KR102530865B1 - Self-Assembling Cyclic Peptide-Oligonucleotide Conjugates and Manufacturing Method Thereof - Google Patents

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KR102530865B1 KR1020200115225A KR20200115225A KR102530865B1 KR 102530865 B1 KR102530865 B1 KR 102530865B1 KR 1020200115225 A KR1020200115225 A KR 1020200115225A KR 20200115225 A KR20200115225 A KR 20200115225A KR 102530865 B1 KR102530865 B1 KR 102530865B1
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    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing

Abstract

본 발명은 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 관한 것으로서, 본 발명의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 용액 상에서 구조적으로 안정적이며, 균일한 크기와 형태를 갖는 자기조립체를 형성할 수 있다. 이종 빌딩블록 구조인 자기조립성 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 효율적으로 제조할 수 있는 새로운 제조방법을 제공할 수 있다The present invention relates to a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex, wherein the cyclic peptide-oligonucleotide complex of the present invention is structurally stable in solution and can form a self-assembly having a uniform size and shape. A new manufacturing method capable of efficiently preparing self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complexes, which are heterogeneous building block structures, can be provided.

Description

자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체 및 이의 제조방법{Self-Assembling Cyclic Peptide-Oligonucleotide Conjugates and Manufacturing Method Thereof}Self-Assembling Cyclic Peptide-Oligonucleotide Conjugates and Manufacturing Method Thereof

본 발명은 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 구조적으로 안정한 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체 및 이의 제조방법에 관한 것이다.The present invention relates to a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex, and more particularly, to a structurally stable self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex and a method for preparing the same.

분자의 고리화는 약물, 신소재 등의 개발에 있어서 많은 장점을 가지고 있다. 특히 고분자 및 펩티드 등의 고리화를 통해 자기조립 양상, 유리 전이온도 및 분해속도를 조절할 수 있다. Cyclization of molecules has many advantages in the development of drugs and new materials. In particular, self-assembly patterns, glass transition temperatures, and decomposition rates can be controlled through cyclization of polymers and peptides.

이종 빌딩블록의 자기조립은 제어가 어렵지만, 복잡성 및 다양성 면에서 여러 장점을 얻을 수 있다. 이러한 측면에서 자기조립성 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(peptide-oligonucleotide conjugates, POCs)는 지난 수년간 관심을 받아왔고, 세포배양물질, 약물전달, 안티센스효과 및 나노입자 기능화에 다양한 활용 가능성을 나타냈다.The self-assembly of heterogeneous building blocks is difficult to control, but offers several advantages in terms of complexity and versatility. In this respect, self-assembling peptide-oligonucleotide conjugates (POCs) have been attracting attention for the past several years, and have shown various applications for cell culture materials, drug delivery, antisense effects, and functionalization of nanoparticles.

그러나, 자기조립성 POCs를 합성하기 위해서는 다음과 같은 문제들이 있다. 첫째 핵산과 펩티드는 서열에 따라 완전히 다른 물리적, 화학적 성질(melting temperature, solubility 등)을 보이며, 이들의 화학적 합성법이 서로 호환이 되지 않는 문제가 있다. 예를 들어 DNA는 펩티드의 고체 합성법에서 사용되는 강한 산성환경을 버틸 수 없는 문제가 있다. 두번째 종래 DNA와 펩티드 합성과정은 DNA와 펩티드가 연결되는 동안에, 펩티드의 자기조립 특성이 억제되어야 하는데, 이를 제어하는 것은 거의 불가능하며, 제어되지 않으면 수율이 현저히 낮아지는 문제들이 있다. 상술한 바와 같이 해결해야할 장벽의 높이 때문에, POCs 합성방법의 개발은 아직도 지지부진한 실정이다.However, there are the following problems in synthesizing self-assembling POCs. First, nucleic acids and peptides show completely different physical and chemical properties (melting temperature, solubility, etc.) depending on the sequence, and there is a problem that their chemical synthesis methods are not compatible with each other. For example, DNA has a problem in that it cannot withstand the strong acidic environment used in solid-state synthesis of peptides. In the second conventional DNA and peptide synthesis process, while the DNA and peptide are connected, the self-assembly characteristics of the peptide must be suppressed, but it is almost impossible to control this, and there are problems in that the yield is significantly lowered if not controlled. Due to the height of the barriers to be overcome as described above, the development of methods for synthesizing POCs is still sluggish.

Morr 연구진에 의해 1999년에 고리형 POCs의 합성방법이 처음 개발되었다. 이후, Bleczinski에 의해 단백질 표면과 특이적으로 상호작용할 수 있는 물질을 개발하기 위해 고리형 POCs 라이브러리(library) 연구가 진행된 바 있다. 상기 고리형 POCs 합성방법은 측쇄기(side chain)에 보호기(protecting group)를 갖지 않거나, 산성에 약하지 않은 보호기를 갖는 한정된 아미노산과 매우 짧은 DNA에만 적용이 가능하며, 공정이 복잡하고 민감하여 반복재현이 어렵고, 비용이 높으며, 수율이 낮다는 등 다양한 문제들이 있다.The synthesis of cyclic POCs was first developed in 1999 by Morr's group. Afterwards, a study of a cyclic POCs library was conducted by Bleczinski to develop a material capable of specifically interacting with the protein surface. The method for synthesizing cyclic POCs can be applied only to limited amino acids and very short DNA that do not have a protecting group on the side chain or have a protecting group that is not weak against acid, and the process is complex and sensitive, so it can be reproduced repeatedly. There are various problems such as difficult, high cost, and low yield.

특허문헌 1. 대한민국 공개특허 제10-2016-0136695호Patent Document 1. Korean Patent Publication No. 10-2016-0136695

따라서, 본 발명은 상기와 같은 문제점을 감안하여 안출된 것으로, 본 발명의 목적은 구조적 안정성과 DNA 이중나선 결합력이 우수한 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체 및 이를 포함하는 자기조립체를 제공하는 것이다.Accordingly, the present invention has been made in view of the above problems, and an object of the present invention is to provide a cyclic peptide-oligonucleotide complex having excellent structural stability and DNA double helix binding ability and a self-assembly comprising the same.

본 발명의 다른 목적은 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 대량으로 제조할 수 있는 방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a method capable of producing a large amount of cyclic peptide-oligonucleotide complexes.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 제조방법에 따라 제조된 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체 및 이의 적용가능한 용도를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a cyclic peptide-oligonucleotide complex prepared according to the above production method and applicable uses thereof.

본 발명은 상기 목적을 이루기 위하여, 화학식 1로 표시되는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a cyclic peptide-oligonucleotide complex represented by Formula 1.

[화학식 1][Formula 1]

Figure 112020095469403-pat00001
Figure 112020095469403-pat00001

상기 화학식 1에서,In Formula 1,

상기 Pep는 화학식 2로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드로,The Pep is a peptide represented by Formula 2, and the Oligo is an oligonucleotide represented by Formula 3,

[화학식 2][Formula 2]

-[X1]a-[X2]b-[X3]c-[X4]d--[X 1 ] a -[X 2 ] b -[X 3 ] c -[X 4 ] d -

[화학식 3][Formula 3]

-Y1-Y2-Y3-Y4-Y5--Y 1 -Y 2 -Y 3 -Y 4 -Y 5 -

상기 화학식 2 및 3에서,In Formulas 2 and 3,

상기 X1, X2, X3 및 X4는 각각 독립적으로 류신(L), 페닐알라닌(F), 글루타민(Q) 및 라이신(K)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나이고, a 내지 d는 1 또는 4 범위의 정수이다.Wherein X 1 , X 2 , X 3 and X 4 are each independently any one selected from the group consisting of leucine (L), phenylalanine (F), glutamine (Q) and lysine (K), and a to d are 1 or an integer in the range of 4.

상기 Y1, Y2, Y3, Y4 및 Y5는 각각 독립적으로 디옥시아데노신 일인산, 디옥시구아노신 일인산, 디옥시티미딘 일인산 및 디옥시사이티딘 일인산으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 뉴클레오티드이다.Y 1 , Y 2 , Y 3 , Y 4 and Y 5 are each independently selected from the group consisting of deoxyadenosine monophosphate, deoxyguanosine monophosphate, deoxythymidine monophosphate and deoxycytidine monophosphate. It is any one nucleotide that becomes.

본 발명의 일 실시예에 의하면, 상기 화학식 2에서 상기 X1은 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)이고, 상기 X2는 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X3은 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X4는 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)일 수 있다.According to an embodiment of the present invention, in Formula 2, X 1 is lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q), and X 2 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F ), wherein X 3 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F), and X 4 may be lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q).

또한, 상기 펩티드는 서열번호 1 내지 4 중에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열로 표시되는 것일 수 있다.In addition, the peptide may be represented by any one amino acid sequence selected from SEQ ID NOs: 1 to 4.

또한, 상기 올리고뉴클레오티드는 서열번호 5 내지 13 중에서 선택되는 어느 하나의 염기 서열로 표시되는 것일 수 있다.In addition, the oligonucleotide may be represented by any one base sequence selected from SEQ ID NOs: 5 to 13.

본 발명의 다른 실시예에 의하면, 상기 복합체는 하기 화학식 4 또는 화학식 5로 표시되는 것일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, the complex may be represented by Formula 4 or Formula 5 below.

[화학식 4][Formula 4]

Figure 112020095469403-pat00002
Figure 112020095469403-pat00002

[화학식 5][Formula 5]

Figure 112020095469403-pat00003
Figure 112020095469403-pat00003

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 용액 상에서 자기조립체를 형성하는 것일 수 있다. According to another embodiment of the present invention, the cyclic peptide-oligonucleotide complex may form a self-assembly in solution.

본 발명은 상기 과제를 달성하기 위하여, 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체가 용액 상에서 자기조립되어 형성된 자기조립체를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a self-assembly formed by self-assembling a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex in a solution.

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 자기조립체는 평균 직경 10 내지 30 nm의 구형 미셀 형태 또는 소낭 형태일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, the self-assembly may be in the form of spherical micelles or vesicles with an average diameter of 10 to 30 nm.

본 발명은 상기 다른 과제를 달성하기 위하여, 하기 단계를 포함하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법을 제공한다. In order to achieve the above other object, the present invention provides a method for preparing a cyclic peptide-oligonucleotide complex comprising the following steps.

1) 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드와 화학식 7로 표시되는 펩티드를 혼합하여 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조하는 단계; 및1) preparing a linear peptide-oligonucleotide complex by mixing the oligonucleotide represented by Chemical Formula 6 and the peptide represented by Chemical Formula 7; and

2) 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 CuSO4, 아스코르브산 및 부탄올을 첨가하여 고리화하는 단계;를 포함한다.2) cyclization by adding CuSO 4 , ascorbic acid and butanol to the linear peptide-oligonucleotide complex;

[화학식 6][Formula 6]

Figure 112020095469403-pat00004
Figure 112020095469403-pat00004

[화학식 7][Formula 7]

Figure 112020095469403-pat00005
Figure 112020095469403-pat00005

상기 화학식 6, 7에서,In Chemical Formulas 6 and 7,

상기 Pep는 화학식 2로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드로,The Pep is a peptide represented by Formula 2, and the Oligo is an oligonucleotide represented by Formula 3,

[화학식 2][Formula 2]

-[X1]a-[X2]b-[X3]c-[X4]d--[X 1 ] a -[X 2 ] b -[X 3 ] c -[X 4 ] d -

[화학식 3][Formula 3]

-Y1-Y2-Y3-Y4-Y5--Y 1 -Y 2 -Y 3 -Y 4 -Y 5 -

상기 화학식 2 및 3에서,In Formulas 2 and 3,

상기 X1, X2, X3 및 X4는 각각 독립적으로 류신(L), 페닐알라닌(F), 글루타민(Q) 및 라이신(K)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나이고, a 내지 d는 1 또는 4 범위의 정수이다.Wherein X 1 , X 2 , X 3 and X 4 are each independently any one selected from the group consisting of leucine (L), phenylalanine (F), glutamine (Q) and lysine (K), and a to d are 1 or an integer in the range of 4.

