸取代,或它们的混合。
在所有这样的实施方式中,优选的变化是保守氨基酸取代。
在所有的实施方式中,包含基本同源序列的抗体保留结合CCR4的能力和抑制MDC与CCR4结合的能力。
本发明的其它实施方式提供结合蛋白,所述结合蛋白结合CCR4且具有抑制MDC与CCR4结合的能力且包括本发明的抗体、本发明的VH或VL域、或本发明的一个或多个CDR。在一种优选的实施方式中,这样的结合蛋白是抗体。
本发明的优选的抗体包括至少一个包括三个CDR的重链可变区和至少一个包括三个CDR的轻链可变区。这些CDR的例示的和优选的序列在本文中描述。
如本文中所使用的,除非有其它明确的说明或以科学术语解释,简写术语“CCR4”意味着CC趋化因子受体4(也被认为是CD194)。
CCR4可以是自由CCR4,如重组或纯化的CCR4,但优选地,它以自然形式存在,如位于细胞表面上。
本发明的抗体或结合蛋白也可以结合CCR4的片段,特别是包括胞外域或由胞外域组成的片段,或可以结合包括CCR4或CCR4片段的实体。当然,本发明的抗体的表位位于CCR4的胞外域中。
“CCR4”也可以指任何形式的CCR4,具体是由于CCR4在哺乳动物种类中保守。因此,本发明的抗体或抗体片段可以结合例如人、猴子(如食蟹猴)、母牛(牛)、小鼠、大鼠、仓鼠、雪貂、豚鼠和/或兔的CCR4。优选地,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人CCR4。因此,除非另有说明,本文中任何涉及“CCR4”可以被认为是“人CCR4”。在一些优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人和猴子(如食蟹猴)CCR4。在其它优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人和小鼠CCR4。在其它优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人、猴子和小鼠CCR4。在其它优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人、猴子、豚鼠和小鼠CCR4。抗体9E和9E10J能够结合人和猴子CCR4,但不结合鼠CCR4(实施例8),所以在一些优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将至少结合人和猴子CCR4,但不结合鼠CCR4。在其它优选的实施方式中,本发明的抗体或抗体片段将结合人和猴子CCR4,但不结合鼠CCR4,如,仅结合人和猴子CCR4。
如本文中所使用的,在本发明的抗体或抗体片段的内容中的术语“结合CCR4”或“抗CCR4”意味着能够实施以下一种或多种、优选地以下多于一种、以及最优选地以下全部情形的抗体或抗体片段:
(a)结合在细胞表面上表达的CCR4,如通过流式细胞术或免疫组织化学法所确定的;
(b)结合构象依赖的(如非线性的)CCR4表位,如通过在非还原条件下在蛋白质印迹中结合CCR4所确定的;
(c)结合固相基质上的自由CCR4,如重组表达的CCR4,如通过ELISA分析或BIAcore分析所确定的;
(d)至少结合人CCR4,更优选地结合人和猴子CCR4或结合人和小鼠CCR4,最优选地结合人、猴子和小鼠CCR4或结合人和猴子CCR4而不结合小鼠CCR4;
(e)如在本文其它地方所讨论的以10nM或更少、优选地5nM或更少、更优选地3nM或更少或2nM或更少、最优选地1nM或更少的结合亲和力(Kd)结合人CCR4;
(f)如在本文其它地方所讨论的以相似的亲和力,如以10nM或更少、优选地5nM或更少、更优选地3nM或更少或2nM或更少、如1nM或更少的Kd结合人和猴子CCR4或结合人和小鼠CCR4,优选地结合人和猴子CCR4而不结合小鼠CCR4。
本发明的优选的抗体或抗体片段也能够实施以下一种或多种、优选地以下多于一种以及最优选地以下所有的功能性质:
(g)如在本其它地方描述的诱导CCR4+细胞的ADCC;
(h)抑制CCR4与至少MDC和/或TARC、优选地MDC和TARC、或优选地至少MDC和/或TARC和选自RANTES、MCP-1和MIP-1α中的一个或多个的结合;
(i)诱导体内抗肿瘤效果;
(j)当对患有肿瘤的动物给药时定位于肿瘤;
(k)诱导CCR4+细胞的CDC;
(l)抑制对CCR4配体的CCR4介导的细胞应答,优选地,抑制对CCR4配体的应答中胞内钙离子浓度的增加;
(m)抑制CCR4+细胞对CCR4配体如MDC的趋化作用。
在结合CCR4+细胞的内容中,应当理解,本发明的抗体结合CCR4+细胞且不明显地结合CCR4-细胞(如在实施例2中所显示的)。
术语“不明显地结合CCR4-细胞”应当被理解为所述抗体与CCR4-细胞的任何结合都不阻止所述抗体出于治疗或诊断目的的应用。因此,“不明显”结合CCR4-细胞意味着所述抗体与CCR4-细胞的结合比它与一种或多种CCR4+细胞的结合弱。因此可能与正常细胞发生一些交叉反应,但是该结合水平可以被认为是“背景”结合。出于治疗或诊断的目的,主要的考虑是所述抗体与一种或多种类型的CCR4+细胞的结合必须比与任何CCR4-细胞的结合更强,在治疗或诊断应用中,所述抗体可能与CCR4-细胞接触。
本发明的抗体可以指定为“CCR4特异的”。所述术语“CCR特异的”应当被解释为所述抗体与表达CCR4的细胞的结合是足够特异的以使得所述抗体用于治疗或诊断目的。本领域技术人员可以容易地通过比较与靶定CCR4+细胞的结合力和与一种或多种类型的CCR4-细胞(如野生型、即未转染CCR4的HEK293T细胞或DT40细胞)的结合力以确定任何给定的抗体是否是CCR4特异的。
本领域技术人员将知道如使用流式细胞术评估与CCR4+细胞的结合相比较于与CCR4-细胞的结合,且实施例2中描述了一种合适的实施例。
本领域已知的免疫组织化学技术将被用于评价抗体与细胞或样品的结合。这样的分析将被用于检测具体抗体的特异性,或检测组织样品中CCR4表达。简要地,所述抗体可以例如在人组织的高密度阵列上被检测,所述人组织包括阳性对照(已知是CCR4阳性的细胞)和阴性对照(已知是CCR4阴性的细胞)。可以通过四步等级(0、1、2、3)的视觉检查评估膜染色强度。优选的抗体对CCR4+组织显示弱的或强的免疫组织化学得分,优选地为强的免疫组织化学得分。
可以使用已知方法分析种类交叉反应性,实施例8中描述了一个合适的分析。
已经显示抗体17G、9E、1O和11F能够抑制CCR4与它的配体TARC和MDC结合(实施例3)。因此,优选地,本发明的抗体能够抑制CCR4与一个或多个它的配体结合。优选地,至少抑制与MDC的结合。更优选地,抑制与MDC和TARC的结合。在一些实施方式中,抑制CCR4与TARC的结合。在本文公开的任何方面的实施方式中,本发明的抗体能够抑制MDC和/或TARC与CCR4结合。因此,尽管贯穿本文所提及的是抑制MDC与CCR4的结合,本文公开的任何该方面和实施方式的一种实施方式是抑制与MDC和/或TARC结合。
“抑制配体与CCR4的结合”意思是与不存在所述抗体时的结合相比,存在所述抗体时,配体与CCR4的结合减少了至少20%、30%或40%,更优选地至少45%、50%、55%、60%、65%、70%或75%,甚至更优选地至少80%。同样期望配体与CCR4的结合减少了至少85%、90%或95%的实施方式。换一种方式看,当所述配体首先与CCR4接触,随后添加所述抗体,所述配体可以抑制抗体与CCR4结合。
确定抗体是否可以抑制配体与CCR4结合的分析是熟知的,并且在实施例3中描述了一个合适的分析。简要地,CCR4+细胞用或不用MDC孵育,然后加入抗体,随后用标记的抗人抗体探测所述抗体。当存在MDC时,预孵育导致结合CCR4的抗体减少。具体地,抑制了抗体与转染了CCR4和用MDC或TARC预孵育的DT40细胞(ATCC CRL-2111)的结合。
用于确定抗体是否能够阻止配体与CCR4结合的可选择的分析包括使用标记的配体,如放射性同位素标记的配体。实施例9中描述了一种合适的分析。
抗体17G和9E已经显示了能够抑制对CCR4配体的CCR4介导的细胞应答,特别是通过抑制应答CCR4配体中胞内钙离子浓度的增加(见实施例5)。已经证明了抗体9E和9E10J对TARC诱导的信号转导的依赖剂量的抑制(见实施例5)。因此,本发明的抗体优选地能够抑制对CCR4配体的CCR4介导的细胞应答,特别是通过抑制答应CCR4配体中胞内钙离子浓度的增加。具体地,所述抗体优选地能够抑制CCRF-CEM细胞(ATCC CCL-119)中MDC诱导的钙离子流和/或TARC诱导的钙离子流。合适的分析方法是已知的,且实施例5中公开了一个分析。
其它优选的性质包括当施用本发明的抗体时在体内不存在有意义的毒性且在体内不存在有意义的其它副作用。
在一些实施方式中,所述抗体可以抑制CCR4+细胞对CCR4配体(如MDC或TARC)的趋化作用。已经显示抗体9E和9E10J能够抑制CCR4+细胞对CCR4配体的趋化作用(实施例13)。因此,本发明的抗体优选地能够抑制CCR4+细胞对CCR4配体(优选地MDC和/或TARC)的趋化作用。
在一些实施方式中,所述抗体可以诱导CCR4+细胞的补体依赖细胞毒性(CDC),但是在其它实施方式中,所述抗体不能够诱导CDC。在一些实施方式中,所述抗体可以诱导CCR4+细胞的细胞凋亡,但是在其它实施方式中,所述抗体不能够诱导细胞凋亡。抗体9E显示不能诱导Ramos细胞的细胞凋亡(见实施例12),因此在一些实施方式中,本发明的抗体不能够诱导CCR4+细胞的有意义的细胞凋亡。在一些实施方式中,通过结合CCR4所述抗体可以被CCR4+细胞内在化,但是在其它实施方式中,没有发生有意义的内在化。
可以使用已知的标准方法评估细胞凋亡的诱导,例如分析膜联蛋白V染色的方法。简要地,可以用抗体孵育细胞合适的时间,如24小时,并在收获细胞和膜联蛋白V染色之后,通过FACS分析(如使用EasyCyte)测量所述效果。
可以使用已知的标准方法分析CDC的诱导,如基于吸收和代谢氧化还原染料如Alamar蓝来测量活细胞的相对数量的方法。合适的分析在H Gazzano-Santoro等,J Immunol Methods.1997,28;202(2):163-71中公开。
本领域技术人员将知道分析内在化的合适方法,例如在流式细胞术或共聚焦显微方法中使用温差荧光标记。合适的分析的例子包括标记有pH敏感染料(如CypHer5E)的二级抗体,其在碱性pH值时有最低限度的荧光(如在细胞外所发现的)和在酸性pH值时有最大限度的荧光(如在细胞内所发现的)。
可以使用标准方法分析趋化作用的抑制,如使用transwell分析。简要地,在一个小室中将能够进行趋化作用并表达CCR4的细胞与抗体接触,CCR4配体(如MDC)放置于另一个小室中,另一个小室与第一个小室通过具有合适孔大小的过滤器膜分开。通过比较存在抗体时的趋化作用和不存在抗体时的趋化作用,确定所述抗体对细胞向配体迁移(趋化作用)的作用。
术语CCR4的“配体”包括CCR4的天然配体,如MDC、TARC、RANTES、MCP-1和/或MIP-1α,这些配体可以是天然产生的、重组表达的或在实验室中合成的。
“CCR4+细胞”意味着在它们表面表达CCR4的细胞,优选地至少基本处于它的野生构型。CCR4+细胞可以天然地表达CCR4,或者它们可以是表达重组CCR4的转化体。
因此,根据本发明,在多种实施方式中可以制备并应用一系列抗CCR4抗体,所述实施方式包括治疗在本文其它地方描述的任何紊乱,具体地是癌症、免疫紊乱、炎症紊乱和传染。
如在贯穿整个申请文件中使用的,术语“一个(种)”在这种意义下使用:它们意味着“至少一个(种)”、“至少第一个(种)”、“一个(种)或多个(种)”或“多个(种)”提及的成分或步骤,除非在那之后具体陈述了上限。因此,如在本文中使用的,“抗体”意味着“至少第一种抗体”。根据本发明的公开内容,本领域技术人员将知道组合物的可操作的限定和参数,如任何单一试剂的量。
本发明的优选实施方式是包括至少一个本发明的抗CCR4抗体或其抗原结合片段的组合物。
包含编码如本文定义的本发明的抗体或它们的部分或片段的核苷酸序列的核酸分子、或与其基本同源的核酸分子构成了本发明的另外方面。优选的核酸分子包含编码SEQ ID NO:35(优选地由SEQ ID NO:34编码)、SEQ ID NO:46(优选地由SEQ ID NO:45编码)、SEQ ID NO:104(优选地由SEQ ID NO:103编码)、SEQ ID NO:114(优选地由SEQ ID NO:113编码)、SEQ ID NO:57(优选地由SEQ ID NO:56编码)或SEQ ID NO:68(优选地由SEQ ID NO:67编码)列出的氨基酸序列的序列。其它优选的核酸分子包含编码重链可变区(VH)的序列和/或包含编码轻链可变区(VL)的序列,所述重链可变区具有SEQ ID NO:69、71、73、75或105(优选地分别由SEQ ID NO:77、79、81、83或106编码)或139的氨基酸序列,所述轻链可变区具有SEQ ID NO:70、72、74、76或115(优选地分别由SEQ ID NO:78、80、82、84或116编码)或140的氨基酸序列。更优选的是编码以下组合物的核酸:SEQ ID NO:139和140,或SEQ ID NO:69和70,或SEQ ID NO:71和72,或SEQ ID NO:105和72,或SEQID NO:71和115,或SEQ ID NO:73和74,或SEQ ID NO:75和76。同样优选的是包括以下组合的核酸分子:SEQ ID NO:77和78,或SEQ ID NO:79和80,或SEQ ID NO:106和80,或SEQ ID NO:79和116,或SEQ ID NO:81和82,或SEQ ID NO:83和84。
其它优选的核酸分子包含编码本发明的IgG形式的抗体(如在实施例1中描述的那些)或鼠嵌合形式的抗体的序列。
如上所显示的,本发明包括的其它核酸分子是编码本发明的人抗体的部分或片段的那些,如编码抗体的重链可变区(VH)的那些(如编码SEQ ID NO:69、71、73、75或105的那些,如分别是SEQ ID NO:77、79、81、83或106)或编码抗体的轻链可变区(VL)的那些(如编码SEQ ID NO:70、72、74、76或115的那些,如分别是SEQ ID NO:78、80、82、84或116)。其它优选的核酸分子是编码本发明的抗体的重链的那些(如编码SEQ ID NO:87、91、95、99、119或123的那些,如分别是SEQ ID NO:85、89、93、97、117或121)或编码抗体的轻链的那些(如编码SEQ ID NO:88、92、96、100、120或124的那些,如分别是SEQ IDNO:86、90、94、98、118或122)。
因此,如本文所定义的抗体的片段、或与其基本同源的序列、或包含编码这些片段的序列的核酸分子形成了本发明的另外方面。
有利地,当以IgG形式时,本发明的抗体具有高的结合CCR4的亲和力,即Kd值的范围是1×10-8M或1×10-9M或更少。重要地,具有这样亲和力的抗体处于已经显示用于治疗的确定的范围。优选地,当以IgG形式时,本发明的抗体结合CCR4的亲和力相应于Kd小于30nM、20nM、15nM或10nM,更优选地小于10、9.5、9、8.5、8、7.5、7、6.5、6、5.5、5、4.5、4、3.5、3、2.5、2、1.5或1nM,最优选地小于0.9、0.8、0.7、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2或0.1nM。
可以使用任何合适的测定Kd的方法。但是,优选地通过以下方法测定Kd:在体外实验中检测抗多种浓度抗原(CCR4)的测试抗体的不同浓度以构建饱和曲线,如使用Lineweaver-Burk方法;或通过使用商业可购的结合模型软件,如BIAcore1000评估软件中的1∶1结合模型。实施例2中使用了一种合适的分析,其中使用“一个位点特异结合”模型f软件Prism(GraphPad,圣地亚哥,CA)从IgG在CCR+细胞上的滴定计算Kd值。
关于Kd值的测定,本领域技术人员将意识到来自使用表达目标物(如CCR4)的细胞的结合实验的表观Kd值不能被认为是亲和力的绝对指示,因为实验条件将影响表观结合亲和力。例如,CCR4的表达水平可能很大程度地取决于培养细胞的条件以及不同细胞类型的区别。因此最好是比较从一组实验中获得的表观Kd值,并且将从一组实验获得的表观Kd值和从不同组实验获得的表观Kd值进行比较并不总是合适的,特别是如果实验条件变化得特别明显。
可选地,可以通过进行细胞表面保持力分析来测定CCR4阳性细胞表面的分离率和抗体半衰期Adams等,1998,Prolonged in vivo tumour retention of a human diabody targeting theextracellular domain of human HER2/neu.BrJ Cancer 77:1405-12;Le Gall等,1999,Di-,tri-andtetrameric single chain Fv antibody fragments against human CD19:effect of valency on cellbinding.FEBS Lett 453:164-8。后一种方法更适于模拟人类病患在治疗状况下的真实情形。
在一些实施方式中,本发明的抗体可以结合人CCR4和猴子CCR4。在物种之间,特别是人和通常被用作临床前动物模型的物种之间的这样交叉反应可能是有利的,因为它使得从临床前研究到临床应用的转换更有效。例如,具有与在使用的具体动物模型中存在的天然CCR4交叉反应的抗体意味着这个模型中的结果更接近于反映人类病患的情形,因此对例如使用的剂量产生更精确的估计并增加鉴定任何潜在相关或有问题的副作用可能性。
例如,本发明的抗体结合人CCR4和猴子CCR4的能力意味着可以在临床前毒性研究中检测这样的抗体以得知治疗的副作用并发现合适的耐受剂量。
此外,结合人CCR4和小鼠CCR4的能力意味着由在小鼠模型(如使用免疫活性小鼠的鼠同源模型)中的本发明抗体显示的结果更接近于代表抗体在人类受试者中的活性。这个的原因是结合人CCR4但不结合小鼠CCR4的抗体将结合由小鼠模型中的人肿瘤细胞表达的CCR4而不能结合内源鼠CCR4。这当然与人类病患的情形不同,其中存在肿瘤表达CCR4和内源CCR4。
这特别是抗体对鼠CCR4和人CCR4有相似亲和力的情况。
这种情形的潜在缺点是结合人CCR4但不结合鼠CCR4或对鼠CCR4具有明显较低亲和力的抗体可能在免疫系统受损的鼠(如裸鼠或SCID鼠)的人肿瘤移植物模型中良好地实现功能,但是这可能不能由在存在更多CCR4的人系统中进行相似的功能实现而反映。换句话说,在具有结合人CCR4但不结合小鼠CCR4的抗体的小鼠移植物系统中看到的抗肿瘤效果可能比临床实际情况看上去更好。相反,当与结合人CCR4和小鼠CCR4的抗体一起处理时,这将与小鼠模型系统中存在的所有形式的CCR4都结合,并且当更接近于表示当抗体被投放于人体中的情形。这特别是抗体对鼠CCR4和人CCR4有相似亲和力的情况。
在优选的实施方式中,本发明的抗体以相似的亲和力结合人CCR4和猴子CCR4,或结合人CCR4和小鼠CCR4,所述亲和力例如是Kd值为10nM或更少或5nM或更少,更优选地为3nM或更少或2nM或更少,最优选地是1nM或更少。
“相似的亲和力”意思是所述抗体与人CCR4的结合亲和力和所述抗体与一种或多种感兴趣的其它物种(如猴子或小鼠)的结合亲和力是可比的,如不多于20倍的差异。更优选地,结合亲和力之间的所述差异少于15倍,更优选地少于10倍,最优选地少于5、4、3或2倍。
但是,在其它实施方式中,本发明的抗体可能不结合猴子CCR4和/或它们可能不结合小鼠CCR4。
