CA2346968A1 - Plasmodium falciparum antigens and their vaccinal and diagnostic applications - Google Patents

Plasmodium falciparum antigens and their vaccinal and diagnostic applications Download PDF

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Anne-Charlotte Gruner
Pierre Druilhe
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Description

ANTIG~NES DE PLASMODIUM FALCIPARUM ET LEURS
APPLICATIONS VACCINALES ET DIAGNOSTIQUES
CONTEXTE DE L'INVENTION
a) Domaine de l'invention La présente invention se rapporte à de nouveaux antigènes de Plasmodium falciparum et à leurs applications vaccinales et diagnostiques.
Plus particulièrement, la présente invention vise des molécules polynucléotidiques et polypeptidiques immunogéniques, des compositions les comprenant, et des méthodes de diagnostic et de vaccination du paludisme.
b) Brève description de l'art antérieur Le paludisme est une maladie provoquée par l'infection de parasites protozoaires appartenant aux apicomplexes de l'espèce Plasmodium et transmis par les femelles des moustiques du genre Anopheles. Malgré le fait que l'OMS a classé, depuis 1998, le paludisme parmi les trois maladies infectieuses d'intérêt majeur pour la santé publique mondiale au même rang que la tuberculose et le SIDA, il n'existe pas encore de vaccin efficace contre cette maladie.
Des études précédentes ont conduit à la mise en évidence de polypeptides antigéniques du stade pré-érythrocytaire de la maladie, notamment les polypeptides SALSA (pour Sporozoïte Liver Stage Antigen) décrits dans EP A
0407230, le LSA 1 (pour Liver Stage Antigen) décrit dans WO 92/13884 et LSA-3 décrit dans FR 2,735,478.
La présente invention est relative à de nouvenes mo~ecu~es polynucléotidiques et polypeptidiques spécifiques des stades pré-érythrocytaires et à leurs utilisations à titre de principe actif de vaccin anti-palustre ou dans des méthodes de diagnostics de la maladie.
RÉSUMÉ DE L'INVENTION
La Demanderesse a identifié une série de 120 fragments d'ADN
génomique codant pour des protéines exprimées aux stades pré-érythrocytaires, c'est-à-dire au stade sporozoïte et/ou au stade hépatique. La caractérisation
ANTIG ~ NES OF PLASMODIUM FALCIPARUM AND THEIR
VACCINE AND DIAGNOSTIC APPLICATIONS
BACKGROUND OF THE INVENTION
a) Field of the invention The present invention relates to novel antigens of Plasmodium falciparum and their vaccine and diagnostic applications.
More in particular, the present invention relates to polynucleotide molecules and immunogenic polypeptides, compositions comprising them, and methods of diagnosis and vaccination of malaria.
b) Brief description of the prior art Malaria is a disease caused by infection of parasites protozoa belonging to the apicomplexes of the Plasmodium species and transmitted by females of Anopheles mosquitoes. Despite the fact that WHO has classified, since 1998, malaria among the three infectious diseases interest major for global public health at the same level as tuberculosis and the AIDS, there is not yet an effective vaccine against this disease.
Previous studies have led to the discovery of polypeptides antigenics of the pre-erythrocytic stage of the disease, including SALSA polypeptides (for Sporozoite Liver Stage Antigen) described in EP A
0407230, LSA 1 (for Liver Stage Antigen) described in WO 92/13884 and LSA-3 described in FR 2,735,478.
The present invention relates to new mo ~ ecu ~ es polynucleotides and polypeptides specific for the pre-erythrocyte and their uses as an active ingredient in malaria vaccine or in methods of diagnosing the disease.
SUMMARY OF THE INVENTION
The Applicant has identified a series of 120 DNA fragments genomics coding for proteins expressed in the preerythrocytic stages, that is to say at the sporozoite stage and / or at the hepatic stage. The caracterisation

2 initiale de cette série de clones a conduit à identifier l'antigène LSA-1, puis SALSA, puis STARP, puis LSA-3. Des travaux plus récents portant sur 10 fragments de la même banque de clones codant pour des stades pré-érythrocytaires a permis de fournir des précisions concernant 8 d'entre eux, 3 se sont avérés être des gènes déjà connus comme étant exprimés au stade érythrocytaire et les 5 autres comme des gènes nouveaux non décrits à ce jour, et dont l'expression aux stades pré-érythrocytaires a pu être confirmée.
Par ailleurs, les travaux réalisés en utilisant les cellules de volontaires protégés par sporozo'ites irradiés, celles de chimpanzés protégés par la même méthode et celles de chimpanzés comme d'Aotus trivirgatus, protégés par immunisation par l'antigène LSA-3 ont conduit à caractériser les réponses cellulaires à fort taux de sécrétion d'interféron-y, généralement associés avec une faible production d'anticorps, comme étant associées avec l'état de protection, et vice-versa.
Parmi les nouveaux gènes pré-érythrocytaires étudiés, deux d'entre eux, dénommés DG747 et DG772 possèdent plusieurs propriétés remarquables : ils génèrent des réponses cellulaires à taux élevé d'Interféron-~y , détectées par ELISPOT chez des volontaires protégés par sporozoïtes irradiés, qui sont retrouvés également pour plusieurs régions de l'antigène LSA-3 mais qui sont absentes pour 4 régions de l'antigène LSA-1, deux de SALSA, deux de STARP
et deux de la "CircumSporozoïte protein". Ces deux mêmes clones sont positifs également dans les mêmes tests chez les chimpanzés protégés par des sporozoïtes irradiés. Le profil de réponse différentielle entre les chimpanzés protégés et celles de chimpanzés ayant reçu des sporozoïtes irradiés à trop forte dose, et non protégés, est identique à celui enregistré avec la molécule LSA-3 qui est capable d'induire une protection. Ce profil de réponse correspond, d'après les travaux réalisés chez le rongeur, à la capacité d'induire un recrutement cellulaire spécifique au niveau intra-hépatique. La séquence complète des deux gènes a été identifiée. Les protéines correspondantes ont une antigénicité
élevée chez les individus exposés au parasite en zone d'endémie (réaction chez 80%
des adultes de zone d'endémie). Leur localisation en surface du sporozoïte et leur production au cours de la maturation intra-hépatique du parasite a été
2 initial of this series of clones led to the identification of the LSA-1 antigen, then SALSA, then STARP, then LSA-3. More recent work on 10 fragments of the same bank of clones coding for pre-allowed to provide details concerning 8 of them, 3 himself have been shown to be genes already known to be expressed at the stage erythrocyte and the other 5 as new genes not described to date, and whose expression at the pre-erythrocytic stages has been confirmed.
In addition, the work carried out using the cells of volunteers protected by irradiated sporozoites, those of chimpanzees protected by the same method and those of chimpanzees like Aotus trivirgatus, protected by immunization with LSA-3 antigen led to characterize responses cells with a high rate of secretion of interferon-y, generally associated with a low production of antibodies, as being associated with the state of protection, and vice versa.
Among the new pre-erythrocyte genes studied, two of them, called DG747 and DG772 have several remarkable properties: they generate cellular responses to high Interferon- ~ y levels, detected by ELISPOT in volunteers protected by irradiated sporozoites, who are also found for several regions of the LSA-3 antigen but which are absent for 4 regions of the LSA-1 antigen, two from SALSA, two from STARP
and two from "CircumSporozoïte protein". These same two clones are positive also in the same tests in chimpanzees protected by irradiated sporozoites. The differential response profile between chimpanzees protected and those of chimpanzees having received sporozoites irradiated with too much strong dose, and unprotected, is identical to that recorded with the LSA-3 molecule which is capable of inducing protection. This response profile corresponds, according to work carried out in rodents, with the capacity to induce recruitment cell specific at the intrahepatic level. The complete sequence of the two genes has been identified. Corresponding proteins have antigenicity high in individuals exposed to the parasite in endemic areas (reaction in 80%
adults in endemic areas). Their location on the surface of the sporozoite and their production during the intrahepatic maturation of the parasite was

3 confirmée par diverses méthodes biologiques. Leur immunogénicité chez l'animal sous forme de protéines recombinantes, ou sous forme de plasmides (immunisation génétique) a été démontrée. Ces caractéristiques en font des candidats importants qui demandent à être l'objet d'études complémentaires, en particulier d'immunisation et de challenge chez le primate supérieur pour obtenir des formulations vaccinales nouvelles, seules ou associées à l'antigène LSA-3.
BR~VE DESCRIPTION DES DESSINS
Les Figures 1 A, 1 B, 1 C et 1 D montre la liste des séquences nucléotidiques (SEQ ID NOs: 1 et 2) et en acides aminé (SEQ ID NOs: 3 et 4) de DG747 et DG772.
La Figure 1E montre des séquences répétées dégénérés caractéristiques du clone DG747.
La Figure 2A montre la séquence du gène codant pour DG747.
La Figure 2B montre la séquence du gène codant pour DG772.
La Figure 3.1 est une représentation schématique des protéines correspondantes au DG747 et DG772.
La Figure 3.2 montre des IFATs des stades sporozoïtes et sanguins de P. falciparum et des sporozoïtes de P. yoeüi avec les anticorps anti-DG747 ou anti-DG772.
La Figure 3.3 montre des Western blots de P. falciparum, P. yoelü et de P. berghei utilisant des anticorps anti-Hiss-747 (a) et anti-Hiss-772 (b).
La Figure 3.4 montre sous forme de photographies des résultats de PCR
d'ADN de 12 souches différentes avec des amorces spécifiques de DG747 (a) et DG772 (b).
La Figure 3.5 illustre à l'aide de graphiques la prévalence des réponses humorales contre His6-747 (a) et Hiss-772 (b) dans deux groupes d'âge et dans deux zones d'endémie différente.
La Figure 3.6 illustre à l'aide de graphiques les réponses cellulaires contre Hiss-747 et His6-772 chez des humains et des chimpanzés immunisés avec des sporozoïtes irradiés.
3 confirmed by various biological methods. Their immunogenicity in animals as recombinant proteins, or as plasmids (genetic immunization) has been demonstrated. These characteristics make them important candidates who request to be the subject of further studies, in particular immunization and challenge in the higher primate for get new vaccine formulations, alone or in combination with the LSA-3 antigen.
BR ~ VE DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
Figures 1 A, 1 B, 1 C and 1 D show the sequence list nucleotides (SEQ ID NOs: 1 and 2) and amino acids (SEQ ID NOs: 3 and 4) DG747 and DG772.
Figure 1E shows typical degenerate repeating sequences of the DG747 clone.
Figure 2A shows the sequence of the gene encoding DG747.
Figure 2B shows the sequence of the gene encoding DG772.
Figure 3.1 is a schematic representation of proteins corresponding to DG747 and DG772.
Figure 3.2 shows IFATs of the sporozoite and blood stages of P. falciparum and sporozoites of P. yoeüi with anti-DG747 antibodies or anti-DG772.
Figure 3.3 shows Western blots of P. falciparum, P. yoelü and P. berghei using anti-Hiss-747 (a) and anti-Hiss-772 (b) antibodies.
Figure 3.4 shows photographs of PCR results DNA from 12 different strains with specific primers for DG747 (a) and DG772 (b).
Figure 3.5 illustrates with graphs the prevalence of responses humoral against His6-747 (a) and Hiss-772 (b) in two age groups and in two different endemic areas.
Figure 3.6 graphically illustrates the cellular responses against Hiss-747 and His6-772 in humans and immune chimpanzees with irradiated sporozoites.

4 La Figure 3.7 illustre à l'aide de graphiques la distribution des isotypes d'IgG dans les réponses humorales contre His6-747 et Hiss-772 d'individus exposés différentiellement au paludisme.
La Figure 3.8 illustre à l'aide de graphiques les réponses humorales de souris immunisées avec quatre formulation de protéines recombinantes.
DESCRIPTION DÉTAILLÉE DE L'INVENTION
L'originalité de la présente invention porte sur la mise en évidence de nouvelles molécules polynucléotidiques et polypeptidiques spécifiques du stade pré-érythrocytaire du paludisme et à leurs utilisations à titre de principe actif de vaccin anti-palustre ou dans des méthodes de diagnostique de la maladie.
Plus particulièrement, l'invention vise des polynucléotides ayant une séquence nucléotidique d'au moins 10 nucléotides consécutifs et ayant au moins 60%, préférablement 80% et plus préférablement au moins 95% d'identité avec la SEQ. ID NO: 1 ou NO 2. D'autres molécules selon l'invention contiennent au moins 20 nucléotides consécutifs ou au moins 50. D'autres molécules selon l'invention s'hybride dans des conditions de fortes stringences avec les séquences nucléotidiques ci-dessus, et plus particulièrement avec les SEQ. ID
NOs: 1 et/ou NO 2. Ä titre d'exemple non-limitatif de conditions de fortes stringences l'on retrouve la méthode suivante:
a) pré-hybridation et hybridation à 68°C dans une solution contenant:

SSPE (1X SSPE = 0.18 M NaCI, 10 mM NaH2P04); 5X solution de Denhardt; 0.05% (w/v) dodecyl sulfate de sodium (SDS); et 100 pg/ml d'ADN de sperme de saumon;
b) deux lavages à température ambiante pendant 10 min en présence de 2X SSPE et de 0.1 % SDS;
c) un lavage à 60°C pendant 15 min en présence de 1X SSPE et 0.1%
SDS; et d) un lavage à 60°C pendant 15 min en présence de 0.1X SSPE et 0.1%
SDS.
L'invention vise aussi les polypeptides (et les fragments de ceux-ci) qui dérivent des séquences nucléotidiques ci-dessus mentionnés et préférablement les polypeptides ayant au moins 10 acide aminés consécutifs et au moins 80% et plus préférablement au moins 95% d'homologie avec l'une des séquences choisies dans le groupe constitué par les SEQ ID NOs: 3 à 7, et la SEQ ID NO:
8. D'autres molécules selon l'invention contiennent au moins 20 acides aminés
4 Figure 3.7 illustrates with graphs the distribution of isotypes of IgG in humoral responses against His6-747 and Hiss-772 of individuals differentially exposed to malaria.
Figure 3.8 illustrates with graphs the humoral responses of mice immunized with four recombinant protein formulations.
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
The originality of the present invention relates to the demonstration of new stage-specific polynucleotide and polypeptide molecules malaria pre-erythrocyte and their uses as a principle active of anti-malaria vaccine or in methods of diagnosing the disease.
More particularly, the invention relates to polynucleotides having a nucleotide sequence of at least 10 consecutive nucleotides and having at least 60%, preferably 80% and more preferably at least 95% identity with the SEQ. ID NO: 1 or NO 2. Other molecules according to the invention contain at least at least 20 consecutive nucleotides or at least 50. Other molecules according to the invention hybridizes under conditions of strong stringency with nucleotide sequences above, and more particularly with the SEQs. ID
NOs: 1 and / or NO 2. As a non-limiting example of strong conditions stringencies we find the following method:
a) pre-hybridization and hybridization at 68 ° C. in a solution containing:

SSPE (1X SSPE = 0.18 M NaCl, 10 mM NaH2PO4); 5X solution Denhardt; 0.05% (w / v) sodium dodecyl sulfate (SDS); and 100 pg / ml salmon sperm DNA;
b) two washes at room temperature for 10 min in the presence of 2X SSPE and 0.1% SDS;
c) washing at 60 ° C for 15 min in the presence of 1X SSPE and 0.1%
SDS; and d) washing at 60 ° C for 15 min in the presence of 0.1X SSPE and 0.1%
SDS.
The invention also relates to the polypeptides (and fragments thereof) which derive from the above-mentioned nucleotide sequences and preferably polypeptides having at least 10 consecutive amino acids and at least 80% and more preferably at least 95% homology with one of the sequences chosen from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 to 7, and SEQ ID NO:
8. Other molecules according to the invention contain at least 20 amino acids

5 consécutifs ou au moins 50.
II est bien connu dans le domaine comment déterminer le pourcentage d'identité entre différentes séquences. Ä titre d'exemple, une méthode d'analyse d'alignement de séquences nucléotidiques et peptidiques selon l'invention est avantageusement 1e programme GAP GCGT"" (Genetic Computer Group) du manuel de programmation UNIXT"~ (Wisconsin Sequence Analysis PackageT""), algorithme de Needleman et Wunsch. Les paramètres utilisés sont les paramètres par défaut ou les paramètres suivants: pour une comparaison de séquences de nucléotides: "gap penalty" = 50; "gap extension penalty": 3; et pour une comparaison de séquences d'acides aminés: "gap penalty" = 5; "gap extension penalty": 0.30.
Les peptides selon la présente invention peuvent être préparés par tout procédé approprié. Ils peuvent notamment être obtenus par synthèse chimique mais il est également possible de les obtenir par voie biologique en utilisant notamment différents vecteurs dans les cultures cellulaires appropriées tel que cela sera décrit ci-après.
Les molécules de l'invention peuvent être utilisées telles quelles ou être modifiées (conjugués chimiques, protéine de fusion) si nécessaire. Par exemple, on peut envisager des modifications (chimiques ou nucléotidiques ou peptidiques) permettant aux nucléotides/peptides de franchir certaines barrières biologiques, de montrer une meilleure solubilisation, de faciliter leur incorporation dans des formes galéniques particulières comme par exemple des liposomes ou des microparticules. II convient d'ailleurs de remarquer à ce propos que les peptides selon la présente invention peuvent se présenter sous forme déglycosylée, ou glycosylée, si cela est nécessaire. Une personne versée dans le domaine de l'invention saura obtenir différents polynucléotides/polypeptides et elle saura également déterminer quels sont, parmi les
5 consecutive or at least 50.
It is well known in the field how to determine the percentage of identity between different sequences. For example, a method analysis for alignment of nucleotide and peptide sequences according to the invention is advantageously the GAP GCGT "" program (Genetic Computer Group) from UNIXT programming manual "~ (Wisconsin Sequence Analysis PackageT""), Needleman and Wunsch algorithm. The parameters used are default settings or the following settings: for a comparison of nucleotide sequences: "gap penalty" = 50; "gap extension penalty": 3; and for a comparison of amino acid sequences: "gap penalty" = 5; "gap penalty extension ": 0.30.
The peptides according to the present invention can be prepared by any appropriate process. They can in particular be obtained by chemical synthesis but it is also possible to obtain them biologically using in particular different vectors in appropriate cell cultures such as than this will be described below.
The molecules of the invention can be used as such or be modified (chemical conjugates, fusion protein) if necessary. Through example, modifications (chemical or nucleotide or peptides) allowing nucleotides / peptides to cross certain barriers to show better solubilization, to facilitate their incorporation in particular dosage forms such as for example liposomes or microparticles. It should also be noted in this connection that the peptides according to the present invention can be in the form deglycosylated, or glycosylated, if necessary. A person versed in the field of the invention will be able to obtain different polynucleotides / polypeptides and it will also be able to determine which of the

6 polynucléotides/polypeptides obtenus, ceux qui ont une activité biologique adéquate.
Ainsi, l'invention a aussi pour objet un procédé de préparation d'un peptide de l'invention, par transformation d'un hôte cellulaire à l'aide d'un vecteur d'expression (plasmide, cosmide, virus, etc) comprenant les séquences d'ADN
codant pour les peptides de l'invention, suivi de la mise en culture de l'hôte cellulaire ainsi transformé, et de la récupération du peptide dans le milieu de culture.
L'invention concerne donc également tout vecteur (de clonage et/ou d'expression) et tout hôte cellulaire (procaryote ou eucaryote) transformé par un tel vecteur, et comprenant les éléments de régulation permettant l'expression de la séquence de nucléotides codant pour un peptide selon l'invention.
Plus particulièrement, l'invention vise les cellules E. Coli recombinante contenant un insert correspondant aux polynucléotides définis par !es SEQ ID
NOs: 1 et 2. Plus préférablement les cellules E. Coli sont celles qui ont été
déposée à la C.N.C.M. le 23 Mai 2001 sous les numéros d'accession I-2671 et I-2672. Brièvement, ces cellules ont été obtenues par transformation d'un plasmide contenant soit un insert correspondant aux polynucléotides définis par la SEQ ID NO: 1, soit un insert correspondant aux polynucléotides définis par la SEQ ID N0:2. dans la souche E. Coü DhSa. Chacun des plasmides a été
obtenus à partir d'un phage ~,gt11 recombinant contenant l'insert. Une PCR à
été
effectuée avec des amorces flanquantes à l'insert et cet insert amplifié a été
digéré avec EcoR1 et sous-cloné dans le vecteur pTreHis6 (Invitrogen) dans les sites de EcoR1.
L'utilisation de vecteurs pour l'expression de protéines et de peptides dans les cellules d'un hôte, notamment l'humain, est connue et ne sera pas décrite plus en détail. II peut être avantageux d'utiliser des vecteurs incorporant des séquences capables d'augmenter l'immunogénicité des polynucléotides/polypeptides de la présente invention, telles que les séquences CPG, le gène du GMCSF (Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor) ou des gènes des cytokines. Les constructions spécifiques dépendent évidemment de l'hôte, de l'épitope et du vecteur retenu.
6 polynucleotides / polypeptides obtained, those which have a biological activity adequate.
Thus, the subject of the invention is also a process for the preparation of a peptide of the invention, by transformation of a cellular host using a vector of expression (plasmid, cosmid, virus, etc.) comprising the DNA sequences coding for the peptides of the invention, followed by culturing the host cell thus transformed, and the recovery of the peptide in the medium of culture.
The invention therefore also relates to any vector (of cloning and / or expression) and any cellular host (prokaryotic or eukaryotic) transformed by a such a vector, and comprising the regulatory elements allowing expression of the nucleotide sequence coding for a peptide according to the invention.
More particularly, the invention relates to recombinant E. Coli cells containing an insert corresponding to the polynucleotides defined by! es SEQ ID
NOs: 1 and 2. More preferably the E. Coli cells are those which have been deposited at the CNCM on May 23, 2001 under accession numbers I-2671 and I-2672. Briefly, these cells were obtained by transformation of a plasmid containing either an insert corresponding to the defined polynucleotides through SEQ ID NO: 1, i.e. an insert corresponding to the polynucleotides defined by the SEQ ID N0: 2. in E. Coü DhSa. Each of the plasmids was obtained from a phage ~, recombinant gt11 containing the insert. A PCR to summer performed with flanking primers at the insert and this amplified insert was digested with EcoR1 and subcloned into the vector pTreHis6 (Invitrogen) in EcoR1 sites.
The use of vectors for the expression of proteins and peptides in the cells of a host, especially humans, is known and will not be described more in detail. It may be advantageous to use vectors incorporating of the sequences capable of increasing the immunogenicity of polynucleotides / polypeptides of the present invention, such as sequences CPG, the GMCSF (Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor) gene or cytokine genes. The specific constructions depend obviously the host, the epitope and the vector selected.

7 Les peptides de la présente invention et les polynucléotides les codant peuvent aussi être utilisés pour préparer des anticorps polyclonal ou monoclonal capables de se fixer (préférablement de manière spécifique) sur au moins un peptide/polynucléotide objet de l'invention. La présente invention vise donc également de tels anticorps purifiés qui peuvent être obtenus par des techniques très bien connues comme par exemple la technique décrite par Kolher et Milstein (Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity, Nature (1975), 262:495-497) Dans un mode de réalisation privilégié de l'invention, au moins une portion des peptides immunogéniques/polynucléotides selon l'invention est conjuguée à
un support sur lequel elle est absorbée ou fixée de façon covalente ou non covalente à son extrémité C et/ou N-terminale. Le support peut être constitué
de molécules porteuses (naturelles ou synthétiques), physiologiquement acceptables et non toxiques. Ces molécules porteuses peuvent permettre notamment d'augmenter l'immunogénicité des peptides de l'invention par l'intermédiaire de groupements réactifs complémentaires respectivement portés par la molécule porteuse et le peptide. Ä titre d'exemple de molécules porteuses, on mentionnera des protéines naturelles telles que l'anatoxine tétanique, l'ovalbumine, des sérums albumines, des hémocyamines, le PPD (purified protein derivative) de la tuberculine, etc. Ä titre de supports macromoléculaires synthétiques, on mentionnera par exemple des polylysines ou des poly(D-L-alanine)-poly(L-lysine). Ä titre de supports hydrocarbonés ou lipidiques, on mentionnera les acides gras saturés ou insaturés. Le support peut également prendre la forme de liposomes, de particules et microparticules, de vésicules, de microsphères de billes de latex, polyphosphoglycans (PGLA), ou de polystyrène.
L'invention porte aussi sur des compositions vaccinales/thérapeutiques (médicament) comprenant des peptides/polynucléotides, des conjugués et/ou des anticorps polyclonaux ou monoclonaux tel que décrits précédemment, et un véhicule pharmaceutique acceptable. L'invention se rapporte aussi à des compositions immunogènes capables d'induire une protection par une infection d'épreuve par Plasmodiums, aussi bien in vivo que in vitro et, de façon préférée, un protection par une infection d'épreuve par Plasmodium falciparum.

