WO2016079981A1 - 検体の破砕装置およびその方法 - Google Patents

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章登 米田
智久 川端
洋一 遠藤
日部 大輔
幹夫 露木
達之 出縄
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和光純薬工業株式会社
富士フイルムテクノプロダクツ株式会社
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Definitions

  • the present invention relates to a specimen crushing apparatus and method. More specifically, a crushing apparatus and a method for crushing a specimen by subjecting the specimen to physical impact by the beads by storing a solution containing the specimen such as bacterial cells or viruses and beads in the container and circularly moving the stored container. About.
  • nucleic acids such as DNA (Deoxyribonucleic Acid) and RNA (Ribonucleic Acid) are extracted from the inside.
  • the extracted nucleic acid is purified and then amplified by a PCR (Polymerase Chain Reaction) method or the like and analyzed by an electrophoresis method or the like.
  • Patent Document 2 Also known is a technique of rotating the container eccentrically in a state where the central axis and the rotation axis of the container are parallel (Patent Document 2). In addition, there is a method of crushing the specimen by mixing a surfactant with the specimen.
  • Patent Document 3 merely discloses the use of a large number of small-diameter beads and one large-diameter bead for crushing a specimen, and how the diagnostic efficiency can be improved by using these beads. I don't suggest anything to improve it.
  • the present invention is an apparatus and method for crushing a specimen by circularly moving a specimen, a container in which a large number of small-diameter beads and one large-diameter bead specimen are stored.
  • An object of the present invention is to provide a specimen crushing apparatus and a method for crushing it.
  • a sample crushing apparatus includes a drive unit that causes a circular motion to a lower part of a container in which a solution containing a sample, a large number of small-diameter beads and one large-diameter bead are stored, And a control unit that controls the drive unit, and the control unit controls the drive unit to cause the lower part of the container to perform a circular motion that continuously changes between two or more different rotational speeds. .
  • a solution containing a sample, a large number of small-diameter beads, and one large-diameter bead are stored in a container, and continuously at two or more different rotational speeds in the lower part of the container. It is characterized by crushing the specimen with beads by changing circular motion.
  • the “multiple small-diameter beads” means that 10 to 50000 beads having a particle diameter of about 0.1 to 1 mm, preferably 1000 to 10000, more preferably about 5000 to 10,000 are present. means.
  • the above-mentioned “large-diameter beads” mean beads having a particle diameter that is about 10 to 100 times larger than the particle diameter of small-diameter beads, and the particle diameter thereof is 1 to 10 mm, preferably 3 to 8 mm.
  • the minimum number of rotations is in a range of 1000 to 4000 rpm and the maximum number of rotations is in a range of 5000 to 9000 rpm among two or more different rotation numbers.
  • rpm means the number of revolutions per minute (revolution) per) minute).
  • the container includes a rib on the upper inner peripheral surface for jumping up the small-diameter beads from the inner peripheral surface. Further, it is desirable that the container is flat so that the lower inner peripheral surface rolls large-diameter beads on the lower inner peripheral surface during circular motion.
  • the large-diameter beads are rolled on the inner peripheral surface below the container, and the small-diameter beads are moved in the vertical direction in the container according to the change in the rotational speed of the circular motion. It is desirable.
  • the drive unit includes a support member that supports the upper portion of the container in a state where the container cannot rotate about the central axis of the container, and a rotating member that rotates about a predetermined rotation axis. It is desirable to provide connection means for directly or indirectly connecting the lower portion of the container to the rotation member in a state where the central axis intersects the rotation axis. In the specimen crushing method of the present invention, it is desirable that the circular motion be performed in a state where the central axis of the container intersects the rotational axis of the circular motion.
  • the angle at which the central axis and the rotation axis intersect is preferably in the range of 2 to 5 degrees.
  • the support member may be made of a flexible member having a hole through which the upper part of the container is inserted.
  • the flexible member has an annular portion that is harder than the material of the container around the hole.
  • the connecting means includes a concave portion or a convex portion provided in the rotary member at a position away from the rotary shaft, and a concave portion or a convex portion provided directly or indirectly at the lower end of the container. It is desirable to consist of the convex part or recessed part which fits a part.
  • the support member further includes a bottomed cylindrical container housing portion having an opening communicating with the hole of the flexible member, and a convex portion and a container housing are provided at the bottom of the container housing portion. It is desirable that a protrusion that engages with a rib formed on the outer peripheral surface of the container to prevent rotation around the central axis of the container is formed on the inner peripheral surface of the container.
  • a plurality of containers may be simultaneously moved circularly.
  • the remaining containers may be circularly moved at a rotational speed different from that of some of the containers. Good.
  • the specimen crushing apparatus and method of the present invention store a specimen-containing solution, a large number of small-diameter beads and one large-diameter bead in a container, and continuously at two or more different rotational speeds in the lower part of the container.
  • the specimen can be efficiently crushed in a short time by causing the circular motion to change in a short time.
  • the specimen crushing apparatus of the present invention is provided with a rib that jumps up the small-diameter bead from the inner peripheral surface on the inner peripheral surface above the container, so that the small-diameter bead positioned above the container jumps up from the inner peripheral surface, Since the sample is dispersed in the solution, the specimen can be efficiently crushed in a shorter time.
  • the specimen crushing apparatus of the present invention forms the inner peripheral surface below the container flat so that the large-diameter beads roll, so that the rolling large-diameter beads stir the solution and remove the specimen. It can be efficiently crushed in a shorter time.
  • the specimen crushing method of the present invention rolls the large-diameter beads on the inner peripheral surface below the container, and moves the small-diameter beads in the vertical direction in the container according to the change in the number of rotations. Since the large-diameter beads that are dispersed in the solution and are agitated stir the solution, the specimen can be efficiently crushed in a shorter time.
  • the perspective view which shows the whole structure of the sample crushing apparatus which is embodiment of this invention The perspective view of the container with which the specimen crushing apparatus which is embodiment of this invention is mounted
  • worn The perspective view of the drive part of the sample crushing apparatus which is embodiment of this invention
  • Overall view and exploded view of accommodation unit of specimen crushing apparatus of the present invention Structural diagram of the inside of the flexible member of the specimen crushing apparatus of the present invention
  • Block diagram of the control system of the specimen crushing apparatus of the present invention The figure which shows the change of the rotation speed of the container by the sample crushing apparatus of this invention Flowchart of the crushing method by the specimen crushing apparatus of the present invention
  • Aspect of stirring by the specimen crushing apparatus of the present invention Data diagram showing the result of specimen crushing by the specimen crushing apparatus of the present invention (part 1) Data diagram showing sample crushing result by sample crushing apparatus of the present invention (part 2) Data
  • FIG. 1 shows an overall configuration of a specimen crushing apparatus 1 according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 2 is a perspective view of the container 2 mounted as a cartridge on the specimen crushing apparatus 1.
  • FIG. 3 shows a cross-sectional view of the container 2.
  • the container 2 stores a solution S containing the specimen K, a large number of small-diameter beads SB, and a single large-diameter bead BB.
  • the container 2 may store a plurality of large-diameter beads BB.
  • the container 2 may store beads having a particle diameter different from that of either the large-diameter bead BB or the small-diameter bead SB.
  • the container 2 includes a cylindrical main body 21 and a lid main body 31.
  • the cylindrical main body 21 includes a substantially hemispherical bottom portion 211, a columnar lower portion 212 continuous from the bottom portion 211, a substantially inverted frustoconical upper portion 213 continuous from the lower portion 212 and having a circular opening at the upper end. Consists of.
  • the upper part 213 may be cylindrical.
  • the cylindrical main body 21 will be described.
  • the bottom portion 211 is about 15 percent high
  • the lower portion 212 is about 25 percent high
  • the upper portion 213 is about 60 percent relative to the height of the cylindrical main body 21 in the central axis AC direction.
  • the ratio which each part occupies is not specifically limited.
  • the cylindrical main body 21 has a substantially uniform peripheral wall 214.
  • the inner peripheral surface 215 of the peripheral wall 214 is a concave hemispherical surface having a substantially uniform radius of curvature in the vicinity of the bottom portion 211, and a surface in which the cross section orthogonal to the central axis AC has a substantially uniform diameter in the vicinity of the lower portion 212.
  • the upper portion 213 is formed in the shape of a plane that becomes a circle having a diameter that increases as the cross section perpendicular to the central axis AC goes upward.
  • a plurality of lower ribs 216 projecting upward are formed on the inner peripheral surface 215 in the vicinity of the bottom portion 211.
  • the lower rib 216 is for stirring the solution S.
  • the lower ribs 216 are preferably formed at equal angular intervals with respect to the central axis AC, and the cross section of the lower ribs 216 orthogonal to the central axis AC is rectangular.
  • three lower ribs 216 having a height of about 3 mm are formed at an angular interval of 120 degrees.
  • the height dimension and the angular interval of the lower rib 216 can be appropriately adjusted according to the type of the specimen K and the amount of storage, and are not particularly limited. It is preferable that the small-diameter bead SB or the large-diameter bead BB that is rolling in the container 2 during the circular motion collide and make its trajectory irregular.
  • the inner peripheral surface 215 is formed in a planar shape having no grooves or protrusions. Further, a plurality of upper ribs 217 protruding in the direction of the central axis AC are formed on the inner peripheral surface 215 in the vicinity of the upper portion 213. The upper rib 217 also agitates the solution S. The upper ribs 217 are formed at equal angular intervals with respect to the central axis AC.
  • the three upper ribs 217 are formed with an angular interval of 120 degrees from each other.
  • the upper rib 217 extends upward from the vicinity of the boundary with the lower portion 212.
  • the cross section of the upper rib 217 perpendicular to the central axis AC is rectangular.
  • the top surface of the upper rib 217 is substantially flush with the inner peripheral surface 215. And as the upper rib 217 extends upward, the top surface thereof is continuously increased.
  • the number of the upper ribs, the height dimension, the angular interval, and the cross-sectional shape can be appropriately changed according to the type, viscosity, storage amount, and the like of the solution, and are not particularly limited, but the solution S is agitated. Further, it is preferable that the small-diameter beads SB rolling in the container 2 collide during the circular movement of the container 2 to make the trajectory irregular.