상기 Y1, Y2, Y3, Y4 및 Y5는 각각 독립적으로 디옥시아데노신 일인산, 디옥시구아노신 일인산, 디옥시티미딘 일인산 및 디옥시사이티딘 일인산으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 뉴클레오티드이다.Y 1 , Y 2 , Y 3 , Y 4 and Y 5 are each independently selected from the group consisting of deoxyadenosine monophosphate, deoxyguanosine monophosphate, deoxythymidine monophosphate and deoxycytidine monophosphate. It is any one nucleotide that becomes.

상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드는, 1-a) 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드에 DTT(dithiothreitol)를 처리하는 단계;를 통해 3' 말단에서 이황화 결합이 제거된 것일 수 있다.The oligonucleotide represented by Formula 6 in step 1) may have a disulfide bond removed from the 3' end through 1-a) treating the oligonucleotide represented by Formula 6 with dithiothreitol (DTT).

본 발명의 다른 실시예에 의하면, 상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드와 화학식 7로 표시되는 펩티드는 1 : 1-4 몰비로 혼합된 것일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, the oligonucleotide represented by Chemical Formula 6 and the peptide represented by Chemical Formula 7 in step 1) may be mixed at a molar ratio of 1:1-4.

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 1) 단계에, 유기용매를 더 포함하는 것일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, in step 1), an organic solvent may be further included.

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 유기용매는 에탄올, 메탄올, 이소프로필알콜, 부탄올, 디메틸설폭사이드(DMSO), 디메틸포름아미드(DMF), 테트라하이드로퓨란(THF), 아세토니트릴, 디클로로메탄, 에틸아세테이트, 헥산, 디에틸에테르, 벤젠, 클로로포름 및 아세톤로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유기용매일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, the organic solvent is ethanol, methanol, isopropyl alcohol, butanol, dimethyl sulfoxide (DMSO), dimethylformamide (DMF), tetrahydrofuran (THF), acetonitrile, dichloromethane , It may be any one or more organic solvents selected from the group consisting of ethyl acetate, hexane, diethyl ether, benzene, chloroform and acetone.

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 2) 단계에서, 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체, CuSO4, 아스코르브산의 당량비는 1 : 2-4 : 5-7 일 수 있다.According to another embodiment of the present invention, in step 2), the equivalent ratio of the linear peptide-oligonucleotide complex, CuSO 4 , and ascorbic acid may be 1:2-4:5-7.

본 발명의 또 다른 실시예에 의하면, 상기 2) 단계는 불활성 분위기 하에서 수행될 수 있다.According to another embodiment of the present invention, step 2) may be performed under an inert atmosphere.

본 발명은 상기 또 다른 과제를 달성하기 위하여, 상기 제조방법으로 제조된 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제공한다.In order to achieve the above another object, the present invention provides a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex prepared by the above preparation method.

본 발명은 펩티드와 올리고뉴클레오티드를 활용한 이종 빌딩블록의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체, 이를 포함하는 자기조립체 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 특히, 이종 빌딩블록 구조인 자기조립성 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 효율적으로 제조할 수 있는 새로운 제조방법을 제공할 수 있다. 상술한 제조방법은 구조적으로 안정화된 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 저비용, 고수율 및 고순도로 제조할 수 있다.The present invention relates to a cyclic peptide-oligonucleotide complex of heterogeneous building blocks using a peptide and an oligonucleotide, a self-assembly comprising the same, and a method for preparing the same. In particular, it is possible to provide a new preparation method capable of efficiently preparing a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex having a heterogeneous building block structure. The above preparation method can prepare a structurally stabilized cyclic peptide-oligonucleotide complex at low cost, high yield and high purity.

본 발명의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 용액 상에서 구조적으로 안정적이며, 균일한 크기와 형태를 갖는 자기조립체를 형성할 수 있다. 또한, 본 발명의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 안정적인 자기조립체의 형성을 통해, 상보적 서열을 갖는 대상물질에 특이적인 이중나선 형성 능력을 제공할 수 있다. 따라서, 본 발명의 자기조립체는 활성물질을 안정적으로 운반하는 전달체로 활용할 수 있으며, 상기 활성물질에 따라 다양한 질환의 치료 또는 검출 등에 다양하게 적용될 수 있다.The cyclic peptide-oligonucleotide complex of the present invention is structurally stable in solution and can form a self-assembly having a uniform size and shape. In addition, the cyclic peptide-oligonucleotide complex of the present invention can provide a specific duplex formation ability to a target material having a complementary sequence through the formation of a stable self-assembly. Therefore, the self-assembly of the present invention can be used as a carrier for stably transporting active substances, and can be variously applied to the treatment or detection of various diseases according to the active substances.

도 1은 본 발명에 따른 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 자기조립체 구조 및 DNA 이중나선 형성 구조를 개략적으로 나타낸 도면이다.
도 2는 본 발명에 따른 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 자기조립체 구조 및 DNA 이중나선 형성 구조를 개략적으로 나타낸 도면이다.
도 3은 본 발명에 따른 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 합성과정을 개략적으로 나타낸 도면이다.
도 4는 본 발명에 따른 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 합성과정을 개략적으로 나타낸 도면이다
도 5는 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(적색 그래프) 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1(흑색 그래프)에 대한 RP-HPLC 결과 그래프이다.
도 6은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이다.
도 7은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이다.
도 8은 α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이다.
도 9는 α-키모트립신으로 처리된 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이다.
도 10은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 단편 구조를 도시한 것이다.
도 11은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1 및 α-키모트립신으로 처리된 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 단편 구조를 도시한 것이다.
도 12는 DNA-1, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 CD 스펙트럼이다.
도 13은 제조예 1로부터 제조된 Pep-1, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 CD 스펙트럼에서 동일한 DNA-1 농도의 스펙트럼을 뺀 결과 그래프이다.
도 14는 온도에 따른 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex)의 CD 스펙트럼이다.
도 15는 온도에 따른 LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex)의 CD 스펙트럼이다.
도 16은 온도에 따른 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)의 CD 스펙트럼이다.
도 17은 온도별 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)의 CD 스펙트럼 중에서 254 nm에서의 CD 값을 도시한 그래프이다.
도 18은 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)을 형광분석법으로 측정한 결과이다.
도 19는 온도에 따른 제조예 3으로부터 제조된 LinPOC-2에 대한 CD 스펙트럼이다.
도 20은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 자기조립의 AFM 이미지이다.
도 21은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 자기조립 AFM 이미지이다.
도 22는 자기조립된 L-duplex에 대한 AFM 이미지이다.
도 23은 자기조립된 L-duplex에 대한 AFM 이미지이다.
도 24는 자기조립된 C-duplex에 대한 AFM 이미지이다.
도 25는 자기조립된 C-duplex에 대한 AFM 이미지이다.
1 is a diagram schematically showing the self-assembly structure and DNA double helix formation structure of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 according to the present invention.
2 is a diagram schematically showing the self-assembly structure and DNA double helix formation structure of CycPOC-1 prepared from Example 1 according to the present invention.
Figure 3 is a view schematically showing the synthesis process of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 according to the present invention.
4 is a view schematically showing the synthesis process of CycPOC-1 prepared from Example 1 according to the present invention.
5 is a graph of RP-HPLC results for LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 (red graph) and CycPOC-1 prepared from Example 1 (black graph).
6 is a MALDI-TOF spectrum of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2.
7 is a MALDI-TOF spectrum for CycPOC-1 prepared from Example 1.
8 is a MALDI-TOF spectrum of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin.
9 is a MALDI-TOF spectrum for CycPOC-1 prepared from Example 1 treated with α-chymotrypsin.
Figure 10 shows the fragment structures of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin.
FIG. 11 shows the fragment structures of CycPOC-1 prepared from Example 1 and CycPOC-1 prepared from Example 1 treated with α-chymotrypsin.
12 is a CD spectrum of DNA-1, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, and CycPOC-1 prepared from Example 1.
13 is a graph showing the results obtained by subtracting the spectrum of the same DNA-1 concentration from the CD spectrum for Pep-1 prepared from Preparation Example 1, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, and CycPOC-1 prepared from Example 1.
14 is a CD spectrum of DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex) according to temperature.
15 is a CD spectrum of LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex) according to temperature.
16 is a CD spectrum of CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) according to temperature.
17 shows 254 CD spectra of DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex), and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) by temperature. It is a graph showing CD values in nm.
18 is a result of measuring DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex), and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) by fluorescence analysis. am.
19 is a CD spectrum for LinPOC-2 prepared from Preparation Example 3 according to temperature.
20 is an AFM image of self-assembly of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2.
21 is a self-assembled AFM image of CycPOC-1 prepared from Example 1.
22 is an AFM image of a self-assembled L-duplex.
23 is an AFM image of a self-assembled L-duplex.
24 is an AFM image of a self-assembled C-duplex.
25 is an AFM image of a self-assembled C-duplex.

이하, 본 발명을 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.

본 발명의 일 측면은 화학식 1로 표시되는 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 관한 것이다. 본 발명의 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 올리고뉴클레오티드와 펩티드를 포함하고, 상기 올리고뉴클레오티드와 펩티드는 티올-말레이미드 반응 및 구리-촉매화 아지드-알킨 고리화 첨가반응(cycloaddition)을 통해 결합하므로, 펩티드와 올리고뉴클레오티드는 구조나 서열에 얽매이지 않으면서, 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 효율적으로 제조 및 제공할 수 있다는 장점을 갖는다.One aspect of the present invention relates to a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex represented by Formula 1. The self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex of the present invention includes an oligonucleotide and a peptide, and the oligonucleotide and the peptide undergo a thiol-maleimide reaction and a copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition. Since peptides and oligonucleotides bind together, they have the advantage of being able to efficiently prepare and provide cyclic peptide-oligonucleotide complexes without being bound by structure or sequence.

[화학식 1][Formula 1]

Figure 112020095469403-pat00006
Figure 112020095469403-pat00006

상기 화학식 1에서,In Formula 1,

상기 Pep는 하기 화학식 2로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 하기 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.The Pep is a peptide represented by Formula 2 below, and the Oligo is an oligonucleotide represented by Formula 3 below.

[화학식 2][Formula 2]

-[X1]a-[X2]b-[X3]c-[X4]d--[X 1 ] a -[X 2 ] b -[X 3 ] c -[X 4 ] d -

[화학식 3][Formula 3]

-Y1-Y2-Y3-Y4-Y5--Y 1 -Y 2 -Y 3 -Y 4 -Y 5 -

상기 화학식 2 및 3에서,In Formulas 2 and 3,

상기 X1, X2, X3 및 X4는 각각 독립적으로 류신(L), 페닐알라닌(F), 글루타민(Q) 및 라이신(K)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나이고, a 내지 d는 1 또는 4 범위의 정수이다.Wherein X 1 , X 2 , X 3 and X 4 are each independently any one selected from the group consisting of leucine (L), phenylalanine (F), glutamine (Q) and lysine (K), and a to d are 1 or an integer in the range of 4.

상기 Y1, Y2, Y3, Y4 및 Y5는 각각 독립적으로 디옥시아데노신 일인산, 디옥시구아노신 일인산, 디옥시티미딘 일인산 및 디옥시사이티딘 일인산으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 뉴클레오티드이다.Y 1 , Y 2 , Y 3 , Y 4 and Y 5 are each independently selected from the group consisting of deoxyadenosine monophosphate, deoxyguanosine monophosphate, deoxythymidine monophosphate and deoxycytidine monophosphate. It is any one nucleotide that becomes.

