CA2748313A1 - Novel fluorescent boron-substituted dipyrromethenes and use thereof for diagnosis - Google Patents
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Abstract
La présente invention se rapporte ô de nouveaux composés fluorescents dérivés de dipyrrométhènes-bore non fluorés, leur procédé de préparation et leur utilisation pour le marquage fluorescent de molécules biologiques. L'invention se rapporte encore ô des molécules biologiques marquées avec lesdits composés fluorescents et leur utilisation dans des méthodes de détection telles que des méthodes de diagnostic médical; en particulier, les méthodes de détection selon l'invention s'avèrent particulièrement utiles pour le diagnostic de maladies neurodégénératives telles que la maladie d'Alzheimer.The present invention relates to novel fluorescent compounds derived from nonfluorinated dipyrromethene boron, process for their preparation and their use for fluorescent labeling of biological molecules. The invention further relates to biological molecules labeled with said fluorescent compounds and their use in detection methods such as medical diagnostic methods; in particular, the detection methods according to the invention are particularly useful for the diagnosis of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease.
Description
Nouveaux composés dipyrrométhènes-borosubstitués fluorescents et leur utilisation pour le diagnostic La présente invention se rapporte à de nouveaux composés fluorescents dérivés non fluorés de dipyrrométhènes-bore, leur procédé de préparation et leur utilisation pour le marquage fluorescent de molécules biologiques. L'invention se rapporte encore à des molécules biologiques marquées avec lesdits composés fluorescents et leur utilisation dans des méthodes de détection telles que des méthodes de diagnostic médical ; en particulier, les méthodes de détection selon l'invention s'avèrent particu-lièrement utiles pour le diagnostic de maladies neurodégénératives telles que la maladie d'Alzheimer.
Les marqueurs fluorescents sont très utilisés pour détecter et/ou doser des molécules biologiques dans les domaines de l'immunologie, de la biologie molécu-laire, du diagnostic médical ou encore des puces à ADN.
Parmi les nombreux composés de l'art antérieur utilisables comme marqueurs fluorescents, on peut citer notamment les difluorures de dipyrrométhènes-bore (désignés ci-après par DFMB). Les brevets US 4,774,339, US 5,187,288 et US 5,451,663 décrivent des composés dérivés de DFMB contenant des groupes fonctionnels fluorescents pouvant être utilisés pour marquer des molécules biolo-giques ou des polymères.
Cependant, les dérivés de DFMB sont instables chimiquement ; ainsi, en milieu basique ou en présence de nucléophiles tels que des amines ou des alcoolats, les atomes de fluor de ces composés sont facilement substitués.
Les Demandes Internationales WO 2006/087459 et WO 2006/087458 décrivent des composés dérivés de dipyrrométhènes-bore non fluorés. Ces composés présentent une meilleure stabilité chimique que les dérivés DFMB ; en particulier, ils sont résistants aux conditions basiques utilisées notamment pour la déprotection des groupements de type carbamate (par exemple : Fmoc) lors des synthèses automatisées de polypeptides.
Il demeure cependant le besoin de disposer de composés fluorescents présen-tant :
- une stabilité chimique encore améliorée ; New fluorescent dipyrromethene-borosubstituted compounds and their use for diagnosis The present invention relates to novel fluorescent compounds derived non-fluorinated dipyrromethene boron compounds, their process of preparation and their use for the fluorescent labeling of biological molecules. The invention relates to still to biological molecules labeled with said fluorescent compounds and their use in detection methods such as methods of diagnostic medical; in particular, the detection methods according to the invention are particularly useful for the diagnosis of neurodegenerative diseases such as the Alzheimer's disease.
Fluorescent markers are widely used to detect and / or assay biological molecules in the fields of immunology, biology molecular medical diagnosis or microarray.
Among the many compounds of the prior art that can be used as markers fluorescents, mention may in particular be made of dipyrromethene boron difluorides (hereinafter referred to as DFMB). US Patents 4,774,339, US 5,187,288 and US 5,451,663 disclose compounds derived from DFMB containing groups functional fluorescers that can be used to label molecules bio-or polymers.
However, the DFMB derivatives are chemically unstable; so, in basic medium or in the presence of nucleophiles such as amines or alcoholates, the fluorine atoms of these compounds are easily substituted.
International Applications WO 2006/087459 and WO 2006/087458 describe non-fluorinated dipyrromethene-boron compounds. These compounds exhibit better chemical stability than DFMB derivatives; in particular, they are resistant to the basic conditions used in particular for the deprotection carbamate groupings (for example: Fmoc) during syntheses automated of polypeptides.
However, there remains the need for fluorescent compounds with so much:
- further improved chemical stability;
2 - un haut rendement quantique de fluorescence et des coefficients d'extinction molaire élevés ;
des longueurs d'onde d'excitation et d'émission pouvant être contrôlées ; et - une fonction permettant un greffage aisé sur des molécules biologiques.
C'est ce à quoi est parvenue la Demanderesse en mettant au point de nouveaux composés fluorescents de formules générale (I) qui sont des dérivés non fluorés de dipyrrométhènes-bore présentant une fonction carbonyle permettant leur greffage sur des molécules biologiques. Les composés de formule générale (I) sont plus stables chimiquement que les fluorophores traditionnels comme la fluorescéine, les rhodamines et les difluoroboradiazaindacènes ; en outre, ces composés sont résistants aux différents réactifs utilisés lors de la synthèse sur support solide de peptides ou d'oligonucléotides et sont donc particulièrement adaptés au marquage des acides aminés ou des nucléotides.
Dans le cadre de l'invention, on entend par molécule biologique un acide aminé, un polypeptide, une protéine, la biotine ou ses dérivés ou analogues structu-raux, un nucléotide ou un acide nucléique (ARN, ADN).
Un fluorophore (aussi désigné par composé ou marqueur fluorescent) est un composé comportant un groupement fonctionnel capable d'absorber l'énergie lumi-neuse à une longueur d'onde (dite longueur d'onde d'excitation ou d'absorption) et de restituer toute ou partie de l'énergie absorbée par une émission lumineuse à
une longueur d'onde (dite longueur d'onde d'émission) égale ou plus grande que la longueur d'onde d'absorption ; un fluorophore peut être lié de façon covalente à une molécule telle qu'une molécule biologique.
De façon générale, une molécule est dite marquée lorsqu'elle comporte au moins un atome ou un groupement d'atomes détectable tel qu'un atome ou un groupement radioactif, un chromophore ou un fluorophore.
Dans le cadre de la présente invention, à moins qu'il n'en soit précisé autre-ment, une molécule est dite marquée lorsqu'elle est liée de façon covalente à
un fluorophore.
On entend par marquage le procédé consistant à lier de façon covalente un fluorophore à une molécule biologique ; de préférence, la molécule biologique est un WO 2010/076432 a high fluorescence quantum yield and coefficients high molar extinction;
excitation and emission wavelengths that can be controlled; and a function allowing easy grafting onto biological molecules.
This is what the Claimant has achieved by developing new fluorescent compounds of general formulas (I) which are non-fluorinated dipyrromethenes-boron having a carbonyl function allowing their grafting on biological molecules. The compounds of general formula (I) are more stable chemically that traditional fluorophores such as fluorescein, rhodamines and difluoroboradiazaindacenes; in addition, these compounds are resistant to the different reagents used during the solid support synthesis of peptides or oligonucleotides and are therefore particularly suitable for the marking of acids amino acids or nucleotides.
In the context of the invention, the term "biological molecule" means an acid amino acid, a polypeptide, a protein, biotin or its derivatives or the like structured a nucleotide or a nucleic acid (RNA, DNA).
A fluorophore (also referred to as a fluorescent compound or marker) is a compound having a functional group capable of absorbing light energy at a wavelength (called the excitation wavelength or absorption) and restore all or part of the energy absorbed by a light emission to a wavelength (so-called emission wavelength) equal to or greater than the absorption wavelength; a fluorophore can be covalently bonded to one molecule such as a biological molecule.
In general terms, a molecule is labeled when it contains least one atom or a group of detectable atoms such as an atom or a radioactive group, a chromophore or a fluorophore.
In the context of the present invention, unless otherwise specified a molecule is said to be labeled when it is covalently bound to a fluorophore.
By labeling is meant the process of covalently binding a fluorophore to a biological molecule; preferably, the biological molecule is a WO 2010/07643
3 PCT/FR2009/001486 acide aminé ou un nucléotide, le fluorophore étant alors couplé sur la chaîne latérale de l'acide aminé ou du nucléotide.
O
//
__C\
Une fonction carbonyle est une fonction de structure suivante :
présente par exemple dans un acide carboxylique, un ester, un amide ou un thioester.
Dans le cadre de la présente invention, la fonction carbonyle des composés de formule générale (I) est définie par le groupement -(Ar),,,-CO-Z où Ar, m et Z sont définis ci-après.
L'invention concerne ainsi plus particulièrement les composés de formule générale (I) N /N
B
R4 S1 S2 R7 (I) dans laquelle :
R' est choisi dans le groupe constitué par -Ar-CO-Z; un atome d'hydrogène (-H) ; -L-H ; -G et -L-G ;
où Ar, Z, L et G sont définis ci-après ;
- R3, R4, R6 et R7 sont choisis indépendamment les uns des autres dans le groupe constitué par -(Ar),,,-CO-Z ; un atome d'hydrogène (-H) ; -L-H ; -G et -L-G ;
où m est O ou 1;
étant entendu qu'un seul des substituants R', R3, R4, R' et R7 est -Ar-CO-Z ou -(Ar)1,,-CO-Z ; préférentiellement R' est -Ar-CO-Z ;
- R2 et R5 identiques ou différents sont choisis indépendamment l'un de l'autre dans le groupe constitué par un atome d'hydrogène (-H) ; -L-H ; -G et -L-G ;
où L et G sont définis ci-après ;
S' et SZ sont des groupements hydrophiles, identiques ou différents, de formule -C=C-L'-A ;
dans laquelle L' et A sont définis ci-après ; 3 PCT / FR2009 / 001486 amino acid or a nucleotide, the fluorophore then being coupled on the chain lateral amino acid or nucleotide.
O
//
__VS\
A carbonyl function is a function of following structure:
for example in a carboxylic acid, an ester, an amide or a thioester.
In the context of the present invention, the carbonyl function of the compounds of formula general (I) is defined by the grouping - (Ar) ,,, - CO-Z where Ar, m and Z are defined above after.
The invention thus relates more particularly to compounds of formula general (I) N / N
B
R4 S1 S2 R7 (I) in which :
R 'is selected from the group consisting of -Ar-CO-Z; an atom hydrogen (-H); -LH; -G and -LG;
where Ar, Z, L and G are defined below;
- R3, R4, R6 and R7 are chosen independently of each other in the group consisting of - (Ar) ,,, - CO-Z; a hydrogen atom (-H); -LH; -G and -LG;
where m is 0 or 1;
it being understood that only one of the substituents R ', R3, R4, R' and R7 is -Ar-CO-Z or -(Ar) 1 ,, - CO-Z; preferentially R 'is -Ar-CO-Z;
- R2 and R5 identical or different are independently selected one of the other in the group consisting of a hydrogen atom (-H); -LH; -G and -LG;
where L and G are defined below;
S 'and SZ are hydrophilic groups, identical or different, of formula -C = C-A-A;
in which L 'and A are defined below;
4 - Ar est choisi parmi un arylène ou un hétéroarylène en C5-C14 sur lequel le groupe -CO-Z est en position ortho, méta ou para, de préférence para ; Ar est préfé-rentiellement un groupe benzène, naphtalène, anthracène, pyrène, pyridine, pyrimidine, thiophène ou pyrrole ;
- Z est un groupement permettant le greffage du composé de formule générale (I) sur une molécule biologique ; en particulier, Z est choisi parmi un groupement -OH, -0-succinimide, -0-maléimide, -N-glycine, -N-lysine, -Y-L"-NH2, -Y-L"-000H, -Y-L"-SH où Y est choisi parmi les atomes de N et O et L" est défini ci-après ;
- L et L" sont choisis indépendamment l'un de l'autre parmi une liaison simple ; une chaîne carbonée saturée éventuellement ramifiée en C1-C10, de préférence en C1-C6 ; un arylène en C6-C16 sur lequel les groupements -H ou -G pour L et -NH2, -COOH ou -SH pour L" sont en position ortho, méta ou para, de préférence para ; un alkénylène en C2-C4; un alkynylène en C2-C4; une chaîne carbonée linéaire ou ramifiée en CI-C20 interrompue par 1 à 10 atomes d'oxygène ; une chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée en C1-C20 interrompue par une à quatre fonctions amides -CO-NH- ; un segment nucléotidique et/ou un segment de sucres ;
G est choisi dans le groupe constitué par l'ester succinimidyle, l'ester sulfosuccinimidyle, l'isothiocyanate, l'isocyanate, l'iodoacétamide, la maléimide, les halosulfonyles, les phosphoramidites, les alkylimidates en C2-C5, les arylimidates en C6-C10, les halogénoacides, de préférence, les chloroacides et les bromoacides, les hydrazines substituées par un alkyle en C1-C4, les hydroxylamines substituées par un alkyle en C1-C4, les carbodiimides et les perfluorophénols ;
L' est choisi parmi une liaison simple ; un alkénylène en C1-CIO ou une chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée, en CI-C20 interrompue par 1 à
10 atomes d'oxygène ;
A représente un groupement choisi parmi un alkyle en CI-C4, de préfé-rence, le méthyle ; un groupement phosphate ou un groupement sulfonate.
De façon préférée, A est un méthyle, un propyl sulfonate, un éthyl sulfonate ou un méthylphosphate.
Les groupements arylènes en C6-C16 préférés sont choisis parmi le benzène, le naphtalène et l'anthracène.
Par les termes alkyle en CI-C4 , on désigne dans l'invention un radical hydrogénocarboné linéaire ou ramifié ou un cycloalkyle comprenant de 1 à 4 atomes de carbone ; on peut citer par exemple un méthyle, un propyle, iin n-butyle, un isopropyle... 4 Ar is chosen from an arylene or a C5-C14 heteroarylene on which the group -CO-Z is in the ortho, meta or para position, preferably para; Ar is preferred essentially benzene, naphthalene, anthracene, pyrene, pyridine, pyrimidine, thiophene or pyrrole;
Z is a group allowing the grafting of the compound of formula general (I) on a biological molecule; in particular, Z is selected from a group -OH, -O-succinimide, -O-maleimide, -N-glycine, -N-lysine, -YL "--YL "-000H, -YL" -SH where Y is selected from the atoms of N and O and L "is defined below;
L and L "are chosen independently of one another from a bond simple; a saturated carbon chain optionally branched C1-C10, preference C1-C6; a C 6 -C 16 arylene on which the groups -H or -G for L and --COOH or -SH for L "are in the ortho, meta or para position, preferably para ; a C2-C4 alkenylene; C2-C4 alkynylene; a linear carbon chain or branched C 1 -C 20 interrupted by 1 to 10 oxygen atoms; chain carbonaceous saturated, linear or branched C1-C20 interrupted by one to four functions amides -CO-NH-; a nucleotide segment and / or a segment of sugars;
G is selected from the group consisting of succinimidyl ester, ester sulphosuccinimidyl, isothiocyanate, isocyanate, iodoacetamide, maleimide, halosulfonyls, phosphoramidites, C2-C5 alkylimidates, arylimidates in C6-C10, the haloacids, preferably the chloroacids and the bromoacids, C1-C4 alkyl substituted hydrazines, substituted hydroxylamines by a C1-C4 alkyl, carbodiimides and perfluorophenols;
The is selected from a single bond; C1-C10 alkenylene or a saturated carbon chain, linear or branched, in C 1 -C 20 interrupted by 1 to 10 atoms oxygen;
A represents a group selected from C 1 -C 4 alkyl, preferably ence, methyl; a phosphate group or a sulfonate group.
Preferably, A is a methyl, a propyl sulfonate, an ethyl sulfonate or a methylphosphate.
The preferred C 6 -C 16 arylene groups are chosen from benzene, naphthalene and anthracene.
By the terms C 1 -C 4 alkyl, is meant in the invention a radical linear or branched hydrogen carbonate or a cycloalkyl comprising from 1 to 4 carbon of carbon ; for example, methyl, propyl, n-butyl, a Isopropyl ...
5 Par alkénylène en C2-C4 , on entend dans l'invention une chaine carbonée linéaire de 2 à 4 atomes de carbone comprenant une double liaison entre deux atomes de carbone.
Par alkynylène en C2-C4 , on entend dans l'invention une chaine carbonée linéaire de 2 à 4 atomes de carbone comprenant une triple liaison entre deux atomes de carbone.
Par alkénylène en C2-CIO , on entend dans l'invention une chaine carbonée linéaire de 2 à 10 atomes de carbone comprenant au moins une double liaison entre deux atomes de carbone.
De préférence, dans le cadre de l'invention, la chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée en CI-C20 interrompue par 1 à 10 atomes d'oxygène est un poly(oxyde d'éthylène) ou un poly(oxyde de propylène) dont le motif se répète entre une et six fois.
Par segment nucléotidique, on entend une chaîne linéaire comprenant un ou plusieurs nucléotides.
Par segment de sucre, on entend une chaîne linéaire comprenant un ou plusieurs oses.
Le choix des radicaux RI à R7 permet de modifier les propriétés du composé, telles que, par exemple, sa longueur d'onde d'émission de fluorescence, son rendement quantique de fluorescence, sa solubilité et son moment dipolaire.
Une famille particulière de composés selon l'invention comprend les composés de formule générale (I) symétriques, c'est-à-dire dans lesquels R2 et R5 sont identiques, R3 et R6 sont identiques, R4 et R7 sont identiques, S' et S2 sont identiques ;
auquel cas la fonction carbonyle -Ar-CO-Z est portée par R.
Par la suite, les composés de formule générale (I) sont également désignés par la formule P-(Ar),,,-CO-Z où P représente l'ensemble du composé de formule générale (I) à l'exception du substituant R' ou R3 ou R4 ou R6 ou R7 qui est le groupement -Ar-CO-Z ou -(Ar),,,-CO-Z; et où Ar, m et Z ont les mêmes définitions que ci-avant. By C 2 -C 4 alkenylene is meant in the invention a carbon chain linear of 2 to 4 carbon atoms comprising a double bond between two carbon of carbon.
By C2-C4 alkynylene is meant in the invention a carbon chain linear form of 2 to 4 carbon atoms comprising a triple bond between two carbon of carbon.
By C 2 -C 10 alkenylene is meant in the invention a carbon chain linear of 2 to 10 carbon atoms comprising at least one double bond enter two carbon atoms.
Preferably, in the context of the invention, the saturated carbon chain, linear or branched C 1 -C 20 interrupted by 1 to 10 oxygen atoms is a poly ( ethylene) or a poly (propylene oxide) whose pattern repeats between a and six times.
By nucleotide segment is meant a linear chain comprising one or several nucleotides.
By segment of sugar is meant a linear chain comprising one or several dares.
The choice of the radicals R1 to R7 makes it possible to modify the properties of the compound, such as, for example, its fluorescence emission wavelength, its yield quantum fluorescence, its solubility and its dipole moment.
A particular family of compounds according to the invention comprises the compounds of general formula (I) symmetrical, that is to say in which R2 and R5 are identical, R3 and R6 are identical, R4 and R7 are identical, S 'and S2 are identical;
in which case the carbonyl function -Ar-CO-Z is carried by R.
Subsequently, the compounds of general formula (I) are also designated by the formula P- (Ar) ,,, - CO-Z where P represents the whole of the compound of formula General (I) with the exception of the substituent R 'or R3 or R4 or R6 or R7 which is the grouping -Ar-CO-Z or - (Ar) ,,, - CO-Z; and where Ar, m and Z have the same definitions as above before.
6 Les composés de formule générale (I), en plus de permettre un greffage aisé
sur des molécules biologiques, présentent de nombreux avantages :
ils émettent à une forte intensité de fluorescence et ils ne perdent pas de cette intensité lorsqu'ils sont fixés sur une molécule biologique telle qu'une protéine ;
- ils sont chimiquement résistants aux étapes de synthèse sur support solide lors de la préparation de polypeptides ou de polynucléotides ;
ils ne perturbent pas les propriétés des molécules biologiques sur lesquelles ils sont fixés.
