RU2779197C9 - Method for determination of apolipoprotein e4 - Google Patents
Method for determination of apolipoprotein e4 Download PDFInfo
- Publication number
- RU2779197C9 RU2779197C9 RU2019113771A RU2019113771A RU2779197C9 RU 2779197 C9 RU2779197 C9 RU 2779197C9 RU 2019113771 A RU2019113771 A RU 2019113771A RU 2019113771 A RU2019113771 A RU 2019113771A RU 2779197 C9 RU2779197 C9 RU 2779197C9
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- apoe4
- glu
- leu
- arg
- ala
- Prior art date
Links
- 108010060159 Apolipoprotein E4 Proteins 0.000 title description 8
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims abstract description 155
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 claims abstract description 114
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 claims abstract description 88
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 claims abstract description 88
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 85
- 239000003599 detergent Substances 0.000 claims abstract description 66
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 63
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 63
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 claims abstract description 53
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract description 53
- 206010001897 Alzheimer's disease Diseases 0.000 claims abstract description 46
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 44
- 101700025839 APOE Proteins 0.000 claims abstract description 40
- 102100007877 APOE Human genes 0.000 claims abstract description 39
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 23
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims abstract description 10
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 9
- 230000001965 increased Effects 0.000 claims abstract description 8
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 claims abstract description 4
- -1 poly(divinylbenzene) Polymers 0.000 claims description 66
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 61
- 108091003117 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 claims description 49
- 229940098773 Bovine Serum Albumin Drugs 0.000 claims description 49
- 210000002381 Plasma Anatomy 0.000 claims description 43
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 40
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 claims description 34
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 claims description 33
- 239000011521 glass Substances 0.000 claims description 27
- 230000000087 stabilizing Effects 0.000 claims description 26
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 claims description 20
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 claims description 20
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 20
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 claims description 20
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 claims description 18
- 210000002966 Serum Anatomy 0.000 claims description 16
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims description 14
- 101710006307 MVA110L Proteins 0.000 claims description 13
- 101710042748 UL80 Proteins 0.000 claims description 13
- 230000001809 detectable Effects 0.000 claims description 13
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 13
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 10
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 claims description 10
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 claims description 10
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 claims description 10
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 10
- 229920000139 polyethylene terephthalate Polymers 0.000 claims description 10
- 239000005020 polyethylene terephthalate Substances 0.000 claims description 10
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 claims description 10
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 claims description 9
- 230000000903 blocking Effects 0.000 claims description 9
- LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M Cetrimonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 8
- 206010057668 Cognitive disease Diseases 0.000 claims description 8
- 239000004698 Polyethylene (PE) Substances 0.000 claims description 8
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 claims description 8
- 206010012289 Dementia Diseases 0.000 claims description 7
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 7
- 102000018358 Immunoglobulins Human genes 0.000 claims description 7
- 108060003951 Immunoglobulins Proteins 0.000 claims description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 7
- 238000011002 quantification Methods 0.000 claims description 7
- 102000011632 Caseins Human genes 0.000 claims description 6
- 108010076119 Caseins Proteins 0.000 claims description 6
- 108091006822 Human Serum Albumin Proteins 0.000 claims description 6
- 102000008100 Human Serum Albumin Human genes 0.000 claims description 6
- 229940072221 IMMUNOGLOBULINS Drugs 0.000 claims description 6
- 102000014171 Milk Proteins Human genes 0.000 claims description 6
- 108010011756 Milk Proteins Proteins 0.000 claims description 6
- 239000005018 casein Substances 0.000 claims description 6
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 claims description 6
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 6
- 235000021239 milk protein Nutrition 0.000 claims description 6
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N N,N'-Methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 claims description 5
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 claims description 5
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 claims description 5
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 claims description 5
- 229920001400 block copolymer Polymers 0.000 claims description 5
- 239000004205 dimethyl polysiloxane Substances 0.000 claims description 5
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 claims description 5
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 claims description 5
- 229920000435 poly(dimethylsiloxane) Polymers 0.000 claims description 5
- 229920000779 poly(divinylbenzene) Polymers 0.000 claims description 5
- 229920003229 poly(methyl methacrylate) Polymers 0.000 claims description 5
- 229920002225 poly(styrene-co-butadiene) Polymers 0.000 claims description 5
- 229920002239 polyacrylonitrile Polymers 0.000 claims description 5
- 239000004926 polymethyl methacrylate Substances 0.000 claims description 5
- 229920000098 polyolefin Polymers 0.000 claims description 5
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 claims description 5
- 229920003288 polysulfone Polymers 0.000 claims description 5
- 229920001343 polytetrafluoroethylene Polymers 0.000 claims description 5
- 239000004810 polytetrafluoroethylene Substances 0.000 claims description 5
- 229920002635 polyurethane Polymers 0.000 claims description 5
- 239000004814 polyurethane Substances 0.000 claims description 5
- 229920002689 polyvinyl acetate Polymers 0.000 claims description 5
- 239000011118 polyvinyl acetate Substances 0.000 claims description 5
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 claims description 5
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 claims description 5
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 claims description 5
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 claims description 5
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 claims description 5
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 claims description 5
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 claims description 5
- 235000012239 silicon dioxide Nutrition 0.000 claims description 5
- 229920001909 styrene-acrylic polymer Polymers 0.000 claims description 5
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 claims description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N D-serine Chemical compound OC[C@@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims description 4
- 229960000310 ISOLEUCINE Drugs 0.000 claims description 4
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 4
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 4
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 4
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 4
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 4
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 claims description 4
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 239000011630 iodine Substances 0.000 claims description 4
- 230000002285 radioactive Effects 0.000 claims description 4
- 206010053643 Neurodegenerative disease Diseases 0.000 claims description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 abstract description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 3
- 230000001575 pathological Effects 0.000 abstract description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 70
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 54
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 37
- 102000004851 Immunoglobulin G Human genes 0.000 description 31
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 30
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 29
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 29
- XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N Val-Gln Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 29
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 29
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 28
- PNMUAGGSDZXTHX-BYPYZUCNSA-N Gly-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O PNMUAGGSDZXTHX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 27
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 27
- MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(4-amino-1-carboxy-4-oxobutyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 26
- OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N Gln-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 25
- VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N L-alanyl-L-glutamic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 25
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 23
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 22
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 21
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 21
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 20
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 20
- FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N (2S)-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 17
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 17
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 17
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 17
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 16
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 16
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 16
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N Alanyl-Arginine Chemical compound CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 15
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 15
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 15
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 15
- BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N Thr-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 15
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 15
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 15
- 238000000034 method Methods 0.000 description 15
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 15
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 15
- UKKNTTCNGZLJEX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Serine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O UKKNTTCNGZLJEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 14
- BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 14
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 14
- PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N Arg-Gln Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 14
- QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 QADCERNTBWTXFV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 14
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 14
- LLEUXCDZPQOJMY-AAEUAGOBSA-N Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LLEUXCDZPQOJMY-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 14
- ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Leucine Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- HHSJMSCOLJVTCX-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O HHSJMSCOLJVTCX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 14
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 14
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 14
- JMCOUWKXLXDERB-WMZOPIPTSA-N Phe-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 JMCOUWKXLXDERB-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 14
- UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N Ser-Gln Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 14
- LDEBVRIURYMKQS-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CO LDEBVRIURYMKQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 14
- APIDTRXFGYOLLH-VQVTYTSYSA-N Thr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O APIDTRXFGYOLLH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 14
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 14
- UBAQSAUDKMIEQZ-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 UBAQSAUDKMIEQZ-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 14
- IBIDRSSEHFLGSD-YUMQZZPRSA-N Val-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 14
- GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N Valyl-Threonine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(C(C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 14
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 14
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 14
- 108010077158 leucinyl-arginyl-tryptophan Proteins 0.000 description 14
- 108010083476 phenylalanyltryptophan Proteins 0.000 description 14
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 14
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 14
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N val-gly Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-carboxybutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 13
- MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[[1-carboxy-4-(diaminomethylideneamino)butyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 13
- MRVYVEQPNDSWLH-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Valine Chemical compound CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O MRVYVEQPNDSWLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 13
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 13
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 13
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 13
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 13
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N gly ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 13
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N α-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 13
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 12
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 12
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 12
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 11
- WUGMRIBZSVSJNP-UFBFGSQYSA-N Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UFBFGSQYSA-N 0.000 description 11
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 11
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 11
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 11
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 11
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 11
- ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 10
- JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N Leucyl-Glutamine Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(N)=O JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 10
- RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Arginine Chemical compound OCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 10
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 10
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N (2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 9
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 9
- KLAONOISLHWJEE-UHFFFAOYSA-N Phenylalanyl-Glutamine Chemical compound NC(=O)CCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 KLAONOISLHWJEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 8
- XITLYYAIPBBHPX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O XITLYYAIPBBHPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 210000001175 Cerebrospinal Fluid Anatomy 0.000 description 7
- 230000002209 hydrophobic Effects 0.000 description 7
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 7
- 229940088598 Enzyme Drugs 0.000 description 6
- 230000035693 Fab Effects 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 6
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 6
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M buffer Substances [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 238000010915 one-step procedure Methods 0.000 description 6
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 6
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 5
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 5
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 5
- LZLREEUGSYITMX-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 5
- 239000012131 assay buffer Substances 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 101000447413 APOE Proteins 0.000 description 4
- 108010060219 Apolipoprotein E2 Proteins 0.000 description 4
- DYDKXJWQCIVTMR-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Methionine Chemical compound CSCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O DYDKXJWQCIVTMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000004556 Brain Anatomy 0.000 description 4
- 108090000197 Clusterin Proteins 0.000 description 4
- 102000003780 Clusterin Human genes 0.000 description 4
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 4
- 108091007172 antigens Proteins 0.000 description 4
- 102000038129 antigens Human genes 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 230000002708 enhancing Effects 0.000 description 4
- 230000002068 genetic Effects 0.000 description 4
- 102000034547 human ApoE protein Human genes 0.000 description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 4
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 4
- 229910052761 rare earth metal Inorganic materials 0.000 description 4
- 150000002910 rare earth metals Chemical class 0.000 description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 4
- 229920002395 Aptamer Polymers 0.000 description 3
- FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N Asn-His Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M CHEMBL593252 Chemical compound [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N Rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 3
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- 238000010306 acid treatment Methods 0.000 description 3
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-O acridine;hydron Chemical class C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3[NH+]=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 3
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 3
- 108010087049 alanyl-alanyl-prolyl-valine Proteins 0.000 description 3
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 description 3
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 description 3
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 description 3
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 3
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- 239000002609 media Substances 0.000 description 3
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 3
- 230000001264 neutralization Effects 0.000 description 3
- 150000001282 organosilanes Chemical class 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 3
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- OPINTGHFESTVAX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Arginine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N OPINTGHFESTVAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZQFAGNFSIZZYBA-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(CCC(N)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 ZQFAGNFSIZZYBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PSBDWGZCVUAZQS-UHFFFAOYSA-N (dimethylsulfonio)acetate Chemical compound C[S+](C)CC([O-])=O PSBDWGZCVUAZQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZIDRAQTRIQDX-UHFFFAOYSA-N 6-Carboxy-X-rhodamine Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(C([O-])=O)C=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 WQZIDRAQTRIQDX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 2
- 108010082126 Alanine Transaminase Proteins 0.000 description 2
- 108010060215 Apolipoprotein E3 Proteins 0.000 description 2
- 102000008128 Apolipoprotein E3 Human genes 0.000 description 2
- 108010003415 Aspartate Aminotransferases Proteins 0.000 description 2
- 102000004625 Aspartate Aminotransferases Human genes 0.000 description 2
- UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N Carbazole Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3NC2=C1 UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000008787 Cardiovascular Disease Diseases 0.000 description 2
- 102100010966 GPT Human genes 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 102000003855 L-lactate dehydrogenases Human genes 0.000 description 2
- 108091000084 L-lactate dehydrogenases Proteins 0.000 description 2
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 2
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 2
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K Tripotassium phosphate Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 230000036462 Unbound Effects 0.000 description 2
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- 239000005862 Whey Substances 0.000 description 2
- 239000000370 acceptor Substances 0.000 description 2
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 230000000240 adjuvant Effects 0.000 description 2
- 238000004164 analytical calibration Methods 0.000 description 2
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 2
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 2
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 description 2
- XJWSAJYUBXQQDR-UHFFFAOYSA-M dodecyltrimethylammonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C XJWSAJYUBXQQDR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- SFNALCNOMXIBKG-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol monododecyl ether Chemical compound CCCCCCCCCCCCOCCO SFNALCNOMXIBKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 2
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular Effects 0.000 description 2
- 230000000670 limiting Effects 0.000 description 2
- YFVGRULMIQXYNE-UHFFFAOYSA-M lithium;dodecyl sulfate Chemical compound [Li+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O YFVGRULMIQXYNE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 2
- 230000001404 mediated Effects 0.000 description 2
- 210000002569 neurons Anatomy 0.000 description 2
- 230000002887 neurotoxic Effects 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 230000002797 proteolythic Effects 0.000 description 2
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 2
- 229940117986 sulfobetaine Drugs 0.000 description 2
- ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(O)=CC=C21 ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 2
- YFBBUHJJUXXZOF-UWVGGRQHSA-N (2S)-1-[2-[[(2S)-2-azaniumyl-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylate Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YFBBUHJJUXXZOF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 description 1
- RZRNAYUHWVFMIP-KTKRTIGZSA-N 1-oleoylglycerol Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(O)CO RZRNAYUHWVFMIP-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- JNGRENQDBKMCCR-UHFFFAOYSA-N 2-(3-amino-6-iminoxanthen-9-yl)benzoic acid;hydrochloride Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[NH2+])C=C2OC2=CC(N)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O JNGRENQDBKMCCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LBCZOTMMGHGTPH-UHFFFAOYSA-N 2-[2-[4-(2,4,4-trimethylpentan-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethanol Chemical compound CC(C)(C)CC(C)(C)C1=CC=C(OCCOCCO)C=C1 LBCZOTMMGHGTPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 2-[[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]acetic acid Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- GUQQBLRVXOUDTN-XOHPMCGNSA-N 3-[dimethyl-[3-[[(4R)-4-[(3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-3,7,12-trihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoyl]amino]propyl]azaniumyl]-2-hydroxypropane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CC(O)CS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 GUQQBLRVXOUDTN-XOHPMCGNSA-N 0.000 description 1
- HUDPLKWXRLNSPC-UHFFFAOYSA-N 4-Aminophthalhydrazide Chemical compound O=C1NNC(=O)C=2C1=CC(N)=CC=2 HUDPLKWXRLNSPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IDLISIVVYLGCKO-UHFFFAOYSA-N 6-carboxy-4',5'-dichloro-2',7'-dimethoxyfluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=C(C(O)=O)C=C2C21C1=CC(OC)=C(O)C(Cl)=C1OC1=C2C=C(OC)C(O)=C1Cl IDLISIVVYLGCKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 6-carboxyfluorescein Chemical compound C12=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C2C11OC(=O)C2=CC=C(C(=O)O)C=C21 BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 206010064930 Age-related macular degeneration Diseases 0.000 description 1
- XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-N Ala-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- FSHURBQASBLAPO-WDSKDSINSA-N Ala-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N FSHURBQASBLAPO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 239000012099 Alexa Fluor family Substances 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000008102 Ankyrins Human genes 0.000 description 1
- 108010049777 Ankyrins Proteins 0.000 description 1
- 102000005434 Apoenzymes Human genes 0.000 description 1
- 108010006591 Apoenzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000007592 Apolipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010071619 Apolipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018655 Apolipoproteins C Human genes 0.000 description 1
- 108010027070 Apolipoproteins C Proteins 0.000 description 1
- PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N Asp-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 229960001950 Benzethonium Chloride Drugs 0.000 description 1
- UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M Benzethonium chloride Chemical compound [Cl-].C1=CC(C(C)(C)CC(C)(C)C)=CC=C1OCCOCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 210000001124 Body Fluids Anatomy 0.000 description 1
- 102100008895 CLEC3B Human genes 0.000 description 1
- 229940109239 Creatinine Drugs 0.000 description 1
- 229960003067 Cystine Drugs 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- OJSUWTDDXLCUFR-YVKIRAPASA-N Deoxy-Bigchap Chemical compound C([C@@H]1CC2)[C@@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@@H]([C@@H](CCC(=O)N(CCCNC(=O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO)CCCNC(=O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO)C)[C@@]2(C)[C@H](O)C1 OJSUWTDDXLCUFR-YVKIRAPASA-N 0.000 description 1
- UVYVLBIGDKGWPX-SPPYGRLSSA-N Digitonin Natural products O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@H]2[C@@H](O)C[C@]3(C)[C@@H]4[C@H]([C@@H]5[C@H](O)[C@@H]6O[C@]7([C@@H](C)[C@@H]6[C@@]5(C)CC4)OC[C@H](C)CC7)CC[C@H]3C2)O[C@H]1CO)[C@H]1[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O[C@H]3[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO2)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 UVYVLBIGDKGWPX-SPPYGRLSSA-N 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 241000271571 Dromaius novaehollandiae Species 0.000 description 1
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N Ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100008658 FN1 Human genes 0.000 description 1
- 101700037202 FYN Proteins 0.000 description 1
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 1
- 102100005993 G6PD Human genes 0.000 description 1
- LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N Gln-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 108010018962 Glucosephosphate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 description 1
- 208000009889 Herpes Simplex Diseases 0.000 description 1
- 108010064750 Humanized Monoclonal Antibodies Proteins 0.000 description 1
- 102000015434 Humanized Monoclonal Antibodies Human genes 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N L-cystine zwitterion Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H]([NH3+])CSSC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N L-lysyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N Leu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C NTISAKGPIGTIJJ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- 102000019298 Lipocalins Human genes 0.000 description 1
- 108050006654 Lipocalins Proteins 0.000 description 1
- 206010067125 Liver injury Diseases 0.000 description 1
- 208000002780 Macular Degeneration Diseases 0.000 description 1
- ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N Met-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- SBWGZAXBCCNRTM-CTHBEMJXSA-N N-methyl-N-[(2S,3R,4R,5R)-2,3,4,5,6-pentahydroxyhexyl]octanamide Chemical compound CCCCCCCC(=O)N(C)C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO SBWGZAXBCCNRTM-CTHBEMJXSA-N 0.000 description 1
- 208000009025 Nervous System Disease Diseases 0.000 description 1
- 206010029305 Neurological disorder Diseases 0.000 description 1
- 206010029350 Neurotoxicity Diseases 0.000 description 1
- HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N Octyl glucoside Chemical compound CCCCCCCCO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O HEGSGKPQLMEBJL-RKQHYHRCSA-N 0.000 description 1
- TZMSYXZUNZXBOL-UHFFFAOYSA-N Phenoxazine Chemical compound C1=CC=C2NC3=CC=CC=C3OC2=C1 TZMSYXZUNZXBOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003867 Phospholipid Transfer Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000216 Phospholipid Transfer Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108091000081 Phosphotransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000030951 Phosphotransferases Human genes 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- RKCAIXNGYQCCAL-UHFFFAOYSA-N Porphin Chemical compound N1C(C=C2N=C(C=C3NC(=C4)C=C3)C=C2)=CC=C1C=C1C=CC4=N1 RKCAIXNGYQCCAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000007759 RPMI Media 1640 Substances 0.000 description 1
- 229920000750 Rapid DNA Polymers 0.000 description 1
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 1
- KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M Sodium lauroyl sarcosinate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCC(=O)N(C)CC([O-])=O KSAVQLQVUXSOCR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920001385 Spiegelmer Polymers 0.000 description 1
- YLJREFDVOIBQDA-UHFFFAOYSA-N Tacrine Chemical compound C1=CC=C2C(N)=C(CCCC3)C3=NC2=C1 YLJREFDVOIBQDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001685 Tacrine Drugs 0.000 description 1
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N Texas Red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010044221 Toxic encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 1
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 1
- FPKOPBFLPLFWAD-UHFFFAOYSA-N Trinitrotoluene Chemical compound CC1=CC=C([N+]([O-])=O)C([N+]([O-])=O)=C1[N+]([O-])=O FPKOPBFLPLFWAD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N Trp-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IMMPMHKLUUZKAZ-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102400000757 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N Xanthene Chemical compound C1=CC=C2CC3=CC=CC=C3OC2=C1 GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XPIVOYOQXKNYHA-RGDJUOJXSA-N [(2R,3S,4S,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methoxyoxan-2-yl]methyl N-heptylcarbamate Chemical compound CCCCCCCNC(=O)OC[C@H]1O[C@H](OC)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O XPIVOYOQXKNYHA-RGDJUOJXSA-N 0.000 description 1
- GNDMXFUIXOEPRA-UHFFFAOYSA-M [4-[3-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-3-oxopropyl]phenyl] 10-methylacridin-10-ium-9-carboxylate;trifluoromethanesulfinate Chemical compound [O-]S(=O)C(F)(F)F.C12=CC=CC=C2[N+](C)=C2C=CC=CC2=C1C(=O)OC(C=C1)=CC=C1CCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O GNDMXFUIXOEPRA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000000999 acridine dye Substances 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 229960000070 antineoplastic Monoclonal antibodies Drugs 0.000 description 1
- 101700070309 apoeb Proteins 0.000 description 1
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010018691 arginyl-threonyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 238000002820 assay format Methods 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture media Substances 0.000 description 1
- NFCRBQADEGXVDL-UHFFFAOYSA-M cetylpyridinium chloride monohydrate Chemical compound O.[Cl-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+]1=CC=CC=C1 NFCRBQADEGXVDL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108091006028 chimera Proteins 0.000 description 1
- 239000000544 cholinesterase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 230000023298 conjugation with cellular fusion Effects 0.000 description 1
- 230000002596 correlated Effects 0.000 description 1
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Natural products C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- 150000004775 coumarins Chemical class 0.000 description 1
- 230000001808 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229960003964 deoxycholic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N digitonin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H]([C@]2(CC[C@@H]3[C@@]4(C)C[C@@H](O)[C@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)CO7)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O6)O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O7)O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O6)O)[C@@H](CO)O5)O)C[C@@H]4CC[C@H]3[C@@H]2[C@@H]1O)C)[C@@H]1C)[C@]11CC[C@@H](C)CO1 UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N 0.000 description 1
- 238000003113 dilution method Methods 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cells Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000002191 fatty alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 230000001605 fetal Effects 0.000 description 1
- 230000037320 fibronectin Effects 0.000 description 1
- 235000019688 fish Nutrition 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 101700062055 fyna Proteins 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth media Substances 0.000 description 1
- 231100000234 hepatic damage Toxicity 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 229920001600 hydrophobic polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000005661 hydrophobic surface Effects 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical Effects 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive Effects 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 238000011068 load Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 230000004065 mitochondrial dysfunctions Effects 0.000 description 1
- 108010045030 monoclonal antibodies Proteins 0.000 description 1
- 102000005614 monoclonal antibodies Human genes 0.000 description 1
- 229960000060 monoclonal antibodies Drugs 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- ZBJVLWIYKOAYQH-UHFFFAOYSA-N naphthalen-2-yl 2-hydroxybenzoate Chemical compound OC1=CC=CC=C1C(=O)OC1=CC=C(C=CC=C2)C2=C1 ZBJVLWIYKOAYQH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 231100000189 neurotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 231100000228 neurotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- WLGDAKIJYPIYLR-UHFFFAOYSA-N octane-1-sulfonic acid Chemical compound CCCCCCCCS(O)(=O)=O WLGDAKIJYPIYLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006353 oxyethylene group Chemical group 0.000 description 1
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N p-acetaminophenol Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- JKCNXKXYMRTCQZ-UHFFFAOYSA-N pentane-1-sulfonic acid;sodium Chemical compound [Na].CCCCCS(O)(=O)=O JKCNXKXYMRTCQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral Effects 0.000 description 1
- 150000005053 phenanthridines Chemical class 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000865 phosphorylative Effects 0.000 description 1
- INAAIJLSXJJHOZ-UHFFFAOYSA-N pibenzimol Chemical compound C1CN(C)CCN1C1=CC=C(N=C(N2)C=3C=C4NC(=NC4=CC=3)C=3C=CC(O)=CC=3)C2=C1 INAAIJLSXJJHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001993 poloxamer 188 Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000259 polyoxyethylene lauryl ether Polymers 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational Effects 0.000 description 1
- 229910000160 potassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000003014 reinforcing Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108091007521 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000003118 sandwich ELISA Methods 0.000 description 1
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 1
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 1
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- NRHMKIHPTBHXPF-TUJRSCDTSA-M sodium cholate Chemical compound [Na+].C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC([O-])=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 NRHMKIHPTBHXPF-TUJRSCDTSA-M 0.000 description 1
- FHHPUSMSKHSNKW-SMOYURAASA-M sodium deoxycholate Chemical compound [Na+].C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC([O-])=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 FHHPUSMSKHSNKW-SMOYURAASA-M 0.000 description 1
- AIMUHNZKNFEZSN-UHFFFAOYSA-M sodium;decane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCS([O-])(=O)=O AIMUHNZKNFEZSN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- DAJSVUQLFFJUSX-UHFFFAOYSA-M sodium;dodecane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCS([O-])(=O)=O DAJSVUQLFFJUSX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- REFMEZARFCPESH-UHFFFAOYSA-M sodium;heptane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCCS([O-])(=O)=O REFMEZARFCPESH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- QWSZRRAAFHGKCH-UHFFFAOYSA-M sodium;hexane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCS([O-])(=O)=O QWSZRRAAFHGKCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- RUYRDULZOKULPK-UHFFFAOYSA-M sodium;nonane-1-sulfonate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCS([O-])(=O)=O RUYRDULZOKULPK-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 1
- 229940032085 sucrose monolaurate Drugs 0.000 description 1
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000005700 syncytium formation by plasma membrane fusion Effects 0.000 description 1
- 108010013645 tetranectin Proteins 0.000 description 1
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 1
- 235000019798 tripotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000003612 virological Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
Настоящее изобретение обеспечивает простой и экономически эффективный способ определения статуса аполипопротеина Е (ApoE) у субъектов. Такие субъекты включают, не ограничиваясь этим, пациентов с когнитивным нарушением, деменцией и/или болезнью Альцгеймера (AD).The present invention provides a simple and cost-effective method for determining apolipoprotein E (ApoE) status in subjects. Such subjects include, but are not limited to, patients with cognitive impairment, dementia, and/or Alzheimer's disease (AD).
