BR112021015289A2 - Composição, método para melhorar saúde animal, e, método para tratar, melhorar os efeitos ou prevenir a enterite necrótica em aves - Google Patents

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Abstract

composição, método para melhorar saúde animal, e, método para tratar, melhorar os efeitos ou prevenir a enterite necrótica em aves. a presente invenção refere-se a composições probióticas e métodos para melhorar a saúde de um animal. as composições probióticas incluem uma ou mais cepas isoladas de novas cepas de lactobacillus reuteri, que colonizam o trato gastrointestinal para melhorar a saúde de um animal.

Description

1 / 41 COMPOSIÇÃO, E, MÉTODO PARA MELHORAR SAÚDE ANIMAL
REFERÊNCIA CRUZADA A PEDIDOS RELACIONADOS
[001] O presente pedido reivindica prioridade ao Pedido Provisório Estadunidense Nº 62/801,307, depositado em 5 de fevereiro de 2019, cujo conteúdo é incorporado aqui a título de referência.
LISTAGEM DE SEQUÊNCIAS
[002] O presente pedido contém uma Listagem de Sequências, que foi apresentada no formato ASCII pela EFS-Web, e está incorporada pelo presente a título de referência em sua totalidade. A cópia ASCII, criada no dia 4 de fevereiro de 2020, está nomeada como “X30027-SeqListing_ST25.txt” e tem um tamanho de 121 KB.
CAMPO DA INVENÇÃO
[003] A presente invenção refere-se a composições probióticas e métodos para melhorar a saúde de um animal. As composições probióticas incluem uma ou mais cepas isoladas de Lactobacillus sp, que colonizam o trato gastrointestinal para melhorar a saúde de um animal.
FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO
[004] Microbianos de alimentação direta (DFMs), também chamados de probióticos, são microrganismos que colonizam o trato gastrointestinal de um animal e proveem algum efeito benéfico a esse animal. Os microrganismos podem ser espécies bacterianas, por exemplo aquelas dos gêneros Bacillus, Lactobacillus, Lactococcus e Entercoccus. Os microrganismos também podem ser leveduras ou até bolores. Os microrganismos podem ser providos a um animal por via oral ou mucosa ou, no caso dos pássaros, podem ser providos a um ovo fertilizado, isto é, in ovo.
[005] A atividade benéfica provida por um DFM pode ser a síntese de vitaminas ou outras moléculas nutricionais necessárias para um metabolismo
2 / 41 saudável do animal hospedeiro. Um DFM também pode proteger o animal hospedeiro de doenças, distúrbios ou sintomas clínicos causados por outros microrganismos patogênicos. Por exemplo, o DFM pode produzir naturalmente fatores com atividade inibitória ou citotóxica contra certas espécies de patógenos, como bactérias deletérias ou causadoras de doenças.
[006] Existe uma necessidade na técnica de composições probióticas e métodos que provejam uma melhor distribuição de moléculas benéficas ao trato gastrointestinal de um animal e melhorem a saúde animal.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO
[007] A presente invenção provê composições e métodos para melhorar a saúde de um animal.
[008] Em uma modalidade, a invenção provê uma composição tendo pelo menos um dentre uma primeira cepa isolada de Lactobacillus reuteri e uma segunda cepa isolada de Lactobacillus reuteri, em que a referida composição melhora a saúde animal quando uma quantidade eficaz é administrada a um animal, em comparação com um animal ao qual a composição não foi administrada.
[009] Em uma modalidade, a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada inclui pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 26, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 1, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 3, um ácido nucleico que codifica para uma sequência de aminoácido com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou
3 / 41 pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 8.
[0010] Em uma modalidade, a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada inclui pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 27, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 28, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 29.
[0011] Em uma modalidade, a invenção provê um método para melhorar a saúde animal. O método inclui a administração de uma quantidade eficaz da composição acima a um animal.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS
[0012] A Figura 1 representa o efeito antimicrobiano da cepa 3630 de L. reuteri. Bactérias patogênicas, mas não Lactobacillus acidophilus não patogênicas, são mortas pela cepa 3630 de L. reuteri, conforme evidenciado por uma “auréola” clara ao redor da cepa 3630. As bactérias patogênicas mostradas são patógenos gram-positivos Clostridium perfringes, Staphylococcus aureus, Streptococcus uberis, Streptococcus suis; os patógenos gram-negativos são Escherichia coli, Salmonella Typhimurium e Campylobacter jejuni.
[0013] A Figura 2 representa o efeito antimicrobiano da cepa 3632 de L. reuteri. Bactérias patogênicas, mas não Lactobacillus acidophilus não patogênicas, são mortas pela cepa 3632 de L. reuteri, conforme evidenciado por uma “auréola” clara ao redor da cepa 3632. As bactérias patogênicas mostradas
4 / 41 são Clostridium perfringes, Staphylococcus aureus, Streptococcus uberis, Streptococcus suis, Escherichia coli, Salmonella Typhimurium, F. necrophorum e Campylobacter jejuni.
[0014] A Figura 3 representa a colonização de L. reuteri cepa 3632 em galinhas, por via de administração oral. À esquerda mostra a linha do tempo experimental. À direita mostra a formação de colônias e PCR e confirmação da sequência.
[0015] A Figura 4 representa uma linha do tempo experimental para determinar a colonização de L. reuteri cepa 3632 em galinhas, por via de administração in ovo. Os pintos foram colhidos no dia 3 e no dia 7, e a cepa é caracterizada.
[0016] A Figura 5 representa colônias de pintos sacrificados no dia 3. A cepa 3632 é encontrada nos tecidos de pintos 3 dias após a eclosão, enquanto a colonização de uma cepa controle cai após o terceiro dia.
[0017] A Figura 6 representa colônias de pintos sacrificados no dia 7. A cepa 3632 é encontrada nos tecidos de pintos 7 dias após a eclosão, enquanto a colonização de uma cepa controle cai após o sétimo dia.
[0018] A Figura 7 descreve a caracterização da colonização de cepas 3630 e 3632 de L. reuteri em pintos pela via de administração no ovo (spray) e in ovo. À esquerda mostra a linha do tempo experimental. À direita mostra a CFU das cepas 3630 e 3632 de L. reuteri de pintos sacrificados aos terceiro e sétimo dias.
[0019] A Figura 8 representa dados de pássaros vacinados com vacina contra coccidiose no dia 0 e alimentadas com L. reuteri na ração do dia 0 ao dia 42 @ 10^7 UFC / kg de ração ou com BMD_55. Maior taxa de conversão alimentar (FCR) de galinhas administradas com L. reuteri 3632, em comparação com galinhas administradas com BMD_55 (dissalicilato de metileno de
5 / 41 bacitracina).
[0020] A Figura 9 representa a quantificação do efeito de morte in vitro da cepa 3632 de L. reuteri em Clostridium perfringens. Em um experimento de co-cultura, L. reuteri parece habitar o crescimento de C. perfringens quase 4 logs. As contagens de CFU foram determinadas 24 horas após a cocultura em caldo BHI. L. reuteri foram enumeradas em placas de ágar MRS e C. perfringens foi enumerada em placas OPSP. Esses dados são de um experimento representativo de 3 repetições. Co-cultura- L. reuteri, L. reuteri recuperados de amostra co-cultivada usando meios específicos de L. reuteri. Co-cultura-C. perfringens, C. perfringens recuperado de amostra de co-cultura usando meio específico de C. perfringens.
[0021] A Figura 10 representa o efeito dos prebióticos no crescimento das cepas 3630 e 3632 de Lactobacillus reuteri. Os prebióticos testados incluem fruto-oligossacarídeos (FOS), arabinoxilano oligossacarídeos (AXOS), mananoligossacarídeos (MOS) ou galacto-oligossacarídeos (GOS). O aumento do crescimento é observado com GOS.
[0022] As Figuras 11A-11B representam o perfil metabólico bioquímico de duas cepas de Lactobacillus reuteri. A figura representa os dados metabólicos obtidos pela análise de componentes principais (PCA) de duas cepas de Lactobacillus reuteri que foram cultivadas individualmente e em conjunto. A Figura 11A representa o grânulo celular da cultura, 1_P-30 é o grânulo da cepa 3630, 2_P-32 é o grânulo da cepa 3632 e 3_P-30-32 é o grânulo de uma co- cultura da cepa 3630 e da cepa 3632 . A Figura 11B representa o sobrenadante da cultura, 1_S-30 é o sobrenadante 3630, 2_S-32 é o sobrenadante 3632 e 3_S- 30-32 é o sobrenadante de uma co-cultura da cepa 3630 e da cepa 3632 . 4_Media1 é o controle de meio AOF-MRS sem glicose, mas 0,5% de GOS.
[0023] Para as Figuras 12-19, os dados representam a molécula do
6 / 41 indivíduo que é segregada para o sobrenadante. 1) cepa 3630 de lactobacillus reuteri, 2) cepa 3632 de lactobacillus reuteri, 3) co-cultura de cepa 3630 de lactobacillus reuteri e cepa 3632 de lactobacillus reuteri, e 4) controle de meio. Os dados são escalados de forma que o valor mediano medido em todas as amostras seja definido como 1,0.
[0024] A Figura 12 representa os níveis de dimetilglicina, alotreonina e 1-metil-4-imidazolacetato secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0025] A Figura 13 representa os níveis de acetato de 4-imidazol, lisina e N6-metilisina secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0026] A Figura 14 representa os níveis de N6, N6-dimetilisina, 5- aminovalerato e tirosina secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0027] A Figura 15 representa os níveis de 4-hidroxifenilpiruvato, indolacetato e gama-glutamilglutamina secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0028] A Figura 16 representa os níveis de glicose 6-fosfato, ácido 4- hidroxil-2-oxoglutárico e mio-inositol secretado por cepas de lactobacillus reuteri.
[0029] A Figura 17 representa os níveis de Uridina 5’-monofosfato (UMP), Citidina 5’-monofosfato (5’-CMP) e 3’-5’-uridililuridina secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0030] A Figura 18 representa os níveis de O-sulfo-L-tirosina, indol 3 acetamida e indolin-2-ona secretados por cepas de lactobacillus reuteri.
[0031] A Figura 19 descreve os níveis de daidzeína secretada por cepas de lactobacillus reuteri.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
[0032] A presente invenção provê composições e métodos para melhorar a saúde de um animal.
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[0033] Em uma modalidade, a invenção provê uma composição com pelo menos um de: uma primeira cepa isolada de Lactobacillus reuteri e uma segunda cepa isolada de Lactobacillus reuteri;
[0034] Em uma modalidade, a primeira cepa de Lactobacillus reuteri isolada é a cepa 3632. Conforme descrito aqui, a cepa 3632 tem uma sequência de ácido nucleico ou de aminoácidos incluindo pelo menos uma das SEQ ID NOs: 1-24 e 26, sequências com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com pelo menos uma das SEQ ID NOs: 1-24 e 26.
[0035] Em uma modalidade, a segunda cepa de Lactobacillus reuteri isolada é a cepa 3630. Conforme descrito aqui, a cepa 3630 tem uma sequência de ácido nucleico incluindo pelo menos uma das SEQ ID NOs: 25 e 27-43, sequências com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com pelo menos uma das SEQ ID NOs: 1-25 e 27-43.
[0036] As cepas isoladas da presente descrição não são geneticamente modificadas por meios recombinantes ou geneticamente modificados.
[0037] Em algumas modalidades, a composição aqui descrita inclui uma primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri e uma segunda cepa isolada de Lactobacillus reuteri em uma razão de aproximadamente 0,75-1,5:1. Em uma modalidade preferida, a composição inclui quantidades quase iguais da primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada e da segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada.
[0038] As composições descritas aqui podem ser formuladas como ração animal, aditivo alimentar, ingrediente alimentar, aditivo de água, aditivo misturado com água, solução consumível, aditivo consumível em spray, sólido consumível, gel consumível, injeção, ou combinações dos mesmos. Em uma
8 / 41 modalidade, a composição inclui água.
[0039] As composições aqui descritas incluem a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada em uma quantidade de cerca de 10^2-10^8 CFU / kgda composição, cerca de 10^4-10^7 CFU / kg da composição, cerca de 10^3- 10^5 CFU / kg da composição, cerca de 10^2 CFU / kg da composição, cerca de 10^3 CFU / kg da composição ou cerca de 10^7 CFU / kg da composição.
[0040] As composições da descrição exibem características/propriedades funcionais e/ou estruturais marcadamente diferentes, em comparação com sua contraparte natural mais próxima. Por exemplo, a cepa de lactobacillus reuteri da descrição é estruturalmente diferente de uma cepa de lactobacillus reuteri, pois existe naturalmente em um trato gastrointestinal. Para elaborar, a cepa de lactobacillus reuteri pode ser isolada e purificada, de modo que não seja encontrada no meio do trato gastrointestinal, a cepa de lactobacillus reuteri pode estar presente em concentrações que não ocorrem no trato gastrointestinal, a cepa de lactobacillus reuteri pode ser associada a transportadores aceitáveis que não ocorrem no trato gastrointestinal, a cepa de lactobacillus reuteri pode ser formulada para ser estável em armazenamento e existir fora do trato gastrointestinal, e o referido micróbio pode ser combinado com outros micróbios em concentrações que não existem no trato gastrointestinal. Além disso, a cepa de lactobacillus reuteri da descrição é funcionalmente diferente de uma cepa de lactobacillus reuteri, pois existe naturalmente em um trato gastrointestinal. Para elaborar, a cepa de lactobacillus reuteri quando aplicada em uma forma isolada e purificada pode levar à modulação do microbioma gastrointestinal, aumento do ganho de peso, aumento da utilização da alimentação, diminuição da quantidade de patógenos microbianos e diminuição das lesões gastrointestinais associadas ao patógeno.
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MÉTODO
[0041] A presente descrição também provê métodos para melhorar a saúde animal, em que o método inclui a administração de uma quantidade eficaz da composição a um animal.
[0042] A composição aqui descrita e acima aumenta a saúde animal, proporcionando benefícios de saúde positivos quando administrada a um animal, em comparação com um animal que não recebeu a composição. Conforme usado neste documento, “animal” inclui pássaros, aves, um ser humano ou um mamífero não humano. Exemplos específicos incluem galinhas, perus, cães, gatos, gado e suínos. A galinha pode ser um frango de corte ou uma galinha que põe ovos ou uma galinha produtora de ovos.
[0043] Os benefícios positivos para a saúde incluem diminuição da taxa de conversão alimentar, aumento do peso, aumento da massa corporal magra, diminuição da formação de lesões associadas ao patógeno no trato gastrointestinal, diminuição da colonização de patógenos, redução da inflamação e diminuição da taxa de mortalidade.
[0044] Em algumas modalidades, as composições aqui descritas diminuem a taxa de conversão de alimentação em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%. Em algumas modalidades, as composições aqui descritas aumentam o peso das aves em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%. Em algumas modalidades, as composições descritas aqui diminuem a formação de lesões associadas a patógenos no trato gastrointestinal em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%. Em algumas modalidades, as composições descritas aqui diminuem a colonização de patógenos em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%. Em algumas modalidades, as composições descritas aqui reduzem inflamação em pelo menos 1%, pelo menos
10 / 41 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%. Em algumas modalidades, as composições descritas aqui diminuem a taxa de mortalidade em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
[0045] Em algumas modalidades, os seguintes valores podem ser combinados de qualquer maneira para criar um mínimo, um máximo ou um intervalo para diminuir a taxa de conversão alimentar, aumentar o peso das aves, aumentar a massa corporal magra, diminuir a formação de lesões associadas ao patógeno no trato gastrointestinal, diminuir colonização de patógenos e diminuição da taxa de mortalidade, 1%, 5%, 25%, 50% e 75%.
[0046] Por exemplo, a diminuição na formação de lesões associadas ao patógeno pode ser diminuída em aproximadamente 1% a 5%, e mais preferencialmente entre aproximadamente 5% a 50%.
[0047] Tal como aqui utilizado, o patógeno inclui Salmonella, Clostridium, Campylobacter, Staphylococcus, Streptococcus e bactéria E. coli. Outros exemplos de agentes patogênicos incluem Salmonella typhimurium, Salmonella infantis, Salmonella Hadar, Salmonella enteritidis, Salmonella Newport, Salmonella Kentucky, Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Streptoccus uberis, Streptococcus suis, Escherichia coli, Campylobacterium jejuni, e Foflobacterium jejuni.
