JPH05509232A - Expression vector containing the HIVnef gene to enhance replication efficiency - Google Patents

Expression vector containing the HIVnef gene to enhance replication efficiency

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JPH05509232A
JPH05509232A JP51423991A JP51423991A JPH05509232A JP H05509232 A JPH05509232 A JP H05509232A JP 51423991 A JP51423991 A JP 51423991A JP 51423991 A JP51423991 A JP 51423991A JP H05509232 A JPH05509232 A JP H05509232A
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ハゼルチン,ウイリアム・エイ
ターウイリガー,アーネスト
ランゴフ,エリク
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デイナ・フアーバー・キヤンサー・インステイテユート
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。 (57) [Summary] This bulletin contains application data before electronic filing, so abstract data is not recorded.

Description

【発明の詳細な説明】 複製効率を増強するためのHr V n e f遺伝子を本発明は、複製コンピ テントHrV−1プロウィルス又はHIV−2プロウイルス、及び上記のプロウ ィルスの複製効率を増強する配列を含有するベクターに関する。 ヒト免疫不全’フィル7、 (HI V −1,HTLV −11r、LAV又 はHTLV−■■■/LAvともいう)は後天性免疫不全症候群(A I D  S)及び関連疾患の病因である[Barre−3inoussi et al、 。 5cience 220:868−871 (1983);Ga1lo et  al、、5cience 224:500−503 (1984);Levy  et al、。 5cience 225+840−842(1984);Popovic et  al、、5cience 224゜497−500 (1984);Sarn gadharanet al、、5cience 224:506−508(1 984);Siegal et al、、N、Engl。 J、Med、305:1439−1444(1981)コ。本疾患は長い無症候 性期間とその後の免疫系及び中枢神経系の進行性変性を特徴とする。ウィルスの 研究は、複製が高度に調節され、Tリンパ球のCD4陽性ヘルパーサブセツトの 潜伏性及び溶解性感染が組織培養中で生じることを示す[Zaguryet a l、、5cience231:850−853(1986)]。感感染者におけ るウィルスの発現も、免疫反応を回避させるように調節されると考えられる。H I V−1の調節及びゲノム構成の分子研究は、それが多数の遺伝子をコードす ることを示す[Ratner et al、。 Nature 313:277−284 (1985);5anchez−Pe scador et al、。 5cience 227:484−492 (1985);Muesjng e t al、、Nature 313:450−457 (1985);Wain −Hobsonet al、、Ce1l 40:9−17 (1985)]。 レトロウィルスは一般に、3つの亜科、即ち腫瘍ウィルス、スプマウイルス及び レンチウィルスに分類される。腫瘍ウィルスによる感染は一般に、悪性疾患を伴 う。これらのウィルスは一般に、gag、pol及びenv遺伝子、並びに長末 端反復(LTR)配列を包含する約8,000〜10,000ヌクレオチドの一 重鎖プラス鎖RNAゲノムを含有する。腫瘍ウィルスは一般に腫瘍遺伝子を含有 する。スプマウイルスは、組織培養の泡沫状細胞変性的変化を誘発するけれども 、1nvivoでは病原性ではないと一般的に考えられる。レンチウィルスによ る感染は一般的に時間がかかり、長い潜伏期間後に慢性衰弱性疾咀を引き起こす 。レンチウィルスは、gag、pol及びenv遺伝子の他に、調節機能を有す る多数の付加的遺伝子を有する。 ヒト免疫不全ウィルス(HTV)は、同じくゆっくりしだ感染を引き起こし、共 通の構造的特性を有するために、レンチウィルスと分類されてきた[Haa e 、A、T、Nature322 :130−136 (1986)参照]。 HTV−1は、他のレトロウィルスとそれぞれgag。 pol及びenv遺伝子を共有する[Hase l t ine、W。 A、Journal of Acquered ImmuneDeficien cy Syndrome、1:217−240 (1988)]。HIV−1は また、ウィルス複製を調節する別の遺伝子を有する。HIV−1ゲノムは、vi f。 vpr、tat、revSvpu及びnefタンパク質をコードする[Hase ltine、W、A、Journal ofAcquered Immune  DeficiencySyndrome、上記]。さらに、HrVの長末端反復 (LTRs)は、組込み、転写及びポリアデニル化に重要なC15−作用配列を 含有する。別のcis作用信号はいくつかの新規HrV遺伝子生成物質によりH IV配列を調節させる[Haseltine、W、A、Journal ofA cquered Immune DeficiencySyndrome、上記 ;5odroski et al、。 Sc i ence 231 :1549−1553 (1986);Arya  et al、、5cience 229:69−73(1985);5odr oski et al、。 5cience 227:171−173 (1985);5odroski  et al、、Nature 321:412−417 (1986);Fei nberg et al。 、Ce1l 46:807−817(1986);Wong−3taal et  al、、AIDS Res、andHuman Retroviruses  3:33−39(1987) 、これらの記載内容は参照により本明細書中に含 めるものとする]。 HIV−2及びサル免疫不全ウィルス(S I V)からのヌクレオチド配列も 、構造遺伝子gag、pol及びenv。 並びにtat、rev及びnef:A節配列を含有する[Guyader、M、 、et al、、Nature。 326:662−669 (1987);Chakrabarti、L、、et  al、、Nature328 : 543−547 (1987)、 これら の記載内容は参照に依り本明細書中に含めるものとする]。 霊長類免疫不全ウィルスHIV−1、HIV−2及びSIVのnef遺伝子は、 これらのウィルスと他のレトロウィルスとを識別する。これらの霊長類免疫不全 ウィルスに最も密接に関連したレトロウィルスであるビスナウィルス、ヤギ関節 炎及び脳炎ウィルス(CAEV)並びにウマ感染性貧血ウィルス(E I AV )のような有蹄類レンチウィルスは、nef、即ちエンベロープ(env)の3 ′付近で開始し、3° LTRに延びる長開放読み取り枠を指定する領域を欠く 。 HIV及びSIVウィルスにより指定されるnefは、脂肪酸であるミリスチン 酸のアミノ末端及び保存アミノ酸配列での付加による翻訳後修飾を含めた共通の 特徴を有する。HIV−1nef遺伝子によりコードされるタンパク質は一般に 、206アミノ酸長であるが、しかし鎖によっていくつかの変動が生じる。さら に、nefタンパク質に対する抗体は、感染個体及び感染サル中で見いだされる 。これは、nefが自然感染において重要な役割を演じることを示唆する。しか しながら、これは他のデータにより否定される。例えば、nefタンパク質は、 多数の複製コンピテントHIV−1単離体中で時期尚早に切頭される。 HIV−1の1118株に由来するプロウィルスを用いた初期の研究は、net タンパク質を発現するウィルスはnefを欠くウィルスよりもわずかに遅<CD 4+T細胞培養中で複製することを明らかにした[Te rwi ] I i  ge r。 E、et al、、J、Virol、60バ54−760(1986)、この記 載内容は参照により本明細書中に含めるものとする]。この所見は、BRU及び NY5株由来の同−遺伝子対を含めたウィルスの他のいくつかの対を用いて確証 された[Luciw、P、、、etal、、PNAS 84:1434−143 8 (1987) ;Niederman、T。 M、、e t a I、、PNAS 86 :1128−1132(1989)  ;Ahmad、N、、et al、。 5cience 241+1481−1485 (1988) ;及びChen g−Myer、C,、et al、、5cience 246:1629−16 32(1989)、これらの記載内容は参照により本明細書中に含めるものとす る]。 nef−ウィルスと比較した場合のnef の複製の5〜10倍の差が、T細胞 中でのこれらのウィルスの増殖に関して報告されている。nefを構造的に発現 するCD4 T細胞系がHIV−1の多数の株の増殖を遅らせることも報告され ている[Cheng、et at、、5cience 246.上記コ。しかし ながら、nef 及びnef−ウィルス間のこの差はいつも認められるわけては ない。いくつかの研究では、nef陽性ウィルスはnef欠損ウィルスと同様に 又はそれよりわずかに良好に複製した。 多くの研究がヒト免疫不全ウィルス(特にHIV−1及びHIV−2)の理解に 費やされてきたけれども、その生活環を十分に理解するには問題があった。これ らのウィルスに感染した個体は一般に長い無症候期間を示し、この間、ウィルス 力価は低く、T4+リンパ球のレベルは正常であって、このような時期は一般に 何年にも及ぶ。本ウィルスはさらに、はとんどの動物において感染を引き起こさ ない。チンパンジーは感染し得るが、しかしチンパンジー中のウィルスは感染の 徴候を容易に示さず、非上記少量のタンパク質又はRNAしか作らないので、そ れらを追跡するのは非常に難しい。 したがって、病気の治療のための動物モデルを開発するために、複製コンピテン トHIVプロウィルス、及びそのプロウィルスを用いて広範囲の細胞及び広範囲 の動物に感染を引き起こすのを容易にする配列に対応するヌクレオチドを含有す るベクターを有するのは非常に有用である。 とくに、感染を阻止する薬剤をスクリーニングし、ある種の細胞における感染を 停止又は最小限にし得る薬剤を開発し得るために、広範囲の細胞でin Vit rO及びin viv。 でウィルスを追跡し得る系においてこのようなベクターの使用は有用である。 HIVの病因の異なる側面を調べるための生育可能な動物モデルを開発するに際 して、ウィルスをil vivoで追跡し得る系におけるこのようなベクターの 使用も有用である。 ワクチン及び/又は抗体を開発するために、より強力且つ有効な免疫反応を誘発 するために動物の免疫系に対してより可視的な標的を提供するより活動的なウィ ルスを有することも有用状々はここに、ウィルス複製及び感染性に必要なI−T  I V遺伝子生成物質(HIVセグメント)を発現するための、ELI株の全 構造遺伝子以外のHIVゲノムに対応する十分なスプマウイルスのヌクレオチド を包含し、さらにH[VのELI株のnef遺伝子に対応するヌクレオチドの一 配列(nef遺伝子セグメント)を含有するベクターを開発した。好ましくは、 このベクターのHI Vセグメントは、機能的vpu遺伝子セグメント又は機能 的vpr遺伝子セグメントをも含有する。さらに好ましくは、このベクターのH IVセグメントは機能的vpu及び機能的vpr遺伝子セグメントの両方を含有 する。 第二の態様において、我々はELI遺伝子セグメントを包含するベクターを記載 する。好ましくは、このベクターも異種遺伝子を含有する。 本ベクターは広範囲の細胞系をトランスフェクトするためにin vivo及び in vitroで用い得る。 図面の簡単な説明 図1は、H[Vゲノム及び調製された一連のベクターの略図である。 図2は、HXB ELI 1−fsベクターの一部の略図である。 図3は、HXB ELI 2及びHXB ELT 2−fsベクターの一部の略 図である。 図4は、HIVセグメント、機能的nef遺伝子、機能的vpu遺伝子及び機能 的vpr遺伝子を含有するベクターの略図である。 図5は、HXB−BH8ベクターの一部の略図である。 図6は、種々のベクターによる経時的末梢血リンパ球(P B L)中のp24 産生のグラフである。 図7は、時間を追った種々のベクターによりトランスフェクトされた単核球/マ クロファージ中のp24産生のグラフである。 図8は、時間を追った種々のベクターによりl・ランスフェクトされたPBL中 のp24産生のグラフである。 本発明の詳細な説明 我々はここに、ウィルス複製及び感染性に必要なHIV遺伝子生成物質(HIV セグメントと呼ぶ)を発現するためのHIVゲノムに対応する十分なスプマウイ ルスのヌクレオチド及びウィルス複製を増強するためのE L 1株のnef遺 伝子に対応するヌクレオチドの一配列(ELI nef遺伝子セグメントと呼ぶ )を含有するベクターを開発した。 好ましくは、I]■VセグメントはHIV−1又ハHI V −2ゲノムのヌク レオチドに対応する。さらに好ましくは、HI VセグメントはHIV−1ゲノ ムのヌクレオチドに対応する。好ましくは、HI Vセグメントは)IIV−1 の全ELI株に対応しない。 対応するという用語は、保存的付加、欠失及び置換が可能であることを意味する 。 ELIのnef遺伝子は、env読み取り枠の末端の直後にあって3° LTR のU3領域の大半を経て延びる、8822位置に位置するその開始フトンを有す る。この遺伝子は、約25〜27Kbの見掛けの分子量を有するタンパク質をコ ードする。 nef機能についてのほとんどの研究が、原型American 1118株[ Gal lo、 R,C,、etal、5cience 224:500 (1 984);Ratner、L、、et al、Nature 313:277  (1985) ) コ 、 French 株 LAV BRU[Barre− 3inoussi、F、、et al。 5cience 220:868(1983);Vain−Hobson、S、 、et al、、Ce1l 40:19(1985)] (これはrllBと約 98%相同な配列を共有する)、又はAmerican 5F−2株[Lavy 、J。 A、、et al、、5cience 229:840(1984);5anc hez−Pescador、R,。 et al、、5ience 227+484 (1985)コ(これはDNA レベルてIIIB及びBRUの両方と90%以上相同である)に由来するクロー ンを用いた。これらはすべて、強力なT細胞刺激株である。これに対比して、L AV ELTは、T I IB、5F−2及びBRU株と対照的により分岐的な りローンの1つである。本クローンは公知の全HT V調節機能に関して無傷で ある[Cohen、E、、et al、。 Nature 334:532 (1988);Cohen、EA、、etal 、、J、AIDS、3+11 (1990)。 Alizon9M、、et al、、Ce11.46:83(1986)、これ らの記載内容はけ参照により本明細書中に含めるものとする]。Zairian 単離物から得られたLAV ELI Frenchクローンは、新鮮なPHA刺 激P BMCを用いて患者の末梢血リンパ球を共培養することにより24歳の女 性AIDS、1!者から、1983年に単離された。 LAV ELIのnef生成物質とnefについての我々の前研究[Terwi  I ] 1ger、E、F、、et al、、JVirol、60ニア54  (1986)]で用いたIIIB由米Hxorfクローンのnef生成物質との 間にはアミノ酸配列(総数207のうち)において47の差異が認められる。 機能的nefセグメントを含有する本発明のベクターの調製に際しては、多数の 技術を用い得る。例えば、機能的nef遺伝子を含有するクローン、例えばLA V ELTを用い得る。 標準的技法により、例えば制限エンドヌクレアーゼの使用により、LAV EL +プロウィルスクローンからこのセグメントを得ることができる。例えば、85 06位置に原BamH[V部位が及び9607位置に5ac1部位がある。この セグメントは全net遺伝子を含有する。標準技法により、ELTnef遺伝子 セグメントにのみ対応し、他のELI遺伝子セグメントのほとんどに対応しない ようこのセグメントを切り取ることができる。例えば、Eco R1を、nef 開始コドンから30塩基対だけ上流にある位1t8792に挿入し得る。 rIIB株よりもELI株とより相同のnef配列を含有する他の)TTVクロ ーンの1つを用いることもできる。本明細書中で用いた場合、IIIB株よりも ELI株とより相同なnef配列を基礎にしたこれらのヌクレオチド配列はウィ ルス複製を増強し、ELI nefと等価であると考えられる。この特性は、本 発明の開示を基礎にして当業者が容易に確定し得る。あるいは、機能的”ELr  nefセグメント”ヌクレオチドセグメントを化学的に合成し得る。本発明の 開示を基礎にした当業者に公知の他の技術を用いてELInefセグメントを調 製してもよい。 本ELF nefセグメントは、好ましくは使用する他のHIV−1又はHIV −2株から得られるnefセグメントカ存在し得る位置におけるHIVセグメン トを含有する本明細書に記載のベクター中に挿入し得る。nef遺伝子を有する H I Vセグメントを用いる場合は、nef遺伝子を切り取り、ELI ne fセグメントを挿入し得る。 HIVセグメントは、複製及び感染に必要な全HTV遺伝子に対応する十分な数 のヌクレオチドを含有する。好ましくは、このセグメントは、機能的vpu遺伝 子又は機能的vpr遺伝子に対応するヌクレオチドをも含有する。さらに好まし くは、それは機能的vpu及びvpr遺伝子の両方に対応するヌクレオチドを含 有する。 例えば、HXB2プロウィルス中のvpu配列はvpuに対する開始コドンを含 有せず、したがって機能的vpu遺伝子を発現しない。HTVセグメントがHX B2株に対応するヌクレオチドを有する場合は、開始コドンをvpu配列を有す る枠のすぐ上流及び枠内に挿入し得る。あるいは、機能的vpu遺伝子を含有す るDNAの配列を機能的vpu遺伝子を含有しない配列に置換し得る。これは、 ヌクレオチド配列中の種々の制限部位を利用して実施し得る。クローンBH8、 B H10、LAVEL■等は、機能的vpu遺伝子を生しるヌクレオチド配列 を含有する。 HXB2株は未熟終止コドンを有し、機能的vprタンパク質を発現しない。機 能的であるとは考えられないこのようなりpr遺伝子に対応するH[Vセグメン トを用いる場合は、LAV BRU、LAV ELT等のような機能的vpr遺 伝子生成物質を発現する株からの機能的vpu遺伝子を挿入し得る。 前記のように、ベクターは、当業者に公知の種々の方法により合成し得る。調製 し得る種々の異なるベクターを図1〜4に示す。 ELT nef配列を含有する配列の異なる組み合わせを構築し、HIV配列の 3′端内に挿入し得るが、このような配列は複製コンピテントHXB2 (HX Bc2とも呼ばれる)プロウィルスに対応するヌクレオチドを有する。適合性制 限部位は、必要な標準技法により、例えば特定オリゴヌクレオチドの突然変異誘 発により生成し得る。例えば、LAV ELI内のB a m H1部位、並び にL A V E T−T及びHX B 2両配列内の新規のEco R1部位 。好ましくは、制限部位を“挿入”するために作られた各ヌクレオチド変化を用 いる場合、変化は任意の遺伝子によりコードされる予定のアミノ酸配列を変えな いか、又は最小度に保存的アミノ酸変化を引き起こす。構築物はシーケンシング により確証し得る。HXB−Ell 1は、位118506の原BamHT部位 と同様3°離れて、env及びrev遺伝子配列内の、nefの上流の全HXB 2配列、並びにその位置と位19607のSac1部位との開のLAVELI配 列から成る。残りの3’ LTR配列は、HXB2に由来する。図1及び2を参 照して頂きたい。HXB−EL r−2においては、HX B 2及びLAVE LI配列間の5゛接合部は、nef開始コドンから30塩基対(b p)だけ上 流の位置8792の新規のEco RT部位に対して下流に移される。 図1及び3参照。HX B −E L r −2は、このEco R1部位と同 じく3′離れたH X B 2配列のみを含有する。LAVELI配列は、I− I X B −E L、 I −2の場合と同様に、この位置3°から9607 のSac ]部位まで延びる。これらのベクターは機能的vpr又はvpu遺伝 子を含有しない。しがしながら、機能的遺伝子は上記のように容易に付加し得る 。例えば、位112008のApa 1部位及び位ffi!5820のSal  1部位間の配列に対応するこれらのベクター中の配列を切り取って、それを機能 的vpr読み取り枠を含有する、クローンLAV BRUからの対応する配列と 置換する。 同様に、位i1582 QのSal 1部位及び位f16382のkpn 1部 位間の配列に対応するベクターからの配列を切り取って、機能的vpu遺伝子を 含有する、BHIOからの対応するセグメントき置換し得る。