Среди различных генов предрасположенности, ассоциированных с риском развития болезни Альцгеймера с поздним началом (LOAD) и других неврологических расстройств, ApoE был идентифицирован в качестве сильной генетической детерминанты (Leduc et al., 2011). Ген APOE человека находится в виде трех полиморфных аллелей ε2, ε3 и ε4, частота которых во всем мире составляет 8,4%, 77,9% и 13,7% соответственно. Аполипопротеин E (ApoE) состоит из 299 аминокислот и связан с липопротеинами в плазме и цереброспинальной жидкости (Leduc et al., 2011). Различия между тремя изоформами ApoE сводятся к аминокислотам 112 и 158 (SEQ ID NO: 1), где присутствует цистеин или аргинин: ApoE2 (cys112, cys158), ApoE3 (cys112, arg158) и ApoE4 (arg112, arg158). Кроме того, риск развития AD высоко коррелирует с аллелем ApoE4. Субъекты с одним аллелем ApoE4 имеют риск развития AD в пять-шесть раз выше, и субъекты с двумя аллелями ApoE4 имеют риск развития AD более чем в 20 раз. Кроме того, наличие одной (гетерозиготной) или двух копий (гомозиготной) аллеля ApoE4 коррелирует с более ранним возрастом начала заболевания примерно на 10-20 лет в сравнении с неносителями у пациентов с поздним началом заболевания (Verghese et al., 2011, Weisgraber & Mahley 1996, Leduc et al., 2011). Результаты исследований показывают, что субъекты, которые соответствуют клиническим критериям умеренного когнитивного нарушения (MCI), и которые также являются ApoE4-позитивными, с большей вероятностью будут прогрессировать до AD в течение нескольких лет, чем субъекты, которые являются ApoE4-негативными (Aggarwal et al., 2005). Следовательно, определение генотипа ApoE можно использовать для выявления пациентов с MCI с более высоким риском прогрессирования от MCI до AD. Носители ApoE4 также по-разному отвечают на несколько видов лечения AD, например, на ингибитор ацетилхолинэстеразы, такрин, что усиливает значение того, что пациенты должны знать их генотип (Cacabelos et al. 2012).Among various susceptibility genes associated with the risk of developing late-onset Alzheimer's disease (LOAD) and other neurological disorders, ApoE has been identified as a strong genetic determinant (Leduc et al., 2011). The human APOE gene is found as three polymorphic alleles ε2, ε3, and ε4, with a worldwide frequency of 8.4%, 77.9%, and 13.7%, respectively. Apolipoprotein E (ApoE) consists of 299 amino acids and is associated with lipoproteins in plasma and cerebrospinal fluid (Leduc et al., 2011). Differences between the three isoforms of ApoE are limited to amino acids 112 and 158 (SEQ ID NO: 1) where cysteine or arginine is present: ApoE2 (cys112, cys158), ApoE3 (cys112, arg158) and ApoE4 (arg112, arg158). In addition, the risk of developing AD is highly correlated with the ApoE4 allele. Subjects with one ApoE4 allele have a five to six times higher risk of developing AD, and subjects with two ApoE4 alleles have a more than 20-fold risk of developing AD. In addition, the presence of one (heterozygous) or two copies (homozygous) ApoE4 allele correlates with an earlier age of onset of about 10-20 years compared to non-carriers in patients with late onset disease (Verghese et al., 2011, Weisgraber & Mahley 1996, Leduc et al., 2011). Research results indicate that subjects who meet the clinical criteria for mild cognitive impairment (MCI) and who are also ApoE4 positive are more likely to progress to AD over several years than subjects who are ApoE4 negative (Aggarwal et al. ., 2005). Therefore, ApoE genotyping can be used to identify MCI patients at higher risk of progression from MCI to AD. ApoE4 carriers also respond differently to several AD treatments, such as the acetylcholinesterase inhibitor, tacrine, reinforcing the importance of patients knowing their genotype (Cacabelos et al. 2012).
Кроме того, статус ApoE можно использовать для прогнозирования других заболеваний (субъекты, несущие изоформу ApoE4, имеют более высокий риск развития сердечно-сосудистых заболеваний (CVD), а также имеют более высокий риск развития рака предстательной железы (патент США № 5945289)). С другой стороны, было показано, что генотип ApoE4 защищает от тяжелого повреждения печени во время гепатита С, повышает вирусную нагрузку и ускоряет прогрессирование заболевания у ВИЧ-инфицированных субъектов, а также повышает риск развития AD в результате инфекции, вызванной вирусом простого герпеса (WO 03/060158 А2). Лечение возрастной макулярной дегенерации также является более эффективным при изоформе ApoE4 (Bakbak et al., 2015).In addition, ApoE status can be used to predict other diseases (subjects carrying the ApoE4 isoform have a higher risk of developing cardiovascular disease (CVD) and also have a higher risk of developing prostate cancer (US patent No. 5945289)). On the other hand, the ApoE4 genotype has been shown to protect against severe liver damage during hepatitis C, increase viral load and accelerate disease progression in HIV-infected subjects, and increase the risk of developing AD as a result of herpes simplex virus infection (WO 03 /060158 A2). Treatment of age-related macular degeneration is also more effective in the ApoE4 isoform (Bakbak et al., 2015).
Генотип ApoE в качестве маркера риска развития болезни Альцгеймера был впервые описан в публикации Mayeux et al., 1998 и патенте США № 5508167. Существует множество возможностей для определения генетического статуса ApoE у субъектов с использованием различных методов генотипирования.The ApoE genotype as a risk marker for developing Alzheimer's disease was first described in Mayeux et al., 1998 and US Pat. No. 5,508,167. There are many possibilities to determine the genetic status of ApoE in subjects using various genotyping methods.
Было показано, что ApoE4 гораздо более чувствителен к протеолизу, чем ApoE3 и ApoE2, и усеченные на карбоксильном конце формы ApoE4 были обнаружены в головном мозге пациентов с AD и трансгенных по ApoE4 мышей. Предполагается, что фрагментация ApЕ4 является ранним событием в патогенезе AD (Brecht W. J. et al., 2004. Neuron-specific apolipoprotein e4 proteolysis is associated with increased tau phosphorylation in brains of transgenic mice. PNAS 24, 2527-2534).ApoE4 has been shown to be much more sensitive to proteolysis than ApoE3 and ApoE2, and carboxyl-truncated forms of ApoE4 have been found in the brains of AD patients and ApoE4 transgenic mice. ApE4 fragmentation has been suggested to be an early event in the pathogenesis of AD (Brecht WJ et al., 2004. Neuron-specific apolipoprotein e4 proteolysis is associated with increased tau phosphorylation in brains of transgenic mice. PNAS 24 , 2527-2534).
В головном мозге пациентов с AD было обнаружено несколько специфических, возможно, нейротоксичных, усеченных на карбоксильном конце фрагментов ApoЕ4:Several specific, possibly neurotoxic, carboxyl-truncated fragments of ApoE4 have been found in the brains of AD patients:
фрагмент ApoE4 1-165 с молекулярной массой 19 кДа (Huang Y. et al., 2001. Apolipoprotein E fragments present in Alzheimer's disease brains induce neurofibrillary tangle-like intracellular inclusions in neurons. 98, 8838-8843);a 19 kDa fragment of ApoE4 1-165 (Huang Y. et al., 2001. Apolipoprotein E fragments present in Alzheimer's disease brains induce neurofibrillary tangle-like intracellular inclusions in neurons. 98, 8838-8843);
фрагмент ApoE4 1-185 (Dafnis I. et al., 2010. An apolipoprotein E4 fragment can promote intracellular accumulation of amyloid peptide beta 42. 115, 873-884);ApoE4 fragment 1-185 (Dafnis I. et al., 2010. An apolipoprotein E4 fragment can promote intracellular accumulation of amyloid peptide beta 42. 115, 873-884);
фрагменты ApoE4 1-191 и ApoE4 1-260 (Tanaka M., 2006. Effect of carboxyl-terminal truncation on structure and lipid interaction of human apolipoprotein E4. Biochemistry, 45(13):4240-7);fragments of ApoE4 1-191 and ApoE4 1-260 (Tanaka M., 2006. Effect of carboxyl-terminal truncation on structure and lipid interaction of human apolipoprotein E4. Biochemistry, 45(13):4240-7);
фрагмент ApoE4 1-272 (Chang S. et al., 2005. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Lipid- and receptor-binding regions of apolipoprotein E4 fragments act in concert to cause mitochondrial dysfunction and neurotoxicity. 102(51):18694-9);ApoE4 fragment 1-272 (Chang S. et al., 2005. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Lipid- and receptor-binding regions of apolipoprotein E4 fragments act in concert to cause mitochondrial dysfunction and neurotoxicity. 102(51) :18694-9);
фрагменты ApoE4 1-259, ApoE4 1-229 и ApoE4 1-202 (Dafnis I. et al., 2015. Influence of Isoforms and Carboxyl-Terminal Truncations on the Capacity of Apolipoprotein E To Associate with and Activate Phospholipid Transfer Protein. Biochemistry, 54(38):5856-66; Vezeridis et al., 2011. Domains of apoE4 required for the biogenesis of apoE-containing HDL. Ann. Med., 43(4):302-11);fragments of ApoE4 1-259, ApoE4 1-229 and ApoE4 1-202 (Dafnis I. et al., 2015. Influence of Isoforms and Carboxyl-Terminal Truncations on the Capacity of Apolipoprotein E To Associate with and Activate Phospholipid Transfer Protein. Biochemistry, 54(38):5856-66 Vezeridis et al., 2011 Domains of apoE4 required for the biogenesis of apoE-containing HDL Ann Med., 43(4):302-11);
фрагмент ApoE4 1-231 (Chou C.Y. et al., 2006. Structural and functional variations in human apolipoprotein E3 and E4. J. Biol. Chem., 281(19):13333-44);ApoE4 fragment 1-231 (Chou C.Y. et al., 2006. Structural and functional variations in human apolipoprotein E3 and E4. J. Biol. Chem., 281(19):13333-44);
фрагменты ApoE4 1-251 и ApoE4 1-266 (Dong L.M. 1994. Human apolipoprotein E. Role of arginine 61 in mediating the lipoprotein preferences of the E3 and E4 isoforms. J. Biol. Chem., 269(35):22358-65).fragments of ApoE4 1-251 and ApoE4 1-266 (Dong L.M. 1994. Human apolipoprotein E. Role of arginine 61 in mediating the lipoprotein preferences of the E3 and E4 isoforms. J. Biol. Chem., 269(35):22358-65 ).
Кроме того, были исследованы усеченные на N-конце фрагменты ApoE4:In addition, N-terminally truncated ApoE4 fragments were examined:
фрагмент ApoE4 72-299 (Chou C.Y. et al. 2006. Structural and functional variations in human apolipoprotein E3 and E4. J Biol Chem. 281(19):13333-44; Chou C.Y. et al. 2005. Structural variation in human apolipoprotein E3 and E4: secondary structure, tertiary structure, and size distribution. Biophys J. 88(1):455-66).fragment ApoE4 72-299 (Chou C.Y. et al. 2006. Structural and functional variations in human apolipoprotein E3 and E4. J Biol Chem. 281(19):13333-44; Chou C.Y. et al. 2005. Structural variation in human apolipoprotein E3 and E4: secondary structure, tertiary structure, and size distribution Biophys J. 88(1):455-66).
В стандартных способах генотипирования используется ДНК, выделенная из периферической венозной крови или эпителиальных клеток ротовой полости, для анализа полиморфизма гена APOE. Более часто используемым способом традиционно был анализ ПЦР-RFLP (ПЦР-полиморфизм длины рестрикционных фрагментов). Однако это трудоемкий и подверженный погрешностям метод за счет возможного неполного расщепления рестриктазами. ПЦР плюс секвенирование или масс-спектрометрия являются эффективными методами, но для них требуется дорогостоящее специальное оборудование. Для методологий ARMS-ПЦР (амплификация рефракторной мутационной системы-ПЦР) и SSP-ПЦР (метод специфических последовательностей праймеров-ПЦР) требуется анализ с помощью агарозных гелей, что, таким образом, ограничивает количество образцов, которые можно исследовать одновременно. Детектирование ПЦР в режиме реального времени по флуоресцентным кривым плавления является простым и быстрым методом, но образование праймеров-димеров может усложнить интерпретацию кривых плавления. Детектирование ПЦР в режиме реального времени по флуоресцентным кривым плавления, использование FRET (флуоресцентный резонансный перенос энергии) или TaqMan® являются очень эффективными, хотя и дорогостоящими методами. Появляются все более и более экспрессные анализы ApoE на основе ДНК (например, Calero et al., 2009; Zhong et al., 2016), но все они основаны на вышеуказанных методах.Standard genotyping methods use DNA isolated from peripheral venous blood or oral epithelial cells to analyze the APOE gene polymorphism. The more commonly used method has traditionally been PCR-RFLP (Restriction Fragment Length PCR Polymorphism) analysis. However, this is a time-consuming and error-prone method due to the possible incomplete digestion by restriction enzymes. PCR plus sequencing or mass spectrometry are effective methods, but they require expensive specialized equipment. The ARMS-PCR (Refractor Mutation System-PCR Amplification) and SSP-PCR (Specific Primer Sequence-PCR) methodologies require analysis with agarose gels, thus limiting the number of samples that can be tested simultaneously. Real-time PCR detection from fluorescent melting curves is a simple and fast method, but primer-dimer formation can complicate the interpretation of melting curves. Real-time PCR detection from fluorescence melting curves, the use of FRET (fluorescence resonance energy transfer) or TaqMan® are very effective, albeit expensive, methods. More and more rapid DNA-based ApoE assays are emerging (e.g., Calero et al., 2009; Zhong et al., 2016), but they are all based on the above methods.
Также доступны анализы, основанные на фенотипе: например, изоэлектрическое фокусирование или 2D гель-электрофорез, которые являются довольно подверженными погрешностям за счет посттрансляционных изменений изоформ ApoE. Еще одним методом является иммунохимический анализ, который описан в патенте США № 6027896 и основан на присутствии восстанавливаемых остатков цистеина в изоформах E2 и E3, но не в E4. Уровни ApoE в биологических жидкостях также можно измерить с использованием коммерчески доступных иммуноанализов, обычно ELISA «сэндвич»-типа. С помощью таких анализов измеряют либо все ApoE в жидкостях организма, либо только ApoE4, либо оба.Phenotype-based assays are also available, such as isoelectric focusing or 2D gel electrophoresis, which are quite prone to errors due to post-translational changes in ApoE isoforms. Another method is immunochemical analysis, which is described in US patent No. 6027896 and is based on the presence of recoverable cysteine residues in the E2 and E3 isoforms, but not in E4. ApoE levels in biological fluids can also be measured using commercially available immunoassays, usually sandwich-type ELISA. These assays measure either all ApoE in body fluids, or only ApoE4, or both.
Было показано, что ApoE из цереброспинальной жидкости (CSF) связывается с полипропиленовыми, полистирольными, полиэтиленовыми и стеклянными пробирками (Hesse et al., 2000, Holmquist, 1982). Основываясь на таких результатах, Hesse et al. объяснили различия в результатах анализа уровней ApoE в CSF в различных экспериментах и определили связывание ApoE с этими материалами в качестве мешающего фактора для проведения иммуноанализов. Holmquist, 1982, описывает связывание выделенных и очищенных сывороточных ApoC и ApoE с пластиковыми пробирками и стеклянными пипетками и подчеркивает вероятность погрешностей в иммуноанализах ApoE, возникающих в процессе пробоподготовки. Тот факт, что делипидированные аполипопротеины сыворотки человека сильно адсорбируются на стеклянных и пластиковых поверхностях, является причиной погрешностей в иммуноанализах методом двойных антител (например, Sandwich ELISA; Holmquist 1982, Høgåsen et al. 1993).ApoE from cerebrospinal fluid (CSF) has been shown to bind to polypropylene, polystyrene, polyethylene and glass tubes (Hesse et al., 2000, Holmquist, 1982). Based on such results, Hesse et al. explained the differences in the results of the analysis of levels of ApoE in CSF in different experiments and identified the binding of ApoE to these materials as an interfering factor for immunoassays. Holmquist, 1982, describes the binding of isolated and purified serum ApoC and ApoE to plastic tubes and glass pipettes and highlights the potential for errors in ApoE immunoassays that occur during sample preparation. The fact that delipidated human serum apolipoproteins are highly adsorbed on glass and plastic surfaces is the cause of errors in double antibody immunoassays (eg Sandwich ELISA; Holmquist 1982, Høgåsen et al. 1993).
Høgåsen et al., 1993 показали, что кластерин прочно связывается с полистирольными микропланшетами. Эта способность к неспецифическому связыванию кластерина усиливается при добавлении твина-20. Они разработали иммуноанализ методом одного антитела, в котором они предварительно инкубировали образцы плазмы или сыворотки в PBS-T (PBS с 0,2% твина-20) на полистирольном микропланшете. Затем они детектировали и количественно определяли иммобилизованный кластерин с использованием специфического антитела к кластерину.Høgåsen et al., 1993 showed that clusterin binds strongly to polystyrene microplates. This ability to non-specifically bind clusterin is enhanced by the addition of tween-20. They developed a single antibody immunoassay in which they pre-incubated plasma or serum samples in PBS-T (PBS with 0.2% Tween-20) on a polystyrene microplate. They then detected and quantified the immobilized clusterin using a specific antibody to clusterin.
Настоящее изобретение использует эту способность ApoE, в частности ApoE4, прочно связываться с полимерными и стеклянными поверхностями и, таким образом, создали простой и экономически эффективный способ иммуноанализа методом одного антитела с использованием образцов крови, плазмы или сыворотки.The present invention exploits this ability of ApoE, in particular ApoE4, to bind strongly to polymeric and glass surfaces and thus provides a simple and cost effective single antibody immunoassay method using blood, plasma or serum samples.
Как описано выше, Hesse et al., 2000 показали, что ApoE из прямо использованной CSF связывается с полимерными или стеклянными пробирками и может детектироваться после элюирования (например, с помощью элюирования SDS и последующего вестерн-блоттинга). Однако в CSF средняя концентрация общего белка составляет 0,15-0,45 мг/мл. В противоположность, в плазме и сыворотке концентрация белка в 100-500 раз выше, чем в CSF, и составляет 60-80 мг/мл. Для иммуноанализа характерно насыщать связывающие поверхности блокирующими белками (например, бычьим сывороточным альбумином) в концентрациях от 0,5 до 2 мг/мл для ингибирования неспецифического связывания белков образца с поверхностями. Концентрации ApoE в сыворотке находятся в диапазоне от 30 до 400 мкг/мл (Bury et al., 1986). Следовательно, расчетное количество ApoE4 в плазме/сыворотке составляет всего 0,02-0,5% от общего содержания белков в плазме/сыворотке, и не следует ожидать, что можно будет измерять сигнал, специфичный для ApoE4. Удивительно, но заявители могут показать, что ApoE4 из плазмы, сыворотки и даже цельной крови специфически и количественно связывается с твердыми поверхностями, даже в присутствии более чем в 200-5000 раз более высокой концентрации общего белка в образце.As described above, Hesse et al., 2000 showed that ApoE from directly used CSF binds to polymer or glass tubes and can be detected after elution (eg, by SDS elution followed by Western blotting). However, in CSF, the average concentration of total protein is 0.15-0.45 mg/ml. In contrast, in plasma and serum, the protein concentration is 100-500 times higher than in CSF, and is 60-80 mg/ml. It is common for immunoassays to saturate binding surfaces with blocking proteins (eg, bovine serum albumin) at concentrations of 0.5 to 2 mg/mL to inhibit non-specific binding of sample proteins to surfaces. Serum ApoE concentrations range from 30 to 400 μg/ml (Bury et al., 1986). Therefore, the estimated amount of ApoE4 in plasma/serum is only 0.02-0.5% of total plasma/serum proteins, and it should not be expected that a signal specific for ApoE4 can be measured. Surprisingly, applicants can show that ApoE4 from plasma, serum, and even whole blood binds specifically and quantitatively to solid surfaces, even in the presence of more than 200-5000 times the total protein concentration in the sample.
Также неожиданно бело установлено, ApoE4 специфически и количественно связывается с твердыми поверхностями в присутствии блокирующих белков (например, 0,5-2 мг/мл бычьего сывороточного альбумина (BSA)) в реакционном буфере. Присутствие блокирующих белков, таких как BSA, может даже усиливать связывание ApoE4 с твердой фазой.Also unexpectedly white found, ApoE4 specifically and quantitatively binds to solid surfaces in the presence of blocking proteins (eg, 0.5-2 mg/ml bovine serum albumin (BSA)) in reaction buffer. The presence of blocking proteins such as BSA may even enhance the binding of ApoE4 to the solid phase.
Фактором, усиливающим специфическое связывание ApoE4 с полимерными и стеклянными поверхностями, является применение детергента. Детергенты обычно используются для предотвращения неспецифического связывания белков образцов с твердой фазой в иммуноанализах. Hesse et al. показали, что ApoE связывается с полистирольными, полипропиленовыми, полиэтиленовыми и стеклянными пробирками в присутствии 0,2% твина-20 (Hesse et al., 2000).A factor that enhances the specific binding of ApoE4 to polymeric and glass surfaces is the use of a detergent. Detergents are commonly used to prevent non-specific binding of sample proteins to solid phases in immunoassays. Hesse et al. showed that ApoE binds to polystyrene, polypropylene, polyethylene and glass tubes in the presence of 0.2% tween-20 (Hesse et al., 2000).
Предметом настоящего изобретения является способ для (а) идентификации статуса ApoE4 и/или (b) количественного определения уровней ApoE4 в образцах крови. Заключение о том, является ли субъект ApoE4-позитивным или ApoE4-негативным (a), основывается на том, что образец крови субъекта имеет уровень ApoE4 выше определенного порогового значения, которое ограничивается внутренним контролем отсечения. Количественное определение уровней ApoE4 в образцах крови (b) проводится анализом внутренних стандартов вместе с образцами и расчетом концентрации ApoE4 с использованием стандартной кривой.The subject of the present invention is a method for (a) identifying ApoE4 status and/or (b) quantifying ApoE4 levels in blood samples. Determining whether a subject is ApoE4 positive or ApoE4 negative (a) is based on the fact that the subject's blood sample has an ApoE4 level above a certain threshold, which is limited by an internal cutoff control. Quantification of ApoE4 levels in blood samples (b) is done by analyzing internal standards along with the samples and calculating the ApoE4 concentration using a standard curve.
Подробное описание вариантов осуществления настоящего изобретенияDetailed description of embodiments of the present invention
Предметом настоящего изобретения является способ (in vitro) детектирования аполипопротеина Е изотипа 4 (ApoE4) или его фрагментов в образце крови субъекта, включающий стадии:The subject of the present invention is a method (in vitro) for detecting apolipoprotein E isotype 4 (ApoE4) or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе посредством ApoE4 или ApoE4 иммобилизован на указанной твердой фазе, и связывающий агент с ApoE4.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase by ApoE4 or ApoE4 is immobilized on said solid phase, and the binding agent to ApoE4.
Предметом настоящего изобретения является способ (in vitro) детектирования аполипопротеина Е изотипа 4 (ApoE4) или его фрагментов в образце крови субъекта, включающий стадии:The subject of the present invention is a method (in vitro) for detecting apolipoprotein E isotype 4 (ApoE4) or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе, где твердая фаза не покрыта каким-либо связывающим агентом или захватывающей молекулой и где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит в присутствии детергента.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, where said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase, where the solid phase is not coated with any binding agent or capture molecule, and where the binding of ApoE4 or the ApoE4-binding agent complex to said solid phase occurs in the presence of detergent.
В контексте настоящего изобретения комплекс ApoE4- связывающий агент иммобилизован через ApoE4 на твердой фазе, в частности, ApoE4 иммобилизован на твердой фазе, и связывающий агент связан с ApoE4.In the context of the present invention, the ApoE4-binding agent complex is immobilized through ApoE4 on the solid phase, in particular ApoE4 is immobilized on the solid phase and the binding agent is bound to ApoE4.
