JP2011133366A - Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board - Google Patents
Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board Download PDFInfo
- Publication number
- JP2011133366A JP2011133366A JP2009293409A JP2009293409A JP2011133366A JP 2011133366 A JP2011133366 A JP 2011133366A JP 2009293409 A JP2009293409 A JP 2009293409A JP 2009293409 A JP2009293409 A JP 2009293409A JP 2011133366 A JP2011133366 A JP 2011133366A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- fluorescent
- fluorescent mark
- filter
- filtration
- detection method
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Landscapes
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Microscoopes, Condenser (AREA)
Abstract
Description
本発明は、微生物検出方法、フィルタ及び蛍光印配置板に関する。 The present invention relates to a microorganism detection method, a filter, and a fluorescent mark arrangement plate.
ステージの平面移動と焦点合わせとが自動化された顕微鏡では、微生物を撮影する際に、ステージの移動により標本上の視野が切り替わる毎にオートフォーカスで焦点を合わす。しかし、標本内の全ての微生物を検出するためには、全ての視野においてオートフォーカスで焦点を合わせなければならないので、撮影に時間がかかるという問題があった。さらに、顕微鏡では、ステージの移動より残留振動が発生してしまうので、これが収束するまでオートフォーカスが行えずに撮影により時間がかかっていた。
そのため、残留振動によるオートフォーカスの遅れを解決する発明として、下記特許文献1には、振動数を計算して、振動が収束した時の焦点を推測することにより残留振動が収束する前にオートフォーカスを行うことができる顕微鏡が開示されている。
また、オートフォーカスを行うことで撮影に時間がかかるという問題を解決する発明として、下記特許文献2には、CCDカメラのビデオ信号から直接対象の焦点度を測定することで、リアルタイムに焦点を合わすことができる顕微鏡が開示されている。
In a microscope in which the plane movement and focusing of the stage are automated, when the microbe is photographed, the focus is adjusted by autofocus every time the visual field on the specimen is switched due to the movement of the stage. However, in order to detect all the microorganisms in the sample, it is necessary to focus on all fields of view by autofocus, so that there is a problem that it takes time to shoot. Furthermore, in the microscope, residual vibration is generated due to the movement of the stage. Therefore, autofocusing cannot be performed until this converges, and it takes time to shoot.
Therefore, as an invention for solving the delay of autofocus due to residual vibration, Japanese Patent Application Laid-Open Publication No. 2004-259542 discloses that autofocus before the residual vibration converges by calculating the frequency and estimating the focus when the vibration converges. A microscope capable of performing is disclosed.
Further, as an invention for solving the problem that it takes a long time to shoot by performing auto-focusing, Japanese Patent Application Laid-Open No. 2004-26883 discloses focusing on a real time by directly measuring the degree of focus of a target from a video signal of a CCD camera. A microscope that can be used is disclosed.
ところで、上記特許文献1では、残留振動が収束する前にオートフォーカスを行うことで撮影時間の短縮を図っている。しかし、標本が暗い場合には露光のための時間が長くなるので、オートフォーカスに時間がかかってしまう。そのため、標本に含まれる微生物が蛍光染色されている場合には、オートフォーカス中に微生物の蛍光が退色してしまうので、当該微生物を検出することが困難になっていた。また、上記特許文献2でも、上記特許文献1と同様の理由で、微生物を検出することが困難になっていた。
By the way, in the above-mentioned
本発明は、上述した事情に鑑みてなされたものであり、蛍光染色された微生物に対して従来よりも早く焦点を合わせることを目的とする。 The present invention has been made in view of the above-described circumstances, and aims to focus on fluorescently stained microorganisms earlier than before.
上記目的を達成するために、本発明では、微生物検出方法に係る第1の解決手段として、ろ過によりフィルタ上に試料中の微生物を捕集し、蛍光染色された微生物をオートフォーカス機能を有する顕微鏡を用いて前記フィルタから検出する微生物検出方法であって、
蛍光を発する蛍光印を前記フィルタ上に配置する蛍光印配置工程を具備するという手段を採用する。
In order to achieve the above object, in the present invention, as a first solution for the microorganism detection method, microorganisms in a sample are collected on a filter by filtration, and the fluorescence-stained microorganisms are microscopes having an autofocus function. A method for detecting microorganisms from the filter using
A means is adopted that includes a fluorescent mark arrangement step of arranging a fluorescent mark emitting fluorescence on the filter.