La synthèse de composés P-(Ar),,,-CO-Z selon l'invention est réalisée à partir d'un intermédiaire de synthèse, dérivé de dipyrrométhènes-bore. Cet intermédiaire de synthèse est obtenu en mettant à réagir, avec le composé difluoré DFMB, un réactif organométallique (organomagnésien ou organolithien) de Grignard de formule SI-MgX, SI-LiX, S2-MgX ou S2LiX, où X est un atome d'halogène, dans les conditions décrites dans la Demande Internationale PCT WO 2006/087459 ; cette réaction permet d'introduire les groupements SI et S2 dans le composé difluoré DFMB.
Cet intermédiaire de -synthèse a pour formule P-(Ar)m Q ; où P, m et Ar sont tels que définis pour la formule (I) et Q est choisi parmi un atome d'halogène, en particulier, I, Br ou Cl ; un groupement -0-triflate (le triflate a pour formule -O-S02-CF3 et est aussi désigné par Tf) ; un groupement -0-tosylate (le tosylate a pour formule -O-S02-C6H6-CH3 et est aussi désigné par Ts) ou un groupement -O-mésylate (le mésylate a pour formule -O-S02-CH3 et est aussi désigné par Ms).
A partir de cet intermédiaire de synthèse P-(Ar),,,-Q, le radical -Q est transformé en fonction carbonyle par réaction avec une source de monoxyde de carbone ou du monoxyde de carbone, en présence :
- d'un nucléophile choisi selon la nature de la fonction carbonyle souhaitée :
de l'eau pour obtenir un acide carboxylique ; un alcool pour obtenir un ester ;
une amine pour obtenir un amide et un thiol pour obtenir un thioester ; et - d'un catalyseur à base de palladium, par exemple le Pd(PPh3)2C12.
Le schéma de cette synthèse est représenté sur la Figure 1.
Le monoxyde de carbone utilisé dans cette réaction peut être non marqué ;
marqué avec un atome de 13C avec un taux de marquage contrôlable de 1 à 99 %
pour un suivi RMN, ou marqué avec un atome 14C pour un suivi radioactif ; un tel 6 The compounds of general formula (I), in addition to allowing easy grafting on biological molecules, have many advantages:
they emit at high fluorescence intensity and they do not lose this intensity when they are attached to a biological molecule such as a protein;
they are chemically resistant to the synthesis steps on a support solid in the preparation of polypeptides or polynucleotides;
they do not disrupt the properties of biological molecules on which they are fixed.
The synthesis of compounds P- (Ar) ,,, - CO-Z according to the invention is carried out from of a synthesis intermediate, derived from dipyrromethenes-boron. This intermediate of synthesis is obtained by reacting, with the difluorinated compound DFMB, a reagent organometallic (organomagnesium or organolithium) of Grignard of formula MgX, Si-LiX, S2-MgX or S2LiX, where X is a halogen atom, in the terms described in PCT International Application WO 2006/087459; this reaction allows to introduce the groups SI and S2 in the difluorinated compound DFMB.
This -synthesis intermediate has formula P- (Ar) m Q; where P, m and Ar are as defined for formula (I) and Q is selected from an atom halogen, in especially I, Br or Cl; a group -O-triflate (the triflate has for formula -O-S02-CF3 and is also referred to as Tf); a group -O-tosylate (the tosylate has for formula -O-SO2-C6H6-CH3 and is also referred to as Ts) or a group -O-mesylate (the mesylate has the formula -O-SO 2 -CH 3 and is also referred to as Ms).
From this synthesis intermediate P- (Ar) ,,, - Q, the radical -Q is converted to carbonyl function by reaction with a source of monoxide carbon or carbon monoxide, in the presence of:
a nucleophile chosen according to the nature of the desired carbonyl function:
of water to obtain a carboxylic acid; an alcohol to obtain an ester;
an amine to obtain an amide and a thiol to obtain a thioester; and a palladium-based catalyst, for example Pd (PPh 3) 2 Cl 2.
The diagram of this synthesis is shown in Figure 1.
The carbon monoxide used in this reaction may be unlabeled;
labeled with a 13C atom with a controllable labeling rate of 1 to 99%
for NMR monitoring, or labeled with a 14C atom for radioactive monitoring; such
7 marquage permet un contrôle supplémentaire des molécules biologiques marquées par le composé (I) fluorescent selon l'invention.
Il est nécessaire d'introduire la fonction carbonyle -CO-Z sur l'intermédiaire de synthèse P-(Ar)n,-Q comportant déjà les groupements S1 et S2 sur le bore ;
en effet, la présence de fonction carbonyle n'est pas compatible avec l'utilisation d'un composé organométallique nécessaire à l'ajout de S' et S2.
Un exemple particulier de préparation de composés de formule générale (I) où
la fonction carbonyle est en R' est illustré à l'exemple 1.
De manière similaire des fonctions carbonyles peuvent être introduites directement en position R3 ou R4 ou R7 ou R6 si ces positions possèdent un groupe-ment -Q tel que défini ci-avant, par l'intermédiaire d'un couplage catalysé
par le palladium en présence de monoxyde de carbone ou de toute autre source de monoxyde de carbone.
Ainsi un objet de la présente invention se rapporte à un procédé de préparation de composés de formule générale (I), caractérisé en ce qu'il comprend la transforma-tion de l'intermédiaire de synthèse P-(Ar)m-Q en composé de formule générale (I) par réaction avec du monoxyde de carbone en présence d'un nucléophile choisi parmi l'eau, un alcool, une amine ou un thiol et d'un catalyseur au palladium ;
ledit inter-médiaire de synthèse est tel que P est un groupement de structure identique au composé de formule générale (I) à préparer à l'exception du radical R' ou R3 ou R4 ou R6 ou R7 selon celui qui est le groupement -Ar-CO-Z pour R' ou -(Ar)11,-CO-Z
pour R3 ou R4 ou R6 ou 7 ; Ar est tel que défini pour la formule (I), m est 0 ou 1 étant entendu que m est 1 si R' est la fonction carbonyle -Ar-CO-Z et Q est choisi parmi un atome d'halogène ; un -0-triflate; un -0-tosylate ou un -0-mésylate. Dans un mode de réalisation privilégié, R' est -Ar-CO-Z.
La présente invention a encore pour objet l'utilisation d'un composé de formule générale (I) comme marqueur fluorescent.
Grâce à sa fonction carbonyle, le composé de formule (I) peut aisément être greffé sur une molécule biologique telle qu'un acide aminé, une protéine, la biotine ou un de ses dérivés ou analogue structuraux ou un nucléotide. 7 marking allows additional control of labeled biological molecules by the fluorescent compound (I) according to the invention.
It is necessary to introduce the carbonyl function -CO-Z on the intermediate P- (Ar) n, -Q already having the groups S1 and S2 on boron;
indeed, the presence of carbonyl function is not compatible with the use of a organometallic compound necessary for the addition of S 'and S2.
A particular example of preparation of compounds of general formula (I) wherein the carbonyl function is in R 'is illustrated in Example 1.
Similarly, carbonyl functions can be introduced directly in position R3 or R4 or R7 or R6 if these positions have a group--Q as defined above, through catalyzed coupling speak palladium in the presence of carbon monoxide or any other source of monoxide of carbon.
Thus, an object of the present invention relates to a method of preparation compounds of general formula (I), characterized in that it comprises the transformed-synthesis of the intermediate P- (Ar) mQ to a compound of the general formula (I) by reaction with carbon monoxide in the presence of a nucleophile selected from water, an alcohol, an amine or a thiol and a palladium catalyst;
said inter synthesis medium is such that P is a grouping of structure identical to compound of general formula (I) to be prepared with the exception of radical R 'or R3 or R4 or R6 or R7 depending on which is the group -Ar-CO-Z for R 'or - (Ar) 11, -CO-Z
for R3 or R4 or R6 or 7; Ar is as defined for formula (I), m is 0 or 1 being understood that m is 1 if R 'is the carbonyl function -Ar-CO-Z and Q is chosen among one halogen atom; a -O-triflate; a -O-tosylate or a -O-mesylate. In one fashion of preferred embodiment, R 'is -Ar-CO-Z.
Another subject of the present invention is the use of a compound of general formula (I) as a fluorescent marker.
Thanks to its carbonyl function, the compound of formula (I) can easily be grafted on a biological molecule such as an amino acid, a protein, the biotin or one of its structural derivatives or analogs or a nucleotide.
8 Ainsi, selon un autre de ses objets, la présente invention se rapporte à une molécule biologique marquée de formule générale (II) (ci-après désignée par molécule biologique marquée ) :
P-(Ar),,,-CO-(X)õ-T (II) dans laquelle :
P, Ar et m sont tels que définis ci-avant ; m est 0 ou 1 étant entendu que m est 1 si le groupement -(Ar),,CO-(X)õ-T est substitué à R1 ;
X est un espaceur porteur d'une fonction carboxylique, amine ou thiol ;
il est par exemple une chaîne comprenant entre un et trois acides aminés, ou encore un alkylène en C1-C6 pouvant être interrompu par 2 ou 3 atomes d'oxygène et se liant de façon covalente au fluophore et à la molécule biologique par l'intermédiaire d'une fonction amide, éther, ester ou thioester ou d'un pont disulfure ;
n est un nombre entier égal à 0 ou 1 - T est une molécule biologique.
Dans le cadre de l'invention, l'espaceur sert à éloigner la molécule biologique T du fluorophore P. De préférence, l'espaceur est inerte chimiquement, c'est-à-dire qu'il ne réagit avec aucun des groupements qu'il éloigne ; en particulier, il n'affecte pas la fluorescence du fluorophore ni l'activité biologique de la molécule biologique.
En tant que molécule biologique, T est choisi parmi un acide aminé naturel ou synthétique, un polypeptide, une protéine, la biotine ou ses dérivés ou analogues structuraux, un nucléotide ou un acide nucléique (ARN, ADN).
Lorsque T est un acide aminé, il est choisi parmi l'alanine, l'arginine, l'asparagine, l'aspartate ou l'acide aspartique, la cystéine, le glutamate ou l'acide glutamique, la glutamine, la glycine, l'histidine, l'isoleucine, la leucine, la lysine, la méthionine, la phénylalanine, la proline, la sérine, la thréonine, le tryptophane, la tyrosine et la valine. De préférence, T est la lysine ou la glycine.
Lorsque T est un nucléotide, il est choisi parmi les ribonucléotides tels que l'adénosine, l'uridine, la guanosine, la cytidine ou la ribothymidine ou les désoxyribo-nucléotides tels que la désoxyadénosine, la désoxyuridine, la désoxyguanosine, la désoxycytidine ou la désoxyribothymidine.
Les molécules biologiques marquées sont préparées selon les méthodes qui suivent. 8 Thus, according to another of its objects, the present invention relates to a labeled biological molecule of general formula (II) (hereinafter referred to as labeled biological molecule):
P- (Ar) ,,, - CO- (X) õ-T (II) in which :
P, Ar and m are as defined above; m is 0 or 1 being understood that m is 1 if the group - (Ar) ,, CO- (X) õ-T is substituted for R1;
X is a spacer carrying a carboxylic, amine or thiol function;
it is for example a chain comprising between one and three amino acids, or one again C1-C6 alkylene which can be interrupted by 2 or 3 oxygen atoms and binder of covalently to the fluophore and the biological molecule via a amide, ether, ester or thioester function or a disulfide bridge;
n is an integer equal to 0 or 1 - T is a biological molecule.
In the context of the invention, the spacer serves to remove the molecule organic Preferably, the spacer is chemically inert, i.e.
say that he does not react with any of the groups he is moving away; in particular, he affects not the fluorescence of the fluorophore nor the biological activity of the molecule organic.
As a biological molecule, T is selected from a naturally occurring amino acid or synthetic, a polypeptide, a protein, biotin or its derivatives or similar nucleotide or nucleic acid (RNA, DNA).
When T is an amino acid, it is chosen from alanine, arginine, asparagine, aspartate or aspartic acid, cysteine, glutamate or acid glutamine, glutamine, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, the methionine, phenylalanine, proline, serine, threonine, tryptophan, the tyrosine and valine. Preferably, T is lysine or glycine.
When T is a nucleotide, it is chosen from ribonucleotides such as adenosine, uridine, guanosine, cytidine or ribothymidine or deoxyribonucleic nucleotides such as deoxyadenosine, deoxyuridine, deoxyguanosine, the deoxycytidine or deoxyribothymidine.
The marked biological molecules are prepared according to the methods follow.
9 Lorsque T est un acide aminé ou une protéine, la préparation de la molécule biologique marquée de formule générale (II) est réalisée à partir d'un composé
de formule générale (I) fonctionnalisé avec un groupement Z porteur d'un acide carboxylique ; ledit composé (I) est (i) transformé en ester d'hydroxysuccinimide ou de tétrafluorophényle puis (ii) mis à réagir avec l'acide aminé ou la protéine (Guide to Labeling proteins with Fluorescent Dyes - Note 7.1 http://www.invitrogen.com/site/
us/en/home/References/Molecular-Probes-The-Handbook/).
Le couplage peptidique peut également être réalisé avec du 1-(3-diméthylami-nopropyl)-3-éthylcarbodiimide (EDCI, voir l'exemple 1).
Il peut être avantageux d'utiliser à l'étape (ii) un acide aminé déjà lié à un groupement protecteur du' type BOC (t-Butoxycarbonyl), Fmoc (9-Fluorényl-méthyloxycarbonyl), Bpoc (2-(4-biphénylyl) propyl(2)oxycarbonyl), Nps (2-nitro-phénylsulfényl) ou Dts (dithia-succionyl), le groupement protecteur étant introduit sur la fonction amine de l'acide aminé qui est impliquée dans la formation du poly-peptide ; en effet, ainsi protégé, l'acide aminé marqué peut ensuite être utilisé dans une technique classique de synthèse de peptides en phase solide (Merrifield, R. B. J.
Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2149-2154). A l'issue de cette synthèse, on obtient un polypeptide fluorescent grâce à la présence du fluorophore sur au moins un de ses acides aminés.
Selon une variante de l'invention, T est la biotine ou un de ses dérivés ou analogues structuraux. Dans ce cas, la préparation de la molécule biologique marquée de formule générale (II) est réalisée à partir d'un composé de formule générale (I) fonctionnalisé avec un groupement Z porteur d'un acide carboxylique ; ledit composé
(I) est (i) transformé en amide par une réaction d'hydrolyse avec une diamine aliphatique pouvant être le 1,6-diaminohexane, le 1,3-diaminopropane ou le 1,2-diaminoéthane puis (ii) mis à réagir, par toute méthode classique connue de l'homme du métier, avec la biotine ou un de ses dérivés ou analogues structuraux possédant une fonction acide carboxylique libre.
Selon une autre variante de l'invention, T'est un nucléotide. Alors la prépara-tion de la molécule biologique marquée de formule générale (II) est réalisée à
partir d'un composé de formule générale (I) fonctionnalisé avec un groupement Z
porteur d'un acide carboxylique ; ledit composé (I) est mis à réagir, par toute méthode classique connue de l'homme du métier, avec un nucléotide modifié avec une fonction amine libre.
Ce nucléotide marqué est ensuite avantageusement utilisé pour la synthèse d'oligonucléotides marqués.
5 Il existe plusieurs techniques de synthèse d'oligonucléotides ; on peut notam-ment citer la synthèse oligonucléotidique sur support solide qui s'inspire de celle proposée par Merrifield en synthèse peptidique ou encore la synthèse d'oligonucléotides par la méthode au phosphoramidite (Matteucci, M. D.;
Caruthers, M. H. Tetrahedron Lett. 1980, 21, 719-722; Matteucci, M. D.; Caruthers, M. H.
J. 9 When T is an amino acid or a protein, the preparation of the molecule labeled biological compound of general formula (II) is made from a compound of general formula (I) functionalized with a group Z carrying an acid carboxylic acid; said compound (I) is (i) converted into an ester of hydroxysuccinimide or of tetrafluorophenyl and then (ii) reacted with the amino acid or the protein (Guide to Labeling proteins with Fluorescent Dyes - Note 7.1 http://www.invitrogen.com/site/
us / en / home / References / Molecular Probes-The-Handbook, /).
Peptide coupling can also be carried out with 1- (3-dimethylamino) n-propyl) -3-ethylcarbodiimide (EDCI, see Example 1).
It may be advantageous to use in step (ii) an amino acid already bound to a protecting group of the BOC (t-butoxycarbonyl), Fmoc (9-Fluorenyl) methyloxycarbonyl), Bpoc (2- (4-biphenylyl) propyl (2) oxycarbonyl), Nps (2-nitro-phenylsulfenyl) or Dts (dithia-succionyl), the protecting group being introduced on the amine function of the amino acid that is involved in the formation of the poly-peptide; indeed, so protected, the labeled amino acid can then be used in a conventional solid phase peptide synthesis technique (Merrifield, GGR
Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2149-2154). At the end of this synthesis, we obtain a fluorescent polypeptide by virtue of the presence of the fluorophore on at least one of his amino acids.
According to a variant of the invention, T is biotin or one of its derivatives or structural analogues. In this case, the preparation of the biological molecule marked of general formula (II) is carried out from a compound of formula general (I) functionalized with a group Z carrying a carboxylic acid; said compound (I) is (i) converted to an amide by a hydrolysis reaction with a diamine aliphatic may be 1,6-diaminohexane, 1,3-diaminopropane or 1,2-diaminohexane diaminoethane and then (ii) reacted by any conventional method known to the man in the art, with biotin or one of its derivatives or structural analogues possessing a free carboxylic acid function.
According to another variant of the invention, T is a nucleotide. Then the preparation labeled biological molecule of the general formula (II) is carried out at go a compound of general formula (I) functionalized with a Z group carrier a carboxylic acid; said compound (I) is reacted by any method known to those skilled in the art, with a nucleotide modified with a function free amine.
This labeled nucleotide is then advantageously used for the synthesis labeled oligonucleotides.
There are several techniques for synthesizing oligonucleotides; we can particular cite the solid-support oligonucleotide synthesis inspired by that proposed by Merrifield in peptide synthesis or synthesis oligonucleotides by the phosphoramidite method (Matteucci, MD;
Caruthers, MH Tetrahedron Lett. 1980, 21, 719-722; Matteucci, MD; Caruthers, MH
J.
10 Am. Chem. Soc. 1981, 103, 3185-3191).
L'interaction de la molécule biologique marquée avec un ligand conduit à une modification du spectre d'émission de fluorescence de ladite molécule ; de cette propriété, découle la mise au point de méthodes de détection.
Un autre avantage découlant de cette propriété est que la mise en oeuvre des méthodes de détection peut se faire uniquement avec le fluorophore selon l'invention et ne nécessite pas d'association de plusieurs fluorophores ou de couple fluorophore-suppresseur de fluorescence comme c'est par exemple le cas pour des techniques telles que la technique FRET de mesure d'interaction entre des protéines (pour Fluorescence Resonance Energy Transfer, voir Lopper et al., Protein-protein interactions : identification, 2007, Encyclopedia of Life Science) ou la PCR
en temps réel (Poitras et al., La PCR en temps réel : principes et applications, 2002, Reviews in Biology and Biotechnology, vol. 2, N 2, p.2-11) ; cela n'empêche cependant pas d'utiliser les fluorophores selon l'invention dans ces techniques.
Dans le cadre de l'invention, un ligand est une molécule dont on souhaite détecter la présence ou non dans un échantillon ; la molécule biologique est choisie pour sa propriété d'interagir avec le ligand.
Le spectre d'émission d'un fluorophore peut être mesuré par toute méthode classique connue de l'homme du métier. De préférence, le spectre d'émission de fluorescence sera mesuré à l'aide d'un spectrofluorimètre ou d'un dispositif de microscopie équipé d'un détecteur spectral ; le spectre est représenté sur un graphe avec la longueur d'onde sur l'axe des abscisses et l'intensité lumineuse sur l'axe des ordonnées. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 3185-3191).
The interaction of the labeled biological molecule with a ligand leads to a modifying the fluorescence emission spectrum of said molecule; of this property, results in the development of detection methods.
Another benefit of this property is that the implementation of the detection methods can be done only with the fluorophore according to the invention and does not require a combination of several fluorophores or couples fluorophore-fluorescence suppressor as is the case, for example, for such as the FRET technique for measuring the interaction between proteins (for Fluorescence Resonance Energy Transfer, see Lopper et al., Protein-Protein interactions: identification, 2007, Encyclopedia of Life Science) or PCR
in time Real (Poitras et al., Real-Time PCR: Principles and Applications, 2002, Reviews in Biology and Biotechnology, vol. 2, N 2, p.2-11); however, this does not prevent to use the fluorophores according to the invention in these techniques.
