CA2075067A1 - Auto-inactivating aviary vector - Google Patents
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Abstract
2075067 9111190 PCTABS00105 La présente invention a pour objet un vecteur viral auto-inactivant d'intégration et d'expression d'au moins un gène hétérologue dans des cellules aviaires, caractérisé en qu'il est constitué à partir du génome proviral d'un rétrovirus aviaire et qu'il comprend entre deux séquences LTR aviaires lesdit(s) gène(s) hétérologue(s) qui se trouve(nt) sous le contrôle d'um promoteur interne hétérologue, des délétions ou des mutations dans la LTR 3' ayant été effectuées de manière à inactiver les promoteurs viraux présents dans les LTR.2075067 9111190 PCTABS00105 The present invention relates to a self-inactivating viral vector for integration and expression of at least one heterologous gene in avian cells, characterized in that it is formed from the proviral genome of a retrovirus. avian and that it comprises between two avian LTR sequences the said heterologous gene (s) which is (are) under the control of a heterologous internal promoter, deletions or mutations in the 3 'LTR having were carried out so as to inactivate the viral promoters present in the LTRs.
Description
WO 91/11190 PCI/FRgl/00062 207aOfi7 ~UR AUTO-INACTIVANT AVIAIRE
La présente invention concerne de nouveaux vecteurs rétroviraux, d'origines aviaires, d'inté~ration et d'expression d'au moins un gène hétérologue dans des cellules aviaires.
La présente invention constitue un développement des inventions décrites dans les demandes de brevets européen EP 178 996 et international WO 89/03877 au nom de la présente demanderesse. Il conviendra de s'y reporter si nécessaire pour la meilleure intelligence de la présente invention.
Par gène héterologue, on entend désigner un gène qui ne se trouve pas dans le ~énome aviaire d'origine et de préférence qui ne se trouve pas dans le génome d'un virus. Il peut s'agir d'un gène utile codant pour une protéine d'intérêt industriel destinée à être obtenue par culture cellulaire ou bien d'un gène pouvant présenter un intérêt particulier pour l'élevage des oiseaux, notamment les poulets ou les cailles, ou encore un gène codant pour une protéine immunogène destinée à servir de vaccin, ou encore il peut s'agir d'un gène marqueur en particulier de résistance à un antibiotique.
Les rétrovirus sont maintenant largement utilisés pour le transfert de gène à cause de leur efficacité élevée en ce qui concerne à la fois leur pénétration à travers la membrane cellulaire ee l'intégration de leur génome dans l'ADN de la cellule hôte. Les vecteurs retroviraux dans lesquels les séquences étrangères insérées sont transcrites directement sous le contrôle de promoteurs internes, sont particulièrement intéressants. Ils permettent une traduction efficace de l'ARN transcrit sous la forme d'une protéine native. Toutefois, on ob5erve des interférences fonctionnelles entre les promoteurs viraux et interne5.
C'-5t pourquoi on a développé ~elon la présente invention une nouvelle génération de vecteurs rétroviraux aviaires. Ces vecteurs portent des mutations dans leurs "longues séquences répétées" terminales (séquences dites LTR) qui inactivent la transcription du provirus intégré
sans affecter l'expression des promoteurs internes.
WO 91/lll90 PCr/FR9ltOO~2 WO 91/11190 PCI/FRgl/00062 207aOfi7 ~UR SELF-INACTIVATING AVIAN
The present invention relates to new vectors retrovirals, of avian origins, integration and expression of at least one heterologous gene in avian cells.
The present invention constitutes a development of the inventions described in European patent applications EP 178 996 and international WO 89/03877 in the name of the present applicant. He agree to refer to it if necessary for the best understanding of the present invention.
By heterologous gene, we mean a gene that does not not found in the ~ enome avian of origin and preferably which does not not found in the genome of a virus. It may be a useful gene encoding for a protein of industrial interest intended to be obtained by culture cell or a gene that may be of particular interest for raising birds, in particular chickens or quails, or a gene encoding an immunogenic protein intended for use as a vaccine, or yet it may be a marker gene in particular for resistance to a antibiotic.
Retroviruses are now widely used for the gene transfer because of their high efficiency with respect to the times their penetration through the cell membrane ee the integration of their genome into the DNA of the host cell. Retroviral vectors in which the inserted foreign sequences are transcribed directly under the control of internal promoters, are particularly interesting. They allow efficient translation of the RNA transcribed in the form of a native protein. However, functional interferences are observed between viral and internal promoters5.
C'-5t why we developed ~ according to the present invention a new generation of avian retroviral vectors. These vectors carry mutations in their terminal "long repeats"
(so-called LTR sequences) which inactivate the transcription of the integrated provirus without affecting the expression of internal promoters.
WO 91/III90 PCr/FR9ltOO~2
2 0 ~ 2 Ces vecteurs sont appelés SIN ("self inactivating"), c'est-à-dire auto-inactivants.
L'article de Dougherty et Temin 1987, PNAS 84, 1197-1201, décrit un vecteur auto-inactivant construit à partir du virus de dinde SNV
5 qui ne peut être amplifié que par la lignée D-17-Rev-A, laquelle en ou~re ne produit des virions infectieux essentiellement que sur les cellules de dinde et de chien, I'efficacité d'infection sur d'autres espèces aviaires étant très faible.
Plus précisément, la présente invention a pour objet un 10 vecteur viral d'intégration et d'expression d'au moins un gène hétérologue dans des cellules aviaires, constitué à partir d'un génome proviral provenant des rétrovirus aviaires AEV et rétrovirus aviaires apparentés notamment du type RAV ou RSV et comprenant entre deux séquences LTR aviaires le(s)dit(s) gène(s) hétérologue(s) qui se trouve(nt) sous le contrôle de 15 promoteur(s) interne(s) hé~érologue(s), caractérisé en ce que des délétions ou des mutations dans la LTR 3' ont été effectuées de manière à inactiver les promoteurs viraux présents dans les LTR, ladite LTR 3' provenant des rétrovirus RAV-O, RAV-I, RAV-2.
Les modifications de structures du génome viral apportées par 20 les vecteurs selon l'invention inactivent totalement les promoteurs viraux présents dans les LTR des formes provirales intégrées dans les cellules cibles du transfert.
Par promoteur interne hétérologue, on entend désigner un promoteur qui ne se trouve pas naturellement dans le génome d'un 25 rétrovirus aviaire et que l'on a placé entre les deux 5équences LTR.
Dans un mode de réalisation 5elon l'invention, le promoteur ou la séquence enhancer, selon les cas, de la LTR 3' du génome viraJ sont délétés en tout ou partie. Le virus issu de ce génome introduit dans Je génome des cellules infectées un provirus dont la LTR S' est copié sur la 30 LTR 3' selon le processus classique de synthèse de l'ADN proviral à partir de l'ARN virionique.
Plus précisément, on effectue une délétion dans la région U3 de la LTR 3'.
WO 91/11190 PCI~FR91/00062 2 0 ~ 2 These vectors are called SIN ("self inactivating"), i.e.
self-inactivating.
The article by Dougherty and Temin 1987, PNAS 84, 1197-1201, describes a self-inactivating vector constructed from SNV turkey virus 5 which can only be amplified by the D-17-Rev-A line, which in ou ~ re only produces infectious virions on the cells of turkey and dog, the effectiveness of infection on other avian species being very weak.
More specifically, the present invention relates to a 10 viral vector for integration and expression of at least one heterologous gene in avian cells, consisting of a proviral genome from avian retroviruses AEV and related avian retroviruses, in particular RAV or RSV type and comprising between two avian LTR sequences the said heterologous gene(s) which is/are under the control of 15 promoter (s) internal (s) he ~ erologist (s), characterized in that deletions or mutations in the 3' LTR have been made in such a way as to inactivate the viral promoters present in the LTRs, said 3' LTR originating from the retroviruses RAV-O, RAV-I, RAV-2.
The structural modifications of the viral genome brought about by the vectors according to the invention totally inactivate the viral promoters present in the LTRs of the proviral forms integrated into the cells transfer targets.
By heterologous internal promoter is meant a promoter that is not found naturally in the genome of a 25 avian retrovirus and which was placed between the two 5 LTR sequences.
In one embodiment 5 according to the invention, the promoter or the enhancer sequence, depending on the case, of the 3' LTR of the viraJ genome are deleted in whole or in part. The virus resulting from this genome introduced into Je genome of infected cells a provirus whose LTR S' is copied from the 30 LTR 3' according to the classic process of proviral DNA synthesis from virionic RNA.
More specifically, a deletion is made in the U3 region of the 3' LTR.
WO 91/11190 PCI~FR91/00062
3 207~67 En particulier, on peut procéder à des mutations ou délétions ponctuelles dans les boîtes CAAT et TATA ou éliminer lesdites boîtes.
Etant donné que la région U3 de la LTR 3' sert de matrlce pour la synthèse de la région correspondante de la LTR 5' dans ~a 5 transcription inverse, toute mutation dans U3 dans la LTiR 3' apparaît dans les deux LTR après un cycle de réplication virale. C'est pourquoi la mutation qui détruit le promoteur de la LTR 3' donne naissance à un provirus inactif dans les cellules infectées. Toutefois, on a observe qu'une transcription à partir d'un promoteur interne, peut toujours avoir lieu.
Dans le cas où on utilise une LTR 3' issue d'un virus dont les LTR sont naturellement très peu actives, il suffit alors de procéder à des - délétions ou mutations ponctuelles pour inactiver les promoteurs viraux présents dans les LTR. On peut citer comme LTR 3' naturellement très peu active celle du virus RAV-0.
Les délétions dans la LTR 3' influencent non seulement l'inactivation des vecteurs mais aussi l'efficacité du transfert dans les cellules c'est pourquoi, selon une autre caractéristique de la présente invention, les vecteurs portent en 5' la LTR du virus RSV (virus du sarcome 20 de Rous). Cette LTR possède une activité transcriptionnelle très élevée.
notamment plus élevée que celle des virus RAV-I et RAV-2~ Ce5 constructions améliorent la transcription du génome viral Jors de la transfcction des cellules helper et par conséquent augmentent le nombre de particules virales produites~
Dans les vecteurs selon l'invention, le5 gènes héterologues (gènes de sélection ou gène utile) sont de fason appropriée sous le contrôle de promoteurs internes hétérologues. Toutefois, dans le cas du gène de sélection, celui-ci peut être animé directement par la LTR 5' et non pas associé à un promoteur interne propre, le gène hétérologue utiie etant sous 30 le contrôle de promoteurs internes hétérologues.
Dans les génomes des vecteurs SIN selon l'inventlon. on peut intégrer des unités transcriptionnelles dans lesquelles le gène hétérologue WO 91/111g0 PCI/FR91/00062 est associé à son propre promoteur dans son génome d'origine, à titre de promoteur interne hétérologue. Dans les cellules infectées, seuls ces promoteurs internes seront alors fonctionnels.
Le fonctionnement correct de ces vecteurs a été vérifié et les résultats sont présentés ci-après.
D'une part, I'expression des gènes insérés est initiée au niveau de leurs promoteurs internes respectifs. D'autre part, dans les cellules infectées les LTR des vecteurs deviennent inactives. Enfin, les vecteurs ne peuvent ressortir des cellules infectées, même après infection de ces dernières avec un virus assistant (helper) compétent.
Les vecteurs selon l'invention apportent par conséquent une grande sécurité d'utilisation puisque dans les cellules infectées d'une part, les LTR inactives ne peuvent altérer le fonctionnement des sequences génétiques adjacentes au site d'insertion du provirus, et d'autre part le provirus ne peut plus générer de virus transmissible.
Dans un mode de réalisation particulier, les vecteurs ont été
construits à partir d'élémcnts de génome issus des rétrovirus RAV-I, RAV-2 et/ou AEV en ce qui concerne la partie entre les deux LTR.
On peut citer notamment des constructions vectorielles constituées cssentiellement à partir du génome du rétrovirus RAV-2 dans lequel les boîtes CAAT et TATA ont été délétées dans la LTR 3' dudit génome. Dans un mode de réalisation, le vecteur comporte comme LTR 3':
- la séquence U3 de la LTR de RAV-2 dans laquelle les boîtes CAAT et TATA ont été déléeés, et - les séquences R et U5 de la LTR de RAV-I.
De fason appropriée, les vecteurs selon l'invention comportent deux gènes hétérologues, à savoir un 8ène de sélection et un gène utile.
Lorsque le vecteur e5t construit à partir du génome du rétrovirus de l'érythroblastose aviaire (AEV), les gènes hétérologues sont avantageusement placés en positions des oncogènes v-erbA et v-erbB~
On entend par gène de sélection un gène marqueur de résistance notamment de résistance à une drogue analogue à un antibiotique. On peut citer en particulier le gène hygroR de résistance à
I'hygromycine G418 et le gène néo de résistance à la néomycine.
.
WO 91/11190 PCI'/FWI/00062 2o7~o67 Bien entendu, les gènes marqueurs qui ont été cites ne le son~
qu'à titre d'exemples purement illustratifs. Il est possibJe d'utiliser tout autre gène de résistance comme gène marqueur.
On entend par gène utile un gène codant pour une protéine 5 d'intérêt autre qu~un gène de sélection.
Dans un mode de mise en oeuvre approprié, les gènes hétérologues sont placés sous le contrôle de promoteurs internes hétérologues, notamment le promoteur simier SV40 ou métallothionéine humain MTlla.
Dans un mode de mise en oeuvre des vecteurs selon i'invention, le gène de sélection est placé sous le contrôle du promoteur simien SV40 et le gène hétérologue utile est placé sous le contrôle du promoteur métallothionéine humain lla (MTlla).
Dans un autre mode de mise en oeuvre, le gène de sélection 15 est animé directement par la LTR 5' et non pas associé à un promoteur propre.
Le sens de transcription d'un gène hétérologue inséré dans le vecteur doit être opposé à celui de la LTR dans le cas où ledit gène hétérologue contient une séquence de contrôle de polyadénylation. Dans le 20 cas contraire, le gène hétérologue pourra être inséré dans le sens de - transcription de la LTR, le transcrit dudit gène utilisant alors le signal polyA fourni par la LTR 3'. Dans Je cas où le gène héterologue inséré
contient des introns, ce gène doit obligatoirement être inséré dans le sens de transcription inverse, afin d'éviter toute interférence entre les signaux 25 de contrôle d'épissage de ce gène et ceux du génome viral.
Dans un mode de réalisation, le gene de sélection est inseré
dans le sens de transcription rétroviral et le gène utile est inséré dans le sens opposé par rapport a celui de la transcription rétrovrrale.
On a utilisé à titre d'exemple de gène hétérologue utile le 30 gène codant pour l'histone H5 et on a montré que l'expression de H5 dans des fibroblastes de caille ou de poulet normaux ou transformés n'a pas affecté significativement les propriétés de croissances des cellules transformées, mais a inhibé la prolifération des fibroblastes normaux.
WO 91/lllgO PCI/FR91/00062 6~
Selon un autre exemple, le gène hétérologue est le gène de E.
Coli codant pour la beta-galactosidase.
En particulier des vecteurs porteurs d'une LTR 3' dérivée du virus RAV-0, naturellement dépourvue de séquences enhancer, ont été
5 construits dans lesquels la boîte CAAT est délétée:
Ces vecteurs portent les séquences suivantes de 51 en 3~:
- une LTR 5' du virus RSV, - une séquence leader du virus RAV^l, - un ~ène de résistance, tel que NeoR, 10 - un ~ène hétérologue d'intérêt, tel que le gène de E. Coli codant pour une - beta-galactosidase rnunie d'un signal d'adre55age nucléaire, sous le con~rôle du promoteur du virus SV40, - la séquence non codante 3' et la LTR 3' du virus RAV-0 délétée de la boîte CAAT.
15Ces vecteurs ont été te5té5 et 50nt fonctionnels et offrent une sécurité maximum d'inactivation puisque la LTR RAV-0 en 3' a subi une délétion dans la séquence promoteur CAAT.
Compte tenu du fait que les rétrovirus aviaires sont des virus à ARN, la terminolo~ie virus pourra parfois dé5igner le génome proviral 20 sous forme d~ADN de même que dans certains cas le gène étranger pourra être sous forme d'ARN, en particulier lorsqu'il est inséré dans le génome d'un virion. Les techniques permettant de passer d'une forme ADN à 12 forme ARN et réciproquement, 50nt connues et sont la transcription et la transcription reverse. Le virus recombinant peut être utilisé tel quel sous 25 forme de virions ARN ou de génome proviral sous forme d'ADN comportant l'in~ertion d'un gène étranger lui aussi sous forme d'ADN et correspondant à la transcription reverse de l'ARN du ~irUs~ peut etre intégré dans un vecteur à ADN tel qu'un plasmide, un cosmide, ou un phage par exemple.
Pour des raisons de commodité, les constructions ont été
30 réalisées tout d'abord sur des plasmides comportant une séquence composite d'ADN correspondant au transcrit reverse d'un vecteur rétroviral à ARN
d'un virus tel que décrit précédemment.
WO 91/111gO PCI'/FIW1/00062 20750~7 La présente invention a également pour objet un procédé de préparation d'un vecteur selon l'invention caractérisé en ce qu~on effectue des délétions ou des mutations dans la LTR 3' aviaire de manière à
inactiver les promoteurs viraux présents dans lesdites LTR et en ce qu'on insère le(s)dit(s) gène(s) hétérologue(s) sous le contrôle d'un promoteur interne hétérolo~ue ou du promoteur de la LTR S'.
Dans un mode de mise en oeuvre du procédé, on insère dans le vecteur pDAI au site Xbal une cassette transcriptionnelle d'un gène hétérologuc.
Par exemple, la cassette transcriptionnelle du ~ène hétéro-logue consiste dans le vecteur pBO~ tel que représenté à la figure 6 dans lequel on,insère ledit gène hétérolo~ue au niveau des sites de restriction du polylinker compris entre la séquence d'initiation de transcription sous forme du promoteur MTlla et la séquence de terminaison de transcription et de polyadénylation dérivée du gène de l'histone HS, ladite cassette étant encadrée par deux site Xbal permettant son isolement puis son insertion au site Xbal unique du vecteur pDAI.
La pré-ente invention concerne en outre un procédé de ~, modification de cellules caractérisé en ce qu'on effectue une transfection ou infection selon les cas desdites cellules avec des vecteurs selon l'invention.
La présente invention concerne donc des cellules transfectées ;, ou infectées par les vecteurs selon l'invention qu'ils soient sous forme de plasmide ou de virus respectivement. Il est évident que la transfection 2S primaire sera en ~énéral effectuée avec des vecteurs de type plasmidique, ,~ c'est-à-dire que le rétrovirus aviaire sera sous forme de l'ADN de son génome mais en présence dc l'ADN d'un virus assistant de5 cellules transfectées vont dans ce cas se transformer et libérer les virus recombinants qui vont pouvoir transfecter d'autres cellules. Ce type de processus permet é~alement de constituer des stocks de virus vecteurs utilisables par la suite à la place des vecteurs plasmidiques.
~, : 35 ..
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WO 91/11190 PCr/FR91/00062 ?,Qr~6~
Les rétrovirus tels que AEV, RAV-I, RAV-2 sont défectifs pour leur réplication. Pour se répliquer, ces virus nécessitent la présence dans la meme cellule hôte d'un virus assistant fonctionnel comme il est connu de l'homme de l'art.
La présente invention a également pour objet un procédé de modification de cellules caractérisé en ce qu'on effectue une co-infection ou co-transfection selon les cas avec un virus assistant qui comporte les gènes assurant la réplkation dudit vecteur.
Les cellules modifiées selon l'invention peuvent être diverses mais sont de préférençe des cellules aviaires, de type hématopoiétique, germinale ou de type fibroblastique.
Les cellules préférées pour la mise en oeuvre des vecteurs de I'invention sont les fibroblastes d'embryon de poulet ou de caille. Toutefois les vecteurs selon l'invention permettent de modifier des cellules de dinde, de canard et d'autres oiseaux.