本发明的抗体结合CCR4。因此,本发明的抗体或结合蛋白可以用于在体内或体外探测CCR4,特别是探测CCR4+细胞。例如,由于一些肿瘤细胞上表达CCR4,本发明的抗体或结合蛋白可以用于在体内或体外探测肿瘤细胞。此外,所述抗体定位于CCR4+细胞的能力意味着本发明的抗体可以靶定存在CCR4+细胞的身体位点,其中所述抗体可以在所述靶位点上起作用。具体地,所述抗体定位于CCR4+肿瘤细胞的能力意味着本发明的抗体能够靶定存在CCR4+肿瘤细胞的身体位点,其中所述抗体可以在所述靶位点上起作用。
例如,所述抗体可以如通过激活或诱导ADCC来诱导它本身的抗CCR4+细胞作用,即作为裸露的抗体。作为裸露Ab的能力是有益的。可选地或另外地,通过与另一种治疗分子(如本文中所描述的毒素或其它抗癌分子或抗炎试剂)连接,所述抗体可以诱导抗CCR4+细胞作用。
优选地,本发明的抗体具有诱导CCR4+细胞的抗体依赖细胞毒性(ADCC)的能力。可以在体外使用本领域已知的方法测定ADCC。实施例6中描述了一个合适的方法。可选地,例如,可以使用铬51释放试验。因此,在体外如存在人PBMC,本发明的抗体可以引起杀死至少10%、15%、20%、22%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的CCR4+细胞。例如,已经显示在存在人PBMC时,抗体17G可以引起杀死至少10%、15%、20%或22%的CCR4+细胞系CCRF-CEM;而在存在人PBMC时,抗体9E可以引起杀死至少10%、15%、20%、22%、30%、40%、45%、50%、55%的CCR4+细胞系CCRF-CEM(见实施例6)。在存在人PBMC时,已经显示抗体9E10J可以引起杀死至少10%、15%、20%、22%、30%、35%、40%、42%的CCR4+细胞系CCRF-CEM(见实施例6)。对于一些应用,特别是一些治疗应用,ADCC是有利的。因此,在优选实施方式中,所述抗体可以诱导CCR4+细胞的ADCC,优选地是CCR4+肿瘤细胞和/或CCR4+Th2细胞的ADCC。在一些实施方式中,所述抗体介导的ADCC存在PBMC,但是同样预期抗体介导的ADCC缺少PBMC的实施方式。在其它实施方式中,所述抗体几乎不诱导或诱导不明显的ADCC。
在需要的抗体浓度以达到这样的ADCC水平方面,优选地,本发明的抗体同样地显示出合适的效力。再一次,实施例6中描述了一种合适的体外试验。因此,在体外,CCR4+细胞(如CCRF-CEM细胞)的半数最大量细胞溶解所需要的抗体浓度(EC50)优选地小于700ng/ml、650ng/ml、620ng/ml、600ng/ml、550ng/ml、500ng/ml、450ng/ml、400ng/ml、350ng/ml、300ng/ml、250ng/ml、200ng/ml、150ng/ml、100ng/ml、90ng/ml、80ng/ml、70ng/ml、60ng/ml、50ng/ml、46ng/ml、40ng/ml、35ng/ml、30ng/ml、25ng/ml、20ng/ml、15ng/ml、10ng/ml、9ng/ml、7ng/ml、5ng/ml、2ng/ml、1ng/ml、0.5ng/ml或0.25ng/ml。例如,已经显示本发明的17G抗体对CCRF-CEM细胞的EC50是619ng/ml;本发明的抗体9E对CCRF-CEM细胞的EC50是46ng/ml;在一个单独的实验中,本发明的抗体9E10J对CCRF-CEM细胞的EC50是25ng/ml(见实施例6)。
当与合适的对照水平比较时,优选地,上述能力是在可测量的或有意义的水平上观察到的,更优选地,在统计学有意义的水平上观察到的。
应当注意,关于非特异和特异肿瘤细胞溶解的量以及EC50值,由不同供体制备的PBMC(效应细胞)可能展示明显不同的ADCC。该现象已经由Naundorf等,2002描述,当由本发明的抗体试验ADCC时同样能够观察到(见实施例6和11)。
人IgG1是一种糖蛋白,具有两条N连接的连接至Fc域的寡聚糖链。所述寡聚糖是复合的双触角型,包括三甘露糖核心结构,存在或不存在核心岩藻糖、二等分的N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)、半乳糖和末端唾液酸,引起了结构多种多样。人血清IgG和治疗抗体已知都是典型地严重岩藻糖化。
已经报导,在一些实例中,可以通过操纵人IgG1亚家族上的寡聚糖状态以实现ADCC的增强。具体地,已经显示去岩藻糖化能够引起一些抗体的ADCC活性增加(Niwa R等,2004)。因此,在优选实施方式中,在生产/表达蛋白过程中、和/或体外生产/表达蛋白之后修饰根据本发明的抗体以产生特异的糖基化形式,特别是对抗体的治疗应用有益的糖基化形式。优选地,所述特异的糖基化形式是减少或缺失基于岩藻糖的糖基化,其优选地增加了抗体诱导ADCC的能力。因此,在优选实施方式中,本发明的抗体具有特异的糖基化形式,优选地增加所述抗体诱导ADCC的特异的糖基化形式。优选地,本发明的抗体是去岩藻糖化的或非岩藻糖化的。
本领域技术人员知道制备去岩藻糖化或非岩藻糖化的抗体的合适方法。如在实施例10中所描述的,这可以通过在存在Kifunensine(例如100ng/ml)时生产抗体而完成,所述Kifunensine是I型α-甘露糖苷酶的选择性抑制剂,导致在生产过程中所述分子的岩藻糖基化减少。缺失一种或多种对于寡聚糖基质的岩藻糖基化所需的蛋白的合适宿主细胞可以用于制备去岩藻糖基化的抗体,如岩藻糖基转移酶缺失的宿主细胞。合适的宿主细胞的例子是这样的细胞:其中与胞内糖核苷-GFP-岩藻糖的合成相关的酶活性和/或与糖链修饰相关的酶活性是减少的或缺失的,所述糖链修饰中岩藻糖的第一位与N-乙酰氨基葡萄糖的第六位在还原末端通过复合的N-糖苷连接的糖链中的α键连接。这样的酶的例子包括与GDP-岩藻糖合成相关的酶,包括GMD(GDP-甘露糖4,6-脱水酶)、Fx(GDP-酮-6-脱氧甘露糖-3,5-差向异构酶、4-还原酶)、GFPP(GDP-β-L-岩藻糖焦磷酸化酶)。
“去岩藻糖化”的意思是结合至Fc区的总复合的N-糖苷连接的糖链中至少10%,优选地至少20%、30%、40 50%、60%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%是岩藻糖没有结合至糖链的还原末端的N-乙酰氨基葡萄糖的糖链。
“非岩藻糖化”的意思是抗体中不存在明显水平的岩藻糖。
一些抗体能够被它们结合的细胞内在化。因此,在本发明的一些实施方式中,实施抗体能够被内在化。这个性质特别有利于用在免疫交联物中,因为与所述抗体分子连接的任何其它试剂应当与抗体分子一起被内在化。在其它实施方式中,没有看见明显的内在化。
具体对于医药应用,期望的是所述抗体没有诱导任何明显的血小板聚集。可以如在实施例15中所描述的测定血小板聚集。该实施例显示了抗体9E10J对血小板聚集没有明显的作用。因此,在本发明的一些实施方式中,所述抗体对血小板聚集没有任何明显的作用。
如上述讨论的,一些PBL(包括Treg)表达CCR4,因此在实施例16中试验了抗体9E10J对PBL的能力,且该实施例显示9E10J可以结合PBL。因此,在本发明的一些实施方式中,所述抗体可以结合PBL,优选地结合Treg和/或Th2细胞。这个性质是有利的,特别是在免疫治疗中,因为它可能耗尽Treg细胞。
在下面的关于本发明的组合物、免疫交联物、医药品、复合物、鸡尾酒、试剂盒、第一和第二医药应用和所有方法的描述中,除非另有明确的说明或以科技术语解释,术语“抗体”和“免疫交联物”、或它们的抗原结合区或片段指抗CCR4抗体以及具体的17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D抗体。
如在本文中使用的“抗体”和“免疫球蛋白”广泛地指包括人抗原结合域的任何免疫学结合试剂或分子,包括多克隆抗体和单克隆抗体。根据重链恒定区的类型,所有抗体都被指定为五个主要类之一:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,且本发明的抗体可能是这些类中的任何一个。这些中的几个被进一步分为亚类或同种型,如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4等等。对应于不同免疫球蛋白家族的重链恒定区被分别定义为α、δ、ε、γ和μ。不同类的免疫球蛋白的亚单元结构和三维构造是已知的。
通常,当本发明中使用全抗体而不是抗原结合区时,IgG和/或IgM是优选的,因为它们在生理情形中是最常见的抗体且因为它们在实验室装置中最容易制备。特别优选的是IgG1抗体。
基于它们恒定域的氨基酸序列和可变域的框架区的一些氨基酸,哺乳动物抗体的“轻链”被指定为两种特别不同类型之一:卡帕(κ)和拉姆达(λ)。本发明的抗体对使用κ或λ轻链恒定区基本没有偏好。
如本领域技术人员所理解的,由术语“抗体”所包括的免疫学结合反应物扩展至所有抗体和它们的抗原结合片段,包括全抗体、二聚抗体、三聚抗体和多聚抗体、双特异抗体、嵌合抗体、重组抗体和工程抗体,和它们的片段。
因此,术语“抗体”用于表示具有抗原结合区的任何抗体样分子,且该术语包括包含抗原结合域的抗体片段,如Fab′、Fab、F(ab′)2、单域抗体(DABs)、TandAbs二聚物、Fv、scFv(单链Fv)、dsFv、ds-scFv、Fd、线性抗体、小体(minibodies)、双价抗体、双特异抗体片段、双靶向抗体(bibody)、三靶向抗体(tribody)(分别指scFv-Fab融合的、双特异的或三特异的)、sc-双价抗体、κ(λ)抗体(scFv-CL融合物)、双特异T细胞联合体(Engager)(BiTE)(scFv-scFv串联体以吸引T细胞)、双可变域(DVD)Ig(双特异形式)、小免疫蛋白(SIP)(小体类型)、SMIP(“小模块化免疫治疗物”scFv-Fc二聚物、DART(ds-稳定的双价抗体“双重亲和力重复靶定”)、包括一个或多个CDR的小抗体类似物等。
制备和使用多种基于抗体的构建体和片段的技术是本领域已知的(见Kabat等,1991,通过引用的方式特异结合至本文)。具体地,双价抗体在EP 404,097和WO 93/11161中进一步描述,而线性抗体在Zapata等(1995)中进一步描述。
可以使用常规技术将抗体分成片段。例如,可以通过用胃蛋白酶处理所述抗体而产生F(ab′)2片段。可以处理得到的F(ab′)2片段以减少二硫键桥以产生Fab1片段。木瓜蛋白酶的消化可以导致形成Fab片段。同样可以通过重组技术合成或化学合成Fab、Fab′和F(ab′)2、scFv、Fv、dsFv、Fd、dAbs、TandAbs、ds-scFv、二聚物、小体、双价抗体、双特异性抗体片段和其它片段。本领域中已知并描述了生产抗体片段的技术。例如,Beckman等,2006;Holliger&Hudson,2005;Le Gall等,2004;Reff&Heard,2001;Reiter等,1996和Young等,1995都进一步描述和实施了有效抗体片段的生产。
所述抗体或抗体片段可以天然产生或完全合成或部分合成产生。因此所述抗体可以来自任何合适来源、如重组来源和/或在转基因动物或转基因植物中、如在使用IgY技术的卵中产生。因此,所述抗体分子可以在体内或体外生产。
优选地,所述抗体或抗体片段包括包含三个CDR域的抗体轻链可变区(VL)和包含三个CDR域的重链可变区(VH)。所述VL和VH通常来自于抗原结合位点。
“Fv”片段是包含全部的抗原识别位点和结合位点的最小抗体片段。该区具有紧密而非共价连接的一个重链可变域和一个轻链可变域的二聚物。在这个结构中,每个可变域的三个超变区(CDR)互相作用以限定VH-VL二聚物表面的抗原结合位点。共同地,六个超变区(CDR)赋予了抗体抗原结合特异性。
但是,在本领域中有明确的记载:抗体存在轻链可变域的三个CDR和重链可变域的三个CDR对于抗原结合并不是必须的,因此,小于上述典型抗体片段的结构已知是有效的。
例如,骆驼(camelid)抗体(Hamers-Casterman等,1993;Arbabi Ghahroudi等,1997)具有广泛的抗原结合性质但是缺少轻链。同样,仅包括VH域(Ward等,1989;Davies和Riechmann,1995)或仅包括VL域(van den Beucken等,2001)的单域抗体的结果显示这些域可以以可接受的高亲和力结合抗原。因此,三个CDR能够有效地结合抗原。
同样已知单一CDR、两个CDR可以有效地结合抗原。作为第一种例子,单一CDR可以插入至异种的蛋白并赋予所述异种蛋白以抗原结合能力,如通过插入至异种蛋白(如GFP)的VH CDR3区赋予所述异种蛋白以抗原结合能力所例示的(Kiss等,2006;Nicaise等,2004)。
进一步已知两个CDR可以有效结合抗原,甚至赋予比亲本抗体所具有的更好的性质。例如,已经显示(Qiu等,2007),来自亲本抗体的两个CDR(VH CDR1区和VL CDR3区)保持了亲本分子的抗原识别性质,但是具有更好的渗透肿瘤的能力。使用合适的连接片段(如来自于VH FR2)以类似于天然亲本抗体的方式将这些CDR域连接起来以调整CDR产生更好的抗原识别。因此,本领域已知,以合适的框架区的方式构建包括两个CDR域(优选地一个来自VH域且一个来自VL域,更优选地,两个CDR域的一个是CDR3域)的结合抗原的抗体类似物以保持在亲本抗体中发现的构造是可能的。
因此,尽管本发明的优选抗体可能包括六个CDR区(三个来自于轻链,三个来自于重链),本发明也包括具有少于六个CDR区的抗体和少至一个或两个CDR区的抗体。此外,同样预期具有仅来自重链或轻链的CDR的抗体。
结合CCR4的本发明的优选抗体包括至少一个包括三个CDR的重链可变区和至少一个包括三个CDR的轻链可变区,其中所述重链可变区包括:
(a)具有SEQ ID NO:1的氨基酸序列或与其基本同源的序列的可变重链(VH)CDR1;
(b)具有SEQ ID NO:2的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR2;和
(c)具有SEQ ID NO:3或15的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR3;或
(d)具有SEQ ID NO:7或101的氨基酸序列或与其基本同源的序列的可变重链(VH)CDR1;
(e)具有SEQ ID NO:8的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR2;和
(f)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR3;或
(g)具有SEQ ID NO:19的氨基酸序列或与其基本同源的序列的可变重链(VH)CDR1;
(h)具有SEQ ID NO:20的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR2;和
(i)具有SEQ ID NO:21的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR3;或
(j)具有SEQ ID NO:125或126的氨基酸序列或与其基本同源的序列的可变重链(VH)CDR1;
(k)具有SEQ ID NO:127或128的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR2;和
(c)具有SEQ ID NO:9的氨基酸序列或与其基本同源的序列的VH CDR3。
用于与具体的重链CDR区连接的优选的轻链CDR区在本文其它地方描述。但是,同样期待包括三个CDR的用于与本发明的重链可变区连接的其它轻链可变区。本领域技术人员可以容易地鉴定与本发明的重链可变区组合并产生结合CCR4的抗体的合适的轻链可变区。
例如,本发明的重链可变区可以与单一的轻链可变区或所有的轻链可变区组合,得到的抗体经检测与CCR4结合。将期望的是合理数量的这种本发明的重链可变区与不同的轻链可变区的组合将保持结合CCR4的能力。
相似的方法将用于鉴定与本发明的优选轻链可变区组合的可选的重链可变区。
在一些实施方式中,所述抗体或抗体片段包括全部或一部分重链恒定区,如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2、IgE、IgM或IgD恒定区。优选地,所述重链恒定区是IgG1重链恒定区,或其一部分。此外,所述抗体或抗体片段可以包括全部或一部分κ轻链恒定区或λ轻链恒定区,或其一部分。所有或部分这样的恒定区可以天然产生或可以全部或部分地合成。这样恒定区的合适序列是已知的并在本领域中有文献记载。当本发明的抗体包括来自重链和轻链的全部恒定区时,这样的抗体在本文中典型地被定义为“全长”抗体或“完全”抗体。
包含Fc区的抗体优选用于一些应用,特别是体内治疗应用,其中Fc区调节了效应作用,如ADCC。
本文使用的与氨基酸或核酸序列相关的术语“基本同源”包括与本文公开的氨基酸或核酸序列具有至少70%或75%、优选地至少80%、以及甚至更优选地至少85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性的序列。因此,本发明的基本同源序列包括本发明的序列的单一或多个碱基或氨基酸改变(添加、取代、插入或缺失)。在氨基酸水平,优选的基本同源序列在一个或多个框架区和/或构成本发明的序列的一个或多个CDR中包含多至1、2、3、4或5个、优选地多至1、2或3个、更优选地多至1或2个变化的氨基酸。所述改变可以是保守的氨基酸或非保守的氨基酸。优选地,所述改变是保守氨基酸取代。
基本同源的核酸序列也包括与本文公开的核酸序列(或它们的互补序列)杂交的核苷酸序列,如在至少适度严格杂交条件下与编码本发明的一个或多个轻链或重链的CDR、本发明的轻链可变区或重链可变区或本发明的抗体的核苷酸序列杂交(或与它们的互补序列杂交)的核苷酸序列。
术语“基本同源”同样包括本发明的氨基酸序列和核苷酸序列的变异体或化学等价物,所述变异体或化学等价物以基本相同的方式实现与本发明的蛋白或核酸分子基本相同的功能。例如,任何基本同源抗体(或编码它的基本同源的核酸)需要保持上述的结合CCR4的能力。例如,任何基本同源的抗体应当保持如在本文其它地方所定义的抗体功能性能力。优选地,任何基本同源的抗体应当保持与被所讨论的抗体识别的CCR4的相同表位特异结合的能力,所述相同表位如本发明的CDR域识别的相同表位或本文公开的本发明的VH和VL域。通过本领域已知和描述的方法,如使用结合分析(如竞争分析)可以容易地检测与相同表位/抗原的结合。可以通过本领域已知和描述的方法容易地检测其它功能性质的保持力。
因此,本领域技术人员将意识到,所述结合分析可以用于检测“基本同源”抗体是否具有与本发明的抗体和抗体片段相同的结合特异性,例如,如ELISA分析或BIAcore分析的结合分析可以容易地用于确定这样的“基本同源”抗体是否可以结合CCR4。如上所述,竞争结合分析可以用于检测“基本同源”抗体是否保持与本发明的抗体所识别的基本一样的CCR4表位特异结合的能力。下面所述的方法仅是合适的竞争分析的一个例子。本领域技术人员将知道其它合适的方法和变化。
本发明蛋白的基本同源序列包括,但不限于,保守氨基酸取代;或例如不影响抗体的VH、VL或CDR域的变化,所述抗体包括例如使用不同连接片段的scFv抗体或添加有对结合抗原没有影响的标签序列或其它成分的抗体;或将一种类型或形式的抗体分子或片段转换成另一种类型或形式的抗体分子或片段(如从Fab转化成scFv,反之亦然);或将一种抗体分子转化成一种具体家族类或亚类的抗体分子(如将一种抗体分子转化成IgG或其亚类如IgG1或IgG3)。
