KR102117833B1 - Composition comprising materials absorbing nucleic acid and separating genetic material rapidly from biological sample, and separating method using the same - Google Patents

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KR102117833B1
KR102117833B1 KR1020190001392A KR20190001392A KR102117833B1 KR 102117833 B1 KR102117833 B1 KR 102117833B1 KR 1020190001392 A KR1020190001392 A KR 1020190001392A KR 20190001392 A KR20190001392 A KR 20190001392A KR 102117833 B1 KR102117833 B1 KR 102117833B1
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남장희
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Abstract

The present invention relates to a composition comprising a nucleic acid adsorption material capable of quickly separating a genetic material from a biological sample, and a method of separating a genetic material from a biological sample using the same, and more specifically, to a composition capable of extracting and separating a genetic material from various biological samples by a simple process, and a method of separating a genetic material using the same. According to the present invention, the composition contains porous zirconia that quickly adsorbs a genetic material present in a biological sample into pores, and thus can extract and separate the genetic material from various biological samples, and extraction and separation of the genetic material from the various biological samples can be implemented by a simple process.

Description

생물시료로부터 유전물질을 신속하게 분리하는 핵산 흡착 물질을 포함하는 조성물 및 그를 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 신속하게 분리하는 방법{Composition comprising materials absorbing nucleic acid and separating genetic material rapidly from biological sample, and separating method using the same}Composition comprising materials absorbing nucleic acid and separating genetic material rapidly from biological sample, and separating method using the same}

본 발명은 생물시료로부터 유전물질을 신속하게 분리하는 핵산 흡착 물질을 포함하는 조성물 및 그를 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 다양한 생물시료에 대하여 간단한 공정으로 유전물질 추출 및 분리가 가능한 조성물 및 그를 이용한 유전물질 분리방법에 관한 것이다.The present invention relates to a composition comprising a nucleic acid adsorption material for rapidly separating a genetic material from a biological sample, and a method for rapidly separating a genetic material from a biological sample using the composition, and more particularly, a simple process for various biological samples. The present invention relates to a composition capable of extracting and separating genetic material and a method of separating genetic material using the same.

DNA 또는 RNA 등의 유전물질을 추출하는 현재의 방법으로는 페놀/클로로포름을 사용하는 방법, 염석하는 방법, 카오트로픽 염 및 실리카 수지를 사용하는 방법, 친화성 수지를 사용하는 방법, 이온 교환 크로마토그래피법 및 자성 비드를 사용하는 방법 등이 있다. 이 방법들은 미국 특허 제5057426호, 제4923978호, EP 특허 제0512767 A1호, 및 EP 제0515484B호, WO 제95/13368호, WO 제97/10331호, 및 WO 제96/18731호, 대한민국 공개특허 제2005-0088164호 등에 기술되어 있다. 이들 특허 및 특허출원들은 고체 지지체상에 핵산을 흡착시킨 후 핵산을 단리(isolation)하는 방법에 관하여 기재하고 있다. 이전에 사용되는 방법들은 핵산을 단리하기 위해서 일정 종류의 용매를 사용하는 것인데, 여기서 사용되는 용매들은 가연성, 연소성 또는 독성 등이 있는 유기 용매들로서, 핵산 추출방법이 복잡하고 유해 화학물질을 취급하는 등의 문제가 있다.Current methods for extracting genetic material such as DNA or RNA include phenol/chloroform, salting out, chaotropic salts and silica resins, affinity resins, ion exchange chromatography And using magnetic beads. These methods are disclosed in U.S. Patent Nos. 5057426, 4923978, EP Patent 0512767 A1, and EP 0515484B, WO 95/13368, WO 97/10331, and WO 96/18731, Republic of Korea Patent 2005-0088164 and the like. These patents and patent applications describe a method of isolating nucleic acids after adsorbing them on a solid support. Previously used methods are to use certain types of solvents to isolate nucleic acids, and the solvents used here are organic solvents that are flammable, combustible or toxic, complex nucleic acid extraction methods, handling hazardous chemicals, etc. There is a problem.

한편, 종래 선행기술로, 대한민국 등록특허 제1365737호는 생물학적 시료로부터 다공성 고체상을 이용하여 핵산 증폭 반응용 생물학적 분자를 추출용매 없이 신속하게 분리하는 방법에 대해서 개시하고 있으나, 다양한 생물시료에 적용하기 어렵다는 한계가 있다. 예컨대, 쌀알과 녹두는 탄수화물이 핵산의 추출량을 낮게하는 문제점을 가지며, 청경채와 같은 엽채류의 노엽은 단위 면적당 세포수가 적어 농도가 낮게 추출되며, 감귤과 같은 나무는 2차 대사산물에 의한 증폭에 문제가 있는 것으로 알려지고 있다. On the other hand, as a prior art, Korean Patent Registration No. 1365737 discloses a method for rapidly separating a biological molecule for nucleic acid amplification reaction using an porous solid phase from a biological sample without an extraction solvent, but is difficult to apply to various biological samples. There are limits. For example, rice grains and mung beans have a problem in that carbohydrates lower the extraction amount of nucleic acids, and leafy leaves of leafy vegetables such as bok choy are extracted with a low concentration due to a small number of cells per unit area, and trees such as citrus fruits have problems with amplification by secondary metabolites. It is said that there is.