  • a screw thread 221 that is screwed to the lid body is formed on the outer peripheral surface 220, and an annular flange 222 is formed below the screw thread 221.
  • the lid body 31 is screwed with the cylindrical body 21 until the lower end of the lid body 31 is close to the flange 222.
  • a plurality of outer ribs 223 projecting outward are formed on the outer peripheral surface 220 below the flange 222.
  • the outer rib 223 is used to engage the container 2 with the specimen crushing device 1.
  • the outer rib 223 extends downward from the vicinity of the flange 222 to the lower end of the bottom portion 211.
  • the outer ribs 223 are formed at equal angular intervals with respect to the central axis AC.
  • the six outer ribs 223 are formed with an angular interval of 60 degrees from each other.
  • the cross section orthogonal to the central axis AC of the outer rib 223 is rectangular.
  • the lower end of the outer rib 223 has a flat surface shape so that the container 2 maintains an upright posture when the container 2 is placed on a flat surface. Thereby, the workability
  • the top surface of the outer rib 223 is substantially flush with the outer peripheral surface 220. And as the outer rib 223 extends downward, its top surface is continuously higher. Thereby, the distance between the central axis AC and the top surface of the outer rib 223 is substantially constant.
  • the number, height dimension, angular interval, and cross-sectional shape of the outer ribs 223 can be appropriately changed depending on the engagement structure of the specimen crushing apparatus 1, and are not particularly limited.
  • the lid body 31 is composed of a substantially cylindrical lower lid portion 311 and a substantially rectangular parallelepiped upper lid portion 312.
  • the lower lid portion 311 is formed with a substantially circular recess 313 from the lower end.
  • a thread groove 314 that is screwed with the thread 221 of the cylindrical main body 21 is formed on the side peripheral surface of the recess 313.
  • the recess 313 is formed with a circular opening 315 that communicates with the upper lid 312.
  • the upper lid portion 312 is formed with a substantially square recess 316 from the upper end.
  • a circular opening 317 that communicates with the opening 315 is formed in the recess 316.
  • the opening 317 is sealed with a metal film 318.
  • the metal film 318 has a thickness that can be perforated by an extraction needle or the like after the crushing process.
  • the material of the metal film is aluminum or stainless steel, but is not particularly limited.
  • the metal film may be a resin film.
  • the material of the resin film is polypropylene, polyethylene or the like, but is not particularly limited.
  • the specimen crushing apparatus 1 will be described.
  • a container 2 is attached to the specimen crushing apparatus 1 as a cartridge.
  • the specimen crushing apparatus 1 is an apparatus that crushes the specimen in the solution S.
  • the specimen crushing apparatus 1 includes a support frame 11 that supports the upper portions of the plurality of containers 2, a plurality of drive units 40 that respectively circularly move the lower portions of the plurality of containers 2, and a fixed frame that fixes the plurality of drive units 40, respectively. 13 and a connecting frame 14 for connecting the support frame 11 and the fixed frame 13 to each other.
  • the support frame 11 supports the four containers 2 arranged in the X-axis direction in FIG. 1 at a predetermined interval. And the container 2 is mounted
  • the fixed frame 13 fixes the four drive units 40 such that the four drive units 40 are positioned below the container 2.
  • FIG. 4 is a perspective view of the drive unit 40.
  • the drive unit 40 includes an accommodation unit 50 that accommodates the container 2, and an eccentric rotation unit 60 that is connected to the accommodation unit 50 and causes the accommodation unit 50 to rotate eccentrically.
  • the accommodating unit 50 includes an accommodating rotating member 51 that accommodates and rotates the container 2 with the lid main body 31 exposed, and a metal ring 52 that holds the accommodating rotating member 51 between the supporting frame 11.
  • the housing rotation member 51 is connected to the eccentric rotation unit 60 at the lower end thereof.
  • the metal ring 52 has a screw mounting hole (not shown).
  • the eccentric rotating unit 60 includes a rotating plate 61 connected to the housing rotating member 51, a rotating shaft 62 that transmits a rotating motion to the rotating plate 61, a tip end portion of the rotating shaft 62 being rotatably held, and an eccentric rotating unit 60.
  • An upper bracket 63 for fixing the motor to the fixed frame 13 a motor 64 for rotating the rotary shaft 62, a lower bracket 65 for rotatably holding the base end portion of the rotary shaft 62 and fixing the motor 64, and an upper bracket 63,
  • a post 66 for connecting the lower bracket 65 is provided.
  • the eccentric rotation unit 60 includes a drive pulley (not shown) attached to the drive shaft of the motor 64, a driven pulley (not shown) attached to the base end portion of the rotation shaft 62, and a belt 67 wound around these pulleys.
  • the rotational motion of the motor 64 is transmitted to the rotary shaft 62.
  • a circular hole 611 is formed in the rotating plate 61.
  • the hole 611 is used for connection with the housing rotation member 51.
  • the hole 611 opens at a position offset by a predetermined distance from the rotation axis AR.
  • the center of the rotating plate 61 is on the axis of the rotation axis AR.
  • FIG. 5 is a diagram illustrating the overall configuration and the disassembled state of the housing rotating member 51.
  • the housing rotation member 51 includes a flexible container support portion 54 and a connecting tube 55.
  • the container support 54 is covered with a connecting tube 55.
  • the container support 54 and the connection tube 55 are fixed to each other.
  • the container support portion 54 is integrally molded of polyurethane, and the connection tube 55 is integrally molded of polypropylene.
  • the material of the container support 54 is not particularly limited as long as it has flexibility. Further, the material of the connecting tube 55 is not particularly limited.
  • the container support part 54 is a bottomless cylindrical shape having a circular opening 541 at the upper end and a circular opening 542 at the lower end, and a flange 543 is formed at the upper end.
  • the flange 543 is formed with four attachment holes 543A corresponding to the attachment holes of the metal ring 52.
  • the housing unit 50 and the eccentric rotation unit 60 are connected so that the center 541A of the opening 541 is positioned on the rotation axis AR.
  • the connecting tube 55 has a bottomed cylindrical shape having an opening 551 at the upper end and a bottom 554 at the lower end.
  • the container support part 54 is inserted through the opening 551.
  • a protrusion 552 that protrudes downward is formed on the bottom 554.
  • the protrusion 552 is inserted into the hole 611 of the rotating plate 61 and is used to connect the connecting tube 55 and the rotating plate 61.
  • the protrusion 552 may be directly inserted into the hole 611, but may be indirectly inserted through the resin tube 553, for example.
  • a hole that does not drop the container 2 may be formed in the bottom 554, and a protrusion protruding upward may be formed on the rotating plate 61 and connected.
  • FIG. 6 is a view showing the inner structure of the container support portion 54.
  • a plurality of engaging ribs 545 are formed on the inner peripheral surface 544 of the container support portion 54 so as to protrude toward the central axis direction of the container support portion 54.
  • the engagement rib 545 engages the container 2 with the container support portion 54 by inserting the outer rib 223 of the cylindrical main body 21 into the groove between the engagement ribs 545. Thereby, it can prevent that the container 2 rotates with respect to the container support part 54.
  • twelve engagement ribs 545 having a height of about 3 mm are formed with an angular interval of 30 degrees from each other. Note that the number, height, and angular interval of the engaging ribs 545 can be appropriately changed depending on the structure of the outer rib 223.
  • a reinforcing ring 546 is fitted on the inner peripheral surface 544.
  • the reinforcing ring 546 prevents the contact portion from being worn by the direct contact between the container 2 and the container support portion 54 during operation.
  • the material of the reinforcing ring 546 is not particularly limited as long as it is harder than the container support portion 54, but a metal material such as aluminum or stainless steel is desirable.
  • the container 2 is inserted from the opening 541 while being engaged with the outer rib 223 and the engaging rib 545, and is received in contact with the bottom 554. Further, the container 2 is prevented from rotating with respect to the accommodation unit 50 due to the engagement between the outer rib 223 and the engagement rib 545. Further, the container 2 is accommodated in a state where the center 541A is substantially on the central axis AC of the container 2.
  • the container support portion 54 is connected to the hole 611 in which the center 541A is positioned substantially on the rotation axis AR and the protrusion 552 is offset from the rotation axis AR. Therefore, the accommodated container 2 moves circularly with the central axis AC and the rotation axis AR intersecting. During the circular motion, the minute circular motion at the top of the container 2 is absorbed by the flexibility of the container support 54.
  • the distance from the center 541A to the bottom 554 occupies about 70% of the length of the container 2 in the direction of the central axis AC. Further, the angle ⁇ formed by the central axis AC of the container 2 and the rotation axis AR of the rotating plate 61 is preferably in the range of 2 to 5 degrees.
  • FIG. 7 shows a block diagram of a control system of the specimen crushing apparatus 1.
  • the four driving units 40 are independently controlled by one control unit 70.
  • the control part 70 controls the drive part 40 so that the four drive parts 40 may circularly move the lower part of the container 2 simultaneously.
  • control unit 70 controls the driving unit 40 so that the rotation speed of the lower portion of the container 2 repeats between a low rotation speed and a high rotation speed.
  • control unit 70 controls the motor 64 by a PWM (Pulse Width Modulation) method so that the rotation number of the rotating plate 61 continuously changes between a low rotation number and a high rotation number. In this case, it is preferable to control so that there is no time for no rotation between the low rotation speed and the high rotation speed.
  • the motor 64 is a DC motor, but the type is not particularly limited.
  • the low rotational speed is preferably in the range of 1000 rpm to 5000 rpm, more preferably in the range of 1000 rpm to 4000 rpm.
  • the high rotational speed is preferably in the range of 6000 rpm to 10,000 rpm, more preferably in the range of 6000 rpm to 9000 rpm, still more preferably in the range of 7000 rpm to 9000 rpm, and particularly preferably in the range of 7000 rpm to 8000 rpm.
  • the high rotational speed and the low rotational speed are within the above-mentioned range, and the rotational speed difference is preferably 1000 rpm to 9000 rpm, more preferably 2000 rpm to 8000 rpm, still more preferably 3000 rpm to 7000 rpm, and particularly preferably 4000 rpm to 7000 rpm.
  • control unit 70 may be controlled to repeat between three or more rotation speeds such as a medium rotation speed in addition to the low rotation speed and the high rotation speed.