Préférablement, les compositions selon l'invention permettent la production d'interféron-y par des leucocytes de sujets immunisés par des sporozoïtes irradiés et/ou l'obtention d'une réponse humorale IgG de type IgG1, IgG2, IgG3 etlou IgG4.
Ces compositions peuvent être avantageuses dans le but d'être administrés in vivo pour le traitement ou la prévention du paludisme chez l'humain. Bien entendu, l'utilisation de compositions à base d'anticorps nécessite généralement que ceux-ci soient compatibles avec l'administration à l'être humain. II peut notamment s'agir d'anticorps humanisés par des techniques connues ou directement exprimés in situ à partir de la séquence d'ADN comme par exemple la technique décrite dans Ren EC, Cellular and Molecular approaches to developping human monoclonal antibodies as drugs (1991), Ann.
Acad. Med. Singapore, 20:66-70.
Les compositions selon la présente invention peuvent se présenter sous une forme solide ou liquide quelconque habituelle pour l'administration pharmaceutique, c'est-à-dire par exemple des formes d'administration liquide, en gel, ou tout autre support permettant par exemple la libération contrôlée.
Parmi les compositions utilisables, on peut citer notamment les compositions injectables plus particulièrement destinées aux injections dans la circulation sanguine chez l'humain.
Les compositions de l'invention peuvent comporter également des composants augmentant ou susceptible d'augmenter l'immunogénicité des peptides, notamment d'autres peptides immunogènes, des adjuvants d'immunité
spécifiques ou non tels que l'alun, le QS21, l'adjuvant de Freund, l'adjuvant SBA2, la montanide, des polysaccharides ou des composés équivalents.
La présente invention concerne de plus des compositions destinées à être administrées afin d'exprimer in situ les peptides décrits précédemment. Par exemple, en injectant l' "ADN nu" codant pour les peptides immunogéniques de l'invention, cette injection conduit, dans un certain nombre de cas, à
l'expression du peptide codée et à une réponse immunitaire contre ledit peptide. On pourra également utiliser des systèmes d'ADN nu mais comportant leur propre système d'expression ou des vecteurs d'expression tel que décrit précédemment. Les vecteurs d'expression sont susceptibles, dans certains cas, d'améliorer l'activité
des peptides exprimés. Les systèmes de vaccination mettant en oeuvre des séquences d'ADN sont connus et sont déjà largement décrits dans la littérature.
Des exemples de vaccination mettant en oeuvre des séquences d'ADN sont décrits dans la demande internationale WO 95/111307 et dans la publication de Bot et al. (DNA immunization of newborn mice with a plasmid expressing nucleoprotein of Influenza virus (1996), Viral Immunol., 9:207-210) L'invention porte aussi sur des méthodes de diagnostic in vitro du paludisme chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum.
Selon un mode de réalisation de l'invention, la méthode comprend les étapes suivantes:
a) mise en contact, dans des conditions permettant une réaction immunologique, d'un tissu ou d'un fluide biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum avec un anticorps tel que décrit précédemment afin de permettre la formation de complexes immuns; et b) la détection in vitro des complexes immuns formés.
Selon un mode de réalisation de l'invention, la méthode diagnostique comprend les étapes suivantes:
a) la mise en contact, dans des conditions permettant une réaction immunologique, d'un tissu ou d'un fluide biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum avec des molécules polynucléotidiques/polypeptidiques telles que décrites précédemment afin de permettre la formation de complexes immuns impliquant au moins une desdites molécules et des anticorps éventuellement présents dans ledit tissu ou ledit fluide biologique; et b) la détection in vitro des complexes immuns éventuellement formés.
L'invention a aussi pour objet des kits (trousses) pour le diagnostique du paludisme chez un individu. Selon un mode de réalisation de l'invention, le kit comprend les éléments suivants:

a) au moins un des éléments choisi dans le groupe constitué par: les molécules polynucléotidiques; les molécules polypeptidiques et les conjugués tels que décrits précédemment;
b) des réactifs pour la constitution du milieu propice à une réaction de 5 liaison entre un échantillon à tester et au moins une des molécules définies en a); et c) des réactifs permettant la détection de complexes antigènes-anticorps produits par ladite réaction de liaison, ces réactifs pouvant également porter un marqueur ou être susceptibles d'être reconnus à leur tour par 10 un réactif marqué.
Selon un autre mode de réalisation de l'invention, le kit comprend les éléments suivants:
- des anticorps tels que décrits précédemment;
- des réactifs pour la constitution du milieu propice à une réaction de liaison entre un échantillon à tester et au moins un desdits anticorps; et - des réactifs permettant la détection de complexes antigènes-anticorps produits par ladite réaction de liaison, ces réactifs pouvant également porter un marqueur ou être susceptibles d'être reconnus à leur tour par un réactif marqué
Bien qu'à travers le mémoire descriptif de la présente invention on utilise le terme "peptide" et "polypeptide", il est entendu que l'invention ne se limite pas aux composés formés par l'union d'un nombre limité d'acides aminés. En effet, la souplesse des technologies recombinantes permet de réaliser des protéines comportant une pluralité d'épitopes identiques ou différents et susceptibles d'améliorer l'activité immunogénique du produit final. Ainsi la présente invention couvre également les polymères immunogéniques comprenant entre deux et dix peptides choisis parmi les polypeptides définis précédemment. De même, la présente invention inclus les oligonucléotides ayant une séquence nucléotidique codant pour des oligonucléotides incorporant un ou plusieurs polynucléotides tels que définis précédemment.
Les exemples ci-après permettront de mettre en évidence d'autres caractéristiques et avantages de la présente invention.

a CA 02346968 2001-05-23 EXEMPLES
Les exemples qui suivent servent à illustrer l'étendue d'utilisation de la présente invention et non à limiter sa portée. Des modifications et variations peuvent y être effectués sans que l'on échappe à l'esprit et à la portée de l'invention. Bien que l'on puissent utiliser d'autres méthodes ou produits équivalents à ceux que l'on retrouve ci-dessous pour tester ou réaliser la présente invention, le matériel et les méthodes préférés sont décrits.
1) INTRODUCTION
1.1 Historique du paludisme Le paludisme est une maladie provoquée par l'infection de parasites protozoaires appartenant aux apicomplexes de l'espèce Plasmodium et transmis par les femelles des moustiques du genre Anopheles. Les efforts soutenus et le programme d'éradication entamé dans les années 50, financé par l'OMS ont permis de limiter les zones où la maladie se propageait et de diminuer le nombre de personnes infectées. Depuis, la baisse d'efficacité des moyens de lutte contre le parasite a provoqué une augmentation des cas de paludisme par rapport à il y a 20 ans. Aujourd'hui le paludisme demeure concentré dans la ceinture sub-tropicale où entre 300 et 500 millions de cas cliniques sont recensés annuellement, dont au minimum 3 millions succombent en majorité à cause de l'infection par le P. falciparum. Suite à l'apparition et à l'extension d'une résistance globale aux seuls médicaments efficaces, et parce que les régions affectées sont en extension, l'OMS a classé, depuis 1998, le paludisme parmi les trois maladies infectieuses d'intérêt majeur pour la santé publique mondiale au même rang que la tuberculose et le SIDA.
La description de l'infection paludéenne, dont les signes cliniques sont très caractéristiques, peut être retrouvée dans des écrits des civilisations les plus anciennes, tels que le Nei Ching, grand répertoire médical pour l'empereur chinois Huang Ti (2700 av. J. C.), des tablettes Mésopotamiennes (2000 av. J.
C.), des papyrus Égyptiens (1500 av. J. C.) et des écrits Védiques (1500-800 av.
J. C.). Une partie du « livre des épidémies » d'Hippocrate (460-370 av. J. C.) a été consacrée à la description détaillée de fièvres tertiaires ou quaternaires où
est mentionnée aussi une relation entre des splénomégalies et la proximité des zones marécageuses. D'ailleurs, le terme paludisme désigne une fièvre issue des zones marécageuses (L. palude = marécage), ce qui est aussi reflété par le terme de malaria (I. mall'aria) probablement introduit par Sansovino en 1560 pour décrire le « mauvais air » issu des marécages. Le drainage de ces zones a été
un des seuls moyens de contrôle du paludisme connu avant la découverte de l'agent infectieux. Malgré la connaissance des signes cliniques, le parasite causant la maladie n'a été découvert qu'à la fin du 19e siècle.
En 1880 Charles Louis Alphonse Laveran a observé l'exflagellation de microgamètes et des hématies altérées dans le sang de (Laveran, 1880), et il a associé ces formes avec la maladie. Ses conclusions ont été controversées et ne furent acceptées par d'autres, en particulier par l'importante école italienne, que 5 ans plus tard. Le mode de transmission de la maladie est resté inconnu encore 12 ans. Patrick Manson avait en 1877 démontré que le nématode de la filariose (Elephantiasis) était transmis par un moustique. II était convaincu que le paludisme suivait un parcours semblable. II a conseillé à Ronald Ross d'entamer des recherches à ce sujet et ce dernier a décrit en 1897, pour la première fois, des oocystes chez des moustiques ayant été nourris sur des humains infectés.
Puis, à l'aide de Piasmodium d'oiseaux, il a pu décrire le cycle entier du parasite chez le moustique. Ce cycle a été confirmé, en 1898, pour les espèces plasmodiales de l'homme par les chercheurs italiens menés par Battista Grassi.
On a longtemps cru qu'après inoculation par le moustique, le sporozoïte envahissait directement le globule rouge du mammifère hôte, initiant ainsi le cycle sanguin asexué et sexué. Un cycle exo-érythrocytaire fut décrit dès 1908 chez des plasmodies d'oiseaux par H. de Beaupaire Aragao qui démontra le développement de formes atypiques, dans des cellules endothéliales et des macrophages, capables de libérer des formes envahissant les globules rouges et de se transformer en formes typiques pigmentées du parasite. Toutefois on a cru que le cycle tissulaire était une forme particulière de ces espèces plasmodiales.
Ce n'est qu'en raison des observations faites au cours d'infections paludéennes induites et suivies étroitement chez des individus (comme la malariothérapie des années 1920-50) que la présence d'un stade supplémentaire tissulaire a été
postulée puis activement recherchée. Les formes pré-érythrocytaires des parasites de primates et d'humains n'ont été découvertes qu'en 1948 lorsque H.E. Shortt et P. C. C. Garnham ont décrit des formes hépatiques issues d'inoculations de sporozoïtes de P. cynomolgi (proche de P. vivax) chez le singe rhésus (Shortt and Garnham, 1948). En 1951, les mêmes stades ont été décrits pour P. falciparum (Shortt et al., 1951 ) dans une expérience remarquable où
une biopsie de foie a été prélevé chez un volontaire préalablement inoculé avec des millions de sporozoïtes. Toutefois les recrudescences dues à P. vivax ou à P.
ovale n'étaient pas expliquées, et on a émis l'hypothèse d'un cycle exo-érythrocytaire « secondaire ». Ce n'est que beaucoup plus tard que ce phénomène fut démontré expérimentalement. Ainsi, un stade « dormant » de la forme hépatique, l'hypnozoïte, a été décrit en 1980 (Krotoski et al., 1980) pour P.
cynomolgi, l'équivalent pour le primate de P. vivax. Cette forme est responsable des rechutes après une longue période d'absence de parasite dans le sang/d'exposition aux parasites, qui sont caractéristiques de P. vivax et P.ovale.
Récemment, un stade supplémentaire, le mérophore, une forme provenant des formes sanguines, a été observé dans la rate et les ganglions lymphatiques de souris infectées par les Plasmodium murins (P, yoelü, P. chabaudi et P.
vincke~) (Landau et al., 1999). Cette étape du cycle reste encore à être décrite dans les espèces plasmodiales humaines.
Le cycle du parasite, comme il est conçu aujourd'hui est représenté dans la figure 1 (Les parties entre parenthèse sont des formes décrites pour d'autres espèces de Plasmodium, mais pas pour P. falciparum).
1.2 Les moyens de lutte contre l'extension du paludisme : nécessité du développement d'un vaccin Les deux découvertes de l'agent causal de la maladie et du vecteur de la maladie ont permis dès le début du 20e siècle d'élaborer des moyens de défense rationnels contre le paludisme en attaquant le parasite chez l'hôte vertébré
par des médicaments ou en ciblant le moustique vecteur soit avec des larvicides, soit avec des insecticides, soit par l'utilisation de moustiquaires. Le succès de l'élimination de la maladie dans les zones tempérées après la 2~"'e guerre mondiale, a mené vers une mise en place d'un programme d'éradication du paludisme qui a culminé dans les années 60 où le DDT a été le principal outil contre les moustiques et la chloroquine a été la principale drogue contre le parasite. La taille des territoires endémiques ciblés a ainsi été réduite (quasi éradication dans les zones tempérées) et le nombre de personnes affectées par la maladie a initialement diminué. Cependant les succès dans les zones tropicales furent de courte durée. Le nombre de malades n'a pas cessé de croître d'une part à cause de l'augmentation démographique, d'autre part en raison de l'apparition de résistances aux insecticides et aux drogues disponibles.
L'apparition de ces résistances a nécessité de s'orienter vers d'autres moyens de lutte. L'existence d'une immunité naturelle induite par l'exposition aux parasites et l'observation que le transfert passif d'immunoglobulines de personnes immunes diminue la parasitémie ainsi que l'immunisation efficace et stérilisante par des sporozoïtes atténués par irradiation ont rendu raisonnable l'argument d'un vaccin contre le paludisme, dont le développement constitue alors une priorité de santé publique au niveau mondial.
1.3 A la recherche de l'immunité salvatrice L'immunité naturelle contre le paludisme est caractérisée par un développement très lent et le fait qu'elle n'aboutit pas à une protection stérilisante. Dans les zones hyperendémiques, l'acquisition de l'immunité
naturelle contre les stades érythrocytaires se manifeste chez les enfants d'abord par une tolérance au parasite (immunité anti-toxique) puis avec l'âge par une diminution de la charge parasitaire dans le sang (immunité anti-parasitaire).
Ces observations, faites au cours des études épidémiologiques ont été
confirmées par des infections expérimentales. La malarariothérapie appliquée aux personnes atteintes de neurosyphilis (Boyd and Coggeshall, 1938; Ciuca et al., 1943; James, 1936), a permis de définir des paramètres qui interviennent dans l'acquisition de l'immunité dans des expériences étroitement contrôlées.
II a ainsi été montré que l'immunité acquise était d'une part dépendante de l'espèce et de la souche et d'autre part différait en fonction du stade du cycle parasitaire infectant. Jusqu'à présent, les mécanismes précis de l'immunité anti-paludéenne restent à élucider.
Du fait que les signes cliniques et la transmission sont uniquement dus aux stades sanguins et que ceux-ci sont les plus accessibles aussi bien in vitro 5 qu'in vivo, la plupart des études vaccinales ont concerné ces stades. Une trentaine d'antigènes exprimés dans les parasites érythrocytaires ont été
identifiés, particulièrement par des anticorps monoclonaux et considérés en tant que candidats vaccins. Toutefois les essais d'induction d'immunité protectrice par les rares antigènes testés chez l'homme sont demeurés infructueux jusqu'à
10 présent.
La première immunisation avec les stades pré-érythrocytaires a été tentée sans succès par les frères Sergent en Algérie (Sergent and Sergent, 1910). La capacité de protéger de façon stérilisante (absence de toute parasitémie sanguine) n'a été obtenue que par l'immunisation avec des sporozoïtes atténués 15 par irradiation. Cette approche fut initiée par des études chez l'oiseau avec des sporozoïtes irradiés par des rayons U.V. (Mulligan et al., 1941 ), et a été
reprise ans plus tard avec des plasmodies de rongeur en utilisant des sporozoïtes irradiés par des rayons X et plus tard des rayons y, dont la dose peut être contrôlée plus facilement (Nussenzweig et al., 1967; Richards, 1966) ;
l'immunité
20 peut être maintenue par un rappel de sporozoïtes non-atténués (Orjih et al., 1982). Chez l'homme, une telle protection a aussi été obtenue (Clyde, 1975;
McCarthy and Clyde, 1977), toutefois elle n'est induite qu'après un très grand nombre d'inoculations par des sporozoïtes irradiés si bien qu'une telle procédure vaccinale ne peut être appliquée à grande échelle.
Pendant longtemps, on a cru que la protection était corrélée avec un phénomène observé lorsque l'on incube les sporozoïtes avec du sérum immun, la CS (Circum sporozoïte) précipitation (Vanderberg et al., 1969). La protéine majoritaire reconnue par ce sérum, la protéine CS, a donc été considérée responsable de cette immunité. Depuis elle a été à l'origine de multiples études vaccinales dans beaucoup de modèles expérimentaux. Or jusqu'à présent aucune de ces études n'a pu reproduire une immunité aussi solide que celle induite par des sporozoïtes irradiés.

Une évaluation critique des résultats expérimentaux précédents a mené à
postuler que c'était le stade hépatique et non le sporozoïte qui était à
l'origine de immunité stérilisante (Druilhe and Marchand, 1989). L'indice principal était le fait que la protection ne pouvait être induite que par l'inoculation des sporozoïtes viables, par voie intraveineuse, capables d'envahir un hépatocyte et de s'y développer, et que les formes hépatiques issues de sporozoïtes irradiés persistaient (Ramsey et al., 1982). De plus, une élimination des stades hépatiques provoquait une susceptibilité aux infections par des sporozoïtes chez des animaux préalablement protégés (Londono et al., 1991; Scheller and Azad, 1995).
Le stade hépatique possède des caractéristiques uniques. L'hépatocyte est une cellule nucléée métaboliquement très active et exprime des molécules du complexe majeur d'histocompatibilité. La schizogonie hépatique entraîne la formation d'entre 10.000 et 30.000 mérozoïtes alors que 4 à 32 mérozoïtes sont libérés par un schizonte sanguin. Les mérozoïtes issus de ces deux stades ont des différences morphologiques, mais on ne sait pas s'il existe des différences fonctionnelles ou moléculaires, car seuls les mérozoïtes sanguins ont pu être extensivement étudiés.
Du fait que dans le foie, seuls quelques hépatocytes sont infectés et qu'in vitro, les techniques de culture restent délicates et difficiles, ceci a constitué un obstacle majeur au développement des connaissances sur le stade hépatique et à la recherche d'antigènes exprimés à ce stade.
1.4 Criblage d'antigènes spécifiques de stade La première stratégie pour établir l'expression spécifique de stade est la génération de banques d'ADN complémentaires à partir d'ARN messagers des différents stades. Ceci a été accompli plusieurs fois aux stades sanguins (Chakrabarti et al., 1994; Watanabe et al., 2001) et plus récemment une fois au stade sporozoïte (Fidock et al., 2000). Cependant, cette approche n'est pas possible pour le stade hépatique des plasmodies humains. Un autre moyen est la génération d'anticorps spécifiques dans des modèles animaux. Ceci est facile aux stades érythrocytaires mais pour le stade hépatique, plusieurs tentatives ont échoués, car les injections de stades hépatiques de P. falciparum n'ont induit que très peu d'anticorps dans les souris. Une dernière approche est le criblage immunologique basé sur l'utilisation d'anticorps d'individus naturellement immunisés. Cette approche a permis de mettre en évidence pour la première fois que d'autres antigènes que la CS étaient présents à la surface du sporozoïte (Galey et al., 1990).
1.5 Stratégie élaborée dans le laboratoire d'identification d'antigènes exprimés aux stades pré-érythrocytaires Afin de contourner la difficulté de criblage aux stades pré-érythrocytaires, une stratégie de criblage d'antigènes de P. falciparum potentiellement exprimés dans les stades sporozoïte et hépatique a été développée (Marchand and Druilhe, 1990).
Le principe était de chercher des individus chez lesquels la réponse immune prédominante était contre les stades pré-érythrocytaires. Nous avons ainsi obtenu des sérums d'individus (sérums PM) vivant en zone d'endémie depuis plus de 20 ans et n'ayant jamais eu d'accès cliniques car ils étaient en permanence sous traitement prophylactique à la chloroquine (schizonticide efficace contre les stades sanguins, mais sans effet sur les stades hépatiques).
Les sérums correspondants ne reconnaissaient en effet que très faiblement des stades sanguins en Western Blot et en IFI (titres inférieurs à 1/200), tandis que les titres contre les stades sporozoïtes et hépatiques du parasite étaient compris entre 1/3200 et 1/6400 en IFI et ils marquaient plusieurs polypeptides sur des extraits protéiques de sporozoïtes de P. falciparum; il s'agissait donc de sérums contenant des anticorps spécifiques des antigènes exprimés aux stades pré-érythrocytaires.
Ces sérums ont été utilisés pour cribler une banque génomique de P.
falciparum (construite par Odile Mercereau Puijalon). L'ADN génomique issu du clone parasitaire T9-96 a été méthylé et digéré par la Dnase 1, et les fragments d'une taille allant de 200 à 2500 paires de bases ont été introduits dans le site EcoR1 du phage ~,gt11 (Guérin-Marchand et al., 1987).

Parmi les 7 millions de fragments d'ADN générés, 2000 clones produisant un antigène recombinant reconnu par des sérums hyper immuns (SHI) d'individus immuns vivant en zone d'endémie, ont ensuite été criblés avec les sérums PM. 120 clones ont ainsi été sélectionnés et l'expression de stade des antigènes correspondants a été déterminée par des tests d'IFIs, avec des anticorps humains immunopurifiés sur chaque protéine recombinante, sur les sporozoïtes, les stades hépatiques et les stades sanguins de P. falciparum, P.
yoelü et parfois avec P. berghei et P. vivax.
Le premier antigène à être étudié et contre lequel les réponses humorales étaient les plus élevées dans plusieurs sérums d'individus vivant dans une zone d'endémie était (e Liver Stage Antigen 1, LSA-1 (Guérin-Marchand et al., 1987). II
demeure le seul antigène caractérisé à être exprimé uniquement au stade hépatique.
A la suite du LSA-1, 3 antigènes STARP, SALSA et LSA-3 ont été
sélectionnés à partir de divers critères et caractérisés au niveau moléculaire (Bottius et al., 1996; Daubersies et al., 2000; Fidock et al., 1994a), et immunologiquement par L. Benmohammed , K. Brahimi, J.P. Sauzet et B.
Perlaza. (BenMohamed et al., 1997; Perlaza et al., 1998; Sauzet et al., 2001 ).
Ces antigènes sont exprimés aussi bien à la surface du sporozoïte qu'au stade hépatique.
Le LSA3 est l'unique antigène reconnu différentiellement par des sérums de volontaires ou de chimpanzés protégés par l'immunisation avec des sporozoïtes irradiés. II est le seul à avoir induit une protection stérilisante et de longue durée chez des chimpanzés (Daubersies et al., 2000), et sera bientôt testé dans des essais cliniques de phase I et II.
2) MATERIEL ET METHODES
2.1. Techniques de biologie moléculaire 2.1.1. Souches bactériennes DHSa: supE44 DIacU169(~80 IacZOM15) hsdR17 recA1 gyrA96 thi- 1 relA1.

2.1.2. Souches de parasites:
NF54 issue d'un isolat de malade européen infecté en Afrique (ATCC
MRA151) (Walliker et al., 1987).
3D7, la souche référence utilisée dans le projet génome, est un clone issu de la souche (ATCC MRA151 ) (Walliker et al., 1987).
T9.96, une souche provenant d'un patient tha'ilandais ATCC : MRA153 , (Thaithong et al., 1984) Pour les tests de polymorphisme, des souches distinctes ont été
employées: B1 (Brésil); F32, D7, D28, D50 issues de la Tanzania; D28 du Sénégal, D41 de l'Inde, D51 de Myanmar, L1 de Libéria, H1 de Honduras, Mad20 de Papua New Guinea, et PA de Palo Alto, d'Amérique du Sud Ouest.
(Stricker et al., 2000).
Les sporozoïtes sont issues de la souche NF54 et obtenus par passage dans des Anopheles Gambiae REF
2.1.3. PCR à partir d'extraits de pliages ou d'ADN de pliages Le Expand High Fidelity KitT"" (Mannheim Boehringer, Allemagne) a été
utilisé comme indiqué par le fournisseur avec 2 mM de MgCIZ, 3.5 unités de Taq polymérase, 0.2 mM de desoxyribonucléotides (dNTP), 50 nM des amorces 21 D
en 5' (CCTGGAGCCCGTCAGTATCGGCGG) et 26D en 3' (GGTAGCGACCGGCGCTCAGCTGG) et 2 p1 d'ADN purifié ou d'extrait de pliage. La réaction a comporté une dénaturation initiale de 2 minutes à 94 °C, suivie par 35 cycles consécutifs de 15 secondes de dénaturation à 94 °C, 30 secondes d'hybridation à 50 °C, et 2 minutes d'élongation à 68 °C. Le circuit cyclique a été suivi par une incubation à 68 °C pendant 5 minutes.
2.1.3.1 Sous-clonage dans les vecteurs histidine, pNAK et Topo Selon la qualité du produit d'amplification des pliages, trois procédures ont été employées:
Les produits PCR présentant un smear ou un rendement très petit et étant de plus petite taille quasi impossible à détecter en digérant l'ADN du pliage correspondant, ont été clonés par l'intermédiaire d'un vecteur permettant un clonage direct du produit PCR sans digestion successive d'une enzyme de restriction à l'aide du kit de TopoTA CloningT"" (Invitrogen, Les Pays-Bas).
Le clonage Topo a aussi été effectué pour les fragments dont nous voulions uniquement déterminer la séquence.
5 Les produits PCR de tailles inférieures à 1 Kbp ont été digérés, précipités à l'éthanol, et resuspendus dans la moitié du volume initial d'H20, puis digérés par 10 U de l'enzyme de restriction EcoR1, pendant 1 heure à 37 °C, tirés sur un gel d'agarose à 2 %, purifiés sur gel par la procédure de gel extraction kit de Qiagen, donnant un volume de 50 NI.
10 Les produits PCR peu abondants de grande taille (supérieurs à 1000 bp) ont été isolés à partir de l'ADN de phage purifié par une digestion avec EcoR1, puis par extraction de l'insert du gel d'agarose.
2.1.3.2 Étude du aolvmorphisme du Gène dans des souches parasitaires 15 différentes.
Les amorces suivantes ont été utilisées pour identifier les polymorphismes en taille de régions spécifiques correspondant aux antigènes étudiés.
747-1: AAAAGTGATGATAGAAATGCTTGTG (5' 747-2: TTTTGTTGATCTTACTTATTTCACC (3') 20 772-1: CGGAATCAGGTTTAAATCCAAC (5') 772-2: AGATCGTTTTTCATCAGGGGG (3') La réaction cyclique a été effectuée avec un programme comportant une étape initiale d'une dénaturation à 94°C pendant 15 secondes, suivie par 39 cycles comprenant une dénaturation à 94°C pendant 2 minutes, une hybridation à 52 °C pendant 1 minute et une élongation à 72°C pendant 2 minutes. Une étape de 5 minutes à 72°C a terminé la réaction.
Les PCR ont été effectuées sur un Crocodile III de Appligène. Les produits ont ensuite été analysés sur gel d'agarose.