Enfin, I'invention concerne le procédé de préparation d'un protéine déterminée dans lequel on cultive les cellules modifiées par un vecteur selon l'invention dans lequel un gène étranger code pour ladite protéine et en ce que l'on récupère la protéine de la culture cellulaire.
D'autres avantages et caractéristiques de la présente invention apparaîtront à la lumière de la description détaillée d'un exemple de réalisation donné à titre purement illustratif et comme modèle pour I'intégration et l'expression d'un gène hétérologue, en utilisant le gène de I'histone H5.
La description qui va suivre est faite en référence aux figures I à 8.
~`
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~, ;~..
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W O 91/llt90 PCT/FR91/00062 20750~7 Fi~ure 1 schema illustrant le transfert de la délétlon de la 3'LTR a la S'LTR (1) Un ~octeur retrotrlrai delot~ tans le promotour de 3'LTR t portant un g~no otrang-r (~) a~oo son propre promoteur (P), ost transfecte dans dos cellules helper ~2) Apre~
S m tegratior, l'ADN proriral est transcrit a partir tu promoteur de 5'LTR, et les transcrlts trlraux contenant la deletlon dans la realon U3 sont encapsid~J dans dos part~culos vlralo6 snfectleuse~ (3) Dan~ des ccllules mfectees par ce~ partlculcs v rale~ dépourvuos de helper, l'ARN viral est transcrit par transcrlptlon m~rerse dans une moleculke d'ADN double-brln montrane une rogion U3 dol~t~o dan~ los doux LTR A m sl, tans ces cellules, la transcriptlon trlralo est a~olie et soule la transcr~ption a partir du pro~ot-us int-rne peut avoir lieu Le trlangle m t~qu- la t~lotlon; ca-- bachuro- rogion U3, case po mt~ o rogion US, caJo clairo rogion R
Fiogs~ ! Stsucture de LTR normalos (en ~aut) et deletées (en as~ La iocaii~atlon tes slgnaux de rogulatlon transcrlptlonneile est ~ndlqu~o L J ZOn-J hachur-o ot po m till-- dans la roglon U3 ~ 20 reprosentont reJpeCtlvem nt les reg~ons tu enhancor et du ; p~omotour La rogion U3 teleteo ~provonant to l'ADN provir~1 RA~-2) a oto la~o, par los llD~ers Clal, aux reg~ons R ot US de la LTR te RAV-1 L- trlanglo po~nt~llo ~ntiquo l'~t-ntuo do la et~on~ (~) Struoturo doo voctouro rotrov~raux. Dan~ pT2~3', ter~vo d'AEV, le gono to ro~stanoo a la ~ooryo~no (3001 ost transcrlt dpu~s la LTR v~ralo, alors qu- tans pDAl, ~1 ost ~ranscr~t a partir du promotsur to SV40 m t-rno (SV) pDAl, doslve essontlellomont to RAV-~, contlont un- reglon U3 doleteo dan~ 13 ;~'LTR pDA~Y et pDA~S ont ete derlv~s to pDAl on msérant respoct~vement les genes nph (reslstanco a l'hygromyc m e) e~ ~i ~os ~loohos ~ntlqu-nt la tlroct~on transor~ptlonnolle dos ~f'erents genes Dans pDA~Y, 13 r~g~on codant pour hph, llée ~u 2a~'6~ 1 o slte de polyadenylatlon du gene de la thym~d m e kina~e (Tk), a ete placée SOUQ le contrôle du promoteur de SV40. Dans pDA~5, le promo~eur de la mctal1Othlonelno humalno MT-IIA (MT) a eté Ut:il3e pour transcrlre le gene ~5 contenant son propre slgnal de polyadenylatlon (Pol HS). Ca~es hachuree. clalre et po~nt;llee.
reJpectl~ement LTR de AEV, RAV-2 ot RAV-1; SD et SA:
r-~p-ctlve~ nt donn-ur t acoept-ur d'~p~Jage; ~U3; r~g~on U3 déletee; ~o: ~hol; ~: a~al; C:Clal. L'eohelle (en paires de kilobases:kb) est lndlquée en bas.
F~ e 3 .4nalyse par Southorn blott m g de cellules OT6 lnrectees par DAH5. 15 ~g d'ADN, l~olé de cellule~ lnfecte-~ (bande~ 5 et ~!
et non 1~fectees (ba~de~ 4 et 6), ont ete digereq par ~bal (bandes 3 207~67 In particular, mutations or deletions can be made in the CAAT and TATA boxes or eliminate said boxes.
Since the U3 region of the 3' LTR serves as a matrix for the synthesis of the corresponding region of the 5' LTR in ~a 5 reverse transcription, any mutation in U3 in the 3' LTiR appears in both LTRs after one cycle of viral replication. This is why the mutation that destroys the 3' LTR promoter gives rise to a inactive provirus in infected cells. However, it has been observed that a transcription from an internal promoter can still take place.
In the case where a 3' LTR from a virus whose LTR are naturally very inactive, it is then sufficient to carry out - point deletions or mutations to inactivate viral promoters present in the LTRs. We can cite as LTR 3 'naturally very little activates that of the RAV-0 virus.
Deletions in the 3' LTR influence not only the inactivation of the vectors but also the efficiency of the transfer in the cells therefore, according to another characteristic of the present invention, the vectors carry in 5′ the LTR of the RSV virus (sarcoma virus 20 of Rous). This LTR has a very high transcriptional activity.
notably higher than that of the RAV-I and RAV-2 ~ Ce5 viruses constructs improve the transcription of the viral genome Jors of the transfcction of helper cells and consequently increase the number of viral particles produced~
In the vectors according to the invention, the5 heterologous genes (selection genes or useful gene) are appropriately under the control heterologous internal promoters. However, in the case of the gene for selection, this one can be animated directly by the LTR 5' and not associated with its own internal promoter, the heterologous gene used being under control of heterologous internal promoters.
In the genomes of the SIN vectors according to the inventlon. one can integrate transcriptional units in which the heterologous gene WO 91/111g0 PCI/FR91/00062 is associated with its own promoter in its original genome, as heterologous internal promoter. In infected cells, only these internal promoters will then be functional.
The correct operation of these vectors has been verified and the results are presented below.
On the one hand, the expression of the inserted genes is initiated at the level of their respective internal promoters. On the other hand, in cells infected the LTRs of the vectors become inactive. Finally, the vectors can emerge from infected cells, even after infection of these latest with a competent helper virus.
The vectors according to the invention therefore provide a great safety of use since in the infected cells on the one hand, inactive LTRs cannot alter the functioning of the sequences genes adjacent to the site of insertion of the provirus, and on the other hand the provirus can no longer generate transmissible viruses.
In a particular embodiment, the vectors have been constructed from genome elements derived from retroviruses RAV-I, RAV-2 and/or AEV for the portion between the two LTRs.
Mention may in particular be made of vector constructions consisting essentially of the genome of the RAV-2 retrovirus in which the CAAT and TATA boxes have been deleted in the 3' LTR of said genome. In one embodiment, the vector comprises as 3' LTR:
- the U3 sequence of the LTR of RAV-2 in which the boxes CAAT and TATA have been removed, and - the R and U5 sequences of the LTR of RAV-I.
Appropriately, the vectors according to the invention comprise two heterologous genes, namely an 8th selection gene and a useful gene.
When the e5t vector constructed from the genome of avian erythroblastosis retrovirus (AEV), heterologous genes are advantageously placed in positions of the v-erbA and v-erbB ~ oncogenes By selection gene is meant a marker gene for resistance, in particular resistance to a drug analogous to a antibiotic. Mention may be made in particular of the hygroR gene for resistance to hygromycin G418 and the neo gene for resistance to neomycin.
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WO 91/11190 PCI'/FWI/00062 2o7~o67 Of course, the marker genes that have been cited do not sound~
purely by way of illustrative examples. It is possible to use any another resistance gene as a marker gene.
By useful gene is meant a gene coding for a protein 5 of interest other than a selection gene.
In a suitable embodiment, the genes heterologous are placed under the control of internal promoters heterologous, in particular the simian promoter SV40 or metallothionein human MTlla.
In one embodiment of the vectors according to the invention, the selection gene is placed under the control of the promoter simian SV40 and the useful heterologous gene is placed under the control of the human metallothionein lla (MTlla) promoter.
In another embodiment, the selection gene 15 is driven directly by the 5' LTR and not associated with a promoter own.
The direction of transcription of a heterologous gene inserted into the vector must be opposed to that of the LTR in the case where said gene heterologous contains a polyadenylation control sequence. In the 20 contrary case, the heterologous gene could be inserted in the direction of - transcription of the LTR, the transcript of said gene then using the signal polyA provided by the 3' LTR. In the case where the heterologous gene inserted contains introns, this gene must be inserted in the direction reverse transcription, in order to avoid any interference between the signals 25 splicing control of this gene and those of the viral genome.
In one embodiment, the selection gene is inserted in the direction of retroviral transcription and the useful gene is inserted into the direction opposite to that of retrovrral transcription.
As an example of a useful heterologous gene, the 30 gene encoding histone H5 and it has been shown that the expression of H5 in normal or transformed quail or chicken fibroblasts did not significantly affected cell growth properties transformed, but inhibited the proliferation of normal fibroblasts.
WO 91/IIIgO PCI/FR91/00062 6~
According to another example, the heterologous gene is the gene of E.
coli encoding beta-galactosidase.
In particular vectors carrying a 3' LTR derived from the RAV-0 viruses, naturally devoid of enhancer sequences, have been 5 constructs in which the CAAT box is deleted:
These vectors carry the following sequences of 51 in 3~:
- a 5' LTR of the RSV virus, - a leader sequence of the RAV^1 virus, - a resistance ~ ene, such as NeoR, 10 - a heterologous ~ ene of interest, such as the E. Coli gene encoding a - beta-galactosidase provided with a nuclear adre55age signal, under the con ~ role the promoter of the SV40 virus, - the 3' non-coding sequence and the 3' LTR of the RAV-0 virus deleted from the CAAT box.
15These vectors have been te5té5 and 50nt functional and offer a maximum safety of inactivation since the LTR RAV-0 in 3' underwent a deletion in the CAAT promoter sequence.
Given the fact that avian retroviruses are viruses to RNA, the terminolo ~ ie virus can sometimes designate the proviral genome 20 in the form of DNA as well as in some cases the foreign gene may be in the form of RNA, especially when inserted into the genome of a virion. The techniques allowing to pass from a DNA form to 12 RNA form and vice versa, 50nt known and are the transcription and the reverse transcription. The recombinant virus can be used as such under 25 form of RNA virions or proviral genome in the form of DNA comprising the in ~ ertion of a foreign gene also in the form of DNA and corresponding to the reverse transcription of the RNA of ~irUs~ can be integrated into a DNA vector such as a plasmid, a cosmid, or a phage for example.
For convenience, the constructions have been 30 carried out first on plasmids comprising a composite sequence of DNA corresponding to the reverse transcript of an RNA retroviral vector of a virus as previously described.
WO 91/111g0 PCI'/FIW1/00062 20750~7 The present invention also relates to a method of preparation of a vector according to the invention characterized in that ~ one carries out deletions or mutations in the avian 3' LTR so as to inactivating the viral promoters present in said LTRs and in that one inserts said heterologous gene(s) under the control of a promoter internal heterolo ~ ue or promoter of the LTR S '.
In one embodiment of the method, one inserts into the vector pDAI at the Xbal site a transcriptional cassette of a gene heterologous.
For example, the transcriptional cassette of the ~ ene hetero-logue consists of the vector pBO ~ as shown in Figure 6 in which one, inserts said heterogeneous gene ~ ue at the restriction sites of the polylinker between the transcription initiation sequence under shape of the MTlla promoter and transcription termination sequence and polyadenylation derived from the histone HS gene, said cassette being framed by two XbaI sites allowing its isolation and then its insertion into the unique Xbal site of the pDAI vector.
The present invention further relates to a method of ~, modification of cells characterized in that a transfection is carried out or infection depending on the case of said cells with vectors according to the invention.
The present invention therefore relates to transfected cells ;, or infected with the vectors according to the invention whether they are in the form of plasmid or virus respectively. It is evident that the transfection Primary 2S will be generally carried out with plasmid-type vectors, , ~ that is to say that the avian retrovirus will be in the form of the DNA of its genome but in the presence of the DNA of a helper virus of 5 cells transfected will in this case transform and release the viruses recombinants which will be able to transfect other cells. This kind of process also makes it possible to constitute stocks of virus vectors subsequently usable in place of the plasmid vectors.
~, : 35 ..
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WO 91/11190 PCr/FR91/00062 ?,Qr~6~
Retroviruses such as AEV, RAV-I, RAV-2 are defective for their replication. To replicate, these viruses require the presence in the same host cell of a functional helper virus as is known from the skilled person.
The present invention also relates to a method of modification of cells characterized in that a co-infection is effected or co-transfection depending on the case with a helper virus which comprises the genes ensuring the replication of said vector.
The modified cells according to the invention can be various but are preferably avian cells, of hematopoietic type, germline or fibroblast type.
Preferred cells for the implementation of the vectors of the invention are chicken or quail embryo fibroblasts. Nevertheless the vectors according to the invention make it possible to modify turkey cells, duck and other birds.
Finally, the invention relates to the process for the preparation of a determined protein in which the cells modified by a vector according to the invention in which a foreign gene encodes said protein and in that the protein is recovered from the cell culture.
Other advantages and characteristics of the present invention will become apparent from the detailed description of an example of realization given for purely illustrative purposes and as a model for integration and expression of a heterologous gene, using the gene of histone H5.
The following description is made with reference to the figures I to 8.
~`
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~, ;~..
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WO 91/llt90 PCT/FR91/00062 20750~7 Fi ~ ure 1 diagram illustrating the transfer of the deletlon of the 3'LTR a la S'LTR (1) A ~ector retrotrlrai delot~ tans the promotour of 3'LTR t wearing a g~no otrang-r (~) a~oo its own promoter (P), ost transfects in back helper cells ~2) Apre~
S m tegratior, the proiral DNA is transcribed from the promoter of 5'LTR, and trlral transcripts containing the deletion in the realon U3 are encapsid~J in dos part~culos vlralo6 snfectleuse~ (3) Dan~ cells mfected by this~ partlculcs v rale ~ devoid of helper, the viral RNA is transcribed by transcrlptlon m~rerse in a double-brln DNA molecule shows a rogion U3 dol~t~o dan~ los sweet LTR A m sl, tans ces cells, the transcriptlon trlralo is a ~ olie and soule the transcription from the int-rne pro~ot-us may take place on trlangle mt ~ qu- the t ~ lotlon; ca-- bachuro- rogion U3, case po mt~ o rogion US, caJo clairo rogion R
Figs~! LTR structure normalos (in ~aut) and deleted (in as~ La iocaii~atlon your rogulatlon slgnaux transcrlptlonneile est ~ndlqu~o LJ ZOn-J hatch-o ot po m till-- in the roglon U3 ~ 20 represent reJpeCtlvem nt the reg~ons tu enhancor and du ; p~omotour The rogion U3 teleteo ~provonant to provir DNA~1 RA~-2) at oto la~o, by los lD~ers Clal, to the R ot US reg~ons of the LTR te RAV-1 L- trlanglo po~nt~llo ~ntiquo l'~t-ntuo do la et~on~ (~) Struoturo doo voctouro rotrov~raux. Dan~ pT2~3', ter~vo of AEV, the gono to ro~stanoo a la ~ooryo~no (3001 ost transcrlt from the LTR v~ralo, while quans pDAl, ~1 ost ~ranscr~ta from promotsur to SV40 m t-rno (SV) pDAl, doslve essontlellomont to RAV-~, contlont un- reglon U3 doleteo dan~ 13 ; ~ 'LTR pDA ~ Y and pDA ~ S have been derlv ~ s to pDAl on msérant respect the nph genes (reslstanco a l'hygromyc me) e~ ~i ~os ~loohos ~ntlqu-nt la tlroct~on transor~ptlonnolle dos ~f'erent genes In pDA~Y, 13 r~g~on coding for hph, llée ~u 2a~'6~ 1 o slte of polyadenylatlon of the gene of thyme ~ dme kina ~ e (Tk), has been placed SOUQ the SV40 promoter control. In pDA~5, the promoter of mctal1Othlonelno humalno MT-IIA (MT) was Ut:il3e to transcrlre the gene ~5 containing its own slgnal of polyadenylatlon (Pol HS). Ca~es hatched. clalre and po ~ nt; llee.
respectively LTR of AEV, RAV-2 and RAV-1; SD and SA:
r-~p-ctlve~ nt donn-ur t acoept-ur d'~p~Jage;~U3; region U3 deleted; ~o: ~hol; ~: a~al; C:Clal. The eohelle (in pairs of kilobases:kb) is listed below.
F~ e 3.4 analysis by Southorn blot mg of lnrected OT6 cells by DAH5. 15 ~ g of DNA, l ~ olé of cell ~ lnfecte-~ (band ~ 5 and ~!
and not 1 ~ fected (ba ~ of ~ 4 and 6), were digested by ~ bal (bands
4 et ~) ou ~hol ~bandes t; et 1). Apre~ electrophore~e et ;ransrert sur n~trocellulo~e, la plage de tran~fert ("blot") a ete hybrldee a~cc une sonde de H5 opeciflque. Leo quant~té de fragment de reotrictlon oorre~pontant a 10, 1 et 0,1 oopio~ de gene H5 par genome (roopectl~rent bante~ 1, 2 ot 3) ¢nt ~t~ tralteeJ en : 20 parallele. La~bda ADN dig~r~ par EooRI ot ~intIII a ~t~ utilise coume marqueur dc taille. Une repr~entation ~ch~m~tlque de la .~ o~rte de restriction de DA~5 est montre au ~a~ de la figure.
Fi~.~ç ~ Eo~al de protectlon par la nuoleaoe S1 de l'ARN
cytop1asrlque transorlt dans des cellulos CT6. 20 ug d'ARN
. cytopl~8rique, i5010 de oellules 30n infeotoes (bande l) et de cellulos mrocteos par DA~5 (bandos 2 et 53, ont eto bybrl~es a~ec la sonde do H5 DanJ les bandOJ 3 ot 4. los oollul-~ ont ~te trait~os rosp-ctlvement avec 50 mM et 100 ~M de Z~Cl~, ~vant l'~solement do l'ARN. Dan- la ~and- 5, d-- o~llul-s ~n~eot~es ont ete malntenues pendant 50 generatlons sans ~eleot~on par G4le avan~ l'extrac:ion. Un fragment de 1~25 p~ isole de pMTX5 ee represontant la sonde de H5 ~bando 6) a protoge ~15 nuoleotldes apres d~gostlon Sl Les chlftres dans la marge gauche representent les tailles, en nucleotldes, des tragmenes utlllses oomme marqueurs de poids moleculaire 207~0~7 Fi~ure 5: Détection par Western blotting de H5 dans des cellules QT6 infectées. Les protéines nucléaires, isolées de cellules QT6 infectées par DAH5 (bandes 1, 2 et 3) ou de cellules QT6 non infectées (bandes 4, 5 et 6), ont é~é soumises à une électrophorèse sur gel de polyacrylamide-SDS et transférées sur nitrocellulose. H5 a été détectée après incubation avec des anticorps anti-H5 et la protéines A 1. Les cellules ont été traitées avec 100 mM de ZnC12 (bandes 2 et 5). Les bandes 7, 8 et 9 représentent l'équivàlent de 0,5 llg, 1 IJ8 et 2 llg de HS purifiée, et les bandes 10, 11 et 12 montrent la quantité de H5 présente tans 5.106, 10.106 es 20.106 érythrocytes de poulet.
FiRure 6: représente p~OL. Ce plasmide a été construit à partir de la cassette de transcription H5 contenant le promoteur MTIIA, la séquence codante de H5 et la séquence polyA. La séquence codante de H5 a été
éliminée par digestion EcoRI + Smal et rcmplacée par un oli~onucléotide de synthèse présente figure 6. on peut cnvisagcr de remplacer le promoteur MTIIA par un autre promoteur.