本発明では、微生物検出方法に係る第2の解決手段として、上記第1の解決手段において、前記フィルタのろ過に使用された面(ろ過面)の外に前記蛍光印を配置するという手段を採用する。 In the present invention, as the second solving means relating to the microorganism detection method, the means for arranging the fluorescent mark outside the surface (filtration surface) used for the filtration of the filter in the first solving means is adopted. To do.
本発明では、微生物検出方法に係る第3の解決手段として、上記第2の解決手段において、前記ろ過面は円形であり、ろ過面の外周に沿って3つ以上の前記蛍光印を配置するという手段を採用する。 In the present invention, as the third solution means related to the microorganism detection method, in the second solution means, the filtration surface is circular, and three or more fluorescent marks are arranged along the outer periphery of the filtration surface. Adopt means.
本発明では、微生物検出方法に係る第4の解決手段として、上記第1〜第3のいずれかの解決手段において、前記蛍光印は、蛍光ビーズから構成されているという手段を採用する。 In the present invention, as a fourth solving means related to the microorganism detection method, in the first to third solving means, a means that the fluorescent mark is composed of fluorescent beads is adopted.
本発明では、微生物検出方法に係る第5の解決手段として、上記第1〜第4のいずれかの解決手段において、蛍光印配置穴が開いた蛍光印配置板を前記フィルタに重ね、蛍光印配置穴の中に蛍光印を作成するという手段を採用する。 In the present invention, as a fifth solving means relating to the microorganism detection method, in any one of the first to fourth solving means, a fluorescent mark arrangement plate having a fluorescent mark arrangement hole is overlapped on the filter, and the fluorescent mark arrangement is arranged. A method of creating a fluorescent mark in the hole is adopted.
本発明では、フィルタに係る第1の解決手段として、ろ過により試料中の微生物を捕集するフィルタであって、蛍光を発する蛍光印が配置されているという手段を採用する。 In the present invention, as a first solving means related to the filter, a filter that collects microorganisms in a sample by filtration and that has fluorescent marks that emit fluorescence is employed.
本発明では、フィルタに係る第2の解決手段として、上記第1の解決手段において、ろ過に使用される面(ろ過面)の外に前記蛍光印が配置されているという手段を採用する。 In the present invention, as the second solving means relating to the filter, a means is adopted in which the fluorescent mark is arranged outside the surface (filtration surface) used for filtration in the first solving means.
本発明では、フィルタに係る第3の解決手段として、上記第2の解決手段において、前記ろ過面は円形であり、ろ過面の外周に沿って3つ以上の前記蛍光印が配置されているという手段を採用する。 In the present invention, as the third solution means related to the filter, in the second solution means, the filtration surface is circular, and three or more fluorescent marks are arranged along the outer periphery of the filtration surface. Adopt means.
本発明では、フィルタに係る第4の解決手段として、上記第1〜第3のいずれかの解決手段において、前記蛍光印は、蛍光ビーズから構成されているという手段を採用する。 In the present invention, as the fourth solving means relating to the filter, in the first to third solving means, the means that the fluorescent mark is composed of fluorescent beads is adopted.
本発明では、蛍光印配置板に係る第1の解決手段として、中央にろ過用穴が開き、前記ろ過用穴の外周に沿って蛍光印配置穴が開いているという手段を採用する。 In the present invention, as a first means for solving the fluorescent mark arrangement plate, a means is adopted in which a filtration hole is opened at the center and the fluorescent mark arrangement hole is opened along the outer periphery of the filtration hole.
本発明によれば、蛍光印をフィルタに配置する。これにより、蛍光顕微鏡は、蛍光印を基準にオートフォーカスしておくことで、視野が移動したとしても蛍光染色された微生物に対して従来よりも早く焦点を合わせることができる。 According to the present invention, the fluorescent mark is arranged on the filter. Thereby, the fluorescent microscope can focus on the fluorescently stained microorganism faster than before even if the field of view moves, by autofocusing with the fluorescent mark as a reference.
