JP2018050559A - Method of isolating fetal cells from peripheral blood collected from pregnant mother, antibody set, and prenatal genetic testing method - Google Patents

Method of isolating fetal cells from peripheral blood collected from pregnant mother, antibody set, and prenatal genetic testing method Download PDF

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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a novel method of isolating fetal cells using antibodies from peripheral blood collected from a pregnant mother.SOLUTION: The method of isolating fetal cells comprises: a step of contacting at least two kinds of antibodies selected from the group consisting of anti-HBG antibody, anti-ALAS 2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody and anti-DDX3Y antibody with a blood cell population and marking the cells with at least two kinds of antibodies; and a step of isolating the cells marked with the at least two kinds of antibodies. An antibody set comprising the at least two kinds of antibodies and an application thereof are also provided.SELECTED DRAWING: None

Description

本発明は、妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離する方法、抗体セット、及び出生前遺伝学的検査方法に関する。   The present invention relates to a method for isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother, an antibody set, and a prenatal genetic testing method.

出生前遺伝学的検査として、従来、羊水穿刺により採取した羊水から胎児細胞を単離し、胎児細胞中の染色体を調べる羊水染色体検査が行われてきた。しかし、羊水穿刺には流産を引き起こす可能性がある。   Conventionally, as a prenatal genetic test, an amniotic fluid chromosome test has been performed in which fetal cells are isolated from amniotic fluid collected by amniocentesis and the chromosomes in the fetal cells are examined. However, amniocentesis can cause miscarriage.

一方、妊娠母体の血液中に存在する胎児由来の無細胞DNA、又は、妊娠母体の血液中に存在する胎児細胞の染色体DNAを解析して、胎児染色体の異常を検出する検査が、非侵襲な出生前遺伝学的検査として知られている。   On the other hand, a test that detects fetal chromosomal abnormality by analyzing fetal cell-free DNA present in the blood of the pregnant mother or chromosomal DNA of fetal cells present in the blood of the pregnant mother is non-invasive. Known as prenatal genetic testing.

非侵襲な出生前遺伝学的検査の中でも、胎児由来の無細胞DNAを解析する検査は、既に実用化されている。一方、胎児細胞の染色体DNAを解析する検査は、いまだ実用に至っていない。その理由として、胎児細胞(例えば、胎児の有核赤血球)が母体血数mL中に1個程度しか存在しない希少細胞であることが挙げられる。しかし、胎児細胞の染色体DNAを解析できれば、より検査精度に優れた非侵襲な出生前遺伝学的検査が期待できる。   Among non-invasive prenatal genetic tests, tests that analyze fetal cell-free DNA have already been put to practical use. On the other hand, tests for analyzing chromosomal DNA of fetal cells have not yet been put to practical use. The reason is that fetal cells (for example, fetal nucleated red blood cells) are rare cells that are present only in about 1 maternal blood count. However, if the chromosomal DNA of fetal cells can be analyzed, a noninvasive prenatal genetic test with better test accuracy can be expected.

ところで、細胞を抗体を用いて免疫学的に識別し単離する方法は、細胞特異性の高い単離方法であり、臨床に普及している。こうした背景のもとに、妊娠母体の末梢血に含まれる胎児細胞を単離する方法として、胎児細胞に特有のタンパク質に結合する抗体を用いて胎児細胞を識別し単離する方法が、例えば特許文献1〜4に開示されている。胎児の赤血球に発現しているヘモグロビンのほとんどは、2個のサブユニットαと2個のサブユニットγとからなるヘモグロビンF(fetal hemoglobin)であるが、生後はサブユニットγよりもサブユニットβの発現が優位になり、成人の赤血球に発現しているヘモグロビンのほとんどは、2個のサブユニットαと2個のサブユニットβとからなるヘモグロビンA(adult hemoglobin)である。この現象を利用して、特許文献1〜4は、サブユニットγに対する抗体を用いて胎児の赤血球を識別し単離することを開示している。   By the way, a method for immunologically identifying and isolating cells using an antibody is an isolation method with high cell specificity and is widely used in clinical practice. Against this background, as a method for isolating fetal cells contained in the peripheral blood of a pregnant mother, a method for identifying and isolating fetal cells using an antibody that binds to a protein unique to fetal cells is, for example, patented. It is disclosed in Documents 1-4. Most of the hemoglobin expressed in fetal erythrocytes is hemoglobin F (fetal hemoglobin) consisting of two subunits α and two subunits γ. Expression is dominant and most of hemoglobin expressed in adult erythrocytes is hemoglobin A (adult hemoglobin) composed of two subunits α and two subunits β. Using this phenomenon, Patent Documents 1 to 4 disclose that fetal erythrocytes are identified and isolated using an antibody against subunit γ.

特開2000−039433号公報JP 2000-039433 A 特表2001−502805号公報JP-T-2001-502805 特開2014−223082号公報Japanese Patent Laying-Open No. 2014-223082 特表2014−533509号公報Special table 2014-533509 gazette

出生前遺伝学的検査の精度を挙げるために、妊娠母体の末梢血から胎児細胞を確実に単離する免疫学的方法が求められている。   In order to improve the accuracy of prenatal genetic testing, there is a need for an immunological method that reliably isolates fetal cells from the peripheral blood of a pregnant mother.

本開示の実施形態は、上記状況のもとになされた。
本開示の課題は、妊娠母体から採取された末梢血から抗体を用いて胎児細胞を単離する新規な方法を提供することである。
また、本開示の課題は、胎児細胞を単離するために用いる新規な抗体セットを提供することである。
また、本開示の課題は、単離された胎児細胞から染色体DNAを入手して行う、胎児の出生前遺伝学的検査方法を提供することである。
The embodiment of the present disclosure has been made under the above circumstances.
An object of the present disclosure is to provide a novel method for isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother using an antibody.
Moreover, the subject of this indication is providing the novel antibody set used in order to isolate a fetal cell.
Another object of the present disclosure is to provide a prenatal genetic testing method for fetuses that is performed by obtaining chromosomal DNA from isolated fetal cells.

上記の課題を解決するための具体的手段には、以下の態様が含まれる。
[1] 妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離する方法であって、抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を血液細胞集団に接触させて少なくとも2種の抗体で細胞をマーキングする工程と、血液細胞集団から、少なくとも2種の抗体でマーキングされた細胞を単離する工程と、を有する、胎児細胞の単離方法。
[2] 少なくとも2種の抗体が、抗HBG抗体を含む、[1]に記載の胎児細胞の単離方法。
[3] さらに、末梢血を密度勾配遠心分離に供して有核赤血球を含む画分を得る工程を有し、有核赤血球を含む画分が血液細胞集団である、[1]又は[2]に記載の胎児細胞の単離方法。
[4] さらに、抗CD45抗体を血液細胞集団に接触させて抗CD45抗体で細胞をマーキングする工程と、血液細胞集団から、抗CD45抗体でマーキングされていない細胞を単離する工程と、を有する、[1]〜[3]のいずれか1つに記載の胎児細胞の単離方法。
[5] さらに、核染色色素を血液細胞集団に接触させて細胞核を染色する工程と、血液細胞集団から、核染色色素によって核が染色された有核細胞を単離する工程と、を有する、[1]〜[4]のいずれか1つに記載の胎児細胞の単離方法。
[6] 血液細胞集団から細胞を単離することがフローサイトメトリーによって行われる、[1]〜[5]のいずれか1つに記載の胎児細胞の単離方法。
[7] 抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を含む、胎児細胞の単離に用いるための抗体セット。
[8] 少なくとも2種の抗体が、抗HBG抗体を含む、[7]に記載の抗体セット。
[9] 少なくとも2種の抗体の一部又は全部がそれぞれ、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、及び磁気ビーズから選ばれる少なくとも1種で標識された抗体である、[7]又は[8]に記載の抗体セット。
[10] [1]〜[6]のいずれか1つに記載の胎児細胞の単離方法により、妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離し、単離された胎児細胞から染色体DNAを入手して行う、胎児の出生前遺伝学的検査方法。
Specific means for solving the above problems include the following aspects.
[1] A method for isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother, comprising anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody At least two antibodies selected from the group consisting of an anti-C4orf3 antibody, an anti-IGF2 antibody, an anti-GYPE antibody, an anti-CLIC6 antibody, and an anti-DDX3Y antibody are contacted with the blood cell population, and the cells are marked with at least two antibodies. A method of isolating fetal cells, comprising: isolating cells marked with at least two antibodies from a blood cell population.
[2] The method for isolating fetal cells according to [1], wherein the at least two kinds of antibodies comprise an anti-HBG antibody.
[3] The method further comprises the step of subjecting peripheral blood to density gradient centrifugation to obtain a fraction containing nucleated red blood cells, wherein the fraction containing nucleated red blood cells is a blood cell population [1] or [2] A method for isolating fetal cells as described in 1. above.
[4] The method further comprises a step of contacting an anti-CD45 antibody with a blood cell population to mark the cells with the anti-CD45 antibody, and a step of isolating cells not marked with the anti-CD45 antibody from the blood cell population. And [1] to [3]. The method for isolating fetal cells according to any one of [1] to [3].
[5] Further, the method includes a step of contacting a nuclear staining dye with a blood cell population to stain the cell nucleus, and a step of isolating a nucleated cell having a nucleus stained with the nuclear staining dye from the blood cell population. [1] The method for isolating fetal cells according to any one of [4].
[6] The method for isolating fetal cells according to any one of [1] to [5], wherein the cells are isolated from the blood cell population by flow cytometry.
[7] Anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y An antibody set for use in isolating fetal cells, comprising at least two types of antibodies selected from the group consisting of antibodies.
[8] The antibody set according to [7], wherein the at least two kinds of antibodies include an anti-HBG antibody.
[9] A part or all of at least two kinds of antibodies are antibodies labeled with at least one kind selected from a fluorescent dye, a fluorescent protein, an enzyme, biotin, and a magnetic bead, [7] or [8] The antibody set described in 1.
[10] Using the fetal cell isolation method according to any one of [1] to [6], fetal cells are isolated from peripheral blood collected from a pregnant mother and chromosomal DNA is isolated from the isolated fetal cells. A prenatal genetic testing method for fetuses.

本開示によれば、妊娠母体から採取された末梢血から抗体を用いて胎児細胞を単離する新規な方法が提供される。
また、本開示によれば、胎児細胞を単離するために用いる新規な抗体セットが提供される。
また、本開示によれば、単離された胎児細胞から染色体DNAを入手して行う、胎児の出生前遺伝学的検査方法が提供される。
According to the present disclosure, a novel method for isolating fetal cells using antibodies from peripheral blood collected from a pregnant mother is provided.
Moreover, according to this indication, the novel antibody set used in order to isolate a fetal cell is provided.
In addition, according to the present disclosure, there is provided a prenatal genetic test method for a fetus, which is performed by obtaining chromosomal DNA from an isolated fetal cell.

有核赤血球画分の全細胞に占める抗体陽性細胞の割合を示すグラフである。It is a graph which shows the ratio of the antibody positive cell which occupies for all the cells of a nucleated erythrocyte fraction.

以下に、実施形態について説明する。これらの説明及び実施例は実施形態を例示するものであり、実施形態の範囲を制限するものではない。   Embodiments will be described below. These descriptions and examples illustrate the embodiments and do not limit the scope of the embodiments.

本開示において「工程」との語は、独立した工程だけでなく、他の工程と明確に区別できない場合であってもその工程の所期の目的が達成されれば、本用語に含まれる。   In the present disclosure, the term “process” is not only included in an independent process, but is included in the term if the intended purpose of the process is achieved even when it cannot be clearly distinguished from other processes.

本開示において組成物中の各成分の量について言及する場合、組成物中の各成分に該当する物質が複数種存在する場合には、特に断らない限り、組成物中に存在する当該複数種の物質の合計量を意味する。   In the present disclosure, when referring to the amount of each component in the composition, when there are a plurality of substances corresponding to each component in the composition, the plurality of the substances present in the composition unless otherwise specified. It means the total amount of substance.