Fi~ure 7: Structure des vecteurs rétrovirus OVA. Les triangles noirs indiquent les positions des promoteurs de transcription internc, tandis que les triangles blancs indiquent la position dcs délétions U3. La présence ou I'absence d'un élément enhancer, d'une boîte CAAT et d'une boîte TATA
- dans chaque LTR aval est indiquée à droite.
Fi~ure 8: représente la construction des vecteurs du type OVA.
EXEMPLE 1.
Le transfert et l'expression de l'histone H5 ont été effectués dar~ des fibroblastes aviaires normaux et transformée par un vccteur rétroviral SIN. Le vecteur, appelé pDAH5, a été obtenu par mutation dans Ia LTR 3' en éliminant les bo;tes CAAT et TATA. La séquence codant pour H5 insérée dans pDAHS a été contr~lée par le promoteur de métallo-thionéine MT-IIA humaihe.
L'infection de cellules de caille QT6 par lc virus DAH5 a conduit à l'intégration d'une copie de gène H5 étranger par génome et à la formation de transcrits d'ARNm initiés correctement et de protéine H5 Cependant, I'expression de la séquence H5 exoeène était constitutive et non inductible, par ions Zn . Le taux de H5 dans les cellules QT6 était équivalent de cclui d'un érythrocyte de poulet mature. 4 and ~) or ~ hol ~ bands t; and 1). After electrophoresis and transmission on n~trocellulo~e, the transfer range ("blot") has been hybridized a ~ cc an opeciflque H5 probe. Leo quantity of fragment of reotrictlon oorre~ bridged to 10.1 and 0.1 oopio~ of gene H5 by genome (roopectl~rent bante~ 1, 2 ot 3) ¢nt ~t~ tralteeJ en : 20 parallel. The~bda DNA dig~r~ by EooRI ot ~intIII a ~t~ uses coume marker dc size. A ch~m~tlque representation of the . ~ o ~ rte restriction DA ~ 5 is shown in ~ a ~ of the figure.
Fi~.~ç~Eo~al of protectlon by the S1 nuoleaoe of RNA
transorlt cytoplasm in CT6 cells. 20 µg of RNA
. cytopl ~ 8rique, i5010 of oellules 30n infeotoes (band l) and of cellulos mrocteos by DA~5 (bandos 2 and 53, have eto bybrl~es a~ec the probe do H5 DanJ the bandOJ 3 ot 4. los oollul-~ have ~te trait~os rosp-ctlvement with 50 mM and 100 ~M of Z~Cl~, ~vant the ~ solement do RNA. Dan- la ~ and- 5, d-- o~llul-s ~n~eot~es have been maintained for 50 generatlons without ~eleot~on by G4le avan ~ the extrac: ion. A fragment of 1~25 p~ isolated from pMTX5 ee representing the probe of H5 ~ bando 6) has protection ~ 15 nuoleotldes after d~gostlon Sl The letters in the left margin represent the sizes, in nucleotides, of the tragmenes used as molecular weight markers 207~0~7 Fi ~ ure 5: Detection by Western blotting of H5 in QT6 cells infected. The nuclear proteins, isolated from QT6 cells infected with DAH5 (lanes 1, 2 and 3) or uninfected QT6 cells (lanes 4, 5 and 6), were subjected to polyacrylamide-SDS gel electrophoresis and transferred to nitrocellulose. H5 was detected after incubation with anti-H5 antibodies and protein A1. The cells were treated with 100 mM ZnCl2 (lanes 2 and 5). Bands 7, 8 and 9 represent the equivalent of 0.5 μg, 1 μg and 2 μg of purified HS, and bands 10, 11 and 12 show the amount of H5 present tans 5.106, 10.106 and 20.106 chicken erythrocytes.
FiRure 6: represents p~OL. This plasmid was constructed from H5 transcription cassette containing the MTIIA promoter, the sequence coding of H5 and the polyA sequence. The coding sequence of H5 was eliminated by EcoRI + Smal digestion and replaced by an oli ~ onucleotide of synthesis presents figure 6. it is possible to consider replacing the promoter MTIIA by another promoter.
Fi ~ ure 7: Structure of OVA retrovirus vectors. The black triangles indicate the positions of internal transcription promoters, while the white triangles indicate the position of U3 deletions. The presence or the absence of an enhancer element, a CAAT box and a TATA box - in each downstream LTR is indicated on the right.
Fi ~ ure 8: represents the construction of OVA type vectors.
EXAMPLE 1.
Transfer and expression of histone H5 were performed dar ~ normal avian fibroblasts and transformed by a vector retroviral SIN. The vector, called pDAH5, was obtained by mutation in Ia LTR 3 'by eliminating the boxes; your CAAT and TATA. The coding sequence for H5 inserted into pDAHS was controlled by the metallo-promoter thioneine MT-IIA human.
Infection of QT6 quail cells by the DAH5 virus leads to the integration of one copy of a foreign H5 gene per genome and to the formation of properly initiated mRNA transcripts and H5 protein However, expression of the exoene H5 sequence was constitutive and non-inducible, by Zn ions. The level of H5 in QT6 cells was equivalent to that of a mature chicken erythrocyte.
5~ 12 L'expression de H5 dans des cellules QT6 transformées infectées par DAH5 ou des fibroblastes d'embryon de poulet transformés par AEV-ES4 a eu seulement de légers effets sur la vitesse de croissance e~
n'a pas inhibé la réplication cellulaire. Inversement, I'expression de H5 dans 5 des fibroblastes de caille et de poulet normaux a été spectaculaire: les cellules ont acquis l'aspect de fibroblastes sénescents, elles poussaient très Ientement et les noyaux semblaient compacts, elles étaient souvent dépourvues de cytoplasme.
L'analyse de la modification post-traductionnelle de H5 dans 10 les cellules QT6 a montré qu'une phosphorylation peut être impliquée dans Ies effets différentiels de la protéine dans des cellules normales e~
transf ormées.
I - MATERIEL ET METHODES
15 1. Construction d'un vecteur rétroviral pour le transfert et l'expression de la séquence codante pour HS
Le principe des vecteurs SIN est illustré sur la figure 1.
La construction du vecteur pTXN3' a été publiée récemment (3 et WO 89/03877). Le génome de pDAI est dérivé du génome du virus ! 20 associé au sarcome de Rous-2 (RAV-2) après modification de la LTR 3'.
On a construit une LTR aviaire mutée par délétion de la région U3 isolée de la LTR du virus de la leucose aviaire RAV-2 entre les nucléotides -149 et -15 (en regard du site cap transcriptionnel: nucléotide +1). C'est-à-dire que la séquence en aval du site Sphl dans U3 a été
25 supprimée. Cette délétion a éliminé les boîtes CAAT et TATA mais a laissé
intact la région de enhancer située en amont de la position -149 (6,16, 22J.
La région U3 de RAV-2 délétée a ensuite été liée aux région5 R et U5 isolées de la LTR de RAV-I. C'est-à-dire que la séquence dé~étee de U3 a été remplacée par le fragment Taql-Sstl dérivé de la LTR de RAV-I. Ce 30 fragment contient esseritiellement les séquences R et U5 et 14 nucleotides résiduels de U3. Le linker Clal a été inséré à la jonction des fragments dérivés de RAV-I et RAV-2. La LTR hybride présente donc une délétion de 134 nucléotides qui a éliminé les boftes CAAT et TATA. La LTR délétée ainsi reconstituée a été utilisée pour remplacer la LTR 3' normale dans le 35 vecteur pDAI. Le vecteur pDAl a été construit à partir de RAV-2 et il porte une cassette transcriptionnelle contenant le gène néo iié au WO 91/11190 PCI/Fl~91/00062 13 2~7aO67 -promoteur précoce de SV40 inséré dans le meme sens de transcription de la transcription viraJe (fi~ure 3). Plus précisément, le fragmen Xho I interne du ~énome de RAV-2 a été éliminé et remplacé par une cassette contenan~
dans l'ordre des séquences ga8 portant ainsi Xbal, le enhancer et le promoteur précoce du virus simien SV40 et la séquence codant pour le gène de la néomycine phosphotransférase bactérienne (néo) (2S).
Comme virus témoin, on a construit le ~énome pDAHY dérivé
de pDAI en insérant une cassette contenant la séquence codant pour 0 I~hy~romycine ~ phosphotransférase (hph~ entre le promoteur précoce de SV40 et le si~nal de polyadénylation de ~SV Tk. Cette cassette de transcription a été insérée dans le sens opposé par rapport au gène néo.
Plus précisément, le vecteur pDAHY a été dérivé de pDAI en insérant au site Xbal une cassette contenant la séquence codant pour l'hy~romycine ~
phosphotransférase bactérienne (hph) ( I l ). Ce ~ène a été mis 50US le contrôle du enhancer et du promoteur précoce de SV40. Le signal de polyadénylation du gène de la thymidine kinase (Tk) de l'herpes virus (HSV) a été ajouté à l'extrémité 3'.
Comme contrôle supplémentaire, le virus pTXN3', un vecteur qui exprime le gène néo de la LTR virale, a été utilisé en parallèle.
Le génome du vecteur pDAHS a été construit à partir de pDAI
` en insérant une cassette de transcription contenant la séquence codant pour `1 HS lié au promoteur du 8ène de la métallothionéine MT-IIA humaine. Dans 1 cette construction, la séquence HS fournit son propre signal de poly-- 25 adénylation et elle a été insérée en direction anti-sens par rapport à la . transcription rétrovirale. Plus précisément, le ~énome pDAH5 a étéconstruit à partir de pDAI en insérant à Xbal une cassette contenant la séquence codant pour HS avec son propre signal de polyadénylation lié au promoteur MT-IIA (13~. L'unité de transcription de H5 en tant que cassette de transcription du 8ène hph a été inséré dans le sens opposé par rapport à
la transcription commandée par la LTR.
Tous ces génomes rétroviraux ont été transfectés dans la li~née de cellules helper G qui libéraient uniquement des vecteurs rétroviraux dépourvus de virus assistants (helper free) ~24). Le ~itre du virus DAH5 dépourvu d'assistant (helper free) était de 100 rfu/ml (unité formant résistance/ml) comme déterminé par sa capacité d'induire la résistance à
G4 18 chez les cellules de caille QT6 réceptrices.
W O 91/11190 PCT/FR91/000~2 5~12 Expression of H5 in transformed QT6 cells infected with DAH5 or transformed chicken embryo fibroblasts by AEV-ES4 had only slight effects on growth velocity e~
did not inhibit cell replication. Conversely, the expression of H5 in 5 of the normal quail and chicken fibroblasts was spectacular: the cells acquired the appearance of senescent fibroblasts, they grew very slowly and the nuclei seemed compact, they were often devoid of cytoplasm.
Analysis of post-translational modification of H5 in 10 QT6 cells showed that phosphorylation may be involved in Ies differential effects of protein in normal cells e ~
transformed.
I - MATERIALS AND METHODS
1. Construction of a retroviral vector for the transfer and expression of the coding sequence for HS
The principle of SIN vectors is illustrated in Figure 1.
The construction of the vector pTXN3' has been published recently (3 and WO 89/03877). The pDAI genome is derived from the virus genome ! 20 associated with Rous sarcoma-2 (RAV-2) after modification of the 3' LTR.
An avian LTR mutated by deletion of the U3 region isolated from the LTR of the avian leukosis virus RAV-2 between the nucleotides -149 and -15 (facing the transcriptional cap site: nucleotide +1). That is, the sequence downstream of the Sph1 site in U3 was 25 removed. This deletion eliminated the CAAT and TATA boxes but left intact the enhancer region located upstream of position -149 (6,16, 22J.
The deleted RAV-2 U3 region was then linked to the 5 R and U5 regions isolated from RAV-I LTR. That is to say, the dice sequence of U3 has was replaced by the Taql-Sstl fragment derived from the RAV-I LTR. This 30 fragment essentially contains the R and U5 sequences and 14 nucleotides residuals of U3. The Clal linker was inserted at the junction of the fragments derivatives of RAV-I and RAV-2. The hybrid LTR therefore has a deletion of 134 nucleotides which eliminated the CAAT and TATA boxes. The deleted LTR
thus reconstituted was used to replace the normal 3' LTR in the pDAI vector. The pDA1 vector was constructed from RAV-2 and it carries a transcriptional cassette containing the neo gene linked to WO 91/11190 PCI/Fl~91/00062 13 2~7aO67 -early promoter of SV40 inserted in the same direction of transcription of the viral transcription (fi~ure 3). Specifically, the internal Xho I fragment RAV-2's huge ~ has been eliminated and replaced with a cassette containing ~
in the order of the ga8 sequences thus carrying Xbal, the enhancer and the simian virus SV40 early promoter and gene coding sequence bacterial neomycin phosphotransferase (neo) (2S).
As a control virus, the enome pDAHY derived of pDAI by inserting a cassette containing the sequence coding for 0 I ~ hy ~ romycin ~ phosphotransferase (hph ~ between the early promoter of SV40 and if ~ nal polyadenylation of ~ SV Tk. This tape of transcript was inserted in the opposite direction relative to the neo gene.
More specifically, the pDAHY vector was derived from pDAI by inserting at Xbal site a cassette containing the sequence encoding hy ~ romycin ~
bacterial phosphotransferase (bph) ( I l ). This ~ene was put 50US on control of the SV40 enhancer and early promoter. The signal of polyadenylation of the herpes virus (HSV) thymidine kinase (Tk) gene was added at the 3' end.
As an additional control, the pTXN3' virus, a vector which expresses the viral LTR neo gene, was used in parallel.
The pDAHS vector genome was constructed from pDAI
` by inserting a transcription cassette containing the sequence coding for `1 HS linked to the 8ene promoter of human metallothionein MT-IIA. In 1 this construction, the HS sequence provides its own signal of poly-- 25 adenylation and it was inserted in the antisense direction with respect to the . retroviral transcription. More specifically, the ~ enome pDAH5 was constructed from pDAI by inserting a cassette containing the sequence encoding HS with its own polyadenylation signal linked to the MT-IIA promoter (13~. The transcription unit of H5 as a cassette of transcription of the 8th hph was inserted in the opposite direction with respect to transcription controlled by the LTR.
All of these retroviral genomes were transfected into the born from helper G cells that only released vectors retrovirals without helper viruses (helper free) ~24). The ~iter of the virus DAH5 without an assistant (helper free) was 100 rfu/ml (unit forming resistance/ml) as determined by its ability to induce resistance to G4 18 in QT6 recipient quail cells.
WO 91/11190 PCT/FR91/000~2
6'~ 14 2. Colluloc Le~ flbroblastes d'em~ryon de poulet t OE F) ont e~e prépares et cultives comme décsit precedemment (9). Les sibroblastes d'em~ryon de callle ~ OE F) ont ete prepares et culti~ec dan~ leo m~moo oonditlonc. Loo cellule~ de poulot ~EV-ES4, let fibroblaoteo de caille CT6 ~l7) et leo cellule~
helper de caille G (~4) ont ete cultives dans le milieu de culture CEF Los cellules AEY-ES4 éta~ent derlvees de OE F lntectes par le vlrUs AE~-ES4 (9); oeo oellules ont éte malntenues en culture penaant ~lusleur~ molc avant d'etre utlliseeo La select~on pour les colonles de cellules neomyc m e-recl~tante~ a ete ~alte en presence ae G~18 (Gibco) a une concentratlon de 200 ~g/mi ;
3. Tr~ f-otio~ t i~lfootio~. Los cellules helper G ont ete transfectees par la methode du polybrene-dimethyl sulfoxyde (14). Lcc sucponslons ~lraleo ont ote rooueillieo pondant des p rlodeJ de 12 houroo ~ part~r doo oolluloo du productour rouc-confluentec (3 ml par boite de lO0 mm), pul~ centrlfugee~
pendant 15 m m ~ 2500 9 et filtree~ cur dec filtrec li~nt ,albi~ment les protelnes (~ poreI. Lo~ ceilulos. ensomocees d ralson do 5 105 ooiluloo par boito do 60 mm. ont ete lnfooteeJ
avec l ml de Jolutlon ~rlrale pendant dou:e heure~, pUl~
sclectionnoe~ tan~ G4l~ Le-~ colonies reJlstantes ont eté evaluees ;0 a 15 ~ours ~pres l' m sootlon 4. I~d~otio~ p~r l- z~o d~ pro-ot-ur do ~T~ .d~ loe O-11Q1-e i~f-ot~--. L-J oellul-- ont ~t~ lnou~-o~ pondant 24 h dans lo mlllou de culturo CEF ~upplomonee a~teC so ~M ou 100 ~M de _3Cl2 (Yer~k, Lo ZnCl~ a ete proparo JOUS formo de Jolutlon de rosor-e 10 ~Y dans un ta~pcn s~lsn ~30tonlquo et stocko ~ ~4'C
5. Cl~otiquo do oroios~noo doe oolluloa i~fooeOoa. Le~
cellule~ ont eee ensemencee~ a ra~on de 5 105 cellule par boit.e WO 91/11190 PCr/FR91/00062 207~0~7 de 60 mm et le mll~eu a en~ulee ete change chaque ~our. A chaque délal, u~e ou trols boite~ par type cellul~ire ont ete trypslnlsées et le~ ceilulos ont eté decomptee~.
6. ~ULa1~JO d'~DN ot d'~N . Un ~DN de haut pold~ moléeulaire ete extrait commo décrit precedemment (10). ApreQ digestion de 15 ~g par de~ enzym~ de ~t-e~trlctlon approprlee~, le~ }ragment3 ont e~e ~paree par eleotrphore~e ~ur do~ gel~ d'agaro~e a 0,8%
L'~DN a en~ulte eee tran~fere eur de~ filtre~ en nitrocellulo~e et hybrlde avec une ~onde marquée amorcee au hasard. Les fi1treS ont ete f m aiemont lavo~ dan~ do~ condltlons extrem~men~ rlgoureuses expoae~ a une pell~cule ~odak-~-Omat. La ~onde ut~ ee éta un fragment EcoRI-~mnl derlve de pHTH5 L'ARN cellulalre total a ete purlfie apres lyse de~ cellules dans un tampon oontenant 1 m~ de Dithlotreltol et 0,2~ de Nom det P40 e~entiellorent com~e decrlt procedommont ~10). De~
exporienco~ dc cartographio S1 o~t eto offoctuoo~ conformement Fa~aloro et al. (~). Un fragm nt d- ro~trlctlon Bam~I-P~tl contonant la ~equonce codant pour ~5 a et~ i~ole a partlr de pMTH5 et ~arque ~ l extremite 5' par ~r 32Pl~TP ct la polynucléoelde : ~ina~e. La sonde a etc coprecipitéo a~eo 10 ~g d' M N total e~
rerl6e en ~u~pon6~0n dans le tampon d'hybrldatlon Sl contenant 40 nM de Pipes lpip~raz m e N-N' bl~(ac~de 2-ethane ~ulfo m que. pH
6,4)r 400 mff de NaCl, l m~ d'EDT~] L'hybrldatlon ~ ete effectllee pend~nt 6-9 b ~ 56-C, puis les hybride6 ont ete digeerès avec 900 U
do nuoleaso Sl par mi ao tampon do dlgostlon (~0 m~ d'acetate ae ~od~um p~ 4,5, 250 m~ do NaC1, 2 mM do Z~S04) p~ndant 30 mln ~
31'~. L'ADN reslJtant ~ la nucl~a-- S1 a te~ f malement pas~e dans un gel do polyaorylamldo ~ 6~ oe expo~e a uno pelliculo Yodak-~-Omat. L'ident~te de~ fragments protoge~ a ete detèrm~nee par comlgratlon avec des marqueurs de poids molécula~re approprle 6'~14 2. Colluloc The ~ flbroblasts of chicken em ~ ryon t OE F) have e ~ e prepare and cultivate as previously described (9). The em ~ ryon sibroblasts of callle ~ OE F) were prepared and culti~ec dan~ leo m~moo oonditlonc. Loo chicken cell ~EV-ES4, let fibroblaoteo of quail CT6 ~l7) and leo cell~
quail helper G (~4) were cultured in the culture medium CEF Los AEY-ES4 cells were derived from OE F lntected by the vlrUs AE-ES4 (9); oeo cells have been retained in culture while ~using~ molc before being used The select~on for neomyc cell columns m e-recl ~ aunt ~ has been ~ alte in presence of G~18 (Gibco) at a concentration of 200 ~g/mi ;
3. Tr~ f-otio~ ti~lfootio~. Los helper G cells have been transfected by the polybrene-dimethyl sulfoxide method (14). Lcc suspected ~lraleo have ote rooueillieo laying p rlodeJ de 12 houroo ~ part~r doo oolluloo du productour rouc-confluentec (3 ml per box of 100 mm), pul~ centrlfugee~
for 15 mm ~ 2500 9 and filtered ~ cur dec Filtrec li ~ nt ,albi~ment the protelnes (~porei. Lo~ ceilulos. ensomocees d ralson do 5 105 ooiluloo per boito do 60 mm. have been lnfooteeJ
with l ml of Jolutlon ~rlrale for 12 hours~, pUl~
selected ~ tan~ G4l~ The remaining colonies were evaluated ;0 to 15 ~ours ~near the m sootlon 4. I~d~otio~ p~r l- z~od~ pro-ot-ur do ~T~ .d~ loe O-11Q1-ei~f-ot~--. LJ oellul-- have ~t~ lnou~-o~ laying 24 h in lo mlllou de culturo CEF ~upplomonee a~teC so ~M or 100 ~M of _3Cl2 (Yer~k, Lo ZnCl~ was proparo JOUS formo of Jolutlon of rosor-e 10 ~Y in a ta~pcn s~lsn ~30tonlquo and stocko ~ ~4'C
5. Cl~otiquo do oroios~noo doe oolluloa i~fooeOoa. The~
cell ~ have been seeded ~ at a rate of 5,105 cells per box.