In the context of the invention, a ligand is a molecule which is desired detect the presence or absence of a sample; the biological molecule is selected for its property of interacting with the ligand.
The emission spectrum of a fluorophore can be measured by any method classic known to those skilled in the art. Preferably, the emission spectrum of fluorescence will be measured using a spectrofluorimeter or a of microscopy equipped with a spectral detector; the spectrum is represented on a graph with the wavelength on the x-axis and the light intensity on the axis of ordered.
11 Il est donc possible de mesurer l'indice d'anisotropie du spectre de fluorescence d'une molécule biologique marquée dans différentes conditions (en présence ou non d'échantillon à tester).
Par indice d'anisotropie d'un spectre (aussi dénommé indice spectral ou indice de déformation), on entend un indice représentatif de l'asymétrie du spectre par rapport à la position du pic principal d'émission de fluorescence.
Pour déterminer l'indice d'anisotropie des spectres mesurés, les spectres sont soumis à une analyse qui consiste à les décomposer en courbes Gaussiennes élémen-taires par déconvolution en utilisant une méthode de régression non-linéaire.
Les caractéristiques de ces courbes Gaussiennes (position du pic, amplitude, aire et dispersion) sont calculées :
- La position du pic correspond à la longueur d'onde à laquelle on observe un maximum d'intensité lumineuse ;
- L'amplitude est l'intensité lumineuse du pic ;
- L'aire est l'intégrale de l'intensité lumineuse sous la courbe ;
- La dispersion est la largeur à mi-hauteur de la courbe exprimée en longueur d'onde.
Au sein d'un même spectre, le rapport de l'amplitude ou de l'aire des deux principales Gaussiennes permet de définir l'indice de déformation du spectre de fluorescence en fonction des conditions d'enregistrement du spectre. Les variations de la valeur de l'indice de déformation du spectre mesuré en présence ou non d'un échantillon permettent de détecter la présence d'un ligand et d'en évaluer la propor-tion.
Dans une variante, l'anisotropie du spectre peut également être mesurée à
l'aide de filtres optiques à bande passante. L'indice de déformation du spectre sera alors évalué par le rapport des intensités de fluorescence mesurées à l'aide des différents filtres à bande passante.
Ainsi, selon encore un autre de ses objets, l'invention se rapporte à une méthode de détection du ligand d'une molécule biologique marquée de formule géné-rale (II) dans un échantillon comprenant les étapes suivantes :
a) mesure du spectre d'émission de fluorescence de l'échantillon à tester seul ;
le spectre obtenu est désigné ligne de base ; 11 It is therefore possible to measure the anisotropy index of the spectrum of fluorescence of a labeled biological molecule under different conditions (in presence or absence of sample to be tested).
By anisotropy index of a spectrum (also called spectral index or index deformation) means an index representative of the spectrum asymmetry by relative to the position of the main fluorescence emission peak.
To determine the anisotropy index of the measured spectra, the spectra are subjected to an analysis which consists of breaking them down into Gaussian curves elementary by deconvolution using a non-linear regression method.
The characteristics of these Gaussian curves (peak position, amplitude, area and dispersion) are calculated:
- The position of the peak corresponds to the wavelength at which one observes a maximum luminous intensity;
- The amplitude is the luminous intensity of the peak;
- The area is the integral of the luminous intensity under the curve;
- The dispersion is the halfway width of the curve expressed in length wave.
Within the same spectrum, the ratio of the amplitude or area of the two main Gaussians allows to define the spectrum deformation index of fluorescence according to the recording conditions of the spectrum. The variations of the value of the spectrum deformation index measured in the presence or absence of a sample can detect the presence of a ligand and evaluate the proportion tion.
In one variant, the anisotropy of the spectrum can also be measured at using optical filters with bandwidth. The strain index of the spectrum will be then evaluated by the ratio of the fluorescence intensities measured using of the different bandwidth filters.
Thus, according to yet another of its objects, the invention relates to a method for detecting the ligand of a labeled biological molecule of formula uncomfortable-(II) in a sample comprising the following steps:
a) measuring the fluorescence emission spectrum of the sample to be tested alone ;
the spectrum obtained is designated baseline;
12 b) mesure du spectre d'émission de fluorescence de la molécule biologique marquée en solution ; soustraction de la ligne de base au spectre obtenu et calcul de l'indice de déformation ;
c) incubation de ladite molécule biologique marquée en solution avec l'échantillon à tester et obtention d'un mélange ;
d) mesure du spectre d'émission de fluorescence du mélange obtenu à l'étape c) ; soustraction de la ligne de base au spectre obtenu et calcul de l'indice de déforma-tion ;
e) comparaison des indices de déformation calculés aux étapes b) et d) et détection de l'interaction entre le ligand et la molécule biologique marquée lorsque lesdits indices sont différents.
De préférence, à l'étape b), la molécule biologique est en solution dans une solution qui a la même composition que la solution dans laquelle on mesure le spectre de fluorescence de la molécule marquée en présence de l'échantillon biologique.
Selon une variante de l'invention, la méthode de détection permet également de quantifier le ligand dans l'échantillon. Pour ce faire, il est préalablement réalisé une courbe d'étalonnage de la valeur de l'indice de déformation du spectre en fonction de la quantité de ligand.
En outre, si le ligand peut présenter des conformations différentes -ce qui peut être le cas pour un peptide dont la conformation tridimensionnelle peut varier en fonction de son environnement-, le spectre de fluorescence de la molécule biologique marquée complexée au ligand sera différent selon la conformation du ligand ;
cette propriété permet de mettre en oeuvre une méthode de détection qualitative d'un ligand.
L'échantillon peut être d'origine biologique, c'est-à-dire qu'il représente tout ou partie d'un organe, d'un tissu, d'une cellule, d'un microorganisme...
L'échantillon peut également être de toute autre nature, il peut par exemple et sans aucun caractère limitatif, être un aliment dans lequel on veut contrôler l'absence de contaminants tels que des microorganismes indésirables ou même pathogènes, des toxines, des polluants comme des pesticides...
La mise en oeuvre de la méthode de détection selon l'invention peut également être utile pour diagnostiquer une maladie. 12 b) measuring the fluorescence emission spectrum of the biological molecule marked in solution; subtraction of the baseline to the spectrum obtained and calculation of the strain index;
c) incubating said labeled biological molecule in solution with the sample to be tested and obtaining a mixture;
d) measuring the fluorescence emission spectrum of the mixture obtained in step vs) ; subtraction of the baseline from the spectrum obtained and calculation of the index of deformity tion;
e) comparison of the strain indices calculated in steps b) and d) and detection of the interaction between the ligand and the labeled biological molecule when said indices are different.
Preferably, in step b), the biological molecule is in solution in a solution that has the same composition as the solution in which the spectrum of fluorescence of the labeled molecule in the presence of the sample organic.
According to a variant of the invention, the detection method also allows to quantify the ligand in the sample. To do this, it is previously realized a calibration curve of the value of the spectrum deformation index in function of the amount of ligand.
In addition, if the ligand may have different conformations -which can be the case for a peptide whose three-dimensional conformation can vary in according to its environment-, the fluorescence spectrum of the molecule organic labeled complexed to the ligand will be different depending on the conformation of the ligand;
this property makes it possible to implement a method of qualitative detection of a ligand.
The sample may be of biological origin, that is, it represents everything or part of an organ, a tissue, a cell, a microorganism ...
The sample may also be of any other nature, for example it may and without any limiting character, to be a food in which we want to control the absence contaminants such as undesirable or even pathogenic microorganisms, of the toxins, pollutants like pesticides ...
The implementation of the detection method according to the invention can also be useful for diagnosing a disease.
13 A ce titre, il a été mis au point une méthode de diagnostic de maladies neuro-dégénératives telles que la maladie d'Alzheimer.
L'accroissement général de la longévité favorise la prévalence de maladies neurodégénératives et, en particulier, de la maladie d'Alzheimer. Ces pathologies constituent un problème social et économique majeur pour la société moderne.
L'examen clinique associé à l'imagerie médicale et à des tests neuropsychologiques permettent un diagnostic tardif dans la phase terminale de la maladie et le diagnostic définitif ne peut être obtenu que par l'examen post mortem de tissus cérébraux, ce qui n'est pas satisfaisant. Ainsi, différentes voies ont été explorées pour identifier un marqueur biologique périphérique qui permettrait un diagnostic non invasif de la maladie.
Il a été mis en évidence que les érythrocytes sont altérés dans la maladie d'Alzheimer ; cette altération se manifeste par une conformation anormale de la protéine kinase C qui peut être provoquée par la dérégulation de la concentration calcique intracellulaire (Janoshazi et al. Neurobiol. Aging 2006, 27 : 245-251).
En outre, il a été montré que le peptide bêta-amyloïde humain, produit dans les tissus nerveux et dans le sang au cours de la maladie d'Alzheimer, pouvait interagir avec la surface des érythrocytes (Mattson MP et al. Brain Res 1997, 771: 147-153) en modifiant l'homéostasie calcique.
Les essais menés dans le cadre de l'invention montrent que les cellules vivantes, telles que les érythrocytes, préalablement placées en présence de faibles concentrations de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué, sont capables de lier subséquemment un peptide bêta-amyloïde porteur d'un fluorophore décrit dans l'invention ; cette liaison s'accompagne d'une déformation spécifique du spectre de fluorescence du fluorophore permettant d'évaluer la concentration de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué à laquelle les cellules ont été préalablement exposées. Il est donc possible de quantifier le peptide bêta-amyloïde 1-42 humain circulant chez un individu.
Plus spécifiquement, la méthode de diagnostic de la maladie d'Alzheimer met en oeuvre la méthode de détection selon l'invention ; elle permet d'évaluer la quantité
de peptide bêta-amyloïde 1-42 dans un échantillon où :
- l'échantillon biologique contient des érythrocytes, par exemple, du sang ;
et 13 As such, a method of diagnosing neurological diseases has been developed.
degenerative diseases such as Alzheimer's disease.
The general increase in longevity favors the prevalence of neurodegenerative diseases and, in particular, Alzheimer's disease. These pathologies constitute a major social and economic problem for modern society.
Clinical examination associated with medical imaging and tests neuropsychological allow for late diagnosis in the terminal phase of the disease and diagnostic definitive can only be obtained by post mortem examination of tissues brain, which is not satisfactory. Thus, different paths have been explored for identify a peripheral biological marker that would allow for a non-invasive diagnosis of the sickness.
It has been shown that erythrocytes are altered in the disease Alzheimer's disease; this alteration is manifested by an abnormal conformation of the protein kinase C that can be caused by the deregulation of the concentration intracellular calcium (Janoshazi et al., Neurobiol Aging 2006, 27: 245-251).
In addition, it has been shown that human beta-amyloid peptide, produced in the nervous tissue and in the blood during Alzheimer's disease, could interact with the erythrocyte surface (Mattson MP et al., Brain Res 1997, 771: 147-153) in modifying calcium homeostasis.
The tests carried out in the context of the invention show that the cells living organisms, such as erythrocytes, previously placed in the presence of low unlabelled beta-amyloid peptide 1-42 concentrations are able to bind subsequently a beta-amyloid peptide carrying a fluorophore described in the invention; this connection is accompanied by a specific deformation of the spectrum of fluorescence of the fluorophore to evaluate the concentration of peptide beta-Unlabelled 1-42 amyloid to which the cells were previously exposed. he It is therefore possible to quantify the circulating human beta-amyloid 1-42 peptide at a individual.
More specifically, the diagnostic method of Alzheimer's disease puts implement the detection method according to the invention; it allows to evaluate the quantity of 1-42 amyloid beta peptide in a sample where:
the biological sample contains erythrocytes, for example, blood;
and
14 - la molécule biologique marquée est telle que T est un peptide dérivé du peptide bêta-amyloïde 1-42.
Le peptide bêta-amyloïde 1-42 est le peptide de séquence SEQ ID NO: 1.
Par dérivé du peptide bêta-amyloïde 1-42, on entend un peptide dont un ou plusieurs des acides aminés ont été substitués par le même acide aminé marqué
par un composé fluorescent de formule générale (I) selon l'invention ; ce dérivé peut égale-ment comprendre une ou plusieurs insertions d'un acide aminé marqué à tout niveau de sa chaîne.
A titre d'exemple, la préparation d'un dérivé du peptide bêta-amyloïde 1-42 est décrit à l'exemple 1 et conduit au peptide suivant :
H-Asp-Ala-glu-Phe-Arg-His-Asp-Ser-Gly-Tyr-Glu-V al-His-His-Gln-Lys x-Leu-V al-Phe-Phe-Ala-Glu-Asp-V al-Gly-S er-Asn-Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met-Val-Gly-Gly-Val-Val-Ile-Ala-OH (SEQ ID NO: 1) où le fluorophore est porté par la lysine en position 16.
D'autres acides aminés que la lysine peuvent être marqués et utilisés pour préparer le dérivé du peptide bêta-amyloïde 1-42 ; il s'agit de préférence des acides aminés présentant une fonction amine ou acide carboxylique sur leur chaîne latérale.
La valeur des indices de déformation des spectres de fluorescence mesurés dans l'échantillon à tester puis la comparaison avec une courbe d'étalonnage permet d'évaluer la proportion de peptide bêta-amyloïde 1-42 présent dans l'échantillon à
tester.
Pour la mise en oeuvre de cette méthode de diagnostic, la courbe d'étalonnage est réalisée en utilisant des érythrocytes humains provenant d'un sujet sain et préincubés pendant 18 heures en présence de concentrations croissantes de peptide bêta-amyloïde 1-42. Alors l'étape e) de la méthode selon l'invention consiste à
comparer l'indice de déformation du spectre obtenu à l'étape d) avec la courbe d' étalonnage.
Ainsi, cette méthode permet d'évaluer la quantité de peptide bêta-amyloïde 1-42 circulante tout en s'affranchissant des difficultés de dosage induites par l'interaction de ce peptide avec d'autres protéines solubles telles que l'albumine sérique. Elle constitue un moyen original de diagnostic de la maladie d'Alzheimer simple, rapide et peu coûteux. C'est également un moyen de pronostic, de suivi de l'efficacité d'un traitement contre la maladie et de développement d'agents théra-peutiques à l'aide de lignées cellulaires ou de modèles animaux de la maladie.
Une autre variante de mise en oeuvre de la méthode selon l'invention permet l'identification d'un composé capable d'interagir avec le ligand d'une molécule biolo-5 gique marquée, une telle variante comprend les étapes suivantes :
a) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-mation de la molécule biologique marquée en solution ;
b) incubation de ladite molécule biologique marquée en solution avec un ligand et obtention d'un mélange 1 , 10 c) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-mation du mélange 1 ;
d) incubation dudit ligand avec ledit composé à tester puis ajout de ladite molécule biologique marquée en solution et obtention d'un mélange 2 ;
e) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-14 the labeled biological molecule is such that T is a peptide derived from beta-amyloid peptide 1-42.
The beta-amyloid peptide 1-42 is the peptide of sequence SEQ ID NO: 1.
By derivative of the beta-amyloid peptide 1-42 is meant a peptide of which one or many of the amino acids have been substituted by the same labeled amino acid by a fluorescent compound of general formula (I) according to the invention; this derivative can equal-include one or more insertions of an amino acid labeled with any level of his chain.
By way of example, the preparation of a derivative of beta-amyloid peptide 1-42 is described in Example 1 and leads to the following peptide:
H-Asp-Ala-glu-Phe-Arg-His-Asp-Ser-Gly-Tyr-Glu-Val-His-His-Gln-Lys x-Leu-Val-Phe-Phe-Ala-Glu-Asp-V al-Gly-S er-Asn-Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met-Val-Gly-Gly-Val-Val-Ile-Ala-OH (SEQ ID NO: 1) where the fluorophore is carried by the lysine in position 16.
Other amino acids than lysine can be labeled and used to prepare the 1-42 amyloid peptide derivative; it is preferably acids amines having an amine or carboxylic acid function on their chain lateral.
The value of the deformation indices of the measured fluorescence spectra in the sample to be tested and then the comparison with a calibration curve allows to evaluate the proportion of beta-amyloid peptide 1-42 present in the sample to test.
For the implementation of this diagnostic method, the calibration curve is performed using human erythrocytes from a healthy subject and preincubated for 18 hours in the presence of increasing concentrations of peptide beta-amyloid 1-42. Then step e) of the method according to the invention consists at compare the deformation index of the spectrum obtained in step d) with the curve calibration.
Thus, this method makes it possible to evaluate the amount of beta-amyloid peptide 1 42 circulating while avoiding the difficulties of dosage induced by the interaction of this peptide with other soluble proteins such as albumin serum. It is an original means of diagnosing the disease Alzheimer simple, fast and inexpensive. It is also a means of prognosis, of follow-up of the effectiveness of a disease treatment and agent development thera-using cell lines or animal models of the disease.
Another variant of implementation of the method according to the invention makes it possible the identification of a compound capable of interacting with the ligand of a biologic molecule In a marked variant, such a variant comprises the following steps:
a) measuring the fluorescence emission spectrum and calculating the deformation index mation of the labeled biological molecule in solution;
b) incubating said labeled biological molecule in solution with a ligand and obtaining a mixture 1, C) measurement of the fluorescence emission spectrum and calculation of the index of deform mixing of the mixture 1;
d) incubating said ligand with said test compound and adding said labeled biological molecule in solution and obtaining a mixture 2;
e) measurement of the fluorescence emission spectrum and calculation of the deformation index
15 mation du mélange 2 ;
f) détection de l'interaction entre le ligand et le composé à tester par comparai-son des indices de déformation calculés aux étapes a), c) et e).
Ainsi mise en oeuvre, la méthode permet d'identifier de potentiels agents thérapeutiques, ou encore de mesurer l'efficacité d'un tel agent in vitro et ex vivo.
L'invention concerne également des trousses diagnostiques ou des ensembles de réactifs pour la mise en oeuvre de la méthode de détection selon l'invention. Ces trousses sont caractérisées en ce qu'elles comprennent au moins une molécule biolo-gique marquée de formulé générale (II) selon l'invention, avec les contenants et réactifs appropriés et un manuel d'utilisation.
L'invention est maintenant décrite plus en détail au regard des figures et des exemples qui suivent. Il doit être bien entendu, toutefois, que ces exemples sont donnés uniquement à titre d'illustration de l'objet de l'invention, dont ils ne consti-tuent en aucune manière une limitation.
- La Figure 1 représente un schéma de synthèse des composés de formule générale (I) selon l'invention.
- La Figure 2 représente le schéma de synthèse conduisant aux composés la-d à 6a tels que décrits dans l'exemple 1 (TEA = triéthylamine). Mixture of the mixture 2;
f) detection of the interaction between the ligand and the test compound by comparisons its deformation indices calculated in steps a), c) and e).
Thus implemented, the method makes it possible to identify potential agents therapeutically, or to measure the efficacy of such an agent in vitro and ex vivo.
The invention also relates to diagnostic kits or sets of reagents for the implementation of the detection method according to the invention. These kits are characterized in that they comprise at least one molecule bio-characterized by the general formula (II) according to the invention, with the containers and appropriate reagents and a user manual.
The invention is now described in more detail with reference to the figures and examples that follow. It must be understood, however, that these examples are given solely by way of illustration of the subject of the invention, of which do not constitute in no way kill a limitation.
FIG. 1 represents a synthetic scheme of compounds of formula general (I) according to the invention.
- Figure 2 represents the synthesis scheme leading to the compounds la-d at 6a as described in Example 1 (TEA = triethylamine).
16 - La Figure 3 représente le schéma de synthèse conduisant aux composés 6a13-b et 7a, 7a13 et b tels que décrits dans l'exemple 1 (EDCI=N-(3-Diméthyl-aminopropyl)-N'-éthylcarbodiimide et NHS = N-hydroxysuccinimide).
- La Figure 4 illustre la mesure de spectres d'émission de fluorescence dans les conditions de l'exemple 3. Le graphe A représente le spectre de fluorescence du peptide bêta-amyloïde couplé au composé 7a et le graphe B représente la déconvolu-tion du spectre de fluorescence du peptide bêta-amyloïde couplé au composé 7a enre-gistré en présence de cellules PC12 avant préincubation (tracés continus) et après préincubation (tracés en pointillés) des cellules avec le peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué.
- La Figure 5 est le graphe représentant les valeurs de l'indice spectral du composé 7a couplé au peptide bêta-amyloïde 1-42 après préincubation de différentes concentrations de peptide bêta-amyloïde (Ab) non marqué comme décrit à
l'exemple 4.
