EA045980B1 - ANTIBODIES AGAINST THE POLIO VIRUS RECEPTOR (PVR) AND THEIR APPLICATION - Google Patents
ANTIBODIES AGAINST THE POLIO VIRUS RECEPTOR (PVR) AND THEIR APPLICATION Download PDFInfo
- Publication number
- EA045980B1 EA045980B1 EA202291063 EA045980B1 EA 045980 B1 EA045980 B1 EA 045980B1 EA 202291063 EA202291063 EA 202291063 EA 045980 B1 EA045980 B1 EA 045980B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- seq
- antibody
- cancer
- pvr
- cells
- Prior art date
Links
- 108010048507 poliovirus receptor Proteins 0.000 title claims description 118
- 102100029740 Poliovirus receptor Human genes 0.000 title claims description 92
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 167
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 133
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 122
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 122
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 122
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 119
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 97
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 96
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 70
- 108010019670 Chimeric Antigen Receptors Proteins 0.000 claims description 55
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 55
- 102100038077 CD226 antigen Human genes 0.000 claims description 44
- 101000884298 Homo sapiens CD226 antigen Proteins 0.000 claims description 44
- 101710117290 Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 claims description 36
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 34
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 claims description 31
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 29
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims description 27
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 20
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 19
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 18
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 claims description 18
- 102100024834 T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains Human genes 0.000 claims description 16
- 101710090983 T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains Proteins 0.000 claims description 16
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 16
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 14
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims description 13
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims description 12
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 claims description 12
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims description 12
- 101000596234 Homo sapiens T-cell surface protein tactile Proteins 0.000 claims description 11
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 102100035268 T-cell surface protein tactile Human genes 0.000 claims description 11
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 11
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 claims description 11
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims description 11
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 10
- 230000028327 secretion Effects 0.000 claims description 9
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 claims description 8
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 claims description 8
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims description 8
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims description 8
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 8
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 7
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 7
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 7
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 6
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 6
- 201000005787 hematologic cancer Diseases 0.000 claims description 6
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 claims description 6
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 claims description 5
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 claims description 5
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 claims description 5
- 230000008901 benefit Effects 0.000 claims description 4
- 230000030833 cell death Effects 0.000 claims description 4
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 claims description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 claims description 4
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 3
- 101100506090 Caenorhabditis elegans hil-2 gene Proteins 0.000 claims description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 2
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 claims description 2
- 208000002495 Uterine Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 201000005188 adrenal gland cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 208000024447 adrenal gland neoplasm Diseases 0.000 claims description 2
- 208000006990 cholangiocarcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000002609 medium Substances 0.000 claims description 2
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims description 2
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 claims description 2
- 206010046766 uterine cancer Diseases 0.000 claims description 2
- PZASAAIJIFDWSB-CKPDSHCKSA-N 8-[(1S)-1-[8-(trifluoromethyl)-7-[4-(trifluoromethyl)cyclohexyl]oxynaphthalen-2-yl]ethyl]-8-azabicyclo[3.2.1]octane-3-carboxylic acid Chemical compound FC(F)(F)C=1C2=CC([C@@H](N3C4CCC3CC(C4)C(O)=O)C)=CC=C2C=CC=1OC1CCC(C(F)(F)F)CC1 PZASAAIJIFDWSB-CKPDSHCKSA-N 0.000 claims 1
- 208000000461 Esophageal Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 claims 1
- 206010030155 Oesophageal carcinoma Diseases 0.000 claims 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 208000000453 Skin Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 208000000102 Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck Diseases 0.000 claims 1
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 claims 1
- 208000024313 Testicular Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 206010057644 Testis cancer Diseases 0.000 claims 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 claims 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims 1
- 201000004101 esophageal cancer Diseases 0.000 claims 1
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 claims 1
- 201000000459 head and neck squamous cell carcinoma Diseases 0.000 claims 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 claims 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 201000005243 lung squamous cell carcinoma Diseases 0.000 claims 1
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 claims 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 claims 1
- 201000000849 skin cancer Diseases 0.000 claims 1
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 claims 1
- 201000003120 testicular cancer Diseases 0.000 claims 1
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 claims 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 53
- 238000000034 method Methods 0.000 description 40
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 description 39
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 38
- 102100035360 Cerebellar degeneration-related antigen 1 Human genes 0.000 description 35
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 31
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 30
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 27
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 20
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 18
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 17
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 16
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 16
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 16
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 16
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 15
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 14
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 14
- 102100024213 Programmed cell death 1 ligand 2 Human genes 0.000 description 13
- 230000006870 function Effects 0.000 description 13
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 13
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 13
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 13
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 13
- -1 CD112 Proteins 0.000 description 12
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 12
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 12
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 12
- 239000012272 PD-L2 inhibitor Substances 0.000 description 11
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 11
- 229940121654 pd-l2 inhibitor Drugs 0.000 description 11
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 10
- 101100407308 Mus musculus Pdcd1lg2 gene Proteins 0.000 description 10
- 239000012271 PD-L1 inhibitor Substances 0.000 description 10
- 108700030875 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Proteins 0.000 description 10
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 10
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- 229940121656 pd-l1 inhibitor Drugs 0.000 description 10
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 10
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 10
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 10
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 9
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 9
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 9
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 9
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 9
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 9
- 101001117317 Homo sapiens Programmed cell death 1 ligand 1 Proteins 0.000 description 8
- 101000611936 Homo sapiens Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 8
- 101000738335 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain Proteins 0.000 description 8
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 8
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 8
- 102100037906 T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain Human genes 0.000 description 8
- 102220009751 rs80358454 Human genes 0.000 description 8
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 8
- 101001023379 Homo sapiens Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 Proteins 0.000 description 7
- 102100035133 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 Human genes 0.000 description 7
- 102000009484 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 7
- 108010034265 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 7
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 7
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 7
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 7
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 7
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 7
- 229960002621 pembrolizumab Drugs 0.000 description 7
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 7
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 6
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 6
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 6
- 238000011577 humanized mouse model Methods 0.000 description 6
- 102220222791 rs1060501227 Human genes 0.000 description 6
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 5
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 5
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 5
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 5
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 5
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- 230000004540 complement-dependent cytotoxicity Effects 0.000 description 5
- 201000010536 head and neck cancer Diseases 0.000 description 5
- 208000014829 head and neck neoplasm Diseases 0.000 description 5
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 5
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 5
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 5
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 5
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 5
- 208000010507 Adenocarcinoma of Lung Diseases 0.000 description 4
- 206010003571 Astrocytoma Diseases 0.000 description 4
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 4
- 229940076838 Immune checkpoint inhibitor Drugs 0.000 description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 230000006051 NK cell activation Effects 0.000 description 4
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 4
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 4
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 4
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 4
- 230000008859 change Effects 0.000 description 4
- 239000002577 cryoprotective agent Substances 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 239000012274 immune-checkpoint protein inhibitor Substances 0.000 description 4
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 4
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 4
- FZWBNHMXJMCXLU-BLAUPYHCSA-N isomaltotriose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O)O1 FZWBNHMXJMCXLU-BLAUPYHCSA-N 0.000 description 4
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 4
- 201000005249 lung adenocarcinoma Diseases 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 4
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 4
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 4
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 4
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- ZBOYJODMIAUJHH-SANMLTNESA-N (2s)-1-[[2,6-dimethoxy-4-[(2-methyl-3-phenylphenyl)methoxy]phenyl]methyl]piperidine-2-carboxylic acid Chemical compound C=1C(OC)=C(CN2[C@@H](CCCC2)C(O)=O)C(OC)=CC=1OCC(C=1C)=CC=CC=1C1=CC=CC=C1 ZBOYJODMIAUJHH-SANMLTNESA-N 0.000 description 3
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 3
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 3
- QBXVXKRWOVBUDB-GRKNLSHJSA-N ClC=1C(=CC(=C(CN2[C@H](C[C@H](C2)O)C(=O)O)C1)OCC1=CC(=CC=C1)C#N)OCC1=C(C(=CC=C1)C1=CC2=C(OCCO2)C=C1)C Chemical compound ClC=1C(=CC(=C(CN2[C@H](C[C@H](C2)O)C(=O)O)C1)OCC1=CC(=CC=C1)C#N)OCC1=C(C(=CC=C1)C1=CC2=C(OCCO2)C=C1)C QBXVXKRWOVBUDB-GRKNLSHJSA-N 0.000 description 3
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 3
- 101001117312 Homo sapiens Programmed cell death 1 ligand 2 Proteins 0.000 description 3
- 101001102797 Homo sapiens Transmembrane protein PVRIG Proteins 0.000 description 3
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 3
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 208000000172 Medulloblastoma Diseases 0.000 description 3
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 3
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 3
- 208000006664 Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma Diseases 0.000 description 3
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 3
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 3
- 102100039630 Transmembrane protein PVRIG Human genes 0.000 description 3
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 3
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 3
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 3
- 229960003852 atezolizumab Drugs 0.000 description 3
- 229950002916 avelumab Drugs 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 3
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 238000003501 co-culture Methods 0.000 description 3
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 3
- 230000006240 deamidation Effects 0.000 description 3
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 229950009791 durvalumab Drugs 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- BEBCJVAWIBVWNZ-UHFFFAOYSA-N glycinamide Chemical compound NCC(N)=O BEBCJVAWIBVWNZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 3
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 3
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 3
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 3
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 3
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 3
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 3
- 238000009738 saturating Methods 0.000 description 3
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 3
- 238000009097 single-agent therapy Methods 0.000 description 3
- 208000000649 small cell carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 229950007213 spartalizumab Drugs 0.000 description 3
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 229950007123 tislelizumab Drugs 0.000 description 3
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 3
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 3
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VRMJUCBBYYGHLR-UHFFFAOYSA-N 3-(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)-1-phenylindole Chemical compound ClC1=NC(Cl)=NC(C=2C3=CC=CC=C3N(C=3C=CC=CC=3)C=2)=N1 VRMJUCBBYYGHLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000014697 Acute lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 2
- 208000003200 Adenoma Diseases 0.000 description 2
- 206010001233 Adenoma benign Diseases 0.000 description 2
- 201000003076 Angiosarcoma Diseases 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 2
- 238000011357 CAR T-cell therapy Methods 0.000 description 2
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- 241000862448 Chlorocebus Species 0.000 description 2
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 2
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 2
- 108091006020 Fc-tagged proteins Proteins 0.000 description 2
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 2
- 201000010915 Glioblastoma multiforme Diseases 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000002125 Hemangioendothelioma Diseases 0.000 description 2
- 208000001258 Hemangiosarcoma Diseases 0.000 description 2
- 102100034458 Hepatitis A virus cellular receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 101000690301 Homo sapiens Aldo-keto reductase family 1 member C4 Proteins 0.000 description 2
- 101000834898 Homo sapiens Alpha-synuclein Proteins 0.000 description 2
- 101001116548 Homo sapiens Protein CBFA2T1 Proteins 0.000 description 2
- 101000652359 Homo sapiens Spermatogenesis-associated protein 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000955999 Homo sapiens V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000666896 Homo sapiens V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation Proteins 0.000 description 2
- 102000017578 LAG3 Human genes 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 2
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 2
- 241000282567 Macaca fascicularis Species 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 2
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 description 2
- 108091007491 NSP3 Papain-like protease domains Proteins 0.000 description 2
- 102100035488 Nectin-2 Human genes 0.000 description 2
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- NBBJYMSMWIIQGU-UHFFFAOYSA-N Propionic aldehyde Chemical compound CCC=O NBBJYMSMWIIQGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 2
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- 102100023935 Transmembrane glycoprotein NMB Human genes 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 2
- 102100038929 V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100038282 V-type immunoglobulin domain-containing suppressor of T-cell activation Human genes 0.000 description 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 2
- 239000003098 androgen Substances 0.000 description 2
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 2
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 2
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 2
- 238000000533 capillary isoelectric focusing Methods 0.000 description 2
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 2
- 229960005395 cetuximab Drugs 0.000 description 2
- 108091008033 coinhibitory receptors Proteins 0.000 description 2
- 201000010989 colorectal carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 2
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 2
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 229940119744 dextran 40 Drugs 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 2
- IJJVMEJXYNJXOJ-UHFFFAOYSA-N fluquinconazole Chemical compound C=1C=C(Cl)C=C(Cl)C=1N1C(=O)C2=CC(F)=CC=C2N=C1N1C=NC=N1 IJJVMEJXYNJXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 2
- 102000054751 human RUNX1T1 Human genes 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 230000002601 intratumoral effect Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 208000003747 lymphoid leukemia Diseases 0.000 description 2
- 238000007885 magnetic separation Methods 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 2
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 208000010658 metastatic prostate carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 2
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N monopropylene glycol Natural products CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000008968 osteosarcoma Diseases 0.000 description 2
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 2
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 2
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 2
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 201000009410 rhabdomyosarcoma Diseases 0.000 description 2
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N thioacetamide Natural products CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 2
- 108091007466 transmembrane glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 230000005909 tumor killing Effects 0.000 description 2
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 2
- 229920003169 water-soluble polymer Polymers 0.000 description 2
- WNXJIVFYUVYPPR-UHFFFAOYSA-N 1,3-dioxolane Chemical compound C1COCO1 WNXJIVFYUVYPPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003349 3-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([*])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 244000303258 Annona diversifolia Species 0.000 description 1
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100029822 B- and T-lymphocyte attenuator Human genes 0.000 description 1
- 208000025324 B-cell acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000010839 B-cell chronic lymphocytic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 101000840545 Bacillus thuringiensis L-isoleucine-4-hydroxylase Proteins 0.000 description 1
- 206010004146 Basal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241001416153 Bos grunniens Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100024263 CD160 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100038078 CD276 antigen Human genes 0.000 description 1
- 101710185679 CD276 antigen Proteins 0.000 description 1
- JEDPSOYOYVELLZ-UHFFFAOYSA-N COc1nc(OCc2cccc(c2C)-c2ccccc2)ccc1CNCCNC(C)=O Chemical compound COc1nc(OCc2cccc(c2C)-c2ccccc2)ccc1CNCCNC(C)=O JEDPSOYOYVELLZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002134 Carboxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 201000000274 Carcinosarcoma Diseases 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 208000005243 Chondrosarcoma Diseases 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- VKDUZONDVBDCAX-VNUFCWELSA-N Cl.C(#N)C=1C=C(COC2=C(CN[C@H](CO)C(=O)O)C=C(C(=C2)OCC2=C(C(=CC=C2)C2=CC3=C(OCCO3)C=C2)C)C)C=CC1 Chemical compound Cl.C(#N)C=1C=C(COC2=C(CN[C@H](CO)C(=O)O)C=C(C(=C2)OCC2=C(C(=CC=C2)C2=CC3=C(OCCO3)C=C2)C)C)C=CC1 VKDUZONDVBDCAX-VNUFCWELSA-N 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 108050006400 Cyclin Proteins 0.000 description 1
- 102000016736 Cyclin Human genes 0.000 description 1
- 201000005171 Cystadenoma Diseases 0.000 description 1
- 102100025621 Cytochrome b-245 heavy chain Human genes 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 1
- 231100000491 EC50 Toxicity 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 208000005431 Endometrioid Carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 1
- CTKXFMQHOOWWEB-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide/propylene oxide copolymer Chemical compound CCCOC(C)COCCO CTKXFMQHOOWWEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 208000004057 Focal Nodular Hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 230000035519 G0 Phase Effects 0.000 description 1
- 230000010190 G1 phase Effects 0.000 description 1
- 208000000527 Germinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- 206010018404 Glucagonoma Diseases 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 206010018852 Haematoma Diseases 0.000 description 1
- 206010019629 Hepatic adenoma Diseases 0.000 description 1
- 101710083479 Hepatitis A virus cellular receptor 2 homolog Proteins 0.000 description 1
- 208000017604 Hodgkin disease Diseases 0.000 description 1
- 208000010747 Hodgkins lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 101000864344 Homo sapiens B- and T-lymphocyte attenuator Proteins 0.000 description 1
- 101000761938 Homo sapiens CD160 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000737793 Homo sapiens Cerebellar degeneration-related antigen 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000935587 Homo sapiens Flavin reductase (NADPH) Proteins 0.000 description 1
- 101001068133 Homo sapiens Hepatitis A virus cellular receptor 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001037256 Homo sapiens Indoleamine 2,3-dioxygenase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001034652 Homo sapiens Insulin-like growth factor 1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000599940 Homo sapiens Interferon gamma Proteins 0.000 description 1
- 101000984189 Homo sapiens Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001138062 Homo sapiens Leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001137987 Homo sapiens Lymphocyte activation gene 3 protein Proteins 0.000 description 1
- 101000586618 Homo sapiens Poliovirus receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000836954 Homo sapiens Sialic acid-binding Ig-like lectin 10 Proteins 0.000 description 1
- 101000863882 Homo sapiens Sialic acid-binding Ig-like lectin 7 Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008029 Immune checkpoint ligands Proteins 0.000 description 1
- 102000037977 Immune checkpoint ligands Human genes 0.000 description 1
- 102000037982 Immune checkpoint proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008036 Immune checkpoint proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 102000006496 Immunoglobulin Heavy Chains Human genes 0.000 description 1
- 108010019476 Immunoglobulin Heavy Chains Proteins 0.000 description 1
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 1
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 1
- 102000016844 Immunoglobulin-like domains Human genes 0.000 description 1
- 108050006430 Immunoglobulin-like domains Proteins 0.000 description 1
- 102100040061 Indoleamine 2,3-dioxygenase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700001097 Insect Genes Proteins 0.000 description 1
- 102100039688 Insulin-like growth factor 1 receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010043610 KIR Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100033627 Killer cell immunoglobulin-like receptor 3DL1 Human genes 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 101150030213 Lag3 gene Proteins 0.000 description 1
- 208000018142 Leiomyosarcoma Diseases 0.000 description 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 1
- 102100025583 Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100020943 Leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000036241 Liver adenomatosis Diseases 0.000 description 1
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 description 1
- 208000028018 Lymphocytic leukaemia Diseases 0.000 description 1
- 102000012750 Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010090054 Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 206010027406 Mesothelioma Diseases 0.000 description 1
- 206010027458 Metastases to lung Diseases 0.000 description 1
- 206010027480 Metastatic malignant melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108700005443 Microbial Genes Proteins 0.000 description 1
- 206010057269 Mucoepidermoid carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000034578 Multiple myelomas Diseases 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 108010082739 NADPH Oxidase 2 Proteins 0.000 description 1
- 206010029488 Nodular melanoma Diseases 0.000 description 1
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 208000032366 Oversensing Diseases 0.000 description 1
- 239000012270 PD-1 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000012668 PD-1-inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 241000009328 Perro Species 0.000 description 1
- 208000007913 Pituitary Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000007452 Plasmacytoma Diseases 0.000 description 1
- 229920002732 Polyanhydride Polymers 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 206010051807 Pseudosarcoma Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 230000010799 Receptor Interactions Effects 0.000 description 1
- 206010070308 Refractory cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000000582 Retinoblastoma Diseases 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 238000011579 SCID mouse model Methods 0.000 description 1
- 101001037255 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Indoleamine 2,3-dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- 102100027164 Sialic acid-binding Ig-like lectin 10 Human genes 0.000 description 1
- 102100029946 Sialic acid-binding Ig-like lectin 7 Human genes 0.000 description 1
- 208000032383 Soft tissue cancer Diseases 0.000 description 1
- 102000005157 Somatostatin Human genes 0.000 description 1
- 108010056088 Somatostatin Proteins 0.000 description 1
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 101100215487 Sus scrofa ADRA2A gene Proteins 0.000 description 1
- 229940126547 T-cell immunoglobulin mucin-3 Drugs 0.000 description 1
- 206010043276 Teratoma Diseases 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 201000005969 Uveal melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 1
- 241001416177 Vicugna pacos Species 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 206010047741 Vulval cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000004354 Vulvar Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000008383 Wilms tumor Diseases 0.000 description 1
- 208000012018 Yolk sac tumor Diseases 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SAZUGELZHZOXHB-UHFFFAOYSA-N acecarbromal Chemical compound CCC(Br)(CC)C(=O)NC(=O)NC(C)=O SAZUGELZHZOXHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 206010000583 acral lentiginous melanoma Diseases 0.000 description 1
- 208000009621 actinic keratosis Diseases 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 208000002517 adenoid cystic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000001256 adenosarcoma Diseases 0.000 description 1
- 201000008395 adenosquamous carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 1
- 230000009824 affinity maturation Effects 0.000 description 1
- 238000012867 alanine scanning Methods 0.000 description 1
- 239000000956 alloy Substances 0.000 description 1
- 229910045601 alloy Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 230000002482 anti-endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 230000009830 antibody antigen interaction Effects 0.000 description 1
- 238000009175 antibody therapy Methods 0.000 description 1
- 238000010913 antigen-directed enzyme pro-drug therapy Methods 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 208000029336 bartholin gland carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229920000249 biocompatible polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 108091006004 biotinylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 201000008275 breast carcinoma Diseases 0.000 description 1
- KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N brefeldin A Chemical compound O[C@@H]1\C=C\C(=O)O[C@@H](C)CCC\C=C\[C@@H]2C[C@H](O)C[C@H]21 KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N 0.000 description 1
- JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N brefeldin-A Natural products CC1CCCC=CC2(C)CC(O)CC2(C)C(O)C=CC(=O)O1 JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZTQSAGDEMFDKMZ-UHFFFAOYSA-N butyric aldehyde Natural products CCCC=O ZTQSAGDEMFDKMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010948 carboxy methyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000008112 carboxymethyl-cellulose Substances 0.000 description 1
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000004709 cell invasion Effects 0.000 description 1
- 230000012292 cell migration Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 1
- 238000002659 cell therapy Methods 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 1
- 238000011284 combination treatment Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 230000009827 complement-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000005138 cryopreservation Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 210000005220 cytoplasmic tail Anatomy 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000002784 cytotoxicity assay Methods 0.000 description 1
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 1
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 description 1
- 229940121647 egfr inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000001991 endodermal sinus tumor Diseases 0.000 description 1
- 201000003908 endometrial adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000006828 endometrial hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 201000000330 endometrial stromal sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 208000028730 endometrioid adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000029179 endometrioid stromal sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 208000037828 epithelial carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229920001038 ethylene copolymer Polymers 0.000 description 1
- DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol bis(2-aminoethyl)tetraacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCOCCOCCN(CC(O)=O)CC(O)=O DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005038 ethylene vinyl acetate Substances 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 1
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 1
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 1
- 238000010230 functional analysis Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 201000003115 germ cell cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003128 head Anatomy 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 201000002222 hemangioblastoma Diseases 0.000 description 1
- 201000011066 hemangioma Diseases 0.000 description 1
- 208000006359 hepatoblastoma Diseases 0.000 description 1
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 description 1
- 102000043557 human IFNG Human genes 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 239000000017 hydrogel Substances 0.000 description 1
- 229920003063 hydroxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 229940031574 hydroxymethyl cellulose Drugs 0.000 description 1
- 230000005965 immune activity Effects 0.000 description 1
- 229940126546 immune checkpoint molecule Drugs 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000012308 immunohistochemistry method Methods 0.000 description 1
- 238000012405 in silico analysis Methods 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 1
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000014828 interferon-gamma production Effects 0.000 description 1
- 238000010212 intracellular staining Methods 0.000 description 1
- 208000020082 intraepithelial neoplasia Diseases 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 229950003188 isovaleryl diethylamide Drugs 0.000 description 1
- 208000003849 large cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000012007 large scale cell culture Methods 0.000 description 1
- 206010024627 liposarcoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 201000005296 lung carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 238000002794 lymphocyte assay Methods 0.000 description 1
- 239000012931 lyophilized formulation Substances 0.000 description 1
- 108010026228 mRNA guanylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N maleic anhydride Chemical compound O=C1OC(=O)C=C1 FPYJFEHAWHCUMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000030883 malignant astrocytoma Diseases 0.000 description 1
- 208000006178 malignant mesothelioma Diseases 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 108010082117 matrigel Proteins 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 239000012092 media component Substances 0.000 description 1
- 201000008203 medulloepithelioma Diseases 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 208000021039 metastatic melanoma Diseases 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- IZXGZAJMDLJLMF-UHFFFAOYSA-N methylaminomethanol Chemical compound CNCO IZXGZAJMDLJLMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004530 micro-emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 239000003094 microcapsule Substances 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 210000000066 myeloid cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000025113 myeloid leukemia Diseases 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000003739 neck Anatomy 0.000 description 1
- 108010068617 neonatal Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 description 1
- 201000008026 nephroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 201000000032 nodular malignant melanoma Diseases 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 1
- 230000008650 pH stress Effects 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 201000005163 papillary serous adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000024641 papillary serous cystadenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 229940121655 pd-1 inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000036470 plasma concentration Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920001993 poloxamer 188 Polymers 0.000 description 1
- 229940044519 poloxamer 188 Drugs 0.000 description 1
- 229920001308 poly(aminoacid) Polymers 0.000 description 1
- 229920001200 poly(ethylene-vinyl acetate) Polymers 0.000 description 1
- 229920001583 poly(oxyethylated polyols) Polymers 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 1
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 1
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229940068977 polysorbate 20 Drugs 0.000 description 1
- 229940068968 polysorbate 80 Drugs 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 208000029340 primitive neuroectodermal tumor Diseases 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 208000037821 progressive disease Diseases 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 201000005825 prostate adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000001514 prostate carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 1
- 230000036593 pulmonary vascular resistance Effects 0.000 description 1
- 238000007420 radioactive assay Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 229920005604 random copolymer Polymers 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 description 1
- 208000016691 refractory malignant neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 201000007416 salivary gland adenoid cystic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 208000004548 serous cystadenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000009450 sialylation Effects 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N somatostatin Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2C3=CC=CC=C3NC=2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)[C@@H](C)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N)C(O)=O)=O)[C@H](O)C)C1=CC=CC=C1 NHXLMOGPVYXJNR-ATOGVRKGSA-N 0.000 description 1
- 229960000553 somatostatin Drugs 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000008174 sterile solution Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000009662 stress testing Methods 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004797 therapeutic response Effects 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 238000012876 topography Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013413 tumor xenograft mouse model Methods 0.000 description 1
- 238000007492 two-way ANOVA Methods 0.000 description 1
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000004222 uncontrolled growth Effects 0.000 description 1
- 208000010576 undifferentiated carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 210000003932 urinary bladder Anatomy 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 206010046885 vaginal cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000013139 vaginal neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000008662 verrucous carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 201000005102 vulva cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Description
Область техники, к которой относится настоящее изобретениеField of technology to which the present invention relates
Настоящее изобретение касается области иммунотерапии и относится к гуманизированным антителам, которые специфически связываются с человеческим рецептором полиовируса (PVR), содержащим определенные наборы CDR и последовательностей каркасных областей. Изобретение также относится к фармацевтическим композициям, содержащим указанные гуманизированные антитела, и их применениям.The present invention relates to the field of immunotherapy and relates to humanized antibodies that specifically bind to the human poliovirus receptor (PVR) containing specific sets of CDRs and framework sequences. The invention also relates to pharmaceutical compositions containing said humanized antibodies and their uses.
Предшествующий уровень техники настоящего изобретенияBACKGROUND OF THE INVENTION
Рецептор полиовируса (PVR), также называемый CD155, представляет собой трансмембранный гликопротеин, вовлеченный в медиацию адгезии клеток к молекулам внеклеточного матрикса. Ранее он был описан как опухолевый антиген и как потенциальная мишень для терапевтического воздействия, поскольку его экспрессия повышается при нейроэктодермальных раках, включающих мультиформную глиобластому, медуллобластому и карциному толстой и прямой кишки (Solecki et al., J. Biol. Chem. 2002, 277: 25697-700), а также при раке поджелудочной железы (Nishiwada et al., Anticancer Res. 2015, 35(4): 2287-97). Также известно, что PVR усиливает индуцированную сывороткой активацию сигнального пути Ras-Raf-MEK-ERK, активируя циклины D2 и Е и подавляя p27Kipl, что в конечном итоге сокращает продолжительность фазы G0/G1 клеточного цикла. (Kakunaga 2004, J. Biological Chemistry, 279, 36419-36425. По этой причине ожидается, что блокирование PVR на опухолевых клетках снижает их жизнеспособность. PVR также играет критическую роль в ангиогенезе, и предполагается, что он регулирует VEGFиндуцированный ангиогенез посредством контроля взаимодействия рецептора фактора роста эндотелия сосудов 2 (VEGFR2) с a(v)P(3) интегрином и опосредованного VEGFR2 сигнального пути Rap1-Akt (Kinugasa et al., 2012, Circ Res. 2012, 110(5),716-26). Кроме того, PVR образует комплекс с IGF1R и участвует в передаче сигнала тирозин-протеинкиназы Met (cMet), и блокирование образования комплекса снижало жизнеспособность клеток и ангиогенез (Lee et al., Scientific Reports 2014, 20, 4, 7139).The poliovirus receptor (PVR), also called CD155, is a transmembrane glycoprotein involved in mediating cell adhesion to extracellular matrix molecules. It has previously been described as a tumor antigen and as a potential therapeutic target because its expression is increased in neuroectodermal cancers, including glioblastoma multiforme, medulloblastoma, and colorectal carcinoma (Solecki et al., J. Biol. Chem. 2002, 277: 25697-700), as well as in pancreatic cancer (Nishiwada et al., Anticancer Res. 2015, 35(4): 2287-97). PVR is also known to enhance serum-induced activation of the Ras-Raf-MEK-ERK signaling pathway by activating cyclins D2 and E and suppressing p27Kipl, which ultimately shortens the duration of the G0/G1 phase of the cell cycle. (Kakunaga 2004, J. Biological Chemistry, 279, 36419-36425. For this reason, blocking PVR on tumor cells is expected to reduce their viability. PVR also plays a critical role in angiogenesis and is thought to regulate VEGF-induced angiogenesis by controlling receptor interaction vascular endothelial growth factor 2 (VEGFR2) with a(v)P(3) integrin and the VEGFR2-mediated Rap1-Akt signaling pathway (Kinugasa et al., 2012, Circ Res. 2012, 110(5),716-26). In addition, PVR forms a complex with IGF1R and is involved in protein tyrosine kinase Met (cMet) signaling, and blocking complex formation reduced cell viability and angiogenesis (Lee et al., Scientific Reports 2014, 20, 4, 7139).