[0048] As composições podem ser administradas por via oral, parenteral, nasal ou mucosa.
[0049] Em alguns aspectos, a administração inclui alimentar as aves ou pulverizar nas aves. Em outros aspectos, a administração inclui a administração on ovo ou administração in ovo.
[0050] Em alguns aspectos, o animal é vacinado em conjunto com a administração. O animal pode ser vacinado antes da administração das composições aqui descritas. O animal pode ser vacinado com uma vacina contra
11 / 41 coccidiose. As vacinas de coccidiose são conhecidas na técnica, por exemplo, COCCIVAC.
[0051] Em algumas modalidades, a administração é por meio de injeção ou infusão. Em uma modalidade, a composição é administrada a uma vaca por meio de infusão intra-mamária.
[0052] As cepas aqui descritas demonstram certas propriedades fenotípicas. Sem desejar se limitar à teoria, acredita-se que essas propriedades fenotípicas, pelo menos, contribuem para o aumento da saúde animal.
[0053] Em algumas modalidades, as cepas isoladas secretam pelo menos um dos dipeptídeos cíclicos (ciclo (his-phe) e ciclo (phe-pro), ácidos graxos de cadeia curta (2-hidroxi-3-metilvalerato e alfa-hidroxiisocaproato), betaína, dimetilglicina , aminoácidos essenciais (por exemplo, alotreonina, fosfotreonina, histidina, lisina, fenilalanina, triptofano, leucina, isoleucina e s-sulfato de cisteína), nucleotídeos (por exemplo, adenosina 5’-monofosfato (AMP), uridina 5’-monofosfato (UMP), citidina 5’-monofosfato (5’-CMP) e citidina 2’3’- monofosfato cíclico), mio-inositol e indolin-2-ona. Algumas das moléculas acima mencionadas provêm características benéficas ao hospedeiro, incluindo aumento de peso, efeitos pró-inflamatórios e efeitos antibióticos.
[0054] Em algumas modalidades, a composição incluindo a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada (cepa 3632) e a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada (cepa 3630) em combinação, secretará certas moléculas benéficas em quantidades maiores do que quando cultivadas individualmente. Veja, por exemplo, as Figuras 12-19.
[0055] Em algumas modalidades, o animal administrado com a composição exibe uma mudança no conteúdo do microbioma do trato gastrointestinal. Por exemplo, pode haver um aumento na quantidade de bactérias bacteroidaceae no intestino de um animal que recebeu a composição
12 / 41 aqui descrita, em comparação com um animal que não recebeu a composição.
[0056] Em algumas modalidades, a invenção provê um método de tratamento, melhoria dos efeitos ou prevenção da enterite necrótica em um animal por meio da administração de uma composição aqui descrita a um animal que dela necessite.
[0057] Em algumas modalidades, a invenção provê um método de tratamento, melhoria dos efeitos ou prevenção da mastite bovina. O método inclui a administração de uma composição aqui descrita a um animal que dela necessite.
[0058] Conforme usado neste documento, “isolado” significa que o sujeito isolado foi separado de pelo menos um dos materiais com os quais está associado em um ambiente particular.
[0059] Assim, um “isolado” não existe em seu ambiente natural; em vez disso, é através das várias técnicas aqui descritas que o micróbio foi removido de seu ambiente natural e colocado em um estado de existência não natural. Assim, a cepa isolada ou micróbio isolado pode existir como, por exemplo, uma cultura biologicamente pura em associação com um transportador aceitável.
[0060] Conforme usado neste documento, “isolados individuais” devem ser entendidos como significando uma composição, ou cultura, que compreende uma predominância de um único gênero, espécie ou cepa de microrganismo, após a separação de um ou mais outros microrganismos. A frase não deve ser interpretada para indicar até que ponto o microrganismo foi isolado ou purificado. No entanto, “isolados individuais” podem compreender substancialmente apenas um gênero, espécie ou cepa de microrganismo.
[0061] Em certos aspectos da descrição, a cepa isolada de lactobacillus reuteri existe como culturas isoladas e biologicamente puras. Será reconhecido por um versado na técnica, que uma cultura isolada e biologicamente pura de
13 / 41 uma determinada cepa de lactobacillus reuteri, denota que a referida cultura está substancialmente livre (dentro da razão científica) de outros organismos vivos e contém apenas a cepa individual de lactobacillus reuteri em questão. A cultura pode conter concentrações variáveis da referida cepa isolada de lactobacillus reuteri. A presente descrição observa que micróbios isolados e biologicamente puros muitas vezes necessariamente diferem de materiais menos puros ou impuros.
[0062] Em modalidades da presente invenção, a composição inclui uma combinação de duas cepas isoladas de lactobacillus reuteri.
[0063] Tal como aqui utilizado, “transportador”, “transportador aceitável” ou “transportador farmacêutico” refere-se a um diluente, adjuvante, excipiente ou veículo com o qual o composto é administrado. Esses veículos podem ser líquidos estéreis, como água e óleos, incluindo os de petróleo, animal, vegetal ou de origem sintética; tais como óleo de amendoim, óleo de soja, óleo mineral, óleo de gergelim e semelhantes. Água ou soluções salinas de solução aquosa e soluções aquosas de dextrose e glicerol são preferencialmente empregadas como transportadores, em algumas modalidades como soluções injetáveis. Alternativamente, o transportador pode ser um transportador de forma de dosagem sólida, incluindo, mas não se limitando a um ou mais de um aglutinante (para pílulas comprimidas), um deslizante, um agente encapsulante, um aromatizante e um corante. A escolha do transportador pode ser selecionada em relação à via de administração pretendida e à prática farmacêutica padrão. Consulte Hardee and Baggo (1998. Development and Formulation of Veterinary Dosage Forms. 2nd Ed. CRC Press. 504 pg.); e E.W. Martin (1970. Remington’s Pharmaceutical Sciences. 17th Ed. Mack Pub. Co.).
[0064] Conforme usado neste documento, “entrega” ou “administração” significa o ato de prover uma atividade benéfica a um hospedeiro. A entrega
14 / 41 pode ser direta ou indireta. A administração pode ser por via oral, nasal ou mucosa. Por exemplo, sem limitação, uma via oral pode ser uma administração através de água potável, uma via nasal de administração pode ser através de um spray ou vapor e uma via de administração mucosa pode ser através do contato direto com o tecido da mucosa. O tecido mucoso é uma membrana rica em glândulas mucosas, como as que revestem a superfície interna do nariz, boca, esôfago, traqueia, pulmões, estômago, intestinos, intestinos e ânus. No caso das aves, a administração pode ser in ovo, ou seja, a administração a um ovo fertilizado. A administração in ovo pode ser através de um líquido que é pulverizado sobre a superfície da casca do ovo ou injetado através da casca.
[0065] Conforme usado neste documento, os termos “tratando”, “tratar” ou “tratamento” incluem restringir, desacelerar, parar, reduzir, melhorar ou reverter a progressão ou gravidade de um sintoma, distúrbio, condição ou doença existente. Um tratamento também pode ser aplicado profilaticamente para prevenir ou reduzir a incidência, ocorrência, risco ou gravidade de um sintoma clínico, distúrbio, condição ou doença.
[0066] Salvo indicação expressa em contrário, “ou” refere-se a um “ou” inclusivo “e não a um” ou “exclusivo. Por exemplo, uma condição A ou B é satisfeita por qualquer um dos seguintes: A é verdadeiro (ou presente) e B é falso (ou não presente), A é falso (ou não presente) e B é verdadeiro (ou presente), e A e B são verdadeiros (ou presentes).
[0067] Quaisquer exemplos ou ilustrações aqui providos não devem ser considerados de forma alguma como restrições, limites ou definições expressas de qualquer termo ou termos com os quais são utilizados. Em vez disso, esses exemplos ou ilustrações devem ser considerados como sendo descritos em relação a uma modalidade particular e como sendo apenas ilustrativos. Aqueles versados na técnica apreciarão que qualquer termo ou termos com os quais esses
15 / 41 exemplos ou ilustrações são utilizados abrangerão outras modalidades que podem ou não ser fornecidas com as mesmas ou em outro lugar no relatório descritivo e todas essas modalidades se destinam a ser incluídas no âmbito desse termo ou termos. A linguagem que designa tais exemplos e ilustrações não limitativos inclui, mas não está limitada a: “por exemplo”, “por exemplo”, “por exemplo,” e “em uma modalidade”. Neste relatório descritivo, grupos de vários parâmetros contendo vários membros são descritos. Dentro de um grupo de parâmetros, cada membro pode ser combinado com qualquer um ou mais dos outros membros para formar subgrupos adicionais. Por exemplo, se os membros de um grupo são a, b, c, d e e, subgrupos adicionais especificamente contemplados incluem qualquer um, dois, três ou quatro dos membros, por exemplo, a e c; a, d e e; b, c, d e e; etc.
[0068] Ao longo deste relatório descritivo, as quantidades são definidas por intervalos e pelos limites inferior e superior dos intervalos. Cada limite inferior pode ser combinado com cada limite superior para definir um intervalo. Os limites inferior e superior devem ser considerados cada um como um elemento separado. Dois limites inferiores ou dois limites superiores podem ser combinados para definir um intervalo.
LISTAGEM DE SEQUÊNCIAS
[0069] SEQ ID NO: 1 cDNA mersacidin-E1 1 atggacaaag aagaattaga aaaaattgta ggtaataact ttgaggaaat gagtttacaa 61 aaaatgacag aaattcaagg tatgggtgaa taccaagtgg attcaacacc agcagcttct 121 gcgatttcac gggcaacaat tcaagtatca cgtgcatctt ctggaaaatg tctaagttgg 181 ggtagtggtg cagcatttag tgcttatttt actcataaaa gatggtgcta g
[0070] SEQ ID NO: 2 Aminoácido mersacidin-E1 (natural) 1 MDKEELEKIV GNNFEEMSLQ KMTEIQGMGE YQVDSTPAAS AISRATIQVS RASSGKCLSW 61 GSGAAFSAYF THKRWC
