KR102584898B1 - Methods for diagnosis about endometrial carcinoma and kit using the same - Google Patents

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김재훈
최정아
정준용
박영훈
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연세대학교 산학협력단
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Abstract

본 명세서에서는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, 넥틴-4(Nectin-4) 발현율을 측정하는 단계; 및 측정된 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단 방법 및 이를 이용한 키트가 제공된다. 본 발명에 따르면, 자궁내막암의 진단, 예측 및 평가할 수 있는 새로운 바이오마커를 제공할 수 있는 효과가 있다.The present specification includes measuring the expression rate of Nectin-4 in a biological sample isolated from an individual; And a method for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which includes determining whether an individual develops endometrial cancer based on the measured expression rate of nectin-4, and a kit using the same are provided. According to the present invention, there is an effect of providing a new biomarker that can diagnose, predict, and evaluate endometrial cancer.

Description

자궁내막암 진단 방법 및 이를 이용한 키트 {METHODS FOR DIAGNOSIS ABOUT ENDOMETRIAL CARCINOMA AND KIT USING THE SAME}Endometrial cancer diagnosis method and kit using the same {METHODS FOR DIAGNOSIS ABOUT ENDOMETRIAL CARCINOMA AND KIT USING THE SAME}

본 발명은 자궁내막암을 진단하는 방법 및 이를 이용한 키트에 관한 것이다. The present invention relates to a method for diagnosing endometrial cancer and a kit using the same.

자궁내막암이란 자궁 내 공간을 덮고 있는 자궁내막에 발생하는 암이다. 조기 진단 시 예후가 긍정적인 것으로 알려져 있으나, 전이 및 재발 위험성이 높기 때문에 지속적인 관리가 필수적이다. Endometrial cancer is cancer that occurs in the endometrium that covers the space within the uterus. The prognosis is known to be positive when diagnosed early, but continuous management is essential because the risk of metastasis and recurrence is high.

자궁내막암은 자궁경부암 및 난소암과는 구별되는 다른 암으로서, 자궁 입구 쪽에서 발생하면 자궁경부암, 자궁 윗부분에 속하는 체부에 생긴 암은 자궁내막암, 자궁 좌우측에 있는 난소에 생긴 암을 난소암이라고 한다. Endometrial cancer is a different type of cancer that is distinct from cervical cancer and ovarian cancer. When it occurs at the entrance to the uterus, it is called cervical cancer, when it occurs in the body part of the upper part of the uterus, it is called endometrial cancer, and when it occurs in the ovaries on the left and right sides of the uterus, it is called ovarian cancer. do.

특히, 난소암 중 가장 큰 비중을 차지하는 상피성 난소암 중 자궁내막양 선암(endometrioid carcinoma)은 자궁내막암(endometrial cancer)와 유사한 이름을 가졌으나, 자궁내막양 선암(endometroid carcinoma)는 자궁내막암(endometrial cancer)와는 구별되는 다른 암이다. In particular, among epithelial ovarian cancers, which account for the largest proportion of ovarian cancers, endometrioid adenocarcinoma has a name similar to endometrial cancer, but endometrioid carcinoma is endometrial cancer. It is a different cancer that is distinct from (endometrial cancer).

현재 자궁내막암의 진단은 대부분의 경우, 초음파 검사와 자궁내막세포 도말검사 등으로 수행되고 있으며, 초음파 검사를 통해 자궁내막의 두께가 측정되고, 자궁내막 조직을 얻어 현미경을 통해 세포를 확인하는 검사가 수행된다. 그러나 자궁내막암 진단검사는 혈액 검사처럼 쉽고 비용이 저렴한 검사가 아니며, 자궁경부 세포진 검사로는 자궁내막암을 진단할 수 없다. Currently, the diagnosis of endometrial cancer is, in most cases, performed through ultrasound and endometrial cell smears. The thickness of the endometrium is measured through ultrasound, and endometrial tissue is obtained and cells are identified through a microscope. is performed. However, endometrial cancer diagnostic testing is not as easy and inexpensive as a blood test, and endometrial cancer cannot be diagnosed with a cervical cytology test.

따라서, 현재 자궁내막암의 진단은 증상이 있어서 내원하는 환자를 대상으로 시행되고 있어 암 진단이 늦어지는 경우가 많다. Therefore, the diagnosis of endometrial cancer is currently performed on patients who visit the hospital because of symptoms, and cancer diagnosis is often delayed.

따라서, 증상이 없더라도 자궁내막암의 조기 진단이 가능하며, 진단의 정확도가 높은 바이오마커가 필요한 실정이다. Therefore, early diagnosis of endometrial cancer is possible even if there are no symptoms, and a biomarker with high diagnostic accuracy is needed.

발명의 배경이 되는 기술은 본 발명에 대한 이해를 보다 용이하게 하기 위해 작성되었다. 발명의 배경이 되는 기술에 기재된 사항들이 선행기술로 존재한다고 인정하는 것으로 이해되어서는 안 된다. The technology behind the invention has been written to facilitate easier understanding of the invention. It should not be understood as an admission that matters described in the technology underlying the invention exist as prior art.

본 발명자들은 자궁내막암 (Endometrial carcinoma, EC)에서 자궁내막암 발병과 넥틴-4 발현과의 관계는 아직 밝혀져 있지 않음에 주목하였다. The present inventors noted that the relationship between endometrial cancer development and nectin-4 expression in endometrial carcinoma (EC) is not yet known.

이에, 본 발명자들은 자궁내막암(Endometrial carcinoma, EC)에서의 넥틴-1, 넥틴-2 및 넥틴-4를 포함한 넥틴 유전자의 카피수(Log2 copy number units)를 정상군(Normal)과 비교한 결과, 자궁내막암(EC)에서의 넥틴-4 유전자의 카피수가 정상군(Normal)과 비교하였을 때, 큰 폭으로 증가되어 있음을 발견하였다. Accordingly, the present inventors compared the copy number (Log2 copy number units) of nectin genes including nectin-1, nectin-2, and nectin-4 in endometrial carcinoma (EC) with the normal group (Normal). , it was found that the copy number of the nectin-4 gene in endometrial cancer (EC) was significantly increased compared to the normal group.

나아가, 본 발명자들은 넥틴-4 발현율이 자궁내막암 진단에 효과적일 수 있음에 주목하였으며, 그 결과, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 대한 정보 제공 방법을 개발할 수 있었다. Furthermore, the present inventors noted that the nectin-4 expression rate can be effective in diagnosing endometrial cancer, and as a result, they were able to develop a method of providing information on the diagnosis of endometrial cancer using the nectin-4 expression rate.

이에, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는, 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, 넥틴-4 (Nectin-4)의 발현율을 측정하고, 측정된 넥틴-4 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 진단에 대한 정보를 제공하도록 구성된, 자궁내막암 진단 방법 및 이를 이용한 키트를 제공하는 것이다. Accordingly, the problem to be solved by the present invention is to measure the expression rate of Nectin-4 in biological samples isolated from an individual, and to diagnose endometrial cancer in an individual based on the measured Nectin-4 expression rate. The goal is to provide endometrial cancer diagnosis methods and kits using the same, which are configured to provide information about endometrial cancer.

본 발명의 과제들은 이상에서 언급한 과제들로 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다. The problems of the present invention are not limited to the problems mentioned above, and other problems not mentioned will be clearly understood by those skilled in the art from the description below.

전술한 바와 같은 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, 넥틴-4(Nectin-4) 발현율을 측정하는 단계 및 측정된 상기 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계를 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단 방법을 제공한다.In order to solve the problems described above, the present invention provides a step of measuring the expression rate of nectin-4 in a biological sample isolated from an individual, and measuring the expression rate of nectin-4 in the uterus of the individual based on the measured expression rate of nectin-4. A method for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, including the step of determining whether endometrial cancer has occurred, is provided.