상기 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 4 내지 16 개, 바람직하게는 4 내지 10개, 더욱 바람직하게는 5 내지 8개, 가장 바람직하게는 7개의 아미노산으로 이루어진 펩티드;와 5개의 염기로 이루어진 올리고뉴클레오티드;로 구성된 복합체일 수 있다. 상기 펩티드의 아미노산 개수가 상기 하한치 미만이거나 상기 상한치를 초과할 경우에는 고리형 구조를 형성할 수 없거나, 복합체 제조 자체가 어려워질 가능성이 높아진다.The self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex consists of a peptide consisting of 4 to 16, preferably 4 to 10, more preferably 5 to 8, most preferably 7 amino acids; and 5 bases. It may be a complex composed of; oligonucleotides. When the number of amino acids in the peptide is less than the lower limit or exceeds the upper limit, it is highly likely that a cyclic structure cannot be formed or that complex preparation itself becomes difficult.

상기 화학식 2에서, 상기 X1은 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)이고, 상기 X2는 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X3은 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X4는 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)일 수 있다.In Formula 2, X 1 is lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q), X 2 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F), and X 3 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F), and X 4 may be lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q).

상기 화학식 2에서 a,b,c 및 d는 해당하는 아미노산(X1, X2, X3 및 X4)이 각각 a, b, c, d개 결합된 것을 의미하는 것이고, 구체적으로 X1의 아미노산이 a개, X2의 아미노산이 b개 존재하는 것을 의미한다.In Formula 2, a, b, c, and d indicate that corresponding amino acids (X 1 , X 2 , X 3 and X 4 ) are respectively linked to a, b, c, and d units, and specifically amino acids of X1 This a number means that there are b number of amino acids of X 2 .

상기 화학식 2에서 상기 a,b,c 및 d는 각각 독립적으로 1 내기 4 중에서 어느 하나의 정수일 수 있고, 바람직하게 a 및 d는 각각 독립적으로 2 내지 3 중에서 어느 하나의 정수이고, b 및 c는 각각 독립적으로 1 내지 2 중에서 어느 하나의 정수일 수 있다. 가장 바람직하게는 상기 a,b,c 및 d의 합이 7 내지 9인 것일 수 있는데, 이를 위해 a 및 d 중에서 어느 하나가 3이면, 나머지 하나는 2인 것일 수 있다.In Formula 2, a, b, c and d may each independently be any one integer from 1 to 4, preferably a and d are each independently any one integer from 2 to 3, and b and c are Each independently may be any one integer from 1 to 2. Most preferably, the sum of a, b, c, and d may be 7 to 9, and for this, when one of a and d is 3, the other may be 2.

상기 화학식 2로 표시되는 펩티드('Pep'라고도 한다)는 무작위 코일형태인 것으로, 서열번호 1 내지 4 중에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열로 표시되는 것일 수 있고, 바람직하게는 서열번호 1로 표시되는 것일 수 있다.The peptide (also referred to as 'Pep') represented by Formula 2 is in the form of a random coil, and may be represented by any one amino acid sequence selected from SEQ ID NOs: 1 to 4, preferably represented by SEQ ID NO: 1. it could be

상기 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드('oligo'라고도 한다)는 서열번호 5 내지 13 중에서 선택되는 어느 하나의 염기 서열로 표시되는 것일 수 있는데, 바람직하게는 서열번호 5 또는 9로 표시되는 것일 수 있다.The oligonucleotide (also referred to as 'oligo') represented by Formula 3 may be represented by any one base sequence selected from SEQ ID NOs: 5 to 13, preferably represented by SEQ ID NO: 5 or 9. .

상기 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 하기 화학식 4 또는 화학식 5로 표시되는 것일 수 있다.The self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex may be represented by Formula 4 or Formula 5 below.

[화학식 4][Formula 4]

Figure 112020095469403-pat00007
Figure 112020095469403-pat00007

[화학식 5][Formula 5]

Figure 112020095469403-pat00008
Figure 112020095469403-pat00008

펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체가 고리화됨에 따라, 전체 분자구조(conformation)에는 거의 영향이 없었으나, 자기조립 특성에는 많은 영향이 나타났다. 구체적으로 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 용액 상에서 자기조립체를 형성할 수 있는데, 상기 자기조립체는 평균 직경 10 내지 30 nm의 구형 미셀 형태 또는 소낭 형태인 것을 특징으로 한다(도 2). 이때, 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는, 본 발명의 올리고뉴클레오티드와 상보적인 서열을 포함하는 핵산 분자와 이중나선을 형성하는 특성을 가지므로, 상보적 서열을 갖는 핵산 분자와 특이적으로 결합할 수 있다.As the peptide-oligonucleotide complexes were cyclized, the overall molecular conformation was hardly affected, but the self-assembly properties were greatly affected. Specifically, the cyclic peptide-oligonucleotide complex can form a self-assembly in solution, and the self-assembly is characterized in that it is in the form of spherical micelles or vesicles with an average diameter of 10 to 30 nm (FIG. 2). At this time, since the cyclic peptide-oligonucleotide complex has a property of forming a double helix with a nucleic acid molecule comprising a sequence complementary to the oligonucleotide of the present invention, it can specifically bind to a nucleic acid molecule having a complementary sequence. can

이에 반해, 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체가 고리화되지 않은 선형의 경우에는, 섬유질의 원통형 미셀과 구형 미셀 형태가 혼재되어 있는 비균질 상태를 나타낸다(도 1). On the other hand, when the peptide-oligonucleotide complex is linear without cyclization, it shows a heterogeneous state in which fibrous cylindrical micelles and spherical micelles are mixed (FIG. 1).

상기 자기조립체는 미셀 혹은 소낭 내부에 생물학적 활성물질을 담지할 수 있고, 이를 전달할 수 있으므로 전달체로써 활용할 수 있을 뿐만 아니라, 올리고뉴클레오티드과 상보적인 핵산 분자에 대한 특이적인 이중나선 형성 능력을 가지고 있으므로, 특정 핵산 분자에 대한 진단 또는 치료 또는 예방용 조성물 등으로 다양하게 적용될 수 있다.Since the self-assembly can support and deliver a biologically active substance inside the micelle or vesicle, it can be used as a delivery vehicle, and it has the ability to form a specific double helix for a nucleic acid molecule complementary to an oligonucleotide, so that a specific nucleic acid It can be variously applied as a composition for diagnosis or treatment or prevention of molecules.

본 발명의 일 측면은 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체가 용액 상에서 자기조립되어 형성된 자기조립체에 관한 것이다. 상기 자기조립체는 평균 직경 10 내지 30 nm의 구형 미셀 형태 또는 소낭 형태인 것으로, 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 상호작용을 통한 자가조립에 의해 형성되고, 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 존재하는 펩티드와 올리고뉴클레오티드를 적절히 선택함으로써, 다양한 기능과 효과를 갖는 새로운 구조의 자기조립체를 제공할 수 있다. 게다가 대상 물질에 상보적인 특정 서열로 펩티드와 올리고뉴클레오티드를 설계할 경우, 대상 물질에 대해 높은 선택성을 갖는 자기조립체를 얻을 수 있다.One aspect of the present invention relates to a self-assembly formed by self-assembling a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex in a solution. The self-assembly is in the form of spherical micelles or vesicles with an average diameter of 10 to 30 nm, is formed by self-assembly through the interaction of the cyclic peptide-oligonucleotide complex, and is present in the cyclic peptide-oligonucleotide complex. By appropriately selecting peptides and oligonucleotides to be used, it is possible to provide self-assemblies with new structures having various functions and effects. In addition, when peptides and oligonucleotides are designed with a specific sequence complementary to a target substance, a self-assembly having high selectivity for the target substance can be obtained.

그러므로, 이러한 본 발명의 자기조립체의 원리를 이용하여, 다양한 상호작용을 갖는 자기조립체를 제조 및 제공할 수 있고, 이를 전달체 또는 진단, 치료 또는 예방용 조성물이나 담체로 활용할 수 있다.Therefore, by using the principle of the self-assembly of the present invention, it is possible to manufacture and provide a self-assembly having various interactions, and use it as a carrier or a composition or carrier for diagnosis, treatment, or prevention.

본 발명의 다른 측면은 하기 단계를 포함하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법에 관한 것이다.Another aspect of the present invention relates to a method for preparing a cyclic peptide-oligonucleotide complex comprising the following steps.

1) 화학식 6으로 표시되는 핵산과 화학식 7로 표시되는 펩티드를 혼합하여 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조하는 단계; 및1) preparing a linear peptide-oligonucleotide complex by mixing a nucleic acid represented by Chemical Formula 6 with a peptide represented by Chemical Formula 7; and

2) 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 CuSO4, 아스코르브산 및 부탄올을 첨가하여 고리화하는 단계;를 포함한다.2) cyclization by adding CuSO 4 , ascorbic acid and butanol to the linear peptide-oligonucleotide complex;

[화학식 6][Formula 6]

Figure 112020095469403-pat00009
Figure 112020095469403-pat00009

[화학식 7][Formula 7]

Figure 112020095469403-pat00010
Figure 112020095469403-pat00010

상기 화학식 6, 7에서,In Chemical Formulas 6 and 7,

상기 Pep는 화학식 2로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.The Pep is a peptide represented by Chemical Formula 2, and the Oligo is an oligonucleotide represented by Chemical Formula 3.

[화학식 2][Formula 2]

-[X1]a-[X2]b-[X3]c-[X4]d--[X 1 ] a -[X 2 ] b -[X 3 ] c -[X 4 ] d -

[화학식 3][Formula 3]

-Y1-Y2-Y3-Y4-Y5--Y 1 -Y 2 -Y 3 -Y 4 -Y 5 -

상기 화학식 2 및 3에서,In Formulas 2 and 3,

상기 X1, X2, X3 및 X4는 각각 독립적으로 류신(L), 페닐알라닌(F), 글루타민(Q) 및 라이신(K)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나이고, a 내지 d는 1 또는 4 범위의 정수이다.Wherein X 1 , X 2 , X 3 and X 4 are each independently any one selected from the group consisting of leucine (L), phenylalanine (F), glutamine (Q) and lysine (K), and a to d are 1 or an integer in the range of 4.

상기 Y1, Y2, Y3, Y4 및 Y5는 각각 독립적으로 디옥시아데노신 일인산, 디옥시구아노신 일인산, 디옥시티미딘 일인산 및 디옥시사이티딘 일인산으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 뉴클레오티드이다.Y 1 , Y 2 , Y 3 , Y 4 and Y 5 are each independently selected from the group consisting of deoxyadenosine monophosphate, deoxyguanosine monophosphate, deoxythymidine monophosphate and deoxycytidine monophosphate. It is any one nucleotide that becomes.

상기 화학식 2에서, 상기 X1은 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)이고, 상기 X2는 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X3은 류신(L), 글루타민(Q) 또는 페닐알라닌(F)이며, 상기 X4는 라이신(K), 류신(L) 또는 글루타민(Q)일 수 있다.In Formula 2, X 1 is lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q), X 2 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F), and X 3 is leucine (L), glutamine (Q) or phenylalanine (F), and X 4 may be lysine (K), leucine (L) or glutamine (Q).

상기 화학식 2에서 a,b,c 및 d는 해당하는 아미노산(X1, X2, X3 및 X4)이 각각 a, b, c, d개 결합된 것을 의미하는 것이고, 구체적으로 X1의 아미노산이 a개, X2의 아미노산이 b개 존재하는 것을 의미한다.In Formula 2, a, b, c, and d indicate that corresponding amino acids (X 1 , X 2 , X 3 and X 4 ) are respectively a, b, c, and d bonded, and specifically X 1 It means that there are a number of amino acids and b number of amino acids of X 2 .