以下、図面を参照して、本発明の実施形態について説明する。
本実施形態に係るレジオネラ菌検出方法は、FISH法を用いて試料からレジオネラ菌を検出する方法であり、以下に説明するように第1〜第11の工程を有するものである。また、これら第1〜第11の工程のうち、第2の工程は、本実施形態における蛍光印配置工程である。
Embodiments of the present invention will be described below with reference to the drawings.
The Legionella detection method according to the present embodiment is a method for detecting Legionella from a sample using the FISH method, and includes first to eleventh steps as described below. Of these first to eleventh steps, the second step is the fluorescent mark placement step in the present embodiment.
レジオネラ菌検出方法について、図1を参照して、説明する。
〔第1の工程〕
まず、第1の工程において、レジオネラ菌を含む液体試料に、終濃度が4%になるようにパラホルムアルデヒド溶液を添加し、当該液体試料を4℃の温度の下で一晩保存することでレジオネラ菌の固定標本を作製する(ステップS1)。
The Legionella detection method will be described with reference to FIG.
[First step]
First, in a first step, a paraformaldehyde solution is added to a liquid sample containing Legionella bacteria so that the final concentration is 4%, and the liquid sample is stored overnight at a temperature of 4 ° C. A fixed specimen of the bacterium is prepared (step S1).
〔第2の工程(蛍光印配置工程)〕
上記第1の工程が終了すると、次に第2の工程において、液体試料のろ過に用いるメンブレンフィルタ上に蛍光印を配置する(ステップS2)。ここで、上記第2の工程について、図2を参照して具体的に説明する。まず、メンブレフィルタFlの上に蛍光印配置板Abを外周が一致するように重ねる(図2の(a)参照)。
[Second step (fluorescent mark placement step)]
When the first step is completed, in the second step, a fluorescent mark is placed on the membrane filter used for filtering the liquid sample (step S2). Here, the second step will be specifically described with reference to FIG. First, the fluorescent mark placement plate Ab is overlaid on the membrane filter Fl so that the outer circumferences coincide (see FIG. 2A).
上記メンブレンフィルタは、直径が25mmの円形であり、孔径が0.22μmであるポリカーボネート製のフィルタである。このメンブレンフィルタの中央部の直径16mmの円形領域(ろ過面Fs)が、ろ過に使用される。また、上記蛍光印配置板Abは、薄いシリコン板であり、その中央にメンブレンフィルタFlのろ過面Fsと同じ大きさの穴(ろ過用穴Fh)が開いている。さらに、蛍光印配置板Abは、ろ過用穴Fhの外周に沿って等間隔で4つの蛍光印配置穴Ahが開いている。なお、蛍光印配置板Abの材質は、上述したシリコンでなくても、柔軟かつメンブレンフィルタFlに密着できるものであればよい。また、蛍光印配置穴Ahそれぞれは、ろ過用穴Fhからの距離が例えば0.5mmと一定であることが好ましい。 The membrane filter is a polycarbonate filter having a circular shape with a diameter of 25 mm and a pore diameter of 0.22 μm. A circular region (filtration surface Fs) having a diameter of 16 mm at the center of the membrane filter is used for filtration. The fluorescent mark arrangement plate Ab is a thin silicon plate, and a hole (filtration hole Fh) having the same size as the filtration surface Fs of the membrane filter Fl is opened at the center thereof. Furthermore, the fluorescent mark arrangement | positioning board Ab has four fluorescent mark arrangement | positioning holes Ah opened at equal intervals along the outer periphery of the hole Fh for filtration. Note that the material of the fluorescent mark arrangement plate Ab is not limited to the above-described silicon, but may be any material that is flexible and can be in close contact with the membrane filter Fl. Moreover, it is preferable that the distance from the filtration hole Fh is constant, for example, 0.5 mm, in each of the fluorescent mark arrangement holes Ah.