В последние годы стало очевидно, что PVR является важным лигандом иммунной контрольной точки (Brilc PK et al. 2019 Cell Mol Immunology). Экспрессия PVR повышается как в злокачественных клетках, так и в инфильтрирующих опухоль миелоидных клетках, у людей и мышей. У мышей PVR-/наблюдается снижение роста опухоли и метастазирование за счет активации DNAM-1 (CD226) и усиления эффекторной функции CD8+ Т- и NK-клеток, соответственно. Блокада белка-1 программируемой гибели клеток (PD-1) или обоих: PD-1 и цитотоксического Т-лимфоцитарного антигена 4 (CTLA4) более эффективна в условиях, когда количество PVR было ограничено, что свидетельствует о клиническом потенциале комбинированной терапии с использованием PD-1/PD-L1 и блокады PVR (LI XY et.al JCI2018). Более того, в клинических условиях экспрессия PD-L1 и PVR регулируется независимо, что позволило разделить пациентов, получавших терапию анти-PD-1-антителом, на 4 группы в зависимости от уровней экспрессии PD-L1 и PVR. Высокая экспрессия PVR у пациентов с низкой экспрессией PD-L1 улучшала состояние не отвечающих на терапию. Это было дополнительно подтверждено с использованием генно-инженерной модели рака. Эти результаты подтверждают значение PVR, как важной иммунной контрольной точки в иммунотерапии опухолей (Lee BR et al. JCI. Insight, 2020). Участие PVR в метастазировании было продемонстрировано посредством инъекции раковых клеток в хвост мышей и измерения метастазов в легких. Было показано, что активированный PVR в раковых клетках перекрестно взаимодействует со своим контррецептором в тромбоцитах, и что такое перекрестное взаимодействие усиливает метастазирование раковых клеток в легкие (Morimoto et al., Oncogene (2008) 27, 264-273).In recent years, it has become apparent that PVR is an important immune checkpoint ligand (Brilc PK et al. 2019 Cell Mol Immunology). PVR expression is increased in both malignant cells and tumor-infiltrating myeloid cells in humans and mice. PVR−/mice exhibit reduced tumor growth and metastasis through activation of DNAM-1 (CD226) and increased effector function of CD8+ T and NK cells, respectively. Blockade of programmed cell death protein-1 (PD-1) or both PD-1 and cytotoxic T-lymphocyte antigen 4 (CTLA4) was more effective in settings where the number of PVRs was limited, suggesting the clinical potential of combination therapy using PD-1. 1/PD-L1 and PVR blockade (LI XY et.al JCI2018). Moreover, in clinical settings, the expression of PD-L1 and PVR is independently regulated, which allowed patients treated with anti-PD-1 antibody therapy to be divided into 4 groups depending on the expression levels of PD-L1 and PVR. High PVR expression in patients with low PD-L1 expression improved treatment non-responders. This was further confirmed using a genetically engineered cancer model. These results support the importance of PVR as an important immune checkpoint in tumor immunotherapy (Lee BR et al. JCI. Insight, 2020). The involvement of PVR in metastasis was demonstrated by injecting cancer cells into the tail of mice and measuring lung metastases. It has been shown that activated PVR in cancer cells cross-talks with its counter-receptor in platelets, and that such cross-talk enhances cancer cell metastasis to the lung (Morimoto et al., Oncogene (2008) 27, 264-273).
В публикации WO 2017149538 одного из авторов настоящего изобретения описаны мышиные антитела и их фрагменты, которые связываются с PVR, а также кодирующие их полинуклеотидные последовательности и клетки гибридомы, продуцирующие эти антитела.Publication WO 2017149538 of one of the authors of the present invention describes murine antibodies and fragments thereof that bind to PVR, as well as the polynucleotide sequences encoding them and the hybridoma cells that produce these antibodies.
В публикации заявки на выдачу патента США № 20070041985 раскрываются молекулы, которые специфически связываются по меньшей мере с одним внутри- или внеклеточным доменом PVR, причем молекула обладает способностью модулировать опосредованную рецептором адгезию, миграцию и/или инвазию клетки, экспрессирующей PVR или любое его производное.US Patent Application Publication No. 20070041985 discloses molecules that specifically bind to at least one intra- or extracellular domain of PVR, wherein the molecule has the ability to modulate receptor-mediated adhesion, migration and/or invasion of a cell expressing PVR or any derivative thereof.
В публикации заявки на выдачу патента США № 20090215175 предлагаются молекулы (например, низкомолекулярные химические соединения, олигонуклеотиды, полипептиды, антитела и фрагменты антител), которые модулируют функции PVR, необходимые для адгезии, миграции, инвазии и/или метастатического потенциала клеток. Указанные молекулы можно применять для лечения путем воздействия на клетки с метастатическим потенциалом, метастаза и рака.US Patent Application Publication No. 20090215175 proposes molecules (eg, small molecule chemicals, oligonucleotides, polypeptides, antibodies, and antibody fragments) that modulate PVR functions required for cell adhesion, migration, invasion, and/or metastatic potential. These molecules can be used for treatment by targeting cells with metastatic potential, metastasis and cancer.
Существует неудовлетворенная потребность в создании гуманизированных антител, распознающих человеческий PVR, которые являются более безопасными и более эффективными и могут использоваться в диагностических и терапевтических целях при заболеваниях, связанных с экспрессией PVR.There is an unmet need to develop humanized antibodies that recognize human PVR, which are safer and more effective and can be used for diagnostic and therapeutic purposes in diseases associated with PVR expression.
- 1 045980- 1 045980
Сущность настоящего изобретенияSummary of the present invention
В настоящем документе, согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, описаны гуманизированные антитела, которые специфически связываются с человеческим рецептором полиовируса (PVR; CD155) и предотвращают связывание PVR по меньшей мере с одним из лигандов, Т-клеточным иммунорецептором с доменами Ig и ITIM (TIGIT), CD96 и CD226 (DNAM-1). Гуманизированные антитела по настоящему изобретению, выбранные из большой коллекции клонов антител, обладают улучшенными свойствами по сравнению с другими известными анти-PVR антителами. Эти улучшенные свойства включают, но не ограничиваются следующими: сниженный потенциал иммуногенности, улучшенная аффинность связывания, активность и биофизические свойства, и улучшенная экспрессия. Поскольку связывание PVR с CD226 приводит к подавлению экспрессии CD226 на поверхности Т- и NK-клеток и снижению активности CD226 в отношении стимуляции Т- и NK-клеток и уничтожения опухолевых клеток, антитела по настоящему изобретению могут восстанавливать экспрессию и/или активность CD226 на этих клетках. Надлежащая экспрессия и функционирование CD226 обеспечивает более эффективное уничтожение опухоли иммунными клетками, в частности, CD8+ Т -клетками и NK- клетками.Disclosed herein, in accordance with some embodiments of the invention, are humanized antibodies that specifically bind to the human poliovirus receptor (PVR; CD155) and prevent PVR from binding to at least one of the ligands, T-cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (TIGIT) , CD96 and CD226 (DNAM-1). The humanized antibodies of the present invention, selected from a large collection of antibody clones, have improved properties compared to other known anti-PVR antibodies. These improved properties include, but are not limited to: reduced immunogenicity potential, improved binding affinity, activity and biophysical properties, and improved expression. Since binding of PVR to CD226 results in suppression of CD226 expression on the surface of T and NK cells and a decrease in the activity of CD226 in stimulating T and NK cells and killing tumor cells, the antibodies of the present invention can restore the expression and/or activity of CD226 on these cells. Proper expression and function of CD226 ensures more effective tumor killing by immune cells, in particular CD8+ T cells and NK cells.
Посредством комбинирования определенных наборов последовательностей участков CDR и последовательностей каркасных участков человека и введения определенных мутаций в эти последовательности для получения улучшенных антител с модифицированными вариабельными областями была получена большая коллекция гуманизированных антител. Новые разработанные гуманизированные вариабельные области сохраняют остатки, критически важные для поддержания конформации антитела и аффинности связывания, и в то же время имеют наименьшую частоту потенциальных Т-клеточных эпитопов, что сводит к минимуму риск нежелательного иммунного ответа на антитела. Описанные здесь антитела были сконструированы с учетом таких факторов, как гомология, Т-клеточные эпитопы, ключевые остатки и предсказанные структуры.By combining certain sets of human CDR region sequences and human framework sequences and introducing certain mutations into these sequences to produce improved antibodies with modified variable regions, a large collection of humanized antibodies has been obtained. The newly designed humanized variable regions retain residues critical to maintaining antibody conformation and binding affinity, while at the same time having the lowest frequency of potential T cell epitopes, thereby minimizing the risk of an unwanted immune response to antibodies. The antibodies described here were designed taking into account factors such as homology, T cell epitopes, key residues and predicted structures.
Варианты с комбинацией специфических человеческих каркасных областей и точечной мутации глутаминовой кислоты в аспарагин в последнем остатке CDR2 вариабельной области легкой цепи (позиция 56 согласно нумерации по Kabat), неожиданно демонстрируют сильное сродство к человеческому PVR и улучшенную иммунную активность.Variants with a combination of specific human framework regions and a point mutation of glutamic acid to asparagine in the last residue of the light chain variable region CDR2 (position 56 according to Kabat numbering) unexpectedly demonstrate strong affinity for human PVR and improved immune activity.
Было обнаружено, что несколько вариантов гуманизированных антител по изобретению являются особенно подходящими для использования в химерных антигенных рецепторах (CAR), благодаря их более низкой аффинности, которая может быть полезна для нацеливания на опухолевые клетки с высокой экспрессией PVR без нацеливания на нормальные ткани.Several variants of the humanized antibodies of the invention have been found to be particularly suitable for use in chimeric antigen receptors (CARs) due to their lower affinity, which may be useful for targeting tumor cells with high PVR expression without targeting normal tissues.
Несколько вариантов гуманизированных антител по настоящему изобретению обеспечивают преимущество, состоящее в улучшенной технологичности, и могут быть получены с исключительно высоким выходом по сравнению с другими вариантами.Several variants of the humanized antibodies of the present invention provide the advantage of improved processability and can be produced in exceptionally high yield compared to other variants.
В настоящее время раскрыто, что гуманизированное антитело, описанное в настоящем документе, демонстрирует высокую эффективность в отношении стимуляции цитотоксических Т- и NK-клеток, а также при лечении рака на гуманизированных мышиных моделях, включая in vivo модели рака поджелудочной железы и рака легких.The humanized antibody described herein has now been disclosed to be highly effective in stimulating cytotoxic T and NK cells and in treating cancer in humanized mouse models, including in vivo models of pancreatic cancer and lung cancer.
Таким образом, настоящее изобретение предлагает в некоторых вариантах осуществления высокоспецифичные неиммуногенные гуманизированные антитела против человеческого PVR, обладающие улучшенной аффинностью, активностью и/или воспроизводимостью.Thus, the present invention provides, in some embodiments, highly specific non-immunogenic humanized anti-human PVR antibodies having improved affinity, activity and/or reproducibility.
Согласно одному аспекту настоящего изобретения, предложено гуманизированное антитело, которое специфически связывается с человеческим рецептором полиовируса (PVR, CD155) или его фрагментом, содержащим по меньшей мере антигенсвязывающий сайт, причем антитело или его фрагмент содержат тяжелую цепь и легкую цепь, где тяжелая цепь содержит вариабельную область с аминокислотной последовательностью, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и где легкая цепь содержит вариабельную область с аминокислотной последовательностью, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.According to one aspect of the present invention, a humanized antibody is provided that specifically binds to the human poliovirus receptor (PVR, CD155) or a fragment thereof comprising at least an antigen binding site, wherein the antibody or fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises a variable a region with an amino acid sequence at least about 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6 ; and wherein the light chain comprises a variable region with an amino acid sequence at least about 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9 .
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело содержит аминокислотную последовательность вариабельной области тяжелой цепи, содержащую последовательности CDR, соответствующие SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11 и SEQ ID NO: 12, и аминокислотную последовательность вариабельной области легкой цепи, содержащую последовательности CDR, соответствующие SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14 и SEQ ID NO: 15.In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain variable region amino acid sequence comprising the CDR sequences corresponding to SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11 and SEQ ID NO: 12, and a light chain variable region amino acid sequence comprising the CDR sequences corresponding to SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14 and SEQ ID NO: 15.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его фрагмент представляет собой моноклональное антитело IgG. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное моноклональное антитело содержит константную область тяжелой цепи, выбранную из IgG4 и IgG1. В некоторых вариантах осуществления изобретения гуманизированное антитело или его фрагмент относится к подклассу IgG4. В некоторых вариантах осуществления изобретения гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент относится к подклассу IgG1.In some embodiments, the humanized antibody or fragment thereof is an IgG monoclonal antibody. In accordance with some embodiments of the invention, the humanized monoclonal antibody comprises a heavy chain constant region selected from IgG4 and IgG1. In some embodiments, the humanized antibody or fragment thereof is of the IgG4 subclass. In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof is of the IgG1 subclass.
- 2 045980- 2 045980
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его фрагмент содержат константную область человеческого IgG4, имеющую замену S228P (также называемую S241P) в шарнирной области.In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody or fragment thereof comprises a human IgG4 constant region having an S228P (also referred to as S241P) substitution in the hinge region.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его фрагмент представляет собой моноклональное антитело, Fab, F(ab)2, однодоменное антитело или одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv).In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody or fragment thereof is a monoclonal antibody, Fab, F(ab) 2 , single domain antibody, or single chain variable fragment (scFv).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательностьIn accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence
QVQLVQSGAE(L/V)KKPGASVK(I/V)SCKATGYTFSNYWIEW(I/V)(K/R)QAPGQGLEW(I/M)GEIFPGSG RINFNEKFKGR(A/V)TFTADTSI(D/S)T(T/A)YM(Q/E)LS(S/R)L(T/R)SDD(S/T)AVYYCARTKIYGNSFDY WGQGT(T/L)VTVSS (SEQ ID NO: 47); и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательностьQVQLVQSGAE(L/V)KKPGASVK(I/V)SCKATGYTFSNYWIEW(I/V)(K/R)QAPGQGLEW(I/M)GEIFPGSG RINFNEKFKGR(A/V)TFTADTSI(D/S)T(T/A)YM( Q/E)LS(S/R)L(T/R)SDD(S/T)AVYYCARTKIYGNSFDY WGQGT(T/L)VTVSS (SEQ ID NO: 47); and a light chain variable region containing the amino acid sequence
DI(M/Q)MTQSPS(F/S)LSASVGDRVTITC(K/R)ASQDVGTAV(V/A)WYQQKPGKAPK(L/S)LIYWASSRHE GVP(D/S)RF(T/S)GSGSGTDFTLTISSLQ(S/P)EDFA(D/T)YFCQQYSRYPLT FGQGT KLEIK (SEQ ID NO: 48).DI(M/Q)MTQSPS(F/S)LSASVGDRVTITC(K/R)ASQDVGTAV(V/A)WYQQKPGKAPK(L/S)LIYWASSRHE GVP(D/S)RF(T/S)GSGSGTDFTLTISSLQ(S/P)EDFA (D/T)YFCQQYSRYPLT FGQGT KLEIK (SEQ ID NO: 48).
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: i) набор из трех последовательностей CDR, содержащих последовательности, представленные в SEQ ID NO: 10-12; и ii) набор из четырех последовательностей каркасных участков тяжелой цепи (FR):In some embodiments, the humanized antibody or fragment thereof comprises a heavy chain variable region comprising: i) a set of three CDR sequences comprising the sequences set forth in SEQ ID NOs: 10-12; and ii) a set of four heavy chain framework region (FR) sequences:
(A) FR-H1, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18, 22 и 26;(A) FR-H1 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 18, 22 and 26;
(B) FR-H2, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 19, 23 и 28;(B) FR-H2 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 19, 23 and 28;
(С) FR-H3, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 20, 24, 27 и 29; и (D) FR-H4, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 21 и 25.(C) FR-H3 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 20, 24, 27 and 29; and (D) FR-H4 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 21 and 25.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область легкой цепи, содержащую:In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a light chain variable region comprising:
i) набор из трех последовательностей CDR, содержащих последовательности, представленные в SEQ ID NO: 13-15; и ii) набор из четырех последовательностей каркасных участков легкой цепи:i) a set of three CDR sequences containing the sequences presented in SEQ ID NO: 13-15; and ii) a set of four light chain framework sequences:
(A) FR-L1, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 30 и 34;(A) FR-L1 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 30 and 34;
(B) FR-L2, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 31 и 37;(B) FR-L2 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 31 and 37;
(C) FR-L3, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32, 35 и 36; и (D) FR-L4 представляющий собой SEQ ID NO: 33.(C) FR-L3 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 32, 35 and 36; and (D) FR-L4 being SEQ ID NO: 33.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи, причем вариабельная область тяжелой цепи содержит:In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable region and a light chain variable region, wherein the heavy chain variable region comprises:
i) набор из трех последовательностей CDR, содержащих последовательности, представленные в SEQ ID NO: 10-12; и ii) набор из четырех последовательностей каркасных участков (FR) тяжелой цепи (НС):i) a set of three CDR sequences containing the sequences presented in SEQ ID NO: 10-12; and ii) a set of four heavy chain framework (FR) sequences:
(A) FR-H1, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18, 22 и 26;(A) FR-H1 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 18, 22 and 26;
(В) FR-H2, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 19, 23 и 28;(B) FR-H2 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 19, 23 and 28;
(С) FR-H3, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 20, 24, 27 и 29;(C) FR-H3 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 20, 24, 27 and 29;
(D) FR-H4, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 21 и 25;(D) FR-H4 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 21 and 25;
и вариабельная область легкой цепи содержит:and the light chain variable region contains:
i) набор из трех последовательностей CDR, содержащих последовательности, представленные в SEQ ID NO: 13-15; и ii) набор из четырех последовательностей каркасных участков (FR) легкой цепи (LC):i) a set of three CDR sequences containing the sequences presented in SEQ ID NO: 13-15; and ii) a set of four light chain (LC) framework regions (FR) sequences:
(A) FR-L1, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 30 и 34;(A) FR-L1 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 30 and 34;
(B) FR-L2, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 31 и 37;(B) FR-L2 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 31 and 37;
(C) FR-L3, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32, 35 и 36; и (D) FR-L4 представляющий собой SEQ ID NO: 33.(C) FR-L3 selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 32, 35 and 36; and (D) FR-L4 being SEQ ID NO: 33.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, по меньшейIn accordance with some embodiments of the invention, the heavy chain variable region of the humanized monoclonal antibody contains an amino acid sequence that is at least about 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO : 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and the light chain variable region contains an amino acid sequence that is at least about 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9. B in accordance with some embodiments of the invention, the heavy chain variable region of the humanized monoclonal antibody contains an amino acid sequence that is at least about 95% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and the light chain variable region comprises an amino acid sequence of at least
- 3 045980 мере приблизительно на 95% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах осуществления изобретения вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6, и вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. В некоторых вариантах осуществления изобретения вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6, а вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.- 3 045980 at least approximately 95% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the heavy chain variable region humanized monoclonal antibody contains an amino acid sequence that is at least about 97% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO : 6, and the light chain variable region contains an amino acid sequence that is at least about 97% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the heavy chain variable region of the humanized monoclonal antibody comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID NO: 6, and the light chain variable region comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело содержит комбинацию вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи, где комбинация выбрана из группы, состоящей из:In some embodiments, the humanized antibody comprises a combination of a heavy chain variable region and a light chain variable region, wherein the combination is selected from the group consisting of:
i) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 1, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 2;i) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 1 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 2;
ii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 4, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 8;ii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 4 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 8;
iii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 5, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 2;iii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 5 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 2;
iv) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 5, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 8;iv) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 5 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 8;
v) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 4, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 2;v) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 4 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 2;
vi) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 1, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 8;vi) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 1 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 8;
vii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 6, и последовательности легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 2; и viii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 6, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 8.vii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 6 and the light chain sequence shown in SEQ ID NO: 2; and viii) the heavy chain variable region sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and the light chain variable region sequence set forth in SEQ ID NO: 8.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности SEQ ID NO: 1, а вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности SEQ ID NO: 2.In accordance with some embodiments of the invention, the heavy chain variable region of the humanized monoclonal antibody contains an amino acid sequence that is at least about 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 1, and the light chain variable region contains an amino acid sequence that is at least about 90% identical to SEQ ID NO: 1. identical to the sequence of SEQ ID NO: 2.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, вариабельная область тяжелой цепи гуманизированного моноклонального антитела содержит аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO: 1, а вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, идентичную SEQ ID NO:2.In accordance with some embodiments of the invention, the heavy chain variable region of the humanized monoclonal antibody contains an amino acid sequence identical to SEQ ID NO: 1, and the light chain variable region contains an amino acid sequence identical to SEQ ID NO: 2.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело ингибирует связывание PVR по меньшей мере с одним из TIGIT, CD96 и CD226.In some embodiments, the humanized antibody inhibits the binding of PVR to at least one of TIGIT, CD96, and CD226.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, указанное антитело ингибирует связывание PVR с TIGIT, CD96 и CD226.In some embodiments, the antibody inhibits the binding of PVR to TIGIT, CD96, and CD226.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело представляет собой антитело IgG4, содержащее последовательности тяжелой цепи, представленные в SEQ ID NO: 49, или последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную ей. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело представляет собой антитело IgG1, содержащее последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 50, или последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную ей.In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody is an IgG4 antibody containing the heavy chain sequences set forth in SEQ ID NO: 49, or a sequence that is at least 90% identical thereto. In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody is an IgG1 antibody comprising the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 50, or a sequence at least 90% identical thereto.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело содержит последовательность легкой цепи, приведенную в SEQ ID NO: 49.In some embodiments, the humanized antibody comprises the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 49.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело проявляет улучшенную антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) или комплементзависимую цитотоксичность (CDC) по сравнению с другими известными антителами.In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody exhibits improved antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) or complement-dependent cytotoxicity (CDC) compared to other known antibodies.
Полинуклеотидные последовательности, кодирующие гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, представлены в соответствии с другим аспектом изобретения.Polynucleotide sequences encoding a humanized antibody or antigen binding fragment thereof are provided in accordance with another aspect of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложена полинуклеотидная последовательность, кодирующая аминокислотные последовательности вариабельной области тяжелой цепи, вариабельной области легкой цепи или обеих, описанных выше.In accordance with some embodiments of the invention, a polynucleotide sequence is provided encoding the amino acid sequences of the heavy chain variable region, the light chain variable region, or both, described above.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложен полинуклеотид,In accordance with some embodiments of the invention, there is provided a polynucleotide
- 4 045980 кодирующий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6.- 4 045980 encoding a heavy chain variable region containing an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложен полинуклеотид, кодирующий вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.In accordance with some embodiments of the invention, there is provided a polynucleotide encoding a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9 .
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, полинуклеотид кодирует гуманизированное антитело или его фрагмент, содержащие: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9. Каждая комбинация вариабельных областей тяжелой и легкой цепи представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In accordance with some embodiments of the invention, the polynucleotide encodes a humanized antibody or fragment thereof comprising: a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 , SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9. Each combination of heavy and light chain variable regions is a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, полинуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область тяжелой цепи гуманизированного антитела, содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 38-42, или ее вариант, имеющий по меньшей мере 90% идентичности последовательности. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In accordance with some embodiments of the invention, the polynucleotide sequence encoding the heavy chain variable region of a humanized antibody comprises a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 38-42, or a variant thereof having at least 90% sequence identity. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, полинуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область легкой цепи гуманизированного антитела, содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 43-46, или ее вариант, имеющий по меньшей мере 90% идентичности последовательности. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In accordance with some embodiments of the invention, the polynucleotide sequence encoding the light chain variable region of a humanized antibody comprises a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 43-46, or a variant thereof having at least 90% sequence identity. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к конструкции нуклеиновой кислоты, содержащей молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую по меньшей мере одну цепь гуманизированного антитела или ее фрагмент, как описано в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, конструкция нуклеиновой кислоты представляет собой плазмиду.In a further aspect, the present invention relates to a nucleic acid construct comprising a nucleic acid molecule encoding at least one humanized antibody chain or fragment thereof, as described herein. In some embodiments of the invention, the nucleic acid construct is a plasmid.
Также описана линия клеток, содержащая нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела по настоящему изобретению. Линия клеток предназначена для экспрессии гуманизированного антитела или его фрагмента, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления изобретения, линия клеток представляет собой линию клеток млекопитающего, такую как линия клеток яичника китайского хомячка (СНО).A cell line containing nucleic acids encoding the antibodies of the present invention is also described. The cell line is designed to express a humanized antibody or fragment thereof, as described herein. In some embodiments, the cell line is a mammalian cell line, such as a Chinese hamster ovary (CHO) cell line.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, линия клеток представляет собой линию бактериальных, растительных, мышиных (например, NSO и Sp2/0), крысиных (например, YB2/0), хомячковых (например, BHK и CHO) или человеческих клеток (например, PER.C6).In accordance with some embodiments of the invention, the cell line is a line of bacterial, plant, murine (eg, NSO and Sp2/0), rat (eg, YB2/0), hamster (eg, BHK and CHO) or human cells (eg, , PER.C6).
В соответствии с еще одним аспектом, настоящее изобретение относится к химерному антигенному рецептору (CAR), содержащему внеклеточную часть (связывающий домен), содержащую любое из гуманизированных антител или их фрагментов, описанных в настоящем документе. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложен CAR, содержащий комбинацию последовательностей вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, описанных выше, обладающий уникальной комбинацией последовательностей CDR и каркасных участков, улучшенным связыванием и другими свойствами.In accordance with yet another aspect, the present invention relates to a chimeric antigen receptor (CAR) comprising an extracellular portion (binding domain) containing any of the humanized antibodies or fragments thereof described herein. In accordance with some embodiments of the invention, a CAR is provided that contains a combination of the heavy and light chain variable region sequences described above, having a unique combination of CDR and framework sequences, improved binding, and other properties.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, CAR содержит комбинацию вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, причем вариабельная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90% идентична последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.In accordance with some embodiments of the invention, the CAR contains a combination of heavy and light chain variable regions, wherein the heavy chain variable region contains an amino acid sequence that is at least 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and the light chain variable region contains an amino acid sequence that is at least 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID nO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID nO: 6, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.In some embodiments, the CAR comprises a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID nO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID nO : 6, and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит комбинацию вариабельных областей тяжелой и легкой цепи гуманизированного антитела, где комбинация выбрана из группы, состоящей из:In some embodiments, the CAR comprises a combination of heavy and light chain variable regions of a humanized antibody, wherein the combination is selected from the group consisting of:
i) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 1, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;i) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 1 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9;
ii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 3, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;ii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 3 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9;
iii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 4, и поiii) the heavy chain variable region sequence set forth in SEQ ID NO: 4, and
- 5 045980 следовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;- 5 045980 sequence of the variable region of the light chain presented in SEQ ID NO: 9;
iv) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 5, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9; иiv) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 5 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9; And
v) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 6, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9.v) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 6 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, CAR содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 3, 4, 5 и 6, и последовательность вариабельной области легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 9, трансмембранный домен и внутриклеточный Т-клеточный сигнальный домен.In accordance with some embodiments of the invention, the CAR comprises a heavy chain variable region sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1, 3, 4, 5 and 6, and a light chain variable region sequence presented in SEQ ID NO: 9 , transmembrane domain and intracellular T cell signaling domain.
Согласно настоящему изобретению, также предложена одноцепочечная вариабельная область (scFv), содержащая вариабельные области тяжелой цепи и легкой цепи антител, описанных в настоящем документе. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, между вариабельными областями находится шарнирная область. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, аминокислотная последовательность scFv выбрана из SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57 и их аналога, по меньшей мере на 90% идентичного любой из указанных последовательностей.The present invention also provides a single chain variable region (scFv) comprising the heavy chain and light chain variable regions of the antibodies described herein. In accordance with some embodiments of the invention, a hinge region is located between the variable regions. In accordance with some embodiments of the invention, the amino acid sequence of the scFv is selected from SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, and an analogue thereof that is at least 90% identical to any of these sequences.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит аминокислотные последовательности, представленные любой из SEQ ID NO: 56 и SEQ ID NO: 57.In some embodiments, the CAR comprises amino acid sequences represented by any of SEQ ID NO: 56 and SEQ ID NO: 57.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, CAR содержит последовательность scFv и по меньшей мере один белковый домен, выбранный из группы, состоящей из CD8 Stalk домена, CD28 ТМ домена, 41ВВ домена и CD3Z, домена (CD3Z, Zetta). В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, CAR содержит CD8 Stalk домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит CD28 ТМ домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит CD3Z домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит 41ВВ домен. В соответствии с конкретными вариантами осуществления изобретения, CAR содержит CD8 Stalk домен, CD28 ТМ домен, 41ВВ домен и CD3Z домен.In accordance with some embodiments of the invention, the CAR comprises a scFv sequence and at least one protein domain selected from the group consisting of a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3Z domain (CD3Z, Zetta). In accordance with some embodiments of the invention, the CAR contains a CD8 Stalk domain. In some embodiments, the CAR contains a CD28 TM domain. In some embodiments, the CAR contains a CD3Z domain. In some embodiments, the CAR contains a 41BB domain. In accordance with specific embodiments of the invention, the CAR contains a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3Z domain.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, CAR содержит последовательность scFv, содержащую сайт связывания PVR любого антитела, описанного выше, и по меньшей мере один домен, выбранный из группы, состоящей из CD8 Stalk домена, CD28 ТМ домена, 41ВВ домена и CD3Z домена. В соответствии с конкретными вариантами осуществления изобретения, CAR содержит последовательность scFv, содержащую сайт связывания PVR любого антитела, описанного выше, и CD8 Stalk домен, CD28 ТМ домен, 41ВВ домен и CD3Z домен.In accordance with some embodiments of the invention, the CAR contains a scFv sequence containing the PVR binding site of any antibody described above and at least one domain selected from the group consisting of a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3Z domain. In accordance with specific embodiments of the invention, the CAR contains a scFv sequence containing the PVR binding site of any antibody described above, and a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3Z domain.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложен лимфоцит, сконструированный для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, предложена Т-клетка, сконструированная для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления изобретения, предложена NK-клетка, сконструированная для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе.In accordance with some embodiments of the invention, a lymphocyte engineered to express a CAR described herein is provided. In accordance with some embodiments of the invention, a T cell engineered to express a CAR described herein is provided. In accordance with additional embodiments of the invention, there is provided an NK cell engineered to express a CAR described herein.
В соответствии с конкретными вариантами осуществления изобретения, предложена сконструированная Т-клетка, экспрессирующая последовательность scFv, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57 или ее аналог, по меньшей мере на 90% идентичный любой из указанных последовательностей; домен CD8 Stelk, домен CD28 ТМ, домен 41ВВ и домен CD3Z.In accordance with specific embodiments of the invention, there is provided an engineered T cell expressing a scFv sequence selected from the group consisting of: SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, or an analogue thereof that is at least 90% identical to any of the above sequences; CD8 Stelk domain, CD28 TM domain, 41BB domain and CD3Z domain.
В соответствии с еще одним аспектом, настоящее изобретение относится к способу лечения рака у субъекта, включающему введение указанному субъекту терапевтически эффективного количества по меньшей мере одного лимфоцита, содержащего CAR, описанного в настоящем документе. В соответствии с еще одним аспектом, настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей гуманизированное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанные в настоящем документе, и фармацевтически приемлемый эксципиент, носитель или разбавитель.In accordance with yet another aspect, the present invention provides a method of treating cancer in a subject, comprising administering to said subject a therapeutically effective amount of at least one CAR-containing lymphocyte described herein. In accordance with yet another aspect, the present invention provides a pharmaceutical composition comprising a humanized antibody or antigen binding fragment described herein and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier or diluent.
Для доставки композиций по настоящему изобретению субъекту, нуждающемуся в этом, можно использовать любой способ введения, включая парентеральный и энтеральный способы введения.Any route of administration, including parenteral and enteral routes of administration, can be used to deliver the compositions of the present invention to a subject in need thereof.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, фармацевтическая композиция составлена для инъекции или инфузии. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, фармацевтическая композиция предназначена для внутривенного введения. В некоторых вариантах осуществления изобретения, фармацевтическая композиция предназначена для внутриопухолевого введения.In accordance with some embodiments of the invention, the pharmaceutical composition is formulated for injection or infusion. In accordance with some embodiments of the invention, the pharmaceutical composition is for intravenous administration. In some embodiments of the invention, the pharmaceutical composition is for intratumoral administration.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент или фармацевтическая композиция предназначены для применения для повышения экспрессии на поверхности и/или передачи сигналов CD226 на CD8+ и CD4+ Тклетках.In accordance with some embodiments of the invention, a humanized antibody or antigen binding fragment or pharmaceutical composition thereof is provided for use in enhancing the surface expression and/or signaling of CD226 on CD8+ and CD4+ T Cells.