WO 91/11190 PCr/FR91/00062 207~0~7 60 mm and the mll ~ had in ~ ulee was changed every ~ our. Every délal, u ~ e or trols box ~ by type cellul ~ ire have been trypslnlsées and the ~ ceilulos have been counted ~.
6. ~ULa1~JO of ~DN ot of ~N . A ~DN of high molecular weight~
was extracted as previously described (10). ApreQ digestion of 15 ~ g by ~ enzym ~ of ~ te ~ trlctlon approprlee ~, the ~ } }ragment3 have e~e ~paree par eleotrphore~e ~ur do~ gel~ d'agaro~ea 0.8%
The ~ DN has in ~ ulte eee tran ~ fere ~ filter ~ in nitrocellulo ~ e and hybrlde with a randomly initiated marked wave. Filters have summer fm aiemont lavo~ dan~ do~ extreme conditions expoae~ has a pell~cule ~odak-~-Omat. The ~wave ut~ ee was an EcoRI-~mnl fragment derived from pHTH5 The total cellular RNA was purlfied after lysis of ~ cells in a buffer containing 1 m ~ of Dithlotreltol and 0.2 ~ of Nom det P40 e ~ entiellorent com ~ e decrlt procedommont ~ 10). From~
exporienco~ dc cartographio S1 o~t eto offoctuoo~ in accordance Fa~aloro et al. (~). A fragment nt d- ro~trlctlon Bam~IP~tl contonating the ~equonce coding for ~5 a and ~i~ole a partlr of pMTH5 and ~ arc ~ the end 5 'by ~ r 32Pl ~ TP ct the polynucleoelde : ~ina~e. The probe has etc coprecipitéo a ~ eo 10 ~ gd' total MN e ~
rerl6e in ~ u ~ pon6 ~ 0n in the hybrldatlon Sl buffer containing 40 nM of Pipes lpip~raz me NN' bl~(ac~de 2-ethane ~ulfo m que. pH
6.4) r 400 mff of NaCl, lm ~ of EDT ~] The hybrldatlon ~ ete effectllee hangs ~ nt 6-9 b ~ 56-C, then the hybrids6 were digested with 900 U
do nuoleaso Sl par mi ao tampon do dlgostlon (~0 m~ of acetate ae ~od~um p~ 4.5, 250 m~ do NaC1, 2 mM do Z~S04) for 30 mln ~
31'~. The DNA reslJtant ~ the nucleus ~ a-- S1 has te ~ f malely not ~ e in un gel do polyaorylamldo ~ 6~ oe expo ~ ea uno pelliculo Yodak-~-Omat. The identity of the protected fragments has been determined by comlgratlon with appropriate molecular weight markers
7. Tr-~of-rt ~l-otrophor~tiqu- d-- prot~ o our p~pior do nitrooolluloJo. Los hlstonos totalos one ote oxeralte~ ~vec H~S04 Qes noyaux purlfies ~19). Lo~ ex~ral~s rassembles on; e~e W O 91/11190 ~ t~ 6 PCT/FR9l/00062 dlalyses et lyophil~es. Les hl~tones ont ete analysee~ p~r electrophorése sur gel dc polyacrylamide-SD~ (dodecyl Qulfat~ de sodlum) (l5). L'eloctrtranstert du gei de poiyacrylam~de sur paplor de n~trocoiluiose a ete effoctue pondant 1 heure ~ 24 v et les filtres ont eté f malement lncub~ avoc des antlcorps antl-H5 et la protélne A marqu~o au 125I. 1-10.105 spm (Amer~ham Corp.) La productlon d'antlcorp~ chez tes lap ms lmmu m 3es par ~5 a ete rapportoo prooodomm nt (18) L-~ anticorpJ antl-~S ont ~t~
pur~fies lmmuno~p~clfiquoment par chromatographie d' affi~lte avec H5 con~uguee au Sepharosc 4~. Lcur Immunoréactlvite ~ ete controlee par radlolmmunodosage en phase soiide (19). 7. Tr-~of-rt ~l-otrophor~tiqu- d-- prot~ o our p~pior do nitrooolluloJo. Los hlstonos totalos one ote oxeralte~ ~vec H~S04 Qes nuclei purlfies ~19). Lo~ ex~ral~s gather on; e~e WO 91/11190 ~ t ~ 6 PCT / FR9l / 00062 dlalyses and freeze-dried ~ es. The hl-tones were analyzed by electrophoresis on dc polyacrylamide-SD~ gel (dodecyl Qulfat~ from sodlum) (15). The eloctrtranstert of poiyacrylam~de gei on n ~ trocoiluosis paplor was carried out for 1 hour ~ 24 v and the filters were f malely lncub ~ avoc antlcorps antl-H5 and protein A labeled with 125I. 1-10.105 spm (Amer~ham Corp.) The productlon of antlcorp ~ in your lap ms lmmu m 3es by ~ 5 has been rapportoo prooodom nt (18) L-~ anticorpJ antl-~S ont ~t~
pure ~ fies lmmuno ~ p ~ clfiquoment by affi ~ lte chromatography with H5 designed at Sepharosc 4~. Lcur Immunoreactlvite ~ ete monitored by solid phase radlol immunoassay (19).
8- I~om nofluore~o-noa. Les cellule~ ont éte cultlvees sur de~
lame~ L~b Tek ~i}es labora~or~es), puls fixees tans l ~thanol aDSO1U SU1V1 d acctono a temperature am~lante. Apres lava~e avec PES-PMS~ [io mM de ta2pon de pho~phato do sodlum, p~ 7.4, 0.l5 M
de NaCl, 0.1 m~ de ph~yl mèthyl sulphonyl fluorure], les cellules ont ete lncuD~es pendant 30 m~n a 4-C a~ec de~ anticorps antl-H5 purifle~ par aff m lt~. D-J antloorp~ anti-lapln marquoJ a la fluor-soolne ont on~ult- ote a3OutoJ ot loJ o-llul-J oolorooJ ont ete exam m ee~ ~u mlcroscope Olympu~ equipe t'une ~pl-illum matlon.
De~ phot~micrographie~ ont ete prl~e~ avec une oamcra Olympus et une pelllcuie couleur Kodak. ~e~ temp~ d'expo~t~on oe de deve-ioppe nt oon~tants ont eto utlll~eJ pour l'lmpro~Jlon. 8- I ~ om nofluor ~ o-noa. The cells ~ have been cultured on ~
lame~ L~b Tek ~i}es labora~or~es), puls fixed in tans l~ethanol aDSO1U SU1V1 d acctono at am~lante temperature. After washing with PES-PMS~ [10 mM of pho-phato do sodlum ta2pon, p~ 7.4, 0.15 M
of NaCl, 0.1 m ~ of ph ~ yl methyl sulphonyl fluoride], the cells were lncuD ~ es for 30 m ~ na 4-C with ~ ec of ~ antl-H5 antibodies purifle~ by aff m lt~. DJ antloorp~ anti-lapln marquoJ a la fluor-soolne ont on~ult- ote a3OutoJ ot loJ o-llul-J oolorooJ ont summer exam m ee~ ~u mlcroscope Olympu~ equips you with a ~pl-illum matlon.
The ~ phot~micrograph~ were taken with an Olympus oamcra and Kodak color film. ~e~ temp~ d'expo~t~on oe deve-ioppe nt oon ~ tants have been utlll ~ eJ for the lmpro ~ Jlon.
9. ~u~ d- pho~phoryl~tio~ d- ln prot~ino ~5. Les collulea ont oto ancuDeeJ pentant 4 h tanJ un mlllou es~en~le ~n~mal x-mpt do PhOJPhat~, PU~ Ont et~ mart~uees pentant 1 h tan~ le m~me m~liou par ~ mCi de H3P04 m~rqu~ au 32p ~Amer~h~m Corp 1 Le~ hlJtonos rlches en ly~nc ont eto xtra~teJ avec de l'~cate perchiorlche ~ 5~ e~ soumises ~ une eloctrophore~e comme decrlt plu~ haut. La pho5phorylat~0n de H5 a éte détectee apres r.ran~tcrt tu qe1 sur paplcr de nltrocellulo~e e~ autorad~ograp~1e de la plaae de transrere ("blot.'l. La mome place de eransrert ~'blot") a ete ut~llsee pour la detectlon de la protelne H5 avec !~n antlcorps ant~-~5 et ur. con~ugue prote m e A-peroxydase de -2075~b7 ramfort ~mcr~bam) ~5 ~ ete rlnalement ~lsuali~cc par lncuba~lon dans 10 m~ de Trls, p~ 7,1, 0,0~5% de H202, 0,04% de 4-amlnoantlpyrlne ~sigma! et 0.2~ de phenol.
ll - RESULTATS
ulal~-- d- l'~ t d- l'lJU~ ir~ d~o l-e a-lluloe cnt6 i~fo~t~-r p~r OU~lS. Des cellules CT6, une lignec de fibro~lastes de caille transformes chimiquemcnt (17), ont eté
:. 10 lnsectee~ par une reserve dc vlru6 DA~5 depour~u d ~ssistant ("helper free"~
pll6 seleotrlonnees par G418 et amplifioes dan~ des cultures polyclonales. Ces cellules n ont pa~ li'oere de v1rus et le~
surnageants des cultures surinfectees par un ~lrus assistant (helper) normai etalent lncapa~los de transmettre la reslstance ~ G41~.
Etant donne qu aucun vlru~ n a pu tre retrouve. nous ooncluons que dans les cellules infectoe~ par D~S, le pro~irus mtegre e~t inactif du point de ~ue de la transoription. Pour determiner la : presenoo, l'or p n~satlon et le nombre de coples du vecteur d'ADN
ntrodult, un ~DN de h~ut polds l~oulairo pro~-nant de cellules CT6 mfoctoes ou non rnroctees a ~te pr~pare lS ~g d'ADN ont ete digeere~ par des enzymes do restriction et ont ete 0Xam~30S par la : metnode du Soutnern blottlng avec un- sonde oont-nant la reglon codant pour ~5 ~flg 3! L'-nzyme de rostrlotion ~hol ooupe aeux fols ~ l'inter~our iu vecteur et la prosonoo d un fragment de 4.6 : 25 kiloka~s (kb) o~t~par consequont caracter~stlque des genes ~ntacts ~5 et noo. Le fraament attendu do 4.6 kb a ete deteote tanJ leJ oellule~ infootoos ~bando ~), ma~s 11 n'~talt pa~ pr~ent dans l'ADN do~ oelluleJ non lnfoct~e5 ~b~nde 6).Pour teJter plu~
' ~ 18 preo~sement la presence d un fragment MTII-H5 lntact, l'AON de cellules GT6 lnfectees et non lnfectee~ a eté coupé par ~bal.
Comme prevu. un rragment de 2,1 kb a eee detecte dans le6 cellules lnfectee~ lbande 5) et n a pa~ ete detecte dans les cellules no~
lnfectées (bande 4) Ce~ donnees montren~ que les provlrus ln~éres n ont paR subl de rearrangements majeur6 et presentalent la structure attendue. Le~ rragment~ de haut po~ds molecuia~re : ob~er~es dans les ccllule~ mfectce~ et non m focteos correspondent au gene H5 endogane. A p rtlr des ~ntensltes ~es bandes à 2,1 et 9,5 kb dans les cellule~ i~fectees, on a estlme qu un gene ~5 exogene s'etalt lntegre par genome ceilulalre Pour conflrmer cette ostamat~on, on a comparé
l lntcnslte de la oande de 2,1 kb a ~elle tonnee par une ~uantlt~
; ^onnue de sequenc~s H5. 15 ~g t'ADN ganom~que avlalre repré~entent o.106 genomes av alres. Les bandos 1. 2 ee 3 cont~ennent resp~ctlvement o 105. 6.106 et 6.107 cop~es de plasmlde p~Tho dl~ere par EcoRI. Sl on compare l'intonslte d'hybrldatlon du fraymcnt de 0,3 kb de la bando 2 au fragment de 2.1 kb de la bande 5, nous con~rmon~ qu'une COple tU prOVlrU~ 3A~S a ete mseree par genome Pour determin~r le8 t~ux de transcr~ts specifi~ues du gene Y5 dans des celluies CT6 mrec~ees par DAH5 e~ non mrectees~ ~une anaiyse quantltatl~e avec la nuolcaJe Sl a ete utlllsee frlg 4) L~ ~cnde d' ~DN ct.~lt un fragment 5~m~I-Pstl de 1026 pb ~sole du plasn~de pMT~5. Ce Itragment contient le promoteur te MT-;;A ee lk nucl~otmde~ de la ~equence codant pour H5. Lo~ tran~crlts ~n1t1es au promoteur do MT-II~ do~ont otro protogcs aur uno longuour de 316 pb (l3~ Co~mo prevu, un ~ragmont proteqe do pros do 315 nuclèat~te6 a ete tetecte avec l'ARN te cellules OT6 ~ntec~eec par ~AH5 (bandes ~ a 5~ Un rracment protege de la mo~me tallle a ete detecte dans aes collulos OT6 lnrocteoJ par DAH5 ma m~onu-s en culture pend~nt 50 aeneratlon6 sanr select~on p~r G41~ (bande 5~
Aucun fr3ament protege n a e~e detectee avoc l ARN de cellulec 3TG
non msec~-e~ (bande 1~. Le promoteur de NT-I;A huma~ne peu~ e~re ,ndu~ pas des me~ m l~ur~ ~el~ que 7n~ 3) Po~ es~e:
20750b`7 l'expreJslon reaulee du gene HS ~ partlr du promoteur lnterne, des OT6 infectees ont été exposees pendant 24 h a SO ~M (bande 3) ou 100 ~M de ZnCl~ (bante 4) avan~ lsolement de l'ARN. La quan~lte d ARNm de ~5 n'a pas augmente significatlvement par rapport l'A~N des celluies non ~ntectees (bande 2!. On peut en conclure que la tranJcript~on de la sequencO cod~nt pour HS a éte efficacement et corroctoment i m tiée dans les cellule~ OT6 et que l'addition de Zn~ n'a pas augmonté le degre ie transcriptlon. De plus la ~equence codant pour ~5 une roi~ tran~reree tan~ les cellules OT6 eealt exprmmee de facon stable pondant au ~olns 50 ~eneratlons de culture~ libéree~ de la ~electlon par G418 2. EspreJ~ion do 1~ prot~in~ ~5 dnn~ d~s fibrobla~tes OT6 infe~t~ pnr 1- ir~J D ~ 5. La JyntheJe de l'hl~tone H5 a e~e ~e~uree dan~ de~ cellule~ CT6 lnfectées par DA~S et non ln~ectecs Le~ hlstones totales ont été extraltes de noyaux purifies lsolés des cellule~ re~poctivo~. Los prote m o~ ont etee analy~eos par eloctrophoreJo Jur gol de polyaorylamido, tranJfereoJ sur nitrocellulo~e et la pro~ence de ~5 a ete detectee apres ~ncubat~on te la plage de transfert ("blot") avec un antlcorps antl-~5 et la prote m e A-l~SI ~fig. S). Cot antlcorps n a tonne aucun slonal lor~qu'il a ete to~te oontre 10J hia~one~ to~aies te cellule~ OT6 non m foctee~ tralteos aroc 0 ~bande 6), 50 uM ~bande Si ou 100 ~M do ~nC12 (bande 4) Un slgDal nettement lsible a~ec la me~e ~ob~l~to de ~S pu~1f~ee (bandeJ 7, ~, 9) ou de ~S
d'hi~toneJ totales d erythrocytes de poulet (bandes 10. !1. '2). 3 eto detocto avoc los hlstonos totaloJ do 5,106 oollulos ~6 l~octoes par ~5 tra~too~ avoc 100 U~ do ZnCl2 (bante 1). 50 uM
de ZnCl~ (bando 2~ ou pas de ZnC12 (bando 3). Pour ~onter de : quant~fler la productlon de H5 dans dos cellules OT6 infoctee~, tes quantltes connuos de H5 purltlee. 0,5 ug Ibande 7). 1 ~g lcande ~ et ~ ua ~bando 91, ou d'hlstono~ totalos extra~tes de - lQ6 (bande l0). l0 l06 (bande ll~ ou ~0.l06 ~bande 12!
er~throcytes do poulets adultes ont e~e soum~sos a une eiectro,D~ore~o sur ie mome gel. A partlr to coq roouitats, on peut conciure que la ouant~te de H5 pre~onte dans 5 10 - w o gl/lllgo ~ Q ~ 20 PCT/FR9l/00062 cellule- OT~ lntectee~ p~r D~H5 est eqUl~alente A la au~ntlte dc H5 produlte par 5.10 erythroc~tes de poulets adultec et que ie n a pas au~men~e le ~egre de productlon de ~5. La io~ailiatlsn nuciealrs de H5 dans le3 cellules 3T6 lntec~oes ? r DA~5 a ete contlrmee par l~munofluorescence.