상기 화학식 2에서 상기 a,b,c 및 d는 각각 독립적으로 1 내기 4 중에서 어느 하나의 정수일 수 있고, 바람직하게 a 및 d는 각각 독립적으로 2 내지 3 중에서 어느 하나의 정수이고, b 및 c는 각각 독립적으로 1 내지 2 중에서 어느 하나의 정수일 수 있다. 가장 바람직하게는 상기 a,b,c 및 d의 합이 7 내지 9인 것일 수 있는데, 이를 위해 a 및 d 중에서 어느 하나가 3이면, 나머지 하나는 2인 것일 수 있다.In Formula 2, a, b, c and d may each independently be any one integer from 1 to 4, preferably a and d are each independently any one integer from 2 to 3, and b and c are Each independently may be any one integer from 1 to 2. Most preferably, the sum of a, b, c, and d may be 7 to 9, and for this, when one of a and d is 3, the other may be 2.

상기 화학식 2로 표시되는 펩티드('Pep'라고도 한다)는 서열번호 1 내지 4 중에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열로 표시되는 것일 수 있고, 바람직하게는 서열번호 1로 표시되는 것일 수 있다.The peptide represented by Formula 2 (also referred to as 'Pep') may be represented by any one amino acid sequence selected from SEQ ID NOs: 1 to 4, preferably represented by SEQ ID NO: 1.

상기 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드('oligo'라고도 한다)은 서열번호 5 내지 13 중에서 선택되는 어느 하나의 염기 서열로 표시되는 것일 수 있는데, 바람직하게는 서열번호 5 또는 9로 표시되는 것일 수 있다.The oligonucleotide (also referred to as 'oligo') represented by Formula 3 may be represented by any one nucleotide sequence selected from SEQ ID NOs: 5 to 13, preferably represented by SEQ ID NO: 5 or 9 .

도 3, 4를 참고하여 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법을 보다 구체적으로 설명하기로 한다.A method for preparing the cyclic peptide-oligonucleotide complex will be described in more detail with reference to FIGS. 3 and 4 .

먼저, 1) 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드와 화학식 7로 표시되는 펩티드를 혼합하여 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조한다(도 3).First, 1) a linear peptide-oligonucleotide complex is prepared by mixing an oligonucleotide represented by Chemical Formula 6 and a peptide represented by Chemical Formula 7 (FIG. 3).

이때 상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드는, 1-a) 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드에 환원제를 처리하는 단계;를 통해 3' 말단에서 이황화 결합이 제거된 것일 수 있다. In this case, the oligonucleotide represented by Chemical Formula 6 in step 1) may have a disulfide bond removed from the 3' end through 1-a) treating the oligonucleotide represented by Chemical Formula 6 with a reducing agent.

상기 환원제는 이황화 결합을 절단 혹은 제거할 수 있는 것이라면 특별히 제한되지 않으나, 바람직하게는 DTT(dithiothreitol), 2-Mercaptoethanol 및 TCEP(Tris(2-carboxyethyl) phosphine)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 환원제일 수 있고, 보다 바람직하게는 DTT(dithiothreitol)일 수 있다.The reducing agent is not particularly limited as long as it can cleave or remove disulfide bonds, but is preferably any one or more reducing agents selected from the group consisting of DTT (dithiothreitol), 2-Mercaptoethanol and TCEP (Tris (2-carboxyethyl) phosphine) It may be the first, and more preferably, it may be DTT (dithiothreitol).

상기 1-a) 단계를 통해, 이황화 결합을 절단 혹은 제거함으로써, 화학식 7로 표시되는 펩티드의 말레이미드기와 결합할 수 있는 자유 티올기를 갖도록 할 수 있다. Through the above step 1-a), by cutting or removing the disulfide bond, it is possible to have a free thiol group capable of binding to the maleimide group of the peptide represented by Chemical Formula 7.

상기 1-a) 단계는 1 내지 50 ℃에서 10 내지 120 분 동안 수행될 수 있고, 바람직하게는 10 내지 30 ℃에서 30 내지 90 분 동안 수행될 수 있다.Step 1-a) may be performed at 1 to 50 °C for 10 to 120 minutes, preferably at 10 to 30 °C for 30 to 90 minutes.

또한, 상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 핵산과 화학식 7로 표시되는 펩티드는 1 : 1 내지 4 몰비로 혼합될 수 있고, 바람직하게는 1 : 1.5 내지 2.5 몰비일 수 있다. 만약 상기 하한치 미만인 경우 DNA와 펩티드의 결합 효율성이 떨어질 수 있으며, 상한치를 초과할 경우 펩티드의 자기조립 경향성이 너무 커져 무작위적인 응집이 발생하여 수율이 저하될 수 있다.In addition, the nucleic acid represented by Chemical Formula 6 and the peptide represented by Chemical Formula 7 in step 1) may be mixed in a molar ratio of 1:1 to 4, preferably 1:1.5 to 2.5 molar ratio. If it is less than the lower limit, the binding efficiency of DNA and peptide may decrease, and if it exceeds the upper limit, the self-assembly tendency of peptides becomes too large, resulting in random aggregation, resulting in a decrease in yield.

상기 1) 단계에, 유기용매를 더 포함할 수 있는데, 상기 유기용매는 상기 화학식 7로 표시되는 펩티드의 용해도를 증가시키면서 반응에는 영향을 미치지 않는 것이라면 특별히 제한되지 않으나, 바람직하게는 에탄올, 메탄올, 이소프로필알콜, 부탄올, 디메틸설폭사이드(DMSO), 디메틸포름아미드(DMF), 테트라하이드로퓨란(THF), 아세토니트릴, 디클로로메탄, 에틸아세테이트, 헥산, 디에틸에테르, 벤젠, 클로로포름 및 아세톤로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유기용매일 수 있다.In step 1), an organic solvent may be further included. The organic solvent is not particularly limited as long as it increases the solubility of the peptide represented by Formula 7 and does not affect the reaction, but is preferably ethanol, methanol, The group consisting of isopropyl alcohol, butanol, dimethyl sulfoxide (DMSO), dimethylformamide (DMF), tetrahydrofuran (THF), acetonitrile, dichloromethane, ethyl acetate, hexane, diethyl ether, benzene, chloroform and acetone It may be any one or more organic solvents selected from.

상기 1) 단계를 통해서 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조하고, 다음 2) 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 CuSO4, 아스코르브산 및 부탄올을 첨가하여 고리화함으로써, 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조한다.A linear peptide-oligonucleotide complex is prepared through step 1), and then cyclized by adding CuSO 4 , ascorbic acid and butanol to the linear peptide-oligonucleotide complex, thereby preparing a cyclic peptide-oligonucleotide complex. do.

상기 2) 단계에서, 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체, CuSO4, 아스코르브산의 당량비는 1 : 2-4 : 5-7 일 수 있다.In step 2), the equivalent ratio of the linear peptide-oligonucleotide complex, CuSO 4 , and ascorbic acid may be 1:2-4:5-7.

상기 2) 단계는 불활성 분위기 하에서 수행되는 것이 바람직하다.Step 2) is preferably performed under an inert atmosphere.

최종적으로 3) 상기 2) 단계를 통해 합성된 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 분리 및 정제하는 단계;를 더 포함할 수 있다.Finally, 3) isolating and purifying the cyclic peptide-oligonucleotide complex synthesized in step 2); may be further included.

상기 분리 및 정제는 펩티드 분리 및 정제 방법이라면 특별히 제한되지 않으나, 바람직하게는 실리카겔(silica gel)이나 활성 알루미나(alumina)등의 각종 합성수지를 충진한 컬럼 크로마토그라피(column chromatography), 여과(filtration) 및 고속액체크로마토그라피(HPLC) 등을 단독으로 혹은 병행하여 사용할 수 있으며, 보다 바람직하게는 한외여과(Ultrafiltration), 양이온 교환 크로마토그래피(cation exchange chromatography) 및 RP-HPLC(Reverse phase-high performance liquid chromatography)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 분리 및 정제방법을 사용할 수 있으며, 가장 바람직하게는 RP-HPLC(Reverse phase-high performance liquid chromatography)(예를 들어, C4 역상(RP), C3 RP) 일 수 있다. 상기 RP-HPLC는 이온쌍 시약을 포함한 이동상으로 용출되는 방법일 수 있으며, 상기 이온쌍 시약은 피크 모양 및 유지 시간을 통제하기 위해서 아세토니트릴(acetonitrile) 또는 트리에틸암모늄 아세트산(triethylammonium acetate, TEAA)을 사용할 수 있다. 상기 이온쌍 시약은 증루수 중에 0.01 내지 1 M 트리에틸암모늄 아세트산을 포함한 것일 수 있다.The separation and purification is not particularly limited as long as it is a peptide separation and purification method, but preferably column chromatography filled with various synthetic resins such as silica gel or activated alumina, filtration and High performance liquid chromatography (HPLC) can be used alone or in parallel, more preferably ultrafiltration, cation exchange chromatography and RP-HPLC (Reverse phase-high performance liquid chromatography) Any one or more separation and purification methods selected from the group consisting of may be used, most preferably RP-HPLC (Reverse phase-high performance chromatography liquid) (eg, C4 reverse phase (RP), C3 RP). there is. The RP-HPLC may be a method of eluting with a mobile phase containing an ion-pair reagent, and the ion-pair reagent uses acetonitrile or triethylammonium acetate (TEAA) to control peak shape and retention time. can be used The ion-pairing reagent may include 0.01 to 1 M triethylammonium acetic acid in distilled water.

상술한 과정을 통해 상기 올리고뉴클레오티드가 펩티드와 반응하여 복합체를 형성함으로써, 쉽게 훼손되는 올리고뉴클레오티드의 안정성을 향상시킬 수 있다. 즉 올리고뉴클레오티드와 펩티드를 결합하여 고리형 구조의 복합체를 형성함으로써, 올리고뉴클레오티드를 보호할 수 있다. 게다가 상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 자발적으로 조립되어 자기조립체를 형성할 수 있다.Through the above process, the oligonucleotide reacts with the peptide to form a complex, thereby improving the stability of the oligonucleotide that is easily damaged. In other words, the oligonucleotide can be protected by combining the oligonucleotide and the peptide to form a complex having a cyclic structure. Moreover, the cyclic peptide-oligonucleotide complexes can spontaneously assemble to form self-assemblies.

상술한 과정을 통해, 티올-말레이미드 반응과 구리-촉매화 아지드-알킨 고리화 첨가반응(cycloaddition)(CuAAC)을 이용하여 자기조립성 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 간단한 공정을 통해 합성함으로써, 저비용, 고수율 및 고순도로 제공할 수 있다. 구체적으로 본 발명의 자기조립성 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법은 수율이 90% 이상인 것으로, 본 발명의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-1)는 1번의 정제과정(HPLC)을 통해 90% 이상의 고수율을 달성할 수 있다는 장점을 갖는다.Through the above-described process, a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex was synthesized through a simple process using a thiol-maleimide reaction and a copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC). , can be provided with low cost, high yield and high purity. Specifically, the method for preparing the self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex of the present invention has a yield of 90% or more, and the cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-1) of the present invention requires one purification step (HPLC). It has the advantage of being able to achieve a high yield of 90% or more.

본 발명의 또 다른 측면은 제조된 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 관한 것이다.Another aspect of the present invention relates to self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complexes prepared.

상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 화학식 1로 표시되는 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체로, 이에 대한 설명은 상기에서 설명한 것과 실질적으로 동일하므로, 중복되는 설명은 생략하기로 한다.The cyclic peptide-oligonucleotide complex is a self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex represented by Formula 1, and since the description thereof is substantially the same as that described above, redundant description will be omitted.

[화학식 1][Formula 1]

Figure 112020095469403-pat00011
Figure 112020095469403-pat00011

상기 화학식 1에서,In Formula 1,

상기 Pep는 하기 화학식 2로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 하기 화학식 3으로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.The Pep is a peptide represented by Formula 2 below, and the Oligo is an oligonucleotide represented by Formula 3 below.