В соответствии с вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или фармацевтическая композиция предназначены для применения при лечении рака у индивидуума. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак выбран из группы, соIn accordance with embodiments of the invention, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof, or pharmaceutical composition is provided for use in the treatment of cancer in an individual. In some embodiments, the cancer is a solid tumor. In some embodiments, the cancer is selected from the group with
- 6 045980 стоящей из рака легкого, рака толстой кишки, глиобластомы, рака надпочечников, рака матки, рака головы и шеи, рака поджелудочной железы и рака молочной железы. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.- 6 045980 worth of lung cancer, colon cancer, glioblastoma, adrenal cancer, uterine cancer, head and neck cancer, pancreatic cancer and breast cancer. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, рак представляет собой гематологический рак.In some embodiments, the cancer is a hematologic cancer.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гематологический рак выбран из лейкоза, включая острый миелоидный лейкоз (AML), хронический миелоидный лейкоз (CML), острый лимфолейкоз (ALL) и хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL); лимфомы, включая болезнь Ходжкина, и неходжкинскую лимфому; и множественной миеломы.In accordance with some embodiments of the invention, the hematologic cancer is selected from leukemia, including acute myeloid leukemia (AML), chronic myeloid leukemia (CML), acute lymphocytic leukemia (ALL), and chronic lymphocytic leukemia (CLL); lymphomas, including Hodgkin's disease, and non-Hodgkin's lymphoma; and multiple myeloma.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, индивидуумом является человек.In some embodiments of the invention, the individual is a human.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, применение дополнительно включает применение агента, который подавляет активность или экспрессию иммунного коингибирующего рецептора.In accordance with some embodiments of the invention, the use further includes the use of an agent that inhibits the activity or expression of an immune coinhibitory receptor.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, иммунный коингибирующий рецептор выбран из группы, состоящей из PD-1, PD-L1, TIGIT, CTLA-4, LAG3, TIM3, BTLA, VISTA, B7H4, CD96, BY55 (CD160), LAIR1, SIGLEC10, CD112R, CD112, ILT-4 и 2В4. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the immune coinhibitory receptor is selected from the group consisting of PD-1, PD-L1, TIGIT, CTLA-4, LAG3, TIM3, BTLA, VISTA, B7H4, CD96, BY55 (CD160), LAIR1, SIGLEC10, CD112R, CD112, ILT-4 and 2B4. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, применение также включает применение в комбинации с антителом против рецептора эндотелиального фактора роста (EGFR).In accordance with some embodiments of the invention, use also includes use in combination with an anti-endothelial growth factor receptor (EGFR) antibody.
В соответствии с другим аспектом настоящего изобретения предложен способ увеличения экспрессии на поверхности и/или передачи сигналов CD226 в CD8+ и CD4+ Т-клетках индивидуума, включающий введение индивидууму терапевтически эффективного количества гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или фармацевтической композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления изобретения, CD8+ Т-клетки представляют собой инфильтрирующие опухоль CD8+ Т-клетки.In accordance with another aspect of the present invention, there is provided a method of increasing the surface expression and/or signaling of CD226 in CD8+ and CD4+ T cells of an individual, comprising administering to the individual a therapeutically effective amount of a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, or a pharmaceutical composition described herein. In some embodiments, the CD8+ T cells are tumor-infiltrating CD8+ T cells.
В соответствии с другим аспектом настоящего изобретения, предложен способ лечения рака у индивидуума, нуждающегося в таком лечении, включающий введение индивидууму терапевтически эффективного количества гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или фармацевтической композиции. В некоторых вариантах осуществления изобретения, рак представляет собой солидную опухоль. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления изобретения, рак представляет собой несолидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения, рак выбран из группы, состоящей из глиобластомы, рака поджелудочной железы, рака молочной железы, рака мочевого пузыря, рака почки, рака головы и шеи, рака яичников, рака толстой кишки, рака шейки матки, рака предстательной железы и рака легких. В некоторых вариантах осуществления изобретения, способ лечения рака включает предотвращение или уменьшение образования, роста или распространения метастазов у субъекта.In accordance with another aspect of the present invention, there is provided a method of treating cancer in an individual in need of such treatment, comprising administering to the individual a therapeutically effective amount of a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, or a pharmaceutical composition. In some embodiments, the cancer is a solid tumor. According to further embodiments of the invention, the cancer is a non-solid tumor. In some embodiments, the cancer is selected from the group consisting of glioblastoma, pancreatic cancer, breast cancer, bladder cancer, kidney cancer, head and neck cancer, ovarian cancer, colon cancer, cervical cancer, prostate cancer, and lung cancer. In some embodiments, a method of treating cancer includes preventing or reducing the formation, growth, or spread of metastases in a subject.
В соответствии с другим аспектом настоящее изобретение относится к способу лечения рака у индивидуума, страдающего раком, включающий введение индивидууму терапевтически эффективного количества гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или фармацевтической композиции и ингибитора передачи сигналов PD-1, PD-L1, CTLA-4 или CD112R. В некоторых вариантах осуществления изобретения, рак представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения, рак выбран из группы, состоящей из глиобластомы, рака поджелудочной железы, рака молочной железы, рака мочевого пузыря, рака почки, рака головы и шеи, рака яичников, рака толстой кишки, рака шейки матки, рака предстательной железы или рака легких. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор передачи сигнала PD-1 представляет собой антитело или его фрагмент, который связывается с PD-1. В некоторых вариантах осуществления изобретения, антитело или его фрагмент, связывающийся с PD-1, представляет собой пембролизумаб, ниволумаб, АМР-514, тислелизумаб, спартализумаб или их PD-1-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения, ингибитор передачи сигналов PD-1 представляет собой антитело, которое специфически связывается с PD-L1 или PD-L2. В некоторых вариантах осуществления изобретения, антитело, которое специфически связывает PD-L1 или PD-L2, включает дурвалумаб, атезолизумаб, авелумаб, BMS936559 или FAZ053 или их PD-L1 или PD-L2-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения, ингибитор передачи сигнала PD-1 содержит Fc-слитый белок, который связывает PD1, PD-L1 или PD-L2. В некоторых вариантах осуществления изобретения, Fc-слитый белок содержит АМР-224 или его PD-1-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения, ингибитор передачи сигнала PD-1 содержит низкомолекулярный ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2. В некоторых вариантах осуществления изобретения, низкомолекулярный ингибитор передачи сигналов PD-1, PD-L1 или PD-L2 содержит одно или более из следующих соединений: №{2-[({2-метокси-6-[(2метил[1,1'-бифенил]-3-ил)метокси]пиридин-3-ил}метил)амино]этил}-ацетамид (BMS 202); (2-((3цианобензил)окси)-4-((3-(2,3-дигидробензо[Ъ][1,4]диоксин-6-ил)-2-метилбензил)окси)-5-метилбензил)-Осерина гидрохлорид; (2R,4R)-1-(5-хлор-2-((3-цианобензил)окси)-4-((3-(2,3-дигидробензо[b][1,4]диоксин6-ил)-2-метилбензил)-окси)бензил)-4-гидроксипирролидин-2-карбоновая кислота; 3-(4,6-дихлор-1,3,5- 7 045980 триазин-2-ил)-1-фенилиндол; 3-(4,6-дих.тор-1,3,5-триазин-2-ил)-1-(|)енил-111-индол; L-a-глутамин; N6,N6бис(к-серил-к-аспарагинил-к-треонил-к-серил-к-а-глутамил-к-серил-к-фенилаланил)-к-лизил-кфенилаланил-к-аргинил-к-валил-к-треонил-к-глутаминил-к-лейцил-к-аланил-к-пролил-к-лизил-каланил-к-глутаминил-к-изолейцил-к-лизил; (2 S)-1-[[2,6-диметоκси-4-[(2-метил[1,1 '-бифенил] -3 ил)метокси]-фенил]метил]-2-пиперидинкарбоновая кислота; глицинамид; Н-(2-меркаптоацетил)-кфенилаланил-Н-метил-к-аланил-к-аспарагинил-к-пролил-к-гистидил-к-лейцил-Н-метилглицил-ктриптофил-к-серил-к-триптофил-Н-метил-к-норлейцил-Н-метил-к-норлейцил-к-аргинил-к-цистеинил-. циклический (1 ^ 14)-тиоэфир; или их производные или аналоги.In accordance with another aspect, the present invention provides a method of treating cancer in an individual suffering from cancer, comprising administering to the individual a therapeutically effective amount of a humanized antibody or antigen binding fragment thereof or a pharmaceutical composition and an inhibitor of PD-1, PD-L1, CTLA-4 or CD112R signaling . In some embodiments, the cancer is a solid tumor. In some embodiments, the cancer is selected from the group consisting of glioblastoma, pancreatic cancer, breast cancer, bladder cancer, kidney cancer, head and neck cancer, ovarian cancer, colon cancer, cervical cancer, prostate cancer, or lung cancer. In some embodiments, the PD-1 signaling inhibitor is an antibody or fragment thereof that binds to PD-1. In some embodiments, the PD-1 binding antibody or fragment thereof is pembrolizumab, nivolumab, AMP-514, tislelizumab, spartalizumab, or a PD-1 binding fragment thereof. In some embodiments, the PD-1 signaling inhibitor is an antibody that specifically binds to PD-L1 or PD-L2. In some embodiments, an antibody that specifically binds PD-L1 or PD-L2 includes durvalumab, atezolizumab, avelumab, BMS936559 or FAZ053 or a PD-L1 or PD-L2 binding fragment thereof. In some embodiments, the PD-1 signaling inhibitor comprises an Fc fusion protein that binds PD1, PD-L1, or PD-L2. In some embodiments, the Fc fusion protein comprises AMP-224 or a PD-1 binding fragment thereof. In some embodiments, the PD-1 signaling inhibitor comprises a small molecule inhibitor of PD-1, PD-L1, or PD-L2. In some embodiments, the small molecule inhibitor of PD-1, PD-L1, or PD-L2 signaling contains one or more of the following compounds: #{2-[({2-methoxy-6-[(2methyl[1,1' -biphenyl]-3-yl)methoxy]pyridin-3-yl}methyl)amino]ethyl}-acetamide (BMS 202); (2-((3cyanobenzyl)oxy)-4-((3-(2,3-dihydrobenzo[b][1,4]dioxin-6-yl)-2-methylbenzyl)oxy)-5-methylbenzyl)-Oserine hydrochloride; (2R,4R)-1-(5-chloro-2-((3-cyanobenzyl)oxy)-4-((3-(2,3-dihydrobenzo[b][1,4]dioxin6-yl)-2 -methylbenzyl)-hydroxy)benzyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxylic acid; 3-(4,6-dichloro-1,3,5- 7 045980 triazin-2-yl)-1-phenylindole; 3-(4,6-dih.tor-1,3,5-triazin-2-yl)-1-(|)enyl-111-indole; L-a-glutamine; N6,N6bis(k-seryl-k-asparaginyl-k-threonyl-k-seryl-k-a-glutamyl-k-seryl-k-phenylalanyl)-k-lysyl-cphenylalanyl-k-arginyl-k-valyl-k -threonyl-c-glutaminyl-c-leucyl-c-alanyl-c-prolyl-c-lysyl-calanyl-c-glutaminyl-c-isoleucyl-c-lysyl; (2 S)-1-[[2,6-dimethoxy-4-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]-3 yl)methoxy]-phenyl]methyl]-2-piperidinecarboxylic acid; glycinamide; H-(2-mercaptoacetyl)-cphenylalanyl-N-methyl-c-alanyl-c-asparaginyl-c-prolyl-c-histidyl-c-leucyl-N-methylglycyl-ctryptophyl-c-seryl-c-tryptophil-N- methyl-c-norleucyl-N-methyl-c-norleucyl-c-arginyl-c-cysteinyl-. cyclic (1^14)-thioether; or their derivatives or analogues.
В данном документе также описан способ получения композиции для лечения рака у индивидуума, страдающего раком, включающий смешивание гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и фармацевтически приемлемого эксципиента, носителя или разбавителя. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак выбран из группы, состоящей из глиобластомы, рака поджелудочной железы, рака молочной железы, рака мочевого пузыря, рака почки, рака головы и шеи, рака яичников, рака толстой кишки, рака шейки матки, рака предстательной железы и рака легких. В настоящем документе также описан способ получения гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, включающий инкубацию описанной в настоящем документе клеточной линии в среде для культивирования клеток в условиях, достаточных для обеспечения экспрессии и секреции гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента.Also described herein is a method of preparing a composition for treating cancer in an individual suffering from cancer, comprising mixing a humanized antibody or antigen binding fragment thereof and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier or diluent. In some embodiments, the cancer is a solid tumor. In some embodiments, the cancer is selected from the group consisting of glioblastoma, pancreatic cancer, breast cancer, bladder cancer, kidney cancer, head and neck cancer, ovarian cancer, colon cancer, cervical cancer, prostate cancer, and lungs. Also described herein is a method of producing a humanized antibody or an antigen binding fragment thereof, comprising incubating a cell line described herein in a cell culture medium under conditions sufficient to permit expression and secretion of the humanized antibody or an antigen binding fragment thereof.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к способу диагностики или прогнозирования рака у субъекта, включающему определение уровня экспрессии PVR в биологическом образце указанного субъекта с использованием по меньшей мере одного описанного здесь гуманизированного антитела, фрагмента или scFv.In yet another aspect, the present invention provides a method for diagnosing or prognosticating cancer in a subject, comprising determining the level of PVR expression in a biological sample of the subject using at least one humanized antibody, fragment or scFv described herein.
В соответствии с еще одним аспектом, настоящее изобретение также относится к способу детекции или количественного определения экспрессии PVR, включающему приведение биологического образца в контакт с описанным в настоящем документе антителом или фрагментом антитела и измерение уровня образования комплекса.In accordance with yet another aspect, the present invention also provides a method for detecting or quantifying PVR expression, comprising contacting a biological sample with an antibody or antibody fragment described herein and measuring the level of complex formation.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, способ детекции или количественного определения экспрессии PVR включает следующие стадии:According to some embodiments of the invention, a method for detecting or quantifying PVR expression includes the following steps:
i) инкубирование образца с антителом, специфичным к PVR, или его фрагментом, содержащим по меньшей мере антигенсвязывающую часть;i) incubating the sample with an antibody specific for PVR, or a fragment thereof containing at least an antigen-binding portion;
ii) обнаружение связанного PVR с использованием обнаруживаемого зонда.ii) detecting the associated PVR using a detectable probe.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, способ дополнительно включает следующие стадии:In accordance with some embodiments of the invention, the method further includes the following steps:
iii) сравнение количества (ii) со стандартной кривой, полученной для стандартного образца, содержащего известное количество PVR; и iv) расчет количества PVR в образце по стандартной кривой.iii) comparing the amount of (ii) with a standard curve obtained from a standard sample containing a known amount of PVR; and iv) calculating the amount of PVR in the sample from the standard curve.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, способ включает определение субъекта, как имеющего PVR-положительный рак, если количество PVR выше, чем контрольный или заданный показатель.In accordance with some embodiments of the invention, the method includes identifying a subject as having a PVR-positive cancer if the amount of PVR is higher than a control or predetermined value.
В соответствии с некоторыми конкретными вариантами осуществления изобретения, образец представляет собой жидкость организма или твердую ткань. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ осуществляется in vitro или ex-vivo.In accordance with some specific embodiments of the invention, the sample is a body fluid or solid tissue. In some embodiments of the invention, the method is carried out in vitro or ex-vivo.
Также предложен набор для измерения экспрессии PVR в биологическом образце, содержащий по меньшей мере одно описанное в настоящем документе антитело или фрагмент антитела и средство для измерения экспрессии PVR. В некоторых вариантах осуществления изобретения набор дополнительно содержит инструкцию по применению набора.Also provided is a kit for measuring PVR expression in a biological sample, comprising at least one antibody or antibody fragment described herein and a means for measuring PVR expression. In some embodiments of the invention, the kit further includes instructions for use of the kit.
Дополнительные варианты осуществления и полный объем применимости настоящего изобретения станут очевидными из подробного описания, приведенного ниже. Однако следует понимать, что подробное описание и конкретные примеры, хотя и указывают предпочтительные варианты осуществления изобретения, даны только в качестве иллюстрации, поскольку различные изменения и модификации в пределах сущности и объема изобретения будут очевидны специалистам в данной области техники из подробного описания.Additional embodiments and the full scope of the present invention will become apparent from the detailed description below. It should be understood, however, that the detailed description and specific examples, while indicating preferred embodiments of the invention, are given by way of illustration only, as various changes and modifications within the spirit and scope of the invention will be apparent to those skilled in the art from the detailed description.
Описание чертежейDescription of drawings
Новые признаки, описанные в данном документе, подробно изложены в прилагаемой формуле изобретения. Лучшее понимание характеристик и преимуществ признаков, описанных в данном документе, будет получено путем обращения к нижеследующему подробному описанию, в котором приведены иллюстративные примеры, в которых используются принципы описанных здесь признаков, и которые сопровождаются следующими чертежами.The new features described herein are set forth in detail in the accompanying claims. A better understanding of the characteristics and advantages of the features described herein will be obtained by reference to the following detailed description, which sets forth illustrative examples employing the principles of the features described herein, and which are accompanied by the following drawings.
Фиг. 1А-1В. Афинность и конкурентный анализ замен N56.Fig. 1A-1B. Affinity and competitive analysis of N56 substitutions.
Фиг. 1А. Улучшенная аффинность связывания PVR вариантами N56E и N56D. Анализ Biacore, поFig. 1A. Improved PVR binding affinity of N56E and N56D variants. Biacore analysis, by
- 8 045980 казывающий относительную и абсолютную аффинность замен N56 (варианты hIgG4) к PVR-HIS (Sino Cat. no. 10109-H08H). Сдвиг аффинности >25% считали значительным. (*) относительные KDs для каждого варианта определяли путем деления KD замены на KD исходного варианта N56 (VH0VK0).- 8 045980 showing the relative and absolute affinity of N56 substitutions (hIgG4 variants) to PVR-HIS (Sino Cat. no. 10109-H08H). Affinity shifts >25% were considered significant. (*) The relative K D s for each variant were determined by dividing the K D of the replacement by the K D of the original N56 variant (VH0VK0).
На фиг. 1В показано сравнение эффективности химерных антител (5В9 дикого типа (WT) с НС из IgG4 (S241P)) с вариабельными областями, содержащими последовательность CDR2 LC с одиночными аминокислотными заменами (для удаления сайта дезамидирования). Активность измеряли в конкурентном анализе с использованием исходного 5В9. Относительную IC50 определяли для каждого варианта путем деления его IC50 на IC50 химерного антитела дикого типа, тестируемого параллельно.In fig. 1B shows a comparison of the effectiveness of chimeric antibodies (5B9 wild type (WT) with HC from IgG4 (S241P)) with variable regions containing the CDR2 LC sequence with single amino acid substitutions (to remove the deamidation site). Activity was measured in a competition assay using parent 5B9. The relative IC 50 was determined for each variant by dividing its IC 50 by the IC 50 of the wild-type chimeric antibody tested in parallel.
Фиг. 2А-2В. Улучшенная перекрестная реактивность связывания обезьяньего PVR с вариантами N56E и N56D. Для оценки максимального связывания насыщающую дозу (10 мкг/мл) варианта моноклональных антител N56 (показано на оси X) использовали для окрашивания PVR-экспрессирующих клеток, а средние значения интенсивности флуоресценции (MFI) определяли с помощью FACS-анализа. Изменение кратности рассчитывали путем деления MFI каждого варианта на MFI исходного антитела (K0). Фиг. 2А. Клетки NCI-H1975 (легкие человека) и фиг. 2В. Клетки Vero (почка африканской зеленой мартышки). Сдвиги аффинности >25% считали значительными.Fig. 2A-2B. Improved binding cross-reactivity of simian PVR with N56E and N56D variants. To assess maximal binding, a saturating dose (10 μg/mL) of the N56 monoclonal antibody variant (shown on the x-axis) was used to stain PVR-expressing cells, and mean fluorescence intensity (MFI) values were determined by FACS analysis. The fold change was calculated by dividing the MFI of each variant by the MFI of the parent antibody (K0). Fig. 2A. NCI-H1975 cells (human lung) and Fig. 2B. Vero cells (African green monkey kidney). Affinity shifts >25% were considered significant.
Фиг. 3. Улучшенная активация NK-клеток вариантами N56E и N56T. Чтобы охарактеризовать варианты с заменой N56, проводили анализ индукции CD107а с использованием человеческих NK-клеток от здорового донора и MDA-MB-231 в качестве клеток-мишеней в соотношении 2:1. Антитела добавляли в концентрации 600 пМ. K0 является исходным (родительским) клоном (N56). Все варианты приводили к значительной индукции CD107a (>240% по сравнению с изотипом IgG1). Кроме того, замены N56, такие как N56E и N56T, значительно улучшали индукцию CD107а по сравнению с K0. (*р<0,04, **р<0,01).Fig. 3. Improved NK cell activation by N56E and N56T variants. To characterize N56 substitution variants, a CD107a induction assay was performed using human NK cells from a healthy donor and MDA-MB-231 as target cells in a 2:1 ratio. Antibodies were added at a concentration of 600 pM. K0 is the original (parent) clone (N56). All variants resulted in significant induction of CD107a (>240% compared to the IgG1 isotype). In addition, N56 substitutions such as N56E and N56T significantly improved CD107a induction compared with K0. (*p<0.04, **p<0.01).
Фиг. 4. Улучшенная пролиферация CD8 Т-клеток с помощью вариантов N56E и N56T. Для характеристики вариантов N56 проводили анализ пролиферации Т-клеток. Раковые клетки А549 использовали при соотношении эффектор/мишень (Е:Т) 4:1 в присутствии 2,5 мкл/мл PHA-L и с использованием свежих РВМС человека, меченных CFSE. Все моноклональные антитела варианта N56 (ось X) добавляли в количестве 4 мкг/мл, и совместную культуру инкубировали в течение 96 ч. Представлены результаты FACS-анализа CD8+ Т-клеток. Относительную MFI CFSE-метки рассчитывали путем деления MFI группы, обработанной IgG, на MFI каждого варианта. Поскольку увеличение пролиферации приводит к снижению сигнала CFSE, ось Y отображает обратное значение этого отношения. Варианты N56E и N56T значительно увеличивали пролиферацию CD8 Т-клеток по сравнению с родительским клоном (K0), помеченным #. (*р<0,05, #<0,04, **р<0,01).Fig. 4. Improved proliferation of CD8 T cells by N56E and N56T variants. T cell proliferation assays were performed to characterize N56 variants. A549 cancer cells were used at an effector/target (E:T) ratio of 4:1 in the presence of 2.5 μl/ml PHA-L and using fresh CFSE-labeled human PBMCs. All monoclonal antibodies of the N56 variant (X axis) were added at 4 μg/ml, and the co-culture was incubated for 96 hours. Results of FACS analysis of CD8+ T cells are presented. The relative MFI of the CFSE tag was calculated by dividing the MFI of the IgG-treated group by the MFI of each variant. Since increased proliferation leads to decreased CFSE signal, the y-axis displays the inverse of this relationship. The N56E and N56T variants significantly increased CD8 T cell proliferation compared to the parental clone (K0) labeled #. (*p<0.05, #<0.04, **p<0.01).
Фиг. 5А-5В иллюстрируют сродство гуманизированных вариантов к человеческому PVR, измеренное с использованием поверхностного плазмонного резонанса (SPR) (фиг. 5А) или их связывания на поверхности клеток HEK293, экспрессирующих PVR, по данным проточной цитометрии (фиг. 5В). Показаны абсолютные и относительные результаты с использованием химерного мутантного родительского антитела N56E (N56E VH0/Vk0) в качестве точки отсчета.Fig. 5A-5B illustrate the affinity of the humanized variants for human PVR measured using surface plasmon resonance (SPR) (Fig. 5A) or their binding to the surface of PVR-expressing HEK293 cells as measured by flow cytometry (Fig. 5B). Absolute and relative results are shown using the chimeric mutant parent antibody N56E (N56E VH0/Vk0) as a reference point.
На фиг. 6А-6В показаны уровни экспрессии (фиг. 6А) и сходство гуманизированных вариантов с последовательностями вариабельного домена зародышевой линии человека (фиг. 6В). Показаны титры отдельных вариантов после транзиентной экспрессии в клетках HEK293 EBNA (фиг. 6А). Показана идентичность последовательности вариабельной области гуманизированных вариантов тяжелой и легкой цепей с последовательностью зародышевой линии человека (фиг. 6В).In fig. 6A-6B show the expression levels (FIG. 6A) and similarity of the humanized variants to human germline variable domain sequences (FIG. 6B). The titers of individual variants after transient expression in HEK293 EBNA cells are shown (Fig. 6A). The variable region sequence of the humanized heavy and light chain variants is shown to be identical to the human germline sequence (Fig. 6B).
На фиг. 7А-7В сравниваются биофизические свойства гуманизированного варианта NB1088 (правый столбец) с гуманизированным вариантом NB941, содержащим последовательность LC CDR2 5В9 WT (левый столбец). На фиг. 7А и фиг. 7В показано снижение образования кислотных соединений в NB1088 с течением времени после стресс-теста при низком рН (фиг. 7А) или при высокой концентрации при 40°С (фиг. 7В).In fig. 7A-7B compare the biophysical properties of the humanized variant NB1088 (right column) with the humanized variant NB941 containing the LC CDR2 5B9 WT sequence (left column). In fig. 7A and FIG. Figure 7B shows the decrease in acidic species formation in NB1088 over time following stress testing at low pH (Figure 7A) or at high concentration at 40°C (Figure 7B).
Фиг. 8A-8D иллюстрируют EC50 для связывания NB1088 с PVR (фиг. 8А); IC50 для ингибирования связывания PVR-TIGIT с помощью NB1088 (фиг. 8В); IC50 для ингибирования связывания PVR-CD96 с помощью NB1088 (фиг. 8С) и IC50 для ингибирования связывания PVR-CD226 с помощью NB1088 (фиг. 8D).Fig. 8A-8D illustrate EC 50 for binding of NB1088 to PVR (FIG. 8A); IC 50 for inhibition of PVR-TIGIT binding by NB1088 (Fig. 8B); IC50 for inhibition of PVR-CD96 binding by NB1088 (Fig. 8C) and IC50 for inhibition of PVR-CD226 binding by NB1088 (Fig. 8D).
На фиг. 9А-9В показано, что NB1088 сам по себе (фиг. 9А и 9В) и в комбинации с ингибированием PD1 пембролизумабом (фиг. 9В) увеличивает высвобождение гамма-интерферона в системе совместного культивирования опухоли/Т-клеток с использованием антиген-специфического анализа Т-клеток (вирус папилломы человека; HPV) (фиг. 9А) или неспецифического анализа аллогенных Т-клеток (фиг. 9В). **р<0,01 односторонний Anova.In fig. 9A-9B show that NB1088 alone (FIGS. 9A and 9B) and in combination with PD1 inhibition by pembrolizumab (FIG. 9B) increases interferon gamma release in a tumor/T cell coculture system using an antigen-specific T assay -cells (human papillomavirus; HPV) (Fig. 9A) or a nonspecific allogeneic T cell assay (Fig. 9B). **p<0.01 one-tailed ANOVA.
На фиг. 10А-10В показано, что в комбинации с антителом, связывающим рецептор эндотелиального фактора роста (EGFR), NB1088 увеличивает антителозависимую клеточную цитотоксичность в экспрессирующей EGFR линии клеток рака молочной железы А549 (фиг. 10А), и что это совпадает с повышенным высвобождением гамма-интерферона (фиг. 10В), (*р<0,05, **р<0,01 односторонний Anova).In fig. 10A-10B show that, in combination with an endothelial growth factor receptor (EGFR) binding antibody, NB1088 increases antibody-dependent cellular cytotoxicity in the EGFR-expressing breast cancer cell line A549 (Fig. 10A), and that this coincides with increased interferon-gamma release (Fig. 10B), (*p<0.05, **p<0.01 one-way Anova).
Фиг. 11А-11В иллюстрируют, что линии опухолевых клеток, экспрессирующие PVR (A549 или CaSki), могут индуцировать подавление CD226, экспрессируемого на CD8 Т-клетках (фиг. 11А) и NKклетках (фиг. 11В), которое может быть восстановлено с помощью NB1088, но не анти-TIGIT (фиг. 11АFig. 11A-11B illustrate that tumor cell lines expressing PVR (A549 or CaSki) can induce downregulation of CD226 expressed on CD8 T cells (FIG. 11A) and NK cells (FIG. 11B), which can be rescued by NB1088. but not anti-TIGIT (Fig. 11A
- 9 045980 и В). На фиг. 11А показаны результаты, полученные в системе совместного культивирования с использованием анализа антиген-специфических Т-клеток (вирус папилломы человека; HPV) или неспецифического анализа аллогенных Т-клеток.- 9 045980 and B). In fig. 11A shows results obtained in a co-culture system using an antigen-specific T-cell (human papillomavirus; HPV) assay or a non-specific allogeneic T-cell assay.
На фиг. 12А-12В показано NB1088-зависимое увеличение высвобождения гамма-интерферона аллоили антиген-чувствительными CD8+ Т-клетками (фиг. 12А), или что NB1088-зависимαя индукция NKклеток, чувствительных к антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC), в присутствии блокирования EGFR (фиг. 12В) зависит от активности CD226, и в обоих случаях NB1088 проявляет более высокую активность по сравнению с ингибированием TIGIT (концентрация обоих антител 10 мкг/мл).In fig. 12A-12B show NB1088-dependent increase in interferon-gamma release by alloy or antigen-sensitive CD8+ T cells (Fig. 12A), or NB1088-dependent induction of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC)-sensitive NK cells in the presence of EGFR blockade (Fig. 12B) is dependent on CD226 activity, and in both cases NB1088 exhibits higher activity compared to TIGIT inhibition (both antibodies at 10 μg/ml).
На фиг. 13А-13Е показано, что NB1088 эффективен в качестве монотерапии на гуманизированной мышиной модели рака поджелудочной железы (фиг. 13А), конкурируя с пембролизумабом (анти-PD-i, вводимым в стандартной дозе, установленной для этих моделей) (фиг. 13В), и на гуманизированной мышиной модели аденокарциномы легкого (фиг. 13С, гуманизированные мыши), и что в этой модели аденокарциномы легкого эффективность зависит от присутствия человеческих иммунных клеток (фиг. 13D, негуманизированные мыши) и коррелирует с повышенной экспрессией CD226 на опухоли, инфильтрирующей CD8+ Т-клетки (фиг. 13Е). (*р<0,05, ***р<0,001, двухфакторный Anova).In fig. 13A-13E show that NB1088 is effective as monotherapy in a humanized mouse model of pancreatic cancer (Fig. 13A), competing with pembrolizumab (anti-PD-i administered at the standard dose established for these models) (Fig. 13B), and in a humanized mouse model of lung adenocarcinoma (Fig. 13C, humanized mice), and that in this model of lung adenocarcinoma, efficacy is dependent on the presence of human immune cells (Fig. 13D, non-humanized mice) and correlates with increased expression of CD226 on tumor infiltrating CD8+ T -cells (Fig. 13E). (*p<0.05, ***p<0.001, two-way Anova).