  • FIG. 8 is a diagram showing changes in the rotational speed with respect to the time axis.
  • the control unit 70 controls the drive unit 40 so that the rotational speed changes between the low rotational speed and the high rotational speed by a predetermined number of repetitions at a substantially constant period T.
  • Control controls the drive unit 40 so that the waveform indicating the change in the rotational speed is a substantially rectangular wave.
  • the waveform indicating the change in the number of rotations is not particularly limited. For example, a sine wave or a triangular wave may be used, and the waveform at a low rotational speed may be different from the waveform at a high rotational speed.
  • the waveform does not have to be a strict rectangle, and may be a waveform close to a rectangle including a delay with respect to a control command from the control unit 70 due to the influence of mechanical backlash or the like of the drive unit 40.
  • the low rotation speed is set to 3000 rpm and the high rotation speed is set to 8000 rpm, but the low speed rotation speed is in the range of 1000 rpm to 5000 rpm and / or the high speed rotation.
  • the number may be set to a different value in the range of 6000 rpm to 10,000 rpm. And you may set so that it may differ for every period, and you may set so that at least 1 period may differ.
  • the period T and the number of repetitions are appropriately adjusted according to the type of specimen, the amount of solution stored, etc., and the number of repetitions is preferably 4 to 30 times within the period T of 3 to 10 seconds. Is preferably in the range of 10 to 20 times.
  • the control unit 70 divides the four drive units 40 into two groups, and while the drive unit 40 belonging to one group is circularly moving the lower part of the container at a high rotational speed, the drive unit belonging to the other group You may control so that 40 carries out circular motion at low rotation speed.
  • the control unit 70 causes the two drive units 40 to circularly move the two containers 2 along the waveform shown by the solid line in FIG. 8
  • the other two drive units 40 have the two containers 2.
  • the resonance by all the drive parts 40 rotating by the same rotation speed can be reduced.
  • the cylindrical body 21 stores the solution S, one large-diameter bead BB, and many small-diameter beads SB (ST1).
  • the lid body 31 and the cylindrical body 21 are screwed to mount the container 2 (ST2).
  • the specimen K is not particularly limited as long as it may contain bacterial cells and viruses. Specifically, animal (especially human) body fluids (blood, serum, plasma, spinal fluid, tears, sweat, urine, pus, runny nose, sputum, etc.), excrement (feces, etc.), organs, tissues, mucous membranes, Skin, a swollen specimen (swab) considered to contain them, a gargle, a culture solution, or the like can be used.
  • Examples of the cells and viruses include tuberculosis, pneumococci, diphtheria, meningococcus, gonorrhea, staphylococci, streptococci, enterobacteria, Escherichia coli, Helicobacter pylori, bacteria, rubella virus, herpes virus, etc. And viruses such as hepatitis virus, ATL virus, AIDS virus, influenza virus, adenovirus, enterovirus, poliovirus, EB virus, HAV, HBV, HCV, HIV, HTLV, and fungi such as Candida and Cryptococcus.
  • tuberculosis pneumococci, diphtheria, meningococcus, gonorrhea, staphylococci, streptococci, enterobacteria, Escherichia coli, Helicobacter pylori, bacteria, rubella virus, herpes virus, etc.
  • viruses such as hepatitis virus, ATL virus,
  • the specimen K may be used as it is, but in the present embodiment, it is used as the solution S diluted with an appropriate diluent.
  • a dilution liquid may have bactericidal property as needed, and may contain a digestive enzyme and a modifier
  • Examples of the diluting solution include water and buffer solutions that are usually used in this field.
  • Examples of the buffer solution include trishydroxylaminomethane buffer solution, phosphate buffer solution, borate buffer solution, and Good's buffer solution.
  • the concentration of the buffer is usually 5 mM to 500 mM, preferably 20 mM to 200 mM.
  • the material of the large-diameter bead BB and the small-diameter bead SB is not particularly limited as long as it has a hardness that gives a physical impact to the specimen, but a bead made of glass, garnet and / or zirconia is desirable, Zirconia beads are more desirable.
  • the shape of the small-diameter bead SB is not particularly limited as long as it is easily dispersed in the solution S.
  • the shape of the large-diameter bead BB is easy to roll on the inner peripheral surface 215 of the container 2. If there is no particular limitation, the shape of both beads is preferably spherical.
  • the particle diameter of the small-diameter bead SB is desirably about 0.1 mm to 1 mm.
  • the particle diameter of the large-diameter bead BB is desirably about several tens of times the diameter of the small-diameter bead SB, specifically 1 to 10 mm, preferably about 3 to 8 mm.
  • FIG. 10 is a diagram for explaining the action of the large-diameter bead BB during the circular motion.
  • the small-diameter beads SB are not shown for easy understanding.
  • a centrifugal force F indicated by an arrow in the figure acts on the large-diameter bead BB during circular motion. Then, due to the action of the centrifugal force F, the large-diameter bead BB moves to a lower position farthest from the rotation axis AR.
  • a contact point TP indicates a point where the large-diameter bead BB contacts the inner peripheral surface 215, and a center KP indicates the center of the large-diameter bead BB.
  • the projected point PP indicates a point obtained by projecting the center KP onto the rotation axis AR.
  • a line segment connecting the center KP and the projection point PP is the rotation radius R of the large-diameter bead BB.
  • the rotation radius R is preferably about 8 to 12 mm.
  • the centrifugal force F is, for example, under the conditions of a radius of rotation R of 8 mm, a density of large diameter beads BB made of zirconia of 5.68 g / cm 3 , a particle size of 5 mm, a low rotational speed of 3000 rpm, and a high rotational speed of 8000 rpm.
  • the centrifugal speed is low, it is about 0.29 N, and when the rotational speed is high, it is about 2.09 N.
  • the inner peripheral surface 215 in the vicinity of the contact point TP is a flat surface having no ribs or grooves as described above. Accordingly, the large-diameter bead BB rolls on the inner peripheral surface 215 while drawing a locus having a substantially constant rotation radius R during eccentric rotation.
  • the position of the contact point TP can be adjusted as appropriate depending on the shape of the inner peripheral surface 215.
  • the solution S is agitated by the lower rib 216 during the eccentric rotation and also agitated by the rolling large-diameter beads BB.
  • the solution S that has reached the upper rib 217 is also stirred by the upper rib 217.
  • FIG. 11 shows how the solution S is stirred during low-speed rotation.
  • the left figure shows the agitation mode during low-speed rotation
  • the right figure shows the agitation mode during high-speed rotation.
  • vortexes are generated on the liquid surface due to stirring by the large-diameter beads BB, the lower ribs 216 and the upper ribs 217.
  • the small-diameter beads SB dispersed in the solution S begin to move downward again.
  • a collision between the small-diameter bead SB and the large-diameter bead BB that starts to move downward occurs, and the physical impact applied to the specimen K increases.
  • the collision frequency between the small-diameter bead SB and the large-diameter bead BB increases, and the specimen K is physically and efficiently. An impact can be applied.
  • a solution containing the specimen, a large number of small-diameter beads SB and one large-diameter bead BB are placed in the container 2 according to the present invention, and two containers 2 are provided. This is done by making a circular motion while continuously changing between the different rotational speeds.
  • a solution containing a sample of 100 to 1000 uL, 5000 to 10,000 small-diameter beads SB of 0.1 to 1 mm, and 1 large-diameter bead BB of 1 to 10 mm are placed in a container, and low rotation speed of 1000 to 5000 rpm 3 This is done by repeating 10 to 20 circular motions with a combination of ⁇ 10 seconds and high rotation of 6000 to 10000 rpm for 3 to 10 seconds as one cycle.
  • the solution S containing the specimen K, a large number of small-diameter beads SB, and one large-diameter bead BB are stored in the container 2, and the lower part of the container 2 is rotated differently.
  • the collision frequency of a large number of small-diameter beads SB and large-diameter beads BB can be increased, and the specimen K can be efficiently crushed in a short time.
  • the upper rib 217 jumps up the small-diameter beads SB from the inner peripheral surface 215, disperses the small-diameter beads SB in the solution S, and increases the collision frequency with the rolling large-diameter beads BB. Can do.
  • the large-diameter bead BB can roll with a constant radius at the rotation radius R and collide with the small-diameter bead SB.
  • the frequency can be increased.
  • the collision frequency with the large-diameter bead BB is increased because the small-diameter bead SB is moved up and down in the container 2 by changing the rotational speed between the low-speed rotation and the high-speed rotation. Can do.
  • the four driving units 40 simultaneously circularly move the lower portions of the four containers 2, a large amount of the specimen K can be efficiently crushed at a time. Further, among the four drive units 40, while the two drive units 40 rotate the lower part of the container 2 at a low speed, the other two drive units 40 rotate the lower part of the container 2 at a high speed. It is also possible to reduce the vibration generated in
  • Bacillus genus bacteria such as “Bacillus subtillis” that forms “SPORE” were used as the specimen K.
  • Bacillus.spore (5 ⁇ 103 ctu) is added to 600 ⁇ L of the solution S (including the bactericidal solution).
  • one zirconia bead having a particle diameter of 5 mm was stored as the large-diameter bead BB, and 0.4 g (about 8000) of zirconia beads having a particle diameter of 0.2 mm was stored as the small-diameter bead SB.
  • Bacillus.spore (5 ⁇ 103 ctu) was crushed with the sample crushing apparatus 1 and purified, and then the nucleic acid was recovered. Next, the number of spore was measured at 400 times under a microscope using a bacterial calculation board (manufactured by SLGC). The number of cells was calculated by diluting the number of cells per square to 5.8, 1.0, 0.4, and 0.1.
  • the calibration curve was obtained by serially diluting the B. subtilis spore genome with distilled water (0 to 1 ⁇ 10 6 / reaction).
  • FIG. 12 and FIG. 13 are data diagrams showing qPCR quantitative values (%) with respect to the number of added spores.
  • FIG. 12 shows data when the low-speed rotation speed is set to 3000 rpm and the high-speed rotation speed setting is changed from 6000 rpm to 10,000 rpm every 1000 rpm.
  • FIG. 13 shows data obtained by setting the high-speed rotation speed to 8000 rpm and changing the low-speed rotation speed setting from 1000 rpm to 5000 rpm every 1000 rpm.