[화학식 2][Formula 2]

-[X1]a-[X2]b-[X3]c-[X4]d--[X 1 ] a -[X 2 ] b -[X 3 ] c -[X 4 ] d -

[화학식 3][Formula 3]

-Y1-Y2-Y3-Y4-Y5--Y 1 -Y 2 -Y 3 -Y 4 -Y 5 -

상기 화학식 2 및 3에서,In Formulas 2 and 3,

상기 X1, X2, X3 및 X4는 각각 독립적으로 류신(L), 페닐알라닌(F), 글루타민(Q) 및 라이신(K)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나이고, a 내지 d는 1 또는 4 범위의 정수이다.Wherein X 1 , X 2 , X 3 and X 4 are each independently any one selected from the group consisting of leucine (L), phenylalanine (F), glutamine (Q) and lysine (K), and a to d are 1 or an integer in the range of 4.

상기 Y1, Y2, Y3, Y4 및 Y5는 각각 독립적으로 디옥시아데노신 일인산, 디옥시구아노신 일인산, 디옥시티미딘 일인산 및 디옥시사이티딘 일인산으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 뉴클레오티드이다.Y 1 , Y 2 , Y 3 , Y 4 and Y 5 are each independently selected from the group consisting of deoxyadenosine monophosphate, deoxyguanosine monophosphate, deoxythymidine monophosphate and deoxycytidine monophosphate. It is any one nucleotide that becomes.

이하, 바람직한 실시예를 들어 본 발명을 더욱 상세하게 설명하기로 한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이에 의하여 제한되지 않는다는 것은 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 자명할 것이다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to preferred embodiments. However, these examples are intended to explain the present invention in more detail, and it will be apparent to those skilled in the art that the scope of the present invention is not limited thereto.

실험재료experimental material

General Chemicals 및 Rink amide resin LL은 Merck(독일) 및 Fisher Scientific(미국)에서 구입하였다. 모든 아미노산과 커플링 시약은 AAPPTec(미국)에서 구입하였고, DNA(5'-azide-3'-thiol-modified)는 Bioneer(한국)에 의뢰하여 합성한 것을 사용하였다.General Chemicals and Rink amide resin LL were purchased from Merck (Germany) and Fisher Scientific (USA). All amino acids and coupling reagents were purchased from AAPPTec (USA), and DNA (5'-azide-3'-thiol-modified) was synthesized by request from Bioneer (Korea).

제조예 1. 펩티드(Pep-1) 합성Preparation Example 1. Peptide (Pep-1) Synthesis

상기 펩티드 LLLFQQKK(Dde)(서열번호 1)는 표준 고체상 펩티드 합성 프로토콜에 따라 합성하였다. Fmoc(Fluorenylmethoxycarbonyl) 보호기는 20% 피페리딘(piperidine)이 용해된 N-methyl-2-pyrrolidone(NMP) 용액으로 15분 처리하여 탈보호하였다. 모든 아미노산은 HCTU(O-(1H-6-chlorobenzotriazole-1-yl)-1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate) 4.5 equiv(relative to the resin)와 HOBt(1-hydroxybenzotriazole hydrate) 4.5 equiv 및 DIPEA(diisopropylethylamine) 10 equiv을 사용하여 20분 동안 커플링하였다. 아미노산은 커플링 5분 전에 미리 활성화한 후 사용하였다. 마지막 아미노산을 커플링한 후, 상기 Dde(1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxacyclohexylidene)ethyl) 보호기를 Fmoc 보호기가 펩티드에 부착한 상태로, 1 M 하이드록시아민(hydroxylamine)과 0.75 M 이미다졸(imidazole)이 용해된 NMP 용액(3 ㎖)을 첨가하고 상온에서 밤새 교반하여 탈부착하였다. 상기 레진을 NMP와 MC(methylene chloride)로 세척하고, 다음으로 DIC(diisopropylcarbodiimide)(10 equiv)를 용해한 MC 커플링 시약을 사용하여 3시간 동안 프로피온산(propiolic acid)(5 equiv) 커플링을 수행하였다. 레진을 다시 MC 및 NMP 용액으로 세척하고, 최종 Fmoc 보호기를 탈보호시킨 후, N-메톡시카보닐 말레이미드(N-methoxycarbonyl maleimide)(5 equiv)와 DIPEA(N,N-Diisopropylethylamine)(10 equiv)가 용해된 NMP를 레진에 첨가하여 밤새 반응시켰다. 반응이 완료된 후, 상기 레진을 THF와 NMP로 세척하고 건조시켰다. 곁사슬에 남아있는 보호기를 제거하고, 상기 레진에서 펩티드를 분리하기 위해, 절단칵테일(TFA:증류수:TIS=95:2.5:2.5)을 첨가하고 3시간 동안 반응시켰다. 반응이 완료된 후 TBME(tert-butyl methyl ether)를 사용하여 펩티드를 침전하였고, C4 컬럼을 사용한 RP-HPLC(Waters, USA)를 통해 정제하였다.The peptide LLLFQQKK(Dde) (SEQ ID NO: 1) was synthesized according to a standard solid phase peptide synthesis protocol. The Fmoc (Fluorenylmethoxycarbonyl) protecting group was deprotected by treatment with a 20% piperidine-dissolved N-methyl-2-pyrrolidone (NMP) solution for 15 minutes. All amino acids are HCTU (O-(1H-6-chlorobenzotriazole-1-yl)-1,1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate) 4.5 equiv (relative to the resin) and HOBt (1-hydroxybenzotriazole hydrate) 4.5 equiv and DIPEA (diisopropylethylamine) was coupled for 20 minutes using 10 equiv. Amino acids were used after pre-activation 5 minutes before coupling. After coupling the last amino acid, the Dde (1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxacyclohexylidene)ethyl) protecting group was added to the peptide with the Fmoc protecting group attached to the peptide, 1 M hydroxylamine and 0.75 NMP solution (3 ml) in which M imidazole was dissolved was added, and the mixture was stirred at room temperature overnight to desorb. The resin was washed with NMP and MC (methylene chloride), and then propionic acid (5 equiv) coupling was performed for 3 hours using an MC coupling reagent in which diisopropylcarbodiimide (DIC) (10 equiv) was dissolved. . After washing the resin again with MC and NMP solutions, deprotecting the final Fmoc protecting group, N-methoxycarbonyl maleimide (5 equiv) and DIPEA (N,N-Diisopropylethylamine) (10 equiv) ) was added to the resin and reacted overnight. After the reaction was complete, the resin was washed with THF and NMP and dried. In order to remove the protecting group remaining on the side chain and separate the peptide from the resin, a cleavage cocktail (TFA:distilled water:TIS=95:2.5:2.5) was added and reacted for 3 hours. After the reaction was completed, the peptide was precipitated using TBME (tert-butyl methyl ether) and purified through RP-HPLC (Waters, USA) using a C4 column.

제조예 2. 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(LinPOC-1) 제조Preparation Example 2. Preparation of linear peptide-oligonucleotide complex (LinPOC-1)

[반응식 1][Scheme 1]

Figure 112020095469403-pat00012
Figure 112020095469403-pat00012

DNA-1은 GCGAG(서열번호 5)로 표시되며, 5'에는 아지드기가, 3'에는 이황화결합이 형성되어 있는 상태로 합성회사에 주문하여 제조된 것을 사용하였다. 상기 DNA-1(100 nmol)을 증류수에 분산시키고, DNA-1의 3' 말단에 이황화결합을 제거하기 위해 0.5 M DTT(dithiothreitol), 120 mM KPB의 혼합 용액(pH 7) 20 μl를 처리하고 1시간 반응시켰다. 이후 EA(ethylacetate) 추출을 통해 DTT를 제거하였다. 제조예 1로부터 제조된 펩티드 분말(2 equiv, 200 nmol)을 DNA 용액에 넣어 혼합물을 제조하였다. 상기 혼합물에서 펩티드의 용해도를 증가시키기 위해 아세토니트릴(acetonitrile)(80 μl)을 첨가하였다. 상기 혼합물을 밤새 주위온도(ambient temperature)에서 교반한 후, 이온 페어링 시약(ion paring reagent)인 TEAA를 사용하여 반분취(semipreparative) C4 컬럼으로 RP-HPLC를 진행하여 원하는 반응물을 분리시키고 MALDI-TOF MS(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry)로 검정하였다.DNA-1 is represented by GCGAG (SEQ ID NO: 5), and was prepared by ordering from a synthesis company in a state in which an azide group is formed at 5' and a disulfide bond is formed at 3'. The DNA-1 (100 nmol) was dispersed in distilled water and treated with 20 μl of a mixed solution (pH 7) of 0.5 M DTT (dithiothreitol) and 120 mM KPB to remove the disulfide bond at the 3' end of DNA-1. It was reacted for 1 hour. Thereafter, DTT was removed through EA (ethylacetate) extraction. A mixture was prepared by putting the peptide powder (2 equiv, 200 nmol) prepared in Preparation Example 1 into a DNA solution. Acetonitrile (80 μl) was added to increase the solubility of the peptides in the mixture. After stirring the mixture overnight at ambient temperature, RP-HPLC was performed with a semipreparative C4 column using TEAA as an ion paring reagent to separate the desired reactant and MALDI-TOF It was verified by MS (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry).

제조예 3. 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(LinPOC-2) 제조Preparation Example 3. Preparation of linear peptide-oligonucleotide complex (LinPOC-2)

DNA는 CTCGC(서열번호 9)로 표시되며, 5'에는 아지드기가, 3'에는 이황화결합이 형성되어 있는 상태로 합성회사에 주문하여 제조된 것을 사용한 것을 제외하고 제조예 2와 모두 동일하게 하여 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(LinPOC-2)를 제조하였다.DNA is represented by CTCGC (SEQ ID NO: 9), with an azide group at 5' and a disulfide bond at 3'. A linear peptide-oligonucleotide complex (LinPOC-2) was prepared.

실시예 1. 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-1) 제조Example 1. Preparation of cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-1)

[반응식 2][Scheme 2]

Figure 112020095469403-pat00013
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고리화를 위해, 정제하지 않은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1를 사용하였다. For cyclization, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 without purification was used.

정제하지 않은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(100 nmol)에 황산구리 5 수화물(100 mM 스톡 용액에서 3 μL) 3 equiv, 아스코르브산(ascorbic acid) 6 equiv(100 mM 스톡 용액에서 6 μL) 및 용매 400 ㎕(물 120 ㎕, MeCN 80 ㎕, t-부탄올 200 μL)를 첨가하였다. 이때, 라디칼에 의한 DNA 분해를 방지하기 위해 상기 반응은 불활성 분위기에서 수행되었고, 불활성 분위기를 위해 아르곤 가스(Ar)를 사용하여 O2를 제거하였다.Copper sulfate pentahydrate (3 μL in 100 mM stock solution) 3 equiv, ascorbic acid 6 equiv (6 μL in 100 mM stock solution) and LinPOC-1 (100 nmol) prepared from Preparation Example 2 without purification 400 μL of solvent (120 μL of water, 80 μL of MeCN, 200 μL of t-butanol) was added. At this time, the reaction was performed in an inert atmosphere to prevent DNA degradation by radicals, and O 2 was removed using argon gas (Ar) for the inert atmosphere.