本開示において「〜」を用いて示された数値範囲は、「〜」の前後に記載される数値をそれぞれ最小値及び最大値として含む範囲を示す。   In the present disclosure, numerical ranges indicated using “to” indicate ranges including numerical values described before and after “to” as the minimum value and the maximum value, respectively.

<胎児細胞の単離方法>
本開示の単離方法は、妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離する方法である。本開示において血液には、血液そのもの、及び、生理食塩水で希釈した血液;血液にグルコース、抗血液凝固剤等の添加剤を加えた保存血液;これらの分画物;などの血液試料が含まれる。本開示において血液細胞集団とは、血液を構成する細胞の集団を指す。
<Method of isolating fetal cells>
The isolation method of the present disclosure is a method of isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother. In the present disclosure, blood includes blood samples such as blood itself and blood diluted with physiological saline; stored blood obtained by adding an additive such as glucose or an anticoagulant to the blood; fractions thereof; It is. In the present disclosure, the blood cell population refers to a population of cells constituting blood.

本開示の単離方法は、妊娠母体から採取された末梢血から、胎児細胞、望ましくは胎児の有核細胞を単離する。有核細胞には染色体が存在するため、胎児の有核細胞を単離することで、胎児染色体および胎児遺伝子の入手が可能となる。妊娠母体の末梢血に含まれる胎児の有核細胞としては、有核赤血球が挙げられる。   The isolation method of the present disclosure isolates fetal cells, preferably fetal nucleated cells, from peripheral blood collected from a pregnant mother. Since nucleated cells have chromosomes, fetal chromosomes and fetal genes can be obtained by isolating fetal nucleated cells. Examples of fetal nucleated cells contained in the peripheral blood of the pregnant mother include nucleated red blood cells.

胎児の有核赤血球は、胎盤を通過して母体の血液中に移行する。胎児の有核赤血球は、妊娠後6週程度から母体血中に存在するといわれている。したがって、本開示の単離方法に供する血液は、妊娠後6週程度以降の妊娠母体から採取した末梢血、又は、妊娠後6週程度以降の妊娠母体から採取した末梢血から調製した血液試料であることが好ましい。   Fetal nucleated red blood cells migrate through the placenta into the maternal blood. Fetal nucleated red blood cells are said to be present in maternal blood from about 6 weeks after pregnancy. Therefore, the blood used for the isolation method of the present disclosure is a blood sample prepared from peripheral blood collected from a pregnant mother about 6 weeks after pregnancy or from peripheral blood collected from a pregnant mother after about 6 weeks after pregnancy. Preferably there is.

母体が妊娠中には、胎児の赤血球は有核であり得る。胎児の有核赤血球は、妊娠母体血中の細胞の約10個に1個の割合で存在しているといわれており、妊娠母体の抹消血中においては、非常に存在確率が低い。妊娠母体の末梢血には、胎児の有核赤血球のほかに、母親の白血球(好酸球、好中球、好塩基球、単球、リンパ球);母親の、核のない成熟した赤血球;母親の有核赤血球;等の血液細胞が含まれる。 When the mother is pregnant, fetal red blood cells can be nucleated. Fetal nucleated red blood cells are said to be present in a ratio of about 1 in 10 6 cells in the maternal blood of the pregnancy, and the probability of existence is very low in the peripheral blood of the pregnant mother. In addition to fetal nucleated red blood cells, maternal white blood cells (eosinophils, neutrophils, basophils, monocytes, lymphocytes); maternal mature red blood cells without a nucleus; Blood cells such as maternal nucleated red blood cells;

上記の様々な細胞を含む血液細胞集団から、胎児細胞、望ましくは胎児の有核赤血球を効率よく単離するために、本開示の単離方法は、抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を用いて細胞を選別する。上記12種の抗体が結合するヒトタンパク質の詳細を表1に示す。   In order to efficiently isolate fetal cells, preferably fetal nucleated red blood cells, from the blood cell population containing the various cells described above, the isolation method of the present disclosure includes anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody. Using at least two antibodies selected from the group consisting of anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody Sort the cells. Details of the human proteins to which the 12 types of antibodies bind are shown in Table 1.

ヒトのヘモグロビンサブユニットγ(hemoglobin subunit gamma;HBG)の遺伝子は2つあり、それぞれHBG1(hemoglobin subunit gamma 1)とHBG2(hemoglobin subunit gamma 2)とを発現する。本開示において、HBGは、HBG1とHBG2とを含む用語であり、抗HBG抗体とは、HBG1及びHBG2の少なくとも一方に結合する抗体を意味する。   There are two human hemoglobin subunit gamma (HBG) genes, which express HBG1 (hemoglobin subunit gamma 1) and HBG2 (hemoglobin subunit gamma 2), respectively. In the present disclosure, HBG is a term including HBG1 and HBG2, and the anti-HBG antibody means an antibody that binds to at least one of HBG1 and HBG2.

本開示において、抗体は、免疫グロブリン分子そのもの(intact immunoglobulin)のみならず、その断片であって抗原への結合能を有する断片(例えば、Fab、F(ab')、Fab')をも包含する用語である。 In the present disclosure, the antibody includes not only an immunoglobulin molecule itself (intact immunoglobulin) but also a fragment thereof (for example, Fab, F (ab ′) 2 , Fab ′) having a binding ability to an antigen. It is a term to do.

本発明者の解析によって、HBG、ALAS2、HEMGN、C9orf5、GYPB、SLC1A5、EIF1AY、C4orf3、IGF2、GYPE、CLIC6、及びDDX3Yは、ヒト成人骨髄血に比べヒト臍帯血において高発現していることが確認された。これらヒトタンパク質に結合する抗体を少なくとも2種用いることによって、血液細胞集団から胎児細胞を効率的に単離することができる。   According to the analysis of the inventor, HBG, ALAS2, HEMGN, C9orf5, GYPB, SLC1A5, EIF1AY, C4orf3, IGF2, GYPE, CLIC6, and DDX3Y are highly expressed in human umbilical cord blood compared to human adult bone marrow blood. confirmed. By using at least two types of antibodies that bind to these human proteins, fetal cells can be efficiently isolated from the blood cell population.

12種の抗体(抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体。以下、同じ。)から少なくとも2種選択する組合せとしては、抗HBG抗体と、それ以外の11種の抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体との組合せが挙げられる。抗HBG抗体を用いることにより、血液細胞集団から単離される細胞が、胎児の赤血球である確率が高まる。好ましい組合せとしては、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗IGF2抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体との組合せが挙げられ、より好ましい組合せとしては、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、及び抗CLIC6抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体との組合せが挙げられ、更に好ましい組合せとしては、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗EIF1AY抗体、及び抗SLC1A5抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体との組合せが挙げられる。   12 antibodies (anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and Combinations of at least two types selected from anti-DDX3Y antibody (hereinafter the same)) include a combination of an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from the other 11 types of antibodies. By using an anti-HBG antibody, the probability that cells isolated from a blood cell population are fetal erythrocytes is increased. A preferred combination is a combination of an anti-HBG antibody and an anti-ALAS2 antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-IGF2 antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody. More preferable combinations include a combination of an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from an anti-ALAS2 antibody, an anti-C9orf5 antibody, an anti-SLC1A5 antibody, an anti-EIF1AY antibody, and an anti-CLIC6 antibody, and A preferable combination includes a combination of an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from an anti-ALAS2 antibody, an anti-C9orf5 antibody, an anti-EIF1AY antibody, and an anti-SLC1A5 antibody.

12種の抗体はそれぞれ、抗原を免疫された非ヒト動物の血液から精製する方法;抗原を免疫された非ヒト動物のB細胞とミエローマ細胞との融合細胞であるハイブリドーマを作製し、ハイブリドーマからモノクローナル抗体を得る方法;等の方法で製造可能である。12種の抗体は、市販品でもよい。   Each of the 12 types of antibodies is a method of purifying an antigen from the blood of an immunized non-human animal; a hybridoma that is a fusion cell of B cells and myeloma cells of an immunized non-human animal is prepared, and a monoclonal antibody is prepared from the hybridoma. It can be produced by a method of obtaining an antibody; The 12 types of antibodies may be commercially available products.

12種の抗体の一部又は全部はそれぞれ、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、及び磁気ビーズから選ばれる少なくとも1種で標識された標識化抗体でもよい。   Each of the 12 types of antibodies may be a labeled antibody labeled with at least one selected from fluorescent dyes, fluorescent proteins, enzymes, biotin, and magnetic beads.

抗体を標識する蛍光色素としては、例えば、FITC(fluorescein isothiocyanate)、テキサスレッド、Cy3、Cy5、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 647等が挙げられる。抗体を標識する蛍光タンパク質としては、例えば、フィコシアニン、アロフィコシアニン、フィコエリスリン、フィコエリスロシアニン等が挙げられる。抗体を標識する酵素としては、例えば、ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ等が挙げられる。   Examples of fluorescent dyes for labeling antibodies include FITC (fluorescein isothiocyanate), Texas Red, Cy3, Cy5, Alexa Fluor 488, Alexa Fluor 647, and the like. Examples of fluorescent proteins for labeling antibodies include phycocyanin, allophycocyanin, phycoerythrin, phycoerythrocyanin, and the like. Examples of the enzyme labeling antibody include peroxidase and alkaline phosphatase.

12種の抗体から少なくとも2種の抗体を選択して組み合せることによって、血液細胞集団から胎児細胞を単離するために用いる抗体セットが提供される。本抗体セットの一つの実施形態例は、少なくとも抗HBG抗体を含み、抗HBG抗体と、それ以外の11種の抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体とを含む。本抗体セットの好ましい実施形態例は、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗IGF2抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体とを含む。本抗体セットのより好ましい実施形態例は、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、及び抗CLIC6抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体とを含む。本抗体セットの更に好ましい実施形態例は、抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗C9orf5抗体、抗EIF1AY抗体、及び抗SLC1A5抗体から選ばれる少なくとも1種の抗体とを含む。
本抗体セットに含まれる少なくとも2種の抗体の一部又は全部はそれぞれ、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、及び磁気ビーズから選ばれる少なくとも1種で標識された標識化抗体でもよい。
By selecting and combining at least two antibodies from the twelve antibodies, an antibody set for use in isolating fetal cells from a blood cell population is provided. One embodiment of this antibody set includes at least an anti-HBG antibody, and includes an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from the other 11 antibodies. A preferred embodiment of this antibody set is an anti-HBG antibody and at least one selected from an anti-ALAS2 antibody, an anti-C9orf5 antibody, an anti-SLC1A5 antibody, an anti-EIF1AY antibody, an anti-IGF2 antibody, an anti-CLIC6 antibody, and an anti-DDX3Y antibody. Antibody. A more preferred embodiment of this antibody set comprises an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from anti-ALAS2 antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, and anti-CLIC6 antibody. Further preferred embodiment examples of the antibody set include an anti-HBG antibody and at least one antibody selected from an anti-ALAS2 antibody, an anti-C9orf5 antibody, an anti-EIF1AY antibody, and an anti-SLC1A5 antibody.
A part or all of at least two kinds of antibodies included in the present antibody set may be labeled antibodies labeled with at least one selected from fluorescent dyes, fluorescent proteins, enzymes, biotin, and magnetic beads.

以下、本開示の単離方法を、工程を説明することによって、詳細に説明する。   Hereinafter, the isolation method of the present disclosure will be described in detail by explaining the steps.

[胎児細胞マーキング工程、胎児細胞単離工程]
本開示の単離方法は、
抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を血液細胞集団に接触させて少なくとも2種の抗体で細胞をマーキングする工程(「胎児細胞マーキング工程」という。)と、
血液細胞集団から、少なくとも2種の抗体でマーキングされた細胞を単離する工程(「胎児細胞単離工程」という。)と、を有する。
[Fetal cell marking process, fetal cell isolation process]
The isolation method of the present disclosure includes:
It consists of anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody Contacting a blood cell population with at least two antibodies selected from the group and marking the cells with at least two antibodies (referred to as “fetal cell marking step”);
Isolating cells marked with at least two types of antibodies from the blood cell population (referred to as “fetal cell isolation step”).