Фиг. 14A-14D относятся к модели на фиг. 13С и 13Е, и показывают, что NB1088 увеличивает частоту интерферон-гамма положительных (фиг. 14А) и интерферон-гаммα/CD107a двойных положительных (фиг. 14В) CD8 Т-клеток, и что NB1088 увеличивает частоту интерферон-гамма+/CD226+ двойных положительных CD8 Т-клеток (фиг. 14D), но не интерферон-гαмма+/CD226- одиночных положительных CD8 Т-клеток (фиг. 14С). *р=0,0210 ***<0,0001 непарный ТТЕСТ.Fig. 14A-14D refer to the model in FIG. 13C and 13E, and show that NB1088 increases the frequency of interferon-gamma positive (Fig. 14A) and interferon-gammaα/CD107a double positive (Fig. 14B) CD8 T cells, and that NB1088 increases the frequency of interferon-gamma+/CD226+ double positive CD8 T cells (Fig. 14D), but not interferon-gamma+/CD226- single positive CD8 T cells (Fig. 14C). *p=0.0210 ***<0.0001 unpaired TTEST.
Фиг. 15А-15В иллюстрируют фармакокинетику NB1088 (фиг. 15А) и соответствующие фармакодинамические изменения поверхностной экспрессии CD226 (фиг. 15В) на циркулирующих CD4 Т-клетках яванского макака, которые обрабатывали различными дозами антитела однократно (для доз 20 и 50 мг/кг) или 4 раза с интервалом в одну неделю (для дозы 200 мг/кг).Fig. 15A-15B illustrate the pharmacokinetics of NB1088 (FIG. 15A) and the corresponding pharmacodynamic changes in surface expression of CD226 (FIG. 15B) on circulating cynomolgus CD4 T cells that were treated with various doses of the antibody once (for doses of 20 and 50 mg/kg) or 4 times with an interval of one week (for a dose of 200 mg/kg).
На фиг. 16 показана экспрессия человеческого PVR в биоптатах различных типов рака, измеренная с помощью иммуногистохимии и оцененная по шкале Н.In fig. Figure 16 shows human PVR expression in biopsies of various cancer types measured by immunohistochemistry and scored by H score.
Фиг. 17 представляет собой общее схематическое изображение конструкций CAR-Т. Фрагмент scFv включает тяжелые и легкие цепи (VH и VL, соответственно) гуманизированных антител по изобретению.Fig. 17 is a general schematic representation of CAR-T designs. The scFv fragment includes the heavy and light chains (VH and VL, respectively) of the humanized antibodies of the invention.
Фиг. 18 иллюстрирует сильную секрецию интерлейкина 2 (IL2) клетками Jurkat, сверхэкспрессирующими aPVR CAR-T конструкции, в сравнении с родительскими клетками Jurkat. Родительские клетки Jurkat или клетки Jurkat, сверхэкспрессирующие aPVR CAR-T конструкции H4K2-NTX1088C или H3K4-NTX1034C (40 тыс. клеток/лунку) инкубировали с клетками А549 или MDA-231 при соотношении Е:Т 1:1 в течение 24 ч. Секрецию IL2 определяли количественно, используя Biolegend hIL-2 (кат. 431804). Оба драйвера CAR-T увеличивали секрецию IL2 более чем в 100 раз по сравнению с родительскими клетками Jurkat в присутствии указанных мишеней.Fig. 18 illustrates the potent secretion of interleukin 2 (IL2) by Jurkat cells overexpressing the aPVR CAR-T construct compared to parental Jurkat cells. Parental Jurkat cells or Jurkat cells overexpressing aPVR CAR-T constructs H4K2-NTX1088C or H3K4-NTX1034C (40 thousand cells/well) were incubated with A549 or MDA-231 cells at an E:T ratio of 1:1 for 24 hours. Secretion IL2 was quantified using Biolegend hIL-2 (cat. 431804). Both CAR-T drivers increased IL2 secretion more than 100-fold compared to parental Jurkat cells in the presence of these targets.
Фиг. 19А-19С иллюстрируют повышенное уничтожение клеток-мишеней с помощью анти-PVR (aPVR) CAR-T. Клетки А549 (фиг. 19А) или MDA-231 (фиг. 19В) (по 200 тыс. клеток) помещали в 12луночный планшет с вариантами CAR-T-PVRNTX-1088C и NTX-1034C в среде NK на 72 часа, при соотношениях Е:Т 0,4 и 0,8 к 1, соответственно (на основе позитивного GFP). Гибель опухолевых клеток оценивали с использованием стандартного протокола CTG (Promega G9241).Fig. 19A-19C illustrate increased killing of target cells by anti-PVR (aPVR) CAR-T. A549 (Fig. 19A) or MDA-231 (Fig. 19B) cells (200 thousand cells each) were placed in a 12-well plate with CAR-T-PVRNTX-1088C and NTX-1034C variants in NK medium for 72 hours, at ratios E :T 0.4 and 0.8 to 1, respectively (based on GFP positivity). Tumor cell death was assessed using a standard CTG protocol (Promega G9241).
Фиг. 20 иллюстрирует эффективное уничтожение гематологических клеток-мишеней с помощью aPVR CAR-T. Клетки K562 (модель AML) инкубировали с вариантами aPVR CAR-T NTX-1088C и NTX1034C в RPMI+IL-2 в течение 18 ч при соотношениях Е:Т, указанных на оси X. Гибель опухолевых клеток оценивали с помощью проточной цитометрии. Значительное уничтожение клеток-мишеней наблюдалось для обоих драйверов CAR-T.Fig. 20 illustrates the effective killing of hematological target cells by aPVR CAR-T. K562 cells (AML model) were incubated with aPVR CAR-T variants NTX-1088C and NTX1034C in RPMI+IL-2 for 18 h at E:T ratios indicated on the x-axis. Tumor cell death was assessed by flow cytometry. Significant target cell killing was observed for both CAR-T drivers.
Подробное раскрытие настоящего изобретенияDetailed Disclosure of the Present Invention
Настоящее изобретение относится к гуманизированным моноклональным антителам, которые распознают рецептор полиовируса (PVR). Преимущественно, антитела по изобретению почти полностью гуманизированы, что позволяет избежать риска нежелательного иммунного ответа на антитела, и поэтому они безопасны для применения у людей in vivo. Антитела по настоящему изобретению характеризуются уникальной последовательностью CDR, а также новыми гуманизированными последовательностями каркасных участков и дизайном. Более конкретно, моноклональные антитела по настоящему изобретению имеют определенные комбинации CDR и неполностью гуманизированных последовательностей каркасных участков, обладают уникальными свойствами, улучшенной безопасностью и эффективностью по сравнению с известными антителами против PVR.The present invention relates to humanized monoclonal antibodies that recognize the poliovirus receptor (PVR). Advantageously, the antibodies of the invention are almost completely humanized, avoiding the risk of an unwanted immune response to the antibodies, and are therefore safe for use in humans in vivo. The antibodies of the present invention are characterized by a unique CDR sequence as well as novel humanized framework sequences and design. More specifically, the monoclonal antibodies of the present invention have certain combinations of CDRs and non-humanized framework sequences and have unique properties and improved safety and efficacy compared to known anti-PVR antibodies.
Некоторые из описанных здесь вариантов обладают повышенной воспроизводимостью и более высокими уровнями экспрессии по сравнению с другими гуманизированными антителами против PVR, содержащими такие же участки CDR. Также в настоящем документе раскрыты способы применения этих антител для лечения рака у индивидуума.Some of the variants described herein have improved reproducibility and higher expression levels compared to other humanized anti-PVR antibodies containing the same CDR regions. Also disclosed herein are methods of using these antibodies to treat cancer in an individual.
Для обеспечения полного понимания различных вариантов осуществления изобретения в нижеследующем описании изложены некоторые конкретные подробности. Однако специалисту в данной областиTo provide a thorough understanding of the various embodiments of the invention, certain specific details are set forth in the following description. However, a person skilled in the art
- 10 045980 техники будет понятно, что приведенные варианты осуществления могут быть реализованы на практике без этих деталей. Если контекст не требует иного, во всем нижеследующем описании и формуле изобретения слово содержать и его варианты, такие как содержит и содержащий, следует толковать в открытом, включающем смысле, то есть, включая, но не ограничиваясь. Используемые в данном описании и прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа а, an и the включают ссылки на множественное число, если из контекста явно не следует иное. Следует также отметить, что термин или обычно используется в своем значении, включая и/или, если из контекста явно не следует иное. Кроме того, приведенные здесь заголовки предназначены только для удобства и не связаны с истолкованием объема или сущности заявленных вариантов осуществления изобретения.- 10 045980 technology it will be clear that the above embodiments can be implemented in practice without these details. Unless the context otherwise requires, throughout the following specification and claims, the word contain and its variants, such as contains and containing, are to be construed in an open, inclusive sense, that is, including, but not limited to. As used in this specification and the accompanying claims, the singular forms a, an and the include references to the plural unless the context clearly requires otherwise. It should also be noted that the term or is generally used with its meaning including and/or, unless the context clearly indicates otherwise. In addition, the headings set forth herein are for convenience only and are not intended to construe the scope or spirit of the claimed embodiments.
Используемый здесь термин PVR относится к рецептору полиовируса, также известному как CD155 (кластер дифференцировки 155), Protein ID: Q92692. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, PVR представляет собой трансмембранный гликопротеин с N-концевой сигнальной последовательностью, тремя внеклеточными иммуноглобулино-подобными доменами, трансмембранным доменом и цитоплазматическим хвостом. Он имеет молекулярную массу около 80 кДа и структуру, состоящую из трех Ig-подобных доменов, при этом два С2-подобных домена расположены за самым дальним V-подобным доменом. Описанные здесь гуманизированные антитела обладают аффинностью к человеческому PVR (hPVR). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела обладают некоторой аффинностью к белкам PVR других животных, в частности приматов. Предпочтительно, аффинность к другим приматам, таким как африканская зеленая мартышка, делает возможным дальнейшее тестирование гуманизированных антител на безопасность и эффективность в неклинических испытаниях. Не было замечено сродства к PVR более эволюционно далеких животных, таких как грызуны.As used herein, the term PVR refers to the poliovirus receptor, also known as CD155 (cluster of differentiation 155), Protein ID: Q92692. In some embodiments, PVR is a transmembrane glycoprotein with an N-terminal signal sequence, three extracellular immunoglobulin-like domains, a transmembrane domain, and a cytoplasmic tail. It has a molecular mass of approximately 80 kDa and a structure consisting of three Ig-like domains, with two C2-like domains located behind the outermost V-like domain. The humanized antibodies described herein have affinity for human PVR (hPVR). In some embodiments, the antibodies have some affinity for PVR proteins of other animals, particularly primates. Preferably, the affinity for other primates, such as the African green monkey, makes it possible to further test the humanized antibodies for safety and effectiveness in non-clinical trials. No affinity for PVR has been observed in more evolutionarily distant animals such as rodents.
Используемый здесь термин приблизительно относится к количеству, которое отличается от указанного количества на 10% или менее.As used herein, the term approximately refers to an amount that differs from the specified amount by 10% or less.
Используемый здесь термин индивидуум, пациент или субъект относится к индивидуумам с диагнозом, подозрением на наличие или с риском развития по меньшей мере одного заболевания, для лечения которого применимы описанные композиции и способ. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, индивидуум представляет собой млекопитающее. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, млекопитающее представляет собой мышь, крысу, кролика, собаку, кошку, лошадь, корову, овцу, свинью, козу, ламу, альпаку или яка. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, индивидуумом является человек.As used herein, the term individual, patient or subject refers to individuals diagnosed with, suspected of having, or at risk of developing at least one disease for which the described compositions and method are useful. In some embodiments of the invention, the individual is a mammal. In some embodiments, the mammal is a mouse, rat, rabbit, dog, cat, horse, cow, sheep, pig, goat, llama, alpaca, or yak. In some embodiments of the invention, the individual is a human.
Используемый здесь термин комбинация или комбинированное лечение может относиться либо к одновременному, либо к последовательному введению препаратов, которые должны находиться в комбинации. Как описано в данном документе, когда комбинация относится к последовательному введению препаратов, препараты можно вводить в любом временном порядке.As used herein, the term combination or combination treatment can refer to either simultaneous or sequential administration of drugs that are to be in combination. As described herein, when the combination refers to sequential administration of drugs, the drugs can be administered in any temporal order.
Термины рак и опухоль относятся к физиологическому состоянию млекопитающих, характеризующемуся нарушением регуляции клеточного роста. Рак -это класс заболеваний, при которых группа клеток демонстрирует неконтролируемый или нежелательный рост. Раковые клетки также могут распространяться в другие места, что может привести к образованию метастазов. Распространение раковых клеток в организме может происходить, например, через лимфу или кровь. Неконтролируемый рост, интрузия и образование метастазов также называются злокачественными свойствами рака. Эти злокачественные свойства отличают рак от доброкачественных опухолей, которые обычно не инвазируют и не метастазируют.The terms cancer and tumor refer to a mammalian physiological condition characterized by dysregulation of cell growth. Cancer is a class of diseases in which a group of cells exhibit uncontrolled or unwanted growth. Cancer cells can also spread to other places, which can lead to the formation of metastases. The spread of cancer cells in the body can occur, for example, through lymph or blood. Uncontrolled growth, intrusion and formation of metastases are also called malignant properties of cancer. These malignant properties distinguish cancer from benign tumors, which usually do not invade or metastasize.
Используемый здесь термин эффективное количество относится к количеству терапевтического средства, которое вызывает биологический эффект при введении млекопитающему. Биологические эффекты включают, но не ограничиваются следующими: ингибирование или блокада взаимодействия рецептор-лиганд (например, PVR-TIGIT, PD-1-PD-L1/PD-L-2), ингибирование сигнального пути, снижение роста опухоли, уменьшение метастазирования опухоли или увеличение продолжительности жизни животного, имеющего опухоль. Терапевтическое количество представляет собой концентрацию лекарственного средства, рассчитанную для получения терапевтического эффекта. Терапевтическое количество охватывает диапазон доз, способных вызывать терапевтический ответ у популяции индивидуумов. Млекопитающее может быть человеком. Человеческий индивидуум может страдать от, подозревать наличие или быть пораженным опухолью.As used herein, the term effective amount refers to the amount of a therapeutic agent that produces a biological effect when administered to a mammal. Biological effects include, but are not limited to: inhibition or blockade of receptor-ligand interaction (eg, PVR-TIGIT, PD-1-PD-L1/PD-L-2), inhibition of signaling pathway, reduction of tumor growth, reduction of tumor metastasis, or increasing the life expectancy of an animal with a tumor. The therapeutic amount is the concentration of a drug calculated to produce a therapeutic effect. A therapeutic amount covers the range of doses capable of producing a therapeutic response in a population of individuals. A mammal can be a human. A human individual may suffer from, suspect or be affected by a tumor.
Используемый здесь термин ингибитор контрольной точки относится к лекарственному средству, которое ингибирует биологическую молекулу (молекулу контрольной точки), продуцируемую организмом, негативно регулирующую противоопухолевую/противораковую активность Т-клеток в организме. Молекулы контрольной точки включают без ограничения PD-1, PD-L-1, PD-L-2, CTLA4, TIM-3, LAG-3, VISTA, SIGLEC7, PVR, TIGIT, IDO, KIR, A2AR, В7-Н3, В7Н4, СЕАСАМ1, NOX2, CD112R и CD112.As used herein, the term checkpoint inhibitor refers to a drug that inhibits a biological molecule (checkpoint molecule) produced by the body that negatively regulates the antitumor/anticancer activity of T cells in the body. Checkpoint molecules include, but are not limited to, PD-1, PD-L-1, PD-L-2, CTLA4, TIM-3, LAG-3, VISTA, SIGLEC7, PVR, TIGIT, IDO, KIR, A2AR, B7-H3, B7H4, SEACAM1, NOX2, CD112R and CD112.
Предлагаемые антитела могут быть моноклональными антителами, поликлональными антителами, мультиспецифическими антителами (например, биспецифическими антителами и полиактивными антителами) и фрагментами антител.Antibodies provided may be monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, multispecific antibodies (eg, bispecific antibodies and polyactive antibodies) and antibody fragments.
Антитела включают конъюгаты антител и молекулы, содержащие антитела, такие как химерныеAntibodies include antibody conjugates and antibody-containing molecules such as chimeric
- 11 045980 молекулы. Таким образом, антитело включает, но не ограничивается полноразмерным антителом, а также фрагментами и частью антитела, сохраняющими специфичность связывания, такими как любая его специфически связывающая часть, включая антитела, содержащие любое количество таких частей, классы и/или изотипы иммуноглобулинов (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA, IgD, IgE и IgM); и биологически релевантные (антигенсвязывающие) фрагменты или их специфически связывающие части, включая, но не ограничиваясь следующими: Fab, F(ab')2, Fv и scFv (одноцепочечный или аналогичный фрагмент). Моноклональное антитело, как правило, представляет собой антитело, находящееся в композиции по существу гомогенных антител; таким образом, любые индивидуальные антитела, содержащиеся в композиции моноклональных антител, идентичны, за исключением возможных встречающихся в природе мутаций, которые могут присутствовать в незначительных количествах. Поликлональное антитело представляет собой препарат, который включает различные антитела с различными последовательностями, которые обычно направлены против двух или более различных детерминант (эпитопов). Моноклональное антитело может содержать человеческую константную область IgG1. Моноклональное антитело может содержать человеческую константную область IgG4.- 11 045980 molecules. Thus, an antibody includes, but is not limited to, a full-length antibody, as well as fragments and portions of an antibody that retain binding specificity, such as any specific binding portion thereof, including antibodies containing any number of such portions, immunoglobulin classes, and/or isotypes (e.g., IgG1 , IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA, IgD, IgE and IgM); and biologically relevant (antigen-binding) fragments or specific binding portions thereof, including but not limited to the following: Fab, F(ab') 2 , Fv and scFv (single chain or similar fragment). A monoclonal antibody is typically an antibody in a composition of substantially homogeneous antibodies; thus, any individual antibodies contained in a monoclonal antibody composition are identical, except for possible naturally occurring mutations that may be present in minute quantities. A polyclonal antibody is a preparation that includes various antibodies with different sequences, which are usually directed against two or more different determinants (epitopes). The monoclonal antibody may contain a human IgG1 constant region. The monoclonal antibody may contain a human IgG4 constant region.
Термин антитело используется здесь в самом широком смысле и включает поликлональные и моноклональные антитела, в том числе интактные антитела и их функциональные (антигенсвязывающие) фрагменты, включая участки связывания антигена Fab-фрагменты, F(ab')2-фрагменты, Fab'-фрагменты, Fv-фрагменты, фрагменты рекомбинантных IgG (rIgG), фрагменты одноцепочечных антител, включая одноцепочечные вариабельные фрагменты (sFv или scFv), и фрагменты однодоменных антител (например, sdAb, sdFv, нанотело). Термин охватывает генетически сконструированные и/или иным образом модифицированные формы иммуноглобулинов, такие как интратела, пептидные антитела, полностью человеческие антитела, гуманизированные антитела и гетероконъюгированные антитела, мультиспецифические, например, биспецифические антитела, диатела, триантела и тетратела, тандемные di-scFv, тандемные tri-scFv. Если не указано иное, термин антитело следует понимать как включающий функциональные фрагменты антител. Термин также охватывает интактные или полноразмерные антитела, включая антитела любого класса или подкласса, в том числе IgG и его подклассы, IgM, IgE, IgA и IgD. Антитело может содержать человеческую константную область IgG1. Антитело может содержать человеческую константную область IgG4.The term antibody is used here in its broadest sense and includes polyclonal and monoclonal antibodies, including intact antibodies and their functional (antigen-binding) fragments, including antigen binding sites Fab fragments, F(ab') 2 fragments, Fab' fragments, Fv fragments, recombinant IgG fragments (rIgG), single chain antibody fragments, including single chain variable fragments (sFv or scFv), and single domain antibody fragments (eg, sdAb, sdFv, nanobody). The term includes genetically engineered and/or otherwise modified forms of immunoglobulins, such as intrabodies, peptide antibodies, fully human antibodies, humanized antibodies and heteroconjugated antibodies, multispecific, e.g. bispecific antibodies, diabodies, triantbodies and tetrabodies, tandem di-scFv, tandem tri -scFv. Unless otherwise indicated, the term antibody should be understood to include functional antibody fragments. The term also covers intact or full-length antibodies, including antibodies of any class or subclass, including IgG and its subclasses, IgM, IgE, IgA and IgD. The antibody may contain a human IgG1 constant region. The antibody may contain a human IgG4 constant region.
Термины участок, определяющий комплементарность и CDR, которые являются синонимами гипервариабельной области или HVR, известны в данной области техники и относятся к несмежным последовательностям аминокислот в вариабельных областях антитела, которые отвечают за антигенную специфичность и/или аффинность связывания. Как правило, имеется три CDR в каждой вариабельной области тяжелой цепи (CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3) и три CDR в каждой вариабельной области легкой цепи (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3). В данной области техники известно, что каркасные участки и FR относятся к тем частям вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, которые не являются CDR. Как правило, имеется четыре FR в каждой полноразмерной вариабельной области тяжелой цепи (FR-H1, FRH2, FR-H3 и FR-H4) и четыре FR в каждой полноразмерной вариабельной области легкой цепи (FR-H4). L1, FR-L2, FR-L3 и FR-L4). Точные границы аминокислотной последовательности конкретного участка CDR или FR можно легко определить с использованием любой из ряда хорошо известных систем, включая описанные Kabat et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (система нумерации Kabat), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (система нумерации Chothia); MacCallum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996), Antibody-antigen interactions: Contact analysis and binding site topography, J. Mol. Biol. 262, 732-745 (система нумерации Contact); Lefranc MP et al., IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains, Dev Comp Immunol, 2003 Jan;27(1):55-77 (система нумерации IMGT); Honegger А и Pluckthun A, Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains: an automatic modeling and analysis tool, J Mol Biol, 2001 Jun 8;309(3):657-70, (система нумерации Aho); и Whitelegg NR и Rees AR, WAM: an improved algorithm for modelling antibodies on the WEB, Protein Eng. 2000 Dec; 13(12):819-24 (система нумерации AbM). В некоторых вариантах осуществления изобретения CDR описанных здесь антител могут быть определены методом, выбранным из Kabat, Chothia, EVIGT, Aho, AbM или их комбинаций.The terms complementarity determining region and CDR, which are synonymous with hypervariable region or HVR, are known in the art and refer to non-contiguous amino acid sequences in the variable regions of an antibody that are responsible for antigen specificity and/or binding affinity. Typically, there are three CDRs in each heavy chain variable region (CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3) and three CDRs in each light chain variable region (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3). It is known in the art that framework regions and FRs refer to those portions of the heavy and light chain variable regions that are not CDRs. Typically, there are four FRs in each full-length heavy chain variable region (FR-H1, FRH2, FR-H3 and FR-H4) and four FRs in each full-length light chain variable region (FR-H4). L1, FR-L2, FR-L3 and FR-L4). The precise amino acid sequence boundaries of a particular CDR or FR region can be readily determined using any of a number of well-known systems, including those described by Kabat et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (Kabat numbering system), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (Chothia numbering system); MacCallum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996), Antibody-antigen interactions: Contact analysis and binding site topography, J. Mol. Biol. 262, 732-745 (Contact numbering system); Lefranc MP et al., IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains, Dev Comp Immunol, 2003 Jan;27(1):55-77 (IMGT numbering system); Honegger A and Pluckthun A, Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains: an automatic modeling and analysis tool, J Mol Biol, 2001 Jun 8;309(3):657-70, (Aho numbering system); and Whitelegg NR and Rees AR, WAM: an improved algorithm for modeling antibodies on the WEB, Protein Eng. 2000 Dec; 13(12):819-24 (AbM numbering system). In some embodiments, the CDRs of antibodies described herein can be determined by a method selected from Kabat, Chothia, EVIGT, Aho, AbM, or combinations thereof.
Границы данного CDR или FR могут варьироваться в зависимости от системы, используемой для идентификации. Например, нумерация по Kabat основана на структурных выравниваниях, тогда как нумерация по Chothia основана на информации о структуре. Нумерация обеих систем Kabat и Chothia основана на наиболее распространенных длинах последовательностей областей антител со вставками, которые обозначаются дополнительными буквами, например, 30а, и делециями, появляющимися в некоторых антителах. Эти две системы помещают определенные вставки и делеции (инсерционноделеционные мутации) в разные места, что приводит к различиям в нумерации. Система Contact основана на анализе сложных кристаллических структур и во многих аспектах похожа на систему нумерации Chothia.The boundaries of a given CDR or FR may vary depending on the system used for identification. For example, Kabat numbering is based on structural alignments, whereas Chothia numbering is based on structure information. The numbering of both Kabat and Chothia systems is based on the most common sequence lengths of antibody regions, with insertions indicated by additional letters, such as 30a, and deletions appearing in some antibodies. The two systems place certain insertions and deletions (insertion-deletion mutations) in different locations, resulting in differences in numbering. The Contact system is based on the analysis of complex crystal structures and is similar in many aspects to the Chothia numbering system.
Термин вариабельная область или вариабельный домен относится к домену тяжелой или легкой цепи антитела, который вовлечен в связывание антитела с антигеном. Вариабельные домены тяжелойThe term variable region or variable domain refers to the heavy or light chain domain of an antibody that is involved in the binding of the antibody to an antigen. Variable domains of severe
- 12 045980 цепи и легкой цепи (VH и VL соответственно) нативного антитела обычно имеют сходные структуры, при этом каждый домен содержит четыре консервативных каркасных участка (FR) и три участка CDR (см., например, Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., стр. 91 (2007)). Одного домена VH или VL может быть достаточно для наличия антигенсвязывающей специфичности. Кроме того, антитела, которые связывают конкретный антиген, могут быть выделены с использованием VH или VL домена антитела, которое связывает антиген, для скрининга библиотеки комплементарных VL или VH доменов, соответственно (см., например, Portolano et al., J. Immunol 150:880-887 (1993), Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991)).- 12 045980 chain and light chain (VH and VL, respectively) of a native antibody typically have similar structures, with each domain containing four conserved framework regions (FR) and three CDR regions (see, for example, Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W. H. Freeman and Co., p. 91 (2007)). A single VH or VL domain may be sufficient to provide antigen-binding specificity. In addition, antibodies that bind a particular antigen can be isolated using the VH or VL domain of the antibody that binds the antigen to screen a library of complementary VL or VH domains, respectively (see, for example, Portolano et al., J. Immunol 150 :880-887 (1993), Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991)).
Предлагаемые антитела включают фрагменты антител. Фрагмент антитела относится к молекуле, отличной от интактного антитела, которая содержит часть интактного антитела, связывающую антиген, с которым связывается интактное антитело. Примеры фрагментов антител включают, но не ограничиваются следующими: Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; диатела; линейные антитела; молекулы одноцепочечных антител (например, scFv или sFv); и мультиспецифические антитела, образованные из фрагментов антител. В конкретных вариантах осуществления изобретения антитела представляют собой фрагменты одноцепочечных антител, содержащие вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи, такие как scFv.Antibodies provided include antibody fragments. An antibody fragment refers to a molecule, other than an intact antibody, that contains a portion of an intact antibody that binds an antigen to which the intact antibody binds. Examples of antibody fragments include, but are not limited to: Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; diabodies; linear antibodies; single chain antibody molecules (eg scFv or sFv); and multispecific antibodies formed from antibody fragments. In specific embodiments, the antibodies are single chain antibody fragments containing a heavy chain variable region and/or a light chain variable region, such as scFv.
Используемый здесь термин антиген относится к молекуле или части молекулы, способной вызывать образование антител и специфически связываться с антителом. Антиген может иметь один или более эпитопов. Упомянутое выше специфическое связывание означает, что антиген будет реагировать высокоселективным образом с соответствующим ему антителом, но не с множеством других антител, которые могут быть индуцированы другими антигенами. Антиген в соответствии с некоторыми вариантами осуществления настоящего изобретения представляет собой человеческий PVR.As used herein, the term antigen refers to a molecule or part of a molecule capable of causing the formation of antibodies and specifically binding to an antibody. An antigen may have one or more epitopes. The specific binding mentioned above means that the antigen will react in a highly selective manner with its corresponding antibody, but not with the many other antibodies that can be induced by other antigens. The antigen in accordance with some embodiments of the present invention is a human PVR.
Фрагменты антител могут быть получены различными способами, включая, но не ограничиваясь протеолитическим расщеплением интактного антитела, а также продуцированием антител рекомбинантными клетками-хозяевами. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела представляют собой фрагменты, полученные рекомбинантным путем, такие как фрагменты, включающие расположение, которое не встречается в природе; такие как фрагменты с двумя или более областями или цепями антител, соединенными синтетическими линкерами, например, полипептидными линкерами; и/или такие, которые не получаются при ферментативном расщеплении природного интактного антитела. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения фрагменты антител представляют собой scFv.Antibody fragments can be produced by a variety of methods, including, but not limited to, proteolytic cleavage of the intact antibody, as well as production of antibodies by recombinant host cells. In some embodiments, the antibodies are recombinantly produced fragments, such as fragments comprising an arrangement that does not occur in nature; such as fragments with two or more antibody regions or chains connected by synthetic linkers, for example, polypeptide linkers; and/or those that are not obtained by enzymatic cleavage of a naturally occurring intact antibody. In accordance with some embodiments of the invention, the antibody fragments are scFv.
Гуманизированное антитело представляет собой антитело, в котором все или практически все аминокислотные остатки CDR получены из CDR нечеловеческого происхождения, а все или практически все аминокислотные остатки FR получены из FR человека. Гуманизированное антитело необязательно может включать по меньшей мере часть константной области антитела, полученную из человеческого антитела. Гуманизированная форма нечеловеческого антитела относится к варианту нечеловеческого антитела, который подвергся гуманизации, как правило, для снижения иммуногенности по отношению к человеку, при сохранении специфичности и аффинности родительского нечеловеческого антитела. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, некоторые остатки FR в гуманизированном антителе замещены соответствующими остатками нечеловеческого антитела (например, антитела, из которого получены остатки CDR), например, для восстановления или улучшения специфичности или аффинности антитела.A humanized antibody is an antibody in which all or substantially all of the CDR amino acid residues are derived from non-human CDRs and all or substantially all of the FR amino acid residues are derived from human FR. The humanized antibody may optionally include at least a portion of the antibody constant region derived from a human antibody. A humanized form of a non-human antibody refers to a variant of a non-human antibody that has been humanized, typically to reduce immunogenicity in humans while maintaining the specificity and affinity of the parent non-human antibody. In accordance with some embodiments of the invention, certain FR residues in a humanized antibody are replaced with corresponding residues of a non-human antibody (eg, the antibody from which the CDR residues are derived), for example, to restore or improve the specificity or affinity of the antibody.
Человеческое антитело представляет собой антитело с аминокислотной последовательностью, соответствующей последовательности, продуцируемой человеком или клеткой человека, или нечеловеческим источником, в котором используются репертуары человеческих антител или другие последовательности, кодирующие человеческие антитела, включая библиотеки человеческих антител. Термин не включает гуманизированные формы нечеловеческих антител, содержащих нечеловеческие антигенсвязывающие области, такие как антитела, в которых все или практически все CDR являются нечеловеческими.A human antibody is an antibody with an amino acid sequence corresponding to that produced by a human or a human cell or non-human source that uses human antibody repertoires or other sequences encoding human antibodies, including human antibody libraries. The term does not include humanized forms of non-human antibodies containing non-human antigen-binding regions, such as antibodies in which all or substantially all of the CDRs are non-human.
