AR040371A1 - Composiciones y metodos para determinar la susceptibilidad de un virus patogeno a los inhibidores de proteasa - Google Patents

Abstract

Se proporciona un enfoque para desarrollar un algoritmo para determinar la efectividad de las drogas antivirales basadas en un análisis comprensivo de los pares fenotípicos y de los datos genotípicos guiados por los cortes clínicos fenotípicos. En un aspecto, el algoritmo permite brindar a un paciente un tratamiento efectivo. Esto contribuye a predecir si una persona infectada responderá al tratamiento con un compuesto antiviral, lo cual permite disenar un régimen de tratamiento efectivo sin someter al paciente a efectos secundarios innecesarios. De igual modo, al evitar la administración de drogas ineficaces se ahorra un tiempo y un dinero considerables. Reivindicación 1: Un método para determinar si un HIV tiene una mayor probabilidad de presentar una susceptibilidad reducida al tratamiento con un inhibidor de proteasa, que comprende: la detección en la proteasa del mencionado HIV, la presencia o la ausencia de una mutación asociada con la susceptibilidad reducida al tratamiento con el mencionado inhibidor de proteasa en la posición de aminoácido 11, 32, 33, 34, 43, 46, 47, 48, 50, 54, 58, 71, 76, 79, 82, 83, 84, 91 ó 95 de una secuencia de aminoácidos de la mencionada proteasa, en la cual la presencia de la mencionada mutación indica que el HIV tiene una mayor probabilidad de presentar una susceptibilidad reducida al tratamiento con el inhibidor de proteasa, con la salvedad de que la mencionada mutación no sea V321, M461, M46L, I47V, I50V, I54L, I54M ó I84V. Reivindicación 3: Un método para determinar si un HIV tiene mayor probabilidad de presentar una susceptibilidad reducida al tratamiento con amprenavir, que comprende: la detección, en la proteasa del mencionado HIV, la presencia o la ausencia de una mutación seleccionada a partir del grupo que consiste en V11I, V11L, L33F, E34Q, K43T, G48M, I54A, I54S, I54T, Q58E, A71L, L76V, P79, V82A, V82F, N83D, I84A, I84C, T91A, T91S, T91V y C95F, en el cual la mutación está asociada con la susceptibilidad reducida al tratamiento con el inhibidor de proteasa mencionado y la presencia de la mencionada mutación indica que el HIV tiene una mayor probabilidad de presentar una susceptibilidad reducida al tratamiento con el inhibidor de proteasa. Reivindicación 4: Un oligonucleótido aislado de entre 10 y 40 nucleótidos de longitud que codifican una porción de una proteasa de HIV en un HIV que comprende una mutación en la posición de aminoácidos 11, 32, 33, 34, 43, 46, 47, 48, 50, 54, 58, 71, 76, 79, 82, 83, 84, 91 ó 95 de una secuencia de aminoácidos de la mencionada proteasa, en el mencionado virus de inmunodeficiencia humano, en el cual la mutación está asociada con la susceptibilidad reducida a un inhibidor de proteasa, con la salvedad de que la mencionada mutación no sea V321, M461, M46L, I47V, I50V, I54L, I54M ó I84V. Reivindicación 5: Un oligonucleótido aislado de entre 10 y 40 nucleótidos de longitud que codifican una porción de una proteasa de HIV que comprende una mutación en el codón 11, 32, 33, 34, 43, 46, 47, 48, 50, 54, 58, 71, 76, 79, 82, 83, 84, 91 ó 95, en el cual la mutación está asociada con la susceptibilidad reducida al mencionado inhibidor de proteasa, con la salvedad de que el codón no codifica a V en la posición 32I o L en la posición 46, V en la posición 47, V en la posición 50, L o M en la posición 54 o V en la posición 84. Reivindicación 8: El método de acuerdo con la reivindicación 1, 2, 3, 6 ó 7, en el cual el mencionado virus de inmunodeficiencia humano es el virus de inmunodeficiencia humano de tipo 1 (HIV-1). Reivindicación 11: El método de acuerdo con al reivindicación 1, 2, 3, 6 ó 7, en el cual la mencionada presencia o la ausencia de una mutación en la mencionada proteasa es detectada por hibridación mediante una sonda con un oligonucleótido de una secuencia específica a una secuencia de ácido nucleico del virus de inmunodeficiencia humano que codifica la mencionada mutación, en la cual la ocurrencia de la hibridación indica la mencionada presencia o ausencia de la mencionada mutación.