[0071] SEQ ID NO: 3 cDNA mersacidin-E2 1 atggaagaaa aagaattaga aggtgtaata gggaattcgt ttgaaagtat gactgtagag 61 gaaatgacaa aaattcaagg tatgggtgaa tatcaagtag attcgacgcc tggatatttt 121 atggaaagtg ctgccttttc agctcttaca gccaatataa caagacatgc tatgcatcat 181 cattaa
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[0072] SEQ ID NO: 2 Aminoácido mersacidin-E2 (natural) 1 MEEKELEGVI GNSFESMTVE EMTKIQGMGE YQVDSTPGYF MESAAFSALT ANITRHAMHH 61 H
[0073] SEQ ID NO: 5 Capreomicidina sintase (natural). 1 MVEIAHFGVE AWLNKWEKSA TYDISQSTIA SLSMHDLLNL DGNNGEEFYE MLDKQQMNYG 61 WIEGSPEFKE EVAKLYHHVD PENILQTNGA TGANILALYA LINPGDHVIA EYPSYQQLYD 121 IPKSLGADVD YWHIHEEDNW YPRIDDLKAM VKPNTKMICL NNANNPTGTV LDKEFLEQVV 181 EIAKSVDAYV LVDEVYLPLD HPEKFAQIID LYDKGISTNS LSKTYSVPGV RIGWTATNAE 241 VADIFRKFRD YTMICGGVFN DQLATYVLRH RDQVLARNRK LVLGNLAIYK DWIDHEDRAS 301 VIMPQAVSTS FPKLDVPVDI HTFCENLLHD EGVLLVPGDA FDTPGHVRLG YCAPEATLKE 361 GLKRLSKYMH QYD
[0074] SEQ ID NO: 6 Proteína de produção de Colicin V (natural). 1 MILTTFIILI LMGCFINGHR RGLLTMTLML GTYIVAWIVA RQGAQLIGGW LKSLLPSIGT 61 PATFSESLLA NVNSNLFFYN GIAFMIIFTI VSILCHWGIR QLNWIKRIPV VGTVDKIAGG 121 LISFLIGYLI IYVVLLIMQL FPAGWWQMQI ANSELARFMI NQTPGIAHLV IDTLVQGG
[0075] SEQ ID NO: 7 Precursor-1 de receptor aglutinina (ARP-1) (natural) 1 MNEYNAEMAK LNQGANAPVI TTNSVNQALS LKPENNATVD IEALNPRITF KRVEEGTKYA 61 GYQIFDKNNA YVNNIDGEFL RVTYTNLKNS TYKGSKISKI VVTYSDSTPT GNRITQSGLN 121 AVTEGANDNF LVVFEDPVRG DMHSTTVTAT YQYYDANGNL IDFSGTNNAW LSVGSLNFDQ 181 GNDYQGGKNE GNPTSGISEG VKLISGAQIK QLAGSSISVH DDGWAYAGFN NYSGTGMNNG 241 INTDNGGSGW DMDGSPNAYY GAIVFQLTGS SVSLRQGLVS WGGADIASQY NNQFLNNAWF 301 TAGTTLPETQ IKQPIRKTSE THYHYNPSVI RL
[0076] SEQ ID NO: 8 Precursor-2 de receptor aglutinina (ARP-2) (natural) 1 MAQKLMSANS TDKNFKMYKS KKSWVFAYST TLALAAVAGI TLSTTNVHAD TTNGGDNQVN 61 ATAVTQNTTS NTVDQIAANT AQTDNTSTSI NIRSLMDDLA SGDDTSSSQN GQEQSQNYAS 121 SNQNSQTQQE NGTTGQSTAS QNGTTSDQTN SDQSDKNYYV ISTRDLDKNG NVNYLTQKNY 181 TSIKGQEVAD GTVVTWPLSV SALPANRAQD LKSHVISETL DPHLEYLHYR AYLTNTDGTV 241 TDVTNHVNLN RSGQTLIFTD DNYLLSIYNN NRYRVQNLPV IKLVTKANGN GYIIPNAFKS 301 SYVFNDGSHD VSFTTTSNNV QIKTFNPGNS KDVEIGGNVQ GDPSGTINGQ VVADGSVVTW 361 PMSVGDLPAN RAQDVLSHIE TDTLYNGLNY EGYHAYLPQA DGSFQDVSSH INVQQNGQDL 421 TFIADDYLIG LYNQDKSTAF KMPIIDLITS VHGTSIIAPN KFNSQLAFKD GNGQTVINNT 481 SNQVQISTYH PTNTKDVELG GNVQGDTPNS INDKVVANGA IVTWPMASSE LPANRVQDLQ 541 SRVISETLDS HLQYQGYKAW LQNADGKYTD VTSHVKLTQD GQNLTFADDE YLLNLYNSNK 601 GTAYKLPIID LVTKVNGAGI TAPNSYTTKY VYSDGDGNTT INVTSNTVKI STFNPTTNKD 661 VELGDNIHGD TESSIAGKLV SEGTIVTWPL STSDLPANRA QDVVSHTAVD ALEPTLQYIS 721 YTAWLPDSNG QLQDVTSHVK MTRDGQKLTF TDDDYLIGLY NQNKDIALKM PIIDLVTKAT 781 GNTKLLPNSF DSQFVYNDVD GNTIINVSSN KPTVETFDPT VHKDVELGGN NVQGDTPNSI 841 DGKIVAQGTV VTWPMSTSDL PANRTQDVVS HSTSETLNQN LQYVGYHAYM PDANGKLQDV 901 TSHVQLQQNG QNLVFTDDSY LINLYNQDKS IAFKMPIIDL MTKAISDSAT IPNTFESQYV 961 FNDGNGNTTF KSTSNTVQII TYKPKTTKDV ELGDNIHGDT NASIAGQMIT DGTVVTWPMS 1021 TSDLPANRTQ DLQQHVVTDN LNDNLIFQGY TAWLPTANGL VDVTNHIELT RDGQNLTFTD 1081 DAYLLNLYNQ NKDTAYKLPI IDLVTKANGN TKLIPNNFDS MFVYNDGDQQ TTVNVTSNTV 1141 NISTYDPTAT KDVELGDDIE GDTADTINNL MVQIGTKMTY PLTVSDLPAN RADEITAHQS 1201 VDTLSDYLEY QGYKAYLPDA DGKLQDITEH VNLKREGQKL SFNDDDYLIN LYNNSKATKQ 1261 ALPVIDLVAK VTGSNDGKKV HIIPNHFDST ITTKDGKINT TSNTVVINSN DPEAVKDVEL 1321 GDNVVGDTPN SVTGTTVADG TIVTWPMSVG SLGANRAQNV IKHTETENLD SGLTYLSFKA 1381 YLPDADGKMQ DITEHINIQQ DGQKLVFTDD DYLISLYNKD KSQRFALPVI DLVTRVNGDN 1441 KIIPNTFVSQ FTFNDGKGNT ITSVTSNQVN VSTFKSNPEK HVTLGTDIEG DDAENADGTV
17 / 41 1501 VAQGSEVTWP LSDKSPLPAN RSQDVKSHTL VDKLDDNLQY NSYKAYLKGT DGKLQDVTDH 1561 IKLTRDGQNL TFIDDDYLLD LYNKDKSTAF NLPIIDLVTT VVGNDKLIPN KFDSNFVFSD 1621 GNKDTSMKTT SNEVSISTYT PVTNKDAELG DNVVGDTSDS IANETVPDGT IVTWPLSVSS 1681 LPANRSQDVF KHVIEDILDG NLTYNSFKAY LKDAAGNLQE VTDHVKLAQE GQHLTFTDDD 1741 YLINLYNSSK NKEQSLPIID LVTTVHGDSK LIPNEFDNVF VFKDGKGQTT VKTTSNKVTI 1801 KTASLPTPTK EETDDQGNNI NGNEVKAGEH VNYTLNWDLS NDKDVKATPE MIKKGFFFID 1861 PIDSRALSVD DLSKAKVVDQ NGNKVDGISF HLYNSLSEVP EFIQEQVKAN NLQDKITGPF 1921 VVAQADDLQA FFDKYVKTGA KLKVTIPTIV KSGFTGEFSN TAYQFGFGKA TPTNTVTNYV 1981 KPMHKPASPE TPAAIAPQVI SATAQPMTSD APVTPSEKTA KLPQTGNADE GALLGLAAVS 2041 LVGSLGLAAL GLKQNRNDD
[0077] SEQ ID NO: 9 Promotor de xilulose-5-fosfato fosfoquetolase (natural) 1 TTAAAGTATT AAAATAGATG TAAAATTTAT TTTTTTCAAA AGAAATTTTA ATTGTACACT 61 GTTGGTATTG AACGGGGTTA AACAAAGGTA AATTAGCATT TCTGCGGATT AAGATAAATA 121 GAAAAATGTT AAAGAACACC TTAAAAAGAT TAATTTTTTA TAATTGGACC GTATCAATTT 181 GTAAAAAGGT TGACTTTTTG AAAAAAAAGT TTATCATTAA CATTGTAAAT TTAATGATTT 241 ACGTTATGTT GTTATAGAGC ACAGGACGTA TTGATTTATA TAGAAGGAGT GTTTATTAGA
[0078] SEQ ID NO: 10 Promotor TU de fator de alongamento (natural) 1 ATGAATGGAC AGATGTTTTA ATCGCTAGAA TAGAAGGAAA GAAAGTCGCA ACAAATACGG 61 TTTCTAGTAC GTGGCAGGAA CGACTAGGTA AGCAGATTGA CGAATTAATA GAAAAACATT 121 AGTCAAATAC ATTTACAAAT GAACAGATAG TTGATATTAT ATTTAAGAAT TCTTCTTCAG 181 AGCCTAAGAT TAAAGCTTTC AATTGGCGAA AAGAAGTTGT ACAATATGTA TAAAGGTATG 241 TCAGTCACCG AATCAGATGA TCTGGCATTA TACTTGTAAA TTATCAGGAG GTTTTCATTA
[0079] SEQ ID NO: 11 Promotor de gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase (natural) 1 ATCTCACGTG CGATCCATTA CACTAAGGGC GCGTCAACAA ATATTATACT ATCTTAAATA 61 AGAATGAATT GCAAGCATTA TTTGAAAATT TTAATTAAAA TAACGCTTAC ATCAGAAAAA 121 TGTTGTGATT GAATAGACAA TTTTTTTGAA GATGGTATCA TAAGTATCGT AGGAGTTGTA 181 TTATTGCTTA GACCTTACCA CTGCGTCACT TACAATGGTT GAGAGTTGCG ATGCTGATGT 241 AATGTGATAA ACTAAGCAAG TACACTAATT ATGTTTTTTC CTAAAGGAGG AATTTGCAGT
[0080] SEQ ID NO: 12 Promotor de glicose-6-fosfato desidrogenase (natural) 1 TTGTTTAAGA TATCTTTCAA AGCTGCGGAA TTTTTCCCAG CTTTTTTAGT TAGTTTTGTT 61 TTCATAAGCT ATAATTTTAA CCGATTCCAA ATTTCTTTTA AAAGTTTTTT TGATCTAGAC 121 CATTAATTGA TAAACGCTTA CCAAAGACTA ATCAACAAGC CATTTAGCGG TAGTGGTCCA 181 TTTTAACTTT CTAAGACATC TTCTCAGAAA ACGTTTCCTT TGATAGTGCA GATTGTGCTT 241 TAAGAGTATA TAATTGTCAC GGTATAAGAA TTTTCTGAAA TTTCAGAAGG AGTGAACATT
[0081] SEQ ID NO: 13 Promotor de L-lactato desidrogenase (natural) 1 CTCCTCTATT ATTATTCCTG ATCAATTTTA AATTAATCTC CCTAGATAGG TATATTTTAG 61 CACAGGTCAC CAACGTTCCA AAGTTTAATC TATGTTTAAA CTTTAATTTT CAAAAAAATG 121 CTATACTATG TTCACGATAC TTTAAGGAAA GGTGATTACA ATAGTGAGTC TCTTAATTGC 181 TATTCTTATC TGCTGGTTGC TATGGAAGAT TGGGGGTTTA ACGGTTAAGT TCATTGGTCT 241 AATCCTTCTT ATTCTATTAA TCGGGACATT AATTCATGTT TTACTTTGGC CAGCGATCCT 301 TTTAGCAGTT ATTATCTTAG GAGCAGGTTT ATTCACTAAC TAATTTATCT ATAAAATCTT 361 ATAGTAATTT TTCTGCGGAA TGTTATAATC ATTACTGTGA GAGAAATCTC AAATAATGTA 421 TACATAAGAT GAAAGGGAGA CTGTTTATT
[0082] SEQ ID NO: 14 Promotor tuf (natural) 1 ACAAATACGG TTTCTAGTAC GTGGCAGGAA CGACTAGGTA AGCAGATTGA CGAATTAATA
18 / 41 61 GAAAAACATT AGTCAAATAC ATTTACAAAT GAACAGATAG TTGATATTAT ATTTAAGAAT 121 TCTTCTTCAG AGCCTAAGAT TAAAGCTTTC AATTGGCGAA AAGAAGTTGT ACAATATGTA 181 TAAAGGTATG TCAGTCACCG AATCAGATGA TCTGGCATTA TACTTGTAAA TTATCAGGAG 241 GTTTTCATTA
[0083] SEQ ID NO: 15 Precursor de alfa-antígeno de C proteína (natural) 1 MVSKNNHQFY QQKHAERKQR WGIRKLSVGV ASVLLGTTFM LYGNHAVLAD TVTSPSDDVT 61 RSTTTQGGNK DKVTEGTTEG TTSTPQTSGD STDKQANGQN VNQQVPTTDT EEATNHQDTP 121 QGQDTTQNTT NVDKKDTEVT PANDATTPTT QKITAKFTTA KFTTAKFTAA KFKVLAARPV 181 MKVAGTASLP ISNQDIKLDS QPMLTEIINK PTDNWVYNNL KWYQDTSTEK IKEILQNHTA 241 NDESGRYYFA GVANYNEHYH AIYLLARSNN LNDNSLYVTI LHTGLGKNIQ EAVVAPGESK 301 KVEYSGTTHT PIFTNYDGTS ASIDLDGIEK GDNIYGMVVG FAYGHNTGIK GDPASMGNGF 361 VMTPIPTKMT TTIHYIDQAT GDEIAVPKSF EGVAYQKYTI TGEAPTIDGY TLKKSPETTG 421 YISPYKVGES YDFRLDKHVV IKQTVIDAQG LVRVTAYYDG EVLNNTTRYL GNKLNVNDRM 481 SFISHGKWYT YINQITSTND GIVYYYAKDG SEDKSEVRVH YIDVTGSKNS IFVPGDGEEV 541 ATDKISGKLG ENYNYDVNLP TDYNLATNQA NTVNGTYTID HHDEYVYVVK KTSAELDPTV 601 PAKTKVDNPT SLTADEKKTI EDKIVEANKD KFPEGTGVTV ANDGKATITY PDKSVDTIEG 661 NQLVEEKTSA EKLDPTVPAK TKVDNPTSLT ADEKKTIEDK IVEANKDKFP EGTGVTVAND 721 GKATITYPDK SVDTIEGNQL VEEKTSAEKL DPTVPAKTKV DNPTSLTADE KKTIEDKIVE 781 ANKDKFPEGT GVTVANDGKA TITYPDKSVD TIEGNQLVEE KTSAEKLDPT VPAKTKVDNP 841 TSLTADEKKT IEDKIVEANK DKFPEGTGVT VANDGKATIT YPDKSVDTIE GNQLVEEKTS 901 AEKLDPTVPA KTKVDNPTSL TADEKKTIED KIVEANKDKF PEGTGVTVAN DGKATITYPD 961 KSVDTIEGNQ LVEEKTSAEK LDPTVPAKTK VDNPTSLTAD EKKTIEDKIV EANKDKFPEG 1021 TGVTVANDGK ATITYPDKSV DTIEGNQLVE EKTSAEKLDP TVPAKTKVDN PTSLTADEKK 1081 TIEDKIVEAN KDKFPEGTGV TVANDGKATI TYPDKSVDTI EGNQLVEEKT SAEKLDPTVP 1141 AKTKVDNPTS LTADEKKTIE DKIVEANKDK FPEGTGVTVA NDGKATITYP DKSVDTIEGN 1201 QLVEEKTSAE KLDPTVPAKT KVDNPTSLTA DEKKTIEDKI VEANKDKFPE GTGVTVANDG 1261 KATITYPDKS VDTIEGNQLV EEKTSAEKLD PTVPAKTKVD NPTSLTADEK KTIEDKIVEA 1321 NKDKFPEGTG VTVANDGKAT ITYPDKSVDT IEGNQLVEEK TSAEKLDPTV PAKTKVDNPT 1381 SLTADEKKTI EDKIVEANKD KFPEGTGVTV ANDGKATITY PDKSVDTIEG NQLVEEKTSA 1441 EKLDPTVPAK TKVDNPTSLT ADEKKTIEDK IVEANKDKFP EGTGVTVAND GKATITYPDK 1501 SVDTIEGNQL VEEKTSAEKL DPTVPAKTKV DNPTSLTADE KKTIEDKIVE ANKDKFPEGT 1561 GVTVANDGKA TITYPDKSVD TIEGNQLVEE KTSAEKLDPT VPAKTKVDNP TSLTADEKKT 1621 IEDKIVEANK DKFPEGTGVT VANDGKATIT YPDKSVDTIE GNQLVEEKTS AEKLDPTVPA 1681 KTKVDNPTSL TADEKKTIED KIVEANKDKF PEGTGVTVAN DGKATITYPD KSVDTIEGNQ 1741 LVEEKTSAEK LDPTVPAKTK VDNPTSLTAD EKKTIEDKIV EANKDKFPEG TGVTVANDGK 1801 ATITYPDKSV DTIEGNQLVE EKTSAEKLDP TVPAKTKVDN PTSLTADEKK TIEDKIVEAN 1861 KDKFPEGTGV TVANDGKATI TYPDKSVDTI EGNQLVEEKT SAEKLDPTVP AKTKVDNPTS 1921 LTADEKKTIE DKIVEANKDK FPEGTGVTVA NDGKATITYP DKSVDTIEGN QLVEEKTSAE 1981 KLDPTVPAKT KVDNPTSLTA DEKKTIEDKI VEANKDKFPE GTGVTVANDG KATITYPDKS 2041 VDTIEGNQLV EEKTSAEKLD PTVPAKTKVD NPTSLTADEK KTIEDKIVEA NKDKFPEGTG 2101 VTVANDGKAT ITYPDKSVDT IEGNQLVEEK TSAEKLDPTV PAKTKVDNPT SLTADEKKTI 2161 EDKIVEANKD KFPEGTGVTV ANDGKATITY PDKSVDTIEG NQLVEEKTSA EKLDPTVPAK 2221 TKVDDPTKLT NDEKKEVEDN IRDHNTGLPE GTKIAVGDNG DTTITYPDKS VDTIEGNQLV 2281 EEKTSAEKLD PTVPAKTKVD DPTKLTNDEK KEVEDNIRDH NTGLPEGTKI AVGDNGDTTI 2341 TYPDNSVDTI PGDKVVEGKS DAAKNEPKVP GDKVKVDDPN KLTEDEKSEV VKAVEDANKD 2401 ENGKSTLPEG SKVTVGDNGD VTVTYPDGSK DTIPGDKVVE GKGTEGQTDA DKNEPKVPGD 2461 KVKVDDPNKL TEDEKSEVVK AVEDANKDEN GKSTLPEGSK VTVGDNGDVT VTYPDGSKDT 2521 IPGDKVVEGK GTEGQTDADK NEPKVPGDKV KVDDPNKLTE DEKSEVVKAV EDANKDENGK 2581 STLPEGSKVT VGDNGDVTVT YPDGSKDTIP GDKVVEGRGT EGQTDADKNE PKVPGDKVKV 2641 DDPTKLTEDE KSDVEQAIKD ANKDENGKST LPEGSKVTVG DNDDVTVTYP DGSKDTIPGD 2701 KVVEGKGTEG QTDADKNEPK VPGDKVKVDD PNKLMEDEKS DVEQAIKDAN KDENGKSTLP 2761 EGSKVTVSDN GDVTITYPDG SKDTIPGDQV IEGKSDADKN TPNVPGGDKV KVDDPTKLTD 2821 NEKNAVKDKV DEANSNLPDG TKVTVGDDGT TTITYPDGST NTISGHDLVT GKTDADKYPL 2881 NPGQAVNVVD PNHLTQAEQD QVKEAIQTTN PTAPIATITV DTAGNVQVTF ADGSTTTLQA 2941 NLHKHVTEAT TGSAIKPGVG TNGGQTKGAT STNQTATKQQ AQQHLPQTGD QPATWAMLSG