Термины полипептид и белок используются взаимозаменяемо для обозначения полимера, состоящего из аминокислотных остатков, и не ограничены минимальной длиной. Полипептиды, включая предлагаемые антитела и цепи антител, и другие пептиды, например, линкеры и связывающие пептиды, могут включать природные и/или неприродные аминокислотные остатки. Указанные термины также включают постэкспрессионные модификации полипептида, например, гликозилирование, сиалирование, ацетилирование, фосфорилирование и т.п. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, модификация полипептида по отношению к его нативной или природной последовательности может осуществляться, пока белок сохраняет желаемую активность. Эти модификации могут быть намеренными, например, как результат сайт-направленного мутагенеза, или могут быть случайными, например, как результат мутаций хозяев, которые продуцируют белки, или ошибок из-за амплификации в ходе ПЦР.The terms polypeptide and protein are used interchangeably to refer to a polymer composed of amino acid residues and are not limited to a minimum length. Polypeptides, including the provided antibodies and antibody chains, and other peptides, such as linkers and binding peptides, may include natural and/or non-natural amino acid residues. These terms also include post-expression modifications of the polypeptide, such as glycosylation, sialylation, acetylation, phosphorylation, and the like. According to some embodiments of the invention, modification of the polypeptide with respect to its native or natural sequence can be carried out while the protein retains the desired activity. These modifications may be intentional, such as the result of site-directed mutagenesis, or they may be accidental, such as the result of mutations in the hosts that produce the proteins or errors due to amplification during PCR.
Процент (%) идентичности последовательности по отношению к последовательности эталонного полипептида представляет собой процент аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые идентичны аминокислотным остаткам в последовательности эталонного полипептида, полученPercentage (%) sequence identity with respect to the reference polypeptide sequence is the percentage of amino acid residues in the candidate sequence that are identical to amino acid residues in the sequence of the reference polypeptide obtained
- 13 045980 ный после выравнивания последовательностей и, если это необходимо, вставки пропусков для достижения максимального процента идентичности последовательности, при этом любые консервативные замены не рассматриваются, как идентичные. Выравнивание для определения процента идентичности аминокислотной последовательности может быть достигнуто различными известными способами, например, с использованием общедоступного компьютерного программного обеспечения, такого как BLAST, BLAST-2, ALIGN или Megalign (DNASTAR). Могут быть определены подходящие параметры для выравнивания последовательностей, включая алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей. Однако для целей настоящего документа значения % идентичности аминокислотной последовательности получены с использованием компьютерной программы сравнения последовательностей ALIGN-2. Программа сравнения последовательностей ALIGN-2 была создана Genentech, Inc., и исходный код был подан вместе с пользовательской документацией в Ведомство по регистрации авторских прав США, Вашингтон, округ Колумбия, 20559, где программа была зарегистрирована под номером регистрации авторского права США TXU510087. Программа ALIGN-2 находится в открытом доступе, полученном от Genentech, Inc., Южный Сан-Франциско, Калифорния, или может быть скомпилирована из исходного кода. Для использования в операционной системе UNIX, включая цифровую UNIX. V4.0D, программа ALIGN-2 должна быть скомпилирована. Все параметры сравнения последовательностей задаются программой ALIGN-2 и не изменяются.- 13 045980 nal after sequence alignment and, if necessary, insertion of gaps to achieve the maximum percentage of sequence identity, with any conservative substitutions not considered identical. Alignment to determine percent amino acid sequence identity can be achieved by various known methods, for example, using publicly available computer software such as BLAST, BLAST-2, ALIGN or Megalign (DNASTAR). Suitable parameters for sequence alignment can be determined, including algorithms necessary to achieve maximum alignment over the entire length of the sequences being compared. However, for the purposes of this document, % amino acid sequence identity values are obtained using the ALIGN-2 sequence comparison computer program. The ALIGN-2 sequence comparison program was created by Genentech, Inc., and the source code was filed along with user documentation with the United States Copyright Office, Washington, DC 20559, where the program was registered under U.S. Copyright Number TXU510087. The ALIGN-2 program is publicly available from Genentech, Inc., South San Francisco, California, or can be compiled from source code. For use on the UNIX operating system, including digital UNIX. V4.0D, ALIGN-2 program must be compiled. All sequence comparison parameters are set by the ALIGN-2 program and do not change.
В ситуациях, когда для сравнения последовательностей аминокислот используется ALIGN-2, % идентичности аминокислотной последовательности А по отношению к аминокислотной последовательности В (которую можно иначе представить, как заданную аминокислотную последовательность А, которая имеет или содержит определенный процент идентичности аминокислотной последовательности по отношению к, в сравнении с, или против данной аминокислотной последовательности В) рассчитывается следующим образом: 100 умножить на X/Y, где X - количество аминокислотных остатков, посчитанных, как идентичные программой выравнивания последовательностей ALIGN-2, в которой осуществляется выравнивание А и В, и где Y - общее количество аминокислотных остатков в В. Следует понимать, что когда длина аминокислотной последовательности А не равна длине аминокислотной последовательности В, % идентичности аминокислотной последовательности А по отношению к В не будет равняться % идентичности аминокислотной последовательности В по отношению к А. Если специально не указано иное, все значения % идентичности аминокислотной последовательности используемые здесь, получены, как описано в предыдущем абзаце, с использованием компьютерной программы ALIGN-2.In situations where ALIGN-2 is used to compare amino acid sequences, the % amino acid sequence identity of A with respect to amino acid sequence B (which can otherwise be thought of as a given amino acid sequence A that has or contains a certain percentage of amino acid sequence identity with respect to, in comparison with or against a given amino acid sequence B) is calculated as follows: 100 times X/Y, where X is the number of amino acid residues counted as identical by the ALIGN-2 sequence alignment program, which performs the alignment of A and B, and where Y - the total number of amino acid residues in B. It should be understood that when the length of the amino acid sequence A is not equal to the length of the amino acid sequence B, the % identity of the amino acid sequence of A with respect to B will not equal the % identity of the amino acid sequence of B with respect to A. Unless specifically stated otherwise, all % amino acid sequence identity values used here were obtained as described in the previous paragraph using the ALIGN-2 computer program.
Термины гомологичный, гомология или процент гомологии, когда они используются здесь для описания аминокислотной последовательности или последовательности нуклеиновой кислоты в сравнении с эталонной последовательностью, могут быть определены с использованием формулы, описанной Karlin и Altschul (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2264-2268, 1990, с изменениями, как в Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877, 1993). Такая формула включена в основные программы поиска, основанные на локальном выравнивании (BLAST) Altschul et al. (J. Mol. Biol. 215: 403-410, 1990). Процент гомологии последовательностей может быть определен с использованием самой последней версии BLAST на дату подачи настоящей заявки.The terms homologous, homology, or percent homology, when used herein to describe an amino acid sequence or nucleic acid sequence in comparison to a reference sequence, can be defined using the formula described by Karlin and Altschul (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2264 -2268, 1990, as modified as Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877, 1993). Such a formula is included in the basic local alignment search programs (BLAST) of Altschul et al. (J. Mol. Biol. 215: 403-410, 1990). Percent sequence homology can be determined using the most recent version of BLAST as of the filing date of this application.
Некоторые варианты осуществления изобретения направлены на варианты аминокислотной последовательности антител, предложенных в настоящем документе. Вариант обычно отличается от полипептида, непосредственно описанного в настоящем документе, одной или более заменами, делециями, добавлениями и/или вставками. Такие варианты могут встречаться в природе или могут быть получены синтетическим путем, например, путем модификации одной или более из указанных выше полипептидных последовательностей по изобретению и оценки одной или более биологических активностей полипептида, как описано в настоящем документе, и/или с использованием любой из известных методик. Например, может быть желательно улучшить аффинность связывания и/или другие биологические свойства антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела могут быть получены путем введения соответствующих модификаций в нуклеотидную последовательность, кодирующую антитело, или путем пептидного синтеза. Такие модификации включают, например, делеции и/или вставки и/или замены остатков в аминокислотных последовательностях антитела. Любая комбинация делеций, вставок и замен может быть использована для получения итоговой конструкции при условии, что итоговая конструкция обладает желаемыми характеристиками, например, связывается с антигеном.Some embodiments of the invention are directed to amino acid sequence variants of the antibodies provided herein. A variant typically differs from the polypeptide directly described herein by one or more substitutions, deletions, additions and/or insertions. Such variants may occur naturally or may be produced synthetically, for example, by modifying one or more of the above polypeptide sequences of the invention and assessing one or more biological activities of the polypeptide as described herein and/or using any of the known techniques. For example, it may be desirable to improve the binding affinity and/or other biological properties of the antibody. Variants of the amino acid sequence of an antibody can be obtained by introducing appropriate modifications into the nucleotide sequence encoding the antibody or by peptide synthesis. Such modifications include, for example, deletions and/or insertions and/or substitutions of residues in the amino acid sequences of the antibody. Any combination of deletions, insertions and substitutions can be used to produce the final construct, provided that the resulting construct has the desired characteristics, such as antigen binding.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаются варианты антител, содержащие одну или более аминокислотных замен. Участки, представляющие интерес для мутагенеза путем замены, включают CDR и FR. Аминокислотные замены могут быть введены в представляющее интерес антитело, а продукты подвергнуты скринингу на желаемую активность, например, сохраненное/улучшенное связывание антигена, сниженную иммуногенность или улучшенную антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) или комплементзависимую цитотоксичность (CDC).In some embodiments, the invention provides antibody variants containing one or more amino acid substitutions. Regions of interest for substitution mutagenesis include CDR and FR. Amino acid substitutions can be introduced into the antibody of interest, and the products are screened for the desired activity, such as preserved/improved antigen binding, reduced immunogenicity, or improved antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) or complement-dependent cytotoxicity (CDC).
В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, вставки или делеции могут быть сделаны в одном или более CDR, при этом замены, вставки или делеции существенно не снижают связывание антитела с антигеном. Например, в CDR могут быть сделаны консервативные замены, которые существенно не снижают аффинность связывания. Такие изменения могут находиться за пределами горячихIn some embodiments, substitutions, insertions or deletions may be made in one or more CDRs, wherein the substitutions, insertions or deletions do not significantly reduce the binding of the antibody to the antigen. For example, conservative substitutions can be made in the CDRs that do not significantly reduce binding affinity. Such changes may be outside the hot zones
- 14 045980 точек CDR. В некоторых вариантах последовательностей VH и VL ни один из участков CDR не изменен.- 14,045,980 CDR points. In some variants of the VH and VL sequences, none of the CDR regions are changed.
Изменения (например, замены) могут быть сделаны в CDR, например, для улучшения аффинности антител. Такие изменения могут быть сделаны в кодонах, кодирующих CDR, с высокой частотой мутаций во время соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)), а полученный вариант можно протестировать на аффинность связывания. Созревание аффинности (например, с использованием подверженной ошибкам ПЦР, перестановки цепей, рандомизации CDR или олигонуклеотид-направленного мутагенеза) можно использовать для улучшения аффинности антител (см., например, Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (2001)). Остатки CDR, вовлеченные в связывание антигена, могут быть специфически идентифицированы, например, с использованием аланин-сканирующего мутагенеза или моделирования (см., например, Cunningham and Wells Science, 244:1081-1085 (1989)). Чаще всего мишенью становятся CDR-H3 и CDR-L3. Альтернативно или дополнительно, для идентификации точек контакта между антителом и антигеном используется кристаллическая структура комплекса антиген-антитело. Такие контактные остатки и соседние остатки могут быть выбраны в качестве кандидатов для замещения, или исключены. Варианты могут быть подвергнуты скринингу, чтобы определить, обладают ли они желаемыми свойствами.Changes (eg, substitutions) can be made to the CDR, for example, to improve antibody affinity. Such changes can be made to codons encoding CDRs with high mutation rates during somatic maturation (see, e.g., Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)), and the resulting variant can be tested for binding affinity . Affinity maturation (eg, using error-prone PCR, strand shuffling, CDR randomization, or oligonucleotide-directed mutagenesis) can be used to improve antibody affinity (see, eg, Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178:1-37 (2001 )). CDR residues involved in antigen binding can be specifically identified, for example, using alanine scanning mutagenesis or modeling (see, for example, Cunningham and Wells Science, 244:1081-1085 (1989)). The most common targets are CDR-H3 and CDR-L3. Alternatively or additionally, the crystal structure of the antigen-antibody complex is used to identify points of contact between antibody and antigen. Such contact residues and adjacent residues may be selected as candidates for replacement, or excluded. Variants can be screened to determine whether they have the desired properties.
Вставки и делеции аминокислотной последовательности включают слияния амино-и/или карбоксильных концов с полипептидами длиной от одного остатка до содержащих сто или более остатков, а также вставки и делеции одного или нескольких аминокислотных остатков внутри последовательности. Примеры концевых вставок включают антитело с N-концевым метионином. Другие варианты вставок в молекулу антитела включают слияние N- или С-конца антитела с ферментом (например, для ADEPT) или полипептидом, который увеличивает время полужизни антитела в сыворотке. Примеры вариантов вставок внутри последовательности молекул антител включают вставку 3 аминокислот в легкой цепи. Примеры терминальных делеций включают антитело с делецией 7 или менее аминокислот на конце легкой цепи.Amino acid sequence insertions and deletions include amino and/or carboxyl terminus fusions to polypeptides ranging in length from one residue to one hundred or more residues, as well as insertions and deletions of one or more amino acid residues within a sequence. Examples of terminal inserts include an antibody with an N-terminal methionine. Other insertions into the antibody molecule include fusing the N- or C-terminus of the antibody with an enzyme (eg, for ADEPT) or polypeptide that increases the half-life of the antibody in serum. Examples of insertion variants within the sequence of antibody molecules include the insertion of 3 amino acids in the light chain. Examples of terminal deletions include an antibody with a deletion of 7 or fewer amino acids at the end of the light chain.
В некоторых вариантах осуществления изобретения константа диссоциации (KD) для предложенного в настоящем документе антитела и мишени антитела, человеческого рецептора полиовируса (CD155), имеет приблизительно 1 мкМ, 100 нМ, 50 нМ, 40 нМ, 30 нМ, 20 нМ, 10 нМ, 5 нМ, 2 нМ, 1 нМ, 0,5 нМ, 0,1 нМ, 0,05 нМ, 0,01 нМ или 0,001 нМ или меньше (например, 10-8М или меньше, например, от 10-8М до 10-13М, например, от 10-9М до 10-13М). KD можно измерить любым подходящим способом. В некоторых вариантах осуществления изобретения KD можно измерить с помощью поверхностного плазмонного резонанса (SPR) (например, с использованием BIACORE®-2000 или BIACORE®-3000).In some embodiments, the dissociation constant (KD) for the antibody provided herein and the antibody target, human poliovirus receptor (CD155), is approximately 1 μM, 100 nM, 50 nM, 40 nM, 30 nM, 20 nM, 10 nM, 5 nM, 2 nM, 1 nM, 0.5 nM, 0.1 nM, 0.05 nM, 0.01 nM or 0.001 nM or less (for example, 10 -8 M or less, for example, from 10 -8 M up to 10 -13 M, for example, from 10 -9 M to 10 -13 M). KD can be measured by any suitable method. In some embodiments, KD can be measured using surface plasmon resonance (SPR) (eg, using BIACORE®-2000 or BIACORE®-3000).
В некоторых вариантах осуществления изобретения одна или более аминокислотных модификаций могут быть введены в Fc-область антитела, представленного в настоящем документе, с образованием, таким образом, варианта Fc-области. Fc-область здесь представляет собой С-концевой участок тяжелой цепи иммуноглобулина, который содержит по меньшей мере часть константной области. Fc-область включает Fc-области с нативной последовательностью и варианты Fc-области. Вариант Fc-области может содержать последовательность Fc-области человека (например, Fc-область IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 человека), включающую аминокислотную модификацию (например, замену) в одном или более аминокислотных положениях.In some embodiments, one or more amino acid modifications may be introduced into the Fc region of an antibody provided herein, thereby forming a variant Fc region. The Fc region here is the C-terminal region of the immunoglobulin heavy chain, which contains at least part of the constant region. The Fc region includes native sequence Fc regions and Fc region variants. The Fc region variant may comprise a human Fc region sequence (eg, human IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 Fc region) including an amino acid modification (eg, substitution) at one or more amino acid positions.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела по данному описанию представляют собой варианты, которые обладают некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, что делает их желательными кандидатами для применений, в которых важен период полужизни антитела in vivo, тогда как некоторые эффекторные функции (такие как комплемент и ADCC) не нужны или вредны. Анализы цитотоксичности in vitro и/или in vivo могут быть проведены для подтверждения снижения/потери CDC и/или ADCC активности. Например, анализы связывания Fc-рецептора (FcR) могут быть проведены, чтобы гарантировать, что антитело не связывается с FcyR (следовательно, вероятно, не имеет ADCCактивности), но сохраняет способность связываться с FcRn. Неограничивающие примеры in vitro анализов для оценки ADCC-активности интересующей молекулы описаны в патентах US 5500362 и US 5821337. В качестве альтернативы можно использовать методы нерадиоактивных анализов (например, методы нерадиоактивной цитотоксичности ACTI™ и CytoTox 96®). Подходящие для таких анализов эффекторные клетки включают мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС), моноциты, макрофаги и клетки-натуральные киллеры (NK).In some embodiments, the antibodies herein are variants that possess some, but not all, effector functions, making them desirable candidates for applications in which the in vivo half-life of the antibody is important, while some effector functions (such as complement and ADCC) are unnecessary or harmful. In vitro and/or in vivo cytotoxicity assays can be performed to confirm reduction/loss of CDC and/or ADCC activity. For example, Fc receptor (FcR) binding assays can be performed to ensure that the antibody does not bind to FcyR (thus likely to have no ADCC activity) but retains the ability to bind to FcRn. Non-limiting examples of in vitro assays for assessing the ADCC activity of a molecule of interest are described in US Pat. No. 5,500,362 and US Pat. No. 5,821,337. Alternatively, non-radioactive assay methods (eg, the ACTI™ and CytoTox 96® non-radioactive cytotoxicity methods) can be used. Suitable effector cells for such assays include peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), monocytes, macrophages, and natural killer (NK) cells.
Антитела могут иметь увеличенный период полувыведения и улучшенное связывание с неонатальным Fc-рецептором (FcRn) (см., например, US 2005/0014934). Такие антитела могут содержать Fcобласть с одной или более заменами, которые улучшают связывание Fc-области с FcRn, и включают антитела с заменами в одном или более остатках Fc-области: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434 в соответствии с системой нумерации EU (см., например, патент US 7371826). Также рассматриваются другие примеры вариантов Fc-области (см., например, Duncan & Winter, Nature 322:738-40 (1988); патенты US 5648260 и US 5624821; и WO 94/29351).Antibodies may have an increased half-life and improved binding to the neonatal Fc receptor (FcRn) (see, for example, US 2005/0014934). Such antibodies may contain an Fc region with one or more substitutions that improve binding of the Fc region to FcRn, and include antibodies with substitutions at one or more Fc region residues: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 or 434 according to the EU numbering system (see, for example, US patent 7371826). Other examples of Fc region variants are also discussed (see, for example, Duncan & Winter, Nature 322:738-40 (1988); US Pat. Nos. 5,648,260 and US 5,624,821; and WO 94/29351).
В некоторых вариантах осуществления изобретения может быть желательно создать антитела соIn some embodiments, it may be desirable to create antibodies with
- 15 045980 сконструированным цистеином, например, тиоМАЬ, в которых один или более остатков заменены остатками цистеина. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, замещенные остатки находятся в доступных участках антитела. Для создания иммуноконъюгата реакционноспособные тиоловые группы могут быть расположены в местах конъюгации с другими фрагментами, такими как фрагменты лекарственного средства или фрагменты лекарственное средство-линкер. В некоторых вариантах осуществления изобретения любой один или более из следующих остатков могут быть заменены цистеином: V205 (нумерация по Kabat) легкой цепи; А118 (нумерация EU) тяжелой цепи; и S400 (нумерация EU) Fc-области тяжелой цепи.- 15 045980 engineered cysteine, for example thioMAB, in which one or more residues are replaced by cysteine residues. In accordance with some embodiments of the invention, the substituted residues are located in accessible regions of the antibody. To create an immunoconjugate, reactive thiol groups can be located at sites of conjugation with other moieties, such as drug moieties or drug-linker moieties. In some embodiments, any one or more of the following residues may be replaced by cysteine: V205 (Kabat numbering) light chain; A118 (EU numbering) heavy chain; and S400 (EU numbering) heavy chain Fc region.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, представленное в настоящем документе, может быть дополнительно модифицировано, чтобы оно содержало дополнительные небелковые фрагменты, которые известны и доступны. Фрагменты, подходящие для дериватизации антитела, включают водорастворимые полимеры, но не ограничиваются ими. Неограничивающие примеры водорастворимых полимеров включают, но не ограничиваются следующими: полиэтиленгликоль (ПЭГ), сополимеры этиленгликоля/пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлоза, декстран, поливиниловый спирт, поливинилпирролидон, поли-1,3-диоксолан, поли-1,3,6-триоксан, сополимер этилена и малеинового ангидрида, полиаминокислоты (либо гомополимеры, либо статистические сополимеры) и декстран или поли(нвинилпирролидон)полиэтиленгликоль, гомополимеры полипропиленгликоля, сополимеры полипропилен оксида/этилен оксида, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их смеси. Полиэтиленгликольпропионовый альдегид может иметь преимущества в производстве благодаря его устойчивости в воде. Полимер может иметь любую молекулярную массу и может быть разветвленным или неразветвленным. Число полимеров, присоединенных к антителу, может варьироваться, а если присоединены два или более полимеров, они могут быть одинаковыми или разными молекулами.In some embodiments, the antibody provided herein may be further modified to contain additional non-protein moieties that are known and available. Fragments suitable for antibody derivatization include, but are not limited to, water-soluble polymers. Non-limiting examples of water-soluble polymers include, but are not limited to: polyethylene glycol (PEG), ethylene glycol/propylene glycol copolymers, carboxymethylcellulose, dextran, polyvinyl alcohol, polyvinylpyrrolidone, poly-1,3-dioxolane, poly-1,3,6-trioxane, ethylene copolymer and maleic anhydride, polyamino acids (either homopolymers or random copolymers) and dextran or poly(vinylpyrrolidone)polyethylene glycol, polypropylene glycol homopolymers, polypropylene oxide/ethylene oxide copolymers, polyoxyethylated polyols (eg glycerol), polyvinyl alcohol and mixtures thereof. Polyethylene glycol propionaldehyde may have advantages in production due to its stability in water. The polymer can have any molecular weight and can be branched or unbranched. The number of polymers attached to the antibody may vary, and if two or more polymers are attached, they may be the same or different molecules.
Описанные здесь антитела могут кодироваться нуклеиновой кислотой. Нуклеиновая кислота представляет собой тип полинуклеотида, состоящего из двух или более нуклеотидных оснований. В некоторых вариантах осуществления изобретения нуклеиновая кислота является компонентом вектора, который можно использовать для переноса в клетку полинуклеотида, кодирующего полипептид. Используемый здесь термин вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной транспортировать другую нуклеиновую кислоту, с которой она связана. Один тип вектора представляет собой интегрированный в геном вектор или интегрированный вектор, который может быть интегрирован в хромосомную ДНК клетки-хозяина. Другой тип вектора представляет собой эписомальный вектор, например нуклеиновую кислоту, способную к внехромосомной репликации. Векторы, способные направлять экспрессию генов, с которыми они оперативно связаны, называются здесь векторами экспрессии. Подходящие векторы включают плазмиды, искусственные хромосомы бактерий, искусственные хромосомы дрожжей, вирусные векторы и т.п. Регуляторные элементы, содержащиеся в векторах экспрессии, такие как промоторы, энхансеры, сигналы полиаденилирования, предназначенные для регуляции транскрипции, могут быть получены из генов млекопитающих, микробов, вирусов или насекомых. Дополнительно могут быть включены способность реплицироваться в хозяине, обычно обеспечиваемая ориджином репликации, и ген селекции для упрощения распознавания трансформантов. Могут применяться векторы, полученные из вирусов, таких как лентивирусы, ретровирусы, аденовирусы, аденоассоциированные вирусы и т.п. Плазмидные векторы могут быть линеаризованы для интеграции в хромосому. Векторы могут содержать последовательности, которые направляют сайт-специфическую интеграцию в определенное положение или ограниченный набор участков генома (например, рекомбинация AttP-AttB). Кроме того, векторы могут содержать последовательности, полученные из мобильных генетических элементов.The antibodies described herein may be encoded by nucleic acid. A nucleic acid is a type of polynucleotide made up of two or more nucleotide bases. In some embodiments, the nucleic acid is a component of a vector that can be used to carry a polynucleotide encoding a polypeptide into a cell. As used herein, the term vector refers to a nucleic acid molecule capable of transporting another nucleic acid to which it is associated. One type of vector is a genome-integrated vector or an integrated vector that can be integrated into the chromosomal DNA of a host cell. Another type of vector is an episomal vector, for example a nucleic acid capable of extrachromosomal replication. Vectors capable of directing the expression of genes to which they are operatively linked are referred to herein as expression vectors. Suitable vectors include plasmids, bacterial artificial chromosomes, yeast artificial chromosomes, viral vectors, and the like. Regulatory elements contained in expression vectors, such as promoters, enhancers, polyadenylation signals for transcriptional regulation, can be derived from mammalian, microbial, viral or insect genes. Additionally, the ability to replicate in the host, typically provided by the origin of replication, and a selection gene may be included to facilitate recognition of transformants. Vectors derived from viruses such as lentiviruses, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, and the like can be used. Plasmid vectors can be linearized for integration into the chromosome. Vectors may contain sequences that direct site-specific integration to a specific position or limited set of genomic regions (eg, AttP-AttB recombination). In addition, the vectors may contain sequences derived from mobile genetic elements.
Нуклеиновые кислоты, кодирующие описанные здесь антитела, можно использовать для инфицирования, трансфекции, трансформации или иного преобразования подходящей клетки, трансгенной по отношению к нуклеиновой кислоте, что позволяет получать антитела для коммерческого или терапевтического использования. Стандартные клеточные линии и способы получения антител из крупномасштабной клеточной культуры известны в данной области. В некоторых вариантах осуществления изобретения клетка представляет собой эукариотическую клетку. В некоторых вариантах осуществления изобретения эукариотическая клетка представляет собой клетку млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления изобретения клетка млекопитающего представляет собой клеточную линию, подходящую для получения антител, например, клетку яичников китайского хомячка (СНО), клетку миеломы мыши NS0 или клетку PER.C6®. В некоторых вариантах осуществления изобретения нуклеиновая кислота, кодирующая антитело, интегрирована в геномный локус клетки, подходящей для получения антител. В некоторых вариантах осуществления изобретения предложен способ получения антитела, включающий культивирование клетки, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, в in vitro условиях, достаточных для обеспечения продуцирования и секреции указанного антитела.The nucleic acids encoding the antibodies described herein can be used to infect, transfect, transform or otherwise transform a suitable cell transgenic for the nucleic acid, thereby producing antibodies for commercial or therapeutic use. Standard cell lines and methods for producing antibodies from large-scale cell culture are known in the art. In some embodiments, the cell is a eukaryotic cell. In some embodiments, the eukaryotic cell is a mammalian cell. In some embodiments, the mammalian cell is a cell line suitable for antibody production, such as a Chinese hamster ovary (CHO) cell, an NS0 mouse myeloma cell, or a PER.C6® cell. In some embodiments, the nucleic acid encoding the antibody is integrated into the genomic locus of a cell suitable for producing antibodies. In some embodiments, the invention provides a method for producing an antibody, comprising culturing a cell containing a nucleic acid encoding the antibody under in vitro conditions sufficient to permit production and secretion of said antibody.
В некоторых вариантах осуществления, описанных в настоящем документе, предложен клеточный мастер-банк, содержащий: (а) клеточную линию млекопитающих, содержащую интегрированную в геном нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, описанное в настоящем документе; и (b) криопротектор. В некоторых вариантах осуществления изобретения криопротектор содержит глицерин. В некоторых вариантах осуществления изобретения клеточный мастер-банк содержит: (а) клеточную линиюIn some embodiments described herein, a cell master bank is provided comprising: (a) a mammalian cell line containing a genome-integrated nucleic acid encoding an antibody described herein; and (b) a cryoprotectant. In some embodiments, the cryoprotectant contains glycerol. In some embodiments, the cell master bank comprises: (a) a cell line
- 16 045980- 16 045980
СНО, содержащую интегрированную в геном нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело с (i) аминокислотной последовательностью тяжелой цепи, представленной любой из SEQ ID NO: 1, 3, 4, 5 или 6; и (ii) аминокислотной последовательностью легкой цепи, представленной любой из SEQ ID NO: 2, 7, 8 или 9; и (b) криопротектор. В некоторых вариантах осуществления изобретения криопротектор содержит глицерин. В некоторых вариантах осуществления изобретения клеточный мастер-банк содержится в подходящем флаконе или контейнере, способном выдерживать замораживание в жидком азоте.CHO containing a genome-integrated nucleic acid encoding an antibody with (i) a heavy chain amino acid sequence represented by any of SEQ ID NO: 1, 3, 4, 5 or 6; and (ii) a light chain amino acid sequence represented by any of SEQ ID NO: 2, 7, 8 or 9; and (b) a cryoprotectant. In some embodiments, the cryoprotectant contains glycerol. In some embodiments, the cell master bank is contained in a suitable vial or container capable of withstanding freezing in liquid nitrogen.
Также в настоящем документе описаны способы получения описанного здесь антитела. Такие способы включают инкубацию клетки или клеточной линии, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, в среде для культивирования клеток в условиях, достаточных для экспрессии и секреции антитела, и дальнейшее выделение антитела из среды для культивирования клеток. Выделение может дополнительно включать одну или более стадий очистки для удаления живых клеток, клеточного дебриса, белков или полипептидов, не являющихся антителами, нежелательных солей, буферов и компонентов среды. В некоторых вариантах осуществления изобретения дополнительные стадии очистки включают центрифугирование, ультрацентрифугирование, использование белка А, белка G, белка A/G или белка L и/или ионообменную хроматографию.Also described herein are methods for producing the antibody described herein. Such methods include incubating a cell or cell line containing a nucleic acid encoding an antibody in a cell culture medium under conditions sufficient for expression and secretion of the antibody, and then isolating the antibody from the cell culture medium. The recovery may further include one or more purification steps to remove live cells, cellular debris, non-antibody proteins or polypeptides, unwanted salts, buffers, and media components. In some embodiments, additional purification steps include centrifugation, ultracentrifugation, Protein A, Protein G, Protein A/G, or Protein L, and/or ion exchange chromatography.
Антитела, описанные в настоящем документеAntibodies described herein
В определенном аспекте в настоящем документе описывается антитело против человеческого PVR (анти-hPVR) или его антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим PVR на границе контакта PVR-TIGIT. В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитело или его антигенсвязывающий фрагмент способны конкурировать с любым одним или более из TIGIT, CD96 и CD226.In a certain aspect, an anti-human PVR (anti-hPVR) antibody or an antigen-binding fragment thereof is described herein. In some embodiments, the antibody or antigen-binding fragment thereof binds to the human PVR at the PVR-TIGIT interface. In some embodiments, the anti-hPVR antibody or antigen binding fragment thereof is capable of competing with any one or more of TIGIT, CD96, and CD226.