  • FIG. 12 also shows comparison data in which the low-speed rotation setting is 0 rpm and the high-speed rotation setting is 3000 rpm.
  • FIG. 13 also shows comparison data in which the low-speed rotation setting is 0 rpm and the high-speed rotation setting is 8000 rpm.
  • the rotation times of the high-speed rotation and the low-speed rotation are each 2.5 seconds, and each cycle is 5 seconds, 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 Second) and 24 times (120 seconds) are shown.
  • the comparison data shown in FIG. 12 is 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), 24 times, with a low speed rotation of 3000 rpm for 2.5 seconds and a rotation stop of 2.5 seconds as one cycle. (120 seconds), and qPCR quantitative value (%) is 13% at maximum with an operation time of 120 seconds.
  • the qPCR quantitative value is higher in all of 30 seconds, 60 seconds, 90 seconds and 120 seconds compared with the same number of seconds in the case of the above-described low speed rotation of 3000 rpm and 0 rpm. (%).
  • the qPCR quantitative value (%) becomes 41% or more by repeating the low speed rotation of 3000 rpm and the high speed rotation of 6000 rpm, and the qPCR quantitative value (%) by repeating the low speed rotation of 3000 rpm and the high speed rotation of 7000 rpm.
  • qPCR quantitative value (%) is 64% or more by repeating low speed rotation of 3000 rpm and high speed rotation of 8000 rpm, and qPCR quantitative value (%) is repeating by repeating low speed rotation of 3000 rpm and high speed rotation of 9000 rpm.
  • the qPCR quantitative value (%) is 35% or more by repeating the low-speed rotation of 3000 rpm and the high-speed rotation of 10000 rpm, both of which are from the maximum qPCR quantitative value (13%) of the low-speed rotation of 3000 rpm and the repetition of 0 rpm.
  • High qPCR quantitative value (%) is short In has been realized.
  • the comparison data of FIG. 13 is 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), 24 times, with a high speed rotation of 8000 rpm for 2.5 seconds and a rotation stop of 2.5 seconds as one cycle. (120 seconds) is repeated, and the qPCR quantitative value (%) is 54% at the maximum with an operation time of 120 seconds.
  • the qPCR quantitative value is high compared to the same number of seconds in the case of the high speed rotation of 8000 rpm and the repetition of 0 rpm in all of 30 seconds, 60 seconds, 90 seconds and 120 seconds. (%).
  • the qPCR quantitative value (%) is 56% or more by repeating the low-speed rotation of 1000 rpm and the high-speed rotation of 8000 rpm in the operation time of 60 seconds or more, and the low-speed rotation of 2000 rpm and 8000 rpm in the operation time of 30 seconds or more.
  • QPCR quantitative value (%) becomes 67% or more by repetition of high-speed rotation
  • qPCR quantitative value (%) becomes 64% or more by repeating low-speed rotation of 3000 rpm and high-speed rotation of 8000 rpm in an operation time of 30 seconds or more.
  • the qPCR quantitative value (%) is 62% or more by repeating the low-speed rotation of 4000 rpm and the high-speed rotation of 8000 rpm, and in each case, the maximum qPCR quantitative value (54 in the case of the high-speed rotation of 8000 rpm and the repetition of 0 rpm) Higher qPCR quantification value (%) It is.
  • the qPCR quantitative value (%) is 62% or more in the operation time of 90 seconds or more even when the low-speed rotation of 5000 rpm and the high-speed rotation of 8000 rpm are repeated, and the maximum qPCR quantitative value in the case of the high-speed rotation of 8000 rpm and the repetition of 0 rpm.
  • a higher qPCR quantitative value (%) is realized in a shorter time than (54%).
  • FIG. 14 shows data when the low-speed rotation is 1000 rpm and the high-speed rotation speed setting is changed from 6000 rpm to 10000 rpm every 1000 rpm.
  • FIG. 14 also shows comparison data in which the low speed rotation setting is 1000 rpm and the high speed rotation setting is 5000 rpm.
  • the rotation time of the high speed rotation and the low speed rotation is 2.5 seconds respectively, and the period of 5 seconds is 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), 24 times (120 seconds). Shows repeated data.
  • the comparison data in FIG. 14 are 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), 24 times, with a high speed rotation of 5000 rpm for 2.5 seconds and a rotation stop of 2.5 seconds as one cycle.
  • the qPCR quantitative value (%) is 52% at maximum with an operation time of 120 seconds. According to the results of FIG. 14, the qPCR quantification is higher in 30 seconds, 60 seconds, 90 seconds and 120 seconds than in the same number of seconds in the case of repetition of the low speed rotation of 1000 rpm and the high speed rotation of 5000 rpm. Value (%) is shown.
  • the qPCR quantitative value (%) becomes 57% or more by repeating the low-speed rotation of 1000 rpm and the high-speed rotation of 6000 rpm in the operation time of 30 seconds or more, and the low-speed rotation of 1000 rpm and 7000 rpm in the operation time of 60 seconds or more.
  • QPCR quantitative value (%) becomes 87% or more by repetition with high-speed rotation
  • qPCR quantitative value (%) becomes 56% or more by repetition of low-speed rotation of 1000 rpm and high-speed rotation of 8000 rpm in an operation time of 60 seconds or more.
  • the qPCR quantitative value (%) becomes 55% or more by repeating the low-speed rotation of 1000 rpm and the high-speed rotation of 9000 rpm, and in the operation time of 60 seconds or more, the low-speed rotation of 1000 rpm and the high speed of 10000 rpm QPCR quantitative value (%) is 59 by repetition with rotation Above and will, than the maximum qPCR quantification value (52%) by repeated with both low-speed rotation and high speed rotation of 5000rpm of 1000 rpm, a high qPCR quantification value (%) is realized in a short time.
  • FIG. 15 shows data when the low-speed rotation is set to 5000 rpm and the setting of the high-speed rotation speed is changed from 6000 rpm to 10,000 rpm every 1000 rpm.
  • FIG. 15 also shows comparison data in which the low-speed rotation setting is 4000 rpm and the high-speed rotation setting is 5000 rpm.
  • the high-speed rotation and the low-speed rotation are each 2.5 seconds, and the 5-second cycle is repeated 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), and 24 times (120 seconds). Data is shown.
  • the comparison data shown in FIG. 15 are 6 times (30 seconds), 12 times (60 seconds), 18 times (90 seconds), 24 times, with a low speed rotation of 4000 rpm for 2.5 seconds and a rotation stop of 2.5 seconds as one cycle.
  • the qPCR quantitative value (%) is 59% at the maximum with an operation time of 120 seconds. According to the result of FIG. 15, compared with the case where the above-described low-speed rotation of 4000 rpm and high-speed rotation of 5000 rpm are repeated in 120 seconds, the low-speed rotation of 5000 rpm and the high-speed rotation of 6000 rpm in the operation time of 90 seconds or more.
  • the qPCR quantitative value (%) is 66% or more by repetition, and the qPCR quantitative value (%) is 74% or more by repeating the low speed rotation of 5000 rpm and the high speed rotation of 7000 rpm for 90 seconds or more in the operation time of 120 seconds or more.
  • the qPCR quantitative value (%) is 62% or more by repeating the low-speed rotation of 5000 rpm and the high-speed rotation of 8000 rpm in the operation time, and the repetition of the low-speed rotation of 5000 rpm and the high-speed rotation of 9000 rpm in the operation time of 120 seconds or more.
  • QPCR quantitative value (%) is 79% or more, and 12
  • the qPCR quantitative value (%) is 68% or more by repeating the low-speed rotation of 5000 rpm and the high-speed rotation of 10000 rpm in the operation time of 2 seconds or more, and in each case, the maximum qPCR quantitative value (59% by repeating the low-speed rotation of 4000 rpm and 5000 rpm) )
  • a higher qPCR quantitative value (%) is realized in a shorter time than above.