3. Propri~t~r d~a oollul~a 0~6 ~t d~o f ibrobla~t~i trnnafor~e pnr ~IEr-ES~ ~spri ~nt 1~ prot~ino ~5. Des cultures de OT6 lnrecteeo par DA~5 ont doveloppe de grands ro~ers ~n~es contenant de~ cellule~ phénotyplquement non dlfferente~ i^
cellules 0~6 non lntectées ou de cellules lnfeceeec par le vlru--.emol~ e ia meme f~corm des .lbroblastes de poulet ~rans~ormes par ie retrovlrus a~lalre AEV-ES4, ont ete lnfec~es par 3AffS ~es celP:les cn~ developpe deo foyer~ ne pou~ant ~re dlstlr~gue~ de ceux de cellules lnfectees par TgN3' et fl3 n ont pas pu etreamplltleos~non montre~. ~our ox~m~ner de racon plus approrondle sl la protolne H~ pouvalt a~olr un cer~aln effe~ sur le~ cellules tran~formees, on a comçare la clnetique de roljsance de sellules oT6 non mfestee a celle de OT6 lnfestees par DA~5 ou p~r ~N3'. Les ~rols typos collulalros ont e~e ~nsemences lndl~duellemon~ ~ la momo donslte dans des boi~e~ ce ju mm et -ul:lves dan~ les meme condltlons. Ensult-, ~ dlfferen~r del~ls, i~ cellulos ont et~ tryps1nisees et decomptees On peut voir que les cellules QT6 infectées par DAH5 ont présen~é une crolssance piu~ lente que lç~ coilule~ ~T6 non ~nfeotoes ou lnfeotoos pa~ TDN3' Los temp3 do gonorat~on ont pu ~tre es~me _0 h pour e3 ceiiuls~ OT~ ~emo1ns et a '5 h pour ioC coilules CS~
?rOdUlSant A protelne H5 On peut dono conciurs que i expre~s:-r. ie i~ prote~ne H ne semDle ~o1r que peu d effe~ ~u:
13 _role~anoe des ^ellule~ 0~5 et le5 fibroblaste3 tr n3~0rmes p3r A~V-ES~
4. Espre~io~ et effets de 1~ protAine ~5 daD~ des fibro~lasto# nor us 3es ~ibroblastes ~'embr70n de pouler W O 91/11190 PCT/FR9l/00062 207aO~'7 ( OE F) et des fibroblastes d'embryon de caille (OEF) ont ete lnfectes soit par le vlrus DA}I5 SOlt pas les vlrus temolns, T ~ 3' ou DA~Y 31X ~ours apros selectlon dans un mlileu contenant G~i6 des grands clonos donses ae flbroblastes ont ste o~serves aans ies _ultures de celiules de ca~lle et de poulet lnfectees par cnaque VlsUS temo m Dans toutes les cultures infectées par DA~5 seulcment quelques petlts agre~ats de cellules dlspersees ont ete oDJerveJ. Ces cellules poussaient très lentement et elle n'ont pas pu etre effioacemont replquee-, en consequence, elles n'ont pas pu etre amplifiees De plus, 1~
piupart ae ces ceilulos som~la~ene malade~ et presenealent une morphoioale apiat~e eeo~l~e ~dont quo a cell~ de flbro~ia~tes _enescents Les memes o~servat~ons ont ete faltes d~ns SlX
exper ences md~pendantos en utilisant des fibroblastes secondalres de poulet ou de ca~lle Etant donne que les ceiiuies ~nteceeos par le vlrus tomoln DA~Y sombla~ont aUJs~ sa~nes que aes fibroDlastes normaux, l'offot obJcr~o avec le vlrus D~5 est le plus probablemont d~ a l'expre~ion do la sequence codant pour ~5 Conm~ ces collulo~ ao to~oloppaiont tro~ mal, on n'a pas pu effoctuor d'analyJe l~oulair- ot on oon~ quonce l'oxpro~s~on de la proteine ~5 a ete analyJee par ~ounofluoresconce ;
une colorat~on selon Giemsa Wri~ht du mtme champ a et~
ettectuoe pour a~st~ngu~r ies noyaux ot le cyeopiasme LOJ f~robla~to~ do poulot normaux ~nfoctes par DA~5 one presonte une fluorescence hceerogene lorsqu'ils ont ete eraltes avec anti-HS Toutes les cellules préseneaient tes noyaux sluoroJoen~s ee l'lntonslto to la ~tluor-soonc~ est on Donno oorr~latlon av-o la struoture de h ohromatlne Les noyaux bautom~nt condonJos pre~onta~-nt la fluor-saonce l~ pius :lve, tandl; les noyaux avec uno chromatine mo ms condensee presentalene uno falble tluorosconc-Certains noyaux nautomone cond-nJ-J s-mbialene eere oxpuises des cellule Tnversement les tibroblastos normaux non ln~ s n'ont pas p~eaen~e de ~luorescence significatlve ee ls con~enalent dec noyaux avec une chromat1ne dlspersee typlque .
wo g~ go Q~ 22 PCT/FR9l/00062 5- ~5 e~t phoephor~l~e dnn~ lo~ oellulo~ CT6. Il re~ort des résultats obtenus que l expresslOn de 1~ protelne ~5 n a qu un ea~ble erret sur la crolssance de cellules transrormees. Am sl, oomme etapç su1vante. on a reoherch~ des modirloat~one poet-traductlonnelles possible~ de cette protelne entrainant son lnact1~atlon dans ces cellules. ~tant do~né que la pho phorylatlon pourr~lt etre lmpllquee dans l' m actlvatlon de ~5 aux stades precoceJ de l'erythropol~so normale ~27), on a examlne i~etendue de la phosphorylatlon de H5 dans lo cellule~ OT6. Des cellules OT6 lnfectees par DA~5 et non lnfectées ont ete lncubees en presence de ~3P04 marque au 32p Le~ h~stone~ rlches en lys m e ont ensulte ete eXtralteS, soumi~es ~ une électrophorese sur un gel te polvacryiar~de-SDS, eransrerees sur r.ltrocellulose et l lmportance de la phosphorylatlon a ~t~ dlroctomont anaiyQee par autorad~ographlede la plage de transfert ("blot"~. Une protelne pho~phorylee, absente dans les cellules OT6 te~olns (bande 1~ a ote dotoctoo dans dos cellulo~ OT6 in~toct~os par DAH5 (bande 2\ Pour id-ntlfi-r cotto prot~ino, la m m pla~e de transfert ("blot") a ete traitoo a~oc un anticorps antl-H5, un conjugue ~rote m e A-peroxydase et la 4-a~ino-antipyr~ne comme cubstrat. L~ prote m e H5 a ete dotectoo dans lo~ collules CT6 m rectee~ par DAH5 (bando 4i ot dan~ lo~ hlston-s totalos ^xtral~çs d~eryt~rocy~es de poulçe !k~nde 5), tandls qu aucune :one n'a ote ob~or~oe dans le~ cellules OT6 temo~ns (bande 3). La prote m e phosphorylee tetectee dans la bante ~ a en gros ia meme moblllte que la protelne H5 identifi~e dans leJ bandoJ 4 et. 5 Nous pouvonJ do~c ooncluro quo la prot~ne H5 05t phosphorylec dans les cellulo~ OT6 l~OCt~O~ par D~S
6. Discu~ion Ces exemple temon~re le transfert et ' expresslon eff~cacos de l'hlJtone H5 dans des fibrobiastos normaux e~
~ransfo,mes Le veceeur SIN decrlt dans cette etude a ett _~nstru~t a parta: ~u ~!lruS de la leucose a~rla~re RA'-~ La W O 91/11190 23 '; PCT/FR91/00062 2075~!h'7 delee~on de~ ~equenoes du promoteur dan~ la 3'LTR contult ~
l'integration d'un pro~irus mactif tan~ le~ cellules infectees.
Le vecteur a transféré une copie de oequenoo ~5 etrangero dans le genome do a~a~ue oelluie lnfeotee Il A ete trouve que ce transtert e~t tres stable etant donne que la ~equence H5 inseree etalt enaore pre~ente dans des cellules cult~v~oJ pondant 50 gonoratmons sans pres~lon selectlve.
Dans les cellules infectées avec le vecteur SIN de DAHS, le~ sequences ~5 otaient eran~criteJ a p4rtir du promoteur de MT-IlA lnterne. ~tant donne qu'aucun virus vecteur n'a pu etre recuperé des cellules m t,ectees meme apre5 ~ur m f,ectlon avec un rus auxlllaire, aucune transcription n'a été
m tlee a partlr de la 5'LTR. Le voctour SIN tecrlt lCl est tout à fait fiable et efficace.
lS
On n ' a pas observé t ' ef f ets slgnificatifs doJ ion~ Zn~ sur l'effioaoito to tranJcription de H5 tans let oellulos infoctooJ. ~ome sans stimulation. l'unlte de transcrlpt~on te H5 int~groo etait actmvo. L'actlvlto con~tltutlve du promoteur de MT-IIA et son abJence de repon~e ~ux lons Zn~;
dans le ~ecteur de DA~5 pourralont otro m horontos a co promoteu:
dans une collule avlairo. ou pourra~on~ otro du~ aux eftfots st m~lateurs croe~ par le promotour de SV40 prox~mal oY les LTR
La quantlto do H5 produmte par collulo OT6 m roctoo pas DAH5 ' e~t ~omblablo a oolle trôuveo dans doJ orythrooytot av~alres maturoJ C'e~t pourquo~, 10J offoto do H5 danJ lo~ oellulo~
in~ect~o~ peuvont otre comparos aux oonditlonJ phyJ~oloq~que~
natl~os.
L'exprorJlon do H5 dans dos fibroblastos tran~form~, -'est-~-dire des fibroblasteJ de caille 0~6 ou doJ fi~robla3te~
d o~oryon do pouiet transtormos par AEV-ES4, n'a paJ lDhlbe ieur orolssanco ln vltro. Des OT6 lnfoct~os pas DA~5 no proJen~ent qu une faibie augmentatlOn de ieur temp~ do goneratlon, de 20 ~ 25 - h~ures, mals lour capaclté de csoitre commo une li~née etabl~a !. e W O 91/11190 ~3 ~ 6 24 PCT/FRgl/00062 pas ete dim~nuee. Ce resultat montre explicltement que la production constante de ~5 a peu d'effet sur le phenotypo te ' f~robiastes transtormes.
Les fi~roblastes de caille ou de poulot normaux expr~mant la protelne HS exogène presentalent un potentiel te csolssance tre~
l~m~te et n'ont pu etre m replques m developpes. De plus. ces cellule~ ressenblent a tos cellulo~ ~onoooonto~ avoc uno morphologle ~platie, un cytoplasme vacuoli~e ee des noyaux o condensés. La condensat~on de la chromatine dans ces cellules etalt dlrectement llee a l'expre~lon de ~5 etant donne que les novaux plus conden~es ont pre~onte la fluoro~cence ia plu~ VlVe lorsqu'-ls ont ete traltes avec l'antlcorp~ ~nt~-H5 De plus, certa ms noyaux avec une chromatine hautement condenJ~e etaient expulses des cellules. Ces aonneos montrent par consequent ~ue HS
presente des erfots tres d~fferones dans des tibrobla~tes normaux et transtormes.
Lo rolo blolog~quo ao ~5 a oto rogulloremont lio a l'ldoe qu'll s'a~ t d'un reproJ~our aonoral. Co po m t do vuo ost conflsme par le le fa~t quo, lorsque les noyaux ont ete roactlves par la fuslon d'erythrocytoJ de poulot avoc dos celluleJ HeL , les evonemene-2 procooo~ constatos compronnont uno decondonsatlon àe ia cnronat m o, uno initiatlon do ynth--- d'ARN ot uno di~parlelon ae HS (~) Une etude reoente realiJeo par mlcro-injectlon de H5 dan~
des mqobla~tos de rat L6 en proliferation. lignoo cellulaire qul ConcJorVe le poton~lel do se differonclor on myotubulos, a mon~re que ;a ml~ratlon et la localisaelon to H5 da~- lo- noynux ~alon-.
llees a la dlm~nut~on do la taillo dos cellulos, la vacuDl~satlon du cytoplasme, le ta~somont doJ noyaux et l'inhi~lt~on de ;~
tran~crlptlon et do la repllcatlon 14).
;e fa~t que H5 est hautement pho~phoryloe dans le~ collule~
^T5 transformeos ~nfoctee~ rappolle le procoJsus o~serve dans 1 erythropolose normaie. La pro~ence te ~5 a éte d~tectse ~ un nlveau redult dans dos çrythroblaJteJ on ~tat de dlv~slon prococe Dans ces sellules. 1~ pro~elne nouvellement oynthet~ee es~
25 2075o67 trln~portee d~n~ le ~oy~u ou elle est modiflee p~r un proce~sus mpllquant la pho~phorylatlon unidirectlonnelle continue pendant laqueile neut groupemcnts phosphoryles peuvent ètre lntrodules.
Aux s~ados termlnaUX de la maturatlon do~ ervthrocytos, ia ; protelne phosphorylée est déphosphorylée e~ ce dernler evenemen~
e~t en bonne corrélation avec l'arret de la synthese d'ADN et d' M N ee la condensatlon de la chromatlne (S. 26). On n'a pa~ pu analy~er l'etendue de la pho~phorylation de H5 dans des fibroblastes normaux mfectes par DA~S otant donne que ces cellule~ n ont paQ pu etre a~plifiees.
Lc moca m ~me exact d'lntoractlon de ~5 avoc i'ADN dans io ohromatlne n e~t pa~ connu. Cepondant, on peu~ envlsager un mécamsme qUl permot ~ la cellule de traitor do grandeJ quantltes iS de HS sans deterloratlon du m~tabollsmo ccllulalre, La pho~phoryiatlon de H; proault uno prot~lno qul a mo~ns d'afflnlte pour l'ADN. par neutrali~atlon de~ charge~, C'e~t pourquol, le~
acides amin~J modifies doivent otro looalioo~ dano des domaines qul sont dec~fJ pour cotte intor~ction. c'eot-~-dire la reglon C-term~nale (re~idus 100-182) qui o~t la rogion qui oontribue le plus a la condensation de la chromatine par neutrallsatlon partlel;e doJ phoJphates de l'ADN. La ~S non modifioe montrant plus a'afr m~t~ pour lo~ structuroJ d'ordro ~uperleur de cnroma~ m o ot d'ACN. ~o l~oralt otrolterNnt a 1'ADN, spoclatoment aux r~glon~ rlcho~ en A-T. on ~o condon5ant ot/ou en chan~e~nt sa confor~at~on t20) ot, ~e oette manioro. en bloquant la liaison de la maoh~nerle do transcrlptlon et do ropllcat~on.
Il sora ~ntoros~ant d'otudior lo~ vo~oo motabollque~ qu~ son~
d~rectomont rosponsablos do la phosphorylation do ~S dans dos -ellulos eransftormoos et lour rolat~on avoa l'oxpro~slon d' oncoaenes Etant donne que lo~ tibroblaJtos OT6 et AEV-ES4 ~ont ~ransforre~ par do~ evenements lnltlaux differont~. il est probable que les deux processus aativent des H5-kinases cormunes L'analv~o des motiflcatlons te HS dan~ dlvorJos collules nfectees par DAHS peut ^rre utll! pour det~ m r le role de oette WO 91/11190 PCr/FR91~00062 6~ 26 protéine dans la réplication et la différenciation cellulaires et dans la connaissance des mécanismes de transformation onco~énique.
Vecreurs portant des séquences du virus RAV-0 et une LTR 5' de RSV
Deux vecteurs porteurs d'une LTR 3' dérivée du virus RAV-0, naturellement dépourvue de séquences enhancer, ont été construits.
Le vecteur OVA-ZZ porte les séquences suivantes de 5' en 3':
- Une LTR du virus RSV, - Une séquence leader du virus RAV- 1, - Le gène de résistance NeoR, - - Le ~ène de E. Coli codant pour une beta-galactosidase munie d'un slgnaJ
d'adressage nucléaire, sous le contrôle du promoteur du virus SV40 (gène SVnlslacZ, fourni par J.F. Nicolas de l'lnstitut P~asteur de Paris. cf. Bonnerotet al. 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84. 6795-6799), - La séquence non codante 3' et la LTR du virus RAV-0.
Le vecteur OVA-Zdel est identique au précédent sauf dans sa partie 3' où la LTR 3' de RAV-0 délétée de 50 nucléotides comprenant sa boite CAAT.
Le virus OVA-Zdel peut être produit à un titre de 1000 particules/ml conférant l'activité beta-galactosidase aux cellules infectées.
Par contre le ~ène NeoR n'est pas exprimé dans les cellules infectées, ce qui confirme le caractère auto-inactivant (SIN) de ce vecteur.
~ OrA-2Z
LTR RSV NtoR SVnl~l~cZ l.TR RAY~) ~ } OYA-Zdol L ~r~--~
LTR RSV NeoR SYnl~lecZ LTR RAV(0) délétée ' ': ' ' , ~, .
' WO 91/11190 PCI/FRg1/00062 2o75o67 Les vecteurs OVA-ZZ et OVA-Zdel ont été transfectés dans la lignée helper Isolde. Les surnageants de pools de cellules helper résistantes au G418 ont été titrés sur cellules QT6 d'une part par sélection au G418 (titre NeoR) et d'autre part par révélation in situ de l'activité beta-5 galactosidase ~titre lacZ). Le rapport des deux titres révèle que seul OVA-Zdel est capable d'une auto-inactivation significative: OVA-ZZ donne 100 G418rfu/ml et 100 lacZfu/ml. L'activité de résistancc au G418 des cellules infectées par ce vecteur résulte sans doute de la transcription initiée au niveau de la LTR 5', qui reste donc assez active. Nous avons donc construit OVA-Zdel, un vecteur similaire à OVA^ZZ mais dont la LTR 3~, toujours issue de RAV-0 a été délétée de sa boite CAAT. La titration a été
réalisée à partir de 20 clones de cellules helper transfectées. L'un des clones produit 1000 lacZfu/ml et aucune (~20/ml) G418ru. Ce résultat démontre l'efficacité et l'inocuité du vecteur OVA-Zdel.
Des expériences ultérieures ont permis de mieux comprendre Ies facteurs qui contrôlent l'efficacité du transfert de gène et de l'auto-inactivation, en comparant OVA-ZZ et OVA-Zdel avec une construction portant une LTR 3' de RSV (OVA-D):
- L'expression transitoire du ~ène nlslacZ dans des cellules QT6 transfectées est réduite de 5 à 10 fois par la délétion de la LTR de RAV-0.
- Le niveau d'ARN messager initié à la LTR S' dans les cellules helper résistantes au G418 n'est pas affecté par les séquences 3'.
- L'encapsidation des ARN porteurs des séquences de RAV-0 est réduite d'un facteur 2 ou 3.
2S Ces résultats permettent d'expliquer pourquoi le titre lacZ obtenu avec OVA-Zdel reste inférieur de 100 fois à celui obtenu avec OVA-D.
On a construit des vecteurs dérlvé- de leuco~e aviaire avec un promoteur de transcription interne et diverses ~équences non-codantes en 3'. Des délétions sont introduites dans l'élément U3 LTR aval ~3') pour 30 obtenir l'auto-inactivation de la transcription à médiation LTR après un . ycle de réplication. Cependant, les séquences non-codantes en 3' semblent déterminer non seulement l'aptitude à l'auto-inactivation des vecteurs, !naiS également l'efficacité du transfert de gene. Une analyse plus poussée révèle l'influence de ces séquences tant sur l'expression du gène interne 35 que sur l'encapsidation de l'ARN. Les éléments construits avec une LTR 5' .. . ~ ~ ' . ' . .
:~ .
WO 91/11190 ~ PCr/FR91/00062 de RSV permettent de réaliser un transfert de gène efficace tout en inactivant fortement la transcription promue par LTR en 5~.
L'aptitude des vecteurs auto-inactivants à pro~uire une préparation virale de tirre élevé et à inactiver pleinement le promoteur LTR repose surtout sur la mutation qui est créée- Cependant, les conséquences de la muta~ion des séquences virales non codantes en 3' sur la transcription, le traitement, la traduction, I'encapsidation et la transcrip-tion inverse de l'ARN sont très imprévisibles (R34, R43, R47).
On décrit ici la construction de plusieurs vecteurs dérivés de 0 leucose aviaire avec divers séquences non codantes en- 3'. L'influence de cesséquences en 3' sur l'expression du virus est analysée plus avant et révèle ses diverses conséquences sur l'expression et la réplication des virus.
MATERIAUX ET PROCEDES
Contruction des plasmides OVA (fi~ures 7, 8) On construit DAI en assemblant dans pBR322 les fra~ments suivants: un fragment Xhol à partir de pRAV-2 (R45) portant une LTR
RAV-2 pleinement active et une séquence leader, un Xhol-Xbal de pTXN3' portant une partie de la séquence GAG du virus d'érythroblastose aviaire (R29), un fragment Accl-Bgltl de pSV2Neo (R50) dans l'orientation directe, et une LTR en 3' délétée. La LTR délétée est créée par assemblage de la partie 3' du génome RAV-2 (de Xhol à un linker Clal inséré dans le site Sphl qui est situé à 149 nucléotides en amont du site de la capsule). Cette délétion enlève les boîtes TATA et CAAT.