HBG、ALAS2、HEMGN、C9orf5、GYPB、SLC1A5、EIF1AY、C4orf3、IGF2、GYPE、CLIC6、及びDDX3Yは、ヒト成人骨髄血に比べヒト臍帯血において高発現していることから、12種の抗体の少なくとも2種の陽性細胞は、胎児細胞である確率が高い。したがって、胎児細胞マーキング工程及び胎児細胞単離工程によって、妊娠母体から採取された末梢血に由来する血液細胞集団から、高確率で胎児細胞が単離される。   Since HBG, ALAS2, HEMGN, C9orf5, GYPB, SLC1A5, EIF1AY, C4orf3, IGF2, GYPE, CLIC6, and DDX3Y are highly expressed in human umbilical cord blood compared to human adult bone marrow blood, at least 12 kinds of antibodies The two types of positive cells have a high probability of being fetal cells. Therefore, fetal cells are isolated with high probability from the blood cell population derived from peripheral blood collected from the pregnant mother by the fetal cell marking step and the fetal cell isolation step.

胎児細胞マーキング工程は、12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体を血液細胞集団に接触させて少なくとも2種の抗体で細胞をマーキングする工程であり、抗体を血液細胞集団に接触させる方法は制限されない。抗体と血液細胞集団との接触は、例えば、血液細胞集団の細胞懸濁液に抗体を添加し、又は、抗体を含有するリン酸緩衝液若しくは生理食塩水に血液細胞集団を添加し、4℃〜室温で30分間〜120分間インキュベートすることによって行われる。12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体は、血液細胞集団に、同時に接触させてもよく、順次接触させてもよい。12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体の一部又は全部が、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、磁気ビーズ等で標識されていない場合には、これら抗体に対する標識化二次抗体を、血液細胞集団にさらに接触させてもよい。二次抗体の標識としては、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、磁気ビーズ等が挙げられる。   The fetal cell marking step is a step in which at least two types of antibodies selected from 12 types of antibodies are brought into contact with the blood cell population, and the cells are marked with at least two types of antibodies. Not limited. The contact between the antibody and the blood cell population may be performed by, for example, adding the antibody to a cell suspension of the blood cell population or adding the blood cell population to a phosphate buffer or physiological saline containing the antibody at 4 ° C. Performed by incubating at room temperature for 30 minutes to 120 minutes. At least two antibodies selected from 12 types of antibodies may be contacted simultaneously or sequentially with the blood cell population. When some or all of at least two kinds of antibodies selected from 12 kinds of antibodies are not labeled with a fluorescent dye, fluorescent protein, enzyme, biotin, magnetic beads, etc., labeled secondary antibodies for these antibodies are used. The blood cell population may be further contacted. Examples of secondary antibody labels include fluorescent dyes, fluorescent proteins, enzymes, biotin, and magnetic beads.

胎児細胞マーキング工程において抗体を接触させる血液細胞集団は、抗体が細胞膜を通過して細胞質に至ることを可能にする目的で、細胞膜透過処理を施された血液細胞集団であることが好ましい。細胞膜透過処理は、例えば、TritonX100等の界面活性剤を含有するリン酸緩衝液又は生理食塩水と、血液細胞集団とを混合し、4℃〜室温で1分間〜30分間インキュベートすることによって行われる。血液細胞集団に細胞膜透過処理を施す場合、血液細胞集団は、細胞内からタンパク質が失われることを抑制する目的で、細胞膜透過処理の前に固定化処理を施された血液細胞集団であることが好ましい。細胞の固定化処理は、例えば、グルタルアルデヒドを含有するリン酸緩衝液又は生理食塩水と、血液細胞集団とを混合し、4℃〜室温で1分間〜30分間インキュベートすることによって行われる。   The blood cell population to which the antibody is contacted in the fetal cell marking step is preferably a blood cell population that has been subjected to cell membrane permeabilization for the purpose of allowing the antibody to pass through the cell membrane and reach the cytoplasm. The cell membrane permeabilization treatment is performed, for example, by mixing a phosphate buffer solution or physiological saline containing a surfactant such as Triton X100 with a blood cell population and incubating at 4 ° C. to room temperature for 1 to 30 minutes. . When a blood cell population is subjected to a cell membrane permeabilization treatment, the blood cell population may be a blood cell population that has been subjected to an immobilization treatment prior to the cell membrane permeation treatment for the purpose of suppressing protein loss from within the cells. preferable. The cell immobilization treatment is performed, for example, by mixing a phosphate buffer solution or physiological saline containing glutaraldehyde and a blood cell population and incubating at 4 ° C. to room temperature for 1 to 30 minutes.

胎児細胞単離工程は、少なくとも2種の抗体でマーキングされた細胞を単離する工程であり、単離する方法は制限されない。
胎児細胞マーキング工程に用いる抗体(12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体、又は、これら抗体に対する二次抗体)が、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、磁気ビーズ等で標識された標識化抗体である場合には、その標識に応じた光学的方法、化学的方法、電気的方法、又は磁気的方法によって胎児細胞単離工程が行われる。胎児細胞単離工程は、効率の観点から、フローサイトメトリーによって行うことが好ましく、したがって、胎児細胞マーキング工程に用いる抗体(12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体、又は、これら抗体に対する二次抗体)は、蛍光色素、蛍光タンパク質、又はビオチンで標識された抗体であることが好ましい。
The fetal cell isolation step is a step of isolating cells marked with at least two kinds of antibodies, and the isolation method is not limited.
A label in which an antibody (at least two kinds of antibodies selected from 12 kinds of antibodies or a secondary antibody to these antibodies) used in the fetal cell marking step is labeled with a fluorescent dye, fluorescent protein, enzyme, biotin, magnetic beads, etc. In the case of an antibody, the fetal cell isolation step is performed by an optical method, a chemical method, an electrical method, or a magnetic method according to the label. The fetal cell isolation step is preferably performed by flow cytometry from the viewpoint of efficiency. Therefore, antibodies used in the fetal cell marking step (at least two antibodies selected from twelve antibodies, or two antibodies against these antibodies). The secondary antibody) is preferably an antibody labeled with a fluorescent dye, fluorescent protein, or biotin.

[有核赤血球濃縮工程]
胎児細胞マーキング工程において抗体を接触させる血液細胞集団は、妊娠母体から採取された末梢血から、有核赤血球を多く含む集団に濃縮された細胞集団であることが好ましい。したがって、本開示の単離方法は、さらに、末梢血を密度勾配遠心分離に供して有核赤血球を含む画分を得る工程(「有核赤血球濃縮工程」という。)を有し、この有核赤血球を含む画分が、胎児細胞マーキング工程における血液細胞集団であることが好ましい。
[Nucleated red blood cell concentration step]
The blood cell population to which the antibody is contacted in the fetal cell marking step is preferably a cell population concentrated from peripheral blood collected from a pregnant mother to a population rich in nucleated red blood cells. Therefore, the isolation method of the present disclosure further includes a step of subjecting peripheral blood to density gradient centrifugation to obtain a fraction containing nucleated red blood cells (referred to as a “nucleated red blood cell concentration step”). It is preferable that the fraction containing erythrocytes is a blood cell population in the fetal cell marking step.

有核赤血球は、密度勾配遠心分離により、血液中に存在する血漿成分やその他の血液細胞と分離され得る。有核赤血球を分離するための密度勾配遠心分離は、公知の方法を適用してよい。例えば、密度の異なる2種類の媒体を遠沈管に重層した不連続密度勾配の上に、生理食塩水で希釈した血液を重層して遠心を行うことにより、有核赤血球を分画し濃縮できる。   Nucleated red blood cells can be separated from plasma components and other blood cells present in the blood by density gradient centrifugation. A known method may be applied to density gradient centrifugation for separating nucleated red blood cells. For example, nucleated red blood cells can be fractionated and concentrated by layering and centrifuging blood diluted with physiological saline on a discontinuous density gradient in which two types of media having different densities are layered on a centrifuge tube.

国際公開第2012/023298号に、胎児の有核赤血球を含めた母体の血球の密度が記載されている。その記載によると、想定される胎児の有核赤血球の密度は、1.065g/mL〜1.095g/mL程度、母親の血球の密度は、赤血球が1.070g/mL〜1.120g/mL程度、好酸球が1.090g/mL〜1.110g/mL程度、好中球が1.075g/mL〜1.100g/mL程度、好塩基球が1.070g/mL〜1.080g/mL程度、リンパ球が1.060g/mL〜1.080g/mL程度、単球が1.060g/mL〜1.070g/mL程度である。   WO 2012/023298 describes the density of maternal blood cells including fetal nucleated red blood cells. According to the description, the expected density of fetal nucleated red blood cells is about 1.065 g / mL to 1.095 g / mL, and the density of mother's blood cells is about 1.070 g / mL to 1.120 g / mL of red blood cells. About 1.090 g / mL to 1.110 g / mL for spheres, about 1.075 g / mL to 1.100 g / mL for neutrophils, about 1.070 g / mL to 1.080 g / mL for basophils, 1.060 g / mL for lymphocytes About 1.080 g / mL and monocytes are about 1.060 g / mL to 1.070 g / mL.

密度1.065g/mL〜1.095g/mL程度の胎児の有核赤血球を、ほかの血液細胞と分離するために、積層する媒体の密度が設定される。胎児の有核赤血球の中心の密度は1.080g/mL程度であるため、この密度をはさむ2つの異なる密度の媒体を隣接して重層することで、その界面に胎児の有核赤血球を有する画分を集めることが可能となる。好ましくは、下層の媒体の密度を1.08g/mL〜1.10g/mL(より好ましくは1.080g/mL〜1.095g/mL)、上層の媒体の密度を1.06g/mL〜1.08g/mL(より好ましくは1.065g/mL〜1.080g/mL)とする。本開示の単離方法においては、下層の媒体と上層の媒体は同じ種類でも異なる種類でもよく、同じ種類の媒体を用いることが好ましい。   In order to separate fetal nucleated red blood cells having a density of about 1.065 g / mL to 1.095 g / mL from other blood cells, the density of the medium to be stacked is set. Since the density of the center of fetal nucleated red blood cells is about 1.080 g / mL, a fraction having fetal nucleated red blood cells at its interface can be obtained by layering two different density media adjacent to each other. It becomes possible to collect. Preferably, the density of the lower layer medium is 1.08 g / mL to 1.10 g / mL (more preferably 1.080 g / mL to 1.095 g / mL), and the density of the upper layer medium is 1.06 g / mL to 1.08 g / mL (more Preferably, it is 1.065 g / mL to 1.080 g / mL. In the isolation method of the present disclosure, the lower layer medium and the upper layer medium may be of the same type or different types, and the same type of medium is preferably used.

媒体としては、ポリビニルピロリドンでコートされた直径15nm〜30nmのケイ酸コロイド粒子分散液であるPercoll(登録商標)、ショ糖から作られた側鎖に富んだ中性の親水性ポリマーであるFicoll-Paque(登録商標)、ポリスクロースとジアトリゾ酸ナトリウムを含むHistopaque(登録商標)等が挙げられる。本開示の単離方法においては、Percoll及び/又はHistopaqueを使用することが好ましい。Percollは、密度1.130g/mLの製品が市販されており、水で希釈することで密度勾配を調製することが可能である。Histopaqueは、市販されている密度1.077g/mLの媒体及び密度1.119g/mLの媒体と水とを用いて密度勾配を調製することが可能である。   As the medium, Percoll (registered trademark), which is a dispersion of 15 to 30 nm in diameter of silicate colloid coated with polyvinylpyrrolidone, Ficoll-, which is a neutral hydrophilic polymer rich in side chains made from sucrose, is used. Examples include Paque (registered trademark), Histopaque (registered trademark) containing polysucrose and sodium ditrizoate. In the isolation method of the present disclosure, it is preferable to use Percoll and / or Histopaque. Percoll has a commercial product with a density of 1.130 g / mL, and it is possible to prepare a density gradient by diluting with water. Histopaque can prepare density gradients using commercially available media with a density of 1.077 g / mL and media with a density of 1.119 g / mL and water.