Предметом настоящего изобретения также является анализ, основанный на связывании аналита (ApoE4 или его фрагментов) с твердой фазой в присутствии детергента и детектировании этого иммобилизованного аналита с помощью ApoE4-специфического связывающего агента с детектируемой меткой.The subject of the present invention is also an assay based on the binding of an analyte (ApoE4 or fragments thereof) to a solid phase in the presence of a detergent and the detection of this immobilized analyte using an ApoE4-specific binding agent with a detectable label.
ApoE4-специфический связывающий агент можно пометить прямо или опосредованно.The ApoE4 specific binding agent can be labeled directly or indirectly.
Предметом настоящего изобретения также является способ детектирования ApoE4 или его фрагментов, где образец крови субъекта контактирует с твердой фазой, тем самым иммобилизуя ApoE4 на указанной твердой фазе.The subject of the present invention is also a method for detecting ApoE4 or fragments thereof, wherein the subject's blood sample is contacted with a solid phase, thereby immobilizing ApoE4 on said solid phase.
Образец крови выбран из группы цельной крови, сыворотки и плазмы. Плазма здесь определяется как ЭДТА-плазма, гепаринизированная плазма и/или цитратная плазма.The blood sample is selected from a group of whole blood, serum and plasma. Plasma is herein defined as EDTA plasma, heparinized plasma and/or citrated plasma.
В контексте настоящего изобретения термин «фрагмент ApoE4» включает более короткие сплайсированные варианты ApoE4 и усеченные белки или пептиды ApoE4, или участки ApoE4 (Rohn et al., 2013; Love et al., 2015).In the context of the present invention, the term "ApoE4 fragment" includes shorter spliced ApoE4 variants and truncated ApoE4 proteins or peptides or ApoE4 regions (Rohn et al., 2013; Love et al., 2015).
Эти фрагменты содержат, по меньшей мере, 6 аминокислот в длину при условии, что аминокислота 158 (аргинин, R) входит в указанный фрагмент, где последовательность, включающая аминокислоту 158, относится к SEQ ID NO:1.These fragments are at least 6 amino acids in length, provided that amino acid 158 (arginine, R) is included in said fragment, where the sequence including amino acid 158 refers to SEQ ID NO:1.
В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения фрагменты выбраны из группы, включающей последовательности SEQ ID. NO: 1-15.In a specific embodiment of the present invention, the fragments are selected from the group consisting of SEQ ID sequences. NO: 1-15.
Как здесь используется, термин «субъект» относится к живому человеку или организму, отличному от человека, предпочтительно человеку, где субъект является здоровым, предположительно здоровым, страдающим когнитивными нарушением, страдающим деменцией, в частности, болезнью Альцгеймера (AD).As used herein, the term "subject" refers to a living human or non-human organism, preferably a human, where the subject is healthy, presumably healthy, suffering from cognitive impairment, suffering from dementia, in particular Alzheimer's disease (AD).
В одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению связывание ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой происходит без взаимодействия соединяющей молекулы, которая способна связывать/соединять ApoE4 или его фрагменты с указанной твердой фазой.In one embodiment of the method of the present invention, the binding of ApoE4 or fragments thereof to the solid phase occurs without the interaction of a connecting molecule that is capable of binding/linking ApoE4 or its fragments to said solid phase.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению на время контактирования твердой фазы с образцом указанное контактирование происходит без взаимодействия указанной соединяющей молекулы.In yet another embodiment of the method of the present invention, for the duration of contact of the solid phase with the sample, said contact occurs without interaction of said connecting molecule.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению связывание ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой происходит в присутствии детергента.In yet another embodiment of the method of the present invention, the binding of ApoE4 or fragments thereof to the solid phase occurs in the presence of a detergent.
Как здесь используется, детергент выбран из группы анионных детергентов (например, додецилсульфата натрия (SDS)), катионных детергентов (например, цетилтриметиламмония бромида (CTAB)), цвиттер-ионных детергентов (например, CHAPS) и неионных детергентов (например, твина-20, тритона Х-100).As used herein, the detergent is selected from the group of anionic detergents (eg, sodium dodecyl sulfate (SDS)), cationic detergents (eg, cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)), zwitterionic detergents (eg, CHAPS), and non-ionic detergents (eg, Tween-20 , triton X-100).
Примеры неионных детергентов включают сложные эфиры эпокси-жирных кислот, например, твин-20 (полиоксиэтилен сорбитан монолаурат), твин-80 (полиоксиэтилен сорбитан моноолеат), тритон (смеси алкиловых полиэфиров спиртов, например, тритон X-100, тритон X-114), Brij 35 и Brij 58 (лауриловый эфир полиоксиэтилена), Nonidet P-40 (октилфеноловый эфир полиоксиэтилена), Lubrol PX (аддукт полиэтиленоксида и алкилового эфира), Berol EMU 043 (C16, C18 жирный спирт с 10 оксиэтиленовыми цепями); дезокси-BIGCHAP, дигитонин, HECAMEG, N-D-глюко-N-метилалканамид (MEGA-8, 9, 10), н-октил-D-глюкопиранозид, rac.-1-олеоилглицерин, Pluronic® F-68, сахарозу монолаурат, сапонин из квиллайи; и тому подобное.Examples of non-ionic detergents include epoxy fatty acid esters, e.g. , Brij 35 and Brij 58 (polyoxyethylene lauryl ether), Nonidet P-40 (polyoxyethylene octylphenol ether), Lubrol PX (polyethylene oxide-alkyl ether adduct), Berol EMU 043 (C16, C18 fatty alcohol with 10 oxyethylene chains); deoxy-BIGCHAP, digitonin, HECAMEG, ND-gluco-N-methylalkanamide (MEGA-8, 9, 10), n-octyl-D-glucopyranoside, rac.-1- oleoylglycerin , Pluronic® F-68, sucrose monolaurate, saponin from quillaya; etc.
Цвиттер-ионные детергенты включают, не ограничиваясь этим, CHAPS, CHAPSO, н-октил-β-D-глюкопиранозид, сульфобетаин SB 12 и сульфобетаин SB 14.Zwitterionic detergents include, but are not limited to, CHAPS, CHAPSO, n-octyl-β-D-glucopyranoside, sulfobetaine SB 12, and sulfobetaine SB 14.
Примеры катионных детергентов включают бензетония хлорид, цетилпиридиния хлорид моногидрат, цетилтриметиламмония бромид (CTAB), додецилтриметиламмония бромид (DTAB) и тому подобное.Examples of cationic detergents include benzethonium chloride, cetylpyridinium chloride monohydrate, cetyltrimethylammonium bromide (CTAB), dodecyltrimethylammonium bromide (DTAB), and the like.
В качестве примера анионного детергента следует указать додецилсульфат натрия (SDS), додецилсульфат лития (LiDS), холат натрия, дезоксихолат натрия, N-лауроилсаркозина натриевую соль, 1-декансульфоновой кислоты натриевую соль, 1-додекансульфоновой кислоты натриевую соль, 1-гептансульфоновой кислоты натриевую соль безводную, 1-гексансульфоновой кислоты натриевую соль безводную, 1-нонансульфоновой кислоты натриевую соль, 1-октансульфоновой кислоты натриевую соль, 1-пентансульфоновой кислоты натриевую соль безводную и так далее.Examples of anionic detergents include sodium dodecyl sulfate (SDS), lithium dodecyl sulfate (LiDS), sodium cholate, sodium deoxycholate, N-lauroylsarcosine sodium salt, 1-decanesulfonic acid sodium salt, 1-dodecanesulfonic acid sodium salt, 1-heptanesulfonic acid sodium salt. anhydrous salt, 1-hexane sulfonic acid sodium salt anhydrous, 1-nonane sulfonic acid sodium salt, 1-octane sulfonic acid sodium salt, 1-pentane sulfonic acid sodium salt anhydrous, and so on.
В одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению концентрация детергента в реагенте предпочтительно составляет от 0,0001 до 10% (мас./об.) и особенно предпочтительно от 0,01 до 1% (мас./об.). Специалист в данной области знает, что можно предусматривать применение определенного диапазона концентраций для каждого конкретного детергента.In one embodiment of the method of the present invention, the concentration of detergent in the reagent is preferably from 0.0001 to 10% (w/v) and particularly preferably from 0.01 to 1% (w/v). The person skilled in the art knows that it is possible to provide for the use of a certain range of concentrations for each particular detergent.
В предпочтительном варианте осуществления способа по настоящему изобретению твин-20 используется в концентрации 0,001-10%, предпочтительно 0,01-1%, наиболее предпочтительно 0,2-0,5%. В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению тритон Х-100 используется в концентрации 0,001-0,5%, предпочтительно 0,01-0,2%, наиболее предпочтительно 0,05-0,1%.In a preferred embodiment of the method of the present invention, Tween-20 is used at a concentration of 0.001-10%, preferably 0.01-1%, most preferably 0.2-0.5%. In yet another embodiment of the method of the present invention, Triton X-100 is used at a concentration of 0.001-0.5%, preferably 0.01-0.2%, most preferably 0.05-0.1%.
В настоящем изобретении детергенты необходимы для связывания ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой, но они не функционируют в качестве соединяющих или связывающих молекул. Детергенты должны присутствовать в реакционном буфере, поскольку связывания ApoE4 с твердой фазой не происходит в буфере для образцов без детергента (см. пример 4).In the present invention, detergents are required to bind ApoE4 or fragments thereof to the solid phase, but they do not function as bonding or binding molecules. Detergents must be present in the reaction buffer since ApoE4 binding to the solid phase does not occur in sample buffer without detergent (see example 4).
В предпочтительном варианте осуществления способа по настоящему изобретению связывающий агент является специфически связывающим агентом для ApoE4 или его фрагментов.In a preferred embodiment of the method of the present invention, the binding agent is a specific binding agent for ApoE4 or fragments thereof.
В дополнительном варианте осуществления способа по настоящему изобретению связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, с константой аффинности связывания, по меньшей мере, 107 М-1, предпочтительно 108 М-1, предпочтительной константой аффинности выше 109 М-1, наиболее предпочтительно выше 1010 М-1.In a further embodiment of the method of the present invention, the binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a non-IgG scaffold protein with a binding affinity constant of at least 10 7 M -1 , preferably 10 8 M -1 , the preferred affinity constant being higher 10 9 M -1 , most preferably above 10 10 M -1 .
В контексте настоящего изобретения «молекулы связывающего агента» представляют собой молекулы, которые можно использовать для связывания молекул-мишеней или представляющих интерес молекул, т.е. аналитов (в контексте настоящего изобретения ApoE4 и его фрагментов), из образца. Таким образом, молекулы связывающего агента должны иметь адекватную форму, как в пространственном отношении, так и в отношении поверхностных свойств, таких как поверхностный заряд, гидрофобность, гидрофильность, наличие или отсутствие доноров и/или акцепторов Льюиса, чтобы специфически связывать молекулы-мишени или представляющие интерес молекулы. Таким образом, связывание может быть опосредовано, например, ионными, ван-дер-ваальсовыми, пи-пи, сигма-пи, гидрофобными или обусловленными водородными связями взаимодействиями или комбинацией двух или более вышеуказанных взаимодействий между захватывающими молекулами и молекулами-мишенями или представляющими интерес молекулами. В контексте настоящего изобретения молекулы связывающего агента могут, например, быть выбраны из группы, включающей молекулу нуклеиновой кислоты, молекулу углевода, молекулу PNA, белок, антитело, пептид или гликопротеин. Предпочтительно молекулы связывающего агента представляют антитела, включая их фрагменты с достаточной аффинностью к молекуле-мишени или представляющей интерес молекуле, и в том числе рекомбинантные антитела или фрагменты рекомбинантных антител, а также химически и/или биохимически модифицированные производные указанных антител или фрагментов, полученных из вариантной цепи длиной, по меньшей мере, 12 аминокислот.In the context of the present invention, "binding agent molecules" are molecules that can be used to bind target molecules or molecules of interest, i.e. analytes (in the context of the present invention ApoE4 and its fragments) from the sample. Thus, the binding agent molecules must have an adequate shape, both spatially and in terms of surface properties, such as surface charge, hydrophobicity, hydrophilicity, the presence or absence of Lewis donors and/or acceptors, in order to specifically bind target or presenting molecules. molecule interest. Thus, binding may be mediated, for example, by ionic, van der Waals, pi-pi, sigma-pi, hydrophobic, or hydrogen-bonded interactions, or a combination of two or more of the above interactions between capturing molecules and target molecules or molecules of interest. . In the context of the present invention, the binding agent molecules may, for example, be selected from the group consisting of a nucleic acid molecule, a carbohydrate molecule, a PNA molecule, a protein, an antibody, a peptide or a glycoprotein. Preferably, the binding agent molecules are antibodies, including fragments thereof with sufficient affinity for the target molecule or molecule of interest, and including recombinant antibodies or recombinant antibody fragments, as well as chemically and/or biochemically modified derivatives of said antibodies or fragments derived from a variant chain length of at least 12 amino acids.
Анти-ApoE4-антитело может иметь форматы, известные в данной области. Примерами являются человеческие антитела, моноклональные антитела, гуманизированные антитела, химерные антитела, CDR-привитые антитела. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антитела по настоящему изобретению представляют рекомбинантно полученные антитела, такие как IgG, обычный полноразмерный иммуноглобулин, или фрагменты антител, содержащие, по меньшей мере, F-(фрагмент) вариабельного домена тяжелой и/или легкой цепи, например, химические сшитые антитела (антигенсвязывающий фрагмент), включая, не ограничиваясь этим, Fab-фрагменты, в том числе Fab минитела, антитело в виде одноцепочечного Fab, антитело в виде одновалентного Fab с эпитопными метками, например Fab-V5S×2; бивалентный Fab (миниантитело), димеризованный с СН3-доменом; бивалентный Fab или мультивалентный Fab, например, полученный путем мультимеризации с помощью гетерологичного домена, например, путем димеризации dHLX-доменов, например, Fab-dHLX-FS×2; F(ab')2-фрагменты, scFv-фрагменты, мультимеризованные, мультивалентные и/или мультиспецифические scFv-фрагменты, бивалентные и/или биспецифические димерные антитела (диатела), BITE® (биспецифический активатор Т-клеток), трехфункциональные антитела, поливалентные антитела, например, из класса, отличного G; однодоменные антитела, например, нанотела, полученные из иммуноглобулинов представителей верблюдовых или рыб, и многие другие форматы.The anti-ApoE4 antibody may be in formats known in the art. Examples are human antibodies, monoclonal antibodies, humanized antibodies, chimeric antibodies, CDR-grafted antibodies. In a preferred embodiment of the present invention, the antibodies of the present invention are recombinantly produced antibodies, such as IgG, conventional full-length immunoglobulin, or antibody fragments containing at least the F-(fragment) of the heavy and/or light chain variable domain, for example, chemical cross-linked antibodies (antigen-binding fragment), including, but not limited to, Fab fragments, including Fab minibody, single chain Fab antibody, epitope tagged monovalent Fab antibody, eg Fab-V5S×2; a bivalent Fab (minibody) dimerized with a CH3 domain; a bivalent Fab or a multivalent Fab, eg obtained by multimerization with a heterologous domain, eg by dimerization of dHLX domains, eg Fab-dHLX-FS×2; F(ab') 2 fragments, scFv fragments, multimerized, multivalent and/or multispecific scFv fragments, bivalent and/or bispecific dimeric antibodies (diabodies), BITE® (bispecific T cell activator), trifunctional antibodies, polyvalent antibodies , for example, from a class other than G; single-domain antibodies, such as nanobodies derived from camelid or fish immunoglobulins, and many other formats.
В дополнение к анти-ApoE4-антителам в данной области хорошо известны другие биополимерные каркасы, которые образуют комплекс с молекулой-мишенью, и их используют для получения высокоспецифичных для мишеней биополимеров. Примерами являются аптамеры, шпигельмеры, антикалины и конотоксины.In addition to anti-ApoE4 antibodies, other biopolymer scaffolds that complex with a target molecule are well known in the art and are used to generate highly target-specific biopolymers. Examples are aptamers, spiegelmers, anticalins and conotoxins.
Каркасы, отличные от Ig, могут представлять белковые каркасы, и они могут использоваться в качестве миметиков антител, поскольку они способны связываться с лигандами или антигенами. Каркасы, отличные от Ig, можно выбрать из группы, включающей каркасы, отличные от Ig, на основе тетранектина (например, описанные в заявке на патент США № 2010/0028995), каркасы на основе фибронектина (например, описанные в ЕР 1266025), каркасы на основе липокалина (например, описанные в WO 2011/154420), каркасы на основе убиквитина (например, описанные в WO 2011/073214), каркасы на основе трансферрина (например, описанные в заявке на патент США № 2004/0023334), каркасы на основе белка А (например, описанные в EP 2231860), каркасы на основе анкириновых повторов (например, описанные в WO 2010/060748), каркасы на основе микропротеинов (предпочтительно микропротеинов, образующих «цистиновый узел») (например, описанные в EP 2314308), каркасы на основе домена SH3 киназы Fyn (например, описанные в WO 2011/023685), каркасы на основе домена EGFR-A (например, описанные в WO 2005/040229) и каркасы на основе домена Кунитца (например, описанные в EP 1941867). Каркасы, отличные от Ig, могут представлять пептидные или олигонуклеотидные аптамеры. Аптамеры обычно получают их отбором из большого пула случайных последовательностей, и они представляют короткие олигонуклеотидные цепи (ДНК, РНК или XNA; Xu et al., 2010, Deng et al., 2014) или короткие вариабельные пептидные домены, присоединенные к белковому каркасу (Li et al., 2011).Scaffolds other than Ig can represent protein scaffolds and can be used as antibody mimetics because they are able to bind to ligands or antigens. Non-Ig scaffolds can be selected from the group consisting of tetranectin-based non-Ig scaffolds (e.g., described in US Patent Application No. 2010/0028995), fibronectin-based scaffolds (e.g., described in EP 1266025), scaffolds lipocalin-based (for example, described in WO 2011/154420), ubiquitin-based scaffolds (for example, described in WO 2011/073214), transferrin-based scaffolds (for example, described in US patent application No. 2004/0023334), scaffolds based on Protein A backbone (e.g. described in EP 2231860), ankyrin repeat scaffolds (e.g. described in WO 2010/060748), scaffolds based on microproteins (preferably "cystine knot" forming microproteins) (e.g. described in EP 2314308) , Fyn kinase SH3 domain scaffolds (e.g. described in WO 2011/023685), EGFR-A domain scaffolds (e.g. described in WO 2005/040229) and Kunitz domain scaffolds (e.g. described in EP 1941867) . Frameworks other than Ig may be peptide or oligonucleotide aptamers. Aptamers are usually generated by selection from a large pool of random sequences, and they are short oligonucleotide chains (DNA, RNA or XNA; Xu et al., 2010, Deng et al., 2014) or short peptide variable domains attached to a protein backbone (Li et al., 2011).
Связывающие агенты, которые можно использовать для определения уровня ApoE4 или его фрагментов, имеют константу аффинности к ApoE4 на уровне, по меньшей мере, 107 М-1, предпочтительно 108 М-1, предпочтительную константу аффинности выше 109 М-1, наиболее предпочтительно выше 1010 М-1. Специалист в данной области знает, что можно предусматривать возможность компенсировать более низкую аффинность путем применения более высокой дозы соединений, и эта мера не приведет к выходу за рамки объема изобретения.Binding agents that can be used to determine the level of ApoE4 or fragments thereof have an affinity constant for ApoE4 of at least 10 7 M -1 , preferably 10 8 M -1 , the preferred affinity constant is above 10 9 M -1 , most preferably above 10 10 M -1 . The person skilled in the art knows that it may be possible to compensate for lower affinity by using a higher dose of compounds, and this measure will not lead to a departure from the scope of the invention.
В более предпочтительном варианте осуществления способа по настоящему изобретению связывающий агент помечен детектируемой меткой для детектирования после связывания с ApoE4.In a more preferred embodiment of the method of the present invention, the binding agent is labeled with a detectable label for detection after binding to ApoE4.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения метка связывающего агента выбрана из группы, включающей хемилюминесцентную метку, ферментную метку, флуоресцентную метку, метку на основе радиоактивного йода. Количество меченого антитела, связанного с аналитом, затем измеряют соответствующим методом.In a preferred embodiment of the present invention, the binding agent label is selected from the group consisting of a chemiluminescent label, an enzyme label, a fluorescent label, a radioactive iodine label. The amount of labeled antibody bound to the analyte is then measured by an appropriate method.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению метка связывающего агента выбрана из группы, включающей криптаты редкоземельных металлов или хелаты редкоземельных металлов в сочетании с флуоресцентным красителем или хемилюминесцентным красителем, в частности, красителем цианинового типа.In yet another embodiment of the method of the present invention, the binding agent label is selected from the group consisting of rare earth metal cryptates or rare earth metal chelates in combination with a fluorescent dye or a chemiluminescent dye, in particular a cyanine type dye.
Предпочтительные способы детектирования уровня ApoE4 или его фрагментов включают иммуноанализы в различных форматах, например, таких как радиоиммуноанализ (RIA), хемилюминесцентный и флуоресцентный иммуноанализ, твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA), чип-шарики на основе люминекса, белковые микрочипы и экспрессные форматы тестов, например, такие как иммунохроматографические методы с тест-полосками.Preferred methods for detecting the level of ApoE4 or fragments thereof include immunoassays in various formats, such as radioimmunoassay (RIA), chemiluminescent and fluorescent immunoassay, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), luminex-based beads, protein microarrays, and rapid test formats, for example such as immunochromatographic methods with test strips.
В контексте настоящего изобретения анализы на основе флуоресценции включают применение красителей, которые, например, могут быть выбраны из группы, включающей FAM (5- или 6-карбоксифлуоресцеин), VIC, NED, флуоресцеин, флуоресцеинизотиоцианат (FITC), IRD-700/800, цианиновые красители, такие как CY3, CY5, CY3.5, CY5.5, Cy7, ксантен, 6-карбокси-2',4',7',4,7-гексахлорфлуоресцеин (HEX), TET, 6-карбокси-4',5'-дихлор-2',7'-диметоксифлуоресцеин (JOE), N,N,N',N'-тетраметил-6-карбоксиродамин (ТАМРА), 6-карбокси-X-родамин (ROX), 5-карбоксиродамин-6G (R6G5), 6-карбоксиродамин-6G (RG6), родамин, родамин зеленый, родамин красный, родамин 110, красители BODIPY, такие как BODIPY TMR, орегон зеленый, кумарины, такие как умбеллиферон, бензимиды, такие как Hoechst 33258; фенантридины, такие как техаский красный, Yakima Yellow, Alexa Fluor, PET, бромистый этидий, акридиновые красители, карбазольные красители, феноксазиновые красители, порфириновые красители, полиметиновые красители и тому подобное.In the context of the present invention, fluorescence-based assays include the use of dyes which, for example, may be selected from the group consisting of FAM (5- or 6-carboxyfluorescein), VIC, NED, fluorescein, fluorescein isothiocyanate (FITC), IRD-700/800, cyanine dyes such as CY3, CY5, CY3.5, CY5.5, Cy7, xanthene, 6-carboxy-2',4',7',4,7-hexachlorofluorescein (HEX), TET, 6-carboxy-4 ',5'-dichloro-2',7'-dimethoxyfluorescein (JOE), N,N,N',N'-tetramethyl-6-carboxyrodamine (TAMPA), 6-carboxy-X-rhodamine (ROX), 5- carboxyrodamine-6G (R6G5), 6-carboxyrodamine-6G (RG6), rhodamine, rhodamine green, rhodamine red, rhodamine 110, BODIPY dyes such as BODIPY TMR, oregon green, coumarins such as umbelliferone, benzimides such as Hoechst 33258 ; phenanthridines such as Texas Red, Yakima Yellow, Alexa Fluor, PET, ethidium bromide, acridine dyes, carbazole dyes, phenoxazine dyes, porphyrin dyes, polymethine dyes, and the like.
В контексте настоящего изобретения анализы на основе хемилюминесценции включают применение красителей, действие которых основано на физических принципах, описанных для хемилюминесцентных материалов в Энциклопедии химической технологии Кирка-Отмера. Предпочтительными хемилюминесцентными красителями являются эфиры акридиния.In the context of the present invention, chemiluminescence-based assays involve the use of dyes that operate on the physical principles described for chemiluminescent materials in the Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology. Preferred chemiluminescent dyes are acridinium esters.
Хемилюминесцентная метка может представлять метку на основе эфира акридиния, стероидные метки, включая изолюминоловые метки и тому подобное.The chemiluminescent label may be an acridinium ester label, steroid labels including isoluminol labels, and the like.