В некоторых вариантах осуществления изобретения EC50 гуманизированного антитела или его антигенсвязывающего фрагмента для связывания с человеческим PVR составляет менее, чем приблизительно 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, 0,5, 0,1, 0,05 или 0,01 нМ. В некоторых вариантах осуществления изобретения EC50 анти-hPVR антитела для связывания с PVR находится в интервале от приблизительно 5 до 1 нМ, от приблизительно 5 нМ до приблизительно 2 нМ, от приблизительно 4 нМ до приблизительно 2 нМ, от приблизительно 4 нМ до приблизительно 3 нМ, или от приблизительно 3 нМ до приблизительно 2 нМ.In some embodiments, the EC 50 of the humanized antibody or antigen binding fragment thereof for binding to human PVR is less than about 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, 0.5, 0.1 , 0.05 or 0.01 nM. In some embodiments, the EC 50 of the anti-hPVR antibody for binding to PVR is in the range of about 5 nM to about 1 nM, about 5 nM to about 2 nM, about 4 nM to about 2 nM, about 4 nM to about 3 nM nM, or from about 3 nM to about 2 nM.
Полумаксимальная эффективная концентрация (EC50) относится к концентрации антитела, которая вызывает ответ, равный половине значения между базовой линией и максимумом, после определенного времени воздействия.The half-maximal effective concentration (EC 50 ) refers to the concentration of an antibody that produces a response equal to half the value between baseline and maximum after a specified exposure time.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело представляет собой рекомбинантное антитело. Согласно конкретным вариантам осуществления изобретения, антитело представляет собой рекомбинантное гуманизированное моноклональное антитело.In some embodiments, the antibody is a recombinant antibody. According to specific embodiments of the invention, the antibody is a recombinant humanized monoclonal antibody.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6.In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID NO : 6.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность легкой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a light chain sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, and SEQ ID NO: 9.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой NB1088 (SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 2).In accordance with some embodiments of the invention, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof is NB1088 (SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2).
Один из аспектов, описанный в настоящем документе, относится к гуманизированному антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и где легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с рецептором полиовируса человека (CD155).One aspect described herein relates to a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence at least about 90% identical to a sequence selected from a group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and wherein the light chain contains an amino acid sequence at least about 90% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, wherein the antibody or its antigen-binding fragment binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В другом аспекте, описанном в настоящем документе, предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь иммуноглобулина, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности SEQ ID NO: 1, а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 90% идентичную последовательности SEQ ID NO: 2, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155).In another aspect described herein, a humanized antibody or antigen binding fragment thereof is provided, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain of an immunoglobulin, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence at least about 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 1, and the light chain contains an amino acid sequence that is at least about 90% identical to the sequence of SEQ ID NO: 2, and the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В некоторых вариантах осуществления изобретения в настоящем документе предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичную последовательности, выбранIn some embodiments, provided herein is a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence at least about 95% identical to the sequence selected
- 17 045980 ной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; и где легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 95% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155).- 17 045980 from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and wherein the light chain comprises an amino acid sequence at least about 95% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, wherein the antibody or its antigen-binding fragment binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В некоторых вариантах осуществления изобретения в настоящем документе предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере приблизительно на 95, 96, 97, 98 или 99% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6, а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 95, 96, 97, 98 или 99% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155). Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, provided herein is a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises at least about 95, 96, 97, 98 or 99% amino acid sequence identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6, and the light chain contains an amino acid sequence of at least approximately 95, 96, 97, 98 or 99% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the human poliovirus receptor (CD155). Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретения в настоящем документе предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере приблизительно на 98% идентичную SEQ ID NO: 1, а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере приблизительно на 98% идентичную SEQ ID NO: 2, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155).In some embodiments, provided herein is a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein said antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence at least about 98% identical to SEQ ID NO: 1. and the light chain contains an amino acid sequence at least about 98% identical to SEQ ID NO: 2, and the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В некоторых вариантах осуществления в настоящем документе предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичную SEQ ID NO: 1, а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, по меньшей мере приблизительно на 99% идентичную SEQ ID NO: 2, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155).In some embodiments, provided herein is a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein said antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence at least about 99% identical to SEQ ID NO: 1. and the light chain contains an amino acid sequence at least about 99% identical to SEQ ID NO: 2, and the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В некоторых вариантах осуществления изобретения в настоящем документе предложено гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, идентичную последовательности SEQ ID NO: 1, а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, идентичную последовательности SEQ ID NO: 2, причем антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с человеческим рецептором полиовируса (CD155).In some embodiments, the invention provides herein a humanized antibody or antigen binding fragment thereof, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain and a light chain, wherein the heavy chain comprises an amino acid sequence identical to that of SEQ ID NO: 1 and the light chain comprises an amino acid sequence a sequence identical to that of SEQ ID NO: 2, wherein the antibody or antigen binding fragment thereof binds to the human poliovirus receptor (CD155).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 1, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 7. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 1, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 1, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 9. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 3, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 3, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 7. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 3, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 3, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 9. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 4, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 4, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 7. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 4, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательностьIn accordance with some embodiments of the invention, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 1 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 7. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof contains the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 1 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 1. and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 3 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 2 In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 3 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 7. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the antigen binding fragment comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 3 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. 3, and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 9. In accordance with some embodiments of the invention, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 2. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 7. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the antigen binding fragment comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the sequence
- 18 045980 тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 4, и последовательность легкой цепи последовательность, представленную в SEQ ID NO: 9. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 5, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 5, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 7. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 5, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 5, и последовательность легкой цепи представленную в SEQ ID NO: 9. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 6, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 6, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 7. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 6, и последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 6, и последовательность легкой цепи последовательность, представленную в SEQ ID NO: 9.- 18 045980 the heavy chain set forth in SEQ ID NO: 4, and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 9. 5, and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 2. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 5 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 7. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 5 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof contains the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 5 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 9. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 6, and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 2. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 7. According to In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and a light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 8. the chain shown in SEQ ID NO: 6, and the light chain sequence shown in SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащий тяжелую цепь, содержит аминокислотную последовательность QVQLVQSGAE(L/V)KKPGASVK(I/V)SCKATGYTFSNYWIEW(I/V)(K/R)QAPGQGLEW(I/M)GEIFPGSG RINFNEKFKGR(A/V)TFTADTSI(D/S)T(T/A)YM(Q/E)LS(S/R)L(T/R)SDD(S/T)AVYYCARTKIYGNSFDY WGQGT(T/ L)VTVSS (SEQ ID NO: 47); а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность DI(M/Q)MTQSPS(F/S)LSASVGDRVTITC(K/R)ASQDVGTAV(V/A)WYQQKPGKAPK(L/S)LIYWASSRHE GVP(D/S)RF(T/S)GSGSGTDFTLTISSLQ(S/P)EDFA( D/T)YFCQQYSRYPLTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 48).In some embodiments, the humanized antibody or heavy chain antigen binding fragment thereof comprises the amino acid sequence QVQLVQSGAE(L/V)KKPGASVK(I/V)SCKATGYTFSNYWIEW(I/V)(K/R)QAPGQGLEW(I/M)GEIFPGSG RINFNEKFKGR(A/V)TFTADTSI(D/S)T(T/A)YM(Q/E)LS(S/R)L(T/R)SDD(S/T)AVYYCARTKIYGNSFDY WGQGT(T/ L)VTVSS (SEQ ID NO: 47); and the light chain contains the amino acid sequence DI(M/Q)MTQSPS(F/S)LSASVGDRVTITC(K/R)ASQDVGTAV(V/A)WYQQKPGKAPK(L/S)LIYWASSRHE GVP(D/S)RF(T/S)GSGSGTDFTLTISSLQ (S/P)EDFA(D/T)YFCQQYSRYPLTFGQGTKLEIK (SEQ ID NO: 48).
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится L, или в положении 20 находится I, или в положении 37 находится I, или в положении 38 находится K, или в положении 48 находится I, или в положении 68 находится А, или в положении 77 находится D, или в положении 79 находится Т, или в положении 82 находится Q, или в положении 85 находится S, или в положении 87 находится Т, или в положении 91 находится S, или в положении 114 находится Т, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, where position 11 is L, or position 20 is I, or position 37 is I, or position 38 is K, or in position 48 there is I, or in position 68 there is A, or in position 77 there is D, or in position 79 there is T, or in position 82 there is Q, or in position 85 there is S, or in position 87 there is T, or in position 91 is S, or position 114 is T, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится V, или в положении 20 находится I, или в положении 37 находится I, или в положении 38 находится K, или в положении 48 находится I, или в положении 68 находится А, или в положении 77 находится D, или в положении 79 находится Т, или в положении 82 находится Е, или в положении 85 находится R, или в положении 87 находится R, или в положении 91 находится Т, или в положении 114 находится L, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, where position 11 is V, or position 20 is I, or position 37 is I, or position 38 is K, or at position 48 there is I, or at position 68 there is A, or at position 77 there is D, or at position 79 there is T, or at position 82 there is E, or at position 85 there is R, or at position 87 there is R, or position 91 is T, or position 114 is L, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится V, или в положении 20 находится V, или в положении 37 находится V, или в положении 38 находится R, или в положении 48 находится М, или в положении 68 находится V, или в положении 77 находится S, или в положении 79 находится А, или в положении 82 находится Е, или в положении 85 находится R, или в положении 87 находится R, или в положении 91 находится Т, или в положении 114 находится L, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, wherein position 11 is V, or position 20 is V, or position 37 is V, or position 38 is R, or in position 48 there is M, or in position 68 there is V, or in position 77 there is S, or in position 79 there is A, or in position 82 there is E, or in position 85 there is R, or in position 87 there is R, or in position 91 is T, or position 114 is L, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится V, или в положении 20 находится V, или в положении 37 находится I, или в положении 38 находится K, или в положении 48 находится I, или в положении 68 находится V, или в положении 77 находится S, или в положении 79 находится Т, или в положении 82 находится Е, или в положении 85 находится R, или в положении 87 находится R, или в положении 91 находится Т, или в положении 114 находится L, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, where position 11 is V, or position 20 is V, or position 37 is I, or position 38 is K, or at position 48 there is I, or at position 68 there is V, or at position 77 there is S, or at position 79 there is T, or at position 82 there is E, or at position 85 there is R, or at position 87 there is R, or position 91 is T, or position 114 is L, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
- 19 045980- 19 045980
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится V, или в положении 20 находится V, или в положении 37 находится V, или в положении 38 находится R, или в положении 48 находится I, или в положении 68 находится V, или в положении 77 находится S, или в положении 79 находится Т, или в положении 82 находится Е, или в положении 85 находится R, или в положении 87 находится R, или в положении 91 находится Т, или в положении 114 находится L, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In accordance with some embodiments of the invention, the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, where position 11 is V, or position 20 is V, or position 37 is V, or position 38 is R, or at position 48 there is I, or at position 68 there is V, or at position 77 there is S, or at position 79 there is T, or at position 82 there is E, or at position 85 there is R, or at position 87 there is R, or position 91 is T, or position 114 is L, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 48, где в положении 3 находится М, или в положении 10 находится F, или в положении 24 находится K, или в положении 34 находится V, или в положении 46 находится L, или в положении 60 находится D, или в положении 63 находится Т, или в положении 80 находится S, или в положении 85 находится D, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In accordance with some embodiments of the invention, the light chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, where position 3 is M, or position 10 is F, or position 24 is K, or position 34 is V, or position 46 is L, or position 60 is D, or position 63 is T, or position 80 is S, or position 85 is D, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 48, где в положении 3 находится Q, или в положении 10 находится S, или в положении 24 находится K, или в положении 34 находится V, или в положении 46 находится L, или в положении 60 находится D, или в положении 63 находится S, или в положении 80 находится Р, или в положении 85 находится D, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the light chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, where position 3 is Q, or position 10 is S, or position 24 is K, or position 34 is V, or position 46 is L, or position 60 is D, or position 63 is S, or position 80 is P, or position 85 is D, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 48, где в положении 3 находится Q, или в положении 10 находится S, или в положении 24 находится R, или в положении 34 находится V, или в положении 46 находится L, или в положении 60 находится S, или в положении 63 находится S, или в положении 80 находится Р, или в положении 85 находится Т, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the light chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, where position 3 is Q, or position 10 is S, or position 24 is R, or position 34 is V, or position 46 is L, or position 60 is S, or position 63 is S, or position 80 is P, or position 85 is T, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 48, где в положении 3 находится Q, или в положении 10 находится S, или в положении 24 находится R, или в положении 34 находится А, или в положении 46 находится L, или в положении 60 находится S, или в положении 63 находится S, или в положении 80 находится Р, или в положении 85 находится Т, или любую их комбинацию. Каждая возможность представляет собой отдельный вариант осуществления изобретения.In some embodiments, the light chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, where position 3 is Q, or position 10 is S, or position 24 is R, or position 34 is A, or position 46 is L, or position 60 is S, or position 63 is S, or position 80 is P, or position 85 is T, or any combination thereof. Each possibility represents a separate embodiment of the invention.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи, причем тяжелая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 47, где в положении 11 находится V, или в положении 20 находится V, или в положении 37 находится V, или в положении 38 находится R, или в положении 48 находится I, или в положении 68 находится V, или в положении 77 находится S, или в положении 79 находится Т, или в положении 82 находится E, или в положении 85 находится R, или в положении 87 находится R, или в положении 91 находится Т, или в положении 114 находится L, или любую их комбинацию; а легкая цепь содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 48, где в положении 3 находится Q, или в положении 10 находится S, или в положении 24 находится K, или в положении 34 находится V, или в положении 46 находится L, или в положении 60 находится D, или в положении 63 находится S, или в положении 80 находится Р, или в положении 85 находится D, или любую их комбинацию.In some embodiments, the humanized antibody or antigen binding fragment thereof comprises a heavy chain variable region and a light chain variable region, wherein the heavy chain comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47 where position 11 is V, or position 20 there is V, or at position 37 there is V, or at position 38 there is R, or at position 48 there is I, or at position 68 there is V, or at position 77 there is S, or at position 79 there is T, or at position 82 there is E, or position 85 is R, or position 87 is R, or position 91 is T, or position 114 is L, or any combination thereof; and the light chain contains the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, where position 3 is Q, or position 10 is S, or position 24 is K, or position 34 is V, or position 46 is L, or position 60 is D, or position 63 is S, or position 80 is P, or position 85 is D, or any combination thereof.
В соответствии с дополнительными вариантами осуществления изобретения, последовательность CDR1 тяжелой цепи представляет собой GYTFSNYWIE (SEQ ID NO: 58).In accordance with additional embodiments of the invention, the heavy chain CDR1 sequence is GYTFSNYWIE (SEQ ID NO: 58).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, человеческие константные области антитела выбирают из группы, состоящей из человеческого IgG1, человеческого IgG2, человеческого IgG3 и человеческого IgG4.In accordance with some embodiments of the invention, the human constant regions of the antibody are selected from the group consisting of human IgG1, human IgG2, human IgG3, and human IgG4.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления изобретения, константные области антитела человека выбирают из группы, состоящей из человеческого IgG1 и человеческого IgG4.In accordance with some embodiments of the invention, the human antibody constant regions are selected from the group consisting of human IgG1 and human IgG4.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело представляет собой антитело IgG4, содержащее последовательности тяжелой цепи, представленные в SEQ ID NO: 49, или последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную ей. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело представляет собой IgG1, содержащее последовательность тяжелой цепи, представленную в SEQ ID NO: 50, или последовательность, по меньшей мере на 90% идентичную ей.In some embodiments, the humanized antibody is an IgG4 antibody comprising the heavy chain sequences set forth in SEQ ID NO: 49 or a sequence that is at least 90% identical thereto. In some embodiments, the humanized antibody is an IgG1 comprising the heavy chain sequence set forth in SEQ ID NO: 50 or a sequence at least 90% identical thereto.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, гуманизированное антитело, содержит последовательность легкой цепи, представленную в SEQ ID NO: 49.In some embodiments, the humanized antibody comprises the light chain sequence set forth in SEQ ID NO: 49.
- 20 045980- 20 045980
Терапевтические методыTherapeutic methods
В некоторых вариантах осуществления изобретения, раскрытых в настоящем документе, представлены анти-hPVR антитела, применимые для лечения рака или опухоли. Лечение относится к способу, направленному на улучшение или облегчение состояния, подлежащего лечению. В отношении рака лечение включает, но не ограничивается следующими: уменьшение объема опухоли, уменьшение роста объема опухоли, увеличение выживаемости без прогрессирования заболевания или общей продолжительности жизни. В некоторых вариантах осуществления изобретения лечение будет влиять на ремиссию подлежащего лечению рака. В некоторых вариантах осуществления изобретения лечение включает применение как профилактической или поддерживающей дозы, предназначенной для предотвращения рецидива или прогрессирования ранее леченого рака или опухоли. Специалистам в данной области техники ясно, что не все индивидуумы будут одинаково отвечать или не отвечать на проводимое лечение, тем не менее эти индивидуумы считаются подвергнутыми лечению.In some embodiments of the invention disclosed herein, anti-hPVR antibodies useful for treating cancer or tumor are provided. Treatment refers to a method aimed at improving or alleviating the condition being treated. For cancer, treatment includes, but is not limited to: reducing tumor volume, reducing tumor growth, increasing progression-free survival or overall life expectancy. In some embodiments, the treatment will affect remission of the cancer being treated. In some embodiments, treatment includes administration of a prophylactic or maintenance dose designed to prevent recurrence or progression of a previously treated cancer or tumor. Those skilled in the art will appreciate that not all individuals will respond or fail to respond equally to treatment, but those individuals will nonetheless be considered to have received treatment.
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитела и антигенсвязывающие фрагменты, описанные в настоящем документе, предназначены для применения в производстве лекарственного средства или для применения в способе лечения PVR-положительного рака.In some embodiments, the anti-hPVR antibodies and antigen binding fragments described herein are for use in the manufacture of a medicament or for use in a method of treating PVR-positive cancer.
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитело или его антигенсвязывающие фрагменты, описанные в настоящем документе, предназначены для лечения рака или опухоли, которые не поддаются лечению ингибитором контрольной точки в качестве монотерапии. Рефрактерный рак - это рак/опухоль, при которой развивается прогрессирующее заболевание, несмотря на лечение одним ингибитором контрольной точки. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор контрольной точки представляет собой ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-1 (CD279), включая пембролизумаб, ниволумаб, АМР-514, спартализумаб, тислелизумаб (BGB-A317) или их PD-1(CD279)-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 представляет собой слитый белок PD-L2-Fc (например, AMP-224). В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 содержит антитело или PD-L1-связывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-L1 (CD274). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-L1 (CD274), включает дурвалумаб (MEDI 4376), атезолизумаб, авелумаб, BMS-936559 или FAZ053, или их PDL1(CD274)-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD1, PD-L1 или PD-L2 содержит антитело или его связывающий PD-L2 фрагмент, который специфически связывается с PD-L2 (CD273). В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PDL1 или PD-L2 содержит один или более низкомолекулярных ингибиторов, таких как Н-{2-[({2-метокси6-[(2-метил[1,1'-бифенил]-3-ил)метокси]пиридин-3-ил}метил)амино]этил}ацетамид (BMS202); (2-((3цианобензил)окси)-4-((3 -(2,3-дигидро-бензо [b] [ 1,4]диоксин-6-ил)-2-метилбензил)окси)-5 -метилбензил)D-серина гидрохлорид; (2R,4R)-1 -(5-хлор-2-((3 -цианобензил)окси)-4-((3 -(2,3дигидробензо[Ъ][1,4]диоксин-6-ил)-2-метилбензил)окси)бензил)-4-гидрокси-пирролидин-2-карбоновая кислота; 3-(4,6-дихлор-1,3,5-триазин-2-ил)-1-фенилиндол; 3-(4,6-дихлор-1,3,5-триазин-2-ил)-1-фенил-1Ниндол; L-a-глутамин; №^6-бис(Ь-серил-Е-аспарагинил-Е-треонил-Е-серил-Е-а-глутамил-Е-серил-Ефенилаланил)-Е-лизил-Е-фенилаланил-Е-аргинил-Е-валил-Е-треонил-Е-глутаминил-Е-лейцил-Е-аланилЬ-пролил-Е-лизил-Е-аланил-Е-глутаминил-Е-изолейцил-Ь-лизил; (2S)-1-[[2,6-диметокси-4-[(2-метил[1,1'бифенил]-3-ил)метокси]фенил]метил]-2-пиперидинкарбоновая кислота; глицинамид; N-(2меркаптоацетил)-Е-фенилаланил-№метил-Е-аланил-Е-аспарагинил-Е-пролил-Е-гистидил-Е-лейцил-№ метилглицил-Е-триптофил-Е-серил-Е-триптофил-№метил-Е-норлейцил-№метил-Е-норлейцил-Еаргинил-Ь-цистеинил-циклический (1 ^ 14)-тиоэфир; или их производное или аналог.In some embodiments, an anti-hPVR antibody or antigen-binding fragments thereof described herein are intended to treat a cancer or tumor that is refractory to treatment with a checkpoint inhibitor as monotherapy. Refractory cancer is a cancer/tumor that develops progressive disease despite treatment with a single checkpoint inhibitor. In some embodiments, the checkpoint inhibitor is a PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor. In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor is an antibody or antigen binding fragment that specifically binds to PD-1 (CD279), including pembrolizumab, nivolumab, AMP-514, spartalizumab, tislelizumab (BGB- A317) or their PD-1(CD279)-binding fragment. In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor is a PD-L2-Fc fusion protein (eg, AMP-224). In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor comprises an antibody or PD-L1 binding fragment that specifically binds to PD-L1 (CD274). In some embodiments, an antibody or antigen-binding fragment that specifically binds to PD-L1 (CD274) includes durvalumab (MEDI 4376), atezolizumab, avelumab, BMS-936559, or FAZ053, or a PDL1(CD274)-binding fragment thereof. In some embodiments, a PD1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor comprises an antibody or PD-L2 binding fragment thereof that specifically binds PD-L2 (CD273). In some embodiments, the PD-1, PDL1, or PD-L2 inhibitor comprises one or more small molecule inhibitors, such as H-{2-[({2-methoxy6-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]- 3-yl)methoxy]pyridin-3-yl}methyl)amino]ethyl}acetamide (BMS202); (2-((3cyanobenzyl)oxy)-4-((3 -(2,3-dihydro-benzo[b][1,4]dioxin-6-yl)-2-methylbenzyl)oxy)-5-methylbenzyl) D-serine hydrochloride; (2R,4R)-1 -(5-chloro-2-((3-cyanobenzyl)oxy)-4-((3 -(2,3dihydrobenzo[b][1,4]dioxin-6-yl)-2 -methylbenzyl)oxy)benzyl)-4-hydroxy-pyrrolidine-2-carboxylic acid; 3-(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)-1-phenylindole; 3-(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)-1-phenyl-1Nindol; L-a-glutamine; N^6-bis(L-seryl-E-asparaginyl-E-threonyl-E-seryl-E-a-glutamyl-E-seryl-Ephenylalanyl)-E-lysyl-E-phenylalanyl-E-arginyl-E-valyl -E-threonyl-E-glutaminyl-E-leucyl-E-alanyl-prolyl-E-lysyl-E-alanyl-E-glutaminyl-E-isoleucyl-L-lysyl; (2S)-1-[[2,6-dimethoxy-4-[(2-methyl[1,1'biphenyl]-3-yl)methoxy]phenyl]methyl]-2-piperidinecarboxylic acid; glycinamide; N-(2mercaptoacetyl)-E-phenylalanyl-Nmethyl-E-alanyl-E-asparaginyl-E-prolyl-E-histidyl-E-leucyl-N methylglycyl-E-tryptophil-E-seryl-E-tryptophil-Nmethyl -E-norleucyl-Nmethyl-E-norleucyl-Earginyl-L-cysteinyl-cyclic (1 ^ 14)-thioether; or their derivative or analogue.
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитело или его антигенсвязывающие фрагменты предназначены для применения в комбинации с ингибитором PD-1, PD-L1 или PDL2. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-1 (CD279), включая пембролизумаб, ниволумаб, АМР-514, спартализумаб, тислелизумаб (BGB-A317), или их PD1(CD279)-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 представляет собой слитый белок PD-L2-Fc (например, AMP-224). В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 содержит антитело или PD-L1связывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-L1 (CD274). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело или антигенсвязывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-L1 (CD274), включает дурвалумаб (MEDI4376), атезолизумаб, авелумаб, BMS-936559 или FAZ053, или их PD-L1 (CD274)-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 содержит антитело или его PD-L2-связывающий фрагмент, который специфически связывается с PD-L2 (CD273). В некоторых вариантах осуществления изобретения ингибитор PD-1, PD-L1 или PD-L2 содержит один или более низкомолекулярных ингибиторов, таких какIn some embodiments, an anti-hPVR antibody or antigen binding fragments thereof are provided for use in combination with a PD-1, PD-L1, or PDL2 inhibitor. In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor is an antibody or antigen binding fragment that specifically binds to PD-1 (CD279), including pembrolizumab, nivolumab, AMP-514, spartalizumab, tislelizumab (BGB- A317), or their PD1(CD279)-binding fragment. In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor is a PD-L2-Fc fusion protein (eg, AMP-224). In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor comprises an antibody or PD-L1 binding fragment that specifically binds to PD-L1 (CD274). In some embodiments, an antibody or antigen binding fragment that specifically binds to PD-L1 (CD274) includes durvalumab (MEDI4376), atezolizumab, avelumab, BMS-936559 or FAZ053, or a PD-L1 (CD274) binding fragment thereof. In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor comprises an antibody or PD-L2-binding fragment thereof that specifically binds PD-L2 (CD273). In some embodiments, the PD-1, PD-L1, or PD-L2 inhibitor comprises one or more small molecule inhibitors, such as
- 21 045980- 21 045980
Ж{2-[({2-метокси-6-[(2-метил[1,Г-бифенил]-3-ил)метокси]пиридин-3-ил}метил)амино]этил}ацетамид (BMS 202); (2-((3-цианобензил)окси)-4-((3-(2,3-дигидробензо[Ь][1,4]диоксин-6-ил)-2-метилбензил)окси)5-метилбензил)-О-серина гидрохлорид; (2R,4R)-1-(5-хлор-2-((3-цианобензил)окси)-4-((3-(2,3дигидробензо[Ь][1,4]диоксин-6-ил)-2-метилбензил)окси)бензил)-4-гидроксипирролидин-2-карбоновая кислота; 3-(4,6-дихлор-1,3,5-триазин-2-ил)-1-фенилиндол; 3-(4,6-дихлор-1,3,5-триазин-2-ил)-1-фенил-1Ниндол; L-a-глутамин; Ж.Ж>-бис(Г-серил-Г-аспарагинил-Г-треонил-Г-серил-Г-а-глутамил-Г-серил-Гфенилаланил)-Г-лизил-Г-фенилаланил-Г-аргинил-Г-валил-Г-треонил-Г-глутаминил-Г-лейцил-Г-аланилГ-пролил-Г-лизил-Г-аланил-Г-глутаминил-Г-изолейцил-Г-лизил; (2S)-1-[[2,6-диметокси-4-[(2-метил[1,1'бифенил]-3-ил)метокси]фенил]метил]-2-пиперидинкарбоновая кислота; глицинамид, N-(2меркаптоацетил)-Г-фенилаланил-Жметил-Г-аланил-Г-аспарагинил-Г-пролил-Г-гистидил-Г-лейцил-Ж метилглицил-Г-триптофил-Г-серил-Г-триптофил-Жметил-Г-норлейцил-Жметил-Г-норлейцил-Гаргинил-Г-цистеинил-циклический (1 ^ 14)-тиоэфир; или их производное или аналог.F{2-[({2-methoxy-6-[(2-methyl[1,G-biphenyl]-3-yl)methoxy]pyridin-3-yl}methyl)amino]ethyl}acetamide (BMS 202); (2-((3-cyanobenzyl)oxy)-4-((3-(2,3-dihydrobenzo[b][1,4]dioxin-6-yl)-2-methylbenzyl)oxy)5-methylbenzyl)- O-serine hydrochloride; (2R,4R)-1-(5-chloro-2-((3-cyanobenzyl)oxy)-4-((3-(2,3dihydrobenzo[b][1,4]dioxin-6-yl)-2 -methylbenzyl)oxy)benzyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxylic acid; 3-(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)-1-phenylindole; 3-(4,6-dichloro-1,3,5-triazin-2-yl)-1-phenyl-1Nindol; L-a-glutamine; J.J>-bis(G-seryl-G-asparaginyl-G-threonyl-G-seryl-G-a-glutamyl-G-seryl-Gphenylalanil)-G-lysyl-G-phenylalanyl-G-arginyl-G- valyl-G-threonyl-G-glutaminyl-G-leucyl-G-alanylG-prolyl-G-lysyl-G-alanyl-G-glutaminyl-G-isoleucyl-G-lysyl; (2S)-1-[[2,6-dimethoxy-4-[(2-methyl[1,1'biphenyl]-3-yl)methoxy]phenyl]methyl]-2-piperidinecarboxylic acid; glycinamide, N-(2mercaptoacetyl)-G-phenylalanyl-Gmethyl-G-alanyl-G-asparaginyl-G-prolyl-G-histidyl-G-leucyl-G methylglycyl-G-tryptophil-G-seryl-G-tryptophil-Gmethyl -G-norleucyl-Gmethyl-G-norleucyl-Garginyl-G-cysteinyl-cyclic (1^14)-thioether; or their derivative or analogue.
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитело или его антигенсвязывающие фрагменты предназначены для применения в комбинации с ингибитором EGFR или антителом, связывающим EGFR.In some embodiments, an anti-hPVR antibody or antigen binding fragments thereof are provided for use in combination with an EGFR inhibitor or an EGFR binding antibody.