本文使用的“保守氨基酸取代”是指所述氨基酸残基被具有相似侧链的另一种氨基酸取代。本领域已经定义了具有相似侧链的氨基酸家族,包括碱性侧链(如赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(如天冬氨酸、谷氨酸)、无电荷的极性侧链(如甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(如甘氨酸、半胱氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、色氨酸)、β-分支侧链(如苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芬芳侧链(如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。
可以用任何合适的方法评估一致性。但是,对于确定序列之间的一致程度,使序列进行多重比对的计算机程序(如Clustal W,(Thompson等,1994))是有用的。如果需要,所述Clustal W运算法则可以与BLOSUM 62得分矩阵(Henikoff和Henikoff,1992)和10分的缺口打开处罚和0.1分的缺口延伸处罚一起使用,使得在两条序列之间获得最高的顺序匹配,其中,所述比对包括一条序列的至少50%的总长度。可以用于比对序列的其它方法是Needleman和Wunsch(1970)提出的比对方法,并由Smith和Waterman(1981)修订,使得在两条序列之间获得最高的顺序匹配并确定两条序列之间相同氨基酸的数量。计算两条氨基酸序列之间百分比一致性的其它方法是本领域公认的,包括例如Carillo和Lipton(1988)描述的那些,和在牛津大学出版社(纽约,1988)出版的Biocomputing:Informatics and Genomics Projects中所描述的那些。
通常,计算机程序可以用于这样的计算。比较和比对序列对的程序,如ALIGN(Myers和Miller,1988)、FASTA(Pearson和Lipman,1988;Pearson,1990)和缺口的(gapped)BLAST(Altschul等,1997)、BLASTP、BLASTN或GCG(Devereux等,1984)也可以用于这个目的。此外,欧洲生物信息研究所的Dali服务器提供基于结构的蛋白序列比对(Holm,1993;1995;1998)。
通过提供参考点,可以使用具有默认参数(如在GENESTREAM网络服务器,IGH,蒙彼利埃,法国的互联网上可以利用的)的ALIGN程序测定根据本发明的具有70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%同源性或序列一致性的序列。
“至少适度严格杂交条件”意思是促进溶液中两个互补核酸分子之间选择性杂交的条件。杂交可以发生于全部或部分核酸序列分子。所述杂交部分的长度典型地是至少15(如20、25、30、40或50)个核苷酸。本领域技术人员将意识到核酸二倍体或杂交体的稳定性由Tm决定,所述Tm在包含钠的缓冲液中由钠离子浓度和温度决定(Tm=81.5℃-16.6(Log10[Na+])+0.41(%(G+C)-600/1)或相似的等式)。因此,决定杂交体稳定性的清洗条件的参数是钠离子浓度和温度。为了鉴定与已知核酸分子相似但不相同的分子,可以假定1%的错配,导致Tm降低大约1℃。例如,如果寻找的核酸分子具有>95%的一致性,最终的清洗温度将减少大约5℃。基于这些考虑,本领域技术人员将能够容易地选择合适的杂交条件。在优选的实施方式中,选择严格杂交条件。例如,可以使用以下条件以完成严格杂交:基于上述等式,在Tm-5℃、5×氯化钠/柠檬酸钠(SSC)/5×Denhardt′s溶液/1.0%SDS下杂交,然后在60℃、0.2×SSC/0.1%SDS下清洗。适度严格杂交条件包括在42℃、3×SSC下的清洗步骤。进一步举例,“杂交”的序列是在非严格条件(如室温,6×SSC,50%甲酰胺)结合(杂交)的并在低严格条件(如室温、2×SSC,更优选地42℃、2×SSC)或更高严格条件(如65℃、2×SSC)下清洗的那些序列(其中,SSC=0.15MNaCl、0.015M柠檬酸钠,pH7.2)。
但是,应当理解,可以使用选择性的缓冲液、盐和温度实现相当的严格度。关于杂交条件的其它指导可以在Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,N.Y.,1989,6.3.1-6.3.6和Sambrook等,分子克隆,实验室手册,冷泉港出版社,1989,卷3中找到。
一般而言,优选在高严格度条件下杂交的序列,如若不是密码子简并,在高严格度条件下杂交的序列。
在其它优选的实施方式中,提供比初始抗CCR4抗体(如17G、9E、1O、11F、9E10J或9E1D)具有改进或更优越性质的二代抗体。例如,所述二代抗体具有更强的结合CCR4的亲和力、更好的交叉反应性、更好的靶定CCR4+细胞(特别是肿瘤细胞)的能力、改进的诱导ADCC的能力、改进的诱导CDC的能力、改进的对本文其它地方描述的紊乱的治疗能力。
使用如本文或本领域详细描述的一种或多种分析法可以容易地进行和量化用于鉴定有效的二代抗体的比较。与本发明的抗CCR4抗体(如17G、9E、1O、11F、9E10J或9E1D抗体)相比,具有至少2倍、5倍、10倍、20倍和优选地至少50倍的改进的生物学性质或活性的二代抗体包括在本发明中。
本发明的抗体、结合蛋白和核酸分子通常是“分离的”或“纯化的”分子范围,因为它们与在人和动物体或源自人或动物体的组织样品中原位存在的任何这样的成分不同。但是。所述序列可以与在人或动物体中发现的序列相应或基本同源。因此,本文使用的涉及核酸分子或序列和蛋白或多肽(如抗体)的术语“分离的”或“纯化的”表示从它们的天然环境中分离、纯化或基本游离的分子,如从人或动物体分离或纯化的分子(如果真正地,它们天然发生),或表示由技术方法产生的分子,即包括重组体和合成产生的分子。
因此,当与核酸分子联合使用时,这样的术语可以表示基本上没有材料的核酸,所述材料天然地与其它核酸/基因或多肽联合。这些术语也可以表示当由重组DNA技术产生时基本上没有细胞物质或培养基的核酸,或当化学合成时基本上没有化学前体或其它化学物质的核酸。分离的或纯化的核酸也可以是基本上没有在源自的核酸中与所述核酸天然侧翼连接的序列(即位于所述核酸的5’或3’末端的序列)或由例如基因工程方法连接至核酸侧翼的序列(如标签序列或没有治疗价值的其它序列)。
因此,当与本发明的蛋白或多肽分子如轻链CDR1、2和3、重链CDR1、2和3、轻链可变区、重链可变区和结合蛋白或抗体(包括全长抗体)联合使用时,术语“分离的”或“纯化的”典型地指基本上没有它所源自的来源的细胞物质或其它蛋白的蛋白。在一些实施方式中,特别是当所述蛋白应用于人或动物时,当由重组技术产生时,这样的分离的或纯化的蛋白基本上没有培养基;或者当化学合成时,这样的分离的或纯化的蛋白基本上没有化学前体或其它化学物质。这样的分离的或纯化的蛋白也可以是无侧翼序列的,如上述关于分离的核酸分子所描述的那些。
本文使用的术语“核酸序列”或“核酸分子”指天然存在的碱基、糖和糖之间(骨架)连接键组成的核苷酸或核苷酸单体序列。该术语同样包括含有非天然存在的单体的修饰的或取代的序列或它们的一部分。本发明的核酸序列可以是脱氧核糖核酸序列(DNA)或核糖核酸序列(RNA)且可以包括天然存在的碱基,包括腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。这些序列也可以包含修饰的碱基。这样修饰的碱基的例子包括氮杂和脱氮杂腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶,以及黄嘌呤和次黄嘌呤。所述核酸分子可以是双链或单链的。所述核酸分子可以是全部地或部分地合成或重组。
在优选实施方式中,本发明的抗体是人抗体,更优选地是全长人抗体。在这点上,人抗体对于人类治疗通常具有至少三个潜在优势。第一,人免疫系统不会将所述抗体识别为外来物质。第二,在人体循环中的半衰期将与天然发生在人体中的半衰期相似,使得可以给予较小的和更少频率的剂量。第三,由于所述效应器是人,它将与人免疫系统的其它部分更好地相互作用,例如通过补体依赖的细胞毒性(CDC)或抗体依赖的细胞毒性(ADCC)更有效地破坏靶细胞。
但是,尽管人抗体通常被认为表现这些优势,已知开发具有足够亲和力和合适功能性质以使得它们作为成功的人类治疗的候选物的人类抗体绝不是简单的。因此本领域仍然缺失用于人类安全或有效治疗的抗CCR4抗体,并提出开发这样的试剂的挑战。
本文中与抗体分子和结合蛋白联合使用的术语“人”首先指具有可变区(如VH、VL、CDR或FR区)和可选的抗体恒定区、分离自或源自人类部分或源自或相应于在人中(如在人生殖细胞或体细胞中)发现的序列的抗体和结合蛋白。17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D抗体是这样的人抗体分子的例子,其中所述可变区已经分离自人部分。
本发明的“人”抗体和结合蛋白进一步包括不是由人序列编码的氨基酸残基,如体外随机引入的突变或定位突变,例如通过体外克隆或PCR引入的突变。这样突变的具体例子是包括在所述抗体或结合蛋白的小数量残基中的保守取代或其它突变的突变,如在所述抗体或结合蛋白的5、4、3、2或1个残基中或在构成所述抗体或结合蛋白的一个或多个CDR的5、4、3、2或1个残基中。一些这样的“人”抗体的例子包括已经进行过标准的修饰技术以减少潜在的免疫原性位点的数量的抗体和可变区。
因此,本发明的“人”抗体包括源自人的序列和涉及在人中发现的序列,但是可能没有天然存在于体内人抗体种系部分。此外,本发明的人抗体和结合蛋白包括含有从人序列中鉴定的人共同序列或与人序列基本同源的序列的蛋白。
此外,本发明的人抗体和结合蛋白不限于VH、VL、CDR或FR区的组合,已发现所述VH、VL、CDR或FR区在人抗体分子中是组合的。因此,本发明的人类抗体和结合蛋白可以包括或对应于这些区的组合,所述组合并不需要在人类中天然存在。
在优选实施方式中,所述人类抗体是完全人抗体。如本文中使用的,“完全人”抗体是包括如上所定义的“人”可变区域和/或CDR的抗体,基本上没有非人抗体序列或没有任何非人抗体序列。例如,包括人可变区域和/或CDR、“基本上没有非人抗体序列”的抗体是其中仅多至5、4、3、2或1个氨基酸不是由人类抗体序列编码的抗体、域和/或CDR。因此,“完全人”抗体不同于“人源化”抗体,所述“人源化”抗体基本上基于非人类可变区域,如小鼠可变区域,其中一些氨基酸已经变化以更好地与一般在人抗体中存在的氨基酸保持一致。
本发明的“完全人”抗体可以是没有任何其它实质抗体序列的人可变区域和/或CDR,如可以是单链抗体。可选地,本发明的“完全人”抗体可以是与一个或多个人类抗体恒定区整合或可操作连接的人类可变区域和/或CDR。一些优选的完全人抗体是具有完全IgG恒定区的IgG抗体。
在其它实施方式中,本发明的“人类”抗体将是部分的人类嵌合抗体。如本文中所使用的,“部分的人类嵌合”抗体是包括可操作地连接至或接枝至非人类(如大鼠或小鼠)的恒定区的“人类”可变区域和/或CDR的抗体。这样的部分人类嵌合抗体可以用在例如临床前研究中,其中所述恒定区将优选地是与在临床前检测中使用的相同动物的恒定区。这些部分人类融合抗体也可以用在例如体外诊断中,其中所述非人类物种的恒定区可以提供抗体探测的额外选择。
本文使用的术语“片段”指生物学相关的片段,如对抗原结合有作用的片段,例如形成部分的抗原结合位点,和/或对抑制或减少CCR4抗原功能有作用的片段。一些优选的片段包括本发明抗体的重链可变区(VH域)和/或轻链可变区(VL域)。一些优选的片段包括本发明的抗体的一个或多个重链CDR(或本发明的VH域)或本发明的抗体的一个或多个轻链CDR(或本发明的VL域)。一些优选的片段是至少5个氨基酸长度并包括至少一个CDR区、优选地CDR3区、更优选地重链CDR3区。
在一些实施方式中,其中本发明的抗体包括任何定义序列的片段(如包括SEQ ID NO:35、46、57、68、104或114的片段),如是包括本发明的VH和/或VL域的抗体,或是包括本发明的一个或多个CDR的抗体或结合蛋白,这些区/域通常在所述抗体或结合蛋白中分离,使得每一个区/域实施它的生物学功能并因此保留结合抗原的作用。因此,所述VH和VL域优选地由合适的支架(scaffold)序列/连接片段序列分开,CDR优选地由合适的框架区分开,所述框架区如在自然存在的抗体和/或有效构建的抗体中所发现的那些。因此,本发明的VH、VL和个别的CDR序列优选地位于合适的框架或支架内或与合适的框架或支架组合以使得抗原结合。这样的框架序列或区可以对应于自然存在的框架区、FR1、FR2、FR3和/或FR4,在适当的情况下以形成合适的支架;或可以对应于如通过比较多个自然存在的框架区所鉴定的共有框架区。可选地,可以使用非抗体支架或框架,如T细胞受体框架。
可以用于框架区的合适序列在本领域是公知的并有文献记载的,且可以使用它们中的任意一种。由于框架区的优选序列是构成本发明的VH和/或VL域的一个或多个(即1、2、3或4个)框架区,即一个或多个在表1、2、3或4中公开的框架区,或与其基本同源的框架区,特别是能够保持抗原特异性的框架区,例如导致所述抗体基本上一样或一样的3D结构的框架区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:30、31、32和33)和/或可变重链(SEQ ID NO:25、26、27和28),在适当的情况下,SEQ ID NO:35(同样在表1中显示)的FR区或与其基本同源的FR区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:41、42、43和44)和/或可变重链(SEQ ID NO:36、37、38和39),在适当的情况下,SEQ ID NO:46(同样在表2中显示)的FR区或与其基本同源的FR区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:41、42、43和44)和/或可变重链(SEQ ID NO:36、37、102和39),在适当的情况下,SEQ ID NO:103的FR区或与其基本同源的FR区。特别优选的实施方式是其中存在SEQ ID NO:102或与其基本同源的序列的重链FR区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:107、109、111和44)和/或可变重链(SEQ ID NO:36、37、38和39),在适当的情况下,SEQ IDNO:114的FR区或与其基本同源的FR区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:52、53、54和55)和/或可变重链(SEQ ID NO:47、48、49和50),在适当的情况下,SEQ ID NO:57(同样在表3中显示)的FR区或与其基本同源的FR区。
在一些优选实施方式中,在本发明的抗体中存在全部四个可变轻链(SEQ ID NO:63、64、65和66)和/或可变重链(SEQ ID NO:58、59、60和61),在适当的情况下,SEQ ID NO:68(同样在表4中显示)的FR区或与其基本同源的FR区。
此外,尽管本发明的优选抗体由本发明的VH、VL或CDR构成,应当注意,本发明的抗体同样包括一个或多个本发明的VH、VL或CDR和非本发明的其它VH、VL或CDR的组合,条件是仍然存在本文所列出的本发明抗体的结合CCR4的性质或抗CCR4的性质。
本文使用的术语“重链互补决定区”(“重链CDR”)指抗体分子中重链可变区(VH域)内的超可变区。所述重链可变区从氨基端到羧基端有三个CDR,定义为重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3。所述重链可变区同样具有四个框架区(从氨基端到羧基端为FR1、FR2、FR3和FR4)。这些框架区分开了CDR。
本文使用的术语“重链可变区”(VH域)指抗体分子的重链可变区。
本文使用的术语“轻链互补决定区”(“轻链CDR”)指抗体分子中轻链可变区(VL域)内的超可变区。所述轻链可变区从氨基端到羧基端有三个CDR,定义为轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3。所述轻链可变区同样具有四个框架区(从氨基端到羧基端为FR1、FR2、FR3和FR4)。这些框架区分开了CDR。
本文使用的术语“轻链可变区”(VL域)指抗体分子的轻链可变区。
应当注意的是,在必要时,本文服从Kabat命名法,以定义CDR的位置(Kabat等,1991,通过参考的方式明确地结合至本文)。
本领域技术人员将知道,本发明的蛋白和多肽,如轻链CDR和重链CDR、轻链可变区和重链可变区、抗体、抗体片段和免疫交联物可以以本领域已知和描述的几种方法的任何一种进行制备,但是最优选地是使用重组方式制备。
编码本发明抗体的轻链可变区和重链可变区的核酸片段可以源自或产生自任何合适的方法,如通过克隆或合成。可以使用本领域公知和描述的方法来制备这样的序列,例如从如人种系基因中克隆合适的序列然后对这些种系序列进行任何必要的修饰以获得本发明的序列。一种可选择的即更有效的方法可以是合成合适的轻链可变区序列或重链可变区序列作为重叠引物,然后使用引物延伸以获得全长序列。然后可以通过PCR使用引物扩增所述全长序列,所述引物包含用于进一步克隆和处理(如克隆至合适的表达载体中)的合适的酶切位点。每个可变区5-7条重叠引物通常是足够的,从而使得该技术非常有效和精确。
一旦已经获得了编码本发明抗体的轻链可变区和重链可变区的核酸片段,这些片段可以进一步用于标准重组DNA技术的处理,例如以将可变区片段转换成具有合适恒定区域的全长抗体分子,或转换成本文其它地方描述的具体形式的抗体片段,如Fab片段、scFv片段等。代表性地,或作为该进一步处理过程的一部分,所述编码本发明抗体分子的核酸片段通常合并在合适的表达载体中以促进本发明抗体的产生。
可能的表达载体包括但不限于,粘粒、质粒或修饰的病毒(如复制缺陷性逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒),只要所述载体能够与使用的宿主细胞适合。所述表达载体“适于宿主细胞的转化”,意思是所述表达载体包含本发明的核酸分子和基于用于表达的宿主细胞所选择的调节序列,所述调节序列与所述核酸分子可操作地连接。可操作地连接意味着表示所述核酸以允许核酸表达的方式与调节序列连接。
本发明因此预期一种重组表达载体,所述重组表达载体包含本发明的核酸分子或其片段,和用于转录和翻译由本发明的核酸分子编码的蛋白序列所必需的调节序列。
合适的调节序列可以源自多种来源,包括细菌、真菌、病毒、哺乳动物或昆虫的基因(如,见Goeddel,1990中描述的调节序列)。合适的调节序列的选择取决于下面描述的选择的宿主细胞,且本领域普通技术人员可以容易地完成。这样的调节序列的例子包括:转录启动子和增强子或RNA聚合酶结合序列,包括翻译起始信号的核糖体结合序列。此外,取决于所选择的宿主细胞和使用的载体,可以将其它序列如复制起点、额外的DNA限制酶切位点、增强子和赋予转录可诱导性的序列合并在所述表达载体中。
本发明的重组表达载体也可以包含促进选择转化或转染有本发明的重组分子的宿主细胞的选择性标记物基因。所述选择性标记物基因的例子是编码以下蛋白的基因:赋予对一些药物具有抗性的新霉素和潮霉素、β-半乳糖苷酶、氯霉素乙酰转移酶、萤火虫萤光素酶、或免疫球蛋白或其部分,如免疫球蛋白(优选地IgG)的Fc部分。选择性标记物基因的转录由选择性标记物蛋白的浓度变化监测,所述选择性标记物蛋白是如β-半乳糖苷酶、氯霉素乙酰转移酶或萤火虫荧光素酶。如果选择性标记物基因编码赋予抗生素抗性(如新霉素抗性)的蛋白,可以用G418选择转化株细胞。已经合并了选择性标记物基因的细胞将存活,而其它细胞死亡。这使得可以看见并分析本发明的重组表达载体的表达,特别是测定突变对表达和表型的作用。将意识到,可以将所述选择性标记物引入至与目标核酸分开的载体上。