본 명세서에 사용되는 용어 "개체"는, 자궁내막암을 포함한 암 질환에 걸렸는지 진단하고자 하는 인간을 포함하는 동물을 의미할 수 있으며, 숙주, 대상체, 환자와 같은 용어로 혼용되어 사용될 수 있다. As used herein, the term “individual” may refer to an animal, including a human, for which it is intended to be diagnosed with a cancerous disease, including endometrial cancer, and may be used interchangeably with terms such as host, subject, and patient.

본 명에서에 사용되는 용어 “자궁내막암 (Endometrial carcinoma, EC)”은, 자궁 윗부분에 속하는 체부에 생긴 전이성을 가진 악성 암 또는 악성 종양을 의미할 수 있다. The term “endometrial carcinoma (EC)” used in the present name may refer to a malignant cancer or malignant tumor with metastatic properties that arises in the body part belonging to the upper part of the uterus.

본 명세서에 사용되는 용어 “자궁내막 양성암 (Endometrial intraepithelial neoplasia, EIN)”은, 자궁 윗부분에 속하는 체부의 자궁내막조직 일부가 과하게 증식해 덩어리가 된 것으로 일정 크기 이상 자라지 않으며 다른 조직에 전이되지 않는 양성 암 또는 양성 종양을 의미할 수 있다. The term “endometrial intraepithelial neoplasia (EIN)” used in this specification refers to a benign cancer that does not grow beyond a certain size and does not metastasize to other tissues. It can mean cancer or benign tumor.

본 명세서에서 사용되는 용어 "넥틴-4 (Nectin-4)"는 넥틴-4 단백질 또는 넥틴-4 단백질을 코딩하는 유전자를 의미할 수 있다. 넥틴-4 (Nectin-4) 단백질은 폴리오바이러스 수용체 관련 단백질 4 (Poliovirus receptor-related-4, PVRL4)로도 알려졌으며, 약 52 kDa 크기의 막관통 단백질이다.The term “Nectin-4” used herein may refer to the nectin-4 protein or a gene encoding the nectin-4 protein. Nectin-4 protein, also known as poliovirus receptor-related-4 (PVRL4), is a transmembrane protein of approximately 52 kDa in size.

본 명세서에서 사용되는 용어 "넥틴-4 발현율”은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 있는 세포, 바람직하게는 자궁내막조직 샘플의 수집된 세포들 중에서 넥틴-4를 발현하는 세포의 수를 비율로 표현한 것일 수 있다. 이때, 비율은 퍼센트(%)로 표시될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. The term "nectin-4 expression rate" used herein is expressed as a ratio of the number of cells expressing nectin-4 among cells collected from a biological sample isolated from an individual, preferably an endometrial tissue sample. In this case, the ratio may be expressed as a percentage (%), but is not limited thereto.

본 명세서에서 사용되는 용어 "넥틴-4 발현율 측정"은 넥틴-4 (nectin-4)의 단백질 또는 이의 유전자의 mRNA의 수준을 측정하는 것을 의미할 수 있다.The term “nectin-4 expression rate measurement” used herein may mean measuring the level of nectin-4 protein or mRNA of its gene.

본 명세서에서 사용된 용어 "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 진단은 자궁내막암 발병 여부를 확인하는 것으로서, 넥틴-4 발현율에 기초하여 자궁내막암 발병 여부를 조기에 확인할 수 있다. As used herein, the term “diagnosis” means confirming the presence or characteristics of a pathological condition. For the purpose of the present invention, diagnosis is to confirm the occurrence of endometrial cancer, and the occurrence of endometrial cancer can be confirmed early based on the nectin-4 expression rate.

본 명세서에서 사용되는 용어, "유전자 카피수"는 세포에서 핵산 분자의 카피수를 지칭한다. 유전자 카피수는 세포의 게놈(염색체) DNA에서의 유전자 카피수를 포함한다. 정상 세포(비-종양 세포)에서 유전자 카피수는 정상적으로 2 카피(염색체 쌍의 각각의 구성원에서 1 카피)이다. 유전자 카피수는 종종 세포 집단의 샘플로부터 수득된 유전자 카피수의 절반을 포함한다. As used herein, the term “gene copy number” refers to the number of copies of a nucleic acid molecule in a cell. Gene copy number includes the number of gene copies in a cell's genomic (chromosomal) DNA. Gene copy number in normal cells (non-tumor cells) is normally 2 copies (1 copy for each member of a chromosome pair). The gene copy number often includes half the gene copy number obtained from a sample of the cell population.

본 발명의 특징에 따르면, 전술한 개체의 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계는, 측정된 넥틴-4 발현율이 미리 결정된 수준 이상인 경우, 전술한 개체에게 자궁내막암이 발병한 것으로 결정하는 단계를 더 포함할 수 있다. According to a feature of the present invention, the step of determining whether the above-mentioned individual develops endometrial cancer includes determining that the above-mentioned individual has endometrial cancer when the measured nectin-4 expression rate is above a predetermined level. More may be included.

본 발명의 다른 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율은 상기 분리된 생물학적 시료 중에서 수집된 세포수 대비 넥틴-4를 발현하는 세포수의 비율일 수 있다. According to another feature of the present invention, the above-mentioned nectin-4 expression rate may be the ratio of the number of cells expressing nectin-4 to the number of cells collected from the separated biological sample.

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 미리 결정된 수준은, 생물학적 시료 내에서 넥틴-4 발현율이 0.5% 이상인 것일 수 있다. According to another feature of the present invention, the above-mentioned predetermined level may be a nectin-4 expression rate of 0.5% or more in the biological sample.

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율 측정법은, 면역조직화학염색법, RT-PCR, 노던 블로팅(northern blotting), 마이크로어레이(microarray), NPA (nuclease protection assay, NPA) 또는 인 시투 하이브리다이제이션(in situ hybridization), ELISA, 웨스턴 블로팅(western blotting), 방사선면역분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS, 단백질 칩 키트, DNA 칩 키트로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나일 수 있다. According to another feature of the present invention, the above-described method for measuring the expression rate of nectin-4 is immunohistochemical staining, RT-PCR, northern blotting, microarray, nuclease protection assay (NPA), or In situ hybridization, ELISA, western blotting, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion, Ouchterlony immunodiffusion, rocket immunoelectrophoresis, immunoprecipitation assay, and complement fixation. It may be at least one selected from the group consisting of analysis method, FACS, protein chip kit, and DNA chip kit.

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 생물학적 시료는, 조직액, 정액, 골수액, 림프액, 눈물, 콧물, 침, 땀, 젖, 혈액, 혈청, 혈장 및 조직으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나일 수 있다. According to another feature of the present invention, the above-described biological sample may be at least one selected from the group consisting of tissue fluid, semen, bone marrow fluid, lymph fluid, tears, nasal discharge, saliva, sweat, milk, blood, serum, plasma, and tissue. there is.

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 조직은, 자궁내막 조직이고, 면역조직 화학염색에 이용될 수 있는 생물학적 시료이며, 냉동 조직절편, 파라핀 절편, 세포도말 표본으로 이루어진 군에서 선택되는 것일 수 있다. According to another feature of the present invention, the above-described tissue is endometrial tissue, is a biological sample that can be used for immunohistochemical staining, and is selected from the group consisting of frozen tissue sections, paraffin sections, and cell smears. You can.

전술한 바와 같은 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여 넥틴-4 발현율을 측정하도록 구성된 제제를 포함하고, 측정된 상기 넥틴-4 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암에 대한 정보를 제공하기 위한 수단을 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트를 제공한다. In order to solve the problems described above, the present invention includes an agent configured to measure the expression rate of nectin-4 in a biological sample isolated from an individual, and based on the measured expression rate of nectin-4, the present invention provides a method for detecting endometrial cancer in an individual based on the measured expression rate of nectin-4. Provided is a kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which includes a means for providing information on endometrial cancer.