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-hPVR антитела или их антигенсвязывающие фрагменты предназначены для лечения рака или опухоли. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак или опухоль представляет собой солидный рак или опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак или опухоль представляет собой гематологический рак или опухоль. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак или опухоль включает рак молочной железы, сердца, легкого, тонкого кишечника, толстой кишки, селезенки, почки, мочевого пузыря, головы, шеи, яичника, предстательной железы, головного мозга, поджелудочной железы, кожи, кости, костного мозга, крови, тимуса, матки, яичек и/или печени. В некоторых вариантах осуществления изобретения опухоли, которые можно лечить антителами по изобретению, включают аденому, аденокарциному, ангиосаркому, астроцитому, эпителиальную карциному, герминому, глиобластому, глиому, гемангиоэндотелиому, гемангиосаркому, гематому, гепатобластому, лейкемию, лимфому, медуллобластому, меланому, нейробластому, остеосаркому, ретинобластому, рабдомиосаркому, саркому и/или тератому. В некоторых вариантах осуществления изобретения опухоль/рак выбирают из группы, включающей акральную лентигинозную меланому, актинический кератоз, аденокарциному, аденоидно-кистозную карциному, аденому, аденосаркому, аденосквамозную карциному, астроцитарные опухоли, карциному бартолиновой железы, базальноклеточную карциному, карциному бронхиальной железы, капиллярную карциному, карциному, карциносаркому, холангиокарциному, хондросаркому, цистаденому, опухоль эндодермального синуса, гиперплазию эндометрия, стромальную саркому эндометрия, эндометриоидную аденокарциному, эпендимальную саркому, саркому Свинга, очаговую узловую гиперплазию, гастроному, опухоли зародышевой линии, глиобластому, глюкагоному, гемангиобластому, гемангиоэндотелиому, гемангиому, аденому печени, аденоматоз печени, гепатоцеллюлярную карциному, инсулинит, интраэпителиальную неоплазию, внутриэпителиальную плоскоклеточную неоплазию, инвазивную плоскоклеточную карциному, крупноклеточную карциному, липосаркому, карциному легких, лимфобластный лейкоз, лимфоцитарный лейкоз, лейомиосаркому, меланому, злокачественную меланому, злокачественную мезотелиальная опухоль, опухоль оболочки нерва, медуллобластому, медуллоэпителиому, мезотелиому, мукоэпидермоидную карциному, миелоидный лейкоз, нейробластому, нейроэпителиальную аденокарциному, узловую меланому, остеосаркому, рак яичников, папиллярную серозную аденокарциному, опухоли гипофиза, плазмоцитому, псевдосаркому, бластную карциному простаты, почечно-клеточный рак, ретинобластому, рабдомиосаркому, саркому, серозную карциному, плоскоклеточный рак, мелкоклеточный рак, рак мягких тканей, соматостатин-секретирующую опухоль, эпидермоидный рак, недифференцированную карциному, увеальную меланому, веррукозный рак, рак влагалища/вульвы, ВИПпому и опухоль Вильмса. В некоторых вариантах осуществления изобретения опухоль/рак, подлежащие лечению одним или более антителами по изобретению, включают рак головного мозга, рак головы и шеи, колоректальную карциному, острый миелоидный лейкоз, острый пре-В-клеточный лимфобластный лейкоз, рак мочевого пузыря, астроцитому, предпочтительно астроцитому II, III или IV степени, глиобластому, мультиформную глиобластому, мелкоклеточный рак и немелкоклеточный рак, предпочтительно немелкоклеточный рак легкого, аденокарциному легкого, метастатическую меланому, андроген-независимый метастатический рак предстательной железы, андроген-зависимый метастатический рак предстательной железы, аденокарциному предстательной железы и рак молочной железы, предпочтительно рак протоков молочной железы и/или карциному молочной железы. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат антителами по настоящему изобретению, включает глиобластому. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат одним или более антителами по настоящему изобретению, включает рак поджелудочной железы. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат одним или более антителами по настоящему изобретению, включает рак яичников. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат одним или более антителами по настоящему изобретению, включает рак легкого. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак,In some embodiments, anti-hPVR antibodies or antigen binding fragments thereof are for the treatment of cancer or tumor. In some embodiments, the cancer or tumor is a solid cancer or tumor. In some embodiments, the cancer or tumor is a hematologic cancer or tumor. In some embodiments, the cancer or tumor includes cancer of the breast, heart, lung, small intestine, colon, spleen, kidney, bladder, head, neck, ovary, prostate, brain, pancreas, skin, bone, bone brain, blood, thymus, uterus, testicles and/or liver. In some embodiments, tumors that can be treated with antibodies of the invention include adenoma, adenocarcinoma, angiosarcoma, astrocytoma, epithelial carcinoma, germinoma, glioblastoma, glioma, hemangioendothelioma, hemangiosarcoma, hematoma, hepatoblastoma, leukemia, lymphoma, medulloblastoma, melanoma, neuroblastoma, osteosarcoma, retinoblastoma, rhabdomyosarcoma, sarcoma and/or teratoma. In some embodiments, the tumor/cancer is selected from the group consisting of acral lentiginous melanoma, actinic keratosis, adenocarcinoma, adenoid cystic carcinoma, adenoma, adenosarcoma, adenosquamous carcinoma, astrocytic tumors, Bartholin's gland carcinoma, basal cell carcinoma, bronchial gland carcinoma, capillary carcinoma , carcinoma, carcinosarcoma, cholangiocarcinoma, chondrosarcoma, cystadenoma, endodermal sinus tumor, endometrial hyperplasia, endometrial stromal sarcoma, endometrioid adenocarcinoma, ependymal sarcoma, Swing's sarcoma, focal nodular hyperplasia, gastronoma, germline tumors, glioblastoma, glucagonoma, hemangioblastoma stoma, hemangioendothelioma, hemangioma , hepatic adenoma, hepatic adenomatosis, hepatocellular carcinoma, insulinitis, intraepithelial neoplasia, intraepithelial squamous neoplasia, invasive squamous cell carcinoma, large cell carcinoma, liposarcoma, lung carcinoma, lymphoblastic leukemia, lymphocytic leukemia, leiomyosarcoma, melanoma, malignant melanoma, malignant mesothelial tumor, membrane tumor nerve, medulloblastoma, medulloepithelioma, mesothelioma, mucoepidermoid carcinoma, myeloid leukemia, neuroblastoma, neuroepithelial adenocarcinoma, nodular melanoma, osteosarcoma, ovarian cancer, papillary serous adenocarcinoma, pituitary tumors, plasmacytoma, pseudosarcoma, blastic carcinoma of the prostate, renal cell carcinoma, re tinoblastoma, rhabdomyosarcoma , sarcoma, serous carcinoma, squamous cell carcinoma, small cell carcinoma, soft tissue cancer, somatostatin-secreting tumor, epidermoid carcinoma, undifferentiated carcinoma, uveal melanoma, verrucous carcinoma, vaginal/vulvar cancer, VIPPoma and Wilms tumor. In some embodiments, the tumor/cancer treatable with one or more antibodies of the invention includes brain cancer, head and neck cancer, colorectal carcinoma, acute myeloid leukemia, pre-B cell acute lymphoblastic leukemia, bladder cancer, astrocytoma, preferably grade II, III or IV astrocytoma, glioblastoma, glioblastoma multiforme, small cell cancer and non-small cell cancer, preferably non-small cell lung cancer, lung adenocarcinoma, metastatic melanoma, androgen-independent metastatic prostate cancer, androgen-dependent metastatic prostate cancer, prostate adenocarcinoma and breast cancer, preferably ductal breast cancer and/or breast carcinoma. In some embodiments, the cancer that is treated with the antibodies of the present invention includes glioblastoma. In some embodiments, the cancer that is treated with one or more antibodies of the present invention includes pancreatic cancer. In some embodiments, the cancer that is treated with one or more antibodies of the present invention includes ovarian cancer. In some embodiments, the cancer that is treated with one or more antibodies of the present invention includes lung cancer. In some embodiments of the invention, cancer,
- 22 045980 который лечат одним или более антителами по настоящему изобретению, включает рак предстательной железы. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат одним или более антителами по настоящему изобретению, включает рак толстой кишки. В некоторых вариантах осуществления изобретения рак, который лечат, включает глиобластому, рак поджелудочной железы, рак яичников, рак толстой кишки, рак предстательной железы или рак легких. В определенном варианте осуществления изобретения рак не поддается другому лечению. В определенном варианте осуществления изобретения рак, подвергающийся лечению, является рецидивирующим. В определенном варианте осуществления изобретения рак представляет собой рецидивирующую/рефрактерную глиобластому, рак поджелудочной железы, рак яичников, рак толстой кишки, рак предстательной железы или рак легких.- 22 045980 which is treated with one or more antibodies of the present invention includes prostate cancer. In some embodiments, the cancer that is treated with one or more antibodies of the present invention includes colon cancer. In some embodiments, the cancer being treated includes glioblastoma, pancreatic cancer, ovarian cancer, colon cancer, prostate cancer, or lung cancer. In a certain embodiment of the invention, the cancer is not responsive to other treatment. In a certain embodiment of the invention, the cancer being treated is recurrent. In a certain embodiment, the cancer is relapsed/refractory glioblastoma, pancreatic cancer, ovarian cancer, colon cancer, prostate cancer, or lung cancer.
Для специалистов в данной области будет очевидно, что терапевтически эффективное количество молекулы по настоящему изобретению будет зависеть, среди прочего, от схемы введения, стандартной дозы вводимой молекулы, от того, вводится ли молекула в комбинации с другими терапевтическими агентами, иммунного статуса и здоровья пациента, терапевтической активности вводимой молекулы, ее устойчивости в кровообращении и мнения лечащего врача.It will be apparent to those skilled in the art that the therapeutically effective amount of a molecule of the present invention will depend on, among other things, the schedule of administration, the unit dosage of the molecule administered, whether the molecule is administered in combination with other therapeutic agents, the immune status and health of the patient, the therapeutic activity of the administered molecule, its stability in the blood circulation and the opinion of the attending physician.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела можно вводить нуждающемуся в этом субъекту любым путем, подходящим для введения фармацевтических композиций, содержащих антитела, например, подкожным, внутрибрюшинным, внутривенным, внутримышечным, внутриопухолевым или внутримозговым и т.д. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела вводят внутривенно. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела вводят подкожно. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела вводят внутриопухолевым путем. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела вводят по подходящей схеме дозирования, например, еженедельно, два раза в неделю, ежемесячно, два раза в месяц, один раз каждые две недели, один раз каждые три недели или один раз в месяц и т.п. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела вводят один раз в три недели. Антитела могут вводиться в любом терапевтически эффективном количестве. В некоторых вариантах осуществления изобретения терапевтически приемлемое количество находится в интервале от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления изобретения терапевтически приемлемое количество находится в интервале от приблизительно 1 мг/кг до приблизительно 40 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления изобретения терапевтически приемлемое количество находится в интервале от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 30 мг/кг. Терапевтически эффективные количества включают количества, достаточные для облегчения одного или более симптомов, связанных с заболеванием или недугом, подлежащим лечению.In some embodiments, antibodies can be administered to a subject in need thereof by any route suitable for administering pharmaceutical compositions containing antibodies, such as subcutaneous, intraperitoneal, intravenous, intramuscular, intratumoral, or intracerebral, etc. In some embodiments, the antibodies are administered intravenously. In some embodiments, the antibodies are administered subcutaneously. In some embodiments, the antibodies are administered intratumorally. In some embodiments, the antibodies are administered at a suitable dosage schedule, for example, weekly, twice weekly, monthly, twice monthly, once every two weeks, once every three weeks, or once a month, and the like. In some embodiments, the antibodies are administered once every three weeks. Antibodies can be administered in any therapeutically effective amount. In some embodiments, the therapeutically acceptable amount is in the range of from about 0.1 mg/kg to about 50 mg/kg. In some embodiments, the therapeutically acceptable amount is in the range of from about 1 mg/kg to about 40 mg/kg. In some embodiments, the therapeutically acceptable amount is in the range of from about 5 mg/kg to about 30 mg/kg. Therapeutically effective amounts include amounts sufficient to relieve one or more symptoms associated with the disease or illness being treated.
Антитела по настоящему изобретению можно применять в основанной на CAR адоптивной иммунотерапии, в которой для лечения рака используются сконструированные лимфоциты, содержащие CAR. Система CAR-T описана здесь в качестве неограничивающего примера.The antibodies of the present invention can be used in CAR-based adoptive immunotherapy, which uses engineered lymphocytes containing CARs to treat cancer. The CAR-T system is described here as a non-limiting example.
В Т -клеточной терапии для лечения рака или опухолей используют химерный антигенный рецептор (CAR) (CAR-T-клеточная терапия). CAR-T-клеточная терапия это клеточная иммунотерапия, которая включает введение раковому пациенту генетически модифицированных Т-клеток, которые воздействуют на опухолевые клетки и вызывают апоптоз опухолевых клеток. Генетически сконструированные Тклетки получают путем экспрессии в Т-клетке CAR, содержащего вариабельные области антитела (VL и VH) в сочетании с внутриклеточным доменом, таким как фрагмент последовательности CD3ζ-цепи, с использованием метода переноса генов. CAR - это общий термин для химерного белка, в котором вариабельные области легкой и тяжелой цепей моноклонального антитела, специфичного к опухолевому антигену, связаны друг с другом и затем соединены с цепью Т-клеточного рецептора (TCR) со стороны Сконца.T cell therapy uses a chimeric antigen receptor (CAR) to treat cancer or tumors (CAR-T cell therapy). CAR-T cell therapy is a cellular immunotherapy that involves injecting a cancer patient with genetically modified T cells that target tumor cells and cause apoptosis of the tumor cells. Genetically engineered T cells are produced by expressing in a T cell a CAR containing the antibody variable regions (VL and VH) in combination with an intracellular domain, such as a fragment of the CD3ζ chain sequence, using a gene transfer method. CAR is a general term for a chimeric protein in which the variable regions of the light and heavy chains of a tumor antigen-specific monoclonal antibody are linked to each other and then linked to the T cell receptor (TCR) chain at the end.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит по меньшей мере один белковый домен, выбранный из группы, состоящей из CD8-домена Stalk-домена, CD28 ТМ-домена, 41ВВ-домена и CD3ζ-домена. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит CD8 Stalk-домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит CD28 ТМ-домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит сигнальный домен CD3Z. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит 41ВВ-домен. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит CD8 Stalk-домен, CD28 ТМдомен, 41ВВ-домен и CD3ζ-домен.In some embodiments, the CAR comprises at least one protein domain selected from the group consisting of a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3ζ domain. In some embodiments, the CAR contains a CD8 Stalk domain. In some embodiments, the CAR contains a CD28 TM domain. In some embodiments, the CAR contains a CD3Z signaling domain. In some embodiments, the CAR contains a 41BB domain. In some embodiments, the CAR comprises a CD8 Stalk domain, a CD28 TM domain, a 41BB domain, and a CD3ζ domain.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, предложен химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий вариабельную область тяжелой цепи (VH) и вариабельную область легкой цепи (VL) по изобретению. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, предложен генетически модифицированный лимфоцит, на поверхности которого экспрессируется CAR. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, предложена генетически модифицированная Т-клетка, на поверхности которой экспрессируется CAR (CAR-T-клетка).According to some embodiments of the invention, a chimeric antigen receptor (CAR) is provided comprising a heavy chain variable region (VH) and a light chain variable region (VL) of the invention. According to some embodiments of the invention, a genetically modified lymphocyte is provided that expresses a CAR on its surface. According to some embodiments of the invention, a genetically modified T cell is provided that expresses a CAR on its surface (CAR-T cell).
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит комбинацию вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, причем вариабельная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 92, 94, 96 или 98% идентична последоIn some embodiments, the CAR comprises a combination of heavy and light chain variable regions, wherein the heavy chain variable region comprises an amino acid sequence that is at least 90, 92, 94, 96, or 98% identical to the sequence.
- 23 045980 вательности выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6; а вариабельная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 90, 92, 94, 96 или 98% идентична последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.- 23 045980 selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6; and the light chain variable region contains an amino acid sequence that is at least 90, 92, 94, 96, or 98% identical to a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID nO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 и SEQ ID nO: 6, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 и SEQ ID NO: 9.In some embodiments, the CAR comprises a heavy chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID nO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID nO : 6, and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит комбинацию вариабельных областей тяжелой и легкой цепи гуманизированного антитела, где комбинация выбрана из группы, состоящей из:In some embodiments, the CAR comprises a combination of heavy and light chain variable regions of a humanized antibody, wherein the combination is selected from the group consisting of:
i) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 1, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;i) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 1 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9;
ii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 3, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;ii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 3 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9;
iii) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 4, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9;iii) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 4 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9;
iv) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 5, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9; иiv) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 5 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9; And
v) последовательности вариабельной области тяжелой цепи, представленной в SEQ ID NO: 6, и последовательности вариабельной области легкой цепи, представленной в SEQ ID NO: 9.v) the heavy chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 6 and the light chain variable region sequence shown in SEQ ID NO: 9.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 3, 4, 5 и 6, и последовательность вариабельной области легкой цепи SEQ ID NO: 9, трансмембранный домен и внутриклеточный Т-клеточный сигнальный домен.In some embodiments, the CAR comprises a heavy chain variable region sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1, 3, 4, 5 and 6, and a light chain variable region sequence SEQ ID NO: 9, transmembrane domain and intracellular T cell signaling domain.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, CAR содержит последовательность scFv, представленную в SEQ ID NO: 56 или SEQ ID NO: 57, или ее аналог, последовательность которого по меньшей мере на 90, 92, 94, 96 или 98% сходна с любой из указанных последовательностей. В соответствии с определенным аспектом настоящее изобретение относится к клетке, содержащей описанный здесь CAR. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, клетка экспрессирует или способна экспрессировать CAR по настоящему изобретению. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, клетка представляет собой лимфоцит. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, клетка выбрана из Т-клетки и клетки натурального киллера (NK).In some embodiments, the CAR comprises the scFv sequence set forth in SEQ ID NO: 56 or SEQ ID NO: 57, or an analogue thereof, that has at least 90%, 92%, 94%, 96%, or 98% sequence similarity to any of these sequences. In accordance with a certain aspect, the present invention relates to a cell containing a CAR described herein. In some embodiments, the cell expresses or is capable of expressing a CAR of the present invention. In some embodiments, the cell is a lymphocyte. In some embodiments, the cell is selected from a T cell and a natural killer (NK) cell.
Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, предложен лимфоцит, сконструированный для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе. Согласно некоторым вариантам осуществления изобретения, предложена Т-клетка, сконструированная для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе.According to some embodiments of the invention, a lymphocyte is provided that is engineered to express a CAR described herein. According to some embodiments of the invention, a T cell engineered to express a CAR described herein is provided.
В соответствии с дополнительными вариантами осуществления изобретения, предложена NKклетка, сконструированная для экспрессии CAR, описанного в настоящем документе.In accordance with additional embodiments of the invention, an NK cell engineered to express a CAR described herein is provided.
Настоящее изобретение также раскрывает способы диагностики и прогнозирования рака.The present invention also discloses methods for diagnosing and prognosticating cancer.
В соответствии с одним из аспектов настоящее изобретение относится к способу диагностики и/или прогнозирования рака или инфекционного заболевания у субъекта, включающему стадию определения уровня экспрессии PVR в биологическом образце указанного субъекта с использованием по меньшей мере одного описанного здесь антитела.In accordance with one aspect, the present invention provides a method for diagnosing and/or prognosticating cancer or an infectious disease in a subject, comprising the step of determining the level of PVR expression in a biological sample of the subject using at least one antibody described herein.
Фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, носители и разбавителиPharmaceutically acceptable excipients, carriers and diluents
В некоторых вариантах осуществления изобретения анти-PVR антитела согласно настоящему описанию включены в фармацевтическую композицию, содержащую один или более фармацевтически приемлемых эксципиентов, носителей и разбавителей. Носитель (носители) должен быть фармацевтически приемлемым в том смысле, что он должен быть совместимым с другими ингредиентами композиции и не оказывать чрезмерно вредного воздействия на реципиента. Активный агент предоставляется в количестве, эффективном для достижения желаемого фармакологического эффекта, как описано выше, и в количестве, подходящем для достижения желаемого воздействия.In some embodiments, the anti-PVR antibodies of the present disclosure are included in a pharmaceutical composition containing one or more pharmaceutically acceptable excipients, carriers, and diluents. The carrier(s) must be pharmaceutically acceptable in the sense that it must be compatible with the other ingredients of the composition and not be unduly harmful to the recipient. The active agent is provided in an amount effective to achieve the desired pharmacological effect as described above and in an amount suitable to achieve the desired effect.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела, согласно настоящему описанию, вводят в виде суспензии в стерильном растворе. В некоторых вариантах осуществления изобретения раствор содержит около 0,9% NaCl. В некоторых вариантах осуществления изобретения раствор содержит около 5,0% декстрозы. В некоторых вариантах осуществления изобретения раствор дополнительно содержит один или более буферов, например, ацетатный, цитратный, гистидиновый, сукцинатный, фосфатный, бикарбонатный и гидроксиметиламинометановый (трис); поверхностно-активные вещества, например, полисорбат 80 (Tween 80), полисорбат 20 (Tween 20) и полоксамер 188; полиол/дисахарид/полисахариды, например, глюкозу, декстрозу, маннозу, маннит, сорбит, сахарозу, трегалозу и декстран 40; аминокислоты, например, глицин или аргинин; антиоксиданты, например, аскорбиновую кислоту, метионин; илиIn some embodiments, antibodies as described herein are administered as a suspension in a sterile solution. In some embodiments, the solution contains about 0.9% NaCl. In some embodiments, the solution contains about 5.0% dextrose. In some embodiments, the solution further contains one or more buffers, for example, acetate, citrate, histidine, succinate, phosphate, bicarbonate and hydroxymethylaminomethane (Tris); surfactants, for example, polysorbate 80 (Tween 80), polysorbate 20 (Tween 20) and poloxamer 188; polyol/disaccharide/polysaccharides, for example glucose, dextrose, mannose, mannitol, sorbitol, sucrose, trehalose and dextran 40; amino acids, such as glycine or arginine; antioxidants, for example, ascorbic acid, methionine; or
- 24 045980 хелатирующие агенты, например, EDTA или EGTA.- 24 045980 chelating agents, for example EDTA or EGTA.
Как правило, антитела, их фрагменты и конъюгаты по настоящему изобретению, содержащие антигенсвязывающую часть антитела или содержащие другой полипептид, включая пептидомиметик, суспендируют в стерильном солевом растворе для терапевтического применения. Альтернативно, могут быть составлены фармацевтические композиции, обеспечивающие контролируемое высвобождение активного ингредиента (молекулы, содержащей антигенсвязывающую часть антитела) или пролонгирование его присутствия в организме пациента. Известны многочисленные подходящие системы доставки лекарств, которые включают, например, имплантируемые системы высвобождения лекарств, гидрогели, гидроксиметилцеллюлозу, микрокапсулы, липосомы, микроэмульсии, микросферы и т.п. Препараты с контролируемым высвобождением могут быть приготовлены с использованием полимеров для комплексообразования или адсорбции молекулы согласно настоящему изобретению. Например, биосовместимые полимеры включают матрицы из сополимера этилен-винилацетат и матрицы из полиангидридного сополимера димера стеариновой кислоты и себариновой кислоты. Скорость высвобождения из такой матрицы молекулы по настоящему изобретению, т.е. антитела или фрагмента антитела, зависит от молекулярной массы молекулы, количества молекулы в матрице и размера диспергированных частиц.Typically, the antibodies, fragments thereof, and conjugates of the present invention, comprising an antigen-binding moiety of the antibody or containing another polypeptide, including a peptidomimetic, are suspended in sterile saline for therapeutic use. Alternatively, pharmaceutical compositions can be formulated to provide controlled release of the active ingredient (the molecule containing the antigen-binding portion of the antibody) or prolong its presence in the patient's body. Numerous suitable drug delivery systems are known, which include, for example, implantable drug release systems, hydrogels, hydroxymethylcellulose, microcapsules, liposomes, microemulsions, microspheres, and the like. Controlled release formulations can be formulated using polymers to complex or adsorb the molecule of the present invention. For example, biocompatible polymers include ethylene-vinyl acetate copolymer matrices and polyanhydride copolymer stearic acid-sebaric acid dimer matrices. The rate of release of the molecule of the present invention from such a matrix, i.e. antibody or antibody fragment depends on the molecular weight of the molecule, the amount of the molecule in the matrix and the size of the dispersed particles.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела, согласно настоящему описанию, доставляются/хранятся в лиофилизированном виде и восстанавливаются перед введением. В некоторых вариантах осуществления изобретения лиофилизированные составы антител содержат наполнитель, такой как маннит, сорбит, сахароза, трегалоза, декстран 40 или их комбинации. Лиофилизированный состав может содержаться во флаконе из стекла или другого подходящего нереакционноспособного материала. Антитела в готовом виде, независимо от того, восстановлены они или нет, могут быть забуферены при определенном рН, обычно менее 7,0. В некоторых вариантах осуществления изобретения рН может составлять от 4,5 до 6,5, от 4,5 до 6,0, от 4,5 до 5,5, от 4,5 до 5,0 или от 5,0 до 6,0.In some embodiments, antibodies as described herein are delivered/stored in lyophilized form and reconstituted prior to administration. In some embodiments, lyophilized antibody formulations contain an excipient such as mannitol, sorbitol, sucrose, trehalose, dextran 40, or combinations thereof. The lyophilized formulation may be contained in a vial of glass or other suitable non-reactive material. As-formulated antibodies, whether reconstituted or unreconstituted, may be buffered at a specific pH, typically less than 7.0. In some embodiments, the pH may be from 4.5 to 6.5, from 4.5 to 6.0, from 4.5 to 5.5, from 4.5 to 5.0, or from 5.0 to 6 ,0.
В некоторых вариантах осуществления изобретения лимфоциты, несущие описанный здесь CAR, транспортируются/хранятся перед использованием. Клетки обычно криоконсервируют, если они не используются сразу же. Способы криоконсервации и среды для хранения, подходящие для клеток, несущих CAR, известны в данной области, см., например, Wang, et al. 2019 Мау;21(5):566-578. Также в настоящем документе описаны наборы, содержащие одно или более описанных в настоящем документе антител в подходящем контейнере и один или более дополнительных компонентов, выбранных из: инструкций по применению; разбавителя, наполнителя, носителя и устройства для введения. В некоторых вариантах осуществления изобретения набор содержит средства для измерения экспрессии человеческого PVR.In some embodiments, lymphocytes carrying a CAR described herein are transported/stored prior to use. Cells are usually cryopreserved if they are not used immediately. Cryopreservation methods and storage media suitable for CAR-bearing cells are known in the art, see, for example, Wang, et al. 2019 Mau;21(5):566-578. Also described herein are kits containing one or more antibodies described herein in a suitable container and one or more additional components selected from: instructions for use; diluent, excipient, carrier and administration device. In some embodiments, the kit contains means for measuring human PVR expression.
Некоторые варианты осуществления изобретения, описанные в настоящем документе, относятся к способу приготовления средства для лечения рака, включающему смешивание одного или более фармацевтически приемлемых наполнителей, носителей или разбавителей и антитела согласно настоящему описанию. Некоторые варианты осуществления изобретения, описанные в настоящем документе, относятся к способу подготовки средства для лечения рака к хранению или транспортировке, включающему лиофилизацию одного или более антител согласно настоящему описанию.Some embodiments of the invention described herein relate to a method of preparing an agent for treating cancer, comprising mixing one or more pharmaceutically acceptable excipients, carriers or diluents and an antibody as described herein. Some embodiments of the invention described herein relate to a method of preparing a cancer treatment agent for storage or transportation, comprising lyophilizing one or more antibodies as described herein.
ПримерыExamples
Следующие иллюстративные примеры представляют варианты осуществления композиций и способов, описанных в настоящем документе, и не должны рассматриваться, как каким-либо образом ограничивающие.The following illustrative examples represent embodiments of the compositions and methods described herein and should not be construed as limiting in any way.
Пример 1. Улучшенная аффинность связывания PVR вариантами N56E и N56D.Example 1: Improved PVR Binding Affinity by N56E and N56D Variants.
Вариабельная область химерного анти-PVR антитела 5В9, раскрытого в WO 2017149538, включает последовательность дезамидирования (аспарагин-глицин) в CDR2 легкой цепи (WASSRHNG, SEQ ID NO: 17). Семь химерных вариантов были получены путем введения точечной мутации в положение остатка аспарагина N56. Для оценки аффинности связывания вариантов с заменой N56 моноклональные антитела дикого типа (WT) и варианты с заменами IgG4 (S241P) иммобилизировали на захватывающем чипе белка А. Связывание тестировали для аналита PVR, конъюгированного с гистидиновой меткой (PVR-HIS, Sino Cat. No. 10109-H08H). Диапазон разведения: пять точек с двукратным разведением от 50 нМ до 3,125 нМ. Используемые условия: Инструмент: Biacore T200 (серийный номер 1909913) с программным обеспечением Biacore T200 Evaluation Software V2.0.1. Рабочий буфер: HBS-P+, 300 мМ NaCl, 1 мг/мл BSA. Скорость потока: 30 мкл /мин. Ассоциация: 350 с, диссоциация: 800 с. Восстановление: 10 мМ глицин, рН 1,5. Анализ: связывание 1:1. Относительную KD для каждого варианта с заменой устанавливали путем деления KD варианта с заменой на KD родительского варианта N56 (VH0VK0). Значительное (>25%) улучшение аффинности было отмечено для вариантов N56E (Asp) и N56D (Glu) (фиг. 1А). Связывание химерных вариантов с человеческим PVR, экспрессированным на клетках HEK293 EBNA, оценивали с помощью проточной цитометрии в конкурентном анализе с использованием родительского антитела 5В9 (WT, фиг. 1В).The variable region of the chimeric anti-PVR antibody 5B9 disclosed in WO 2017149538 includes a deamidation sequence (asparagine-glycine) in the light chain CDR2 (WASSRHNG, SEQ ID NO: 17). Seven chimeric variants were obtained by introducing a point mutation at the position of the asparagine residue N56. To assess the binding affinity of N56 substitution variants, wild-type (WT) and IgG4 substitution variant (S241P) monoclonal antibodies were immobilized on a Protein A capture chip. Binding was tested for the PVR analyte conjugated to a histidine tag (PVR-HIS, Sino Cat. No. 10109-H08H). Dilution range: five points with 2-fold dilution from 50 nM to 3.125 nM. Conditions used: Instrument: Biacore T200 (serial number 1909913) with Biacore T200 Evaluation Software V2.0.1. Working buffer: HBS-P+, 300 mM NaCl, 1 mg/ml BSA. Flow rate: 30 µl/min. Association: 350 s, dissociation: 800 s. Recovery: 10 mM glycine, pH 1.5. Analysis: 1:1 binding. The relative KD for each variant with substitution was established by dividing the KD of the variant with substitution by the KD of the parent variant N56 (VH0VK0). Significant (>25%) improvements in affinity were noted for the N56E (Asp) and N56D (Glu) variants (Fig. 1A). Binding of the chimeric variants to human PVR expressed on HEK293 EBNA cells was assessed by flow cytometry in a competition assay using the parental antibody 5B9 (WT, Fig. 1B).
Пример 2. Улучшенная перекрестная реактивность в отношении связывания обезьяньего PVR с вариантами N56E и N56D.Example 2: Improved cross-reactivity for simian PVR binding to N56E and N56D variants.
Исследовали связывание вариантов антител с заменой N56 с клетками, связывающими PVR человека (protein id: Q92692Q92692) и хлороцебуса (африканская зеленая мартышка, protein id: UniProtKBWe studied the binding of antibody variants with the N56 substitution to cells that bind human PVR (protein id: Q92692Q92692) and chlorocebus (African green monkey, protein id: UniProtKB
- 25 045980- 25 045980
Р32506). На фиг. 2А показано относительное связывание всех вариантов, добавленных в насыщающей концентрации (10 мкг/мл), к клеткам NCI-H1975, экспрессирующим человеческий PVR. На фиг. 2В показано относительное связывание всех вариантов, добавленных в насыщающей концентрации (10 мкг/мл) к клеткам Vero, экспрессирующим PVR хлороцебуса. Для детекции использовали козье анти-человеческое антитело 647 (иммунологическое исследование Джексона 109-606-088) в разведении 1:250. Связывание клеток с антителами анализировали с помощью FACS. Изменение кратности рассчитывали путем деления MFI каждого варианта на MFI родительского антитела (K0). Значительное (>25%) увеличение перекрестной реактивности наблюдали для вариантов N56E и N56D.P32506). In fig. 2A shows the relative binding of all variants added at saturating concentration (10 μg/ml) to NCI-H1975 cells expressing human PVR. In fig. 2B shows the relative binding of all variants added at saturating concentration (10 μg/ml) to Vero cells expressing Chlorocebus PVR. For detection, goat anti-human antibody 647 (Jackson immunoassay 109-606-088) was used at a dilution of 1:250. Antibody binding of cells was analyzed by FACS. The fold change was calculated by dividing the MFI of each variant by the MFI of the parent antibody (K0). A significant (>25%) increase in cross-reactivity was observed for the N56E and N56D variants.
Пример 3. Улучшение активации NK-клеток вариантами N56E и N56T.Example 3: Improvement of NK cell activation by N56E and N56T variants.