On construit OVA en assemblant le polylinker de pBluescript (Stratagene SanDiego), les fragments suivants: le fraRment Ndel-EcoRI de pUT507 (RS2) (portant 0,5 kh de séquences de RSV souche Schmldt-Ruppin D, couvrant une partie du gène v-src et la partie amont d'U3), I'EcoRI-Xhol de pRAV-I (R35) (de U3 à GAG) un Xhol-Xbal de pTXN5' (R29b WO91/1119~ PCT/FR91/00062 .: 29 207aO~7 (gène NeoR) et le fragment Sall-BamHI de pMuMLVSVnlslacZ
(R24) (le promoteur SV40) suivi par une version mutée du gène lacZ d'E. coli codant pour une protéine ciblée au noyau de la cellule). Etant donné l'insertion de petits fragments de polylinker pBluescript, cette structure est flanquée de deux sites de restriction SpeI.
Pour construire OVA-D, on transfère le fragment Ndel-Xhol d'OVA entre les sites Saml et Xhol de pBluescript (pour fournir une séquence non codante en 3' type RSV complète), puis on insère le fragment OVA Spel dans le site Spel amont dans : l'orlentation droite. On construit OVA-ZZ en transfé-rant le fragment HindIII-BamHI de pGJ18 ~R19) porlant IS deux copies de RAV~0) LTR dans pBluescrlpt (donnant BluZZ~, pu~s en insérant le fragment OVA Spel dans le site ~indIII de BluZZ dans l'orientation correcte, après remplissage partiel des extrémités saillantes par la polymérase de Klenow. On obtient OVAZdel en . 20 délétant BluZZ par digestion à Ndel et religationà faible concentration d'ADN ~donnant BluZdel) et en.insérant le fragment OVA Spel au site HindIII, Culture cellulaire Tous les réactifs sont achetés auprès de Gibco. On cultive des cellules helper Isold ~R44) dans un milieu William5 additionné de 54 de sérum de foetu~ de veau, 2~ de ~rum de poulet, NaCl ~60 mM), pénicilline ~1000 u/ml), streptomycine (0,05~, phl~omycine (50 ~g/ml) et hygromycine (50 ~g/ml). On cultive QT6 (R36) et des fibroblastes embryonnaires de poulet préparés à partir de .
WO91~11190 PCT/FR9ltO0062 ~ 30 à partir d'embryons S/O SPAPAS âgés de l0 jours (CEP, R45) dans un milieu HamPl0 additionné de 5% de sérum de veau, 1% de sérum de poulet, 2% de bouillon de tryptose phosphaté, de la pénicilline et de la streptomycine. On change le milieu tous les trois jours.
Transfectio~, production de virus et titrage On transfecte l'ADN de plasmide purifié
par production de bandes CsCl (R39) dans des ~ellules 9. ~u~ d-pho~phoryl~tio~ d-ln prot~ino ~5. The collulea ont oto ancuDeeJ pentant 4 h tanJ un mlllou es~en~le ~n~mal x-mpt do PhOJPhat~, PU~ Ont and~ mart~uees pentant 1 h tan~ the same m~liou by ~ mCi de H3P04 m~rqu~ au 32p ~Amer~h~m Corp 1 Le~ hlJtonos rlches en ly~nc have been xtra~teJ with the ~cate perchiorlche ~ 5~ e~ submitted ~ an electrophore~ e like decrlt higher ~ high. The pho5phorylat~0n of H5 was detected after r.ran~tcrt tu qe1 sur paplcr de nltrocellulo~ee~ autorad~ograp~1e de la plaae de transrere ("blot.'l. The mome place de eransrert ~'blot") was used for the detection of protelne H5 with !~n antlbody ant~-~5 and ur. con~ugue protects me A-peroxidase from -2075~b7 ramfort ~mcr~bam) ~5 ~ been lnally ~lsuali~cc by lncuba~lon in 10 m~ of Trls, p~ 7.1, 0.0~5% of H202, 0.04% of 4-amlnoantlpyrlne ~sigma! and 0.2~ of phenol.
ll - RESULTS
ulal~-- d- l'~ t d- l'lJU~ ir~ d~o le a-lluloe cnt6 i~fo~t~-rp~r OU~ls. CT6 cells, a line of chemically transformed quail fibers (17), were :. 10 lnsected~ by a reserve dc vlru6 DA~5 depour~ud ~ssistant ("helper free"~
pll6 selected by G418 and amplified in cultures polyclonal. These cells have no viruses and the ~
supernatants of cultures superinfected by a ~ lrus assistant (helper) normai etalent lncapa ~ los to transmit the resistor ~ G41 ~.
Since no vlru~ could be found. we conclude that in the cells infected by D~S, the pro~irus mtegre e~t inactive from the point of ~ ue transoription. To determine the : presenoo, the gold pn~satlon and the number of coples of the DNA vector ntrodult, a ~DN of h~ut polds l~oulairo pro~-nant of cells CT6 mfoctoes or not rnroctees has ~ te prepared lS ~ g of DNA have been digested ~ by restriction enzymes and were 0Xam ~ 30S by the : metnode of the Soutnern blottlng with a- probe oont-nant the reglon coding for ~5 ~flg 3! L'-nzyme de rostrlotion ~hol ooupe aeux fols ~ the inter~ our iu vector and the prosonoo d a fragment of 4.6 : 25 kiloka ~ s (kb) or therefore characteristic of the genes ~ntacts ~5 and noo. The expected fraament do 4.6 kb has been deleted tanJ leJ oellule~ infootoos ~bando ~), ma~s 11 n'~talt pa~ pr~ent in DNA do ~ oelluleJ non lnfoct ~ e5 ~ b ~ nde 6).
' ~18 preo ~ ment the presence of an MTII-H5 fragment lntact, the AON of Infected and non-infected GT6 cells ~ was cut by ~ bal.
As expected. a 2.1 kb fragment was detected in the 6 cells lnfected ~ lband 5) and has not been detected in cells no ~
lnfected (band 4) This data shows that the ln~ere provlrus do not have any major rearrangements6 and present the expected structure. Le~ rragment~ de haut po~ds molecuia~re : ob~er~es in the ccllule~ mfectce~ and not m focteos correspond to the endogenous H5 gene. A p rtlr ~ntensltes ~es bands at 2.1 and 9.5 kb in the cell ~ i ~ fected, we have estlme that an exogenous ~5 gene has been integrated per genome ceilulalre To conflrmer this ostamat ~ on, we compared l lntcnslte of the oande of 2.1 kb has ~it thundered by a ~uantlt~
; ^onne of sequences H5. 15 ~ g DNA ganom ~ that avlalre repre ~ hear o.106 genomes before alres. Bandos 1. 2 and 3 contain respectively 105. 6.106 and 6.107 cop ~ es of plasmlde p ~ Tho dl ~ ere by EcoRI. If we compare the hybrldatlon intonslte of the 0.3 kb fraymcnt from bando 2 to 2.1 kb fragment of bando 5, we con~rmon~ that a COple tU proVlrU~ 3A~S has been msered by genome To determine the rate of specific transcripts of gene Y5 in CT6 cells mrected by DAH5 and not mrected~ ~a quantitative analysis with the Sl nuolcaje was used frlg 4) The ~ ~ cnde of ~ DN ct. ~ lt a 5 ~ m ~ I-Pstl fragment of 1026 bp ~ sole of the plasn~ of pMT~5. This fragment contains the promoter te MT-;;A ee lk nucl ~ otmde ~ of ~ equence coding for H5. Lo~ tran~crlts ~n1t1es to the promoter do MT-II ~ do ~ have otro protogcs aur uno lengthuour de 316 pb (l3~ Co~mo planned, a ~ragmont protected do pros do 315 nuclèat ~ te6 has been detected with RNA te cells OT6 ~ ntec ~ eec by ~AH5 (bands ~ at 5~ A protected rracment of the mo~me tallle has been detected in aes collulos OT6 lnrocteoJ by DAH5 ma m~onu-s en culture for 50 aeneratlon6 without selecting on p~r G41~ (band 5~
No protected fragment born ~ e detected with cell RNA c 3TG
non msec~-e~ (band 1~. The promoter of NT-I;A huma~ne little~e~re ,ndu~ pas des me~ ml~ur~ ~el~ que 7n~ 3) Po~ es~e:
20750b`7 the increased expression of the HS gene ~ partlr of the internal promoter, OT6 infected were exposed for 24 ha SO ~M (band 3) or 100 ~ M ZnCl ~ (bante 4) avan ~ isolation of RNA. The quantity d mRNA of ~5 did not increase significantly compared to the A ~ N of the cells not ~ ntected (band 2!. We can conclude that the transcription of the sequence coded for HS was effectively and corroctoment im tiated in the cells ~ OT6 and that the addition of Zn~ did not increase the degree of transcriptlon. Of plus the ~equence coding for ~5 a king~ tran~reree tan~ the OT6 cells eealt expressed stably laying at ~ olns 50 ~eneratlons of culture~ freed~ from the ~electlon by G418 2. EspreJ~ion do 1~ prot~in~ ~5 dnn~ d~s fibrobla~tes OT6 infe~t~ pnr 1- ir~JD ~ 5. The JyntheJe of hl~tone H5 ae~e ~e~urea dan~ de~ cell~ CT6 lnfected by DA~S and not ln~ectecs The total hlstones were extracted from isolated purified nuclei cells~ re~ poctivo~. Los prote mo~ have been analyzed by electrophoreJo Jur gol of polyaorylamido, tranJfereoJ on nitrocellulo~e and the pro~ence of ~5 was detected after ~ncubat~on the transfer range ("blot") with an antibody antl-~5 and the prote me Al~SI~fig. S). Antibody cost na ton no slonal when he was to~te against 10J hia~one~ to~aies te cell~ OT6 no m foctee~ tralteos aroc 0 ~band 6), 50 µM ~band Si ou 100 ~M do ~nC12 (band 4) A slgDal clearly readable with ~ec the me~e ~ob~l~to of ~S pu~1f~ee (bandJ 7, ~, 9) or of ~S
of hi ~ toneJ total chicken erythrocytes (bands 10.! 1. '2). 3 eto detocto avoc los hlstonos totaloJ do 5,106 oollulos ~6 l~octoes per ~5 tra~too~ avoc 100 U~ do ZnCl2 (bante 1). 50 µM
of ZnCl~ (bando 2~ or no ZnC12 (bando 3).
: quant ~ fler the productlon of H5 in back cells OT6 infoctee ~, your known quantltes of H5 purllee. 0.5 µg Iband 7). 1~g lcande ~ and ~ ua ~bando 91, or d'hlstono~ totalos extra~tes de - lQ6 (band l0). l0 l06 (band ll~ or ~0.l06 ~band 12!
erythrocytes of adult chickens were subjected to a eiectro, D~ore~o on the gel mome. A partlr to coq roouitats, we can conciure that ouant ~ te of H5 pre ~ onte in 5 10 - wo gl/lllgo ~ Q ~ 20 PCT/FR9l/00062 cell- OT ~ lntectee ~ p ~ r D ~ H5 is eqUl ~ alente A la au ~ ntlte dc H5 produced by 5.10 erythrocytes of adult chickens and that ie did not au~men~e the ~5 productlon ~egre. The io~ailiatlsn nuciealrs of H5 in le3 3T6 cells lntec~oes? r DA~5 was monitored by munofluorescence.
3. Propri~t~rd~a oollul~a 0~6 ~td~of ibrobla~t~i trnnafor~e pnr ~IEr-ES~ ~spri ~nt 1~prot~ino ~5. From cultures of OT6 inserted by DA~5 have developed large ro~ers ~ n ~ es containing ~ cell ~ phenotypically not different ~ i ^
0~6 cells not lntected or lnfeceeec cells by the vlru--.emol~ e ia even f~corm chicken .lbroblasts passed on by the retrovirus to the AEV-ES4, were infected by 3AffS ~es celP:les cn~ develops deo foyer~ ne pou~ant ~re dlstlr ~ gue ~ of those of cells lnfected by TgN3 'and fl3 n have could not bereamplltleos~not shown~. ~our ox~m~ner de racon plus approrondle sl the protolne H~ pouvalt a~olr a cer~aln effe~ on the ~ tran ~ cells formed, we have comçare the clnetique of roljsance of uninfested OT6 stools to that of infested OT6 by DA~5 or p~r ~N3'. Collulalros ~rols typos have been ~ nseeds lndl ~ duellemon ~ ~ the momo donslte in boi ~ e ~ this ju mm and -ul: lves dan ~ the same conditions. Ensult-, ~dlfferen~r del~ls, i~ cells have been tried and counted It can be seen that the QT6 cells infected with DAH5 have presented a growth piu~ slower than lç~ coilule~ ~T6 no ~nfeotoes or Infeotoos pa~ TDN3' Los temp3 do gonorat~on may have been es~me _0 h for e3 ceiiuls~ OT~ ~emo1ns and at '5 h for ioC coilules CS~
?rOdUlSant A protelne H5 We can therefore conciurs that i express:-r. ie i~ protein H seems to have little effect ~ u:
13 _role~anoe des ^cellule~ 0~5 et le5 fibroblaste3 tr n3~0rms p3r A~V-ES~
4. Espre~io~ and effects of 1~ protein ~5 daD~ of fibro~lasto# nor us 3rd ~ibroblasts ~'embr70n chicken WO 91/11190 PCT / FR9l / 00062 207aO~'7 (OEF) and quail embryo fibroblasts (OEF) were lnfected either by the vlrus DA}I5 SOlt not the vlrus temolns, T ~ 3' or DA~Y 31X ~bear apros selectlon in a mlileu containing G~i6 large clones donated to fibroblasts have been observed in ies Cultures of Ca~lle and Chicken Cells Infected with Cnaque VlsUS temo m In all infected crops by DA ~ 5 only a few approved petlts of dispersed cells have been oDJerveJ. These cells grew very slowly and it could not be effectively replicated, in therefore, they could not be amplified In addition, 1~
part of these cells are sick and presently a morphoioale apiat~e eeo~l~e ~dont quo a cell~ de flbro~ia~tes _enescents The same observations were made in SlX
md~pendantos experiments using fibroblasts secondaries of chicken or ca~lle Since the ceiiuies ~nteceeos by the vlrus tomoln DA~Y sombla~ont aUJs~ sa~nes that aes normal fibroDlastes, the ofot obJcr~o with the vlrus D~5 is the most likely, the expression of the sequence coding for ~5 As these collulo~ ao to~oloppa were too bad, we couldn't effoctuor d'analyJe l~oulair- ot on oon~ once the oxpro~s~on of the protein ~ 5 was analyJee by ~ ounofluoresconce;
a coloring according to Giemsa Wri~ht of the same field a and~
ettectuoe for a~st~ngu~r ies ot cyeopiasm LOJ f~robla~to~ do poulot normal ~nfoctes par DA~5 one exhibited heterogeneous fluorescence when wiped with anti-HS All cells presented with anti-HS
nuclei sluoroJoen~s ee the lntonslto to the ~tluor-soonc~ est on Donno oorr~latlon av-o the h ochromatlne struoture The nuclei bautom~nt condonJos pre~onta~-nt la fluor-saonce l~ pius :lve, tandl; nuclei with condensed mo ms chromatin presentalene uno falble tluorosconc-Some nautomone nuclei cond-nJ-J s-mbialene eere oxpuises Tnverse cells normal non-ln ~ s tibroblastos do not suffer from any significant luorescence containing nuclei with a typical dark chromate .
wo g~ go Q~ 22 PCT/FR9l/00062 5- ~5 e~t phoephor~l~e dnn~lo~oellulo~ CT6. It requires results obtained that the expresslOn of 1 ~ protelne ~ 5 has only one ea ~ ble erret on the growth of transrormees cells. Am sl, as next step. we looked for mods ~ one poet-traductlonnelles possible~ of this protelne entailing its lnact1~atlon in these cells. ~ as do ~ born as pho phorylatlon could be lmpllquee in the m actlvatlon of ~5 at the stages precoceJ of erythropol ~ so normal ~27), we examined i ~ extent of the phosphorylatlon of H5 in lo cell ~ OT6. From OT6 cells infected with DA~5 and uninfected were incubated in the presence of ~3P04 mark at 32p Le~ h~stone~ rlches en lys me were followed by eXtraltes, subjected to electrophoresis on a gel te polvacryiar ~ de-SDS, eransrees on r.ltrocellulose and l lmportance of phosphorylatlon a ~ t~ dlroctomont anaiyQee by autorad~ograph of the transfer range ("blot"~. A
pho~phorylated protelne, absent in OT6 te~olns cells (band 1~ a ote dotoctoo in back cellulo~ OT6 in~toct~os by DAH5 (band 2\ For id-ntlfi-r cotto protein, the same place of transfer ("blot") was treated with ~ oc an antl-H5 antibody, a combines ~rotate me A-peroxidase and 4-a~ino-antipyr~ne as cubstrat. The prote me H5 has been dotectoo in the CT6 collules m rectee~ by DAH5 (bando 4i ot dan~ lo~ hlston-s totalos ^xtral~çs d~eryt~rocy~es de poulçe!k~nde 5), while none : one has not ob ~ or ~ oe in the ~ OT6 temo ~ ns cells (band 3). The protect me phosphorylated detected in the bante ~ basically ia meme moblllte as the H5 protelne identified in leJ bandoJ 4 and. 5 We can therefore conclude that the protein H5 05t phosphorylec in cellulo~ OT6 l~OCt~O~ by D~S
6. Discussion These example temon ~ re the transfer and 'expresslon eff ~ cacos of hlJtone H5 in normal fibrobiastos e ~
~ransfo,mes The SIN vector decrlt in this study has ett _~nstru~ta parta: ~u ~!lruS of leukosis a~rla~re RA'-~ La WO 91/11190 23'; PCT/FR91/00062 2075~!h'7 delee ~ on de ~ ~ equenoes of the promoter dan ~ the 3'LTR contult ~
the integration of a pro ~ irus mactif tan ~ the ~ infected cells.
Vector transferred copy de oequenoo ~5 etrangero in the genome do a~a~ue oelluie lnfeotee It was found that this transfer was very stable being gives that the inserted sequence H5 is still present in cult cells v~oJ laying 50 gonoratmons without pres~lon selectlve.
In cells infected with the SIN vector of DAHS, the ~ sequences ~ 5 were deleted from the promoter of MT-IIA Internal. ~ as long as no vector virus could be recovered from mt cells, ected even after 5 ~ ur mf, ectlon with a auxiliary rus, no transcription has been m tlee a partlr of the 5'LTR. The SIN tecrlt lCl voctour is quite reliable and efficient.
lS
We did not observe the effects slgnificatives doJ ion~ Zn~ on the effioaoito to tranJcription of H5 tans let oellulos infoctooJ. ~ome without stimulation. the bottom of transcrlpt~on te H5 int~groo was actmvo. The actlvlto con tltutlve of the MT-IIA promoter and its absence of repon ~ e ~ ux lons Zn ~;
in the ~ sector of DA ~ 5 could otro m horontos a co promoteu:
in an avlairo collule. or can~ we~ otro du~ to the eftfots st m~lators croe~ by the promotour of SV40 prox~mal oY the LTR
The quantlto do H5 produmte by collulo OT6 m roctoo not DAH5 'e~t ~omblablo a oolle trôuveo in doJ orythrooytot av~alres maturoJ C'e~t why~, 10J offoto do H5 danJ lo~ oellulo~
in~ect~o~ can be compared to oonditlonJ phyJ~oloq~que~
natl~os.