대한민국 등록특허 제1365737호 (2014.02.14)Republic of Korea Registered Patent No. 1365737 (2014.02.14)

따라서 본 발명의 목적은 다양한 생물시료에 대하여 유전물질 추출 및 분리가 가능한 조성물 및 그를 이용한 유전물질 분리방법을 제공하는데 있다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a composition capable of extracting and separating genetic material for various biological samples and a method for separating genetic material using the same.

본 발명의 다른 목적은 다양한 생물시료에 대한 유전물질 추출 및 분리를 간단한 공정으로 구현 가능한 조성물 및 그를 이용한 유전물질 분리방법을 제공하는데 있다.Another object of the present invention is to provide a composition capable of realizing extraction and separation of genetic material for various biological samples in a simple process and a method for separating genetic material using the same.

상술한 목적을 달성하기 위한 본 발명의 실시예에 따른 조성물은 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함한다.The composition according to an embodiment of the present invention for achieving the above object comprises a porous zirconia that quickly adsorbs the dielectric material present in the biological sample into pores.

또한, 본 발명에 따른 조성물에 있어서, 상기 다공성의 지르코니아는 지르코니아 비드인 것을 특징으로 한다.In addition, in the composition according to the present invention, the porous zirconia is characterized in that the zirconia beads.

또한, 본 발명에 따른 조성물에 있어서, 상기 지르코니아 비드의 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것을 특징으로 한다.In addition, in the composition according to the present invention, the size of the zirconia beads is characterized in that 1.4 ~ 3.0 mm.

또한, 본 발명에 따른 조성물에 있어서, 상기 생물시료는 동물, 식물, 세균 또는 곰팡이인 것을 특징으로 한다.In addition, in the composition according to the present invention, the biological sample is characterized in that the animal, plant, bacteria or fungi.

본 발명의 실시예에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법은, 생물시료에 다공성의 지르코니아를 접촉시키는 단계(S10); 및 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20)를 포함한다.A method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to an embodiment of the present invention includes contacting a porous zirconia with the biological sample (S10); And absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous zirconia pore (S20).

또한, 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 있어서, 상기 S10단계는, 상기 생물시료를 다공성의 지르코니아에 접촉시켜 그라인딩(grinding)하는 단계(S12);를 포함하는 것을 특징으로 한다.In addition, in the method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to the present invention, step S10 comprises: grinding (S12) the biological sample in contact with porous zirconia; It is characterized by including.

또한, 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 있어서, 상기 S20단계는, 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질이 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)에 흡착되는 단계(S22);를 포함한다.In addition, in the method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to the present invention, in step S20, the genetic material present in the biological sample is adsorbed on the porous pores of zirconia. Step (S22); includes.

또한, 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 있어서, 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20) 이후에, 물로 세척하는 단계(30)를 더 포함하는 것을 특징으로 한다.In addition, in the method for rapidly separating the genetic material for nucleic acid amplification reaction from the biological sample according to the present invention, after the step of absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous pores of zirconia (S20) In, it characterized in that it further comprises the step of washing with water (30).

또한, 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 있어서, 상기 다공성의 지르코니아는 다공성 지르코니아 비드이고, 상기 다공성 지르코니아 비드의 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것을 특징으로 한다.In addition, in the method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to the present invention, the porous zirconia is a porous zirconia bead, and the size of the porous zirconia bead is 1.4 to 3.0 mm. .

또한, 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 있어서, 상기 생물시료는 동물, 식물, 세균 또는 곰팡이인 것을 특징으로 한다.In addition, in the method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to the present invention, the biological sample is characterized in that it is an animal, a plant, a bacteria, or a fungus.

본 발명의 실시예에 따른 키트는 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함한다.Kit according to an embodiment of the present invention includes a porous zirconia that quickly adsorbs the dielectric material present in the biological sample to the pores.

본 발명에 따르면, 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함함으로써 다양한 생물시료에 대하여 유전물질 추출 및 분리가 가능하다는 장점이 있다.According to the present invention, by including the porous zirconia for quickly adsorbing the dielectric material present in the biological sample to the pores (pore), there is an advantage that it is possible to extract and separate the genetic material for various biological samples.