上記のように、そ の他のストラテジー及びこのストラテジーの変法を、本発明の開示を基礎にして 当業者は用い得る。 ELI nef遺伝子を含有するプロウィルスプラスミド、及び上記のHTVセ グメントベクターは、制限酵素部位の使用によるといった公知の方法によりこの 配列をプラスミド主鎖中に挿入することにより容易に作製し得る。 本明細書中で用いる場合、十分数のヌクレオチドという用語は、特許請求された 機能的能力が失われない限り、付加、欠失及び置換を可能にする。例えば、ウィ ルス複製に換算してnef遺伝子の機能的能力を言及する場合には、その結果束 じるウィルスの複製は同−遺伝子性nefウィルスによるよりも多くなければな らない。 ベクターを用いて、標準的方法により望ましい細胞をトランスフェクトする。例 えば、リン酸カルシウム同時沈殿法又はDEAEデキストラン法を用いて、in  vitroで細胞をトランスフェクトし得る。あるいは、このベクターを用い て、in vivoで生細胞をトランスフェクトし得る。このような方法は、当 業者には公知である。 本発明のnef遺伝子セグメントの使用により、HI V株、例えば末梢血単核 球(PBMC) 、並びに精製−次ヒト単核球又は単核球様細胞系中で十分に複 製しないHXB2株を得ることができるし、このような細胞系における感染性の 増強が得られる。 理論的に結びつけるつもりはないが、HIVゲノムの種々の遺伝子間の複雑な一 連の相互作用が認められ、これらは本ウィルスを用いて観察されるより急性の作 用のいくつかに関与し得ると思われる。例えば、HI Vが感染個体における免 疫反応をかわすことにより提案されたストラテジーのひとつは、大半の感染細胞 内で、ウィルスが休眠状態にあるか又は非常に低レベルで複製する低レベル感染 状態の確立によるものである。したがって、宿主DNA中へのウィルスの取り込 みを経てウィルスは安定感染を確立し得る。このような目的を達成するために、 非常に“攻撃的”であるとは見えないように、原ウィルスを最初に注意深く調節 する。本発明のnef遺伝子セグメントを取り出して、それを他の株又はHIV −2ゲノムとともに挿入することにより、いくつかの相互作用を克服し得ると考 えられる。 したがって、ベクターにより構成されるブaウィルスはより攻前駆体はPBMC 中であまり複製しなかった。代償的突然変異が、HXB2に対する前駆体の3’ env配列中に生じ、PBMC中で十分に複製し得るウィルスを産生した。HX B2ウィルスは、原nef突然変異並びに3’ env配列における代償的突然 変異を含有する。さらに、3’env代償的突然変異は、BI3及びBH10n ef遺伝子のような密接に関連したnet配列の存在下で増殖に陰性の作用を及 ぼす。この陰性相互作用は、ELI nef遺伝子のような分岐的nef配列に は及ばない。 その結果として、nefの外側のHIVの配列はnef機能に影響を及ぼす。遺 伝子性配列との相互作用に関してnef対立遺伝子に差異が認められる。BI3 及びBHIOnefは、HXB2 3° env配列を伴う陰性調節遺伝子であ る。 ELI nefは、HXB2又はELT3’ env配列を伴う陽性調節遺伝子 である。ELI nefは、−次単核球及びマクロファージの増殖のための必須 遺伝子である。したがって、HIV株が示す種々の向性を本発明のベクターは示 さない。したがって、このようなベクターを用いて、本株が一般的になし得るよ り広い範囲の細胞を形質転換し得る。 標準的技法を用いて、本ベクターを用いて動物の抗原反応を生じさせ、次いで生 じた抗体を治療に用い得る。 nefの簡単なフレームシフト突然変異を含有するクローン化81部位ID1e ウイルスはnef読み取り枠の復位に関してin vivoで戻り復帰体に対す る強い傾向を有するということが報告されている。しばしば提案されるように、 単核球がin vivoでのHrV感染の一次初期標的であるか及び/又は感染 マクロファージが系内のウィルスの大型プールを保持するための重要な長期貯蔵 所を構成する場合に、なぜ無傷nef機能に対する強力な選択圧がin viv oに存在し、しかし必然的にin vitroには存在しないかを、即ちELI  nefJl伝子により示される同性を我々の発見は説明する。 理論的に結びつけるつもりはないが、異なる種類のCD4−陽性細胞に対する向 性の大きな変化は事実、明瞭なウィルス調節現象である。 このベクターを用いてin VitrO又はin viv。 で細胞をトランスフェクトすると、薬剤をスクリーニングし、ウィルスの病原性 を理解するための系を改良することができる。 このベクターにより形質転換される細胞の範囲はITIB株のような他の実験呈 味を用いた場合よりも広いため、一般的なものより広い範囲の感染細胞における ウィルスの拡散に及ぼす薬剤の作用を調べることができる。 例えば、それを−次細胞培養における試験に用いて、ELInefが単核球中で の抗レベルの複製を可能にする機序を確定し得る。このような情報は、特にウィ ルスの単核球向性株が、免疫学的損傷が明らかであるか否かとは関係なく、中枢 神経系疾患の発症における重要な役割を演じることを示唆する証拠の点で、AI DSの疾病進行の機序を理解ための極めて重要な関連性の1つである[Koya nagi、Y、、et at、。 5cience 236:819 (1987)]。 ある検定において、予定の化合物を細胞又は体液に添加し、その後それらの細胞 を本発明のベクターでトランスフェクトしようと試み得る。多量のベクターを、 このような細胞を形質転換するのに有効であることが予め確定された細胞に添加 する。 その後、その細胞の感染性のレベルを測定して、ウィルスの拡散を防止するに際 しての化合物の有効性を確定する。あるいは、in vitro又は1nviv oで本発明のベクターを用いて先ず細胞をトランスフェクトし、その後予定の化 合物を細胞に添加し、次いてウィルスの拡散を防止するに際しての化合物の有効 性を確定する。観察したパラメーターとしては、シンシチウム形成、単一細胞殺 害、R■Aにより測定されるようなHIVp24コアタンパク質の上清のレベル 、AIDS患者血清を用いた代謝的標識化ウィルスタンパク質の免疫沈降等が挙 げられる。 ベクターは、好ましくは一次単核球/′マクロファージを用いてin vitr oで使用する。 ベクターは、in vivoで細胞を“感染”するために用いてもよい。概して 、HIVの伝統的実験呈味は、伝統的動物モデル系中では、例えば幾人かの研究 者達がHTV病原性のあ□ C る観点に関して生育可能な動物モデル中で発症させようとしている5CID−H Uマウス系においては、非常に不十分に複製した。前記のように、本発明は典型 的実験呈味よりも積極的に一次リンパ球中で複製し、5CID−HUマウスの場 合よりももっと有効に複製するに違いないプロウィルスクローンを生じる。他の 好ましい動物モデルとしては、ヒト以外の哺乳類が挙げられる。このような哺乳 類の好ましい例としては、ウサギ、マウス、らっと、ネコ及び霊長類が挙げられ る。好ましい霊長類としては、チノパンツー及びサルが挙げられる。 感染を確立するために動物に投与するのに必要な有効量のベクターは容易に確定 し得る。例えば、0.1μg〜約I QmHのベクター/体重1kgである。投 与は、筋肉内、腹腔内、静脈内又は皮下といったような非経口的投与を含めた任 意の種々の経路が可能である。 “感染″(トランスフェクション)を確立するために必要な量及び条件が分かれ ば、予め選択した化合物の1nvivoでの有効性を確立するためのモデル検定 の開発が可能になる。標準的手段により、例えば注射によって動物に化合物を投 与する。 その後、感染を正常に確立し、感染が発症するか否かを、そして発症した場合に は感染の程度を測定するために動物を観察するのに十分な量のベクターを投与す る。あるいは、先ず動物における感染を確立するのに十分な量のベクターを投与 し、次いで予め選択した化合物を投与する。その後、ベクターによる“感染”に 及ぼす予選走化合物の作用を測定するために動物を観察する。 別の態様では、ウィルス複製を増強するためのHIV−1のELI株のnef遺 伝子に対応する十分数のヌクレオチド(ELI nef遺伝子セグメント)、プ ロモーター配列及びポリアデニル化配列は含有するがヌクレオチド配列をコード する全ELIは含有しないベクターを調製する。好ましくは、ベクターは、LT R配列を含有し、さらに好ましくはHIVLTR配列を含有する。プロモーター は、LTRであるか又は別のウィルスプロモーター、例えばSL3プロモーター のような別個のプロモーターであり得る。このベクターは、好ましくは異種遺伝 子を含有する。ある態様においては、異種遺伝子はマーカー遺伝子である。マー カー遺伝子は、当業界で十分公知であって、例えばクロラムフェニコールアセチ ルトランスフェラーゼ(CA T)遺伝子、又はヒト成長ホルモン(hGH)の ような成長ホルモンである。ベクターは、複製コンピテントHIVプロウィルス を含有するベクターを用いて細胞中に、あるいは複製コンピテントHr V、例 えばHXB2又はHXB−BI3によりトランスフェクトされる細胞系中に共ト ランスフェクトされ得る。これにより、ELI nefセグメント及び他のウィ ルス遺伝子間の相互作用の分析がさらに可能になる。 このベクターを用いるれば、このようなウィルスにトランスフェクトされる宿主 の範囲も増大するに違いない。 以下の実施例により本発明をさらに説明する。これらの実施例は本発明を理解す るためのものであって、本発明を限定するものではない。 HX B 2 ハ、)(IV−1117)I I 18株由来の全長感染性プロ ウィルスであって[Fisher、A、G、、et al、。 Nature 316:262−265 (1985)]、各遺伝子における単 一点突然変異の結果としてnef、vpr及びvpu遺伝子を欠く。ヌクレオチ ド8506にBamH1部位が認められ、この位置を種々のプラスミドの調製に 用いた(図1参照)。 適合性制限部位−特にLAV ELI内のB a m Hr部位、並びにLAV  ELI及びI−I X B 2両配列内の新規のEc。 Rr部位を、必要な場合は特定オリゴヌクレオチドの突然変異誘発により生成し た。各々の場合、任意の遺伝子によりコードされる予定のアミノ酸配列を変えな い変化を生じさせた。構築物はシーケンシングにより確証した。 HXB−ELI 1は、位置8506の原B a m HT部位と同様3“離れ て、env及びrev遺伝遺伝列配列内nefの上流の全HXB2配列、並びに その位置と位置9607のSac1部位との間のLAVELI配列から成る(図 1及び2参照)。残りの3“ LTR配列は、HX B 2に由来する。 HXB−ELT−2においては、HXB2及びL A V E T−1配列間の 5″接合部は、nef開始コドンから30塩基対(b p)だけ上流の位ff1 8792の新規のEcoRI部位に対して下流に移される。図1及び3参照。H XB−EL I−2は、このEco R1部位と同しく3′離れたHXB2配列 のみを含有する。LAV ELI配列は、HXB−EL T−2(D場合と同様 に、この位置3゛から9607のSac 1部位まで延びる。 ELF配列による置換も、revの二次コードエクソン内、トランスメンブラン タンパク質のカルボキシ末端をコードするenv遺伝子のその部分、並びにne fと重複する3゜LTRのU3領域内に変化をもたらした[5odroski。 J、G、、et al、、Nature 371:412(1986)]。した がって、フレームシフトを組換え体のnef読み取り枠内に導入して、機能障害 性nef−HXB−ELT 1−nefを含有する二次同一遺伝子クローンを生 成した。4塩基対フレームシフトを、位置8928の原Xho1部位を充填する ことによりHXB−EL r−1及び2のnefコード配列内に導入して、同一 遺伝子nef欠損プロウィルスを生成した。それぞれ図2及び3を参照していた だきたい。 HXB−BI3においては、原Xho1部位の3°末端は、BH8プロウィルス 由来の配列を含有した。この株は、全nef開放読み取り枠を含有する1118 株であって、元は十 季 HXB−orfと呼ばれた(図5参照)o vpr 、vpuHXB−BI3− Rプロウィルスは、vpr−1vpu−HX B −B H81,:由来した。 位置2008のApa 1部位と位置5820のSal 1部位との間のHXB −BH8のプロウィルス配列を、クローンLAV BRUからの対応する配列と 置換した。このセグメントは機能的vpr読み取り枠を含む。 次に、5820及び位置6382のkpn 1部位間のHXB−BH8配列を切 り取って、密接に関連するTIIBクローンであるBHIOからの対応するセグ メントで置換した。このセグメントは機能的vpu遺伝子を含む。HXB−EL I 1において同一の置換を行なって、HXB−ELI 1−Rを生成した(図 4参照)。 HXB−ELT 1−R配列を、EcoR部位及びPvu I T部位間の公知 のプラスミドpBR322中に挿入して、プラスミドDFCI−HTを生成した 。これはpBR322主鎖を伴うHXB−El、、I 1−R配列を含有する。 このプラスミドの標本は、ブダペスト条約下で、寄託番号68343号としてA merican TypeCulture Co11ection (ATCC )に寄託LopataSet at、、Nucl、Ac1dsRes。 12:5707−5717 (1984);Queen andBaltimo re、Ce1l 33ニア4l−748(1983);5odroski、J、 、et at、。 5cience 231:1549−1553(1986)に記載されているよ うに、各プロウィルスプラスミド10mgを用いて0日目にDEAE−デキスト ラン法により107個のJurkat細胞をトランスフェクトした。その後、培 養を12.5mlのRPMI+15%ウシ胎仔血清中ウシ保持し、毎日の全培地 変化を生じさせた。各上清のアリコートを、後の検定のために各給餌時間に取っ ておいた。上清のHIV p24コアタンパク質のレベルの他に、シンシチウム 形成及び総細胞数に関して培養をモニタリングした。 Terwilliger、et al、、J、Viol。 60.754−760 (1986)に記載されて0るようζこ、各トランスフ ェクトJurkat培養のアリコートを代謝的Iこ標識化して、免疫沈降用に採 集した。各試料の半分をAIDS患者の血清を用いて免疫沈降させた。他の半分 +1、nefタンパク質抗血清と反応させた。La emm l i、U、に、 。 Nature 227:680−685 (1970)l:記載されているよう に、免疫沈降及びポリアクリルアミドゲル電気泳動を実施した。 健常血清陰性血液ドナーから得られた淡黄色被膜からのFicol1分離により 、末梢血単核細胞(PBMC)を分離した。PBMC培養を、10%ウシウシ血 清及び抗体並びに20%P HA状態調節培地を含有するRPMI−1640中 の24mm組織培養ウェル(Co s t a r、 MA)に4×106の密 度で植付けた。48時間培養後、ウィルスを各ウェルに添加した。J IJ r  k a を細胞培養のトランスフェクションから滴定ウィルスストックを得た 。p24 20ngと等価の感染上清を一次細胞の各ウェルに添加した。感染細 胞培養を一夜インキユベートし、次いて成長培地を注意して各ウェルからデカン トし、新鮮な培地に交換した。最終培地交換後、培養に給餌する前に3日毎にp 24検定用の試料を採集した。市販のR1Δキット(Dupont、NEN)を 用いて、p24を測定した。 次に、等量の細胞無含有ウィルスを用いて新鮮な活性化末梢血単核細胞(PBM C)なら精製−次ヒト単核球を上記と同一手段によって感染させた。上清中のp 24コア抗原を測定することにより、各ウィルスの複製を時間を追って検定した 。 単核球は、Percoll勾配上での分別により、PBMCから得た。汚染T細 胞は、ノイラミニダーゼ処理ヒツジ赤血球を用いてロゼツト化することにより除 去した低密度細胞からのものであった。 単核球集団の純度は、単離単核球のサイドピンスピン細胞標本のイムノペルオキ シダーゼ染色により立証した。L e u 3−Mで染色した細胞の95%以上 、及び〈5%がLeu 18(CD20) 、Leu 3 (CD4)又はLe u(CD8)l:対して陽性であった。4×106個の単核球をP 8MC培養 用に上記のように培養し、比較可能な増殖環境を保持した。ウィルスストックを PBMCに関して記載されているのと同様に用い、p24検定用試料を同時に収 穫した。 前記のように、HXB−ELI 1を生成するに際して3′LAV ELI配列 のl、lKbセグメントを挿入すると、revの二次コードエクソン内、トラン スメンブランタンパク質のカルボキシ末端をコードするenv遺伝子のその部分 、並びにnefと重複する3’ LTRのU3領域内に変化が生じた。 フレームシフトベクターHXB−ELF 1−fsを生成して、機能障害性ne fを含有する二次同一遺伝子クローンを生じた。次に、プロウィルス構築物のこ の対を上記のようにJurkat細胞中にトランスフェクトし、ウィルス複製の 動力学的所見を比較した。 TTTB由来nef陽性(HX B −B H8)及び陰性(HXB2)ウィル スの対も、対照としてトランスフェクトした。上記のように、HXB2はnef 内に点突然変異を含有し、その結果アミノ酸123の後の読み取り枠中に挿入さ れている未熟停止コドンを生しる。この切頭化nefタンパク質は機能性でない 。HXB−B)T8(以前はHx−orfと呼ばれた)はこの突然変異を含有せ ず、全長nef生成物質を産生するETerwilliger、E、F、、et  al、、J。 Vi ro 1.60 : 754 (1986)]。 上清p24のレベルの遅延は、初期トランスフェクト後にHXB 2を含有する ものと比較した場合、HX B −B T−T 8でトランスフェクトした培養 に検出された。シンシチウム形成のパターンの顕著な差異も、明らかであった。 トランスフェクト後のHXB−ELI 1由来のウィルスの複製は、事実上HX  B2とは異ならなかった。別の実験ては、T−T X B −E L T 1 によってしめされるウィルス感染の動力学的所見は、IT X B 2の場合と 同等であるか又はわずかに増強された。 しかしながら、測定されたすべてのパラメーターにより、同−遺伝子性nef欠 損組換え体プロウィルス(HXB−ELTl−fs)由来のウィルスの複製は顕 著に減衰した。nef陰性ウィルス培養中の上清p24レベルは、同−遺伝子性 nef!It性ウィルス培養と比較して、この実験において100分の1に減少 した。ピーク細胞関連ウィルスタンパク質産生もこのウィルス培養中で劇的に減 少したが、これは免疫沈降処理におけるかすかなウィルスバンドで示された。こ れらの測定値は、シンシチウム形成により評価したかあるいは経時的総細胞数の 現象により評価したかに関係なく、感染細胞に及ぼすHXB−EL I−nef ウィルスの細胞変性作用の劇的な減衰と平行した。同様の結果が反復実験から得 られ、時折nef陽性及びnef陰性HXB−EL I−1クロ一ン間の動力学 の大きな差異さえ認められた。nef特異性ボリクa−ナルウサギ血清を用いた 代謝的標識化感染細胞溶解物は、HX B −B H8又はHXB−Ell 1 ウイルスに感染した細胞からの溶解物中の27Kb nefタンパク質の存在を 明示した。このバンドはHXB2又はHXB−ELI 1−fsでトランスフェ クトされた細胞からの溶解物中には認められなかった。 HX B −B H8によるトランスフェクトは、機能的nef遺伝子のHX  B 2プロウイルスへの導入によりnef一対部分よりもCD4 Tmm上上ゆ っくりと複製するウィルスが生したという初期の報告を確証した。 LAV ELT nef遺伝子は、Jurkat細胞中のウィルスの複製に及ぼ す顕著な増強作用を示すと考えられた。この陽性作用は大きく、それとは逆に、 ウィルスのHXB−BH8/HXB2対に関連して観察されたrrrB nef の陰性作用は小さかった。プロウィルスのHXB−ELF 1対の別々に得られ たクローンを用いた反復実験は、比較可能な結果を生し、ある構築物内の多少能 れた部位での無作為二次変化が結果に関与するという可能性を排除した。 われわれの実験計画における人工生成物質の生成野可能性を最小限にするために 、別のプロウィルス構築物を上記と同様に調製した。動力学的試験も、トランス フェクト化安定T細胞系に対するものとして、細胞無含有ウィルスで試験した新 たに培養した一次細胞にも及んた。HXB−ELI 2は、HXB−ELr L より小さなLAV ELI配列挿入を含有した(図1及び3参照)。800塩基 対挿入物の3゛末端は同しままであるが、しかし5°末端はnef開始コドンに 対する5°をちょうど30塩基対だけ下流に移動する。HXB−Ell 2及び HXB2間のnefタンパク質の予定アミノ酸配列中の47の差異の他には、H XB−ELI 2の予定env生成物質中の単一アミノ酸変化のみが認められる 。位置854でのHXB2env生成物質中のイソロイシン、即ちgp41のカ ルボキシ末端前の2残基たけがHXB−ELI 2中のセリンに変換された。そ の他のいかなるコード枠にも変化は認められない。 HXB−EL[2プロウイルスの同一遺伝子nef欠損形態も、上記のようにn ef、HXB−ELT 2−fsへのフレームンフトの挿入により生成した。  前記のように、HXB2はnef、vpu [Cohen、E、A、、et a l、、J。 Aros 3:11 (1990)]及びvpr [AI 1zon。 