The exprorJlon do H5 in back fibroblastos tran~form~, -'est-~-say quail fibroblasts 0~6 or doJ fi~robla3te~
do~oryon do pouiet transtormos par AEV-ES4, n'a J lDhlbe ieur orolssanco ln vltro. OT6 lnfoct~os not DA~5 no proJen~ent that a small increase in their temp ~ do goratlon, from 20 ~ 25 - hours, but their ability to csoitre commo a li ~ born established ~ a!. and WO 91/11190 ~ 3 ~ 6 24 PCT / FRgl / 00062 not been diminished. This result clearly shows that the constant production of ~5 has little effect on the phenotypo te ' transformative f~robiasts.
Normal quail or chicken fi~roblasts express the exogenous HS protelne present a potential you csolssance tre ~
l~m~te and could not be m replicated m developed. Moreover. those cell~ looks like tos cellulo~ ~onoooonto~ avoc uno flattened morphology, a vacuoliated cytoplasm of the nuclei o condensed. The condensation of chromatin in these cells etalt dlrectement llee has the expre ~ lon of ~ 5 given that the more condensed new ones have pre-contaminated the fluoro-cence i rained VlVe when -ls have been treated with the antlcorp ~ ~ nt ~ -H5 In addition, some nuclei with highly condensed chromatin were expels cells. These aonneos therefore show ~ue HS
shows very different erfots in normal tibroblasts and transformers.
Lo rolo blolog~quo ao ~5 a oto rogulloremont lio a l'ldoe it is about an aonoral reproJ~ our. Co po mt do vuo ost conflsme by the fact quo, when the nuclei have been roactlves by the chicken erythrocytoJ fusion with HeL cell back, the evonemene-2 procooo~ findings include a decondonsatlon toe ia cnronat mo, uno initiatlon do ynth--- d'RNA ot uno di~parlelon ae HS (~) A recent realiJeo study by mlcro-injectlon of H5 dan~
proliferating L6 rat mqobla ~ tos. cellular lignoo qul ConcJorVe le poton~lel do se differonclor on myotubulos, a mon~re that; a ml ~ ratlon and the localisaelon to H5 da ~ - lo- noynux ~ alon-.
llees a la dlm~nut~on do la taillo dos cells, la vacuDl~satlon of the cytoplasm, the ta~somont doJ nuclei and the inhi~lt~on of;~
tran ~ crlptlon and do the repllcatlon 14).
;e fa ~ t that H5 is highly pho ~ phoryl in the ~ collule ~
^T5 transformos ~nfoctee~ reports the procoJsus o~serve in 1 normal erythropolosis. The pro~ence te ~5 was d~tectse ~ a nlveau redult in dos çrythroblaJteJ on ~tat de dlv~slon prococe in these cells. 1~ pro~elne newly oynthet~ee es~
25 2075o67 trln~porte d~n~ the ~oy~u where it is modified by a process mplquant the unidirectional pho ~ phorylatlon continues during laqueile neut phosphorylated groups can be introduced.
At the termlnal stages of the maturation of erythrocytos, ia ; phosphorylated protein is dephosphorylated e~ this last event~
e ~ t correlates well with the arrest of DNA synthesis and of MN ee the condensatlon of chromatlne (S. 26). We have not could not analyze the extent of H5 phophorylation in normal fibroblasts mfected with DA~S given that these cell ~ n paQ could be a ~ plified.
Lc moca m ~ me exact lntoractlon of ~ 5 avoc i'ADN in io ochromatlne does not ~ t ~ known. However, one can envlsager a qUl permot mechanism ~ the cell of traitor do grandeJ quantltes iS of HS without deterloratlon of the m ~ tabollsmo ccllulalre, The pho ~ phoryiatlon of H; proault uno prot~lno qul a mo~ns d'afflnlte for DNA. by neutrali~atlon de~charge~, C'e~t why, the~
modified amino acids must otro looalioo~ dano domains what are dec~fJ for this intor~ction. that is to say the region C-terminal (re~idus 100-182) which where the region that contributes the more has the condensation of chromatin by neutrallsatlon partlel;e doJ phoJphates of DNA. The unmodified ~S showing plus a'afr m~t~ for lo~ structuroJ d'ordro ~uperleur de cnroma~ mo ot from ACN. ~ol~oralt otrolterNnt a 1'ADN, spoclatoment to the r~glon~ rlcho~ in A-T. on ~ o condon5ant ot/ou en chan ~ e ~ nt sa confor ~ at ~ on t20) ot, ~ e oette manioro. by blocking the binding of the maoh~nerle of transcrlptlon and ropllcat~on.
Il sora ~ntoros~ant d'otudior lo~ vo~oo motabollque~ qu~ son~
d~rectomont rosponsablos do phosphorylation do ~S in back -ellulos eransftormoos and lour rolat~on avoa l'oxpro~slon d' oncoaenes Since lo~ tibroblaJtos OT6 and AEV-ES4 ~have ~ransforre~ by do~ lnltlaux events differ~. It is likely that both processes aerate common H5-kinases L'analv~o des motiflcatlons te HS dan~ dlvorJos collules nfected by DAHS can ^rre utll! for det~ mr the role of oette WO 91/11190 PCr / FR91 ~ 00062 6~26 protein in cell replication and differentiation and in the knowledge of the mechanisms of onco~enic transformation.
Vectors carrying RAV-0 virus sequences and an RSV 5' LTR
Two vectors carrying a 3' LTR derived from the RAV-0 virus, naturally devoid of enhancer sequences, were constructed.
The OVA-ZZ vector carries the following sequences from 5' to 3':
- An LTR of the RSV virus, - A leader sequence of the RAV-1 virus, - The NeoR resistance gene, - - The ~ ene of E. Coli coding for a beta-galactosidase provided with a slgnaJ
nuclear targeting, under the control of the SV40 virus promoter (gene SVnlslacZ, supplied by JF Nicolas of the lnstitut P~asteur in Paris. see Bonnerot et al. 1987, Proc. Natl. Acad. Science. USA 84. 6795-6799), - The 3' non-coding sequence and the LTR of the RAV-0 virus.
The OVA-Zdel vector is identical to the previous one except in its 3' part where the 3' LTR of RAV-0 deleted by 50 nucleotides comprising its CAAT box.
OVA-Zdel virus can be produced at a titer of 1000 particles/ml conferring beta-galactosidase activity on infected cells.
On the other hand the ~ ene NeoR is not expressed in the infected cells, this which confirms the self-inactivating character (SIN) of this vector.
~OrA-2Z
LTR RSV NtoR SVnl~l~cZ l.TR RAY~) ~ } OYA-Zdol L ~r~--~
LTR RSV NeoR SYnl~lecZ LTR RAV(0) deleted '':'' , ~, .
' WO 91/11190 PCI/FRg1/00062 2o75o67 The OVA-ZZ and OVA-Zdel vectors were transfected into the Isolde helper line. Supernatants from pools of resistant helper cells with G418 were titrated on QT6 cells on the one hand by selection with G418 (NeoR title) and on the other hand by in situ revelation of the beta-5 galactosidase ~ lacZ titer). The ratio of the two titles reveals that only OVA-Zdel is capable of significant self-inactivation: OVA-ZZ gives 100 G418rfu/ml and 100 lacZfu/ml. The G418 resistance activity of cells infected with this vector probably results from the transcription initiated at the 5' LTR, which therefore remains fairly active. So we have builds OVA-Zdel, a vector similar to OVA^ZZ but whose LTR 3~, still from RAV-0 has been deleted from its CAAT box. The titration was produced from 20 clones of transfected helper cells. One of the clones produced 1000 lacZfu/ml and none (~20/ml) G418ru. This result demonstrates the efficacy and safety of the OVA-Zdel vector.
Subsequent experiments have provided a better understanding the factors that control the efficiency of gene transfer and self-inactivation, by comparing OVA-ZZ and OVA-Zdel with a construct carrying an RSV 3' LTR (OVA-D):
- The transient expression of nlslacZ ~ ene in QT6 cells transfected cells is reduced 5 to 10-fold by deletion of the RAV-0 LTR.
- The level of messenger RNA initiated at the LTR S' in the cells G418-resistant helper is not affected by 3' sequences.
- The encapsidation of the RNA carrying the RAV-0 sequences is reduced by a factor of 2 or 3.
2S These results explain why the lacZ titer obtained with OVA-Zdel remains 100 times lower than that obtained with OVA-D.
Avian leukemia-derived vectors were constructed with a internal transcription promoter and various non-coding sequences in 3'. Deletions are introduced into the downstream U3 LTR element ~3') to 30 achieve self-inactivation of LTR-mediated transcription after a . replication cycle. However, the 3' non-coding sequences seem determine not only the self-inactivation ability of vectors, !NaiS also the efficiency of gene transfer. Further analysis reveals the influence of these sequences both on the expression of the internal gene 35 than on RNA encapsidation. Elements built with a 5' LTR
.. . ~~'. ' . .
:~ .
WO 91/11190 ~ PCr/FR91/00062 of RSV make it possible to achieve efficient gene transfer while strongly inactivating LTR-promoted transcription at 5~.
The ability of self-inactivating vectors to produce a high-fire viral preparation and fully inactivate the promoter LTR relies mostly on the mutation that is created- However, the consequences of the muta ~ ion of non-coding viral sequences in 3 'on the transcription, processing, translation, encapsidation and transcription RNA reverses are very unpredictable (R34, R43, R47).
We describe here the construction of several vectors derived from 0 avian leukosis with various 3' non-coding sequences. The influence of 3'-ceasequences on virus expression is further analyzed and reveals its various consequences on virus expression and replication.
MATERIALS AND PROCESSES
Construction of OVA plasmids (fi ~ ures 7, 8) DAI is constructed by assembling in pBR322 the fra ~ ments following: an XhoI fragment from pRAV-2 (R45) carrying an LTR
Fully active RAV-2 and a leader sequence, an XhoI-XbaI from pTXN3' carrying part of the GAG sequence of the avian erythroblastosis virus (R29), an Accl-Bgltl fragment of pSV2Neo (R50) in the forward orientation, and a deleted 3' LTR. The deleted LTR is created by assembling the 3' part of the RAV-2 genome (from XhoI to a Clal linker inserted in the site SphI which is located 149 nucleotides upstream of the capsule site). This deletion removes the TATA and CAAT boxes.
OVA is built by assembling the polylinker of pBluescript (Stratagene SanDiego), the following fragments: the Ndel-EcoRI fraRment of pUT507(RS2) (carrying 0.5 kh of Schmldt-Ruppin strain RSV sequences D, covering part of the v-src gene and the upstream part of U3), EcoRI-XhoI
of pRAV-I (R35) (from U3 to GAG) an XhoI-Xbal of pTXN5' (R29b WO91/1119~ PCT/FR91/00062 .: 29 207aO~7 (NeoR gene) and the SalI-BamHI fragment of pMuMLVSVnlslacZ
(R24) (the SV40 promoter) followed by a mutated version of the lacZ gene of E. coli encoding a targeted protein to the cell nucleus). Given the insertion small fragments of pBluescript polylinker, this structure is flanked by two restriction sites spI.
To build OVA-D, we transfer the Ndel-XhoI fragment of OVA between the Saml and XhoI from pBluescript (to provide a sequence not encoding in 3' complete RSV type), then we insert the OVA Spel fragment in the upstream Spel site in : right orientation. We construct OVA-ZZ by transferring rant the HindIII-BamHI fragment of pGJ18 ~ R19) carrying IS two copies of RAV~0) LTR in pBluescrlpt (giving BluZZ~, pu~s by inserting the OVA Spel fragment into BluZZ's ~indIII site in the correct orientation, after partial filling of the protruding ends by Klenow polymerase. We get OVAZdel by . 20 deleting BluZZ by digestion with Ndel and religation at low concentration of DNA ~ giving BluZdel) and by inserting the OVA Spel fragment at the HindIII site, Cellular culture All reagents are purchased from Gibco. Isold ~R44 helper cells are cultured) in a William5 medium supplemented with 54 of serum calf fetus, 2~ chicken rum, NaCl ~60 mM), penicillin ~1000 u/ml), streptomycin (0.05 ~, phl ~ omycin (50 ~ g / ml) and hygromycin (50 ~ g / ml). QT6 (R36) and fibroblasts are cultured chicken embryos prepared from .
WO91~11190 PCT/FR9ltO0062 ~30 from 10-day-old S/O SPAPAS embryos (CEP, R45) in a HamPl0 medium supplemented with 5% of calf serum, 1% chicken serum, 2% broth phosphate tryptose, penicillin and streptomycin. We change the medium every three days.
Transfection, virus production and titration Purified plasmid DNA is transfected by production of CsCl (R39) bands in cells
10 Isold soit par précipltation au phosphate de calcium (R40) soit au polybrène (R41). ~n séle~ionne les uellules (250 ug/ml) avec G418 (Gibco) 24 heures après tranfection, pendant au moins l0 jours. On récolte le surnageant viral à partir de cellules 15 subconfluentes 16 heures après changement du milieu, et on centrifuge (2000 g, S minutes~ pour enlever les débris cellulaires. Pour le titrage, on ajoute ~l à 500 ~l de surnageant de cellules helper à des cellules QT6 ou CEF (S x l0 cellules par 25 cm2).
20 On sélectionne les cellules infectées avec G418 au bout de 24 heures, ou on les colore pour déterminer l'activité de nlslacZ au bout de 48 heures ~RS3) Analyse de 1'ARN
On extrait l'ARN à partir de cellules helper 25 ou de surnageant centrifugé (45 minutes, '5000 tpm dans un rotor de ~ackman SW41) par digestion à la prot~inase K et extraction au ph~nol-CHCl3 co~me il est dit (R39). On hybride les produits de buvardage à fentes et de buvardage Northern avec un échantillon d'ARN synthétisé in vitro marqué avec 32P en utilisant des techni~ues standards. On proc~de à l'établisse-ment de la carte Sl comme il est dit (R39).
-~
.
' --WO91/11190 PCT/FR9l/00062 207aO67 RESULTAT~S
Une importante délétion dans les éléments promoteurs du LTR en 3' réduit le titre du virus La figure 7 montre la structure de DAl, vecteur portant le g~le ~eoR promu par le promoteur SV40 et inséré dans l'orientation directe(par rapport à la transcription du virus). On délète la séquence U3 de la LTR en 3' à partir du nucléotide -149 à -15 10 (jusqu'au site de capsule ; voir matériaux et procédés).
Cette délétion comprend la boîte C M T et la boite TATA mais ni la séquence enhancer ni le signal de polyadénylation. Plusieurs autres vecteurs sont dérivés de DAl par insertion d'un gène additionnel 15 entre la LTR en 5' et le promoteur SV40, dans l'orien-tation inverse.
On transfecte ces produits de construction dans les cellules helper, qui sont ensuite sélec-tionnées avec G418, et on titre les virus recombinants 20 à partir du surnageant cellulaire. Les titres viraux sont faibles, allant de 3U G418 rfu/ml à 200 G418 rfu/ml lorsqu'on te~te les populations de cellules clonales. On surinfecte les cellules infectées ré-sistantes avec un virus helper compétent pour la 25 réplication pour sauver les virus non inactivés.
Comme aucun virus recombinant n'e8t aauvé dans un ensemble d'environ 100 clonea cellulair-a 1nfoct~s, on conclut que la délét~on inact~vo efficacement le promoteur LTR en 5' après un cycle de répli-30 cation vlrale.
L'analyse d'ARN Sl ~Choue à détecter lesARN promus par LTR et par SV40 dans les cellules WO91/11190 ~ PCT/FR91/00062 ~ 32 helper transfectées résistantes à G418. (Une expé-rience témoin a ~té réalisée avec succès avec pTXN3', vecteur antérieurement décrit (R29J). Ainsi, il est vraisemblable que la stabilité et/ou le traite-S ment d'extrémité en 3' de l'ARN soit affectés parla mutation LTR en 3'. L'ajout d'un signal de poly-adénylation SV40 en aval du LTR en 3' échoue à réta-blir le titre viral ~données non représentées). Par conséquent, une approche semblable à celle qui a 10 été utilisée avec succès pour gén~rer des virus auto-inactivants dérivés de virus de nécrose de rate de rat aboutit à un faible succès avec les virus dérivés de leucose aviaire.
Modifi~ation des séquences non codantes en 3 ! seulement Pour permettre une comparaison directe de diverses séquences non codantes en 3' et étudier précisément leur influence sur l'efficacité du trans-fert de gène, on met au point une série de vecteurs qui ne diffèrent que par leur extrémité 3'. On y : 20 parvient en construisant OVA, plasmide qui peut fournir sous la forme d'un seul fragment de restriction une ; cassette portant (Ae 5' à 3') une LTR pleinement active de type RSV, une séquence leader RAV(l), la séquence codante NeoR, et le gène nlslacZ commandé par le 25 promoteur de transcription SV40 (comme l'unité SV40-nlslacZ est placée dans l'orlentation avant, il e3~
concevable que la réinitiation de traduction puisse se produire à faible fréquence ~ur les transcripts promus par LTR en 5', et rendent compte d'une faible 30 partie de la traduction de nlslacZ).
La cassette OVA est insérée en amont de diverses L~R
WO91/11190 PCT/FR~1/00062 33 207~7 qui fournissent le signal nécessaire pour le traitement d'extrémité en 3' des transcripts promus par LTR
en 5' et SV40.
Comme témoin positif, on utilise la LTR
RSV pleinement active comme LTR en 3' et on obtient OVA-D. OVA-ZZ possède le RAV(0) LTR non muté comme séquence 3'. Cette LTRestnaturellement résente dans un provirus endogène qui peut être cultivé
à un titre relativement élevé (R32) et s'est révélé
10 posséder une activité de promoteur, de terminateur, mais non d'enhancer ~Rl4, Rl9). On attend donc du produit de construction OVA-ZZ une auto-inactivation très limitée mais un transfert de gène efficace. Pour augmenter l'aptitude à l'auto-inactivation, on construit également OVA-Zdel en délétant 50 nucléotides comprenantla boite CAAT
de RAV(0).
Le titre viral est influencé par les séquences non codantes en 3' On effectue des titrages de virus à base : de révélation in situ d'activité de bêta-galac-tosidase ou de sélection G418 à partir de cellules helper transfectées de façon stable ~tableau I).
Le titre exprimé sous forme de lac+fu/ml ~'itre lacZ) 25 résulte des efficacités combinées du transfert de gène et de l'expression du gène interne. La compa-raison avec le titre exprimé soug la forme G418r~u/ml ~titre NeoR~ donne une estimation de llauto-inactivation~
OVA-D semble donner un titre élevé dans les deux dosages, confirmant que les virus de leucose aviaire .. comme les virus de leucémie murine, peuvent loger le promoteur interne. A notre surprise, l'efficacité
WO 91/11190 PCI`/FWt/OOn62 ~ 34 du transfert de gène est spectaculalrement rédulte . avec OVA-2Z (100 lac+fu/ml) et le vecteur ne présente aucun s~gne d'auto-inactivation (100G418rfu/ml~. -La délétion de la boîte CAAT en 3' dans OV-Zdel i aboutit à une amélioration dans l'efficacité du trans-fert de gène et à l'augmentation du rapport entre le titre lacZ et NeoR. Pour améliorer à la fois l'ef-ficacité du transfert de gène et l'auto-inactivation, on isole 20 clones de cellules helper transfectées 10 avec OVA-Zdel et on y titre à la fois l'expression de nlslacZ et de NeoR. 10 de ces clones ne donnent aucun virus (< 20 lac+ ou G418rfuiml). Les résultats obtenus avec les quatre clones qui donnent le titre lacZ le plus élevé sont reportés au tableau II. Le 15 rapport entre les deux titres viraux (c'est-à-dire l'efficacité de l'auto-inactivation) varie largement d'un clone à l'autre et peut dépasser 60. Par conséquent, OVA-Zdel peut être considéré comme un vecteur de rétrovirus auto-inactivant efficace.
L'auto-inactivation est encore confirmée dans une expérience de sauvetage du virus qui échoue à donner un virus recombinant après surinfection par RAV(l) ~<20 lac+fu/ml).