2層の不連続密度勾配は、例えば以下のようにして遠沈管に形成する。まず、凝固点以上かつ14℃以下(好ましくは8℃以下)の温度状態にある下層の媒体を遠沈管の底部に収容する、又は、下層の媒体を遠沈管の底部に収容したのち14℃以下(好ましくは8℃以下)の温度下で保存して冷却する。次に、下層の媒体の上に上層の媒体を重層する。   The two-layer discontinuous density gradient is formed in the centrifuge tube as follows, for example. First, the lower layer medium in a temperature state not lower than the freezing point and not higher than 14 ° C. (preferably not higher than 8 ° C.) is accommodated in the bottom part of the centrifuge tube, or after the lower layer medium is accommodated in the bottom part of the centrifuge tube, It is preferably stored and cooled at a temperature of 8 ° C. or lower. Next, the upper layer medium is overlaid on the lower layer medium.

[白血球マーキング工程、白血球除外工程]
本開示の単離方法は、赤血球の単離効率を向上させる観点から、さらに、
抗CD45抗体を血液細胞集団に接触させて抗CD45抗体で細胞をマーキングする工程(「白血球マーキング工程」という。)と、
血液細胞集団から、抗CD45抗体でマーキングされていない細胞を単離する工程(「白血球除外工程」という。)と、を有することが好ましい。
[Leukocyte marking process, leukocyte exclusion process]
From the viewpoint of improving the isolation efficiency of red blood cells, the isolation method of the present disclosure further includes
A step of contacting an anti-CD45 antibody with a blood cell population and marking the cell with the anti-CD45 antibody (referred to as a “leukocyte marking step”);
Preferably, a step of isolating cells that are not marked with an anti-CD45 antibody from the blood cell population (referred to as a “leukocyte exclusion step”).

白血球共通抗原であるCD45は、白血球全般、即ち、好酸球、好中球、好塩基球、単球、及びリンパ球に発現していることから、血液細胞集団に含まれるCD45陰性細胞は、赤血球である確率が高い。したがって、白血球マーキング工程及び白血球除外工程によって、妊娠母体から採取された末梢血に由来する血液細胞集団から、高確率で赤血球が単離される。   Since CD45, which is a leukocyte common antigen, is expressed on leukocytes in general, ie, eosinophils, neutrophils, basophils, monocytes, and lymphocytes, CD45 negative cells contained in the blood cell population are: There is a high probability that it is a red blood cell. Therefore, red blood cells are isolated with high probability from the blood cell population derived from peripheral blood collected from the pregnant mother by the leukocyte marking step and the leukocyte exclusion step.

白血球マーキング工程は、抗CD45抗体を血液細胞集団に接触させて抗CD45抗体で細胞をマーキングする工程であり、抗CD45抗体を血液細胞集団に接触させる方法は制限されない。抗CD45抗体と血液細胞集団との接触は、例えば、血液細胞集団の細胞懸濁液に抗CD45抗体を添加し、又は、抗CD45抗体を含有するリン酸緩衝液若しくは生理食塩水に血液細胞集団を添加し、4℃〜室温で30分間〜120分間インキュベートすることによって行われる。白血球マーキング工程は、胎児細胞マーキング工程と同時に行ってもよく、胎児細胞マーキング工程の前又は後に行ってもよい。胎児細胞マーキング工程と白血球マーキング工程との同時実施は、例えば、血液細胞集団の細胞懸濁液に、12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体及び抗CD45抗体を添加する、又は、12種の抗体から選ばれる少なくとも2種の抗体及び抗CD45抗体を含有するリン酸緩衝液若しくは生理食塩水に、血液細胞集団を添加することによって行われる。   The leukocyte marking step is a step in which an anti-CD45 antibody is brought into contact with the blood cell population and the cells are marked with the anti-CD45 antibody, and the method of bringing the anti-CD45 antibody into contact with the blood cell population is not limited. The contact between the anti-CD45 antibody and the blood cell population is, for example, adding the anti-CD45 antibody to a cell suspension of the blood cell population, or the blood cell population in a phosphate buffer or physiological saline containing the anti-CD45 antibody. And is incubated at 4 ° C. to room temperature for 30 minutes to 120 minutes. The leukocyte marking step may be performed simultaneously with the fetal cell marking step, or may be performed before or after the fetal cell marking step. For example, the fetal cell marking step and the leukocyte marking step may be performed simultaneously by adding at least two antibodies selected from 12 antibodies and an anti-CD45 antibody to a cell suspension of a blood cell population, or 12 This is carried out by adding a blood cell population to a phosphate buffer or physiological saline containing at least two antibodies selected from these antibodies and an anti-CD45 antibody.

抗CD45抗体は、白血球除外工程を光学的方法、化学的方法、電気的方法、又は磁気的方法によって行う観点から、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、又は磁気ビーズ等で標識された標識化抗体であることが好ましく、白血球除外工程をフローサイトメトリーによって行う観点から、蛍光色素、蛍光タンパク質、又はビオチンで標識された抗体であることが好ましい。   The anti-CD45 antibody is labeled with a fluorescent dye, fluorescent protein, enzyme, biotin, magnetic beads or the like from the viewpoint of performing the leukocyte exclusion step by an optical method, a chemical method, an electrical method, or a magnetic method. From the viewpoint of performing the leukocyte exclusion step by flow cytometry, an antibody labeled with a fluorescent dye, a fluorescent protein, or biotin is preferable.

白血球除外工程は、抗CD45抗体の標識に応じた光学的方法、化学的方法、電気的方法、又は磁気的方法によって行われる。白血球除外工程は、胎児細胞単離工程の前に行ってもよく、胎児細胞単離工程の後に行ってもよい。   The leukocyte exclusion step is performed by an optical method, a chemical method, an electrical method, or a magnetic method according to the labeling of the anti-CD45 antibody. The leukocyte exclusion step may be performed before the fetal cell isolation step or after the fetal cell isolation step.

[細胞核染色工程、有核細胞単離工程]
本開示の単離方法は、有核細胞の単離効率を向上させる観点から、さらに、
核染色色素を血液細胞集団に接触させて細胞核を染色する工程(「細胞核染色工程」という。)と、
血液細胞集団から、核染色色素によって核が染色された有核細胞を単離する工程(「有核細胞単離工程」という。)と、を有することが好ましい。
[Cell nucleus staining process, nucleated cell isolation process]
From the viewpoint of improving the isolation efficiency of nucleated cells, the isolation method of the present disclosure further includes:
A step of staining a cell nucleus by contacting a nuclear staining dye with a blood cell population (referred to as a “cell nucleus staining step”);
It is preferable to have a step of isolating nucleated cells whose nuclei are stained with a nuclear staining dye (referred to as “nucleated cell isolation step”) from a blood cell population.

細胞核染色工程及び有核細胞単離工程によって、妊娠母体から採取された末梢血に由来する血液細胞集団から、高確率で有核細胞が単離される。   Nucleated cells are isolated with high probability from a blood cell population derived from peripheral blood collected from a pregnant mother by the cell nucleus staining step and the nucleated cell isolation step.

細胞核染色工程は、核染色色素を血液細胞集団に接触させて細胞核を染色する工程であり、核染色色素を血液細胞集団に接触させる方法は制限されない。核染色色素と血液細胞集団との接触は、例えば、血液細胞集団の細胞懸濁液に核染色色素を添加し、又は、核染色色素を含有するリン酸緩衝液若しくは生理食塩水に血液細胞集団を添加し、4℃〜室温で30分間〜120分間インキュベートすることによって行われる。細胞核染色工程は、胎児細胞マーキング工程の前に行ってもよく、胎児細胞マーキング工程の後かつ胎児細胞単離工程の前に行ってもよく、胎児細胞単離工程の後に行ってもよい。本開示の単離方法が白血球マーキング工程及び白血球除外工程を有する場合、細胞核染色工程は、白血球マーキング工程の前に行ってもよく、白血球マーキング工程の後かつ白血球除外工程の前に行ってもよく、白血球除外工程の後に行ってもよい。   The cell nucleus staining step is a step of staining a cell nucleus by bringing a nucleus staining dye into contact with a blood cell population, and a method for contacting the nucleus staining dye with a blood cell population is not limited. The contact between the nuclear staining dye and the blood cell population can be achieved, for example, by adding the nuclear staining dye to the cell suspension of the blood cell population, or in the phosphate buffer or physiological saline containing the nuclear staining dye. And is incubated at 4 ° C. to room temperature for 30 minutes to 120 minutes. The cell nucleus staining step may be performed before the fetal cell marking step, may be performed after the fetal cell marking step and before the fetal cell isolation step, or may be performed after the fetal cell isolation step. When the isolation method of the present disclosure includes a leukocyte marking step and a leukocyte exclusion step, the cell nucleus staining step may be performed before the leukocyte marking step, or after the leukocyte marking step and before the leukocyte exclusion step. It may be performed after the leukocyte exclusion step.

核染色色素としては、クロマチン、核タンパク質、DNA等を染色する色素のいずれでもよく、具体的には、DAPI(4',6-diamidino-2-phenylindole)、ヨウ化プロピジウム、7−AAD(7-Amino-Actinomycin D)、ヘキスト33342、DRAQ5、メチレンブルー、ヘマトキシリン、チオニン等が挙げられる。   The nuclear staining dye may be any dye that stains chromatin, nucleoprotein, DNA, and the like. Specifically, DAPI (4 ′, 6-diamidino-2-phenylindole), propidium iodide, 7-AAD (7 -Amino-Actinomycin D), Hoechst 33342, DRAQ5, methylene blue, hematoxylin, thionine and the like.

核染色色素が非蛍光色素の場合、有核細胞単離工程は、例えば、細胞集団を光学顕微鏡で観察し、核が染色された細胞を単離することにより行われる。
核染色色素が蛍光色素の場合、有核細胞単離工程は、例えば、フローサイトメトリーにより行われる。
When the nuclear staining dye is a non-fluorescent dye, the nucleated cell isolation step is performed, for example, by observing a cell population with an optical microscope and isolating cells with stained nuclei.
When the nuclear staining dye is a fluorescent dye, the nucleated cell isolation step is performed, for example, by flow cytometry.

有核細胞単離工程は、胎児細胞単離工程の前に行ってもよく、胎児細胞単離工程の後に行ってもよい。本開示の単離方法が白血球マーキング工程及び白血球除外工程を有する場合、有核細胞単離工程は、白血球除外工程の前に行ってもよく、白血球除外工程の後に行ってもよい。   The nucleated cell isolation step may be performed before the fetal cell isolation step or after the fetal cell isolation step. When the isolation method of the present disclosure includes a leukocyte marking step and a leukocyte exclusion step, the nucleated cell isolation step may be performed before the leukocyte exclusion step or after the leukocyte exclusion step.

本開示の単離方法の一例としては、胎児細胞マーキング工程、白血球マーキング工程、細胞核染色工程、胎児細胞単離工程、白血球除外工程、及び有核細胞単離工程を有し、胎児細胞マーキング工程及び白血球マーキング工程を行い(その順番は制限されない)、次いで細胞核染色工程を行い、次いで3つの単離工程をフローサイトメトリーによって順次行う(その順番は制限されない)実施形態が挙げられる。本実施形態例によれば、胎児の有核赤血球を効率よく単離することができる。   Examples of the isolation method of the present disclosure include a fetal cell marking step, a leukocyte marking step, a cell nucleus staining step, a fetal cell isolation step, a leukocyte exclusion step, and a nucleated cell isolation step, Examples include performing a leukocyte marking step (the order is not limited), followed by a cell nucleus staining step, followed by three isolation steps sequentially by flow cytometry (the order is not limited). According to this embodiment, fetal nucleated red blood cells can be isolated efficiently.