다음, 상기 혼합물을 주위온도에서 밤새도록 방치하였다. 반응이 완료된 혼합물을 4 mL의 0.1 M TEAA(Triethylammonium acetate) 용액으로 희석하였다. 상기 혼합물로부터 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-1)를 정제하기 위해, 이온 페어링 시약인 0.1 M TEAA를 사용하여 RP-HPLC을 수행하여 원하는 생성물을 분리하였고, MALDI-TOF MS로 검증하였다. 그 결과 수율이 90% 이상인 것으로 확인되었다. 본 발명의 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-1)는 1번의 정제과정(HPLC)을 통해 90% 이상의 고수율을 달성하고 있음을 알 수 있다.The mixture was then left overnight at ambient temperature. The reaction mixture was diluted with 4 mL of a 0.1 M TEAA (triethylammonium acetate) solution. To purify the cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-1) from the mixture, RP-HPLC was performed using 0.1 M TEAA as an ion pairing reagent to isolate the desired product, which was verified by MALDI-TOF MS. As a result, it was confirmed that the yield was 90% or more. It can be seen that the cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-1) of the present invention achieves a high yield of 90% or more through one purification process (HPLC).

실시예 2. 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-2) 제조Example 2. Preparation of cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-2)

제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 대신에 제조예 3으로부터 제조된 LinPOC-2를 사용한 것을 제외하고, 실시예 1과 모두 동일하게 하여 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체(CycPOC-2)를 제조하였다.A cyclic peptide-oligonucleotide complex (CycPOC-2) was prepared in the same manner as in Example 1, except that LinPOC-2 prepared in Preparation Example 3 was used instead of LinPOC-1 prepared in Preparation Example 2.

실험예 1. LinPOC-1, CycPOC-1의 고리화 형성 여부 검증Experimental Example 1. Verification of LinPOC-1 and CycPOC-1 Cyclization

제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 형성유무를 RP-HPLC와 MALDI-TOF로 검증하였다. 또한, 고리화 형성 유무를 확인하기 위하여 서열 특이적 효소인 α-키모트립신(α-chymotrypsin)으로 처리한 후 MALDI-TOF로 분석하였다. 고리화 확인과정은 구체적으로 다음과 같다. 물에 10 mg/ml의 농도로 용해된 α-키모트립신 용액을 제조하고, 여기에 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1 용액에 α-키모트립신 용액의 농도가 1 mg/ml가 되도록 첨가한 후, 밤새 반응시킨 다음, 이를 MALDI-TOF로 분석하였다.The presence or absence of LinPOC-1 prepared in Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared in Example 1 were verified by RP-HPLC and MALDI-TOF. In addition, in order to confirm the presence or absence of cyclization, the cells were treated with α-chymotrypsin, a sequence-specific enzyme, and then analyzed by MALDI-TOF. The cyclization confirmation process is specifically as follows. An α-chymotrypsin solution dissolved in water at a concentration of 10 mg/ml was prepared, and the concentration of the α-chymotrypsin solution in the LinPOC-1 prepared in Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared in Example 1 solution. was added to 1 mg/ml, allowed to react overnight, and then analyzed by MALDI-TOF.

도 5는 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(적색 그래프) 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1(흑색 그래프)에 대한 RP-HPLC 결과 그래프이다.5 is a graph of RP-HPLC results for LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 (red graph) and CycPOC-1 prepared from Example 1 (black graph).

도 5에 나타난 바와 같이, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1은 효율적으로 펩티드와 올리고뉴클레오티드가 접합되어 복합체를 형성하고 있음을 알 수 있다. 본 발명의 화학식 2로 표시되는 펩티드는 높은 소수성과 자기조립 특성을 가지므로 수용액에서 낮은 용해도를 갖는데, 이를 해결하기 위하여 적정 유기용매의 적가를 통해 펩티드를 수용액 내에 어느 정도 용해되도록 해준다면 펩티드와 올리고뉴클레오티드의 결합반응을 통해 불량한 용해도 문제를 극복할 수 있음을 알 수 있다. 상기 유기용매로는 아세토니트릴(acetonitrile, MeCN)이 가장 바람직하다.As shown in FIG. 5, it can be seen that the LinPOC-1 prepared in Preparation Example 2 forms a complex by efficiently conjugating the peptide and the oligonucleotide. The peptide represented by Formula 2 of the present invention has high hydrophobicity and self-assembly characteristics, so it has low solubility in aqueous solution. It can be seen that the problem of poor solubility can be overcome through the conjugation reaction of nucleotides. As the organic solvent, acetonitrile (MeCN) is most preferred.

또한, 티올-말레이미드 반응을 통해 선형의 POC를 형성하고, 이후 Cu(Ⅱ) 촉매, 아스코르브산 및 t-부탄올을 혼합함으로써, 고리화 첨가반응시켜 고리형 POC를 제조하였다. 이는 도 5를 통해 확인할 수 있다.In addition, a linear POC was formed through a thiol-maleimide reaction, followed by a cycloaddition reaction by mixing a Cu(II) catalyst, ascorbic acid, and t-butanol to prepare a cyclic POC. This can be confirmed through FIG. 5 .

구체적으로 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(적색 그래프)의 머무름 시간(retention time)(TR = 32.1 분)과 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1(흑색 그래프)의 머무름 시간(retention time)(TR = 31.4 분)이 서로 상이하며, 이러한 머무름 시간의 차이는 전반적인 형태가 상이함을 의미한다. 즉 선형 구조에서 고리형 구조로 성공적으로 변화하였음을 알 수 있다.Specifically, the retention time (T R = 32.1 min) of LinPOC-1 (red graph) prepared from Preparation Example 2 and the retention time (retention time) of CycPOC-1 (black graph) prepared from Example 1 (T R = 31.4 min) are different from each other, and this difference in retention time means that the overall shape is different. That is, it can be seen that the linear structure was successfully changed to the cyclic structure.

도 6은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이며, 도 7은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이며, 도 8은 α-chymotrypsin으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이며, 도 9는 α-chymotrypsin으로 처리된 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 MALDI-TOF 스펙트럼이다. 도면에서 매트릭스(matrix)는 3-HPA(3-hydroxypicolinic acid)이다. Figure 6 is a MALDI-TOF spectrum for LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, Figure 7 is a MALDI-TOF spectrum for CycPOC-1 prepared from Example 1, Figure 8 is a preparation treated with α-chymotrypsin MALDI-TOF spectrum for LinPOC-1 prepared from Example 2, and FIG. 9 is a MALDI-TOF spectrum for CycPOC-1 prepared from Example 1 treated with α-chymotrypsin. In the drawing, the matrix is 3-hydroxypicolinic acid (3-HPA).

도 6 및 7에 따르면, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(3195 Da)과 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1(3192 Da)은 동일한 분자량을 갖는 것으로 확인되었다. 다만 머무름 시간의 경우, 간혹 오류를 갖고 있기 때문에 보다 정확한 측정을 위해, 방향족 아미노산의 C말단 쪽의 펩티드 결합을 분해하는 α-키모트립신을 사용한 다른 분석을 수행하였다.According to Figures 6 and 7, it was confirmed that LinPOC-1 (3195 Da) prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 (3192 Da) prepared from Example 1 had the same molecular weight. However, in the case of retention time, since it sometimes has an error, another analysis was performed using α-chymotrypsin, which cleaves the peptide bond at the C-terminus of an aromatic amino acid, for more accurate measurement.

도 8 및 9에 따르면, α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1과 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1은 MALDI-TOF 스펙트럼에서 상이함을 확인하였다. α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1과 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1로부터 얻을 수 있는 각각의 단편 예상 구조와 분자량이 MALDI-TOF 스펙트럼의 결과와 일치함을 확인하였다.8 and 9, it was confirmed that LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin and CycPOC-1 prepared from Example 1 were different in MALDI-TOF spectra. It was confirmed that the predicted structure and molecular weight of each fragment obtained from LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin and CycPOC-1 prepared from Example 1 were consistent with the results of the MALDI-TOF spectrum. .

α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1과 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 MALDI-TOF 스펙트럼을 비교하면, 서로 공통된 피크가 없음을 알 수 있다. 즉 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1은 고리화 구조를 성공적으로 형성하고 있음을 알 수 있다.Comparing the MALDI-TOF spectra of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin and CycPOC-1 prepared from Example 1, it can be seen that there is no peak in common with each other. That is, it can be seen that CycPOC-1 prepared in Example 1 successfully formed a cyclized structure.

도 10은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 α-키모트립신으로 처리된 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 단편 구조를 도시한 것이고, 도 11은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1 및 α-키모트립신으로 처리된 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 단편 구조를 도시한 것이다. 이에 따르면, 선형과 고리형 구조 차이로 인해, α-키모트립신의 처리를 통해 얻을 수 있는 단편의 구조가 상이함을 알 수 있고, 이는 MALDI-TOF 스펙트럼 결과를 통해서도 확인하였다(피크 상이함). 즉 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1은 고리형 구조를 성공적으로 형성하고 있음을 알 수 있다.Figure 10 shows the fragment structure of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 treated with α-chymotrypsin, and Figure 11 shows CycPOC-1 prepared from Example 1 and The fragment structure of CycPOC-1 prepared from Example 1 treated with α-chymotrypsin is shown. According to this, it can be seen that the structures of the fragments obtained through the treatment of α-chymotrypsin are different due to the difference between the linear and cyclic structures, which was also confirmed through the MALDI-TOF spectrum results (different peaks). That is, it can be seen that CycPOC-1 prepared in Example 1 successfully formed a cyclic structure.

실험예 2. LinPOC-1, CycPOC-1의 입체구조 분석Experimental Example 2. Analysis of the three-dimensional structure of LinPOC-1 and CycPOC-1

LinPOC-1, CycPOC-1의 입체구조를 분석하기 위하여 CD 분광법을 사용하였다. 상기 CD 분광법은 Peltier 온도 조절기가 구비된 Chiralscan circular dichroism spectrometer(Applied Photophysics., Ltd, UK)를 사용하여 수행하였다. CD 스펙트럼은 2 mm 경로길이(pathlength)를 갖는 큐벳(cuvette)을 사용한 190 nm 내지 300 nm를 기록하였다. 이때, 20 ℃ 하에서 LinPOC-1, CycPOC-1을 각각 증류수에 용해(20 μM, 250 ㎕)한 후 CD 분광법으로 분석하였다.CD spectroscopy was used to analyze the three-dimensional structures of LinPOC-1 and CycPOC-1. The CD spectroscopy was performed using a Chiralscan circular dichroism spectrometer (Applied Photophysics., Ltd, UK) equipped with a Peltier temperature controller. CD spectra were recorded from 190 nm to 300 nm using a cuvette with a 2 mm pathlength. At this time, LinPOC-1 and CycPOC-1 were dissolved in distilled water at 20 °C (20 μM, 250 μl), and then analyzed by CD spectroscopy.

도 12는 DNA-1, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 CD 스펙트럼이다.12 is a CD spectrum of DNA-1, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, and CycPOC-1 prepared from Example 1.

도 12에 따르면, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 전체 CD 스펙트럼은 비슷한 패턴을 나타내었다. 그러나 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1(204 nm) 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1(202 nm)의 최소값은 약간의 차이를 나타내는 것으로 확인되었다. 이러한 차이는 앞서 관찰한 HPLC 결과와 일치하는 것이다.According to FIG. 12, the overall CD spectra of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 showed similar patterns. However, it was confirmed that the minimum value of LinPOC-1 (204 nm) prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 (202 nm) prepared from Example 1 showed a slight difference. This difference is consistent with the HPLC results observed previously.

도 13은 제조예 1로부터 제조된 Pep-1, 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 CD 스펙트럼에서 동일한 DNA-1 농도의 스펙트럼을 뺀 결과 그래프이다. 용매와 농도는 각 시료(물, 20 μM)에 동일하게 사용하였다.13 is a graph showing the results obtained by subtracting the spectrum of the same DNA-1 concentration from the CD spectrum for Pep-1 prepared from Preparation Example 1, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, and CycPOC-1 prepared from Example 1. The same solvent and concentration were used for each sample (water, 20 μM).