そして、電気泳動用ピペットで蛍光印配置穴Ahの中に蛍光ビーズ(Fluorebrite Polychromatic Red Microspheres,Polysciens,Inc)の懸濁液を滴下する。すると、図2の(b)に示すように蛍光ビーズから構成される4つの蛍光印FmがメンブレンフィルタFl上に配置される。上記蛍光ビーズは、微生物等を画像解析によって抽出する際に、基準色及び基準サイズとして用いられるものであり、0.5μm程度の大きさである。そして、蛍光ビーズは、波長495nmの青色の励起光が照射されると、波長520nmの緑色の蛍光を発する。この蛍光ビーズの懸濁液は、3.64×1011Particles/mlを例えば1/10〜1/20、より望ましい限定的な濃度として1/100〜1/200、さらに望ましい限定的な濃度として1/1000〜1/2000に希釈したものである。そして、この懸濁液を10μlずつ蛍光印配置穴Ahの中のメンブレンフィルタFl上にのせる。 Then, a suspension of fluorescent beads (Fluorebrite Polychromatic Red Microspheres, Polysciens, Inc) is dropped into the fluorescent mark placement hole Ah with an electrophoresis pipette. Then, as shown in FIG. 2B, four fluorescent marks Fm made of fluorescent beads are arranged on the membrane filter Fl. The fluorescent beads are used as a reference color and a reference size when extracting microorganisms and the like by image analysis, and have a size of about 0.5 μm. The fluorescent beads emit green fluorescence with a wavelength of 520 nm when irradiated with blue excitation light with a wavelength of 495 nm. The suspension of fluorescent beads is 3.64 × 10 11 Particles / ml, for example, 1/10 to 1/20, more preferably 1/100 to 1/200, more preferably limited concentration. Diluted 1/1000 to 1/2000. Then, 10 μl of this suspension is placed on the membrane filter Fl in the fluorescent mark placement hole Ah.
〔第3の工程〕
上記第2の工程が終了すると、次に第3の工程において、上記液体試料をろ過装置によってろ過することで、レジオネラ菌の固定標本をメンブレンフィルタ上に捕集する(ステップS3)。ここで、上記第3の工程について、図3及び図4を参照して具体的に説明する。ろ過装置10は、図3に示すように、ろ過タワー1、蛍光印配置板Ab、メンブレンフィルタFl及びろ過びん2から構成されている。
[Third step]
When the second step is completed, in the third step, the liquid sample is filtered by a filtration device, whereby a fixed specimen of Legionella is collected on the membrane filter (step S3). Here, the third step will be specifically described with reference to FIGS. As shown in FIG. 3, the
ろ過タワー1はメンブレンフィルタFlに液体試料を導入するための筒形状の流路であり、蛍光印配置板Abの上に取り付けられている。そして、ろ過タワー1の内周と蛍光印配置板Abのろ過用穴Fhは一致する。これにより、液体試料が、メンブレンズフィルタFlのろ過面Fsに導かれる。蛍光印配置板Ab及びメンブレンフィルタFlについては、上述しているので説明を省略する。ろ過びん2は、吸引ろ過器(図示略)に接続し、内部の空気が吸引ろ過器に吸引されることでメンブレンフィルタFlを通過した液体をためるびんである。
The
このようなろ過装置10において液体試料をろ過する。そして、ろ過が完了すると、ろ過タワー1及びろ過びん2から蛍光印配置板Ab及びメンブレンフィルタFlを取り外す。そして、メンブレンフィルタFlから蛍光印配置板Abを取り外すと、図4に示すように、メンブレンフィルタFlの中央部のろ過面Fsにはレジオネラ菌を含む標本Spが捕集されている。そして、4つの蛍光印Fmが、ろ過面Fsの外周に沿って配置されている。
In such a
〔第4の工程〕
上記第3の工程が終了すると、次に第4の工程において、上記メンブレンフィルタを99.5%のエタノールに1分間入れることで脱水し、その後に常温の空気中で乾燥させる(ステップS4)。
〔第5の工程〕
上記第4の工程が終了すると、次に第5の工程において、上記メンブレンフィルタの全面にハイブリダイゼーションバッファを塗布する(ステップS5)。なお、上記ハイブリダイゼーションバッファの構成は、NaClが0.9%、Tris‐Clが20mM、formamideが35%、Blocking reagentが2%、SDS(Sodium Dodecyl sulphate:界面活性剤)が0.02%である。
[Fourth step]
When the third step is completed, in the fourth step, the membrane filter is dehydrated by placing it in 99.5% ethanol for 1 minute, and then dried in air at room temperature (step S4).