所述重组表达载体可以包含表达融合基团的基因,所述融合基团增加了所述重组蛋白的表达,增加了重组蛋白的可溶性,并通过在亲合纯化中作为配体(例如,可以存在使得进行纯化和/或鉴定的适当的“标签”,如组氨酸标签或myc标签)增加了目标重组蛋白的纯化。例如,可以将蛋白水解的分解位点添加至目标重组蛋白以使得在纯化所述融合蛋白之后将所述重组蛋白从融合基团中分离。典型的融合表达载体包括pGEX(Amrad Corp.,Melbourne,澳大利亚)、pMal(新英格兰生物实验室,Beverly,MA)和pRIT5(Pharmacia,Piscataway,NJ),它们分别将谷胱甘肽S转移酶(GST)、麦芽糖E结合蛋白或蛋白A融合至重组蛋白中。
可以将重组表达载体引入至宿主细胞中以产生转化的宿主细胞。术语“转化有”、“转染有”、“转化”和“转染”意味着包括通过本领域已知的多种可能的技术之一将核酸(如载体)引物至细胞中。本文使用的术语“转化的宿主细胞”意味着同样包括已经转化有本发明的重组表达载体的能够糖基化的细胞。可以通过如电穿孔或氯化钙介导的转化将核酸转化至原核细胞。例如,可以通过常规技术,如磷酸钙或氯化钙共沉淀、DEAE-右旋糖苷介导的转染、脂质转染法、电穿孔或显微注射法将核酸引入至哺乳动物细胞中。用于转化和转染宿主细胞的合适方法可以在Sambrook等,1989和其它实验室教科书中找到。
合适的宿主细胞包括广泛多种的真核宿主细胞和原核细胞。例如,本发明的蛋白可以在酵母细胞或哺乳动物细胞中表达。其它合适的宿主细胞可以在Goeddel,1990中找到。此外,本发明的蛋白可以在原核细胞如大肠杆菌中表达(Zhang等,2004)。
适于完成本发明的酵母和真菌宿主细胞包括但不限于:啤酒酵母(Saccharomycescerevisiae)、毕赤酵母属(Pichia)或克鲁维酵母属(Kluyveromyces)和曲霉属(Aspergillus)的多个种。在酵母菌啤酒酵母(S.cerevisiae)中表达的载体的例子包括pYepSec1(Baldari.等,1987)、pMFa(Kurjan和Herskowitz,1982)、pJRY88(Schultz等,1987)和pYES2(InvitrogenCorporation,San Diego,CA)。用于转化酵母和真菌的方案是本领域普通技术人员熟知的(见Hinnen等,1978;Ito等,1983,和Cullen等,1987)。
适于完成本发明的哺乳动物细胞包括:COS(如ATCC No.CRL 1650或1651)、BHK(如ATCC No.CRL 6281)、CHO(ATCC No.CCL 61)、HeLa(如ATCC No.CCL 2)、293(ATCC No.1573)、NS-1细胞、NS0(ATCC CRL-11177)和Per.C6
(Crucell,Leiden,荷兰)。引导在哺乳动物细胞中表达的合适的表达载体通常包括启动子(如来自于病毒物质,如多瘤病毒、腺病毒2、细胞巨化病毒和猿病毒40),以及其它转录和翻译控制序列。哺乳动物表达载体的例子包括pCDM8(Seed,B.,1987)和pMT2PC(Kaufman等,1987)。
根据本文提供的教导,同样可以容易地实现用于将合适类型的表达载体引入至植物、鸟和昆虫细胞中的启动子、终止子和方法。例如,在一个实施方式中,本发明的蛋白可以从植物细胞中表达(见Sinkar等,1987,其综述了毛根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)载体的应用;同样见Zambryski等,1984,其描述了用于植物细胞表达载体的应用,所述载体包括PAPS2022、PAPS2023和PAPS2034等)。
适于实现本发明的昆虫细胞包括来自家蚕、Trichoplusia或Spodotera种的细胞和细胞系。适于在培养的昆虫细胞(SF9细胞)中表达蛋白的杆状病毒载体包括pAc系列(Smith等,1983)和pVL系列(Luckow和Summers 1989)。PCT/US/02442中描述了一些适于表达本发明的重组蛋白的杆状病毒-昆虫细胞表达系统。
可选地,同样可以在非人类的转基因动物如大鼠、兔子、绵羊和猪中表达本发明的蛋白(Hammer等,1985;Palmiter等,1983;Brinster等,1985;Palmiter和Brinster 1985,以及U.S.专利号4,736,866)。
同样可以使用蛋白质化学领域内公知的技术通过化学合成法制备本发明的蛋白,如固相合成法(Merrifield(1964);Frische等;1996)或在均质溶液中合成。
可以利用重组技术通过融合制备N-末端或C-末端融合蛋白,所述融合蛋白包括与其它分子如蛋白结合的本发明抗体和蛋白。得到的融合蛋白包含本发明的抗体或蛋白,所述抗体或蛋白与选择的蛋白或标记物蛋白或本文描述的标签蛋白融合。同样可以通过公知技术将本发明的抗体和蛋白与其它蛋白结合。例如,可以使用包含双异官能硫醇的连接体将所述蛋白化学结合,所述连接体如在WO 90/10457中所描述的、N-琥珀酰亚胺基-3-(2-吡啶二硫代-丙酸酯)或N-琥珀酰亚胺基-5硫代乙酸酯。可以用于制备融合蛋白或结合物的蛋白质的实例包括细胞结合蛋白如免疫球蛋白、激素、生长因子、植物血凝素、胰岛素、低密度脂蛋白、胰高血糖素、内啡肽、铁传递蛋白、蛙皮素、唾液酸糖蛋白、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、红血球凝集素(HA)和截短型的myc。
不考虑制备第一个抗CCR4抗体核酸片段的方式,可以通过标准的分子生物学技术容易地制备更多的合适的抗体核酸片段。为了确认任何变异体、突变体或二代抗CCR4抗体核酸片段适于在本发明中使用,将检测核酸片段以确认根据本发明的抗CCR4抗体的表达。优选地将在标准的、更优选地标准严格杂交条件下检测所述变异体、突变体或二代核酸片段以确认杂交。例示的合适的杂交条件包括在大约50℃、大约7%十二烷基硫酸钠(SDS)、大约0.5M NaPO4、大约1mM EDTA条件下杂交,并在42℃下用大约1%SDS清洗。
由于可以容易地制备多种抗体,可以通过对动物或病患提供至少第一个核酸片段或分子以实行本发明的治疗方法,所述第一个核酸片段或分子在病患体内表达生物学有效量的至少第一个本发明的抗CCR4抗体。所述“表达抗CCR4抗体的核酸片段或分子”通常将是以至少一种表达构建体或载体的形式,和可以是以包含在病毒或包含在重组宿主细胞内的表达构建体或载体的形式。本发明的优选基因治疗载体通常将是病毒载体,如重组逆转录病毒、单纯疱疹病毒(HSV)、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、细胞巨化病毒(CMV)等等。
另一方面提供一种包含一种或多种本发明的核酸片段或分子的表达构建体或表达载体。优选地,所述表达构建体或载体是重组的。优选地,所述构建体或载体进一步包括用于转录和翻译由本发明的核酸分子编码的蛋白序列的必需的调节序列。
另一方面提供一种包含一种或多种本发明的表达构建体或表达载体的宿主细胞或病毒。还提供包含一种或多种本发明的核酸分子的宿主细胞或病毒。表达本发明抗体的宿主细胞或病毒构成了另一方面。
本发明的另一方面提供一种生产本发明抗体的方法,所述方法包括培养本发明宿主细胞的步骤。优选的方法包括步骤:(i)在适于表达编码的抗体或蛋白的条件下培养宿主细胞,所述宿主细胞包含一种或多种本发明的重组表达载体或一种或多种本发明的核酸序列;以及可选地(ii)从宿主细胞或培养基/上清液中分离或获得所述抗体或蛋白。这样的生产方法同样可以包括纯化所述抗体或蛋白产物的步骤和/或将所述抗体或产物配制在包括至少一种其它成分(如药物学可接受的载体或赋形剂)的组合物中。
在本发明的抗体或蛋白由多于一种多肽链(例如Fab片段的一些片段)组成的实施方式中,所有的多肽优选地在宿主细胞中(从相同或不同的表达载体)表达,则所述完整蛋白(如本发明的结合蛋白)可以在所述宿主细胞中聚集并从宿主细胞中分离或纯化。
本发明的抗体同样可以用于生产结合CCR4的其它抗体。这样的应用包括例如在亲本抗体的氨基酸序列中添加、缺失、取代或插入一个或多个氨基酸以形成新的抗体,其中所述亲本抗体是如在本文其它地方描述的本发明的一种抗体,并检测得到的新抗体以鉴定结合CCR4的抗体。这样的方法可以用于形成多样的新抗体,可以检测所有抗体结合CCR4的能力。
优选地,所述添加、缺失、取代或插入一个或多个氨基酸发生在一个或多个CDR域。
可以使用本领域公知和文献记载的技术以任何合适的方式实现对亲本抗体的这样的修饰或突变,例如通过随机突变或定向突变的方法完成。如果使用定向突变,则鉴定用于突变形成的合适残基的一种方式利用结合蛋白-抗原复合物(如Ab-Ag复合物)的结晶结构的分辨力(resolution)以鉴定涉及抗原结合的关键残基(Davies和Cohen,1996)。然后,突变这些残基以提高交互作用。可选地,可以简单地靶定用于定向突变的一个或多个氨基酸残基并评估结合CCR4的效果。
可以以任何合适方式实现随机突变,例如,通过易错PCR、链改组或突变体大肠杆菌菌株实现。
因此,本发明的一个或多个VH域可以与来自任何合适来源的单一的VL域或全部的VL域结合,并检测得到的新抗体以鉴定特异于CCR4的抗体。相反地,本发明的一个或多个VL域可以与来自任何合适来源的单一的VH域或全部的VH域结合,并检测得到的新抗体以鉴定结合CCR4的抗体。
相似地,在适当情况下,本发明VH和/或VL域的一个或多个或优选地全部三个CDR可以接枝于单一VH和/或VL域或全部的VH和/或VL域,并检测得到的新抗体以鉴定结合CCR4的抗体。
已经显示,CDR,特别是轻链和/或重链的CDR3的定向突变是增加抗体亲和力的有效技术,并且是优选的。优选地,封闭CDR3或被称为“热点”的特异区的3-4个氨基酸作为突变形成的目标。
“热点”是体内发生体细胞高度突变的序列(Neuberger和Milstein,1995)。所述热点序列可以被定义为一些密码子中的共同核苷酸序列。所述共同序列是四核苷酸RGYW,其中R可以是A或G,Y可以是C或T,W可以是A或T(Neuberger和Milstein,1995)。此外,相比于由对应于潜在热点序列的TCN编码的丝氨酸,由核苷酸AGY编码的丝氨酸残基主要地存在于可变区的CDR域(Wagner等,1995)。
因此,可以扫描本发明每一个抗体的重链CDR和轻链CDR的核苷酸序列是否存在热点序列和AGY密码子。然后可以可选地使用国际ImMunoGen Tics数据库(IMGT1http://imgt.cines.fr/textes/vquest/)将轻链CDR域和重链CDR域的鉴定的热点与重链和轻链的原始序列进行比较(Davies等,1990)。与种系相同的序列暗示没有发生体细胞突变。因此,可以模拟体内发生的体细胞突变引入随机突变或可选地,在热点和/或AGY密码子处发生定点突变。相反,一种不同序列显示已经发生体细胞突变。仍然需要确定体内体细胞突变是否是最佳的。
用于突变的优选热点是编码暴露的氨基酸的那些,且优选地编码形成部分抗原结合位点的氨基酸的那些。用于突变的其它优选热点是编码非保守氨基酸的那些。优选地,不突变编码CDR内的包埋氨基酸或保守氨基酸的热点。这些残基对于整体结构通常是关键地,且由于它们是包埋的,它们不太可能与抗原相互作用。
实现上述氨基酸和蛋白质域操作的方式是本领域技术人员熟知的。例如,上述操作可以在核酸水平通过遗传工程便利地实现,其中编码合适结合蛋白和它们的域的核酸分子被修饰以使得得到的表达蛋白的氨基酸序列以合适的方式顺次被修饰。
检测一种或多种抗体特异结合CCR4的能力可以通过任何合适的方式实现,这些方式在本领域是公知的并有文献记载的。可以从培养收集物中获得CCR4+细胞系,或可以通过用使得重组CCR4表达的构建体转化CCR4阴性细胞制备CCR4+细胞系。这些细胞或固定的CCR4可以通过常规方法如ELISA、BiaCon等容易地用于分析结合。
由这些方法生产的新抗体将优选地具有提高的功能性质,如对于CCR4比亲本抗体具有更高或改进的亲和力(或至少相当的亲和力),并可以以与本发明其它地方描述的本发明抗体相同的方式治疗和使用(例如,用于治疗、诊断、组合物中等)。可选地或其它地,所述新抗体将具有一个或多个在本文其它地方描述的其它提高的功能性质。
由这些方法产生、获得或可获得的新抗体形成本发明的另一方面。
本发明进一步提供包含至少一种本发明的人类抗体或抗体片段的组合物,可选地包括一种稀释剂。这样的组合物可以是药物学可接受的组合物或用于实验室研究的组合物。在药物组合物这方面,它们可以优选地被配制成肠胃外、静脉内或甚至皮下给药。
本发明提供本发明的人类抗体和抗体片段的一些方法和应用。关于所有方法,除非另有明确的说明,术语“一个(种)”用于表示所述方法中“至少一个(种)”、“至少第一个(种)”、“一个(种)或多个(种)”或“多个(种)”步骤。这与治疗方法中的给药步骤特别相关。因此,不仅仅可以使用本发明的不同剂量,也可以使用例如注射的不同剂量数,达到和包括多种注射。在施用抗CCR4治疗抗体之前、之后或期间可以使用组合的治疗。
提供具有重要的生物学暗示的本发明抗体或免疫交联物的多种体外有用的方法和应用。首先提供的是结合CCR4的方法和在结合CCR4中的应用,所述方法通常包括用本发明的至少第一种抗CCR4抗体或其抗原结合片段有效地接触包含CCR4的组合物。本发明的抗体或其免疫交联物可以因此用于结合分析中。合适地有用的结合分析包括本领域中一般使用的那些,如免疫印迹技术、蛋白质印迹、斑点印迹、RIA、ELISA、免疫组织化学法、荧光激活细胞分离技术(FACS)、免疫沉淀反应、亲和色谱法等。
提供检测CCR4的方法和在检测CCR4中的应用,所述方法或应用通常包括在有效允许CCR4/抗体复合物形成的条件下用本发明的至少第一个抗体或免疫交联物或它们的抗原结合片段接触怀疑含有CCR4的组合物,并检测形成的复合物。所述检测方法和应用可以与生物学样品联合使用,如诊断肿瘤;还提供基于此的诊断试剂盒。
本发明的方法和应用特别计划用于患有疾病或状况或处于疾病或状况发展的风险的动物和病患,所述疾病或状况与CCR4表达或活性相关或其中CCR4具有生物学作用。这样的疾病和状况包括由CCR4阳性细胞(典型地CCR4+、Th2或Th17细胞)介导的疾病,在结合CCR4配体后,所述细胞可以参与将引起紊乱或疾病或对紊乱或疾病有作用的信号转导途径。它们也包括由表达CCR4细胞的异常增殖引起的疾病。这样异常增殖的细胞可以是自然的CCR4+,或者它们可以是已经突变或转化的以表达CCR4。如上描述的,CCR4的表达可以帮助癌症细胞表达该抗原以躲避免疫系统。因此,提供了治疗由CCR4介导的和/或由CCR4阳性细胞的异常增殖所表征的疾病或紊乱的方法。
从另一方面看,提供了状况的治疗,其可以获益于以下的一种或多种:
(i)选择性消除CCR4+细胞;
(ii)抑制CCR4与一个或多个它的配体结合;
(iii)抑制CCR4介导的对CCR4配体的细胞反应,特别是抑制趋化作用或增加的细胞内钙离子浓度(细胞活化)。
优选地,所述CCR4配体是MDC和/或TARC。
本领域普通技术人员已知,由于CCR4涉及在广泛范围的疾病和紊乱中,一旦显示提供的抗CCR4治疗对任何可接受的模型系统有效,则该抗CCR4治疗可以用于治疗与CCR4表达相关的全部范围的疾病和紊乱。
在一种实施方式中,所述CCR4介导的状况是2型T辅助细胞介导的免疫疾病。“2型T辅助细胞介导的免疫疾病”的意思是涉及由于过敏原特异的Th2细胞的显现和激活的免疫球蛋白E(IgE)和肥大细胞的疾病。
CCR4介导的疾病或紊乱可以是与炎症、感染和/或癌症相关的疾病或状况。这样的疾病或紊乱可以用本发明的抗体和组合物治疗或预防。优选的疾病或状况包括:(1)过敏性疾病,如全身过敏或超敏反应、药物过敏症、过敏性支气管肺曲霉病(ABPA)、虫刺过敏症和食物过敏症;(2)炎性肠疾病,如克罗恩氏病、溃疡性结肠炎、回肠炎和肠炎;(3)阴道炎;(4)牛皮癣和炎症性皮肤病,如皮炎、湿疹、遗传过敏性皮炎、过敏性接触皮炎、风疹和瘙痒症;(5)血管炎;(6)脊柱关节病;(7)硬皮病;(8)哮喘和呼吸过敏性疾病,如过敏性哮喘、过敏性鼻炎、慢性阻塞性肺病、超敏肺疾病等等;(9)自身免疫疾病,如关节炎(包括风湿性的和牛皮癣的)、多发性硬化、系统性红斑狼疮、I型糖尿病、肾小球性肾炎等等;(10)移植排斥(包括同种异体移植排斥和移植物抗宿主病)和(11)其中不期望的炎症反应需要被抑制的其它疾病,如动脉硬化、肌炎、T细胞介导的神经变性疾病、多发性硬化、脑炎、脑膜炎、肝炎、肾炎、脓毒病、结节病、过敏性结膜炎、耳炎、卡斯托曼病、窦炎、LPS诱导的内毒素休克、白塞病和痛风;(12)癌症,血液癌症和非血液癌症,优选地乳癌、结肠直肠癌、食道癌、胃癌、肝细胞癌、肺癌、黑色素瘤、卵巢癌、胰腺癌、成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATL)、外周T细胞淋巴瘤、非特异的弥漫性大B细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、B细胞慢性淋巴细胞白血病、CTCL、独特地蕈状真菌病、塞扎里综合征、宫颈癌、肾癌、脑癌、前列腺癌、胃癌;(13)传染病,如爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)感染、HIV感染和其它病毒感染。
本发明的抗体与CCR4的结合同样可以削弱CCR4阳性异常细胞(如癌细胞)的能力以躲避宿主免疫系统。本发明的抗体可以用于阻止由Treg细胞引起的DC抑制,因此提供本发明的抗CCR4抗体作为疫苗中的佐剂的应用。所述疫苗优选地适用于癌症或传染性疾病的疫苗。所述疫苗可以是预防性疫苗或治疗性疫苗。“佐剂”的意思是提高宿主对抗原的免疫反应的试剂。当用作疫苗佐剂时,本发明的抗体因此典型地与抗原联合或共同给药,期望抗所述抗原能够引起免疫反应。
如在本文中使用的,术语“异常增殖”意思是偏离正常的、正确的或期望的过程的细胞增殖。例如,异常细胞增殖可以包括细胞不适当的增殖,所述细胞的DNA或其它细胞成分已经被破坏或有缺陷。
异常细胞增殖可以包括细胞增殖,所述细胞增殖的特征与由不适当的高水平细胞分裂、不适当的低水平细胞凋亡或二者所引起、介导或导致的迹象相关。这样的迹象的特征是例如癌的或非癌的,良性的或恶性的细胞、细胞群或组织的单一或多样的局部异常增殖。
本文中任何提及“肿瘤”同样指“癌症”或“癌”。同样可以治疗转移性癌,如同可以减少原发性肿瘤的转移。采用抗CCR4抗体的免疫疗法可能治疗在手术后期病患中留下的被称为微小残留疾病(MRD)。
因此本发明进一步提供治疗上述疾病的方法和在治疗上述疾病的方法中的应用,包括对患有这样疾病的动物或病患施用治疗有效量的本发明的抗CCR4抗体,或这样的抗CCR4抗体的抗原结合片段或免疫交联物。
本发明的另一方面提供了本发明的抗体或这样的抗体的抗原结合片段或免疫交联物在制备用于治疗、成像或诊断的组合物或药物中的应用。
本发明的另一方面提供了在治疗、诊断或成像中应用的本发明的抗体或这样的抗体的抗原结合片段或免疫交联物。
此外,本发明提供组合物,所述组合物包含本发明的抗体或这样的抗体的抗原结合片段或免疫交联物和一种或多种制药学可接受的赋形剂、载体、稀释剂、缓冲液或稳定剂。
本文描述的体内方法通常在哺乳动物中实现。可以处理任何哺乳动物,例如人和任何家畜、家养动物的或实验动物。具体例子包括小鼠、大鼠、猪、猫、狗、绵羊、兔子、母牛和猴子。但是优选地,所述哺乳动物是人。
因此,本文使用的术语“动物”或“病患”包括任何哺乳动物,例如人和任何家畜、家养动物或实验动物。具体例子包括小鼠、大鼠、猪、猫、狗、绵羊、兔子、母牛和猴子。但是优选地,所述动物或病患是人受试者。