본 발명의 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트의 넥틴-4 발현율을 측정하도록 구성된 제제는, 넥틴-4 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드(oligopeptide), 리간드(ligand), PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer) 중 적어도 하나일 수 있다. According to a feature of the present invention, the agent configured to measure the nectin-4 expression rate of the kit for providing information on endometrial cancer using the above-described nectin-4 expression rate includes an antibody, an oligopeptide that specifically binds to the nectin-4 protein. It may be at least one of an oligopeptide, a ligand, a peptide nucleic acid (PNA), and an aptamer.

본 발명의 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트는 넥틴-4를 코딩하는 유전자의 mRNA 발현율을 측정하는 제제를 더 포함할 수 있다. According to a feature of the present invention, the kit for providing information on endometrial cancer using the above-described nectin-4 expression rate may further include an agent for measuring the mRNA expression rate of the gene encoding nectin-4.

본 발명의 다른 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4를 코딩하는 유전자의 mRNA 발현율을 측정하는 제제는, 넥틴-4를 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머(primer), 프로브(probe) 및 뉴클레오티드(nucleotide) 중 적어도 하나일 수 있다. According to another feature of the present invention, the agent for measuring the mRNA expression rate of the gene encoding the nectin-4 described above includes primers, probes, and nucleotides that specifically bind to the gene encoding nectin-4. It may be at least one of (nucleotide).

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트는 전술한 개체의 자궁내막암에 대한 예후 정보를 제공하기 위한 수단을 포함할 수 있으며, 전술한 수단은 자궁내막암에 대한 정보를 디스플레이 하도록 구성된 장치이고, 자궁내막암에 대한 정보를 제공하기 위하여 분리된 컴퓨팅 장치에 넥틴-4의 발현율을 전달하기 위한 통신부를 포함할 수 있다. According to another feature of the present invention, the kit for providing information on endometrial cancer using the above-described nectin-4 expression rate may include means for providing prognostic information on endometrial cancer of the above-mentioned individual, One means is a device configured to display information about endometrial cancer, and may include a communication unit for transmitting the expression rate of nectin-4 to a separate computing device to provide information about endometrial cancer.

나아가, 본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 자궁내막암에 대한 정보를 디스플레이 하도록 구성된 컴퓨팅 장치는, 측정된 넥틴-4의 발현율이 미리 결정된 수준 이상인 경우, 넥틴-4 발현율을 포함하는 자궁내막암으로 결정된 정보를 제공할 수 있다. 이때, 넥틴-4 발현율은 상기 분리된 생물학적 시료 중에서 수집된 세포수 대비 넥틴-4를 발현하는 세포수의 비율일 수 있다. 나아가, 전술한 미리 결정된 수준은, 생물학적 시료 내에서 넥틴-4 발현 세포 비율이 0.5% 이상일 수 있다. Furthermore, according to another feature of the present invention, the computing device configured to display information about the above-described endometrial cancer, when the measured expression rate of nectin-4 is above a predetermined level, the endometrium including the nectin-4 expression rate It can provide information that has been determined to be cancer. At this time, the nectin-4 expression rate may be the ratio of the number of cells expressing nectin-4 to the number of cells collected from the separated biological sample. Furthermore, the predetermined level described above may be a percentage of nectin-4 expressing cells in the biological sample of 0.5% or more.

본 발명의 또 다른 특징에 따르면, 전술한 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트에 사용되는 생물학적 시료는, 자궁내막 조직이고, 면역조직 화학염색에 이용될 수 있는 생물학적 시료이며, 냉동 조직절편, 파라핀 절편, 세포도말 표본으로 이루어진 군에서 선택되는 것일 수 있다. According to another feature of the present invention, the biological sample used in the kit for providing information on endometrial cancer using the above-described nectin-4 expression rate is endometrial tissue, and is a biological sample that can be used for immunohistochemical staining. , may be selected from the group consisting of frozen tissue sections, paraffin sections, and cell smears.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명한다. 다만, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것에 불과하므로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 한정되는 것으로 해석되어서는 아니된다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples. However, since these examples are only for illustrative purposes of the present invention, the scope of the present invention should not be construed as being limited by these examples.

본 발명은 자궁내막암의 진단, 예측 및 평가할 수 있는 새로운 바이오마커를 제공할 수 있는 효과가 있다.The present invention has the effect of providing a new biomarker for diagnosing, predicting, and evaluating endometrial cancer.

또한, 본 발명은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, 넥틴-4의 발현율을 측정하도록 구성된 제제를 포함하고, 측정된 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체에게 자궁내막암 발병 여부를 알려주는 키트를 더 제공할 수 있다. In addition, the present invention provides a kit that includes an agent configured to measure the expression rate of nectin-4 in a biological sample isolated from an individual, and informs whether the individual develops endometrial cancer based on the measured expression rate of nectin-4. More can be provided.

나아가, 본 발명은 정상군과 자궁내막암 환자를 넥틴-4 발현율에 따라 분류하여 확률값으로 구하고, 민감도와 특이도 및 ROC 커브를 기초로 하여 컷오프(cutoff) 값을 구한 후, 높은 정확도로 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계를 포함하는 방법을 제공할 수 있다. Furthermore, the present invention classifies normal groups and endometrial cancer patients according to the nectin-4 expression rate, obtains a probability value, calculates a cutoff value based on sensitivity, specificity, and ROC curve, and then determines the endometrial cancer with high accuracy. A method comprising determining whether cancer has occurred may be provided.

또한, 본 발명에서 제공하는 바이오마커를 사용할 경우, 보다 높은 용이성과 정확성으로 자궁내막암을 조기 진단할 수 있으므로 자궁내막암 환자의 생존율을 높이는데 기여할 수 있다. In addition, when using the biomarker provided by the present invention, endometrial cancer can be diagnosed early with greater ease and accuracy, thereby contributing to increasing the survival rate of endometrial cancer patients.

본 발명에 따른 효과는 이상에서 예시된 내용에 의해 제한되지 않으며, 더욱 다양한 효과들이 본 명세서 내에 포함되어 있다. The effects according to the present invention are not limited to the contents exemplified above, and further various effects are included in the present specification.

도 1은 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막암에 대한 정보 제공 방법의 절차를 예시적으로 도시한 것이다.
도 2는 자궁내막암(Endometrial carcinoma, EC)에서의 넥틴-4 유전자의 카피수(Log2 copy number units)를 정상군(Normal)과 대비하여 나타낸 결과이다.
도 3a는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막 정상(Normal) 조직, 자궁내막 양성암(Endometrial intraepithelial neoplasia, EIN) 조직 및 자궁내막암 (Endothelial carcinoma, EC) 조직에서 발현된 넥틴-4에 대한 면역조직화학염색(immunohistochemical staining, IHC) 결과를 도시한 것이다.
도 3b는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막 정상군(Normal), 자궁내막 양성암 군(EIN) 및 자궁내막암 군(EC) 에서의 넥틴-4 발현 세포의 비율을 나타내는 결과이다.
도 4a는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 수신자 조작 특성(receiver operating characteristic, ROC) 곡선에서 유덴 인덱스(Youden index)법을 통해서 얻은 최적의 컷오프값(Cutoff value)을 이용하여 예측된 넥틴-4 발현율에 따른 자궁내막암 예측의 정확도를 나타낸다.
도 4b는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 넥틴-4 발현율에 따른 자궁내막암 예측을 위한 ROC 곡선의 컷오프값(cutoff value), 민감도(sensitivity), 특이도(specificity), 양성예측도(Positive predictive value, PPV) 및 음성예측도(Negative predictive value, NPV)를 나타낸다.
Figure 1 exemplarily illustrates the procedures of a method for providing information on endometrial cancer according to various embodiments of the present invention.
Figure 2 shows the results showing the copy number (Log2 copy number units) of the nectin-4 gene in endometrial carcinoma (EC) compared to the normal group.
Figure 3a shows immunity against nectin-4 expressed in normal endometrial tissue, endometrial intraepithelial neoplasia (EIN) tissue, and endometrial cancer (Endothelial carcinoma (EC)) tissue according to various embodiments of the present invention. This shows the results of immunohistochemical staining (IHC).
Figure 3b is a result showing the ratio of nectin-4 expressing cells in the normal endometrial group (Normal), endometrial benign cancer group (EIN), and endometrial cancer group (EC) according to various embodiments of the present invention.
Figure 4a shows the nectin-4 expression rate predicted using the optimal cutoff value obtained through the Youden index method in the receiver operating characteristic (ROC) curve according to various embodiments of the present invention. It indicates the accuracy of endometrial cancer prediction according to .
Figure 4b shows the cutoff value, sensitivity, specificity, and positive predictive value of the ROC curve for predicting endometrial cancer according to the nectin-4 expression rate according to various embodiments of the present invention. value, PPV) and negative predictive value (NPV).