NK-клетки от здоровых доноров инкубировали в присутствии выбранных вариантов с заменой N56 и целевой клеточной линии рака молочной железы (MDA-MB-231) при соотношении Е:Т (эффектор : мишень) 2:1 в течение 2 ч при 37°С. Активацию NK-клеток измеряли по индукции поверхностной экспрессии CD107а, и для каждого варианта рассчитывали кратность изменения по сравнению с контрольным IgG (ось Y). Все моноклональные антитела использовали в концентрации 600 пМ (0,09 мкг/мл). (*р<0,04, **р<0,01 по двустороннему t -критерию Стьюдента). Как показано на фиг. 3, варианты N56E и N56T показали улучшенную активацию NK-клеток по сравнению с K0, о чем свидетельствует повышенная экспрессия CD107а.NK cells from healthy donors were incubated in the presence of selected N56 substitution variants and the target breast cancer cell line (MDA-MB-231) at an E:T (effector:target) ratio of 2:1 for 2 h at 37°C. NK cell activation was measured by induction of CD107a surface expression, and the fold change relative to control IgG was calculated for each variant (y-axis). All monoclonal antibodies were used at a concentration of 600 pM (0.09 μg/ml). (*p<0.04, **p<0.01 by two-sided Student's t -test). As shown in FIG. 3, N56E and N56T variants showed improved NK cell activation compared to K0, as evidenced by increased CD107a expression.
Пример 4. Улучшенная пролиферация CD8 Т-клеток с помощью вариантов N56E и N56T.Example 4: Enhanced CD8 T Cell Proliferation by N56E and N56T Variants.
Человеческие РВМС метили флуоресцентной меткой CFSE (C34554 ThermoFischer) и инкубировали с целевыми клетками рака молочной железы А549 в присутствии 2,5 мкл/мл PHA-L (Roche) и указанными вариантами антител в концентрации 4 мкг/мл. После инкубации в течение 96 часов иммунные клетки собирали, окрашивали анти-человеческим CD8 и анализировали с помощью FACS. Клеточную пролиферацию CD8+ Т-клеток оценивали по интенсивности сигнала CFSE. Уровни CFSE для клеток, обработанных IgG, принимали за 1. Результаты представляли как кратное увеличение пролиферации по сравнению с этим контролем. Поскольку увеличение пролиферации приводит к снижению сигнала CFSE, ось Y отображает обратное значение этого соотношения. Эксперименты проводились в четырех повторах. Показаны результаты для одного донора РВМС. Полученные данные позволяют предположить, что варианты N56E и N56T оказывают значительно более сильное влияние на пролиферацию CD8+ Т-клеток в присутствии опухолевых клеток по сравнению с родительским антителом (фиг. 4; *р<0,05, **р<0,01 по двустороннему t-критерию Стьюдента).Human PBMCs were fluorescently labeled with CFSE (C34554 ThermoFischer) and incubated with targeted A549 breast cancer cells in the presence of 2.5 μl/ml PHA-L (Roche) and the indicated antibody variants at a concentration of 4 μg/ml. After incubation for 96 hours, immune cells were collected, stained with anti-human CD8, and analyzed by FACS. Cellular proliferation of CD8+ T cells was assessed by CFSE signal intensity. CFSE levels for IgG-treated cells were set to 1. Results were reported as fold increase in proliferation compared to that control. Since increased proliferation leads to decreased CFSE signal, the y-axis displays the inverse of this relationship. Experiments were carried out in four repetitions. Results for one PBMC donor are shown. The findings suggest that the N56E and N56T variants have a significantly stronger effect on CD8+ T cell proliferation in the presence of tumor cells compared to the parent antibody (Fig. 4; *p<0.05, **p<0.01 by two-tailed Student's t-test).
Пример 5. Идентификация гуманизированного варианта 5В9 с улучшенной воспроизводимостью.Example 5: Identification of a humanized 5B9 variant with improved reproducibility.
Вариант антитела N56E показал наилучшие результаты в конкурентном анализе и был выбран в качестве основного варианта для гуманизации. На основе структурного анализа был идентифицирован большой предварительный набор сегментов последовательности, которые использовались для создания гуманизированных вариантов 5В9. Эти сегменты были отобраны и проанализированы с использованием технологии iTope™ для in silico анализа связывания пептидов с аллелями человеческого МНС класса II (Perry et al. 2008) и с использованием базы TCED™ (T cell epitope database) известных Т-клеточных эпитопов, относящихся к последовательностям антител (Bryson et al 2010). Сегменты последовательности, которые были идентифицированы, как фрагменты нечеловеческой зародышевой линии, связывающиеся с человеческим МНС класса II, или те, что показали значительное совпадение с базой TCED™, были отброшены. Это привело к уменьшению набора сегментов, и их комбинации были дополнительно проанализированы как описано выше, чтобы убедиться, что соединения сегментов не образуют потенциальных Т-клеточных эпитопов. Выбранные последовательности сегментов были собраны в полные последовательности V-областей, которые были лишены значимых Т-клеточных эпитопов. Затем были выбраны пять последовательностей тяжелых цепей (от VH1 до VH5) и 4 последовательности легких цепей (содержащих замену N56E) (от Vk1 до Vk4).The N56E antibody variant performed best in the competition assay and was selected as the lead variant for humanization. Based on structural analysis, a large preliminary set of sequence segments was identified and used to generate humanized 5B9 variants. These segments were selected and analyzed using iTope™ technology for in silico analysis of peptide binding to human MHC class II alleles (Perry et al. 2008) and using the TCED™ (T cell epitope database) of known T cell epitopes related to antibody sequences (Bryson et al 2010). Sequence segments that were identified as non-human germline fragments binding to human MHC class II, or those that showed significant overlap with the TCED™ base, were discarded. This resulted in a reduced set of segments, and their combinations were further analyzed as described above to ensure that segment junctions did not form potential T cell epitopes. Selected segment sequences were assembled into complete V region sequences that were devoid of significant T cell epitopes. Five heavy chain sequences (VH1 to VH5) and 4 light chain sequences (containing the N56E substitution) (Vk1 to Vk4) were then selected.
Таблица 1Table 1
Вариабельные области и последовательности CDRVariable regions and CDR sequences
- 26 045980- 26 045980
- 27 045980- 27 045980
Таблица 2 Последовательности каркасных участков (не CDR) гуманизированных вариабельных областей тяжелой цепиTable 2 Sequences of framework regions (non-CDRs) of humanized heavy chain variable regions
Таблица 3Table 3
Последовательности каркасных участков (не CDR) гуманизированных ______________вариабельных областей легкой цепи ____________Framework sequences (not CDRs) of humanized ______________ light chain variable regions ____________
Все варианты тестировали на связывание с помощью SPR (фиг. 5А), а варианты с аффинностью в два раза отличающейся от родительского антитела тестировали на связывание с PVR клеточной поверхности с использованием проточной цитометрии (фиг. 5В). За исключением вариантов, содержащих Vk4, все варианты показали уровни связывания, близкие к родительской химерной (мышь/человек) молекуле, содержащей замену N56E (IgG4 (S241P) N56E_VHO/VKO). Отмечалось, что гуманизация привела к удалению участка N-гликозилирования в положении N20 области FR1 легкой цепи.All variants were tested for binding by SPR (Fig. 5A), and variants with 2-fold different affinities from the parent antibody were tested for binding to cell surface PVR using flow cytometry (Fig. 5B). With the exception of the Vk4-containing variants, all variants showed binding levels similar to the parental chimeric (mouse/human) molecule containing the N56E substitution (IgG4 (S241P) N56E_VHO/VKO). It was noted that humanization resulted in the removal of an N-glycosylation site at position N20 of the FR1 region of the light chain.
Для выбора лидерного кандидата учитывали уровни экспрессии после транзиентной экспрессии в клетках HEK293 EBNA и сходство с последовательностью зародышевой линии человека (фиг. 6). На фиг. 6А суммированы титры всех вариантов после транзиентной трансфекции. Вариант VH4/Vk2 показал саExpression levels after transient expression in HEK293 EBNA cells and similarity to the human germline sequence were taken into account to select the lead candidate (Fig. 6). In fig. Figure 6A summarizes the titers of all variants after transient transfection. Option VH4/Vk2 showed sa
- 28 045980 мые высокие титры экспрессии и обладает высоким процентом идентичности последовательностей с генами зародышевой линии человека (фиг. 6В). Наконец, оценку воспроизводимости варианта VH4/Vk2 (NB1088) проводили в сравнении с вариантом, идентичным NB1088, но с исходным деамидирующим компетентным LC CDR2 из 5В9 (WASSRHNG), обозначенным как NB0941. Были определены биофизические свойства NB0941 и NB1088. Как показано на фиг. 7А и 7В, стресс, связанный с высоким рН, и инкубация при 40°С выявили изменения в капиллярном изоэлектрическом фокусировании (cIEF), в частности, увеличение процентного содержания кислотных соединений, возможно, из-за дезамидирования. Эти изменения были более выражены в NB0941 по сравнению с NB1088. Поэтому NB1088 с оптимизированным профилем иммуногенности, экспрессии и связывания, а также желаемыми биофизическими свойствами был выбран в качестве лидерного гуманизированного варианта для функционального анализа.- 28 045980 high expression titers and has a high percentage of sequence identity with human germline genes (Fig. 6B). Finally, the reproducibility of the VH4/Vk2 variant (NB1088) was assessed in comparison with a variant identical to NB1088 but with the parent deamidating competent LC CDR2 from 5B9 (WASSRHNG), designated NB0941. The biophysical properties of NB0941 and NB1088 were determined. As shown in FIG. 7A and 7B, high pH stress and incubation at 40°C revealed changes in capillary isoelectric focusing (cIEF), particularly an increase in the percentage of acidic species, possibly due to deamidation. These changes were more pronounced in NB0941 compared to NB1088. Therefore, NB1088, with its optimized immunogenicity, expression and binding profile, as well as desirable biophysical properties, was selected as the lead humanized variant for functional analysis.
Снижение аффинности, наблюдаемое в некоторых вариантах, особенно полезно при разработке CAR-драйвера, учитывая тот факт, что нормальные ткани экспрессируют минимальные уровни PVR. Результаты (фиг. 16) показывают, что PVR сверхэкспрессируется в различных опухолях, что позволяет эффективно нацеливать на эти опухоли CAR-T, управляемый PVR. Потенциальная проблема безопасности может быть легко решена с помощью анти-PVR вариантов со сниженной (настроенной) аффинностью, как описано в публикации Liu et al. (Cancer research, 2015; Volume 75, Issue 17).The reduction in affinity observed in some embodiments is particularly useful in CAR driver development given the fact that normal tissues express minimal levels of PVR. The results (Figure 16) show that PVR is overexpressed in a variety of tumors, allowing PVR-driven CAR-T to effectively target these tumors. The potential safety issue can be easily addressed by using affinity-reduced anti-PVR variants as described by Liu et al. (Cancer research, 2015; Volume 75, Issue 17).
Пример 6. NB1088 ингибирует связывание PVR с TIGIT, CD96 и CD226.Example 6 NB1088 inhibits PVR binding to TIGIT, CD96 and CD226.
NB1088 тестировали на его способность блокировать связывание TIGIT, CD96 и CD226 с PVR. Диссоциированные клетки СНО (яичники китайского хомячка), стабильно экспрессирующие человеческий PVR, инкубировали с NB1088 в указанных концентрациях в течение 20 мин на льду с последующим добавлением 10 мкг/мл биотинилированного рекомбинантного TIGIT, CD96 или CD226-Fc, соответственно, и выдерживали на льду еще 120 мин. После промывания поверхно-связанный NB1088 определяли с помощью вторичного антитела, конъюгированного с анти-человеческим Alexa-488, a биотинилированные белки определяли с помощью конъюгированного с Alexa647 стрептавидина, и анализировали с использованием проточной цитометрии. На фиг. 8А показано, что NB1088 связывается с PVR с EC50 около 3,3 наномоль. IC50 для NB1088 для конкуренции с TIGIT, CD96 или CD226 за связывание с PVR составляет 1,1, 1,1 и 1,9 нМ, соответственно, как показано на фиг. 8B-8D.NB1088 was tested for its ability to block the binding of TIGIT, CD96, and CD226 to PVR. Dissociated CHO (Chinese hamster ovary) cells stably expressing human PVR were incubated with NB1088 at the indicated concentrations for 20 min on ice, followed by the addition of 10 μg/ml biotinylated recombinant TIGIT, CD96, or CD226-Fc, respectively, and kept on ice for an additional 120 min. After washing, surface-bound NB1088 was detected using a secondary antibody conjugated to anti-human Alexa-488, and biotinylated proteins were detected using Alexa647-conjugated streptavidin and analyzed using flow cytometry. In fig. 8A shows that NB1088 binds to PVR with an EC 50 of about 3.3 nM. The IC 50 for NB1088 to compete with TIGIT, CD96, or CD226 for binding to PVR is 1.1, 1.1, and 1.9 nM, respectively, as shown in FIG. 8B-8D.
Пример 7. NB1088 стимулирует цитотоксические Т- и NK-клетки.Example 7: NB1088 stimulates cytotoxic T and NK cells.
Определяли способность NB1088 стимулировать активность Т- и NK-клеток in vitro. Используя методику на основе антиген-специфического вируса папилломы человека (HPV), 30000 клеток HPV+ клеточной линии эпидермоидной карциномы шейки матки человека (клетки CaSki) и 30000 HPVспецифических CD8 Т-клеток совместно инкубировали с контрольным IgG или NB1088 в концентрации 10 мкг/мл в течение ночи. Высвобождение гамма-интерферона в супернатант определяли с помощью системы MSD, специфичной для гамма-интерферона человека. Как показано на фиг. 9А, NB1088 увеличивал высвобождение гамма-интерферона из человеческих HPV-специфических CD8+ (цитотоксических) Т-клеток при инкубации с HPV+ клетками CaSki. Чтобы протестировать активность CD8 Т-клеток в аллогенной системе, РВМС предварительно активировали в течение трех дней фитогемагглютинином (РНА) и интерлейкином 2 (TL2), выдерживали в течение ночи в отсутствие PHA/IL2 перед выделением CD8 Т-клеток с использованием методики негативного выделения с помощью магнитной сепарации. 10000 опухолевых клеток А549 и 100000 здоровых донорских CD8+ Т-клеток совместно культивировали в течение ночи в присутствии 100 ЕД/мл IL2 и 1 мкг/мл анти-CD28-антитела. Как показано на фиг. 9В, NB1088 увеличивал высвобождение гамма-интерферона из CD8+ Т-клеток в большей степени, чем антитело против PD-1 (пембролизумаб), и оно дополнительно повышалось в результате комбинации NB1088 и антитела против PD-1.The ability of NB1088 to stimulate T and NK cell activity in vitro was determined. Using an antigen-specific human papillomavirus (HPV)-based technique, 30,000 HPV+ human cervical epidermoid carcinoma cell line cells (CaSki cells) and 30,000 HPV-specific CD8 T cells were co-incubated with control IgG or NB1088 at a concentration of 10 μg/ml for nights. The release of interferon gamma into the supernatant was determined using the human interferon gamma-specific MSD system. As shown in FIG. 9A, NB1088 increased interferon-gamma release from human HPV-specific CD8+ (cytotoxic) T cells when incubated with HPV+ CaSki cells. To test CD8 T cell activity in an allogeneic system, PBMCs were preactivated for three days with phytohemagglutinin (PHA) and interleukin 2 (TL2), maintained overnight in the absence of PHA/IL2 before isolating CD8 T cells using a negative isolation technique. using magnetic separation. 10,000 A549 tumor cells and 100,000 healthy donor CD8+ T cells were cocultured overnight in the presence of 100 U/ml IL2 and 1 μg/ml anti-CD28 antibody. As shown in FIG. 9B, NB1088 increased the release of interferon gamma from CD8+ T cells to a greater extent than the anti-PD-1 antibody (pembrolizumab), and it was further increased by the combination of NB1088 and the anti-PD-1 antibody.
Также определяли влияние NB1088 на антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC). NK-клетки от здоровых доноров выделяли из РВМС, оставленных на ночь, с использованием методики негативного выделения с помощью магнитной сепарации. 10000 PVR+ и EGFR+ опухолевых клеток А549 и 50000 NK-клеток инкубировали или с контрольным IgG; или с контрольным IgG и анти-EGFR антителом цетуксимаб (5 мкг/мл), или с цетуксимабос и NB1088. Активность NK-клеток в отношении антителозависимой клеточной цитотоксичности или высвобождения гамма-интерферона определяли с помощью Cell Titer Glow путем анализа жизнеспособности прикрепленных клеток А549 после совместного культивирования и удаления NK-клеток или с помощью MSD анализа супернатантов, как указано выше. Как показано на фиг. 10А и 10В, при инкубации с цетуксимабом NB1088 был способен увеличивать опосредованное NK-клетками уничтожение клеток А549, а также высвобождение гаммаинтерферона.The effect of NB1088 on antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) was also determined. NK cells from healthy donors were isolated from overnight PBMCs using a negative isolation technique using magnetic separation. 10,000 PVR+ and EGFR+ A549 tumor cells and 50,000 NK cells were incubated with either control IgG; or with control IgG and anti-EGFR antibody cetuximab (5 μg/ml), or with cetuximabos and NB1088. NK cell activity for antibody-dependent cellular cytotoxicity or interferon-gamma release was determined using Cell Titer Glow by assaying the viability of adherent A549 cells after co-culture and removal of NK cells or by MSD analysis of supernatants as above. As shown in FIG. 10A and 10B, when incubated with cetuximab, NB1088 was able to increase NK cell-mediated killing of A549 cells as well as interferon-gamma release.
Пример 8. NB1088 восстанавливает экспрессию и активность CD226 в CD8 Т- и NK-клетках.Example 8: NB1088 restores CD226 expression and activity in CD8 T and NK cells.
Определяли способность NB1088 влиять на функцию CD226. CD226 (DNAM-1) представляет собой гликопротеиновый рецептор клеточной поверхности, экспрессируемый NK- и Т-клетками, который служит лигандом для PVR и способствует уничтожению опухоли CD8+ Т- и NK-клетками. По своей функции ему противостоят TIGIT и CD96, представляющие собой ингибирующие молекулы, экспрессируемые на Т- и NK-клетках. Таким образом, усиление функции CD226 из-за NB1088 указывает на то, чтоThe ability of NB1088 to influence CD226 function was determined. CD226 (DNAM-1) is a cell surface glycoprotein receptor expressed by NK and T cells that serves as a ligand for PVR and promotes tumor killing by CD8+ T and NK cells. In terms of its function, it is opposed by TIGIT and CD96, which are inhibitory molecules expressed on T and NK cells. Thus, the gain of CD226 function due to NB1088 indicates that
- 29 045980- 29 045980
NB1088 будет усиливать активность Т- и NK-клеток и обладать широким спектром противоопухолевой активности. Влияние NB1088 на экспрессию и функцию CD226 тестировали в антигенспецифических и аллогенных системах совместного культивирования, как описано выше. Как показано на фиг. 11А и 11В, совместное культивирование CD8 Т-клеток и NK-клеток с PVR+ клетками-мишенями приводило к сильному снижению поверхностной экспрессии CD226 на CD8 Т-клетках и NK-клетках. NB1088 восстанавливал экспрессию CD226 на клеточной поверхности CD8 Т-клеток или NK-клеток, независимо от системы совместного культивирования (фиг. 11А и В), в отличие от анти-TIGIT. Функциональные последствия повышения экспрессии CD226 на Т- и NK-клетках после обработки NB1088 оценивали с использованием описанных выше антигенспецифических и аллогенных систем совместного культивирования с небольшими модификациями (фиг. 12А и В). Повышенная экспрессия CD226 коррелировала со значительно более высокими уровнями высвобождения гамма-интерферона после обработки NB1088 по сравнению с обработкой контрольным IgG или анти-TIGIT (фиг. 12А и В). Превосходная активность Т- и NKклеток при обработке NB1088 была, по крайней мере, частично опосредована активностью CD226. АнтиCD226 (DX11, 20 мкг/мл) снижало NB1088-зαβисимое высвобождение гамма-интерферона как алло-, так и антиген-стимулированными CD8 Т-клетками (фиг. 12А) и NK-клетками после совместного культивирования с А549 (фиг. 12В) до уровней, наблюдаемых с анти-TIGIT. Эти данные демонстрируют, что NB1088 улучшает активность Т- и NK-клеток по сравнению с блокадой TIGIT за счет увеличения экспрессии и/или функции CD226.NB1088 will enhance T and NK cell activity and have broad spectrum antitumor activity. The effect of NB1088 on CD226 expression and function was tested in antigen-specific and allogeneic coculture systems as described above. As shown in FIG. 11A and 11B, coculture of CD8 T cells and NK cells with PVR+ target cells resulted in a strong reduction in the surface expression of CD226 on CD8 T cells and NK cells. NB1088 restored CD226 expression on the cell surface of CD8 T cells or NK cells, regardless of the coculture system (Fig. 11A and B), in contrast to anti-TIGIT. The functional consequences of increased CD226 expression on T and NK cells following NB1088 treatment were assessed using the antigen-specific and allogeneic coculture systems described above with minor modifications (Fig. 12A and B). Increased expression of CD226 correlated with significantly higher levels of interferon-gamma release following treatment with NB1088 compared to treatment with control IgG or anti-TIGIT (Fig. 12A and B). The superior T and NK cell activity upon NB1088 treatment was at least partially mediated by CD226 activity. Anti-CD226 (DX11, 20 μg/ml) reduced NB1088-dependent interferon gamma release by both allo- and antigen-stimulated CD8 T cells (Fig. 12A) and NK cells after coculture with A549 (Fig. 12B) to levels observed with anti-TIGIT. These data demonstrate that NB1088 improves T and NK cell activity compared with TIGIT blockade by increasing CD226 expression and/or function.
Пример 9. Эффективность монотерапии NB1088 в гуманизированных мышиных моделях ксенотрансплантатов опухоли.Example 9 Efficacy of NB1088 monotherapy in humanized tumor xenograft mouse models.
Определяли способность NB1088 уничтожать опухоли А549 (аденокарциномы легкого) или HPAF (поджелудочной железы) на модели гуманизированных мышей. Вкратце, 5х106 опухолевых клеток (А549 или HPAF) смешивали в матригеле с человеческими активированными мононуклеарными клетками периферической крови в соотношении 1:1 и подкожно имплантировали в бок иммунодефицитным мышам NOD/SCID (12 животных на состояние). Как показано на фиг. 13А и 13В, NB1088 был способен уменьшать объем опухоли, по меньшей мере так же, как aнти-PD-1 антитело пембролизумаб. NB1088 также был способен сокращать объем опухоли в модели А549/РВМС (фиг. 13С), но не тогда, когда использовались только клетки А549 (фиг. 13D). В модели А549/РВМС уменьшение объема опухоли коррелировало с повышенной экспрессией CD226 на CD8 Т-клетках, выделенных из опухолей, обработанных NB1088 (фиг. 13Е). Также оценивали влияние NB1088 на эффекторную функцию CD8 Т-клеток ех vivo (фиг. 14А и В). Суспензии лизированных одиночных клеток из опухолей стимулировали анти-CD28/анти-CD3 в присутствии брефельдина А и αнти-CD107а в течение 5 ч при 37°С. После стимуляции клетки окрашивали с использованием стандартных методик поверхностного/внутриклеточного окрашивания, чтобы с использованием проточной цитометрии оценить продуцирование гамма-интерферона CD8+ Т-клетками. Как показано на фиг. 14А и 14В, NB1088 увеличивал частоту общих гамма-интерферон положительных (фиг. 14А) и полифункциональных гαмма-интерферон/CD107а двойных положительных (фиг. 14В) CD8 Т-клеток, полученных из опухолей. Кроме того, повышенная частота гамма-интерферон положительных CD8+ Т-клеток в опухолях, обработанных NB1088, была получена исключительно из CD226положительных CD8+ Т-клеток (фиг. 14С и 14D), что свидетельствует о важном вкладе функции CD226 in vivo в противоопухолевую активность NB1088.The ability of NB1088 to kill A549 (lung adenocarcinoma) or HPAF (pancreatic) tumors was determined in a humanized mouse model. Briefly, 5 x 10 6 tumor cells (A549 or HPAF) were mixed in Matrigel with human activated peripheral blood mononuclear cells in a 1:1 ratio and implanted subcutaneously in the flank of immunodeficient NOD/SCID mice (12 animals per condition). As shown in FIG. 13A and 13B, NB1088 was able to reduce tumor volume at least as well as the anti-PD-1 antibody pembrolizumab. NB1088 was also able to reduce tumor volume in the A549/PBMC model (Fig. 13C), but not when A549 cells alone were used (Fig. 13D). In the A549/PBMC model, decreased tumor volume correlated with increased expression of CD226 on CD8 T cells isolated from tumors treated with NB1088 (Fig. 13E). The effect of NB1088 on CD8 T cell effector function ex vivo was also assessed (FIG. 14A and B). Suspensions of lysed single cells from tumors were stimulated with anti-CD28/anti-CD3 in the presence of brefeldin A and αanti-CD107a for 5 h at 37°C. After stimulation, cells were stained using standard surface/intracellular staining techniques to assess interferon gamma production by CD8+ T cells using flow cytometry. As shown in FIG. 14A and 14B, NB1088 increased the frequency of total interferon gamma positive (Fig. 14A) and multifunctional interferon gamma/CD107a double positive (Fig. 14B) tumor-derived CD8 T cells. In addition, the increased frequency of interferon gamma positive CD8+ T cells in tumors treated with NB1088 was derived exclusively from CD226 positive CD8+ T cells (Figures 14C and 14D), suggesting an important contribution of CD226 function in vivo to the antitumor activity of NB1088.
Пример 10. Фармакокинетика NB1088 и фармакодинамические изменения экспрессии CD226 на CD4 Т-клетках яванского макака.Example 10: Pharmacokinetics of NB1088 and pharmacodynamic changes in CD226 expression on cynomolgus CD4 T cells.
Фармакокинетические свойства NB1088 измеряли после однократной или 4x1 еженедельной внутривенной болюсной инъекции в дозах 2, 50 или 200 мг/кг на яванских макаках (2 самки обезьян на каждую дозу). Кроме того, оценивали изменения экспрессии CD226 на циркулирующих периферических CD4 Т-клетках. На фиг. 15А показаны концентрации]4® 1088 в плазме (мкг/мл), как функция времени (в часах) и дозы. IC90 и 10х IC90 рассчитывали на основе in vitro анализов активности с использованием анализа РВМС яванских макаков. NB1088 показало типичный фармакокинетический профиль и достигало концентраций выше 10х IC90 на протяжении всего исследования после повторной дозы 200 мг/кг. На фиг. 15В показаны уровни экспрессии CD226 на циркулирующих CD4 Т-клетках, нормализованные до дозы перед введением, измеренные с помощью проточной цитометрии со специфическими антителами. NB1088 повышал уровни поверхностной экспрессии CD226 до 1,5 раз в группе, получавшей дозу 50 мг/кг, и в группе повторной дозы 200 мг/кг, и оставался повышенным в группе повторной дозы 200 мг/кг. Эти данные показывают, что NB1088 может запускать и модулировать экспрессию CD226 на CD4 Т-клетках яванского макака.The pharmacokinetic properties of NB1088 were measured after a single or 4x1 weekly intravenous bolus injection at doses of 2, 50, or 200 mg/kg in cynomolgus monkeys (2 female monkeys per dose). In addition, changes in CD226 expression on circulating peripheral CD4 T cells were assessed. In fig. 15A shows plasma concentrations of 4 ® 1088 (µg/ml) as a function of time (hours) and dose. IC90 and 10x IC90 were calculated from in vitro activity assays using the cynomolgus monkey PBMC assay. NB1088 exhibited a typical pharmacokinetic profile and achieved concentrations above 10x IC90 throughout the study after a repeat dose of 200 mg/kg. In fig. 15B shows CD226 expression levels on circulating CD4 T cells, normalized to predose, measured by flow cytometry with specific antibodies. NB1088 increased CD226 surface expression levels by up to 1.5-fold in the 50 mg/kg dose group and the 200 mg/kg repeat dose group, and remained elevated in the 200 mg/kg repeat dose group. These data indicate that NB1088 can trigger and modulate CD226 expression on cynomolgus CD4 T cells.
Пример 11. Экспрессия человеческого PVR в разных типах опухолей.Example 11: Expression of human PVR in different tumor types.
Оценивали уровни экспрессии PVR для человеческих раков различного происхождения. Экспрессию PVR определяли стандартными методами иммуногистохимии с использованием коммерчески доступного клона кроличьего моноклонального антитела D3G7H и микрочипов раковой ткани. Окрашивание оцифровывали и количественно определяли интенсивность для расчета Н-показателей в процессе и между опытами. На фиг. 16 показаны повышенные уровни экспрессии PVR при большинстве раков, проPVR expression levels were assessed for human cancers of various origins. PVR expression was determined by standard immunohistochemistry methods using a commercially available rabbit monoclonal antibody clone D3G7H and cancer tissue microarrays. Staining was digitized and intensity quantified to calculate H-scores within and between trials. In fig. Figure 16 shows increased levels of PVR expression in most cancers, pro
--
Claims (15)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/912,534 | 2019-10-08 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA045980B1 true EA045980B1 (en) | 2024-01-24 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2788979T3 (en) | Antigen-binding molecules comprising a ligand trimer of the TNF family | |
US20210130459A1 (en) | Antibodies specific to human nectin4 | |
JP2023126946A (en) | Compositions comprising combination of anti-lag-3 antibody, pd-1 pathway inhibitor, and immunotherapeutic agent | |
JP7366908B2 (en) | Single domain antibodies against PD-1 and variants thereof | |
JP2019516394A (en) | Novel anti-PD-L1 antibody | |
TWI774137B (en) | Antibodies against CD3 and BCMA and bispecific binding proteins prepared therefrom | |
JP7360441B2 (en) | Mesothelin and CD137 binding molecules | |
JP7274426B2 (en) | Treatment of cancer with anti-GITR agonist antibodies | |
US20220372161A1 (en) | Antibodies against the poliovirus receptor (pvr) and uses thereof | |
JP2021520201A (en) | Anti-CD27 antibody and its use | |
JP2020531854A (en) | TIM-3 antagonists for the treatment and diagnosis of cancer | |
AU2022285741A1 (en) | Anti-ccr8 antibodies and uses thereof | |
EP3856778A1 (en) | System and method for the development of cd30 bispecific antibodies for immunotherapy of cd30+ malignancies | |
CN114364400A (en) | Methods of treating cancer using PD-1 axis inhibitors and anti-periostin antibodies | |
US20220010003A1 (en) | Anti-periostin antibodies and uses thereof | |
EP3636320A1 (en) | Antibodies targeting cd137 and methods of use thereof | |
EA045980B1 (en) | ANTIBODIES AGAINST THE POLIO VIRUS RECEPTOR (PVR) AND THEIR APPLICATION | |
TWI839395B (en) | Antibodies targeting cd137 and methods of use thereof | |
RU2815066C2 (en) | Molecules binding mesothelin and cd137 | |
US20240052065A1 (en) | Binding molecules for the treatment of cancer | |
CA3206413A1 (en) | Antibodies against cd112r and uses thereof | |
KR20240051277A (en) | Bispecific and trispecific binding proteins for PD-L1, CD137, and/or TGFβ and uses thereof | |
WO2022018294A1 (en) | A combination of anti-dr5 antibodies and an immunomodulatory imide drug for use in treating multiple myeloma | |
JP2023506593A (en) | ANTI-GITR ANTIBODY AND USES THEREOF |