또한, 종래의 경우 증폭반응 전에 일반적으로 핵산의 정량이 필요하나, 본 발명의 경우 지르코니아 비드에 흡착되는 핵산의 량이 거의 일정하며, 이 핵산의 량이 PCR 반응에 충분하고, 다공성 비드를 직접 반응액에 포함하여 증폭을 실시함으로써 핵산 정량과정이 불필요하여 노동력 감소와 시간절약의 효과가 있다.In addition, in the conventional case, it is generally necessary to quantify the nucleic acid before the amplification reaction, but in the present invention, the amount of nucleic acid adsorbed on the zirconia beads is almost constant, the amount of this nucleic acid is sufficient for PCR reaction, and the porous beads are directly added to the reaction solution. Including amplification, the nucleic acid quantification process is unnecessary, which reduces labor and saves time.

또한, 본 발명에 따르면, 다양한 생물시료에 대한 유전물질 추출 및 분리를 간단한 공정으로 구현 가능하다는 장점이 있다. In addition, according to the present invention, there is an advantage that it is possible to implement the extraction and separation of genetic material for various biological samples in a simple process.

도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 비드를 이용한 유전물질 추출용 팁(Tip)이다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 유전물질 추출용 팁(Tip)을 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 분리하는 공정을 나타낸 모식도이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 튜브 내경 크기에 적합한 지르코니아 비드 직경 크기를 설명하는 모식도이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 펠트(Felt)를 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 분리하는 공정을 나타낸 모식도이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 메뉴얼 및 지르코니아 파쇄에 의한 핵산 추출 비교 실험 결과이다(M: 100bp ladder, C1,C2: 막자사발(pestle), A: 지르코니아 마쇄, B: 막자사발(pestle) 추출 후 지르코니아 바인딩 시험).
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아를 이용한 핵산 추출 후 세척(washing) 방법에 따른 증폭 비교 실험 결과이다(M: 100bp ladder, C: 막자사발(pestle) 40ng DNA, 1~2: 물 세척, 3~4: 70% 에탄올 세척)
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따른 RAPD(random amplified polymorphic DNA)를 이용한 다양한 시료의 지르코니아를 이용한 핵산 추출 후 PCR 반응을 확인한 결과이다(M: 100bp ladder, A: 쌀 1립, B: 녹두 1립, C: 청경채잎, D: 감귤잎, A01~D11: RAPD 프라이머).
도 8은 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 비드의 크기에 따른 PCR 반응을 확인한 결과이다(M: 100bp ladder, C: 막자사발(pestle) 40ng DNA, A: 1.4mm, B: 2.0mm, 1: 고추, 2: 청경채).
1 is a tip (Tip) for extracting a dielectric material using zirconia beads according to an embodiment of the present invention.
2 is a schematic diagram showing a process of separating a dielectric material from a biological sample using a tip for extracting the dielectric material according to an embodiment of the present invention.
Figure 3 is a schematic diagram illustrating the zirconia bead diameter size suitable for the PCR tube inner diameter size according to an embodiment of the present invention.
4 is a schematic diagram showing a process of separating a dielectric material from a biological sample using zirconia felt according to an embodiment of the present invention.
5 is a comparison experiment results of nucleic acid extraction by manual and zirconia crushing according to an embodiment of the present invention (M: 100bp ladder, C1, C2: pestle, A: zirconia grinding, B: pestle ) Zirconia binding test after extraction).
6 is a comparison result of amplification according to a washing method after nucleic acid extraction using zirconia according to an embodiment of the present invention (M: 100bp ladder, C: pestle 40ng DNA, 1~2: water Washing, 3~4: 70% ethanol washing)
7 is a result of confirming the PCR reaction after nucleic acid extraction using zirconia of various samples using random amplified polymorphic DNA (RAPD) according to an embodiment of the present invention (M: 100bp ladder, A: rice 1 grain, B: green beans 1 lip, C: green leaf, D: citrus leaf, A01~D11: RAPD primer).
Figure 8 is a result confirming the PCR reaction according to the size of the zirconia beads according to an embodiment of the present invention (M: 100bp ladder, C: pestle 40ng DNA, A: 1.4mm, B: 2.0mm, 1 : Red pepper, 2: Chongkyungchae).