19 / 41 3001 LGVAFLGLLG LKKKRED
[0084] SEQ ID NO: 16 Arabinogalactano endo-1, 4-beta-galactosidase (natural) 1 MEIKKHFKLY KDGKKWCCAA IATTVLGIGL AIGSPSVLAD ADTITSTSDA NNSLVKNDNT 61 SDTDSNSEST FTDTNKNSTN EKEINENKNI DSSQQINQEQ TKSNNSEEQT TPVNVKAENT 121 DIKDSIPEKS TPNSFKEING STYYYGENGD LYRNQFYNNW GRTYYFQANG ARLDNGFYNN 181 WGRTYYFGSD GARWDNRFYN NWGRTYYFQN DGSRLDNSFY NNWGRTYYFG VDGARWDNRY 241 MVKWGRAYYF GNDGALLQNQ LKSINGINYW INNEGIIPLK NQFLTANENQ LFYFDGNGSL 301 VVNKFYHNWG HTYYFGSDGA RYTDQFLNRD GKVYYFDNQG IMYQDQYYKN WGHTYYFGSD 361 GARYTDQFLN RDGKVYYFDN QGIMYQDQYY KNWGHTYYFG SDGARYTDQF LNRDGKVYYF 421 DNQGIMYQDQ YYKNWGHTYY FGSDGARYTD QFLNRDGKVY YFDNQGIMVT NQVRVIDGKG 481 YEFNDNGEAT ETSDMGQTRD TVAKEVAQAL TNQGIKGVKY DWRNTNNDYQ ELALHDIAQE 541 VAQGDTNPDK NVIEKKLQAN NLLSGKVLVV YSTDFTNDDP QKITNTFMNS YDFTNADNSV 601 LGVGADLNKN KLVIILFKPG EKAEQPQATS TISASISDIF KKAGVNVDVD NGLTKGSVVN 661 SADLGNALTN GTAELLKGDK GTIISQEVLK AIFAAFAGNT SAVEGTKNYY NGNDAYHYEF 721 WLEGQSADDK LNNFLALNKG AKYGDQLKVN YTATLVFGQE TGTNSNESKV PASERTDEQL 781 DLAYKTGTDT GLRYDSVKVE KIPGMTDDMV RGVDVSSYQA LINAGVKFYD FNGQESNLFK 841 ILKDSGVNWV RLRVWNDPYN AQGQPYAGGD NNEENLIKMA KEASDNGLKL LIDFQYSDFW 901 TDPAQQILPK AWRNLSHGEM SQEVYLYTSK ILNDLQKAGA SVKMVQIGNE ITNGAFGLYT 961 GRNGGGNWAS LWETSDGDQV AKYIQAGSSA VRRIDPTIKV AIQLETPEIN KYRGIMNVLK 1021 KNNVDYDYLG TSYYPFWSTT QGNGWYDNVD LGYGANTPVN LEAIEKMAWN EFGKRTVILE 1081 SGWLNNTNDA DGTHNSVGEN NETTNIDRYS ADPQGQVDEI EDMYNAIIAQ KGLGAFYWEP 1141 AWIPVKAGWN NWQYNKLMSN IYGSGWASQY AKGYAPDSVL YYDGKEAWGG SSWDNISLFD 1201 DHGHPLQSLN VYNGMLNGYE SPKNVKSSLS TQLVKIWNET DVIPNDGLTE GTKLSTDLFG 1261 TTQLSGNDGQ SIGNAELTKL AGRLKDGISS KVYTAANGAR YHYIYWLEGG NNKVNTFVSA 1321 NKDAKYGQPL IANYSATVVV DSEPGTQVAT SPLQIKISQV WNTVNNEEIK IDNPLKQGDL 1381 ITDKSDNAFS GILNSKDIKE ALTGEKGKDV SESTVNDVKS LLPKEVKGSK TYTTADGNQY 1441 YYDFWLASVE TSNVNYGEPI IVNYTASLKW LG
[0085] SEQ ID NO: 17 Proteína de segregação cromossômica (natural) 1 MEKTMKKKAL VATTAVAGIT LVGEVTTVHA ADNVQQPVNE QNVNQSSQEE KQAAQNLQNA 61 QSDVNTATEA NSNAQDNLAS ANNNLSNAKK AVSDQAAKVA DATKAQSDAS TKVDNDNKVV 121 ADAQQKADQA TPANIENAKQ AIEGQNKVID QDNENIKYSN TDQDKAQNTL NNAQSNEDKA 181 NATLSNKKSS QASAQNNVKQ AEDALNGTHL VEAQNAFNQA QSNVENAQSK YDQANNQLSD 241 AQKKVTTNQN DLTAKNKALD NINNQVDTDQ NNVNSNQATA DSASSATQVA QNAVDQTKQS 301 LDKVIEELNG FSENTIKVPA GAQEAYEAFI DAVDNNADQS QLDSLAKKMY DTLHQGQGTN 361 GINHFNSSKY DQNQLVDVDH LTTDQLNELT QFAADMINSA RKAWGSDKNA GTLIPTQGVS 421 EMAQQIAKGY VSDNWHISQG HDVKRVTAAA GLIGLNDAGQ FYEDASEGYV HAWPWEKDSY 481 TMDNLKEAVY DSILGMLFAD DNSGNGHMTD LLGLHVNRKE DHQYFGLSTN MCPGSYMGQL 541 HFIIVENDPA YIKDPQTFNA KGGTTKIEYI DPKVQLNQQK DILTTTLSTQ QADLATKQDA 601 LNKANQNLAN AKKQLSEDQD LQTVAQQNRD SAQKALNDAT AKVSNLQATV NSLSQDLNSA 661 KATLDQAKKT LESYTADHKA KLDNYNNAKA ALDDANKAVA EAQSAVDTAV NETKIAQNNL 721 DQKKQAVTDA QNKLANDQEY LATLKQNLAD LQNAPQNLQK AKDQLAKDQI ALDNANKDLQ 781 NQKDSLDELN KKLEDAQVKV NEAQSAANVT KATLDQAQAK LSDAEATWKE LHNDAHRYGN 841 VVKVTPITME AGTSLPDPVI ENGFTVNTGT NQLFVSLAAI DSSNNNIPQG TKASWANRSK 901 ALTDSQNAGS YSEDILITFP DNSTVTVPVD LTVTAKKITE DQKATEGGYH IVNGSVVDKQ 961 NNLVSGWTVK NGQMVDPEGN VIKTTMSTAQ GVTIEKNNSK SGNTKTNMIQ TSLTIANNKA 1021 TTNKDNQLPQ TGNYNNNTKV LGLAGIALAS ALTMFGYKKR QHN
[0086] SEQ ID NO: 18 Ácido d-gama-glutamil-meso-diaminopimélico endopeptidase Cwls (natural) 1 MKSTTKKILA SSLGVAGAMA MGTVTAKADT TVTVNAGDSL NGIAQKYNVS ADDIATANHL 61 QNKELIFVGQ KLTIPTKDKN ETPANNAEKK DQASKNSQSL QDSVNKAMSY LGTPYVWGGN 121 KPGGFDCSGL VQYCYGIPQR TTYEQQALGP HIHDNVLNAP YGALVFYGSD DAPYHVAISL 181 GDGRIIQAPN ENETVKITDQ QYFPGNYYVV MH
20 / 41
[0087] SEQ ID NO: 19 Precursor de n-acetilmuramoil-L-alanina amidase sle1 (natural) 1 ATGCGTAATC AATTCATCGA TGTTTCAAGT TATCAACCAG ATACTGTTGC CTTTTTCCAA 61 GCTGCTAAAG CTCAGGGTGC ATTAGGGGTC GTTGTTAAGT TAACGGAAGG GTCCGAAGAT 121 GGTTCGGCTT ATGTTAATCC ACGTGCGGCC GCTCAAATTC GTAATGCCTT AGCGGTTGGC 181 TTGCGCGTTT CCTGTTACCA CTTTGCTCGT TATACATCAG TGACTGATGC ACAAAATGAA 241 GCTCGATTCT TCGTTAAAAT CGCTAAGCAA TTTGGTATGT ATGACGATAC TTTGATGATT 301 GATGATGCGG AAGTTCATTC AACTGCAGAT TATCAATCAG TATCCTTAGC CTTTCTTCAA 361 GAAGTAGAAG CTCTTGGTTA CAAGAATACT GGGATTTACT CCATGAAGTC CTTCTTCACT 421 GGCGGTATTC TTAATTCACA TGGCTTTGAT TCCCGGAAGA TTTGGATTGC TGGCTATGGT 481 GTGACTGAAC TGGGGATTGA TAATGCAAGT GCTTGGCAAT ATTCTGATCA TAGCATCATG 541 GGAATTGATA CTAGTTATGA CTTTGACGGT GCCTTTACGA CTGGTTTAGT ATCAGGCAAT 601 GTTCCGCAAG CTGTTATTCC AGCACCACAG CCGGTTCAAC ATATTGGTCA CCCAGCTACT 661 GGAACCTACA TTGTTCAGCC GGGCGATACA TTGAGTGGAA TTGCAGAAAA ATACGGGACT 721 ACTTATCAGA ACCTAGCAGC AATCAATGGT ATTGGTAATC CAAACCAGAT CAATGTCGGC 781 CAAGTCCTCA AAGTCACCGG AAAAGTATCA AACGAAAATA CTTACTTTGT TCAATCAGGC 841 GATACGTTAT CCGGAATTGC CACCAAATTC GGCACCACTG TCTCAGACCT CGTAAGCCGT 901 AATCACATTA CTAACCCGAA TGTGATCTAC GTTGGGCAAA AACTCTACTT AGCCGGCAAC 961 GGACAATCCA ATGCTTATAC TGTCCAAGCA GGGGACACAC TAAGCGGAAT TGCGGCTAAG 1021 TTTGGCAAGA CCTGGCAAGC ATTAGCTCAA AAGAATGGCA TCGCAAATCC TAATATGATT 1081 TTCATTGGTC AAACAATTCA GATTTAA
[0088] SEQ ID NO: 20 Família peptidase M23 (natural) 1 GTGTACCGAA TTATTGGTTA TAATGAACCA ACAGATAAAG CAGGATTTAT TGTACTGGAT 61 CCCCGAGTTA ATCGTCATAT TAGTTCGGGA AAACTCACGC TTAAAGAATC TAATATTGAT 121 GATTTGACTA TTACGGTTAA TCAAGCAAGT CCATTATGGG ACAACGTAAG GCCTTATCAT 181 ACTCATGTTA ACGTTTATGA TGATAATGAA CTTATTTTTC GTGGACGAGC TATCAAACCT 241 AAAAAGTCGA TGGAAGAAAG CGGACAATTC ATTCGTGAAT ATGTTTTTGA AGATATTGAA 301 GCATATCTCA TGGATAGCAC CCAAAGATTT TATGAAGGTG TTGGTCAAAC GCCCAAAGAA 361 TTTTTACAAA CTTTAATCGA TGTTCATAAT TCACAGGTTC CTGACTATAA AAAGTTTCAA 421 GTCCGGAATG TAAATGTCAC TAATAATAAG GATGACCAAT ATCGACAAAT TGATTATCCC 481 AAAACTAGCG ATGCTATTAA TGATAAATTA GTTAAATCTC TTGGTGGTTA TATTGTGACT 541 ACTTACAACG CTAACGGAAT AAACTACATT GACTACTTAA CGGATATTGG GGTTGATCAT 601 AAAGATGATA CTCCTATTCA GTTAGCTAAA AATATGAAGT CTGCAAGTAT GCAAATTGAT 661 CCTACTAAGG TGATTACAAG ACTGATTCCA CTGGGAAAGA CACTAGAACC ATCAAAAGTT 721 GATGTAAGTG ATGATGATGG AGAGGGCGGT TCTGGATCAT TAGATAGCCC TGAAGAATTT 781 TGTAAATCAG AAATTAATGC TACTTGGGGT AGTGATATTA ATAATATGAA ACAAGATTTT 841 GCCGCTCGTT CTTCGAGAGT TCGGGCTTGG GGAGTGGACG TTAATCGTTT ATATGATGTG 901 GTGAAAAATG CTGGAGTAAG TCCTGAATGG TTCTTTGCTT ATGAACTTCA AGAACAAGGA 961 ACTTACTATG GATGGCTTAA CCATACTTAT CGACACGGTG ATGCGTATAG TGATGCGCAA 1021 TCTGTTTGTG AGTGGATTAA AAATTGTTCA AATAGTAATT CCATTAATCC AGCATGGAGC 1081 GCACCGGAAG GATCAATGGC GCCGAATCAA GCATTAGCGG ATAAATGGAA TCAAGAGTTT 1141 GGAAAAGGTA CTATTGGCCG CGTTTATTTA CAAGGGACTG CCGCTGCTGT TTGGGATTTA 1201 GCTGGTCAAA CGCCTAATCC AGCTATTGGA AAGCCAATTA GTGGATGCAT TTCTTGTATT 1261 AAACGTTGGG GTGGTCATTC TAATGCAGCT GGTGGTACAT GGGGATGGCC TTTTCCTGAT 1321 GTTGGGGAAG GTCATTTTTC TCAAGTTCAG AGTTTCGGAA ATGATGGCGG ATATCGTCAA 1381 AATAGTTATC ACGATGGTGT GGATTTTGGA TCAATAGATC ATCCTGGTAG AGAAGTGCAT 1441 TGTATTCATG GTGGAACGGT AACTATCAAA TCAGCTATGG GTGGCTTAGG TAATTTTGTG 1501 GTTATTCATA CGCCGGAAGG ATTCAATATC GTTTATCAAG AAGCTTTTAG TTCTCCCTCT 1561 AATATTATTG TTAGTGTTGG GCAAAAAGTA AAAACTGGTG ATGTAATTGG ATATCGTGAT 1621 ACAGACCATG TTCATATTGG CGTAACTAAG CAAGATTTTT ATCAAGCAGT TCGAAATTCT 1681 TTTTCTCCTG CAGGTGGTTG GCTAGATCCA GTAAAACTAA TTAAAGAAGG TGGCGATGGG 1741 TCTAAACCAC AAGAAGGAAA GAAAGATCAA ACTGTTGATA ATAGTAATGC TGCACGTCCT 1801 AAATTAACCA TTACTACTGT CAATAACGGT AGAGACTATA TTGATATTCC TGATTTACAA 1861 AAAGAATTCG GTATTATTGA GGGAACTGTT GAATTTGATA ATGTAGATGA TCCGAATGTT 1921 TTAATGCAAC AAGCTCAAAC ATGGATAAAG GCTCAAAGAA TACCTCAAAG TTGGGAAGTT
21 / 41 1981 ACAGCTTTAG AATTACATAT GACAAACTTC AAATCTTTTA AGGTTGCTGA TAGGTACATG 2041 TTTATTAATC CAAATGTTGC AAAACCCCAA TTATTACGAA TTACTCAAAA AGAAATTGAT 2101 TTACTAAAGC CCCATGCGTC TTCATTAACG ATTGGTGATA AGACGATGGG GCTTACTGAT 2161 TATCAGTTAG AAAATCAAGT CAATTTTCAA CAATTTAAGG AAATTCGAGT GATGGTTAAT 2221 CAGGTTGTCC AAACCCAAGA GCAATCTGCT AATAACAATA ATAAGGTTAT GCAAAATTTT 2281 GCTAGTAGTG CTGATCTTGC ACAAATGAGA CAGGATCTAA GAAATCTTCA AGATGATAAC 2341 GATCGTGCTC GCAAAGGAAT GGTTTCCTTA GAAGAATTCA ATAAACTAAA GGAACAAGTA 2401 GAAAAACTAA CAACAGGAGG CGATGATAAT GGCAAGTGA
[0089] SEQ ID NO: 21 Proteína de partição cromossômica Smc (natural) 1 MNKANQKVAD DTTAVNNKQT DVNNAAEAKK NADEALKNAN DAQTSAQKNK DAKQAIADEA 61 SVALADANTA VKDAQAKVDA INDKLANFNT ITLPAGYKDD LIAYYNYFGN SNYNQDEANN 121 LAQDLLKYRD QAMSQNKFKD NLSDDRVVDI DNLNSTDRAE LSQFVASLIN QVRTQMGTNL 181 VISSPAADDY AEQVSQNYNK DNWNSADNGK HDQSALNNAT DQLNISWNGE NMGLDQSIFT 241 TDYTVLTDGT KLPTGNKQTI NDLKHLIYDD FISMMFDDAD SAWGHATNFA GIDNFAAEKQ 301 AVGFSLDKFY NTHYDLVEAN QKVEENSYTL PSINALTQKL ADAKDDLSIK QTDQASKQKA 361 NDDAQNALSS ANQVLVAAQN DVKDKTATAQ EANDNLTTAQ NDLATLQNQL SADQANQKQA 421 QTTFDSFDAD LATKQANLQK ATDSLKAEQG RLAIAQADLD NANKALSDAN NNLAQKKQVV 481 ENDNETLKVD NDKLVQLQNN LSDLQNAPKL LAAAKEQVAT AQKALADAQE AYNVANDKLT 541 SLKQTAAGTT TNVSKAQQAL AEAKNNEDAA KEVLDQAQQA LTELRQKEAL AKQVAEEQAK 601 LAAEKEAKDN GYHIENNQVV DAKGNSVNGW TVKGNQIVSP TNATVDPAVS VTTNVNVDSK 661 GQVQPQTSVT ANSVKTVAAT ESANPVATTT VQTREQYKQQ LKSNNQLPQT GNNDSAVLSL 721 AGVALAAMLS LFGIKKREY
[0090] SEQ ID NO: 22 promotor de endopeptidase Cwls (natural) 1 AAATTAAAAG GCTGGATTTT TTCGGCCTTT TTTTAGTGCA AATAATTATT TTTTACGTAT 61 TTATATTATA GGGCTAATCA CTAAACTAAT AATTAGTGGT TGAAGCGCTG AAAATTTTCT 121 GCTATTTTAT TAATAGTTTG ATAATAAAAT AATGATATTT AATATAAAGA GGGATAAACG 181 AAATA
[0091] SEQ ID NO: 23 promotor de proteína de segregação cromossômica (natural) 1 GAAGTACAAA GTTACTTTAA CTATAATGAA AAACAAGACA ATATAAAGAA AACAACATAT 61 AAGGTTCAGT TCATAACTGA TTAGATTTAT AATAAATATT GTAAATCGGA CAAAAATAAA 121 TTAATTTTCA ATTAATTCAA AAAAACCATA TTTTTTTCGT TTTGGCATAT TTGGATTTGC 181 TACACTAAAG ATGATCAAGA AAGGGGAAAA GATAATCTTC AATCTTGTGT ACTTAGTTTG 241 TTAATTAATT TATAAATTTA GGGAGGAAAC CTATC