<胎児の出生前遺伝学的検査方法>
本開示の検査方法は、妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離し、単離された胎児細胞から染色体DNAを入手して行う、胎児の出生前遺伝学的検査の方法である。本開示の検査方法は、ヒト個体が生来的に保有する遺伝情報を明らかにする検査であり、例えば、染色体の異数性の有無の検出、遺伝子多型の検出、及び、遺伝子変異の検出の少なくともいずれかを行う検査である。本開示の検査方法は、例えば、13番染色体、18番染色体、及び21番染色体のトリソミー;性染色体の過剰;等の染色体の異数性の有無の検出に適用される。
<Prenatal genetic testing methods for fetuses>
The test method of the present disclosure is a method for prenatal genetic testing of a fetus that is performed by isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother and obtaining chromosomal DNA from the isolated fetal cells. The test method of the present disclosure is a test for clarifying genetic information inherently possessed by a human individual. For example, detection of the presence or absence of chromosome aneuploidy, detection of gene polymorphism, and detection of gene mutation It is an inspection that performs at least one of them. The test method of the present disclosure is applied to detection of the presence or absence of chromosome aneuploidy such as, for example, trisomy of chromosomes 13, 18, and 21; excess of sex chromosomes;

本開示の検査方法は、公知の遺伝子検査の方法、及び公知の遺伝子解析技術を適用して実施してよい。本開示の検査方法は、染色体DNAの解析を容易にする目的で、胎児細胞から全ゲノム増幅(whole genome amplification;WGA)を行う工程を有することが好ましい。さらに、本開示の検査方法は、例えば、全ゲノム増幅の増幅産物を鋳型にして、染色体上の目的領域をポリメラーゼ連鎖反応(polymerase chain reaction;PCR)により増幅する増幅工程と、増幅した目的領域の塩基配列及び量を決定する配列解析工程と、を有することが好ましい。以下、上記の工程を説明することによって、本開示の検査方法の実施形態例を詳細に説明する。   The testing method of the present disclosure may be performed by applying a known genetic testing method and a known genetic analysis technique. The test method of the present disclosure preferably includes a step of performing whole genome amplification (WGA) from fetal cells for the purpose of facilitating analysis of chromosomal DNA. Furthermore, the inspection method of the present disclosure includes, for example, an amplification step of amplifying a target region on a chromosome by a polymerase chain reaction (PCR) using an amplification product of whole genome amplification as a template, and the amplified target region. And a sequence analysis step for determining the base sequence and amount. Hereinafter, an exemplary embodiment of the inspection method of the present disclosure will be described in detail by describing the above-described steps.

[全ゲノム増幅]
全ゲノム増幅の方法は、特に制限されず、公知の方法で行ってよい。全ゲノム増幅は、例えば、界面活性剤とタンパク質分解酵素とを用いて細胞を溶解させる工程と、細胞から溶出したゲノムDNAを鋳型にしてDNAポリメラーゼによってDNAを増幅する工程と、を有する。
[Whole genome amplification]
The method of whole genome amplification is not particularly limited, and may be performed by a known method. Whole genome amplification has, for example, a step of lysing cells using a surfactant and a proteolytic enzyme, and a step of amplifying DNA by DNA polymerase using genomic DNA eluted from the cells as a template.

全ゲノム増幅は、市販の試薬を適用して行ってよい。PCRに基づく試薬としては、例えば、PicoPLEX WGA Kit(New England Biolabs社)、GenomePlex Single Cell Whole Genome Amplification Kit(Sigma-Aldrich社)、国際公開第2012/166425号に開示のMALBAC法(Multiple Annealing and Looping-Based Amplification Cycles)に係る試薬が挙げられる。鎖置換型DNA合成反応に基づく試薬としては、例えば、GenomiPhi DNA Amplification Kit(GEヘルスケア社、GenomiPhiは登録商標)、REPLI-g Single Cell Kit(QIAGEN社、REPLI-gは登録商標)が挙げられる。   Whole genome amplification may be performed by applying commercially available reagents. Examples of the PCR-based reagent include PicoPLEX WGA Kit (New England Biolabs), GenomePlex Single Cell Whole Genome Amplification Kit (Sigma-Aldrich), and MALBAC method (Multiple Annealing and Looping disclosed in International Publication No. 2012/166425). -Based Amplification Cycles). Examples of the reagent based on the strand displacement type DNA synthesis reaction include GenomiPhi DNA Amplification Kit (GE Healthcare, GenomiPhi is a registered trademark) and REPLI-g Single Cell Kit (QIAGEN, REPLI-g is a registered trademark). .

全ゲノム増幅は、その終了後にアガロースゲル電気泳動を行って、増幅の有無を確認することが好ましい。全ゲノム増幅の増幅産物は、精製することが好ましい。精製は、例えば、QIAquick PCR Purification Kit(QIAGEN社、QIAquickは登録商標)を用いて行う。増幅産物の量は、例えば、NanoDrop(登録商標、Thermo Fisher Scientific社)、BioAnalyzer(Agilent社)、Quantus Fluorometer(Promega社)を用いて濃度を測定することで確認し得る。   It is preferable to confirm the presence or absence of amplification by performing agarose gel electrophoresis after the completion of whole genome amplification. The amplification product of whole genome amplification is preferably purified. Purification is performed using, for example, a QIAquick PCR Purification Kit (QIAGEN, QIAquick is a registered trademark). The amount of the amplification product can be confirmed by measuring the concentration using, for example, NanoDrop (registered trademark, Thermo Fisher Scientific), BioAnalyzer (Agilent), or Quantus Fluorometer (Promega).

[PCRによる目的領域の増幅工程]
本増幅工程は、全ゲノム増幅で得た増幅産物を鋳型にして、目的領域をPCRにより増幅する工程である。目的領域(増幅される領域)は、遺伝学的検査の目的に応じて選択される、染色体上の領域である。PCRに使用するプライマー対の塩基配列は、目的領域の塩基配列とシークエンサーの解析原理とに従って設計される。増幅工程は、染色体上の複数の領域を解析する目的で、複数のプライマー対を用いて複数の目的領域の多重増幅を行う多重PCR(マルチプレックスPCR)としてもよい。増幅工程は、シークエンサーの解析原理に従って、PCRを1回行ってもよく2回以上行ってもよい。
[Amplification process of target region by PCR]
This amplification step is a step of amplifying the target region by PCR using the amplification product obtained by whole genome amplification as a template. The target region (region to be amplified) is a region on the chromosome that is selected according to the purpose of genetic testing. The base sequence of the primer pair used for PCR is designed according to the base sequence of the target region and the analysis principle of the sequencer. The amplification step may be multiplex PCR (multiplex PCR) for performing multiplex amplification of a plurality of target regions using a plurality of primer pairs for the purpose of analyzing a plurality of regions on the chromosome. In the amplification step, PCR may be performed once or two or more times according to the analysis principle of the sequencer.

PCR試薬としては、例えば、Multiplex PCR Assay Kit(タカラバイオ社)、Multiplex PCR Assay Kit ver2(タカラバイオ社)、KAPA Library Amplification Kit(日本ジェネティクス社)、Platinum Multiplex PCR Master Mix Kit(ライフテクノロジーズ社、Platinumは登録商標)が挙げられる。マルチプレックスPCRを行う場合には、プライマー対ごとにアニーリングの至適温度が異なることがあるため、反応条件の検討をすることが好ましい。PCRのサイクル数は、リアルタイムPCRによる検討を予め行って、その結果に基づき設定してよい。PCRは、その途中で、反応温度及び/又は反応時間を変更してもよい。   PCR reagents include, for example, Multiplex PCR Assay Kit (Takara Bio), Multiplex PCR Assay Kit ver2 (Takara Bio), KAPA Library Amplification Kit (Nippon Genetics), Platinum Multiplex PCR Master Mix Kit (Life Technologies, Platinum is a registered trademark). When performing multiplex PCR, it is preferable to examine the reaction conditions because the optimum temperature for annealing may differ for each primer pair. The number of cycles of PCR may be set based on the result of a pre-examination by real-time PCR. PCR may change reaction temperature and / or reaction time in the middle.

増幅工程で得た増幅産物は、精製することが好ましく、精製は、例えば、QIAquick PCR Purification Kit(QIAGEN社)、AMPure XP Kit(BECKMAN COULTER社)を用いて行う。増幅産物の量は、例えば、NanoDrop(Thermo Fisher Scientific社)、BioAnalyzer(Agilent社)、Quantus Fluorometer(Promega社)、KAPA Library Quantification Kits(日本ジェネティクス社)を用いて濃度を測定することで確認し得る。   The amplification product obtained in the amplification step is preferably purified, and purification is performed using, for example, QIAquick PCR Purification Kit (QIAGEN) or AMPure XP Kit (BECKMAN COULTER). The amount of amplification product is confirmed by measuring the concentration using, for example, NanoDrop (Thermo Fisher Scientific), BioAnalyzer (Agilent), Quantus Fluorometer (Promega), KAPA Library Quantification Kits (Nippon Genetics). obtain.

[配列解析工程]
配列解析工程は、増幅された目的領域の塩基配列と量とを決定する工程である。配列解析工程は、各種のシークエンサーによって行われる。PCRによる増幅工程で得た増幅産物の全部又は一部が、配列解析工程でシークエンサーにかけられる物質であり、PCRによる増幅工程で得た増幅産物が、いわばシークエンス用ライブラリである。
[Sequence analysis process]
The sequence analysis step is a step of determining the base sequence and amount of the amplified target region. The sequence analysis step is performed by various sequencers. All or part of the amplification product obtained in the amplification step by PCR is a substance that can be applied to the sequencer in the sequence analysis step, and the amplification product obtained in the amplification step by PCR is a sequence library.

配列解析工程は、解析の精度及び速さ、1度に処理可能な試料数の多さ等の点で、次世代シークエンサーによって行われることが好ましい。次世代シークエンサー(Next Generation Sequencer;NGS)とは、サンガー法を利用したキャピラリーシークエンサー(第一世代シークエンサーと呼ばれる)に対比して分類されるシークエンサーを意味する。次世代シークエンサーは、第二世代、第三世代、第四世代、及び今後開発されるシークエンサーを含む。現時点で最も普及している次世代シークエンサーは、DNAポリメラーゼによる相補鎖合成又はDNAリガーゼによる相補鎖結合に連動した蛍光又は発光をとらえ塩基配列を決定する原理のシークエンサーである。具体的には、MiSeq(Illumina社)、HiSeq2000(Illumina社、HiSeqは登録商標)、Roche454(Roche社)等が挙げられる。   The sequence analysis step is preferably performed by a next-generation sequencer in terms of the accuracy and speed of analysis, the number of samples that can be processed at one time, and the like. The next generation sequencer (NGS) means a sequencer classified in comparison with a capillary sequencer (called a first generation sequencer) using the Sanger method. Next generation sequencers include second generation, third generation, fourth generation, and sequencers that will be developed in the future. The most popular next-generation sequencer at present is a sequencer based on the principle of determining a base sequence by capturing fluorescence or light emission linked to complementary strand synthesis by DNA polymerase or complementary strand binding by DNA ligase. Specific examples include MiSeq (Illumina), HiSeq2000 (Illumina, HiSeq is a registered trademark), Roche454 (Roche).

シークエンサーで得られた配列データをアライメントする手段としては、Burrows-Wheeler Aligner(BWA)が挙げられ、BWAによって既知のヒトゲノム配列へ配列データをマッピングすることが好ましい。遺伝子を解析する手段としては、SAMtools及びBEDtoolsが挙げられ、これらの解析手段により遺伝子多型、遺伝子変異、及び/又は染色体数を解析することが好ましい。   Burrows-Wheeler Aligner (BWA) is mentioned as a means for aligning the sequence data obtained by the sequencer, and it is preferable to map the sequence data to a known human genome sequence by BWA. Examples of means for analyzing genes include SAMtools and BEDtools, and it is preferable to analyze gene polymorphisms, gene mutations, and / or chromosome numbers by these analysis means.