이하, 첨부된 도면을 참조하여 본 명세서에 개시된 실시 예를 상세히 설명하되, 도면 부호에 관계없이 동일하거나 유사한 구성요소는 동일한 참조 번호를 부여하고 이에 대한 중복되는 설명은 생략하기로 한다. 이하의 설명에서 사용되는 구성요소에 대한 접미사 "모듈" 및 "부"는 명세서 작성의 용이함만이 고려되어 부여되거나 혼용되는 것으로서, 그 자체로 서로 구별되는 의미 또는 역할을 갖는 것은 아니다. 또한, 본 명세서에 개시된 실시 예를 설명함에 있어서 관련된 공지 기술에 대한 구체적인 설명이 본 명세서에 개시된 실시 예의 요지를 흐릴 수 있다고 판단되는 경우 그 상세한 설명을 생략한다. 또한, 첨부된 도면은 본 명세서에 개시된 실시 예를 쉽게 이해할 수 있도록 하기 위한 것일 뿐, 첨부된 도면에 의해 본 명세서에 개시된 기술적 사상이 제한되지 않으며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변경, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다. Hereinafter, exemplary embodiments disclosed herein will be described in detail with reference to the accompanying drawings, but the same or similar elements will be given the same reference numbers regardless of the reference numerals, and redundant descriptions thereof will be omitted. The suffixes "module" and "part" for components used in the following description are given or mixed only considering the ease of writing the specification, and do not have meanings or roles that are distinguished from each other. In addition, in describing the embodiments disclosed in this specification, detailed descriptions of related well-known technologies are omitted when it is determined that the gist of the embodiments disclosed herein may obscure the subject matter. In addition, the accompanying drawings are only for easy understanding of the embodiments disclosed in the present specification, and the technical spirit disclosed in the specification is not limited by the accompanying drawings, and all modifications included in the spirit and technical scope of the present invention , It should be understood to include equivalents or substitutes.

제1, 제2 등과 같이 서수를 포함하는 용어는 다양한 구성요소들을 설명하는데 사용될 수 있지만, 상기 구성요소들은 상기 용어들에 의해 한정되지는 않는다. 상기 용어들은 하나의 구성요소를 다른 구성요소로부터 구별하는 목적으로만 사용된다.Terms including ordinal numbers such as first and second may be used to describe various components, but the components are not limited by the terms. The terms are used only for the purpose of distinguishing one component from other components.

어떤 구성요소가 다른 구성요소에 "연결되어" 있다거나 "접속되어" 있다고 언급된 때에는, 그 다른 구성요소에 직접적으로 연결되어 있거나 또는 접속되어 있을 수도 있지만, 중간에 다른 구성요소가 존재할 수도 있다고 이해되어야 할 것이다. 반면에, 어떤 구성요소가 다른 구성요소에 "직접 연결되어" 있다거나 "직접 접속되어" 있다고 언급된 때에는, 중간에 다른 구성요소가 존재하지 않는 것으로 이해되어야 할 것이다.When an element is said to be "connected" or "connected" to another component, it is understood that other components may be directly connected to or connected to the other component, but there may be other components in between. It should be. On the other hand, when a component is said to be "directly connected" or "directly connected" to another component, it should be understood that no other component exists in the middle.

단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다. Singular expressions include plural expressions unless the context clearly indicates otherwise.

본 출원에서, "포함한다" 또는 "가지다" 등의 용어는 명세서상에 기재된 특징, 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 지정하려는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 미리 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다.In this application, terms such as "comprises" or "have" are intended to indicate the presence of features, numbers, steps, actions, components, parts or combinations thereof described in the specification, but one or more other features. It should be understood that the existence or addition possibilities of fields or numbers, steps, operations, components, parts or combinations thereof are not excluded in advance.

이하, 도면들을 참조하여 본 발명의 실시예에 대해 상세히 설명하기로 한다. 본 발명은 본 발명의 정신 및 필수적 특징을 벗어나지 않는 범위에서 다른 특정한 형태로 구체화될 수 있음은 당업자에게 자명하다.Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail with reference to the drawings. It will be apparent to those skilled in the art that the present invention may be embodied in other specific forms without departing from the spirit and essential features of the present invention.

도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 비드를 이용한 유전물질 추출용 팁(Tip)이고, 도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 유전물질 추출용 팁(Tip)을 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 분리하는 공정을 나타낸 모식도이며, 도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 PCR 튜브 내경 크기에 적합한 지르코니아 비드 직경 크기를 설명하는 모식도이다. 도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 펠트(Felt)를 이용하여 생물시료로부터 유전물질을 분리하는 공정을 나타낸 모식도이다.1 is a tip for extracting a dielectric material using zirconia beads according to an embodiment of the present invention, and FIG. 2 is a tip for extracting a dielectric material according to an embodiment of the present invention from a biological sample It is a schematic diagram showing the process of separating the dielectric material, and FIG. 3 is a schematic diagram illustrating the zirconia bead diameter size suitable for the PCR tube inner diameter size according to an embodiment of the present invention. 4 is a schematic view showing a process of separating a dielectric material from a biological sample using zirconia felt according to an embodiment of the present invention.

도 1 내지 4를 참조하면, 본 발명에 따른 조성물은 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함한다. 1 to 4, the composition according to the present invention includes a porous zirconia that rapidly adsorbs dielectric material present in a biological sample to pores.