[0092] SEQ ID NO: 24 Promotor de proteína de partição cromossômica Smc (natural) 1 GCAATGCACA AGATGCTGAA ACAAAGGCAC AACAAAATGC AGATCAAGCT TCACCAGCTA 61 ATATTCAAAA GGCACAAGAT GCTATTGCTA ATCAAGAAAC TCAAATTAGT AAAGACACCG 121 ATGCTATTAA TGACGCTAAC AAAGCCGTTA GCGATGCACA AAGCACAGTT GATGCAGCGC 181 AAAAAAAGTT AATGATGCAA CTACTGCTCG TGACAATCAA CAAAAGAATG TTGATACTGC 241 TAGTGATGCA GTTAAGAATG CTCAAGCTAT TCTTGACAAC AGTGATCAGG CTAAAAAGGA 301 AGCCCAAGAT GCT
[0093] SEQ ID NO: 25 Lactobacillus reuteri 3630 F1 16S 1 GCCGCGGGTG CCTATACATG CAGTCGTACG CACTGGCCCA ACTGATTGAT GGTGCTTGCA 61 CCTGATTGAC GATGGATCAC CAGTGAGTGG CGGACGGGTG AGTAACACGT AGGTAACCTG 121 CCCCGGAGCG GGGGATAACA TTTGGAAACA GATGCTAATA CCGCATAACA ACAAAAGCCA 181 CATGGCTTTT GTTTGAAAGA TGGCTTTGGC TATCACTCTG GGATGGACCT GCGGTGCATT 241 AGCTAGTTGG TAAGGTAACG GCTTACCAAG GCGATGATGC ATAGCCGAGT TGAGAGACTG
22 / 41 301 ATCGGCCACA ATGGAACTGA GACACGGTCC ATACTCCTAC GGGAGGCAGC AGTAGGGAAT 361 CTTCCACAAT GGGCGCAAGC CTGATGGAGC AACACCGCGT GAGTGAAGAA GGGTTTCGGC 421 TCGTAAAGCT CTGTTGTTGG AGAAGAACGT GCGTGAGAGT AACTGTTCAC GCAGTGACGG 481 TATCCAACCA GAAAGTCACG GCTAACTACG CCCCCCACCA GCCCCAA
[0094] SEQ ID NO: 26 Lactobacillus reuteri 3632 F1 16S 1 TGCTGGGGTT TGCCTATACA TGCAGTCGTA CGCACTGGCC CAACTGATTG ATGGTGCTTG 61 CACCTGATTG ACGATGGATC ACCAGTGAGT GGCGGACGGG TGAGTAACAC GTAGGTAACC 121 TGCCCCGGAG CGGGGGATAA CATTTGGAAA CAGATGCTAA TACCGCATAA CAACAAAAGC 181 CACATGGCTT TTGTTTGAAA GATGGCTTTG GCTATCACTC TGGGATGGAC CTGCGGTGCA 241 TTAGCTAGTT GGTAAGGTAA CGGCTTACCA AGGCGATGAT GCATAGCCGA GTTGAGAGAC 301 TGATCGGCCA CAATGGAACT GAGACACGGT CCATACTCCT ACGGGAGGCA GCAGTAGGGA 361 ATCTTCCACA ATGGGCGCAA GCCTGATGGA GCAACACCGC GTGAGTGAAG AAGGGTTTCG 421 GCTCGTAAAG CTCTGTTGTT GGAGAAGAAC GTGCGTGAGA GTAACTGTTC ACGCAGTGAC 481 GGTATCCAAC CAGAAAGTCA CGACTAACTA CGCCCCACAC CCCAGCCGCA A
[0095] SEQ ID NO: 27 Lactobacillus reuteri 3630_00184 1 ATGGATATGA AAATAAAAAA AGAACCACCA CAACAAGTAA AATTAGTTGA AGTAATTCAG 61 GTTATAACCT CTCGTGGAGC TGGAACAAAG GAGGATCCGA TAAGAAAGAT TATTCAGTAT 121 TGGAGCAAAG AAGGCACATT ATTAGCAGAA AGTTTTGGAA ACTAA
[0096] SEQ ID NO: 28 Lactobacillus reuteri 3630_00491 1 ATGGCTGGTA TCAAAAGTAT CGCAAAAGCG GTAATGACCC AGAATCACTT CGTGATCGCC 61 GAGGCAAAGC TAAGCCAGAA GAGAAGTGGA CGGAAGTTGA CCGACTCAAG GCAGAAAATC 121 GCTTATTAA
[0097] SEQ ID NO: 29 Lactobacillus reuteri 3630_00497 1 ATGGCTAAAT ACACTGTTGA ATTAAGTGAA GAAGATATCC AAATGATCAA GGATTGTCAT 61 TCAAAGAATC CTTCTATCAT GAAGGCAATG AACGACGCTA AAAAAGTTGA AGATTAA
23 / 41
SEQ ID NO: 30 Lactobacillus reuteri 3630_00533 1 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 61 TCACTGGCAC TCGTTGATGC ACTTTCGCTA GCACTAGTAG AAGCTGACTC ACTTGCACTT 121 GTCGATGCCG ATTCGCTTGC ACTTGTCGAT GCTGATTCGC TTGCGCTCGT TGAGGCTGAT 181 TCGCTAGCAC TAGTAGAAGC TGATTCACTG GCACTCGTTG AGGCACTTTC ACTTGCGCTT 241 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC GCTCGTTGAT GCACTTTCGC TGGCACTTGT CGATGCCGAT 301 TCACTTACGC TCGTTGAGGC CGATTCGCTG ACACTCGTTG ATGCACTTTC ACTTACGCTC 361 GTTGAGGCCG ATTCGCTGAC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTACGCTCGT TGAGGCCGAT 421 TCGCTGACAC TCGTTGATGC ACTTTCGCTG GCACTTGTCG AGGCACTTTC ACTTACGCTC 481 GTTGAGGCCG ATTCACTTAC GCTCGTTGAG GCCGATTCAC TTGCGCTTGT GGATGCGGAC 541 TCACTTGCAC TCGTTGAGGC ACTTTCACTT GCACTTGTCG ATGCAGATTC GCTGGCACTC 601 GTTGATGCAC TTTCACTTGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCACTTGT CGATGCGGAT 661 TCACTTGCAC TTGTTGAAGC GGATTCGCTA GCACTTGTCG ATGCGGATTC ACTTGCGCTT 721 GTTGAAGCGG ATTCGCTGGC GCTTGTTGAA GCCGACTCAC TTGCACTCGT TGAGGCTGAT 781 TCACTTGCAC TCGTTGAGGC ACTTTCGCTG GCGCTCGTTG ATGCAGATTC GCTGGCACTC 841 GTTGAGGCCG ATTCGCTGGC GCTTGTTGAG GCCGATTCGC TTGCACTTGT CGATGCTGAT 901 TCACTTGCAC TGGTTGAAGC AGATTCGCTG GCACTCGTTG AGGCACTTTC GCTGGCACTC 961 GTTGAGGCCG ATTCACTTGC GCTTGTTGAA GCTGATTCAC TTGCACTTGT CGATGCTGAT 1021 TCACTTGCGC TAGTAGATGC CGATTCGCTG GCACTCGTTG AAGCAGATTC ACTTGCGCTT 1081 GTTGAAGCCG ATTCACTTGC GCTTGTTGAA GCCGACTCAC TTGCACTCGT TGAGGCACTT 1141 TCGCTGGCGC TCGTTGAAGC AGATTCGCTG GCACTCGTTG AAGCAGATTC GCTGGCGCTT 1201 GTTGAGGCCG ATTCGCTTGC ACTTGTCGAT GCTGATTCAC TTGCACTGGT TGAAGCAGAT 1261 TCGCTGGCAC TCGTTGAGGC ACTTTCGCTG GCACTCGTTG AGGCCGATTC ACTTGCGCTT 1321 GTTGAAGCTG ATTCACTTGC ACTTGTCGAT GCTGATTCAC TTGCGCTAGT AGATGCCGAT 1381 TCGCTGGCAC TAGTAGAAGC AGATTCACTT GCGCTTGTTG AAGCCGATTC ACTTGCGCTT 1441 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC ACTCGTTGAT GCCGATTCAC TTGCACTTGT GGATGCGGAC 1501 TCACTTGCAC TCGTTGATGC ACTTTCACTT GCACTTGTGG ATGCGGATTC GCTGGCACTC 1561 GTTGATGCAC TTTCACTTGC GCTCGTTGAT GCCGATTCAC TGGCACTCGT TGATGCACTT 1621 TCGCTAGCAC TAGTAGAAGC TGACTCACTT GCACTTGTCG ATGCCGATTC GCTTGCACTT 1681 GTCGATGCTG ATTCGCTTGC GCTCGTTGAG GCTGATTCGC TAGCACTAGT AGAAGCTGAT 1741 TCACTGGCAC TCGTTGAGGC ACTTTCACTT GCGCTTGTTG AAGCCGACTC ACTTGCGCTC 1801 GTTGATGCCG ATTCACTGGC ACTCGTTGAG GCACTTTCAC TTGCGCTTGT TGAAGCCGAC 1861 TCACTTGCGC TCGTTGATGC ACTTTCGCTG GCACTTGTCG ATGCCGATTC ACTTGCGCTT 1921 GTGGATGCGG ACTCACTTGC ACTCGTTGAA GCCGATTGGC TTGCACTAGT AGAAGCTGAT 1981 TCACTGGCGC TCGTTGAGGC TGATTCGCTG GCGCTCGTTG AGGCTGATTC ACTGGCACTC 2041 GTTGAGGCCG ATTCGCTGGC GCTCGTTGAT GCAGATTCGC TGGCACTAGT AGAAGCTGAT 2101 TCACTGGCGC TCGTTGATGC CGATTCACTT GCACTTGTCG ATGCGGACTC ACTTGCACTC 2161 GTTGATGCAC TTTCGCTTGC ACTTGTGGAT GCGGATTCGC TGGCACTCGT TGATGCACTT 2221 TCGCTAGCAC TTGTCGATGC CGATTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC GCTAGCACTC 2281 GTTGATGCAC TTTCACTTGC ACTTGTGGAT GCGGATTCGC TGGCACTTGT TGATGCGGAC 2341 TCACTTGCAC TTGTTGAAGC CGATTCACTG GCGCTCGTTG ATGCCGATTC ACTTGCACTT 2401 GTCGATGCCG ATTCACTGGC GCTTGTTGAT GCGGACTCAC TTGCACTCGT TGATGCACTT 2461 TCACTTGCAC TTGTGGATGC GGATTCGCTG GCACTAGTAG AAGCTGACTC ACTTGCACTT 2521 GTCGATGCCG ATTCACTGGC ACTCGTTGAA GCACTTTCAC TTGCGCTTGT TGATGCGGAC 2581 TCACTTGCAC TCGTTGAAGC CGATTCGCTA GCACTTGTCG AAGCTGATTC ACTGGCGCTC 2641 GTTGATGCTG ATTCACTGGC GCTTGTTGAA GCCGACTCAC TTGCGCTCGT TGATGCACTT 2701 TCACTTGCGC TCGTTGATGC CGATTCACTA GCACTAGTAG AAGCTGATTC ACTGGCGCTT 2761 GTTGATGCAG ATTCGCTGGC ACTTGTCGAT GCCGATTCGC TAGCACTAGT AGAAGCTGAT 2821 TCACTGGCGC TTGTTGATGC AGATTCGCTG GCACTTGTCG ATGCCGATTC GCTAGCACTA 2881 GTAGAAGCTG ATTCACTTGC ACTTGTCGAT GCCGATTCAC TGGCGCTCGT TGATGCCGAT 2941 TCGCTGGCAC TAGTAGAAGC TGACTCACTT GCACTTGTCG ATGCCGATTC ACTGGCACTC 3001 GTTGATGCAC TTTCGCTAGC ACTTGTAGAT GCGGATTCAC TTGCACTCGT TGATGCACTT 3061 TCACTGGCAC TCGTTGATGC ACTTTCGCTA GCACTCGTTG AAGCACTTTC ACTTGCGCTT 3121 GTTGATGCGG ATTCGCTGGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 3181 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC GCTTGCACTT 3241 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTAGTAGAA GCAGATTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 3301 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGCACTT 3361 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTAGTAGAA GCTGACTCAC TTGCACTCGT TGAAGCACTT
24 / 41 3421 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTTGTCG ATGCTGATTC GCTAGCACTA 3481 GTAGAAGCTG ATTCACTTGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTTGT TGAAGCCGAC 3541 TCACTTGCGC TCGTTGATGC CGATTCACTT GCACTCGTTG AGGCACTTTC ACTTGCGCTT 3601 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC GCTCGTTGAT GCACTTTCGC TGGCACTTGT CGATGCCGAT 3661 TCGCTGGCAC TAGTAGATGC GGACTCACTT GCGCTCGTTG AAGCCGATTG GCTTGCACTA 3721 GTAGAAGCTG ATTCACTGGC GCTCGTTGAG GCTGATTCAC TGGTACTCGT TGATGCACTT 3781 TCGCTAGCAC TCGTTGAAGC ACTTTCACTT GCGCTTGTGG ATGCGGACTC ACTTGCACTA 3841 GTAGAAGCAG ATTCACTTGC GCTCGTTGAT GCCGATTCAC TTGCACTTGT CGATGCCGAT 3901 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC GCTTGCACTT 3961 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTAGTAGAA GCAGATTCAC TGGCGCTCGT TGATGCCGAT 4021 TCACTTGCAC TTGTCGATGC CGATTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC ACTGGCACTC 4081 GTTGATGCAC TTTCGCTAGC ACTCGTTGAA GCACTTTCAC TTGCGCTTGT TGATGCGGAC 4141 TCACTTGCAC TTGTTGAAGC CGATTCACTG GCGCTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGTGCTT 4201 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC GCTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 4261 TCACTAGCAC TAGTAGAAGC TGATTCACTG GCGCTTGTTG ATGCCGATTC GCTGGCACTT 4321 GTCGATGCCG ATTCGCTAGC ACTAGTAGAA GCTGATTCAC TGGCACTTGT CGATGCCGAT 4381 TCACTGGCGC TCGTTGATGC CGATTCGCTG GCACTAGTAG AAGCTGACTC ACTTGCACTT 4441 GTCGATGCCG ATTCACTGGC ACTCGTTGAT GCACTTTCGC TAGCACTCGT TGATGCACTT 4501 TCGCTAGCAC TCGTTGATGC ACTTTCACTT GCGCTCGTTG ATGCAGATTC GCTAGCACTA 4561 GTAGAAGCTG ACTCACTTGC ACTTGTCGAT GCCGATTCAC TGGCACTCGT TGATGCACTT 4621 TCGCTAGCAC TCGTTGATGC ACTTTCACTT GCGCTTGTTG AAGCCGACTC ACTTGCGCTC 4681 GTTGATGCAG ATTCGCTAGC ACTAGTAGAA GCAGATTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 4741 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGCACTT 4801 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTAGTAGAA GCTGACTCAC TTGCACTCGT TGAAGCACTT 4861 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTTGTCG ATGCTGATTC GCTAGCACTA 4921 GTAGAAGCTG ATTCACTTGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTTGT TGAAGCCGAC 4981 TCACTTGCGC TCGTTGATGC CGATTCACTT GCACTCGTTG AGGCACTTTC ACTTGCGCTT 5041 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC GCTCGTTGAT GCACTTTCGC TGGCACTTGT CGATGCCGAT 5101 TCGCTGGCAC TAGTAGATGC GGACTCACTT GCGCTCGTTG AAGCCGATTG GCTTGCACTA 5161 GTAGAAGCTG ATTCACTGGC GCTCGTTGAG GCTGATTCAC TGGTACTCGT TGATGCACTT 5221 TCGCTAGCAC TCGTTGAAGC ACTTTCACTT GCGCTTGTGG ATGCGGACTC ACTTGCACTA 5281 GTAGAAGCAG ATTCACTTGC GCTCGTTGAT GCCGATTCAC TTGCACTTGT CGATGCCGAT 5341 TCACTTGCGC TTGTGGATGC GGACTCACTT GCACTCGTTG ATGCACTTTC GCTTGCACTT 5401 GTGGATGCGG ATTCGCTGGC ACTAGTAGAA GCAGATTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 5461 TCACTTGCAC TTGTCGATGC CGATTCACTT GCACTTGTTG AAGCAGATTC ACTTGCGCTC 5521 GTTGAGGCCG ATTCGCTGGC ACTCGTTGAT GCCGATTCGC