Abstract

【課題】検体、多数の小径ビーズおよび1つの大径ビーズ検体を貯留した容器を円運動させて検体を破砕する装置およびその方法において、短時間且つ効率的に検体を破砕する。 【解決手段】検体を含む溶液(S)、多数の小径ビーズ(SB)および1個の大径ビーズ(BB)を容器(2)に貯留させる。駆動部(40)が貯留させた容器(2)の下部を円運動させる。制御部(70)が、容器(2)の下部が2つ以上の互いに異なる回転数間で連続的に変化する円運動をするように、駆動部(40)を制御する。

Description

検体の破砕装置およびその方法
 本発明は、検体の破砕装置およびその方法に関する。より詳しくは、菌体またはウィルス等の検体を含む溶液およびビーズを容器に貯留させ、貯留させた容器を円運動させることにより、検体にビーズによる物理的衝撃を与えて破砕する破砕装置およびその方法に関する。
 近年、生命科学の発展に伴い遺伝子診断が注目を集めている。遺伝子診断においては、菌体またはウィルス等の検体を破砕し、その内部よりDNA(Deoxyribonucleic Acid)やRNA(Ribonucleic Acid)等の核酸を抽出する。そして、抽出された核酸は、精製された後にPCR(Polymerase Chain Reaction)法等で増幅され、電気泳動法等で分析される。
 このように、遺伝子診断においては、前処理として核酸を破壊しない程度に検体を破砕する必要がある。そして、この検体の破砕処理に関しては、様々な手法が知られている。検体を含む溶液と蛋白質分解酵素を容器に貯留し、貯留した容器の下部を偏心回転させることにより、溶液および蛋白質分解酵素を撹拌して破砕する技術が知られている(特許文献1)。
 また、容器の中心軸と回転軸とが平行な状態で容器を偏心回転させる技術も知られている(特許文献2)。その他にも、検体に界面活性剤を混合して検体を破砕する方法もある。
 しかしながら、上記のような化学的処理による破砕では、細胞の硬質な細胞壁を十分に破砕できない虞がある。そこで、検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを容器に貯留させて撹拌することにより、ビーズによる物理的衝撃を検体に与えて破砕する技術が提案されている(特許文献3)。
特開2002-255号公報 特許第5542379号 特開2006-141292号公報
 しかしながら、遺伝子診断においては、動物(主にヒト)や植物から採取した多数の検体を短時間に破砕し、診断効率を高めることも要求されている。特許文献3に提案される技術は、検体を破砕するために多数の小径ビーズと1個の大径ビーズを用いることを開示しているに過ぎず、これらのビーズを用いて如何に診断効率を向上させるかまでは何ら提言するものではない。
 本発明は、上記事情に鑑み、検体、多数の小径ビーズおよび1つの大径ビーズ検体を貯留した容器を円運動させて検体を破砕する装置および方法であって、短時間且つ効率的に検体を破砕できる検体破砕装置およびその方法を提供することを目的とする。
 上記課題を達成するため、本発明の検体の破砕装置は、検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを貯留させた容器の下部に円運動をさせる駆動部と、この駆動部を制御する制御部とを備え、制御部が、容器の下部に2つ以上の互いに異なる回転数間で連続的に変化する円運動をさせるように、駆動部を制御することを特徴とする。
 本発明の検体の破砕方法は、検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを容器に貯留させ、この容器の下部に2つ以上の互いに異なる回転数の間で連続的に変化する円運動をさせて、ビーズにより検体を破砕することを特徴とする。
 ここで、上記「多数の小径ビーズ」とは、0.1~1mm程度の粒子径を有するビーズが10~50000個、好ましくは1000~10000個、より好ましくは5000~10000個程度存在することを意味する。上記「大径ビーズ」とは、小径ビーズの粒子径よりも10~100倍程度大きい粒子径を有するビーズを意味し、その粒径は1~10mm、好ましくは3~8mmである。
 また、本発明の検体破砕装置およびその方法において、2つ以上の互いに異なる回転数のうち、最低回転数が1000~4000rpmの範囲、最高回転数が5000~9000rpmの範囲であることが望ましい。上記「rpm」とは、1分間あたりの回転数(revolution per minute)を意味する。
 また、本発明の検体破砕装置において、容器は、上方の内周面に、小径ビーズを内周面より跳ね上げるリブを備えることが望ましい。また、容器は、その下方の内周面が円運動中に大径ビーズを下方の内周面上で転動させるように、平坦であることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕方法は、大径ビーズを容器の下方の内周面上で転動させ、小径ビーズを、円運動の回転数の変化に応じて、容器内で上下方向に移動させることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置において、駆動部は、容器の上部を、容器が容器の中心軸まわりに回転不能な状態で、支持する支持部材と、所定の回転軸まわりに回転する回転部材と、中心軸が回転軸に対して交差した状態で、容器の下部を回転部材に直接または間接的に連結する連結手段とを備えることが望ましい。また、本発明の検体破砕方法において、容器の中心軸が円運動の回転軸と交差した状態で円運動をさせることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置およびその方法において、中心軸と回転軸との交差する角度は2~5度の範囲であることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置において、支持部材は、容器の上部を挿通させる孔を有する可撓性部材からなるものであってもよい。
 また、本発明の検体破砕装置において、可撓性部材が、孔の周囲に容器の材質よりも硬質な環状部を備えていることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置において、連結手段は、回転部材に、回転軸から離れた位置に設けられた凹部または凸部と、容器の下端に直接または間接的に設けられた、凹部または凸部と嵌合する凸部または凹部とからなることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置において、支持部材が、可撓性部材の孔と連通する開口を有する有底筒状の容器収容部をさらに備え、容器収容部の底部に凸部と、容器収容器の内周面上に、容器の外周面上に形成されたリブと係合して容器の中心軸まわりの回転を防止する突起とが形成されていることが望ましい。
 また、本発明の検体破砕装置および方法において、複数の容器を同時に円運動させてもよい。また、本発明の検体破砕装置および方法においては、複数の容器のうち、一部の容器を円運動させている間、残りの容器を一部の容器とは異なる回転数で円運動させてもよい。
 本発明の検体破砕装置およびその方法は、検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを容器に貯留させ、この容器の下部に2つ以上の互いに異なる回転数間で連続的に変化する円運動をさせることにより、短時間に効率的に検体を破砕できる。
 また、本発明の検体破砕装置は、容器の上方の内周面に、小径ビーズを内周面より跳ね上げるリブを備えることにより、容器の上方に位置する小径ビーズを内周面より跳ね上げ、溶液内に分散させるため、より短時間で効率的に検体を破砕できる。
 また、本発明の検体破砕装置は、容器の下方の内周面を、大径ビーズが転動するように、平坦に形成することにより、転動する大径ビーズが溶液を撹拌して検体をより短時間で効率的に破砕できる。
 また、本発明の検体破砕方法は、大径ビーズを容器下方の内周面で転動させ、小径ビーズを、回転数の変化に応じて、容器内で上下方向に移動させることにより、小径ビーズが溶液内に分散され、且つ転動する大径ビーズが溶液を撹拌するため、検体をより短時間で効率的に破砕できる。
本発明の実施形態である検体破砕装置の全体構成を示す斜視図 本発明の実施形態である検体破砕装置に装着される容器の斜視図 本発明の実施形態である検体破砕装置に装着される容器の断面図 本発明の実施形態である検体破砕装置の駆動部の斜視図 本発明の検体破砕装置の収容ユニットの全体図および分解図 本発明の検体破砕装置の可撓性部材の内側の構造図 本発明の検体破砕装置の制御系のブロック図 本発明の検体破砕装置による容器の回転数の変化を示す図 本発明の検体破砕装置による破砕方法のフローチャート 本発明の検体破砕装置における大径ビーズの作用を示す図 本発明の検体破砕装置による撹拌の態様図 本発明の検体破砕装置による検体の破砕結果を示すデータ図(その1) 本発明の検体破砕装置による検体の破砕結果を示すデータ図(その2) 本発明の検体破砕装置による検体の破砕結果を示すデータ図(その3) 本発明の検体破砕装置による検体の破砕結果を示すデータ図(その4)
 本発明の一実施形態について図面を用いて詳細に説明する。図1は本発明の一実施形態である検体破砕装置1の全体構成を示す。図2は検体破砕装置1にカートリッジとして装着される容器2の斜視図を示す。図3は容器2の断面図を示す。
 最初に容器2について説明する。容器2には、検体Kを含む溶液S、多数の小径ビーズSBおよび1個の大径ビーズBBを貯留させる。容器2には、複数個の大径ビーズBBを貯留させてもよい。さらに、容器2には、大径ビーズBBおよび小径ビーズSBのいずれのビーズとも粒径が異なるビーズを貯留させてもよい。
 容器2は、筒状本体21と蓋本体31とから構成される。筒状本体21は、略半球状の底部211と、底部211から連続する円柱状の下方部212と、下方部212から連続し上端に円形の開口を有する略逆円錐台状の上方部213とからなる。なお、上方部213は、円柱状であってもよい。
 筒状本体21について説明する。筒状本体21において、筒状本体21の中心軸AC方向の高さに対して、底部211が15パーセント程度の高さ、下方部212が25パーセント程度の高さ、上方部213が60パーセント程度の高さをそれぞれ占めている。なお、筒状本体21において、各部の占める割合は特に限定されるものではない。
 そして、筒状本体21は略均一な周壁214を有している。周壁214の内周面215は、底部211の近傍が略均一な曲率半径を有する凹半球面状、下方部212の近傍が中心軸ACと直交する断面が略均一な直径を有する円になる面状、上方部213の近傍が、中心軸ACと直交する断面が上方に向かう程に拡大する直径を有する円になる面状で形成されている。
 底部211の近傍において、内周面215には上方に突出する下リブ216が複数形成されている。下リブ216は溶液Sを撹拌するものである。下リブ216は中心軸ACに対して等しい角度間隔を空けて形成されているのが好ましく、下リブ216の中心軸ACと直交する断面は矩形状である。本実施形態において、3mm程度の高さを有する3つの下リブ216が、互いに120度の角度間隔を空けて形成されている。なお、下リブ216の高さ寸法および角度間隔は、検体Kの種類や貯留量に応じて適宜調整可能であり、特に限定されるものではないが、溶液Sを撹拌するもの、さらに容器2の円運動時に容器2内を転動中の小径ビーズSBまたは大径ビーズBBが衝突し、その軌道を不規則にさせるものが好ましい。
 下方部212の近傍において、内周面215は溝や突起等を有さない面状で形成されている。また、上方部213の近傍において、内周面215には、中心軸AC方向に突出する上リブ217が複数形成されている。上リブ217も溶液Sを撹拌するものである。上リブ217は、中心軸ACに対して等しい角度間隔を空けて形成されている。