Les ~équences en 3' influent sur l'eYpression 25 transitoire du gène interne Pour acquérir des informations 9upplé-mentaires sur les facteurs qui d~terminent la produc-tion de virus dans les cellules helper, on transfecte des cellules Isold ou QT6 avec les plasmides OVA
30 et on dose 48 heures plus tard l'expression transi-toire du gène SV40-nlslacZ par coloration ln situ (tableau III). Dans ces conditions, OVA-D et OVA-20 7'i0 67 ZZ donnent des résultats similaires. La délétiond'U3 dans OVA-Zdel altère l'expression transitoire de SV40-nlslacZ. Ces résultats confortent l'idée que le modeste titre viral obtenu avec OVA-Zdel est lié à un défaut dans l'expression de SV-nlslacZ
; et que la partie délétée de l'élément RAV(0) U3 porte un signal important pour l'expression du gène viral. Bn revanche, le faible titre viral obtenu avec OVA-ZZ n'est pas en corrélation avec l'expres-sion transitoire de nlslacZ, ce qui indique qu'une étape post-transcriptionnelle de production virale est également contrariée lorsqu'on utilise la séquence ~AV(O) 3l. Les transcripts promus par SV40 sont moins abondants que les transcripts promus par L~R en 5' dans les cellules transfectées de façon stable mais le niveau constant des deux ARN dans ces cellules n'est pas clairement dépendant des séquences non codantes en 3'.
Bien que cette observation soit un argument contre un engagement possible des séquences 3' dans ` la transcription virale, elle peut être biais~e par le fait que seules les cellules produisant suffisam-ment d'ARN viral pour résister à la sélection G418 sont considérées dans ce dernier cas.
V~ri~t;on clo~le d~ns l'espre~sion du gène SV~0-nlslacZ d~ns les cellulos infoct~o-On coloro dos clonos d- collulo5 infectées ré~itant à G418 ~clones G418R) pour d~terminer l'acti-vité de ~-galactosidase. Bien que cette analyse soit effectuée sur un nombre de clones limlté, elle aboutlt ~ plusieurs observations intéressantes :
: . ' . :, ' O91/11190 ~ PCT/FR91/00062 q ~ ~ 36 - Certains clones G418R ne contiennent pas de cellules lac+ cell. Ceci pourralt résulter d'une mutation se produisant dans le gène nlslacZ.
Cependant, comme les cellules helper G418R/lac peuvent produire un virus recombinant lac+ (données non représentées) et cor,-~e un faible nlveau d'expression de gène NeoR suffit pour fournir une résistance à
G418 (voir ci-dessus et R29), il est plus vraisemblable que les cellules G418R/lac- expriment en fait 10 nlslacZ, mais en dessous du niveau seuil nécessaire pour colorer positivement dans le dosage in situ.
Un effet de position peut expliquer la raison pour la~uelle le phénotype est presque constant dans un seul clone G418R. Il est donc vraisemblable qu'une 15 coloration lacZ in,situ aboutisse à une sous-estimation de l'efficacité effective du transfert de gène.
- La proportion relative des clones G418R/lac-et G418R/lac+ dépend du vecteur qui est utilisé pour infecter les cellules. Comme on s'y attend d'après 20 des dosages transitoires, ce rapport est semblable pour OVA-D et OVA-ZZ et est supérieur à celui que l'on obtient avec OVA-Zdel.
L'analyse d'ARN révèle que le~ aéquences non codantes en 3' influencent l'efficacité de l'enveloppage de 25 l'AR~.
Un faible titre viral peut r~sulter soit d'une production xéduite de partlcule virales por-tant l'ADN vecteur par le9 cellule8 helpér, soit d'un faible niveau d'expression de gène viral dans 30 les cellules infectées. Pour identifier quelle est l'étape limitante dans la présente situation, on 37 2075~fi7 analyse les ARN de rétrovirus dans les cellules helper transfectées de façon stable par OVA-D, OVA-Z7 et OVA-Zdel (clone A) et dans les particules virales qu~elles produisent. L'analyse de buvardage à fentes montre que le titre viral est en corrélation avec la quantité d'ARN de rétrovirus 5 enveloppée dans les particules de virus mais non avec le niveau constant d'ARN vecteur présent dans les cellules. L'analyse quantitative révèle que les transcripts d'OVA-ZZ et OVA-Zdel initiés à la LTR en 5' sont sous-représentés dans les particules virales. L'enveloppa~e de l'ARN semble donc être une étape limitante dans la production de virus pour OVA-7' e~
1 0 OVA-Zdel.
On montre ici que les séquences non codantes en 3' influencent I'aptitude à l'inactivation des vecteurs rétrovirus mais égalemen~
I'efficacité du transfert de gène à médiation rétrovirale dans les cellules aviaires. Comme les délétions U3 qui ont été test es affectent le titre 15 viral, on est porté à supposer que les séquences LTR jouent un rôle dans ce phénomène.
Toutefois OVA-Zdel avec une LTR 5' de RSV nous permet de produire 100 lacZfu/ml tout en inactivant pleinement le promoteur LTR.
20 Tableau 1: Titra~e du virus On transfecte les cellules helper et on les soumet à sélection par G418. On titre alors le surna~eant cellulaire sur des cellules QT6 et ~; CEF pour l'expression de NeoR comme de lacZ. On fait la moyenne du tltre viral à partir d'au moins 3 expériences differentes de transfection.
Tableau ll: Variation clonale dans le titre viral obtenu avec OVA-Zdel On titre 20 clones de cellules helper transfectées de façon stable avec OVA-Zdel pour l'expression du gène NeoR comme. Iac'. A, B, C
et D sont les quatre clones qui donnent le titre lacZ le plus élevé.
W091/11190 PcT/FR9l/ooo62 20~ rl 38 Tableau III : E~pression transitoire de SVnlslacZ
dans le~ vecteurs OVA.
Expression transitoire : on transfecte des cellules QT6 par précipitation au phosphate de calcium ou avec du polybrène ~voir matériaux et pro-cédés~. On fixe les cellules au bout de 48 heures et on les colore pour déterminer l'activité de ~-galactosidase. Lorsque plus de 500 cellules sont positives pour l'expression transitive de nlslacZ
sur une seule boite, on extrapole le nombre total de cellules lac+ à partir d'un comptage exhaustif effectué s~r une surface limitée. La dernière piste indique les rapports moyens relatifs à OVA-D.
Tableau I
¦Construct ¦DA(l) IOVA-D¦ OVA ZZ ¦OVA Zdel ~aL~L 10 000 100~ 250 NeoR fu/ml ¦ ~ 10010 000 100 100 Tableau II
Construct~ :~ OVA-ZZ OVA-Zdel Ca Phospbate _6000 6000 _ Polvbrene182 154 = 26 Tableau III
~ ~ b ~ 1200 1 400 G4 1 8rfu/ml _ 2000 250 -- ~ 20 200 Rapport 7.3 6.4 60 _ 2.2 39 207~067 BIBLIOGRAPHIE
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.
.~ 10 Isold either by calcium phosphate precipitation (R40) or polybrene (R41). ~n sele~ion the cells (250 ug/ml) with G418 (Gibco) 24 hours after tranfection, for at least 10 days. We harvest viral supernatant from cells 15 subconfluent 16 hours after changing the medium, and centrifuged (2000 g, S minutes ~ to remove cellular debris. For titration, we add ~l to 500 ~l of helper cell supernatant to QT6 or CEF cells (5 x 10 cells per 25 cm2).
Cells infected with G418 are selected at after 24 hours, or they are stained to determine nlslacZ activity after 48 hours ~RS3) RNA analysis RNA is extracted from helper cells 25 or centrifuged supernatant (45 minutes, '5000 rpm in a rotor of ~ ackman SW41) by digestion at the prot~inase K and ph~nol-CHCl3 extraction as it is said (R39). We hybridize the blotting products Northern slitter and blotter with a sample of RNA synthesized in vitro labeled with 32P using standard techniques. We proceed to establish ment of the Sl card as it is said (R39).
-~
.
'--WO91/11190 PCT/FR9l/00062 207aO67 RESULTS
A large deletion in the promoter elements 3' LTR reduces titer virus Figure 7 shows the structure of DAl, vector carrying the g ~ the ~ eoR promoted by the promoter SV40 and inserted in direct orientation(compared to the transcription of the virus). We delete the sequence U3 of the 3' LTR from nucleotide -149 to -15 10 (to capsule site; see materials and methods).
This deletion includes the CMT box and the box TATA but neither the enhancer sequence nor the signal of polyadenylation. Several other vectors are derived from DAl by insertion of an additional gene 15 between the 5' LTR and the SV40 promoter, in the orientation reverse tation.
These constructs are transfected in the helper cells, which are then selected titrated with G418, and the recombinant viruses are titrated 20 from the cell supernatant. The Viral Headlines are low, ranging from 3U G418 rfu/ml to 200 G418 rfu/ml when testing cell populations clonal. Re-infected cells are superinfected resistant with a competent helper virus for the 25 replication to rescue uninactivated viruses.
As no recombinant virus was rescued in a set of about 100 clonea cellulair-a 1nfoct~s, we conclude that the deletion effectively inacts the 5' LTR promoter after a cycle of replication 30 true cation.
Sl RNA analysis can detect LTR- and SV40-promoted RNAs in cells WO91/11190 ~ PCT/FR91/00062 ~32 transfected helper resistant to G418. (An expe-control test was successfully carried out with pTXN3', previously described vector (R29J). Thereby, it is likely that the stability and/or treatment The 3' end of the RNA is affected by the 3' LTR mutation. Adding a poly-signal SV40 adenylation downstream of the 3' LTR fails to restore blir viral titer ~data not shown). By Consequently, an approach similar to that which has 10 has been used successfully to generate self-generating viruses.
inactivating agents derived from spleen necrosis virus rat results in poor success with derived viruses avian leukosis.
Modifi ~ ation of non-coding sequences in 3! only To allow a direct comparison of various 3' non-coding sequences and study precisely their influence on the efficiency of the trans-gene transfer, a series of vectors are being developed which differ only in their 3' end. We : 20 achieves by constructing OVA, a plasmid that can provide as a single restriction fragment ; cassette carrying (Ae 5' to 3') a fully active LTR
of RSV type, a RAV(1) leader sequence, the sequence encoding NeoR, and the nlslacZ gene controlled by the 25 SV40 transcription promoter (such as the SV40-nlslacZ is placed in the front orientation, it e3~
conceivable that reinitiation of translation could occur at low frequency ~on the transcripts promoted by LTR in 5', and reflect a low 30 part of the translation of nlslacZ).
The OVA cassette is inserted upstream of various L~R
WO91/11190 PCT/FR~1/00062 33 207~7 that provide the signal needed for processing 3' end of LTR-promoted transcripts in 5' and SV40.
As a positive control, LTR is used.
RSV fully active as LTR in 3' and we obtain OVA-D. OVA-ZZ has the RAV(0) LTR no mutated as a 3' sequence. This LTR is naturally resides in an endogenous provirus which can be cultured at a relatively high titer (R32) and has been shown 10 possess promoter, terminator, but not to enhance ~Rl4, Rl9). We therefore expect build product OVA-ZZ a very limited self-inactivation but a transfer effective gene. To increase the ability to self-inactivation, OVA-Zdel is also constructed in deleting 50 nucleotides comprising the CAAT box of RAV(0).
Viral titer is influenced by sequences non-coding in 3' Virus assays are performed based on : in situ revelation of beta-galac- activity tosidase or G418 selection from cells stably transfected helper ~Table I).
The titer expressed as lac+fu/ml ~'itre lacZ) 25 results from the combined transfer efficiencies of gene and internal gene expression. The compa-reason with the title expressed in the form G418r~u/ml ~NeoR titer~ gives self-inactivation estimate~
OVA-D seems to give a high titer in both assays, confirming that avian leukosis viruses .. such as murine leukemia viruses, can harbor the internal promoter. To our surprise, the efficiency WO 91/11190 PCI`/FWt/OOn62 ~34 of gene transfer is dramatically reduced . with OVA-2Z (100 lac+fu/ml) and the vector does not present no signs of self-inactivation (100G418rfu/ml~. -The deletion of the 3' CAAT box in OV-Zdel i results in an improvement in the efficiency of the trans-gene fer and the increase in the ratio between the title lacZ and NeoR. To improve both the ef-efficiency of gene transfer and self-inactivation, 20 clones of transfected helper cells are isolated 10 with OVA-Zdel and both the expression nlslacZ and NeoR. 10 of these clones do not give no virus (< 20 lac+ or G418rfuiml). The results obtained with the four clones which give the title highest lacZ are reported in Table II. the 15 ratio between the two viral titers (i.e.
the effectiveness of self-inactivation) varies widely from clone to clone and can exceed 60. Therefore, OVA-Zdel can be considered as a vector of effective self-inactivating retrovirus.
Self-inactivation is still confirmed in a failed virus rescue experiment to give a recombinant virus after superinfection by RAV(l) ~<20 lac+fu/ml).
The ~ equences in 3 'influence the eYpression 25 internal gene transient To acquire information 9supplé-on the factors that determine the production tion of virus in the helper cells, we transfect Isold or QT6 cells with OVA plasmids 30 and assayed 48 hours later transient expression tory of the SV40-nlslacZ gene by ln situ staining (Table III). Under these conditions, OVA-D and OVA-20 7'i0 67 ZZ give similar results. U3 deletion in OVA-Zdel alters transient expression of SV40-nlslacZ. These results support the idea than the modest viral titer obtained with OVA-Zdel is linked to a defect in the expression of SV-nlslacZ
; and that the deleted part of the RAV(0) U3 element carries an important signal for gene expression viral. On the other hand, the low viral titer obtained with OVA-ZZ is not correlated with the express-transient nlslacZ, indicating that a post-transcriptional step of viral production is also upset when using the sequence ~AV(O) 3l. Transcripts promoted by SV40 are less abundant than promoted transcripts by L~R in 5' in the cells transfected in a way stable but the constant level of both RNA in these cells is not clearly dependent 3' non-coding sequences.
Although this observation is an argument against a possible engagement of the 3' sequences in ` the viral transcription, it can be biased by the fact that only cells producing enough ment of viral RNA to resist G418 selection are considered in the latter case.
V~ri~t;on clo~le d~ns the espre~sion of the gene SV~0-nlslacZ in the cells infoct~o-On coloro dos clones d- collulo5 infected d ~ itant to G418 ~ clones G418R) to d ~ finish the acti-vity of ~ -galactosidase. Although this analysis is carried out on a limited number of clones, it aboutlt ~ several interesting observations:
: . ' . :, ' O91/11190 ~ PCT/FR91/00062 q~~36 - Some G418R clones only contain no cells lac+ cell. This could result of a mutation occurring in the nlslacZ gene.
However, since G418R/lac helper cells can produce recombinant lac+ virus (data not represented) and cor, - ~ e a low level of expression enough NeoR gene to provide resistance to G418 (see above and R29), it is more likely that G418R/lac- cells actually express 10 nlslacZ, but below the necessary threshold level to stain positively in the in situ assay.
A position effect may explain the reason for the phenotype is almost constant in a single clone G418R. It is therefore likely that a 15 in situ lacZ staining leads to an underestimation the effective efficiency of gene transfer.
- The relative proportion of G418R/lac- clones and G418R/lac+ depends on the vector that is used for infect cells. As expected from 20 transient dosages, this ratio is similar for OVA-D and OVA-ZZ and is higher than that which obtained with OVA-Zdel.
RNA analysis reveals that the non-coding sequences in 3' influence the effectiveness of the envelopment of 25 the AR~.
A low viral titer may result either reduced production of viral particles both the vector DNA by the9 cell8 helper, or a low level of viral gene expression in 30 infected cells. To identify what is the limiting step in the present situation, we 37 2075~fi7 analyzes retrovirus RNAs in transfected helper cells stable by OVA-D, OVA-Z7 and OVA-Zdel (clone A) and in particles viruses they produce. Slit blot analysis shows that the viral titer correlates with the amount of retrovirus RNA
5 enveloped in the virus particles but not with the constant level of vector RNA present in the cells. Quantitative analysis reveals that the OVA-ZZ and OVA-Zdel transcripts initiated at the 5' LTR are sub-represented in virus particles. The envelope of RNA therefore seems be a limiting step in virus production for OVA-7' e~
10 OVA-Zdel.
It is shown here that 3' non-coding sequences influence the ability to inactivate retrovirus vectors but also ~
the efficiency of retroviral-mediated gene transfer into cells avians. As tested U3 deletions affect titer 15 virus, one is inclined to suppose that the LTR sequences play a role in this phenomenon.
However OVA-Zdel with a 5' LTR of RSV allows us to produce 100 lacZfu/ml while fully inactivating the LTR promoter.
20 Table 1: Virus titer Helper cells are transfected and subjected to selection by G418. The cell surna ~ eant is then titrated on QT6 cells and ~; CEF for both NeoR and lacZ expression. We take the average of the tlter viral from at least 3 different transfection experiments.
Table ll: Clonal variation in viral titer obtained with OVA-Zdel 20 clones of helper cells transfected in a manner stable with OVA-Zdel for NeoR gene expression as. Iac'. A, B, C
and D are the four clones which give the highest lacZ titer.
W091/11190 PcT/FR9l/ooo62 20~ rl 38 Table III: Transient E ~ pressure of SVnlslacZ
in the OVA vectors.
Transient expression: we transfect QT6 cells by phosphate precipitation of calcium or with polybrene ~see materials and pro-ceded~. The cells are fixed after 48 hours and stained to determine the activity of ~-galactosidase. When more than 500 cells are positive for the transitive expression of nlslacZ
on a single box, we extrapolate the total number of lac+ cells from an exhaustive count performed on a limited area. The last track indicates average ratios for OVA-D.
Table I
¦Construct ¦DA(l) IOVA-D¦ OVA ZZ ¦OVA Zdel ~aL~L 10,000 100~ 250 NeoR fu/ml ¦ ~ 10010,000 100 100 Table II
Construct~ :~ OVA-ZZ OVA-Zdel Ca Phosphate _6000 6000 _ Polybrene182 154 = 26 Table III
~ ~ b ~ 1200 1400 G4 1 8rfu/ml _ 2000 250 -- ~ 20 200 Ratio 7.3 6.4 60 _ 2.2 39 207~067 BIBLIOGRAPHY
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Claims (18)
partir du génome proviral provenant de rétrovirus aviaires, essentiellement AEV et/ou de rétrovirus apparentés notamment du type RAV, et comprenant entre deux séquences LTR aviaires le(s)dit(s) gène(s) hétérologue(s) qui se trouve(nt) sous le contrôle d'un promoteur interne hétérologue, caractérisé
en ce que des délétions ou des mutations dans la LTR 3' ont été effectuées de manière à inactiver les promoteurs viraux présents dans les LTR, la LTR 3' provenant des rétrovirus RAV-0, RAV- 1, RAV-2. 1. Self-inactivating viral vector for integration and expression of at least one heterologous gene in avian cells, consisting of from the proviral genome from avian retroviruses, mainly AEV and/or related retroviruses in particular of the RAV type, and comprising between two avian LTR sequences the said heterologous gene(s) which find(s) under the control of a heterologous internal promoter, characterized in that deletions or mutations in the 3' LTR have been made so as to inactivate the viral promoters present in the LTRs, the 3' LTR from retroviruses RAV-0, RAV-1, RAV-2.
caractérise en ce qu'il est construit essentiellement à partir du génome du rétrovirus RAV-2 dont la LTR 3' comprend la séquence U3 de la LTR de RAV-2 dans laquelle les boites CAAT et TATA ont été délétées et les séquences R et U5 de la LTR de RAV- 1. 5. Vector according to one of the preceding claims.
characterized in that it is constructed essentially from the genome of the RAV-2 retrovirus whose 3' LTR comprises the U3 sequence of the LTR of RAV-2 in which the CAAT and TATA boxes have been deleted and the RAV-1 LTR R and U5 sequences.
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Legal Events
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FZDE | Dead |