TAGCACTAGT AGAAGCTGAT 5581 TCACTTGCGC TCGTTGATGC CGATTCACTT GCACTTGTCG ATGCCGATTC ACTGGCGCTT 5641 GTGGATGCGG ACTCACTTGC ACTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCACTTGT GGATGCGGAT 5701 TCGCTGGCAC TTGTCGATGC CGATTCACTG GCGCTTGTTG ATGCGGACTC ACTTGCACTC 5761 GTTGATGCAC TTTCACTTGC ACTTGTGGAT GCGGATTCGC TGGCACTAGT AGAAGCTGAC 5821 TCACTTGCAC TTGTTGAAGC CGATTCACTG GCGCTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGTGCTT 5881 GTTGAAGCCG ACTCACTTGC GCTCGTTGAT GCACTTTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 5941 TCACTAGCAC TAGTAGAAGC TGATTCACTG GCGCTTGTTG ATGCAGATTC GCTGGCACTT 6001 GTCGATGCCG ATTCGCTAGC ACTAGTAGAA GCTGATTCAC TTGCGCTCGT TGATGCCGAT 6061 TCGCTAGCAC TTGTCGAAGC TGATTCACTG GCACTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGCACTC 6121 GTTGATGCCG ATTCGCTAGC ACTTGTCGAA GCTGATTCAC TTGCGCTCGT TGATGCTGAT 6181 TCACTGGCGC TTGTTGAAGC CGACTCACTT GCGCTCGTTG ATGCACTTTC ACTTGCGCTC 6241 GTTGATGCCG ATTCACTAGC ACTAGTAGAA GCTGATTCAC TGGCGCTTGT CGATGCCGAT 6301 TCGCTAGCAC TTGTCGAAGC TGATTCACTT GCACTCGTTG ATGCTGATTC ACTTGCACTT 6361 GTCGATGCTG ATTCACTTGC GCTCGTTGAT GCTGATTCGC TGGCACTTGT CGATGCCGAT 6421 TCACTTGCGC TTGTTGAAGC TGATTCACTT GCGCTTGTTG ATGCGGATTC GCTTGCACTC 6481 GTTGATGCAC TTTCACTTGC GCTCGTTGAT GCCGATTCGC TGGCGCTCGT TGATGCACTT 6541 TCACTTACGC TCGTTGATGC ACTTTCACTT ACGCTCGTTG ATGCACTTTC ACTTACGCTC 6601 GTTGATGCAC TTTCACTTAC GCTCGTTGAT GCACTTTCAC TTACGCTTTT TGATGCCGAT 6661 TCGCTGGCAC TCCTCGTTGA AGCGGATTCG CTGGCACTCC TCGTTGAAGC GGATTCACTT 6721 ACGCTCGTTG ATGCGCTAGT CGAAGTACTC GTCGAGGTGG ATTCCTGTTC ACTCTTACTC 6781 GTCAATTGA
25 / 41
[0098] SEQ ID NO: 31 Lactobacillus reuteri 3630_00804 1 ATGGAGATAT TGGTAACGTT ATTTGATTTG GTGTTTTTTA TTACGTTTAT AGTCGCAATT 61 GTCTATGGTA TTAGGTGGTT TAAAGGAAGA AAAGATAAAG AAAATGAATC TCTTAAGAAA 121 CGCCGTTTGT AA
[0099] SEQ ID NO: 32 Lactobacillus reuteri 3630_00827 1 ATGATTAACT TAAACTTAGC AGGCTTAGAT TTTGTAATGA CGGCACTTTT TATTGTGTTG 61 TTTACAGAAC AGTTGAAAAA TGCCCGAACT CAGCGTGATG CTCTGATTGG TTTAGCATTT 121 GCAATTATTT GTTTACTATT TTGCAACAAG AATGTTTTTC TATTAGTGAC ATTAGTAACA 181 CTTGTCGCAC TGTTTTCATT AAATTACTTA ATCACGAGGA GAAAAAATGA CATTAACTGA
[00100] SEQ ID NO: 33 Lactobacillus reuteri 3630_00947 1 ATGTCAGAGA TGAAAAATCG CGTAATTAAT TTTCGGAATG ATAACTTAGC CAAACTTATA 61 GTCAATTATT ATGGAAATAG TCAATTAAGT GTGCATATTA CTAATAATAT GTTTTTTGAA 121 TGA
[00101] SEQ ID NO: 34 Lactobacillus reuteri 3630_01261 1 ATGAAACGCA AAATTGCATT AGCTCAACTT GATATTCAAT TAGGAAATCC TGCCGAAAAT 61 TATCAAAAAG CTAAACAAGC GATTGAAGAA GCTGCTAGTC ACCATGCAGA TATCGTTGTC 121 TTGCCGGAGA TGTGGAATGC TGGCTATGCC TTAGATCAAT TAGCAGAATT GGCAGATGAA 181 AACGGTCAAA AGACACAAAA ATTTCTTAGT GAGTTAGCGT TAGAAAATCA AATTAACATT 241 GTCGGTGGTT CAGTAGCGGT GAGATGTGGA CAATCTTTTT TCAATACAAC CTATGTTTAT 301 GATCAAAAGG GAAATCTAAT TAGCAGTTAC GAGAAGGTGC ATTTATTTGG ACTAATGAAT 361 GAAGACCGAT ATCTAAAAGC CGGGCAAAAA GAAAATCACT TTGAATTAGC TGGGGTTCCG 421 AGTGCAAGTT TTATTTGTTA TGATTTGCGA TTCCCTGAAT GGATTAGAAC AGTCACTCGT 481 TATGGAACTG ATATCTTATA TTTTTCGGCA GAATGGCCAA GCAAACGGAT TAAACAATGG 541 AAAATAATGC TTCAGTCACG GGCAATTGAA AATCAAGCCT TTGTAGTCGC GGTCAATCGT 601 GTTGGGACGG ATTTAGAGAA TAGCTTTAAT GGTCATTCGT TAGTAATAGA TCCGCTTGGG 661 CAGATTATCC ATGATGCAGG AGAAGTTGAA CAAGTAAGTT ATGCAGAAAT TGACTTAGCG 721 CAGTTAGCAC AGGTTCGGGG GCCGATTCCG GTGTTTAAGG ATCGCCGACC AAGTCTTTAT 781 CATTAA
[00102] SEQ ID NO: 35 Lactobacillus reuteri 3630_01695 1 ATGCAAAATA AAGATGCTTG TACATCAATT ATGGTCGGTA AAAAGGCTTC TCTCGACGGT 61 GCTAATTATA TTGCTCGTAA TGAAGATCGC GTAAAAGCAA TTGAACCCAA GCGATTTTTA 121 GTAAAACCGG CAGTAAAAGG ACGCCACGAA ACCTACGTAT CACCTTACAA TAAAGTAACT 181 GTAGCTTTGC CGGAAGAGAG AATGCGTTAT ACTTCTACGC CTACCCTTGA TCAAACAGCC 241 GGACCTAATG AAGAAGATGG AATTAATGAA GCAAATGTGG CAGCTTCCTT TACTGAGAGT 301 GTTTATGCAA ATGATCGGGT GTTAGCATAT GATCCATACG TAAAAAATGG CCTGGCAGAA 361 GACTCACTTT GTACTTTAGT ATTACCGTAT ATTCATTCTG CCCGTGAAGG AGTTGAATAT 421 ACTGGAAAAT TAATTGCTGA ATTGGGCTCT GCTGAGGGAA ATGGAATGCA ATTTGCAGAT 481 GCAGATGATA TTTGGTATAT GTAA
[00103] SEQ ID NO: 36 Lactobacillus reuteri 3630_01889 1 ATGAATTATT TTATCGGTGT TGATGTTGGA ACTACTTCTA CAAAGGCAGT TCTATATGAC 61 CAAAATGCAA CTGTGTTAGA TCAATTTAGC CAAGGTTATT CCCTTTACCG CGATGCTAGT 121 GGAATGGCTG AACAAAACCC AACTGCAATT GTCGAAGCAG TCGAAAAAGT TATTCATGAT 181 GCAGCACAAA AAGCAGATTT AACAAATGGA AAATTGTTAG CGGTATCATT TTCTAGTGCT 241 AACCAAAGTG TGATTATGCT CGACAAGAAT TTCAATCCCC TTTCACGGGT CATCACTTGG 301 GCTGATACCC GTGCACGTGA TGTCGCCAAC GAATTAAAGA ATAGTCCTGC TGGTCAGCAA 361 ATCTATGCTA AAACAGGTAC ACCTATTCAT CCAATGTCCC CATTGACCAA GATTATGTGG 421 CTCAATAAGA CACAAGCAGA TAAGGTTGCT CAAACTGCAT ATTTTGGCGA TATCAAATCC 481 TACCTCTTCC ACCAGTTTTT CAATACATTT AAGGTTGATG TTTCCATCGC TTCATGTACC 541 GGAATGATGA ATGTCAATAC GTGTGACTGG GACGATCAAG CATTGGAACT CGCTAACGTC 601 GACTGTTCCC AATTACCAGA AATCGTGAAC GGAACAACCC AAGCGATTGG CCTAACAGCA 661 GCGGCGCAAG CAAAAATGGG TATCCCCGCT GACACGCCAT TTGTCTATGG TGCCTTTGAC
26 / 41 721 GGTGCTTTAT CTAATTTAGG TGTGGGGGCA ATTAAGCAAA ATACTGTTGC CATTACGATT 781 GGAACTTCGG CTGGTGTTCG GGTAGTAACT GACCATCCAG TGATCGATCC TCAGCAACGA 841 CTCTTCTGTT ACGCCGTGGA TAAAGGTTTA TGGGTCATCG GCGGTCCGCT TAATAATGGT 901 GGCGATGTCT ATCAGTGGGC CGTTGAACAC TTAGTTGACG CTAGTGCAGT TAAAAATGAA 961 AATATTGATC CCTACACTCT TGCTAACCGA GTTATTGAAG GTGTTCCCGC CGGAGCTCAC 1021 GGTTTGCTCT TCCACCCATT CCTTGGCGGT GAACGGGCAC CATTATGGGA CGCTAATGCG 1081 CGCGGTAGTT TCTTTGGACT TTCCCACATT CATACTCGTG CCGATATGCT GCGCTCAGTA 1141 ATGGAAGGAA TTTGTATGAA TATTGCAACT GTTTTCCAAG CGGTTCGTGA TCTTGTTGGT 1201 AATCCTGCAA GCGTAACTGC AACTGGCGGT TTTGCGCGAG CTGAAGTTTG GCGGCAAATG 1261 TTAGCAGATG TCTTGAACTG TCCGGTCAAT ATCCCGAACT CATTTGAATC TGGTTGTCTC 1321 GGTGCAATCA CCATGGCAAT GAAGAGTTTA GGAATGATTG AAAACTATGA AATCATTAAA 1381 ACATTAGTTG GTGATATCAG TTCTTATCAG CCAAATCAAG ATGCGGTTAA TGTTTATCAA 1441 AATTACTTAC CACTTTTTAA GCAGGTCGAA GGATTATTAA CACCAGCCTA TTCGACCATC 1501 GCTAAATTAC AACAACAATC TACTACTCAT TAG
[00104] SEQ ID NO: 37 Lactobacillus reuteri 3630_01932 1 ATGACAACAT CAATGATCCA CAGTAGAAGT ATGTTGGCGA AAGTGATTGC AGAATCACCT 61 TCACCTTTTA TTATACCAAT TTTTTGTCCT AATGTAATAA AGATTATCTT TTTATCTATA 121 AATTATTTTA TGAAAAGAGT GGAAAAGGCA AGAAGAGCAA TCAAAAAGCC AATTTTAACA 181 ATTTTATTAA GTTGA
[00105] SEQ ID NO: 38 Lactobacillus reuteri 3630_02243 1 ATGAGCAAAC TATTACTTGA TGAAAGACCG TTACAAGTTC AGGCATCGTT AGCTGGAGCG 61 TTGAAAAGCT TAGACGAAGC TGTTATTCTC CAGCAGCTTC ACTATTGGCT TCAACGTTCT 121 AATACAGTAA GAGACAATCA CAAATGGGTC TATAACAGCA TGGCTGATTG GAATAAACAG 181 TTCCCTTGGC TTTCTAGAAA GGCTCTATCG AACCACTTTA AGAAATTAGA AAAACGAGGA 241 CTAATTATTA CAGGCAACTA TAATAAATTA TCTTTTGACA AAACAAAGTG GTATCGAATT 301 GACTATGACG CATTTTCCCA TTTGGAACAA CGATTGGGTA GAAACTACCC AACGAATGGG 361 AAGAATCTAC CCAATGGAGA CGGTAAAAAC TGCCCAATCG GAGAGGAAGA ATCTACCCAA 421 CCAATACCAA TAGACTACCA AGAGACTACA CAAAAGACTA CTACAAGAGA TAAAGGGCAG 481 GCACAGCCAG CCCAACCTTC CATTGCTGCA CAGCGGCGAG AAGTTGTTGA ATATCTCAAT 541 CAAAAAAACT GGCAAGCACT TCAAGCCTGA
[00106] SEQ ID NO: 39 Lactobacillus reuteri 3630_02365 1 TTGAATAATT TTCAAAAGGC AATTTTCTTG TTGCAGAATA TCGACAAGCT TAAACAGCTT 61 AATGGTAAAG CGATGACTCT TACTGAGTTC TCTAAAATAA CTGATGTTTC ACGGCCAACG 121 TTGTATAAAT ACATTCAGCA TCCAGAAACA ATGAGTAGTT CGTTTGTAAA TAAAGCGGCC 181 ATGCTCTACG ACAAGGTTGT TAAATTTCAA GATATTCTTG ATACAGTTCA GCGTGAAGAT 241 AAACAATTTA AGACTACCAG GCAGGAATTG ATTAAGCTTT TAGAGTCTAA TGTAGCTAAT 301 ATTGAAGTTA CAGATTATAC AAAAGCAATC GCGACAGTAA TTATTAGTGA CTTAAAAGAA 361 GAAAATTCAA GTCTGCTAAA AGCGTTAAGT AAGCAATTAC CATTTAAACC AAATTTAAAT 421 GATAATTTGT CAAAATAG
[00107] SEQ ID NO: 40 Lactobacillus reuteri 3630_02435 1 GTGAAGATGA ATAGTATGAC AAACAACCAA AAAGAAAGTT GGAACGTTGG CAACTATAAA 61 ATCAATGTAT TACCAGATGA TGAGTTCCAG CAATTGTTAA AGAACCAACG CCAACTTCAA 121 CAGATCATTG AAAGTATGCC ACTACCAACC GACCCCAATG TTGATCTAGT TAAAAAGATT 181 CATTCCCAAC TCCCTATTAC AAACTGGGCT TGGGAATTAA CTAAACAACG AGAACATGAG 241 GAAAAGTTAA AGAAACAAAA GCAGCGAATT GCACAGCAAT CGCTTAACTA TCCAACAAAC 301 CTCAAGAAAC CGGATAATGG CCTTTCCCTA TAA
[00108] SEQ ID NO: 41 Lactobacillus reuteri 3630_02436 1 ATGAATTCTA ATTTGAAAAA GAATTTGATT ATCGCAAATG GATTTCTACT ACTAATAATA 61 ATATTTTATG TTTTATTACA TATGGGTCCA TTAAATATGA AAGTCTTATT AGTAGGATTG 121 GTATTAATGA ATCTGACAGT AATATTTAAA TAA
[00109] SEQ ID NO: 42 Lactobacillus reuteri 3630_02437
27 / 41 1 ATGGATAAAT TAACATTGAA AAAACTAATT ATTATTACAT TAGGCATGCT AATGGTATTT 61 CTTTTAGGTA TGCACCTTCA TCAAAAGACA CACTTTAACA AAAACGTGAA GATTAATAAT 121 ATTCCAGTCG GAGGTCTTAC TGTTCAACAG GCATATAATA AAGTAAGTAA TACTAAAAGA 181 AAATCAAAAA TCTACATTAA CAAAAAGTTA GTTTATTCAG GTAAAAGTAC TGACTCAGGT 241 TTTAAGTTAT CTGATAAAGA AAGATTTAGT AAGGCGTTAC ATTACCAATA CACTTTTTTT 301 CCCTCACGAA AACATGAAAA TTTGCTAGTT GAGCCAGCTG ATTTAGATAA GTCAGCGTTA 361 AATAATATTG ATTCGGCAAT AGTAGCTAGG ATTCATCAGC TCAATATAGG CAGAAAGGCC 421 CCACGTGATG CATACGCCGT TTACCAGAAT AATAAAGTTT CAGTTATTCC AGCAATTGAT 481 GGGACACGAT ATAGTGAACA AGGACTTTGT AATATTGCTA ATAAGGAATT TGTTAATGGG 541 ACAATTCATT TAACTCCTAA GGTTATTACT CCTTTATCGG CAAACAGTAA AGTAGTTCAA 601 GATGAAAAGA AACACCTGAG TAAACTACAA AATCGATCGG TTGTTTATCA GGTTCAGAAA 661 ACAAAATATA ATTTTAAAGC GTCTAATGTC ATTTCTAAAG CAACTTATCA GCATGGGAAA 721 TACCATTTTG AAACTGACAA CGTTAAATCC AAGATTGCCA ATATAAATAA TAAGCAAGCA 781 ACATTAGGAA AGAGCTTTAA ATTTAGAACT GATTCTGGAA AAGTTATTTC TACATCTAAT 841 CAGGGAACAT ATGGTTGGAA AATAAGTAGC AAGCAGGCAG GACAAACACT CTCTAAAGCG 901 TTAGCTAATA ATGTTAAGAG CGTTAATGCC GAAAATGATA TTTACGGTAA AGGCTATAGT 961 CATCTTGGTA CTGGATATTC GGCTGTGAAT AATCATGGGC TTGGTAATAC TTATGTGGCT 1021 GTATCATTAG CTAAACAGCA TGCTTGGTTT TATAAAAATG GAAAATGTGT ACTGAGTACA 1081 GATATTGTTA GTGGATCAGA TGACGCTAAT AATAGGACTC CTAAAGGTGT TTGGTATATC 1141 ATGTATCAAC AAACGCCATC AGTTTTACGT GGGACTAATG ATGATGGTTC CAAGTATAGT 1201 AGTCCTGTTC AGTATTGGTC TCCGTTTACT TTATCAGGGT GTGGCTTTCA TGATGCTAGT 1261 TGGAGGCATA ATTGGTCTAA AACAGCTTAT AAACAGACTC ATGGTGGCTC ACATGGCTGT 1321 ATTAACATGC ATCCGGAAAA TGCAGGAGAC GGTTTCCATG CCCTTACTAA AGGAGAACCG 1381 GTAATAATTT ATTAG