本发明联系了使用非结合的或裸露抗体或其片段治疗如上定义的紊乱和CCR4+细胞(优选地CCR4+肿瘤细胞)的方法,所述目标方法使用免疫交联物,其中本发明的抗体或抗原结合片段可操作地连接至治疗试剂。除非另有明确说明或者以科技术语解释,本文中使用的术语“抗体和其片段”因此意味着没有连接至另一种试剂的“未结合或裸露的”抗体或片段,所述试剂优选地是治疗或诊断试剂。这些定义并不排除所述抗体的修饰,如,仅作为示例,所述修饰是提高所述抗体或抗体与其它效应物的组合物的生物半衰期、亲和力、亲合力或其它性质。
本发明的方法和应用同样包括未结合的或裸露的抗体和免疫交联物的应用。在基于免疫交联物的治疗方法中,本发明的抗体或抗原结合片段优选地可操作地连接至第二种治疗试剂(抗CCR4抗体本身是第一种治疗试剂)。所述治疗试剂可以是例如抗癌症试剂或抗炎症试剂,包括皮质类固醇和非类固醇抗炎症药物(NSAID)。
前述的治疗方法和应用将通常包括对动物或病患系统地施用制药学有效的组合物,如通过经皮吸收、肌肉内注射、静脉注射等等。但是,可以接受使得治疗试剂定位在肿瘤位点的任何给药途径。因此,递送的其它合适途径包括口服、经鼻或呼吸和局部的。
本文使用的“给药(或施用)”指以有效发挥治疗效果(如抗肿瘤效果)的量和时间提供或递送抗CCR4抗体治疗。部分地,由于简单和可重复性,似蛋白质治疗的被动给药通常是优选的。
但是,术语“给药(或施用)”在本文中用于表示将本发明的抗CCR4抗体递送或以其它方式提供至靶位点的任意和全部方式。因此,“给药(或施用)”包括以有效递送至靶位点的方式提供产生本发明的抗CCR4抗体的细胞。在这样的实施方式中,可以期望在选择性的可渗透膜、结构或可移植的装置中配制或包裹所述细胞,通常是可以被移除以终止治疗的一种形式。外源的本发明的抗CCR4抗体通常也将是优选地,因为这代表了一种可以严密监视和控制剂量的非侵入性方法。
本发明的治疗方法和应用同样延及提供编码本发明的抗CCR4抗体的核酸,其有效导致所述核酸在肿瘤附近表达或导致所述核酸在靶位点定位。可以使用任何基因治疗技术,如裸露的DNA递送、重组基因和载体、基于细胞的递送、包括体外处理病患细胞等等。
本发明的抗CCR4抗体同样可以用于将其它治疗或诊断试剂递送至靶位点。在这样的实施方式中,实施其它治疗或诊断试剂通常可操作地连接至本发明的抗CCR4抗体。
用在本发明的“治疗有效量”是指本发明的抗CCR4抗体或其免疫交联物的量,在对患有CCR4+肿瘤的动物或病患给药的基础上,所述量可以有效地特异杀死至少一部分靶CCR4+细胞,特异地诱导至少一部分靶CCR4+细胞的细胞凋亡,特异地诱导至少一部分靶CCR4+细胞坏死,抑制CCR4配体与CCR4结合,抑制CCR4介导的对CCR4配体的细胞应答、优选地抑制应答CCR4配体时细胞内钙离子浓度的增加,减少炎症,和/或诱导肿瘤衰退或好转。优选地,当在正常、健康组织中表现出很少结合和不结合、或很少杀死或不杀死细胞,以及对动物或病患的正常、健康组织发挥出可以忽略的或可以处理的副作用时实现这些效果。
“靶位点”是指介导紊乱或以引起或加剧紊乱的异常方式增殖的CCR4+细胞的位置。所述靶位点因此可以例如是肿瘤或CCR4介导的炎症的位点。“靶细胞”是介导紊乱或以引起或加剧紊乱的异常方式增殖的CCR4+细胞。因此,靶细胞可以例如包括CCR4+肿瘤细胞、CCR4+Treg细胞和/或CCR4+Th2细胞。
在本文中涉及的将CCR4+细胞如CCR4+肿瘤细胞杀死或诱导细胞凋亡或诱导细胞坏死或减少炎症或诱导肿瘤衰退或好转的内容中使用的术语“优选地”和“特异地”意思是实现CCR4+靶细胞破坏(如肿瘤细胞破坏和/或肿瘤坏死)的本发明抗CCR4抗体或其免疫交联物实际上被限制被靶位点上,且基本上不扩展引起动物或受试者的正常的、健康的组织破坏和/或组织坏死。
本发明的抗CCR4抗体或治疗结合物优选地连接至一种或多种放射疗法试剂、化学疗法试剂、抗血管新生试剂、诱导细胞凋亡试剂、抗微管蛋白药物、抗细胞或细胞毒性试剂、细胞因子或趋化因子拮抗剂、细胞因子或趋化因子表达抑制剂、ATP酶抑制剂、抗炎症试剂、其它抗体(如双特异性抗体)或凝结剂(凝结因子)或抗炎症试剂如皮质类固醇、优选地糖皮质激素或非类固醇抗炎症药物(NSAID)。
因此本发明提供一系列连接的抗体和其片段,其中所述抗CCR4抗体可操作地连接至至少一种其它的治疗或诊断试剂。术语“免疫交联物”广泛地用于定义所述抗体与另一种有效试剂的可操作的联系,且不意味着单独表示任何类型的可操作的联系,特别是不限于化学“结合”。特别期待的是重组融合蛋白。只要递送或靶定试剂能够与所述目标结合,且在递送的基础上,所述治疗或诊断试剂充分起作用,则连接的模式将是合适的。
同样期待通过抗体上的糖基团连接试剂。O-连接和N-连接的糖基化都是在抗体中天然存在的。如果需要,可以对重组抗体进行修饰以重新产生或产生额外的糖基化位点,这可以通过将合适的氨基酸序列(如天冬酰胺-X-丝氨酸、天冬酰胺-X-苏氨酸、丝氨酸或苏氨酸,其中X是除脯氨酸外的任何氨基酸)加工至所述抗体的原始序列中而简单实现。
目前用于本发明的抗CCR4抗体或治疗结合物和相关方法和应用的优选试剂是补充或提高所述抗体的效果的那些试剂和/或选择用于具体类型紊乱(如肿瘤类型)或病患的那些试剂。
“补充或提高所述抗体的效果的治疗试剂”包括放射疗法试剂、化学疗法试剂、抗血管新生试剂、诱导细胞凋亡试剂、抗微管蛋白药物、抗细胞或细胞毒性试剂、凝结剂、细胞因子或趋化因子拮抗剂、细胞因子或趋化因子表达抑制剂、ATP酶抑制剂、抗炎症试剂如皮质类固醇、优选地糖皮质激素或非类固醇抗炎症药物(NSAID)、其它抗体(如双特异性抗体),优选地它们中的一种或多种可以在此使用。
目前优选的抗癌症、特别是抗白血病试剂包括蒽环霉素药物,如道诺霉素、阿霉素、阿糖胞苷、6-硫鸟嘌呤、米托蒽醌、白消安(Myleran
)、达沙替尼(Sprycel
TM)、强的松、硫酸长春新碱(Oncovin
)、苯丁酸氮芥、氟达拉滨、喷司他丁和克拉屈滨。
目前治疗ATL的优选试剂包括齐多夫定(叠氮胸苷)和CHOP方式。CHOP代表环磷酰胺、羟基道诺霉素(阿霉素)、长春新碱(Oncovin)(长春新碱)、强的松/氢化波尼松。
目前优选的抗血管新生试剂包括血管抑素、内皮抑素、促血管生成素、血管抑制素、人血管生成抑制素和maspin中的任何一种。
本文使用的“抗微管蛋白药物”意思是抑制细胞有丝分裂的任何试剂、药物、前药或其组合物,优选地通过直接或间接抑制细胞有丝分裂所必需的微管蛋白活性(优选地,微管蛋白的聚合或解聚)。目前优选的抗微管蛋白药物包括秋水仙碱、紫杉醇、长春碱、长春新碱、去乙酰长春酰胺和一种或多种的考步他汀(combretastatin)。
目前优选的NSAID包括COX-2抑制剂、磺酰苯胺、利克飞龙(licofelone)和ω-3脂肪酸。
所述优选试剂与本发明的抗CCR4抗体的连接或联系给出了“免疫交联物”,其中这样的免疫交联物通常具有提高的和甚至协同的治疗性质,如抗肿瘤或抗炎症性质。
抗细胞和细胞毒性试剂的应用导致了本发明的抗CCR4抗体“免疫毒素”,然而凝结因子的应用导致本发明的抗CCR4抗体“凝结配体(coaguligand)”。
同样期待至少两种治疗试剂的应用,如一种或多种放射疗法试剂、化学疗法试剂、抗血管新生试剂、诱导细胞凋亡试剂、抗微管蛋白药物、抗细胞和细胞毒性试剂、细胞因子或趋化因子拮抗剂、细胞因子或趋化因子表达抑制剂、ATP酶抑制剂、抗炎症试剂如皮质类固醇、优选地糖皮质激素、或非类固醇抗炎症药物(NSAID)、其它抗体(如双特异性抗体)和凝结剂因子的组合。
在一些实施方式中,本发明的抗CCR4抗体治疗剂将可操作地连接至能够杀死细胞或抑制细胞生长或细胞分裂的细胞毒性试剂、抑制细胞生长试剂或其它的抗细胞试剂。合适的抗细胞试剂包括化学疗法试剂,以及细胞毒素和细胞生长抑制剂。细胞生长抑制剂通常打乱了靶细胞的自然细胞循环,优选地使得所述细胞从细胞循环中去除。
示例性的化学治疗试剂包括:激素,如类固醇;抗代谢物,如阿糖胞苷、氟尿嘧啶、氨甲蝶呤、或氨蝶呤;蒽环霉素;丝裂霉素C;长春花生物碱;抗生素;秋水酰胺;依托泊苷;光神霉素;和抗肿瘤烷化剂,如苯丁酸氮芥或美法仑。一些优选的抗细胞试剂是DNA合成抑制剂,如道诺霉素、阿霉素/亚德里亚霉素等等。大体上,目前优选的抗癌试剂是紫杉酚/紫杉醇、多烯紫杉醇、顺铂、吉西他滨、考步他汀和阿霉素/亚德里亚霉素。
V型ATP酶抑制剂目前同样是优选的,例如水扬酰胺(salicylihalamide)、刀球航霉素或巴弗洛霉素,同样优选的是蛋白合成抑制剂,如psymberin、青腰虫素、irciniastatin A。
由于与其它潜在的治疗试剂相比,大多数毒素具有更强的递送细胞杀伤效应的能力,故在一些治疗应用中,毒素部分将是优选的。因此,用于本发明的抗CCR4抗体构建体的一些优选抗细胞试剂是来源于植物、真菌或细菌的毒素。示例性的毒素包括表鬼臼毒素;细菌内毒素或细菌内毒素的脂质A部分;核糖体失活蛋白,如皂草素或白树毒素;a-八叠球菌;曲霉素;局限曲霉素;核糖核酸酶,如胚胎核糖核酸酶;白喉毒素和假单胞菌外毒素。目前优选的例子是蓖麻毒素、白树毒素、红豆因、白喉、假单胞菌和百日咳毒素。
一些优选的毒素是A链毒素,如蓖麻毒素A链。最优选的毒素基团是已经过修饰或去除糖基残基的蓖麻毒素A链,被称为“去糖基化A链”(dgA)。去糖基化蓖麻毒素A链是优选的,因为它具有极强的潜力、更长的半衰期,且因为制造临床等级和规模是经济上可行的。同样可以使用重组和/或截短的蓖麻毒素A链。
本发明的抗CCR4抗体治疗剂同样可以包括能够促进凝结的成分,即凝结剂。这里,所述靶定抗体可以直接地或间接地(如通过另一种抗体)连接至一种直接或间接刺激凝结的因子。
用于这种应用的优选凝结因子是组织因子(TF)和TF衍生物,如截短的TF(tTF)、二聚体、三聚体、聚合体/多聚体TF和缺乏激活因子VII能力的突变体TF。其它合适的凝结因子包括依赖维生素K的凝结剂,如因子II/IIa、因子VII/VIIa、因子IX/IXa和因子X/Xa;缺乏Gla修饰的依赖维生素K的凝结因子;拉塞尔毒蛇蛇毒因子X活化剂;激活血小板化合物,如凝血噁烷A2和凝血噁烷A2合酶;和纤维蛋白溶解抑制剂,如α2-抗纤维蛋白溶酶。总体而言,目前优选的是截短的组织因子(tTF)。
免疫交联物和免疫毒素的制备是本领域公知的(见,如美国专利号4,340,535)。出于更进一步补充涉及免疫毒素的生产、纯化和应用的教导,通过参考的方式将下述每一项专利进一步结合至本文:美国专利号:6,004,554、5,855,866、5,965,132、5,776,427、5,863,538、5,660,827和6,051,230。
多种化学疗法试剂和其它药理学试剂同样可以成功地连接至本发明的抗CCR4抗体治疗剂。已经连接至抗体的示例性抗肿瘤试剂包括阿霉素、道诺霉素、氨甲蝶呤和长春碱。此外,已经描述了其它试剂如新制癌菌素、大分子霉素、三亚胺醌和α-蝇蕈素的连接(见美国专利号5,660,827、5,855,866和5,965,132,每一篇都结合至本文)。
同样可以容易地实现“凝结配体”的制备。一种或多种凝结因子与本发明的抗CCR4抗体的可操作的联系可以是直接联接,如上面对于免疫毒素所描述的那些。可选地,所述可操作地联系也可以是非直接的连接,如所述抗体可操作地连接至结合凝结因子的第二个结合区,所述第二个结合区优选地是抗体或抗体的抗原结合片段。所述凝结因子应当在与它的功能性凝结位点不同的位置与本发明的抗CCR4抗体连接,特别是使用共价键结合所述分子。
同样可以在本发明的方法中使用双特异性或三特异性抗体。在这样的抗体中,一条臂结合CCR4且是本发明的抗体。制备双特异性抗体的方法是本领域公知的并有文献记载的。
在制备免疫交联物、免疫毒素和凝聚配体中,可以使用重组表达。编码选择的本发明的抗CCR4抗体、治疗试剂、毒素或凝结剂的核酸分子序列在表达载体中框内连接。因此,重组表达导致核酸翻译以产生期望的免疫交联物。化学交联剂和抗生物素蛋白:生物素桥同样可以将治疗试剂和本发明的抗CCR4抗体连接。
本发明的组合物和方法可以与其它治疗剂和诊断剂联合使用。在生物试剂方面,优选地诊断试剂或治疗试剂,与本发明的抗CCR4抗体结合使用,术语“结合”简洁地用于包括一系列实施方式。除非另有明确的说明或以科学术语解释,“结合”术语应用于多种形式的组合的组合物、医药品、鸡尾酒、试剂盒、方法和第一及第二医药用途。
本发明的“结合的”实施方式因此包括,例如其中本发明的抗CCR4抗体是裸露的抗体且与一种不与其可操作地连接的试剂或治疗试剂联合使用。在这样的例子中,所述试剂或治疗试剂可以以非靶定的或靶定的形式使用。在“非靶定的形式”中,所述试剂,特别是治疗试剂,将通常根据本领域的常规应用而使用。在“靶定的形式”中,所述试剂将通常可操作地连接至不同的抗体或靶定区,所述抗体或靶定区将试剂或治疗试剂递送至目标疾病位点。这样靶定形式的生物试剂(诊断剂和治疗剂)的应用在本领域中同样是非常标准的。
在本发明其它的“结合的”实施方式中,本发明的抗CCR4抗体是免疫交联物,其中所述抗体是与所述试剂或治疗试剂可操作地连接或结合的它本身。所述可操作的连接包括如本文中所述的和本领域已知的所有形式的直接和间接的连接。
所述“结合的”应用,特别是涉及本发明的抗CCR4抗体与治疗试剂结合同样包括组合的组合物、医药品、鸡尾酒、试剂盒、方法和第一及第二医药用途,其中所述治疗试剂是前药形式。在这样的实施方式中,所述能够将前药转换成功能性形式的药物的激活成分可以再一次可操作地与本发明的抗CCR4抗体连接。
在一些优选的实施方式中,所述治疗组合物、混合物、医药品、鸡尾酒、试剂盒、方法和第一及第二医药用途将是“前药组合物”。如本领域普通技术人员所理解的,除非有明确说明,术语“前药组合物”意思是本发明的抗体与能够将所述前药转换成活性药物的成分可操作地连接,而不是将抗体与前药本身连接。但是,没有要求本发明的前药实施方式必须用作前药组合物。因此,前药可以以本领域使用的任何方式所使用,包括ADEPT和其它形式。
因此,当描述组合的组合物、医药品、鸡尾酒、试剂盒、方法和第一及第二医药用途时,优选地以诊断试剂形式,更优选地以治疗试剂形式,所述组合物包括是裸露抗体的抗CCR4抗体和免疫交联物,且其中本发明的体内实施方式的实践包括在前、同时或在后施用裸露的抗体或免疫交联物和生物试剂、诊断试剂或治疗试剂;只要在一些结合的或未结合的形式中,实现提供全面提供一些形式的抗体和一些形式的生物试剂、诊断试剂或治疗试剂。
简单地解释了本发明关于肿瘤的上述和其它效果以解释操作的组合模式、连接试剂的类型等等。该描述的方法不应当被解释为本发明的抗CCR4抗体的有益性质的保守的陈述或过度简化。因此,应当理解为这样的抗体本身具有抗CCR4性质且这样抗体的免疫交联物将保留这些性质并将这些性质与连接试剂的性质结合;此外,所述抗体和任何连接试剂的结合效果将典型地被提高和/或放大。
因此,本发明提供组合物、药物组合物、治疗试剂盒和医学鸡尾酒,可选地在至少第一种组合物或容器中包括生物学有效量的至少第一种本发明的抗CCR4抗体或这样的抗CCR4抗体的抗原结合片段或免疫交联物;和生物学有效量的至少第二种生物学试剂、成分或系统。
所述“至少第二种生物学试剂、成分或系统”通常将是治疗或诊断试剂、成分或系统,但不需要一定是。例如,所述至少第二种生物学试剂、成分或系统可以包括用于修饰所述抗体和/或用于将其它试剂连接至所述抗体的成分。一些优选的第二种生物学试剂、成分或系统是用于制备和使用前药的前药或成分,包括用于制备前药本身的成分和配合本发明的抗体在这样的前药或ADEPT实施方式中起作用的成分。
当包括治疗试剂或诊断试剂作为至少第二种生物学试剂、成分或系统时,这样的治疗剂和/或诊断剂将典型地是在治疗或诊断一种或多种上述紊乱中使用的那些。
因此,在一些实施方式中,“至少第二种治疗试剂”将包括在治疗试剂盒或鸡尾酒中。术语“至少第二种治疗剂”是针对本发明的抗CCR4抗体是第一种治疗试剂而言的。因此,本发明的抗体可以和化学疗法试剂、放射疗法试剂、细胞因子或趋化因子拮抗剂、细胞因子或趋化因子表达抑制剂、抗血管新生试剂、诱导细胞凋亡试剂或抗癌免疫毒素或凝聚配体、或包括皮质类固醇和NSAID的抗炎症试剂结合,这些试剂的一部分在本文的其它地方描述。
其它示例性的抗癌试剂包括如新霉素、鬼臼毒素、TNF-α、αvβ3拮抗剂、钙离子载体、钙流诱导试剂、以及它们的任意衍生物或前药。目前优选的抗微管蛋白药物包括秋水仙碱、紫杉酚、长春碱、长春新碱、去乙酰长春酰胺、考布他汀或它们的衍生物或前药。
在本发明的组合物、试剂盒和/或药物方面,所述治疗试剂的组合的有效量可以是包括在单一容器或容器装置中,或包括在不同容器或容器装置中。所述鸡尾酒通常将被混合在一起以组合使用。通常优选的是配制成静脉内给药的试剂。同样可以包括成像成分。所述试剂盒同样可以包括使用所述至少第一种抗体和所包括的一种或多种其它生物学试剂的说明书。
通常而言,所述至少第二种治疗试剂可以与本发明的抗CCR4抗体同时施用于动物或病患;所述第二种治疗试剂和本发明的抗CCR4抗体来自单一的药物组合物或来自紧密共同施用的两种药物组合物。
可选地,可以在施用本发明的抗CCR4抗体相续的时间内对动物或病患施用所述至少第二种治疗试剂。本文使用的“相续的时间”意思是“交错的”,使得在不同于施用本发明的抗CCR4抗体的时间对所述动物或病患施用至少第二种抗癌试剂。通常,在有效分隔开的时间内施用两种试剂以使得两种试剂发挥各自的治疗效果,即,在“生物学有效时间间隔”施用它们。可以在本发明的抗CCR4抗体之前的生物学有效时间或在所述治疗之后的生物学有效时间对所述动物或病患施用所述至少第二种治疗试剂。
因此,本发明提供治疗患有肿瘤的动物或病患的方法,包括:
(a)对所述动物或病患进行充分减少所述肿瘤负担的第一种治疗;和
(b)随后施用至少第一种本发明的抗CCR4抗体或其抗原结合片段;可选地其中所述抗体或片段可操作地与第二种治疗试剂连接。
优选的第一种治疗包括外科切除和化学疗法干涉。
在其它实施方式中,本发明提供治疗患有CCR4介导的紊乱的动物或病患,包括:
(a)对所述动物或病患进行充分减少所述CCR4介导的负担如炎症的第一种治疗;和
(b)随后施用至少第一种本发明的抗CCR4抗体或其抗原结合片段;可选地其中所述抗体或片段可操作地与第二种治疗试剂连接。
在一些其它实施方式中,本发明的抗体和免疫交联物可以与一种或多种诊断试剂结合,典型的诊断试剂是在诊断如上所述的紊乱中所使用的。因此本发明包括一系列的诊断组合物、试剂盒和方法。
更多方面是诊断或成像受试者的方法,包括对受试者施用合适量的如本文所定义的本发明的抗体或其它蛋白并检测受试者中所述的本发明抗体或其它蛋白的存在和/或量和/或位置。
在一种实施方式中,本发明提供一种减少动物中与CCR4表达相关的免疫抑制的方法,包括对所述动物施用有效量的本发明的抗体或它的免疫交联物,以在所述动物中形成所述抗体和CCR4的复合物,因此减少动物中与CCR4表达相关的免疫抑制。
根据上述应用和方法成像或诊断的合适疾病包括任何疾病,优选地是在本文其它地方描述的任何癌症。
在一种实施方式中,本发明提供一种在动物中诊断疾病或监测疾病进程的方法,包括步骤:
(a)用本发明的抗体或其免疫交联物接触取自所述动物的检测样品。
在另一种实施方式中,本发明提供一种在动物中诊断疾病或监测疾病进程的方法,包括步骤:
(a)用本发明的抗体或其免疫交联物接触取自所述动物的检测样品;
(b)测量或检测所述检测样品中抗体-抗原复合物的存在和/或量和/或位置;以及可选地
(c)将检测样品中抗体-抗原复合物的存在和/或量与对照样品进行比较。
在上面的方法中,在允许形成抗体-抗原复合物的条件下完成所述接触步骤。本领域技术人员可以容易地决定合适的条件。
在上述方法中,可以使用任何合适的检测样品,如怀疑感染疾病的活检细胞、组织或器官或组织切片。
在上述方法中,在检测样品中存在任何量的抗体-抗原复合物将预示着存在疾病。优选地,对于阳性诊断,所述检测样品中抗体-抗原复合物的量大于、优选地明显大于在合适的对照样品中发现的量。更优选地,所述明显更大的水平是统计学明显,优选地概率值<0.05。测量统计显著性的合适方法是本领域公知的并有文献记载的,且可以使用这些中任一种。