[Fifth step]
When the fourth step is completed, in the fifth step, a hybridization buffer is applied to the entire surface of the membrane filter (step S5). The hybridization buffer is composed of 0.9% NaCl, 20 mM Tris-Cl, 35% formamide, 2% Blocking reagent, and 0.02% SDS (Sodium Dodecyl sulphate: surfactant). is there.
〔第6の工程〕
上記第5の工程が終了すると、次に第6の工程において、上記メンブレンフィルタ上のレジオネラ菌にプローブを結合させる(ステップS6)。第5の工程を具体的に説明すると、まずレジオネラ菌用プローブ溶液の入ったシャーレのような内底面が平坦な容器に上記メンブレンフィルタを入れる。そして、インキュベータを使ってシャーレのような内底面が平坦な容器を46℃の温度下で、約2時間インキュベートさせる。これにより、レジオネラ菌に対するプローブの結合が促進され、時間の経過とともにレジオネラ菌とプローブとが結合する。なお、プローブとは、標的微生物であるレジオネラ菌の核酸(多くの場合においてリボソームRNA(ribosome Ribonucleic acid))に対して相補的なポリヌクレオチドに蛍光色素を共有結合したものである。
[Sixth step]
When the fifth step is finished, in the sixth step, a probe is bound to Legionella on the membrane filter (step S6). The fifth step will be specifically described. First, the membrane filter is put in a container having a flat inner bottom surface such as a petri dish containing a probe solution for Legionella bacteria. Then, a container with a flat inner bottom surface such as a petri dish is incubated at a temperature of 46 ° C. for about 2 hours using an incubator. Thereby, the coupling | bonding of the probe with Legionella is accelerated | stimulated, and Legionella and a probe couple | bond together with progress of time. The probe is a probe in which a fluorescent dye is covalently bonded to a polynucleotide complementary to the nucleic acid of Legionella, which is a target microorganism (in many cases, ribosome RNA (ribosome RNA)).
〔第7の工程〕
上記第6の工程が終了すると、次に第7の工程において、プローブ溶液から取り出したメンブレンフィルタをウォッシングバッファに浸し、メンブレンフィルタ上の未反応のプローブを洗浄する(ステップS7)。
〔第8の工程〕
上記第7の工程が終了すると、次に第8の工程において、メンブレンフィルタを99.5%のエタノールに1分間入れることでメンブレンフィルタを脱水し、その後に常温の空気中で乾燥させる(ステップS8)。
〔第9の工程〕
上記第8の工程が終了すると、次に第9の工程において、0.05%寒天を加熱溶解後、40℃程度で溶解を保持した寒天溶液中にメンブレンフィルタを浸した後に、標本捕集面を下にしてスライドガラス上に気泡を含まないように付着させ、乾燥させる(ステップS9)。メンブレンフィルタを載せる基板はスライドガラスでも良いが、より平面度を増すためには平行平面基板など平面度の高い物を用いたほうがよい。また、蛍光染色の場合には基板は透明である必要は無く、シリコンウェハーなども利用可能である。
[Seventh step]
When the sixth step is completed, in the seventh step, the membrane filter taken out from the probe solution is immersed in a washing buffer, and unreacted probes on the membrane filter are washed (step S7).
[Eighth step]
When the seventh step is completed, next, in the eighth step, the membrane filter is dehydrated by placing it in 99.5% ethanol for 1 minute, and then dried in air at normal temperature (step S8). ).
[Ninth step]
When the eighth step is completed, in the ninth step, after 0.05% agar is dissolved by heating, the membrane filter is immersed in an agar solution kept dissolved at about 40 ° C. Is attached so as not to contain air bubbles on the slide glass and dried (step S9). The substrate on which the membrane filter is placed may be a slide glass, but in order to increase the flatness, it is better to use a high flatness material such as a parallel flat substrate. In the case of fluorescent staining, the substrate does not need to be transparent, and a silicon wafer or the like can be used.
〔第10の工程〕
上記第9の工程が終了すると、次に第10の工程において、スライドガラス上のメンブレンフィルタにベクターシールドを滴下し、その上に気泡がはいらないようカバーガラスを載せて、密着させる(ステップS10)。
[Tenth step]
When the ninth step is finished, next, in a tenth step, a vector shield is dropped on the membrane filter on the slide glass, and a cover glass is placed on the membrane filter so as not to enter air bubbles (step S10). .