본 발명의 이점 및 특징, 그리고 그것들을 달성하는 방법은 첨부되는 도면과 함께 상세하게 후술되어 있는 실시예들을 참조하면 명확해질 것이다. 그러나, 본 발명은 이하에서 개시되는 실시예들에 한정되는 것이 아니라 서로 다른 다양한 형태로 구현될 것이며, 단지 본 실시예들은 본 발명의 개시가 완전하도록 하며, 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 발명의 범주를 완전하게 알려주기 위해 제공되는 것이며, 본 발명은 청구항의 범주에 의해 정의될 뿐이다. The advantages and features of the present invention and methods for achieving them will become clear by referring to the embodiments described in detail below along with the accompanying drawings. However, the present invention is not limited to the embodiments disclosed below and will be implemented in various different forms, but the present embodiments only serve to ensure that the disclosure of the present invention is complete and are within the scope of common knowledge in the technical field to which the present invention pertains. It is provided to fully inform those who have the scope of the invention, and the present invention is only defined by the scope of the claims.

본 문서에서 사용된 표현 "~하도록 구성된(또는 설정된)(configured to)"은 상황에 따라, 예를 들면, "~에 적합한(suitable for)," "~하는 능력을 가지는(having the capacity to)," "~하도록 설계된(designed to)," "~하도록 변경된(adapted to)," "~하도록 만들어진(made to)," 또는 "~ 를 할 수 있는(capable of)"과 바꾸어 사용될 수 있다. As used in this document, the expression “configured to” depends on the situation, for example, “suitable for,” “having the capacity to.” ," can be used interchangeably with "designed to," "adapted to," "made to," or "capable of."

본 문서에서 사용된 용어들은 단지 특정한 실시 예를 설명하기 위해 사용된 것으로, 다른 실시예의 범위를 한정하려는 의도가 아닐 수 있다. 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함할 수 있다. 기술적이거나 과학적인 용어를 포함해서 여기서 사용되는 용어들은 본 문서에 기재된 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가질 수 있다. 본 문서에 사용된 용어들 중 일반적인 사전에 정의된 용어들은, 관련 기술의 문맥상 가지는 의미와 동일 또는 유사한 의미로 해석될 수 있으며, 본 문서에서 명백하게 정의되지 않는 한, 이상적이거나 과도하게 형식적인 의미로 해석되지 않는다. 경우에 따라서, 본 문서에서 정의된 용어일지라도 본 문서의 실시예들을 배제하도록 해석될 수 없다.Terms used in this document are merely used to describe specific embodiments and may not be intended to limit the scope of other embodiments. Singular expressions may include plural expressions, unless the context clearly dictates otherwise. Terms used herein, including technical or scientific terms, may have the same meaning as generally understood by a person of ordinary skill in the technical field described in this document. Among the terms used in this document, terms defined in general dictionaries may be interpreted to have the same or similar meaning as the meaning they have in the context of related technology, and unless clearly defined in this document, have an ideal or excessively formal meaning. It is not interpreted as In some cases, even terms defined in this document cannot be interpreted to exclude embodiments of this document.

본 발명의 여러 실시예들의 각각 특징들이 부분적으로 또는 전체적으로 서로 결합 또는 조합 가능하며, 당업자가 충분히 이해할 수 있듯이 기술적으로 다양한 연동 및 구동이 가능하며, 각 실시예들이 서로에 대하여 독립적으로 실시 가능할 수도 있고 연관 관계로 함께 실시 가능할 수도 있다. Each feature of the various embodiments of the present invention can be partially or fully combined or combined with each other, and as can be fully understood by those skilled in the art, various technical interconnections and operations are possible, and each embodiment may be implemented independently of each other. It may be possible to conduct them together due to a related relationship.

이하에서는 도 1을 참조하여, 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막암 진단 방법의 절차에 대하여 구체적으로 설명한다.Hereinafter, with reference to FIG. 1, the procedures of the endometrial cancer diagnosis method according to various embodiments of the present invention will be described in detail.

도 1은 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막암 진단 방법의 절차를 예시적으로 도시한 것이다.Figure 1 exemplarily illustrates the procedures of an endometrial cancer diagnosis method according to various embodiments of the present invention.

도 1을 참조하면, 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막암 진단 방법은 먼저, 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여 넥틴-4 (Nectin-4)의 발현율을 측정하고 (S110), 측정된 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 발병 여부를 결정하도록 구성된다 (S120).Referring to Figure 1, the endometrial cancer diagnosis method according to various embodiments of the present invention first measures the expression rate of nectin-4 (Nectin-4) in a biological sample isolated from an individual (S110), and the measured nectin It is configured to determine whether an individual develops endometrial cancer based on the expression rate of -4 (S120).

본 발명의 다양한 실시예에 따르면, 넥틴-4 발현율 측정은 넥틴-4 (nectin-4)의 단백질 또는 이의 유전자의 mRNA의 수준을 측정하는 것을 의미할 수 있다. According to various embodiments of the present invention, measuring the expression rate of nectin-4 may mean measuring the level of protein of nectin-4 or mRNA of its gene.

나아가, 넥틴-4 과발현은 넥틴-4를 발현하는 세포의 비율 (% of positive cells)이 미리 정해진 기준값 이상이라는 것을 의미할 수 있다. Furthermore, nectin-4 overexpression may mean that the percentage of positive cells expressing nectin-4 is greater than a predetermined reference value.

본 발명의 다양한 실시예에 따르면, 자궁내막암은 넥틴-4 단백질이 과발현된 특징을 나타내는 암을 포함할 수 있다. 그러나, 이에 제한되지 않고, 넥틴-4가 과발현되고 조절되지 않는 세포 성장으로 특징 지어진 생리학적 상태를 가진 암들을 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 개시에서 정보를 제공할 수 있는 암은 대장암, 췌장암, 위암, 간암, 자궁경부암, 갑상선암, 부갑상선암, 폐암, 비소세포성 폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신강골반 암종, 중추신경계 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌사수체 선종으로 이루어진 그룹에서 선택된 적어도 하나를 포함할 수 있으나, 바람직하게는 자궁내막암일 수 있다. According to various embodiments of the present invention, endometrial cancer may include cancer characterized by overexpression of nectin-4 protein. However, it is not limited to this and may include cancers in which nectin-4 is overexpressed and has a physiological state characterized by uncontrolled cell growth. For example, cancers for which information may be provided in the present disclosure include colon cancer, pancreatic cancer, stomach cancer, liver cancer, cervical cancer, thyroid cancer, parathyroid cancer, lung cancer, non-small cell lung cancer, prostate cancer, gallbladder cancer, biliary tract cancer, and non-Hodgkin's lymphoma. , Hodgkin lymphoma, blood cancer, bladder cancer, kidney cancer, melanoma, colon cancer, bone cancer, skin cancer, head cancer, uterine cancer, rectal cancer, brain tumor, perianal cancer, fallopian tube carcinoma, vaginal cancer, vulvar carcinoma, esophageal cancer, small intestine cancer, and endocrine cancer. At least one selected from the group consisting of adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, ureteral cancer, renal cell carcinoma, renal pelvic carcinoma, central nervous system tumor, primary CNS lymphoma, spinal cord tumor, brainstem glioma, or cerebral pituitary adenoma. It may include, but preferably, it may be endometrial cancer.