监测疾病的进程同样可以包括在所述时间内监测检测样品中抗体-抗原复合物的存在和/或量。因此,监测可以包括(d)将取自所述动物的第一种检测样品中抗体-抗原复合物的存在和/或量与取自所述动物的第二种检测样品中抗体-抗原复合物的存在和/或量进行比较。“第一种检测样品”的意思在取出“第二种检测样品”之前取出的样品,例如在取出第二种检测样品之前的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12天、周、月或年取出的样品。与第一种检测样品相比,抗体-抗原复合物的量在第二种检测样品中减少表示疾病好转,而增加表示疾病恶化。
本领域技术人员可以容易地选择合适的对照样品,例如,在诊断具体疾病情况下,合适的对照可以是取自不患有疾病的受试者的样品。同样可以容易地测定合适的对照“值”而不需要在每一次检测中运行对照“样品”,例如,通过参考本领域已知的正常受试者的范围。
对于在诊断或成像应用中使用,本发明的抗体可以用可检测的标记物标记,所述标记物如不透射线物或放射性同位素,如3H、14C、32P、35S、123I、125I、131I;放射性发射体(如α、β或γ发射体);荧光(荧光团)或化学发光(发色团)化合物,如异硫氰酸荧光素、若丹明或萤光素;酶,如碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或辣根过氧化物酶;成像剂;或金属离子;或化学基团如生物素,其可以通过结合特异的同类可检测基团(如标记的抗生物素蛋白/链霉亲和素)而被检测。将标记物连接至结合蛋白(如抗体或抗体片段)的方法是本领域已知的。这样的可检测标记物可以检测所述检测样品中结合蛋白-抗原复合物的存在、量或位置。
在体内使用的优选的可检测的标记物包括X-射线可检测的化合物,如铋(III)、金(III)、镧(III)或铅(II);放射性离子,如铜67、镓67、镓68、铟111、铟113、碘123、碘125、碘131、汞197、汞203、铼186、铼188、铷97、铷103、锝99m或钇90;核磁自旋共振同位素,如钴(II)、铜(II)、铬(III)、镝(III)、铒(III)、钆(III)、钬(III)、铁(II)、铁(III)、锰(II)、钕(III)、镍(II)、钐(III)、铽(III)、钒(II)或镱(III);或若丹明或荧光素。
本发明同样包括包含本发明抗体的诊断或成像试剂,所述本发明抗体连接至直接或间接产生可检测的信号的标记物。合适的标记物在本文其它地方描述。
本发明进一步提供试剂盒,所述试剂盒包括一种或多种本发明的抗体、免疫交联物或组合物或一种或多种编码本发明抗体的核酸分子、或一种或多种包括本发明的核酸序列的重组表达载体、或一种或多种包括本发明的重组表达载体或核酸序列的宿主细胞或病毒。优选地,所述试剂盒用于本文描述的方法和应用中,如本文描述的治疗、诊断或成像方法,或用在本文描述的体外分析或方法中。在这样试剂盒中的抗体优选地是本文其它地方描述的抗体结合物,如可以连接至可检测基团或可以是免疫交联物。优选地,所述试剂盒包括说明所述试剂盒成分如在诊断中使用的说明书。优选地,所述试剂盒用于诊断或治疗本文其它地方描述的疾病,且可选地包括说明所述试剂盒成分在诊断或治疗这样疾病中应用的说明书。
本文定义的本发明的抗体同样可以用作体外或体内应用和分析的分子工具。由于所述抗体具有抗原结合位点,这些可以作为特异结合对的成员而起作用且这些分子可以用在需要特异结合对成员的任何分析中。
因此,本发明的其它方面提供包含本文定义的本发明抗体的试剂,且这样抗体用作如体外或体内分析中的分子工具。
可以通过以下方式完成癌症治疗:
(a)通过对患有肿瘤的动物或病患施用诊断量的至少第一种可检测的-标记的本发明的抗CCR4抗体、包括可操作地连接至本发明的抗CCR4抗体的诊断试剂形成肿瘤图像,从而形成肿瘤的可检测图像;以及
(b)随后对同样的动物或病患施用治疗最优化量的本发明的至少第一种裸露的抗CCR4抗体或使用同样抗体的治疗剂-抗体构建体,从而引起抗肿瘤效果。
现在,将参考所述表和图更详细地描述以下非限定性实施例,其中,
表1列出了本文公开的涉及抗体17G的一些序列;
表2列出了本文公开的涉及抗体9E的一些序列;
表3列出了本文公开的涉及抗体1O的一些序列;
表4列出了本文公开的涉及抗体11F的一些序列;
表5列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体17G的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表6列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体9E的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表7列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体1O的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表8列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体11F的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表9显示了使用软件Prism(GraphPad,圣地亚哥,CA)的“一个位点特异结合”模式从IgG对CCR4+细胞的滴度计算的亲和力(KD值)。使用应用不同CCR4+细胞类型的IgG形式的抗体17G、9E和KM3060var(见实施例2)。
表10显示了抗体KM3060var的序列。
表11列出了本文公开的涉及抗体9E10J的一些序列;
表12列出了本文公开的涉及抗体9E1D的一些序列;
表13列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体9E10J的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表14列出了本文公开的涉及IgG形式的抗体9E1D的一些序列。所述可变区用下划线表示。
表15显示了从实施例4获得结果测定的表观亲和力(IC50和KD)。
表16显示了在Ca++流分析中测量的IC50值(实施例5)。
表17显示了抗CCR4抗体的ADCC活性的比较(实施例6)。
表18显示了包括去岩藻糖化的9E10J的抗CCR4抗体的ADCC活性的比较(实施例11)。
表19显示了实施例14的一些结果。表观亲和力(KD)通过在流式细胞技术中饱和抗体对细胞的滴定而测量。
表20显示了实施例9的一些结果。生物素化的MDC的细胞结合抑制的IC50值和计算的亲和力(KD)从对DT-40-CCR4+和CCRF-CEM细胞的竞争结合实验中测量。
表21显示了实施例9的一些结果。生物素化的TARC细胞结合抑制的IC50值从对DT-40-CCR4+和CCRF-CEM细胞的竞争结合实验中测量。
表22显示了从实施例9的竞争实验中测量的IC50值的概括。
表23显示了基于本文公开的抗体的CDR共同序列。
表24显示了实施例15关于测量9E10J对血小板凝聚效果的一些结果。从新鲜的供体血液中分离血小板并在存在9E10J-IgG(10μg/ml)或天然配体MDC和TARC(0.25μg/ml)时孵育血小板。ADP(3μM)用作对照以证明血小板的表现如所期待的。所述测量中还包括抗GFP(10μg/ml)以证明所述分析的特异性。通过测量样品室中的吸光率测量凝聚并以%表示,并将其与平行进行的血小板耗尽的血浆(=0%凝聚)进行比较。预孵育=首先用所述血小板孵育IgG样品10分钟,然后加入配体;混合=将IgG样品与配体混合,然后用血小板孵育。
图1显示了克隆17G的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图2显示了克隆9E的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图3显示了克隆1O的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图4显示了克隆11F的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图5图示说明了实施例2的流式细胞计数的结果。通过对转染和未转染CCR4的DT40细胞染色确定IgG形式的抗体17G和9E的CCR4特异性。在这个实验中,所述IgG形式的抗CCR4抗体KM3060var作为阳性对照,抗GFP的IgG作为阴性对照。
图6图示说明了实施例2的流式细胞计数的一些结果。使用流式细胞计数分析抗CCR4抗体KM3060var、17G和9E与表达CCR4细胞系CCRF-CEM的结合。对细胞一式三份染色,且误差棒显示标准偏差太小而看不见。所述阴性对照抗GFP抗体没有给出任何染色信号。
图7图示说明了实施例2的流式细胞计数的一些结果。通过对转染或未转染CCR4的DT40细胞染色确定1O抗体的CCR4特异性。在本实验中,所述抗GFP scFv作为阴性对照。
图8图示说明了实施例2的流式细胞计数的一些结果。通过对转染或未转染CCR4的DT40细胞染色确定11F抗体的CCR4特异性。在本实验中,所述抗VZV scFv作为阴性对照。
图9是显示实施例3的一些结果的图。如在用各不同浓度的MDC与孵育之后,通过用scFV染色细胞流式细胞计数所测定的,所述抗CCR4抗体干扰11F、9E、17G和1O干扰配体MDC与转染CCR4的DT40细胞的结合。根据之前的报导,抗体KM3060var不干扰MDC与CCR4受体的结合。
图10。图10A、B和C是显示了实施例4的竞争分析的结果的图。抗体与CCR4的结合被显示为图示的逐渐增加浓度的检测抗体(即假定的竞争者)的最大结合(即,不存在任何竞争者时的结合)百分比。
图10A显示存在非生物素化的IgG形式的17G、9E和KM3060var时,0.28nM的生物素化的IgG形式的17G与转染CCR4的DT40细胞结合。KM3060var对17G与CCR4的结合不具有任何可察觉的效果,而抗体9E的存在引起与CCR4结合的17G的量减少,表明17G和9E彼此竞争结合CCR4。
图10B显示了存在非生物素化的17G、9E和KM3060var时,7nM的生物素化IgG形式的9E与转染CCR4的DT40细胞结合。KM3060var对9E与CCR4的结合不具有任何可察觉的效果,而抗体17G的存在引起与CCR4结合的9E的量减少,证实了图10A中17G和9E彼此竞争结合CCR4的结果。
图10C显示了存在非生物素化的17G、9E和KM3060var时,6.8nM生物素化IgG形式的KM3060var与转染CCR4的DT40细胞结合。可见看见,17G和9E都不与KM3060var竞争结合CCR4。
图11显示了实施例5的结果,其中分析了通过IgG形式的9E、17G和KM3060var的钙流抑制。用Fluo-4标记的天然CCR4+CCRF-CEM细胞系用抗体预孵育,随后用TARC(A)或MDC(B)配体刺激。在加入配体后的大约15秒开始记录细胞。TARC和MDC均引起钙流,在图中表现为峰值。TARC诱导的钙流几乎完全由17G和9E分别抑制,但KM3060var不抑制。MDC诱导的钙流也同样强烈地由17G和9E分别抑制,但KM3060var不抑制。
图12A和B显示实施例6的抗体依赖的细胞毒性(ADCC)结果。该图片显示了,当存在人PBMC时,17G(图12B)和9E(图12A)能够诱导CCRE-CEM细胞的ADCC。
图13是显示实施例2的一些结果的图。通过对转染和未转染CCR4的DT40细胞染色确定抗体9E10J和9E1D的CCR4特异性。在这个实验中,9E作为阳性对照。使用浅灰棒显示结合CCR4+细胞,使用深灰棒显示结合至CCR4-细胞,缺少深灰棒意味着没有检测到明显结合。
图14是显示实施例3的一些结果的图。当存在或不存在CCR4配体TARC时,分析抗CCR4抗体17G、9E、1O、11F和KM3060var scFv与转染CCR4的DT40细胞的结合,如通过流式细胞计数所测定的。
图15显示了实施例4的一些结果。当存在逐渐增加浓度的未标记的IgG形式的9E、9E10J或KM3060var时,固定量的生物素化的IgG1形式的9E在0.7nM(a,c)或3.3nM(b)时对DT-40-CCR4+(a-b)或CCRF-CEM细胞(c)的竞争滴定。通过Strep-PE检测结合的生物素化的IgG。MFI=荧光强度中值。
图16显示了实施例5的一些结果。使用重叠浓度间隔对用Fluo-4标记的CCRF-CEM细胞进行Ca++流分析。在加入CCR4特异配体TARC之前用IgG形式的9E、9E10J或KM3060var预孵育所述细胞15分钟。所述IgG浓度是0.001μg/ml(a)、0.01μg/ml(b)、0.1μg/ml(c)、0.1μg/ml(e)、1.0μg/ml(f)和10μg/ml(g)。使用软件Prism(GraphPad)对曲线下的面积(AUC)求积分并绘制成AUC百分比用于TARC单独的最大刺激,如在图(d)和(h)中关于左柱和右柱所分别显示的。
图17显示了实施例5的一些结果。使用重叠浓度间隔对用Fluo-4标记的CCRF-CEM细胞进行Ca++流分析。在加入CCR4特异配体TARC之前用IgG形式的9E10J或KM3060var预孵育所述细胞15分钟。使用广泛范围的IgG浓度。记录信号并使用软件Prism(GraphPad)对曲线下的面积(AUC)求积分并绘制成AUC百分比用于TARC单独的最大刺激。
图18显示了实施例6的一些结果,关于由抗CCR4抗体介导的CCRF-CEM细胞的ADCC。图18(a)比较了IgG形式的9E和IgG形式的9E10J,图18(b)比较了9E10J和KM3060var。
图19显示了实施例10的一些结果。去岩藻糖化的9E10J(9E10Jdef)、未修饰的9E10J和KM3060var与DT40细胞的结合,所述DT40细胞稳定转染CCR4(+)或未转染CCR4、即CCR4阴性(-)。显示的是20μg/ml浓度时的结合信号。用抗人FITC(异硫氰酸荧光素)(山羊)结合的IgG检测结合。
图20显示了实施例11的一些结果。由抗CCR4抗体介导的CCRF-CEM细胞的ADCC,将去岩藻糖化的9E10J(9E10Jdef)与未修饰的9E10J和KM3060var比较。
图21显示了实施例14的一些结果。IgG 9E、9E1D和KM3060var对DT-40CCR4+细胞(a)和对人T-细胞白血病细胞CCRF-CEM(b)的结合滴定。用抗人FITC进行检测。MFI,荧光强度中值。
图22显示了实施例14的一些结果。scFv 9E、9E1D和9E10J对DT-40CCR4+细胞的结合滴定。所述scFv通过myc-标签交叉连接以刺激模拟类似二聚IgG的情形。用抗人PE进行检测。MFI,荧光强度中值。
图23显示了实施例14的一些结果。IgG形式的9E、9E10J和KM3060var对人T细胞白血病细胞CCRF-CEM的结合滴定。用抗人PE进行检测。MFI,荧光强度中值。
图24显示了实施例9的一些结果。当存在逐渐增加浓度的未标记的抗体(scFv或IgG形式的9E10J)或CCR4配体(MDC)时,固定量的生物素化的MDC(a、b中大约10nM,c、d中大约20nM)对DT-40-CCR4+(a)或CCRF-CEM细胞(b-d)的竞争滴定。通过Strep-PE检测结合的生物素化的MDC。MFI,荧光强度中值。
图25显示了实施例9的一些结果。当存在逐渐增加浓度的未标记的抗体(IgG形式的9E10J)或CCR4配体(MDC或TARC)时,固定量的生物素化的TARC(大约20nM)对DT-40-CCR4+(a、b)或CCRF-CEM细胞(c、d)的竞争滴定。使用Strep-PE检测结合的生物素化的MDC。在(b)和(d)中,在存在1%BSA情况下用细胞孵育蛋白。MFI,荧光强度中值。
图26显示了实施例9的一些结果。当存在逐渐增加量的未标记的抗体9E、9E10J或未标记的配体时,固定量的生物素化的MDC(a)和TARC(b)的竞争滴定。
图27显示了克隆9E10J的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图28显示了克隆9E1D的重链和轻链的核苷酸和氨基酸序列。通过NcoI/NotI位点将scFv克隆至pHOG21中。用于初始克隆的限制性位点(NcoI、HindIII、MluI和NotI)用斜体和下划线表示。VH和VL之间的连接片段是斜体的。C-myc表位和6个组氨酸分别用下划线和双下划线表示。
图29显示了实施例13的一些结果。抗CCR4抗体和对照抑制配体(TARC;3.5nM)诱导的细胞迁移。人T细胞白血病CCRF-CEM细胞被诱导以迁移至Multiscreen-MIC室中,其中配体TARC被放置在较低的室中,而在较上方的室中所述细胞与抗体或培养基共孵育仅作为对照。检测和计算迁移至较低室中的细胞。绘制了一式三份的平均值和SD值。(a)比较9E10J与9E和抗GFP对TARC诱导的迁移的抑制。(b)比较9E10J与1G1和KM3060var对TARC诱导的迁移的抑制。
图30显示了实施例16的一些结果。外周血淋巴细胞(PBL)的染色。从总细胞群中提出淋巴细胞。通过用抗CD3-APC-lgG(人)和抗CD8-PE-Cy5-IgG(人)孵育而挑出T细胞。从20μg/ml低至0.3ng/ml滴定生物素化的9E10J和生物素化的比较物KM3060var,并用PE连接的链霉亲和素检测。使用PBL的图例是a)提取淋巴细胞群;b)提取CD3阳性细胞并又分成CD8阳性(CD4阴性)细胞和CD8阴性(CD4阳性)细胞;c)9E10J和KM3060var对提取的CD8阴性细胞(CD4阳性细胞)的滴定曲线,表示为%阳性事件。
以下非限定性例子示例性地说明了本发明。
实施例
实施例1:新抗体
已经鉴定了四个能够特异结合CCR4的人类抗体。将单链形式的抗体克隆至pHOG21质粒中,所述质粒包含c-myc和6个组氨酸标签表位。转染TG1细菌,用IPTG诱导scFv表达。通过EasyCyte确认纯化的scFv的结合。
对产生克隆的抗体的重链和轻链的核苷酸序列测序。所述抗体被指定为17G、9E、11F、1O、9E10J和9E1D。17G的轻链和重链的核苷酸序列和氨基酸序列在图1中示出。17G的轻链和重链的CDR域在表1中示出。9E的轻链和重链的核苷酸和氨基酸序列在图2中示出。9E的轻链和重链的CDR域在表2中示出。1O的轻链和重链的核苷酸序列和氨基酸序列在图3中示出。1O的轻链和重链的CDR域在表3中示出。11F的轻链和重链的核苷酸序列和氨基酸序列在图4中示出。11F的轻链和重链的CDR域在表4中示出。
已经鉴定了另外两种能够特异结合CCR4的抗体。如上所述制备单链形式的抗体。9E10J的轻链和重链的核苷酸序列和氨基酸序列在图27中示出。9E10J的轻链和重链的CDR域在表11中示出。9E1D的轻链和重链的核苷酸序列和氨基酸序列在图28中示出。9E1D的轻链和重链的CDR域在表12中示出。
同样制备了IgG形式的抗体17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D。使用标准方案制备IgG。简要地,将编码相对应的可变域的基因克隆至哺乳动物表达载体pLNO中,所述表达载体包含人恒定区基因(Norderhaug等,1997)。所述抗体在细胞工厂中表达,收获的第一拨产品通过蛋白A柱纯化并通过尺寸排阻色谱法分馏成单体。所述IgG保留了它们特异结合CCR4的能力。
所述IgG形式是IgG1同种型,并包括两条重链和两条轻链。每一条重链包括一个SEQ IDNO:69(对于17G)、SEQ ID NO:71(对于9E或9E1D)、SEQ ID NO:73(对于1O)、SEQ ID NO:75(对于11F)、或SEQ ID NO:105(对于9E10J)的VH域和一个人IgG1恒定区。每一条轻链包括一个SEQ ID NO:70(对于17G)、SEQ ID NO:72(对于9E或9E10J)、SEQ ID NO:74(对于1O)、SEQ ID NO:76(对于11F)或SEQ ID NO:115(对于9E1D)的VL域和一个人λ轻链恒定区,但IgG形式的11F除外,它包括人κ轻链。17G、9E、1O、11F、9E10J和9E1D的全长IgG序列分别在表5、6、7、8、13和14中示出。