2. 9.4. Purification d'ADN
2.1.4.1 Pour les analyses de recombinants Les colonies positives en PCR ont été inoculées dans 3 ml de milieu contenant l'antibiotique correspondant au vecteur utilisé (100 pg/ml ampicilline pour Topo et Histidine, 20 pg/ml kanamycine pour le vecteur Vical) et 2 ml d'inoculum ont été utilisés dans la préparation d'ADN plasmidique avec le QiagenT"" Miniprep Kit. L'ADN obtenu a successivement été digéré avec les enzymes de restriction utilisées dans le clonage et soumis à une électrophorèse sur gel d'agarose, afin de détecter l'insertion du fragment.
2.1.4.2 Pour l'isolement de fragments:
100 ml de milieu Luria Broth supplémenté en antibiotique approprié ont .
été inoculés avec 1 colonie de bactérie comportant le recombinant, et incubé à
37 °C sur la nuit dans un bain thermostaté en agitation vigoureuse. Le lendemain, la culture bactérienne a été récoltée et l'ADN plasmique purifié
comme décrit (Qiagen maxiprepT"~, Qiagen, Allemagne).
2.1.4.3 Pour l'immunisation de constructions ADN nu Afin d'éliminer les endotoxines, qui sont présents dans les bactéries et qui peuvent entraîner des réponses non spécifiques lors des immunisations de souris, l'ADN des constructions a été purifié à partir de 2 I de culture de bactéries recombinantes, par Qiagen EndoFree Plasmid GigaT"" kit (Qiagen, Allemagne).
2.1.4.4 Pour la purification d'ADN de phaaes recombinants Les phages ont été réamplifiés sur des boîtes d'agarose de LB, en déposant 5 p1 sur du Topagar pris avec 200 p1 d'inoculum de Y1090, et en laissant à 37 ° C sur la nuit.
Ensuite, une quantité plus grande a été produite en culture liquide.
D'abord, une plage piquée sur la boîte a été incubée avec 200 p1 d'inoculum de Y1090, laissée à 37 °C avec agitation pendant 15 minutes . Ensuite, 5 ml de milieu sans antibiotique supplémenté avec 10 mM de MgS04 a été ajouté, et la culture laissée en agitation pendant 4 heures, jusqu'à l'apparition de lyse.
50 p1 de Chloroforme a été ajouté, et le tout centrifugé à 7000 g pendant 10 minutes.
Après centrifugation, le surnageant libéré des débris cellulaires a été
récupéré.
Ce stock a été utilisé dans la production de 500 ml de phage en culture liquide l'équivalent de 7.5 10$ pfu (unités formant des plaques) à été ajouté à 500 NI
de cellules d'une culture inoculée sur la nuit de Y1090, et 500 p1 de 10 mM
MgCl2/CaCl2. Tout a été incubé à 37 °C 15 minutes, et ajouté à 500 ml de milieu LB sans antibiotique. La lyse des bactéries observée par l'apparition de filaments dans la culture a été suivie jusqu'à la lyse totale (4-5h). Ensuite, la culture a été
centrifugée à 6000 g pendant 15 minutes à 4 °C, le surnageant récupéré, et stocké à 4 °C sur la nuit.
Le lendemain, la purification de l'ADN a été entreprise avec le Lambda Maxi Kit (Qiagen, Allemagne) avec des ajustements en début de protocole à
cause du volume plus grand de surnageant de départ. Le culot final a été
resuspendu dans 500 p1 de tampon TE.
2.1.4.5 Ä partir de parasites 100 p1 de culot de culture de globules rouges à 10 % de parasitémie, a été
resuspendu dans 100 p1 de PBS, pH 7,2 et purifié par le Qiaamp DNA Mini KitT"' (Qiagen, Allemagne). A partir de 100 p1 de culot d'une culture parasitée à 10 %, on a obtenu environ 5pg d'ADN.
2. 7.5. Purification d'ARN total parasitaire Nous avons utilisé deux méthodes en fonction de la quantité d'ARN voulu.
Pour des quantités importantes, la méthode décrite par (Kyes et al., 2000) a été
employée, tandis que pour obtenir des préparations de quantités plus restreintes, nous avons utilisé le RNeasy kitT"" (Qiagen, Allemagne.) 2. 7 . 6. R T PCR.
La RT-PCR a été effectuée avec le kit RT-PCR de Qiagen (Allemagne).
Des amorces spécifiques pour chaque gène et situées, si possible, de telle façon que l'on puisse distinguer entre les produits issus d'amplification d'ADN
génomique et d'ARN (autour des introns) ont été utilisées. Une première réaction de Transcription réverse a été effectuée à 50 ° C pendant 30 minutes, puis une réaction de PCR a été effectuée, dans les même conditions que celle décrites pour une PCR d'ADN de parasite avec les amorces sélectionnées, parfois suivi d'une deuxième réaction (nested PCR) avec des amorces situés dans la séquence du premier produit PCR amplifié. Cependant, la température d'hybridation varie en fonction des amorces utilisées (entre 50 et 60 °
C).
2.7.7. Purification des recombinanfs histidine 2 I de milieu de Luria Broth additionné avec l'ampicilline à 100 ng/ml a été
inoculé avec 50 ml de culture de bactérie contenant le plasmide recombinant.
La croissance des bactéries a été suivie par la mesure de la turbidité
bactérienne à
600 nm et à la densité optique voulue (entre 0,5 et 1 ) une concentration d'IPTG
variant entre 0,5 et 1 mM selon le recombinant a été ajoutée à la culture, et l'induction a duré entre 2 h et 4 h.
Ensuite les cellules ont été récoltées et le culot de bactéries resuspendu dans un tampon de 20 mM de NaP04, pH 7.4, et 8 M d'urée (TU) (25 ml/litre de culture bactérienne). Ensuite, la suspension de cellules a été soumise à des sonications de 10 chocs de 1 minute chacun, et le surnageant contenant les protéines recombinantes a été récupéré par centrifugation à 10.000 g pendant 10 minutes, et filtré à 0.22 pm. Ensuite, une étape de purification par affinité sur une colonne de Nickel a été effectuée. Une colonne de 1 ml (HiTrapT"", Pharmacie, Suède) a été lavée comme indiqué par le fournisseur et 1 ml de NiCl2 a été appliqué, suivi par d'autres lavages. Ensuite, la colonne a été
lavée avec 5 ml de TU, et le surnageant appliqué sur la colonne. Ensuite, un lavage de 10 ml de TU a été effectué, et le recombinant élué par un gradient croissant en imidazole, compétiteur de l'histidine. Selon le recombinant purifié, des concentrations différentes ont été employées, et les résultats obtenus sont résumés dans le tableau ci-dessous. Ensuite, le pool de protéines a été
dialysé
contre un tampon L-histidine pH 6, et chromatographié sur une colonne échangeuse d'anions (HiTrap QT"", Pharmacie, Suède) afin d'éliminer une partie des Lipo Poly Saccharides (LPS) ou endoxines qui induisent des réponses non spécifiques (Morrison and Ryan, 1987).

Tableau de purification des recombinants histidine DO Emplacement RecombinantInduction' aprs de la protine,ImidazoleNaCI

inductionPoids (mM)3 (mM)4 molculaire2 DO
IPTG
Tem s 747 0.5 0.5 4h 2.7 Mem, 18 50 360 772 0.5 0.5 4h 2.2 SN, 35 36 120 1 : La DO mesurée à 600 nm, La concentration en IPTG (mM) ; et le temps d'induction avant récolte.
2 : Après sonication, et centrifugation d'une suspension de bactéries ne contenant pas d'urée (8M) dans le tampon, le surnageant et le culot contenant les débris de membranes bactériennes ont été testés en Western blot afin de détecter où la protéine recombinante se trouvait. En présence d'urée toutes les protéines étaient solubles, et les procédures de purification ont donc été appliquées en présence de 8 M d'urée.
3 : La concentration d'imidazole à laquelle la protéine a été éluée sur la colonne de HiTrap-NiT"' 4 : La concentration de NaCI à laquelle la protéine a été éluée sur la colonne de HiTrap-QT""
2.2. Techniaues immunoloaiaues 2.2. 7. ELISAs (Enzyme Linked ImmunoSorbant Assay) Les conditions optimales ont été déterminées avec 100 p1 de solution d'antigène d'une concentration de 10, 5 ou 1 pg/ml coatés sur les plaques dans 50 mM de Carbonate pH 9.6 ou 1X PBS pH 7.4 en incubant les plaques sur la nuit à 4 °C. La saturation a été effectuée, soit en PBS supplémenté par 3 % de lait écrémé, ou 1 % de BSA (albumine de sérum de veau) à température ambiante ou à 37°C pendant 2 heures. La dilution de sérums de 100 ou de fois a été effectuée soit avec du PBS/lait à 1.5 % , soit avec du PBS/BSA 1 %, et l'incubation a été faite à température ambiante ou à 37°C pendant 1 h.
L'incubation avec les anticorps secondaires couplés à la HRPO
(peroxidase de navet) dilués au 1/2000 dans le tampon de dilution des sérums a été effectuée à température ambiante, et les révélations ont été faites à
l'aide des tampons de TMB (peroxidase substrate et peroxidase solution B) (Laboratories Kirkegaard et Perry, USA) mélangés volume à volume immédiatement avant utilisation dont 100 p1 ont été distribués dans chaque puit. Les réactions colorées en bleu ont été arrêtées en ajoutant le même volume d'une solution d'1 M
d'acide phosphorique. Les réactions sont lues à 450 nm dans un lecteur Multiscan AscentT"" (Labsystems).

Les résultats des souris sont exprimés en Ratio (unité arbitraire par rapport aux taux des réponses dans des témoins naïfs) et dans les expériences où les taux des isotypes ont été étudiés, par rapport au Ratio des IgG totaux déterminé
dans la même expérience.

2.2.2. Immunopurification d'anticorps spécifiques Pour l'immunopurification d'anticorps spécifiques contre les recombinants Hiss, une méthode décrite par (Brahimi et al., 1993) a été employée. 100 pl/puits de solution d'antigène dans du PBS, pH 7.2, à une concentration de 5 pg/ml ont 10 été adsorbés sur plaques Nunc MaxisorpT"" (Nunc, Danemark), et les plaques incubées à +4 °C la nuit. Ensuite, des sérums hyperimmuns ont été
incubés à
une dilution de 1/50 pendant 1 heure à température ambiante, les plaques lavées et l'élution des anticorps effectuée par ajout de glycine pH 2.5 à 0.2 M, incubation pendant 3 minutes et récupération suivie par une neutralisation du pH avec du 15 Tris, 1 M, pH 11. L'immunopurification à partir de recombinants de fusion ~i-galactosidase a été effectuée sur des filtres de nitrocellulose, comme décrit (Beall and Mitchell, 1986).
2.2.3. SDS-PAGE et Western Biot 20 En fonction des échantillons à tester, des gels de pourcentage d'acrylamide (BioRadTM 29.1:1 ratio) variables (5, 7.5, 10 ou 12 %) ont été
utilisés. Après migration en tampon Tris/glycine (pH 8.5) avec le kit minigel (Biorad, USA) les gels ont soit été colorés par bleu de Coomassie soit soumis à
un transfert sur filtres de nitrocellulose (0.45 pm), dans la cellule Trans-Blot 25 (BioRad.) Après transfert, les protéines ont été visualisées par une coloration avec 0,2 % de rouge Ponceau dans une solution d'acide acétique (5%), puis le filtre a été saturé en TBS/lait écrémé à 5 % pendant 30 minutes. Les anticorps humains immunopurifiés sans dilution, et les sérums dilués 1/100 ou 1/200 dans du TBS/lait 5%/ TweenT"" 0,05% ont été incubés pendant 1 à 2 heures à
température ambiante. Ensuite, le filtre a été lavé 3 fois 10 minutes en TBS/Tween 0,05 %, et incubé avec les antisérums couplés à la phosphatase alcaline dilués 1/5000, pendant 30 minutes. Après lavage dans le méme tampon, les réactions colorées ont été produites par l'ajout de NBT (330 pg/ml)et de BCIP
(165 Ng/ml) (Promega, Allemagne) dilués dans du tampon Tris pH 9.
2.2.4. IFI (Immunofluorescence indirecte) Toutes les incubations à 37°C ont été effectuées dans une chambre humide afin d'éviter l'assèchement des tissus ou cellules à étudier. Les tampons ont été filtrés par un filtre à 0,22 pm afin d'éviter des contaminations par d'autres microorganismes et des bruits de fond.
2.2.4.1 Stade sporozoïtes Après dissection des glandes salivaires de moustiques infectés avec le parasite, les sporozoïtes ont été fixés avec 0.01 % de glutaraldehyde en PBS
et lavés soigneusement en PBS.
Afin d'étudier le marquage uniquement en surface des sporozoïtes, (Galey et al., 1990) a développé une technique permettant une fixation « humide »
avec une suspension de sporozoïtes attachés à la polylysine. Les lames de titration (PolyLabo, France) ont été coatées avec 1 p1 d'une solution de 50 mg/ml de polylysine, puis laissées sécher une nuit à 37°C. 1 p1 d'une suspension de sporozoïtes (20 /p1) a été déposée sur chaque puits, et incubé dans une chambre humide à 4°C sur la nuit. La détection d'une présence intra-parasitaire a été faite par fixation des sporozoïtes dans l'acétone.
2.2.4.2 Stade hépatiaue Les coupes fixées au Carnoy et paraffinées ont été préparées par 3 bains de Xylène de 10 mn chacun, 3 bains d'alcool absolu de 5 mn chacun, 2 bains d'eau distillée de 5 mn chacun, et séchées à l'air libre. Ensuite, les coupes ont été réhydratées pendant 10 mn dans du PBS pH 7.4 filtré. Les coupes à
congélation ont été fixées 10 minutes en acétone.

2.2.4.3 Stade sanguin.
Les frottis sanguins ont été fixés 10 minutes à l'acétone, et des cases pour chaque échantillon à tester ont été délimitées en dessinant des bords avec un marqueur Pentel-rouge sur le frottis.
La suite de la technique a été identique pour les trois stades: Après fixation, les anticorps à tester (dilués dans du PBS) ont été déposés sur chaque puit, coupe ou case, et la lame incubée à 37°C en chambre humide pendant 1 heure. Les lames ont été lavées 3 fois 10 minutes dans du PBS 1X, puis incubées avec un anti-IgG anti-humain ou souris (selon les anticorps spécifiques utilisés), couplé à la fluorescéine (Alexis) dilué 1/200 dans du PBS et du bleu d'Evans 1/50000, incubées 30 minutes à 37°C en chambre humide, lavées trois fois en PBS 1X, et couvertes par une lamelle après qu'une goutte de tampon glycériné (PBS 30 % glycérol) ait été déposée. La lecture de la lame a été
effectuée au microscope à U.V (Olympus, BH2)) 2.2.5. Immunisations de souris 2.2.5.1 Par les recombinants histidines Les protocoles a, b et c ont essentiellement été appliqués pour obtenir des sérums spécifiques, tandis que les protocoles b, c et d ont été employés afin d'effectuer des infections d'épreuve par P. yoelü.
a) Adjuvant IFA/Alum Des souris BALB/c femelles de 6 semaines ont reçu 1 première injection intra-péritonéale de 500 NI, avec 1 mélange de 20 pg d'antigène (Hiss-249, Hiss 680, His6-747. Hiss-772), 2 mg/ml d'Alum (AI(OH)3, et de l'Adjuvant incomplet de Freund (AIF), volume dans volume, supplémenté avec 0.9% de NaCI.
Les 2 injections suivantes, chacune à 15 jours d'intervalle, ont été
effectuées avec la même quantité d'antigène dans le même volume, mais sans AIF, et avec de la méthiolate, un conservateur, à 0.05%.
Les souris ont été prélevées (500 NI) avant l'immunisation 2 semaines, 1 mois et 6 semaines après la première immunisation, sur EDTA et les plasma récupérés et stockés à -20°C.

b) CFA
Des souris BALB/c femelles de 6 semaines ont reçu 3 injections sous-cutanées tous les 15 jours à la base de la queue d'un mélange constitué par p1 d'adjuvant complet de Freund et de 10 Ng d'antigène (Hiss-114 ou His6-662) dans 100 p1 de PBS. 1 semaine après la troisième injection, les sérums des souris ont été prélevés et les réponses testés en ELISAs contre le recombinant et en IFI sur les sporozoïtes. 18 jours après la dernière injection, les souris ont subi une infection d'épreuve par des sporozoïtes de P, yoelü.
c) SBAS2 (Adjuvant Smith and Klein Beecham) Des souris C3H femelles de 7 semaines ont reçu trois injections sous-cutanées à la base de la queue de 100 u) d'un mélange constitué par 57 NI
d'adjuvant mélangé avec 43 p1 d'antigène (Hiss-249, His6-747 ou Hiss-772) correspondant à 10 pg, les injections étant espacées de 3 semaines chacune. 10 jours après la dernière immunisation, les souris ont été prélevées et les sérums correspondants récoltés.
d) Microparticules Les solutions d'antigènes (Hiss-249, His6-747 ou Hiss-772) ont été
adsorbées sur des microparticules en polystyrène de 0.5 pm de diamètre (Polysciences Inc, USA) par incubation à 37 °C en agitation pendant 4 heures dans une solution de glycine, pH 8Ø L'adsorption de l'antigène a été
vérifiée par la capacité des micro- billes d'agglutiner avec un sérum spécifique à
l'antigène adsorbé. Des souris C3H femelles de 7 semaines ont reçu trois injections sous-cutanées à la base de la queue de 100 p1 d'un mélange constitué de microbilles coatés avec l'antigène correspondant à 10 pg, les injections étant espacées de semaines chacune. 10 jours après la dernière immunisation, les souris ont été
prélevées et les sérums correspondants récoltés.

2.2.5.2 Par les recombinants ADN
Des souris BALBIc et C3H de 6 semaines ont été injectées 3 fois à 8 semaines d'intervalle par voie intramusculaire avec 100 NI d'antigène (pNAK114, pNAK249, pNAK438, pNAK571, pNAK747, pNAK772) dans du PBS pH 7.4, puis une 4ème fois 12 semaines après la Sème injection. Les prélèvements de sang ont été effectués 1 semaine après la Sème et la 4ème immunisation sur EDTA, et les sérums récoltés après une incubation du prélèvement la nuit à 4°C.
Les rates de 3 souris Igroupe ont été prélevées après la 4ème immunisation, et les stimulations des réponses cellulaires étudiées. Après un Sème boost, 8 semaines après la 4eme injection, les souris ont subi une infection d'épreuve par des sporozoïtes de P. yoelü.
2.2. 6. Infection d'épreuves par sporozoi'tes et par stade sanguin Les sporozoïtes issus de moustiques Anopheles stephensü infectés par le clone 1.1 de P. yoelü yoelü ont été obtenus par une méthode (Ozaki et al., 1984) qui consiste en l'isolement de la cage thoracique du moustique et l'obtention par centrifugation à travers de la laine de verre des sporozoïtes, qui ont été
lavés par des resuspensions successives en PBS après centrifugation.
Les souris ont été infectées par des sporozoïtes de P. yoelü par voie rétro orbitale avec 150 à 200 sporozoïtes (200 p1/ injection), et la parasitémie suivie par des frottis du jour 3 suivant l'infection jusqu'au 12ème jour post-infection, aussi bien sur les animaux immunisés que sur des souris naïves infectées par le même lot de sporozoïtes.
Des stades sanguins prélevés sur d'autres souris infectées par P. yoelü
ont été lavés dans du PBS, et l'équivalent de 5 x 104 parasites ont été
injectés par voie intrapéritonéale.
2.2.7. Étude des réponses cellulaires.
Afin d'étudier aussi bien l'induction de prolifération de cellules-T
spécifiques ainsi que la sécrétion de cytokines capables de stimuler la réponse immune, nous avons étudié la stimulation de splénocytes de souris par les antigènes et la sécrétion d'IFN-y par ces cellules.