- La Figure 6 est un histogramme qui illustre la variation de la valeur de l'indice spectral du peptide bêta-amyloïde 1-42 couplé au composé 7a en présence d'érythrocytes de rat préincubés avec le peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué
comme décrit à l'exemple 5.
Exemple 1 - préparation de composés de formule générale (I) selon l'invention où R' est -Ar-CO-Z
Les composés la-d à 7a-b de cet exemple ont été choisis pour leur correspon-dance spectrale avec les fluorophores courants les plus utilisés avec l'indice a :
fluorescéine, indice b : Rhodamine 6G ; indice c : TMR (tétraméthyl rhodamine);
indice d : TOTO-3.
Le schéma de synthèse conduisant aux composés la-d à 6a est représenté à la Figure 2.
Les composés la-d sont obtenus par action de l'organométallique méthoxyéthoxyéthynylé (réactif de Grignard), dans le THF à 60 C sur le produit difluoré correspondant (pouvant être préparé comme décrit dans le Brevet US 4,744,339) en suivant les modes opératoires décrits dans la Demande Inter-nationale WO 2006/087459. 16 FIG. 3 represents the synthesis scheme leading to the compounds 6a13-b and 7a, 7a13 and b as described in Example 1 (EDCI = N- (3-Dimethyl) aminopropyl) -N'-ethylcarbodiimide and NHS = N-hydroxysuccinimide).
FIG. 4 illustrates the measurement of fluorescence emission spectra in the conditions of Example 3. Graph A represents the spectrum of fluorescence of beta-amyloid peptide coupled to compound 7a and graph B represents the déconvolu-of the fluorescence spectrum of the compound 7a beta amyloid peptide regis-in the presence of PC12 cells before preincubation (continuous plots) and after preincubation (dashed lines) of the cells with the beta peptide amyloid 1-42 not marked.
FIG. 5 is the graph representing the values of the spectral index of compound 7a coupled to beta-amyloid peptide 1-42 after preincubation of different unlabeled beta-amyloid (Ab) peptide concentrations as described in The example 4.
- Figure 6 is a histogram that illustrates the variation in the value of the spectral index of the beta-amyloid peptide 1-42 coupled to the compound 7a in presence of rat erythrocytes preincubated with unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 as described in Example 5.
Example 1 - preparation of compounds of general formula (I) according to the invention where R 'is -Ar-CO-Z
The compounds la-d at 7a-b of this example were chosen for their corresponding spectral dance with the most commonly used fluorophores with the index at :
fluorescein, index b: Rhodamine 6G; c index: TMR (tetramethyl rhodamine);
index d: TOTO-3.
The synthetic scheme leading to compounds la-d at 6a is shown in FIG.
Figure 2 The compounds la-d are obtained by action of the organometallic methoxyethoxyethynyl (Grignard reagent), in 60 C THF on the product difluorinated corresponding (can be prepared as described in the patent US 4,744,339) by following the procedures described in the Application Inter-national WO 2006/087459.
17 L'iode porté par les composés la-d est ensuite converti en groupement carbonyle sous atmosphère de monoxyde de carbone en présence de catalyseur Pd(PPh3)2C12, dans un mélange de triéthylamine benzène à 70 C.
Le choix du nucléophile utilisé permet d'obtenir directement de nombreuses fonctions pouvant être ensuite utilisées pour le couplage sur une molécule biologique :
avec de l'éthanol, les ester éthyliques 2a-d sont obtenus avec de très bons rendements ;
en utilisant une diamine aliphatique en excès, des composés de type 4 peuvent être obtenus ;
- lorsqu'on utilise directement un acide aminé avec une amine libre et protégé au niveau de la fonction acide carboxylique (par exemple, un éthylester de glycine), l'acide aminé peut être introduit directement pour donner des composés de type 5.
A partir des composés 3a-d, on obtient les composés 7a, a13, b selon le schéma de synthèse représenté en Figure 3. Les composés portant un exposant 13 sont marqués au 13C.
La fonction ester des composés 2a-d peut être saponifiée pour obtenir les acides carboxyliques 3a-d correspondants, en présence de soude dans l'éthanol (voir la Figure 2). Ces acides carboxyliques peuvent être soit directement utilisés pour le marquage de molécules biologiques, soit liés à des espaceurs de types acides aminés (greffés en utilisant des techniques de couplage peptidiques utilisées avec les composés 6a-b ci-après comme représenté sur le schéma de synthèse de la Figure 3).
Afin de pouvoir être utilisés dans un synthétiseur de peptides, les composés 3a-b sont couplés avec un ester de glycine via une synthèse peptidique classique (EDC, DMAP). Cette étape permet si besoin d'introduire par exemple un fragment marqué avec un atome 13C (composé 5a13) pour permettre une traçabilité en RMN.
Les composés 5a-b obtenus sont ensuite saponifiés en acides carboxyliques 6a-b.
Les acides 6a-b sont transformés en ester d'hydroxysuccinimide, qui sont directement mis à réagir avec une lysine-Fmoc.
Les composés 7a-b peuvent être directement utilisés pour introduire un acide aminé Lys marqué dans un synthétiseur de peptide. 17 The iodine carried by the compounds la-d is then converted into a grouping carbonyl under carbon monoxide in the presence of a catalyst Pd (PPh 3) 2 Cl 2 in a mixture of triethylamine benzene at 70 ° C.
The choice of the nucleophile used makes it possible to obtain many functions that can then be used for coupling to a molecule organic :
with ethanol, the ethyl esters 2a-d are obtained with very high good yields;
using an excess aliphatic diamine, type 4 compounds can be obtained;
when directly using an amino acid with a free amine and protected at the level of the carboxylic acid function (for example, a ethyl ester glycine), the amino acid can be introduced directly to give composed of type 5.
From compounds 3a-d, compounds 7a, a13 and b are obtained according to the scheme synthesis shown in FIG. 3. Compounds bearing an exponent 13 are marked at 13C.
The ester function of the compounds 2a-d can be saponified to obtain the corresponding carboxylic acids 3a-d, in the presence of sodium hydroxide in ethanol (see Figure 2). These carboxylic acids can be used directly for the labeling of biological molecules, either linked to acid type spacers amino (grafted using peptide coupling techniques used with the compounds 6a-b below as shown in the synthesis diagram of FIG.
3).
In order to be able to be used in a peptide synthesizer, the compounds 3a-b are coupled with a glycine ester via peptide synthesis classical (EDC, DMAP). This step makes it possible, for example, to introduce a fragment labeled with a 13C atom (compound 5a13) to allow traceability in NMR.
The compounds 5a-b obtained are then saponified to carboxylic acids 6a-b.
Acids 6a-b are converted to hydroxysuccinimide ester, which are directly reacted with lysine-Fmoc.
Compounds 7a-b can be directly used to introduce an acid Amine labeled lys in a peptide synthesizer.
18 Préparation du composé 2a Le composé 2a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
O OEt Co `~ EfOH
N. N d(PP1 ??2C1 \ N, 1 NI
NEtj fl O
~t 2a A une solution du composé la (235 mg, 0,37 mmol) dans 15 mL de benzène a été ajouté 1 mL d'éthanol (17,2 mmol), 44 mg de palladium bis-triphénylphosphine bis-chlorure (0,07 mmol) et 5 mL de triéthylamine. La solution a été agitée à
pendant une nuit en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été extrait au dichlorométhane et lavé à l'eau (3x20 mL). La phase organique a été
séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été purifié par chromato-graphie sur colonne de gel de silice (CH2CI2/MeOH 99:1 ou AcOEt/Ether de pétrole 40:60) pour donner le composé 2a sous forme d'une poudre orange (210 mg, 97%).
Caractérisation du composé 2a RMN'H (CDC13, 400 MHz) : 6 = 1,33 (s, 6H), 1,42 (t, 3H, 3J= 7,0 Hz), 2,71 (s, 6H), 3,35 (s, 6H), 3,53 (m, 4H), 3,64 (m, 4H), 4,19 (s, 4H), 4,40 (q, 2H, 3J= 7,0 Hz), 6,00 (s, 2H), 7,78 (AB sys, 4H, JAB = 8,5 Hz, voà = 300,4 Hz);
RMN 13C {'H} (CDCl3, 100 MHz,) : ô= 14,4, 14,8, 16,1, 59,0, 59,7, 61,4, 68,4, 68,6, 71,8, 90,9, 121,8, 128,6, 129,1, 130,3, 131,0, 140,3, 140,3, 140,9, 155,6, 166,1;
RMN "B (CDC13, 128,4 MHz) : 6 = -10,2 (s);
UV-Vis (CH2C12) 2 nm (s, M-' cm"') = 500 (90000), 366 (4900), 308 (7700);
FAB+ m/z : 585,2 ([M+H]+, 100) ; 18 Preparation of compound 2a Compound 2a is prepared according to the following reaction scheme:
O OEt Co `~ EfOH
N.N d (PP1 ?? 2C1 \ N, 1Ni NEtj fl O
~ t 2a To a solution of compound la (235 mg, 0.37 mmol) in 15 mL of benzene a 1 mL of ethanol (17.2 mmol), 44 mg of palladium bis triphenylphosphine bis-chloride (0.07 mmol) and 5 mL of triethylamine. The solution was stirred at overnight by "bubbling" carbon monoxide. The mixture reaction was extracted with dichloromethane and washed with water (3x20 mL). The organic phase has been dried on hydrophilic cotton and evaporated. The residue was purified by chromatography silica gel column (99: 1 CH 2 Cl 2 / MeOH or AcOEt / Ether) oil 40:60) to give compound 2a as an orange powder (210 mg, 97%).
Characterization of compound 2a 1 H NMR (CDCl 3, 400 MHz): δ = 1.33 (s, 6H), 1.42 (t, 3H, 3 J = 7.0 Hz), 2.71 (s, 6H), 3.35 (s, 6H), 3.53 (m, 4H), 3.64 (m, 4H), 4.19 (s, 4H), 4.40 (q, 2H, 3J = 7.0 Hz), 6.00 (s, 2H), 7.78 (AB sys, 4H, JAB = 8.5 Hz, vv = 300.4 Hz);
13 C NMR (CDCl 3, 100 MHz): δ = 14.4, 14.8, 16.1, 59.0, 59.7, 61.4, 68.4, 68.6, 71.8, 90.9, 121.8, 128.6, 129.1, 130.3, 131.0, 140.3, 140.3, 140.9, 155.6, 166.1;
NMR B (CDCl 3, 128.4 MHz): δ = -10.2 (s);
UV-Vis (CH 2 Cl 2) 2 nm (s, M-cm -1) = 500 (90000), 366 (4900), 308 (7700);
FAB + m / z: 585.2 ([M + H] +, 100);
19 Analyse élémentaire calculée pour C34H41BN206 : C, 69,86 ; H, 7,07 ; N, 4,79.
Trouvé: C, 69,77 ; H, 7,04 ; N, 4,59.
Préparation du composé 2b Le composé 2b est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
O OEt CO
\ EtOH
NB,N~ Pd(PPh3)2C12 N, ,N
// \\ NEt3 B
O O O O
O O
lb 2b A une solution du composé lb (980 mg, 1,41 mmol) dans 50 mL de benzène ont été ajoutés 3 mL d'éthanol (17,2 mmol), 240 mg de palladium bis-triphényl-phosphine bis-chlorure (0,07 mmol) et 15 mL de triéthylamine. La solution a été
agitée à 70 C pendant une nuit en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été extrait au dichlorométhane et lavé à l'eau (3x20 mL). La phase organique a été séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été
purifié par chromatographie sur colonne de gel de silice (AcOEt/Ether de pétrole 19 Elemental analysis calculated for C34H41BN2O6: C, 69.86; H, 7.07; N, 4.79.
Found: C, 69.77; H, 7.04; N, 4.59.
Preparation of compound 2b Compound 2b is prepared according to the following reaction scheme:
O OEt CO
\ EtOH
NB, N ~ Pd (PPh 3) 2 Cl 2 N,, N
// \\ NEt3 B
OOOO
OO
lb 2b To a solution of compound Ib (980 mg, 1.41 mmol) in 50 mL of benzene 3 ml of ethanol (17.2 mmol), 240 mg of bis-triphenyl palladium were added.
phosphine bis-chloride (0.07 mmol) and 15 mL of triethylamine. The solution summer stirred at 70 ° C overnight by "bubbling" carbon monoxide. The reaction mixture was extracted with dichloromethane and washed with water (3x20 mL). The The organic phase was dried over hydrophilic cotton and evaporated. The residue summer purified by silica gel column chromatography (AcOEt / Ether from oil
20:80 ; 40:60) pour donner le composé 2b sous forme d'une poudre orange (895 mg, quantitatif).
Caractérisation du composé 2b RMN 'H (CDC13 300 MHz) : 0,97 (t, 6H, 3J= 7,40 Hz), 1,23 (s, 6H), 1,43 (t, 3H, 3J= 7,10 Hz), 2,31 (q, 4H, 3J= 7,40 Hz) 2,69 (s, 6H), 3,35 (s, 6H), 3,53 (m, 4H), 3,65 (m, 4H), 4,19 (s, 4H), 4,43 (q, 2H, 3J = 7,10 Hz), 7,78 (AB sys, 4H, JqB
= 8,19 Hz, v08= 223,07 Hz);
RMN 13C (CDC13, 300 MHz,) : ô =12,03, 14,07, 14,41, 14,76, 17,40, 29,78, 59,02, 59,79, 61,37, 68,57, 71,85, 90,67, 128,60, 128,95, 130,19, 130,81, 133,11, 136,02, 138,77, 141,27, 154,05, 166,28.
NMR "B (CDC13,128,4 MHz) : ô = -10,2 (s);
UV-Vis (CH2Cl2) 1 nm (s, M-' cm') = 522 (80000),488 (20000), 381 (6400), 277 (6400).
Préparation du composé 2c Le composé 2c est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
I COOEt e i CO
EtOH
Pd(PPh3)2C12 NEt3 le 2c O
A une solution du composé le (100 mg, 0,095 mmol) dans 25 mL de benzène a été ajouté 1 mL d'éthanol, 24 mg de palladium bis-triphénylphosphine bis-chlorure et 5 mL de triéthylamine. La solution a été agitée à 70 C pendant une nuit en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été extrait au dichloro-10 méthane et lavé à l'eau (3x10 mL). La phase organique a été séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été purifié par chromatographie sur colonne de gel de silice (AcOEt/Ether de pétrole 80 :20 ; 100%) pour donner le composé 2c sous forme d'une poudre bleue (88 mg, 92%).
Caractérisation du composé 2c 15 RMN'H (CDC13 200 MHz) : 1,40 (s, 6H), 1,44 (t, 3H, 3J= 10,5 Hz) 3,15 (in, 4H), 3,19 (s, 6H), 3,41 (s, 6H), 3,50 (m, 4H), 3,59 (m, 4H), 3,74 (m, 4H), 3,88 (m, 4H), 4,15 (s, 4H), 4,18 (m, 4H), 4,41 (q, 2H, 3J= 10,5 Hz), 6,62 (s, 2H), 7,27 (AB
sys, 8H, JAB = 8,73 Hz, v08= 120,73 Hz), 7,60 (AB sys, 4H, JAB = 16,26 Hz, v08= 192,63 Hz) 7,83 (AB sys, 4H, JAB = 8,34 Hz, v08= 141,89 Hz).
20 UV-Vis (CH2Cl2) a, nm (s, M-1 cm-) = 647 (121000), 373 (72800). 20:80; 40:60) to give compound 2b as an orange powder (895).
mg, quantitative).
Characterization of compound 2b 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 0.97 (t, 6H, 3 J = 7.40 Hz), 1.23 (s, 6H), 1.43 (t, 3H, 3 J = 7.10 Hz), 2.31 (q, 4H, 3 J = 7.40 Hz) 2.69 (s, 6H), 3.35 (s, 6H), 3.53.
(m, 4H), 3.65 (m, 4H), 4.19 (s, 4H), 4.43 (q, 2H, 3 J = 7.10 Hz), 7.78 (AB sys, 4H, JqB).
= 8.19 Hz, v08 = 223.07 Hz);
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 12.03, 14.07, 14.41, 14.76, 17.40, 29.78, 59.02, 59.79, 61.37, 68.57, 71.85, 90.67, 128.60, 128.95, 130.19, 130.81, 133.11, 136.02, 138.77, 141.27, 154.05, 166.28.
NMR B (CDCl 3,128.4 MHz): δ = -10.2 (s);
UV-Vis (CH 2 Cl 2) 1 nm (s, M-cm 2) = 522 (80000), 488 (20000), 381 (6400), 277 (6400).
Preparation of compound 2c Compound 2c is prepared according to the following reaction scheme:
I COOEt ei CO
EtOH
Pd (PPh3) 2C12 NEt3 the 2c O
To a solution of compound 1e (100 mg, 0.095 mmol) in 25 mL of benzene 1 mL of ethanol, 24 mg of palladium bis-triphenylphosphine bis-chloride and 5 mL of triethylamine. The solution was stirred at 70 ° C overnight in making "bubble" carbon monoxide. The reaction mixture was extracted dichloro-Methane and washed with water (3x10 mL). The organic phase was dried on cotton hydrophilic and evaporated. The residue was purified by chromatography on gel column silica (AcOEt / 80: 20 petroleum ether, 100%) to give the compound 2c under form of a blue powder (88 mg, 92%).
Characterization of compound 2c 1 H NMR (CDCl 3 200 MHz): 1.40 (s, 6H), 1.44 (t, 3H, 3 J = 10.5 Hz) 3.15 (in, m.p.
4H), 3.19 (s, 6H), 3.41 (s, 6H), 3.50 (m, 4H), 3.59 (m, 4H), 3.74 (m, 4H), 3.88 (m). , 4H), 4.15 (s, 4H), 4.18 (m, 4H), 4.41 (q, 2H, 3J = 10.5 Hz), 6.62 (s, 2H), 7.27 (AB).
sys, 8H, JAB = 8.73 Hz, v08 = 120.73 Hz), 7.60 (AB sys, 4H, JAB = 16.26 Hz, v08 = 192.63.
Hz) 7.83 (AB sys, 4H, JAB = 8.34 Hz, v08 = 141.89 Hz).
UV-Vis (CH 2 Cl 2) α, nm (s, M -1 cm -1) = 647 (121000), 373 (72800).
21 Préparation du composé 2d Le composé 2d est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
I COOEt \ 'B' N~ CO 'B' EtOH // \\ PdNEt 3)X12 O 0 ld0 O 2d0 A une solution du composé ld (100 mg, 0,118 mmol) dans 25 mL de benzène ont été ajoutés 2 mL d'éthanol, 24 mg de palladium bis-triphénylphosphine bis-chlorure (0,07 mmol) et 5 mL de triéthylamine. La solution a été agitée à 70 C
pendant une nuit en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été extrait au dichlorométhane et lavé à l'eau (3x10 mL). La phase organique a été
séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été purifié par chromato-graphie sur colonne de gel de silice (AcOEt/Ether de pétrole 20:80 ; 40:60) pour donner le composé 2d sous forme d'une poudre violette (82 mg, 88%).
Caractérisation du composé 2d RMN 'H (CDC13 300 MHz) : 1,35 (s, 3H), 1,38 (s, 3H), 1,43 (t, 3H, 3J = 7,15 Hz) 2,74 (s, 3H), 3,25 (s, 6H), 3,31 (m, 4H), 3,39 (s, 3H), 3,54 (m, 6H), 3,72 (m, 2H), 3,87 (m, 2H), 4,18 (m, 4H), 4,43 (q, 2H, 3J = 7 Hz), 6,02 (s, I H), 6,59 (s, I H), 7,22 (AB
sys, 4H, JAB = 8,67 Hz, vo8= 180,18 Hz); 7,58 (AB sys, 2H, JAB = 16,29 Hz, vod=
297,72 Hz), 7,85 (AB sys, 4H, JAB = 7,99 Hz, voc5= 226,28 Hz). 21 Preparation of compound 2d Compound 2d is prepared according to the following reaction scheme:
I COOEt \ 'B' N ~ CO 'B' EtOH // \\ PdNEt 3) X12 O 0 ld0 O 2d0 To a solution of compound 1d (100 mg, 0.118 mmol) in 25 mL of benzene 2 ml of ethanol, 24 mg of palladium bis-triphenylphosphine bis-chloride (0.07 mmol) and 5 mL of triethylamine. The solution was stirred at 70 ° C
overnight by "bubbling" carbon monoxide. The mixture reaction was extracted with dichloromethane and washed with water (3x10 mL). The organic phase has been dried on hydrophilic cotton and evaporated. The residue was purified by chromatography Silica gel column analysis (AcOEt / Petroleum ether 20:80; 40:60) for give compound 2d as a violet powder (82 mg, 88%).