본 발명에 있어서, 생물시료는 동물, 식물, 세균 또는 곰팡이 유래일 수 있고, 바람직하게는 고추, 쌀, 녹두, 청경채 또는 감귤이 해당될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the biological sample may be derived from animals, plants, bacteria, or fungi, and preferably may be red pepper, rice, green beans, bok choy, or tangerines, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 유전물질은 유전적 기능단위를 포함하는 동·식물, 미생물 또는 기타 유전적 기원이 되는 물질로서, 종자, 잡수, 정자 혹은 개개의 유기물 등이 포함되며, 식물, 동물, 미생물에서 추출한 염색체, 유전인자, 박테리아, Plasmid와 같은 DNA도 포함되며 혹은 이러한 것들의 일부분도 포함되나, DNA를 갖고 있지 않는 생화학적 추출물은 포함되지 않는다.In the present invention, the genetic material is an animal, plant, microorganism, or other genetically-derived material that includes a genetic functional unit, and includes seeds, freshwater, sperm, or individual organic substances, and is used in plants, animals, and microorganisms. DNA, such as extracted chromosomes, genetic factors, bacteria, or Plasmid, is also included, or some of these, but not biochemical extracts that do not contain DNA.

지르코니아는 산화지르코늄(ZrO2)으로 내열성 세라믹의 재료로 사용되며, 치아, 세라믹 용기 등 다양한 산업용 재료로 이용되고 있고, 생명공학 연구에서는 주로 시료를 파쇄하는 비드(bead)로 사용하고 있다. 본 발명에 따른 조성물에 있어서, 상기 다공성의 지르코니아는 지르코니아 비드일 수 있다.Zirconia is a zirconium oxide (ZrO 2 ) used as a material for heat-resistant ceramics, and is used in various industrial materials such as teeth and ceramic containers. In the composition according to the present invention, the porous zirconia may be zirconia beads.

지르코니아 비드를 직접 이용하여 PCR을 하면 용액상태의 경우와 달리 비드에 붙는 핵산의 량이 거의 일정하므로 핵산 정량없이 실험을 진행할 수 있어 시간 및 노력에 있어서 효율적인 장점이 있으며, 지르코니아는 흡착력이 강하여 물로 세척을 하더라도 증폭이 원할히 이루어지는 장점이 있다.When PCR is performed using zirconia beads directly, unlike the solution, the amount of nucleic acids attached to the beads is almost constant, so the experiment can be conducted without quantifying nucleic acids, which is an efficient advantage in time and effort. Even if it has the advantage of smooth amplification.

지르코니아 비드를 직접 PCR에 이용하는 경우 비드의 크기는 매우 중요하다. 본 발명에 있어서, 상기 지르코니아 비드의 직경 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것이 바람직하고, 정확성 및 재현성을 위해 상기 지르코니아 비드의 직경 크기가 2.0 ~ 3.0 mm인 것이 보다 바람직하다. 지르코니아 비드의 직경 크기가 1.4mm인 경우 결과의 균일성이 낮고, 2.0mm인 경우는 균일성이 높은 결과를 나타내므로, 지르코니아 비드의 직경 크기가 상기 범위의 하한치를 벗어나면 유전물질 추출율이 저하되어 정확성 및 재현성이 떨어진다. 한편, 일반적인 PCR 반응액의 높이가 4mm 정도이고 이 부위의 폭은 3.0mm이므로, 지르코니아 비드의 직경 크기가 3.0mm를 초과하는 경우는 지르코니아 비드가 반응액에 닿지 않거나 일부만 잠기게 되어 실험에 오차를 나타내게 된다.When using zirconia beads for direct PCR, the size of the beads is very important. In the present invention, it is preferable that the diameter size of the zirconia beads is 1.4 to 3.0 mm, and it is more preferable that the diameter size of the zirconia beads is 2.0 to 3.0 mm for accuracy and reproducibility. When the diameter size of the zirconia beads is 1.4 mm, the uniformity of the result is low, and when 2.0 mm, the uniformity of the result is high, and if the diameter size of the zirconia beads is outside the lower limit of the above range, the extraction rate of the dielectric material decreases. Poor accuracy and reproducibility. On the other hand, since the height of a typical PCR reaction solution is about 4 mm and the width of this site is 3.0 mm, when the diameter size of the zirconia beads exceeds 3.0 mm, the zirconia beads do not contact the reaction solution or are only partially immersed in the experiment. Will appear.

이와 같은 본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법에 대해서 도 1 내지 4를 참조하여 설명하면 다음과 같다. A method for rapidly separating the genetic material for nucleic acid amplification reaction from the biological sample according to the present invention will be described with reference to FIGS. 1 to 4 as follows.

본 발명에 따른 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법은 생물시료에 다공성의 지르코니아를 접촉시키는 단계(S10); 및 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20)를 포함한다.A method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample according to the present invention comprises contacting a porous zirconia with the biological sample (S10); And absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous zirconia pore (S20).