2.2.7.1 Proliférations de lymphocytes T
Les rates ont été prélevées sur les souris, les suspensions de splénocytes ont été lavées deux fois dans du RPMI 1640 (Gibco, France) et les cellules 5 resuspendues à une concentration finale de 5 x 106 cellules /rnl dans du RPMI
supplémenté avec 100 U/ml pénicilline, 2 mM L-glutamine, 10 mM Hepes, 50 pM
~3-mercaptoéthanol, 1,5% sérum de veau foetal (SVF) et 0,5 % de sérum de souris normal. 100p1/puits de chaque suspension a été distribuée dans des plaques de 96 puits à fond rond (Costar, USA) et les protéines recombinantes à
10 tester ont été ajoutés à une concentration de 50 mg/ml. Ces tests ont été
effectués en triplicat. Après 48 h d'incubation, (37 °C avec 5 % de C02), 50p1/puit de surnageant de culture a été prélevé et stocké à -70 °C avant la détermination de titres d'IFN-y. 50 NI/puit de surnageant a été prélevé pour dosage de cytokines. Afin de détecter la réplication d'ADN due à une stimulation de division, 15 50 p1 d'une solution de thymidine tritiée (3H) (Amersham Life Science, England) à
1 pCi/puit a été ajoutée durant les 12 dernières heures d'incubation. Les cellules ont été récoltées dans un récolteur de cellules automatique (Skatron Inc, Sterling, VA, USA), et l'incorporation de Thymidine 3H quantifiée par scintillation. Les résultats sont exprimés en Index de Stimulation (1.S.) et la prolifération a été
20 considérée comme positive, lorsque le S.1. est au dessus de 2.
2.2.7.2 Détection de sécrétion d'interféron ~r (IFN-y) Les titres d'IFN-y dans les surnageants de culture ont été déterminés par un méthode d'ELISA à double capture. Des plaques Maxisorp (Nunc, Danemark) 25 à fond plat ont été coatées par un anticorps monoclonal de rat anti- IFN-y de souris primaire (R4-6A2) (Pharmingen, San Diego, CA) dilué dans un tampon de 0.1 M de carbonate, pH 9.6, et laissé sur la nuit à 4 °C. Entre chaque étape de la procédure, les plaques ont été lavées plusieurs fois avec du tampon PBS
supplémenté avec 0,05 % Tween T"" (PBS-T). Ensuite, les plaques ont été
30 saturées avec 3% d'albumine de sérum de veau (BSA, Sigma Chemicals, St Louis, USA) dans du PBS-T. Des surnageants non-dilués ont été ajoutés aux puits et les plaques incubées sur la nuit à 4°C, suivi par une incubation d'1 h à

température ambiante avec un anticorps monoclonal rat anti-souris IFN-y secondaire biotinylé (XMG1.2, Pharmingen, San Diego, CA) dilué dans du PBS-T. Les étapes de marquage avec des anticorps couplés à la peroxidase sont identiques à celles utilisées dans la technique de l'ELISA. (A.2.1 ) 2.2.7.3 Détection de cellules sécrétrices d'IFN-v par Elispot Le nombre de cellules sécrétrices d'IFN-~y a été déterminé dans des splénocytes non stimulées 40 heures après qu'elles soient fraîchement isolées et incubés avec les antigènes. Des plaques de microtitrage (Multiscreen-HAT"", plaque stérile, Millipore) ont été coatées par 50 p1 d'une solution contenant pg/ml d'anticorps anti-IFN-y (18181 D, Becton Dickinson Co). Après une incubation sur la nuit à 4 °C, les puits ont été lavés et saturés par une solution de 5 % de SVF. Des suspensions de cellules de 5 x 105 cellules/puit ont été
incubées avec l'antigène à 50 pg/ml dans un volume total de 200 p1 pendant 40 h, à 37 °C dans une atmosphère humidifiée de 5 % de COZ. Les plaques ont ensuite été lavées 3 fois avec du PBS-T et 3 fois avec du PBS seul et les puits ont alors été coatés par 50N1 de solution d'anticorps anti-souris IFN-y biotinylé
(Becton Dickinson Co, USA) dilué au 1/200 et incubé sur la nuit à 4 °C.
Les plaques ont ensuite été lavées de la même façon que précédemment, avant un ajout de 50 p1 par puit de phosphatase alcaline couplée à la streptavidine (Boehringer-Mannheim, Allemagne) à une dilution de 1/2000 dans du PBS. Après 1 h d'incubation, et lavage des plaques, des spots ont été détectés par développement d'une réaction colorée avec les réactifs BCIP/NBT à 50 Ng/ml à
l'endroit où des cellules individuelles ont sécrété de l'IFN-y. Les résultats sont exprimés comme le nombre de cellules formant des spots par rapport aux 5 x 106 splénocytes.
2.2.8. Sérums et cellules 2.2.8.1 D'individus naturellement exposés au parasite.
10 sérums provenant d'adultes vivant dans une forte zone d'endémie (Côte d'Ivoire) et naturellement protégés ont été employés dans des études d'ELISA et des immunopurifications d'anticorps spécifiques aux antigènes étudiés.
Des sérums provenant d'individus de deux tranches d'ages allant de 0 -9 ans ou au dessus de 12 ans, ont été sélectionnés des Villages Ndiop et Dielmo (Rogier and Trape, 1995; Trape et al., 1994). Ndiop est situé dans une zone d'endémie qui compte environ 20 piqûres infectieuses/an, et Dielmo, dans une zone qui compte 150 piqüres infectieuses/an. Chaque sérum dans une des deux régions correspond en age et en sexe à un sérum de l'autre région.
2.2.8.2 D'animaux ou d'humains immunisés avec des sporozoïtes irradiés.
Deux chimpanzés ont été immunisés soit avec des sporozoïtes irradiés à
18 kRad, soit à 30 kRad par 4 injections de 5 x 106 sporozoïtes chacune par voie intravéneuse. Les 3 premières immunisations ont été effectuées avec 1 mois d'intervalle, tandis que la 4é"'e a été effectuée 4 mois après la 3é"'e. Leur sérum et les cellules du sang périphérique ont été étudiés dans des tests de réponses cellulaires et de réponses humorales après 3 immunisations. Les deux animaux ont été infectés par l'injection intravéneuse de 4 x 104 sporozoïtes (faible dose) chacune de P. falciparum et seulement le chimpanzé immunisé avec les sporozoïtes irradiés à 18 kRad a été protégé (n'a pas développé de parasitémie sanguine) Deux volontaires humains immunisés par le même moyen, ont reçu un rappel avec un nouveau lot de sporozoïtes irradiés, et les cellules du sang périphérique ont été étudiées dans des tests d'Elispot. De plus, le sérum de 4 volontaires humains immunisés avec des sporozoïtes irradiés a également été à
la disposition de la Demanderesse.
2.2.8.3 D'individus exposés différemment au parasite Nous avions à notre disposition des sérums de 8 individus exposés naturellement au parasite mais sous traitement de chloroquine permanent, ce qui élimine les stades sanguins à une forme très précoce et des sérums de 5 individus accidentellement infectés par la transfusion de sang infecté par P.
falciparum.

3) RESULTATS
3.0: Exemple 1 Identification de deux antigènes nouveaux DG47 et DG772 de P. falciparum reconnus par des volontaires immunisés avec des sporozoïtes irradié
Les clones DG 747 et DG772 ont été sélectionnés non seulement à cause des critères initiaux posés (détection sur les sporozoïtes et le stade hépatique, ainsi qu'une reconnaissance par des sérums hyperimmuns), mais parce que plusieurs caractéristiques supplémentaires nous ont intéressés : le DG747 n'avait aucune réactivité croisée avec d'autres protéines de la banque PM, et le DG772 n'avait qu'une seule réactivité croisée, avec LSA1, le seul antigène identifié
comme exprimé uniquement au stade hépatique de P. falciparum. De plus, des anticorps spécifiques des deux protéines marquaient des sporozoïtes de P.
yoeüi.
Un séquençage initial a révélé que ces deux clones contenaient des inserts appartenant à des gènes jusqu'ici inconnus, mais dont la séquence était disponible sur les bases de données du génome de P. falciparum. Nous nous sommes donc consacrés au travail de la caractérisation moléculaire d'expression du stade, de la conservation du gène, ainsi qu'à un travail de caractérisation immunologique (antigénicité, immunogénicité) de ces nouveaux antigènes. Les résultats ont montré que a) ces deux antigènes induisent une réponse immune chez des individus ou des animaux uniquement exposés aux stades pré-érythrocytaires aussi bien artificiellement (par immunisation) que naturellement (sur le terrain), b) qu'ils sont reconnus par des sérums d'individus naturellement exposés au cycle entier du parasite, aussi bien dans des zones de faible que de forte endémie. De plus, nous avons évalué chez la souris leur potentiel immunogène et protecteur par l'immunisation et l'infection d'épreuve par P.
yoelü.
3.1. Analyse des séquences DG747 code pour un polypeptide de 59 acides aminés dont les 40 acides aminés (aa) C-terminaux font partie d'une structure répétitive de 5 x 8 aa riches en arginine et en lysine. Cette séquence est identique aux aa 81-140 du gène PfB0155c (1524 pb, 508 aa) situé sur le chromosome 2 (figure 3.1a). Ce gène qui code pour une protéine putative (Gardner et al., 1999), ne comporte ni introns, ni peptide signal prédits, ni de régions homologues à d'autres protéines qu'elles soient de Plasmodium ou d'autres organismes. La protéine correspondante a une masse moléculaire théorique de 59 kDa, et un point isoélectrique neutre (7.5), mais certaines régions ont des p1 très variables, par exemple la région retrouvée dans DG747 a une charge positive à pH neutre.
DG772 contient un insert de 333 pb, qui sont traduits en 111 aa contenus dans un cadre de lecture ouvert. Ce polypeptide correspond à la région des aa 1146-1256 d'une protéine de 1493 acides aminés codée par un gène situé sur le chromosome 1 (figure 3.1 b). La masse théorique de la protéine est de 173 kDa et le point isoélectrique est de 5.05. La protéine est constituée en majorité
d'acides aminés polaires et ne contient pas de sites hydrophobes, à part dans la partie N-terminale, où il pourrait y avoir un site d'ancrage de GPI. Le gène ne contient pas de répétitions et la séquence nucléotidique traduite a une forte homologie avec les protéines de la famille « EBP » (Adams et al., 1992), c'est-à-dire avec des régions 5'cys et 3'cys qui sont caractéristiques de cette famille.
3.2. Expression de stade et conservation du gène Afin d'évaluer plus précisément l'expression de stade des deux protéines, nous avons utilisé les techniques d'IFI et de Western blot sur des stades différents de P. falciparum et sur les parasites murins P. yoelü et P.
berghei.
La surface des sporozoïtes de P. falciparum a été marquée par les anticorps (humains ou de souris) spécifiques de DG747 et de DG772, mais les stades érythrocytaires ont été marqués d'une façon différente pour les deux groupes d'anticorps. Les anticorps anti-His6-747 (anti-747) marquent peu les stades jeunes, mais fortement les stades schizontes mûrs, avec un marquage localisé autour des structures knob (figure 3.2 image A), tandis que les anticorps anti-Hiss-772 (anti-772) marquent le parasite d'une façon plus homogène tout au long du stade érythrocytaire. Dans les espèces murines P. yoelü et P, berghei, la surface des sporozoïtes a été fortement marquée par les anticorps spécifiques des deux antigènes.

Afin de définir les tailles des protéines détectées, nous avons aussi effectué un Western Blot des extraits protéiques de parasites sanguins de P.
falciparum avec les mêmes anticorps (figure 3.3 a et b).
Les anticorps anti-747 marquent un polypeptide d'environ 70 kDa aussi bien dans 5 les extraits d'anneaux que ceux de schizontes, tandis qu'aucune bande n'a été
détectée dans les érythrocytes non parasités. Le polypeptide détecté par des anticorps anti-772 est plus grand, d'une masse moléculaire de 150 kDa, et est détecté aussi bien dans les anneaux que dans les schizontes. Le marquage d'extraits protéiques de P. yoelü a détecté un polypeptide de 70 kDa pour les 10 anti-747 dans les sporozoïtes et les stades sanguins et un polypeptide de 60 kDa pour les anti-772, seulement détecté dans les sporozoïtes de P. yoelü.
De plus, afin de confirmer la présence des protéines et leur constance d'expression à la surface des sporozoïtes provenant de plusieurs parasites différents, nous avons examiné par IFI des lots de sporozoïtes provenant de 15 différents isolats Thai de P. falciparum. Le sérum anti-772 a marqué tous les sporozoïtes, tandis que seulement 7 sur 10 des isolats testés étaient marqués par les anti-747. De même, des amplifications par PCR avec des amorces spécifiques pour les deux fragments de gène (indiquées dans les figures 3.1 a et 3.1 b) ont été effectuées avec de l'ADN issu de stades sanguins de 12 souches 20 différentes de P. falciparum (figure 3.4). Les produits PCR correspondant au DG772 ont été amplifiés à partir des 12 échantillons et leur taille était similaire, tandis que les amorces spécifiques pour DG747 n'ont pu amplifier un fragment qu'à partir de 9 des 12 ADN. II faut préciser que toutes les lignées de parasites utilisées dans ce travail (T9-96, NF54 et 3D7) contiennent les gènes 25 correspondants. Ces résultats indiquent une variation au niveau de l'expression ou de la présence de DG747 dans des souches parasitaires, car au total, seulement 15 sur 22 parasites ont semblé contenir le gène du DG747 ou ont montré une réactivité positive en IFI. Une des amorces utilisées pour la détection du gène codant pour DG747 est situé dans la partie 3' des répétitions contenues 30 dans le DG747, tandis que l'autre est située plus en aval ce qui pourrait expliquer l'absence d'amplification par PCR, s'il existait une variation au niveau du nombre de ces répétitions. Toutefois, les résultats restent à confirmer, de préférence sur de l'ADN issu de parasites isolés sur le terrain, car tous les parasites testés en PCR ont été cultivés à plus ou moins long terme in vitro, ce qui peut entraîner des délétions au niveau chromosomal. Le phénomène de délétion a d'ailleurs aussi été observé dans des populations de parasites in vivo (Corcoran and Kemp, 1986).
3.3. Reconnaissance par le système immunitaire humain dans des zones endémiques En plus de l'étude de la constance d'expression de l'antigène, nous avons étudié la prévalence des réponses humorales d'individus vivant dans des zones de forte (Dielmo) ou de faible (Ndiop) endémie, et dans deux groupes d'âge différents dans ces deux zones (figures 3.5a et 3.5b) On observe une même prévalence (40 %) contre 747 dans la zone de faible endémie, sauf que le nombre d'individus qui répondent fortement (l'intensité
de réponse par rapport aux témoins) augmente avec l'âge. Dans la zone de forte endémie, le nombre de répondeurs contre 747 augmentent avec l'âge, ainsi que l'intensité de la réponse, et la prévalence chez les adultes, que l'on peut considérer comme ayant acquis une immunité, est de 85 %. De plus, ces réponses semblent corrélées avec l'exposition au sporozoïte, car le taux d'anticorps est plus élevé chez les individus d'un groupe d'âge donné dans une zone de transmission plus forte. Toutefois, dans une même zone, la réponse n'a pas changé d'une façon significative durant des saisons de plus faible transmission (saison sèche) (résultats non montrés), ce qui pourrait correspondre à la réponse contre les stades sanguins et/ou indiquer que la réponse immune anti-747 est de longue durée. La réponse induite par DG747 augmente en prévalence et en intensité en fonction de l'exposition et de la durée d'exposition au parasite (âge).
La réponse anti-772 augmente comme l'anti-747 en fonction de l'âge, mais avec une augmentation beaucoup moins importante, par rapport au taux de transmission observé entre Ndiop et Dielmo et par rapport à l'âge. Le taux de réponses anti-772 mesuré en % de prévalence et en intensité est plus élevé
pour les individus de bas âge que celui des réponses anti-747, mais moins forte (75 %) que l'anti-747 (85 %) à Dielmo dans les individus immuns.
3.4. Comparaison des réponses induites par des stades différents du parasite Nous avions le privilège d'être en possession de cellules issues d'individus immunisés avec des sporozoïtes irradiés, et de sérums provenant de personnes exposées de façon différente à l'infection parasitaire.
3.4.1. Réponses cellulaires Toutes ces études ont été effectuées en étroite collaboration avec Jean-Pierre Sauzet dans le laboratoire. Compte tenu du peu de matériel dont nous disposions, nous avons restreint les analyses afin de détecter ce que nous avions précédemment défini comme un des critères importants (rôle dans la protection) pour l'évaluation d'un potentiel vaccinal au stade pré-érythrocytaire. Nous avons étudié la sécrétion de IFN-y de cellules issues de 2 individus immunisés avec des sporozoïtes irradiés de P. falciparum, car nous avions observé, lors de l'analyse d'autres antigènes, et en particulier de LSA3, un candidat vaccin étudié dans notre laboratoire (Daubersies et al., 2000), que le taux de sécrétion de cette cytokine semble être corrélé à la protection. Chez ces deux volontaires, le nombre de cellules sécrétant l'IFN-y contre DG747 et DG772 est aussi élevé que pour les recombinants issus de LSA3 (729 et PC), (figure 3.6a). De plus, nous avons examiné si les réponses immunes cellulaires mesurées par la prolifération de lymphocytes T et la sécrétion d'IFN-~y différaient entre deux chimpanzés immunisés avec les sporozo'ites irradiés de P. falciparum, mais dont un n'était pas protégé, (figure 3.6b et figure 4.3).
Les cellules du système immunitaire de l'animal immunisé avec les sporozoïtes irradiés viables (18 kRad) et ultérieurement protégé, ont reconnu les antigènes DG747 et DG772, ainsi que l'ont fait les cellules de l'animal immunisé
avec des sporozoïtes irradiés non-viables (30 kRad), et pas protégé lors d'une infection d'épreuve.

Les proliférations lymphocytaires sont à la limite de la valeur seuil, tandis que les taux de sécrétion d'IFN-y sont élevés, aussi bien pour la quantité de cytokine détectée que pour le nombre de cellules sécrétrices (détecté par Elispot). Ceci est valable aussi bien pour les animaux efficacement immunisés et ceux n'étant pas protégés. Cependant, il semble que les taux de réponses sont plus élevés pour les animaux immunisés avec les sporozoïtes irradiés de 30 kRad. Les réponses induites par 747 sont plus fortes que celles qu'induit 772, et les deux plus fortes que celles induites par LSA3.
Les cellules prélevées sur des animaux ayant subi une immunisation supplémentaire par les sporozoïtes irradiés ont été endommagées lors du transport à partir du centre de primatologie en Afrique, et nous n'avons donc pas pu étudier la présence d'un « boost » induit contre ces antigènes.
3.4.2. Étude des réponses humorales Nous n'étions pas en possession des cellules de tous les groupes humains exposés de façon différente à l'infection parasitaire, mais nous avons pu étude en détail la réponse humorale (isotypes d'IgG) de volontaires immunisés avec des sporozoïtes irradiés (ISS, seulement exposés aux stades pré-érythrocytaires), d'individus naturellement immuns vivant en zone de forte endémie (exposés à
tous les stades du parasite), et d'un individu ayant été accidentellement infecté
par le paludisme par transfusion sanguine, (uniquement exposé aux stades sanguins) (figure 3.7a et 3.7b).
Pour les deux antigènes, la différence la plus grande est observée pour l'isotype cytophile IgG1 dont le taux est beaucoup plus élevé dans le sérum d'individus immuns (SHl) que dans le sérum issu du malade infecté par transfusion ou de volontaires ISS. Les réponses de ces deux derniers groupes sont assez semblables et ne font pas apparaître de déséquilibre entre anticorps cytophiles (IgG1 et IgG3) et non cytophiles (IgG2 et IgG4). Nous avons en outre remarqué que le sérum issu d'un individu exposé longuement au parasite, mais sous prophylaxie permanente (le PM), a le même profil en isotypes que les ISS.

3.5. lmmunogénicité chez la souris Des souris de deux souches différentes ont été immunisées avec les recombinants sous formes de protéines, avec des adjuvants différents ou sous forme de constructions d'ADN « nu », sans adjuvant.
Une étude préliminaire avec une construction ADN nu ne comportant pas de séquence signal permettant l'exportation de la protéine synthétisée a été
effectuée. Les souris immunisées n'ont généré aucune réponse humorale, que cela soit pour ces deux antigènes ou pour d'autres étudiés simultanément.
Cependant, nous avons détecté des réponses cellulaires spécifiques anti-747 et anti-772. Aussi bien les proliférations de lymphocytes T que le taux de sécrétion d'IFN-y ont été testés pour deux souches de souris, la C3H et la BALB/c. Les profils de réponses sont présentés dans les tableaux 3.1 a et 3.1 b où l'on peut remarquer que pour le cas des réponses cellulaires de souris immunisées avec pNAK747, il y a aussi bien des stimulations de prolifération que de sécrétion d'IFN-y, tandis que pour pNAK772, les proliférations des cellules T ont été
très peu stimulées par rapport à la stimulation de sécrétion d'IFN-y qui est considérable. Parmi toutes les souris immunisées, le niveau le plus élevé de sécrétions d'IFN-y est observé lorsque le niveau de stimulation de prolifération est le plus bas.
Les vaccinations par les autres formulations (protéine recombinante et ADN nu avec une séquence signal) ont toutes induit une réponse humorale chez les souris (figure 3.8). Tous les sérums issus de ces souris immunisées reconnaissent la protéine native en tests d'IF/ et le marquage correspond avec celui observé pour les anticorps humains immunopurifiés.
Les réponses anti-747 présentent un profil similaire pour toutes les souris immunisées et toutes les formulations utilisées, avec une réponse isotypique à
prépondérance IgG2b. Les réponses anti-772 sont aussi similaires entre souris et formulations de vaccins, mais avec une nette prédominance des IgG1. Le profil isotypique dépend donc de l'immunogène plus que du mode de présentation utilisé. Cependant, les titres à point final sont beaucoup plus élevés lorsque l'on immunise avec des protéines recombinantes (1/200.000) par rapport à l'ADN

(1/2000), et les titres des sérums de souris immunisées avec His6-772 sont plus élevés que ceux des Hiss-747.
Puisque nous avions observé une réactivité croisée avec le stade sporozoïte de P. yoelü, nous avons testé le potentiel protecteur de ces antigènes 5 par l'infection avec des sporozoïtes de cette espèce de souris immunisées avec les protéines recombinantes. La parasitémie a été suivie par l'observation des formes sanguines sur des frottis à partir du jour 3 de l'infection et pendant jours consécutifs. Nous n'avons observé aucune protection quelle que soit la souche de souris utilisée, car la parasitémie a été détectée au même jour que 10 celle des souris non immunisées, et la courbe était semblable à celle des souris témoins (résultats non-montrés).
3.6 Données supplémentaires 3.6.1 DG772 15 Par RT-PCR sur l'ARN total issu de sporozoïtes et de parasites sanguins, les inventeurs ont pu déterminer les sites d'épissage de l'ARN messager correspondant au gène codant. La séquence des amorces a été extraite des données du génome de Plasmodium falciparum.
Les produits d'amplification sont de tailles identiques dans les stades 20 sporozoïtes et les stades sanguins, et diffèrent de la taille du produit obtenu par amplification de l'ADN génomique et par séquençage les sites d'épissages se sont avérés d'être identiques (voir les introns indiqués dans la figure).
Le gène codant pour DG772 appartient à une famille de protéines identifiés par un motif partagé. Toutes les protéines de la famille des EBP
25 (Erythrocyte Binding Proteins) partagent des motifs conservés de résidus cystéine dont l'agencement est similaire pour toutes les protéines. Cependant, le degré d'identité ne dépasse pas 31 % (max. 57 % d'homologie), même dans les régions les plus conservées.
30 3.6.2 Tests d'immunogénicité envisagés dans les humains.
D'après nos résultats obtenus dans les souris, nous pouvons confirmer que les antigènes DG747 et DG772 employés aussi bien sous forme d'ADN que sous forme de protéine recombinante sont immunogènes. De plus, du fait que les protéines recombinantes sont reconnues par des individus immunisés et protégés contre l'infection par des sporozoïtes de Plasmodiurn falciparum indiquerait un rôle de ces antigènes dans l'immunité pré-érythrocytaire. Un test dans des primates, et en particulier des chimpanzés va nous permettre des résultats préliminaires qui nous permettront de choisir la formulation optimale pour des tests cliniques chez l'humain.
Dans les essais de phase I, afin d'étudier l'immunogénicité et la sûreté du produit, nous envisageons trois formulations toutes préparées dans des conditions GMP: 1) l'antigène sous forme de protéine recombinante purifiée à
partir de la bactérie Lactococcuc lactis (utilisation permise dans les humains) adjuvée avec l'adjuvant SBAS2 (GSK) ; 2) la construction d'ADN dans le vecteur VicaIT"" (Avantis Pasteur) ; et 3) des lipopeptides synthétiques injectés sans aucun adjuvant (v. LSA3) . Ces formulations vont être distribuées par injection sous-cutanée (au niveau du deltoïde). Par des tests préliminaires, nous savons que les antigènes Hiss-747 et His6-772 induisent des réponses cellulaires et des réponses humorales chez des individus n'ayant été exposés uniquement aux stades pré-érythrocytaires. Nous allons ensuite étudier les réponses cellulaires et les réponses humorales des individus immunisés par les formulations choisies en les comparant avec celles observées dans des individus immunisés avec des sporozoïtes atténués par irradiation et protégés contre une infection d'épreuve avec des sporozoïtes non-atténués. En fonction de ces réponses, une infection d'épreuve avec des sporozo'ites de Plasmodium falciparum sera envisagée.
3.6.3 Homologie avec d'autres séguences nucléotidiques.
Une hybridation par Southern blot dans les conditions stringentes standard (0.1 X SSC, 80 °C) ne donnerait lieu à aucune autre hybridation qu'avec le gène correspondant.
3.6.4 Recherche d'homologie par des moyens bioinformatiaue Les recherches ont été effectuées avec le logiciel BLAST (tblastx et blastn) sur toutes les bases de données disponibles du génome de Plasmodium falciparum ainsi que les bases de données d'autres organismes. Les paramètres utilisées sont les paramètres de défaut trouvées sur les site http://vvww.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
3.7 Discussion Ce travail qui fait partie de l'étude des antigènes exprimés aux stades pré-érythrocytaires nous a permis une première caractérisation et l'évaluation du potentiel vaccinal de deux nouveaux antigènes de P. falciparum. Ces deux antigènes ont des caractéristiques différentes au niveau moléculaire. D'une part, la protéine dont fait partie le DG747 contient des répétitions, tandis que la molécule contenant le DG772 n'a aucune répétition directe. Le gène Pfb0155c codant pour DG747 est petit (1524 bp) et contient une région répétitive à
laquelle appartient DG747. Nous n'avons pas pu détecter la présence du gène par PCR
dans toutes les souches, ni pu observer une réactivité avec toutes les souches de sporozoïtes étudiées. L'absence observée peut être due à une réelle délétion du gène ou aux procédures expérimentales. En effet, une des amorces utilisées pour la détection de la partie codante pour DG747 chevauche la partie répétitive, ce qui peut entraîner une difficulté à amplifier un gène contenant une répétition plus grande, ou à détecter un gène contenant moins de répétitions. De plus, ceci est aussi le cas pour la détection en immunofluorescence indirecte où un nombre éventuel de variations de répétitions peut changer l'affinité des anticorps spécifiques, si l'epitope cible chevauche cette région. L'expression détectée par IFI semble être présente tout au long du cycle parasitaire asexué dans l'hôte vertébré (nous n'avons pas analysé les stades sexués). Malgré la présence de répétitions dans le DG747, nous n'avons pas détecté de réactivité croisée avec d'autres antigènes de P, falciparum. La séquence du gène entier n'a pas d'homologie avec d'autres protéines plasmodiales jusqu'ici identifiées, et nous n'avons pas encore d'indications sur une fonction biologique éventuelle.
Le DG772 ne contient pas de répétitions et sa présence semble être constante, qu'elle soit détectée par PCR ou par IFI. Au niveau biologique, le gène codant pour DG772 s'avère être intéressant. Nous avons trouvé par homologie de séquence que ce gène de 5300 bp de cadre de lecture ouverte fait partie de la famille des EBP (Erythrocyte Binding Protein) (Adams et al., 1992), mais que la séquence de DG772 n'appartient pas aux régions conservées de cette famille, il ne partage qu'une petite partie de séquences avec l'extrémité N-terminale de la région 3'cys. D'ailleurs, il n'a pas de réactivités croisées ni d'homologie de séquence avec DG249, un autre clone faisant partie d'une des parties consensus du gène codant pour EBA-175. II se peut que DG772 fasse partie d'une région qui confère une particularité à chaque molécule de cette famille. La présence de deux molécules de la famille d'EBP (EBA-175 et 772) sur les sporozoïtes pourrait impliquer qu'il existe plusieurs molécules de cette famille qui interviendraient de façon alternative dans le processus d'invasion comme décrit dans les stades sanguins.
Une connaissance de la prévalence est utile lors de l'évaluation d'un candidat vaccin, et les prévalences obtenues pour DG747 et DG772, de 85% et 75 % ,sont importantes. Cette étude a montré l'antigénicité importante d'un petite partie des deux molécules, et a suggéré qu'il y aurait un intérêt à étudier plus en détail d'autres epitopes de la même molécule. La réponse humorale détectée contre DG747 et DG772 dans des individus exposés en permanence indique qu'il y a une prépondérance en réponse IgG1 (type cytophile) développée lors d'une exposition soutenue qui n'est pas retrouvée dans le cas de paludisme transfusionnel. Par contre, les profils de réponses humorales obtenus pour deux groupes exposés aux stades pré-érythrocytaires à plus ou moins longue durée (PM et ISS) se ressemblent, et le niveau d'IgG1 est bas, ce qui indique que cet isotype traduit l'exposition répétée de l'antigène aux stades sanguins.
L'étude des réponses cellulaires dans ces mêmes zones devra être effectuée afin d'avoir une notion plus précise des réponses immunitaires induites par ces antigènes.
Aux stades pré-érythrocytaires, nous avons observé une induction de réponse cellulaire par ces antigènes aussi bien dans des chimpanzés que chez des humains. Nous avons observé la sécrétion IFN-y, décrit comme un facteur intervenant dans la protection contre les stades pré-érythrocytaires. La différence de réponse observée chez les chimpanzés en fonction de la dose d'irradiation pourrait signifier que les antigènes sont reconnus aussi bien sur les sporozoïtes que dans les stades hépatiques. En effet, les sporozoïtes irradiés à 30 kRad sont incapables de pénétrer dans l'hépatocyte, et les réponses détectées sont donc seulement dues à cette exposition, tandis que les sporozoïtes irradiés à 18 kRad se développent dans l'hépatocyte, et les réponses détectées sont donc dues à
ce stade. II serait intéressant d'étudier de plus près les réponses induites dans ces deux animaux (restriction MHC1), et l'induction de « boost » de réponse lors de plusieurs immunisations successives. Ce travail a aussi montré que dans ces deux fragments d'antigènes, il existe aussi bien des épitopes T que des épitopes B.
L'immunogénicité induite par les deux antigènes dans la souris est différente avec une prédominance d'IgG1 pour le DG772, qui n'est pas observée pour DG747. Par contre, nous n'avons observé aucune différence dans les réponses en fonction des formulations, ce qui est intéressant car la présentation des molécules n'est pas identique pour chaque formulation. Les réponses cellulaires uniquement obtenues pour la formulation n'ayant pas induit de réponses humorales détectables montre qu'il y a eu aussi bien des proliférations de lymphocytes, que des sécrétions d'IFN-y en fonction des souris. Les sécrétions d'IFN-y ont tendance à être plus élevées lorsque les taux de prolifération sont bas, mais ceci reste à être étudié plus précisément avec un nombre plus élevé de souris. L'absence de protection des souris immunisées ne permet pas d'exclure une protection chez l'homme ou par infection avec P.
falciparum car les épitopes cibles ne sont pas nécessairement les mëmes. Afin d'étudier un rôle dans l'interaction P. falciparumlhôte vertébré, nous avons à
disposition un modèle in vitro avec des hépatocytes humains et des sporozoïtes de P. falciparum qui permettront l'étude de l'inhibition de l'invasion, et les études in vivo seront possibles dans un modèle de singes AotusIP. falciparum qui se trouve en Colombie. Actuellement, nous sommes en train d'effectuer le travail nécessaire pour compléter les analyses entamées sur ces antigènes pour ce qui est de l'immunogénicité.

