CA2321303C - Methode de determinataion de l'espace forme par un ensemble de molecules au moyen de distances metriques minimales - Google Patents
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Abstract
L'invention concerne plusieurs techniques permettant de caractériser des molécules en fonction de la forme de leur champ. On utilise la distance minimale entre deux champs moléculaire comme métrique de forme indépendante de la structure chimique sous-jacente et une description multidimensionnelle de la forme spatiale des molécules est ainsi produite. L'invention concerne également des modes d'utilisation ces attributs pour créer et caractériser des bases de données de molécules et de faire des recherches dans ces dernières, en se référant à la similarité de champ. Ces attributs permettent en particulier d'effectuer des recherches dans une base de données dans un temps sous-linéaire. La portée de cette approche est ensuite étendue par la description de moyens permettant de diviser automatiquement les molécules en une série de fragments au moyen d'une décomposition gaussienne ellipsoïdale. Ce procédé permet non seulement d'analyser ces fragments à l'aide de la technique de métrique de forme décrite ci-dessus, mais les paramètres de cette décomposition eux-mêmes peuvent en outre être utilisés pour poursuivre l'organisation de la base de données et les recherches dans cette dernière. On peut également utiliser le procédé ellipsoïdal pour délimiter des sites de liaison ou des sites actifs sur des macromolécules au moyen d'une matrice de recherche de molécules complémentaires dans une base de données du type décrit. L'application la plus immédiate de ces techniques est la recherche et la conception de médicaments pharmaceutiques.
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