Characterization of compound 2d 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 1.35 (s, 3H), 1.38 (s, 3H), 1.43 (t, 3H, 3 J = 7.15;
Hz) 2.74 (s, 3H), 3.25 (s, 6H), 3.31 (m, 4H), 3.39 (s, 3H), 3.54 (m, 6H), 3.72 (m). , 2H), 3.87 (m, 2H), 4.18 (m, 4H), 4.43 (q, 2H, 3 J = 7Hz), 6.02 (s, 1H), 6.59 (s, 1H), 7.22 (AB
sys, 4H, JAB = 8.67 Hz, vo8 = 180.18 Hz); 7.58 (AB sys, 2H, JAB = 16.29 Hz, vOD =
297.72 Hz), 7.85 (AB sys, 4H, JAB = 7.99 Hz, voc5 = 226.28 Hz).
22 Préparation du composé 3a Le composé 3a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
C7 ,C}Et 0 OH
2a 3a A une solution du composé 2a (210mg, 0,36 mmol) dans 20 mL d'éthanol a été
ajouté 215 mg de soude (5,39 mmol). La solution a été agitée pendant 3 heures à
température ambiante. 30-40 mL d'acétate d'éthyle ont été ajoutés. La phase organique a été extraite à l'eau (3x20 mL). Les phases aqueuses ont été rassemblées et acidifiées à l'aide de solution HC1 1M jusqu'à pH 1-2.
La phase aqueuse a été extraite au dichlorométhane. La phase organique a été
séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 3a sous forme d'une poudre orange (190 mg, 95%).
Caractérisation du composé 3a UV-Vis (CH2C12) X, nm (c, M-1 cm-) = 501 (72800), 366 (4000), 307 (6400);
UV-Vis (Tampon PBS) a, nm (s, M-1 cm') = 494 (71500), 364 (3900), 307 (4900). 22 Preparation of compound 3a Compound 3a is prepared according to the following reaction scheme:
C7, C} and 0 OH
2a 3a To a solution of Compound 2a (210mg, 0.36mmol) in 20mL of ethanol was 215 mg of sodium hydroxide (5.39 mmol) was added. The solution was stirred for 3 hours at ambient temperature. 30-40 mL of ethyl acetate was added. The sentence organic was extracted with water (3x20 mL). The aqueous phases have been collected and acidified with 1M HCI solution to pH 1-2.
The aqueous phase was extracted with dichloromethane. The organic phase has been dried on hydrophilic cotton and then evaporated to dryness to give compound 3a under form of an orange powder (190 mg, 95%).
Characterization of compound 3a UV-Vis (CH 2 Cl 2) λmax (c, M-1 cm -1) = 501 (72800), 366 (4000), 307 (6400);
UV-Vis (PBS buffer) a, nm (s, M-1 cm ') = 494 (71500), 364 (3900), 307 (4900).
23 Préparation du composé 3b Le composé 3b est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
O OEt O OH
NaOH
NI, B~IN EtOH, H2O N\
BiN
O O
O O O O-) 2b 3b A une solution du composé 2b (840mg, 1,31 mmol) dans 50 mL d'éthanol ont été ajoutés 2,10 g de soude (0,525 mol). La solution a été agitée pendant une nuit à
température ambiante. 30-40 mL d'acétate d'éthyle ont été ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (3x20 mL). Les phases aqueuses ont été rassemblées et acidifiées à
l'aide de solution HCl 1M jusqu'à pH 1-2. La phase aqueuse a été extraite au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 3b sous forme d'une poudre orange (778 mg, 97%).
UV-Vis (Tampon PBS) 1 nm (s, M-1 cm-') = 517 (65000), 378 (3600), 320 (5000);
Préparation du composé 3c Le composé 3c est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
COOEt COOH
.B.N~ B, ~~ \\ NaOH ~~ \\
EtOH, >\ H2O
0 0 2c 0 0 0 0 3c 0 0 23 Preparation of compound 3b Compound 3b is prepared according to the following reaction scheme:
O OEt O OH
NaOH
NI, B ~ IN EtOH, H2O N
BiN
OO
OOO O-) 2b 3b To a solution of Compound 2b (840mg, 1.31mmol) in 50mL of ethanol 2.10 g of sodium hydroxide (0.525 mol) were added. The solution was stirred during a night in ambient temperature. 30-40 mL of ethyl acetate was added. The sentence organic is extracted with water (3x20 mL). The aqueous phases have been collected and acidified to using 1M HCl solution until pH 1-2. The aqueous phase was extracted dichloromethane. The organic phase was dried on hydrophilic cotton then evaporated to dry to give compound 3b as an orange powder (778 mg, 97%).
UV-Vis (PBS buffer) 1 nm (s, M-1 cm -1) = 517 (65,000), 378 (3600), 320 (5000);
Preparation of compound 3c Compound 3c is prepared according to the following reaction scheme:
COOEt COOH
.BN ~ B, ~~ \\ NaOH ~~ \\
EtOH
> \ H2O
0 0 2c 0 0 0 0 3c 0 0
24 A une solution du composé 2c (80mg, 0,080 mmol) dans 20 mL d'éthanol ont été ajoutés 130 mg de soude (3,22 mmol). La solution a été agitée pendant une nuit à
température ambiante. 10-20 mL d'acétate d'éthyle ont été ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (3x10 mL). Les phases aqueuses ont été rassemblées et acidifiées à
l'aide de solution HCl 1M jusqu'à pH 1-2. La phase aqueuse a été extraite au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 3c sous forme d'une poudre bleue (70 mg, 90%).
Caractérisation du composé 3c RMN'H (CDC13 300 MHz) : 1,41 (s, 6H), 3,15 (m, 4H), 3,20 (s, 6H), 3,41 (s, 6H), 3,52 (m, 4H), 3,60 (m, 4H), 3,74 (m, 4H), 3,90 (m, 4H), 4,17 (s, 4H), 4,22 (m, 4H), 6,63 (s, 2H), 7,28 (AB sys, 8H, JAB = 8,6 Hz, v08= 120,59 Hz), 7,61 (AB sys, 4H, JAB
= 16,12 Hz, v08= 191,44 Hz) 7,88 (AB sys, 4H, JAB = 8,19 Hz, v08= 144,73 Hz).
UV-Vis (CH2C12) a, nm (s, M"1 cm') = 647 (118000), 373 (67800).
Préparation du composé 3d Le composé 3d est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
COOEt CO
NaOH
EtOH, H2O
O O
O O~
2d O O~
3d A une solution du composé 2d (80 mg, 0,10 mmol) dans 20 mL d'éthanol ont été ajoutés 162 mg de soude (4,05 mmol). La solution a été agitée pendant une nuit à
température ambiante. 10-20 mL d'acétate d'éthyle ont été ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (3x10 mL). Les phases aqueuses ont été rassemblées et acidifiées à
l'aide de solution HCl I M jusqu'à pH 1-2. La phase aqueuse a été extraite au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 3d sous forme d'une poudre orange (70 mg, 90%).
Caractérisation du composé 3d RMN 'H (CDC13 300 MHz) :1,36 (s, 3H), 1,39 (s, 3H), 2,74 (s, 3H), 3,26 (s, 6H), 3,32 (m, 4H), 3,40 (s, 3H), 3,56 (m, 6H), 3,73 (m, 2H), 3,88 (m, 2H), 4,18 (m, 6H), 6,03 (s, 1H), 6,59 (s, 1H), 7,22 (AB sys, 4H, JAB = 8,67 Hz, v08= 180,18 Hz);
5 7,58 (AB sys, 2H, JAB = 16,29 Hz, v"8= 297,72 Hz), 7,85 (AB sys, 4H, JAB =
7,99 Hz, v08= 226,28 Hz).
RMN 13C (CDC13, 300 MHz,) : ô= 14,86, 15,08, 16,37, 29,79, 58,91, 59,18, 59,58, 67,63, 68,41, 69,79, 70,88, 71,69, 72,05, 91,43, 128,76, 129,06, 129,69, 130,15, 130,44, 130,86, 134,10, 138,65, 140,39, 140,59, 141,25, 152,61, 155,54, 10 159,61, 170,40.
UV-Vis (Tampon PBS) a, nm (s, M-' cm"') ='564 (70000), 338 (25000).
Préparation du composé 4a Le composé 4a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
H
Co 1 thvIènedl i3iixae .............. _..._........ -_ ........... _...............
............_............., Pd(PPh ,~)2C1M
4a 15 A une solution du composé la (200 mg, 0,31 mmol) dans 15 mL de benzène a été ajouté 1 mL d'éthylènediamine (15 mmol), 66 mg de palladium bis-triphényl-phosphine bis-chlorure (0,09 mmol) et 1 mL de triéthylamine. La solution a été
agitée à 70 C pendant une nuit en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été extrait au dichlorométhane et lavé à l'eau (3x20 mL). La phase 20 organique a été séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été
purifié par chromatographie sur colonne de silice (gradient de CH2C12 100% à CH2C12 75:25) pour donner le composé 4a sous forme d'une poudre orange (160 mg, 80%).
Caractérisation du composé 4a RMN 'H (CDC13, 300 MHz) : 5 = 1,34 (s, 6H), 2,72 (s, 6H), 3,01 (t, 2H, 3J=
5,7 Hz), 3,36 (s, 6H), 3,55 (m, 6H), 3,64 (m, 4H), 4.20 (s, 4H), 6,01 (s, 2H), 6,98 (t, 1H, 3J= 5,5 Hz), 7,69 (AB sys, 4H, JAB = 8,3 Hz, v0 = 162,7 Hz);
'3C {1H} NMR (CDC13, 75,4 MHz,) : 8 = 15,0, 16,2, 41,3, 42,2, 59,1, 59,8, 68,7, 71,9, 90,6, 121,9, 127,9, 128,8, 129,4, 134,9, 139,1, 140,4, 141,0, 155,7, 167,0;
RMN"B (CDC13, 128,4 MHz) : 8 = -10,3 (s);
UV-Vis (CH2C12) X nm (E, M-' cm-') = 500 (64500), 371 (5600) FAB+ m/z : 599,2 ([M+H] +, 100) ;
Analyse élémentaire calculée pour C34H43BN405 : C, 68,23 ; H, 7,24 ; N, 9,36.
Trouvé: C, 67,84 ; H, 7,07 ; N, 9,22.
Préparation du composé 5a Le composé 5a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
Co G- Iveine ester ?El~N- Bcl. Pp1..1Cl, 5 t -Nht. ~ ~
la 5i1 A une solution du composé la (100 mg, 0,16 mmol) dans 6 mL de toluène anhydre ont été ajoutés 80 mg de glycine ester d'éthyle (0,47 mmol), 22 mg de palladium bis-triphénylphosphine bis-chlorure (0,03 mmol) et 2 mL de triéthylamine.
La solution a été agitée à 80 C pendant 6h en faisant "buller" du monoxyde de carbone. Le mélange réactionnel a été filtré sur Celite et partiellement évaporé. Le résidu a été extrait au dichlorométhane et lavé à l'eau (2x20 mL). La phase organique a été séchée sur du coton hydrophile et évaporée. Le résidu a été purifié par chromato-graphie sur colonne de gel de silice (AcOEt/Ether de pétrole 50:50) pour donner le composé 5a sous forme d'une poudre orange (43 mg, 43%).
Caractérisation du composé 5a RMN 'H (CDC13, 300 MHz) : O = 1,33 (t, 3H, 3J = 7,2 Hz), 1,34 (s, 6H), 2,72 (s, 6H), 3,36 (s, 6H), 3,55 (m, 4H), 3,66 (m, 4H), 4,20 (s, 4H), 4,27 (d, 2H, 3J= 4,5 Hz), 4,29 (q, 2H, 3J = 7,1 Hz), 6,01 (s, 2H), 6,77 (t, 1H, 3J = 4,9 Hz), 7,69 (AB sys, 4H, JAB = 8,3 Hz, vad = 156,4 Hz);
RMN 13C {'H} (CDCI3, 75,4 MHz,) : 8 = 14,3, 14,9, 16,2, 42,1, 59,1, 59,8, 61,9, 68,7, 71,9, 91,0, 121,9, 127,9, 129,0, 129,3, 134,2, 139,5, 140,2, 141,0, 155,8, 166,7, 170,2;
RMN 11B (CDC13, 128,4 MHz) : 5 = -10,3 (s);
UV-Vis (CH2C12) X nm (s, M"1 cm') = 501 (84200), 366 (4200), 309 (6500).
Préparation du composé 6a Le composé 6a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
LOH
0 t~ Et .,, NaOH
O-~ O
5a 6 A une solution du composé 5a (40 mg, 0,06 mmol) dans l'éthanol (10 mL) a été ajoutée une solution aqueuse de soude (60 mg, 1,2 mmol). La solution a été
agitée pendant 2h à température ambiante. 10-20 mL d'acétate d'éthyle ont été
ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (2x20 mL). Les phases aqueuses ont été
rassem-blées et acidifiées à l'aide de solution HC1 1M jusqu'à pH 1-2. Le produit a été extrait au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur Na2SO4 puis évaporée à
sec pour donner le composé 6a sous forme d'une poudre orange (35 mg, 90%).
Caractérisation du composé 6a RMN 'H (CDC13, 400 MHz) : d = 1,32 (s, 6H), 2,72 (s, 6H), 3,36 (s, 6H), 3,55 (m, 4H), 3,66 (m, 4H), 4,19 (s, 4H), 4,27 (d, 2H, 3J = 3,4 Hz), 4,87 (b, I H), 6,01 (s, 2H), 7,04 (t, 1H, 3J= 3,8 Hz), 7,69 (AB sys, 4H, JAB = 6,0 Hz, vo 5 = 160,2 Hz);
RMNNMR '3C {'H} (CDC13, 100 MHz,) : ô = 14,9, 16,2, 42,0, 59,0, 59,7, 68,6, 71,8, 90,9, 121,9, 128,0, 129,0, 129,3, 133,8, 139,6, 140,2, 140,9, 155,8, 167,3, 172,3;
RMN "B (CDC13, 128,4 MHz) : 6 = -10,2 (s);
UV-Vis (CH2C12) X nm (s, M-' cm') = 501 (65000), 366 (3800), 309 (5900);
UV-Vis (Tampon PBS) a, nm (s, M-' cm') = 496 (59600), 367 (4100), 308 (6100).
Préparation du composé 7a Le composé 7a est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
COOH
0 N HFmo 0 N"-'-OH O N.,%LO.N 0 N"ilN
NOHS. Et I.I-I \ T nitx-I...~,5-()1I
\ NB-N- N. N- U N
OO 0 \\~ 0 0Y \_0 ~_o o) 0 ô-1 ~- àJ
Cil 741 A une solution du composé 6a (25 mg, 0,04 inmol) et de N-hydroxysuccinimide (7 mg, 0,06 mmol) dans du dichlorométhane (5 mL) ont été ajoutés, à 0 C, 12 mg de N-diméthyle-3-aminopropyle-carbo-diimide (0,06 mmol). Le milieu réactionnel a été
agité pendant une nuit en laissant le bain remonter à température ambiante. La solu-tion a été diluée dans du dichlorométhane, lavée avec une solution d'acide chlorhydrique 1M (2 x 20 mL), avec une solution NaHCO3 5% puis avec une solution saturée NaCI. La phase organique a été séchée sur Na2SO4 puis évaporée à sec sous pression réduite. Le résidu a été dissout dans l'acétonitrile (5 mL). A cette solution a été ajouté une solution de Fmoc-Lys-OH (16 mg, 0,04 mmol) et de K2CO3 (11 mg, 0,08 mmol) dans un mélange acétonitrile/eau (5 mLl1 mL). La solution a été
agitée à
température ambiante pendant lh, ensuite elle a été extraite à l'acétate d'éthyle. La phase organique a été lavée à l'eau (2 x 20mL), séchée sur MgSO4 et évaporée.
Le résidu a été purifié par chromatographie sur colonne de silice éluée (gradient de AcOEt 100% à AcOEt/EtOH 90:10). Les phases aqueuses ont été rassemblées, acidi-fiées avec une solution d'acide chlorhydrique 1M jusqu'à pH 1 et extraites au dichlorométhane. La phase organique résultante a été séchée sur MgSO4 et évaporée.
Les différentes. fractions ont été rassemblées pour donner le composé 7a sous forme d'une poudre orange (25 mg, 64%).
Caractérisation du composé 7a RMN 'H (CDC13, 300 MHz) : S = 1,27 (s, 6H), 1,35-1,82 (m, 6H), 2,67 (s, 6H), 3,21-3,31 (m, 8H), 3,49 (m, 4H), 3,61 (m, 4H), 3,99-4,36 (m, 10H), 5,95 (s, 2H), 7,22-7,39 (m, 6H), 7,54-7,58 (m, 2H), 7,70 (d, 2H, 3J= 7,5 Hz), 7,93 (d, 2H, 3J= 7,7 Hz);
RMN 13C {'H} (CDC13, 75,4 MHz,) : ô = 14,7, 16,0, 23,4, 28,6, 31,5, 31,9, 39,1, 43,3, 53,6, 58,9, 59,6, 67,0, 68,5, 71,7, 90,7, 118,8, 120,0, 121,8, 123,3, 125,1, 127,1, 127,8, 128,0, 129,2, 129,8, 133,9, 139,4, 140,2, 140,9, 141,3, 143,8, 143,9, 155,6, 156,4, 167,5, 169,2;
ESI m/z: 986,4 ([M+Na]+, 100).
Préparation du composé 5a13 Le composé 5a13 est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
O OH O (~30i~0s ~ I e EDCI, DMAP
N,B.N \
// \\ H3N'O"COOMe O 0 ~_O 3a OO ~O~ 5a130~
A une solution du composé 3a (570 mg, 1,025 mmol) dans du dichloro-méthane (30 mL) a été ajoutés, à 0 C, 294 mg de N-diméthyle-3-aminopropyle-carbo-diimide (1,537 mmol) et 187 mg de diméthyle-amino-pyridine (1,537 mmol). Le milieu réactionnel a été agité pendant une heure à température ambiante. A
cette solu-5 tion a été ensuite ajoute 142 mg de glycine ester marqué au carbone 13 (1,127 mmol).
Le milieu réactionnel a été agité pendant une heure à température ambiante. La solu-tion a été diluée dans du dichlorométhane, lavée a l'eau (2 x 20 mL), avec une solu-tion NaHCO3 5% puis avec une solution saturée NaCI. La phase organique a été
séchée sur Na2SO4 puis évaporée à sec sous pression réduite. Le résidu a été
purifié
10 par chromatographie sur colonne de silice éluée avec un gradient acétate d'éthyle/éther de pétrole 20/80, 30/70, 40/60, pour donner le compose 5a'3 sous forme de poudre orange (527 mg, 82%) Caractérisation du composé 5a13 RMN 'H (CDC13 300 MHz) : 1,32 (s, 6H), 2,71 (s, 6H), 3,34 (s, 6H), 3,52 (lm, 15 4H), 3,64 (m, 4H), 4,02 (d, 1H, 'J= 141,3 Hz, 3J= 4,4 Hz), 4,18 (s, 4H), 4,50 (d, 1H, 'J= 141,3 Hz, 3J= 4,4 Hz), 6,00 (s, 2H), 6,85 (s, 1H), 7,68 (AB sys, 4H, JAB =
8 Hz, v S= 159,56 Hz).
RMN 13C (CDC13, 300 MHz,) : ô= 14,72, 16, 41,72, 52,48, 58,86, 59,54, 68,44, 71,66, 76,57, 77, 77,42, 121,66, 127,78, 128,71, 129,06, 133,88, 139,24, 140, 20 140,72, 155,51, 166,58, 169,976, 170,79.
Préparation du composé 6a13 Le composé 6a13 est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
o o O H O H
13C OMe 13C, OH
NaOH
B"N- EtOH, H2O B'IN
O O CJo 5at3 6a13 A une solution du composé 5a13 (500 mg, 0,795 mmol) dans l'éthanol (30 mL) a été ajoutée une solution aqueuse de soude (1,27 g, 32 mmol). La solution a été agitée pendant 2h à température ambiante. 20-30 mL d'acétate d'éthyle ont été
ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (3x20 mL). Les phases aqueuses ont été
rassem-blées et acidifiées à l'aide de solution HCl 1M jusqu'à pH 1-2. La phase aqueuse a été
extraite au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 6a13 sous forme d'une poudre orange (464 mg, 95%).