M、 、 et al、 、 Ce1l 46:83 (1986)]遺伝子の 他に、他の2つの調節遺伝子を欠いている。HXB−BI3に由来するHXB− BI3−R(修復用)プロウィルスでは、無傷vpr及びvpu枠は、他のTT IBクローン及び前記のLAV ELIからの配列を用いた組換えにより修復し た(図1参照)。したがって、HXB−BI3−Rは)TIV遺伝子のすべてに 対して十分に機能的であると予測されるプロウィルスを表わす。HXB−ELT  1において同一の組換えを行なって、HXB−ELI 1−Rを生成した(図 4参照)。 したがって、HXB−BI3−R及びHXB−ELT 1−Rは同−遺伝子性で あるが、但し、HXB−ELI 1−R中の1、IKbのLA、V ELI配列 +!HXB−BHI C1−R中の対応するITIB配列に取って代わる。 TIIBはT細胞系中では非常によく複製するが、しかしPBMC中ではあまり 複製せず、特に−次単核球又は単核球用細胞系中では弱い[Koyanagi、 Y、etal、。 5cience、236:819 (1987)]。かろうじて検出可能なレベ ルのp24抗原産生が、HXB2ウィルスに感染したPBMCの上清内に観察さ れた(図6参照)。同様に、HXB−BI3及びHX B −B H8−Rウィ ルスも、HX B 2上のPBMC中で有意の活性増大を示さなかった(図6) 。これら3つのいかなるウィルスによる検出可能な複製も、単核球マクロファー ジ培養中には観察されなかった(図7)。 図6及び7はともに、HXB−ELI 1(ELT−1nef 、中空丸) 、 HXB−EL I 2 (EL T−2nef H中実矩形)、HXB−BI3  (BI3 nef 。 中空矩形);HXB−ELI 1−fs(ELI−1fsnef+、中実丸); HXB−ELI 2−fs (ELI −2fs nef−、中実三角)及びH XB2(HXBc2nef−、中空三角)でトランスフェクトされた細胞に関す る時間を追ったp24産生を示す。 これに対比して、HXB−ELI 1及びHXB−EL 12ウイルスはPBM C内で強力な複製を示し、p24抗原産生の最大レベルは感染後17及び20日 回心それぞれ約26ng/ml及び約33ng/mlに達した。反復実験では、 2つのウィルスの活性レベルの一貫した差異は認められなかった。 HXB−ELI 1−Rウィルスは攻撃的でさえあって、ピークウィルス産生レ ベルはHXB−ELI 1又はELI 2より3〜5倍高くなった。これは、T TTB nef配列を含有する任意のウィルスによって得られた最大ウィルス力 価の50倍以上であった。これに対比して、同一遺伝子nefフレーシーフトH XB−ELI 1−fs及びHXB−ELI 2−fsウィルスのいずれかに感 染させた培養中では、上清p24レベルはわずかに検出限界内又はそれ以下であ った。 3つのnef陽性HX B −E L 1組換え体ウィルスはすべて、−次単核 球培養内で非常に元気に複製した。例えば、典型的実験におけるHXB−ELI  1は、感染後20日回心単核球中で約35 n g/m lのピーク産生レベ ルに達した。HXB−ELI 1−Rはまた、他の2つのウィルスより数倍高い 最大力価に達した。p24は、HXB−EL I−n e f−欠損同一遺伝子 ウィルスのいずれかで感染させた単核球の上清中には検出されなかった。例えば 図8を参照すると、HXB−EL 11−Rは中空矩形て、HXB−EL Iは 中空三角で、HX B 2は中空丸で表されて、別の典型的実験の結果を示す。 Jurkat、PBMC及び単核球感染から得られた結果はすべて、LAVEL I配列を含有しないウィルスと比較して、LAV ELI組換え体ウィルスの行 動の劇的な変化を際立たせ、特にこの変化が無傷LAVEL+遺伝子の存在を要 することを示す。netコード配列は無傷であったがITIBが関与しなかった HXI3−BI3のようなウィルスは、この新規の表現型を示さなかった。 この差異は、Jurkat細胞中の同一遺伝子nef陽性及びnef陰性ウィル スを比較した場合でさえ明白であって、この場合、IIIB nefはウィルス 複製に小陰性作用を発揮し、一方LAV ELI nefは大きな陽性作用を生 じるのが認められる。しかしながら、最も驚くべきは、無傷LAVELI ne f遺伝子の存在が組換え体ウィルスに単核球細胞に対する新規の向性を付与する ことであって、これもP BMCにおける活発な複製のためのその能力に反映さ れる。HXB−ELI 1−Rウィルスによる感染単核球中でのウィルス産生の レベルは、おそらく単核球向性のHTV株に関して報告されたものと同じ高さで ある[Koyanagi、Y、、etal、、5cience、236:819  (1987)。 Shwartz、S、、et al、、PNAS、86:7200(1989) 、Collman、R,、et al、。 J、Exp、Med、170 : 571 (1989)]。 おそらく、例えば、3’ LTRのU3領域内の付加的重複要素は、LAV E LI組換え体の表現型変化に関与し得るがしかし、HXB−ELT 2はHXB −ELI 1と同様に単核球中で複製すると考えられるため、env及びrev 遺伝子中に存在するHXB2及びHXB−ELI 1間の付加的配列差は表現型 に関与するとは思えない。しかしながら、nef欠損LAV ELIウィルスの 両方を用いて得られた陰性結果から、無傷LAV ELF nefが表現型に不 可欠であることは明瞭である。これに対比して、vpu陽性、vpr陽性HXB −ELI 1−Rウィルスによる一次細胞中のウィルス産生のレベルの約5倍の 増強が、これらの機能を欠く親HXB−EL 11と比較した場合に認められる 一方、HXB−BH8におけるvpu及びvprの復帰は単核球中のこのウィル スによる複製に対する遮断を軽減するためにもPBMC中での低レベルの感染を 増強するためにも何もしなかった。以前に報告されているように、これらの因子 の各々は、ウィルス複製を増強するために機能する[Cohen、E、A、、e t al、、J。 AIDS、3 : 11 (1990)、Al 1zon、M、、etal、、 Ce1l、46:83 (1986)]。その他の読み取り枠中のコード化変化 を、原HXB−ELT 1と比較してHXB−ELI 1−Rに導入した一方で 、Jurkat細胞のウィルス感染中のvpu及びvprに関して我々が特性化 した作用の大きさは、HXB−ELT 1−Rで感染させたPBMC及び単核球 培養の両方で観察されたウィルス力価の増強を説明するのに全く十分である。 異なる型のCD4陽性細胞に対する向性の大きな変動は、事実上明瞭な天然のウ ィルス調節現象であると考えられる。 nefがトランスのHIV LTRからの発現を適度に下げ調節し得るという他 の研究者の観察を、我々は首尾よく繰り返した。これは、nef発現ベクター又 はnef配列抽出物にフレームシフトを含有する同一遺伝子ベクターと一緒にH IVLTR−CAT構築物をCO3−7細胞中に共トランスフェクションするこ とにより達成した。各プラスミドは、複製の5v40原を包含した。しかしなが ら、同様の結果は、HXB2又はLAV ELIからクローン化されたHTV  LTR要素を用いて、nefのどの株が発現中であるかには無関係に得られた。 複製試験とともに、これは下げ調節作用が二次的現象であることを示唆する。 前記の開示の利点により、本発明の概念から逸脱しない限り、本明細書に記載の 実施例の多数の修正及び変更が可能であり、本発明は添付の請求の範囲の範囲及 び精神によってのみ限定されるものであることは、当業者には明らかである。 l\ /′\ム FIG + 特表千5−509232 (14) F I G、6 要 約 複製コンピテントであるために必要なHTV遺伝子生成物質を発現するための十 分数のヌクレオチドを含有し、さら:こELI nef遺伝子セグメントを含有 するベクターを開示する。これらのベクターを用いて、検定系で使用するための 広範囲の細胞及び宿主をトランスフェクトし得る。 国際調査報告 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention provides an HrV nef gene for enhancing replication efficiency, which can be used in replication competent HrV-1 provirus or HIV-2 provirus, as well as in the above-mentioned proviruses. The present invention relates to a vector containing a sequence that enhances the replication efficiency of a virus. Human immunodeficiency’fil7, (HIV-1, HTLV-11r, LAV or HTLV-■■■/LAv) is the etiological agent of acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) and related diseases [Barre-3inoussi et al. 5science 220:868-871 (1983); Gallo et al., 5science 224:500-503 (1984); Levy et al. 5science 225+840-842 (1984); Popovic et al, 5science 224°497-500 (1984); Sarn gadharanet al, 5science 224:506-508 (1 984); Siegal et al., N. Engl. J, Med, 305:1439-1444 (1981). The disease is characterized by a long asymptomatic period followed by progressive degeneration of the immune system and central nervous system. Viral studies show that replication is highly regulated and that latent and lytic infection of the CD4-positive helper subset of T lymphocytes occurs in tissue culture [Zaguryet al., 5science 231:850-853 (1986 )]. In infected people It is also believed that the expression of these viruses is regulated to evade immune responses. Molecular studies of the regulation and genome organization of HIV-1 have shown that it encodes a large number of genes. [Ratner et al. Nature 313:277-284 (1985); 5anchez-Pescador et al. 5science 227:484-492 (1985); Muesjng et al., Nature 313:450-457 (1985); Wain-Hobsonet al., Ce11 40:9-17 (1985)]. Retroviruses are generally classified into three subfamilies: oncoviruses, spumaviruses, and lentiviruses. Infections with tumor viruses are generally associated with malignant disease. cormorant. These viruses generally contain gag, pol and env genes, as well as long tails. One of approximately 8,000 to 10,000 nucleotides, including long terminal repeat (LTR) sequences. Contains the heavy positive strand RNA genome. Tumor viruses generally contain oncogenes. Although spumavirus induces foamy cytopathic changes in tissue culture, it is generally considered not to be pathogenic in vivo. Due to lentivirus Infection is generally slow and causes chronic debilitating disease after a long incubation period. Lentiviruses have regulatory functions in addition to gag, pol and env genes. It has a large number of additional genes. Human immunodeficiency virus (HTV) also causes a slow-growing infection and is common. They have been classified as lentiviruses because of their common structural properties [see Haae, A. T., Nature 322:130-136 (1986)]. HTV-1 and other retroviruses each have gag. They share the pol and env genes [Haseltine, W. A, Journal of Acquered Immune Deficiency Syndrome, 1:217-240 (1988)]. HIV-1 also has other genes that regulate viral replication. The HIV-1 genome is vi f. It encodes the vpr, tat, revSvpu and nef proteins [Hase ltine, W.A., Journal of Acquered Immune Deficiency Syndrome, supra]. Additionally, the long terminal repeats (LTRs) of HrV contain C15-acting sequences important for integration, transcription and polyadenylation. Another cis-acting signal regulates HIV sequences by several novel HrV gene products [Haseltine, W.A., Journal of Aqueried Immune Deficiency Syndrome, supra; 5 Odroski et al. Sci ence 231:1549-1553 (1986); Arya et al., 5science 229:69-73 (1985); 5odr oski et al. 5science 227:171-173 (1985); 5odroski et al., Nature 321:412-417 (1986); Feinberg et al. , Ce1l 46:807-817 (1986); Wong-3taal et al., AIDS Res, and Human Retroviruses 3:33-39 (1987), the contents of which are incorporated herein by reference. ] Nucleotide sequences from HIV-2 and simian immunodeficiency virus (SIV) also contain the structural genes gag, pol and env. and tat, rev and nef:A node sequences [Guyader, M., et al., Nature. 326:662-669 (1987); Chakrabarti, L., et al., Nature 328: 543-547 (1987), the contents of which are incorporated herein by reference]. The nef genes of the primate immunodeficiency viruses HIV-1, HIV-2, and SIV distinguish these viruses from other retroviruses. These primate immunodeficiency viruses are the most closely related retroviruses, visnaviruses, Ungulate lentiviruses, such as inflammatory and encephalitis virus (CAEV) and equine infectious anemia virus (EIAV), have a long opening that begins near the nef, 3′ of the envelope (env) and extends into the 3° LTR. Lacking an area to specify a reading frame. The nef specified by the HIV and SIV viruses have common features including post-translational modification by addition of the fatty acid myristic acid at the amino terminus and a conserved amino acid sequence. The protein encoded by the HIV-1nef gene is generally 206 amino acids long, but some variation occurs from chain to chain. Sara Additionally, antibodies against the nef protein are found in infected individuals and infected monkeys. This suggests that nef plays an important role in natural infection. deer However, this is contradicted by other data. For example, the nef protein is prematurely truncated in many replication-competent HIV-1 isolates. Early studies using proviruses derived from the 1118 strain of HIV-1 revealed that viruses expressing the net protein replicated in CD4+ T cell cultures slightly slower than viruses lacking nef [ T erwi ] I i ge r. E. et al., J. Virol, 60 bar 54-760 (1986), this article. The contents herein are incorporated by reference]. This finding was corroborated using several other pairs of viruses, including the isogene pair from strains BRU and NY5 [Luciw, P., et al., PNAS 84:1434-1438 (1987 ); Niederman, T. M., et al., PNAS 86:1128-1132 (1989); Ahmad, N., et al. 5science 241+1481-1485 (1988); and Cheng-Myer, C., et al., 5science 246:1629-1632 (1989), the contents of which are incorporated herein by reference. ]. A 5-10 fold difference in replication of nef compared to nef-viruses has been reported for the proliferation of these viruses in T cells. It has also been reported that a CD4 T cell line constitutively