 本実施形態において、3つの上リブ217が互いに120度の角度間隔を空けて形成されている。また、上リブ217は、下方部212との境界近傍より上方に延びている。また、上リブ217の中心軸ACと直交する断面は矩形状である。また、下方部212との境界近傍において、上リブ217の頂面は内周面215と略面一である。そして、上リブ217は、上方に延びる程、その頂面が連続的に高くなっている。なお、上リブの数、高さ寸法、角度間隔および断面形状も、溶液の種類や粘度や貯留量等に応じて適宜変更可能であり、特に限定されるものではないが、溶液Sを撹拌するもの、さらに容器2の円運動時に容器2内を転動中の小径ビーズSBが衝突し、その軌道を不規則にさせるものが好ましい。
 上方部213において、外周面220には、蓋本体と螺号するネジ山221が形成され、ネジ山221の下方には、環状のフランジ222が形成されている。蓋本体31は、蓋本体31の下端がフランジ222と近接する位置まで筒状本体21と螺号する。
 フランジ222より下方において、外周面220には外方に突出する外リブ223が複数形成されている。外リブ223は容器2を検体破砕装置1に係合させるために利用される。外リブ223は、フランジ222の近傍より底部211の下端まで下方に延びている。また、外リブ223は中心軸ACに対して互いに等しい角度間隔を空けて形成されている。
 本実施形態において、6つの外リブ223が互いに60度の角度間隔を空けて形成されている。外リブ223の中心軸ACと直交する断面は矩形状である。また、外リブ223の下端は、容器2を平坦面に載置したとき、容器2が起立姿勢を維持するように、平坦な面状になっている。これにより、ユーザによる作業性が向上する。
 外リブ223の上端において、外リブ223の頂面は外周面220と略面一である。そして、外リブ223は、下方に延びる程、その頂面が連続的に高くなっている。これにより、中心軸ACと外リブ223との頂面との距離は略一定になっている。なお、外リブ223の数、高さ寸法、角度間隔および断面形状は、検体破砕装置1の係合構造によって適宜変更可能であり、特に限定されるものではない。
 蓋本体31は、略円筒状の下蓋部311と略直方体状の上蓋部312とからなる。下蓋部311には、下端より略円形の凹部313が形成されている。そして、凹部313の側周面には、筒状本体21のネジ山221と螺号するネジ溝314が形成されている。また、凹部313には上蓋部312と連通する円形の開口315が形成されている。
 上蓋部312には、上端より略正方形の凹部316が形成されている。そして、凹部316には、開口315と連通する円形の開口317が形成されている。開口317は金属膜318で封止されている。金属膜318は、破砕処理後に抽出針等で穿孔できる程度の厚さを有している。なお、金属膜の材質は、アルミやステンレス等であるが、特に限定されるものではない。また、上記金属膜は、樹脂膜であってもよい。該樹脂膜の材質は、ポリプロピレン、ポリエチレン等であるが、特に限定されるものではない。
 これにより、破砕処理の溶液Sを回収するために、筒状本体21と蓋本体31との螺号を解除する必要がなくなり、作業性が向上する。さらに、螺号解除によるコンタミネーションの発生を低減することもできる。
 検体破砕装置1について説明する。検体破砕装置1には、カートリッジとして容器2が着される。そして、検体破砕装置1は溶液S内の検体を破砕する装置である。検体破砕装置1は、複数の容器2の上部をそれぞれ支持する支持フレーム11と、複数の容器2の下部をそれぞれ円運動させる複数の駆動部40と、複数の駆動部40をそれぞれ固定する固定フレーム13と、支持フレーム11と固定フレーム13を連結する連結フレーム14とを備えている。
 支持フレーム11は、図1中のX軸方向に配列された4つの容器2を、所定間隔を空けて支持している。そして、容器2は、図1中のZ軸方向に略起立した姿勢で装着される。なお、装着される容器2の数、配列方向、間隔は特に限定されるものではない。固定フレーム13は、4つの駆動部40が容器2の下方に位置するように、4つの駆動部40をそれぞれ固定する。
 図4は駆動部40の斜視図である。駆動部40は、容器2を収容する収容ユニット50と、収容ユニット50と連結して収容ユニット50を偏心回転運動させる偏心回転ユニット60とを備えている。
 収容ユニット50は、蓋本体31を露出させた状態で容器2を収容して回転させる収容回転部材51と、支持フレーム11との間で収容回転部材51を挟持する金属リング52とからなる。収容回転部材51は、その下端において、偏心回転ユニット60と連結している。また、金属リング52には不図示のネジの取り付け孔が形成されている。
 偏心回転ユニット60は、収容回転部材51と連結する回転板61と、回転板61に回転運動を伝達する回転シャフト62と、回転シャフト62の先端部を回転自在に保持して且つ偏心回転ユニット60を固定フレーム13に固定する上ブラケット63と、回転シャフト62を回転させるモータ64と、回転シャフト62の基端部を回転自在に保持し且つモータ64を固定する下ブラケット65と、上ブラケット63と下ブラケット65とを連結するポスト66を備えている。
 偏心回転ユニット60は、モータ64の駆動シャフトに取り付けられた不図示の駆動プーリと、回転シャフト62の基端部に取り付けられた不図示の従動プーリ、これらのプーリ間に巻き掛けられたベルト67を備えることにより、モータ64の回転運動を回転シャフト62に伝達している。
 そして、回転板61には円形の孔611が形成されている。孔611は、収容回転部材51との連結に利用される。孔611は、回転軸ARから所定の距離だけオフセットした位置に開口している。なお、回転板61の中心は回転軸ARの軸上にある。
 収容回転部材51について説明する。図5は収容回転部材51の全体構成および分解状態を示す図である。収容回転部材51は、可撓性を有する容器支持部54と連結チューブ55とからなる。そして、容器支持部54は連結チューブ55に被覆されている。容器支持部54および連結チューブ55は互いに固定されている。容器支持部54はポリウレタン、連結チューブ55はポリプロピレンを一体成型したものである。容器支持部54の材質は可撓性を有するものであれば、特に限定されるものではない。また、連結チューブ55の材質も特に限定されるものではない。
 容器支持部54は、上端に円形の開口541、下端に円形の開口542を有する無底の円筒形状であり、上端にはフランジ543が形成されている。そして、フランジ543には、金属リング52の取付孔に対応する4つの取付孔543Aが形成されている。収容ユニット50と偏心回転ユニット60とは、開口541の中心541Aが回転軸AR上に位置するように、連結されている。
 連結チューブ55は上端に開口551および下端に底554を有する有底の円筒形状である。容器支持部54は開口551より挿通される。底554には下方に突出する突起552が形成されている。突起552は、回転板61の孔611に嵌挿され、連結チューブ55と回転板61とを連結するために利用される。突起552を孔611に直接嵌挿させてもよいが、例えば樹脂製チューブ553を介して間接的に嵌挿させてもよい。なお、底554に容器2が落下しない程度の孔を形成し、回転板61に上方に突出する突起を形成して連結してもよい。
 図6は容器支持部54の内側構造を示す図である。容器支持部54の内周面544には、容器支持部54の中心軸方向に向かって突出する係合リブ545が複数形成されている。係合リブ545は、係合リブ545の間の溝に筒状本体21の外リブ223を挿通させることにより、容器2を容器支持部54に係合する。これにより、容器2が容器支持部54に対して回転することを防止できる。
 本実施形態において、3mm程度の高さを有する12個の係合リブ545が、互いに30度の角度間隔を空けて形成されている。なお、係合リブ545の数、高さおよび角度間隔は、外リブ223の構造次第で適宜変更可能なものである。
 容器支持部54の上端近傍において、内周面544には、補強リング546が嵌め込まれている。補強リング546は、運転中に容器2と容器支持部54が直接接触することより、接触部分が摩耗することを防止するものである。補強リング546の材質は、容器支持部54よりも硬質であれば特に限定されるものではないが、アルミやステンレス等の金属材料が望ましい。
 容器2は、開口541より外リブ223と係合リブ545と係合させながら挿入され、底554に当接して収容される。また、容器2は、外リブ223と係合リブ545との係合により、収容ユニット50に対する回転が防止される。また、容器2は、中心541Aが容器2の略中心軸AC上にある状態で収容される。
 このように、容器支持部54は、中心541Aが略回転軸AR上に位置し、且つ突起552が回転軸ARよりオフセットした孔611と連結されている。したがって、収容された容器2は中心軸ACと回転軸ARとが交差した状態で円運動する。円運動中において、容器2の上部の微小な円運動は容器支持部54の可撓性によって吸収される。
 本実施形態において、中心541Aより底554までの距離は、容器2の中心軸AC方向の長さに対して70パーセント程度を占める。また、容器2の中心軸ACと回転板61の回転軸ARとのなす角度θは2~5度の範囲が望ましい。
 次に検体破砕装置1の制御系について説明する。図7は、検体破砕装置1の制御系のブロック図を示す。検体破砕装置1において、4つの駆動部40が1つの制御部70により独立して制御されている。そして、制御部70は、4つの駆動部40が容器2の下部を同時に円運動させるように、駆動部40を制御する。
 また、制御部70は、容器2の下部の回転数が低回転数と高回転数との間を繰り返すように、駆動部40を制御する。具体的に、制御部70は、回転板61の回転数が低回転数と高回転数との間を連続的に変化するように、モータ64をPWM(Pulse Width Modulation)方式で制御する。この場合、低回転数と高回転数との間に無回転となる時間がないように制御するのが好ましい。本実施形態において、モータ64は、直流モータであるが、その種類は特に限定されるものではない。
 低回転数は、1000rpm~5000rpmの範囲が望ましく、1000rpm~4000rpmの範囲がより望ましい。また、高回転数は、6000rpm~10000rpmの範囲が望ましく、6000rpm~9000rpmの範囲がより望ましく、7000rpm~9000rpmの範囲が更に望ましく、7000rpm~8000rpmの範囲が特に望ましい。また、高回転数と低回転数は、上記範囲であって且つ回転数差が、1000rpm~9000rpmが望ましく、2000rpm~8000rpmがより望ましく、3000rpm~7000rpmが更に望ましく、4000rpm~7000rpmが特に望ましい。
 また、制御部70は、低回転数および高回転数以外に、例えば中回転数等の3種類以上の回転数間を繰り返すように制御するものであってもよい。
 図8は時間軸に対する回転数の変化を示す図である。制御部70は、図8の実線で示すように、回転数が、低回転数と高回転数との間を略一定の周期Tで所定の繰返数だけ変化するように、駆動部40を制御する。本実施形態では、制御部70は、回転数の変化を示す波形が略矩形波となるように、駆動部40を制御するものである。回転数の変化を示す波形は特に限定されるものではない。例えば正弦波や三角波等であってもよく、低回転数での波形と高回転数での波形が異なるものでもよい。なお、厳密な矩形である必要はなく、駆動部40の機械的なバックラッシュ等の影響による制御部70からの制御命令に対する遅れを含む、矩形に近い波形であってもよい。また、図8においては、一例として、いずれの周期Tにおいても低回転数を3000rpmに高回転数を8000rpmに設定しているが、低速回転数を1000rpm~5000rpmの範囲で、および/または高速回転数を6000rpm~10000rpmの範囲で異なる値に設定してもよい。そして、周期毎に異なるように設定してもよく、少なくとも1つの周期が異なるように設定してもよい。
 また、周期Tや繰返数は、検体の種類や溶液の貯留量等によって適宜調整されるものであるが、周期Tが3~10秒の範囲で、繰返数が4~30回、好ましくは10~20回の範囲であることが望ましい。また、制御部70は、4つの駆動部40を2つのグループに分け、一方のグループに属する駆動部40が容器の下部を高回転数で円運動させている間、他方のグループに属する駆動部40が低回転数で円運動させるように制御してもよい。