Caractérisation du composé 6a13 RMN 'H (CDC13 300 MHz) : ô= 1,29 (s, 6H), 2,70 (s, 6H), 3,34 (s, 6H), 3,52 (m, 4H), 3,65 (m, 4H), 3,93 (s, 1H, 'J = 140,6 Hz), 4,17 (s, 4H), 4,39 (s, 1H, 'J =
140,6 Hz), 7,67 (AB sys, H, JAB = 7,72 Hz, v0 = 177,95 Hz).
13C RMN (CDC13, 300 MHz,) : ô =14,72, 15,43, 16,03, 42,20, 43,02, 54,94, 58,36, 58,85, 59,55, 68,46, 71,63, 76,57, 90,76, 121,74, 127,94, 128,74, 129,05, 133,70, 139,35, 139,94, 140,68, 140,78, 155,26, 155,48, 155,57, 167,35.
Préparation du composé 7a13 Le composé 7a13 est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
COOH
NHFmo c O H O O
H O
I~ lo I~
~ 1ï()l-I S, iI:X,`I.I-IC'I ~ ~ ~ Ftaioc-i,},-QI-C ~ ~
N..N~ NB.N- K C'~:~; N. N-oi~O O O O O, O
p o o o p pJ
6.l i' A une solution du composé 6a13 (430 mg, 0,7 mmol) et de N-hydroxysuccinimide (120 mg, 1,05 mmol) dans du dichlorométhane (50 mL) ont été ajoutés, à 0 C, 207 mg de N-diméthyle-3-aminopropyle-carbo-diimide (1,05 mmol). Le milieu réactionnel a été agité pendant une nuit en laissant le bain remonter à température ambiante. La solution a été diluée dans du dichlorométhane, lavée avec une solution d'acide chlorhydrique 1M (3 x 20 mL), avec une solution NaHCO3 5% puis avec une solution saturée NaCI. La phase organique a été séchée sur Na2SO4 puis évaporée à sec sous pression réduite. Le résidu a été dissout dans l'acétonitrile (50 mL). A cette solution, a été ajouté une solution de Fmoc-Lys-OH (566 mg, 1,40 mmol) et de K2CO3 (193 mg, 1,40 mmol) dans un mélange acétonitrile/eau (15 mL/5 mL). La solution a été
agitée à
température ambiante pendant 2h, ensuite elle a été extraite à l'acétate d'éthyle. La phase organique a été lavée à l'eau (3 x 20mL), séchée sur MgSO4 et évaporée.
Le résidu a été purifié par chromatographie sur colonne de silice éluée avec un gradient allant de AcOEt 100% à AcOEt/EtOH 90:10. Les différentes fractions ont été
rassem-blées pour donner le composé 7a'3 sous forme d'une poudre orange (539 mg, 80%).
Caractérisation du composé 7a13 RMN 'H (MeOD 400 MHz 60 C) : ô =1,18 (m, 1H), 1,22 (s, 6H), 1,40 (m, 2H), 1,53 (m, 2H), 2,71 (s, 6H), 3,23 (t, 2H, 3J = 6,72 Hz) 3,34 (s, 6H), 3,51 (m, 4H), 3,63 (m, 4H), 4,14 (s, 4H), 4,18 (t, 1H, 3J = 5,10 Hz),4,21 (d, 2H, I JHC 13= 140Hz), 6,04 (s, 2H), 7,25 (m, 2H), 7,33 (m, 4H),7,61 (ln, 2H), 7,71 (d, 2H), 8,01 (d, 2H).
Préparation du composé 5b Le composé 5b est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
NO
O OH EDCI, DMAP
Glycine ester O 3b O 5b O
A une solution du composé 3b (600 mg, 0,979 mmol) dans du dichloro-méthane (50 mL) ont été ajouté, à 0 C, 280 mg de N-diméthyle-3-arinopropyle-carbo-diimide (1,47 minol) et 180 mg de diréthyle-amino-pyridine (1,47 mmol).
Le milieu réactionnel a été agité pendant une heure à température ambiante. A
cette solution a été ensuite ajoute 205 mg de glycine ester (1,47 mmol). Le milieu réaction-nel a été agité pendant une heure à température ambiante. La solution a été
diluée dans du dichlorométhane, lavée à l'eau. (2 x 20 mL), avec une solution NaHCO3 5%
puis avec une solution saturée NaC1. La phase organique a été séchée sur Na2SO4 puis évaporée à sec sous pression réduite. Le résidu a été purifié par chromatographie sur colonne de silice éluée avec un gradient acétate d'éthyle/éther de pétrole 20/80, 30/70, 40/60, pour donner le compose 5b sous forme de poudre orange (560 mg, 82%).
Caractérisation du composé 5b RMN 'H (CDC13 300 MHz) : 0,97 (t, 6H, 3J = 7,35 Hz), 1,22 (s, 6H) 1,31 (t, 2H, 3J = 7,10 Hz), 2,28 (q, 4H, 3J = 7,5 Hz) 2,68 (s, 6H), 3,34 (s, 6H), 3,53 (in, 4H), 3,64 (in, 4H), 4,18 (s, 4H), 4,25 (m, 4H), 6,84 (t, 1H, 3J= 4,7 Hz), 7,78 (AB
sys, 4H, JAB = 8,5 Hz, v â= 300,4 Hz);
RMN 13C (CDC13, 300 MHz,) : ô= 12,08, 14,05, 14,25, 14,75, 15,34, 17,38, 29,72, 42,05, 59, 59,76, 61,85, 68,55, 71,83, 90,62, 127,81, 128,66, 129,16, 133,11, 133,91, 136,02, 138,60, 140,27, 154,04, 166,80, 170,14.
Préparation du composé 6b Le composé 6b est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
O O
O N v 'OEt N__I~OH
NaOH
BEtOH , H2O
CO O
O OJ O O
5b 6b A une solution du composé 5b (510 mg, 0,732 mmol) dans l'éthanol (50 mL) a été ajoutée une solution aqueuse de soude (1,20 g, 30 mmol). La solution a été
agitée pendant 2h à température ambiante. 20-30 mL d'acétate d'éthyle ont été
ajoutés. La phase organique est extraite à l'eau (3x20 mL). Les phases aqueuses ont été
rassem-blées et acidifiées à l'aide de solution HCl 1 M jusqu'à pH 1-2. La phase aqueuse a été
extraite au dichlorométhane. La phase organique a été séchée sur coton hydrophile puis évaporée à sec pour donner le composé 6b sous forme d'une poudre orange (490 mg, quantitatif).
Caractérisation du composé 6b RMN 1H (CDC13 300 MHz) : d =0,96 (t, 6H, 3J = 7,3 Hz), 1,22 (s, 6H), 2,30 (q, 4H, 3J = 7,3 Hz), 2,68 (s, 6H), 3,34 (s, 6H), 4,19 (s, 4H), 3,54 (m, 4H), 3,66 (m, 4H), 4,18 (s, 4H), 4,26 (d, 2H, 3J 4,8 Hz), 7,13 (t, 1 H, 3J = 4,8 Hz), 7,40 (AB sys, H, JAB = 6,0 Hz, vo8= 160,2 Hz);
RMN 13C (CDC13, 300 MHz,) : 8 =12,08, 14,03, 14,73, 17,35, 41,93, 58,91, 59,71, 68,48, 71,74, 90,51, 127,90, 128,60, 129,18, 133,14, 133,57, 136,01, 138,54, 140,39, 154,04, 167,35, 172,29.
Préparation du composé 7b Le composé 7b est préparé selon le schéma réactionnel suivant :
CO CH
o 0 NHFmcc o b JLOH C), C n l~~aavc-1.~~-(>(3 ~
N.S.N 4K_CYly \
C NI
0 N.~.N
O
A une solution du composé 6b (430 mg, 0,643 mmol) et de N-hydroxysuccinimide 5 (112 mg, 0,968 mmol) dans du dichlorométhane (50 mL) ont été ajoutés, à 0 C, mg de N-diméthyle-3-aminopropyle-carbo-diimide (0,968 mmol). Le milieu réaction-nel a été agité pendant une nuit en laissant le bain remonter à température ambiante.
La solution a été diluée dans du dichlorométhane, lavée avec une solution d'acide chlorhydrique 1M (3 x 20 mL), avec une solution NaHCO3 5% puis avec une solution 10 saturée NaC1. La phase organique a été séchée sur Na2SO4 puis évaporée à
sec sous pression réduite. Le résidu a été dissout dans l'acétonitrile (50 mL). A cette solution a été ajouté une solution de Fmoc-Lys-OH (522 mg, 1,29 mmol) et de K2CO3 (180 mg, 1,29 mmol) dans un mélange acétonitrile/eau (15 mL/5 mL). La solution a été
agitée à
température ambiante pendant 2h, ensuite elle a été extraite à l'acétate d'éthyle. La 15 phase organique a été lavée à l'eau (3 x 20mL), séchée sur MgSO4 et évaporée. Le résidu a été purifié par chromatographie sur colonne de silice éluée avec un gradient de AcOEt 100% à AcOEt/EtOH 90:10. Les différentes fractions ont été
rassemblées pour donner le composé 7b sous forme d'une poudre orange (491 mg, 75%).
Caractérisation du composé 7b 20 NMR 1H (MeOD 400 MHz 60 C) : 8 =0,98 (t, 6H, 3J= 7,50 Hz), 1,26 (s, 6H), 1,41 (m, 2H), 1,55 (m, 2H), 2,33 (q, 4H, 3J= 7,50 Hz), 2,71 (s, 6H), 3,24 (t, 2H, 3J=
5,10 Hz) 3,34 (s, 6H), 3,51 (m, 4H), 3,63 (m, 4H), 4,06 (s, 3H), 4,14 (s, 4H), 4,19 (t, 1H, 3J= 5,10 Hz), 4,37 (m, 2H), 7,30 (m, 6H), 7,62 (m, 2H), 7,87 (AB sys, H, JAR =
7,66 Hz, vo8= 112,84 Hz).
Exemple 2 - Synthèse d'un peptide comportant une lysine marquée par un composé de formule générale (I) selon l'invention Le composé 7a (lysine marquée) préparé selon l'exemple 1 est utilisé dans un synthétiseur automatique de peptide et substitué à la lysine de la position 16 de la séquence d'acides aminés suivante correspondant au peptide bêta-amyloïde 1-42 humain :
H-Asp-Ala-Glu-Phe-Arg=His-Asp-Ser-Gly-Tyr-Glu-Val-His-His-Gln-Lys X-Leu-Val-Phe-Phe-Ala-Glu-Asp-V al-Gly-S er-Asn-Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met-Val-Gly-Gly-Val-Val-Ile-Ala-OH (SEQ ID NO:1).
Le peptide est utilisé dans les exemples 3, 4 et 5 et est appelé par la suite peptide amyloïde marqué.
Protocole commun aux exemples 3 et 4 Des cellules PC 12 (issues d'une tumeur de glande médullo-surrénale de rat mâle) sont ensemencées dans des boîtes de Pétri à fond de verre préalablement traitées au collagène et à la polyornithine. Elles sont cultivées pendant 7 jours dans une atmosphère à 5% de C02 à 37 C dans du milieu RPMI 1640 contenant de la glutamine et supplémenté par 10% de sérum de cheval, 5% de sérum de veau foetal, 50 U/mL de pénicilline et 50 g/mL de streptomycine. Pour induire la différenciation des cellules, on ajoute au milieu, 24 heures après l'ensemencement, 50 ng/mL
de facteur de croissance neurotrophile (NGF) 2.5S murin.
Le jour précédant la mesure, le peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué de SEQ. ID. NO:l ou le peptide inverse correspondant (42-1) non marqué de SEQ ID
NO:2 est ajouté à diverses concentrations comprises entre 10 et 1000 nmol.L"'.
Le jour suivant, cette préparation est lavée 3 fois par du milieu de Krebs à
température ambiante et placée sur un microscope inversé couplé à un spectrofluori-mètre. Un spectre de fluorescence (excitation 480 mn ; émission 495-600 nm) de la ligne de base est enregistré avant l'addition du peptide amyloïde marqué
(250 nmol.L"'). Un second spectre de fluorescence est enregistré après 10 minutes d'incubation.
Exemple 3 - mesure de la valeur de l'indice spectral du composé 7a couplé
au peptide bêta-amyloïde 1-42 après préincubation du peptide bêta-amyloïde non marqué
Le spectre de la ligne de base est soustrait du spectre de fluorescence du peptide amyloïde marqué. Le spectre obtenu est décomposé en 4 courbes gaussiennes élémentaires par déconvolution et régression non-linéaire comme illustré à la Figure 4, ce spectre de fluorescence (tracé noir) peut être décomposé en courbes gaussiennes élémentaires (tracés en différents niveaux de gris) à l'aide d'un logiciel de déconvolu-tion de spectres (Peakfit, Seasolve Software Inc., www.seasolve.com) (Graphe A). Le rapport de l'amplitude (mesurée graphiquement ou bien par le logiciel de déconvolu-tion) des courbes gaussiennes centrées respectivement à 525 nm et 540 nm définit un indice spectral décrivant l'étalement du spectre.
Le Graphe B représente la déconvolution du spectre de fluorescence du peptide amyloïde marqué enregistré en présence de cellules PC 12 avant préincubation (tracés continus) et après préincubation (tracés en pointillés) des cellules en présence de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué. On constate une augmentation importante de l'amplitude de la courbe gaussienne centrée à 525 nm qui se traduit par une augmentation de l'indice spectral lorsque les cellules ont été placées préalablement en présence de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué.
On observe ainsi que la préincubation des cellules avec le peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué conduit à une modification du spectre et la présence du peptide bêta-amyloïde 1-42 peut être détectée dans un échantillon.
Exemple 4 - mesure de la valeur de l'indice spectral du composé 7a couplé
au peptide bêta-amyloïde 1-42 après préincubation de différentes concentrations de peptide bêta-amyloïde non marqué
Selon le même principe expérimental, la valeur de l'indice spectral du composé 7a couplé au peptide bêta-amyloïde 1-42 est mesurée après préincubation de différentes concentrations de peptide bêta-amyloïde non marqué de SEQ ID NO:
1.
Les cellules PC 12 sont préincubées 12 heures en présence de peptide bêta-amyloïde 1-42 ou 42-1 non marqué puis rincées avant d'être placées sous un microscope couplé à un spectrofluorimêtre. Un premier spectre (ligne de base) est enregistré.
On ajoute ensuite le peptide bêta-amyloïde marqué. Un spectre est enregistré
minutes après l'addition du composé fluorescent.
L'indice spectral est le rapport entre l'amplitude de la première et celle de la deuxième gaussienne calculée par déconvolution (voir la Figure 4).
5 Les résultats sont représentés à la Figure 5 :
- En l'absence de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué (premier histogramme) ;
- En présence de 100 nM de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué
(second histogramme) ;
10 - En présence de 250 nM de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué
(troisième histogramme) - En présence de 250 nM de peptide bêta-amyloïde 42-1 non marqué
(quatrième histogramme).
La valeur de l'indice spectral de fluorescence de la sonde varie en fonction de la concentration de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué présent pendant la phase de préincubation des cellules. On constate également une absence de modification de la valeur de l'indice spectral, lorsque les cellules sont incubées en présence de peptide b-amyloïde 42-1 inactif. (Student t-test p<0.5% par rapport à Ab 0 nM; O p<l%
par rapport à Ab 1-42 250 nM). Ce graphe est représentatif de 4 expériences indépen-dantes mesurées en triplicate.
La Figure 5 montre que la variation de la valeur du rapport est spécifiquement induite par le peptide bêta-amyloïde 1-42 et que cette valeur augmente avec l'augmentation de concentration en peptide préincubé ; en outre, on observe que le peptide bêta-amyloïde 42-1 n'a aucun effet significatif sur la valeur du rapport.
Ainsi, l'analyse du spectre de fluorescence de la sonde permet d'évaluer la concentration de peptide bêta-amyloïde à laquelle les cellules ont été pré-incubées.
Exemple 5 - Variation de la valeur de l'indice spectral du peptide bêta-amyloïde 1-42 couplé au composé 7a en présence d'érythrocytes de rat préincubés avec le peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué
Un échantillon de sang de rat (1 à 3 ml) est recueilli dans un tube hépariné.
L'échantillon est dilué avec du milieu de Krebs puis centrifugé trois fois en suppri-mant la couche tampon ( buffy coat ). Les érythrocytes obtenus sont ensuite incubés à 37 C pendant 2 heures en présence du peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué
ou le peptide inverse correspondant (42-1) non marqué à diverses concentrations (10-nmol.L-I). Après un lavage supplémentaire, les cellules sont placées dans un spectro-fluorimètre et un spectre de fluorescence (excitation 480 nm ; émission 495-600 nm) de la ligne de base est enregistré avant l'addition du peptide amyloïde marqué
(250 nmol.L-1). Un second spectre de fluorescence est enregistré après 10 minutes d'incubation en présence du peptide amyloïde marqué.
Le spectre de la ligne de base est soustrait du spectre de fluorescence du peptide bêta-amyloïde marqué. Le spectre obtenu est décomposé en 4 courbes gaussiennes élémentaires par déconvolution et régression non-linéaire. Le rapport de l'amplitude de la gaussienne centrée autour de 510 nm sur l'amplitude de la gaussienne centrée autour de 530 nm est calculé. Sa valeur varie en fonction de la concentration de peptide bêta-amyloïde 1-42 non marqué en présence de laquelle les cellules ont été incubées comme illustré dans la Figure 6.
L'histogramme de la Figure 6 montre que la valeur de l'indice spectral augmente en fonction de la concentration de peptide bêta-amyloïde non marqué
utili-sée pendant la préincubation des cellules. 24 To a solution of Compound 2c (80mg, 0.080mmol) in 20mL of ethanol 130 mg of sodium hydroxide (3.22 mmol) were added. The solution was stirred during a night in ambient temperature. 10-20 mL of ethyl acetate was added. The sentence organic is extracted with water (3x10 mL). The aqueous phases have been collected and acidified to using 1M HCl solution until pH 1-2. The aqueous phase was extracted dichloromethane. The organic phase was dried on hydrophilic cotton then evaporated to dry to give compound 3c as a blue powder (70 mg, 90%).
Characterization of compound 3c 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 1.41 (s, 6H), 3.15 (m, 4H), 3.20 (s, 6H), 3.41 (s, 6H), 3.52 (m, 4H), 3.60 (m, 4H), 3.74 (m, 4H), 3.90 (m, 4H), 4.17 (s, 4H), 4.22 (m). , 4H), 6.63 (s, 2H), 7.28 (AB sys, 8H, JAB = 8.6 Hz, v08 = 120.59 Hz), 7.61 (AB sys, 4H, JAB
= 16.12 Hz, v08 = 191.44 Hz) 7.88 (AB sys, 4H, JAB = 8.19 Hz, v08 = 144.73 Hz).
UV-Vis (CH 2 Cl 2)? Nm (s, M -1 cm -1) = 647 (118000), 373 (67800).
Preparation of the 3d compound Compound 3d is prepared according to the following reaction scheme:
COOEt CO
NaOH
EtOH, H2O
OO
OO ~
2d OO ~
3d To a solution of the compound 2d (80 mg, 0.10 mmol) in 20 mL of ethanol were 162 mg of sodium hydroxide (4.05 mmol) were added. The solution was stirred during a night in ambient temperature. 10-20 mL of ethyl acetate was added. The sentence organic is extracted with water (3x10 mL). The aqueous phases have been collected and acidified to using 1M HCl solution until pH 1-2. The aqueous phase was extracted dichloromethane. The organic phase was dried on hydrophilic cotton then evaporated to dry to give compound 3d as an orange powder (70 mg, 90%).
Characterization of the 3d compound 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 1.36 (s, 3H), 1.39 (s, 3H), 2.74 (s, 3H), 3.26 (s, 6H), 3.32 (m, 4H), 3.40 (s, 3H), 3.56 (m, 6H), 3.73 (m, 2H), 3.88 (m, 2H), 4.18 (m, 6H), 6.03 (s, 1H), 6.59 (s, 1H), 7.22 (AB sys, 4H, JAB = 8.67 Hz, v08 = 180.18).
Hz);
Δ 7.58 (AB sys, 2H, JAB = 16.29 Hz, v δ = 297.72 Hz), 7.85 (AB sys, 4H, JAB =
7.99 Hz, v08 = 226.28 Hz).
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 14.86, 15.08, 16.37, 29.79, 58.91, 59.18, 59.58, 67.63, 68.41, 69.79, 70.88, 71.69, 72.05, 91.43, 128.76, 129.06, 129.69, 130.15, 130.44, 130.86, 134.10, 138.65, 140.39, 140.59, 141.25, 152.61, 155.54, 10,159.61, 170.40.