expressing nef slows the growth of many strains of HIV-1 [Cheng, et at, 5science 246. The above. but However, this difference between nef and nef-viruses is not always observed. In some studies, nef-positive viruses replicated as well or slightly better than nef-deficient viruses. Although much research has been devoted to understanding human immunodeficiency viruses (particularly HIV-1 and HIV-2), there have been problems in fully understanding their life cycles. this Individuals infected with these viruses generally exhibit long asymptomatic periods during which viral titers are low and T4+ lymphocyte levels are normal, and these periods generally extend over many years. Furthermore, the virus does not cause infection in most animals. Chimpanzees can be infected, but the virus in chimpanzees does not easily show signs of infection and only produces small amounts of non-infectious proteins or RNA, so They are very difficult to track down. Therefore, in order to develop animal models for the treatment of diseases, replication-competent HIV proviruses containing nucleotides corresponding to sequences that facilitate the use of the provirus to cause infection in a wide range of cells and animals. It is very useful to have a vector that does this. In particular, in vitro and in viv in a wide range of cells in order to be able to screen for agents that block infection and develop agents that can stop or minimize infection in certain types of cells. The use of such vectors is useful in systems where viruses can be tracked. In developing viable animal models to investigate different aspects of HIV pathogenesis. Also useful is the use of such vectors in systems where viruses can be tracked il vivo. To develop vaccines and/or antibodies, more active vaccines provide a more visible target to the animal's immune system to elicit a stronger and more effective immune response. It is also useful here to have a virus that corresponds to the entire HIV genome other than the structural genes of the ELI strain, in order to express the I-T IV gene products (HIV segments) required for viral replication and infectivity. A vector was developed that contains sufficient spumavirus nucleotides to carry out the virus and also contains a sequence of nucleotides (nef gene segment) corresponding to the nef gene of the ELI strain of H[V. Preferably, the HIV segment of the vector also contains a functional vpu or vpr gene segment. More preferably, the HIV segment of the vector contains both a functional vpu and a functional vpr gene segment. In a second embodiment, we describe vectors containing ELI gene segments. Preferably, this vector also contains a heterologous gene. This vector can be used in vivo and in vitro to transfect a wide variety of cell lines. BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS Figure 1 is a schematic representation of the H[V genome and the series of vectors prepared. FIG. 2 is a schematic diagram of a portion of the HXB ELI 1-fs vector. Figure 3 shows a schematic diagram of a portion of the HXB ELI 2 and HXB ELT 2-fs vectors. It is a diagram. FIG. 4 is a schematic diagram of a vector containing an HIV segment, a functional nef gene, a functional vpu gene, and a functional vpr gene. Figure 5 is a schematic diagram of a portion of the HXB-BH8 vector. FIG. 6 is a graph of p24 production in peripheral blood lymphocytes (PBL) over time by various vectors. Figure 7 shows mononuclear cells/macrocells transfected with various vectors over time. Figure 2 is a graph of p24 production in clophages. Figure 8 is a graph of p24 production in PBL transfected with various vectors over time. DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION We have hereby provided that sufficient spomaviruses corresponding to the HIV genome to express the HIV gene products (referred to as HIV segments) required for viral replication and infectivity are provided. virus nucleotides and the nef residue of the E L 1 strain to enhance virus replication. A vector was developed containing a sequence of nucleotides corresponding to the gene (referred to as the ELI nef gene segment). Preferably, the I]V segment is a nucleus of the HIV-1 or HIV-2 genome. Corresponds to leotide. More preferably, the HIV segment is derived from the HIV-1 genome. corresponds to the nucleotide of the system. Preferably, the HIV segment does not correspond to all ELI strains of IIV-1. The term corresponding means that conservative additions, deletions and substitutions are possible. The ELI nef gene has its start futon located at position 8822, immediately following the end of the env open reading frame and extending through most of the U3 region of the 3° LTR. Ru. This gene encodes a protein with an apparent molecular weight of approximately 25-27 Kb. code. Most studies on nef function have been conducted on the prototypical American 1118 strain [Gallo, R.C., et al., 5science 224:500 (1 984); Ratner, L., et al., Nature 313:277 (1985)); French strain LAV BRU [Barre-3inoussi, F., et al. 5science 220:868 (1983); Vain-Hobson, S., et al., Ce1l 40:19 (1985)] (which shares approximately 98% sequence homology with rllB), or the American 5F-2 strain [ Lavy, J. A., et al., 5science 229:840 (1984); et al., 5ience 227+484 (1985) (which is more than 90% homologous at the DNA level to both IIIB and BRU). I used a button. All of these are potent T cell stimulators. In contrast, LAVELT is a more divergent strain in contrast to TIIIB, 5F-2 and BRU strains. This is one type of loan. This clone is intact with respect to all known HTV regulatory functions [Cohen, E., et al. Nature 334:532 (1988); Cohen, EA, et al., J. AIDS, 3+11 (1990). Alizon9M, et al, Ce11.46:83 (1986), this The contents of these publications are hereby incorporated by reference]. LAV ELI French clones obtained from Zairian isolates were A 24-year-old woman was diagnosed by co-culturing the patient's peripheral blood lymphocytes with GekiP BMC. Sexual AIDS, 1! It was isolated from a person in 1983. The nef producers of LAV ELI and the nef producers of the IIIB Yume Hxorf clone used in our previous study [Terwi Iger, E, F, et al., J Virol, 60 Near 54 (1986)] There are 47 differences in the amino acid sequence (out of a total of 207) between the two. A number of techniques can be used in preparing vectors of the invention containing a functional nef segment. For example, a clone containing a functional nef gene, such as LAV ELT, can be used. This segment can be obtained from the LAV EL + proviral clone by standard techniques, eg, by the use of restriction endonucleases. For example, there is an original BamH[V site at position 8506 and a 5ac1 site at position 9607. This segment contains the entire net gene. Using standard techniques, this segment can be excised to correspond only to the ELTnef gene segment and not to most other ELI gene segments. For example, Eco R1 can be inserted at position 1t8792, 30 base pairs upstream from the nef start codon. Other) TTV clones containing nef sequences that are more homologous to the ELI strain than to the rIIB strain. One of the steps can also be used. As used herein, these nucleotide sequences are based on the nef sequence, which is more homologous to strain ELI than strain IIIB. ELI nef enhances virus replication and is considered equivalent to ELI nef. This characteristic can be easily determined by a person skilled in the art based on the disclosure of the present invention. Alternatively, functional "ELr nef segment" nucleotide segments can be chemically synthesized. ELInef segments can be prepared using other techniques known to those skilled in the art based on the present disclosure. It may be manufactured. The ELF nef segment preferably comprises an HIV segment in a position where nef segments obtained from other HIV-1 or HIV-2 strains used may be present. can be inserted into the vectors described herein containing the vectors. If an HIV segment with the nef gene is used, the nef gene can be cut out and the ELI ne f segment inserted. The HIV segment contains a sufficient number of nucleotides to accommodate all HTV genes necessary for replication and infection. Preferably, this segment contains a functional vpu gene. It also contains nucleotides corresponding to a child or functional vpr gene. even more preferable In particular, it contains nucleotides corresponding to both functional vpu and vpr genes. have For example, the vpu sequence in the HXB2 provirus contains the start codon for vpu. and therefore do not express a functional vpu gene. If the HTV segment has nucleotides corresponding to the HX B2 strain, change the start codon to the vpu sequence. It can be inserted immediately upstream of and within the frame. Alternatively, containing a functional vpu gene The sequence of the DNA containing the vpu gene can be replaced with a sequence that does not contain a functional vpu gene. This can be accomplished by utilizing various restriction sites in the nucleotide sequence. Clones BH8, BH10, LAVEL, etc. contain nucleotide sequences that yield functional vpu genes. Strain HXB2 has a premature stop codon and does not express a functional vpr protein. machine The H[V segment corresponding to this pr gene is unlikely to be functional. If using a functional vpr legacy such as LAV BRU, LAV ELT, etc. A functional vpu gene from a strain expressing the gene product can be inserted. As mentioned above, vectors may be synthesized by a variety of methods known to those skilled in the art. A variety of different