고리화의 경우, 종종 펩티드의 입체구조(conformation)에 변화를 줄 수 있기 때문에, 펩티드에 대한 CD 스펙트럼을 비교하고자 하였다. 이를 위해 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에 대한 CD 스펙트럼에서 DNA의 기여(contribution)를 없애고, 펩티드만의 입체구조(conformation)를 관찰하고자 하였다. 도 13에 나타난 바와 같이 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1에서 펩티드의 입체구조는 무작위 코일형태로 동일한 것으로 여겨지며, 즉 고리화가 펩티드 형태에는 전혀 영향을 미치지 않는 것으로 확인되었다. Since cyclization can often change the conformation of a peptide, we wanted to compare the CD spectra for the peptides. To this end, the contribution of DNA was removed from the CD spectra for LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1, and the conformation of only the peptide was observed. As shown in FIG. 13, the stereostructures of the peptides in LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 are considered to be the same in the form of random coils, that is, cyclization does not affect the peptide shape at all. confirmed to be

실험예 3. LinPOC-1, CycPOC-1의 DNA 이중나선 형성 능력(DNA duplex formation capability) 분석Experimental Example 3. Analysis of DNA duplex formation capability of LinPOC-1 and CycPOC-1

CD 분광법과 형광 분광법을 사용하여 Watson-Crick 염기쌍에 의한 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 DNA 이중 형성 능력을 평가하였다.The DNA duplex formation ability of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 by Watson-Crick base pairing was evaluated using CD spectroscopy and fluorescence spectroscopy.

구체적으로, DNA-1(서열번호 5:GCGAG)와 상보적인 DNA-2(서열번호9:CTCGC)를 사용하여 제조예 3의 LinPOC-2, 실시예 2의 CycPOC-2를 제조하였다. 완충액에 서로 상보적인 대응물(DNA-1과 DNA-2, LinPOC-1과 LinPOC-2 및 CycPOC-1과 CycPOC-2)을 동일 몰량으로 혼합하고, DNA 이중나선(DNA-only-duplex), L-duplex(LinPOC-1/LinPOC-2) 및 C-duplex(CycPOC-1/CycPOC-2)를 형성하기에 충분한 반응시간을 제공하였다. Specifically, LinPOC-2 of Preparation Example 3 and CycPOC-2 of Example 2 were prepared using DNA-1 (SEQ ID NO: 5: GCGAG) and complementary DNA-2 (SEQ ID NO: 9: CTCGC). Mutually complementary counterparts (DNA-1 and DNA-2, LinPOC-1 and LinPOC-2, and CycPOC-1 and CycPOC-2) were mixed in equal molar amounts in a buffer, DNA-only-duplex, Sufficient reaction time was provided to form L-duplex (LinPOC-1/LinPOC-2) and C-duplex (CycPOC-1/CycPOC-2).

온도에 따른 CD 스펙트럼 변화를 분석하기 위하여, 동일 몰량으로 혼합한 대응물(DNA-1과 DNA-2, LinPOC-1과 LinPOC-2 및 CycPOC-1과 CycPOC-2) 각각을 준비하고, 이를 10 mM Tris(150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, pH 8)의 300 ㎕에서 혼합하였다. 이후 상기 혼합물을 CD 조사를 이전에 밤새 배양하고, 상기 온도를 4 ℃에서 54 ℃까지 1분마다 1 ℃씩 증사키면서 CD 스펙트럼을 측정하였다.In order to analyze the CD spectrum change with temperature, each of the counterparts (DNA-1 and DNA-2, LinPOC-1 and LinPOC-2, and CycPOC-1 and CycPOC-2) mixed in equal molar amounts was prepared, and Mixed in 300 μl of mM Tris (150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, pH 8). The mixture was then incubated overnight prior to CD irradiation, and the CD spectrum was measured while increasing the temperature by 1 °C per minute from 4 °C to 54 °C.

형광 분석법은 다음과 같이 수행하였다. CD 스펙트럼과 동일한 조건으로 시료를 준비하고, 물에 용해된 EtBr을 시료에 최종 농도 20 μM까지 첨가한 후, 상기 혼합물을 형광 측정 전에 1 시간 동안 방치한 다음, 형광 스펙트럼을 측정하였다. 여기파장은 520 nm이고, 형광 스펙트럼은 550 nm에서 750 nm까지 분석하였다.Fluorescence analysis was performed as follows. A sample was prepared under the same conditions as the CD spectrum, EtBr dissolved in water was added to the sample to a final concentration of 20 μM, and the mixture was left for 1 hour before fluorescence measurement, and then the fluorescence spectrum was measured. The excitation wavelength was 520 nm, and the fluorescence spectrum was analyzed from 550 nm to 750 nm.

DNA의 입체구조 변화는 CD 스펙트럼 상에서 매우 민감하게 나타난다. 또한 DNA 이중나선(duplex)은 온도 증가에 따라 단일가닥으로 구조가 풀리는데, 이는 CD 스펙트럼에 변화를 야기한다. 따라서 온도변화에 따른 CD 스펙트럼 결과 변화를 통해 DNA 이중나선(duplex) 형성 정도를 분석하고자 하였다. 구체적으로 DNA 이중나선(duplex)을 완전히 형성하고 있다면, 온도가 증가할수록 CD 스펙트럼이 크게 변화할 것이고, DNA 이중나선(duplex)이 일부만 형성되어 있다면 CD 스펙트럼의 변화가 크지 않을 것이다.Changes in the conformational structure of DNA appear very sensitively on the CD spectrum. In addition, the structure of the DNA duplex is unwound into a single strand as the temperature increases, which causes a change in the CD spectrum. Therefore, we tried to analyze the degree of DNA duplex formation through the change of the CD spectrum result according to the temperature change. Specifically, if the DNA duplex is completely formed, the CD spectrum will change significantly as the temperature increases, and if the DNA duplex is partially formed, the CD spectrum will not change significantly.

도 14는 온도에 따른 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex)의 CD 스펙트럼이고, 이에 따르면, DNA-1, DNA-2의 혼합에 의해 형성된 DNA 이중나선(DNA-only-duplex)은 208 nm 및 254 nm에서 음성밴드, 280 nm에서 양성밴드를 갖는 전형적인 B-구조임을 확인하였다.14 is a CD spectrum of DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex) according to temperature, according to which, DNA-only-duplex formed by mixing DNA-1 and DNA-2 was confirmed to be a typical B-structure with negative bands at 208 nm and 254 nm and positive bands at 280 nm.

도 15는 온도에 따른 LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex)의 CD 스펙트럼이며, 도 16은 온도에 따른 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)의 CD 스펙트럼이다. 도 15 및 도 16에 따르면, LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)에 대한 CD 스펙트럼은 DNA 이중나선(DNA-only-duplex)과 거의 동일한 최소 및 최대값을 나타내었다. 즉 LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)은 B-형태가 존재함을 알 수 있다.15 is a CD spectrum of LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex) according to temperature, and FIG. 16 is a CD spectrum of CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) according to temperature. 15 and 16, CD spectra for LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex) and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) are almost identical to those of DNA-only-duplex. It showed the same minimum and maximum values. That is, it can be seen that LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex) and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) have B-forms.

다만, 온도가 증가함에 따라, CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)의 CD 스펙트럼(240 nm ~ 300 nm)은 낮은 변화가 나타났으나, LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex)의 CD 스펙트럼은 큰 변화를 나타냈다.However, as the temperature increased, the CD spectrum (240 nm ~ 300 nm) of CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) showed a low change, but LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex) The CD spectrum of showed a large change.

도 17은 온도별 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)의 CD 스펙트럼 중에서 254 nm에서의 CD 값을 도시한 그래프로, 이에 따르면 C-duplex는 온도 변화에 따라 254nm에서 CD 값의 변화량이 L-duplex보다 낮았다. 이를 통해, C-duplex가 L-duplex보다 DNA 이중나선을 유의미하게 더 적게 형성함을 알 수 있다. 17 shows 254 CD spectra of DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex), and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) by temperature. A graph showing the CD value at nm, according to which the change in CD value at 254 nm for C-duplex was lower than that for L-duplex with temperature change. Through this, it can be seen that C-duplex forms significantly fewer DNA double helices than L-duplex.

도 18은 DNA-1/DNA-2(DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2(L-duplex) 및 CycPOC-1/CycPOC-2(C-duplex)을 형광분석법으로 측정한 결과로, 이에 따르면 C-duplex는 L-duplex보다 EtBr의 형광이 더 적게 관찰됨을 확인하였다. 이는 도 17의 결과와 일치하는 것이다.18 is a result of measuring DNA-1/DNA-2 (DNA-only-duplex), LinPOC-1/LinPOC-2 (L-duplex), and CycPOC-1/CycPOC-2 (C-duplex) by fluorescence analysis. According to this, it was confirmed that less fluorescence of EtBr was observed in C-duplex than in L-duplex. This is consistent with the results of FIG. 17 .

도 18의 형광강도는 DNA 염기쌍 사이에 EtBr이 삽입될 때 극적으로 증가하므로, 형광강도를 통해 DNA 이중나선(duplex)의 형성정도를 알 수 있다. 구체적으로 DNA 이중나선 형성정도가 증가할수록 EtBr의 형광 강도가 증가하고, DNA 이중나선(duplex)의 형성정도가 감소할수록 EtBr의 형광 강도가 낮아진다. Since the fluorescence intensity of FIG. 18 dramatically increases when EtBr is inserted between DNA base pairs, the degree of formation of a DNA duplex can be seen through the fluorescence intensity. Specifically, the fluorescence intensity of EtBr increases as the degree of formation of the DNA double helix increases, and the fluorescence intensity of EtBr decreases as the degree of formation of the DNA duplex decreases.

C-duplex의 형광강도가 L-duplex의 형광강도보다 더 낮음을 확인한 바, C-duplex는 L-duplex 보다는 다소 낮으나, 우수한 DNA 이중나선(duplex) 형성 특성을 가지고 있음을 알 수 있다. As it was confirmed that the fluorescence intensity of C-duplex was lower than that of L-duplex, C-duplex was slightly lower than L-duplex, but it could be seen that it had excellent DNA duplex formation characteristics.

보다 정확한 비교를 위해, 단일가닥(single-straned) POCs인 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 형광강도를 측정하였다. 그 결과 단일가닥(single-straned)인 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1에서는 EtBr의 형광강도가 관찰되지 않았다. EtBr의 형광강도를 통해 DNA 이중나선 형성정도를 확인할 수 있음을 다시 한번 검증하였고, C-duplex는 L-duplex보다는 적으나 염기쌍 형성을 통한 이중나선을 효율적으로 형성하고 있음을 알 수 있다.For more accurate comparison, the fluorescence intensity of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, which is single-straned POCs, was measured. As a result, the fluorescence intensity of EtBr was not observed in the single-stranded LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2. It was once again verified that the degree of DNA double helix formation could be confirmed through the fluorescence intensity of EtBr.

도 19는 온도에 따른 제조예 3으로부터 제조된 LinPOC-2에 대한 CD 스펙트럼이다. 상기 LinPOC-2 시료는 10 mM Tris 완충액(pH 8, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2)에 용해한 것을 사용하였다. 상기 LinPOC-2의 농도는 15 μM이다.19 is a CD spectrum for LinPOC-2 prepared from Preparation Example 3 according to temperature. The LinPOC-2 sample was dissolved in 10 mM Tris buffer (pH 8, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2). The concentration of LinPOC-2 is 15 μM.

도 19에 나타난 바와 같이 LinPOC-2 단독만 존재하는 경우에는 온도 증가에 따른 CD스펙트럼의 변화가 관찰되지 않음을 알 수 있다. As shown in FIG. 19, when only LinPOC-2 is present, it can be seen that no change in the CD spectrum with increasing temperature is observed.