UV-Vis (PBS buffer), nm (s, m-cm -1) = 564 (70000), 338 (25,000).
Preparation of compound 4a Compound 4a is prepared according to the following reaction scheme:
H
Co 1 thvIènedl i3iixae .............. _..._........ -_ ........... _......... ......
............_............., Pd (PPh, ~) 2C1M
4a To a solution of compound la (200 mg, 0.31 mmol) in 15 mL of benzene a 1 mL of ethylenediamine (15 mmol), 66 mg of palladium bis-triphenyl-phosphine bis-chloride (0.09 mmol) and 1 mL of triethylamine. The solution has been agitated at 70 C overnight by "bubbling" carbon monoxide. The mixture The reaction mixture was extracted with dichloromethane and washed with water (3 × 20 mL). The phase The organic layer was dried over hydrophilic cotton and evaporated. The residue was purified by silica column chromatography (100% CH2Cl2 to CH2Cl2 75:25 gradient) to give compound 4a as an orange powder (160 mg, 80%).
Characterization of compound 4a 1 H NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 1.34 (s, 6H), 2.72 (s, 6H), 3.01 (t, 2H, 3 J =
5.7 Hz), 3.36 (s, 6H), 3.55 (m, 6H), 3.64 (m, 4H), 4.20 (s, 4H), 6.01 (s, 2H), 6.98 (t, 1H, 3J = 5.5 Hz), 7.69 (AB sys, 4H, JAB = 8.3 Hz, v0 = 162.7 Hz);
3C {1H} NMR (CDCl 3, 75.4 MHz): δ = 15.0, 16.2, 41.3, 42.2, 59.1, 59.8, 68.7, 71.9, 90.6, 121.9, 127.9, 128.8, 129.4, 134.9, 139.1, 140.4, 141.0, 155.7, 167.0;
NMR δ (CDCl 3, 128.4 MHz): δ = -10.3 (s);
UV-Vis (CH 2 Cl 2) x nm (E, M-cm -1) = 500 (64500), 371 (5600) FAB + m / z: 599.2 ([M + H] +, 100);
Elemental analysis calculated for C34H43BN4O5: C, 68.23; H, 7.24; N, 9.36.
Found: C, 67.84; H, 7.07; N, 9.22.
Preparation of compound 5a Compound 5a is prepared according to the following reaction scheme:
Co G- Iveine ester El ~ N- Bcl. Pp1..1Cl, 5 t -Nht. ~ ~
the 5i1 To a solution of compound la (100 mg, 0.16 mmol) in 6 mL of toluene anhydrous were added 80 mg of glycine ethyl ester (0.47 mmol), 22 mg of palladium bis-triphenylphosphine bis-chloride (0.03 mmol) and 2 mL of triethylamine.
The solution was stirred at 80 ° C. for 6 hours while "bubbling" monoxide carbon. The reaction mixture was filtered through celite and partially evaporated. The The residue was extracted with dichloromethane and washed with water (2 × 20 mL). The sentence organic was dried on hydrophilic cotton and evaporated. The residue was purified by chromatography Silica gel column analysis (AcOEt / 50:50 petroleum ether) for give the compound 5a as an orange powder (43 mg, 43%).
Characterization of compound 5a 1 H NMR (CDCl 3, 300 MHz): O = 1.33 (t, 3H, 3 J = 7.2 Hz), 1.34 (s, 6H), 2.72 (s, 6H), 3.36 (s, 6H), 3.55 (m, 4H), 3.66 (m, 4H), 4.20 (s, 4H), 4.27 (d, 2H, 3J = 4.5 Hz), 4.29 (q, 2H, 3J = 7.1 Hz), 6.01 (s, 2H), 6.77 (t, 1H, 3J = 4.9 Hz), 7.69;
(AB sys, 4H, JAB = 8.3 Hz, vad = 156.4 Hz);
13 C (H) NMR (CDCl 3, 75.4 MHz): δ = 14.3, 14.9, 16.2, 42.1, 59.1, 59.8, 61.9, 68.7, 71.9, 91.0, 121.9, 127.9, 129.0, 129.3, 134.2, 139.5, 140.2, 141.0, 155.8, 166.7, 170.2;
NMR 11B (CDCl 3, 128.4 MHz): δ = -10.3 (s);
UV-Vis (CH 2 Cl 2) x nm (s, M -1 cm -1) = 501 (84200), 366 (4200), 309 (6500).
Preparation of compound 6a Compound 6a is prepared according to the following reaction scheme:
LOH
0 t ~ Et. ,, NaOH
O- ~ O
5a 6 To a solution of compound 5a (40 mg, 0.06 mmol) in ethanol (10 mL) a an aqueous solution of sodium hydroxide (60 mg, 1.2 mmol) was added. The solution has been agitated for 2 hours at room temperature. 10-20 mL of ethyl acetate were added. The organic phase is extracted with water (2x20 mL). The aqueous phases have been rassem-and acidified with 1M HCl solution to pH 1-2. The product has been extracted with dichloromethane. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated at dry to give compound 6a as an orange powder (35 mg, 90%).
Characterization of compound 6a 1 H NMR (CDCl 3, 400 MHz): d = 1.32 (s, 6H), 2.72 (s, 6H), 3.36 (s, 6H), 3.55.
(m, 4H), 3.66 (m, 4H), 4.19 (s, 4H), 4.27 (d, 2H, 3 J = 3.4 Hz), 4.87 (b, 1H), 6.01 (s, 2H), 7.04 (t, 1H, 3J = 3.8 Hz), 7.69 (AB sys, 4H, JAB = 6.0 Hz, vo 5 = 160.2.
Hz);
NMRNR 3 C (H) (CDCl 3, 100 MHz): δ = 14.9, 16.2, 42.0, 59.0, 59.7, 68.6, 71.8, 90.9, 121.9, 128.0, 129.0, 129.3, 133.8, 139.6, 140.2, 140.9, 155.8, 167.3, 172.3;
NMR B (CDCl 3, 128.4 MHz): δ = -10.2 (s);
UV-Vis (CH 2 Cl 2) x nm (s, M-cm 2) = 501 (65,000), 366 (3800), 309 (5900);
UV-Vis (PBS buffer) a, nm (s, M-cm 2) = 496 (59600), 367 (4100), 308.
(6100).
Preparation of compound 7a Compound 7a is prepared according to the following reaction scheme:
COOH
0 N HFmo 0 N "-'- OH O N.,% LO.N 0 N" ilN
Nohs. And II-I \ T nitx-I ... ~, 5 - () 1I
\ NB-N- N. N- UN
OO 0 \\ ~ 0 0Y \ _0 ~ _o o) 0 ô-1 ~ - toJ
Cil 741 To a solution of compound 6a (25 mg, 0.04 inmol) and N-hydroxysuccinimide (7 mg, 0.06 mmol) in dichloromethane (5 mL) was added at 0 C, 12 mg of NOT-dimethyl-3-aminopropyl-carbo-diimide (0.06 mmol). The reaction medium summer stirred overnight, allowing the bath to warm to room temperature. The solutions This solution was diluted in dichloromethane, washed with an acid solution 1M hydrochloric acid (2 x 20 mL), with a 5% NaHCO3 solution and then with a solution saturated NaCl. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated to dryness under reduced pressure. The residue was dissolved in acetonitrile (5 mL). At this solution a a solution of Fmoc-Lys-OH (16 mg, 0.04 mmol) and K2CO3 (11 mg, 0.08 mmol) in acetonitrile / water (5 mL1 mL). The solution has been agitated to room temperature for 1h, then it was extracted with acetate ethyl. The The organic phase was washed with water (2 × 20 mL), dried over MgSO 4 and evaporated.
The The residue was purified by chromatography on an eluted silica column (gradient of AcOEt 100% AcOEt / EtOH 90:10). The aqueous phases were collected, acidified with 1M hydrochloric acid solution to pH 1 and extracted with dichloromethane. The resulting organic phase was dried over MgSO 4 and evaporated.
The different. fractions were pooled to give compound 7a under form an orange powder (25 mg, 64%).
Characterization of compound 7a 1 H NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 1.27 (s, 6H), 1.35-1.82 (m, 6H), 2.67 (s, 6H), 3.21-3.31 (m, 8H), 3.49 (m, 4H), 3.61 (m, 4H), 3.99-4.36 (m, 10H), 5.95;
(s, 2H), 7.22-7.39 (m, 6H), 7.54-7.58 (m, 2H), 7.70 (d, 2H, 3J = 7.5 Hz), 7.93 (d, 2H, 3J = 7.7 Hz);
13 C NMR (CDCl 3, 75.4 MHz): δ = 14.7, 16.0, 23.4, 28.6, 31.5, 31.9, 39.1, 43.3, 53.6, 58.9, 59.6, 67.0, 68.5, 71.7, 90.7, 118.8, 120.0, 121.8, 123.3, 125.1, 127.1, 127.8, 128.0, 129.2, 129.8, 133.9, 139.4, 140.2, 140.9, 141.3, 143.8, 143.9, 155.6, 156.4, 167.5, 169.2;
ESI m / z: 986.4 ([M + Na] +, 100).
Preparation of compound 5a13 Compound 5a13 is prepared according to the following reaction scheme:
O OH O (~ 30i ~ 0s ~ I e EDCI, DMAP
N, BN \
// \\ H3N'O "COOMe O 0 ~ _O 3a OO ~ O ~ 5a130 ~
To a solution of compound 3a (570 mg, 1.025 mmol) in dichloromethane methane (30 mL) was added at 0 C, 294 mg of N-dimethyl-3-aminopropyl-carbo diimide (1.537 mmol) and 187 mg of dimethylamino-pyridine (1.537 mmol). The The reaction medium was stirred for one hour at room temperature. AT
this solution 142 mg of 13 C-labeled glycine ester was then added.
(1.127 mmol).
The reaction medium was stirred for one hour at room temperature. The solutions The mixture was diluted with dichloromethane, washed with water (2 x 20 mL), solutions 5% NaHCO3 and then with saturated NaCl solution. The organic phase has been dried over Na 2 SO 4 and then evaporated to dryness under reduced pressure. The residue was purified By chromatography on a silica column eluted with an acetate gradient of ethyl / petroleum ether 20/80, 30/70, 40/60, to give the compound 5a'3 form orange powder (527 mg, 82%) Characterization of the compound 5a13 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 1.32 (s, 6H), 2.71 (s, 6H), 3.34 (s, 6H), 3.52 (1m, 4H), 3.64 (m, 4H), 4.02 (d, 1H, J = 141.3 Hz, 3J = 4.4 Hz), 4.18 (s, 4H), 4.50 (d, 1H, J = 141.3 Hz, 3J = 4.4 Hz), 6.00 (s, 2H), 6.85 (s, 1H), 7.68 (AB sys, 4H, JAB =
8 Hz, v S = 159.56 Hz).
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 14.72, 16, 41.72, 52.48, 58.86, 59.54, 68.44, 71.66, 76.57, 77, 77.42, 121.66, 127.78, 128.71, 129.06, 133.88, 139.24, 140, 140.72, 155.51, 166.58, 169.976, 170.79.
Preparation of compound 6a13 Compound 6a13 is prepared according to the following reaction scheme:
oo OH OH
13C OMe 13C, OH
NaOH
B "N- EtOH, H2O B'IN
OO CJo 5at3 6a13 To a solution of compound 5a13 (500 mg, 0.795 mmol) in ethanol (30 mL) an aqueous solution of sodium hydroxide (1.27 g, 32 mmol) was added. The solution been agitated for 2 hours at room temperature. 20-30 mL of ethyl acetate were added. The organic phase is extracted with water (3x20 mL). The aqueous phases have been rassem-and acidified with 1M HCl solution to pH 1-2. The sentence aqueous has been extracted with dichloromethane. The organic phase was dried on cotton hydrophilic then evaporated to dryness to give compound 6a13 as an orange powder (464 mg, 95%).
Characterization of compound 6a13 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): δ = 1.29 (s, 6H), 2.70 (s, 6H), 3.34 (s, 6H), 3.52.
(m, 4H), 3.65 (m, 4H), 3.93 (s, 1H, J = 140.6 Hz), 4.17 (s, 4H), 4.39 (s, 1H, 'J =
140.6 Hz), 7.67 (AB sys, H, JAB = 7.72 Hz, v0 = 177.95 Hz).
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 14.72, 15.43, 16.03, 42.20, 43.02, 54.94, 58,36, 58.85, 59.55, 68.46, 71.63, 76.57, 90.76, 121.74, 127.94, 128.74, 129.05, 133,70, 139.35, 139.94, 140.68, 140.78, 155.26, 155.48, 155.57, 167.35.
Preparation of compound 7a13 Compound 7a13 is prepared according to the following reaction scheme:
COOH
NHFmo vs OHOO
HO
I ~ lo I ~
~ 1ï () lI S, iI: X, `II-IC'I ~ ~ ~ Ftaioc-i,}, - QI-C ~ ~
N..N ~ NB.N- K C ~ ~: ~; N. N-oi ~ OOOOO, O
poop pJ
6.l i ' To a solution of compound 6a13 (430 mg, 0.7 mmol) and N-hydroxysuccinimide (120 mg, 1.05 mmol) in dichloromethane (50 mL) were added at 0.degree.
207 mg N-dimethyl-3-aminopropyl-carbo-diimide (1.05 mmol). The reaction medium at stirred overnight, allowing the bath to warm up room. The solution was diluted in dichloromethane, washed with an acid solution 1M hydrochloric acid (3 x 20 mL), with a 5% NaHCO3 solution and then with a solution saturated NaCl. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated to dryness under reduced pressure. The residue was dissolved in acetonitrile (50 mL). At this solution, a A solution of Fmoc-Lys-OH (566 mg, 1.40 mmol) and K2CO3 (193 mg) was added.
mg, 1.40 mmol) in acetonitrile / water (15 mL / 5 mL). The solution has been agitated to room temperature for 2 hours, then it was extracted with acetate ethyl. The organic phase was washed with water (3 x 20mL), dried over MgSO4 and evaporated.
The The residue was purified by chromatography on a silica column eluted with gradient ranging from 100% AcOEt to 90:10 AcOEt / EtOH. The different fractions were rassem-to give compound 7a'3 as an orange powder (539 mg, 80%).
Characterization of compound 7a13 1 H NMR (MeOD 400 MHz 60 C): δ = 1.18 (m, 1H), 1.22 (s, 6H), 1.40 (m, 2H), 1.53.
(m, 2H), 2.71 (s, 6H), 3.23 (t, 2H, 3 J = 6.72 Hz) 3.34 (s, 6H), 3.51 (m, 4H), 3.63 (m, 4H), 4.14 (s, 4H), 4.18 (t, 1H, 3J = 5.10 Hz), 4.21 (d, 2H, 1 JHC 13 = 140 Hz), 6.04 (s, 2H), 7.25 (m, 2H), 7.33 (m, 4H), 7.61 (1n, 2H), 7.71 (d, 2H), 8.01 (d, 2H).
Preparation of compound 5b Compound 5b is prepared according to the following reaction scheme:
NO
O OH EDCI, DMAP
Glycine ester O 3b O 5b O
To a solution of compound 3b (600 mg, 0.979 mmol) in dichloromethane methane (50 mL) was added at 0 C, 280 mg of N-dimethyl-3-arinopropyl-carbo-diimide (1.47 minol) and 180 mg of direthyl-amino-pyridine (1.47 mmol).
The The reaction medium was stirred for one hour at room temperature. AT
this 205 mg of glycine ester (1.47 mmol) was then added. The environment reaction-It was stirred for one hour at room temperature. The solution has been diluted in dichloromethane, washed with water. (2 x 20 mL), with 5% NaHCO3 solution then with saturated NaCl solution. The organic phase was dried over Na2SO4 then evaporated to dryness under reduced pressure. The residue was purified by chromatography on silica column eluted with a gradient of ethyl acetate / petroleum ether 20/80, 30/70, 40/60, to give compound 5b as an orange powder (560 mg, 82%).
Characterization of compound 5b 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): 0.97 (t, 6H, 3 J = 7.35 Hz), 1.22 (s, 6H) 1.31 (t, 2H, 3 J = 7.10 Hz), 2.28 (q, 4H, 3 J = 7.5 Hz) 2.68 (s, 6H), 3.34 (s, 6H), 3.53.
(in, 4H), 3.64 (in, 4H), 4.18 (s, 4H), 4.25 (m, 4H), 6.84 (t, 1H, 3 J = 4.7 Hz), 7.78 (AB);
sys, 4H, JAB = 8.5 Hz, v = 300.4 Hz);
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 12.08, 14.05, 14.25, 14.75, 15.34, 17.38, 29.72, 42.05, 59, 59.76, 61.85, 68.55, 71.83, 90.62, 127.81, 128.66, 129.16, 133.11, 133.91, 136.02, 138.60, 140.27, 154.04, 166.80, 170.14.
Preparation of compound 6b Compound 6b is prepared according to the following reaction scheme:
OO
ON v 'OEt N__I ~ OH
NaOH
BEtOH, H2O
CO O
O OJ OO
5b 6b To a solution of compound 5b (510 mg, 0.732 mmol) in ethanol (50 mL) a an aqueous solution of sodium hydroxide (1.20 g, 30 mmol) was added. The solution has been agitated for 2 hours at room temperature. 20-30 mL of ethyl acetate were added. The organic phase is extracted with water (3x20 mL). The aqueous phases have been rassem-and acidified with 1M HCl solution to pH 1-2. The sentence aqueous has been extracted with dichloromethane. The organic phase was dried on cotton hydrophilic then evaporated to dryness to give compound 6b as an orange powder (490 mg, quantitative).
Characterization of compound 6b 1 H NMR (CDCl 3 300 MHz): d = 0.96 (t, 6H, 3 J = 7.3 Hz), 1.22 (s, 6H), 2.30 (q, 4H, 3 J = 7.3 Hz), 2.68 (s, 6H), 3.34 (s, 6H), 4.19 (s, 4H), 3.54 (m, 4H), 3.66 (m, 4H), 4.18 (s, 4H), 4.26 (d, 2H, 3J, 4.8Hz), 7.13 (t, 1H, 3J = 4.8Hz), 7.40.
(AB sys, H, JAB = 6.0 Hz, vo8 = 160.2 Hz);
13 C NMR (CDCl 3, 300 MHz): δ = 12.08, 14.03, 14.73, 17.35, 41.93, 58.91, 59.71, 68.48, 71.74, 90.51, 127.90, 128.60, 129.18, 133.14, 133.57, 136.01, 138.54, 140.39, 154.04, 167.35, 172.29.
Preparation of compound 7b Compound 7b is prepared according to the following reaction scheme:
CO CH
o 0 NHFmcc ob JLOH C), C n l ~~ aavc-1. ~~ - (> (3 ~
NSN 4K_CYly \
C NI
0 N. ~ .N
O
To a solution of compound 6b (430 mg, 0.643 mmol) and N-hydroxysuccinimide (112 mg, 0.968 mmol) in dichloromethane (50 mL) was added at 0.degree.
mg N-dimethyl-3-aminopropyl-carbo-diimide (0.968 mmol). The environment reaction-nel was stirred overnight, allowing the bath to warm up room.
The solution was diluted in dichloromethane, washed with a solution acid 1M hydrochloric acid (3 x 20 mL), with a 5% NaHCO3 solution and then with a solution Saturated NaCl. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated at dry under reduced pressure. The residue was dissolved in acetonitrile (50 mL). At this solution a a solution of Fmoc-Lys-OH (522 mg, 1.29 mmol) and K2CO3 (180 mg, 1.29 mmol) in acetonitrile / water (15 mL / 5 mL). The solution has been agitated to room temperature for 2 hours, then it was extracted with acetate ethyl. The The organic phase was washed with water (3 x 20mL), dried over MgSO 4 and evaporated. The The residue was purified by chromatography on a silica column eluted with gradient of AcOEt 100% with AcOEt / EtOH 90:10. The different fractions were gathered to give compound 7b as an orange powder (491 mg, 75%).