vectors that can be prepared are shown in Figures 1-4. Different combinations of sequences containing the ELT nef sequence can be constructed and inserted within the 3' end of the HIV sequence, such sequences having nucleotides corresponding to replication competent HXB2 (also called HX Bc2) proviruses. . Conformity system Restriction sites can be determined by any necessary standard techniques, e.g. mutagenesis of a particular oligonucleotide. It can be produced by For example, the B a m H1 site within LAV ELI, the alignment A novel Eco R1 site within both the LAVET-T and HXB2 sequences. Preferably, each nucleotide change made to "insert" a restriction site is used to If the change does not change the amino acid sequence intended to be encoded by any gene. or minimally conservative amino acid changes. Constructs can be verified by sequencing. HXB-Ell 1 contains the entire HXB 2 sequence upstream of nef within the env and rev gene sequences, as well as the original BamHT site at position 118506, 3° apart, and the open LAVELI between that position and the Sac1 site at position 19607. Distribution Consists of columns. The remaining 3' LTR sequences are derived from HXB2. See Figures 1 and 2. I would like you to look at it. In HXB-EL r-2, the 5' junction between the HX B 2 and LAVE LI sequences is 30 base pairs (bp) up from the nef start codon. The flow is moved downstream to a new Eco RT site at position 8792. See Figures 1 and 3. HX B -E L r -2 is the same as this Eco R1 site. It contains only two H X B sequences separated by 3'. The LAVELI sequence extends from this position 3° to the Sac] site at 9607, as in I-IXB-EL, I-2. These vectors contain functional vpr or vpu genes. Contains no children. However, functional genes can be easily added as described above. For example, Apa 1 site of position 112008 and position ffi! The sequences in these vectors corresponding to the sequences between the Sal 1 sites of 5820 are excised and replaced with the corresponding sequences from clone LAV BRU, which contains a functional vpr open reading frame. Similarly, 1 part of Sal at position i1582 Q and 1 part of kpn at position f16382 The sequence from the vector corresponding to the interposition sequence can be excised and replaced with the corresponding segment from BHIO containing a functional vpu gene. As mentioned above, Other strategies and variations of this strategy may be used by those skilled in the art based on the present disclosure. A proviral plasmid containing the ELI nef gene and the HTV cell described above. A vector can be easily constructed by inserting this sequence into the plasmid backbone by known methods, such as through the use of restriction enzyme sites. As used herein, the term sufficient number of nucleotides allows additions, deletions, and substitutions without loss of claimed functional ability. For example, When referring to the functional capacity of the nef gene in terms of viral replication, the resulting bundle of virus replication must be greater than that produced by the isogenic nef virus. No. The vector is used to transfect desired cells by standard methods. example For example, cells can be transfected in vitro using the calcium phosphate co-precipitation method or the DEAE-dextran method. Alternatively, this vector can be used to transfect living cells in vivo. Such methods are known to those skilled in the art. The use of the nef gene segments of the invention allows for fully replicating HIV strains, such as peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), as well as purified human mononuclear cells or mononuclear cell lines. It is possible to obtain HXB2 strains without production, and enhanced infectivity in such cell lines can be obtained. Although we do not intend to link them theoretically, we understand the complex interactions between various genes in the HIV genome. A series of interactions were observed, and these may be related to the more acute effects observed with this virus. It seems likely that some of these may be involved. For example, if HIV causes immunity in infected individuals, One of the strategies proposed to fend off the epidemic response is through the establishment of a low-level infection state in which the virus remains dormant or replicates at very low levels within most infected cells. Therefore, the incorporation of the virus into the host DNA Through this process, the virus can establish a stable infection. To accomplish this goal, the original virus is first carefully conditioned so that it does not appear too "aggressive." It is believed that some interactions may be overcome by taking the nef gene segment of the invention and inserting it with other strains or HIV-2 genomes. available. Therefore, the vector-constituted A virus was less likely to replicate in PBMCs than its progenitors. Compensatory mutations were made in the 3' env sequence of the precursor to HXB2, producing a virus that could replicate well in PBMC. The HX B2 virus contains the original nef mutation as well as compensatory mutations in the 3' env sequence. Furthermore, 3'env compensatory mutations exert negative effects on proliferation in the presence of closely related net sequences such as the BI3 and BH10nef genes. Boss. This negative interaction does not extend to divergent nef sequences such as the ELI nef gene. As a result, HIV sequences outside nef affect nef function. Legacy Differences are observed in nef alleles with respect to interaction with genetic sequences. BI3 and BHIOnef are negative regulatory genes with HXB2 3° env sequences. Ru. ELI nef is a positive regulatory gene with HXB2 or ELT3' env sequences. ELI nef is an essential gene for the proliferation of secondary monocytes and macrophages. Therefore, the vectors of the present invention exhibit the various tropisms exhibited by HIV strains. I don't. Therefore, using such a vector, we can demonstrate the general ability of this strain. can transform a wide range of cells. Using standard techniques, the vectors are used to generate an antigenic response in animals and then tested live. Different antibodies can be used therapeutically. Cloning site 81 ID1e containing a simple frameshift mutation of nef The virus was resistant to revertants in vivo for reinstatement of the nef open reading frame. It has been reported that there is a strong tendency to It is often proposed that monocytes are the primary initial target of HrV infection in vivo and/or that infected macrophages constitute an important long-term reservoir for maintaining a large pool of virus within the system. Our findings explain why strong selective pressure for intact nef function exists in vivo, but not necessarily in vitro, in the case of homology exhibited by the ELI nefJl gene. Although not intended to be theoretically linked, the large variation in tropism for different types of CD4-positive cells is in fact a distinct viral regulatory phenomenon. In VitrO or in viv using this vector. transfecting cells with a virus can improve systems for screening drugs and understanding virus pathogenesis. The range of cells transformed by this vector is wider than when using other experimental strains such as the ITIB strain, allowing us to predict the effect of the drug on virus spread in a wider range of infected cells than is typical. You can check it out. For example, it can be used in tests in secondary cell culture to determine the mechanism by which ELInef allows anti-level replication in mononuclear cells. Such information is especially In terms of evidence suggesting that mononucleotropic strains of M. russianus play an important role in the development of central nervous system disease, irrespective of whether immunological damage is evident or not, the disease of AI DS. It is one of the crucial links for understanding the mechanism of progression [Koya nagi, Y., et at. 5science 236:819 (1987)]. In some assays, one may add the compound of interest to cells or body fluids and then attempt to transfect those cells with the vectors of the invention. A large amount of vector is added to cells that have previously been determined to be effective in transforming such cells. The level of infectivity of those cells can then be measured to help prevent the spread of the virus. to determine the effectiveness of the compound as a compound. Alternatively, cells can be first transfected with the vectors of the invention in vitro or in vivo, and then the desired transfection The compound is added to the cells and the effectiveness of the compound in preventing the spread of the virus is then determined. Parameters observed included syncytium formation, single cell killing. supernatant levels of HIV p24 core protein as measured by RA, and immunoprecipitation of metabolically labeled viral proteins using AIDS patient serum. can be lost. The vector is preferably used in vitro using primary monocytes/macrophages. Vectors may be used to "infect" cells in vivo. In general, the traditional experimental manifestations of HIV in traditional animal model systems, for example, some researchers have attempted to develop in viable animal models regarding certain aspects of HTV pathogenicity. In the 5CID-HU mouse line, it replicated very poorly. As mentioned above, the present invention replicates more aggressively in primary lymphocytes than in typical laboratory experiments and is shown to be effective in the field in 5CID-HU mice. This results in proviral clones that must replicate more efficiently than