여기서, 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20) 이후에, 물로 세척하는 단계(30)를 더 포함할 수 있다.Here, after the step (S20) of absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous pores of zirconia (S20), it may further include a step of washing with water (30).

상기 S10단계는, 상기 생물시료를 다공성의 지르코니아에 접촉시켜 그라인딩(grinding)하는 단계(S12)를 포함할 수 있다.The step S10 may include a step (S12) of grinding the biological sample by contacting the porous zirconia.

또한, 상기 S20단계는, 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질이 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)에 흡착되는 단계(S22)를 포함할 수 있다.In addition, the step S20 may include a step (S22) in which the dielectric material present in the biological sample is adsorbed to the porous pores of zirconia.

상기 다공성의 지르코니아는 다공성 지르코니아 비드인 것이 바람직하고, 이때, 다공성 지르코니아 비드의 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것을 특징으로 한다.The porous zirconia is preferably a porous zirconia bead, wherein the size of the porous zirconia beads is characterized in that 1.4 ~ 3.0 mm.

본 발명의 일 실시예로서, 생물시료에 다공성의 지르코니아를 접촉시키는 단계(S10); 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20); 및 상기 유전물질을 흡수시킨 다공성의 지르코니아를 핵산 증폭 반응을 위한 주형으로 첨가하고, 표적 프라이머 세트를 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계를 포함하는 지르코니아를 이용하여 생물시료로부터 표적서열을 증폭하는 방법을 제공한다.As an embodiment of the present invention, contacting the porous zirconia with the biological sample (S10); Absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous pores of zirconia (S20); And adding a porous zirconia absorbing the genetic material as a template for a nucleic acid amplification reaction, and amplifying the target sequence by performing an amplification reaction using a target primer set to amplify the target sequence from the biological sample using zirconia. It provides a way to amplify.

또한, 본 발명의 일 실시예로서, 생물시료에 다공성의 지르코니아를 접촉시키는 단계(S10); 상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20); 상기 유전물질을 흡수시킨 다공성의 지르코니아를 핵산 증폭 반응을 위한 주형으로 첨가하고, 표적 프라이머 세트를 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계; 및 상기 증폭 산물을 검출하는 단계를 포함하는 지르코니아를 이용하여 생물시료 내에서 표적 서열의 존재 여부를 신속하게 확인하는 방법을 제공한다.In addition, as an embodiment of the present invention, the step of contacting the porous zirconia to the biological sample (S10); Absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous pores of zirconia (S20); Amplifying the target sequence by adding porous zirconia absorbing the genetic material as a template for a nucleic acid amplification reaction and performing an amplification reaction using a target primer set; And it provides a method for quickly confirming the presence of a target sequence in a biological sample using zirconia comprising the step of detecting the amplification product.

한편, 본 발명의 실시예에 따른 키트는 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함할 수 있다.On the other hand, the kit according to an embodiment of the present invention may include a porous zirconia that quickly adsorbs the dielectric material present in the biological sample to pores.

본 발명에 따르면, 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함함으로써 다양한 생물시료에 대하여 유전물질 추출 및 분리가 가능하고, 다양한 생물시료에 대한 유전물질 추출 및 분리를 간단한 공정으로 구현 가능하다는 장점이 있다.According to the present invention, it is possible to extract and separate genetic material for various biological samples by including porous zirconia that quickly adsorbs the genetic material present in the biological sample to pores, and extracts genetic material for various biological samples And separation can be implemented in a simple process.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세하게 설명하고자 하나, 하기의 실시예는 단지 설명의 목적을 위한 것이며, 본 발명의 범위를 한정하고자 하는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples, but the following examples are for illustrative purposes only and are not intended to limit the scope of the present invention.

실시예 1: 지르코니아 비드에 의한 파쇄 후 핵산의 추출 농도Example 1: Extraction concentration of nucleic acids after crushing with zirconia beads

고추 잎 시료를 일반적인 막자사발(pestle)과 지르코니아 비드를 이용하여 각각 파쇄 후 핵산의 추출농도를 비교한 결과(도 5 참조), 막자사발(pestle)이 가장 높은 핵산 추출 농도를 보였고, 지르코니아를 이용한 추출에서는 상당히 낮은 농도를 보이는 것을 확인하였다. 또한 막자사발(pestle)에 의한 추출 후 지르코니아 비드에 핵산의 바인딩을 시험한 결과 용출되는 핵산의 양이 상당히 낮은 것이 확인되었다. 따라서 상당한 량의 핵산이 지르코니아에 바인딩하는 것을 확인할 수 있는 결과이다. As a result of comparing the extraction concentrations of nucleic acids after crushing the pepper leaf samples using common pestle and zirconia beads (see FIG. 5), the pestle showed the highest nucleic acid extraction concentration, and using zirconia. It was confirmed that the extraction showed a fairly low concentration. In addition, as a result of testing the binding of the nucleic acid to the zirconia beads after extraction by pestle, it was confirmed that the amount of the eluted nucleic acid was significantly low. Therefore, it is confirmed that a significant amount of nucleic acid binds to zirconia.