〔第11の工程〕
上記第10の工程が終了すると、次に第11の工程において、蛍光顕微鏡の対物レンズの焦点を蛍光印に基づいてオートフォーカスにより調整し、その後に蛍光顕微鏡でメンブレンフィルタ上のレジオネラ菌を検出する(ステップS11)。つまり、蛍光顕微鏡にスライドガラスを取り付け、対物レンズをカバーガラスに接するように配置する。そして、蛍光顕微鏡に波長495nmの青色の励起光を照射させた上で、対物レンズが蛍光印の真上に来るようにステージを移動させ、オートフォーカスにより対物レンズの焦点を蛍光印に合わせる。この際、蛍光印は、励起光により蛍光を発している。その後、蛍光印の高さとレジオネラ菌の高さの違いに基づいて対物レンズの焦点をレジオネラ菌に合うように調整する。そして、自動的にステージを移動させながら、メンブレンズフィルタのろ過面上の標本の撮影を実行させて、撮影した画像から蛍光を基にレジオネラ菌を検出する。
[Eleventh step]
When the tenth step is completed, in the eleventh step, the focus of the objective lens of the fluorescent microscope is adjusted by autofocus based on the fluorescent mark, and then Legionella on the membrane filter is detected by the fluorescent microscope. (Step S11). That is, a slide glass is attached to the fluorescence microscope, and the objective lens is disposed so as to be in contact with the cover glass. Then, after irradiating the fluorescence microscope with blue excitation light having a wavelength of 495 nm, the stage is moved so that the objective lens is directly above the fluorescent mark, and the focus of the objective lens is adjusted to the fluorescent mark by autofocus. At this time, the fluorescent mark emits fluorescence by excitation light. Thereafter, the focal point of the objective lens is adjusted to match that of Legionella based on the difference between the height of the fluorescent mark and the height of Legionella. Then, while moving the stage automatically, the specimen on the filtration surface of the membrane filter is photographed, and Legionella is detected from the photographed image based on the fluorescence.
上述のように、レジオネラ菌に焦点が合うように調整されているので、蛍光顕微鏡の視野が移動しても、オートフォーカスによる焦点の再調整がほとんど行われることがない。そして、蛍光顕微鏡によって画像を撮影したところ、通常の方法では画像全体にフォーカスの合う写真は10枚に1枚程度であったが、本実施形態に係る微生物検出方法を使うことで多数の画像において良好なフォーカスの画像が得られた。 As described above, since adjustment is made to focus on Legionella, even if the visual field of the fluorescence microscope moves, readjustment of focus by autofocus is hardly performed. Then, when images were taken with a fluorescence microscope, in the normal method, the number of photographs focused on the entire image was about 1 in 10, but in the case of many images using the microorganism detection method according to this embodiment. An image with good focus was obtained.
以上のように、本実施形態では、蛍光印をメンブレンフィルタに配置する。これにより、蛍光顕微鏡は、蛍光印を基準にオートフォーカスしておくことで、視野が移動したとしても蛍光染色された微生物に対して従来よりも早く焦点を合わせることができる。 As described above, in the present embodiment, the fluorescent mark is arranged on the membrane filter. Thereby, the fluorescent microscope can focus on the fluorescently stained microorganism faster than before even if the field of view moves, by autofocusing with the fluorescent mark as a reference.
以上、本発明の実施形態について説明したが、本発明は上記実施形態に限定されることなく、例えば以下のような変形が考えられる。
(1)上記実施形態は、FISH法を用いたレジオネラ菌検出方法に本発明を適用したものであったが、本発明はこれに限定されない。
例えば、DAPI(4',6-Diamidine-2'-phenylindole dihydrochloride)染色法やアクリジンオレンジ染色法などのFISH法以外の蛍光染色法でレジオネラ菌を検出するレジオネラ菌検出方法に、本発明を適用するようにしてもよい。
As mentioned above, although embodiment of this invention was described, this invention is not limited to the said embodiment, For example, the following modifications can be considered.
(1) Although the said embodiment applied this invention to the Legionella detection method using FISH method, this invention is not limited to this.