配列解析工程で解析した、増幅された目的領域の塩基配列と量とから、染色体の異数性の有無、遺伝子多型、及び/又は遺伝子変異が検出される。染色体の異数性の検出方法の一例を、以下に説明する。   Presence / absence of chromosome aneuploidy, gene polymorphism, and / or gene mutation are detected from the base sequence and amount of the amplified target region analyzed in the sequence analysis step. An example of a method for detecting chromosome aneuploidy will be described below.

胎児の有核赤血球から得た染色体について、増幅産物の量をシークエンサーで解析する。基準(あるいは参照)として、母親の細胞から得た染色体について、増幅産物の量をシークエンサーで解析する。胎児が染色体の異数性を有しなければ、母親由来の増幅産物の量と胎児由来の増幅産物の量とは、ほぼ1:1の量比になると予想される。増幅領域が位置する染色体が胎児においてトリソミーである場合には、母親由来の増幅産物の量と胎児由来の増幅産物の量とは、ほぼ1.0:1.5(あるいは2:3)の量比になると予想される。   For chromosomes obtained from fetal nucleated red blood cells, the amount of amplification product is analyzed with a sequencer. As a standard (or reference), the amount of amplification product is analyzed with a sequencer for chromosomes obtained from maternal cells. If the fetus has no chromosomal aneuploidy, it is expected that the amount of amplification product from the mother and the amount of amplification product from the fetus will be approximately 1: 1. When the chromosome in which the amplification region is located is trisomy in the fetus, the amount of the amplification product derived from the mother and the amount of the amplification product derived from the fetus are approximately 1.0: 1.5 (or 2: 3). Expected to be

以下に、実施例により発明の実施形態を詳細に説明するが、発明の実施形態は、これら実施例により限定されるものではない。   Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in detail by way of examples, but the embodiments of the present invention are not limited to these examples.

下記において、物質濃度に関し「M」はモル濃度を表し、1M=1mol/Lである。また、物質濃度に関し、特に断りのない限り「%」は「v/v%」である。   In the following, regarding the substance concentration, “M” represents a molar concentration, and 1M = 1 mol / L. Regarding the substance concentration, “%” is “v / v%” unless otherwise specified.

下記において、「EDTA」とは、エチレンジアミン四酢酸(ethylenediaminetetraacetic acid)を意味し、「BSA」とは、ウシ血清アルブミン(bovine serum albumin)を意味し、「PBS」とは、リン酸緩衝液(phosphate buffered saline)を意味、「PE」とは、フィコエリスリンを意味する。PBSは、特に断りのない限り、pH7.4である。   In the following, “EDTA” means ethylenediaminetetraacetic acid, “BSA” means bovine serum albumin, and “PBS” means phosphate buffer (phosphate). buffered saline), and “PE” means phycoerythrin. PBS has a pH of 7.4 unless otherwise noted.

<実施例1>
胎児細胞において発現頻度が高い遺伝子を探索する目的で、トランスクリプトーム解析を行った。
<Example 1>
Transcriptome analysis was performed for the purpose of searching for genes with high expression frequency in fetal cells.

[血液試料]
VERITAS社から、ヒト臍帯血(商品番号C−CB101)を購入した。
[Blood sample]
Human umbilical cord blood (product number C-CB101) was purchased from VERITAS.

抗凝固剤としてEDTAのナトリウム塩10.5mg入りの7mL採血管に、妊婦ボランティア2名からそれぞれ末梢血7.0mLを採取した。妊婦ボランティアからの採血は、インフォームドコンセントを得た上で行った。   As an anticoagulant, 7.0 mL of peripheral blood was collected from two pregnant volunteers in a 7 mL blood collection tube containing 10.5 mg of sodium salt of EDTA. Blood collection from pregnant volunteers was performed after obtaining informed consent.

血液はそれぞれ、生理食塩水を用いて2倍に希釈し、以下の工程に供した。   Each blood was diluted 2-fold with physiological saline and subjected to the following steps.

[全RNA抽出]
各血液からTotal RNAをNucleoSpin RNA Blood kit(MACHEREY-NAGEL社)を用いて回収した。Total RNAの回収量は、臍帯血(1.2mL)から2340ng、母体末梢血A(7.0mL)から5985ng、母体末梢血B(7.0mL)から5355ngであった。RNAの分解度を示すRIN値(RNA Integrity Number)は、それぞれ9.5(臍帯血)、7.9(母体末梢血A)、7.7(母体末梢血B)であり、顕著な分解がないことを確認した。
[Total RNA extraction]
Total RNA was collected from each blood using NucleoSpin RNA Blood kit (MACHEREY-NAGEL). The recovered amounts of total RNA were 2340 ng from cord blood (1.2 mL), 5985 ng from maternal peripheral blood A (7.0 mL), and 5355 ng from maternal peripheral blood B (7.0 mL). The RIN values (RNA Integrity Numbers) indicating the degree of degradation of RNA are 9.5 (umbilical cord blood), 7.9 (maternal peripheral blood A), and 7.7 (maternal peripheral blood B), respectively. Confirmed that there is no.

[RNAシークエンス解析]
シークエンス用ライブラリは、各血液から抽出したTotal RNA のうち1μgを出発材料とし、TruSeq RNA Sample Preparation Kit v2(Illumina社)を用いて調製した。調製したライブラリにおけるポリヌクレオチドの長さは382bp〜385bp(アダプター配列を含む)であった。シークエンス解析は次世代シークエンサーHiSeq2500(Illumina社)を用いて行い、リード長101bp、Paired-end、Multiplexにて配列情報を取得した。
[RNA sequence analysis]
The sequencing library was prepared using TruSeq RNA Sample Preparation Kit v2 (Illumina) using 1 μg of total RNA extracted from each blood as a starting material. The length of the polynucleotide in the prepared library was 382 bp to 385 bp (including the adapter sequence). Sequence analysis was performed using the next-generation sequencer HiSeq2500 (Illumina), and sequence information was obtained with a read length of 101 bp, Paired-end, and Multiplex.

[バイオインフォマティクス解析]
次世代シークエンサーにて得られた配列情報を、下記のフローに従い解析した。
[Bioinformatics analysis]
The sequence information obtained by the next generation sequencer was analyzed according to the following flow.

フロー:(1)リードデータのクオリティチェック、(2)リードデータのクリーニング、(3)poly-A/T tailの除去、(4)リファレンス配列にマッピング、(5)ジャンクション構造予測、(6)アセンブリング及び発現レベル比較 Flow: (1) Read data quality check, (2) Read data cleaning, (3) Removal of poly-A / T tail, (4) Mapping to reference sequence, (5) Junction structure prediction, (6) Assembly And expression level comparison

各フローの詳細は、下記のとおりである。
(1)リードデータのクオリティチェック、(2)リードデータのクリーニング
cutadaptプログラムによって、以下の手順で行った。
・3’端の混入してしまったアダプター配列を除去。
・3’端のクオリティ値が5未満の塩基の除去。
・クオリティの低いリードの除去。
・クオリティ値が5未満の塩基が全塩基の10%より多いリードの除去。
・Nが全塩基の10%より多いリードの除去。
・1種類の塩基が、「リードの全塩基数−3」個以上を占めているリードの除去。
・3’端に頻出する6bpのアダプター配列の除去。
・塩基長が20bp未満になったリードの除去。
・Paired-endのリードのみを抽出。
Details of each flow are as follows.
(1) Read data quality check, (2) Read data cleaning
The cutadapt program performed the following procedure.
-Remove the adapter sequence that has been contaminated at the 3 'end.
-Removal of bases with a quality value at the 3 'end of less than 5.
・ Removal of low quality leads.
-Removal of reads with more than 10% of all bases with a quality value of less than 5.
-Removal of reads where N is greater than 10% of total bases.
・ Removal of leads in which one type of base occupies more than “total number of bases −3”.
-Removal of a 6 bp adapter sequence that frequently appears at the 3 'end.
-Removal of reads whose base length is less than 20 bp.
-Extract only Paired-end leads.

(3)poly-A/T tailの除去
PRINSEQプログラムによって、以下の手順で行った。
・3’端又は5’端に10塩基以上連続するA又はTを除去。
・塩基長が20bp未満になったリードの除去。
・Paired-endのリードのみを抽出。
(3) Removal of poly-A / T tail
The PRINSEQ program was followed by the following procedure.
-Remove A or T that is 10 bases or more continuous at the 3 'end or 5' end.
-Removal of reads whose base length is less than 20 bp.
-Extract only Paired-end leads.

(4)リファレンス配列へのマッピング、(5)ジャンクション構造予測
TopHatプログラムを、コマンド「tophat -o $SAMPLE -G ref_genes.gtf -p 2 --solexa1.3-quals bowtie-indexed-genome fastq1 fastq2」にて実行した。
(4) Mapping to reference sequence, (5) Junction structure prediction
The TopHat program was executed with the command "tophat -o $ SAMPLE -G ref_genes.gtf -p 2 --solexa1.3-quals bowtie-indexed-genome fastq1 fastq2".

(6)アセンブリング及び発現レベル比較
Cufflinksプログラムを以下の手順で実行した。
・cufflinks:サンプルごとに転写物をアセンブリングする。ミトコンドリア由来転写物及びリボソーマルRNAを除去する。コマンド「cufflinks -o $SAMPLE -M mask.gtf -g ref_genes.gtf -b genome.fasta -u -p 2 $SAMPLE.bam」
・cuffmerge:全サンプルの転写物をマージして、コンセンサスな転写物を作成する。コマンド「cuffmerge -o merge_all -g ref_genes.gtf -s genome.fasta -p 8 gtflist」
・cuffcompare:サンプルごとの転写物とコンセンサス転写物とを比較する。コマンド「cuffcompare -o $SAMPLE -r merged.gtf $SAMPLE.transcripts.gtf」
・cuffquant:サンプルごとにコンセンサス転写物の発現レベルを算出する。コマンド「cuffquant -o $SAMPLE -b genome.fasta -u merged.gtf $SAMPLE.bam」
・cuffdiff:サンプル間で発現レベル及び構造を比較する。コマンド「cuffdiff merged.gtf $SAMPLE1.bam $SAMPLE2.bam -M mask.gtf -b genome.fasta -u -p 2 -o $GROUP1_$GROUP2 -L $GROUP1,$GROUP2」
・cummeRbund:cuffdiffの統計結果をグラフ化する。
(6) Assembly and expression level comparison
The Cufflinks program was executed in the following procedure.
Cufflinks: Assemble transcripts for each sample. Mitochondrial transcripts and ribosomal RNA are removed. Command `` cufflinks -o $ SAMPLE -M mask.gtf -g ref_genes.gtf -b genome.fasta -u -p 2 $ SAMPLE.bam ''
Cuffmerge: Merge transcripts from all samples to create a consensus transcript. Command `` cuffmerge -o merge_all -g ref_genes.gtf -s genome.fasta -p 8 gtflist ''
Cuffcompare: Compares the transcript for each sample with the consensus transcript. Command `` cuffcompare -o $ SAMPLE -r merged.gtf $ SAMPLE.transcripts.gtf ''
Cuffquant: Calculate the expression level of the consensus transcript for each sample. Command `` cuffquant -o $ SAMPLE -b genome.fasta -u merged.gtf $ SAMPLE.bam ''
Cuffdiff: Compare expression levels and structure between samples. Command `` cuffdiff merged.gtf $ SAMPLE1.bam $ SAMPLE2.bam -M mask.gtf -b genome.fasta -u -p 2 -o $ GROUP1_ $ GROUP2 -L $ GROUP1, $ GROUP2 ''
-CummeRbund: graphs the statistical results of cuffdiff.