실시예 2: 지르코니아를 이용한 핵산 추출 후 세척(washing) 방법에 따른 증폭 비교Example 2: Comparison of amplification according to washing method after nucleic acid extraction using zirconia

도 5의 시험 결과를 참조하면, 막자사발(pestle)에 의한 추출 후 지르코니아 비드에 핵산의 바인딩을 시험한 결과 용출되는 핵산의 양이 상당히 낮은 것이 확인되어, 핵산이 물 및 1×TE buffer에 완전히 용출되지 않을 것으로 예측되어, 이러한 예측를 입증하기 위한 시험을 실시하였다(도 6 참조). 우선 고추 시료를 지르코니아 비드를 이용하여 핵산을 바인딩하고, 물과 70% 에탄올로 2회 세척한 후 지르코니아 비드를 PCR 튜브에 직접 넣은 다음 증폭을 실시하였다. 그 결과 대조구(C)를 포함한 모든 처리구에서 증폭이 고르게 이루어진 것을 확인할 수 있었다. 증폭량으로 보면 대조구(C)에 비해 상당히 높은 증폭량이 확인되었으며 안정적임을 확인할 수 있다. 따라서 지르코니아는 핵산을 충분히 바인딩하는 물질이며 유전자 증폭에 직접 이용하여 정확성과 재현성을 향상시킬 수 있음을 확인하였다. Referring to the test results of FIG. 5, after the extraction by pestle, it was confirmed that the amount of nucleic acid eluted was significantly low as a result of testing the binding of the nucleic acid to the zirconia beads. It was predicted that it would not elute, and tests were conducted to demonstrate this prediction (see Figure 6). First, the pepper sample was bound to nucleic acids using zirconia beads, washed twice with water and 70% ethanol, and then zirconia beads were directly placed in a PCR tube, followed by amplification. As a result, it was confirmed that amplification was evenly performed in all treatments including the control (C). In terms of the amplification amount, it was confirmed that the amplification amount was considerably higher than that of the control (C) and was stable. Therefore, it was confirmed that zirconia is a substance that sufficiently binds nucleic acids and can be directly used for gene amplification to improve accuracy and reproducibility.

실시예 3: RAPD를 이용한 다양한 시료의 지르코니아를 이용한 핵산 추출 후 PCR 반응 확인 결과Example 3: PCR reaction confirmation result after nucleic acid extraction using zirconia of various samples using RAPD

지르코니아를 이용한 다양한 식물체를 대상으로 핵산 추출에 대한 시험을 수행하였다. 실험에 이용된 시료는 쌀, 녹두, 청경채, 감귤이며, 증폭 프라이머는 다양한 식물체를 이용하는 경우이므로 임의적인(random) 프라이머를 이용하는 RAPD를 이용하여 수행하였다. 추출 방법은 고추와 동일하게 수행하였으며 추출 후 지르코니아를 직접 PCR 튜브에 넣어 증폭하였다.A test for nucleic acid extraction was performed on various plants using zirconia. Samples used in the experiment are rice, mung beans, bok choy, and citrus, and the amplification primers are used when using various plants, so they were performed using RAPD using random primers. The extraction method was performed in the same way as pepper, and after extraction, zirconia was directly put into a PCR tube and amplified.

그 결과 각기 다른 시료에서 모두 증폭이 이루어 지는 것을 확인하였다. 쌀알과 녹두는 탄수화물이 핵산의 추출량을 낮게하는 문제점을 가지며, 청경채와 같은 엽채류의 노엽은 단위 면적당 세포수가 적어 농도가 낮게 추출되며, 감귤과 같은 나무는 2차 대사산물에 의한 증폭에 문제가 있는 것으로 알려지고 있다. 따라서 이러한 시료의 특성에도 불구하고 본 발명에 의하면 원활한 증폭이 이루어졌음을 확인할 수 있고, 지르코나아를 이용한 핵산 추출은 다양한 생물시료에서 적용 가능함을 확인하였다.As a result, it was confirmed that amplification was performed in different samples. Carbohydrates in rice grains and mung beans have the problem of lowering the extraction amount of nucleic acids, and the leafy leaves of leafy vegetables such as bok choy are extracted with a low concentration due to the small number of cells per unit area, and trees such as citrus fruits have problems with amplification by secondary metabolites. It is said to be. Therefore, despite the characteristics of these samples, it was confirmed that smooth amplification was achieved according to the present invention, and it was confirmed that nucleic acid extraction using zirconia was applicable to various biological samples.