Characterization of compound 7b NMR 1H (MeOD 400 MHz 60 C): δ = 0.98 (t, 6H, 3 J = 7.50 Hz), 1.26 (s, 6H), 1.41 (m, 2H), 1.55 (m, 2H), 2.33 (q, 4H, 3 J = 7.50 Hz), 2.71 (s, 6H), 3.24 (t, 2H, 3J =
5.10 Hz) 3.34 (s, 6H), 3.51 (m, 4H), 3.63 (m, 4H), 4.06 (s, 3H), 4.14 (s, 4H), 4.19 (t, 1H, 3 J = 5.10 Hz), 4.37 (m, 2H), 7.30 (m, 6H), 7.62 (m, 2H), 7.87 (AB sys, H, JAR =
7.66 Hz, vo8 = 112.84 Hz).
Example 2 Synthesis of a Peptide Comprising a Labeled Lysine a compound of general formula (I) according to the invention Compound 7a (labeled lysine) prepared according to Example 1 is used in a automatic peptide synthesizer and substituted for lysine of position 16 of the next amino acid sequence corresponding to beta-amyloid peptide 1-42 human :
H-Asp-Ala-Glu-Phe-Arg = His-Asp-Ser-Gly-Tyr-Glu-Val-His-His-Gln-Lys X-Leu-Val-His Phe-Phe-Ala-Glu-Asp-V al-Gly-S er-Asn-Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met-Val-Gly-Gly-Val-Val-Ile-Ala-OH (SEQ ID NO: 1).
The peptide is used in Examples 3, 4 and 5 and is called thereafter labeled amyloid peptide.
Protocol common to Examples 3 and 4 PC 12 cells (from a rat adrenal gland tumor) male) are sown in petri dishes with glass bottom treated collagen and polyornithine. They are grown for 7 days in a atmosphere at 5% CO 2 at 37 ° C. in RPMI 1640 medium containing glutamine and supplemented with 10% horse serum, 5% calf serum fetal, 50 U / mL penicillin and 50 g / mL streptomycin. To induce the differentiation cells, the medium is added, 24 hours after seeding, 50 ng / mL
of Neurotrophic growth factor (NGF) 2.5S murine.
The day before the measurement, the unlabeled beta-amyloid 1-42 peptide of SEQ. ID. NO: 1 or the corresponding unlabeled reverse peptide (42-1) of SEQ ID
NO: 2 is added at various concentrations between 10 and 1000 nmol.L ".
The next day, this preparation is washed 3 times with Krebs's ambient temperature and placed on an inverted microscope coupled to a spectrofluori-metre. A fluorescence spectrum (excitation 480 nm, emission 495-600 nm) of the baseline is recorded before the addition of the labeled amyloid peptide (250 nmol.L "') A second fluorescence spectrum is recorded after 10 minutes incubation.
Example 3 - Measurement of the value of the spectral index of compound 7a coupled to amyloid beta peptide 1-42 after preincubation of non-amyloid beta peptide Mark The baseline spectrum is subtracted from the fluorescence spectrum of the labeled amyloid peptide. The spectrum obtained is broken down into 4 curves gaussian elements by deconvolution and nonlinear regression as illustrated in figure 4, this fluorescence spectrum (black plot) can be broken down into curves gaussian elementary (plots in different levels of gray) using déconvolu-spectra (Peakfit, Seasolve Software Inc., www.seasolve.com) (Graph AT). The amplitude ratio (measured graphically or by the software of déconvolu-Gaussian curves centered respectively at 525 nm and 540 nm defines a spectral index describing the spread of the spectrum.
Graph B represents the deconvolution of the fluorescence spectrum of the labeled amyloid peptide recorded in the presence of PC 12 cells before preincubation (continuous plots) and after preincubation (dashed lines) of the cells in the presence unlabeled beta-amyloid peptide 1-42. There is an increase important of the amplitude of the Gaussian curve centered at 525 nm which results in a increased spectral index when the cells were placed previously in presence of unlabeled beta-amyloid peptide 1-42.
It is thus observed that the preincubation of the cells with the beta peptide Unlabelled 1-42 amyloid leads to spectrum modification and presence of beta-amyloid peptide 1-42 can be detected in a sample.
Example 4 - Measurement of the value of the spectral index of compound 7a coupled to amyloid beta peptide 1-42 after preincubation of different concentrations unlabeled beta-amyloid peptide According to the same experimental principle, the value of the spectral index of compound 7a coupled to beta-amyloid peptide 1-42 is measured after preincubation of different concentrations of unlabeled beta-amyloid peptide of SEQ ID NO:
1.
PC 12 cells are preincubated for 12 hours in the presence of beta peptide.
amyloid 1-42 or 42-1 unmarked and then rinsed before being placed under a microscope coupled to a spectrofluorimetre. A first spectrum (baseline) is checked in.
The labeled beta-amyloid peptide is then added. A spectrum is recorded minutes after the addition of the fluorescent compound.
The spectral index is the ratio between the amplitude of the first and that of the second Gaussian calculated by deconvolution (see Figure 4).
The results are shown in Figure 5:
- In the absence of unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 (first histogram) ;
In the presence of 100 nM of unlabelled beta-amyloid peptide 1-42 (second histogram);
10 - In the presence of 250 nM unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 (third histogram) In the presence of 250 nM of unlabeled beta-amyloid peptide 42-1 (fourth histogram).
The value of the fluorescence spectral index of the probe varies according to of the concentration of unlabelled beta-amyloid peptide 1-42 present during the phase preincubation of the cells. There is also an absence of modification of the value of the spectral index, when the cells are incubated in the presence of peptide 42-1 amyloid inactive. (Student t-test p <0.5% compared to Ab 0 nM; O p <1%
compared to Ab 1-42 (250 nM). This graph is representative of 4 experiments independent dantes measured in triplicate.
Figure 5 shows that the change in the value of the report is specifically induced by beta-amyloid peptide 1-42 and that this value increases with the preincubated peptide concentration increase; in addition, we observe that the beta-amyloid peptide 42-1 has no significant effect on the value of the report.
Thus, the analysis of the fluorescence spectrum of the probe makes it possible to evaluate the concentration of amyloid beta peptide to which the cells were incubated.
Example 5 - Variation in the value of the spectral index of the beta peptide amyloid 1-42 coupled to compound 7a in the presence of rat erythrocytes preincubated with unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 A sample of rat blood (1 to 3 ml) is collected in a heparinized tube.
The sample is diluted with Krebs medium and centrifuged three times in suppri-the buffer layer (buffy coat). The erythrocytes obtained are then incubated at 37 ° C. for 2 hours in the presence of the unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 where the corresponding unlabeled reverse peptide (42-1) at various concentrations (10-nmol.LI). After an additional wash, the cells are placed in a spectro fluorimeter and a fluorescence spectrum (excitation 480 nm, emission 495-600 nm) of the baseline is recorded before the addition of the labeled amyloid peptide (250 nmol.L-1). A second fluorescence spectrum is recorded after 10 minutes incubation in the presence of the labeled amyloid peptide.
The baseline spectrum is subtracted from the fluorescence spectrum of the beta-amyloid peptide labeled. The spectrum obtained is broken down into 4 curves elementary Gaussian by deconvolution and nonlinear regression. The report of the amplitude of the Gaussian centered around 510 nm on the amplitude of the Gaussian centered around 530 nm is calculated. Its value varies according to of the concentration of unlabeled beta-amyloid peptide 1-42 in the presence of which the cells were incubated as shown in Figure 6.
The histogram of Figure 6 shows that the value of the spectral index increases as a function of the concentration of unlabeled beta-amyloid peptide utili-during preincubation of the cells.
Claims (19)
dans laquelle :
- R1 est choisi dans le groupe constitué par -Ar-CO-Z ; un atome d'hydrogène (-H) ; -L-H ; -G et -L-G, où Ar, Z, L et G sont définis ci-après ;
- R3, R4, R6 et R7 sont choisis indépendamment les uns des autres dans le groupe constitué par -(Ar)m-CO-Z ; un atome d'hydrogène (-H); -L-H; -G et -L-G;
où m est 0 ou 1;
étant entendu qu'un seul des substituants R1, R3, R4, R6 et R7 est -Ar-CO-Z ou -(Ar)m-CO-Z;
- R2 et R5 identiques ou différents sont choisis indépendamment l'un de l'autre dans le groupe constitué par un atome d'hydrogène (-H); -L-H; -G et -L-G;
où L et G sont définis ci-après;
- S1 et S2 sont des groupements hydrophiles, identiques ou différents, de formule -C.ident.C-L'-A ;
dans laquelle L' et A sont définis ci-après - Ar est choisi parmi un arylène ou un hétéroarylène en C5-C14 sur lequel le groupe -CO-Z est en position ortho, méta ou para, de préférence para ;
- Z est choisi parmi un groupement -OH, -O-succinimide, -O-maléimide, -N-glycine, -N-lysine, -Y-L''-NH2, -Y-L''-COOH, -Y-L''-SH où Y est choisi parmi les atomes de N et O et L'' est défini ci-après ;
- L et L" sont choisis indépendamment l'un de l'autre parmi une liaison simple ; une chaîne carbonée saturée éventuellement ramifiée en C1-C10, de préférence en C1-C6 ; un arylène en C6-C16 sur lequel les groupements -H ou -G pour L et -NH2, -COOH ou -SH pour L'' sont en position ortho, méta ou para, de préférence para ; un alkénylène en C2-C4 ; un alkynylène en C2-C4 ; une chaîne carbonée linéaire ou rami-fiée en C1-C20 interrompue par 1 à 10 atomes d'oxygène ; une chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée en C1-C20 interrompue par une à quatre fonctions amides -CO-NH- ; un segment nucléotidique et/ou un segment de sucres ;
- G est choisi dans le groupe constitué par l'ester succinimidyle, l'ester sulfosuccinimidyle, l'isothiocyanate, l'isocyanate, l'iodoacétamide, la maléimide, les halosulfonyles, les phosphoramidites, les alkylimidates en C2-C5, les arylimidates en C6-C10, les halogénoacides, de préférence, les chloroacides et les bromoacides, les hydrazines substituées par un alkyle en C1-C4, les hydroxylamines substituées par un alkyle en C1-C4, les carbodiimides et les perfluorophénols ;
- L' est choisi parmi une liaison simple ; un alkénylène en C1-C10 ou une chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée en C1-C20 interrompue par 1 à 10 atomes d'oxygène ;
- A représente un groupement choisi parmi un alkyle en C1-C4, de préfé-rence, le méthyle ; un groupement phosphate ou un groupement sulfonate. 1. Compound of general formula (I):
in which :
R1 is selected from the group consisting of -Ar-CO-Z; an atom hydrogen (-H); -LH; -G and -LG, where Ar, Z, L and G are defined below;
- R3, R4, R6 and R7 are chosen independently of each other in the group consisting of - (Ar) m-CO-Z; a hydrogen atom (-H); -LH; -G and -L-BOY WUT;
where m is 0 or 1;
it being understood that only one of the substituents R1, R3, R4, R6 and R7 is -Ar-CO-Z or -(Ar) m-CO-Z;
- R2 and R5 identical or different are independently selected one of the other in the group consisting of a hydrogen atom (-H); -LH; -G and -L-BOY WUT;
where L and G are defined below;
S1 and S2 are hydrophilic groups, identical or different, of formula -C.ident.C-The-A;
in which L 'and A are defined below Ar is chosen from an arylene or a C5-C14 heteroarylene on which the group -CO-Z is in the ortho, meta or para position, preferably para;
Z is chosen from a group -OH, -O-succinimide, -O-maleimide, -N-glycine, -N-lysine, -Y-L '' -NH 2, -Y-L '' - COOH, -Y-L '' - SH where Y is chosen among the N and O and L '' atoms is defined hereinafter;
L and L "are chosen independently of one another from a bond simple; a saturated carbon chain optionally branched C1-C10, preference C1-C6; a C 6 -C 16 arylene on which the groups -H or -G for L and --COOH or -SH for L '' are in the ortho, meta or para position, preferably para ; a C2-C4 alkenylene; C2-C4 alkynylene; a linear carbon chain or rummy-C1-C20 terminated by 1 to 10 oxygen atoms; a carbon chain saturated, linear or branched C1-C20 interrupted by one to four amide functions -CO-NH-; a nucleotide segment and / or a segment of sugars;
G is chosen from the group consisting of the succinimidyl ester, the ester sulphosuccinimidyl, isothiocyanate, isocyanate, iodoacetamide, maleimide, halosulfonyls, phosphoramidites, C2-C5 alkylimidates, arylimidates in C6-C10, the haloacids, preferably the chloroacids and the bromoacids, C1-C4 alkyl substituted hydrazines, substituted hydroxylamines by a C1-C4 alkyl, carbodiimides and perfluorophenols;
- The is chosen from a single bond; a C1-C10 alkenylene or a saturated, linear or branched C1-C20 carbon chain interrupted by 1 to 10 carbon oxygen;
A represents a group chosen from a C 1 -C 4 alkyl, preferably ence, methyl; a phosphate group or a sulfonate group.
en ce que Ar est choisi parmi le benzène, le naphtalène, l'anthracène, le pyrène, la pyridine, la pyrimidine, le thiophène ou le pyrrole. 4. Compound according to any one of the preceding claims, characterized in that Ar is selected from benzene, naphthalene, anthracene, pyrene, the pyridine, pyrimidine, thiophene or pyrrole.
en ce que A est choisi parmi un méthyle, un propyl sulfonate, un éthyl sulfonate ou un méthylphosphate. 5. Compound according to any one of the preceding claims, characterized in that A is selected from methyl, propyl sulfonate, ethyl sulfonate or a methyl phosphate.
en ce que la chaîne carbonée saturée, linéaire ou ramifiée en C1-C20 interrompue par 1 à 10 atomes d'oxygène est un poly(oxyde d'éthylène) ou un poly(oxyde de propylène) dont le motif se répète entre une et six fois. 6. Compound according to any one of the preceding claims, characterized in that the saturated carbon chain, linear or branched C1-C20 interrupted by 1 at 10 oxygen atoms is a poly (ethylene oxide) or a poly (oxide of propylene) whose motive is repeated between one and six times.
ledit intermédiaire est tel que P est un groupement de structure identique au composé de formule générale (I) à préparer à l'exception du radical R1 ou R3 ou R4 ou R6 ou R7 selon celui qui est le groupement -Ar-CO-Z pour R1 ou -(Ar)m-CO-Z
pour R3 ou R4 ou R6 ou R7 ; Ar est tel que défini pour la formule (I), m est 0 ou 1 étant entendu que m est 1 si R1 est la fonction carbonyle -Ar-CO-Z et Q est choisi parmi un atome d'halogène ; un -O-triflate ; un -O-tosylate ou un -O-mésylate. 7. Process for preparing a compound of general formula (I) according to one of any of claims 1 to 6, characterized in that it comprises the transformed-synthesis of the intermediate P- (Ar) mQ to a compound of the general formula (I) by reaction with a carbon source in the presence of a nucleophile selected from the water, an alcohol, an amine or a thiol and a palladium catalyst;
said intermediate is such that P is a group of structure identical to compound of general formula (I) to be prepared except radical R1 or R3 or R4 or R6 or R7 depending on which is the group -Ar-CO-Z for R1 or - (Ar) m-CO-Z
for R3 or R4 or R6 or R7; Ar is as defined for formula (I), m is 0 or 1 being understood that m is 1 if R1 is the carbonyl function -Ar-CO-Z and Q is chosen among one halogen atom; a -O-triflate; -O-tosylate or -O-mesylate.
P-(Ar)m-CO-(X)n-T (II) dans laquelle :
- P est le composé de formule générale (I) selon l'une quelconque des revendications 1 à 6 à l'exception du radical R1 ou R3 ou R4 ou R6 ou R7 qui est le groupement -(Ar)m-CO-Z ;
- Ar est choisi parmi un arylène ou un hétéroarylène en C5-C10 sur lequel le groupe-CO-Z est en position ortho, méta ou para, de préférence para ;
- m est 0 ou 1 étant entendu que m est 1 si le groupement -(Ar)m-CO-(X)n-T est substitué à R1;
- X est un espaceur porteur d'une fonction carboxylique, amine ou thiol ;
- n est un nombre entier égal à 0 ou 1 - T est une molécule biologique. 9. Marked biological molecule of general formula (II):
P- (Ar) m-CO- (X) nT (II) in which :
P is the compound of general formula (I) according to any one of Claims 1 to 6 with the exception of the radical R1 or R3 or R4 or R6 or R7 which is the grouping - (Ar) m-CO-Z;
Ar is chosen from an arylene or a C5-C10 heteroarylene on which the group-CO-Z is in the ortho, meta or para position, preferably para;
m is 0 or 1 with the proviso that m is 1 if the group - (Ar) m-CO-(X) nT is substituted for R1;
X is a spacer carrying a carboxylic, amine or thiol function;
n is an integer equal to 0 or 1 - T is a biological molecule.
avec un groupement Z porteur d'un acide carboxylique ; ledit composé (I) est (i) transformé en amide par une réaction d'hydrolyse avec une diamine aliphatique puis (ii) mis à réagir avec une biotine ou un de ses dérivés ou analogues structuraux possédant une fonction acide carboxylique libre. Process for the preparation of a biological molecule according to claim 9 or claim 10 wherein T is biotin or a derivative thereof or the like structured characterized in that it is carried out from a compound of formula general (I) according to any one of claims 1 to 6 functionalized with a a Z group carrying a carboxylic acid; said compound (I) is (i) turned into amide by a hydrolysis reaction with an aliphatic diamine and (ii) to react with a biotin or a derivative or structural analogue thereof having a free carboxylic acid function.
ledit composé (I) étant mis à réagir avec un nucléotide modifié avec une fonction amine libre. 15. Process for the preparation of a biological molecule according to claim 9 or claim 10 wherein T is a nucleotide, characterized in that it is implemented from a compound of general formula (I) according to any one of revendica-1 to 6 functionalized with a group Z carrying an acid carboxylic acid;
said compound (I) being reacted with a modified nucleotide with a function free amine.
a) mesure du spectre d'émission de fluorescence de l'échantillon à tester seul ;
le spectre obtenu est désigné ligne de base ;
b) mesure du spectre d'émission de fluorescence de la molécule biologique marquée en solution ; soustraction de la ligne de base au spectre obtenu et calcul de l'indice de déformation ;
c) incubation de ladite molécule biologique marquée en solution avec l'échantillon à tester et obtention d'un mélange ;
d) mesure du spectre d'émission de fluorescence du mélange obtenu à l'étape c) ; soustraction de la ligne de base au spectre obtenu et calcul de l'indice de déforma-tion ;
e) comparaison des indices de déformation calculés aux étapes b) et d) et détection de l'interaction entre le ligand et la molécule biologique marquée lorsque lesdits indices sont différents. 16. Method for detecting a ligand of a labeled biological molecule according to any one of claims 9 to 12 in a sample including following steps :
a) measuring the fluorescence emission spectrum of the sample to be tested alone ;
the spectrum obtained is designated baseline;
b) measuring the fluorescence emission spectrum of the biological molecule marked in solution; subtraction of the baseline to the spectrum obtained and calculation of the strain index;
c) incubating said labeled biological molecule in solution with the sample to be tested and obtaining a mixture;
d) measuring the fluorescence emission spectrum of the mixture obtained in step vs) ; subtraction of the baseline from the spectrum obtained and calculation of the index of deformity tion;
e) comparison of the strain indices calculated in steps b) and d) and detection of the interaction between the ligand and the labeled biological molecule when said indices are different.
a) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-mation de la molécule biologique marquée en solution ;
b) incubation de ladite molécule biologique marquée en solution avec un ligand et obtention d'un mélange 1;
c) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-mation du mélange 1 ;
d) incubation dudit ligand avec ledit composé à tester puis ajout de ladite molécule biologique marquée en solution et obtention d'un mélange 2;
e) mesure du spectre d'émission de fluorescence et calcul de l'indice de défor-mation du mélange 2 ;
f) détection de l'interaction entre le ligand et le composé à tester par comparai-son des indices de déformation calculés aux étapes a), c) et e). 18. Method of identifying a compound capable of interacting with the ligand of a labeled biological molecule according to any of claims 9 at 12 comprising the following steps:
a) measuring the fluorescence emission spectrum and calculating the deformation index mation of the labeled biological molecule in solution;
b) incubating said labeled biological molecule in solution with a ligand and obtaining a mixture 1;
c) measurement of the fluorescence emission spectrum and calculation of the deformation index mixing of the mixture 1;
d) incubating said ligand with said test compound and adding said labeled biological molecule in solution and obtaining a mixture 2;
e) measurement of the fluorescence emission spectrum and calculation of the deformation index mixing of the mixture 2;
f) detection of the interaction between the ligand and the test compound by comparisons its deformation indices calculated in steps a), c) and e).
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