[00110] SEQ ID NO: 43 Lactobacillus reuteri 3630_02438 1 ATGCAATTAA ACCATAAATT AGGAGTTTTC TTGGCAGCGC CATTTGCTCT ACTGGTTTTA 61 TCAGCTACAA ACGTGCATGC CGATAACATT CAAAGTAATA GTAACCAGAC AATCAGTAAT 121 ATGAGTTTGC AAACTAATGA CACAAAGACT CAACAAAATG TTGTAATGTC AAACGATGCA 181 AAAGCTCAAA TTACTGTAAA TCCTAGTTCT AATGCTAATT CTAGTTCTGT AGCAAAGATA 241 AATGAAAAGA ATAATGTAAA ATCGGATACT GACAATACTA ATGTCGAATC AAATGCTGAT 301 AATATTGGGA ACATTGCTTC TAGCGATTCC ACGGCAGTGG CTAATTCTGC TAGTTCCGAT 361 AATATTCAGT CATTTAACGT AAATACGCAG GAACAGCCTG CAATAAATGT ATCTGAACTA 421 ACAACCGAAG AGTATGTTAC GAATTACACT CAACAACAGA TCAATAATGC GACGACTATT 481 CATGATTACT TTATAAATCA AGGATGGACA CCAAATGCTA TTGCTGGAAT GCTTGGTAAC 541 TTTGTTTCAG AGTCAGGTTT AATCCCAGAC TTACATCAAT ATGGTGGTGG GCCTGGTTAT 601 GGGTTAGCTC AATGGCCATT TAATAGTGTA GTAAATTGGT GTCGTAATAA TGGATATGAT 661 TATCGTACTT TGCAAGGACA ATGTGCATAT ATTGAATATC AAATGACTCA TGGACAGCAG 721 TATTATCCAT CAGCTTACTC TAGAATGACC GCTAATGAAT ATATGCATAG TTATGCTTCA 781 GCATATACTT TAGGTATGAT TTGGCTTAAT AACTTTGAGC GACCTGCAAA TAGGAATCAG 841 CCAGCTCGTG GTCAACAGGC TCAATACTGG TATCAGTATT TCCAAAGTCA TGGTTCTACA 901 TCAGCACCGG TACAACAAAA TCCTAGTACA CCAGCAACAA CTCCTAGCTC AAGTCGAATG 961 AGTCAACACG GGACATTCAA AGTTGCTTAT GGATTAAATG TACGCCAAGC ACCAAGTACA 1021 TCGGCAGCTA TTGTAACGTA TTACAATGGT GGTCAAAGCT TTACATATGA TTCAAAGATT 1081 GAAGCTAACG GGTATCTTTG GGTATCATAC ATGAGTTATA GTGGCGTACG TCGTTATGTT 1141 GCAATTAAGA ATTTGAATAA TGGAACGACT TACGGTTATG ATTCGAATAA CTTCTCATAC 1201 AGTGCTCCTG CATCTTCAAC ACCATCTACT AATGTGCCAA GTACGCCAGC ACCAAGTACA 1261 TCTACTTCAT CAACTGAGAA GCAATATGGA ACATTCAAAG TTGCTTATGG ATTAAATGTA 1321 CGCCAAGCAC CAAGTACATC GGCAGCTATT GTAACGTATT ACAATGGTGG TCAAAGCTTT 1381 ACATATGATT CAAAGATTGA AGCTAATGGG TATCTTTGGG TATCATACAT GAGTTATAGT 1441 GGCGTACGTC GTTATGTTGC GATTAAGAAT TTGAGTAATG GAACAACTTA CGGTTACGAT 1501 TCAAATAACT TTTCATTTAA TGGGACTCCA GTAACATCAA ATAATAATCC TTCTAGTACT 1561 CCGGCAGTTC CGCAAGGTAA TAAGGGCCAA CAAGTTGTTG CTCTTGCACG TCAACAAATA 1621 GGTAAACCTT ATGTTTGGGG AGCAACCGGT CCTAATTCGT TTGATTGTTC AGGACTCGTG 1681 CAGTATGTTT ATCGTCAAGT TGGTGTTAAC TTACCACGGA CTACAACTCA ACAAGAATAT 1741 TGTGGACATG CTGTAAGCTT TAATAATCTT CAACCTGGAG ATCTAATGTT CTGGGGAAAG 1801 TATGGTAGTG CATATCACGT TGGAATCTAT ACCGGAAACG GTAATGTTTT ATTTGCACCG 1861 CAACCTGGTC AAACAGTTAA GGAACAACCA ATGCGCTATT ACATGCCTGC CTTTGCAAGA
28 / 41 1921 AGAGTATTGT AA
[00111] A presente descrição pode ser melhor compreendida com referência aos exemplos, apresentados abaixo. Os exemplos a seguir são apresentados de modo a prover aos versados na técnica uma descrição e descrição completa de como os compostos, composições e/ou métodos reivindicados neste documento são feitos e avaliados e se destinam a ser puramente exemplares e são não pretende limitar a descrição.
[00112] EXEMPLO 1. Identificação da cepa de L. reuteri.
[00113] Sete cepas de Lactobacillus reuteri (L. reuteri) foram isoladas de aves mais velhas no Centro de Pesquisa de Hannover a partir do conteúdo cecal recebido da Poultry Clinic da Universidade de Hannover. Todas as sete cepas são identificadas como L. reuteri por sequenciamento de rRNA 16S.
[00114] Embora apenas um crescimento limitado seja observado para a maioria das cepas sob condições aeróbicas em caldo MRS e ágar (de Man, J.D.; Rogosa, M.; and Sharpe, M.E. “A Medium for the Cultivation of Lactobacilli”. J Appl Bact. 23: 130–135 (1960)), todos os isolados mostram um crescimento muito bom em ágar MRS e caldo MRS em condições anaeróbicas a 39 °C. A cultura das cepas bacterianas em ágar sangue sob condições anaeróbias resulta principalmente em crescimento limitado. Nenhuma das cepas é capaz de crescer em caldo Mueller Hinton em condições anaeróbicas. Para todas as análises posteriores, as cepas bacterianas são cultivadas em meio MRS sob condições anaeróbicas a 39 °C.
[00115] A susceptibilidade antimicrobiana de isolados bacterianos foi testada usando o AVIPRO® PLATE. Todas as cepas são resistentes contra colistina, doxiciclina, enrofloxacina, eritromicina, neomicina, oxacilina, penicilina G, sulfametoxazol-trimetroprima, tetraciclina, tilmicosina e tilosina. Todas as cepas são resistentes à estreptomicina, exceto a cepa 3632, e à tiamulina, exceto a cepa 2098. Além disso, a resistência a cefpodaxima-proxetil
29 / 41 é observada com as cepas 2091, 2095, 2097 e 3630; resistência à cefotaxima é observada com as cepas 2091, 2095 e 2097; e resistência à lincomicina é observada com as cepas 3630 e 3632. Nenhuma cepa foi encontrada para ser resistente contra amoxicilina, ceftiofur, eritromicina D, lincomicina- espectinomicina e rifampicina nas concentrações testadas.
[00116] EXEMPLO 2. Seleção da cepa de L. reuteri e atividade anti- infecciosa.
[00117] Para selecionar a melhor cepa para uso posterior como priobiótico, os isolados de L. reuteri foram testados para várias propriedadesanti- infecciosas probióticas desejáveis, tais como cinética de crescimento, capacidade de produzir peróxido de hidrogênio, autoagregação, perfil enzimático, sobrevivência na presença de boi enzimas biliares e pancreáticas e sensibilidade ao choque térmico e alterações de pH. As cepas de L. reuteri também são testadas quanto à segurança usando um ensaio hemolítico.
[00118] Em geral, todas as cepas se comportam muito semelhantes em termos de propriedades probióticas, incluindo cinética de crescimento e capacidade de produzir peróxido de hidrogênio, exceto para a cepa 3632, que mostra algumas propriedades únicas, incluindo a capacidade de se autoagregar em meio líquido (comparável à da cepa probiótica humana bem caracterizada L. reuteri ATCC 23272). Além da autoagregação, L. reuteri 3632 também parece produzir um pigmento laranja, que se assemelha ao beta-caroteno na cor. Nenhuma das outras cepas, incluindo a cepa humana de L. reuteri ATCC 23272 e L. acidophilus, produziu pigmento de cor laranja. Nenhuma das cepas é hemolítica nas placas de ágar sangue, sugerindo que esses isolados têm menor probabilidade de serem patogênicos para humanos.
[00119] O sequenciamento do genoma completo foi realizado para as cepas de L. reuteri 2091, 3632, 3630 e uma cepa de L. reuteri 170331 isolada
30 / 41 independentemente de origem europeia, usando o sequenciamento PACBIO® (Amplicon Express). As estatísticas de sequenciamento, montagem e anotação estão resumidas na TABELA 1. As estruturas e organizações genômicas diferem entre as cepas testadas. TABELA 1 Cepa 170331 2091 3632 3630 Tamanho do genoma 2,090,596 bp 2,231,245 bp 2,482,713 bp 2,399,045 bp Contigs 9 11 7 5 Sequências de codificação 2,154 2,280 2,595 2,467 (ORFs) Sítios de ligação ribossomal 2,231 2.354 2,680 2,467 Terminadores de transcrição 1,123 1,123 1,375 1,339 Operões 452 472 541 475 tRNA 75 61 77 73 rRNA 18 19 13 18 Outros RNAs 39 99 89 N/A CRISPR 1 0 0 0 Prófagos 7 1 8 5 Ilhas 30 22 24 9 Bacteriocinas 0 1 4 3
[00120] EXEMPLO 2.5. Colonização de L. reuteri 3632 em embriões de 16 dias
[00121] O objetivo deste estudo foi testar se L. reuteri 3632 coloniza o intestino de embriões de 16 dias de idade. Para tanto, embriões de 16 dias de idade foram obtidos de Charles River e inoculados com 10^8 CFU/ embrião de L. reuteri 3632 por via de célula de ar, saco vitelino e alantóide. Os embriões foram sacrificados em 18 dias e os intestinos foram colhidos e semeados em placas de ágar MRS. Um grupo não inoculado foi incluído como controle. L. reuteri foi recuperado do intestino da maioria dos embriões, sugerindo que L. reuteri 3632 coloniza o intestino de embriões de 16 dias. L. reuteri 3632 não foi recuperado de nenhum dos embriões de controle (não inoculados), mesmo após 2 dias de enriquecimento em cultura líquida.
[00122] EXEMPLO 3. Co-cultura de L. reuteri e C. perfringens em caldo de infusão cérebro-coração (BHI).
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[00123] L. reuteri e C. perfringens foram cultivadas em caldo BHI. As contagens de CFU foram determinadas 24 horas após a cocultura em caldo BHI. L. reuteri foram enumeradas em placas de ágar MRS e C. perfringens foi enumerada em placas OPSP. Esses dados são de um experimento representativo de 3 repetições. Co-cultura- L. reuteri, L. reuteri recuperados de amostra co- cultivada usando meios específicos de L. reuteri. Co-cultura-C. perfringens, C. perfringens recuperado de amostra de co-cultura usando meio específico de C. perfringens. Consulte a Figura 9.
[00124] EXEMPLO 4. Efeitos in vivo de L. reuteri.
[00125] Os pássaros foram vacinados com CocciVac no dia 0 e alimentados com L. reuteri na ração do dia 0 ao dia 42 @ 10^7 UFC / kg de ração. Um grupo separado de aves foi alimentado com ração suplementada com dissalicilato de metileno de bacitracina (BMD_55).
[00126] A taxa de conversão alimentar e o índice europeu de frangos de corte foram calculados. As aves que foram alimentadas com L. reuteri demonstraram uma redução na taxa de conversão alimentar e no índice de frangos de carne europeus em comparação com aquelas alimentadas com BMD_55. Consulte a Figura 8.
[00127] EXEMPLO 4. O efeito dos prebióticos no crescimento de Lactobacillus reuteri.
[00128] As cepas 3630 e 3632 de L. reuteri foram cultivadas individualmente e em combinação, na presença de vários prebióticos diferentes, incluindo frutooligossacarídeos (FOS), arabinoxilano oligossacarídeos (AXOS), mananoligossacarídeos (MOS) ou galacto-oligossacarídeos (GOS).
[00129] Como mostrado na Figura 10, as cepas cultivadas na presença de GOS demonstraram um crescimento aumentado em comparação com as cepas cultivadas na presença de FOS, AXOS ou MOS.
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[00130] EXEMPLO 5. Efeitos in vivo de L. reuteri.
[00131] Uma cepa identificada pode funcionar efetivamente como um microbiano de alimentação direta apenas se a cepa for capaz de colonizar o trato gastrointestinal do hospedeiro. A capacidade das cepas de L. reuteri para colonizar galinhas é avaliada seguindo diferentes vias de administração.