 本実施形態では、制御部70が、2つの駆動部40が2つの容器2を図8の実線で示す波形に沿って円運動させている間、他の2つの駆動部40が2つの容器2を、実線の波形とは半周期T/2だけ位相の異なる破線の波形に沿って円運動させるように制御する。これにより、全ての駆動部40が同じ回転数で回転することによる共振を低減できる。
 次に検体破砕装置1による検体の破砕方法について、図9のフローチャートを用いて説明する。最初に、筒状本体21に、溶液Sと、1つの大径ビーズBBと、多数の小径ビーズSBを貯留させる(ST1)。蓋本体31と筒状本体21とを螺号して容器2を装着する(ST2)。
 ユーザによる指示もしくは容器2の装着を確認するセンサからの信号を受け付け(ST3)、容器2を低回転数で半周期T/2だけ偏心回転させる(ST4)。次に、高回転数で半周期T/2だけ偏心回転させる(ST5)。なお、(ST4)を高回転数での偏心回転、(ST5)を低回転数での偏心回転としてもよい。
 周期Tの繰返数が、ユーザより受け付けた、もしくは予め設定されている所定回数に達したか否かを終了したかを確認し(ST6)、終了していない場合は再び(ST4)へ戻り、終了している場合は検体破砕装置1の運転を終了する(ST7)。容器2を検体破砕装置1より取り外し(ST8)、溶液Sを抽出して終了する。
 次に検体Kについて説明する。検体Kは、菌体やウィルスを含む可能性のあるものであれば、特に限定されるものではない。具体的に、動物(特にヒト)の体液(血液、血清、血漿、髄液、涙液、汗、尿、膿、鼻水、または喀痰等)、排泄物(糞便等)、臓器、組織、粘膜、皮膚、それらを含むと考えられる搾過検体(スワブ)、うがい液、培養液等を用いることができる。
 上記菌体やウィルスとしては、例えば結核菌、肺炎球菌、ジフテリア菌、髄膜炎菌、淋菌、ブドウ球菌、レンサ球菌、腸内細菌、大腸菌、ヘリコバクター・ピロリ等の細菌、ルベラウィルス、ヘルペスウィルス、肝炎ウィルス、ATLウィルス、AIDSウィルス、インフルエンザウィルス、アデノウィルス、エンテロウィルス、ポリオウィルス、EBウィルス、HAV、HBV、HCV、HIV、HTLV等のウィルス、例えばカンジダ,クリプトコッカス等の真菌等が挙げられる。
 検体Kは、そのままの状態で用いてもよいが、本実施形態においては、適当な希釈液で希釈した溶液Sとして用いる。なお、希釈液は、必要に応じて殺菌性を有してもよく、消化酵素や変性剤を含有させてもよい。
 上記希釈液としては、通常この分野で用いられる水、緩衝液等が挙げられ、該緩衝液としては、トリスヒドロキシルアミノメタン緩衝液、りん酸緩衝液、ほう酸緩衝液、Good's緩衝液等が挙げられ、該緩衝剤の濃度は、通常5mM~500mMであり、好ましくは20mM~200mMである。
 次に各ビーズについて説明する。大径ビーズBBおよび小径ビーズSBは、検体に物理的衝撃を与える硬度を有するものであれば、その材質は特に限定されるものではないが、ガラス、ガーネットおよび/またはジルコニアからなるビーズが望ましく、ジルコニアビーズがより望ましい。
 小径ビーズSBの形状も、溶液S内に分散しやすいものであれば、特に限定されるものではなく、大径ビーズBBの形状は、容器2の内周面215上を転動しやすいものであれば、特に限定されるものではないが、両ビーズともその形状は球状であることが望ましい。
 小径ビーズSBの粒子径は0.1mm~1mm程度であることが望ましい。大径ビーズBBの粒子径は、小径ビーズSBの直径寸法の数十倍程度であることが望ましく、具体的には、1~10mm、好ましくは3mm~8mm程度であることが望ましい。
 次に、大径ビーズBB、小径ビーズSB、下リブ216および上リブ217の作用について説明する。図10は、円運動中の大径ビーズBBの作用を説明する図である。なお、図10においては、理解を容易にするため、小径ビーズSBの図示を省略している。
 図10に示すように、円運動中の大径ビーズBBには、図中矢印で示す遠心力Fが作用する。そして、遠心力Fの作用により、大径ビーズBBは、回転軸ARから最も離れた下方位置へ移動する。
 図10において、接触点TPは、大径ビーズBBと内周面215との接触する点、中心KPは大径ビーズBBの中心を示している。また、投影点PPは中心KPを回転軸ARに投影した点を示す。中心KPと投影点PPとを結ぶ線分が大径ビーズBBの回転半径Rとなる。
 回転半径Rは8~12mm程度であることが望ましい。また、遠心力Fは、例えば回転半径Rが8mm、ジルコニアからなる大径ビーズBBの密度が5.68g/cm、粒子径が5mm、低回転数が3000rpm、高回転数が8000rpmの条件において、遠心低回転数時に0.29N程度、高回転数時には2.09N程度となる。
 接触点TP近傍の内周面215は、前述の通り、リブや溝等を有さない平坦面である。したがって、大径ビーズBBは、偏心回転中、略一定の回転半径Rとなる軌跡を描いて内周面215上を転動する。なお、接触点TPの位置は、内周面215の形状によって適宜調整可能である。
 溶液Sは、偏心回転中、下リブ216によって撹拌されるとともに、転動する大径ビーズBBによっても撹拌される。また、上リブ217に到達した溶液Sは上リブ217によっても撹拌される。
 図11は、低速回転時の溶液Sの撹拌態様を示す。図11において、左図が低速回転時の撹拌態様、右図が高速回転時の撹拌態様を示す。溶液Sには、大径ビーズBB、下リブ216および上リブ217による撹拌により、液面に渦が発生する。
 低速回転時には、遠心力Fの作用により多数の小径ビーズSBが、容器2の下方位置に集まり、転動する大径ビーズBBと小径ビーズSBとの衝突、並びにこれらビーズと内周面215との衝突により、検体Kには物理的衝撃が付与される。
 そして、低速回転より高速回転に変化すると、溶液Sの渦が大きくなり、液面も内周面215に沿って上方する。そして、軽い小径ビーズSBも溶液Sとともに上方へ移動し始める。上方へ移動し始めた小径ビーズSBと大径ビーズBBとの衝突が発生し、検体Kに付与される物理的衝撃が増加する。小径ビーズSBがさらに上方へ移動すると、上リブ217により小径ビーズSBは内周面215より跳ね上げられ、溶液S内へ分散される。
 再び、高速回転より低速回転に変化すると、溶液S内に分散された小径ビーズSBが再び下方へ移動し始める。下方へ移動し始めた小径ビーズSBと大径ビーズBBとの衝突が発生し、検体Kに付与される物理的衝撃が増加する。このように、低速回転と高速回転とを繰り返し、小径ビーズSBを容器2内で上下移動させることにより、小径ビーズSBと大径ビーズBBとの衝突頻度が増加し、検体Kに効率よく物理的衝撃を付与することができる。
 本発明の破砕装置を用いた検体の破砕方法は、本発明に係る容器2内に、検体を含む溶液、多数の小径ビーズSBおよび1個の大径ビーズBBを入れ、該容器2を2つ以上の互いに異なる回転数間で連続的に変化させて円運動させることによりなされる。具体的には例えば100~1000uLの検体を含む溶液、0.1~1mmの小径ビーズSBを5000~10000個、1~10mmの大径ビーズBB1個を容器に入れ、1000~5000rpmの低回転3~10秒と6000~10000rpmの高回転3~10秒の組み合わせを1周期として10~20回の円運動を繰り返すことによりなされる。
 以上に説明した通り、本実施形態によれば、検体Kを含む溶液S、多数の小径ビーズSBおよび1個の大径ビーズBBを容器2に貯留させ、その容器2の下部を、互いに異なる回転数間で連続的に変化する円運動をさせることにより、多数の小径ビーズSBと大径ビーズBBとの衝突頻度を増加させて検体Kを短時間で効率よく破砕できる。
 また、本実施形態によれば、上リブ217が小径ビーズSBを内周面215より跳ね上げ、小径ビーズSBを溶液Sへ分散し、転動する大径ビーズBBとの衝突頻度を増加させることができる。
 また、本実施形態によれば、容器2の下方の内周面215が平坦であるため、大径ビーズBBが、回転半径Rで一定の軌跡を描いて転動でき、小径ビーズSBとの衝突頻度を増加させることができる。
 また、本実施形態によれば、低速回転と高速回転との間で回転数を変化させることより、小径ビーズSBを容器2において上下移動させるため、大径ビーズBBとの衝突頻度を増加させることができる。
 また、本実施形態によれば、4つの駆動部40が4つの容器2の下部を同時に円運動させるため、1度に多量の検体Kを効率よく破砕できる。また、4つの駆動部40のうち、2つの駆動部40が容器2の下部を低速回転させている間、他の2つの駆動部40が容器2の下部を高速回転させるため、検体破砕装置1に発生する振動を低減させることもできる。
 以下に示す実施例では、検体Kとして「胞子(SPORE)」を形成する「枯草菌(Bacillus subtillis)」等の「バチルス(Bacillus)属細菌」を用いた。溶液S(殺菌液含む)600uL中にはBacillus.spore(5×103ctu)が添加されている。また、容器2には、大径ビーズBBとして粒径5mmのジルコニアビーズを1個、小径ビーズSBとして粒径0.2mmのジルコニアビーズを0.4g(8000個程度)を貯留させた。
 破砕評価は、検体破砕装置1でBacillus.spore(5×103ctu)を破砕し、精製した後に核酸を回収した。次に、バクテリア計算盤(SLGC社製)を用いて顕微鏡下400倍でspore数を計測した。計算盤1マスあたりの細胞数を5.8,1.0,0.4,0.1となるように希釈してspore数を算出した。
 検量線は蒸留水を用いてB.subtilis spore ゲノムを段階希釈(0~1×106/reaction)した。qPCRの反応試薬組成は、Syber Premix ExTaqII(10μL)、100nM of Bs-spo-F4-1/R4-1(amplicon=235-bp)、温度サイクルは、95℃(30sec)の初期状態より開始し、95℃(6sec)、62℃(20sec)、72℃(20sec)を1サイクルとして45回繰り返した。
 図12および図13は添加したspore数に対するqPCR定量値(%)の値を示すデータ図である。図12は低速回転数を3000rpmに設定し、高速回転数の設定を6000rpmより1000rpm毎に10000rpmまで変化させた場合のデータである。また、図13は高速回転数を8000rpmに設定し、低速回転数の設定を1000rpmより1000rpm毎に5000rpmまで変化させたデータである。
 また、図12には低速回転の設定を0rpm、高速回転の設定を3000rpmとした比較データ、図13には低速回転の設定を0rpm、高速回転の設定を8000rpmとした比較データも示している。また、図12および図13において、高速回転および低速回転の回転時間はそれぞれ2.5秒であり、1周期を5秒として6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)を繰り返したデータを示している。
 図12の比較データは3000rpmの低速回転を2.5秒、回転停止2.5秒を1周期として、6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)でそれぞれ繰り返させたものであり、120秒の動作時間によりqPCR定量値(%)が最大で13%である。
 これに対し、本発明の実施例では、30秒、60秒、90秒および120秒の全てにおいて、上記3000rpmの低速回転と0rpmの繰り返しの場合の同秒数と比較して、高いqPCR定量値(%)を示している。また、30秒以上の動作時間において、3000rpmの低速回転と6000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が41%以上となり、3000rpmの低速回転と7000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が32%以上となり、3000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が64%以上となり、3000rpmの低速回転と9000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が50%以上となり、3000rpmの低速回転と10000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が35%以上となり、いずれも3000rpmの低速回転と0rpmの繰り返しの最大qPCR定量値(13%)より、高いqPCR定量値(%)が短時間で実現されている。