For example, the present invention is applied to a Legionella detection method for detecting Legionella by a fluorescent staining method other than the FISH method such as a DAPI (4 ′, 6-Diamidine-2′-phenylindole dihydrochloride) staining method or an acridine orange staining method. You may do it.
(2)上記実施形態では、メンブレンフィルタ上に4つの蛍光印を配置したが、本発明はこれに限定されない。
例えば、メンブレンフィルタ上に蛍光印を3つ以上であればいくつ配置してもよい。すなわち、本発明の蛍光印は3つ以上であればよい。
(2) In the above embodiment, four fluorescent marks are arranged on the membrane filter, but the present invention is not limited to this.
For example, any number of three or more fluorescent marks on the membrane filter may be arranged. That is, the fluorescent mark of the present invention may be three or more.
(3)上記実施形態では、メンブレンフィルタのろ過面の外に蛍光印を配置したが、本発明はこれに限定されない。
例えば、ろ過面上に蛍光印を配置するようにしてもよい。
(3) In the said embodiment, although the fluorescent mark was arrange | positioned out of the filtration surface of a membrane filter, this invention is not limited to this.
For example, fluorescent marks may be arranged on the filtration surface.
(4)上記実施形態では、蛍光印を蛍光ビーズで構成したが、本発明はこれに限定されない。
例えば、蛍光インクで蛍光印を構成するようにしてもよい。すなわち、蛍光を発するものであれば、どのようなもので蛍光印を構成するようにしてもよい。
(4) In the said embodiment, although the fluorescent mark was comprised with the fluorescent bead, this invention is not limited to this.
For example, the fluorescent mark may be made of fluorescent ink. That is, as long as it emits fluorescence, the fluorescent mark may be made of anything.
(5)上記実施形態では、蛍光印を基準にオートフォーカスしておくことで、視野が移動したとしても蛍光染色された微生物に対して従来よりも早く焦点を合わせが、本発明はこれに限定されない。
例えば、蛍光印が3点以上存在する場合には、蛍光印の空間座標から標本の面に近似する標本近似面を求め、当該標本近似面に基づいて標本の水平位置に応じた垂直位置を算出し、垂直位置を前記水平位置における合焦点とするようにしてもよい。
(5) In the embodiment described above, autofocusing is performed based on the fluorescent mark, so that even if the visual field moves, the fluorescently stained microorganism is focused earlier than before, but the present invention is limited to this. Not.
For example, when there are three or more fluorescent marks, a sample approximate surface that approximates the surface of the sample is obtained from the spatial coordinates of the fluorescent mark, and a vertical position corresponding to the horizontal position of the sample is calculated based on the sample approximate surface The vertical position may be the focal point at the horizontal position.
1…ろ過タワー、2…ろ過びん、10…ろ過装置
DESCRIPTION OF
Claims (10)
蛍光を発する蛍光印を前記フィルタ上に配置する蛍光印配置工程を具備することを特徴とする微生物検出方法。 A microorganism detection method for collecting microorganisms in a sample on a filter by filtration, and detecting fluorescence-stained microorganisms from the filter using a microscope having an autofocus function,
A method of detecting a microorganism, comprising a fluorescent mark arranging step of arranging a fluorescent mark emitting fluorescence on the filter.
蛍光を発する蛍光印が配置されていることを特徴とするフィルタ。 A filter that collects microorganisms in a sample by filtration,
A filter characterized in that a fluorescent mark emitting fluorescence is arranged.