Tableau D1:Récapitulatif des antigènes pré-érythrocytaires du paludisme connus à présent*.
Antigne Rfrences ' Stades Localisation'Structures d'expression Intron ' Reps S
H
SSA
SSS

CS (Nardin et al., 1982) + j - - CHR3 + +

LSA1 (Gurin-Marchand et al.,+ j,m - - CHR4 - +
1987) TRAP (Robson et al., 1988) + j,m m - CHR13 - +

PfHsp70 (Renia et al., 1990) + j,m j,m - CHR13 +

STARP (Fidock et al.. 1994) + j,m - - CHR12 + +

EXP-1 (Koenen et al., 1984), - m j,m Nt CHR12 - +
lSanchez et al., 1994) Pfs16 (Bruce et al., 1990) + nt - + ? - -SALSA (Bottius et al., 1996) + j,m - - CHR2 + -LSA3 fDaubersies et al., + j,m - - CHR2 + +
2000) PfEMP3 (Pasloske et al., 1993),+ j,m j,m - CHR2 + +
(Grner et al., 2001) GLURP (Borre et al., 1991 + m j,m Nt CHR10 - +
) EBA-175 (Camus and Hadley, 1985)+ j,m j,m - CHR4,13 +

DG?47., ~:~ : - ~,. ' j,m j,m.:- CHR~, ~ +
' + _ ' _ ' ~.
, aG772 + j, '..j, CHR1 +
:: rn m , * Les antigènes en gris sont les antigènes caractérisés dans cette demande.
5 NT : Non testé
1 : La présence aux stades pré-érythrocytaires d'autres antigènes (MSP-1) a aussi été suggérée, mais les résultats préliminaires restent à confirmer. Les références soulignées indiquent l'année de découverte de l'expression pré-érythrocytaire.
2. S : sporozoïte ; H : Stade hépatique jeune et mûr ; SSA : Stade Sanguin asexué jeune et mûr ;
10 SSS : Stade sanguin sexué. 3. ST : sub-télomérique. Les caractères en gras indiquent la forme du stade où le marquage est le plus intense.
3. La plupart des localisations chromosomales a été faites par recherche d'homologie sur des bases de données Tableau 3.1a: Stimulation de proliférations cellulaires et de sécrétion d'IFN-y par Hiss-747 après 3 immunisations avec pNAK747.
Prolifration Interfron Souche de sourislymphocytaire gamma Index de stimulation IU/ml Hiss-747 GEX- Hiss-747 NN GEX- NN

C3H 8.63.0 3.21.1 7.00.4 4.010.9 C3H 23.65.9 8.82.9 7.00.7 4.00.2 C3H 3.00.9 1.10.1 16.011.9 1.02.1 Positifs 2/3 - 1/3 BALB/c 2.70.2 1.30.2 40.05.0 24.03.0 BALB/c 23.64.3 3.00.3 15.04.4 8.01.8 BALB/c 33.77.2 5.90.3 16.011.5 10.04.2 Positifs 213 - 3l3 -pGEX-NN : antigène de P. falciparum non cross-réactif avec Hiss-747.
Les résultats positifs sont en gras.
Tableau 3.1 b: Stimulation de proliférations cellulaires et de sécrétion d'IFNJy par Hiss-772 après 3 immunisations avec pNAK772.
Prolifration Interfron souche de sourislymphocytaire gamma Index de stimulation IUlml Hiss-772 GEX- Hiss-772 NN GEX- NN

C3H 0.90.1 0.70.1 23.912.0 10.712.9 C3H 0.90.2 0.60.1 1.72.0 3.32.1 C3H 0.80.2 0.90.2 6.60.1 5.82.6 Positifs 013 - 113 --BALB/c 3.50.3 - - - 2.70.4 24.02.2 1~.83.0 _ -BALB/c 1.90.3 1.20.4 31.37.1 5.60.9 BALBIc 3.20.9 1.50.2 25.012.1 6.91.5 Positifs 1I3 ~ - ~ 313 -pGEX-NN : antigène de P. falciparum non cross-réactif avec Hiss-772.
Les résultats positifs sont en gras Tableau 4.1: Réponses cellulaires de souris après 5 immunisations avec pNAK438*.
souris Prolifration (1.S.)Scrtion d'IFN-y Anticorps C3H 2.30.3 2.22.0 -C3H 1.81.1 15.64.0 -C3H 3.21.3 0.50.2 -Positifs 2/3 113 BALB/c 4.3 1.6 26.2 6.3 -BALB/c 5.30.6 29.38.5 -BALB/c 15.32.2 12.78.7 -Positifs 3I3 313 * Les taux de réponses sont représentés par rapport aux réponses obtenues par une valeur seuil.
La valeur seuil est calculée en faisant la moyenne des réponses d'animaux non-immunisés et celle des animaux immunisés contre un antigène non-relevant, comme l'OspC, une protéine de la Borrelia burgdorferi.
Tableau 4.2: Détection d'expression par IFI avec des anticorps humains immunopurifiés ou des sérums de souris spécifiques anti-Hiss-680 a-Hiss-680 Parasites* souris ou humains Sporozotes P. falciparum ++

Sporozotes P. yoel clone ++
1.1 Stade hpatique P. falciparum ++

Stade sanguin T23 ++/+++ (75%) anneaux/schizontes ++/+++ (75%) Stade sanguin NF54 anneaux/schizontes * Les sporozo~ites de Plasmodium falciparum viennent de la souche NF54.
T23: souche de provenance thaï; NF54 souche d'origine africaine.

Tableau 5.1: Réactivités croisées détectées en Western blots entre les Réaction forte Réaction moyenne E : anticorps immunopurifiés (élués) sur les protéines recombinantes correspondantes.
P : protéine recombinante.
Tableau 5.2: Réactivités croisées au niveau nucléotidique entre les clones de la famille Pfl1-1*
clones PM PCR571 1 sonde contrle 43 +++ ++

88 ++ 0 322 +++++ +++++

525 ++++ +++++

563 ++++ ++++

571 +++++ +++++

676f +++++ ++++

729E +++ +++++

263 ++++ NT

381 ++ NT
._ -453 +++ I NT
l * L'intensité du signal est symbolisé par des croix.
NT : non testé.
membres de la famille Pf11-1 Tableau 5.3 : Homologies de séquences des clones étudiés par BLAST
Taille Rptitions Homologie Degr d'homologie nuclotidique'acides amins avec 571 lone (bp) Nuclotides Nuclotides Protines Protines DG43 900 PIVeELLEE Pf11-1 Part 1 :94 %, 80%, 80%
100% (=88) DG88 900 PIVeELLEE Pf11-1 Part 1 :94 %, Idem DG43 100%(=43) DG263-7253 Non P, falciparum Chr 12 -95%, 60%

DG263-8176 Non P. f. CHR12 95%, 45% -humain chr22 58%

DG322-1500, - - -DG322-22000 PeeVLEEvI Pf11-1 86 %, 65% 79% -DG381 400 PEkIvEEVI plastid tRNA 100%, CHR2-71%

DG453 300 PIVEEvVEE Pf11-1 Part 2 88%, 83% 93%, 72%

DG525 450 PeIeEVEvI GLURP R2 98%, 100% -DG563 438 PIVEEvvEE Pf11-1 Part 4 : 86%, 75%, 56%, Part 1 68%

DG571 550 PEEiIEEiv Pf11-1 Part 5 87 %, 100 %, 100%
55%

DG676f 2000 PvVEEvLEE Pf11.1 Part 488 %, Part74%, 44%
5 75%

DG729E 1.7 - ma13P5100% -1 : Taille estimée par rapport aux produits PCR obtenus, ou la taille précise lorsque le clone entier a été séquencé.
CHR : Chromosome; part : partie Tableau 5.4: Réactivité en IFI testés avec des anticorps spécifiques aux Hiss-571 et Vi571 Parasites a-Hiss-571, aVi571 souris ou humains Sporozotes P. falciparum NF54 ++

Sporozotes P. yoel clone 1.1 ++

Stade hpatique P. falciparum ++

Stade sanguin T23 anneaux/schizontes++/+++ (75%) Stade sanguin NF54 anneaux/schizontes++/+++ (75%) Tableau 5.5: Réponses cellulaires des souris immunisées avec pNAK571 Prolifration Interfron souche de sourislymphocytaire gamma Index de stimulation IU/ml 571 pGEX NNpGEX 571 pGEX
NNpGEX

C3H morte 0.9 0.1 0.7 0.05 31.0 2.5 21.2110.6 C3H 0.90.2 0.70.1 30.22.6 10.502.03 C3H 0.80.2 0.90.2 16.80.1 6.652.8 Positifs 013 - 213 -BALB/c 3.50.3 2.70.13 23.1 0.9 10.362.2 BALB/c 1.90.3 1.20.1 15.92.1 8.633.9 BALB/c (morte) 3.20.9 1.50.1 5.31.3 1.060.5 Positifs 213 - 313 -NNpGEX : recombinant de fusion GST de LSA3 non relevant.
Bien que la présente invention ait été décrite par rapport aux réalisation concrètes et privilégiée, il apparaîtra toutefois évident aux personnes versées dans l'art ou la science en cause qu'il est possible d'introduire un certains nombres de variations et modifications sans déroger à la portée de l'invention décrite dans ce document.
7 The peptides of the present invention and the polynucleotides encoding them can also be used to prepare polyclonal antibodies or monoclonal able to attach (preferably specifically) to at least one peptide / polynucleotide object of the invention. The present invention therefore aims also such purified antibodies which can be obtained by techniques very well known, for example the technique described by Kolher and Milstein (Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity, Nature (1975), 262: 495-497) In a preferred embodiment of the invention, at least one portion immunogenic peptides / polynucleotides according to the invention is conjugated to a support on which it is absorbed or fixed covalently or not covalent at its C and / or N-terminal end. The support can be constituted of carrier molecules (natural or synthetic), physiologically acceptable and non-toxic. These carrier molecules can allow in particular to increase the immunogenicity of the peptides of the invention by through complementary reactive groups respectively carried by the carrier molecule and the peptide. As an example of molecules carriers, natural proteins such as tetanus toxoid will be mentioned, ovalbumin, serum albumin, hemocyamines, PPD (purified protein derivative) of tuberculin, etc. As supports macromolecular synthetic, for example polylysines or poly (DL-alanine) -poly (L-lysine). As hydrocarbon or lipid supports, we will mention saturated or unsaturated fatty acids. Support can also take the form of liposomes, particles and microparticles, vesicles, of microspheres of latex beads, polyphosphoglycans (PGLA), or polystyrene.
The invention also relates to vaccine / therapeutic compositions.
(drug) comprising peptides / polynucleotides, conjugates and / or polyclonal or monoclonal antibodies as described above, and a acceptable pharmaceutical vehicle. The invention also relates to immunogenic compositions capable of inducing protection by infection test by Plasmodiums, both in vivo and in vitro and, so preferred, protection by a challenge infection with Plasmodium falciparum.

Preferably, the compositions according to the invention allow the production of interferon-y by leukocytes from subjects immunized with sporozoites irradiated and / or obtaining an IgG humoral response such as IgG1, IgG2, IgG3 andlou IgG4.
These compositions can be advantageous in order to be administered in vivo for the treatment or prevention of malaria in human. Of course, the use of compositions based on antibodies need generally that these are compatible with the administration to be human. It can in particular be antibodies humanized by techniques known or directly expressed in situ from the DNA sequence as for example the technique described in Ren EC, Cellular and Molecular approaches to developping human monoclonal antibodies as drugs (1991), Ann.
Acad. Med. Singapore, 20: 66-70.
The compositions according to the present invention can be presented under any solid or liquid form customary for administration pharmaceutical, i.e. for example forms of liquid administration, in gel, or any other support allowing, for example, controlled release.
Among the compositions which can be used, mention may in particular be made of the compositions injectable more particularly intended for injections into the bloodstream in human.
The compositions of the invention may also include components increasing or likely to increase the immunogenicity of peptides, including other immunogenic peptides, adjuvants of immunity specific or not such as alum, QS21, Freund's adjuvant, adjuvant SBA2, montanide, polysaccharides or equivalent compounds.
The present invention further relates to compositions intended to be administered in order to express in situ the peptides described above. Through example, by injecting "naked DNA" encoding the immunogenic peptides of the invention, this injection leads, in a certain number of cases, to expression of the encoded peptide and to an immune response against said peptide. We will be able to also use naked DNA systems but with their own system of expression or expression vectors as described above. The expression vectors are likely, in some cases, to improve the activity expressed peptides. Vaccination systems using DNA sequences are known and are already widely described in the literature.
Examples of vaccination using DNA sequences are described in international application WO 95/111307 and in the publication of Bot et al. (DNA immunization of newborn mice with a plasmid expressing nucleoprotein of Influenza virus (1996), Viral Immunol., 9: 207-210) The invention also relates to methods of in vitro diagnosis of malaria in an individual likely to be infected with Plasmodium falciparum.
According to one embodiment of the invention, the method comprises the following steps:
a) contacting, under conditions allowing a reaction immunological, tissue or biological fluid taken from a individual likely to be infected with Plasmodium falciparum with a antibody as previously described to allow formation immune complexes; and b) in vitro detection of the immune complexes formed.
According to one embodiment of the invention, the diagnostic method includes the following steps:
a) contacting, under conditions allowing a reaction immunological, tissue or biological fluid taken from a individual likely to be infected with Plasmodium falciparum with polynucleotide / polypeptide molecules as described previously to allow the formation of immune complexes involving at least one of said molecules and antibodies possibly present in said tissue or said biological fluid; and b) in vitro detection of any immune complexes that may have formed.
The invention also relates to kits (kits) for the diagnosis of malaria in an individual. According to one embodiment of the invention, the kit includes the following:

a) at least one of the elements chosen from the group consisting of:
polynucleotide molecules; the polypeptide molecules and the conjugates as previously described;
b) reagents for the constitution of the medium suitable for a reaction of 5 bond between a test sample and at least one of the molecules defined in a); and c) reagents for the detection of antigen-antibody complexes produced by said binding reaction, these reagents also being able to wear a marker or be likely to be recognized in turn by 10 a labeled reagent.
According to another embodiment of the invention, the kit comprises the following items:
- antibodies as described above;
- reagents for the constitution of the medium favorable to a reaction of binding between a test sample and at least one of said antibodies; and - reagents for the detection of antigen-antibody complexes produced by said binding reaction, these reagents also being able to wear a marker or be likely to be recognized in turn by a labeled reagent Although through the specification of the present invention, the term "peptide" and "polypeptide", it is understood that the invention is not limited not to compounds formed by the union of a limited number of amino acids. Indeed, the flexibility of recombinant technologies enables proteins to be produced comprising a plurality of identical or different epitopes and susceptible to improve the immunogenic activity of the final product. So this invention also covers immunogenic polymers comprising between two and ten peptides chosen from the polypeptides defined above. Likewise, the present invention includes oligonucleotides having a sequence nucleotide coding for oligonucleotides incorporating one or more polynucleotides such as defined above.
The examples below will highlight other features and advantages of the present invention.

a CA 02346968 2001-05-23 EXAMPLES
The following examples serve to illustrate the extent of use of the present invention and not to limit its scope. Modifications and variations can be carried out without escaping the spirit and scope of the invention. Although other methods or products can be used equivalent to those found below to test or carry out the The present invention describes the preferred equipment and methods.
1) INTRODUCTION
1.1 History of malaria Malaria is a disease caused by infection of parasites protozoa belonging to the apicomplexes of the Plasmodium species and transmitted by females of Anopheles mosquitoes. The sustained efforts and the eradication program started in the 1950s, funded by WHO
allowed to limit the areas where the disease spread and to decrease the number of infected people. Since then, the decline in effectiveness of the means of control against the parasite has caused an increase in malaria cases compared to it there at 20 years. Today malaria remains concentrated in the sub-belt tropical where between 300 and 500 million clinical cases are recorded annually, of which at least 3 million die mainly due to infection with P. falciparum. Following the appearance and extension of a overall resistance to only effective drugs, and because the regions affected are in extension, WHO has classified, since 1998, malaria among the three infectious diseases of major interest to global public health at same rank as tuberculosis and AIDS.
Description of malaria infection, the clinical signs of which are very characteristics, can be found in writings of civilizations the more ancient, such as the Nei Ching, a large medical directory for the emperor Chinese Huang Ti (2700 BC), Mesopotamian tablets (2000 BC) C.), Egyptian papyri (1500 BC) and Vedic writings (1500-800 BC.
BC). Part of Hippocrates'"book of epidemics" (460-370 BC) at was devoted to the detailed description of tertiary or quaternary fevers or a relationship between splenomegalies and the proximity of swampy areas. Besides, the term malaria designates a fever of the swampy areas (L. palude = swamp), which is also reflected in the term malaria (I. mall'aria) probably introduced by Sansovino in 1560 for describe the "bad air" from the swamps. The drainage of these areas has been one of the only means of malaria control known before the discovery of the infectious agent. Despite knowledge of clinical signs, the parasite causing the disease was not discovered until the end of the 19th century.
In 1880 Charles Louis Alphonse Laveran observed the exaggeration of altered microgamets and red blood cells from (Laveran, 1880), and it has associated these forms with the disease. His findings were controversial and born were accepted by others, in particular by the important school Italian, that 5 years later. The mode of transmission of the disease remains unknown 12 years. Patrick Manson in 1877 demonstrated that the filariasis nematode (Elephantiasis) was transmitted by a mosquito. He was convinced that the malaria followed a similar course. He advised Ronald Ross to begin research on this and the latter described in 1897, for the first time, oocysts in mosquitoes that have been fed on infected humans.
Then, using Bird Piasmodium, he was able to describe the entire cycle of parasite in the mosquito. This cycle was confirmed in 1898 for the species plasmodiales of the man by the Italian researchers carried out by Battista Grassi.
It has long been believed that after inoculation by the mosquito, the sporozoite directly invaded the red blood cell of the host mammal, thereby initiating the asexual and gendered blood cycle. An exo-erythrocytic cycle was described as early as 1908 in parasites of birds by H. de Beaupaire Aragao who demonstrated the development of atypical forms, in endothelial cells and macrophages, capable of releasing forms invading red blood cells and to transform into typical pigmented forms of the parasite. However we have vintage that the tissue cycle was a special form of these species Plasmodium.
It is only because of observations made during infections malarial induced and closely monitored in individuals (such as malariotherapy of the 1920s-50s) that the presence of an additional tissue stage was postulated then actively sought. Pre-erythrocytic forms of primates and humans parasites were only discovered in 1948 when HE Shortt and PCC Garnham described hepatic forms resulting sporozoite inoculations of P. cynomolgi (close to P. vivax) in monkey rhesus (Shortt and Garnham, 1948). In 1951 the same stages were described for P. falciparum (Shortt et al., 1951) in a remarkable experiment where a liver biopsy was taken from a volunteer previously inoculated with of the million sporozoites. However, the upsurges due to P. vivax or P.
oval were not explained, and it was hypothesized that an exo-"secondary" erythrocyte. It was not until much later that phenomenon was demonstrated experimentally. So a "dormant" stage of the hepatic form, the hypnozoite, was described in 1980 (Krotoski et al., 1980) for P.
cynomolgi, the primate equivalent of P. vivax. This form is responsible relapses after a long period of absence of parasite in the blood / parasite exposure, which are characteristic of P. vivax and Ovale.
Recently, an additional stage, the merophore, a form originating from blood forms, has been observed in the spleen and lymph nodes of mouse infected with murine Plasmodium (P, yoelü, P. chabaudi and P.
Vincke ~) (Landau et al., 1999). This stage of the cycle still remains to be described in the human plasmodial species.
The parasite cycle, as it is designed today is depicted in Figure 1 (The parts in brackets are shapes described for other Plasmodium species, but not for P. falciparum).
1.2 Means of combating the spread of malaria: the need for vaccine development The two discoveries of the causative agent of the disease and the vector of the illnesses made it possible from the beginning of the 20th century to develop defenses rational against malaria by attacking the parasite in the vertebrate host through drugs or targeting the vector mosquito either with larvicides, is with insecticides, either through the use of mosquito nets. The success of elimination of the disease in temperate zones after WWII
led to the establishment of an eradication program for malaria which peaked in the 1960s when DDT was the main tool mosquito and chloroquine was the main drug against parasite. The size of the target endemic areas has thus been reduced (quasi eradication in temperate zones) and the number of people affected by the disease initially decreased. However the successes in the zones were short lived. The number of patients has not stopped grow on the one hand because of population growth, on the other hand due to the emergence of resistance to insecticides and available drugs.
The emergence of these resistances necessitated turning to other means of struggle. The existence of natural immunity induced by exposure to the parasites and the observation that the passive transfer of immunoglobulins from immune people decrease parasitaemia as well as effective immunization and sterilizing by sporozoites attenuated by irradiation have rendered reasonable the argument of a malaria vaccine, the development of which constitutes then a global public health priority.
1.3 In search of life-saving immunity Natural immunity against malaria is characterized by very slow development and the fact that it does not result in protection sterilizing. In hyperendemic areas, the acquisition of immunity natural against erythrocyte stages manifests in children first by a tolerance to the parasite (anti-toxic immunity) then with age by a decrease in parasitic load in the blood (anti-parasitic immunity).
These observations, made during epidemiological studies were confirmed by experimental infections. Applied malaria therapy people with neurosyphilis (Boyd and Coggeshall, 1938; Ciuca and al., 1943; James, 1936), made it possible to define parameters which intervene in the acquisition of immunity in tightly controlled experiments.
He has thus been shown that the acquired immunity was on the one hand dependent on species and strain and on the other hand differed depending on the stage of the cycle parasitic infective. So far, the precise mechanisms of anti-malarial remain to be elucidated.
Because clinical signs and transmission are only due at the blood stages and that these are the most accessible as well in vitro 5 that in vivo, most vaccine studies have concerned these stages. A
thirty antigens expressed in erythrocyte parasites have been identified, particularly by monoclonal antibodies and considered in so as vaccine candidates. However, trials of induction of protective immunity through the rare antigens tested in humans have remained unsuccessful until 10 present.
The first immunization with the pre-erythrocytic stages has been attempted unsuccessfully by the Sergent brothers in Algeria (Sergent and Sergent, 1910). The ability to protect in a sterilizing manner (absence of any parasitaemia blood) was only obtained by immunization with attenuated sporozoites 15 by irradiation. This approach was initiated by studies in birds with some sporozoites irradiated with UV rays (Mulligan et al., 1941), and has been reprise years later with rodent parasites using sporozoites irradiated with x-rays and later y-rays, the dose of which may be more easily controlled (Nussenzweig et al., 1967; Richards, 1966);
immunity 20 can be maintained by a recall of non-attenuated sporozoites (Orjih and al.
1982). In humans, such protection has also been obtained (Clyde, 1975;
McCarthy and Clyde, 1977), however it is only induced after a very large number of inoculations by irradiated sporozoites so that such procedure vaccine cannot be applied on a large scale.
For a long time, it was believed that protection was correlated with a phenomenon observed when the sporozoites are incubated with immune serum, CS (Circum sporozoite) precipitation (Vanderberg et al., 1969). Protein recognized by this serum, the protein CS, was therefore considered responsible for this immunity. Since then it has been the source of multiple studies in many experimental models. Gold so far none of these studies has been able to reproduce as strong an immunity as that induced by irradiated sporozoites.