 図13の比較データは8000rpmの高速回転を2.5秒、回転停止2.5秒を1周期として、6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)をそれぞれ繰り返させたものであり、120秒の動作時間によりqPCR定量値(%)が最大で54%である。
 これに対し、本発明の実施例では、30秒、60秒、90秒および120秒の全てにおいて、上記8000rpmの高速回転と0rpmの繰り返しの場合の同秒数と比較して、高いqPCR定量値(%)を示している。また、60秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が56%以上となり、30秒以上の動作時間において、2000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が67%以上となり、30秒以上の動作時間において、3000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が64%以上となり、30秒以上の動作時間において、4000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転の繰り返しでqPCR定量値(%)が62%以上となり、いずれも8000rpmの高速回転と0rpmの繰り返しの場合の最大qPCR定量値(54%)より、高いqPCR定量値(%)が短時間で実現されている。
 また、5000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転の繰り返しでも、90秒以上の動作時間において、qPCR定量値(%)が62%以上となり、8000rpmの高速回転と0rpmの繰り返しの場合の最大qPCR定量値(54%)より、高いqPCR定量値(%)が短時間で実現されている。
 図14は、低速回転を1000rpmとし、高速回転数の設定を6000rpmより1000rpm毎に10000rpmまで変化させた場合のデータである。また、図14には、低速回転の設定を1000rpm、高速回転の設定を5000rpmとした比較データも示している。高速回転および低速回転の回転時間はそれぞれ2.5秒であり、5秒間の周期を6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)を繰り返したデータを示している。
 図14の比較データは5000rpmの高速回転を2.5秒、回転停止2.5秒を1周期として、6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)で繰り返させたものであり、120秒の動作時間によりqPCR定量値(%)が最大で52%である。図14の結果によれば、30秒、60秒、90秒および120秒の全てにおいて、上記1000rpmの低速回転と5000rpmの高速回転との繰り返しの場合の同秒数と比較して、高いqPCR定量値(%)を示している。そして、30秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と6000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が57%以上となり、60秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と7000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が87%以上となり、60秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が56%以上となり、90秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と9000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が55%以上となり、60秒以上の動作時間において、1000rpmの低速回転と10000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が59%以上となり、いずれも1000rpmの低速回転と5000rpmの高速回転との繰り返しによる最大qPCR定量値(52%)よりも、高いqPCR定量値(%)が短時間で実現されている。
 図15は、低速回転を5000rpmとし、高速回転数の設定を6000rpmより1000rpm毎に10000rpmまで変化させた場合のデータである。また、図15には低速回転の設定を4000rpm、高速回転の設定を5000rpmとした比較データも示している。高速回転および低速回転の回転時間はそれぞれ2.5秒であり、5秒間の周期を6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)繰り返したデータを示している。
 図15の比較データは4000rpmの低速回転を2.5秒、回転停止2.5秒を1周期として、6回(30秒)、12回(60秒)、18回(90秒)、24回(120秒)でそれぞれ繰り返させたものであり、120秒の動作時間によりqPCR定量値(%)が最大で59%である。図15の結果によれば、120秒における上記4000rpmの低速回転と5000rpmの高速回転との繰り返しの場合と比較して、90秒以上の動作時間において、5000rpmの低速回転と6000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が66%以上となり、120秒以上の動作時間において、5000rpmの低速回転と7000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が74%以上となり、90秒以上の動作時間において、5000rpmの低速回転と8000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が62%以上となり、120秒以上の動作時間において、5000rpmの低速回転と9000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が79%以上となり、120秒以上の動作時間において、5000rpmの低速回転と10000rpmの高速回転との繰り返しでqPCR定量値(%)が68%以上となり、いずれも4000rpmの低速回転と5000rpmの繰り返しによる最大qPCR定量値(59%)以上よりも、高いqPCR定量値(%)が短時間で実現されている。

Claims (20)

  1.  検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを貯留させた容器の下部に円運動をさせる駆動部と、
     該駆動部を制御する制御部とを備え、
     該制御部が、前記容器の下部に2つ以上の互いに異なる回転数間で連続的に変化する前記円運動をさせるように、前記駆動部を制御することを特徴とする検体の破砕装置。
  2.  前記制御部が、前記容器の下部に、前記2つ以上の互いに異なる回転数のうち、最低回転数が1000~5000rpmの範囲であり、且つ最高回転数が6000~10000rpmの範囲である前記円運動をさせるように、前記駆動部を制御することを特徴とする請求項1に記載の検体の破砕装置。
  3.  前記容器が、該容器の上方の内周面に、前記小径ビーズを前記内周面より跳ね上げるリブを備えていることを特徴とする請求項1または2に記載の検体の破砕装置。
  4.  前記容器の下方の内周面が、前記円運動中に前記大径ビーズを前記下方の内周面上で転動させるように、平坦であることを特徴とする請求項3に記載の検体の破砕装置。
  5.  前記駆動部が、
     前記容器の上部を、前記容器が該容器の中心軸まわりに回転不能な状態で、支持する支持部材と、
     所定の回転軸まわりに回転する回転部材と、
     前記中心軸が前記回転軸に対して交差した状態で前記容器の下部を前記回転部材に直接または間接的に連結する連結手段とを備えたことを特徴とする請求項1~4のいずれか1項に記載の検体の破砕装置。
  6.  前記中心軸と前記回転軸との交差する角度が2~5度の範囲であることを特徴とする請求項5に記載の検体の破砕装置。
  7.  前記支持部材が、前記容器の上部を挿通させる孔を有する可撓性部材からなることを特徴とする請求項5または6に記載の検体の破砕装置。
  8.  前記可撓性部材が、前記孔の周囲に前記容器の材質よりも硬質な環状部を備えていることを特徴とする請求項7に記載の検体の破砕装置。
  9.  前記連結手段が、前記回転部材に、前記回転軸から離れた位置に設けられた凹部または凸部と、前記容器の下端に直接または間接的に設けられた、前記凹部または凸部と嵌合する凸部または凹部とからなることを特徴とする請求項5~8のいずれか1項に記載の検体の破砕装置。
  10.  前記支持部材が、前記可撓性部材の前記孔と連通する開口を有する有底筒状の容器収容部をさらに備え、該容器収容部の底部に凸部と、前記容器収容器の内周面上に、前記容器の外周面上に形成されたリブと係合して前記容器の前記中心軸まわりの回転を防止する突起とが形成されていることを特徴とする請求項7または8に記載の検体の破砕装置。
  11.  前記駆動部を複数備え、該複数の駆動部が複数の前記容器を同時に前記円運動させることを特徴とする請求項1~10のいずれか1項に記載の検体の破砕装置。
  12.  前記制御部が、前記複数の容器のうち、一部の前記容器を前記円運動させている間、残りの前記容器を前記一部の容器とは異なる回転数で前記円運動させるように、前記駆動部を制御することを特徴とする請求項11に記載の検体の破砕装置。
  13.  検体を含む溶液、多数の小径ビーズおよび1個の大径ビーズを容器に貯留させ、
     該容器の下部に2つ以上の互いに異なる回転数の間で連続的に変化する円運動をさせて、前記ビーズにより前記検体を破砕することを特徴とする検体の破砕方法。
  14.  前記2つ以上の互いに異なる回転数のうち、最低回転数が1000~5000rpmの範囲であり、最高回転数が6000~10000rpmの範囲であることを特徴とする請求項13に記載の検体の破砕方法。
  15.  前記円運動により、前記大径ビーズを前記容器の下方の内周面上で転動させ、前記小径ビーズを、前記円運動の回転数の変化に応じて、前記容器内で上下方向に移動させることを特徴とする請求項13または14に記載の検体の破砕方法。
  16.  前記容器の中心軸が前記円運動の回転軸と交差した状態で前記円運動をさせることを特徴とする請求項13~15のいずれか1項に記載の検体の破砕方法。
  17.  前記容器の上部を支持した状態で前記円運動させることを特徴とする請求項16に記載の検体の破砕方法。
  18.  前記中心軸が前記回転軸に対して2~5度の範囲の角度をなして交差していることを特徴とする請求項16または17に記載の検体の破砕方法。
  19.  前記容器を複数用意し、各該容器に前記溶液、前記多数の小径ビーズおよび前記1個の大径ビーズを貯留させ、前記複数の容器を同時に前記円運動させることを特徴とする請求項13~18のいずれか1項に記載の検体の破砕方法。
  20.  前記複数の容器を2つのグループに分け、一方のグループに属する前記容器の下部に前記円運動をさせている間、他方のグループに属する前記容器の下部に前記一方のグループとは異なる回転数で前記円運動をさせることを特徴とする請求項19に記載の検体の破砕方法。
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