[発現レベルの比較]
以上の解析の結果、臍帯血においては515,217種、母体末梢血Aにおいては583,632種、母体末梢血Bにおいては579,043種の転写物がアセンブルされ、コンセンサス転写物は631,932種であった。発現レベルをサンプル間で比較する指標として、FPKM(fragments per kilobase of exon per million fragments mapped)を用いた。コンセンサス転写物のうち、臍帯血と母体末梢血Aの間で15,157種の発現レベルを比較し、臍帯血と母体末梢血Bの間で14,436種の発現レベルを比較し、母体末梢血Aと母体末梢血Bの間で20,508種の発現レベルを比較した。臍帯血において特異的に発現している遺伝子の抽出を以下の手順で実施した。
[Comparison of expression levels]
As a result of the above analysis, 515,217 types of umbilical cord blood, 583,632 types of maternal peripheral blood A, 579,043 types of transcripts of maternal peripheral blood B were assembled, and 631,932 types of consensus transcripts. As an index for comparing the expression level between samples, FPKM (fragments per kilobase of exon per million fragments mapped) was used. Of the consensus transcripts, 15,157 expression levels were compared between umbilical cord blood and maternal peripheral blood A, 14,436 expression levels were compared between umbilical cord blood and maternal peripheral blood B, and maternal peripheral blood A and maternal blood. The expression levels of 20,508 species were compared among peripheral blood B. Extraction of a gene specifically expressed in cord blood was performed by the following procedure.

まず、下記の要件(a)と要件(b)を設定し、要件(a)を満たす転写物と要件(b)を満たす転写物を、臍帯血と母体末梢血Aの間と、臍帯血と母体末梢血Bの間とからそれぞれ抽出した。
・要件(a):FPKM値が、臍帯血で5以上且つ母体末梢血で0.1以下(臍帯血のみで発現が認められる)。
・要件(b):FPKM値が、臍帯血で200以上且つ母体末梢血で50以下(母体末梢血でも発現が認められるが、臍帯血で高発現している)。
First, the following requirement (a) and requirement (b) are set, and a transcript satisfying the requirement (a) and a transcript satisfying the requirement (b) are separated between the cord blood and the maternal peripheral blood A, and the cord blood. Extracted from between maternal peripheral blood B.
Requirement (a): FPKM value is 5 or more for cord blood and 0.1 or less for maternal peripheral blood (expression is observed only in cord blood).
Requirement (b): The FPKM value is 200 or more for umbilical cord blood and 50 or less for maternal peripheral blood (expressed in maternal peripheral blood but highly expressed in umbilical cord blood).

次に、抽出された遺伝子のうち、2グループに共通な転写物を抽出した。その結果、要件(a)を満たす遺伝子が68種、要件(b)を満たす遺伝子が123種、合計191種抽出された。191種の遺伝子のなかから、臍帯血のFPKM値が特に高く、且つ、遺伝子がコードするタンパク質に対する抗体が市販されている16種を選択した。この16種について、遺伝子がコードするタンパク質名とFPKM値とを表2に示す。   Next, among the extracted genes, transcripts common to two groups were extracted. As a result, 68 types of genes satisfying the requirement (a) and 123 types of genes satisfying the requirement (b) were extracted, a total of 191 types. Among 191 genes, 16 were selected which have a particularly high FPKM value in cord blood and are commercially available for antibodies against the protein encoded by the gene. Table 2 shows the names of proteins encoded by the genes and the FPKM values for these 16 species.

<実施例2>
実施例1において選択した16種のタンパク質に対する抗体を用いて、ヒト臍帯血とヒト成人骨髄血とから胎児細胞の単離を試みた。16種のタンパク質に対する抗体として、表3に示す抗体を用意した。
<Example 2>
Using antibodies against the 16 proteins selected in Example 1, fetal cells were isolated from human umbilical cord blood and human adult bone marrow blood. The antibodies shown in Table 3 were prepared as antibodies against 16 proteins.

[血液試料]
VERITAS社から、ヒト臍帯血(商品番号C−CB101)とヒト成人骨髄血(商品番号ABM001)を購入した。血液はそれぞれ、生理食塩水を用いて2倍に希釈し、以下の工程に供した。
[Blood sample]
Human umbilical cord blood (product number C-CB101) and human adult bone marrow blood (product number ABM001) were purchased from VERITAS. Each blood was diluted 2-fold with physiological saline and subjected to the following steps.

[密度勾配遠心分離による有核赤血球の濃縮]
Percoll液(登録商標、シグマアルドリッチ社製)と水を使用して、密度1.070g/mLの液と、密度1.095g/mLの液を調製した。遠沈管に密度1.095g/mLの液2mLを入れ、4℃下に30分間置き冷却した。次いで、密度1.095g/mLの液の上に、密度1.070g/mLの液2mLを、界面が乱れないようにゆっくり重層した。次いで、密度1.070g/mLの液の上に、希釈した血液11mLをゆっくり重層し、遠心分離を2000rpmで20分間行った。次いで、密度1.070g/mLの液と密度1.095g/mLの液の間に沈積した画分を、ピペットを用いて採取した。採取した画分を、洗浄液(2mM EDTA,0.1%BSA−PBS)にて2回洗浄し、有核赤血球を含む画分を得た。
[Concentration of nucleated red blood cells by density gradient centrifugation]
Using a Percoll solution (registered trademark, Sigma-Aldrich) and water, a liquid having a density of 1.070 g / mL and a liquid having a density of 1.095 g / mL were prepared. A centrifuge tube was charged with 2 mL of a liquid having a density of 1.095 g / mL, and cooled at 4 ° C. for 30 minutes. Next, 2 mL of a liquid having a density of 1.070 g / mL was slowly layered on the liquid having a density of 1.095 g / mL so as not to disturb the interface. Next, 11 mL of diluted blood was slowly layered on the liquid having a density of 1.070 g / mL, and centrifugation was performed at 2000 rpm for 20 minutes. Next, a fraction deposited between a liquid having a density of 1.070 g / mL and a liquid having a density of 1.095 g / mL was collected using a pipette. The collected fraction was washed twice with a washing solution (2 mM EDTA, 0.1% BSA-PBS) to obtain a fraction containing nucleated red blood cells.

[免疫染色]
上記で得た画分の細胞数をセルカウンター(Bio-Rad Laboratories社、TC20全自動セルカウンター)で計測し、細胞濃度が1×10個/mLになるように0.1%BSA−PBSで希釈した。この細胞懸濁液1mLに、白血球を染色する目的でBV421標識抗CD45抗体(ホスト動物:マウス、BD biosciences社)を10μL添加し、4℃で30分間インキュベートした。次いで、0.1%BSA−PBSで1回洗浄し、0.025%グルタルアルデヒド−PBSを1mL添加し、25℃で10分間転倒混和することで細胞を固定化した。次いで、固定化処理後の細胞を0.1%BSA−PBSで1回洗浄し、1mLの0.1%BSA−PBSで懸濁し、0.1%TritonX100−PBSを100μL添加し、25℃で5分間静置することで細胞膜透過処理を行った。次いで、細胞膜透過処理後の細胞を0.1%BSA−PBSで1回洗浄し、1mLの0.1%BSA−PBSで懸濁し、1.5mLチューブに100μLずつ分注した。各チューブに、表3に示す各抗体(一次抗体。抗HBG抗体としては、FITCで標識された抗体を用いた。)を添付文書に記載される推奨量または希釈率となるように添加し、25℃で60分間インキュベートした。一次抗体処理後の細胞を0.1%BSA−PBSで1回洗浄し、100μLの0.1%BSA−PBSで懸濁した。一次抗体が直接蛍光標識されている場合(HBG、C4orf3、GYPE、CD71)は、後述する核染色の工程に進んだ。一次抗体が標識されていない場合は、蛍光標識された二次抗体を用いて標識反応を行った。一次抗体のホスト動物種に対応した二次抗体としてPE標識抗ラビットIgG(Thermo Fisher Scientific)を用いた。抗体濃度が10μg/mLになるように希釈した二次抗体溶液を各チューブに200μL添加し、25℃で30分間インキュベートすることで標識反応を行った。
[Immunostaining]
The number of cells in the fraction obtained above was measured with a cell counter (Bio-Rad Laboratories, TC20 fully automatic cell counter), and 0.1% BSA-PBS so that the cell concentration was 1 × 10 7 cells / mL. Diluted with To this 1 mL of cell suspension, 10 μL of BV421-labeled anti-CD45 antibody (host animal: mouse, BD biosciences) was added for the purpose of staining leukocytes, and incubated at 4 ° C. for 30 minutes. Subsequently, the cells were washed once with 0.1% BSA-PBS, 1 mL of 0.025% glutaraldehyde-PBS was added, and the cells were fixed by inversion mixing at 25 ° C. for 10 minutes. Next, the cells after the fixation treatment were washed once with 0.1% BSA-PBS, suspended in 1 mL of 0.1% BSA-PBS, 100 μL of 0.1% Triton X100-PBS was added, and 25 ° C. The cell membrane permeabilization treatment was performed by allowing to stand for 5 minutes. Next, the cells after the cell membrane permeabilization treatment were washed once with 0.1% BSA-PBS, suspended in 1 mL of 0.1% BSA-PBS, and dispensed at 100 μL each into a 1.5 mL tube. To each tube, add each antibody shown in Table 3 (primary antibody. As anti-HBG antibody, an antibody labeled with FITC was used) so that the recommended amount or dilution rate described in the package insert was obtained, Incubated at 25 ° C. for 60 minutes. The cells after the primary antibody treatment were washed once with 0.1% BSA-PBS and suspended in 100 μL of 0.1% BSA-PBS. When the primary antibody was directly fluorescently labeled (HBG, C4orf3, GYPE, CD71), it proceeded to the nuclear staining step described later. When the primary antibody was not labeled, a labeling reaction was performed using a fluorescently labeled secondary antibody. PE labeled anti-rabbit IgG (Thermo Fisher Scientific) was used as a secondary antibody corresponding to the host animal species of the primary antibody. A labeling reaction was performed by adding 200 μL of a secondary antibody solution diluted to an antibody concentration of 10 μg / mL to each tube and incubating at 25 ° C. for 30 minutes.

[核染色]
抗体処理後の細胞を0.1%BSA−PBSで1回洗浄し、核染色剤としてDRAQ5(Cell Signaling Technology社)を5μM含む0.1%BSA−PBS 1mLに置換して5分間静置し、細胞核を染色した。核染色後の細胞懸濁液を次工程に供した。
[Nuclear staining]
The antibody-treated cells were washed once with 0.1% BSA-PBS, replaced with 1 mL of 0.1% BSA-PBS containing 5 μM DRAQ5 (Cell Signaling Technology) as a nuclear stain, and allowed to stand for 5 minutes. Cell nuclei were stained. The cell suspension after nuclear staining was subjected to the next step.

[有核赤血球の単離]
フローサイトメータ(SONY(株)社製SH800ZP)を用いて、前方散乱光と側方散乱光にて、細胞懸濁液から細胞をゲーティングした。次いで、ゲーティングした細胞画分からCD45陰性細胞をゲーティングすることで白血球を除き、赤血球を主成分とするCD45陰性画分を得た。次いで、CD45陰性画分からDRAQ5陽性細胞をゲーティングすることで、有核赤血球画分を得た。
[Isolation of nucleated red blood cells]
Using a flow cytometer (SH800ZP manufactured by Sony Corporation), cells were gated from the cell suspension with forward scattered light and side scattered light. Subsequently, white blood cells were removed from the gated cell fraction by gating CD45 negative cells to obtain a CD45 negative fraction mainly composed of red blood cells. Subsequently, DRAQ5 positive cells were gated from the CD45 negative fraction to obtain a nucleated red blood cell fraction.