A critical evaluation of previous experimental results has led to postulate that it was the hepatic stage and not the sporozoite which was at the origin of sterilizing immunity (Druilhe and Marchand, 1989). The main clue was the fact that protection could only be induced by the inoculation of sporozoites viable, intravenously, able to invade and enter a hepatocyte develop, and that liver forms from irradiated sporozoites persisted (Ramsey et al., 1982). In addition, elimination of stages liver causes susceptibility to sporozoite infections in previously protected animals (Londono et al., 1991; Scheller and Azad, 1995).
The hepatic stage has unique characteristics. The hepatocyte is a metabolically active nucleated cell and expresses molecules of major histocompatibility complex. Hepatic schizogony leads to formation of between 10,000 and 30,000 merozoites while 4 to 32 merozoites are released by a blood schizont. Merozoites from these two stages have morphological differences, but it is not known if there are any differences functional or molecular, because only blood merozoites could be extensively studied.
Because in the liver only a few hepatocytes are infected and that in in vitro, cultivation techniques remain delicate and difficult, this has constituted a major obstacle to the development of knowledge on the hepatic stage and looking for antigens expressed at this point.
1.4 Screening of specific stage antigens The first strategy for establishing stage specific expression is generation of complementary DNA libraries from messenger RNAs different stages. This has been accomplished several times in the blood stages (Chakrabarti et al., 1994; Watanabe et al., 2001) and more recently once at sporozoite stage (Fidock et al., 2000). However, this approach is not possible for the hepatic stage of human parasites. Another way is generation of specific antibodies in animal models. This is easy at the erythrocytic stages but for the hepatic stage, several attempts have failed because injections of P. falciparum liver stages did not induce than very few antibodies in mice. A final approach is screening immunological based on the use of antibodies from naturally occurring individuals immune. This approach made it possible to highlight for the first time that antigens other than CS were present on the surface of the sporozoite (Galey et al., 1990).
1.5 Strategy developed in the antigen identification laboratory expressed at the pre-erythrocytic stages In order to get around the difficulty of screening at the pre-erythrocytic stages, a screening strategy for potentially P. falciparum antigens expressed in the sporozoite and hepatic stages has been developed (Marchand and Druilhe, 1990).
The principle was to look for individuals in whom the answer predominant immune was against the preerythrocytic stages. We have thus obtained sera from individuals (PM sera) living in endemic areas for over 20 years and having never had clinical access as they were in permanently on prophylactic treatment with chloroquine (schizonticide effective against blood stages, but has no effect on stages liver).
The corresponding sera recognized only very weakly blood stages in Western Blot and IFI (titer less than 1/200), while than the titers against the sporozoite and hepatic stages of the parasite were understood between 1/3200 and 1/6400 in IFI and they labeled several polypeptides on protein extracts of P. falciparum sporozoites; so it was about serums containing antibodies specific for the antigens expressed at the pre-erythrocyte.
These sera were used to screen a genomic library of P.
falciparum (built by Odile Mercereau Puijalon). Genomic DNA from parasitic clone T9-96 was methylated and digested with Dnase 1, and the fragments ranging in size from 200 to 2,500 base pairs have been introduced into the site EcoR1 of phage ~, gt11 (Guérin-Marchand et al., 1987).

Among the 7 million DNA fragments generated, 2000 clones producing a recombinant antigen recognized by hyper immune sera (SHI) immune individuals living in endemic areas were then screened with PM sera. 120 clones were thus selected and the stage expression of corresponding antigens was determined by IFI tests, with immunopurified human antibodies on each recombinant protein, on sporozoites, hepatic stages and blood stages of P. falciparum, P.
yoelü and sometimes with P. berghei and P. vivax.
The first antigen to be studied and against which humoral responses were highest in several sera from individuals living in a zoned endemic was (e Liver Stage Antigen 1, LSA-1 (Guérin-Marchand et al., 1987). II
remains the only antigen characterized to be expressed only at the stage hepatic.
Following LSA-1, 3 STARP, SALSA and LSA-3 antigens were selected from various criteria and characterized at the molecular level (Bottius et al., 1996; Daubersies et al., 2000; Fidock et al., 1994a), and immunologically by L. Benmohammed, K. Brahimi, JP Sauzet and B.
Perlaza. (BenMohamed et al., 1997; Perlaza et al., 1998; Sauzet et al., 2001 ).
These antigens are expressed both on the surface of the sporozoite and at the stage hepatic.
LSA3 is the only antigen recognized differently by sera volunteers or chimpanzees protected by immunization with irradiated sporozoites. He is the only one to have induced protection sterilizing and long-lived in chimpanzees (Daubersies et al., 2000), and will soon be tested in phase I and II clinical trials.
2) MATERIAL AND METHODS
2.1. Molecular biology techniques 2.1.1. Bacterial strains DHSa: supE44 DIacU169 (~ 80 IacZOM15) hsdR17 recA1 gyrA96 thi- 1 relA1.

2.1.2. Pest strains:
NF54 from an isolate from a European patient infected in Africa (ATCC
MRA151) (Walliker et al., 1987).
3D7, the reference strain used in the genome project, is a clone from of the strain (ATCC MRA151) (Walliker et al., 1987).
T9.96, a strain from a Thai patient ATCC: MRA153, (Thaithong et al., 1984) For the polymorphism tests, separate strains were employed: B1 (Brazil); F32, D7, D28, D50 from Tanzania; D28 from Senegal, D41 from India, D51 from Myanmar, L1 from Liberia, H1 from Honduras, Mad20 from Papua New Guinea, and PA from Palo Alto, from South West America.
(Stricker et al., 2000).
The sporozoites are from the NF54 strain and obtained by passage in Anopheles Gambiae REF
2.1.3. PCR from extracts of folds or DNA from folds The Expand High Fidelity KitT "" (Mannheim Boehringer, Germany) has been used as directed by the supplier with 2 mM MgCIZ, 3.5 units of Taq polymerase, 0.2 mM deoxyribonucleotides (dNTP), 50 nM primers 21 D
in 5 '(CCTGGAGCCCGTCAGTATCGGCGG) and 26D in 3' (GGTAGCGACCGGCGCTCAGCTGG) and 2 p1 of purified DNA or extract of folding. The reaction involved an initial denaturation of 2 minutes at 94 ° C, followed by 35 consecutive cycles of 15 seconds denaturation at 94 ° C, 30 seconds of hybridization at 50 ° C, and 2 minutes of elongation at 68 ° C. The circuit cyclic was followed by incubation at 68 ° C for 5 minutes.
2.1.3.1 Subcloning in the vectors histidine, pNAK and Topo Depending on the quality of the folding amplification product, three procedures have have been employed:
PCR products with a very small smear or yield and being smaller size almost impossible to detect by digesting folding DNA
corresponding, were cloned via a vector allowing a direct cloning of the PCR product without successive digestion of a restriction using the TopoTA CloningT "" kit (Invitrogen, The Netherlands).
The Topo cloning was also done for the fragments we wanted only determine the sequence.
5 PCR products smaller than 1 Kbp have been digested, precipitated with ethanol, and resuspended in half of the initial volume of H2O, then digested per 10 U of the restriction enzyme EcoR1, for 1 hour at 37 ° C., drawn on a 2% agarose gel, gel purified by the gel extraction kit procedure of Qiagen, giving a volume of 50 NI.
10 Large, scanty PCR products (greater than 1000 bp) were isolated from purified phage DNA by digestion with EcoR1, then by extraction of the insert from the agarose gel.
2.1.3.2 Study of the aolvmorphism of the Gene in parasitic strains 15 different.
The following primers were used to identify polymorphisms in size of specific regions corresponding to the antigens studied.
747-1: AAAAGTGATGATAGAAATGCTTGTG (5 ' 747-2: TTTTGTTGATCTTACTTATTTCACC (3 ') 20 772-1: CGGAATCAGGTTTAAATCCAAC (5 ') 772-2: AGATCGTTTTTCATCAGGGGG (3 ') The cyclic reaction was carried out with a program comprising a initial stage of denaturation at 94 ° C for 15 seconds, followed by 39 cycles including denaturation at 94 ° C for 2 minutes, one hybridization at 52 ° C for 1 minute and elongation at 72 ° C for 2 minutes. A
5 minute step at 72 ° C completed the reaction.
The PCRs were carried out on an Appligene Crocodile III. The products were then analyzed on agarose gel.

2. 9.4. DNA purification 2.1.4.1 For analyzes of recombinants PCR positive colonies were inoculated into 3 ml of medium containing the antibiotic corresponding to the vector used (100 pg / ml ampicillin for Topo and Histidine, 20 pg / ml kanamycin for the vector Vical) and 2 ml inoculum were used in the preparation of plasmid DNA with the QiagenT "" Miniprep Kit. The DNA obtained was successively digested with the restriction enzymes used in cloning and subjected to electrophoresis on agarose gel, in order to detect the insertion of the fragment.
2.1.4.2 For the isolation of fragments:
100 ml of Luria Broth medium supplemented with an appropriate antibiotic have.
were inoculated with 1 colony of bacteria comprising the recombinant, and incubated at 37 ° C overnight in a thermostatic bath with vigorous stirring. The next day the bacterial culture was harvested and the purified plasma DNA
as described (Qiagen maxiprepT "~, Qiagen, Germany).
2.1.4.3 For the immunization of naked DNA constructs In order to eliminate endotoxins, which are present in bacteria and which may cause non-specific responses during immunizations of mice, the DNA of the constructs was purified from 2 l of culture of bacteria recombinant, by Qiagen EndoFree Plasmid GigaT "" kit (Qiagen, Germany).
2.1.4.4 For the purification of DNA from recombinant phaaes The phages were re-amplified on LB agarose dishes, in depositing 5 p1 on Topagar taken with 200 p1 of Y1090 inoculum, and leaving at 37 ° C overnight.
Then more was produced in liquid culture.
First, a patch pricked on the dish was incubated with 200 μl of inoculum of Y1090, left at 37 ° C with stirring for 15 minutes. Then, 5 ml of antibiotic-free medium supplemented with 10 mM MgS04 was added, and the culture left in agitation for 4 hours, until the appearance of lysis.
50 p1 of Chloroform was added, and the whole centrifuged at 7000 g for 10 minutes.
After centrifugation, the supernatant released from cell debris was recovered.
This stock was used in the production of 500 ml of phage in culture liquid the equivalent of 7.5 $ 10 pfu (plate forming units) has been added to 500 NI
of cells of a culture inoculated on the night of Y1090, and 500 p1 of 10 mM
MgCl2 / CaCl2. Everything was incubated at 37 ° C for 15 minutes, and added to 500 ml.
middle LB without antibiotic. The lysis of bacteria observed by the appearance of filaments in the culture was followed until total lysis (4-5h). Then the culture was centrifuged at 6000 g for 15 minutes at 4 ° C, the supernatant recovered, and stored at 4 ° C overnight.
The next day, DNA purification was undertaken with the Lambda Maxi Kit (Qiagen, Germany) with adjustments at the start of the protocol to because of the larger volume of starting supernatant. The final pellet was resuspended in 500 µl TE buffer.
2.1.4.5 from parasites 100 p1 of red blood cell culture pellet at 10% parasitaemia, was resuspended in 100 μl of PBS, pH 7.2 and purified by Qiaamp DNA Mini KitT "' (Qiagen, Germany). From 100 p1 pellet of a parasitized culture to 10 %
we got about 5pg of DNA.
2. 7.5. Purification of total parasitic RNA
We used two methods depending on the amount of RNA wanted.
For large quantities, the method described by (Kyes et al., 2000) has summer employed, while to obtain preparations of larger quantities restricted, we used the RNeasy kitT "" (Qiagen, Germany.) 2. 7. 6. RT PCR.
RT-PCR was carried out with the RT-PCR kit from Qiagen (Germany).
Primers specific for each gene and located, if possible, such way that we can distinguish between products from DNA amplification genomics and RNA (around the introns) were used. A first reaction Reverse Transcription was performed at 50 ° C for 30 minutes, then one PCR reaction was carried out, under the same conditions as that described for parasite DNA PCR with selected primers, sometimes followed a second reaction (nested PCR) with primers located in the sequence of the first amplified PCR product. However, the temperature of hybridization varies according to the primers used (between 50 and 60 °
VS).
2.7.7. Purification of histidine recombinants 2 I of Luria Broth medium added with ampicillin at 100 ng / ml was inoculated with 50 ml of bacteria culture containing the recombinant plasmid.
The growth of bacteria was followed by measurement of turbidity bacterial to 600 nm and at the desired optical density (between 0.5 and 1) a concentration IPTG
varying between 0.5 and 1 mM depending on the recombinant was added to the culture, and the induction lasted between 2 h and 4 h.
Then the cells were harvested and the pellet of bacteria resuspended in 20 mM NaPO 4 buffer, pH 7.4, and 8 M urea (TU) (25 ml / liter of bacterial culture). Then, the cell suspension was subjected to sonications of 10 shocks of 1 minute each, and the supernatant containing the recombinant protein was recovered by centrifugation at 10,000 g for 10 minutes, and filtered at 0.22 pm. Then, a purification step by affinity on a Nickel column was carried out. A 1 ml column (HiTrapT "", Pharmacy, Sweden) was washed as directed by the supplier and 1 ml of NiCl2 was applied, followed by further washes. Then the column was washed with 5 ml of TU, and the supernatant applied to the column. Then a wash of 10 ml of TU was carried out, and the recombinant eluted by an increasing gradient in imidazole, competitor of histidine. Depending on the purified recombinant, different concentrations were used, and the results obtained are summarized in the table below. Then the protein pool was dialysis against an L-histidine buffer pH 6, and chromatographed on a column anion exchanger (HiTrap QT "", Pharmacy, Sweden) to eliminate some Lipo Poly Saccharides (LPS) or endoxins which induce non-responsive specific (Morrison and Ryan, 1987).

Histidine recombinant purification table DO Location RecombinantInduction 'after protein, ImidazoleNaCI

induction Weight (mM) 3 (mM) 4 molculaire2 DO
IPTG
Tem s 747 0.5 0.5 4h 2.7 Mem, 18 50 360 772 0.5 0.5 4h 2.2 SN, 35 36 120 1: OD measured at 600 nm, IPTG concentration (mM); and the time induction before harvest.
2: After sonication, and centrifugation of a suspension of bacteria does not containing no urea (8M) in the buffer, the supernatant and the pellet containing the debris of bacterial membranes were tested in Western blot to detect where the recombinant protein was. In urea all proteins were soluble, and the procedures for purification therefore have applied in the presence of 8 M urea.
3: The concentration of imidazole at which the protein has eluted on the HiTrap-NiT column "' 4: The concentration of NaCl at which the protein has been eluted on the column from HiTrap-QT ""
2.2. Immunological techniques 2.2. 7. ELISAs (Enzyme Linked ImmunoSorbant Assay) Optimal conditions were determined with 100 µl of solution antigen with a concentration of 10, 5 or 1 pg / ml coated on the plates in 50 mM Carbonate pH 9.6 or 1X PBS pH 7.4 by incubating the plates on the overnight at 4 ° C. Saturation was carried out, either in PBS supplemented by 3% of skim milk, or 1% BSA (calf serum albumin) at room temperature ambient or at 37 ° C for 2 hours. The dilution of sera of 100 or times was carried out either with 1.5% PBS / milk or with 1% PBS / BSA, and the incubation was carried out at room temperature or at 37 ° C. for 1 h.
Incubation with secondary antibodies coupled to HRPO
(turnip peroxidase) diluted 1/2000 in the dilution buffer for sera a was done at room temperature, and the disclosures were made at the help of TMB (peroxidase substrate and peroxidase solution B) buffers (Laboratories Kirkegaard and Perry, USA) mixed volume to volume immediately before use of which 100 p1 were distributed in each well. The reactions colored in blue were stopped by adding the same volume of a 1 M solution acid phosphoric. Reactions are read at 450 nm in a Multiscan reader AscentT "" (Labsystems).

The results of the mice are expressed in Ratio (arbitrary unit relative to response rates in naïve witnesses) and in experiments where isotype levels were studied, compared to the ratio of total IgG
determined in the same experience.

2.2.2. Immunopurification of specific antibodies For immunopurification of specific antibodies against recombinants Hiss, a method described by (Brahimi et al., 1993) was used. 100 pl / well of antigen solution in PBS, pH 7.2, at a concentration of 5 pg / ml have 10 were adsorbed on Nunc MaxisorpT "" plates (Nunc, Denmark), and the plates incubated at + 4 ° C overnight. Then, hyperimmune sera were incubated at a 1/50 dilution for 1 hour at room temperature, the plates washed and the elution of the antibodies carried out by adding glycine pH 2.5 to 0.2 M, incubation for 3 minutes and recovery followed by neutralization of the pH with 15 Tris, 1 M, pH 11. Immunopurification from fusion recombinants ~ i-galactosidase was performed on nitrocellulose filters, as described (Beall and Mitchell, 1986).
2.2.3. SDS-PAGE and Western Biot 20 Depending on the samples to be tested, percentage gels acrylamide (BioRadTM 29.1: 1 ratio) variables (5, 7.5, 10 or 12%) were used. After migration in Tris / glycine buffer (pH 8.5) with the minigel kit (Biorad, USA) the gels have either been colored by Coomassie blue or submitted at transfer to nitrocellulose filters (0.45 pm), in the Trans- cell blot 25 (BioRad.) After transfer, the proteins were visualized by staining with 0.2% Ponceau red in acetic acid solution (5%), then filter at saturated with TBS / 5% skim milk for 30 minutes. Human antibodies immunopurified without dilution, and sera diluted 1/100 or 1/200 in TBS / 5% milk / TweenT "" 0.05% were incubated for 1 to 2 hours at ambient temperature. Then the filter was washed 3 times 10 minutes in 0.05% TBS / Tween, and incubated with phosphatase-coupled antisera alkaline diluted 1/5000, for 30 minutes. After washing in the same buffer, the colored reactions were produced by the addition of NBT (330 pg / ml) and BCIP
(165 Ng / ml) (Promega, Germany) diluted in Tris pH 9 buffer.
2.2.4. IFI (Indirect immunofluorescence) All incubations at 37 ° C were carried out in a chamber humid to avoid drying of the tissues or cells to be studied. The tampons were filtered by a 0.22 µm filter to avoid contamination by other microorganisms and background noise.
2.2.4.1 Sporozoite stage After dissection of the salivary glands of mosquitoes infected with the parasite, the sporozoites were fixed with 0.01% glutaraldehyde in PBS
and washed thoroughly in PBS.
In order to study the marking only on the surface of sporozoites, (Galey et al., 1990) developed a technique allowing “wet” fixation with a suspension of sporozoites attached to the polylysine. Titration slides (PolyLabo, France) were coated with 1 p1 of a 50 mg / ml solution of polylysine, then left to dry overnight at 37 ° C. 1 p1 of a suspension of sporozoites (20 / p1) was deposited on each well, and incubated in a bedroom humid at 4 ° C overnight. Detection of an intra-parasitic presence was made by fixation of sporozoites in acetone.
2.2.4.2 Hepatic stage The sections fixed to the Carnoy and paraffined were prepared by 3 baths of Xylene of 10 min each, 3 baths of absolute alcohol of 5 min each, 2 baths distilled water for 5 minutes each, and dried in the open air. Then the cuts have was rehydrated for 10 min in filtered PBS pH 7.4. The cuts to freezing were set 10 minutes in acetone.

2.2.4.3 Blood stage.
The blood smears were fixed for 10 minutes with acetone, and boxes for each sample to be tested has been delimited by drawing edges with a Pentel-red marker on the smear.
The rest of the technique was identical for the three stages: After fixation, the antibodies to be tested (diluted in PBS) were deposited on each well, cut or box, and the slide incubated at 37 ° C in a humid chamber during 1 hour. The slides were washed 3 times 10 minutes in 1 × PBS, then incubated with anti-human or mouse anti-IgG (depending on the antibodies specific used), coupled to fluorescein (Alexis) diluted 1/200 in PBS and blue Evans 1/50000, incubated for 30 minutes at 37 ° C in a humid chamber, washed three once in PBS 1X, and covered with a coverslip after a drop of buffer glycerine (PBS 30% glycerol) has been deposited. Reading the slide was performed under UV microscope (Olympus, BH2)) 2.2.5. Mouse immunizations 2.2.5.1 By histidine recombinants Protocols a, b and c were mainly applied to obtain specific sera, while protocols b, c and d were used in order to to perform challenge infections with P. yoelü.
a) IFA / Alum adjuvant 6 week old female BALB / c mice received 1 first injection intraperitoneal 500 NI, with 1 mixture of 20 pg of antigen (Hiss-249, Hiss 680, His6-747. Hiss-772), 2 mg / ml Alum (AI (OH) 3, and incomplete Adjuvant of Freund (AIF), volume in volume, supplemented with 0.9% NaCI.
The next 2 injections, each 15 days apart, were performed with the same amount of antigen in the same volume, but without AIF, and with methiolate, a preservative, at 0.05%.
The mice were removed (500 NI) before immunization 2 weeks, 1 months and 6 weeks after the first immunization, on EDTA and plasma recovered and stored at -20 ° C.

b) CFA
6-week-old female BALB / c mice received 3 sub-injections cutaneous every 15 days at the base of the tail of a mixture consisting of p1 of complete Freund's adjuvant and 10 Ng of antigen (Hiss-114 or His6-662) in 100 µl of PBS. 1 week after the third injection, the sera of mice were removed and the responses tested in ELISAs against the recombinant and in IFI on sporozoites. 18 days after the last injection, the mice sustained challenge infection with P, yoelü sporozoites.
c) SBAS2 (Smith and Klein Beecham adjuvant) 7-week-old female C3H mice received three sub-injections skin at the base of the tail of 100 u) of a mixture consisting of 57 NI
adjuvant mixed with 43 µl of antigen (Hiss-249, His6-747 or Hiss-772) corresponding to 10 pg, the injections being spaced 3 weeks each. 10 days after the last immunization, the mice were removed and serums correspondents collected.
d) Microparticles Antigen solutions (Hiss-249, His6-747 or Hiss-772) were adsorbed on polystyrene microparticles 0.5 µm in diameter (Polysciences Inc, USA) by incubation at 37 ° C with shaking for 4 hours in glycine solution, pH 8Ø Adsorption of the antigen has been verified by the ability of the microbeads to agglutinate with a serum specific for antigen absorbed. 7-week-old female C3H mice received three sub-injections skin at the base of the 100 p1 tail of a mixture of microbeads coated with the antigen corresponding to 10 pg, the injections being spaced weeks each. 10 days after the last immunization, the mice were collected and the corresponding sera collected.