Ферментные метки могут представлять лактатдегидрогеназу (LDH), креатининкиназу (CPK), щелочную фосфатазу, аспартатаминотрансферазу (AST), аланинаминотрансферазу (ALT), кислую фосфатазу, глюкозо-6-фосфатдегидрогеназу и тому подобное.Enzyme labels may represent lactate dehydrogenase (LDH), creatinine kinase (CPK), alkaline phosphatase, aspartate aminotransferase (AST), alanine aminotransferase (ALT), acid phosphatase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and the like.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению твердая фаза выбрана из группы, включающей полимерную поверхность (например, полистирол), стеклянную поверхность, целлюлозу и производные целлюлозы (например, нитроцеллюлозу, поливинилиденфторид, нейлон). В еще одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению твердая фаза выбрана из группы, включающей стеклянные или полимерные поверхности, где полимерная поверхность включает, не ограничиваясь этим, полистирол, поли(дивинилбензол), стирол-акриловый сополимер, стирол-бутадиеновый сополимер, стирол-дивинилбензольный сополимер, поли(стирол-оксиэтилен), полиметилметакрилат, полиуретан, полиглутаральдегид, полиэтиленимин, поливинилпирролидон, N,N'-метилен-бис-акриламид, полиолефины, полиэтилен, политетрафторэтилен, полиэтилентерефталат, полипропилен, поливинилхлорид, поливинилацетат, полиакрилонитрил, полисульфон, поли(сульфоновый эфир), полидиметилсилоксан, пиролизованные материалы, блок-сополимеры и сополимеры вышеуказанных соединений, силиконы или диоксид кремния.In yet another embodiment of the process of the present invention, the solid phase is selected from the group consisting of polymeric surface (eg polystyrene), glass surface, cellulose and cellulose derivatives (eg nitrocellulose, polyvinylidene fluoride, nylon). In yet another specific embodiment of the method of the present invention, the solid phase is selected from the group consisting of glass or polymeric surfaces, where the polymeric surface includes, but is not limited to, polystyrene, poly(divinylbenzene), styrene-acrylic copolymer, styrene-butadiene copolymer, styrene- divinylbenzene copolymer, poly(styrene-oxyethylene), polymethylmethacrylate, polyurethane, polyglutaraldehyde, polyethyleneimine, polyvinylpyrrolidone, N,N'-methylene-bis-acrylamide, polyolefins, polyethylene, polytetrafluoroethylene, polyethylene terephthalate, polypropylene, polyvinyl chloride, polyvinyl acetate, polyacrylonitrile, polysulfone, poly (sulfonic ether), polydimethylsiloxane, pyrolyzed materials, block copolymers and copolymers of the above compounds, silicones or silicon dioxide.
Любой материал является пригодным для такой поверхности/твердой фазы, при условии, что он служит для достижения целей настоящего изобретения. Предпочтительные примеры поверхностей включают полимерные поверхности и стеклянные поверхности. Группа полимерных поверхностей включает, не ограничиваясь этим: полистирол, поли(дивинилбензол), стирол-акриловый сополимер, стирол-бутадиеновый сополимер, стирол-дивинилбензольный сополимер, поли(стирол-оксиэтилен), полиметилметакрилат, полиуретан, полиглутаральдегид, полиэтиленимин, поливинилпирролидон, N,N'-метилен-бис-акриламид, полиолефины, полиэтилен, политетрафторэтилен, полиэтилентерефталат, полипропилен, поливинилхлорид, поливинилацетат, полиакрилонитрил, полисульфон, поли(сульфоновый эфир), полидиметилсилоксан, пиролизованные материалы, блок-сополимеры и сополимеры вышеуказанных соединений, силиконы или диоксид кремния, целлюлозу и производные целлюлозы (например, нитроцеллюлозу, поливинилиденфторид, нейлон). Предпочтительным материалом для поверхности является полистирол.Any material is suitable for such a surface/solid phase, provided that it serves to achieve the objectives of the present invention. Preferred examples of surfaces include polymeric surfaces and glass surfaces. The group of polymer surfaces includes, but is not limited to: polystyrene, poly(divinylbenzene), styrene-acrylic copolymer, styrene-butadiene copolymer, styrene-divinylbenzene copolymer, poly(styrene-oxyethylene), polymethylmethacrylate, polyurethane, polyglutaraldehyde, polyethyleneimine, polyvinylpyrrolidone, N, N'-methylene-bis-acrylamide, polyolefins, polyethylene, polytetrafluoroethylene, polyethylene terephthalate, polypropylene, polyvinyl chloride, polyvinyl acetate, polyacrylonitrile, polysulfone, poly(sulfonic ether), polydimethylsiloxane, pyrolyzed materials, block copolymers and copolymers of the above compounds, silicones or silicon dioxide , cellulose and cellulose derivatives (eg nitrocellulose, polyvinylidene fluoride, nylon). The preferred surface material is polystyrene.
Полистирол представляет гидрофобный полимер, который легко дериватизируется производителем. Микротитрационные планшеты для EIA обычно изготовлены из: 1) немодифицированного полистирола (например, планшеты pureGrade BRANDplates®), 2) модифицированного полистирола, который имеет ионизированную и гидрофобную поверхность (например, планшеты lipoGrade BRANDplates®, планшеты Thermo Scientific Microlite 1+), 3) полистирола, оптимизированного для связывания IgG (гидрофильного и гидрофобного; например, планшеты Greiner High Binding, immuneBRANDplates®) или 3) полистирола с гидрофильной или слабо связывающей поверхностью (например, планшеты Thermo Scientific MultiSorp, hydroGrade BRANDplates®). Полимерные поверхности, в том числе полистирольные микропланшеты, модифицируются физической бомбардировкой энергетическими частицами (ионами, электронами, быстрыми нейтралами и/или радикалами) и/или фотонами ультрафиолетового излучения или химическими реакциями на поверхности или рядом с ней (например, обработкой кислотой или обработкой органосиланами) (Hegemann et al., 2003, WO 9203732, DE 2018523 A1). Предпочтительной твердой фазой для настоящего изобретения является высокосвязывающий полистирольный микропланшет.Polystyrene is a hydrophobic polymer that is easily derivatized by the manufacturer. EIA microtiter plates are typically made from: 1) unmodified polystyrene (eg pureGrade BRANDplates ® ), 2) modified polystyrene that has an ionized and hydrophobic surface (eg lipoGrade BRANDplates ® ,
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения твердая фаза является немодифицированной (чистой) или модифицированной для того, чтобы быть гидрофильной, гидрофобной или оптимизированной для связывания IgG (высокосвязывающая: гидрофильная и гидрофобная) физической бомбардировкой энергетическими частицами (ионами, электронами, быстрыми нейтралами и/или радикалами) и фотонами ультрафиолетового излучения и/или химическими реакциями на поверхности или рядом с ней (например, обработкой кислотой или обработкой органосиланами).In yet another embodiment of the present invention, the solid phase is unmodified (pure) or modified to be hydrophilic, hydrophobic or optimized for IgG binding (high binding: hydrophilic and hydrophobic) by physical bombardment with energetic species (ions, electrons, fast neutrals and/or radicals) and ultraviolet radiation photons and/or chemical reactions at or near the surface (e.g. acid treatment or treatment with organosilanes).
В еще одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению поверхность твердой фазы используют в подходящих формах, таких как планшеты, мультилуночные планшеты, пробирки или шарики, пластины, пленки, частицы, магнитные или немагнитные частицы. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения форма поверхности твердой фазы представляет собой микротитрационный планшет.In yet another specific embodiment of the method of the present invention, the surface of the solid phase is used in suitable forms such as plates, multiwell plates, tubes or beads, plates, films, particles, magnetic or non-magnetic particles. In a preferred embodiment of the present invention, the shape of the solid phase surface is a microtiter plate.
В более конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению образец крови субъекта контактирует с ненасыщенной твердой фазой. Это означает, что твердая фаза на время, когда она контактирует с образцом, не является насыщенной/покрытой блокирующими агентами и/или связывающими молекулами, и/или стабилизирующими белками и/или соединяющими молекулами.In a more specific embodiment of the method of the present invention, the subject's blood sample is contacted with an unsaturated solid phase. This means that the solid phase, at the time it is in contact with the sample, is not saturated/coated with blocking agents and/or binding molecules and/or stabilizing proteins and/or connecting molecules.
Однако блокирующие агенты или стабилизирующие белки могут поддерживать имеющееся связывание ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой и связывающим агентом, когда образец уже конактировал с твердой фазой, что означает, что стабилизирующие/блокирующие молекулы/белки могут необязательно присутствовать на время детектирования комплекса иммобилизованный ApoE4-связывающий агент (на заявленной стадии b).However, blocking agents or stabilizing proteins may maintain the existing binding of ApoE4 or fragments thereof to the solid phase and the binding agent when the sample has already been in contact with the solid phase, which means that stabilizing/blocking molecules/proteins may not necessarily be present at the time of detection of the immobilized ApoE4-binding complex. agent (at the stated stage b).
В контексте настоящего изобретения термин «блокирующие агенты» включает, не ограничиваясь этим, растворы белков (например, бычьего сывороточного альбумина, человеческого сывороточного альбумина, молочных белков, казеина, рыбьего желатина) или цельную сыворотку (например, телячью сыворотку).In the context of the present invention, the term "blocking agents" includes, but is not limited to, protein solutions (eg, bovine serum albumin, human serum albumin, milk proteins, casein, fish gelatin) or whole whey (eg, calf whey).
В одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению твердая поверхность не покрыта каким-либо связывающим агентом или захватывающей молекулой. Как здесь используется, определение термина «связывающий агент», приведено выше.In one embodiment of the method of the present invention, the solid surface is not coated with any binding agent or capture molecule. As used here, the definition of the term "coupling agent" is given above.
В контексте настоящего изобретения «захватывающие молекулы» представляют молекулы, которые можно использовать для связывания молекул-мишеней или представляющих интерес молекул, т.е. аналитов (т.е. в контексте настоящего изобретения пептида(ов)) из образца. Таким образом, захватывающие молекулы должны иметь адекватную форму, как в пространственном отношении, так и в отношении поверхностных свойств, таких как поверхностный заряд, гидрофобность, гидрофильность, наличие или отсутствие доноров и/или акцепторов Льюиса, чтобы специфически связывать молекулы-мишени или представляющие интерес молекулы. Таким образом, связывание может быть опосредовано, например, ионными, ван-дер-ваальсовыми, пи-пи, сигма-пи, гидрофобными или обусловленными водородными связями взаимодействиями или комбинацией двух или более вышеуказанных взаимодействий между захватывающими молекулами и молекулами-мишенями или представляющими интерес молекулами. В контексте настоящего изобретения захватывающие молекулы могут, например, быть выбраны из группы, включающей молекулу нуклеиновой кислоты, молекулу углевода, молекулу PNA, белок, антитело, пептид или гликопротеин. Предпочтительно захватывающие молекулы представляют антитела, включая их фрагменты с достаточной аффинностью к мишени или представляющей интерес молекуле, и в том числе рекомбинантные антитела или фрагменты рекомбинантных антител, а также химически и/или биохимически модифицированные производные указанных антител или фрагментов, полученных из вариантной цепи длиной, по меньшей мере, 12 аминокислот.In the context of the present invention, "capture molecules" are molecules that can be used to bind target molecules or molecules of interest, ie. analytes (i.e., in the context of the present invention, peptide(s)) from the sample. Thus, capture molecules must be of adequate shape, both spatially and in terms of surface properties, such as surface charge, hydrophobicity, hydrophilicity, the presence or absence of Lewis donors and/or acceptors, in order to specifically bind target molecules or molecules of interest. molecules. Thus, binding may be mediated, for example, by ionic, van der Waals, pi-pi, sigma-pi, hydrophobic, or hydrogen-bonded interactions, or a combination of two or more of the above interactions between capturing molecules and target molecules or molecules of interest. . In the context of the present invention, capture molecules may, for example, be selected from the group consisting of a nucleic acid molecule, a carbohydrate molecule, a PNA molecule, a protein, an antibody, a peptide, or a glycoprotein. Preferably, capture molecules are antibodies, including fragments thereof with sufficient affinity for the target or molecule of interest, and including recombinant antibodies or recombinant antibody fragments, as well as chemically and/or biochemically modified derivatives of said antibodies or fragments derived from a variant chain of length, at least 12 amino acids.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению стабилизирующий белок поддерживает имеющееся связывание ApoE4 или его фрагментов из образца крови с твердой фазой, где указанный белок может быть необязательно добавлен в реакционный буфер.In yet another embodiment of the method of the present invention, the stabilizing protein maintains the existing binding of ApoE4 or fragments thereof from the solid phase blood sample, where said protein may optionally be added to the reaction buffer.
Реакционные буферы для иммуноанализов обычно содержат стабилизирующие/блокирующие белки (например, бычий сывороточный альбумин, человеческий сывороточный альбумин, молочные белки, казеин, желатин, иммуноглобулины). Эти дополнительные белки предотвращают неспецифическое связывание с твердой фазой и стабилизируют партнеров по связыванию (связывающий агент и антиген), а также взаимодействие связывающий агент-антиген. Удивительно, что добавление таких стабилизирующих/блокирующих белков в реакцию усиливает связывание ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой (см. пример 6).Reaction buffers for immunoassays typically contain stabilizing/blocking proteins (eg, bovine serum albumin, human serum albumin, milk proteins, casein, gelatin, immunoglobulins). These additional proteins prevent non-specific binding to the solid phase and stabilize binding partners (binding agent and antigen) as well as binding agent-antigen interaction. Surprisingly, the addition of such stabilizing/blocking proteins to the reaction enhances the binding of ApoE4 or its fragments to the solid phase (see example 6).
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению стабилизирующий белок выбран из группы, включающей бычий сывороточный альбумин (BSA), человеческий сывороточный альбумин, казеин, молочные белки, иммуноглобулины, стабилизирующие аминокислоты (например, аланин, аргинин, глицин, изолейцин, лизин, пролин, серин) и тому подобное. Предпочтительным стабилизирующим белком является бычий сывороточный альбумин (BSA).In yet another embodiment of the method of the present invention, the stabilizing protein is selected from the group consisting of bovine serum albumin (BSA), human serum albumin, casein, milk proteins, immunoglobulins, stabilizing amino acids (e.g., alanine, arginine, glycine, isoleucine, lysine, proline , serine) and the like. The preferred stabilizing protein is bovine serum albumin (BSA).
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению концентрация BSA находится в диапазоне 0-10%, предпочтительно 0,2-5%, наиболее предпочтительно 0,5-2,5%.In yet another embodiment of the method of the present invention, the concentration of BSA is in the range of 0-10%, preferably 0.2-5%, most preferably 0.5-2.5%.
В еще одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению присутствие других белков, отличных от ApoE4, в образце крови не влияет на детектирование ApoE4 или его фрагментов.In yet another specific embodiment of the method of the present invention, the presence of proteins other than ApoE4 in the blood sample does not affect the detection of ApoE4 or fragments thereof.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению контактирование образца крови субъекта с твердой фазой и контактирование указанного образца, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4 или его фрагментом, происходит в одностадийной или двустадийной процедуре (см. пример 5).In yet another embodiment of the method of the present invention, contacting a blood sample of a subject with a solid phase and contacting said sample with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4 or a fragment thereof occurs in a one-step or two-step procedure (see example 5 ).
В контексте настоящего изобретения термин «одностадийная процедура» означает, что иммобилизация ApoE4 или его фрагментов на твердой фазе и связывание ApoE4 или его фрагментов с меченым связывающим агентом (например, антителом) выполняются одновременно в одном и том же сосуде. Во время такого рода процедуры ApoE4 один, и затем специфический связывающий агент и/или комплексы ApoE4-связывающий агент иммобилизуются на твердой фазе.In the context of the present invention, the term "one-step procedure" means that the immobilization of ApoE4 or its fragments on the solid phase and the binding of ApoE4 or its fragments to a labeled binding agent (eg, antibody) are performed simultaneously in the same vessel. During this kind of procedure, the ApoE4 alone and then the specific binding agent and/or the ApoE4-binding agent complexes are immobilized on the solid phase.
Как здесь используется, термин «двустадийная процедура» означает, что иммобилизация ApoE4 или его фрагментов на твердой фазе и связывание ApoE4 или его фрагментов специфическим связывающим агентом происходит на временные точки постадийно, необязательно, со стадией промывания между стадиями инкубации. Например, ApoE4 может быть вначале иммобилизован на твердой фазе, и затем ApoE4-специфический меченный связывающий агент будет связываться с иммобилизованным ApoE4. Другая возможность состоит в том, что ApoE4 и ApoE4-специфический меченный связывающий агент инкубируют на первой стадии для обеспечения образования комплексов ApoE4-связывающий агент, и на второй стадии комплексы ApoE4-связывающий агент иммобилизуют на твердой фазе.As used here, the term "two-step procedure" means that the immobilization of ApoE4 or its fragments on the solid phase and the binding of ApoE4 or its fragments with a specific binding agent occurs at time points in steps, optionally with a washing step between the incubation steps. For example, ApoE4 may be first immobilized on solid phase and then an ApoE4-specific labeled binding agent will bind to the immobilized ApoE4. Another possibility is that the ApoE4 and the ApoE4-specific labeled binding agent are incubated in the first step to allow formation of the ApoE4-binding agent complexes, and in the second stage the ApoE4-binding agent complexes are immobilized on the solid phase.
В еще одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению комплекс ApoE4-связующий агент детектируется качественно или количественно, где качественное детектирование комплекса ApoE4-связующий агент указывает на присутствие ApoE4 или его фрагментов в указанном образце, и где количественное определение комплекса ApoE4-связывающий агент указывает на концентрацию ApoE4 или его фрагментов в указанном образце.In yet another specific embodiment of the method of the present invention, the ApoE4-binding agent complex is detected qualitatively or quantitatively, wherein the qualitative detection of the ApoE4-binding agent complex indicates the presence of ApoE4 or fragments thereof in said sample, and where the quantitative detection of the ApoE4-binding agent complex indicates the concentration of ApoE4 or its fragments in the specified sample.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению количественное определение концентрации ApoE4 или его фрагментов показывает, насколько субъекты являются гомозиготными или гетерозиготными по аллелям ApoE4.In yet another embodiment of the method of the present invention, the quantitative determination of the concentration of ApoE4 or its fragments shows how the subjects are homozygous or heterozygous for ApoE4 alleles.
В еще одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению присутствие комплекса ApoE4-связывающий агент коррелирует с риском развития/заболеваемостью AD.In yet another specific embodiment of the method of the present invention, the presence of the ApoE4-binding agent complex correlates with the risk of developing/morbidity of AD.
В одном конкретном варианте осуществления способа по настоящему изобретению детектирование ApoE4 используется для определения риска развития болезни Альцгеймера (AD).In one specific embodiment of the method of the present invention, ApoE4 detection is used to determine the risk of developing Alzheimer's disease (AD).
Предметом настоящего изобретения также является способ прогнозирования риска заболеваемости болезнью Альцгеймера, а также медицинских последствий всех вышеуказанных заболеваний и инфекций.The subject of the present invention is also a method for predicting the risk of Alzheimer's disease, as well as the medical consequences of all the above diseases and infections.
В одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению детектирование иммобилизованного ApoE4 в комплексе ApoE4-связывающий агент используется для классификации субъекта, как ApoE4-позитивного или ApoE4-негативного, когда уровень детектированного ApoE4 в комплексе ApoE4-связывающий агент выше определенного порогового значения, где указанное пороговое значение определяется конкретным значением внутреннего положительного контроля.In one embodiment of the method of the present invention, the detection of immobilized ApoE4 in the ApoE4-binding agent complex is used to classify a subject as ApoE4-positive or ApoE4-negative when the level of detected ApoE4 in the ApoE4-binding agent complex is above a certain threshold value, where the specified threshold value determined by the specific value of the internal positive control.
В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению уровень комплекса ApoE4-связывающий агент выше определенного порогового значения является прогностическим для повышенного риска заболеваемости AD, где указанное пороговое значение определяется внутренним контролем отсечения.In yet another embodiment of the method of the present invention, the level of the ApoE4-binding agent complex above a certain threshold is predictive of an increased risk of AD morbidity, where said threshold is determined by an internal cut-off control.
Согласно способу по настоящему изобретению ApoE4-позитивные образцы крови субъектов имеют значение выше, чем конкретный уровень внутреннего контроля отсечения (= порогового значения). В более предпочтительном варианте осуществления пороговое значение примерно в 1,5-100 раз ниже уровня в ApoE4-позитивных образцах, предпочтительно в 1,5-20 раз ниже, наиболее предпочтительно в 1,5-10 раз ниже. ApoE4-негативные образцы имеют значение ниже, чем внутренний контроль отсечения. В более предпочтительном варианте осуществления пороговое значение примерно в 10-10000 раз выше, чем уровень в ApoE4-негативных образцах, предпочтительно в 50-5000 раз выше, наиболее предпочтительно в 100-1000 раз выше.According to the method of the present invention, ApoE4-positive blood samples of subjects have a value higher than a specific level of internal control cut-off (= threshold value). In a more preferred embodiment, the threshold value is about 1.5-100 times lower than the level in ApoE4 positive samples, preferably 1.5-20 times lower, most preferably 1.5-10 times lower. ApoE4-negative samples have a lower value than the internal cut-off control. In a more preferred embodiment, the threshold value is about 10-10000 times higher than the level in ApoE4 negative samples, preferably 50-5000 times higher, most preferably 100-1000 times higher.
В контексте настоящего изобретения уровень ApoE4 выше указанного порогового значения указывает на присутствие ApoE4 у пациента и, таким образом, высокий риск развития/заболеваемости AD. Уровень ApoE4 ниже указанного порогового значения указывает на отсутствие ApoE4 у пациента и, таким образом, низкий риск развития/заболеваемости AD.In the context of the present invention, an ApoE4 level above this threshold indicates the presence of ApoE4 in the patient and thus a high risk of developing/morbidity with AD. An ApoE4 level below this threshold indicates the absence of ApoE4 in the patient and thus a low risk of developing/incidence of AD.
В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения для качественного детектирования комплекса ApoE4-связывающий агент уровень ApoE4 или его фрагментов измеряют с помощью иммуноанализа с использованием антител или фрагментов антител. ApoE4-позитивные и ApoE4-негативные образцы разделяются по пороговому значению, который определяется конкретным внутренним контролем отсечения, где все ApoE4-негативные образцы показывают только фоновый сигнал, и все ApoE4-позитивные образцы имеют сигнал, по меньшей мере, в 1,5 раза выше, чем контроль отсечения (см. примеры 5, 6 и 7).In a specific embodiment of the present invention, for qualitative detection of the ApoE4-binding agent complex, the level of ApoE4 or fragments thereof is measured by an immunoassay using antibodies or antibody fragments. ApoE4-positive and ApoE4-negative samples are separated by a threshold, which is determined by a specific internal cut-off control, where all ApoE4-negative samples show only background signal, and all ApoE4-positive samples have a signal at least 1.5 times higher than clipping control (see examples 5, 6 and 7).
Еще одним вариантом осуществления настоящего изобретения является оценка измеренных единиц (т.е. единиц флуоресценции, люминесценции, ферментативной реакции и т. д.), которые соответствуют уровню детектированных уровней ApoE4, которые можно анализировать количественно с использованием калибраторов ApoE4 со стандартными концентрациями (см. пример 7). Посредством количественного анализа ApoE4-позитивная группа по настоящему изобретению может быть дополнительно разделена на две группы, которые соответствуют субъектам, которые являются гомозиготными или гетерозиготными по аллелям ApoE4 с использованием определенного порогового значения. Такое конкретное пороговое значение можно определить анализом ранее генотипированных гомозиготных или гетерозиготных образцов.Another embodiment of the present invention is the evaluation of measured units (i.e., units of fluorescence, luminescence, enzymatic reaction, etc.) that correspond to the level of detected levels of ApoE4, which can be analyzed quantitatively using ApoE4 calibrators with standard concentrations (see. example 7). Through quantitative analysis, the ApoE4-positive group of the present invention can be further divided into two groups, which correspond to subjects that are homozygous or heterozygous for ApoE4 alleles using a certain threshold value. Such a specific threshold can be determined by analysis of previously genotyped homozygous or heterozygous samples.
Одним из вариантов осуществления настоящего изобретения является корреляция присутствия ApoE4/комплекса ApoE4- связывающий агент с риском развития/заболеваемости AD. Оценка результатов указывает на низкий риск развития/заболеваемости AD у ApoE4-негативных субъектов и указывает на высокий риск развития/заболеваемости AD у ApoE4-позитивных субъектов.One embodiment of the present invention is to correlate the presence of ApoE4/ApoE4-binding agent complex with the risk of developing/morbidity of AD. Evaluation of the results indicates a low risk of development/incidence of AD in ApoE4-negative subjects and indicates a high risk of development/incidence of AD in ApoE4-positive subjects.
В одном варианте осуществления изобретения способ используется для стратификации риска или стратификации применения терапевтических мероприятий для заболевания или патологического состояния, ассоциированного с повышенными уровнями ApoE4.In one embodiment of the invention, the method is used to stratify risk or stratify the use of therapeutic interventions for a disease or condition associated with elevated levels of ApoE4.
В еще одном варианте осуществления изобретения заболевание или патологическое состояние выбрано из группы когнитивного нарушения и нейродегенеративных заболеваний, включая деменцию и/ или болезнь Альцгеймера.In yet another embodiment of the invention, the disease or pathological condition is selected from the group of cognitive impairment and neurodegenerative diseases, including dementia and/or Alzheimer's disease.