여기서, 본 발명의 다양한 실시예에 따르면, mRNA 발현율을 측정하는 제제는 넥틴-4를 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머(primer), 프로브(probe) 및 뉴클레오티드(nucleotide) 중 적어도 하나일 수 있다. Here, according to various embodiments of the present invention, the agent for measuring the mRNA expression rate may be at least one of a primer, a probe, and a nucleotide that specifically binds to the gene encoding nectin-4. there is.

나아가, 넥틴-4 단백질의 발현율을 측정하는 제제는 넥틴-4 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드(oligopeptide), 리간드(ligand), PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer) 중 적어도 하나로 구성될 수 있다. Furthermore, the agent for measuring the expression rate of the nectin-4 protein includes at least an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid), and aptamer that specifically binds to the nectin-4 protein. It can be composed of one.

나아가, 도 1을 참조하면, 개체의 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계에서 넥틴-4 발현율은 개체로부터 분리된 생물학적 시료, 바람직하게는 자궁내막조직 절편으로부터 수집된 세포들 중에서 넥틴-4를 발현하는 세포의 수를 비율로 표현한 것일 수 있으며, 측정된 넥틴-4 발현 세포가 0.5% 이상일 때, 개체에게 자궁내막암이 발병한 것으로 결정할 수 있다. Furthermore, referring to Figure 1, in the step of determining whether an individual develops endometrial cancer, the nectin-4 expression rate is determined by expressing nectin-4 among cells collected from a biological sample isolated from the individual, preferably an endometrial tissue section. The number of cells may be expressed as a ratio, and when the measured nectin-4 expressing cells are more than 0.5%, it can be determined that the individual has developed endometrial cancer.

그러나 제한되지 않고, 자국내막암이 발병한 것으로 결정하기 위한 미리 결정된 값은 넥틴-4발현 세포의 발현율이 0.5% 이상, 0.7821% 이상, 또는 1% 이상으로 결정될 수도 있다.However, without being limited, a predetermined value for determining that endometrium cancer has developed may be determined as an expression rate of nectin-4 expressing cells of 0.5% or more, 0.7821% or more, or 1% or more.

이때, 넥틴-4 발현율 측정은 면역조직화학염색법, RT-PCR, 노던 블로팅(northern blotting), 마이크로어레이(microarray), NPA (nuclease protection assay, NPA) 또는 인 시투 하이브리다이제이션(in situ hybridization), ELISA, 웨스턴 블로팅(western blotting), 방사선면역분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS, 단백질 칩 키트, DNA 칩 키트 중에서 선택되어 측정될 수 있다. At this time, the nectin-4 expression rate was measured using immunohistochemical staining, RT-PCR, northern blotting, microarray, nuclease protection assay (NPA), or in situ hybridization. , ELISA, western blotting, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion method, Ouchterlony immunodiffusion method, rocket immunoelectrophoresis, immunoprecipitation assay, complement fixation assay, FACS, protein chip kit, DNA chip. It can be measured by selecting from a kit.

나아가, 넥틴-4 발현율 측정에 사용된 생물학적 시료는, 조직액, 정액, 골수액, 림프액, 눈물, 콧물, 침, 땀, 젖, 혈액, 혈청, 혈장 및 조직일 수 있으나, 바람직하게는 자궁내막 조직이고, 면역조직 화학염색에 이용될 수 있는 생물학적 시료이며, 자궁내막 조직은 넥틴-4 발현율 측정을 위해 냉동 조직절편, 파라핀 절편 및 세포 도말 표본 중 하나로 처리될 수 있다. Furthermore, the biological sample used to measure the nectin-4 expression rate may be tissue fluid, semen, bone marrow fluid, lymph fluid, tears, nasal discharge, saliva, sweat, milk, blood, serum, plasma, and tissue, but is preferably endometrial tissue. It is a biological sample that can be used for immunohistochemical staining, and endometrial tissue can be processed into one of frozen tissue sections, paraffin sections, and cell smears to measure the nectin-4 expression rate.

이상의 절차에 따라, 본 발명의 다양한 실시예에 따른 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단 방법은, 넥틴-4의 발현율을 측정함으로써 자궁내막암 진단의 정확성을 높일 수 있는 정보를 제공할 수 있으며, 나아가, 상기 진단 방법을 활용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트를 제공할 수 있다. According to the above procedure, the endometrial cancer diagnosis method using the nectin-4 expression rate according to various embodiments of the present invention can provide information that can increase the accuracy of endometrial cancer diagnosis by measuring the expression rate of nectin-4. Furthermore, a kit for providing information on endometrial cancer using the above diagnostic method can be provided.

도 2는 미국 국립암연구소(NCI)의 The Cancer Genome Atlas(TCGA) 프로그램에서 발췌한 공공 데이터로부터 분석한 자궁내막암(Endometrial carcinoma, EC)에서의 넥틴-4 유전자의 카피수 (Log2 copy number units)를 정상군(Normal)과 대비하여 나타낸 결과이다. 도 2를 참조하면, 넥틴-1 및 넥틴-2는 넥틴-4와 같은 폴리오바이러스 수용체 관련 단백질 4 (PVRL4)에서 세포-세포 접착에 관여한다고 알려져 있다. 넥틴-1과 넥틴-3는 시냅스에서 상호 작용하며 뇌 발달 초기 및 노화 단계의 신경 조직에서 넥틴-1은 주로 축삭 쪽, 넥틴-3는 수지상 쪽에서 발견되는 것으로 알려지고 있다. Figure 2 shows the copy number (Log2 copy number units) of the nectin-4 gene in endometrial carcinoma (EC) analyzed from public data extracted from The Cancer Genome Atlas (TCGA) program of the U.S. National Cancer Institute (NCI). ) is the result compared to the normal group (Normal). Referring to Figure 2, nectin-1 and nectin-2 are known to be involved in cell-cell adhesion in poliovirus receptor-related protein 4 (PVRL4), such as nectin-4. Nectin-1 and nectin-3 interact at synapses, and it is known that nectin-1 is mainly found on the axonal side and nectin-3 on the dendritic side in neural tissue in the early and aging stages of brain development.

도 2를 참조하면, 자궁내막암(EC)에서의 넥틴-4 유전자의 카피수는 정상군 (Normal)과 비교하였을 때, 통계적으로 유의하게 (p<0.0001) 큰 폭으로 증가되어 있음을 나타낸다. Referring to Figure 2, the copy number of the nectin-4 gene in endometrial cancer (EC) is statistically significantly (p<0.0001) significantly increased compared to the normal group (Normal).

이에, 본 발명자들은 자궁내막암(EC) 군과 정상군 (Normal)과 통계적으로 확연한 차이 (p<0.0001)를 보이는 넥틴-4 유전자의 카피수에 주목하였으며, 넥틴-4가 자궁내막암 진단을 위한 바이오마커로서 역할을 할 수 있음을 발견하였다. Accordingly, the present inventors focused on the copy number of the nectin-4 gene, which showed a statistically significant difference (p<0.0001) between the endometrial cancer (EC) group and the normal group, and found that nectin-4 was used to diagnose endometrial cancer. It was discovered that it can serve as a biomarker for

실시예 1. 넥틴-4에 대한 면역조직화학염색 (immunohistochemical staining, IHC) 결과Example 1. Immunohistochemical staining (IHC) results for nectin-4

나아가, 본 발명의 발명자들은 전술한 과정을 통하여 도출한 바이오마커로서 넥틴-4에 대해 자궁내막암에서의 발현율을 검증하고자 하였다. Furthermore, the inventors of the present invention sought to verify the expression rate of nectin-4 in endometrial cancer as a biomarker derived through the above-described process.

도 3a는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막 정상 (Normal) 조직, 자궁내막 양성암 (Endometrial intraepithelial neoplasia, EIN) 조직 및 자궁내막암 (Endothelial carcinoma, EC) 조직에서 발현된 넥틴-4에 대한 면역조직화학염색 (immunohistochemical staining, IHC) 결과를 나타낸다. Figure 3a shows immunity against nectin-4 expressed in normal endometrial tissue, endometrial intraepithelial neoplasia (EIN) tissue, and endometrial cancer (Endothelial carcinoma (EC)) tissue according to various embodiments of the present invention. Shows the results of immunohistochemical staining (IHC).