[抗体陽性細胞の単離]
フローサイトメータ(SONY(株)社製SH800ZP)を用いて、有核赤血球画分から抗体陽性細胞をゲーティングし、有核赤血球画分の全細胞に占める抗体陽性細胞の割合(%、個数基準)を求めた。その結果を、表4及び図1に示す。図1の横軸は、臍帯血を試料にした場合の、有核赤血球画分の全細胞に占める抗体陽性細胞の割合であり、図1の縦軸は、成人骨髄血を試料にした場合の、有核赤血球画分の全細胞に占める抗体陽性細胞の割合である。
[Isolation of antibody positive cells]
Using a flow cytometer (SH800ZP manufactured by Sony Corporation), antibody-positive cells are gated from the nucleated erythrocyte fraction, and the ratio of antibody-positive cells to all cells in the nucleated erythrocyte fraction (%, number basis) Asked. The results are shown in Table 4 and FIG. The horizontal axis in FIG. 1 is the ratio of antibody-positive cells to the total cells of the nucleated red blood cell fraction when umbilical cord blood is used as the sample, and the vertical axis in FIG. 1 is the case when adult bone marrow blood is used as the sample. The ratio of antibody-positive cells to the total cells of the nucleated red blood cell fraction.

臍帯血に含まれる赤血球のほとんどが、胎児の有核赤血球であり、成人骨髄血に含まれる赤血球のほとんどが、成熟した無核の赤血球であるところ、
抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体は、成人骨髄血に比べ臍帯血において、抗体陽性細胞の割合が多かった。
一方、抗CD71抗体、抗SNCA抗体、抗AHSP抗体、及び抗HMBS抗体は、臍帯血と成人骨髄血とで抗体陽性細胞の割合に差はなかった。
Most of the red blood cells in cord blood are fetal nucleated red blood cells, and most of the red blood cells in adult bone marrow blood are mature, anucleated red blood cells,
Anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody are The percentage of antibody-positive cells was higher in umbilical cord blood than in adult bone marrow blood.
On the other hand, anti-CD71 antibody, anti-SNCA antibody, anti-AHSP antibody, and anti-HMBS antibody did not differ in the proportion of antibody-positive cells between umbilical cord blood and adult bone marrow blood.

<実施例3>
表3に示す抗体を2種組み合わせて、ヒト臍帯血とヒト成人骨髄血とから胎児細胞の単離を試みた。
<Example 3>
Two antibodies shown in Table 3 were combined to try to isolate fetal cells from human umbilical cord blood and human adult bone marrow blood.

実施例2と同様にして、ヒト臍帯血とヒト成人骨髄血とから、密度勾配遠心分離によって有核赤血球を含む画分を得た。次いで、有核赤血球を含む画分を、実施例2と同様にして、BV421標識抗CD45抗体で処理した。次いで、一次抗体による処理を実施例2と同様にして、但し、表5に示す組合せの2種の抗体を用いて行った。この際、抗HBG抗体としては、抗C4orf3抗体又は抗GYPE抗体と組み合せる場合には、RPEで標識された抗体を用い、上記以外の抗体と組み合せる場合には、FITCで標識された抗体を用いた。次いで、標識されていない一次抗体に対して、実施例2と同様にして、二次抗体としてPE標識抗ラビットIgG(Thermo Fisher Scientific)を反応させた。次いで、実施例2と同様にして、DRAQ5で細胞核の染色を行い、核染色後の細胞懸濁液を次工程に供した。   In the same manner as in Example 2, a fraction containing nucleated red blood cells was obtained from human umbilical cord blood and human adult bone marrow blood by density gradient centrifugation. Subsequently, the fraction containing nucleated red blood cells was treated with a BV421-labeled anti-CD45 antibody in the same manner as in Example 2. Next, the treatment with the primary antibody was carried out in the same manner as in Example 2, except that two kinds of antibodies in the combinations shown in Table 5 were used. At this time, as an anti-HBG antibody, when combined with an anti-C4orf3 antibody or anti-GYPE antibody, an antibody labeled with RPE is used. When combined with an antibody other than the above, an antibody labeled with FITC is used. Using. Subsequently, PE labeled anti-rabbit IgG (Thermo Fisher Scientific) was reacted as a secondary antibody to the unlabeled primary antibody in the same manner as in Example 2. Next, in the same manner as in Example 2, staining of cell nuclei was performed with DRAQ5, and the cell suspension after nuclear staining was subjected to the next step.

実施例2と同様にして、フローサイトメータ(SONY(株)社製SH800ZP)を用いて、細胞懸濁液から細胞をゲーティングした。次いで、ゲーティングした細胞画分からCD45陰性細胞をゲーティングすることで白血球を除き、赤血球を主成分とするCD45陰性画分を得た。次いで、CD45陰性画分からDRAQ5陽性細胞をゲーティングすることで、有核赤血球画分を得た。次いで、有核赤血球画分から抗体陽性細胞をゲーティングした。有核赤血球画分の全細胞に占める抗体(1)陽性かつ抗体(2)陽性の細胞の割合(%、個数基準)を計測した。その結果を、表5に示す。   In the same manner as in Example 2, cells were gated from the cell suspension using a flow cytometer (SH800ZP manufactured by Sony Corporation). Subsequently, white blood cells were removed from the gated cell fraction by gating CD45 negative cells to obtain a CD45 negative fraction mainly composed of red blood cells. Subsequently, DRAQ5 positive cells were gated from the CD45 negative fraction to obtain a nucleated red blood cell fraction. Subsequently, antibody positive cells were gated from the nucleated red blood cell fraction. The ratio (%, number basis) of antibody (1) positive and antibody (2) positive cells in all cells of the nucleated red blood cell fraction was measured. The results are shown in Table 5.

抗HBG抗体と、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体のいずれか1つとで免疫染色した場合、成人骨髄血よりも臍帯血において、抗体(1)陽性かつ抗体(2)陽性である細胞の割合が多く、臍帯血/成人骨髄血が2.8〜39.2であった。
一方、抗CD71抗体と、抗SNCA抗体、抗AHSP抗体、及び抗HMBS抗体のいずれか1つとで免疫染色した場合、臍帯血と成人骨髄血とで、抗体(1)陽性かつ抗体(2)陽性である細胞の割合に差はなかった。
Anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody In the case of immunostaining with any one, the ratio of cells positive for antibody (1) and antibody (2) is higher in umbilical cord blood than in adult bone marrow blood, and umbilical cord blood / adult bone marrow blood is 2.8-39. .2.
On the other hand, when immunostaining with anti-CD71 antibody and any one of anti-SNCA antibody, anti-AHSP antibody, and anti-HMBS antibody, antibody (1) positive and antibody (2) positive with umbilical cord blood and adult bone marrow blood There was no difference in the proportion of cells.

実施例1〜3の結果は、抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を用いて細胞を免疫染色することによって、妊娠母体の末梢血から胎児細胞を単離することが可能であることを示している。   The results of Examples 1 to 3 are as follows: anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti Demonstrate that fetal cells can be isolated from peripheral blood of a maternal mother by immunostaining cells with at least two antibodies selected from the group consisting of CLIC6 antibody and anti-DDX3Y antibody Yes.

Claims (10)

妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離する方法であって、
抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を血液細胞集団に接触させて前記少なくとも2種の抗体で細胞をマーキングする工程と、
前記血液細胞集団から、前記少なくとも2種の抗体でマーキングされた細胞を単離する工程と、
を有する、胎児細胞の単離方法。
A method for isolating fetal cells from peripheral blood collected from a pregnant mother,
It consists of anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody Contacting at least two antibodies selected from the group with a blood cell population and marking the cells with said at least two antibodies;
Isolating cells marked with the at least two antibodies from the blood cell population;
A method for isolating fetal cells.
前記少なくとも2種の抗体が、抗HBG抗体を含む、請求項1に記載の胎児細胞の単離方法。   The method for isolating fetal cells according to claim 1, wherein the at least two kinds of antibodies comprise an anti-HBG antibody. さらに、前記末梢血を密度勾配遠心分離に供して有核赤血球を含む画分を得る工程を有し、
前記有核赤血球を含む画分が前記血液細胞集団である、
請求項1又は請求項2に記載の胎児細胞の単離方法。
Further, the step of subjecting the peripheral blood to density gradient centrifugation to obtain a fraction containing nucleated red blood cells,
The fraction containing the nucleated red blood cells is the blood cell population;
The method for isolating fetal cells according to claim 1 or 2.
さらに、
抗CD45抗体を前記血液細胞集団に接触させて前記抗CD45抗体で細胞をマーキングする工程と、
前記血液細胞集団から、前記抗CD45抗体でマーキングされていない細胞を単離する工程と、
を有する、請求項1〜請求項3のいずれか1項に記載の胎児細胞の単離方法。
further,
Contacting an anti-CD45 antibody with the blood cell population and marking the cells with the anti-CD45 antibody;
Isolating cells not marked with the anti-CD45 antibody from the blood cell population;
The method for isolating fetal cells according to any one of claims 1 to 3, comprising:
さらに、
核染色色素を前記血液細胞集団に接触させて細胞核を染色する工程と、
前記血液細胞集団から、前記核染色色素によって核が染色された有核細胞を単離する工程と、
を有する、請求項1〜請求項4のいずれか1項に記載の胎児細胞の単離方法。
further,
Contacting the blood cell population with a nuclear staining dye to stain the cell nucleus;
Isolating nucleated cells having nuclei stained with the nuclear staining dye from the blood cell population;
The method for isolating fetal cells according to any one of claims 1 to 4, comprising:
前記血液細胞集団から細胞を単離することがフローサイトメトリーによって行われる、請求項1〜請求項5のいずれか1項に記載の胎児細胞の単離方法。   The method for isolating fetal cells according to any one of claims 1 to 5, wherein the cells are isolated from the blood cell population by flow cytometry. 抗HBG抗体、抗ALAS2抗体、抗HEMGN抗体、抗C9orf5抗体、抗GYPB抗体、抗SLC1A5抗体、抗EIF1AY抗体、抗C4orf3抗体、抗IGF2抗体、抗GYPE抗体、抗CLIC6抗体、及び抗DDX3Y抗体からなる群から選ばれる少なくとも2種の抗体を含む、胎児細胞の単離に用いるための抗体セット。   It consists of anti-HBG antibody, anti-ALAS2 antibody, anti-HEMGN antibody, anti-C9orf5 antibody, anti-GYPB antibody, anti-SLC1A5 antibody, anti-EIF1AY antibody, anti-C4orf3 antibody, anti-IGF2 antibody, anti-GYPE antibody, anti-CLIC6 antibody, and anti-DDX3Y antibody An antibody set for use in isolating fetal cells, comprising at least two antibodies selected from the group. 前記少なくとも2種の抗体が、抗HBG抗体を含む、請求項7に記載の抗体セット。   The antibody set according to claim 7, wherein the at least two kinds of antibodies comprise an anti-HBG antibody. 前記少なくとも2種の抗体の一部又は全部がそれぞれ、蛍光色素、蛍光タンパク質、酵素、ビオチン、及び磁気ビーズから選ばれる少なくとも1種で標識された抗体である、請求項7又は請求項8に記載の抗体セット。   The part or the whole of the at least two kinds of antibodies is an antibody labeled with at least one kind selected from a fluorescent dye, a fluorescent protein, an enzyme, biotin, and a magnetic bead, respectively. Antibody set. 請求項1〜請求項6のいずれか1項に記載の胎児細胞の単離方法により、妊娠母体から採取された末梢血から胎児細胞を単離し、単離された前記胎児細胞から染色体DNAを入手して行う、胎児の出生前遺伝学的検査方法。   A fetal cell is isolated from peripheral blood collected from a pregnant mother by the method for isolating fetal cells according to any one of claims 1 to 6, and chromosomal DNA is obtained from the isolated fetal cells. A prenatal genetic testing method for the fetus.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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WO2021009682A1 (en) * 2019-07-15 2021-01-21 Menarini Biomarkers Singapore Pte Ltd Compositions and methods for isolating, detecting, and analyzing fetal cells

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