실험예 4. LinPOC-1, CycPOC-1의 자기조립 분석Experimental Example 4. LinPOC-1, CycPOC-1 self-assembly analysis

제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1을 원자힘 현미경(AFM)으로 촬영하여 자기조립 여부를 확인하였다. 우선 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1를 각각 30 μM 농도로 물에 용해하고, 초음파 처리한 후, 자기조립되도록 밤새 방치하였다. AFM 분석전에 LinPOC-1, CycPOC-1의 최종농도가 5 μM이 되도록 각각 희석하였다. 새로 절단된 운모(mica) 상에 LinPOC-1, CycPOC-1을 로딩하고, 건조시켰다. AFM 이미지를 비접촉모드로 촬영하였다.LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 were photographed with an atomic force microscope (AFM) to confirm self-assembly. First, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 were each dissolved in water at a concentration of 30 μM, treated with ultrasonic waves, and then allowed to self-assemble overnight. Before AFM analysis, LinPOC-1 and CycPOC-1 were each diluted to a final concentration of 5 μM. LinPOC-1 and CycPOC-1 were loaded on freshly cut mica and dried. AFM images were taken in non-contact mode.

도 20은 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 자기조립의 AFM 이미지이고, 도 21은 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 자기조립 AFM 이미지이다.20 is an AFM image of self-assembly of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2, and FIG. 21 is an AFM image of self-assembly of CycPOC-1 prepared from Example 1.

도 20에 따르면 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 자기조립체는 구형 또는 섬유형태가 혼재되어 형성됨을 알 수 있다. 상기 구형 자기조립체와 섬유형 자기조립체의 평균 직경은 약 20 nm로 유사하였다. 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1의 모노머 평균 직경이 약 10 nm인 점을 고려하면 구형 자기조립체는 미셀형태이고, 섬유형 자기조립체는 원통형 미셀인 것으로 여겨진다.According to FIG. 20, it can be seen that the self-assembly of LinPOC-1 prepared in Preparation Example 2 is formed in a mixture of spherical or fibrous shapes. The average diameter of the spherical self-assembly and the fibrous self-assembly was similar to about 20 nm. Considering that the monomer average diameter of LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 is about 10 nm, it is considered that the spherical self-assembly is in the form of micelles and the fibrous self-assembly is in the form of cylindrical micelles.

도 21에 따르면 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1의 자기조립체는 구형 자기조립체만이 균질하게 형성되어 있음을 확인하였다. 이의 평균 직경은 약 22 nm로, LinPOC-1의 자기조립체보다 약간 더 크다. According to FIG. 21, it was confirmed that only spherical self-assemblies were homogeneously formed in the self-assembly of CycPOC-1 prepared in Example 1. Its average diameter is about 22 nm, slightly larger than the self-assembly of LinPOC-1.

실험예 5. LinPOC-1, CycPOC-1의 이중나선 자기조립 형성여부Experimental Example 5. Formation of double helix self-assembly of LinPOC-1 and CycPOC-1

제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1을 원자힘 현미경(AFM)으로 촬영하여 자기조립 여부를 확인하였다. 우선 제조예 2로부터 제조된 LinPOC-1 및 실시예 1로부터 제조된 CycPOC-1를 각각 30 μM 농도로 증류수에 용해하고, 초음파 처리한 후, 자기조립되도록 밤새 방치하였다. AFM 분석전에 LinPOC-1, CycPOC-1의 최종농도가 5 μM이 되도록 각각 희석하였다. 새로 절단된 운모(mica) 상에 LinPOC-1, CycPOC-1을 로딩하고, 건조시켰다.LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 were photographed with an atomic force microscope (AFM) to confirm self-assembly. First, LinPOC-1 prepared from Preparation Example 2 and CycPOC-1 prepared from Example 1 were each dissolved in distilled water at a concentration of 30 μM, subjected to ultrasonic treatment, and left overnight to self-assemble. Before AFM analysis, LinPOC-1 and CycPOC-1 were each diluted to a final concentration of 5 μM. LinPOC-1 and CycPOC-1 were loaded on freshly cut mica and dried.

이중나선(duplex)을 확인하기 위해, 상기 LinPOC-1(제조예 1)의 자기조립체 및 CycPOC-1(실시예 1)의 자기조립체가 포함된 독립적인 용액에 각각 상보적인 LinPOC-2(제조예 2)와 CycPOC-2(실시예 2)를 동일한 몰량으로 각각 혼합한 후, 상기 혼합물을 밤새 배양하여, L-duplex(LinPOC-1/LinPOC-2)와 C-duplex(CycPOC-1/CycPOC-2)를 제조하였다. 상기 L-duplex와 C-duplex를 각각 5 ㎕ 씩 채취하여, 새로 절단된 운모(mica) 상에 로딩하고, 건조시킨 뒤, AFM 이미지를 비접촉모드로 촬영하였다.In order to confirm the duplex, LinPOC-2 (Preparation Example 1) complementary to independent solutions containing the self-assembly of LinPOC-1 (Preparation Example 1) and the self-assembly of CycPOC-1 (Example 1) 2) and CycPOC-2 (Example 2) were mixed in equal molar amounts, and the mixture was incubated overnight to obtain L-duplex (LinPOC-1/LinPOC-2) and C-duplex (CycPOC-1/CycPOC- 2) was prepared. 5 μl of each of the L-duplex and the C-duplex was taken, loaded onto freshly cut mica, dried, and AFM images were taken in a non-contact mode.

도 22 및 도 23은 자기조립된 L-duplex에 대한 AFM 이미지이고, 도 24 및 도 25는 자기조립된 C-duplex에 대한 AFM 이미지이다.22 and 23 are AFM images of self-assembled L-duplex, and FIGS. 24 and 25 are AFM images of self-assembled C-duplex.

도 22 내지 도 25에 나타난 바와 같이, L-duplex는 고도로 조밀한 구조의 자기조립체를 형성한 반면, C-duplex는 느슨하고 덜 연관된 구조의 자기조립체를 형성하였다. 선형 또는 고리형의 입체구조로 인해 L-duplex와 C-duplex의 이중나선 형성에 차이가 생겼고, 이것이 L-duplex와 C-duplex의 자기조립에도 영향을 끼친 것으로 보인다. As shown in FIGS. 22 to 25 , the L-duplex formed a self-assembly with a highly dense structure, whereas the C-duplex formed a self-assembly with a loose and less connected structure. The linear or cyclic three-dimensional structure caused a difference in the formation of the double helix of L-duplex and C-duplex, which seems to have affected the self-assembly of L-duplex and C-duplex.

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Claims (16)

화학식 1로 표시되는 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체:
[화학식 1]
Figure 112023031911004-pat00014

상기 화학식 1에서,
상기 Pep는 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 서열번호 5 또는 9로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.
Self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex represented by Formula 1:
[Formula 1]
Figure 112023031911004-pat00014

In Formula 1,
The Pep is a peptide represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and the oligo is an oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 5 or 9.
삭제delete 삭제delete 삭제delete 제1항에 있어서,
상기 복합체는 하기 화학식 4 또는 화학식 5로 표시되는 것을 특징으로 하는 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체.
[화학식 4]
Figure 112020095469403-pat00015

[화학식 5]
Figure 112020095469403-pat00016
According to claim 1,
The self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that the complex is represented by the following formula (4) or formula (5).
[Formula 4]
Figure 112020095469403-pat00015

[Formula 5]
Figure 112020095469403-pat00016
제1항에 있어서,
상기 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체는 용액 상에서 자기조립체를 형성하는 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체.
According to claim 1,
The cyclic peptide-oligonucleotide complex is a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that it forms a self-assembly in solution .
제1항에 따른 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체가 용액 상에서 자기조립되어 형성된 자기조립체.A self-assembly formed by self-assembling the self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex according to claim 1 in a solution. 제7항에 있어서,
상기 자기조립체는 평균 직경 10 내지 30 nm의 구형 미셀 형태 또는 소낭 형태인 것을 특징으로 하는 자기조립체.
According to claim 7,
The self-assembly is in the form of spherical micelles or vesicles with an average diameter of 10 to 30 nm.
1) 화학식 6으로 표시되는 펩티드와 화학식 7로 표시되는 올리고뉴클레오티드를 혼합하여 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체를 제조하는 단계; 및
2) 상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체에 CuSO4, 아스코르브산 및 부탄올을 첨가하여 고리화하는 단계;를 포함하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
[화학식 6]
Figure 112023031911004-pat00017

[화학식 7]
Figure 112023031911004-pat00018

상기 Pep는 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 서열번호 5 또는 9로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.
1) preparing a linear peptide-oligonucleotide complex by mixing the peptide represented by Formula 6 and the oligonucleotide represented by Formula 7; and
2) cyclization by adding CuSO 4 , ascorbic acid and butanol to the linear peptide-oligonucleotide complex;
[Formula 6]
Figure 112023031911004-pat00017

[Formula 7]
Figure 112023031911004-pat00018

The Pep is a peptide represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and the oligo is an oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 5 or 9.
제9항에 있어서,
상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드는,
1-a) 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드에 환원제를 처리하는 단계;를 통해 3' 말단에서 이황화 결합이 제거된 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 9,
The oligonucleotide represented by Formula 6 in step 1) is
1-a) treating the oligonucleotide represented by Formula 6 with a reducing agent; a method for producing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that disulfide bonds are removed from the 3' end.
제9항에 있어서,
상기 1) 단계의 화학식 6으로 표시되는 올리고뉴클레오티드와 화학식 7로 표시되는 펩티드는 1 : 1 내지 4 몰비로 혼합되는 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 9,
A method for producing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that the oligonucleotide represented by formula 6 and the peptide represented by formula 7 in step 1) are mixed in a molar ratio of 1: 1 to 4.
제9항에 있어서,
상기 1) 단계에, 유기용매를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 9,
In step 1), a method for preparing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that it further comprises an organic solvent.
제12항에 있어서,
상기 유기용매는 에탄올, 메탄올, 이소프로필알콜, 부탄올, 디메틸설폭사이드(DMSO), 디메틸포름아미드(DMF), 테트라하이드로퓨란(THF), 아세토니트릴, 디클로로메탄, 에틸아세테이트, 헥산, 디에틸에테르, 벤젠, 클로로포름 및 아세톤로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유기용매인 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 12,
The organic solvent is ethanol, methanol, isopropyl alcohol, butanol, dimethyl sulfoxide (DMSO), dimethylformamide (DMF), tetrahydrofuran (THF), acetonitrile, dichloromethane, ethyl acetate, hexane, diethyl ether, A method for producing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that at least one organic solvent selected from the group consisting of benzene, chloroform and acetone.
제9항에 있어서,
상기 2) 단계에서,
상기 선형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체, CuSO4, 아스코르브산의 당량비는 1 : 2-4 : 5-7인 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 9,
In step 2),
A method for producing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that the equivalent ratio of the linear peptide-oligonucleotide complex, CuSO 4 and ascorbic acid is 1: 2-4: 5-7.
제9항에 있어서,
상기 2) 단계는 불활성 분위기 하에서 수행되는 것을 특징으로 하는 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체의 제조방법.
According to claim 9,
Step 2) is a method for producing a cyclic peptide-oligonucleotide complex, characterized in that carried out under an inert atmosphere.
제9항의 제조방법에 따라 제조된 하기 화학식 1로 표시되는 자기조립 고리형 펩티드-올리고뉴클레오티드 복합체:
[화학식 1]
Figure 112023031911004-pat00044

상기 화학식 1에서,
상기 Pep는 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시되는 펩티드이고, 상기 Oligo는 서열번호 5 또는 9로 표시되는 올리고뉴클레오티드이다.
A self-assembling cyclic peptide-oligonucleotide complex represented by Formula 1 prepared according to the method of claim 9:
[Formula 1]
Figure 112023031911004-pat00044

In Formula 1,
The Pep is a peptide represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and the oligo is an oligonucleotide represented by SEQ ID NO: 5 or 9.
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