hybrids. Other preferred animal models include non-human mammals. This kind of feeding Preferred examples of the species include rabbits, mice, rats, cats and primates. Ru. Preferred primates include chinopants and monkeys. The effective amount of vector required to be administered to an animal to establish infection can be readily determined. For example, 0.1 μg to about I QmH vector/kg body weight. throw Administration may include parenteral administration such as intramuscular, intraperitoneal, intravenous or subcutaneous. Various routes are possible. Knowing the amounts and conditions necessary to establish "infection" (transfection) allows the development of model assays to establish the in vivo efficacy of preselected compounds. Administer the compound to the animal by standard means, e.g. by injection. give Thereafter, administer enough vector to successfully establish infection and observe the animal to determine whether infection develops and, if so, the extent of infection. Ru. Alternatively, the vector is first administered in an amount sufficient to establish infection in the animal, followed by administration of the preselected compound. The animals are then observed to determine the effect of the pre-tactic compound on "infection" by the vector. In another embodiment, the nef gene of an ELI strain of HIV-1 to enhance viral replication. A sufficient number of nucleotides corresponding to the gene (ELI nef gene segment), A vector is prepared that contains the romator and polyadenylation sequences but not the entire ELI encoding nucleotide sequence. Preferably, the vector contains an LTR sequence, more preferably an HIV LTR sequence. The promoter can be an LTR or a separate promoter, such as another viral promoter, such as the SL3 promoter. This vector is preferably a heterologous Contains children. In certain embodiments, the heterologous gene is a marker gene. Mar Car genes are well known in the art and include, for example, chloramphenicol acetyl transferase (CAT) gene, or a growth hormone such as human growth hormone (hGH). The vector can be inserted into cells using a vector containing a replication competent HIV provirus, or a replication competent Hr V, e.g. For example, co-transfected into a cell line transfected with HXB2 or HXB-BI3. can be transfected. This allows ELI nef segments and other further enables analysis of interactions between rus genes. Use of this vector should also increase the range of hosts that can be transfected with such viruses. The invention is further illustrated by the following examples. These examples will help you understand the invention. The present invention is not limited to the present invention. (IV-1117) is a full-length infectious provirus derived from the II18 strain [Fisher, A.G., et al. Nature 316:262-265 (1985)], lacking the nef, vpr and vpu genes as a result of a single point mutation in each gene. Nucleochi A BamH1 site was found at code 8506, and this position was used for the preparation of various plasmids (see Figure 1). Compatible restriction sites - specifically the B am Hr site within LAV ELI and the novel Ec within both the LAV ELI and I-I X B 2 sequences. Rr sites are generated, if necessary, by mutagenesis of specific oligonucleotides. Ta. In each case, the intended amino acid sequence encoded by any gene is not changed. brought about significant changes. Constructs were verified by sequencing. HXB-ELI 1 contains the entire HXB2 sequence upstream of nef in the env and rev genetic sequences, as well as the original Bam HT site at position 8506, 3" apart, and between that position and the Sac1 site at position 9607. (see Figures 1 and 2). The remaining 3" LTR sequences are derived from HX B 2. In HXB-ELT-2, the 5'' junction between the HXB2 and LAVET-1 sequences is directed to a novel EcoRI site at position ff1 8792, 30 base pairs (bp) upstream from the nef start codon. See Figures 1 and 3. HXB-EL I-2 contains only the HXB2 sequence, which is also 3' away from this Eco R1 site. (As in case D, this extends from position 3' to the Sac 1 site at 9607.Replacements with ELF sequences also occur within the secondary coding exon of rev, that part of the env gene encoding the carboxy terminus of the transmembrane protein, and ne f [5odroski. J. G., et al., Nature 371:412 (1986)]. Therefore, a frameshift was introduced within the nef reading frame of the recombinant to generate a second identical genetic clone containing the dysfunctional nef-HXB-ELT1-nef. accomplished. A 4 base pair frameshift was introduced into the nef coding sequence of HXB-EL r-1 and 2 by filling in the original Xho1 site at position 8928 to generate an identical nef-deficient provirus. were referring to Figures 2 and 3 respectively. I want to eat it. In HXB-BI3, the 3° end of the original Xho1 site contained sequences from the BH8 provirus. This strain is the 1118 strain containing the entire nef open reading frame and was originally called HXB-orf (see Figure 5). HX B-B H81,: derived. The proviral sequence of HXB-BH8 between the Apa 1 site at position 2008 and the Sal 1 site at position 5820 was replaced with the corresponding sequence from clone LAV BRU. This segment contains a functional vpr reading frame. Next, we cut the HXB-BH8 sequence between the kpn 1 sites at positions 5820 and 6382. and the corresponding segment from BHIO, a closely related TIIB clone. Replaced with ment. This segment contains a functional vpu gene. Identical substitutions were made in HXB-ELI 1 to generate HXB-ELI 1-R (see Figure 4). The HXB-ELT 1-R sequence was inserted into the known plasmid pBR322 between the EcoR and Pvu IT sites to generate plasmid DFCI-HT. It contains the HXB-El, , I 1-R sequence with the pBR322 backbone. A specimen of this plasmid has been deposited with the American Type Culture Collection (ATCC) under the Budapest Treaty under deposit number 68343. 12:5707-5717 (1984); Queen and Baltimore re, Ce1l 33 Near 4l-748 (1983); 5odroski, J., et at. 5science 231:1549-1553 (1986). Sea urchins were treated with DEAE-dextrin on day 0 using 10 mg of each proviral plasmid. 107 Jurkat cells were transfected by run method. After that, cultivate The culture was maintained in 12.5 ml of RPMI + 15% fetal bovine serum, with daily total media changes occurring. An aliquot of each supernatant was set aside at each feeding time for later assays. In addition to supernatant HIV p24 core protein levels, cultures were monitored for syncytium formation and total cell number. Terwilliger, et al., J. Viol. 60.754-760 (1986). An aliquot of the cultured Jurkat culture was metabolically labeled and harvested for immunoprecipitation. collected. Half of each sample was immunoprecipitated with AIDS patient serum. The other half +1 was reacted with nef protein antiserum. La emm l i, U, to. Immunoprecipitation and polyacrylamide gel electrophoresis were performed as described: Nature 227:680-685 (1970). Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were isolated by Ficol1 isolation from pale yellow capsules obtained from healthy seronegative blood donors. PBMC culture was performed using 10% bovine blood. Cells were cultured at a density of 4 x 10 cells in 24 mm tissue culture wells (Costar, MA) in RPMI-1640 containing supernatant and antibody and 20% PHA conditioned medium. It was planted at a certain degree. After 48 hours of culture, virus was added to each well. Titrated virus stocks were obtained from transfection of cell cultures with JIJrka. Infectious supernatant equivalent to 20 ng of p24 was added to each well of primary cells. infection details Incubate the cell culture overnight, then carefully decant the growth medium from each well. and replaced with fresh medium. Samples for p24 assay were collected every 3 days after the final medium change and before feeding the cultures. p24 was measured using a commercially available R1Δ kit (Dupont, NEN). Equal amounts of cell-free virus were then used to infect freshly activated peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or purified human mononuclear cells by the same means described above. Replication of each virus was assayed over time by measuring p24 core antigen in the supernatant. Mononuclear cells were obtained from PBMC by fractionation on a Percoll gradient. Contaminated T-thin Cells are removed by rosetting using neuraminidase-treated sheep red blood cells. It was from low-density cells that had been removed. The purity of the mononuclear cell population is determined by immunoperoxidation of side-pin spin cell preparations of isolated mononuclear cells. Verified by Sidase staining. More than 95% of the cells stained with Leu3-M and <5% were positive for Leu18(CD20), Leu3(CD4) or Leu(CD8)l:. 