CA2459127A1 - Polymorphismes d'adn mitochondrial humain, haplogroupes, associations avec des conditions physiologiques et reseaux de genotypage - Google Patents

Polymorphismes d'adn mitochondrial humain, haplogroupes, associations avec des conditions physiologiques et reseaux de genotypage Download PDF

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Douglas C. Wallace
Seyed Hosseini
Dan Mishmar
Eduardo Ruiz-Pesini
Marie Lott
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La présente invention concerne des polymorphismes d'ADN mitochondrial (ADNmt) humain qui sont des éléments de diagnostic de la totalité des principaux haplogroupes humains et des méthodes de diagnostic de ces haplogroupes et de sous-haplogroupes sélectionnés. Cette invention concerne des méthodes qui permettent d'identifier des gènes d'ADN mitochondrial significativement évolutifs, des allèles nucléotidiques et des allèles d'acides aminés significativement évolutifs. Les allèles et les gènes significativement évolutifs sont identifiés au moyen d'une ou deux populations d'une espèce unique. Le processus d'identification d'allèles nucléotidiques significativement évolutifs implique l'identification de gènes significativement évolutifs puis des allèles nucléotidiques significativement évolutifs dans ces mêmes gènes, et l'identification d'allèles d'acides aminés significativement évolutifs codés par tous les allèles non synonymes. Les codages synonymes des allèles nucléotidiques codant les allèles d'acides aminés significativement évolutifs selon l'invention sont équivalents aux allèles d'acides aminés significativement évolutifs présentés ici et sont inclus dans le champ d'application de cette invention. Les codages synonymes comprennent des allèles situés à des loci de nucléotides voisins qui se trouvent dans le même codon. Cette invention concerne également des méthodes d'association d'haplogroupes et d'allèles nucléotidiques et d'acides aminés significativement évolutifs ayant des prédispositions pour des conditions physiologiques; des méthodes de diagnostic de la prédisposition envers LHON, et des méthodes de diagnostic permettant de diagnostiquer une probabilité accrue de développer une cécité, d'atteindre l'âge de cent ans et de bénéficier d'une longévité accrue qui ne dépendent pas de la position géographique de l'individu soumis au diagnostic. Le diagnostic d'un individu présentant une prédisposition relativement à une condition physiologique liée au métabolisme dépend de la région géographique de l'individu. Les conditions physiologiques pouvant être diagnostiquées à l'aide des méthodes selon l'invention comprennent les conditions de bonne santé et les conditions pathologiques. Les conditions physiologiques qui sont associées aux haplogroupes et aux allèles selon la présente invention comprennent les déséquilibres énergétiques, les maladies métaboliques, le métabolisme énergétique anormal, la régulation thermique anormale, la phosphorylation oxydative anormale, le transport électronique anormal, l'obésité, la quantité de la masse grasse, le diabète, l'hypertension et les maladies cardio-vasculaires.
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