CN102043864A - 中药心血管毒性分析的计算机操作方法及其系统 - Google Patents

Abstract

本发明涉及中药心血管毒性分析相关技术领域，特别是中药心血管毒性分析的计算机操作方法及其系统。一种中药心血管毒性分析的计算机操作方法，所述方法包括以下步骤：获取中药检索信息的获取步骤；根据检索信息从数据库中获取中药信息的检索步骤；显示中药信息的显示步骤。本发明通过对中药进行检索，从而使用户知道某一味中药可能有心血管毒性，达到中药心血管毒性预测的目的。通过预测中药心血管毒性，提高心血管毒性评价实验的目的性，减少资源浪费，加快中药进入世界市场的进程。

Description

中药心血管毒性分析的计算机操作方法及其系统

技术领域

 本发明涉及中药心血管毒性分析相关技术领域，特别是中药心血管毒性分析的计算机操作方法及其系统。

背景技术

中药进入世界市场是大势所趋，中药如果要得到国际医药主流社会的接受，首先要解决的是药物安全性的问题，心血管毒性是药物安全性评价的重要指标之一。然而，心血管毒性评价实验周期长、代价昂贵，是中药进入世界市场的瓶颈问题。

发明内容

本发明的第一个发明目的，在于提供中药心血管毒性分析的计算机操作方法，以解决现有技术中,中药心血管毒性分析时间周期过长的技术问题。

为了实现本发明的第一个发明目的，采用的技术方案如下：

一种中药心血管毒性分析的计算机操作方法，所述方法包括以下步骤：

获取中药检索信息的获取步骤；

根据检索信息从数据库中获取中药信息的检索步骤；

显示中药信息的显示步骤。

作为一种优选方案，所述中药检索信息包括：中药名称和/或中药处方和/或活性成分结构。

作为进一步的优选方案，所述数据库包括中药数据库和心血管毒性分子数据库。

作为更进一步的优选方案，所述中药信息包括：中药的基本信息和/或文字记载的毒性信息和/或毒性分子结构及其文字描述信息。

作为再进一步的优选方案，如果获取的中药检索信息为中药名称，则所述检索步骤具体包括：

根据中药名称从中药数据库中检索获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

根据获取的活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

作为再进一步的优选方案，如果获取的中药检索信息为中药处方，则所述检索步骤具体包括：

根据中药处方从中药数据库中检索所述中药处方所包含的所有的中药名称；

根据每个中药名称从中药数据库中检索获取每个中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

根据获取的活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

作为再进一步的优选方案，如果获取的中药检索信息为活性成分结构，则所述检索步骤具体包括：

根据活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

作为更进一步的优选方案，所述活性结构比较规则为：将活性成分结构与心血管毒性分子数据库中的所有毒性分子结构进行相似度计算，大于阈值的毒性分子结构为满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构。

优选地，所述阈值为75%。

所述相似度计算的具体方式如下：

对所需检索的活性成分结构的分子结构A拆分片段，得到包含多个片段的片段组FA = {fa₁,fa₂,fa₃…fa_m}，其中fa_m为第m个片段；

对心血管毒性分子数据库中保存的第一毒性分子结构B，拆分片段，得到包含多个片段的片段组FB = {fb₁,fb₂,fb₃…fb_n}，其中fa_n为第n个片段;

计算相似度S(A,B) = (FA ∩ FB) / (FA ∪ FB)。

m和n可以为不同的数值，也可以相同。

本发明的第二个发明目的，在于提供一种中药心血管毒性分析的计算机系统，以实现本发明第一个发明目的所提供的一种中药心血管毒性分析的计算机操作方法。

一种中药心血管毒性分析的计算机系统，所述系统包括：

用于获取中药检索信息的获取模块；

根据检索信息从数据库中获取中药信息的检索模块；

显示中药信息的显示模块;

所述数据库包括中药数据库和心血管毒性分子数据库，所述检索模块包括中药名称检索子模块、中药处方子模块和活性成分结构子模块；

中药名称子模块根据中药名称从中药数据库中检索获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

中药处方子模块根据中药处方从中药数据库中检索所述中药处方所包含的所有的中药名称；

活性成分结构子模块根据活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

本发明通过对中药进行检索，从而使用户知道某一味中药可能有心血管毒性，达到中药心血管毒性预测的目的。通过预测中药心血管毒性，提高心血管毒性评价实验的目的性，减少资源浪费，加快中药进入世界市场的进程。

附图说明

    图1是本发明实施例系统运行过程说明图；

图2是本发明实施例系统结构示意图；

图3是本发明实施例系统功能模块图；

图4是本发明实施例预测方法的说明图。

具体实施方式

下面结合附图和具体实施例对本发明做进一步详细的说明。

图1给出了这种中药心血管毒性分析的计算机系统运行过程说明，首先用户检索使用，可以通过检索中药的名称，也可以检索处方，还可以通过结构进行检索。用户输入的中药名称自动进入中药数据库进行检索查询获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构信息等；处方名称自动进入中药材数据库进行检索获取处方由哪些中药组成，再自动将处方中的每一味中药进行检索获取其中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构信息等；中药的基本信息、文字记载的毒性信息直接反馈给用户，活性成分结构信息则自动进入毒性小分子库进行检索，找出哪些毒性小分子的结构与中药的活性成分结构相似，把相似的结构列出来，同时给出描述这个毒性结构的文字信息，再将这部分反馈给用户；结构检索则直接进入毒性小分子数据库进行检索，取得毒性分子结构与文字描述信息反馈给用户，化合物结构检索可以进行单分子检索也可以上传分子结构库进行多个分子同时检索。