A fluorescent mark arrangement plate, wherein a filtration hole is opened in the center, and a fluorescent mark arrangement hole is formed along an outer periphery of the filtration hole.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2009293409A JP2011133366A (en) | 2009-12-24 | 2009-12-24 | Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2009293409A JP2011133366A (en) | 2009-12-24 | 2009-12-24 | Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011133366A true JP2011133366A (en) | 2011-07-07 |
Family
ID=44346255
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009293409A Pending JP2011133366A (en) | 2009-12-24 | 2009-12-24 | Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP2011133366A (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015505051A (en) * | 2011-12-21 | 2015-02-16 | シャハーフ,キャサリン,エム. | System for imaging lesions that align tissue surfaces |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH1149997A (en) * | 1997-08-05 | 1999-02-23 | Riso Kagaku Corp | Emulsion ink for stencil printing |
WO2003067230A1 (en) * | 2002-02-07 | 2003-08-14 | Fuji Electric Holdings Co.,Ltd. | Fluorescent image measuring method and device |
WO2004022774A1 (en) * | 2002-09-05 | 2004-03-18 | Fuji Electric Systems Co.,Ltd. | Method for detecting microbe or cell |
WO2004027085A1 (en) * | 2002-09-05 | 2004-04-01 | Nitto Denko Corporation | Adhesive sheet for testing microbe on solid body and kit |
JP2004333151A (en) * | 2003-04-30 | 2004-11-25 | Tokyo Aircraft Instrument Co Ltd | Acidophilic bacterium inspecting system |
-
2009
- 2009-12-24 JP JP2009293409A patent/JP2011133366A/en active Pending
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH1149997A (en) * | 1997-08-05 | 1999-02-23 | Riso Kagaku Corp | Emulsion ink for stencil printing |
WO2003067230A1 (en) * | 2002-02-07 | 2003-08-14 | Fuji Electric Holdings Co.,Ltd. | Fluorescent image measuring method and device |
WO2004022774A1 (en) * | 2002-09-05 | 2004-03-18 | Fuji Electric Systems Co.,Ltd. | Method for detecting microbe or cell |
WO2004027085A1 (en) * | 2002-09-05 | 2004-04-01 | Nitto Denko Corporation | Adhesive sheet for testing microbe on solid body and kit |
JP2004333151A (en) * | 2003-04-30 | 2004-11-25 | Tokyo Aircraft Instrument Co Ltd | Acidophilic bacterium inspecting system |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015505051A (en) * | 2011-12-21 | 2015-02-16 | シャハーフ,キャサリン,エム. | System for imaging lesions that align tissue surfaces |
US10165976B2 (en) | 2011-12-21 | 2019-01-01 | Orlucent, Inc. | System for imaging lesions aligning tissue surfaces |
US11185278B2 (en) | 2011-12-21 | 2021-11-30 | Orlucent, Inc. | System for imaging lesions aligning tissue surfaces |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN115078319A (en) | Light sheet fluorescence microscopic imaging device for transparentizing liquid drop imaging and detection method | |
JP6072891B2 (en) | Bioanalytical device and biomolecule analyzer | |
CN104471380A (en) | Analysis device and analysis method | |
WO2015157246A2 (en) | Use of microparticle additives to simultaneously enable artifact-free image registration, auto-focusing, and chromatic aberration correction in microscopy | |
US20100182417A1 (en) | Automatic focusing apparatus, microscope, and automatic focusing method | |
JP4152054B2 (en) | Image reading device | |
CN110824165B (en) | Lung cancer tumor marker detection device and method based on micro-fluidic chip and mobile phone | |
CN102224407B (en) | Method and apparatus for rapid filter analysis of fluid samples | |
JPWO2003100086A1 (en) | Viable cell counting method and apparatus | |
JP2015190989A (en) | Slide glass with cover glass containing pattern | |
JPWO2004022774A1 (en) | Method for detecting microorganisms or cells | |
JP2020173204A (en) | Image processing system, method for processing image, and program | |
JP2011133366A (en) | Microorganism detection method, filter, and fluorescent mark arrangement board | |
JP6667419B2 (en) | Imaging apparatus and method, and imaging control program | |
JP2011004654A (en) | Method for detecting microorganisms | |
JP2016034099A (en) | Observation method using microscopic imaging apparatus | |
JP2008116422A (en) | Particulate detection apparatus | |
JP4840398B2 (en) | Antigen separation apparatus and antigen measurement method and apparatus using the same | |
WO2018123677A1 (en) | Image processing method and image processing system | |
US20190113510A1 (en) | Biological material analysis device, biological material analysis system, biological material selection method, biological material analysis program, and cell culture vessel | |
JPH026729A (en) | Measuring instrument for number of cells | |
JP4171974B2 (en) | Antigen separation apparatus and antigen measurement method and apparatus using the same | |
JP5609126B2 (en) | Microorganism detection method | |
JP5470988B2 (en) | Microorganism detection method | |
JP6875375B2 (en) | PCR container |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20121025 |
|
A977 | Report on retrieval |
Effective date: 20130910 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Effective date: 20130924 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20140218 |