2.2.5.2 By DNA recombinants BALBIc and C3H mice of 6 weeks were injected 3 times at 8 weeks apart intramuscularly with 100 NI antigen (PNAK114, pNAK249, pNAK438, pNAK571, pNAK747, pNAK772) in PBS pH 7.4, then a 4th time 12 weeks after the 5th injection. Blood samples were performed 1 week after the 5th and 4th immunization on EDTA, and sera collected after incubation of the sample overnight at 4 ° C.
The spleens of 3 Igroupe mice were removed after the 4th immunization, and stimulation of the cellular responses studied. After a 5th boost, 8 weeks after the 4th injection, the mice underwent infection test by P. yoelü sporozoites.
2.2. 6. Infection of tests by sporozoites and by blood stage Sporozoites from Anopheles stephensü mosquitoes infected with clone 1.1 of P. yoelü yoelü were obtained by a method (Ozaki et al., 1984) which consists of isolating the mosquito's rib cage and obtaining through centrifugation through glass wool of the sporozoites, which have been washed by successive resuspensions in PBS after centrifugation.
The mice were infected with P. yoelü sporozoites retroactively orbital with 150 to 200 sporozoites (200 p1 / injection), and parasitaemia followed by smears from day 3 following infection until the 12th day post-infection, both on immunized animals and on naive mice infected with the same batch of sporozoites.
Blood stages taken from other mice infected with P. yoelü
were washed in PBS, and the equivalent of 5 x 104 parasites were injected intraperitoneally.
2.2.7. Study of cellular responses.
In order to study both the induction of T-cell proliferation specific as well as the secretion of cytokines capable of stimulating the reply immune we studied the stimulation of mouse splenocytes by antigens and the secretion of IFN-γ by these cells.

2.2.7.1 T cell proliferation Spleens were removed from mice, splenocyte suspensions were washed twice in RPMI 1640 (Gibco, France) and the cells 5 resuspended at a final concentration of 5 x 106 cells / rnl in RPMI
supplemented with 100 U / ml penicillin, 2 mM L-glutamine, 10 mM Hepes, 50 pM
~ 3-mercaptoethanol, 1.5% fetal calf serum (SVF) and 0.5% serum normal mouse. 100 μl / well of each suspension was distributed in 96-well round bottom plates (Costar, USA) and recombinant proteins to 10 test were added at a concentration of 50 mg / ml. These tests were performed in triplicate. After 48 h of incubation, (37 ° C with 5% of C02), 50p1 / well culture supernatant was removed and stored at -70 ° C before the determination IFN-y titles. 50 NI / well of supernatant was taken for assay of cytokines. In order to detect DNA replication due to stimulation of division, 15 50 µl of a tritiated thymidine solution (3H) (Amersham Life Science, England) to 1 pCi / well was added during the last 12 hours of incubation. The cell were harvested in an automatic cell harvester (Skatron Inc, Sterling, VA, USA), and incorporation of Thymidine 3H quantified by scintillation. The results are expressed in Stimulation Index (1.S.) and proliferation has summer 20 considered positive, when S.1. is above 2.
2.2.7.2 Detection of secretion of interferon ~ r (IFN-y) IFN-γ titers in culture supernatants were determined by a double capture ELISA method. Maxisorp plates (Nunc, Denmark) 25 with flat bottom were coated with an anti-IFN-γ rat monoclonal antibody of primary mouse (R4-6A2) (Pharmingen, San Diego, CA) diluted in a buffer of 0.1 M carbonate, pH 9.6, and left overnight at 4 ° C. Between each stage of the procedure, the plates were washed several times with PBS buffer supplemented with 0.05% Tween T "" (PBS-T). Then the plates were 30 saturated with 3% calf serum albumin (BSA, Sigma Chemicals, St Louis, USA) in PBS-T. Undiluted supernatants have been added to wells and plates incubated overnight at 4 ° C, followed by 1 hour incubation at room temperature with an anti-mouse IFN-y rat monoclonal antibody secondary biotinylated (XMG1.2, Pharmingen, San Diego, CA) diluted in PBS-T. The labeling steps with antibodies coupled to peroxidase are identical to those used in the ELISA technique. (A.2.1) 2.2.7.3 Detection of IFN-v secretory cells by Elispot The number of IFN- ~ y secreting cells was determined in unstimulated splenocytes 40 hours after freshly isolated and incubated with antigens. Microtiter plates (Multiscreen-HAT "", sterile plate, Millipore) were coated with 50 μl of a solution containing pg / ml of anti-IFN-γ antibody (18181 D, Becton Dickinson Co). After one overnight incubation at 4 ° C, the wells were washed and saturated with a solution of 5% of SVF. 5 x 105 cell / well cell suspensions were incubated with the antigen at 50 pg / ml in a total volume of 200 p1 for 40 h, at 37 ° C in a humidified atmosphere of 5% COZ. The plaques have then washed 3 times with PBS-T and 3 times with PBS alone and the well were then coated with 50N1 of IFN-γ anti-mouse antibody solution biotinylated (Becton Dickinson Co, USA) diluted 1/200 and incubated overnight at 4 ° C.
The plates were then washed in the same way as before, before a addition of 50 p1 per well of alkaline phosphatase coupled to streptavidin (Boehringer-Mannheim, Germany) at a dilution of 1/2000 in PBS. After 1 h of incubation, and washing of the plates, spots were detected by development of a colored reaction with BCIP / NBT reagents at 50 Ng / ml at where individual cells secreted IFN-γ. The results are expressed as the number of spot forming cells compared to 5 x 106 splenocytes.
2.2.8. Serums and cells 2.2.8.1 Individuals naturally exposed to the parasite.
10 sera from adults living in a strong endemic area (Ivory Coast) and naturally protected have been used in studies of ELISA and immunopurifications of antibodies specific to antigens studied.
Sera from individuals of two age ranges from 0 -9 years or above 12 years old, Ndiop and Dielmo Villages have been selected (Rogier and Trape, 1995; Trape et al., 1994). Ndiop is located in an area endemic which has about 20 infectious bites / year, and Dielmo, in a area with 150 infectious bites / year. Each serum in one of two regions corresponds in age and sex to a serum from the other region.
2.2.8.2 Animals or humans immunized with irradiated sporozoites.
Two chimpanzees were immunized with either sporozoites irradiated with 18 kRad, i.e. 30 kRad by 4 injections of 5 x 106 sporozoites each by way intravéneuse. The first 3 immunizations were performed with 1 month interval, while the 4th "e was performed 4 months after the 3rd"'e. Their serum and peripheral blood cells have been studied in response tests and humoral responses after 3 immunizations. The two animals were infected with the intravenous injection of 4 x 104 sporozoites (low dose) each of P. falciparum and only the chimpanzee immunized with the sporozoites irradiated at 18 kRad was protected (did not develop parasitaemia blood) Two human volunteers immunized by the same means, received a recall with a new batch of irradiated sporozoites, and blood cells have been studied in Elispot tests. In addition, the serum of 4 human volunteers immunized with irradiated sporozoites has also been at available to the Applicant.
2.2.8.3 Individuals exposed differently to the parasite We had at our disposal sera from 8 exposed individuals naturally to the parasite but under permanent chloroquine treatment, this who eliminates blood stages to a very early form and sera of 5 individuals accidentally infected with transfusion of P. infected blood falciparum.

3) RESULTS
3.0: Example 1 Identification of two new antigens DG47 and DG772 from P. falciparum recognized by volunteers immunized with irradiated sporozoites The clones DG 747 and DG772 were selected not only because initial criteria set (detection on sporozoites and stage hepatic, as well as recognition by hyperimmune sera), but because several additional features interested us: the DG747 did not have no cross-reactivity with other PM library proteins, and DG772 had only one cross-reactivity, with LSA1, the only antigen identified as expressed only in the hepatic stage of P. falciparum. In addition, antibodies specific for the two proteins labeled P. sporozoites yoeüi.
Initial sequencing revealed that these two clones contained inserts belonging to hitherto unknown genes, but whose sequence was available on the P. falciparum genome databases. We are therefore devoted to the work of molecular characterization expression stage, gene conservation, as well as characterization work immunological (antigenicity, immunogenicity) of these new antigens. The results showed that a) these two antigens induce an immune response in individuals or animals only exposed in the pre-red blood cells both artificially (by immunization) and naturally (in the field), b) that they are recognized by sera from individuals naturally exposed to the entire parasite cycle, both in areas of low and of strong endemic. In addition, we assessed their potential in mice immunogenic and protective through immunization and P. challenge infection yoelü.
3.1. Sequence analysis DG747 codes for a polypeptide of 59 amino acids including 40 acids amines (aa) C-terminals are part of a repeating structure of 5 x 8 aa rich arginine and lysine. This sequence is identical to aa 81-140 of the gene PfB0155c (1524 bp, 508 aa) located on chromosome 2 (Figure 3.1a). This gene who code for a putative protein (Gardner et al., 1999), does not contain introns nor signal peptide predicted, nor of regions homologous to other proteins than either from Plasmodium or other organisms. The corresponding protein has a theoretical molecular mass of 59 kDa, and a neutral isoelectric point (7.5), but some regions have very variable p1, for example the region found in DG747 has a positive charge at neutral pH.
DG772 contains an insert of 333 bp, which are translated into 111 aa contents in an open reading frame. This polypeptide corresponds to the region of aa 1146-1256 of a protein of 1493 amino acids encoded by a gene located on the chromosome 1 (Figure 3.1b). The theoretical mass of the protein is 173 kDa and the isoelectric point is 5.05. Most of the protein acids polar amines and does not contain hydrophobic sites, except in the part NOT-terminal, where there could be a GPI anchor site. The gene does not contain of repetitions and the translated nucleotide sequence has strong homology with proteins of the “EBP” family (Adams et al., 1992), that is to say with of the 5'cys and 3'cys regions which are characteristic of this family.
3.2. Stage expression and gene conservation In order to more precisely assess the stage expression of the two proteins, we used IFI and Western blot techniques on stadiums different from P. falciparum and on the murine parasites P. yoelü and P.
berghei.
The surface of P. falciparum sporozoites was marked by antibodies (human or mouse) specific to DG747 and DG772, but the erythrocytic stages were marked differently for the two antibody groups. Anti-His6-747 (anti-747) antibodies barely mark the young stages, but strongly mature schizont stages, with markings located around the knob structures (Figure 3.2 image A), while the antibody anti-Hiss-772 (anti-772) mark the parasite in a more homogeneous way at along the erythrocytic stage. In the murine species P. yoelü and P, berghei, the surface of sporozoites has been strongly marked by specific antibodies of the two antigens.

In order to define the sizes of the proteins detected, we also performed a Western Blot of protein extracts from P. blood parasites falciparum with the same antibodies (Figure 3.3 a and b).
Anti-747 antibodies label a polypeptide of around 70 kDa as well in 5 the extracts of rings than those of schizonts, while no band has summer detected in unparasitized erythrocytes. The polypeptide detected by anti-772 antibody is larger, with a molecular mass of 150 kDa, and is detected both in rings and in schizonts. Marking protein extracts from P. yoelü detected a 70 kDa polypeptide for Anti-747 in sporozoites and blood stages and a polypeptide of 60 kDa for anti-772, only detected in the sporozoites of P. yoelü.
In addition, to confirm the presence of proteins and their consistency expression on the surface of sporozoites from several parasites different, we have examined by IFI batches of sporozoites from 15 different Thai isolates of P. falciparum. Anti-772 serum has marked all the sporozoites, while only 7 in 10 of the isolates tested were marked by anti-747. Likewise, PCR amplifications with primers specific for the two gene fragments (shown in Figures 3.1 a and 3.1 b) were carried out with DNA from blood stages of 12 strains 20 different from P. falciparum (Figure 3.4). The corresponding PCR products at DG772 were amplified from the 12 samples and their size was similar, whereas the specific primers for DG747 could not amplify a fragment only from 9 of 12 DNA. It should be noted that all the lines of parasites used in this work (T9-96, NF54 and 3D7) contain the genes 25 correspondents. These results indicate a variation in expression or the presence of DG747 in parasitic strains, because in total, only 15 of 22 parasites appeared to contain or have the DG747 gene showed positive reactivity in IFI. One of the primers used for the detection of the gene encoding DG747 is located in the 3 'part of the repeats contained 30 in DG747, while the other is located further downstream which could explain the absence of PCR amplification, if there was a variation in the number of these repetitions. However, the results remain to be confirmed, from preference on DNA from parasites isolated in the field, because all parasites tested in PCR were cultivated in the more or less long term in vitro, which can train chromosomal deletions. The deletion phenomenon has moreover also observed in populations of parasites in vivo (Corcoran and Kemp, 1986).
3.3. Recognition by the human immune system in areas endemic In addition to studying the constancy of expression of the antigen, we have studied the prevalence of humoral responses from individuals living in areas high (Dielmo) or low (Ndiop) endemic, and in two age groups different in these two areas (Figures 3.5a and 3.5b) The same prevalence is observed (40%) against 747 in the low-lying area endemic, except that the number of individuals who respond strongly (the intensity of response compared to controls) increases with age. In the strong zone endemic, the number of responders versus 747 increases with age, as does the intensity of the response, and the prevalence in adults, that we can consider to have acquired immunity, is 85%. In addition, these responses appear to be correlated with sporozoite exposure because the rate of antibodies is higher in individuals of a given age group in a stronger transmission area. However, in the same area, the response did not not changed significantly during weaker seasons transmission (dry season) (results not shown), which could correspond to the response against blood stages and / or indicate that the immune response anti-747 is long lasting. The response induced by DG747 increases in prevalence and intensity as a function of exposure and duration exhibition to the parasite (age).
The anti-772 response increases like anti-747 with age, but with a much smaller increase, compared to the rate of transmission observed between Ndiop and Dielmo and in relation to age. The rate of anti-772 responses measured in% of prevalence and in intensity is higher for individuals younger than those with anti-747 responses, but less strong (75 %) than anti-747 (85%) to Dielmo in immune individuals.
3.4. Comparison of responses induced by different stages of parasite We had the privilege of being in possession of cells from individuals immunized with irradiated sporozoites, and sera from people differently exposed to parasitic infection.
3.4.1. Cellular responses All these studies were carried out in close collaboration with Jean-Pierre Sauzet in the laboratory. Given the limited material we had, we restricted the analyzes in order to detect what we had previously defined as one of the important criteria (role in protection) for the evaluation of a vaccine potential at the pre-erythrocytic stage. We have studied the secretion of IFN-y from cells from 2 individuals immunized with of the irradiated sporozoites of P. falciparum, as we observed during analysis other antigens, and in particular LSA3, a vaccine candidate studied in our laboratory (Daubersies et al., 2000), that the rate of secretion of this cytokine appears to be correlated with protection. In these two volunteers, the number of cells secreting IFN-y against DG747 and DG772 is as high as for recombinants from LSA3 (729 and PC), (Figure 3.6a). In addition, we have examined whether the cellular immune responses measured by the proliferation of T cells and IFN- ~ y secretion differed between two chimpanzees immunized with irradiated sporozoites of P. falciparum, but one was not protected, (figure 3.6b and figure 4.3).
The immune system cells of the animal immunized with viable irradiated sporozoites (18 kRad) and subsequently protected, recognized the antigens DG747 and DG772, as did the animal's cells immune with irradiated non-viable sporozoites (30 kRad), and not protected during a challenge infection.

Lymphocyte proliferation is at the limit of the threshold value, while that the secretion rates of IFN-y are high, as well for the amount of cytokine detected only for the number of secretory cells (detected by ELISPOT). This also applies to animals that are effectively immunized and those not being protected. However, it appears that response rates are higher for animals immunized with irradiated sporozoites by 30 kRad. The responses induced by 747 are stronger than those induced by 772, and both stronger than those induced by LSA3.
Cells taken from immunized animals by the irradiated sporozoites were damaged during the transport from the primatology center in Africa, so we don't have not was able to study the presence of an induced “boost” against these antigens.
3.4.2. Study of humoral responses We were not in possession of the cells of all human groups differently exposed to parasitic infection but we were able study in detail the humoral response (IgG isotypes) of volunteers immunized with irradiated sporozoites (ISS, only exposed to the pre-erythrocytic stages), naturally immune individuals living in highly endemic areas (exposed to all stages of the parasite), and of an individual who has been accidentally infected by malaria by blood transfusion, (only exposed at stages ) (Figures 3.7a and 3.7b).
For the two antigens, the greatest difference is observed for the cytophilic isotype IgG1, the level of which is much higher in serum immune individuals (SHl) only in the serum from the patient infected with transfusion or ISS volunteers. The responses of these last two groups are quite similar and do not show any imbalance between antibody cytophiles (IgG1 and IgG3) and non-cytophiles (IgG2 and IgG4). We have in outraged noticed that the serum from an individual exposed at length to the parasite, but under permanent prophylaxis (PM), has the same profile in isotypes as ISS.

3.5. immunogenicity in mice Mice of two different strains were immunized with the recombinants in the form of proteins, with different adjuvants or in form of "naked" DNA constructs, without adjuvant.
A preliminary study with a naked DNA construct not comprising signal sequence allowing the export of the synthesized protein has been performed. The immunized mice did not generate any humoral response, except either for these two antigens or for others studied simultaneously.
However, we detected specific cellular responses to 747 and Anti-772. Both the T cell proliferation and the rate of secretion of IFN-γ were tested for two strains of mice, C3H and BALB / c. The response profiles are presented in tables 3.1 a and 3.1 b where can note that for the cellular responses of mice immunized with pNAK747, there are both stimulation of proliferation and secretion of IFN-γ, while for pNAK772, T cell proliferations were very little stimulation compared to stimulation of secretion of IFN-y which is considerable. Among all immunized mice, the highest level of IFN-y secretions are observed when the stimulation level of proliferation is the lowest.
Vaccinations with other formulations (recombinant protein and Naked DNA with a signal sequence) all induced a humoral response in mice (Figure 3.8). All sera from these immunized mice recognize the native protein in IF / tests and the labeling corresponds with that observed for immunopurified human antibodies.
Anti-747 responses show a similar profile for all mice immunized and all formulations used, with an isotypic response to preponderance of IgG2b. Anti-772 responses are also similar between mice and vaccine formulations, but with a clear predominance of IgG1. The profile isotypic therefore depends on the immunogen more than the mode of presentation used. However, endpoint titles are much higher when one immunizes with recombinant proteins (1 / 200,000) against DNA

(1/2000), and the titers of the sera of mice immunized with His6-772 are more higher than those of Hiss-747.
Since we had observed a cross reactivity with the stadium sporozoite of P. yoelü, we tested the protective potential of these antigens 5 by infection with sporozoites of this species of immunized mice with recombinant proteins. Parasitaemia was followed by observation of blood forms on smears from day 3 of infection and during consecutive days. We did not observe any protection whatever the mouse strain used because parasitaemia was detected on the same day as 10 that of unimmunized mice, and the curve was similar to that of mouse controls (results not shown).
3.6 Additional data 3.6.1 DG772 15 By RT-PCR on total RNA from sporozoites and blood parasites, the inventors were able to determine the splicing sites of the messenger RNA
corresponding to the coding gene. The primer sequence was extracted from Plasmodium falciparum genome data.
Amplification products are identical in size in stadiums 20 sporozoites and blood stages, and differ in product size obtained by amplification of genomic DNA and by sequencing the splice sites have been shown to be identical (see the introns shown in the figure).
The gene encoding DG772 belongs to a family of proteins identified by a shared motif. All proteins of the EBP family 25 (Erythrocyte Binding Proteins) share conserved residue patterns cysteine with a similar arrangement for all proteins. However, the degree of identity does not exceed 31% (max. 57% homology), even in most preserved regions.
30 3.6.2 Immunogenicity tests envisaged in humans.
From our results obtained in mice, we can confirm that the DG747 and DG772 antigens used both in the form of DNA and as a recombinant protein are immunogenic. In addition, because the recombinant proteins are recognized by immune individuals and protected against infection by Plasmodiurn falciparum sporozoites would indicate a role for these antigens in preerythrocytic immunity. A
test in primates, and in particular chimpanzees will allow us preliminary results which will allow us to choose the formulation optimal for clinical trials in humans.
In phase I trials, to study the immunogenicity and safety of product, we are considering three formulations all prepared in GMP conditions: 1) the antigen in the form of a recombinant protein purified to from the bacteria Lactococcuc lactis (use permitted in humans) adjuvanted with SBAS2 adjuvant (GSK); 2) the construction of DNA in the vector VicaIT "" (Avantis Pasteur); and 3) synthetic lipopeptides injected without no adjuvant (see LSA3). These formulations will be distributed by injection subcutaneous (at the level of the deltoid). By preliminary tests, we know that the Hiss-747 and His6-772 antigens induce cellular responses and of the humoral responses in individuals who have been exposed only to pre-erythrocytic stages. We will then study the answers cell and humoral responses of individuals immunized with the selected formulations in comparing them with those seen in individuals immunized with sporozoites attenuated by radiation and protected against infection test with non-attenuated sporozoites. Based on these responses, an infection test with Plasmodium falciparum sporozoites will be considered.
3.6.3 Homology with other nucleotide sequences.
Southern blot hybridization under standard stringent conditions (0.1 X SSC, 80 ° C) would not give rise to any other hybridization except with the gene corresponding.
3.6.4 Search for homology by bioinformatical means Research was carried out with BLAST software (tblastx and blastn) on all the available Plasmodium genome databases falciparum as well as the databases of other organisms. The settings used are the default parameters found on the sites http://vvww.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
3.7 Discussion This work, which is part of the study of antigens expressed at the pre-red blood cells allowed us a first characterization and evaluation of the vaccine potential of two new P. falciparum antigens. These two antigens have different characteristics at the molecular level. On the one go, the protein of which DG747 is a member contains repeats, while the molecule containing DG772 has no direct repeat. The Pfb0155c gene coding for DG747 is small (1524 bp) and contains a repetitive region at which belongs to DG747. We could not detect the presence of the gene by PCR
in all strains, nor observed reactivity with all strains of sporozoites studied. The absence observed may be due to a real deletion of the gene or to experimental procedures. Indeed, one of the primers used for detection of the coding part for DG747 overlaps the part repetitive, which can cause difficulty in amplifying a gene containing a repetition larger, or to detect a gene containing fewer repeats. Moreover, this is also the case for detection in indirect immunofluorescence where a number possible repetition variations may change the affinity of the antibodies specific, if the target epitope straddles this region. Expression detected through IFI appears to be present throughout the asexual parasitic cycle in the host vertebrate (we did not analyze the sexual stages). Despite the presence of repetitions in DG747, we did not detect cross-reactivity with other antigens of P, falciparum. The entire gene sequence has not homology with other plasmodial proteins so far identified, and we we do not yet have indications on a possible biological function.
DG772 does not contain repeats and its presence seems to be constant, whether detected by PCR or IFI. At the biological level, the uncomfortable coding for DG772 turns out to be interesting. We found by homology of sequence that this 5300 bp open reading frame gene is part of the family of Erythrocyte Binding Protein (Adams et al., 1992), but that the DG772 sequence does not belong to the conserved regions of this family, it only shares a small portion of sequences with the N-terminus of the 3'cys region. Besides, it has no cross reactivities nor homology of sequence with DG249, another clone belonging to one of the consensus parts of the gene encoding EBA-175. DG772 may be part of a region which gives a peculiarity to each molecule of this family. The presence of two molecules of the EBP family (EBA-175 and 772) on sporozoites could imply that there are several molecules in this family which would intervene from alternative way in the invasion process as described in the stages blood.
Knowledge of prevalence is useful when evaluating a vaccine candidate, and the prevalence obtained for DG747 and DG772, 85% and 75% are important. This study showed the significant antigenicity of a small part of the two molecules, and suggested that there would be an interest in studying more detail of other epitopes of the same molecule. The humoral response detected against DG747 and DG772 in permanently exposed individuals indicates that there is a preponderance in IgG1 response (cytophilic type) developed during a sustained exposure which is not found in the case of malaria Transfusion. However, the humoral response profiles obtained for of them groups exposed to the pre-erythrocytic stages with more or less long duration (PM and ISS) are similar, and the IgG1 level is low, indicating that this isotype translates the repeated exposure of the antigen to the blood stages.
The study cellular responses in these same areas will need to be performed in order having a more precise notion of the immune responses induced by these antigens.
At the pre-erythrocytic stages, we observed an induction of cellular response by these antigens both in chimpanzees and in humans. We observed IFN-γ secretion, described as a factor involved in the protection against pre-erythrocytic stages. The difference response observed in chimpanzees as a function of radiation dose could mean that antigens are recognized as well on sporozoites than in the hepatic stages. Indeed, sporozoites irradiated at 30 kRad are unable to enter the hepatocyte, and the responses detected are therefore only due to this exposure, while the sporozoites irradiated at 18 kRad develop in the hepatocyte, and the detected responses are therefore due to this Stadium. It would be interesting to study more closely the responses induced in these two animals (MHC1 restriction), and the induction of response “boost” during of several successive immunizations. This work has also shown that in these two fragments of antigens, there are both T epitopes and epitopes B.
The immunogenicity induced by the two antigens in mice is different with a predominance of IgG1 for DG772, which is not observed for DG747. However, we did not observe any difference in the responses based on formulations, which is interesting because the presentation molecules is not identical for each formulation. The answers cellular only obtained for the formulation which did not induce detectable humoral responses shows that there have been both blooms of lymphocytes, as secretions of IFN-γ depending on the mice. The IFN-y secretions tend to be higher when levels of proliferation are low, but this remains to be studied more precisely with a higher number of mice. The lack of protection of immune mice does not does not exclude protection in humans or by infection with P.
falciparum because the target epitopes are not necessarily the same. To to study a role in the P. falciparuml vertebrate host interaction, we have to layout an in vitro model with human hepatocytes and sporozoites of falciparum which will allow the study of invasion inhibition, and the studies in vivo will be possible in an AotusIP monkey model. falciparum which is found in Colombia. Currently we are doing the work necessary to complete the analyzes started on these antigens for what is immunogenicity.