4 x 106 mononuclear cells were cultured as described above for P8MC culture to maintain a comparable growth environment. Virus stocks were used as described for PBMC, with samples for p24 assay collected at the same time. I harvested it. As mentioned above, when generating HXB-ELI 1, inserting the l, lKb segments of the 3'LAV ELI sequence creates transducers within the secondary code exon of rev. Changes occurred in that portion of the env gene that encodes the carboxy terminus of the smembrane protein, as well as within the U3 region of the 3' LTR, which overlaps with nef. A frameshift vector HXB-ELF 1-fs was generated to generate a second identical gene clone containing a dysfunctional ne f. Next, we will discuss the proviral construct. were transfected into Jurkat cells as described above, and the kinetics of virus replication were compared. TTTB-derived nef positive (HX B -B H8) and negative (HXB2) viruses A pair of cells was also transfected as a control. As mentioned above, HXB2 contains a point mutation within nef that results in an insertion in the open reading frame after amino acid 123. Generates a premature stop codon. This truncated nef protein is non-functional. HXB-B) T8 (previously called Hx-orf) does not contain this mutation and produces a full-length nef product.ETerwilliger, E.F., et al., J. Viro 1.60: 754 (1986)]. A delay in the levels of supernatant p24 was detected in cultures transfected with HXB-BTT8 when compared to those containing HXB2 after initial transfection. Significant differences in the patterns of syncytium formation were also evident. Virus replication from HXB-ELI 1 after transfection was virtually no different from HX B2. In other experiments, the kinetics of viral infection exhibited by T-TXB-ELT1 were similar to or slightly enhanced with ITXB2. However, all parameters measured showed that the isogenic nef deficiency Replication of the virus derived from the damaged recombinant provirus (HXB-ELTl-fs) was not observed. It decreased significantly. Supernatant p24 levels in nef-negative virus cultures are similar to isogenic nef! It was reduced by a factor of 100 in this experiment compared to the It-mediated virus culture. Peak cell-associated viral protein production was also dramatically reduced during this virus culture. However, this was indicated by a faint virus band in the immunoprecipitation process. child These measurements demonstrate a dramatic attenuation of the cytopathic effects of the HXB-EL I-nef virus on infected cells, whether assessed by syncytium formation or by the phenomenon of total cell counts over time. parallel. Similar results were obtained from repeated experiments, and sometimes even large differences in kinetics between nef-positive and nef-negative HXB-EL I-1 clones were observed. Metabolically labeled infected cell lysates using nef-specific volemic rabbit serum demonstrated the presence of the 27Kb nef protein in lysates from cells infected with HXB-B H8 or HXB-Ell1 viruses. . This band was transferred with HXB2 or HXB-ELI 1-fs. It was not observed in lysates from isolated cells. Transfection with HXB-BH8 results in higher CD4 Tmm elevation than the nef pair by introducing a functional nef gene into the HXB2 provirus. This confirmed earlier reports of a virus that replicated slowly. The LAV ELT nef gene influences virus replication in Jurkat cells. It was thought that it exhibited a remarkable enhancing effect. This positive effect was large; in contrast, the negative effect of rrrB nef observed in association with the HXB-BH8/HXB2 pair of viruses was small. Replicate experiments using a pair of independently derived clones of the provirus HXB-ELF yielded comparable results, suggesting that random quadratic changes at more or less favorable sites within a given construct may have contributed to the results. The possibility of doing so has been ruled out. To minimize the potential for generation of artifacts in our experimental design, another proviral construct was prepared as described above. Kinetic studies were also performed on novel cell-free virus tests against transfected stable T cell lines. It also extended to primary cells that were cultured. HXB-ELI 2 contained a smaller LAV ELI sequence insertion than HXB-ELr L (see Figures 1 and 3). The 3' end of the 800 base pair insert remains the same, but the 5' end is at the nef start codon. 5° to exactly 30 base pairs downstream. Besides the 47 differences in the predicted amino acid sequence of the nef protein between HXB-Ell 2 and HXB2, only a single amino acid change is observed in the predicted env product of HXB-ELI 2. Isoleucine in the HXB2 env product at position 854, i.e., a component of gp41. Two residues before the carboxy terminus were converted to serine in HXB-ELI 2. So No changes are allowed to any other code frame. An isogenic nef-deleted form of the HXB-EL[2 provirus was also generated by insertion of a framenft into nef, HXB-ELT 2-fs, as described above. As previously described, HXB2 is compatible with nef, vpu [Cohen, E. A., et al., J. et al. Aros 3:11 (1990)] and vpr [AI 1zon. M, et al., Ce1l 46:83 (1986)] gene, it lacks two other regulatory genes. In the HXB-BI3-R (repair) provirus derived from HXB-BI3, the intact vpr and vpu frames were repaired by recombination with sequences from other TT IB clones and the LAV ELI described above. (See Figure 1). Therefore, HXB-BI3-R) represents a provirus predicted to be fully functional for all of the TIV genes. Identical recombination was performed in HXB-ELT 1 to generate HXB-ELI 1-R (see Figure 4). Therefore, HXB-BI3-R and HXB-ELT 1-R are isogenic, with the exception that 1 in HXB-ELI 1-R, LA of IKb, VELI sequence +! Replaces the corresponding ITIB sequence in HXB-BHI C1-R. TIIB replicates very well in T cell lines, but poorly in PBMCs, and particularly weakly in sub-monocytes or mononuclear cell lines [Koyanagi, Y. et al. 5science, 236:819 (1987)]. Barely detectable level p24 antigen production was observed in the supernatant of PBMC infected with HXB2 virus. (See Figure 6). Similarly, HXB-BI3 and HXB-B H8-R rus also showed no significant activity increase in PBMCs on HXB2 (Fig. 6). Detectable replication by any of these three viruses has been shown to occur in mononuclear cell macrophages. It was not observed during di-culture (Fig. 7). 6 and 7 both show HXB-ELI 1 (ELT-1nef, hollow circle), HXB-ELI 2 (EL T-2nef H solid rectangle), HXB-BI3 (BI3nef, hollow rectangle); HXB-ELI For cells transfected with 1-fs (ELI-1fsnef+, solid circles); HXB-ELI 2-fs (ELI-2fs nef-, solid triangles) and H XB2 (HXBc2nef-, hollow triangles). Figure 2 shows p24 production over time. In contrast, HXB-ELI 1 and HXB-EL 12 viruses exhibited strong replication within PBM C, with maximal levels of p24 antigen production occurring at 17 and 20 days post-infection at approximately 26 ng/ml and 33 ng, respectively. /ml was reached. Repeated experiments showed no consistent differences in the activity levels of the two viruses. The HXB-ELI 1-R virus is even aggressive, reaching peak virus production levels. Bell was 3-5 times higher than HXB-ELI 1 or ELI 2. This was more than 50 times the maximum viral titer obtained with any virus containing the TTTB nef sequence. In contrast, susceptibility to either the same gene nef fleift H XB-ELI 1-fs or HXB-ELI 2-fs viruses In infected cultures, supernatant p24 levels were just within or below the detection limit. It was. All three nef-positive HXB-E L1 recombinant viruses replicated very vigorously in secondary mononuclear cell cultures. For example, HXB-ELI 1 in a typical experiment produces peak production levels of approximately 35 ng/ml in converted mononuclear cells 20 days postinfection. Reached ru. HXB-ELI 1-R also reached maximum titers several times higher than the other two viruses. p24 was not detected in the supernatants of mononuclear cells infected with either of the HXB-EL I-ne f-deficient isogenic viruses. For example, referring to FIG. 8, HXB-EL 11-R is represented by a hollow rectangle, HXB-EL I by a hollow triangle, and HX B 2 by a hollow circle to illustrate the results of another exemplary experiment. The results obtained from Jurkat, PBMC and mononuclear cell infections all show that the line of LAV ELI recombinant viruses compared to viruses that do not contain LAVEL I sequences. This highlights a dramatic change in the dynamics, especially as this change requires the presence of an intact LAVEL+ gene. Show that. Viruses such as HXI3-BI3, in which the net coding sequence was intact but ITIB was not involved, did not exhibit this novel phenotype. This difference is due to the same gene nef-positive and nef-negative viruses in Jurkat cells. It is clear even when comparing the two cases that IIIB nef exerts a small negative effect on viral replication, while LAV ELI nef produces a large positive effect. It is permitted to do so. Most surprising, however, is that the presence of the intact LAVELI nef gene confers on the recombinant virus a novel tropism for mononuclear cells, which also reflects its ability for active replication in PBMCs. reflected in It will be done. The level of virus production in infected mononuclear cells by HXB-ELI 1-R virus is probably as high as that reported for mononucleotropic HTV strains [Koyanagi, Y., et al. 5science, 236:819 (1987). Shwartz, S., et al., PNAS, 86:7200 (1989), Collman, R., et al. J. Exp. Med, 170: 571 (1989)]. Perhaps additional redundant elements, e.g. within the U3 region of the 3' LTR, could be involved in the phenotypic changes of LAV E LI recombinants; Additional sequence differences between HXB2 and HXB-ELI1 present in the env and rev genes are unlikely to contribute to the phenotype. However, the negative results obtained with both nef-deficient LAV ELI viruses indicate that intact LAV ELF nef is phenotypically defective. It is clear that it is essential. In contrast, there was an approximately 5-fold enhancement in the level of virus production in primary cells by the vpu-positive, vpr-positive HXB-ELI 1-R virus when compared to the parent HXB-EL 11, which lacks these functions. On the other hand, the reversion of vpu and vpr in HXB-BH8 is associated with this virus in monocytes. Nothing was done to alleviate the block to replication by PBMCs or to enhance low-level infection in