실시예 4: 지르코니아 비드의 크기에 따른 PCR 반응 확인 결과Example 4: PCR reaction confirmation results according to the size of the zirconia beads

도 8은 본 발명의 일 실시예에 따른 지르코니아 비드의 크기에 따른 PCR 반응을 확인한 결과이다(M: 100bp ladder, C: 막자사발(pestle) 40ng DNA, A: 1.4mm, B: 2.0mm, 1: 고추, 2: 청경채). 도 8을 참조하면, 지르코니아 비드의 크기에 따른 핵산 추출 정도는 2.0mm가 1.4mm 보다 안정적인 것으로 확인되었다.8 is a result confirming the PCR reaction according to the size of the zirconia beads according to an embodiment of the present invention (M: 100bp ladder, C: pestle 40ng DNA, A: 1.4mm, B: 2.0mm, 1 : Red pepper, 2: Chongkyungchae). Referring to FIG. 8, the degree of nucleic acid extraction according to the size of the zirconia beads was confirmed to be 2.0 mm more stable than 1.4 mm.

한편, 이상의 상세한 설명은 모든 면에서 제한적으로 해석되어서는 아니되고 예시적인 것으로 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 첨부된 청구항의 합리적 해석에 의해 결정되어야 하고, 본 발명의 등가적 범위 내에서의 모든 변경은 본 발명의 범위에 포함된다.Meanwhile, the above detailed description should not be construed as being limited in all respects, but should be considered as illustrative. The scope of the invention should be determined by rational interpretation of the appended claims, and all changes within the equivalent scope of the invention are included in the scope of the invention.

Claims (11)

생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함하는 조성물.
A composition comprising porous zirconia that quickly adsorbs dielectric material present in a biological sample to pores.
제1항에 있어서,
상기 다공성의 지르코니아는 지르코니아 비드인 것을 특징으로 하는 조성물.
According to claim 1,
The porous zirconia composition, characterized in that the zirconia beads.
제2항에 있어서,
상기 지르코니아 비드의 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것을 특징으로 하는 조성물.
According to claim 2,
The size of the zirconia beads is characterized in that the composition is 1.4 ~ 3.0 mm.
제1항에 있어서,
상기 생물시료는 동물, 식물, 세균 또는 곰팡이인 것을 특징으로 하는 조성물.
According to claim 1,
The biological sample is a composition characterized in that the animal, plant, bacteria or fungi.
생물시료에 다공성의 지르코니아를 접촉시키는 단계(S10); 및
상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20);
를 포함하고,
상기 S10단계는,
상기 생물시료를 다공성의 지르코니아에 접촉시켜 그라인딩(grinding)하는 단계(S12);를 포함하는 것을 특징으로 하는 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법.
Contacting the porous zirconia with the biological sample (S10); And
Absorbing the dielectric material present in the biological sample into the porous pores of zirconia (S20);
Including,
In step S10,
A method of rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample, comprising; grinding (S12) by contacting the biological sample with porous zirconia.
삭제delete 제5항에 있어서,
상기 S20단계는,
상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질이 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)에 흡착되는 단계(S22);를 포함하는 것을 특징으로 하는 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법.
The method of claim 5,
In step S20,
A method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample comprising the step (S22) of adsorbing the dielectric material present in the biological sample to the porous pores of the zirconia (S22).
제5항에 있어서,
상기 생물시료 내에 존재하는 유전물질을 상기 다공성의 지르코니아의 포어(pore)로 흡수시키는 단계(S20) 이후에, 물로 세척하는 단계(30);
를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법.
The method of claim 5,
After the step (S20) of absorbing the dielectric material present in the biological sample into the pores of the porous zirconia (S20), washing with water (30);
A method for rapidly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample, further comprising a.
제5항에 있어서,
상기 다공성의 지르코니아는 다공성 지르코니아 비드이고,
상기 다공성 지르코니아 비드의 크기는 1.4 ~ 3.0 mm인 것을 특징으로 하는 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법.
The method of claim 5,
The porous zirconia is a porous zirconia bead,
Method for quickly separating the genetic material for nucleic acid amplification reaction from the biological sample, characterized in that the size of the porous zirconia beads is 1.4 ~ 3.0 mm.
제5항에 있어서,
상기 생물시료는 동물, 식물, 세균 또는 곰팡이인 것을 특징으로 하는 생물시료로부터 핵산 증폭 반응용 유전물질을 신속하게 분리하는 방법.
The method of claim 5,
The biological sample is a method for quickly separating a genetic material for nucleic acid amplification reaction from a biological sample, characterized in that the animal, plant, bacteria or fungi.
생물시료 내에 존재하는 유전물질을 포어(pore)로 신속하게 흡착시키는 다공성의 지르코니아를 포함하는 키트.A kit comprising porous zirconia that quickly adsorbs genetic material present in a biological sample to pores.
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