Table D1: Summary of malaria preerythrocytic antigens now known *.
Antigne References 'Location Stadiums' Structures Intron expression 'Reps S
H
SSA
SSS

CS (Nardin et al., 1982) + j - - CHR3 + +

LSA1 (Gurin-Marchand et al., + J, m - - CHR4 - +
1987) TRAP (Robson et al., 1988) + j, mm - CHR13 - +

PfHsp70 (Renia et al., 1990) + j, mj, m - CHR13 +

STARP (Fidock et al. 1994) + j, m - - CHR12 + +

EXP-1 (Koenen et al., 1984), - mj, m Nt CHR12 - +
lSanchez et al., 1994) Pfs16 (Bruce et al., 1990) + nt - +? - -SALSA (Bottius et al., 1996) + j, m - - CHR2 + -LSA3 fDaubersies et al., + J, m - - CHR2 + +
2000) PfEMP3 (Pasloske et al., 1993), + j, mj, m - CHR2 + +
(Grner et al., 2001) GLURP (Borre et al., 1991 + mj, m Nt CHR10 - +
) EBA-175 (Camus and Hadley, 1985) + j, mj, m - CHR4.13 +

DG? 47., ~: ~: - ~ ,. 'j, mj, m.: - CHR ~, ~ +
'+ _' _ '~.
, aG772 + j, '..j, CHR1 +
:: rn m, * The antigens in gray are the antigens characterized in this application.
5 NT: Not tested 1: The presence at the pre-erythrocytic stages of other antigens (MSP-1) has also been suggested, but the preliminary results remain to be confirmed. The references underlined indicate the year of discovery of the pre-erythrocytic expression.
2. S: sporozoite; H: Young and mature liver stage; SSA: Blood Stage asexual young and mature;
10 SSS: Sexual blood stage. 3. ST: sub-telomeric. Bold type indicate shape from the stage where the marking is most intense.
3. Most of the chromosomal locations were made by research of homology on data base Table 3.1a: Stimulation of cell proliferation and secretion of IFN-γ by Hiss-747 after 3 immunizations with pNAK747.
Interfron proliferation Gamma lymphocyte strain IU / ml stimulation index Hiss-747 GEX- Hiss-747 NN GEX- NN

C3H 8.63.0 3.21.1 7.00.4 4.010.9 C3H 23.65.9 8.82.9 7.00.7 4.00.2 C3H 3.00.9 1.10.1 16.011.9 1.02.1 Positive 2/3 - 1/3 BALB / c 2.70.2 1.30.2 40.05.0 24.03.0 BALB / c 23.64.3 3.00.3 15.04.4 8.01.8 BALB / c 33.77.2 5.90.3 16.011.5 10.04.2 Positive 213 - 3l3 -pGEX-NN: P. falciparum antigen not cross-reactive with Hiss-747.
Positive results are in bold.
Table 3.1b: Stimulation of cell proliferation and secretion of IFNJy by Hiss-772 after 3 immunizations with pNAK772.
Interfron proliferation mouse gamma lymphocyte strain IUlml Stimulation Index Hiss-772 GEX- Hiss-772 NN GEX- NN

C3H 0.90.1 0.70.1 23.912.0 10.712.9 C3H 0.90.2 0.60.1 1.72.0 3.32.1 C3H 0.80.2 0.90.2 6.60.1 5.82.6 Positive 013 - 113 -BALB / c 3.50.3 - - - 2.70.4 24.02.2 1 ~ .83.0 _ -BALB / c 1.90.3 1.20.4 31.37.1 5.60.9 BALBIc 3.20.9 1.50.2 25.012.1 6.91.5 Positive 1I3 ~ - ~ 313 -pGEX-NN: P. falciparum antigen not cross-reactive with Hiss-772.
Positive results are in bold Table 4.1: Cellular responses of mice after 5 immunizations with pNAK438 *.
mouse Prolifration (1.S.) IFN-y antibody scan C3H 2.30.3 2.22.0 -C3H 1.81.1 15.64.0 -C3H 3.21.3 0.50.2 -Positive 2/3 113 BALB / c 4.3 1.6 26.2 6.3 -BALB / c 5.30.6 29.38.5 -BALB / c 15.32.2 12.78.7 -Positive 3I3 313 * The response rates are represented in relation to the responses obtained by a threshold value.
The threshold value is calculated by averaging the responses of animals not immune and that of animals immunized against a non-relevant antigen, such as OspC, a protein Borrelia burgdorferi.
Table 4.2: Expression detection by IFI with human antibodies immunopurified or specific mouse sera anti-Hiss-680 a-Hiss-680 Parasites * mice or humans Sporozotes P. falciparum ++

Sporozotes P. yoel clone ++
1.1 Hpatic stage P. falciparum ++

T23 ++ / +++ blood stage (75%) rings / schizonts ++ / +++ (75%) NF54 blood stage rings / schizonts * The sporozoites of Plasmodium falciparum come from the strain NF54.
T23: strain of Thai origin; NF54 strain of African origin.

Table 5.1: Cross-reactivities detected in Western blots between Strong reaction Average reaction E: immunopurified antibodies (eluted) on the recombinant proteins corresponding.
P: recombinant protein.
Table 5.2: Cross-reactivities at the nucleotide level between the clones from the Pfl1-1 family *
PM PCR571 clones 1 control probe 43 +++ ++

88 ++ 0 322 +++++ +++++

525 ++++ +++++

563 ++++ ++++

571 +++++ +++++

676f +++++ ++++

729E +++ +++++

263 ++++ NT

381 ++ NT
._ -453 +++ I NT
l * The signal strength is symbolized by crosses.
NT: not tested.
family members Pf11-1 Table 5.3: Sequence homologies of the clones studied by BLAST
Size Rptitions Homology Degree of homology amino acids with 571 lone (bp) Nuclotides Nuclotides Proteins Proteins DG43 900 PIVeELLEE Pf11-1 Part 1: 94%, 80%, 80%
100% (= 88) DG88 900 PIVeELLEE Pf11-1 Part 1: 94%, Same as DG43 100% (= 43) DG263-7253 No P, falciparum Chr 12 -95%, 60%

DG263-8176 No P. f. CHR12 95%, 45% -human chr22 58%

DG322-1500, - - -DG322-22000 PeeVLEEvI Pf11-1 86%, 65% 79% -DG381 400 PEkIvEEVI plastid tRNA 100%, CHR2-71%

DG453 300 PIVEEvVEE Pf11-1 Part 2 88%, 83% 93%, 72%

DG525 450 PeIeEVEvI GLURP R2 98%, 100% -DG563 438 PIVEEvvEE Pf11-1 Part 4: 86%, 75%, 56%, Part 1 68%

DG571 550 PEEiIEEiv Pf11-1 Part 5 87%, 100%, 100%
55%

DG676f 2000 PvVEEvLEE Pf11.1 Part 488%, Part74%, 44%
5 75%

DG729E 1.7 - ma13P5 100% -1: Estimated size in relation to the PCR products obtained, or the precise size when the whole clone has been sequenced.
CHR: Chromosome; part: part Table 5.4: Reactivity in IFIs tested with antibodies specific for Hiss-571 and Vi571 Parasites a-Hiss-571, aVi571 mice or humans Sporozotes P. falciparum NF54 ++

Sporozotes P. yoel clone 1.1 ++

Hpatic stage P. falciparum ++

Blood stage T23 rings / schizonts ++ / +++ (75%) NF54 blood stage rings / schizonts ++ / +++ (75%) Table 5.5: Cellular responses of mice immunized with pNAK571 Interfron proliferation mouse gamma lymphocyte strain IU / ml stimulation index 571 pGEX NNpGEX 571 pGEX
NNpGEX

C3H dead 0.9 0.1 0.7 0.05 31.0 2.5 21.2110.6 C3H 0.90.2 0.70.1 30.22.6 10.502.03 C3H 0.80.2 0.90.2 16.80.1 6.652.8 Positive 013 - 213 -BALB / c 3.50.3 2.70.13 23.1 0.9 10.362.2 BALB / c 1.90.3 1.20.1 15.92.1 8.633.9 BALB / c (dead) 3.20.9 1.50.1 5.31.3 1.060.5 Positive 213 - 313 -NNpGEX: recombinant GST fusion of LSA3 not relevant.
Although the present invention has been described in relation to the embodiments concrete and privileged, it will appear obvious to people paid in the art or science involved that it is possible to introduce some number of variations and modifications without departing from the scope of the invention described in this document.

Claims (41)

1. Polynucléotide purifié caractérisé en ce qu'il comprend une séquence nucléotidique ayant au moins 60 %, préférablement au moins 80% et plus préférablement au moins 95% d'identité avec la SEQ ID NO: 1 (DG747) ou la SEQ ID NO: 2 (DG772). 1. Purified polynucleotide characterized in that it comprises a sequence nucleotide having at least 60%, preferably at least 80% and more preferably at least 95% identity with SEQ ID NO: 1 (DG747) or the SEQ ID NO: 2 (DG772). 2. Polynucléotide purifié caractérisé en ce qu'il comprend au moins 10 nucléotides consécutifs identiques à la SEQ ID NO: 1 ou la SEQ ID NO: 2. 2. Purified polynucleotide characterized in that it comprises at least 10 consecutive nucleotides identical to SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2. 3. Polynucléotide purifié caractérisé en ce qu'il s'hybride dans des conditions de fortes stringences avec un polynucléotide selon la revendication 1 ou la revendication 2. 3. Purified polynucleotide characterized in that it hybridizes in terms high stringencies with a polynucleotide according to claim 1 or the claim 2. 4. Polypeptide purifié caractérisé en ce qu'il est codé par un polynucléotide selon l'une quelconque des revendications 1 à 3. 4. Purified polypeptide characterized in that it is coded by a polynucleotide according to any one of claims 1 to 3. 5. Polypeptide purifié caractérisé en ce qu'il présente au moins 60 %, préférablement au moins 80% et plus préférablement au moins 95% d'homologie avec la SEQ ID NO: 3 (DG747) ou la SEQ ID NO: 4 (DG772). 5. Purified polypeptide characterized in that it has at least 60%, preferably at least 80% and more preferably at least 95% homology with SEQ ID NO: 3 (DG747) or SEQ ID NO: 4 (DG772). 6. Polypeptide purifié caractérisé en ce qu'il comprend au moins 5 acide aminés consécutifs identiques à l'une des séquences choisies dans le groupe constitué par les SEQ ID NOs: 3 à 7, et la SEQ ID NO: 8. 6. Purified polypeptide characterized in that it comprises at least 5 acids consecutive amines identical to one of the sequences chosen from the group consisting of SEQ ID NOs: 3 to 7, and SEQ ID NO: 8. 7. Polypeptide purifié caractérisé en ce qu'il présente au moins 40%
d'identité avec un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 4 à
6.
7. Purified polypeptide characterized in that it has at least 40%
identity with a polypeptide according to any one of claims 4 to 6.
8. Polypeptide recombinant ou chimérique caractérisé en ce qu'il comprend au moins un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 4 à 7. 8. Recombinant or chimeric polypeptide characterized in that it comprises at least one polypeptide according to any one of claims 4 to 7. 9. Antigène caractérisé en ce qu'il consiste en un polynucléotide selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, ou en un polypeptide selon l'une quelconque des revendications 4 à 8. 9. Antigen characterized in that it consists of a polynucleotide according to one any one of claims 1 to 3, or a polypeptide according to one any of claims 4 to 8. 10. Conjugué antigénique constitué de polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, et/ou de polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8; et d'un support sur lequel lesdits polynucléotides/
polypeptides sont adsorbés.
10. Antigenic conjugate consisting of polynucleotides according to any one of claims 1 to 3, and / or of polypeptides according to any one of claims 4 to 8; and a support on which said polynucleotides /
polypeptides are adsorbed.
11. Conjugué selon la revendication 10 caractérisé en ce que le support est constitué de microsphères, de microparticules de billes de latex, de polyphosphoglycans (PGLA) ou de polystyrène. 11. Conjugate according to claim 10 characterized in that the support is consisting of microspheres, microparticles of latex beads, polyphosphoglycans (PGLA) or polystyrene. 12. Utilisation d'un conjugué selon la revendications 10 ou 11, pour l'immunisation d'individus infectés ou susceptibles d'être infectés par le paludisme. 12. Use of a conjugate according to claims 10 or 11, for immunization of individuals infected or likely to be infected with malaria. 13. Anticorps monoclonaux ou polyclonaux purifiés reconnaissants spécifiquement au moins une des polynucléotides, polypeptides et/ou conjugués définis aux revendications 1 à 11. 13. Recognized purified monoclonal or polyclonal antibodies specifically at least one of the polynucleotides, polypeptides and / or conjugates defined in claims 1 to 11. 14. Anticorps selon la revendication 13, caractérisé en ce qu'ils sont humanisés. 14. Antibody according to claim 13, characterized in that they are humanized. 15. Vecteur de clonage ou d'expression comprenant une séquence polynucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 à 3. 15. Cloning or expression vector comprising a sequence Polynucleotide according to any one of claims 1 to 3. 16. Un vecteur selon la revendication 15, dans lequel la dite séquence est incorporé dans un des sites non essentiel à la réplication dudit vecteur. 16. A vector according to claim 15, wherein said sequence is incorporated into one of the sites which is not essential for the replication of said vector. 17. Un vecteur selon la revendication 15 ou 16, caractérisé en ce que ledit vecteur est choisi parmi les plasmides, les cosmides ou les phages. 17. A vector according to claim 15 or 16, characterized in that said vector is chosen from plasmids, cosmids or phages. 18. Cellule hôte comprenant un vecteur selon l'une quelconque des revendications 15 à 18. 18. Host cell comprising a vector according to any one of claims 15 to 18. 19. Cellule E.Coli recombinante choisie parmi les cellules déposées à la C.N.C.M. le 23 Mai 2001 sous les numéros d'accession I-2671 et I-2672. 19. Recombinant E. Coli cell chosen from the cells deposited at the CNCM on May 23, 2001 under accession numbers I-2671 and I-2672. 20. Composition immunogène comprenant:
- au moins un des éléments suivants: des polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, des polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8, des conjugués selon la revendication 10 ou 11; et - au moins un véhicule pharmaceutique acceptable.
20. Immunogenic composition comprising:
- at least one of the following: polynucleotides according to one any of claims 1 to 3, polypeptides according to one any of claims 4 to 8, conjugates according to claim 10 or 11; and - at least one acceptable pharmaceutical vehicle.
21. Composition immunogène selon la revendication 20 caractérisée en ce qu'elle contient de plus au moins un composé choisi dans le groupe constitué
par l'alun, le QS21, le montanide, l'adjuvant SBAS2 et l'adjuvant incomplet de Freund.
21. Immunogenic composition according to claim 20, characterized in that that it additionally contains at least one compound chosen from the group consisting through alum, QS21, montanide, SBAS2 adjuvant and incomplete adjuvant Freund.
22. Composition immunogène selon la revendication 20 ou 21, caractérisée en la molécule polypeptidique est adsorbé sur des microparticules. 22. Immunogenic composition according to claim 20 or 21, characterized in the polypeptide molecule is adsorbed on microparticles. 23. Composition immunogène selon l'une quelconque des revendications 20 à
22, dans laquelle ladite molécule polynucléotidique est sous forme d'ADN.
23. Immunogenic composition according to any one of claims 20 to 22, wherein said polynucleotide molecule is in the form of DNA.
24. Composition immunogène selon l'une quelconque des revendications 20 à
23 caractérisée en ce qu'elle comprend de plus au moins un épitope choisi dans le groupe constitué par: les protéines CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1,TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II et LSA-3.
24. Immunogenic composition according to any one of claims 20 to 23 characterized in that it further comprises at least one epitope chosen from the group consisting of: proteins CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1, TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II and LSA-3.
25. Composition immunogène selon l'une quelconque des revendications 20 à
24 caractérisée en ce qu'elle permet l'obtention de réponse cellulaire et/ou humorale in vivo et/ou in vitro.
25. Immunogenic composition according to any one of claims 20 to 24 characterized in that it makes it possible to obtain a cellular response and / or humoral in vivo and / or in vitro.
26. Composition immunogène selon les revendications 24 ou 25, caractérisée en ce qu'elle permet la production d'interféron-.gamma. par des leucocytes de sujets immunisés par des sporozoïtes irradiés. 26. Immunogenic composition according to claims 24 or 25, characterized in that it allows the production of interferon-.gamma. by leukocytes from topics immune to irradiated sporozoites. 27. Composition immunogène selon l'une quelconque des revendications 24 à
26, caractérisée en ce qu'elle permet l'obtention d'une réponse humorale IgG.
27. Immunogenic composition according to any one of claims 24 to 26, characterized in that it makes it possible to obtain an IgG humoral response.
28. Composition immunogène selon la revendication 27, caractérisée en ce qu'elle permet l'obtention de réponse humorale de type IgG1, IgG2, IgG3 et/ou IgG4. 28. Immunogenic composition according to claim 27, characterized in that that it allows the obtaining of an humoral response of the IgG1, IgG2, IgG3 and / or IgG4. 29. Composition immunogène selon l'une quelconque des revendications 20 à
28, caractérisée en ce qu'elle est capable d'induire, in vivo et in vitro, une protection par une infection d'épreuve par Plasmodium falciparum.
29. Immunogenic composition according to any one of claims 20 to 28, characterized in that it is capable of inducing, in vivo and in vitro, a protection by challenge infection with Plasmodium falciparum.
30. Vaccin anti-palustre comprenant:
- au moins un des éléments suivants: des polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, des polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8, des conjugués selon la revendication 10 ou 11; et - au moins un véhicule pharmaceutique acceptable.
30. Anti-malaria vaccine comprising:
- at least one of the following: polynucleotides according to one any of claims 1 to 3, polypeptides according to one any of claims 4 to 8, conjugates according to the claim 10 or 11; and - at least one acceptable pharmaceutical vehicle.
31. Vaccin selon la revendication 30, caractérisé en ce qu'il comprend de plus au moins un épitope choisi dans le groupe constitué par: les protéines CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1, TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II et LSA-3. 31. Vaccine according to claim 30, characterized in that it further comprises at least one epitope chosen from the group consisting of: proteins CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1, TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II and LSA-3. 32. Composition pharmaceutique comportant à titre de substance active un ou plusieurs anticorps polyclonaux ou monoclonaux selon la revendication 13 ou 14, en association avec un véhicule pharmaceutique acceptable. 32. Pharmaceutical composition comprising, as active substance, one or more several polyclonal or monoclonal antibodies according to claim 13 or in combination with an acceptable pharmaceutical vehicle. 33. Composition pharmaceutique selon la revendication 32, caractérisée en ce qu'elle comprend de plus au moins un composé choisi dans le groupe constitué
par l'alun, le QS21, le montanide, l'adjuvant SBAS2 et l'adjuvant incomplet de Freund.
33. Pharmaceutical composition according to claim 32, characterized in that that it further comprises at least one compound chosen from the group consisting alum, QS21, montanide, SBAS2 adjuvant and incomplete adjuvant Freund.
34. Utilisation d'au moins un des éléments suivants: polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8, conjugués selon la revendication 10 ou 11; anticorps selon la revendication 13 ou 14; pour la fabrication d'un médicament destiné
au traitement du paludisme.
34. Use of at least one of the following: polynucleotides according to any one of claims 1 to 3, polypeptides according to any one claims 4 to 8, conjugated according to claim 10 or 11; antibody according to claim 13 or 14; for the manufacture of a medicinal product intended at treatment of malaria.
35. Méthode de diagnostic in vitro du paludisme chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum comprenant les étapes suivantes a) la mise en contact, dans des conditions permettant une réaction immunologique, d'un tissu et/ou d'un fluide biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum avec un anticorps selon la revendication 13 ou 14 afin de permettre la formation de complexes immuns; et b) la détection in vitro des complexes immuns formés A 35. Method for in vitro diagnosis of malaria in a susceptible individual to be infected with Plasmodium falciparum including the following steps a) contacting, under conditions allowing a reaction immunological, tissue and / or biological fluid taken from a individual likely to be infected with Plasmodium falciparum with a antibody according to claim 13 or 14 in order to allow the formation immune complexes; and b) in vitro detection of immune complexes formed A 36. Méthode de diagnostic in vitro du paludisme chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum comprenant les étapes suivantes a) la mise en contact, dans des conditions permettant une réaction immunologique, d'un tissu et/ou d'un fluide biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par Plasmodium falciparum au moins un des éléments suivants: des polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3; des polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8, des conjugués selon la revendication 10 ou 11;
afin de permettre la formation de complexes immuns impliquant au moins une desdites conjugués et des anticorps éventuellement présents dans ledit tissu ou ledit fluide biologique; et b) la détection in vitro des complexes immuns éventuellement formés.
36. Method for in vitro diagnosis of malaria in a susceptible individual to be infected with Plasmodium falciparum including the following steps a) contacting, under conditions allowing a reaction immunological, tissue and / or biological fluid taken from a individual likely to be infected with Plasmodium falciparum at least one of the following: polynucleotides according to any one claims 1 to 3; polypeptides according to any one of claims 4 to 8, conjugates according to claim 10 or 11;
in order to allow the formation of immune complexes involving at at least one of said conjugates and possibly antibodies present in said tissue or said biological fluid; and b) in vitro detection of any immune complexes that may have formed.
37. Méthode selon la revendication 35, caractérisée en ce qu'à l'étape a), le tissu et/ou le fluide biologique est de plus mis en contact avec au moins un épitope choisi dans le groupe constitué par: les protéine CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1,TRAP,STARP,SALSA,SALSA I,SALSA II ou LSA-3. 37. Method according to claim 35, characterized in that in step a), the tissue and / or biological fluid is further contacted with at least one epitope chosen from the group consisting of: the proteins CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1, TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II or LSA-3. 38. Kit pour le diagnostic in vitro du paludisme comprenant les éléments suivants:

a) au moins un des éléments choisi dans le groupe constitué par: les polynucléotides selon l'une quelconque des revendications 1 à 3; les polypeptides selon l'une quelconque des revendications 4 à 8, les conjugués selon la revendication 10 ou 11;

b) des réactifs pour la constitution du milieu propice à une réaction de liaison entre un échantillon à tester et au moins une des molécules définies en a); et c) des réactifs permettant la détection de complexes antigènes-anticorps produits par ladite réaction de liaison, ces réactifs pouvant également porter un marqueur ou être susceptibles d'être reconnus à leur tour par un réactif marqué.
38. Kit for the in vitro diagnosis of malaria comprising the elements following:

a) at least one of the elements chosen from the group consisting of:
polynucleotides according to any one of claims 1 to 3; the polypeptides according to any one of claims 4 to 8, the conjugates according to claim 10 or 11;

b) reagents for the constitution of the medium suitable for a reaction of bond between a sample to be tested and at least one of the molecules defined in a); and c) reagents for the detection of antigen-antibody complexes produced by said binding reaction, these reagents can also carry a marker or be capable of being recognized in turn by a reagent Mark.
39. Kit pour le diagnostic in vitro du paludisme comprenant les éléments suivants:
- des anticorps selon la revendication 13 ou 14;
- des réactifs pour la constitution du milieu propice à une réaction de liaison entre un échantillon à tester et au moins un desdits anticorps; et - des réactifs permettant la détection de complexes antigènes-anticorps produits par ladite réaction de liaison, ces réactifs pouvant également porter un marqueur ou être susceptibles d'être reconnus à leur tour par un réactif marqué.
39. Kit for the in vitro diagnosis of malaria comprising the elements following:
- antibodies according to claim 13 or 14;
- reagents for the constitution of the medium favorable to a reaction of binding between a test sample and at least one of said antibodies; and - reagents for the detection of antigen-antibody complexes produced by said binding reaction, these reagents also being able to wear a marker or be likely to be recognized in turn by a labeled reagent.
40. Le kit pour le diagnostic in vitro du paludisme selon la revendication 38, caractérisé en ce qu'il comprend de plus au moins une molécule peptidique choisie dans le groupe constitué par: les protéine CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1,TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II et LSA-3. 40. The kit for the in vitro diagnosis of malaria according to claim 38, characterized in that it further comprises at least one peptide molecule chosen from the group consisting of: proteins CS, MSP-1, MSP-3, LSA-1, TRAP, STARP, SALSA, SALSA I, SALSA II and LSA-3. 41. Kit pour le diagnostic in vitro du paludisme selon l'une quelconque des revendications 38 à 40, caractérisé en ce qu'il comprend également l'adjuvant SBAS2. 41. Kit for the in vitro diagnosis of malaria according to any one of the Claims 38 to 40, characterized in that it also comprises the adjuvant SBAS2.
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