Предметом изобретения также является анализ, который обеспечивает осуществление способа детектирования ApoE4 или его фрагментов.The subject of the invention is also an assay that provides a method for detecting ApoE4 or fragments thereof.
В контексте настоящего изобретения анализ включает все тестовые компоненты, которые необходимы для осуществления способа по настоящему изобретению. Однако, как здесь указывалось, «анализ» представляет собой не только коробку или блок, содержащий указанные тестовые компоненты, а скорее функциональную комбинацию всех взаимодействующих компонентов, обеспечивающую осуществление заявленного способа по настоящему изобретению.In the context of the present invention, the assay includes all test components that are necessary to carry out the method of the present invention. However, as stated here, "assay" is not only a box or block containing these test components, but rather a functional combination of all interacting components, providing the implementation of the claimed method of the present invention.
Указанный анализ по настоящему изобретению обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению также в виде полностью автоматизированной системы анализа, например, на платформе, доступной на рынке (Roche cobas®, Abbott Architect®, Siemens Centauer®, Brahms Kryptor®, Biomerieux Vidas®, Alere Triage®).Said assay of the present invention enables the implementation of the method of the present invention also as a fully automated assay system, for example on a platform available on the market (Roche cobas ® , Abbott Architect ® , Siemens Centauer ® , Brahms Kryptor ® , Biomerieux Vidas ® , Alere Triage ® ).
В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения анализ обеспечивает осуществление способа детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта, включающего следующие стадии:In a specific embodiment of the present invention, the assay provides for a method for detecting ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the following steps:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе через ApoE4 или ApoE4 иммобилизован на указанной твердой фазе, и связывающий агент с ApoE4.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase via ApoE4 or ApoE4 immobilized on said solid phase, and the binding agent to ApoE4.
В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения анализ обеспечивает осуществление способа детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта, включающего следующие стадии:In a specific embodiment of the present invention, the assay provides for a method for detecting ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the following steps:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе через ApoE4 или ApoE4 иммобилизован на указанной твердой фазе, где твердая фаза не покрыта каким-либо связывающим агентом или захватывающей молекулой и где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит в присутствии детергента.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase via ApoE4 or ApoE4 immobilized on said solid phase, where the solid phase is not coated with any binding agent or capture molecule and where binding of ApoE4 or ApoE4 complex is the binding agent with said solid phase occurs in the presence of a detergent.
В контексте настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на твердой фазе через ApoE4, и связывающий агент связан с ApoE4.In the context of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention wherein the ApoE4-binding agent complex is immobilized on the solid phase via ApoE4 and the binding agent is bound to ApoE4.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где связывание ApoE4 с твердой фазой происходит без взаимодействия соединяющей молекулы (которая способна связывать/соединять ApoE4 или его фрагменты) с указанной твердой фазой).In one embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the binding of ApoE4 to a solid phase occurs without the interaction of a linking molecule (which is capable of binding/linking ApoE4 or fragments thereof) to said solid phase).
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где на время контактирования твердой фазы с образцом указанное контактирование происходит без взаимодействия указанной соединяющей молекулы.In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention wherein, for the duration of contact of the solid phase with the sample, said contact occurs without interaction of said connecting molecule.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где связывание ApoE4 с твердой фазой происходит в присутствии детергента.In yet another embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the binding of ApoE4 to the solid phase occurs in the presence of a detergent.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где концентрация детергента в реагенте предпочтительно составляет от 0,0001 до 10% (мас./об.) и особенно предпочтительно от 0,01 до 1% (мас./об.). Специалист в данной области знает, что можно предусматривать применение определенного диапазона концентраций для каждого конкретного детергента.In one embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the concentration of detergent in the reagent is preferably from 0.0001 to 10% (w/v) and particularly preferably from 0.01 to 1% (w/v). about.). The person skilled in the art knows that it is possible to provide for the use of a certain range of concentrations for each particular detergent.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где твин-20 используется в концентрации 0,001-10%, предпочтительно 0,01-1%, наиболее предпочтительно 0,2-0,5%. В еще одном варианте осуществления способа по настоящему изобретению тритон Х-100 используется в концентрации 0,001-0,5%, предпочтительно 0,01-0,2%, наиболее предпочтительно 0,05-0,1%.In a preferred embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention wherein Tween-20 is used at a concentration of 0.001-10%, preferably 0.01-1%, most preferably 0.2-0.5%. In yet another embodiment of the method of the present invention, Triton X-100 is used at a concentration of 0.001-0.5%, preferably 0.01-0.2%, most preferably 0.05-0.1%.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где связывающий агент специфически связывается с ApoE4 или его фрагментами.In a preferred embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention wherein the binding agent specifically binds to ApoE4 or fragments thereof.
В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный IgG, с константой аффинности связывания, по меньшей мере, 107 М-1, предпочтительно 108 М-1, предпочтительной константой аффинности выше 109 М-1, наиболее предпочтительно выше 1010 М-1.In a further embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the binding agent is an antibody or functional antibody fragment or scaffold protein other than IgG with a binding affinity constant of at least 10 7 M -1 , preferably 10 8 M -1 preferred affinity constant above 10 9 M -1 most preferably above 10 10 M -1 .
В более предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где связывающий агент помечен детектируемой меткой для детектирования после связывания с ApoE4.In a more preferred embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the binding agent is labeled with a detectable label for detection after binding to ApoE4.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где метка связывающего агента выбрана из группы, включающей хемилюминесцентную метку, ферментную метку, флуоресцентную метку, метку на основе радиоактивного йода. Количество меченого антитела, связанного с аналитом, затем измеряют соответствующим методом.In a preferred embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the binding agent label is selected from the group consisting of a chemiluminescent label, an enzyme label, a fluorescent label, a radioactive iodine label. The amount of labeled antibody bound to the analyte is then measured by an appropriate method.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где метка связывающего агента выбрана из группы, включающей криптаты редкоземельных металлов или хелаты редкоземельных металлов в сочетании с флуоресцентным красителем или хемилюминесцентным красителем, в частности, красителем цианинового типа.In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the binding agent label is selected from the group consisting of rare earth metal cryptates or rare earth metal chelates in combination with a fluorescent dye or a chemiluminescent dye, in particular a cyanine type dye.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где твердая фаза выбрана из группы, состоящей из полимерной поверхности (например, полистирола), стеклянной поверхности, целлюлозы и производных целлюлозы (например, нитроцеллюлозы, поливинилиденфторида, нейлона).In yet another embodiment of the present invention, said analysis provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the solid phase is selected from the group consisting of a polymeric surface (e.g., polystyrene), a glass surface, cellulose, and cellulose derivatives (e.g., nitrocellulose, polyvinylidene fluoride, nylon).
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где твердая фаза выбрана из группы, состоящей из стеклянных или полимерных поверхностей, где полимерная поверхность включает, не ограничиваясь этим, полистирол, поли(дивинилбензол), стирол-акриловый сополимер, стирол-бутадиеновый сополимер, стирол-дивинилбензольный сополимер, поли(стирол-оксиэтилен), полиметилметакрилат, полиуретан, полиглутаральдегид, полиэтиленимин, поливинилпирролидон, N,N'-метилен-бис-акриламид, полиолефины, полиэтилен, политетрафторэтилен, полиэтилентерефталат, полипропилен, поливинилхлорид, поливинилацетат, полиакрилонитрил, полисульфон, поли(сульфоновый эфир), полидиметилсилоксан, пиролизованные материалы, блок-сополимеры и сополимеры вышеуказанных соединений, силиконы или диоксид кремния.In yet another embodiment of the present invention, said analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the solid phase is selected from the group consisting of glass or polymeric surfaces, where the polymeric surface includes, but is not limited to, polystyrene, poly(divinylbenzene), styrene-acrylic copolymer , styrene-butadiene copolymer, styrene-divinylbenzene copolymer, poly(styrene-oxyethylene), polymethyl methacrylate, polyurethane, polyglutaraldehyde, polyethyleneimine, polyvinylpyrrolidone, N,N'-methylene-bis-acrylamide, polyolefins, polyethylene, polytetrafluoroethylene, polyethylene terephthalate, polypropylene, polyvinyl chloride , polyvinyl acetate, polyacrylonitrile, polysulfone, poly(sulfonic ether), polydimethylsiloxane, pyrolyzed materials, block copolymers and copolymers of the above compounds, silicones or silicon dioxide.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где твердая фаза является немодифицированной (чистой) или модифицированной для того, чтобы быть гидрофильной, гидрофобной или оптимизированной для связывания IgG (высокосвязывающая: гидрофильная и гидрофобная) физической бомбардировкой энергетическими частицами (ионами, электронами, быстрыми нейтралами и/или радикалами) и фотонами ультрафиолетового излучения и/или химическими реакциями на поверхности или рядом с ней (например, обработкой кислотой или обработкой органосиланами).In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the solid phase is unmodified (pure) or modified to be hydrophilic, hydrophobic, or optimized for IgG binding (high binding: hydrophilic and hydrophobic) by physical bombardment with energetic particles. (ions, electrons, fast neutrals and/or radicals) and photons of ultraviolet radiation and/or chemical reactions on or near the surface (for example, acid treatment or treatment with organosilanes).
В еще одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где поверхность твердой фазы используется в подходящих формах, таких как планшеты, мультилуночные планшеты, пробирки или шарики, пластины, пленки, частицы, магнитные или немагнитные частицы. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения форма поверхности твердой фазы представляет собой микротитрационный планшет.In yet another specific embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention wherein the solid phase surface is used in suitable forms such as plates, multiwell plates, tubes or beads, plates, films, particles, magnetic or non-magnetic particles. In a preferred embodiment of the present invention, the shape of the solid phase surface is a microtiter plate.
В более конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где образец крови субъекта контактирует с ненасыщенной твердой фазой. Это означает, что твердая фаза на время, когда она контактирует с образцом, не является насыщенной/покрытой блокирующими агентами и/или связывающими молекулами, и/или стабилизирующими белками и/или соединяющими молекулами.In a more specific embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the blood sample of the subject is contacted with an unsaturated solid phase. This means that the solid phase, at the time it is in contact with the sample, is not saturated/coated with blocking agents and/or binding molecules and/or stabilizing proteins and/or connecting molecules.
Однако блокирующие агенты или стабилизирующие белки могут поддерживать имеющееся связывание ApoE4 или его фрагментов с твердой фазой и связывающим агентом, когда образец уже связан с твердой фазой, что означает, что стабилизирующие/блокирующие молекулы/белки могут необязательно присутствовать на время детектирования комплекса иммобилизованный ApoE4-связывающий агент (на заявленной стадии b).However, blocking agents or stabilizing proteins may maintain the existing binding of ApoE4 or fragments thereof to the solid phase and the binding agent when the sample is already bound to the solid phase, which means that the stabilizing/blocking molecules/proteins may not necessarily be present at the time of detection of the immobilized ApoE4-binding complex. agent (at the stated stage b).
В одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где твердая фаза не покрыта каким-либо связывающим агентом или захватывающей молекулой. Как здесь используется, определение термина «связывающий агент», приведено выше.In one embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the solid phase is not coated with any binding agent or capture molecule. As used here, the definition of the term "coupling agent" is given above.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где стабилизирующий белок поддерживает имеющееся связывание ApoE4 из образца крови с твердой фазой, где указанный белок может быть необязательно добавлен в реакционный буфер.In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the stabilizing protein maintains the present binding of ApoE4 from the solid phase blood sample, wherein said protein may optionally be added to the reaction buffer.
В одном дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где стабилизирующий белок выбран из группы, включающей бычий сывороточный альбумин (BSA), человеческий сывороточный альбумин, казеин, молочные белки, иммуноглобулины, стабилизирующие аминокислоты (например, аланин, аргинин, глицин, изолейцин, лизин, пролин, серин) и тому подобное. Предпочтительным стабилизирующим белком является бычий сывороточный альбумин (BSA).In one further embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the stabilizing protein is selected from the group consisting of bovine serum albumin (BSA), human serum albumin, casein, milk proteins, immunoglobulins, stabilizing amino acids (e.g., alanine, arginine , glycine, isoleucine, lysine, proline, serine) and the like. The preferred stabilizing protein is bovine serum albumin (BSA).
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где концентрация BSA находится в диапазоне 0-10%, предпочтительно 0,2-5%, наиболее предпочтительно 0,5-2,5%.In yet another embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method according to the present invention, where the concentration of BSA is in the range of 0-10%, preferably 0.2-5%, most preferably 0.5-2.5%.
В еще одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где присутствие других белков, отличных от ApoE4, в образце крови не влияет на детектирование ApoE4 или его фрагментов.In yet another specific embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, where the presence of other proteins other than ApoE4 in the blood sample does not affect the detection of ApoE4 or fragments thereof.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где контактирование образца крови субъекта с твердой фазой и контактирование указанного образца, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4 или его фрагментом, происходит в одностадийной или двустадийной процедуре (см. пример 5).In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein contacting a blood sample of a subject with a solid phase and contacting said sample with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4 or a fragment thereof occurs in a single step. or a two-stage procedure (see example 5).
В еще одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где способ детектирования ApoE4 или его фрагментов, комплекса ApoE4-связывающий агент, детектирует качественно или количественно, где качественное детектирование комплекса ApoE4-связующий агент указывает на присутствие ApoE4 или его фрагментов в указанном образце, и где количественное определение комплекса ApoE4-связывающий агент указывает на концентрацию ApoE4 или его фрагментов в указанном образце.In yet another specific embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the method for detecting ApoE4 or fragments thereof, the ApoE4-binding agent complex, detects qualitatively or quantitatively, wherein the qualitative detection of the ApoE4-binding agent complex indicates the presence of ApoE4 or its fragments in the specified sample, and where the quantitative determination of the complex ApoE4-binding agent indicates the concentration of ApoE4 or its fragments in the specified sample.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где количественное определение концентрации ApoE4 показывает, насколько субъекты являются гомозиготными или гетерозиготными по аллелям ApoE4.In yet another embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the quantitative determination of the concentration of ApoE4 shows how subjects are homozygous or heterozygous for ApoE4 alleles.
В еще одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где присутствие комплекса ApoE4-связывающий агент коррелирует с риском развития/заболеваемости AD.In yet another specific embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the presence of an ApoE4-binding agent complex correlates with the risk of developing/incidence of AD.
В одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где детектирование ApoE4 или его фрагментов используется для определения риска развития болезни Альцгеймера (AD).In one specific embodiment of the present invention, the specified analysis provides for the implementation of the method of the present invention, where the detection of ApoE4 or its fragments is used to determine the risk of developing Alzheimer's disease (AD).
В еще одном конкретном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где детектирование ApoE4 или его фрагментов используется для прогнозирования риска заболеваемости болезнью Альцгеймера, а также медицинских последствий всех вышеуказанных заболеваний и инфекций.In yet another specific embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, where the detection of ApoE4 or fragments thereof is used to predict the risk of Alzheimer's disease, as well as the medical consequences of all of the above diseases and infections.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где детектирование иммобилизованного ApoE4 в комплексе ApoE4-связывающий агент используется для классификации субъекта, как ApoE4-позитивного или ApoE4-негативного, когда уровень детектированного ApoE4 в комплексе ApoE4-связывающий агент выше определенного порогового значения, где указанное пороговое значение определяется конкретным значением внутреннего положительного контроля.In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, wherein the detection of immobilized ApoE4 in the ApoE4-binding agent complex is used to classify a subject as ApoE4-positive or ApoE4-negative when the level of detected ApoE4 in the ApoE4-binding agent complex above a certain threshold value, where the specified threshold value is determined by a specific value of the internal positive control.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный анализ обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где уровень комплекса ApoE4-связывающий агент выше определенного порогового значения является прогностическим для повышенного риска заболеваемости AD, где указанное пороговое значение определяется внутренним контролем отсечения.In yet another embodiment of the present invention, said assay provides for the implementation of the method of the present invention, where the level of the ApoE4-binding agent complex above a certain threshold is predictive of an increased risk of AD morbidity, where said threshold is determined by an internal cut-off control.
Согласно способу по настоящему изобретению ApoE4-позитивные образцы крови субъектов со значением выше, чем уровень отсечения, где отсечение определяют измерением ApoE4-негативного образца и ApoE4-позитивного образца и вычислением отношения.According to the method of the present invention, ApoE4-positive blood samples of subjects with a value higher than the cut-off level, where the cut-off is determined by measuring the ApoE4-negative sample and the ApoE4-positive sample and calculating the ratio.
В одном варианте осуществления отношение рассчитывается следующим образом:In one embodiment, the ratio is calculated as follows:
[Сигнал]негCO+коэффициент X, умноженный на [Сигнал]позCO, где коэффициент равен >0 и <1.[Signal] neg CO+X factor multiplied by [Signal] pos CO where the factor is >0 and <1.
Согласно способу по настоящему изобретению в одном варианте осуществления ApoE4-позитивные образцы крови субъектов имеют значение выше, чем уровень отсечения (порогового значения), где пороговое значение определяют измерением сигнала отрицательного контроля ApoE4 и вычислением от 1,5- до 100000-кратного сигнала, более предпочтительно от 10- до 50000-кратного сигнала, еще более предпочтительно от 20- до 20000-кратного сигнала, наиболее предпочтительно от 50- до 10000-кратного сигнала, наиболее предпочтительно от 100- до 1000-кратного сигнала. Согласно способу по настоящему изобретению ApoE4-позитивные образцы крови субъектов имеют значение выше, чем уровень отсечения (порогового значения), где пороговое значение определяют измерением сигнала положительного контроля ApoE4 и умножением значения сигнала на коэффициент > 0 и <1, более предпочтительно >0,01 и <0,8, еще более предпочтительно >0,05 и <0,5, наиболее предпочтительно >0,1 и <0,25.According to the method of the present invention, in one embodiment, ApoE4-positive blood samples of subjects have a value greater than a cut-off level (cut-off value), where the cut-off value is determined by measuring the ApoE4 negative control signal and calculating from 1.5- to 100,000-fold signal, greater than preferably 10 to 50,000 times the signal, even more preferably 20 to 20,000 times the signal, most preferably 50 to 10,000 times the signal, most preferably 100 to 1000 times the signal. According to the method of the present invention, ApoE4-positive blood samples from subjects have a value greater than a cut-off level (cut-off value), where the cut-off value is determined by measuring the ApoE4 positive control signal and multiplying the signal value by a factor of >0 and <1, more preferably >0.01 and <0.8, even more preferably >0.05 and <0.5, most preferably >0.1 and <0.25.
В конкретном варианте осуществления настоящего изобретения анализ используется для определения уровня ApoE4 и его фрагментов, содержащих, по меньшей мере, 6 аминокислот, где чувствительность определения в указанном анализе позволяет детектировать/количественно определять ApoE4 и его фрагменты в образце крови субъектов, и она составляет <1 нг/мл, предпочтительно <5 нг/мл, более предпочтительно <10 нг/мл и еще более предпочтительно <25 нг/мл.In a specific embodiment of the present invention, the assay is used to determine the level of ApoE4 and its fragments containing at least 6 amino acids, where the sensitivity of the determination in the specified analysis allows the detection/quantification of ApoE4 and its fragments in a blood sample of subjects, and it is <1 ng/ml, preferably <5 ng/ml, more preferably <10 ng/ml and even more preferably <25 ng/ml.
Предметом изобретения также является анализ, который обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, где уровень ApoE4 или его фрагментов измеряют с использованием иммуноанализа, включающего один или несколько захватывающих зондов, направленных против одного или нескольких эпитопов ApoE4 или их фрагментов.The subject of the invention is also an assay that provides for the implementation of the method of the present invention, where the level of ApoE4 or fragments thereof is measured using an immunoassay comprising one or more capture probes directed against one or more ApoE4 epitopes or fragments thereof.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения указанный иммуноанализ выбран из группы, включающей радиоиммуноанализ (RIA), гомогенный иммуноферментный иммуноанализ (EMIT), твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA), иммуноанализ с реактивацией апофермента (ARIS), иммуноанализ с тест-полоской и иммунохроматографические анализы.In one embodiment of the present invention, said immunoassay is selected from the group consisting of radioimmunoassay (RIA), homogeneous enzyme immunoassay (EMIT), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), apoenzyme reactivation immunoassay (ARIS), test strip immunoassay, and immunochromatographic assays.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения таким анализом может быть так называемый POC-тест (анализ на месте лечения), который представляет технологию тестирования, которая позволяет выполнять анализ в течение менее 1 ч рядом с пациентом без необходимости в полностью автоматизированной системы анализа. Одним из примеров этой технологии является технология иммунохроматографического анализа.In yet another embodiment of the present invention, such an assay may be a so-called POC test (point-of-care assay), which is a testing technology that allows the assay to be performed in less than 1 hour at the patient's side without the need for a fully automated assay system. One example of this technology is the immunochromatographic assay technology.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения таким анализом является иммуноанализ методом одного антитела с применением любого типа технологии детектирования, включая, не ограничиваясь этим, ферментную метку, хемилюминесцентную метку, электрохемилюминесцентную метку, предпочтительно полностью автоматизированный анализ. Примеры автоматизированного или полностью автоматизированного анализа включают анализы, которые можно использовать для одной из следующих систем: Roche Elecsys®, Abbott Architect®, Siemens Centauer®, Brahms Kryptor®, Biomerieux Vidas®, Alere Triage®.In yet another embodiment of the present invention, such an assay is a single antibody immunoassay using any type of detection technology, including, but not limited to, an enzyme label, a chemiluminescent label, an electrochemiluminescent label, preferably a fully automated assay. Examples of automated or fully automated assays include assays that can be used for one of the following systems: Roche Elecsys® , Abbott Architect®, Siemens Centauer®, Brahms Kryptor® , Biomerieux Vidas® , Alere Triage® .
Еще одним предметом настоящего изобретения является анализ, который обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, включающий тестовые компоненты:Another subject of the present invention is an assay that provides for the implementation of the method of the present invention, including test components:
а. один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,a. one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
b. твердую фазу (например, планшет, пробирку, шарики, пластину),b. solid phase (e.g. plate, test tube, beads, plate),
с. реакционный буфер, содержащий детергент.with. reaction buffer containing detergent.
Еще один вариант осуществления настоящего изобретения представляет анализ, который обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, включающий:Yet another embodiment of the present invention provides an assay that enables the implementation of the method of the present invention, comprising:
а. один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,a. one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
b. полимерную или стеклянную твердую фазу, предпочтительно высокосвязывающий полистирольный микропланшет,b. a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
с. реагент, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20.with. a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20.
Анализ может дополнительно включать контроли:The assay may additionally include controls:
необходим, по меньшей мере, один из следующих контролей: отрицательный контроль, контроль отсечения и положительный контроль,at least one of the following controls is required: a negative control, a cut-off control, and a positive control,
контроли могут представлять образцы с известной концентрацией ApoE4 (нативного, очищенного или рекомбинантного).controls can represent samples with a known concentration of ApoE4 (native, purified or recombinant).
Еще один вариант осуществления настоящего изобретения представляет анализ, который обеспечивает осуществление способа по настоящему изобретению, для количественного определения ApoE4 или его фрагментов в образце субъекта, включающий:Yet another embodiment of the present invention provides an assay that provides for the implementation of the method of the present invention to quantify ApoE4 or fragments thereof in a sample of a subject, comprising:
а. один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,a. one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
b. полимерную или стеклянную твердую фазу, предпочтительно высокосвязывающий полистирольный микропланшет,b. a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
с. реагент, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20.with. a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20.
Анализ может дополнительно включать один или несколько калибраторов:The assay may optionally include one or more calibrators:
калибратором могут быть образцы с известной концентрацией ApoE4 (нативного, очищенного или рекомбинантного).the calibrator can be samples with a known concentration of ApoE4 (native, purified or recombinant).
Еще один вариант осуществления настоящего изобретения представляет анализ, который обеспечивает способ детектирования ApoE4 или его фрагментов, состоящий из:Yet another embodiment of the present invention provides an assay that provides a method for detecting ApoE4 or fragments thereof, consisting of:
одного связывающего агента, направленного против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, содержащих, по меньшей мере, 6 аминокислот, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments containing at least 6 amino acids, where the binding agent is labeled with a detectable label,
полимерной или стеклянной твердой фазы, предпочтительно высокосвязывающего полистирольного микропланшета,a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
реагента, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20,a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20,
контролей и/или калибраторов,controls and/or calibrators,
промывочного буфера,wash buffer,
реагентов для измерения.reagents for measurement.
Еще одним предметом настоящего изобретения является набор для детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта.Another subject of the present invention is a kit for detecting ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject.
Как указано в данном документе, «набор» представляет собой коробку, содержащую комбинацию материалов, которые необходимы для осуществления способа по настоящему изобретению, в частности, детектирования ApoE4 и его фрагментов в образце крови субъекта.As used herein, a "kit" is a box containing a combination of materials that are necessary to carry out the method of the present invention, in particular the detection of ApoE4 and its fragments in a subject's blood sample.