도 3a를 참조하면, 도 3a에서 넥틴-4는 황색으로 염색되어 나타나며 청색으로 염색되어 나타난 것은 세포의 핵을 나타낸다. 도 3a의 우측에 도시된 “Cytoplasmic & membrane”은 도 3a의 (A), (B) 및 (C)에서 황색으로 염색된 부분이 세포질과 세포막에 발현한 넥틴-4 단백질임을 나타내며, 도 3a의 우측에 도시된 “Cytoplasmic”은 도 3a의 (D), (E) 및 (F)에서 황색으로 염색된 부분이 세포질에 발현한 넥틴-4 단백질임을 나타낸다. Referring to FIG. 3A, nectin-4 in FIG. 3A appears stained yellow, and nectin-4 stained blue represents the nucleus of the cell. “Cytoplasmic & membrane” shown on the right side of Figure 3a indicates that the yellow-stained areas in (A), (B), and (C) of Figure 3a are nectin-4 proteins expressed in the cytoplasm and cell membrane. “Cytoplasmic” shown on the right indicates that the yellow-stained area in (D), (E), and (F) of Figure 3a is the nectin-4 protein expressed in the cytoplasm.

다시 도 3a를 참조하면, 넥틴-4의 발현율은 자궁내막 정상군(Normal) 조직 (도 3a의 (A) 및 (D)) 및 자궁내막 양성암(EIN) 조직 (도 3a의 (B) 및 (E)) 과 비교하여 자궁내막암(EC) 조직 (도 3a의 (C) 및 (F)) 에서 더 높게 나타난다 Referring again to Figure 3a, the expression rate of nectin-4 is the normal endometrial tissue ((A) and (D) in Figure 3a) and endometrial benign cancer (EIN) tissue ((B) and (in Figure 3a) It appears higher in endometrial cancer (EC) tissue ((C) and (F) of Figure 3a) compared to E)).

도 3b는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 자궁내막 정상 환자군(Normal), 자궁내막 양성암 환자군(EIN) 및 자궁내막암 환자군(EC) 에서의 자궁내막 조직 내에서 넥틴-4 발현 세포의 비율(% of positive cells, intensity > weak, low)을 나타내는 결과이다. Figure 3b shows the ratio (%) of nectin-4 expressing cells in endometrial tissue in normal endometrial patients (Normal), endometrial benign cancer patients (EIN), and endometrial cancer patients (EC) according to various embodiments of the present invention. This result shows (of positive cells, intensity > weak, low).

이때, 넥틴-4 발현율은 미국 R&D사의 Nectin-4 ELISA 키트를 이용하여 측정하였다. At this time, the nectin-4 expression rate was measured using the Nectin-4 ELISA kit from an American R&D company.

도 3b를 참조하면, 자궁내막암 환자군(EC)의 중간선(median) 값은 23.615%의 넥틴-4 발현 세포 비율 (% of positive cell)을 나타낸다. 즉, 자궁내막암 환자군(EC)에서 자궁내막 조직 내에서 23.615%의 세포가 넥틴-4 발현 세포인 것임을 의미할 수 있다. 상기 자궁내막암 군의 23.615%의 넥틴-4 발현 세포 비율은 넥틴-4 발현 세포가 거의 없는 정상군(Normal)의 중간선(median) 값(0%)과 대비하여 확연한 차이를 보이며, 자궁내막 양성암 군(EIN)의 중간선(median) 값 3.87% 와 비교하였을 때도 확연히 높은 넥틴-4 발현 세포 비율을 나타낸다. Referring to Figure 3b, the median value of the endometrial cancer patient group (EC) represents a % of positive cells expressing nectin-4 of 23.615%. In other words, this may mean that 23.615% of the cells in the endometrial tissue in the endometrial cancer patient group (EC) are nectin-4 expressing cells. The ratio of nectin-4 expressing cells of 23.615% in the endometrial cancer group shows a clear difference compared to the median value (0%) of the normal group, which has almost no nectin-4 expressing cells, and shows a clear difference in the endometrial cancer group. Even when compared to the median value of 3.87% in the benign cancer group (EIN), the percentage of cells expressing nectin-4 is clearly higher.

즉, 자궁내막 조직 내에서 넥틴-4 발현 세포의 비율은 자궁내막 정상군(Normal) 및 자궁내막 양성암 군(EIN) 보다 자궁내막암 군(EC)에서 높게 나타난다 (p<0.0001). In other words, the proportion of nectin-4 expressing cells in endometrial tissue is higher in the endometrial cancer group (EC) than in the normal endometrial group (Normal) and the endometrial benign cancer group (EIN) (p<0.0001).

< 넥틴-4에 대한 면역조직화학염색 및 측정 방법 > < Immunohistochemical staining and measurement method for nectin-4 >

자궁내막 조직에서의 넥틴-4 발현율 확인을 위해 자궁내막조직을 면역조직화학염색 하고자 하였으며, 이를 위해 자궁내막 조직의 조직 마이크로어레이(Tissue microarray, TMA)를 먼저 박절(section)하였다. 다음으로 조직 마이크로어레이 박절을 통해 얻어진 5 μm 두께의 조직 마이크로어레이(TMA) 절편은 자일렌(xylene)으로 탈파라핀화 되었고 일련의 등급 에탄올 시리즈로 다시 수화되었다. 본 발명에서는 위와 같은 과정을 통해 얻어진 시료를 생물학적 시료로 하였다.To confirm the expression rate of nectin-4 in endometrial tissue, we attempted to perform immunohistochemical staining of the endometrial tissue. For this purpose, a tissue microarray (TMA) of the endometrial tissue was first sectioned. Next, 5-μm-thick tissue microarray (TMA) sections obtained through tissue microarray sectioning were deparaffinized in xylene and rehydrated in a series of graded ethanol. In the present invention, the sample obtained through the above process was used as a biological sample.

이어서 수행된 TMA 절편의 열-매개 항원 회수(Heat-mediated antigen retrieval)는 pH 6.0의 구연산염 버퍼 처리후 압력 챔버 (Pascal; Dako, Carpinteria, CA, USA)를 사용하여 수행되었다. Heat-mediated antigen retrieval of TMA sections was then performed using a pressure chamber (Pascal; Dako, Carpinteria, CA, USA) after treatment with citrate buffer at pH 6.0.

다음으로, 시료는 내인성 과산화효소 활성 억제를 위해 3% 과산화수소소 용액 (Dako)으로 상온에서 20분간 침지 되었고, 이어서 상기 TMA 절편 슬라이드는 실온에서 1시간 동안 mouse monoclonal anti-Nectin-4 antibody (Santa Cruz Biotechnology, Dallas, TX, USA)로 염색되었다. Next, the sample was immersed in 3% hydrogen peroxide solution (Dako) for 20 minutes at room temperature to inhibit endogenous peroxidase activity, and then the TMA section slide was incubated with mouse monoclonal anti-Nectin-4 antibody (Santa Cruz) for 1 hour at room temperature. Biotechnology, Dallas, TX, USA).

이후, 면역조직화학염색된 넥틴-4 단백질의 확인을 위해 슬라이드는 Envision+Ms HRP link secondary (Dako)로 염색되고 3,3'-다이아미노벤지딘(Dako)으로 시각화되었으며 헤마톡실린으로 염색되었다. 이어서, 면역 염색된 슬라이드는 Aperio AT2 디지털 스캐너(Leica Biosystems, Vista, CA)를 사용하여 스캔되었으며, Visiopharm Digital Image Analysis (DIA) software v6.9.1 (Visiopharm, Hø?rsholm, Denmark)로 이미지 분석되었다. Then, for confirmation of immunohistochemically stained nectin-4 protein, the slides were stained with Envision+Ms HRP link secondary (Dako), visualized with 3,3'-diaminobenzidine (Dako), and stained with hematoxylin. The immunostained slides were then scanned using an Aperio AT2 digital scanner (Leica Biosystems, Vista, CA) and image analyzed with Visiopharm Digital Image Analysis (DIA) software v6.9.1 (Visiopharm, Hø?rsholm, Denmark).