已经鉴定了另一种抗体9E1Dv。所述抗体在FR3的第88位具有一个点突变(根据Kabat等,Sequences of proteins of immunological interest;第五版,1991编号),其中9E1Dv具有丙氨酸(A),代替了在9E1D中发现的缬氨酸(V)。在目前检测的范围内,9E1Dv的性质与抗体9E1D的性质似乎一致。
实施例2:抗CCR4抗体与表达目标的细胞的结合
为证明实施例1中公开的抗体的CCR4特异性以及评估它们的结合亲和力,用IgG形式的17G和9E以及scFv 1O和11F在流式细胞计数中对内部转染有CCR4和未转染CCR4的HEK293T细胞、DT40细胞和天然的CCR4+CCRF-CEM细胞系染色。作为阳性对照,使用内部克隆的并表达的IgG形式的KM3060var,所述IgG形式的KM3060var特异于存在于人CCR4的N末端2-29位的表位(EP1270595)。抗GFP抗体(由抗绿色荧光蛋白所产生)或抗VZN抗体(由抗水痘带状疱疹病毒产生)用作阴性对照(抗GFP抗体是scFv和IgG形式,而抗VAN仅作为scFv形式)。
CCRF-CEM(急性淋巴细胞性白血病,ATCC号CCL-119)、HEK293T/17(人肾,ATCC号CRL-11268),和DT40(鸡淋巴瘤,ATCC号CRL-2111)细胞系从美国模式培养物保藏所获得(ATCC,洛克维尔,MD)。CCRF-CEM细胞和DT40细胞在RPMI-1640培养基中培养,HEK293T细胞在Dulbecco′s Modified Eagle Medium(DMEM)中培养。所有的细胞用胎牛血清培养,对于DT细胞和HEK293T细胞,其浓度是10%;对于CCRF-CEM细胞,其浓度是20%。所有的培养基都补充有青霉素和链霉素。
对于流式细胞计数实验,从培养瓶中收获细胞,用PBS清洗两次,用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬,最后等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。将细胞在400g下离心5分钟并在4℃下用不同抗体稀释度孵育45分钟。
对于用scFv的染色,在添加至细胞之前,用嵌合的(鼠可变域/人恒定域)抗c-myc抗体预孵育scFv制品。
在用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗之后,4℃下,所述细胞用10μg/ml的RPE连接的山羊抗人IgG(AbDSerotec,Düsseldorf,德国)染色30分钟。清洗所述染色的细胞,用200μl的含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬并转移至U型96孔板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)中用于在EasyCyte流式细胞仪(Guava Technologies,Hayward,CA,美国)中获得结果。
获得的结果清楚地表明抗体17G、9E、1O和11F特异于CCR4。图5中示例性地说明了抗体17G和9E与CCR4阳性DT40细胞的结合同与CCR4阴性DT细胞的结合的比较。17G和9E与表达CCR4的CCRF-CEM细胞的结合在图6中示出。同样发现了17G和9E与CCR+HEK293T细胞同CCR-HEK293T细胞比较的选择性结合。
在低的纳摩尔浓度的范围内评估从这些IgG滴定实验中推断的亲和力值(KD)(见表9)。
抗体1O scFv对CCR4的特异性在图7中例示,抗体11F scFv对CCR4的特异性在图8中例示。
在基本符合上述描述的情况下,检测9E10J和9E1D对未转染和转染CCR4的DT40细胞的结合特异性。对于这个实验,9E10J和9E1D作为scFv表达,其在3’末端具有c-myc标签,用于产生二聚物以模拟IgG模式。在加入至细胞之前,用抗c-myc抗体预孵育上述抗体。基本上如上所述完成染色。所述结果显示9E10J和9E1D选择性地结合CCR4阳性细胞(图13)。
实施例3:抗CCR4抗体干扰配体结合
为确定所述抗CCR4抗体是否干扰CCR4配体和受体结合,在用scFv染色之前,用转染CCR4的DT40细胞预孵育MDC(从PeproTech EC Ltd.获得,伦敦,英国)。作为阴性对照,使用KM3060var scFv(序列见表10),其特异于人CCR4的N末端部分。在之前显示,所述抗体KM3060不干扰配体与受体结合(T Ishida等(2006)Specific Recruitment of CC ChemokineReceptor 4-Positive Regulatory T Cells in Hodgkin Lymphoma Fosters Immune Privilege,CancerRes 66:(11):5716-5722.)。KM3060var对应于KM3060,但是它在不同的宿主细胞中表达,其可能导致连接至该抗体的糖链不同。
从培养瓶中收获CCR4+DT40细胞,用RPMI-1640培养基清洗2次,并等分至V型96孔板中,每孔1×105个细胞(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)。在500×g下对细胞离心5分钟,然后在37℃下,用含有0、1或10ng/ml MDC(PeproTech EC,伦敦,英国)的RPMI-1640培养基孵育30分钟。在500×g离心5分钟后,吸出上清液,在4℃下用0.5μg/ml的scFv和2.5μg/ml的含人Fc的内部产生的抗-cMyc孵育细胞1小时。用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗三次之后,在4℃下用2.5μg/ml的RPE连接的山羊抗人IgG(AbDSerotec,Düsseldorf,德国)对细胞染色1小时。将细胞清洗、在200μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于使用EasyCyte装置的流式细胞计数(Guava Technologies,Hayward,CA,美国)。所述结果显示,除用KM3060var抗体染色之外,在用10ng/ml的MDC预孵育转染CCR4的DT40细胞之后,所述结果显示了染色信号的明显降低(图9)。这表明抗体17G、9E、1O和11F干扰配体结合并因此具有阻止CCR4的活性。
相似的实验显示全部4个抗体17G、9E、1O和11F同样干扰TARC和CCR4结合。该结果在图14中示出。
实施例4:抗CCR4抗体之间的竞争
为分析结合抗CCR4抗体17G、9E和KM3060var的表位,使用流式细胞计数进行竞争实验。当存在不同浓度的未生物素化的抗CCR4抗体时,生物素化的抗体与转染CCR4的DT40细胞的结合受到挑战。从培养瓶中收获CCR4+DT40细胞,用PBS清洗两次,用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬,最后等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。将细胞在400×g下离心5分钟并在4℃下用不同抗体稀释度孵育45分钟。将细胞在400×g下离心5分钟并在4℃下用固定量的生物素化的IgG和不同浓度的未生物素化的抗体孵育3-4小时。在用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗之后,4℃下,所述细胞用2.5μg/ml的链霉亲和素-RPE(BD Pharmingen,圣地亚哥,CA,美国)染色30分钟。将染色的细胞清洗、在250μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于在EasyCyte流式细胞计数仪(Guava Technologies,Hayward,CA,美国)上获得结果。显示在图10A、B和C中的结果说明17G和9E抗体具有相同的或至少重叠的表位。KM3060var抗体和其它两种抗体与细胞的结合没有竞争,说明17G和9E与KM3060var不结合相同的表位。
进行了更多的竞争实验以评估所述检测抗体是否识别相同的或重叠的表位,以测量它们对于CCR4的相对亲和力。使用标记的9E作为竞争剂检测抗体9E10J、9E和KM3060var。
如实施例2中所描述的培养DT40和CCRF-CEM细胞。从培养瓶中收获细胞,用PBS清洗两次(400×g、5分钟、4℃),并用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬。将细胞等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。离心细胞(400×g、5分钟、4℃)并在50μl的混合有生物素化的竞争抗体9E(0.1或0.5μg/ml)的IgG形式的9E10J或KM3060var(从5μg/ml开始系列稀释)中重悬。4℃下,将所述细胞孵育2小时,每45分钟用吸液管混合。将所述细胞用150μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗三次并在4℃下用3μg/ml的链霉亲和素PE(BD Biosciences)染色45分钟。将细胞清洗、在200μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔Costar板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于使用FACS Canto II流式细胞计数仪(BD Biosciences,海德尔堡,德国)的流式细胞计数。
在图15中显示的结果证明了9E和9E10J以剂量依赖方式有效地抑制细胞结合生物素化的IgG形式的9E。相反,当用生物素化的9E滴定KM3060var时,结合信号几乎没有减少;因此确定了由这些抗体识别的表位不重叠。
为检测IC50值(导致50%生物素化的IgG的结合被抑制的抗体浓度),使用软件Prism(GraphPad)的“log(抑制剂)vs.应答”模式通过非线性回归曲线拟合对实验数据进行拟合。根据来自之前描述的方法的以下等式计算表观结合亲和力(KD)(Kipriyanov等,1997b;Schodin&Kranz,1993):
KD (I)=IC50/(1+[bio-lgG(9E)]/KD (9E)),
其中,I是未标记的抑制剂(IgG),[bio-lgG(9E)]是固定浓度的生物素化的IgG形式的9E,KD (9E)是源自饱和滴定实验(4.95nM)的IgG形式的9E的结合亲和力。结果在表15中示出。
实施例5:拮抗活性
评估了9E和17G在天然的CCR4+CCRF-CEM细胞系中减少配体诱导的钙流的能力。抗体KM3060var用作阴性对照。已经报道序列相同的去岩藻糖化的克隆KM2760不抑制CCR4信号转导。在调节条件下培养的CCRF-CEM靶细胞通过离心沉淀并在RPMI-1640培养基中重悬两次。一毫升的2.5×106细胞与Fluo-4-AM(Invitrogen,Carlsbad,加利福尼亚)、PluronicF-127(Invitrogen,Carlsbad,加利福尼亚)和丙磺舒混合达到终浓度分别是1μM、0.02%和1mM。所述细胞在37℃下在垂直旋转轮(7rpm)上孵育30分钟。所有的后续步骤在存在1mM丙磺舒的情况下完成。所述细胞在含有10%FCS的RPMI-1640中清洗两次,在分析缓冲液(145mM NaCl、4mM KCl、1mM NaH2PO4、0.8mM MgCl2、25mM Hepes、22mM葡萄糖)中清洗一次,然后重悬至1.2×106细胞/ml的终密度。混合等体积的细胞、含有或不含有抗体的分析缓冲液和配体(MDC或TARC)。在加入配体之前,将前两种成分(细胞和抗体)预孵育15分钟。IgG、TARC和MDC的终浓度分别是10μg/ml、10ng/ml和2.5ng/ml。立即使用FACSCanto II流式细胞计数仪(BD Biosciences,海德尔堡,德国)上的515-545nm光谱过滤器分析所述样品。
显示在图11中的结果清楚地证明了9E和17G均作为TARC和MDC的抑制剂。假设单独对TARC的信号是100%,以10μg/mL浓度的IgG形式的9E、17G和KM3060var预孵育的细胞显示对TARC刺激的信号反应是3%、-1%和104%(图11A)。因此,用IgG形式的9E、17G和KM3060var预孵育的细胞显示对MDC刺激的信号反应分别是不存在IgG时对MDC的信号的64%、42%和92%(图11B)。当用IgG形式的9E或17G代替TARC和MDC配体加入细胞时,没有检测到信号(数据未显示)。IgG形式的9E或17G同样没有显示CXCR4特异的SDF-1配体的任何抑制(数据未显示)。
同样在相似的条件下用人IgG1形式的抗体9E10J进行所述实验,但是所述细胞在37℃下不使用旋转轮用Fluo4-AM孵育抗体孵育40分钟。抗体KM3060var作为阴性对照,同样也包括抗体9E(都是以人IgG形式)。在图16中显示的结果证明9E和9E10J抗体对TARC诱导的信号转导有剂量依赖的抑制。
使用广泛范围的IgG浓度的9E10J详细分析Ca++流抑制(图17)。如在实施例14中所解释的计算IC50(ng/ml)值。在浓度100-300ng/ml(0.7-2.0nM)时达到完全信号抑制,计算的IC50值是43.3pM(表16)。
实施例6:抗体依赖的细胞介导的细胞毒性(ADCC)
在天然CCR4+CCRF-CEM细胞系中评估9E和17G诱导ADCC的能力。在常规情况下培养的CCRF-CEM靶细胞通过离心沉淀并在RPMI-1640培养基中重悬。该步骤重复一次。一毫升的2.5×106细胞与钙黄绿素-AM(Invitrogen,Carlsbad,加利福尼亚)混合以达到10μM的终浓度,然后在37℃下在垂直旋转轮(7rpm)上孵育30分钟。所述细胞在含有10%FCS的RPMI-1640中清洗三次并将细胞密度调整至3×105/ml。分别地,按照常规步骤制备外周血单核细胞(PBMC)(通过Ficoll-Hypaque梯度离心富集),在含有10%FCS的RPMI-1640中清洗,然后悬浮至每毫升6×106。将50μl的每一种靶细胞和效应细胞添加至96孔微量滴定板的相同孔中,使得效应物和靶细胞的比例(E∶T)是20∶1。将20μl所述抗体(都是以IgG形式)添加至相同孔中以达到终浓度范围是10-10000ng/mL,且每个浓度四份样品。然后在37℃下将所述微量滴定板孵育4小时,然后在3小时和45分钟之后向一些孔中加入20μl的0.9%Triton-X100以使靶细胞完全溶解。然后将每个样品100μl的上清液转移至黑色微量滴定板,并在TECAN M200板读数仪中分析荧光(激发:488nm;发射:518nm)。从所有其它样品的强度中减去没有抗体的样品中的荧光强度。在用TritonX-100处理后,基于100%细胞溶解的样品的荧光强度,评估含有抗体的样品的溶解百分比。通过非线性回归分析和使用软件Prism(GraphPad,圣地亚哥,CA,美国)的三参数拟合模型计算剂量-反应曲线。
在图12A和12B中显示的结果清楚地证明当存在人PBMC时,9E和17G能够诱导ADCC,EC50值分别是619ng/ml和46ng/ml,且最大杀死量是55%和22%。
除了不使用旋转轮外,在与上面描述的那些条件相似的条件下,同样检测抗体9E10J诱导CCRF-CEM细胞的ADCC的能力,并与抗体9E和抗体KM3060var进行比较,。显示在图18和表17中的结果显示9E和9E10J能够诱导ADCC,且由9E10J对ADCC的诱导比KM3060var对ADCC的诱导更强。
实施例7-抗cMyc杂交体/人IgG1抗体的制备
抗cMyc杂交体/人IgG1抗体:9E10H链(AJ000488)和轻链9E10L链(AJ000489)可变DNA序列从GeneArt定制,并转换成杂交体人IgG1/κ蛋白。根据Norderhaug等,JIM204:77-87的方法分别用特别引物以scFv为模板通过PCR克隆可变VH和VL区、消化并连接至重链载体和轻链载体。瞬时转染HEK293/T细胞;5-6天后,通过蛋白A及随后的尺寸排阻纯化IgG以分离单体IgG部分。
实施例8:种类交叉反应
检测抗体9E和9E10J与来自非人类物种的CCR4的交叉反应的能力。
在含有10%FBS(来自PAA,目录号A15-252)和1×青霉素/链霉素(来自PAA,目录号P11-010)的DMEM(来自PAA,目录号E15-810)中培养Hek293T/17。它们每周被分离2-3倍。Hek293T/17以32000细胞/cm2播种48小时,在周末时播种27000细胞/cm2。
对于瞬时转染,在T75(NUNC)培养瓶中,将Hek293T/17细胞以2×106细胞起始量培养。48小时后,用Fugene(ROCHE)转染所述细胞。每个T75使用40μl的Fugene和16μg的DNA。转染后48小时分析所述细胞。
用编码人CCR4的pcDNA3.1质粒或编码小鼠CCR4(GeneBank CAA62372)或猴子(猕猴)CCR4(PubMed登录号XP_001098807)的pLNO质粒(Norderhaug等,1997)瞬时转染HEK-293T/17细胞,使用Fugene(Roche)作为转染试剂。非转染(CCR4阴性)的细胞用作阴性对照。在上述的常规条件下,继续培养所述细胞48小时。在室温下用PBS清洗所述细胞两次,通过用Accutase(PAA实验室,林茨,奥地利)孵育3分钟将所述细胞从培养瓶中分离。所述细胞用PBS清洗两次(400×g、5分钟、4℃),并用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬。将细胞等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。离心细胞(400×g、5分钟、4℃)并在50μl的含有0.2%BSA和0.09%NaN3和10μg/ml的9E或9E10J的PBS中重悬。4℃下,将所述细胞继续孵育60分钟。通过离心和在100μl的FACS缓冲液中再重悬将所述样品清洗两次。所述细胞球最终在50μl含有3μg/ml的抗人IgG-PE(BD Biosciences)中重悬并在4℃下孵育45分钟。如上所述将所述样品清洗两次并在250μl的FACS缓冲液中重悬,随后转移至至U型96孔板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于基于FACS Canto II(BD Biosciences,San Jose,CA)的流式细胞计数。
9E和9E10J均与人和猴子CCR4强烈结合,没有检测到与鼠CCR4结合。
实施例9:抑制配体结合
使用生物素化的配体在竞争实验中检测抗体9E和9E10J抑制MDC和TARC与CCR4+细胞结合的能力。设计所述实验以给出抗体与CCR4的亲和力同配体与CCR4的亲和力的比较的表征。
用生物素化的MDC或生物素化的TARC对DT-40-CCR4+细胞和CCRF-CEM细胞进行竞争结合分析。如在实施例2中所描述的培养DT40和CCRF-CEM细胞。使用标准程序将TARC和MDC生物素化。所述生物化过程引起一些损失,使得本文叙述的生物素化的MDC和TARC的浓度是近似值。