Еще одним предметом настоящего изобретения является набор для детектирования ApoE4 и его фрагментов в образце крови субъекта, содержащий:Another subject of the present invention is a kit for detecting ApoE4 and its fragments in a blood sample of a subject, comprising:
а. один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,a. one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
b. твердую фазу (например, планшет, пробирку, шарики, пластину),b. solid phase (e.g. plate, test tube, beads, plate),
с. реакционный буфер, содержащий детергент.with. reaction buffer containing detergent.
Еще один вариант осуществления настоящего изобретения представляет набор для детектирования ApoE4 и его фрагментов в образце крови субъекта, содержащий:Another embodiment of the present invention provides a kit for detecting ApoE4 and its fragments in a blood sample of a subject, comprising:
один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
полимерную или стеклянную твердую фазу, предпочтительно высокосвязывающий полистирольный микропланшет,a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
реагент, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20.a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20.
Набор может дополнительно содержать контроли:The set may additionally contain controls:
необходим, по меньшей мере, один из следующих контролей: отрицательный контроль, контроль отсечения и положительный контроль,at least one of the following controls is required: a negative control, a cut-off control, and a positive control,
контролями могут быть образцы с известной концентрацией ApoE4 (нативного, очищенного или рекомбинантного).controls can be samples with a known concentration of ApoE4 (native, purified or recombinant).
Еще один вариант осуществления настоящего изобретения представляет набор для количественного определения ApoE4 или его фрагментов в образце субъекта, содержащий:Another embodiment of the present invention provides a kit for the quantification of ApoE4 or fragments thereof in a subject sample, comprising:
один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
полимерную или стеклянную твердую фазу, предпочтительно высокосвязывающий полистирольный микропланшет,a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
реагент, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20.a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20.
Набор может дополнительно содержать один или несколько калибраторов:The kit may additionally contain one or more calibrators:
калибратором могут быть образцы с известной концентрацией ApoE4 (нативного, очищенного или рекомбинантного).the calibrator can be samples with a known concentration of ApoE4 (native, purified or recombinant).
Еще одним вариантом осуществления настоящего изобретения является набор для детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта, состоящий из:Another embodiment of the present invention is a kit for detecting ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject, consisting of:
одного связывающего агента, направленного против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, содержащих, по меньшей мере, 6 аминокислот, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments containing at least 6 amino acids, where the binding agent is labeled with a detectable label,
полимерной или стеклянной твердой фазы, предпочтительно высокосвязывающего полистирольного микропланшета,a polymer or glass solid, preferably a highly binding polystyrene microplate,
реагента, который содержит детергент, предпочтительно 0,2% твина-20,a reagent that contains a detergent, preferably 0.2% tween-20,
контролей и/или калибраторов,controls and/or calibrators,
промывочного буфера,wash buffer,
реагентов для измерения.reagents for measurement.
Еще одним вариантом осуществления настоящего изобретения является применение связывающего агента для детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта, включающее стадии:Another embodiment of the present invention is the use of a binding agent for the detection of ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps of:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе через ApoE4 или ApoE4 иммобилизован на указанной твердой фазе и связывающий агент с ApoE4.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase via ApoE4 or ApoE4 is immobilized on said solid phase and binding agent to ApoE4.
Еще одним вариантом осуществления настоящего изобретения является применение связывающего агента для детектирования ApoE4 или его фрагментов в образце крови субъекта, включающее стадии:Another embodiment of the present invention is the use of a binding agent for the detection of ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps of:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе через ApoE4 или ApoE4 иммобилизован на указанной твердой фазе, где твердая фаза не покрыта указанным связывающим агентом или захватывающей молекулой и где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит в присутствии детергента.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, where said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase via ApoE4 or ApoE4 immobilized on said solid phase, where the solid phase is not coated with said binding agent or capture molecule, and where said ApoE4 or ApoE4-binding agent complex is bound with the specified solid phase occurs in the presence of a detergent.
В контексте настоящего изобретения заявление о применении связывающего агента в способе по настоящему изобретению является синонимом заявленного способа по настоящему изобретению, включающего все вышеуказанные варианты осуществления.In the context of the present invention, the application of a binding agent in the method of the present invention is synonymous with the claimed method of the present invention, including all of the above embodiments.
Следующие варианты осуществления также являются предметом настоящего изобретения:The following embodiments are also the subject of the present invention:
1. Способ (in vitro) детектирования аполипопротеина Е изотипа 4 (ApoE4) или его фрагментов в образце крови субъекта, включающий стадии:1. A method (in vitro) for detecting apolipoprotein E isotype 4 (ApoE4) or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps of:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе через ApoE4.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase via ApoE4.
2. Способ (in vitro) детектирования аполипопротеина Е изотипа 4 (ApoE4) или его фрагментов в образце крови субъекта, включающий стадии:2. A method (in vitro) for detecting apolipoprotein E isotype 4 (ApoE4) or fragments thereof in a blood sample of a subject, comprising the steps of:
а. контактирование указанного образца с твердой фазой,a. contacting said sample with a solid phase,
контактирование указанного образца одновременно или последовательно, по меньшей мере, с одним связывающим агентом, который специфически связывается с ApoE4, с образованием тем самым комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, иcontacting said sample simultaneously or sequentially with at least one binding agent that specifically binds to ApoE4, thereby forming an ApoE4-binding agent complex, where said binding agent is an antibody or a functional fragment of an antibody or a scaffold protein other than IgG, and
b. детектирование комплекса ApoE4-связывающий агент, где указанный комплекс ApoE4-связывающий агент иммобилизован на указанной твердой фазе, где твердая фаза не покрыта указанным связывающим агентом или захватывающей молекулой и где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит в присутствии детергента.b. detection of an ApoE4-binding agent complex, wherein said ApoE4-binding agent complex is immobilized on said solid phase, wherein said solid phase is not coated with said binding agent or capture molecule, and wherein binding of ApoE4 or ApoE4-binding agent complex to said solid phase occurs in the presence of a detergent.
3. Способ согласно вариантам осуществления 1 или 2, где ApoE4 или его фрагменты иммобилизованы на указанной твердой фазе, и связывающий агент связан с ApoE4.3. The method according to
4. Способ согласно вариантам осуществления 1-3, где фрагменты ApoE4 содержат, по меньшей мере, 6 аминокислот в длину при условии, что аминокислота 158 (аргинин) входит в указанный фрагмент, где последовательность, включающая аминокислоту 158, относится к SEQ ID NO:1.4. The method according to embodiments 1-3, wherein the ApoE4 fragments are at least 6 amino acids in length, provided that amino acid 158 (arginine) is included in said fragment, wherein the sequence including amino acid 158 refers to SEQ ID NO: one.
5. Способ согласно вариантам осуществления 1-4, где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит без взаимодействия соединяющей молекулы, которая способна связывать ApoE4 или его фрагменты с указанной твердой фазой.5. The method according to embodiments 1-4, wherein the binding of ApoE4 or an ApoE4-binding agent complex to said solid phase occurs without interaction of a linking molecule that is capable of binding ApoE4 or fragments thereof to said solid phase.
6. Способ согласно вариантам осуществления 1-5, где на время контактирования твердой фазы с образцом указанное контактирование происходит без взаимодействия указанной соединяющей молекулы.6. The method according to embodiments 1-5, wherein for the duration of contact of the solid phase with the sample, said contact occurs without interaction of said connecting molecule.
7. Способ согласно вариантам осуществления 1-6, где связывание ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент с указанной твердой фазой происходит в присутствии детергента.7. The method according to embodiments 1-6, wherein the binding of ApoE4 or the ApoE4-binding agent complex to said solid phase occurs in the presence of a detergent.
8. Способ согласно вариантам осуществления 1-7, где комплекс ApoE4-связывающий агент детектируется качественно или количественно.8. The method according to embodiments 1-7, wherein the ApoE4-binding agent complex is detected qualitatively or quantitatively.
9. Способ согласно вариантам осуществления 1-8, где количественное определение комплекса ApoE4-связывающий агент указывает на концентрацию ApoE4 в указанном образце, где концентрация показывает, насколько субъекты являются гомозиготными или гетерозиготными по аллелям ApoE4.9. The method according to embodiments 1-8, wherein the quantification of the ApoE4-binding agent complex indicates the concentration of ApoE4 in said sample, wherein the concentration indicates how homozygous or heterozygous the subjects are for ApoE4 alleles.
10. Способ согласно вариантам осуществления 1-9, где связывающий агент представляет антитело или функциональный фрагмент антитела или каркасный белок, отличный от IgG, с константой аффинности связывания, по меньшей мере, 107 М-1, предпочтительно 108 М-1, предпочтительной константой аффинности выше 109 М-1, наиболее предпочтительно выше 1010 М-1.10. The method according to embodiments 1-9, wherein the binding agent is an antibody or a functional antibody fragment or scaffold protein other than IgG with a binding affinity constant of at least 10 7 M -1 , preferably 10 8 M -1 , preferably an affinity constant above 10 9 M -1 , most preferably above 10 10 M -1 .
11. Способ согласно вариантам осуществления 1-10, где связывающий агент помечен меткой для детектирования, где указанная метка выбрана из группы, включающей хемилюминесцентную метку, ферментную метку, флуоресцентную метку или метку на основе радиоактивного йода.11. The method according to embodiments 1-10, wherein the binding agent is labeled with a detection label, wherein said label is selected from the group consisting of a chemiluminescent label, an enzyme label, a fluorescent label, or a radioactive iodine label.
12. Способ согласно вариантам осуществления 1-11, где детектирование ApoE4 используется для классификации субъекта, как ApoE4-позитивного или ApoE4-негативного, когда уровень детектированного ApoE4 выше определенного порогового значения, где указанное пороговое значение определяется конкретным значением внутреннего положительного контроля.12. The method according to embodiments 1-11, wherein ApoE4 detection is used to classify a subject as ApoE4 positive or ApoE4 negative when the detected ApoE4 level is above a certain threshold, where said threshold is determined by a particular internal positive control value.
13. Способ согласно вариантам осуществления 1-12, где твердая фаза выбрана из группы, состоящей из полимерной поверхности (например, полистирола), стеклянной поверхности, целлюлозы и производных целлюлозы (например, нитроцеллюлозы, поливинилиденфторида, нейлона).13. The method according to embodiments 1-12, wherein the solid phase is selected from the group consisting of a polymeric surface (eg, polystyrene), a glass surface, cellulose, and cellulose derivatives (eg, nitrocellulose, polyvinylidene fluoride, nylon).
14. Способ согласно вариантам осуществления 1-13, где твердая фаза выбрана из группы стеклянных или полимерных поверхностей, где полимерная поверхность включает, не ограничиваясь этим, полистирол, поли(дивинилбензол), стирол-акриловый сополимер, стирол-бутадиеновый сополимер, стирол-дивинилбензольный сополимер, поли(стирол-оксиэтилен), полиметилметакрилат, полиуретан, полиглутаральдегид, полиэтиленимин, поливинилпирролидон, N,N'-метилен-бис-акриламид, полиолефины, полиэтилен, политетрафторэтилен, полиэтилентерефталат, полипропилен, поливинилхлорид, поливинилацетат, полиакрилонитрил, полисульфон, поли(сульфоновый эфир), полидиметилсилоксан, пиролизованные материалы, блок-сополимеры и сополимеры вышеуказанных соединений, силиконы или диоксид кремния.14. The method according to embodiments 1-13, wherein the solid phase is selected from the group of glass or polymeric surfaces, wherein the polymeric surface includes, but is not limited to, polystyrene, poly(divinylbenzene), styrene-acrylic copolymer, styrene-butadiene copolymer, styrene-divinylbenzene copolymer, poly(styrene-oxyethylene), polymethylmethacrylate, polyurethane, polyglutaraldehyde, polyethyleneimine, polyvinylpyrrolidone, N,N'-methylene-bis-acrylamide, polyolefins, polyethylene, polytetrafluoroethylene, polyethylene terephthalate, polypropylene, polyvinyl chloride, polyvinyl acetate, polyacrylonitrile, polysulfone, poly( sulfonic ether), polydimethylsiloxane, pyrolyzed materials, block copolymers and copolymers of the above compounds, silicones or silicon dioxide.
15. Способ согласно вариантам осуществления 1-14, где указанный образец крови контактирует с ненасыщенной твердой фазой.15. The method according to embodiments 1-14, wherein said blood sample is contacted with an unsaturated solid phase.
16. Способ согласно вариантам осуществления 1-15, где твердая фаза не покрыта каким-либо связывающим агентом или захватывающей молекулой.16. The method according to embodiments 1-15 wherein the solid phase is not coated with any binding agent or capture molecule.
17. Способ согласно вариантам осуществления 1-16, где необязательный стабилизирующий белок в реакционном буфере стабилизирует связывание ApoE4 и его фрагментов в образце крови с твердой фазой посредством блокирования сайтов неспецифического связывания и взаимодействия с конформацией ApoE4, где стабилизирующий белок выбран из группы, включающей бычий сывороточный альбумин (BSA), человеческий сывороточный альбумин, казеин, молочные белки, иммуноглобулины, стабилизирующие аминокислоты (например, аланин, аргинин, глицин, изолейцин, лизин, пролин, серин), и предпочтительно стабилизирующим белком является бычий сывороточный альбумин (BSA).17. The method according to embodiments 1-16, wherein the optional stabilizing protein in the reaction buffer stabilizes the binding of ApoE4 and its fragments in the blood sample to the solid phase by blocking non-specific binding sites and interacting with the ApoE4 conformation, wherein the stabilizing protein is selected from the group consisting of bovine serum albumin (BSA), human serum albumin, casein, milk proteins, immunoglobulins, stabilizing amino acids (eg alanine, arginine, glycine, isoleucine, lysine, proline, serine), and preferably the stabilizing protein is bovine serum albumin (BSA).
18. Способ согласно вариантам осуществления 1-17, где концентрация BSA в качестве стабилизирующего белка находится в диапазоне 0-10%, предпочтительно, 0,2-5%, наиболее предпочтительно 0,5-2,5%.18. The method according to embodiments 1-17, wherein the concentration of BSA as a stabilizing protein is in the range of 0-10%, preferably 0.2-5%, most preferably 0.5-2.5%.
19. Способ согласно вариантам осуществления 1-18, где детергент выбран из группы анионных детергентов (например, додецилсульфата натрия (SDS)), катионных детергентов (например, цетилтриметиламмония бромида (CTAB)), цвиттер-ионных детергентов (например, CHAPS) и/или неионных детергентов (например, твина-20, тритона X-100).19. The method according to embodiments 1-18, wherein the detergent is selected from the group of anionic detergents (eg, sodium dodecyl sulfate (SDS)), cationic detergents (eg, cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)), zwitterionic detergents (eg, CHAPS), and/ or non-ionic detergents (eg Tween-20, Triton X-100).
20. Способ согласно вариантам осуществления 1-19, где концентрация твина-20 выбрана в диапазоне 0,001-10%, предпочтительно 0,01-1%, наиболее предпочтительно 0,2-0,5%.20. The method according to embodiments 1-19, wherein the concentration of tween-20 is selected in the range of 0.001-10%, preferably 0.01-1%, most preferably 0.2-0.5%.
21. Способ согласно вариантам осуществления 1-20, где концентрация тритона Х-100 выбрана в диапазоне 0,001-0,5%, предпочтительно 0,01-0,2%, наиболее предпочтительно 0,05-0,1%.21. The method according to embodiments 1-20, wherein the concentration of Triton X-100 is selected in the range of 0.001-0.5%, preferably 0.01-0.2%, most preferably 0.05-0.1%.
22. Способ согласно любому из предшествующих вариантов осуществления, где образец крови выбран из группы цельной крови, сыворотки и цитратной плазмы, гепаринизированной плазмы, ЭДТА-плазмы.22. The method according to any of the preceding embodiments, wherein the blood sample is selected from the group of whole blood, serum and citrated plasma, heparinized plasma, EDTA plasma.
23. Способ согласно любому из предшествующих вариантов осуществления, где субъект выбран из группы, включающей живого человека или организм человека, предпочтительно субъекта-человека, где субъект является здоровым, предположительно здоровым, страдающим когнитивным нарушением, деменцией, в частности, AD.23. The method according to any of the preceding embodiments, wherein the subject is selected from the group consisting of a living human or human body, preferably a human subject, wherein the subject is healthy, presumably healthy, suffering from cognitive impairment, dementia, in particular AD.
24. Набор, содержащий:24. A set containing:
а. один связывающий агент, направленный против эпитопа, входящего в последовательность ApoE4 или его фрагментов, где связывающий агент помечен детектируемой меткой,a. one binding agent directed against an epitope included in the sequence of ApoE4 or its fragments, where the binding agent is labeled with a detectable label,
b. твердую фазу (например, планшет, пробирку, шарики, пластину),b. solid phase (e.g. plate, test tube, beads, plate),
с. реакционный буфер, содержащий детергент.with. reaction buffer containing detergent.
25. Применение набора согласно любому из предшествующих вариантов осуществления для детектирования и/или количественного определения ApoE4 или его фрагментов in vitro в образце крови субъекта.25. Use of a kit according to any of the preceding embodiments for the in vitro detection and/or quantification of ApoE4 or fragments thereof in a blood sample of a subject.
26. Применение способа согласно любому из предшествующих вариантов осуществления для стратификации риска или стратификации применения терапевтических мероприятий для заболевания или патологического состояния, ассоциированного с повышенными уровнями ApoE4.26. Use of a method according to any of the preceding embodiments for risk stratification or stratification of the use of therapeutic interventions for a disease or condition associated with elevated levels of ApoE4.
27. Применение способа согласно любому из предшествующих вариантов осуществления, где заболевание или патологическое состояние выбрано из группы когнитивного нарушения и нейродегенеративных заболеваний, включая деменцию и/или болезнь Альцгеймера (AD).27. Use of a method according to any of the preceding embodiments, wherein the disease or condition is selected from the group of cognitive impairment and neurodegenerative diseases, including dementia and/or Alzheimer's disease (AD).
28. Способ согласно любому из предшествующих вариантов осуществления для выявления риска развития AD, где повышенный уровень ApoE4 выше определенного порогового значения является прогностическим для повышенного риска развития AD.28. A method according to any of the preceding embodiments for detecting the risk of developing AD, wherein an elevated level of ApoE4 above a certain threshold is predictive of an increased risk of developing AD.
29. Способ согласно любому из предшествующих вариантов осуществления, где указанное присутствие ApoE4 или комплекса ApoE4-связывающий агент коррелирует с риском развития/заболеваемости AD.29. The method according to any of the preceding embodiments, wherein said presence of ApoE4 or an ApoE4-binding agent complex correlates with the risk of developing/morbidity of AD.
ПримерыExamples
Пример 1Example 1
Получение антител и определение их констант аффинностиObtaining antibodies and determining their affinity constants
- Пептиды/конъюгаты для иммунизации:- Peptides/conjugates for immunization:
Синтезировали специфический пептид ApoE4 для иммунизации и специфический контрольный пептид ApoE2/3, см. таблицу 1 (JPT Technologies, Берлин, Германия). Пептид ApoE4 синтезировали с дополнительным N-концевым остатком цистеина для обеспечения конъюгации пептида с бычьим сывороточным альбумином (BSA). Пептид ковалентно связывали с BSA с использованием связывающего геля Sulfolink (Perbio-science, Бонн, Германия). Процедуру сочетания выполняли в соответствии с руководством Perbio.A specific ApoE4 peptide for immunization and a specific control peptide ApoE2/3 were synthesized, see Table 1 (JPT Technologies, Berlin, Germany). The ApoE4 peptide was synthesized with an additional N-terminal cysteine residue to allow conjugation of the peptide to bovine serum albumin (BSA). The peptide was covalently linked to BSA using Sulfolink binding gel (Perbio-science, Bonn, Germany). The coupling procedure was performed according to the Perbio manual.
[M[M
-1-one
]]
- Иммунизация мышей, слияние иммунных клеток и скрининг:- Mice Immunization, Immune Cell Fusion and Screening:
Мышей Balb/c иммунизировали 100 мкг конъюгата пептид-BSA на сутки 0 и 14 (эмульгировали в 100 мкл полного адъюванта Фрейнда) и 50 мкг на сутки 21 и 28 (в 100 мкл неполного адъюванта Фрейнда). За 3 суток до проведения эксперимента по слиянию животные получали 50 мкг конъюгата, растворенного в 100 мкл физиологического раствора, в виде одной внутрибрюшинной и одной внутривенной инъекции.Balb/c mice were immunized with 100 μg of peptide-BSA conjugate on
Спленоциты от иммунизированных мышей и клетки миеломной клеточной линии SP2/0 подвергали слиянию с 1 мл 50% полиэтиленгликоля в течение 30 с при 37°С. После промывания клетки высевали в 96-луночные планшеты для культивирования клеток. Гибридные клоны селектировали культивированием в среде HAT [культуральная среда RPMI 1640, с добавлением 20% эмбриональной сыворотки теленка и добавки HAT]. Через две недели среду HAT заменяли средой HT на три пассажа с последующим возвратом в нормальную среду для культивирования клеток.Splenocytes from immunized mice and SP2/0 myeloma cell line were fused with 1 ml of 50% polyethylene glycol for 30 seconds at 37°C. After washing, the cells were plated in 96-well cell culture plates. Hybrid clones were selected by cultivation in HAT medium [RPMI 1640 culture medium supplemented with 20% fetal calf serum and HAT supplement]. Two weeks later, HAT medium was replaced with HT medium for three passages, followed by a return to normal cell culture medium.
Супернатанты клеточных культур подвергали первичному скринингу на антигенспецифичные IgG антитела через три недели после слияния. Положительные тестированные микрокультуры переносили в 24-луночные планшеты для размножения. После повторного тестирования выбранные культуры клонировали и реклонировали с использованием метода предельных разведений, и определяли изотипы (Lane et al., 1985, Ziegler et., al. 1996).Cell culture supernatants were subjected to primary screening for antigen-specific IgG antibodies three weeks after fusion. Positive tested microcultures were transferred to 24-well multiplication plates. After retesting, selected cultures were cloned and recloned using the limiting dilution method and isotypes determined (Lane et al., 1985, Ziegler et., al. 1996).
- Получение моноклональных антител- Obtaining monoclonal antibodies
Антитела получали с использованием стандартных методов получения антител (Marx et al., 1997) и очищали с помощью белка А. Чистота антител составляла >95% на основе результатов анализа электрофорезом в SDS-геле.Antibodies were prepared using standard antibody preparation methods (Marx et al., 1997) and purified with protein A. Antibody purity was >95% based on SDS gel electrophoresis analysis.
- Константы аффинности- Affinity constants
Для определения аффинности антитела к ApoE4, исследовали кинетику связывания рекомбинантного ApoE4 с иммобилизованным антителом с помощью поверхностного плазмонного резонанса без меток с использованием системы Biacore 2000 (GE Healthcare Europe GmbH, Фрейбург, Германия). Обратимую иммобилизацию антител проводили с использованием антитела против мышиного Fc, ковалентно связанного с высокой плотностью с поверхностью сенсора CM5, в соответствии с инструкциями производителя (набор для захвата мышиных антител; GE Healthcare).To determine the affinity of the antibody to ApoE4, the binding kinetics of the recombinant ApoE4 to the immobilized antibody was studied by unlabeled surface plasmon resonance using the Biacore 2000 system (GE Healthcare Europe GmbH, Freiburg, Germany). Reversible antibody immobilization was performed using an anti-mouse Fc antibody covalently bound to the surface of a CM5 sensor according to the manufacturer's instructions (Mouse Antibody Capture Kit; GE Healthcare).
- Процедура мечения (индикатор)- Labeling procedure (indicator)
100 мкг (100 мкл) антитела (1 мг/мл в PBS, pH 7,4) смешивали с 10 мкл NHS-эфира акридиния (1 мг/мл в ацетонитриле, InVent GmbH, Германия; ЕР 0 353 971) и инкубировали в течение 20 мин при комнатной температуре. Меченые антитела очищали гель-фильтрационной ВЭЖХ на Bio-Sil® SEC 400-5 (Bio-Rad Laboratories, Inc., США). Очищенные меченые антитела разбавляли (300 ммоль/л фосфата калия, 100 ммоль/л NaCl, 10 ммоль/л Na-ЭДТА, 5 г/л бычьего сывороточного альбумина, pH 7,0). Конечная концентрация составляла примерно 800000 относительных световых единиц (RLU) меченого соединения (примерно 20 нг меченого антитела) на 200 мкл. Хемилюминесценцию эфира акридиния измеряли с использованием AutoLumat LB 953 (Berthold Technologies GmbH & Co. KG).100 μg (100 μl) of antibody (1 mg/ml in PBS, pH 7.4) was mixed with 10 μl of acridinium NHS ester (1 mg/ml in acetonitrile, InVent GmbH, Germany;
Пример 2Example 2
Анализ образцов плазмы с известным генотипом. Используя соответствующие плазму и цельную кровь, можно генетически анализировать статус ApoE генотипированием и измерением уровней ApoE4 в соответствующей плазме с помощью анализа ApoE4 по настоящему изобретению.Analysis of plasma samples with a known genotype. Using appropriate plasma and whole blood, one can genetically analyze ApoE status by genotyping and measuring ApoE4 levels in appropriate plasma using the ApoE4 assay of the present invention.