PBMCs. As previously reported, each of these factors functions to enhance viral replication [Cohen, E. A., et al., J. et al. AIDS, 3:11 (1990), Alzon, M., et al., Ce1l, 46:83 (1986)]. Coding changes in other open reading frames were introduced into HXB-ELI 1-R compared to the original HXB-ELT 1, while the effects we characterized on vpu and vpr during viral infection of Jurkat cells. The magnitude is quite sufficient to explain the enhancement of virus titers observed in both PBMC and mononuclear cell cultures infected with HXB-ELTI-R. The large variation in tropism for different types of CD4-positive cells is evidenced by the fact that there are virtually no distinct natural This is thought to be a virus regulation phenomenon. We successfully repeated the observation of other investigators that nef can moderately downregulate expression from the HIV LTR in trans. This can be used as a nef expression vector or co-transfected the HIV LTR-CAT construct into CO3-7 cells together with the same gene vector containing a frameshift in the nef sequence extract. This was achieved by Each plasmid contained 5v40 origins of replication. But long Similar results were obtained using HTV LTR elements cloned from HXB2 or LAV ELI, regardless of which strain of nef was being expressed. Together with replication studies, this suggests that the downregulation effect is a secondary phenomenon. In view of the benefit of the foregoing disclosure, numerous modifications and variations of the embodiments described herein are possible without departing from the inventive concept, and the invention lies within the scope of the appended claims. It will be clear to those skilled in the art that the invention is limited only by the spirit and spirit of the invention. l\ /'\mu FIG + Special Table of Contents 15-509232 (14) Vectors containing fractional nucleotides and further containing this ELI nef gene segment are disclosed. These vectors can be used to transfect a wide variety of cells and hosts for use in assay systems. international search report

Claims (27)

【特許請求の範囲】[Claims] 1.以下の: (a)ウイルス複製及び感染性に必要なHIV遺伝子生成物質即ちHIVセグメ ントを発現するためのHIVゲノムに対応するが、しかしELI株からのウイル ス複製及び感染性に必要な遺伝子の全てには対応しない十分数のヌクレオチド; 及び(b)ウイルス複製を増強するためのHIV−1のELI株のnef遺伝子 に対応する十分数のヌクレオチド、即ちELInef遺伝子セグメントを含有す るベクター。1. below: (a) HIV gene products necessary for viral replication and infectivity, i.e., HIV segments; corresponding to the HIV genome to express the vector, but the virus from the ELI strain a sufficient number of nucleotides that do not correspond to all of the genes required for virus replication and infectivity; and (b) the nef gene of the ELI strain of HIV-1 to enhance viral replication. contains a sufficient number of nucleotides corresponding to the ELInef gene segment, i.e. vector. 2.HIVセグメントが機能的vpuタンパク質を産生するための機能的HIV vpu遺伝子に対応する十分数のヌクレオチドを含有する請求項1記載のベクタ ー。2. Functional HIV for HIV segment to produce functional vpu protein The vector according to claim 1, containing a sufficient number of nucleotides corresponding to the vpu gene. -. 3.HIVセグメントが機能的vprタンパク質を産生するための機能的HIV vpr遺伝子に対応する十分数のヌクレオチドを含有する請求項1記載のベクタ ー。3. Functional HIV for HIV segment to produce functional vpr protein The vector according to claim 1, containing a sufficient number of nucleotides corresponding to the vpr gene. -. 4.HIVセグメントが機能的vpuタンパク質を産生するための機能的vpu 遺伝子に対応する十分数のヌクレオチドを含有する請求項3記載のベクター。4. Functional vpu for HIV segment to produce functional vpu protein The vector according to claim 3, containing a sufficient number of nucleotides corresponding to the gene. 5.HIVセグメントが機能的envタンパク質を産生するための十分数のヌク レオチドに対応するが、ELI株のenvヌクレオチドには対応しない請求項1 記載のベクター。5. HIV segments have sufficient numbers of nuclei to produce functional env proteins. Claim 1 which corresponds to leotide but not to the env nucleotide of the ELI strain. Vectors listed. 6.HIVセグメントが機能的gagタンパク質を産生するための十分数のヌク レオチドに対応するが、ELI株のgagヌクレオチドには対応しない請求項1 記載のベクター。6. HIV segments have sufficient numbers of nuclei to produce functional gag protein. Claim 1 which corresponds to leotide but not to the gag nucleotide of the ELI strain. Vectors listed. 7.HIVセグメントが機能的polタンパク質を産生するための十分数のヌク レオチドに対応するが、ELI株のpolヌクレオチドには対応しない請求項1 記載のベクター。7. HIV segments have sufficient numbers of nuclei to produce functional pol protein. Claim 1 which corresponds to leotide but not to the pol nucleotide of the ELI strain. Vectors listed. 8.HIVゲノムがHIV−2ゲノムである請求項1記載のベクター。8. The vector according to claim 1, wherein the HIV genome is an HIV-2 genome. 9.HIVセグメントがHIV−1ゲノムのヌクレオチドに対応する請求項1記 載のベクター。9. Claim 1, wherein the HIV segment corresponds to a nucleotide of the HIV-1 genome. Vectors included. 10.HIVセグメントが機能的gag、pol、env、rev、tat、v pu及びvprタンパク質を産生するためのgag遺伝子、pol遺伝子、en v遺伝子、rev遺伝子、tat遺伝子、vpu遺伝子及びvpr遺伝子に対応 する十分数のヌクレオチドを含有する請求項1記載のベクター。10. HIV segments are functional gag, pol, env, rev, tat, v gag gene, pol gene, en for producing pu and vpr proteins Compatible with v gene, rev gene, tat gene, vpu gene and vpr gene 2. The vector according to claim 1, containing a sufficient number of nucleotides to 11.以下の: (a)ウイルス複製を増強するためのHIV−1のELI株のnef遺伝子に対 応する十分数のヌクレオチド、即ちELInef遺伝子セグメント; (b)プロモーター配列;及び (c)ポリアデニル化配列 を包含するベクターであって、すべてのELIコード化ヌクレオチド配列を含有 するわけではないベクター。11. below: (a) against the nef gene of the ELI strain of HIV-1 to enhance virus replication; a sufficient number of nucleotides corresponding to the ELInef gene segment; (b) a promoter sequence; and (c) Polyadenylation sequence and contains all ELI-encoding nucleotide sequences. Vector that does not. 12.LTR配列に対応する十分数のヌクレオチドを含有する請求項11記載の ベクター。12. 12. Contains a sufficient number of nucleotides corresponding to the LTR sequence. vector. 13.異種遺伝子をも含有する請求項11記載のベクター。13. 12. The vector according to claim 11, which also contains a heterologous gene. 14.HIVウイルスによる感染に対して有効な化合物に関するinvivo検 定方法であって、以下の:(a)動物に請求項1記載のベクターを、その動物が 感染するのに十分な量で投与し; (b)予定化合物を動物に添加し;そして(c)動物を観察して、ベクターによ る感染に及ぼす予定化合物の作用を確定する 工程から成る方法。14. In vivo tests for compounds effective against infection by the HIV virus 2. A method for determining the method of claim 1, comprising: (a) administering the vector of claim 1 to an animal; administered in sufficient quantity to cause infection; (b) add the intended compound to the animal; and (c) observe the animal and to determine the effect of the intended compound on infection A method consisting of steps. 15.HIVウイルスによる感染に対する化合物の有効性の検定方法であって、 以下の: (a)予定化合物を予め選定した動物に添加し;(b)請求項1記載のベクター を、感染を引き起こすのに十分であると確定された量で予め選定した動物に投与 し;そして (c)動物を観察して、ベクターによる感染における予め選定した化合物の作用 を確定する 工程から成る方法。15. 1. A method for testing the effectiveness of a compound against infection by the HIV virus, the method comprising: below: (a) adding a predetermined compound to a preselected animal; (b) the vector of claim 1; is administered to preselected animals in an amount determined to be sufficient to cause infection. And (c) Observe the effects of preselected compounds on infection by vectors in animals. confirm A method consisting of steps. 16.動物がヒト以外の哺乳類である請求項14記載の方法。16. 15. The method according to claim 14, wherein the animal is a mammal other than a human. 17.哺乳類が霊長類である請求項16記載の方法。17. 17. The method according to claim 16, wherein the mammal is a primate. 18.哺乳類が、ウサギ、マウス、ラット、ネコ、チンパンジー及びサルから成 る群から選択される請求項16記載の方法。18. Mammals include rabbits, mice, rats, cats, chimpanzees, and monkeys. 17. The method according to claim 16, wherein the method is selected from the group consisting of: 19.動物がチンパンジーである請求項14記載の方法。19. 15. The method according to claim 14, wherein the animal is a chimpanzee. 20.予め選定した動物がヒト以外の哺乳類である請求項15記載の方法。20. 16. The method of claim 15, wherein the preselected animal is a non-human mammal. 21.哺乳類が霊長類である請求項15記載の方法。21. 16. The method according to claim 15, wherein the mammal is a primate. 22.哺乳類がウサギ、マウス、ラット、ネコ、チンパンジー及びサルから成る 群から選択される請求項15記載の方法。22. Mammals include rabbits, mice, rats, cats, chimpanzees, and monkeys 16. The method of claim 15, wherein the method is selected from the group. 23.予め選定した動物がチンパンジーである請求項15記載の方法。23. 16. The method of claim 15, wherein the preselected animal is a chimpanzee. 24.HIVウイルスに対して有効な化合物の検定方法であって、以下の: (a)十分な量の請求項1記載のベクターで細胞系をトランスフェクトして感染 培養物を得て; (b)感染培養物に予定化合物を添加し;そして(c)培養物をスクリーニング して、トランスフェクト化培養物に及ぼす化合物の作用を確定する 工程から成る方法。24. A method for assaying compounds effective against the HIV virus, comprising: (a) transfecting and infecting a cell line with a sufficient amount of the vector according to claim 1; Obtain a culture; (b) adding the intended compound to the infected culture; and (c) screening the culture. to determine the effect of compounds on transfected cultures. A method consisting of steps. 25.細胞系が一次単核球である請求項24記載の方法。25. 25. The method of claim 24, wherein the cell line is a primary mononuclear cell. 26.HIVウイルスによる感染性に対する化合物の有効性の検定方法であって 、以下の: (a)予定化合物を細胞の培養物に添加し;(b)細胞の培養物をトランスフェ クトするのに十分であると予め確定された量の請求項1記載のベクターで工程( a)の細胞の培養物をトランスフェクトしょうと試みて;そして(c)培養物を スクリーニングして、培養がトランスフェクトされたかを、そしてトランスフェ クトされた場合には、工程(b)のベクターによるトランスフェクションの程度 を確定する 工程から成る方法。26. 1. A method for testing the effectiveness of a compound against infectivity by HIV virus, the method comprising: ,below: (a) adding a predetermined compound to a culture of cells; (b) transfecting a culture of cells; step ( a) attempting to transfect the culture of cells; and (c) transfecting the culture. Screen to determine if the culture is transfected and the extent of transfection with the vector in step (b). confirm A method consisting of steps. 27.細胞の培養物が一次単核球の培養物である請求項24記載の方法。27. 25. The method of claim 24, wherein the culture of cells is a culture of primary mononuclear cells.
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