본 발명에서 넥틴-4 발현율은 생물학적 시료 중에서 수집된 세포수 대비 넥틴-4를 발현하는 세포의 백분율 (0-100%)로 표현되었다. In the present invention, the nectin-4 expression rate was expressed as the percentage (0-100%) of cells expressing nectin-4 compared to the number of cells collected from the biological sample.

실시예 2. 넥틴-4 발현율에 따른 자궁내막암 예측의 정확도Example 2. Accuracy of endometrial cancer prediction according to nectin-4 expression rate

도 4a는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 수신자 조작 특성 (receiver operating characteristic, ROC) 곡선에서 유덴 인덱스(Youden index)법을 통해서 얻은 최적의 컷오프값 (Cutoff value)을 이용하여 예측된 넥틴-4 발현율에 따른 자궁내막암 예측의 정확도를 나타낸다. 통계에 사용된 정상군(normal)의 개수는 87개이고, 시험군인 자궁내막암 군(EC)의 개수는 320개이다. Figure 4a shows the nectin-4 expression rate predicted using the optimal cutoff value obtained through the Youden index method in the receiver operating characteristic (ROC) curve according to various embodiments of the present invention. It indicates the accuracy of endometrial cancer prediction according to . The number of normal groups used in statistics is 87, and the number of endometrial cancer groups (EC), which is the test group, is 320.

도 4b는 본 발명의 다양한 실시예에 따른 넥틴-4 발현율에 따른 자궁내막암 예측을 위한 도 4a의 ROC 곡선의 컷오프값 (cutoff value), 민감도(sensitivity), 특이도(specificity), 양성예측도(Positive predictive value, PPV) 및 음성예측도(Negative predictive value, NPV)를 나타낸다. Figure 4b shows the cutoff value, sensitivity, specificity, and positive predictive value of the ROC curve of Figure 4a for predicting endometrial cancer according to the nectin-4 expression rate according to various embodiments of the present invention. (Positive predictive value, PPV) and negative predictive value (NPV).

도 4a에 따르면, 자궁내막암 발병 여부 판단을 위한, 넥틴-4 발현 세포비율(% of positive cells)의 컷오프값(cutoff value)을 0.7821%로 했을 때, AUC= 0.922 의 높은 수치를 나타내므로, 자궁내막암에서의 넥틴-4 발현율이 0.7821% 이상일 때, 자궁내막암일 확률이 높음을 알 수 있다. According to Figure 4a, when the cutoff value of the percentage of positive cells expressing nectin-4 for determining the occurrence of endometrial cancer is 0.7821%, it shows a high value of AUC = 0.922, When the nectin-4 expression rate in endometrial cancer is 0.7821% or higher, the probability of endometrial cancer is high.

도 4b를 참조하면, 민감도(sensitivity)는 82.81%, 특이도(specificity)는 95.4%, 양성예측도(Positive predictive value, PPV)는 98.5%, 음성예측도(Negative predictive value, NPV)는 60.1% 를 나타낸다. 여기서, 민감도(sensitivity)는 양성인 개체에 대하여 양성을 판단할 수 있는 확률을 의미하며, 특이도(specificity)는 음성인 개체에 대하여 음성을 판단할 수 있는 확률을 의미한다. 나아가, 양성예측도(Positive predictive value, PPV)는 검사 결과가 양성일 때, 질병이 실제로 존재할 확률을 나타내고, 음성예측도(Negative predictive value, NPV)는 검사 결과가 음성일 때, 질병이 실제로 없을 확률을 의미한다. Referring to Figure 4b, sensitivity is 82.81%, specificity is 95.4%, positive predictive value (PPV) is 98.5%, and negative predictive value (NPV) is 60.1%. represents. Here, sensitivity refers to the probability of determining positive for a positive individual, and specificity refers to the probability of determining negative for a negative individual. Furthermore, positive predictive value (PPV) represents the probability that the disease actually exists when the test result is positive, and negative predictive value (NPV) represents the probability that the disease actually does not exist when the test result is negative. means.

이에, 본 발명은, 도 4a 및 도 4b의 정상군과 자궁내막암 환자를 넥틴-4 발현율에 따라 분류하는 모델에 기초하여 자궁내막암 발병 여부를 결정하는 단계를 더 포함할 수 있다. Accordingly, the present invention may further include a step of determining whether endometrial cancer develops based on a model that classifies the normal group and endometrial cancer patients in FIGS. 4A and 4B according to the nectin-4 expression rate.

이상의 실시예의 결과로, 넥틴-4 발현율, 즉 넥틴-4 발현 세포 비율이 높은 환자군은 정상군에 비하여 컷오프값 이상의 넥틴-4 발현율을 나타냄을 알 수 있다. As a result of the above examples, it can be seen that the patient group with a high nectin-4 expression rate, that is, a high proportion of nectin-4 expressing cells, shows a nectin-4 expression rate higher than the cutoff value compared to the normal group.

이에, 넥틴-4는 자궁내막암, 특히 넥틴-4 발현을 포함하는 즉, 넥틴-4 발현 자궁내막암에 대하여 특이적으로 높은 발현율을 나타내는 특정 분자 마커임을 확인할 수 있었다. 이때, 자궁내막암의 진단을 위한 생물학적 시료는 자궁내막 조직일 수 있다. 즉, 자궁내막 조직에서 넥틴-4 발현율을 측정함으로써 자궁내막암을 보다 높은 정확도로 진단할 수 있는 효과가 있다.Accordingly, it was confirmed that nectin-4 is a specific molecular marker that shows a high expression rate specifically for endometrial cancer, especially endometrial cancer including nectin-4 expression, that is, nectin-4-expressing endometrial cancer. At this time, the biological sample for diagnosing endometrial cancer may be endometrial tissue. In other words, measuring the nectin-4 expression rate in endometrial tissue has the effect of diagnosing endometrial cancer with higher accuracy.

또한, 본 발명은 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대하여, 넥틴-4의 발현율을 측정하도록 구성된 제제를 포함하고, 측정된 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체에게 자궁내막암 발병 여부를 알려주는 키트를 더 제공할 수 있다. In addition, the present invention provides a kit that includes an agent configured to measure the expression rate of nectin-4 in a biological sample isolated from an individual, and informs whether the individual develops endometrial cancer based on the measured expression rate of nectin-4. More can be provided.

본 발명의 여러 실시예들의 각각 특징들은 부분적으로 또는 전체적으로 서로 결합 또는 조합 가능하며, 당업자가 충분히 이해할 수 있듯이 기술적으로 다양한 연동 및 구동이 가능하며, 각 실시예들이 서로에 대하여 독립적으로 실 시 가능할 수도 있고 연관 관계로 함께 실시 가능할 수도 있다. Each of the features of the various embodiments of the present invention can be combined or combined with each other, partially or entirely, and as can be fully understood by those skilled in the art, various technical interconnections and operations are possible, and each embodiment may be implemented independently of each other. and may be implemented together due to a related relationship.

이상 첨부된 도면을 참조하여 본 발명의 실시예들을 더욱 상세하게 설명하였으나, 본 발명은 반드시 이러한 실시예로 국한되는 것은 아니고, 본 발명의 기술사상을 벗어나지 않는 범위 내에서 다양하게 변형 실시될 수 있다. 따라서, 본 발명에 개시된 실시예들은 본 발명의 기술 사상을 한정하기 위한 것이 아니라 설명하기 위한 것이고, 이러한 실시예에 의하여 본 발명의 기술 사상의 범위가 한정되는 것은 아니다. 그러므로, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 발명의 보호 범위는 아래의 청구범위에 의하여 해석되어야 하며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 기술 사상은 본 발명의 권리범위에 포함되는 것으로 해석되어야 할 것이다. Although embodiments of the present invention have been described in more detail with reference to the accompanying drawings, the present invention is not necessarily limited to these embodiments, and various modifications may be made without departing from the technical spirit of the present invention. . Accordingly, the embodiments disclosed in the present invention are not intended to limit the technical idea of the present invention, but are for illustrative purposes, and the scope of the technical idea of the present invention is not limited by these embodiments. Therefore, the embodiments described above should be understood in all respects as illustrative and not restrictive. The scope of protection of the present invention should be interpreted in accordance with the claims below, and all technical ideas within the equivalent scope should be construed as being included in the scope of rights of the present invention.