2.1 Методы2.1 Methods
- Генотипирование- Genotyping
Генетический анализ 180 образцов цельной крови проводили Medigenomix, Ebersberg, Deutschland. ДНК из образцов выделяли и ген ApoE секвенировали, используя секвенирование по Сэнгеру (Sanger & Coulson 1975).Genetic analysis of 180 whole blood samples was performed by Medigenomix, Ebersberg, Deutschland. DNA from the samples was isolated and the ApoE gene was sequenced using Sanger sequencing (Sanger & Coulson 1975).
- Процедура анализа ApoE4- ApoE4 assay procedure
Анализ методом одного антитела к ApoE4 проводили одностадийной процедурой. Образцы плазмы непосредственно пипетировали в лунки 96-луночного микротитрационного планшета (Greiner, Lumitrac600, высокосвязывающий полистирол; из расчета 20 мкл образца на лунку) в двух повторах. В каждый микропланшет добавляли контроль отсечения с низким уровнем ApoE4 (рекомбинантный ApoE4 [4 мкг/мл] в ApoE4-негативной плазме человека, 20 мкл на лунку, в двух повторах). В лунки вносили 200 мкл реакционного буфера (PBS с 0,2% твина-20, 1% BSA, 0,1% бычьего IgG, 0,1% овечьего IgG и 0,02% мышиного IgG, pH 7,4) с меченым эфиром акридиния анти-ApoE4-антителом (индикатор). Микропланшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре. Несвязанный индикатор удаляли, промывая 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100). Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).ApoE4 single antibody assay was performed in a one-step procedure. Plasma samples were directly pipetted into the wells of a 96-well microtiter plate (Greiner, Lumitrac600, high binding polystyrene; 20 μl of sample per well) in duplicate. A low ApoE4 cutoff control (recombinant ApoE4 [4 μg/ml] in ApoE4 negative human plasma, 20 μl per well, in duplicate) was added to each microplate. 200 μl of reaction buffer (PBS with 0.2% tween-20, 1% BSA, 0.1% bovine IgG, 0.1% ovine IgG and 0.02% mouse IgG, pH 7.4) with labeled acridinium ether anti-ApoE4 antibody (indicator). The microplates were incubated for 1 h at room temperature. The unbound indicator was removed by washing 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100). Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).
2.2 Результаты2.2 Results
На фиг. 1a приведены результаты анализа ApoE4, дифференцированные по генотипу. С помощью контроля отсечения можно легко разделить ApoE4-позитивные и ApoE4-негативные образцы по значениям RLU. Все ApoE4-негативные образцы имеют значения RLU ниже 3000 RLU, и все ApoE4-позитивные образцы имеют значения RLU выше 3000 RLU. Отрицательные образцы в основном показывают только фоновый сигнал в иммунном анализе, и отсутствие сигнала ApoE4. На фиг. 1b приведена соответствующая ROC-кривая. С использованием площади под кривой (AUC), равной 1, анализ точно дифференцирует ApoE4-позитивные и ApoE4-негативные образцы.In FIG. 1a shows the results of the ApoE4 analysis differentiated by genotype. With clipping control, ApoE4-positive and ApoE4-negative samples can be easily separated by RLU values. All ApoE4 negative samples have RLU values below 3000 RLU and all ApoE4 positive samples have RLU values above 3000 RLU. Negative samples generally show only a background signal in the immune assay, and no ApoE4 signal. In FIG. 1b shows the corresponding ROC curve. Using an area under the curve (AUC) of 1, the assay accurately differentiates between ApoE4 positive and ApoE4 negative samples.
Пример 3Example 3
Анализ связывания ApoE4 с различными полимерными и стеклянными поверхностями с/без детергента.Analysis of ApoE4 binding to various polymeric and glass surfaces with/without detergent.
3.1 Методы3.1 Methods
- Предварительная инкубация образцов плазмы на полимерных или стеклянных поверхностях:- Pre-incubation of plasma samples on polymer or glass surfaces:
Каждый ApoE4-позитивный образец плазмы разделяли на аликвотные порции по 120 мкл, которые инкубировали в пробирках из разных материалов (полистирола (PS), полипропилена (PP), полиэтилентерефталата (PET) и стекла), по две пробирки на каждый материал. К одной половине аликвотных порций до инкубации добавляли 0,1% тритона Х-100, и другую половину обрабатывали равным объемом PBS. Все пробирки инкубировали при комнатной температуре в течение ночи.Each ApoE4-positive plasma sample was divided into 120 µl aliquots, which were incubated in tubes of different materials (polystyrene (PS), polypropylene (PP), polyethylene terephthalate (PET) and glass), two tubes for each material. 0.1% Triton X-100 was added to one half of the aliquots prior to incubation and the other half was treated with an equal volume of PBS. All tubes were incubated at room temperature overnight.
- Анализ методом одного антитела к ApoE4- Analysis by the method of one antibody to ApoE4
20 мкл каждого препарата, а также контроля без предварительной инкубации, пипеткой вносили в высокосвязывающий микротитрационный планшет Greiner из расчета на лунку. Затем проводили анализ ApoE4, как описано в примере 2. Измеренную концентрацию ApoE4 рассчитывали относительно концентрации в соответствующем контрольном образце (определенном как 100%).20 μl of each preparation, as well as control without pre-incubation, was pipetted into a high-binding Greiner microtiter plate per well. An ApoE4 assay was then performed as described in Example 2. The measured ApoE4 concentration was calculated relative to the concentration in the corresponding control sample (defined as 100%).
3.2 Результаты3.2 Results
Образцы, обработанные детергентом, показывали существенное снижение уровня ApoE4 после предварительной инкубации в полимерных или стеклянных пробирках, потеря составляла примерно 50% (см. фиг. 2). Различия между типом поверхности, на которой образцы предварительно инкубировали, отсутствовали. После предварительной инкубации образцов, не обработанных детергентом, наблюдали незначительную потерю сигнала ApoE4, но не такую значимую, как при использовании детергента.Detergent-treated samples showed a significant decrease in ApoE4 levels after pre-incubation in polymer or glass tubes, the loss was approximately 50% (see Fig. 2). There were no differences between the type of surface on which the samples were preincubated. After pre-incubation of samples not treated with detergent, a slight loss of the ApoE4 signal was observed, but not as significant as when using detergent.
Детергент усиливал связывание ApoE4 с полимерными или стеклянными поверхностями.The detergent enhanced the binding of ApoE4 to polymer or glass surfaces.
Пример 4Example 4
Анализ того, насколько детергенты функционируют в качестве соединяющих молекул между ApoE4 и твердой фазой.An analysis of how detergents function as bridge molecules between ApoE4 and the solid phase.
4.1 Методы4.1 Methods
- Покрытие микротитрационных планшетов (МТП)- Coating of microtiter plates (MTP)
В три высокосвязывающих микротитрационных планшета Greiner вносили 300 мкл на лунку либо ddH2O, 0,05% раствора тритона X-100 в ddH2O или 0,4% раствора тритона X-100 в ddH2O (по одному планшету на каждый вариант). Планшеты инкубировали в течение ночи при комнатной температуре. После этого МТР трижды промывали 1×PBS и непосредственно использовали для одностадийного анализа методом одного антитела к ApoE4.Three high-binding Greiner microtiter plates were loaded with 300 µl per well of either ddH 2 O, 0.05% Triton X-100 in ddH 2 O, or 0.4% Triton X-100 in ddH 2 O (one plate per variant). ). The plates were incubated overnight at room temperature. Thereafter, the MTP was washed three times with 1×PBS and directly used for one-step analysis by a single anti-ApoE4 antibody method.
- Анализ методом одного антитела к ApoE4- Analysis by the method of one antibody to ApoE4
20 мкл плазмы ApoE4-позитивных и ApoE4-негативных образцов, а также контроль отсечения (4 мкг/мл рекомбинантного ApoE4 в плазме человека) пипеткой вносили в предварительно обработанные высокосвязывающие микропланшеты Greiner из расчета на лунку. Половину лунок заполняли 200 мкл буфера с индикатором (PBS с 1% BSA, 0,1% бычьего IgG, 0,1% овечьего IgG и 0,02% мышиного IgG, pH 7,4 + меченное эфиром акридиния анти-ApoE4-антитело), содержащего 0,05% тритона Х-100, и другую половину заполняли тем же буфером с индикатором, но без детергента (0% тритона Х-100). Микропланшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре. Несвязанный индикатор удаляли, промывая 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100). Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).20 μl plasma of ApoE4 positive and ApoE4 negative samples, as well as a cut-off control (4 μg/ml recombinant ApoE4 in human plasma) were pipetted into pretreated Greiner high binding microplates per well. Half of the wells were filled with 200 µl of indicator buffer (PBS with 1% BSA, 0.1% bovine IgG, 0.1% ovine IgG and 0.02% mouse IgG, pH 7.4 + acridinium ester labeled anti-ApoE4 antibody) containing 0.05% Triton X-100 and the other half filled with the same indicator buffer but without detergent (0% Triton X-100). The microplates were incubated for 1 h at room temperature. The unbound indicator was removed by washing 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100). Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).
4.2 Результаты4.2 Results
Если детергенты будут функционировать в качестве соединяющей молекулы между ApoE4 и твердой фазой, то должен быть сильный сигнал, когда анализ ApoE4 проводится на планшетах, обработанных детергентом, без какого-либо детергента в аналитическом буфере, возможно, даже в зависимости от концентрации. Но это был не тот вариант. Все образцы, а также контроль отсечения, не показывали сигнала на любом предварительно обработанном планшете, когда анализ проводили в аналитическом буфере без детергента (см. фиг. 3). Сигналы как ApoE4-позитивных, так и ApoE4-негативных образцов находились на базовой линии на одном уровне и, следовательно, их невозможно было дифференцировать друг от друга. Напротив, когда анализ проводили с присутствием детергента в аналитическом буфере, то в ApoE4-позитивных образцах и контроле отсечения появлялся значительный сигнал. Этот сигнал также не зависел от количества тритона X-100, связанного с MTP.If detergents are to function as a bridge molecule between ApoE4 and the solid phase, then there should be a strong signal when ApoE4 assay is run on detergent-treated plates without any detergent in the assay buffer, possibly even depending on the concentration. But that was not the option. All samples, as well as the cutoff control, showed no signal on any pretreated plate when the assay was run in assay buffer without detergent (see FIG. 3). The signals of both ApoE4-positive and ApoE4-negative samples were at the baseline at the same level and, therefore, they could not be differentiated from each other. In contrast, when the assay was performed with the presence of detergent in the assay buffer, a significant signal appeared in the ApoE4 positive samples and the cutoff control. This signal was also independent of the amount of X-100 triton associated with MTP.
Детергент является необходимым компонентом буфера в анализе ApoE4. Покрытие детергентом MTP и добавление образца и буфера, не содержащего детергент, не приводит к достоверному сигналу. Это показывает, что детергент в большей степени необходим в его подвижной форме, а не в иммобилизованной форме, возможно в качестве соединяющей молекулы.Detergent is a necessary buffer component in the ApoE4 assay. Coating with MTP detergent and adding sample and detergent-free buffer does not result in a reliable signal. This shows that the detergent is more needed in its mobile form than in its immobilized form, possibly as a bonding molecule.
Пример 5Example 5
- Процедура одностадийного анализа- One step analysis procedure
Анализ методом одного антитела к ApoE4 проводили, как описано в примере 2. В одностадийной процедуре образцы и индикаторное антитело инкубировали вместе в течение 1 ч при комнатной температуре. Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad). При добавлении в каждый микропланшет был контроль отсечения с низким уровнем ApoE4 (рекомбинантный ApoE4 [4 мкг/мл] в ApoE4-негативной плазме человека; 20 мкл на лунку, в двух повторах).Anti-ApoE4 single antibody assay was performed as described in Example 2. In a one-step procedure, samples and indicator antibody were incubated together for 1 hour at room temperature. Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad). When added to each microplate, there was a low ApoE4 cut-off control (recombinant ApoE4 [4 μg/ml] in human ApoE4 negative plasma; 20 μl per well, in duplicate).
- Двустадийная процедура анализа- Two-stage analysis procedure
В двустадийной процедуре образцы плазмы непосредственно пипетировали в лунки 96-луночного микротитрационного планшета (Greiner, Lumitrac600, высокосвязывающий полистирол; 20 мкл образца на лунку) в двух повторах. При добавлении в каждый микропланшет был контроль отсечения с низким уровнем ApoE4 (рекомбинантный ApoE4 [4 мкг/мл] в ApoE4-негативной плазме человека; 20 мкл на лунку, в двух повторах). Лунки заполняли 200 мкл реакционного буфера (PBS с 0,2% твина-20, 1% BSA, 0,1% бычьего IgG, 0,1% овечьего IgG и 0,02% мышиного IgG, pH 7,4). Микропланшеты инкубировали в течение ночи при комнатной температуре (= стадия 1). После этого микропланшеты промывали 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100) и 200 мкл реакционного буфера с меченым эфиром акридиния анти-ApoE4-антителом вносили в лунки. Микропланшеты инкубировали в течение 2 ч при комнатной температуре (= стадия 2) и снова промывали 4 раза раствором для промывания. Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).In a two-step procedure, plasma samples were directly pipetted into the wells of a 96-well microtiter plate (Greiner, Lumitrac600, high binding polystyrene; 20 μl of sample per well) in duplicate. When added to each microplate, there was a low ApoE4 cut-off control (recombinant ApoE4 [4 μg/ml] in human ApoE4 negative plasma; 20 μl per well, in duplicate). The wells were filled with 200 μl of reaction buffer (PBS with 0.2% tween-20, 1% BSA, 0.1% bovine IgG, 0.1% ovine IgG and 0.02% mouse IgG, pH 7.4). The microplates were incubated overnight at room temperature (= stage 1). Thereafter, the microplates were washed 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100) and 200 μl of acridinium ester labeled anti-ApoE4 antibody reaction buffer was added to the wells. The microplates were incubated for 2 hours at room temperature (= stage 2) and washed again 4 times with the wash solution. Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).
Для более прямого сравнения двух вариантов процедуры анализа значения RLU преобразовывали в относительные единицы «кратность изменения по сравнению с контролем отсечения».For a more direct comparison of the two variants of the analysis procedure, the RLU values were converted to relative units "fold change compared to cut-off control".
5.2 Результаты5.2 Results
В данном случае короткую (1 ч) одностадийную процедуру сравнивали с длинной (в течение ночи/2 ч) двустадийной процедурой. Относительные световые единицы (RLU) одностадийного анализа были примерно в десять раз ниже, чем RLU в двустадийном анализе (см. таблицу 2). Но это отношение было верным только для каждого ApoE4-позитивного образца и контроля отсечения. Значения для ApoE4-негативных образцов оставались одинаково низкими в любом формате анализа. Значения для образцов относительно внутреннего контроля отсечения были примерно одинаковыми в каждом анализе (см. фиг. 4), и с помощью каждого анализа можно было дифференцировать ApoE4-позитивные от ApoE4-негативных образцов.In this case, a short (1 h) one-step procedure was compared with a long (overnight/2 h) two-step procedure. The relative light units (RLU) of the one-step assay were about ten times lower than the RLUs of the two-step assay (see Table 2). But this ratio was only true for each ApoE4-positive sample and cut-off control. Values for ApoE4-negative samples remained equally low in either assay format. The sample values relative to the internal control cut-off were approximately the same in each assay (see FIG. 4) and ApoE4-positive from ApoE4-negative samples could be differentiated with each assay.
Пример 6Example 6
Влияние блокирующего/стабилизирующего агента (BSA) на связывание ApoE4 с твердой фазой.Effect of a blocking/stabilizing agent (BSA) on ApoE4 binding to the solid phase.
6.1 Методы6.1 Methods
Анализ ApoE4 проводили двустадийной процедурой, где первую стадию (связывание ApoE4 с твердой фазой) проводили в присутствии или в отсутствии BSA. Вторую стадию (связывание анти-ApoE4-антитела с иммобилизованным ApoE4) проводили в аналитическом буфере, содержащем 1% BSA.The ApoE4 assay was performed in a two step procedure where the first step (binding of ApoE4 to the solid phase) was performed in the presence or absence of BSA. The second step (binding of anti-ApoE4 antibody to immobilized ApoE4) was performed in assay buffer containing 1% BSA.
Образцы плазмы и контроль отсечения с низким уровнем ApoE4 (рекомбинантный ApoE4 [4 мкг/мл] в ApoE4-негативной плазме человека) непосредственно пипетировали в лунки 96-луночного микротитрационного планшета (Greiner, Lumitrac600 высокосвязывающий полистирол; 20 мкл образца на лунку). В лунки вносили 200 мкл реакционного буфера (PBS с 0,2% твина-20, 0,1% бычьего IgG, 0,1% овечьего IgG и 0,02% мышиного IgG, pH 7,4), который содержал 1% BSA или не содержал BSA (0% BSA). Микропланшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре (= стадия 1). После этого микропланшеты промывали 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100) и 200 мкл 1% BSA-содержащего реакционного буфера с меченым эфиром акридиния анти-ApoE4-антителом вносили в лунки. Микропланшеты инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре (= стадия 2) и снова промывали 4 раза раствором для промывания. Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).Plasma samples and a low ApoE4 cutoff control (recombinant ApoE4 [4 μg/mL] in ApoE4 negative human plasma) were directly pipetted into the wells of a 96-well microtiter plate (Greiner, Lumitrac600 high binding polystyrene; 20 μl sample per well). 200 µl of reaction buffer (PBS with 0.2% tween-20, 0.1% bovine IgG, 0.1% ovine IgG and 0.02% mouse IgG, pH 7.4) containing 1% BSA was added to the wells. or did not contain BSA (0% BSA). The microplates were incubated for 1 hour at room temperature (= stage 1). After that, the microplates were washed 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100) and 200 μl of 1% BSA-containing reaction buffer with labeled acridinium ether anti-ApoE4 antibody was added to the wells . The microplates were incubated for 1 hour at room temperature (= stage 2) and washed again 4 times with the wash solution. Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).
6.2 Результаты6.2 Results
Сигналы образцов, инкубированных в буфере без BSA, были достоверно ниже, чем с присутствием BSA в реакционной смеси (см. таблицу 3, фиг.5). С помощью обоих вариантов анализа было возможным дифференцировать ApoE4-позитивные и ApoE4-негативные образцы с использованием контроля отсечения. Следовательно, BSA не является необходимым для связывания ApoE4, но неожиданно он существенно усиливал связывание ApoE4 с твердой фазой и, таким образом, можно необязательно добавлять его в реакционный буфер для усиления сигналов. Такой результат является неожиданным, поскольку BSA обычно используется для блокирования неспецифических сигналов и часто сопровождается более низкими сигналами после добавления BSA.The signals of samples incubated in buffer without BSA were significantly lower than with the presence of BSA in the reaction mixture (see table 3, figure 5). With both assays, it was possible to differentiate between ApoE4 positive and ApoE4 negative samples using cutoff control. Therefore, BSA is not necessary for ApoE4 binding, but surprisingly it significantly enhanced ApoE4 binding to the solid phase and thus it can optionally be added to the reaction buffer to enhance signals. This result is unexpected since BSA is commonly used to block non-specific signals and is often accompanied by lower signals after BSA addition.
Таблица 3Table 3
Пример 7Example 7
Количественное определение ApoE4 в образцах плазмы.Quantification of ApoE4 in plasma samples.
7.1 Методы7.1 Methods
Анализ ApoE4 проводили, как описано в примере 2. Для количественного определения уровней ApoE4 в плазме использовали калибраторы. Рекомбинантный ApoE4 последовательно разводили в ApoE4-негативной плазме человека с получением калибровочной кривой в диапазоне концентраций 0,01-21,87 мкг/мл. Концентрацию ApoE4 в образцах рассчитывали с использованием калибровочной кривой на основе линейной регрессии. Образцы, которые показали значения RLU выше самого высокого стандартного значения, разводили ApoE4-негативной плазмой человека и замеряли повторно. Контроль отсечения с определенной концентрацией 4 мкг/мл также измеряли в качестве контроля для стандартной кривой.ApoE4 assay was performed as described in Example 2. Calibrators were used to quantify plasma ApoE4 levels. Recombinant ApoE4 was serially diluted in ApoE4-negative human plasma to obtain a calibration curve over a concentration range of 0.01-21.87 µg/mL. The concentration of ApoE4 in the samples was calculated using a calibration curve based on linear regression. Samples that showed RLU values above the highest standard value were diluted with ApoE4-negative human plasma and measured again. A cut-off control at a specific concentration of 4 μg/mL was also measured as a control for the standard curve.
7.2 Результаты7.2 Results
В диапазоне концентраций от 0,01 до 21,87 мкг/мл ApoE4 линейно разводится (см. фиг. 6). В таблице 4 приведены измеренные значения RLU и рассчитанные концентрации ApoE4. ApoE4-позитивные образцы имели концентрации в диапазоне 9,7-30,4 мкг/мл. Концентрация всех ApoE4-негативных образцов во всех случаях составляла <0,1 мкг/мл (фоновое значение в анализе). Концентрация контроля отсечения равнялась 4 мкг/мл, точно так же, как измерено с помощью калибраторов, разбавленных перед измерением.In the concentration range from 0.01 to 21.87 μg/ml ApoE4 linearly diluted (see Fig. 6). Table 4 shows the measured RLU values and the calculated ApoE4 concentrations. ApoE4-positive samples had concentrations in the range of 9.7-30.4 µg/ml. The concentration of all ApoE4-negative samples in all cases was <0.1 μg/ml (baseline value in the analysis). The cutoff control concentration was 4 µg/mL, exactly as measured with the calibrators diluted prior to measurement.
Пример 8Example 8
Влияние предварительного покрытия белком на связывание ApoE4 с твердой фазой.Effect of protein precoating on ApoE4 binding to the solid phase.
8.1 Методы8.1 Methods
96-луночный микротитрационный планшет (Greiner, Lumitrac600 высокосвязывающий полистирол) предварительно покрывали 300 мкл на лунку человеческой сыворотки (ApoE4-негативной) или насыщенным раствором, содержащим 6,5 мМ KH2PO4, 3,5 мМ Na2HPO4×2 H2O, 3% Karion (сахар) и 0,5% BSA в течение 18 ч при комнатной температуре. После инкубации микропланшеты промывали 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100).A 96-well microtiter plate (Greiner, Lumitrac600 high binding polystyrene) was pre-coated with 300 µl per well of human serum (ApoE4 negative) or a saturated solution containing 6.5 mM KH 2 PO 4 , 3.5 mM Na 2 HPO 4 ×2 H 2 O, 3% Karion (sugar) and 0.5% BSA for 18 hours at room temperature. After incubation, the microplates were washed 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100).
Затем проводили анализ ApoE4 в одностадийной процедуре (как описано в примере 2).ApoE4 analysis was then performed in a one-step procedure (as described in Example 2).
Образцы плазмы (ApoE4-позитивные и ApoE4-негативные) и образцы рекомбинантного ApoE4 (рекомбинантный ApoE4 в ApoE4-негативной плазме человека) непосредственно пипетировали в лунки 96-луночного микротитрационного планшета (20 мкл образца на лунку). Лунки заполняли 200 мкл реакционного буфера (PBS с 0,2% твина-20, 0,1% бычьего IgG, 0,1% овечьего IgG и 0,02% мышиного IgG, pH 7,4), содержащего меченное эфиром акридиния анти-ApoE4-антитело. После этого микропланшеты промывали 4 раза раствором для промывания (20 мМ PBS, pH 7,4, 0,1% тритона X-100). Люминесценцию (в относительных световых единицах (RLU)) измеряли с использованием люминометра MTP (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).Plasma samples (ApoE4-positive and ApoE4-negative) and recombinant ApoE4 samples (recombinant ApoE4 in human ApoE4-negative plasma) were pipetted directly into the wells of a 96-well microtiter plate (20 μl of sample per well). The wells were filled with 200 µl of reaction buffer (PBS with 0.2% tween-20, 0.1% bovine IgG, 0.1% ovine IgG and 0.02% mouse IgG, pH 7.4) containing acridinium ester labeled anti- ApoE4 antibody. Thereafter, the microplates were washed 4 times with a wash solution (20 mM PBS, pH 7.4, 0.1% Triton X-100). Luminescence (in relative light units (RLU)) was measured using an MTP luminometer (Centro LB960, Berthold Technologies GmbH, Bad Wildbad).
8.2 Результаты8.2 Results
Как показано на фиг. 7 (A) ApoE4-позитивные образцы ЭДТА-плазмы давали достоверный сигнал на необработанной твердой фазе. Напротив, лунки, предварительно обработанные белок-содержащим раствором (либо BSA, либо сывороткой человека), не давали сигнала.As shown in FIG. 7(A) ApoE4-positive EDTA plasma samples gave a significant signal on the untreated solid phase. In contrast, wells pre-treated with a protein-containing solution (either BSA or human serum) produced no signal.