[00132] L. reuteri é administrada por via oral a pintos de 10 dias de idade. Em vários momentos após a inoculação, os pintos são sacrificados e a presença de L. reuteri é medida na cultura, intestino delgado e ceco. A cepa 3632 é capaz de colonizar todos os três tecidos e permanecer detectável por pelo menos 18 dias.
[00133] L.reuteri é administrado por inoculação in ovo (ou seja, injeção no ovo) 3 dias antes da eclosão. A cepa 3632 é encontrada nos tecidos de pintos 3 e 7 dias após a eclosão, enquanto a colonização de uma cepa controle cai após o terceiro dia.
[00134] L.reuteri é administrado in ovo pulverizando um líquido contendo bactérias na superfície do ovo. Novamente, as cepas 3630 e 3632 são capazes de colonizar e permanecer presentes em pintos 3 e 7 dias após a eclosão. A inoculação por spray é tão eficiente quanto a injeção in ovo, mas requer menos manipulação do ovo incubado.
[00135] A Tabela 2 mostra quantifica o efeito do tratamento com L. reuteri 3632 na sobrevivência. A pontuação da diferença entre a cepa 3632 e o controle é de 3,3 e a diferença entre a DMO e o controle é de 2,5. A cepa 3632 provê maior sobrevida em relação aos pintos tratados com DMO. TABELA 2 Condições de tratamento Pontuação de diferença Lr_3632 Ctrl 3.333333 BMD_55 Ctrl 2.5
[00136] EXEMPLO 6. Modelo de enterite necrótica.
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[00137] L. Reuteri administrado in ovo e na água potável diariamente @ 10^8 CFU/pássaro. As aves foram administradas por sonda oral com E. maxima no dia 14. As aves foram administradas por sonda oral com C. perfringes nos dias 18, 19 e 20 com 10^8 CFUs/ pássaro. TABELA 3 Sumário de pontuação de lesão intestinal, porcentual de mortalidade total (d15-d28), e porcentual de mortalidade por enterite necrótica. Tratamento Nº de Média da Porcentagem de Porcentagem de gaiolas pontuação da mortalidade total mortalidade NE (SE) lesão (SE) (SE) T1. Sem contestação, 4 0,25a (0,25) 0,0a (3,4) 0,0a (2,5) sem tratamento T2. E. maxima por si só 4 0,50a (0,25) 4,2a (3,4) 0,0a (2,5) a b T3. E. maxima + C. 4 0,50 (0,25) 20,8 (3,4) 20,8b (2,5) perfringens T4. Lactobacillus reuteri 5 0,20a (0,22) 0,0a (3,0) 0,0a (2,3) por si só (in ovo + oral) T5. E. maxima + L. 5 0,20a (0,22) 3,3a (3,4) 0,0a (2,3) reuteri (in ovo + oral)
[00138] T6. 5 0,20a (0,22) 6,7a,b (3,0) 6,7a (2,3) E. maxima + C. perfringens + L. reuteri (in ovo + oral) T7. E. maxima + C. 1 0,0a (0,50) 16,7a,b (6,8) 16,7a,b (5,1) perfringens + L. reuteri (spray + oral) † P-valor 0,881 0.003 < 0,001
[00139] † Pontuações de lesão e porcentagens de mortalidade no nível da gaiola testados por ANOVA de uma via. Dentro das colunas, médias e porcentagens com um sobrescrito em comum não diferem com um nível de significância de 5% em todas as comparações.
[00140] EXEMPLO 7. Análise metabolômica global.
[00141] Uma análise metabolômica global das cepas 3632 e 3630 de L. reuteri foi conduzida. As cepas foram cultivadas individualmente e em combinação, e várias moléculas foram analisadas no sedimento celular e no sobrenadante das culturas. As cepas foram cultivadas em meio de controle AOF- MRS sem glicose, mas com 0,5% de GOS. As moléculas no sobrenadante representam moléculas que são secretadas pela célula.
[00142] As amostras foram submetidas a perfis metabólicos globais não direcionados. O teste t de Welch e a Análise de Componentes Principais (PCA) foram usados para analisar os dados. A análise de componentes principais
34 / 41 (PCA) é um procedimento matemático que reduz a dimensionalidade dos dados enquanto retém a maior parte da variação em um conjunto de dados. Esta abordagem permite a avaliação visual das semelhanças e diferenças entre as amostras. Espera-se que as populações diferentes se agrupem separadamente e vice-versa.
[00143] Os dados são mostrados nas Figuras 12-19.
MODALIDADES DA INVENÇÃO
[00144] 1. Uma composição compreendendo pelo menos um de: uma primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri e uma segunda cepa isolada de lactobacillus reuteri; em que a referida composição aumenta a saúde animal quando uma quantidade eficaz é administrada a um animal, em comparação com um animal ao qual a composição não foi administrada.
[00145] 2. A composição de acordo com a modalidade 1, em que a primeira cepa de lactobacillus reuteri compreende pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 26, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 1, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 3, e um ácido nucleico que codifica para uma sequência de aminoácido com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 8;
35 / 41 em que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 25, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 27, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 28, e uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 29.
[00146] 3. A composição de acordo com a modalidade 1 ou 2, em que a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 26.
[00147] 4. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 3, em que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25.
[00148] 5. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 4, em que a composição compreende uma primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreendendo uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos
36 / 41 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25; uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 1.
[00149] 6. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 5, em que a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 26; e em que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25.
[00150] 7. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 6, em que pelo menos uma da primeira cepa de lactobacillus e uma segunda cepa de lactobacillus secretam pelo menos um dos dipeptídeos cíclicos, ácidos graxos de cadeia curta, betaína, dimetilglicina, aminoácidos essenciais, nucleotídeos, mio-inositol e indolin-2-ona.
[00151] 8. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 7, em que a composição compreende uma razão de primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada para segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada de 0,75-1,5:1.
[00152] 9. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 8, em que a composição compreende quantidades quase iguais da primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada e da segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada.
[00153] 10. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 9, em que a composição é formulada como ração animal, aditivo alimentar,
37 / 41 ingrediente alimentar, aditivo de água, aditivo misturado com água, solução consumível, aditivo consumível em spray, sólido consumível, gel consumível, injeção, ou combinações dos mesmos.
[00154] 11. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 10, em que a composição compreende ração animal.
[00155] 12. A composição de acordo com a modalidade 11, em que a composição compreende a primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri em uma quantidade de cerca de 10^2-10^8 CFU / kg da composição, cerca de 10^4-10^7 CFU / kg da composição, ou cerca de 10^3-10^5 CFU / kg da composição.
[00156] 13. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 10 a 12, em que a composição compreende a segunda cepa isolada de lactobacillus reuteri em uma quantidade de cerca de 10^2-10^8 CFU / kg da composição, cerca de 10^4-10^7 CFU / kg da composição, ou cerca de 10^3- 10^5 CFU / kg da composição.
[00157] 14. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 10 a 13, em que a composição compreende a primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri em uma quantidade de cerca de 10^7 CFU / kg da composição.
[00158] 15. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 10 a 14, em que a composição compreende a segunda cepa isolada de lactobacillus reuteri em uma quantidade de cerca de 10^7 CFU / kg da composição.
[00159] 16. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 15, em que a composição compreende água.
[00160] 17. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 16, em que o animal é um pássaro, uma ave, um humano ou um mamífero não humano.
38 / 41
[00161] 18. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 17, em que o animal é ave e aumentar a saúde das aves compreende pelo menos um de: diminuir a taxa de conversão alimentar, aumentar o peso, aumentar a massa corporal magra, diminuir a formação de lesões associadas ao patógeno no trato gastrointestinal, diminuir a colonização de patógenos e diminuir a taxa de mortalidade.
[00162] 19. A composição de acordo com a modalidade 18, em que aumentar a saúde das aves compreende diminuir a taxa de conversão alimentar em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
[00163] 20. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 17 a 19, em que aumentar a saúde das aves compreende aumentar o peso das aves em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
[00164] 21. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 17 a 20, em que aumentar a saúde das aves compreende diminuir a formação de lesões associadas a patógenos no trato gastrointestinal em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
[00165] 22. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 17 a 21, em que aumentar a saúde das aves compreende diminuir a taxa de mortalidade em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
[00166] 23. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 18 a 22, em que o patógeno compreende pelo menos uma das bactérias Salmonella, Clostridium, Campylobacter, Staphylococcus, Streptococcus e E. coli.
[00167] 24. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 18 a 23, em que o patógeno compreende pelo menos um de Salmonella typhimurium, Salmonella infantis, Salmonella Hadar, Salmonella enteritidis,
39 / 41 Salmonella Newport, Salmonella Kentucky, Clostridium perfringens, Staphylococcus aureus, Streptoccus uberis, Streptococcus suis, Escherichia coli, Campylobacter jejuni e Fusobacterium necrophorum.
[00168] 25. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 24, em que administrado compreende administração in ovo.
[00169] 26. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 25, em que administrado compreende administração em spray.
[00170] 27. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 26, em que a ave é uma galinha.
[00171] 28. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 27, em que a ave é um frango de carne.
[00172] 29. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 27, em que a ave é uma galinha que produz ovos.
[00173] 30. O método de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 29, em que o animal ao qual a composição foi administrada exibe adicionalmente pelo menos uma característica intestinal melhorada, em comparação com um animal ao qual a composição não foi administrada; em que as características intestinais aprimoradas incluem: dipeptídeos cíclicos aumentados, ácidos graxos de cadeia curta aumentados, betaína aumentada, dimetilglicina aumentada, aminoácidos essenciais aumentados, nucleotídeos aumentados e mio-inositol aumentado.
[00174] 31. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 30, em que o animal ao qual a composição foi administrada exibe uma mudança no conteúdo do microbioma do trato gastrointestinal.
[00175] 32. Método de acordo com a modalidade 31, em que a mudança compreende um aumento na quantidade de bactérias Bacteroidaceae.
[00176] 33. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades
40 / 41 1 a 32, em que administrado compreende a administração de uma vacina.
[00177] 34. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 33, em que o animal é uma ave e uma vacina é administrada às aves antes da administração da composição.
[00178] 35. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 34, em que o animal é uma ave e uma vacina é administrada às aves simultaneamente à administração.
[00179] 36. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 35, em que o animal é uma ave e uma vacina é administrada às aves, em que a dita vacina compreende uma vacina que auxilia na prevenção de coccidiose.
[00180] 37. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 36, em que administrado compreende a administração de galacto- oligosacarídeos (GOS).
[00181] 38. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 37 para uso em terapia.
[00182] 39. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 38 para uso na melhoria da saúde animal.
[00183] 40. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 39 em ser para uso na redução da colonização por uma bactéria patogênica em um animal.
[00184] 41. A composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 40 em ser para uso na fabricação de um medicação para reduzir a colonização por uma bactéria patogênica em um animal.
[00185] 42. Um método para melhorar saúde animal, o método compreendendo: administrar a um animal uma quantidade eficaz de uma composição como definida em qualquer uma das modalidades 1 a 41.
41 / 41
[00186] 43. Um método de acordo com a modalidade 42, em que o animal é uma ave.
[00187] 44. Um método de acordo com a modalidade 42 ou 43, em que aumentar a saúde animal inclui diminuir a formação de lesões associadas a patógenos no trato gastrointestinal, diminuir a colonização de patógenos e diminuir a taxa de mortalidade.
[00188] 45. Um método para tratar, melhorar os efeitos ou prevenir a enterite necrótica em aves, por meio da administração de uma composição de acordo com qualquer uma das modalidades 1 a 29 a aves em necessidade da mesma.

Claims (20)

REIVINDICAÇÕES
1. Composição, caracterizada pelo fato de que compreende pelo menos um de: uma primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri e uma segunda cepa isolada de lactobacillus reuteri; em que a referida composição aumenta a saúde animal quando uma quantidade eficaz é administrada a um animal, em comparação com um animal ao qual a composição não foi administrada.
2. Composição de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a primeira cepa de lactobacillus reuteri compreende pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 26, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 1, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 3, e um ácido nucleico que codifica para uma sequência de aminoácido com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 8; em que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende pelo menos um de: uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 25,
uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 27, uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 28, e uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 29.
3. Composição de acordo com a reivindicação 1 ou 2, caracterizada pelo fato de que a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 26.
4. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizada pelo fato de que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25.
5. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 4, caracterizada pelo fato de que a composição compreende uma primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreendendo uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25; uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% de identidade de sequência com SEQ ID NO: 1.
6. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 5, caracterizada pelo fato de que a primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 26; e em que a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada compreende uma sequência de ácido nucleico com pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequência com SEQ ID NO: 25.
7. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizada pelo fato de que pelo menos uma da primeira cepa de lactobacillus e uma segunda cepa de lactobacillus secretam pelo menos um dos dipeptídeos cíclicos, ácidos graxos de cadeia curta, betaína, dimetilglicina, aminoácidos essenciais, nucleotídeos, mio-inositol e indolin-2-ona.
8. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 7, caracterizada pelo fato de que a composição compreende uma razão de primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada para segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada de 0,75-1,5:1.
9. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 8, caracterizada pelo fato de que a composição compreende quantidades quase iguais da primeira cepa de lactobacillus reuteri isolada e da segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada.
10. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizada pelo fato de que a composição é formulada como ração animal, aditivo alimentar, ingrediente alimentar, aditivo de água, aditivo misturado com água, solução consumível, aditivo consumível em spray, sólido consumível, gel consumível, injeção, ou combinações dos mesmos.
11. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações
1 a 10, caracterizada pelo fato de que a composição compreende ração animal.
12. Composição de acordo com a reivindicação 11, caracterizada pelo fato de que a composição compreende a primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri e a segunda cepa isolada de lactobacillus reuteri, cada uma, em uma quantidade de cerca de 10^2-10^8 CFU / kg da composição, cerca de 10^4-10^7 CFU / kg da composição, ou cerca de 10^3-10^5 CFU / kg da composição.
13. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 10 a 12, caracterizada pelo fato de que a composição compreende a primeira cepa isolada de lactobacillus reuteri em uma quantidade de cerca de 10^7 CFU / kg da composição, e em que a composição compreende a segunda cepa de lactobacillus reuteri isolada em uma quantidade de cerca de 10^7 CFU / kg da composição.
14. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 10 a 12 e 14, caracterizada pelo fato de que o animal é um pássaro, uma ave, um humano ou um mamífero não humano.
15. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 14, caracterizada pelo fato de que o animal é ave e aumentar a saúde das aves compreende pelo menos um de: diminuir a taxa de conversão alimentar, aumentar o peso, aumentar a massa corporal magra, diminuir a formação de lesões associadas ao patógeno no trato gastrointestinal, diminuir a colonização de patógenos e diminuir a taxa de mortalidade em pelo menos 1%, pelo menos 5%, pelo menos 25% ou pelo menos 50%.
16. Composição de acordo com a reivindicação 15, caracterizada pelo fato de que o patógeno compreende pelo menos um de Salmonella typhimurium, Salmonella infantis, Salmonella Hadar, Salmonella enteritidis, Salmonella Newport, Salmonella Kentucky, Clostridium perfringens,
Staphylococcus aureus, Streptoccus uberis, Streptococcus suis, Escherichia coli, Campylobacter jejuni e Fusobacterium necrophorum.
17. Composição de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 16, caracterizada pelo fato de que o animal é uma ave e uma vacina é administrada às aves, em que a dita vacina compreende uma vacina que auxilia na prevenção de coccidiose.
18. Método para melhorar saúde animal, o método caracterizado pelo fato de que compreende: administrar a um animal uma quantidade eficaz de uma composição como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 17.
19. Método de acordo com a reivindicação 18, caracterizado pelo fato de que o animal é uma ave.
20. Método de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado pelo fato de que o animal administrado com a composição exibe ainda pelo menos uma característica melhorada do intestino, em comparação com um animal ao qual a composição não foi administrada; em que as características intestinais melhoradas incluem: dipeptídeos cíclicos aumentados, ácidos graxos de cadeia curta aumentados, betaína aumentada, dimetilglicina aumentada, aminoácidos essenciais aumentados, nucleotídeos aumentados e mio- inositol aumentado.
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