从培养瓶中收获细胞,用PBS清洗两次(400×g、5分钟、4℃),并用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬。将细胞等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。离心细胞(400×g、5分钟、4℃)并在50μl的混合有固定浓度的生物素化配体(10或20nM,见图24的图例)的IgG、单链或未标记的配体中重悬(起始于100/500/26,4μg/ml的1∶10稀释系列)。4℃下,将所述细胞孵育2小时,每45分钟用吸液管混合。将所述细胞用150μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗三次,并在4℃下用3μg/ml的链霉亲和素PE(BD Biosciences)染色45分钟。将细胞清洗、在200μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔Costar板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于使用FACS Canto II流式细胞计数仪(BD Biosciences,海德尔堡,德国)的流式细胞计数。为检测IC50值(导致信号减少50%的抑制剂的浓度),使用软件Prism(GraphPad)的“log(抑制剂)vs.应答”模式通过非线性回归曲线拟合对实验数据进行拟合。根据来自之前描述的方法的以下等式计算表观结合亲和力(KD)(Kipriyanov等,1997b;Schodin&Kranz,1993):
KD(I)=IC50/(1+[bio-MDC]/KD(MDC)),
其中,I是未标记的抑制剂(抗体或配体),[bio-MDC]是固定浓度的生物素化的MDC,KD(MDC)是MDC,0.18nM的结合亲和力(Imai等,1998)。
在图24和表20中显示的竞争结合实验结果证明高亲和力配体MDC的CCR4结合可以由IgG形式的9E10J以剂量依赖形式有效抑制。转染CCR4的DT40细胞比CCRF-CEM细胞表达更高密度的CCR4,CCRF-CEM细胞表面上具有15倍少的CCR4受体。
应当注意到,未标记的MDC能够完全抑制生物素化的MDC与CCRF-CEM细胞的结合,而抗体9E10J不能(图24)。这个观察表明MDC可能与CCRF-CEM细胞上的另一种受体结合。更可能地,这是一种非典型的清除(诱捕)GPCR受体D6,其能够以高亲和力结合MDC(Graham,2009;Locati等,2005)。这也可以解释更高的表观IC50。
使用生物素化的TARC进行相似的结合抑制实验。如所期望的,TARC、抗体9E10J和MDC均与标记的TARC有效竞争(图25)。为避免标记配体的非特异细胞结合,一半的实验在存在1%的BSA时进行,所述BSA作为封闭剂。BSA的存在或不存在似乎没有明显的影响(图25b和d中存在BSA,图25a和c中不存在BSA)。
实施例10:去岩藻糖化的9E10J的产生
已经报导,可以通过操作寡聚糖对人IgG1亚类的状态提高ADCC(Niwa R等,CanRes,64卷,2004)。已经证明修改岩藻糖的量对提高ADCC具有有益效果。因此,在存在Kifunensine时生产抗体9E10J,所述Kifunensine是一种I型α-甘露糖苷酶的选择性抑制剂,引起在细胞培养生产中IgG岩藻糖化的停止。对于质量控制,首先检测去岩藻糖化的IgG形式的9E10J对DT40细胞的结合特异性,并与未修饰的9E10J和KM3060var进行比较,所述DT40细胞稳定转染有CCR4。
在存在Kifunensine(100ng/ml;Sigma)时生产IgG。在收获细胞培养基之后,首先基于亲和力纯化使用蛋白A柱(HiTrap,5ml,蛋白A;GE)分离IgG。使用柠檬酸盐缓冲液(pH3)洗提IgG并转移至1M Tris缓冲液(pH 9)中。在第二次纯化之前,浓缩IgG样品并装填用于尺寸排阻色谱法(HiLoad Sephadex 200,GE;运行缓冲液PBS pH 7.4)。收集单体部分并第二次浓缩IgG。对于结合实验,两倍梯度稀释IgG,起始于20μg/ml的浓度直到0.15625μg/ml。在稳定转染有人CCR4的DT40细胞(1.5*106/ml)上孵育IgG。未转染的DT40细胞用作阴性对照。通过抗人FITC(山羊)结合的抗体检测结合的IgG。
图19中呈现的结果证明去岩藻糖化模式的修饰对9E10J的CCR4结合能力没有任何影响。
实施例11:去岩藻糖化的IgG1变异体的抗体依赖的细胞毒性(ADCC)的诱导
将根据实施例10中描述的内容制备的去岩藻糖化的9E10J与未修饰的9E10J和未修饰的KM3060var进行比较。使用组成型表达CCR4的CCRF-CEM细胞检测IgG。如在实施例6中的描述分析ADCC诱导。
在图20和表18中显示的结果证明,与未修饰的9E10J相比,候选的9E10J的去岩藻糖化变异体具有提高的通过PBMC杀死CCR4阳性CCRF-CEM细胞的性质并具有更高的细胞溶解活性(低4-5倍的EC50)。
实施例12:生长抑制和细胞凋亡的诱导
使用膜联蛋白V染色和FACS分析分析抗体诱导Ramos细胞(源自Burkitt淋巴瘤的B类淋巴母细胞系)的能力。没有观察到细胞凋亡的明显诱导。使用9E、9E10J和KM3060var(均以IgG形式)对CCRF-CEM细胞和Ramos细胞(源自Burkitt淋巴瘤的B类淋巴母细胞系)进行生长抑制检测。没有观察到生长抑制。
实施例13:趋化作用的抑制
i)通过一个室中用抗体9E或9E10J接触能够趋化作用的CCR4+细胞,将CCR4配体(MDC或TARC)放置在另一个室中分析抗体9E和9E10J对趋化作用的抑制,所述另一个室与第一个室通过具有合适孔尺寸的膜或过滤器分离。通过比较存在抗体时的趋化作用和不存在抗体时的趋化作用测量抗体对细胞向配体迁移的作用(趋化作用)。发现9E和9E10J均能够抑制CCR4阳性细胞向MDC和TARC的趋化作用。
ii)评估了9E10J减少配体诱导的天然CCR4+CCRF-CEM细胞的迁移的能力,并与9E、KM3060var和1G1抗体进行比较。所述的抗体以IgG1的形式检测。
如在实施例2中描述的培养的CCRF-CEM靶细胞通过离心沉淀并在没有FCS的RPMI-1640培养基中重悬两次。在第三次离心步骤中,细胞在补充有1%FCS的RPMI-1640培养基中重悬并调整到1.6×107细胞/ml的终密度。平行地,向Multiscreen-MIC 96孔板(8μm孔,Millipore,Billerica,MA,美国,MAMIC5S10)的每一个较低室中加入150μl的补充有1%FCS、含有3.5nM的TARC的RPMI。向Multiscreen-MIC 96孔板的上面室中加入50μl的含有IgG的细胞(从167nM系列稀释至0.3nM)并在37℃下孵育3小时。移走过滤器并在重悬浮之后将100μl的细胞(从较低的室)转移至96孔COASTAR板中(Greiner Bio-One,Frikenhausen,德国);向样品中另加入100μl的PBS(补充有0.2%BSA和0.09%NaN3)。通过计算获得的细胞计算迁移。
在图29中呈现的数据证明了9E和9E10J对TARC诱导的CCRF-CEM细胞的趋化作用的抑制。对于抗体KM3060var和1G1或对照IgG(抗GFP)没有观察到对趋化作用的明显抑制。
实施例14:对于CCR4的结合特异性和亲和力
在滴定实验中,检测scFv或IgG形式的9E1D和9E10J对DT40+细胞的特异结合性。
如实施例2中所描述的内容培养DT40和CCRF-CEM细胞。从培养瓶中收获DT40CCR4+细胞和DT40(CCR4-)细胞,用PBS清洗两次(400×g、5分钟、4℃),并用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬。将细胞等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。离心细胞(400×g、5分钟、4℃)并在50μl的含有ScFv(5μg/ml)、0.2%BSA和0.09%NaN3、内部产生的具有人Fc的抗cMyc抗体(25μg/ml)的PBS中重悬。孵育一个小时后(4℃),将所述细胞用150μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗三次并在4℃下用2.5μg/ml的RPE连接的山羊抗人IgG(AbDSerotec,Düsseldorf,德国)染色45分钟。将细胞清洗、在200μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔Costar板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于使用Easy Cyte装置(Guava Technologies,Hayward,CA,美国)的流式细胞计数。
可选地,将9E1D和9E10J转化成全长人IgG1形式并检测其细胞结合。从培养瓶中收获DT40CCR4+细胞和DT40(CCR4-)细胞,用PBS清洗两次(400×g、5分钟、4℃),并用含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS重悬。将细胞等分成至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frickenhausen,德国)中,每孔1×105个细胞。离心细胞(400×g、5分钟、4℃)并以起始于10μg/ml(50μl/孔)的1∶5的IgG稀释系列重悬。4℃下,孵育一个小时后,将所述细胞用150μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS清洗三次,并在4℃下用2.5μg/ml的RPE连接的山羊抗人IgG(AbDSerotec,Düsseldorf,德国)或2.5μg/ml抗人IgG Fc(山羊多克隆aff.pur)FITC(Sigma Aldrich)染色45分钟。将细胞清洗、在200μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS中重悬并转移至U型96孔Costar板(Corning,Schiphol-Rijk,荷兰)用于使用Easy Cyte装置(Guava Technologies,Hayward,CA,美国)或FACS Canto II流式细胞仪(BD Biosciences,海德尔堡,德国)的流式细胞计数。
使用软件Prism(GraphPad,圣地亚哥,CA)的“一个位点-特异结合”模式从非线性拟合的实验数据曲线中推算表观亲和力值(KD)。由于已知KM3060var与CCR4结合,它被用作阳性对照。结果显示在图21、22和23以及表19中。
实施例15:血小板的凝聚测量
已知CCR4在血小板上表达,且它的配体MDC和TARC诱导血小板凝聚。这可能有潜在的问题,因为IgG分子具有两个配体结合位点,因此有这样的可能:如果IgG的两条臂能够结合不同血小板上的CCR4,能够识别CCR4的IgG可能能够交叉连接血小板。这可能导致体内点凝结。因此,检测9E10J-IgG对血小板凝聚的作用。9E10J-IgG与分离的血小板单独孵育或与配体MDC或TARC结合孵育。ADP是一种充分描述的凝聚诱导物(Varon和Spectre″Antiplatelet agents″Hematology Am Soc Hematol Educ Program.267-72,2009),在每一次测量中作为阴性对照。
将一共30ml的新鲜的捐献血液收集到含有柠檬酸钠的管中。在室温(RT)下185g离心15分钟获得富含血小板的血浆。含有血小板的血浆转移至新的管子中。为定义基准,通过在RT下将1ml富含血小板的血浆在1200g下5分钟离心制备无血小板的血浆,将上清液转移至新的管子中并以下述与富含血小板的样品相同的方式处理。在37℃下通过搅拌使用Packs-4血小板凝集仪(Helena Biosciences,美国)测量凝聚。在FACS缓冲液(PBS,pH 7.4,0.2%BSA,0.09%NaN3)中用浓度为10μg/ml的血小板孵育IgG(9E10J和抗GFP作为阴性对照)。ADP作为凝聚的阳性对照,其使用的终浓度是3μM。配体(MDC和TARC)被检测是0.25μg/ml。
将用ADP获得的信号设为100%,基线0由无血小板的血浆定义,在所有的实验设定中都平行地测量无血小板的血浆。
为检查检测的IgG与分离的血小板结合,平行地进行血小板的FACS染色。将血小板转移至V型96孔板(Greiner Bio-One,Frikenhausen,德国)中并通过加入100μl的FACS缓冲液(1×PBS,pH 7.4,补充有0.02%BSA和0.09%NaN3)清洗一次。然后在4℃下在存在9E10J-IgG(10μg/ml)时将血小板孵育1小时,然后在100μl的FACS缓冲液(1×PBS,pH 7.4,补充有0.02%BSA和0.09%NaN3)中清洗两次。4℃下,在IgG染色的细胞上孵育1小时后,使用抗人PE(1∶400稀释)检测结合的IgG。在FACS测量中分析染色的血小板。
观察到9E10J-IgG对血小板的结合(数据没有显示)。凝聚测量的结果在表24中概括。推断:尽管9E10J-IgG与血小板结合,它对血小板凝聚没有作用;它本身不诱导凝聚,它也不抑制配体诱导的血小板凝聚。
实施例16:IgG形式的9E10J与外周血淋巴细胞(PBL)的结合
由于已知CCR4在淋巴细胞(如Th2细胞和Treg细胞)上表达,绘制9E10J和KM3060var对从血沉棕黄色块中分离的PBL的滴定曲线。
按照EZ-连接马来酰亚胺-PEO固相生物素化试剂盒(Pierce,Thermo Fisher,P.O.Box 117Rockford,IL.61105美国)的手册对抗体9E10J和KM3060var进行生物素化。如根据实施例2给出的方案通过评估生物素化的抗体和非生物素化的抗体与CCRF-CEM细胞的结合所判定的,所述生物素化不明显影响抗体识别它们目标的能力(数据没有显示)。
通过Ficoll-(Hypaque)梯度离心从新鲜的捐献血液中制备人PBL,在RPMI-1640/10%FCS中清洗。向Leucosep管(50ml;Greiner Bio-One,Frikenhausen,德国)加入15m1的淋巴细胞分离剂(Fresenius Kabi Norge,奥斯陆,挪威)并在室温下1000g离心30秒。
将所述血沉棕黄色块用280ml的1×Dulbeccos PBS(pH 7.4)稀释并将35ml稀释的血液转移至每一个Leucosep管(50ml;Greiner;Bio-One,Frikenhausen)。基于在室温下1000g离心10分钟(无中断,无加速),将所述靶细胞转移至50ml管中(50ml Falcon,Greiner Bio-One,Frikenhausen,德国),处于50ml的RPMI培养基中。在室温下,以200g、15分钟将PBL制成球形,在50ml的RPMI培养基中重悬并在计数细胞前通过70μm细胞过滤网过滤。在补充有0.2%BSA和0.09%NaN3的1×PBS(pH7.4)中将PBL稀释至终细胞数量为1.5×106个细胞/ml。
在补充有0.2%BSA和0.09%NaN3的1×PBS Dulbeccos(pH7.4)中将生物素化的IgG形式的9E10J和KM3060var从20μg/ml稀释至0.3ng/ml,并将一共1.5×105个PBL孵育2小时。在用150μl含有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS(pH7.4)中清洗细胞两次后,移除未结合的IgG。在孵育之后用PE标记的链霉亲和素(BD-Biosciences Norge;在补充有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS(pH 7.4)中以1∶100稀释)检测结合的IgG。
用抗CD3-APC连接的抗体和抗CD8-PE-Cy5连接的抗体(BD-Biosciences Norge;均在补充有0.2%BSA和0.09%NaN3的PBS(pH 7.4)中以1∶100稀释)对细胞进行双重染色。为补偿荧光染料的信号重叠,将抗CD4-PE连接的IgG(BD-Biosciences挪威)添加至分离的孔中。在FACS-cantoII(BD-Biosciences挪威)上分析样品。
为评估PBL与IgG形式的9E10J和KM3060var的结合,首先从全部情况中挑选出淋巴细胞。然后,从淋巴细胞群中分离出CD3阳性细胞。然后将CD3阳性细胞分成CD8阳性(=CD4阴性)细胞和CD8阴性(=CD4阳性)细胞,其包括Treg片段。PE频道中的信号强度表示IgG形式的9E10J和KM3060var对CD8阴性(=CD4阳性)细胞的结合。在与阴性对照(=PE连接的链霉亲和素)比较后,结合以%(阳性事件)表示。
如在图30中所表示的,9E10J结合挑选的CD4阳性细胞(通过CD8阴性染色测定)。在浓度低至32ng/ml(相当于~210pM的IgG)时仍然可检测到结合。在这个浓度,没有检测到竞争剂KM3060var的结合信号。从这个角度讲,9E10J可能对无Treg细胞的免疫疗法有作用。
表1
表2
表2续:
表3
*SEQ ID NO:1与SEQ ID NO:13一样
**SEQ ID NO:2与SEQ ID NO:14一样
表4
表5:IgG形式的17G的序列
表5续
表6:IgG形式的9E的序列
表7:IgG形式的1O的序列
表8:IgG形式的11F的序列
表9
IgG |
CCR4+DT40 |
CCR4+DT40(2) |
CCR4+HEK293T |
CCRF-CEM |
17G |
0.42±0.07nM |
0.42±0.03nM |
0.62±0.22nM |
0.16±0.02nM |
9E |
0.72±0.28nM |
0.17±0.03nM |
0.36±0.19nM |
0.39±0.02nM |
KM3060var |
3.67±0.29nM |
4.82±0.16nM |
11.40±1.74nM |
79.83±6.59nM |
表10
表11
表11续
表12
表12续
表13:IgG形式的9E10J的序列
表14:IgG形式的9E1D的序列
表15:如从结合抑制实验所测定的表观亲和力(IC50和KD)
表16:如在Ca++流分析中所测定的,导致50%TARC诱导的CCR4信号转导(IC50)的计算的抗体浓度
表17:抗CCR4抗体的比较的ADCC活性
表18:去岩藻糖化的9E10J抗CCR4抗体与未修饰的9E10J和比较剂KM3060var的比较的ADCC活性
表19:如在流式细胞计数中通过饱和抗体对细胞滴定所测量的表观亲和力(KD)
ND:未测量
表20如对DT-40-CCR4+和CCRF-CEM细胞的竞争结合实验所测定的,生物素化的MDC对细胞结合抑制的IC50值和计算的亲和力(KD)
表21如对DT-40-CCR4+和CCRF-CEM细胞的竞争结合实验所测定的,生物素化的TARC对细胞结合抑制的IC50值
表22从竞争实验测量的IC50-值的概括
表23
*修正的序列
表24
IgG单独 |
%凝聚 |
9E10J |
未检测到 |
抗-GFP |
未检测到 |
配体单独 |
|
TARC |
98% |
MDC |
97% |
预孵育IgG/配体 |
|
抗-GFP/TARC |
88% |
抗-GFP/MDC |
100% |
9E10J/TARC |
82% |
9E10J/MDC |
93% |
IgG/配体混合物 |
|
9E10J/TARC |
100% |
9E10J/MDC |
78% |
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