Аналогично, как показано на фиг. 7 (B), ApoE4-негативные образцы ЭДТА-плазмы, содержащие различные концентрации рекомбинантного ApoE4, давали достоверный сигнал на необработанных лунках, но не давали сигнал, когда инкубацию проводили в лунках, предварительно обработанных белком.Similarly, as shown in FIG. 7(B), ApoE4-negative EDTA plasma samples containing various concentrations of recombinant ApoE4 gave a significant signal in untreated wells, but no signal when incubated in wells pre-treated with protein.
СсылкиLinks
Aggarwal N.T., Wilson R.S., Beck T.L. et al. The apolipoprotein E epsilon4 allele and incident Alzheimer's disease in persons with mild cognitive impairment. Neurocase. 2005; 11(1):3-7.Aggarwal N.T., Wilson R.S., Beck T.L. et al. The apolipoprotein E epsilon4 allele and incident Alzheimer's disease in persons with mild cognitive impairment. Neurocase. 2005; 11(1):3-7.
Bakbak B. et al., 2015. Association of Apolipoprotein E Polymorphism with Intravitreal Ranibizumab Treatment Outcomes in Age-Related Macular Degeneration. Current eye research, 3683(October), pp. 1-5.Bakbak B. et al., 2015. Association of Apolipoprotein E Polymorphism with Intravitreal Ranibizumab Treatment Outcomes in Age-Related Macular Degeneration. Current eye research, 3683(October), pp. 1-5.
Bury J. et al., 1986. Apolipoprotein E quantified by enzyme-linked immunosorbent assay. Clin Chem., 32(2), pp. 265-70.Bury J. et al., 1986. Apolipoprotein E quantified by enzyme-linked immunosorbent assay. Clin Chem., 32(2), pp. 265-70.
Cacabelos R. et al., 2012. Genomics of dementia: APOE - And CYP2D6-related pharmacogenetics. International Journal of Alzheimer's Disease, 2012(518901).Cacabelos R. et al., 2012. Genomics of dementia: APOE - And CYP2D6-related pharmacogenetics. International Journal of Alzheimer's Disease, 2012(518901).
Calero O. et al., 2009. Apolipoprotein E genotyping method by Real Time PCR, a fast and cost-effective alternative to the TaqMan and FRET® assays. J. Neurosci. Methods, 183(2), pp. 238-40.Calero O. et al., 2009. Apolipoprotein E genotyping method by Real Time PCR, a fast and cost-effective alternative to the TaqMan and FRET® assays. J. Neurosci. Methods, 183(2), pp. 238-40.
Deng B. et al., 2014. Aptamer binding assays for proteins: The thrombin example-A review. Analytica Chimica Acta, 837, pp. 1-15.Deng B. et al., 2014. Aptamer binding assays for proteins: The thrombin example-A review. Analytica Chimica Acta, 837, pp. 1-15.
Hegemann D., Brunner H. & Oehr C., 2003. Plasma treatment of polymers for surface and adhesion improvement. Nuclear Instruments and Methods in Physics, 208, pp. 281-286.Hegemann D., Brunner H. & Oehr C., 2003. Plasma treatment of polymers for surface and adhesion improvement. Nuclear Instruments and Methods in Physics, 208, pp. 281-286.
Hesse C. et al., 2000. Measurement of Apolipoprotein E (apoE) in Cerebrospinal Fluid. Neurochemical Research, 25(4), pp. 511-517.Hesse C. et al., 2000. Measurement of Apolipoprotein E (apoE) in Cerebrospinal Fluid. Neurochemical Research, 25(4), pp. 511-517.
Høgåsen K. et al., 1993. Quantitation of vitronectin and clusterin Pitfalls and solutions in enzyme immunoassays for adhesive proteins. Journal of Immunological Methods, 160, pp. 107-115.Høgåsen K. et al., 1993. Quantitation of vitronectin and clusterin Pitfalls and solutions in enzyme immunoassays for adhesive proteins. Journal of Immunological Methods, 160, pp. 107-115.
Holmquist L., 1982. Loss of human serum apolipoproteins C and E during manipulation of diluted solutions. Journal of Lipid Research, 23, pp. 357-359.Holmquist L., 1982. Loss of human serum apolipoproteins C and E during manipulation of diluted solutions. Journal of Lipid Research, 23, pp. 357-359.
Kirk-Othmer, Encyclopedia of chemical technology, 4th ed., executive editor, J. I. Kroschwitz; editor, M. Howe-Grant, John Wiley & Sons, 1993, vol. 15, p. 518-562, включено здесь посредством ссылки, в том числе цитаты на страницах 551-562.Kirk-Othmer, Encyclopedia of chemical technology, 4th ed., executive editor, J. I. Kroschwitz; editor, M. Howe-Grant, John Wiley & Sons, 1993, vol. 15, p. 518-562, incorporated here by reference, including the quotations on pages 551-562.
Lane R.D. (1985). A short-duration polyethylene glycol fusiontechnique for increasing production of monoclonal antibody-secreting hybridomas. J. Immunol. Meth., 81: 223-228Lane R.D. (1985). A short-duration polyethylene glycol fusiontechnique for increasing production of monoclonal antibody-secreting hybridomas. J. Immunol. Meth. 81: 223-228
Leduc V. et al., 2011. Function and comorbidities of apolipoprotein e in Alzheimer's disease. International Journal of Alzheimer's disease, 2011(974361).Leduc V. et al., 2011. Function and comorbidities of apolipoprotein e in Alzheimer's disease. International Journal of Alzheimer's disease, 2011(974361).
Li J. et al., 2011. Peptide aptamers with biological and therapeutic applications. Current medicinal chemistry, 18(27), pp. 4215-22.Li J. et al., 2011. Peptide aptamers with biological and therapeutic applications. Current medicinal chemistry, 18(27), pp. 4215-22.
Love J.E. et al., 2015. Alternative splicing in Alzheimer´s Disease. J Parkinsons Dis Alzheimers Dis. 2(2). pii: 6.Love J.E. et al., 2015. Alternative splicing in Alzheimer's Disease. J Parkinsons Dis Alzheimers Dis. 2(2). pii: 6.
Marx et al., Monoclonal Antibody Production, ATLA 25, 121, 1997Marx et al., Monoclonal Antibody Production,
Mayeux R. et al., 1998. Utility of the Apolipoprteoin E Genotype in the Diagnosis of Alzheimer's Disease. N. Engl. J. Med., 338(8), pp. 506-511.Mayeux R. et al., 1998. Utility of the Apolipopreoin E Genotype in the Diagnosis of Alzheimer's Disease. N. Engl. J. Med., 338(8), pp. 506-511.
Rohn T.T., 2013. Proteolytic cleavage of apolipoprotein E4 as the keystone for the heightened risk associated with Alzheimer's disease, Int. J. Mol. Sci., 14(7):14908-22.Rohn T.T., 2013. Proteolytic cleavage of apolipoprotein E4 as the keystone for the heightened risk associated with Alzheimer's disease, Int. J. Mol. Sci., 14(7):14908-22.
Sanger F., Coulson A.R. (May 1975). "A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase". J. Mol. Biol., 94 (3): 441-8Sanger F., Coulson A.R. (May 1975). "A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase". J. Mol. Biol., 94 (3): 441-8
Verghese P.B., Castellano J.M. & Holtzman D.M., 2011. Roles of Apolipoprotein E in Alzheimer's disease and other neurological disorders. Lancet neurology, 10(3), pp. 241-252.Verghese P.B., Castellano J.M. & Holtzman D.M., 2011. Roles of Apolipoprotein E in Alzheimer's disease and other neurological disorders. Lancet neurology, 10(3), pp. 241-252.
Weisgraber K.H. & Mahley R.W., 1996. Human apolipoprotein E: the Alzheimer's disease connection. Federation of American Societies for Experimental Biology, 10, pp. 1485-94.Weisgraber K.H. & Mahley R.W., 1996. Human apolipoprotein E: the Alzheimer's disease connection. Federation of American Societies for Experimental Biology, 10, pp. 1485-94.
Xu Y., Yang X. & Wang E., 2010. Review: Aptamers in microfluidic chips. Analytica chimica acta, 683(1), pp. 12-20.Xu Y., Yang X. & Wang E., 2010. Review: Aptamers in microfluidic chips. Analytica chimica acta, 683(1), pp. 12-20.
Ziegler B. et al. (1996) Glutamate decarboxylase (GAD) is not detectable on the surface of rat islet cells examined by cytofluorometry and complement-dependent antibody-mediated cytotoxicity of monoclonal GAD antibodies, Horm. Metab. Res. 28: 11-15)Ziegler B. et al. (1996) Glutamate decarboxylase (GAD) is not detectable on the surface of rat islet cells examined by cytofluorometry and complement-dependent antibody-mediated cytotoxicity of monoclonal GAD antibodies, Horm. Metab. Res. 28:11-15)
Zhong L. et al., 2016. A rapid and cost-effective method for genotyping apolipoprotein E gene polymorphism. Molecular Neurodegeneration, 11(2), pp. 1-8.Zhong L. et al., 2016. A rapid and cost-effective method for genotyping apolipoprotein E gene polymorphism. Molecular Neurodegeneration, 11(2), pp. 1-8.
ПоследовательностиSequences
SEQ ID NO: 1SEQ ID NO: 1
SEQ ID NO: 2 (человеческий преApoE4 1-317, SEQ ID NO: 2 (human preApoE4 1-317, включая сигнальную последовательностьincluding signal sequence ))
SEQ ID NO: 3 (фрагмент ApoE4 1-165)SEQ ID NO: 3 (ApoE4 fragment 1-165)
SEQ ID NO: 4 (фрагмент ApoE4 1-185)SEQ ID NO: 4 (ApoE4 fragment 1-185)
SEQ ID NO: 5 (фрагмент ApoE4 1-191)SEQ ID NO: 5 (ApoE4 fragment 1-191)
SEQ ID NO: 6 (фрагмент ApoE4 1-202)SEQ ID NO: 6 (ApoE4 fragment 1-202)
SEQ ID NO: 7 (фрагмент ApoE4 1-229)SEQ ID NO: 7 (ApoE4 fragment 1-229)
SEQ ID NO: 8 (фрагмент ApoE4 1-231)SEQ ID NO: 8 (ApoE4 fragment 1-231)
SEQ ID NO: 9 (фрагмент ApoE4 1-251)SEQ ID NO: 9 (ApoE4 fragment 1-251)
SEQ ID NO: 10 (фрагмент ApoE4 1-259)SEQ ID NO: 10 (ApoE4 fragment 1-259)
SEQ ID NO: 11 (фрагмент ApoE4 1-260)SEQ ID NO: 11 (ApoE4 fragment 1-260)
SEQ ID NO: 12 (фрагмент ApoE4 1-266)SEQ ID NO: 12 (ApoE4 fragment 1-266)
SEQ ID NO: 13 (фрагмент ApoE4 1-271)SEQ ID NO: 13 (ApoE4 fragment 1-271)
SEQ ID NO: 14 (фрагмент ApoE4 1-272)SEQ ID NO: 14 (ApoE4 fragment 1-272)
SEQ ID NO: 15 (ApoE4 72-299)SEQ ID NO: 15 (ApoE4 72-299)
Описание фигурDescription of figures
Фиг. 1:Fig. one:
(A) Анализ образцов плазмы с известным генотипом ApoE. Концентрации ApoE4 в плазме коррелируют с генетическим статусом (низкие значения для ApoE4-негативных образцов, высокие значения для ApoE4-позитивных образцов; статистический анализ: критерий Манна-Уитни).(A) Analysis of plasma samples with a known ApoE genotype. Plasma ApoE4 concentrations correlate with genetic status (low values for ApoE4-negative samples, high values for ApoE4-positive samples; statistical analysis: Mann-Whitney test).
(B) ROC-кривая анализа ApoE4 с генотипом (AUC - площадь под кривой).(B) ROC curve of ApoE4 analysis with genotype (AUC - area under the curve).
Фиг. 2:Fig. 2:
Результаты измерения уровней ApoE4 после предварительной инкубации в пробирках из различного материала с добавлением и без добавления детергента (PS - полистирол, PP - полипропилен, PET - полиэтилентерефталат).Results of measuring ApoE4 levels after pre-incubation in test tubes of various materials with and without detergent added (PS - polystyrene, PP - polypropylene, PET - polyethylene terephthalate).
Фиг. 3:Fig. 3:
Результаты измерения уровней ApoE4 в MTP после предварительной обработки MTP с/без детергента (тритона X-100). Аналитический буфер содержал тритон X-100 (0,05%) или не содержал детергента (0%), образцы анализировали в одностадийной процедуре. Показан контроль отсечения (A), два ApoE4-позитивных образца D1 (B) и D2 (C) и ApoE4-отрицательный образец D3 (D).Results of measuring ApoE4 levels in MTP after MTP pretreatment with/without detergent (Triton X-100). Assay buffer contained Triton X-100 (0.05%) or no detergent (0%), samples were analyzed in a one-step procedure. Clipping control shown (A), two ApoE4-positive samples D1 (B) and D2 (C) and ApoE4-negative sample D3 (D).
Фиг. 4:Fig. 4:
Сравнение одностадийного и двустадийного анализа ApoE4. Пунктирная линия показывает значение контроля отсечения. Каждый образец со значениями ниже такого значения отсечения является ApoE4-негативным, и каждый образец со значениями выше порогового значения является ApoE4-позитивным.Comparison of one-step and two-step ApoE4 assay. The dotted line shows the clipping control value. Each sample with values below this cut-off value is ApoE4-negative, and each sample with values above the cut-off value is ApoE4-positive.
Фиг. 5:Fig. five:
Анализ связывания ApoE4 с твердой фазой в присутствии (1%)/ отсутствии (0%) BSA. Пунктирная линия показывает значение контроля отсечения (C) в соответствующем варианте анализа.Analysis of ApoE4 binding to solid phase in the presence (1%)/absence (0%) of BSA. The dotted line shows the cutoff control value (C) in the corresponding assay.
Фиг. 6:Fig. 6:
Линейная регрессия стандартов ApoE4 в диапазоне концентраций от 0,01 до 21,87 мкг/мл.Linear regression of ApoE4 standards over the concentration range from 0.01 to 21.87 µg/mL.
Фиг. 7:Fig. 7:
Результаты измерение уровней ApoE4 после предварительной обработки твердой фазы белковым раствором (бычьим сывороточным альбумином или человеческой сывороткой).Results Measurement of ApoE4 levels after pretreatment of the solid phase with a protein solution (bovine serum albumin or human serum).
(A) Результаты измерения ApoE4-позитивных и ApoE4-негативных образцов в нативной ЭДТА-плазме.(A) Measurement results of ApoE4-positive and ApoE4-negative samples in native EDTA plasma.
(B) Результаты измерения растворов рекомбинантного ApoE4.(B) Measurement results of recombinant ApoE4 solutions.
--->--->
Список последовательностейSequence list
<110> sphingotec GmbH<110> sphingotec GmbH
<120> СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АПОЛИПОПРОТЕИНА Е4<120> METHOD FOR DETERMINING APOLYPOPROTEIN E4
<130> S75097WO<130> S75097WO
<150> EP 16 193 587.9<150> EP 16 193 587.9
<151> 2016-10-12<151> 2016-10-12
<160> 15 <160> 15
<170> PatentIn version 3.5<170>PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 299<211> 299
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 1<400> 1
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met
260 265 270 260 265 270
Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu Val Glu Lys Val Gln Ala Ala Val Gly Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu Val Glu Lys Val Gln Ala Ala Val Gly
275 280 285 275 280 285
Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro Ser Asp Asn His Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro Ser Asp Asn His
290 295 290 295
<210> 2<210> 2
<211> 317<211> 317
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 2<400> 2
Met Lys Val Leu Trp Ala Ala Leu Leu Val Thr Phe Leu Ala Gly Cys Met Lys Val Leu Trp Ala Ala Leu Leu Val Thr Phe Leu Ala Gly Cys
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Ala Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Gln Ala Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu
20 25 30 20 25 30
Arg Gln Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Arg Gln Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu
35 40 45 35 40 45
Gly Arg Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Gly Arg Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln
50 55 60 50 55 60
Val Gln Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Val Gln Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Met Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Leu Met Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu
85 90 95 85 90 95
Glu Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Glu Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser
100 105 110 100 105 110
Lys Glu Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Lys Glu Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp
115 120 125 115 120 125
Val Arg Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Val Arg Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu
130 135 140 130 135 140
Gly Gln Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Gly Gln Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg
145 150 155 160 145 150 155 160
Lys Leu Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Lys Leu Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg
165 170 175 165 170 175
Leu Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Leu Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Ser Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Ser Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val
195 200 205 195 200 205
Arg Ala Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Arg Ala Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg
210 215 220 210 215 220
Ala Gln Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ala Gln Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly
225 230 235 240 225 230 235 240
Ser Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Ser Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu
245 250 255 245 250 255
Val Arg Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Val Arg Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala
260 265 270 260 265 270
Glu Ala Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Glu Ala Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu
275 280 285 275 280 285
Asp Met Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu Val Glu Lys Val Gln Ala Ala Asp Met Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu Val Glu Lys Val Gln Ala Ala
290 295 300 290 295 300
Val Gly Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro Ser Asp Asn His Val Gly Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro Ser Asp Asn His
305 310 315 305 310 315
<210> 3<210> 3
<211> 165<211> 165
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 3<400> 3
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Val Tyr Gln Ala Gly
165 165
<210> 4<210> 4
<211> 185<211> 185
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 4<400> 4
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val
180 185 180 185
<210> 5<210> 5
<211> 191<211> 191
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 5<400> 5
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg
180 185 190 180 185 190
<210> 6<210> 6
<211> 202<211> 202
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 6<400> 6
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro
195 200 195 200
<210> 7<210> 7
<211> 229<211> 229
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 7<400> 7
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Thr Arg Asp Arg Leu
225 225
<210> 8<210> 8
<211> 231<211> 231
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 8<400> 8
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu
225 230 225 230
<210> 9<210> 9
<211> 251<211> 251
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 9<400> 9
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg
245 250 245 250
<210> 10<210> 10
<211> 259<211> 259
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 10<400> 10
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Phe Gln Ala
<210> 11<210> 11
<211> 260<211> 260
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 11<400> 11
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Arg Phe Gln Ala Arg
260 260
<210> 12<210> 12
<211> 266<211> 266
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 12<400> 12
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu
260 265 260 265
<210> 13<210> 13
<211> 271<211> 271
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 13<400> 13
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp
260 265 270 260 265 270
<210> 14<210> 14
<211> 272<211> 272
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 14<400> 14
Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln Lys Val Glu Gln Ala Val Glu Thr Glu Pro Glu Pro Glu Leu Arg Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg Gln Thr Glu Trp Gln Ser Gly Gln Arg Trp Glu Leu Ala Leu Gly Arg
20 25 30 20 25 30
Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln Phe Trp Asp Tyr Leu Arg Trp Val Gln Thr Leu Ser Glu Gln Val Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met Glu Glu Leu Leu Ser Ser Gln Val Thr Gln Glu Leu Arg Ala Leu Met
50 55 60 50 55 60
Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Asp Glu Thr Met Lys Glu Leu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu
85 90 95 85 90 95
Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg
100 105 110 100 105 110
Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu
130 135 140 130 135 140
Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala
165 170 175 165 170 175
Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala
245 250 255 245 250 255
Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met
260 265 270 260 265 270
<210> 15<210> 15
<211> 228<211> 228
<212> Белок<212> Protein
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 15<400> 15
Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu Lys Ala Tyr Lys Ser Glu Leu Glu Glu Gln Leu Thr Pro Val Ala Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Glu Thr Arg Ala Arg Leu Ser Lys Glu Leu Gln Ala Ala Gln Ala Arg
20 25 30 20 25 30
Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg Leu Gly Ala Asp Met Glu Asp Val Arg Gly Arg Leu Val Gln Tyr Arg
35 40 45 35 40 45
Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Ser Thr Glu Glu Leu Arg Val Gly Glu Val Gln Ala Met Leu Gly Gln Ser Thr Glu Glu Glu Leu Arg Val
50 55 60 50 55 60
Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp Arg Leu Ala Ser His Leu Arg Lys Leu Arg Lys Arg Leu Leu Arg Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg Ala Asp Asp Leu Gln Lys Arg Leu Ala Val Tyr Gln Ala Gly Ala Arg
85 90 95 85 90 95
Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro Glu Gly Ala Glu Arg Gly Leu Ser Ala Ile Arg Glu Arg Leu Gly Pro
100 105 110 100 105 110
Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala Leu Val Glu Gln Gly Arg Val Arg Ala Ala Thr Val Gly Ser Leu Ala
115 120 125 115 120 125
Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg Gly Gln Pro Leu Gln Glu Arg Ala Gln Ala Trp Gly Glu Arg Leu Arg
130 135 140 130 135 140
Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu Ala Arg Met Glu Glu Met Gly Ser Arg Thr Arg Asp Arg Leu Asp Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala Val Lys Glu Gln Val Ala Glu Val Arg Ala Lys Leu Glu Glu Gln Ala
165 170 175 165 170 175
Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser Gln Gln Ile Arg Leu Gln Ala Glu Ala Phe Gln Ala Arg Leu Lys Ser
180 185 190 180 185 190
Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu Trp Phe Glu Pro Leu Val Glu Asp Met Gln Arg Gln Trp Ala Gly Leu
195 200 205 195 200 205
Val Glu Lys Val Gln Ala Ala Val Gly Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro Val Glu Lys Val Gln Ala Ala Val Gly Thr Ser Ala Ala Pro Val Pro
210 215 220 210 215 220
Ser Asp Asn His Ser Asp Asn His
225 225
<---<---
Claims (30)
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP16193587.9A EP3309550A1 (en) | 2016-10-12 | 2016-10-12 | Method for the detection of apolipoprotein e4 |
EP16193587.9 | 2016-10-12 | ||
PCT/EP2017/076046 WO2018069437A1 (en) | 2016-10-12 | 2017-10-12 | Method for the detection of apolipoprotein e4 |
Publications (4)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2019113771A RU2019113771A (en) | 2020-11-13 |
RU2019113771A3 RU2019113771A3 (en) | 2021-02-04 |
RU2779197C2 RU2779197C2 (en) | 2022-09-05 |
RU2779197C9 true RU2779197C9 (en) | 2022-12-15 |
Family
ID=
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1994009155A1 (en) * | 1992-10-13 | 1994-04-28 | Duke University | Methods of detecting alzheimer's disease |
WO2003070169A2 (en) * | 2002-02-19 | 2003-08-28 | Ilex Products, Inc. | Aminodiphosphonate apolipoprotein e modulators |
RU2014123511A (en) * | 2011-11-10 | 2015-12-20 | Дженентек, Инк | METHODS FOR TREATING, DIAGNOSTIC AND MONITORING ALZHEIMER'S DISEASE |
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1994009155A1 (en) * | 1992-10-13 | 1994-04-28 | Duke University | Methods of detecting alzheimer's disease |
WO2003070169A2 (en) * | 2002-02-19 | 2003-08-28 | Ilex Products, Inc. | Aminodiphosphonate apolipoprotein e modulators |
RU2014123511A (en) * | 2011-11-10 | 2015-12-20 | Дженентек, Инк | METHODS FOR TREATING, DIAGNOSTIC AND MONITORING ALZHEIMER'S DISEASE |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
LIU C.-C. et al., Apolipoprotein E and Alzheimer disease: risk, mechanisms and therapy, NATURE REV. NEUROL., (2013), vol. 9, no. 2, pages 106 - 118, DOI: http://dx.doi.org/10.1038/nrneurol.2012.263. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2023002599A (en) | Method for detecting apolipoprotein E4 | |
JP6713478B2 (en) | Method for measuring PIVKA-II, and method for producing PIVKA-II immunoassay reagent or kit | |
WO2013035799A1 (en) | Antibody capable of binding to specific region of periostin, and method for measuring periostin using same | |
US9494606B2 (en) | Quantification of lipoproteins | |
JP2012058048A (en) | Method for improving accuracy of periostin measurement | |
US11267882B2 (en) | Methods of detecting human IL-21 | |
RU2779197C9 (en) | Method for determination of apolipoprotein e4 | |
RU2779197C2 (en) | Method for determination of apolipoprotein e4 | |
WO2014147873A1 (en) | Antibody that binds specifically with hmgb1 decomposition product, and method and reagent for assaying hmgb1 decomposition product | |
RU2671578C2 (en) | Method for predicting risk of getting cancer or diagnosing cancer in female subject | |
US11327078B2 (en) | Monoclonal antibody against APOA4, immunological measurement method, and kit for measurement | |
WO2017188312A1 (en) | Assay method for anti-drug antibodies | |
WO2022023461A1 (en) | Improved epitope for detecting and/or quantifying autoantibodies against alpha-fetoprotein | |
JP6407990B2 (en) | Augrin immunoassay | |
JP7066142B2 (en) | How to improve the sensitivity of periostin measurement contained in a sample | |
JP5750646B2 (en) | Test method for allergic diseases by measuring SCCA2 concentration | |
WO2018194134A1 (en) | Anti-periostin antibody-immobilized carrier, periostin measurement reagent, and method for stabilizing anti-periostin antibody in carrier having said antibody immobilzed thereon | |
JP5750645B2 (en) | Testing method for allergic diseases | |
JP2021063020A (en) | Antibodies that bind to decomposition product of hmgb1, methods and reagents for measuring hmgb1 decomposition product |