对毒性小分子库中的分子结构与所需检索的活性成分结构信息进行相似度计算的方式如下：

1．将分子结构拆分成若干片段，按照以下公式进行相似度计算：

分子结构A和分子结构B，拆分片段：分子结构A的片段FA = {fa₁,fa₂,fa₃…fa_m}、分子结构B的片段FB = {fb₁,fb₂,fb₃…fb_n}，相似度S(A,B) = (FA ∩ FB) / (FA ∪ FB) 。

2.返回相似度S大于预先设定的阈值的分子结构，优选地选择阈值为75%。

图2给出了这种中药心血管毒性分析的计算机系统的结构示意图。

一种中药心血管毒性分析的计算机系统200，所述系统200包括：

用于获取中药检索信息的获取模块210；

根据检索信息从数据库220中获取中药信息的检索模块230；

显示中药信息的显示模块240。

所述数据库220包括中药数据库221和心血管毒性分子数据库222，所述检索模块230包括中药名称检索子模块231、中药处方子模块232和活性成分结构子模块233；

中药名称子模块根据中药名称从中药数据库中检索获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

中药处方子模块根据中药处方从中药数据库中检索所述中药处方所包含的所有的中药名称；

活性成分结构子模块根据活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

图3给出了这种中药心血管毒性分析的计算机系统的功能模块。

输入模块用于实现用户输入的功能，可以进行文字输入、结构输入和化合物结构库上传输入等（即所述获取模块210）。

显示模块用于实现系统查询计算的结果显示呈现的功能。既有文字信息也有结构信息（即所述显示模块240）。

存储模块用于实现各个数据库221及222的读取存放功能。

信息处理模块主要用于实现化合物结构相似度计算功能。

（存储模块与信息处理模块共同构成所述检索模块）

用户子系统用于实现用户的创建登陆解决多用户冲突等问题的功能。

安全检测子系统保障系统能够按照设定的程序正常运行。

信息录入子系进行后台操作，用于实现数据库的更新功能。

图4说明解释了这种中药心血管毒性分析的计算机操作方法。即在中药活性成分数据库中进行检索，将某味中药的活性成分分子结构送到心血管毒性分子数据库中进行相似度计算，将大于阈值的结构（包括中药活性成分结构和心血管毒性分子结构）反馈显示出来，再结合其文字描述信息一并反馈给用户，使得用户知道到某一味中药可能有心血管毒性，达到中药心血管毒性预测的目的。

Claims (10)

1. 一种中药心血管毒性分析的计算机操作方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

获取中药检索信息的获取步骤；

根据检索信息从数据库中获取中药信息的检索步骤；

显示中药信息的显示步骤。

2.根据权利要求1所述的操作方法，其特征在于，所述中药检索信息包括：中药名称和/或中药处方和/或活性成分结构。

3.根据权利要求2所述的操作方法，其特征在于，所述数据库包括中药数据库和心血管毒性分子数据库。

4.根据权利要求3所述的操作方法，其特征在于，所述中药信息包括：中药的基本信息和/或文字记载的毒性信息和/或毒性分子结构及其文字描述信息。

5.根据权利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果获取的中药检索信息为中药名称，则所述检索步骤具体包括：

根据中药名称从中药数据库中检索获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

根据获取的活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

6.根据权利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果获取的中药检索信息为中药处方，则所述检索步骤具体包括：

根据中药处方从中药数据库中检索所述中药处方所包含的所有的中药名称；

根据每个中药名称从中药数据库中检索获取每个中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

根据获取的活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

7.根据权利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果获取的中药检索信息为活性成分结构，则所述检索步骤具体包括：

根据活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

8.根据权利要求5～7任一项所述的操作方法，其特征在于，所述活性结构比较规则为：将活性成分结构与心血管毒性分子数据库中的所有毒性分子结构进行相似度计算，大于阈值的毒性分子结构为满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构。

9.根据权利要求8所述的操作方法，其特征在于，所述相似度计算的具体方式如下：

对所需检索的活性成分结构的分子结构A拆分片段，得到包含多个片段的片段组FA = {fa₁,fa₂,fa₃…fa_m}，其中fa_m为第m个片段；

对心血管毒性分子数据库中保存的第一毒性分子结构B，拆分片段，得到包含多个片段的片段组FB = {fb₁,fb₂,fb₃…fb_n}，其中fa_n为第n个片段;

计算相似度S(A,B) = (FA ∩ FB) / (FA ∪ FB)。

10.一种中药心血管毒性分析的计算机系统，用于实现权利要求1～8任一项所述的方法，其特征在于，所述系统包括：

用于获取中药检索信息的获取模块；

根据检索信息从数据库中获取中药信息的检索模块；

显示中药信息的显示模块;

所述数据库包括中药数据库和心血管毒性分子数据库，所述检索模块包括中药名称检索子模块、中药处方子模块和活性成分结构子模块；

中药名称子模块根据中药名称从中药数据库中检索获取中药的基本信息、文字记载的毒性信息、活性成分结构；

中药处方子模块根据中药处方从中药数据库中检索所述中药处方所包含的所有的中药名称；

活性成分结构子模块根据活性成分结构，从心血管毒性分子数据库中选择满足活性成分结构比较规则的毒性分子结构及其文字描述信息。

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