Claims (16)

개체로부터 분리된 자궁내막 조직 시료에 대하여, 넥틴-4(Nectin-4) 발현율을 측정하는 단계; 및
측정된 상기 넥틴-4의 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 발병 여부에 관한 정보를 제공하는 단계를 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
Measuring the expression rate of Nectin-4 in an endometrial tissue sample isolated from an individual; and
A method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, comprising providing information on whether an individual develops endometrial cancer based on the measured expression rate of nectin-4.
제1 항에 있어서,
상기 개체의 자궁내막암 발병 여부에 관한 정보를 제공하는 단계는,
측정된 넥틴-4 발현율이 미리 결정된 수준 이상인 경우,
상기 개체에게 자궁내막암이 발병한 것으로 정보를 제공하는 단계를 더 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to claim 1,
The step of providing information regarding whether the individual develops endometrial cancer,
If the measured nectin-4 expression rate is above a predetermined level,
A method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, further comprising providing information that the individual has endometrial cancer.
제1 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율은 상기 분리된 자궁내막 조직 시료 중에서 수집된 세포수 대비 넥틴-4를 발현하는 세포수의 비율인 것인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to claim 1,
The nectin-4 expression rate is a ratio of the number of cells expressing nectin-4 to the number of cells collected from the separated endometrial tissue sample. A method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate.
제2 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율의 미리 결정된 수준은,
0.5 % 이상인 것인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to clause 2,
The predetermined level of the nectin-4 expression rate is,
A method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which is 0.5% or more.
제1 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율 측정법은,
면역조직화학염색법, RT-PCR, 노던 블로팅(northern blotting), 마이크로어레이(microarray), NPA (nuclease protection assay, NPA) 또는 인 시투 하이브리다이제이션(in situ hybridization), ELISA, 웨스턴 블로팅(western blotting), 방사선면역분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS, 단백질 칩 키트, 및 DNA 칩 키트로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to claim 1,
The method for measuring the nectin-4 expression rate is,
Immunohistochemical staining, RT-PCR, northern blotting, microarray, nuclease protection assay (NPA) or in situ hybridization, ELISA, western blotting. at least one selected from the group consisting of blotting, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion, Ouchterlony immunodiffusion, rocket immunoelectrophoresis, immunoprecipitation assay, complement fixation assay, FACS, protein chip kit, and DNA chip kit. Hanain, a method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using nectin-4 expression rate.
제1 항에 있어서,
상기 자궁내막 조직 시료는,
조직액, 정액, 골수액, 림프액, 눈물, 콧물, 침, 땀, 젖, 혈액, 혈청, 혈장 및 조직으로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나를 더 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to claim 1,
The endometrial tissue sample,
Necessary for diagnosing endometrial cancer using nectin-4 expression rate, further comprising at least one selected from the group consisting of tissue fluid, semen, bone marrow fluid, lymph fluid, tears, nasal discharge, saliva, sweat, milk, blood, serum, plasma, and tissue. How to provide information.
제6 항에 있어서,
상기 자궁내막 조직은,
면역조직 화학염색에 이용될 수 있는 생물학적 시료이며,
냉동 조직절편, 파라핀 절편 및 세포도말 표본으로 이루어진 군에서 선택되는 것인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암 진단에 필요한 정보 제공 방법.
According to clause 6,
The endometrial tissue is,
It is a biological sample that can be used for immunohistochemical staining,
A method of providing information necessary for diagnosing endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which is selected from the group consisting of frozen tissue sections, paraffin sections, and cell smears.
개체로부터 분리된 자궁내막 조직 시료에 대하여 넥틴-4 발현율을 측정하도록 구성된 제제를 포함하고,
측정된 상기 넥틴-4 발현율에 기초하여 개체의 자궁내막암 발병에 대한 정보를 제공하기 위한 수단을 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
Comprising an agent configured to measure the expression rate of nectin-4 in an endometrial tissue sample isolated from an individual,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, comprising means for providing information on the development of endometrial cancer in an individual based on the measured nectin-4 expression rate.
제8 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율을 측정하도록 구성된 제제는,
넥틴-4 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드(oligopeptide), 리간드(ligand), PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer) 로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to clause 8,
The agent configured to measure the nectin-4 expression rate,
Using the nectin-4 expression rate, at least one selected from the group consisting of antibodies, oligopeptides, ligands, PNA (peptide nucleic acids), and aptamers that specifically bind to the nectin-4 protein. Informational kit about endometrial cancer.
제8 항에 있어서,
상기 넥틴-4를 코딩하는 유전자의 mRNA 발현율을 측정하는 제제를 더 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to clause 8,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, further comprising an agent for measuring the mRNA expression rate of the gene encoding the nectin-4.
제10 항에 있어서,
상기 넥틴-4를 코딩하는 유전자의 mRNA 발현율을 측정하는 제제는,
상기 넥틴-4를 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머(primer), 프로브(probe) 및 뉴클레오티드(nucleotide) 중 적어도 하나인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to claim 10,
An agent for measuring the mRNA expression rate of the gene encoding the nectin-4,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which is at least one of a primer, a probe, and a nucleotide that specifically binds to the gene encoding the nectin-4.
제8 항에 있어서,
상기 수단은,
상기 자궁내막암에 대한 정보를 디스플레이 하도록 구성된 장치이고,
상기 자궁내막암에 대한 정보를 제공하기 위하여 분리된 컴퓨팅 장치에 상기 넥틴-4의 발현율을 전달하기 위한 통신부를 포함하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to clause 8,
The means are:
A device configured to display information about endometrial cancer,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, including a communication unit for transmitting the expression rate of nectin-4 to a separate computing device to provide information on the endometrial cancer.
제12 항에 있어서,
상기 컴퓨팅 장치는,
측정된 상기 넥틴-4의 발현율이 미리 결정된 수준 이상인 경우,
넥틴-4 발현을 포함하는 자궁내막암으로 결정된 정보를 제공하는, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to claim 12,
The computing device is,
If the measured expression rate of nectin-4 is above a predetermined level,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, which provides information determined as endometrial cancer including nectin-4 expression.
제13 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율은 상기 분리된 자궁내막 조직 시료 중에서 수집된 세포수 대비 넥틴-4를 발현하는 세포수의 비율인 것인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to claim 13,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, wherein the nectin-4 expression rate is the ratio of the number of cells expressing nectin-4 to the number of cells collected from the separated endometrial tissue sample.
제13 항에 있어서,
상기 넥틴-4 발현율의 미리 결정된 수준은,
0.5 % 이상인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to claim 13,
The predetermined level of the nectin-4 expression rate is,
Kit for providing information on endometrial cancer using nectin-4 expression rate of 0.5% or higher.
제8 항에 있어서,
상기 자궁내막 조직 시료는,
면역조직 화학염색에 이용될 수 있는 생물학적 시료이며,
냉동 조직절편, 파라핀 절편 및 세포도말 표본으로 이루어진 군에서 선택되는 것인, 넥틴-4 발현율을 이용한 자궁내막암에 대한 정보 제공용 키트.
According to clause 8,
The endometrial tissue sample,
It is a biological sample that can be used for immunohistochemical staining,
A kit for providing information on endometrial cancer using the nectin-4 expression rate, selected from the group consisting of frozen tissue sections, paraffin sections, and cell smears.
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